View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9369_high_4 (Length: 448)

Name: NF9369_high_4
Description: NF9369
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9369_high_4
NF9369_high_4
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (72-434)||(20774166-20774528)
chr5 (69-434)||(22462356-22462721)
chr5 (72-434)||(28894541-28894903)
chr5 (72-434)||(28916012-28916374)
chr5 (72-434)||(28923367-28923729)
chr5 (72-434)||(20821860-20822222)
chr5 (72-434)||(22235519-22235881)
chr5 (75-433)||(21890359-21890717)
chr5 (72-433)||(17268934-17269294)
chr5 (72-415)||(21563591-21563934)
chr5 (72-433)||(24716126-24716487)
chr5 (72-433)||(24619895-24620256)
chr5 (72-433)||(22503086-22503447)
chr5 (72-433)||(25848482-25848843)
chr5 (72-433)||(24749154-24749515)
chr5 (72-433)||(14886591-14886952)
chr5 (74-434)||(21831360-21831720)
chr5 (72-434)||(20342689-20343051)
chr5 (69-433)||(24797997-24798361)
chr5 (72-434)||(23079688-23080050)
chr5 (72-373)||(22381606-22381907)
chr5 (72-388)||(19770385-19770701)
chr5 (72-388)||(27668135-27668451)
chr5 (77-391)||(25423619-25423933)
chr5 (72-433)||(23471654-23472015)
chr5 (72-388)||(14999384-14999700)
chr5 (72-388)||(34566919-34567235)
chr5 (72-388)||(37291141-37291457)
chr5 (69-391)||(20467739-20468060)
chr5 (72-388)||(16356927-16357243)
chr5 (72-400)||(22332520-22332848)
chr5 (72-388)||(22348848-22349164)
chr5 (72-388)||(27610779-27611095)
chr5 (72-388)||(27685045-27685361)
chr5 (72-388)||(40709205-40709521)
chr5 (72-273)||(21339046-21339247)
chr5 (196-433)||(37542981-37543218)
chr5 (72-388)||(41771267-41771583)
chr5 (72-388)||(27518832-27519148)
chr5 (72-388)||(29475718-29476034)
chr5 (72-388)||(22135093-22135409)
chr5 (72-400)||(23574167-23574490)
chr5 (72-298)||(21497772-21497997)
chr5 (76-267)||(21496569-21496760)
chr5 (160-400)||(26738360-26738600)
chr5 (75-273)||(18776198-18776396)
chr5 (72-220)||(23516966-23517114)
chr5 (152-418)||(21407643-21407909)
chr5 (72-201)||(20799185-20799314)
chr5 (72-184)||(23440650-23440762)
chr5 (375-434)||(21680377-21680436)
chr5 (72-201)||(37545328-37545457)
chr5 (72-139)||(922-989)
chr5 (336-400)||(23440899-23440963)
chr5 (72-127)||(26738611-26738666)
chr5 (198-400)||(20799999-20800201)
chr5 (337-388)||(21338942-21338993)
chr5 (336-391)||(23517215-23517270)
chr5 (357-391)||(21936830-21936864)
chr5 (357-391)||(24581902-24581936)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (69-434)||(654-1019)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (69-434)||(20856250-20856615)
chr1 (72-434)||(20835377-20835739)
chr1 (72-434)||(22432605-22432967)
chr1 (72-434)||(19662626-19662992)
chr1 (72-434)||(20939552-20939914)
chr1 (72-433)||(19854821-19855174)
chr1 (72-433)||(31539487-31539848)
chr1 (72-433)||(24099093-24099454)
chr1 (72-433)||(37677588-37677949)
chr1 (72-433)||(20294920-20295281)
chr1 (72-400)||(21749449-21749777)
chr1 (68-400)||(50619767-50620099)
chr1 (72-388)||(16350134-16350450)
chr1 (72-400)||(22361767-22362095)
chr1 (72-388)||(51333028-51333344)
chr1 (72-388)||(21837458-21837774)
chr1 (72-388)||(33390564-33390880)
chr1 (72-388)||(21830811-21831127)
chr1 (72-388)||(17044550-17044866)
chr1 (72-298)||(16369805-16370031)
chr1 (72-220)||(19106875-19107023)
chr1 (135-391)||(20139401-20139657)
chr1 (68-400)||(19760389-19760721)
chr1 (333-433)||(21951678-21951778)
chr1 (141-400)||(20250379-20250638)
chr1 (72-184)||(16078391-16078503)
chr1 (72-184)||(41354208-41354320)
chr1 (72-145)||(41308333-41308406)
chr1 (357-391)||(20830924-20830958)
chr1 (336-388)||(16078191-16078243)
chr1 (336-388)||(20937686-20937738)
chr1 (336-388)||(41353197-41353249)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (69-434)||(95422-95787)
scaffold0029 (76-434)||(113087-113445)
scaffold0029 (72-388)||(109277-109593)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (72-433)||(27900879-27901240)
chr4 (72-433)||(15002782-15003143)
chr4 (72-433)||(15246417-15246778)
chr4 (72-433)||(1648695-1649056)
chr4 (74-434)||(15078130-15078490)
chr4 (72-434)||(8706411-8706773)
chr4 (72-404)||(15358537-15358869)
chr4 (72-432)||(15319644-15320004)
chr4 (72-433)||(3264212-3264573)
chr4 (72-434)||(33223416-33223778)
chr4 (72-433)||(11206649-11207010)
chr4 (72-433)||(29452955-29453316)
chr4 (68-434)||(14691391-14691757)
chr4 (72-433)||(20891475-20891836)
chr4 (74-433)||(44661284-44661643)
chr4 (72-434)||(15414443-15414805)
chr4 (68-433)||(14850524-14850889)
chr4 (75-388)||(16251648-16251961)
chr4 (72-388)||(8052826-8053142)
chr4 (72-388)||(8386905-8387221)
chr4 (72-388)||(12477093-12477409)
chr4 (72-388)||(14681060-14681376)
chr4 (72-388)||(27711829-27712145)
chr4 (72-388)||(29038607-29038923)
chr4 (68-396)||(1639620-1639948)
chr4 (72-400)||(7090925-7091253)
chr4 (72-388)||(12524169-12524485)
chr4 (72-400)||(15147076-15147403)
chr4 (72-388)||(40473533-40473849)
chr4 (72-388)||(18297698-18298014)
chr4 (72-388)||(19777996-19778312)
chr4 (72-388)||(23956240-23956556)
chr4 (72-388)||(14303181-14303497)
chr4 (72-405)||(16354631-16354964)
chr4 (75-388)||(18226649-18226962)
chr4 (79-396)||(14159970-14160287)
chr4 (141-217)||(18549694-18549770)
chr4 (357-391)||(15292618-15292652)
chr4 (74-112)||(16146409-16146447)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (75-433)||(67897-68255)
scaffold0034 (72-434)||(4373-4735)
scaffold0034 (72-433)||(13322-13683)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (72-434)||(15459693-15460055)
chr6 (72-434)||(34645148-34645510)
chr6 (72-434)||(21563694-21564056)
chr6 (72-434)||(21569553-21569915)
chr6 (72-433)||(25768548-25768909)
chr6 (72-434)||(19453777-19454139)
chr6 (76-434)||(21471962-21472320)
chr6 (72-433)||(8762496-8762857)
chr6 (72-434)||(14381029-14381391)
chr6 (72-433)||(5296769-5297130)
chr6 (74-411)||(17415845-17416182)
chr6 (72-434)||(27560179-27560541)
chr6 (72-433)||(22796195-22796556)
chr6 (72-433)||(18795047-18795408)
chr6 (72-424)||(28282385-28282737)
chr6 (75-434)||(19879658-19880017)
chr6 (72-434)||(10468411-10468773)
chr6 (72-433)||(24364769-24365130)
chr6 (72-388)||(1542692-1543008)
chr6 (72-400)||(18407538-18407866)
chr6 (72-388)||(24312776-24313092)
chr6 (72-405)||(5838810-5839143)
chr6 (68-400)||(15896447-15896779)
chr6 (72-400)||(19865044-19865372)
chr6 (72-403)||(28262790-28263121)
chr6 (72-403)||(28341539-28341870)
chr6 (72-388)||(16626325-16626641)
chr6 (72-388)||(29591528-29591844)
chr6 (135-388)||(20636909-20637162)
chr6 (72-388)||(2874411-2874727)
chr6 (72-400)||(22762051-22762379)
chr6 (76-403)||(28291965-28292292)
chr6 (79-400)||(27391769-27392090)
chr6 (72-400)||(25112909-25113237)
chr6 (79-400)||(27331029-27331350)
chr6 (72-400)||(22078286-22078614)
chr6 (69-388)||(25609469-25609788)
chr6 (72-400)||(16927236-16927564)
chr6 (72-400)||(23078826-23079154)
chr6 (72-388)||(27187793-27188109)
chr6 (72-388)||(27261131-27261447)
chr6 (72-391)||(22434226-22434545)
chr6 (75-340)||(11280161-11280426)
chr6 (69-208)||(17032737-17032876)
chr6 (135-433)||(18197291-18197589)
chr6 (72-155)||(1641129-1641212)
chr6 (72-215)||(16963148-16963291)
chr6 (366-434)||(19435653-19435721)
chr6 (159-391)||(22442711-22442943)
chr6 (72-219)||(27559765-27559912)
chr6 (135-220)||(21836973-21837058)
chr6 (357-391)||(1648419-1648453)
chr6 (168-298)||(18966984-18967114)
chr6 (360-391)||(23996893-23996924)
chr6 (357-391)||(16381978-16382012)
chr6 (375-425)||(19488843-19488893)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (72-433)||(6708-7069)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (72-434)||(10419690-10420052)
chr3 (72-433)||(13322298-13322659)
chr3 (72-434)||(14086795-14087157)
chr3 (72-434)||(13971765-13972127)
chr3 (72-434)||(17492752-17493114)
chr3 (72-434)||(18133991-18134353)
chr3 (72-425)||(12360196-12360549)
chr3 (72-433)||(16827849-16828209)
chr3 (72-433)||(16836156-16836517)
chr3 (72-434)||(13942146-13942508)
chr3 (75-433)||(14574054-14574406)
chr3 (72-424)||(8758737-8759089)
chr3 (72-424)||(41177644-41177996)
chr3 (72-433)||(11303419-11303780)
chr3 (72-433)||(28754440-28754801)
chr3 (72-433)||(47124066-47124427)
chr3 (72-424)||(4678560-4678912)
chr3 (72-434)||(44777369-44777731)
chr3 (72-376)||(15952671-15952975)
chr3 (72-433)||(10384091-10384451)
chr3 (72-425)||(16380582-16380935)
chr3 (72-433)||(16338158-16338519)
chr3 (72-387)||(15227771-15228086)
chr3 (72-433)||(9522831-9523192)
chr3 (72-415)||(16329324-16329668)
chr3 (72-405)||(12498360-12498693)
chr3 (72-405)||(16491866-16492199)
chr3 (72-388)||(10005712-10006028)
chr3 (72-400)||(17489962-17490290)
chr3 (72-403)||(6600848-6601179)
chr3 (285-434)||(11960814-11960963)
chr3 (72-388)||(5424632-5424948)
chr3 (72-388)||(10906322-10906638)
chr3 (72-388)||(13252802-13253118)
chr3 (72-388)||(16635885-16636201)
chr3 (72-388)||(43163209-43163525)
chr3 (72-403)||(53384705-53385036)
chr3 (72-388)||(48425559-48425875)
chr3 (73-220)||(14126464-14126611)
chr3 (72-388)||(15347947-15348263)
chr3 (72-388)||(20061756-20062072)
chr3 (69-400)||(16371522-16371853)
chr3 (72-254)||(12850104-12850286)
chr3 (75-388)||(16411984-16412297)
chr3 (69-400)||(14876188-14876520)
chr3 (72-388)||(15589094-15589410)
chr3 (75-403)||(16756272-16756600)
chr3 (69-367)||(15061865-15062163)
chr3 (74-388)||(15339383-15339697)
chr3 (75-388)||(26792101-26792414)
chr3 (72-388)||(15402212-15402528)
chr3 (72-388)||(16806628-16806944)
chr3 (75-400)||(15209006-15209331)
chr3 (75-388)||(15724636-15724949)
chr3 (72-298)||(16692272-16692502)
chr3 (76-400)||(15248263-15248587)
chr3 (72-220)||(11564551-11564699)
chr3 (84-273)||(15015573-15015762)
chr3 (69-127)||(11960986-11961044)
chr3 (33-69)||(14685174-14685210)
chr3 (378-434)||(31694831-31694887)
chr3 (378-434)||(31939331-31939387)
chr3 (72-111)||(26008961-26009000)
chr3 (357-391)||(8274098-8274132)
chr3 (357-391)||(13967039-13967073)
chr3 (357-391)||(30138213-30138247)
chr3 (357-391)||(30147764-30147798)
chr3 (357-434)||(16742359-16742436)
chr3 (33-69)||(10790579-10790615)
chr3 (81-245)||(18748796-18748960)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (133-433)||(468-768)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (72-434)||(20975511-20975873)
chr8 (72-433)||(1266797-1267158)
chr8 (72-425)||(21840976-21841329)
chr8 (72-433)||(31416335-31416696)
chr8 (75-433)||(23655489-23655847)
chr8 (74-434)||(22061293-22061653)
chr8 (72-434)||(20388658-20389020)
chr8 (72-434)||(22371499-22371861)
chr8 (72-433)||(19851970-19852331)
chr8 (72-433)||(19858006-19858367)
chr8 (72-433)||(803534-803895)
chr8 (72-433)||(6679670-6680031)
chr8 (72-424)||(31570712-31571064)
chr8 (72-433)||(16271085-16271446)
chr8 (72-433)||(22051422-22051783)
chr8 (72-433)||(6604217-6604578)
chr8 (72-433)||(27355107-27355468)
chr8 (72-434)||(29303286-29303648)
chr8 (69-433)||(14565698-14566062)
chr8 (72-433)||(12305317-12305678)
chr8 (68-433)||(20395986-20396351)
chr8 (68-433)||(22377315-22377680)
chr8 (68-433)||(22383490-22383855)
chr8 (70-390)||(23949476-23949796)
chr8 (72-388)||(19113249-19113565)
chr8 (72-391)||(16407949-16408267)
chr8 (72-390)||(21393769-21394087)
chr8 (72-390)||(21788263-21788581)
chr8 (72-405)||(21251500-21251833)
chr8 (72-388)||(32600703-32601019)
chr8 (72-433)||(20009780-20010122)
chr8 (74-400)||(21921630-21921955)
chr8 (72-388)||(17673929-17674245)
chr8 (72-388)||(18857136-18857452)
chr8 (72-400)||(21166432-21166759)
chr8 (76-400)||(22040422-22040746)
chr8 (76-388)||(30313050-30313362)
chr8 (72-400)||(23650600-23650928)
chr8 (72-400)||(19978526-19978854)
chr8 (72-220)||(22046932-22047080)
chr8 (76-217)||(15533943-15534084)
chr8 (75-388)||(22164098-22164411)
chr8 (76-388)||(22120080-22120392)
chr8 (72-388)||(22132947-22133263)
chr8 (69-391)||(22987757-22988074)
chr8 (72-179)||(20017865-20017972)
chr8 (72-184)||(19484980-19485092)
chr8 (354-433)||(22248278-22248357)
chr8 (141-217)||(19863684-19863760)
chr8 (141-217)||(19868321-19868397)
chr8 (357-390)||(21850241-21850274)
chr8 (336-400)||(21043268-21043332)
chr8 (102-217)||(22129017-22129132)
chr8 (357-391)||(16876998-16877032)
chr8 (37-69)||(1733390-1733422)
chr8 (336-388)||(19483970-19484022)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (72-434)||(33097-33459)
scaffold0076 (234-434)||(56320-56520)
scaffold0076 (357-391)||(41067-41101)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (72-434)||(49934-50296)
scaffold0028 (72-388)||(43678-43994)
scaffold0028 (72-388)||(8998-9314)
scaffold0028 (72-220)||(15460-15608)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (72-434)||(6658-7020)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (72-434)||(51600-51962)
scaffold0067 (72-434)||(60634-60996)
scaffold0067 (72-434)||(67022-67384)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (72-434)||(118092-118454)
scaffold0004 (72-422)||(323228-323578)
scaffold0004 (72-434)||(202888-203250)
scaffold0004 (72-273)||(386343-386544)
scaffold0004 (69-298)||(112542-112771)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (72-434)||(27365036-27365398)
chr2 (72-434)||(19652009-19652371)
chr2 (72-433)||(24641866-24642227)
chr2 (225-433)||(27210130-27210338)
chr2 (72-434)||(23276900-23277262)
chr2 (72-434)||(24948713-24949075)
chr2 (72-424)||(12574477-12574829)
chr2 (72-433)||(1063875-1064236)
chr2 (72-433)||(20828383-20828744)
chr2 (72-433)||(20833109-20833470)
chr2 (72-420)||(21125130-21125476)
chr2 (72-424)||(27787865-27788217)
chr2 (72-433)||(31830782-31831143)
chr2 (72-304)||(23294082-23294314)
chr2 (120-434)||(23110907-23111221)
chr2 (72-433)||(11357832-11358193)
chr2 (72-400)||(24675613-24675941)
chr2 (75-388)||(27371396-27371709)
chr2 (72-388)||(9610260-9610576)
chr2 (72-400)||(21325257-21325585)
chr2 (72-388)||(27218140-27218456)
chr2 (72-388)||(16923013-16923329)
chr2 (72-388)||(16982276-16982592)
chr2 (72-388)||(17063841-17064157)
chr2 (72-388)||(17067499-17067815)
chr2 (72-388)||(22324859-22325175)
chr2 (72-388)||(24707485-24707801)
chr2 (135-400)||(23107721-23107986)
chr2 (75-388)||(24262497-24262810)
chr2 (72-388)||(10868974-10869290)
chr2 (72-388)||(16925484-16925800)
chr2 (72-388)||(16999124-16999440)
chr2 (72-400)||(22756456-22756784)
chr2 (72-298)||(23064201-23064427)
chr2 (75-388)||(21145044-21145357)
chr2 (72-385)||(41608391-41608704)
chr2 (72-388)||(24876752-24877068)
chr2 (328-434)||(23294315-23294421)
chr2 (72-220)||(24710157-24710305)
chr2 (72-220)||(44385740-44385888)
chr2 (74-220)||(20442684-20442830)
chr2 (72-220)||(23189131-23189279)
chr2 (81-434)||(45529644-45529997)
chr2 (72-271)||(30211037-30211236)
chr2 (212-433)||(24819644-24819865)
chr2 (68-201)||(24825472-24825605)
chr2 (234-400)||(21890709-21890875)
chr2 (357-388)||(22276687-22276718)
chr2 (329-388)||(24710415-24710474)
chr2 (333-388)||(44385572-44385627)
chr2 (357-390)||(12640234-12640267)
chr2 (93-246)||(25128792-25128945)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (74-434)||(14285780-14286140)
chr7 (75-434)||(13666023-13666382)
chr7 (72-434)||(6413994-6414356)
chr7 (72-433)||(13021840-13022201)
chr7 (72-433)||(19147694-19148055)
chr7 (72-433)||(20747093-20747454)
chr7 (72-433)||(15102008-15102369)
chr7 (69-433)||(11305668-11306032)
chr7 (72-424)||(18053367-18053719)
chr7 (72-434)||(14130356-14130718)
chr7 (72-434)||(23505274-23505636)
chr7 (72-434)||(14434174-14434536)
chr7 (72-433)||(14263649-14264010)
chr7 (72-433)||(49152784-49153145)
chr7 (75-433)||(16071699-16072057)
chr7 (204-434)||(19613290-19613520)
chr7 (72-433)||(16949876-16950237)
chr7 (72-434)||(11387832-11388194)
chr7 (69-434)||(15340911-15341276)
chr7 (72-434)||(12206204-12206566)
chr7 (68-391)||(15625030-15625353)
chr7 (72-433)||(8211533-8211894)
chr7 (70-433)||(812-1175)
chr7 (72-433)||(12456185-12456546)
chr7 (72-433)||(13968073-13968434)
chr7 (70-424)||(11771677-11772031)
chr7 (72-433)||(26118010-26118371)
chr7 (72-388)||(12687983-12688299)
chr7 (249-434)||(12457300-12457485)
chr7 (72-388)||(9596539-9596855)
chr7 (72-388)||(18551230-18551546)
chr7 (72-388)||(8199110-8199426)
chr7 (72-388)||(44790823-44791139)
chr7 (72-399)||(14040178-14040504)
chr7 (72-399)||(14350208-14350534)
chr7 (72-388)||(11236685-11237001)
chr7 (72-388)||(8708087-8708403)
chr7 (72-388)||(10871477-10871793)
chr7 (72-388)||(11552574-11552890)
chr7 (72-388)||(13686546-13686862)
chr7 (72-388)||(14332879-14333195)
chr7 (72-388)||(15160529-15160845)
chr7 (68-400)||(15154117-15154449)
chr7 (72-388)||(18178224-18178540)
chr7 (76-388)||(16788-17100)
chr7 (81-415)||(21662452-21662786)
chr7 (72-245)||(14955102-14955275)
chr7 (105-388)||(23203085-23203368)
chr7 (105-388)||(23509212-23509495)
chr7 (259-391)||(321506-321638)
chr7 (81-245)||(4440419-4440583)
chr7 (72-130)||(23199451-23199509)
chr7 (357-391)||(27107243-27107277)
chr7 (72-108)||(12457262-12457298)
chr7 (33-65)||(14325743-14325775)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (72-434)||(19644-20006)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (72-433)||(27749-28110)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (72-434)||(41443-41803)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (72-434)||(21091-21453)
scaffold0235 (148-434)||(10877-11163)
[»] scaffold0298 (5 HSPs)
scaffold0298 (72-433)||(20507-20868)
scaffold0298 (72-350)||(12865-13143)
scaffold0298 (72-350)||(16635-16913)
scaffold0298 (346-434)||(11477-11565)
scaffold0298 (346-434)||(15247-15335)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (72-425)||(40262-40615)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (79-434)||(25285-25640)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (72-434)||(48627-48989)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (72-434)||(46819-47181)
scaffold0010 (72-433)||(41754-42115)
scaffold0010 (72-433)||(2445-2806)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (72-433)||(10317-10678)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (72-433)||(27048-27409)
scaffold0192 (72-250)||(26666-26844)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (74-433)||(17958-18317)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (74-433)||(3277-3636)
scaffold0035 (141-217)||(12833-12909)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (79-434)||(195124-195479)
scaffold0011 (69-433)||(149091-149455)
scaffold0011 (70-422)||(25965-26317)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (72-434)||(4872-5234)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (165-433)||(5830-6098)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (72-432)||(5757-6117)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (75-434)||(100972-101331)
scaffold0020 (74-400)||(180725-181051)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (72-434)||(944-1306)
scaffold0120 (72-388)||(6547-6863)
scaffold0120 (336-388)||(12846-12898)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (72-415)||(114704-115052)
scaffold0001 (72-273)||(90513-90714)
scaffold0001 (68-391)||(390663-390986)
scaffold0001 (133-273)||(89835-89975)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (72-430)||(6660-7019)
scaffold0149 (72-430)||(11091-11450)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (72-434)||(44029-44391)
scaffold0114 (72-434)||(45041-45403)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (75-433)||(47651-48009)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (72-434)||(6456-6818)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (148-433)||(2188-2473)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (72-433)||(51284-51645)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (93-434)||(81252-81593)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (69-425)||(12215-12570)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (174-434)||(13719-13979)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (72-434)||(11293-11655)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (215-433)||(57268-57486)
scaffold0053 (69-433)||(48455-48819)
scaffold0053 (72-130)||(57541-57599)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (72-433)||(1393-1754)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (72-433)||(4954-5315)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (72-433)||(393-754)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (72-433)||(5274-5635)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (72-433)||(570-931)
scaffold0139 (72-199)||(28043-28170)
scaffold0139 (72-199)||(34296-34423)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (69-434)||(260829-261194)
scaffold0005 (72-388)||(278296-278612)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (148-434)||(7660-7946)
scaffold0222 (72-434)||(2775-3137)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (72-414)||(31934-32276)
scaffold0106 (72-405)||(14563-14896)
scaffold0106 (72-220)||(17965-18113)
scaffold0106 (152-388)||(18321-18557)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (76-415)||(28207-28546)
scaffold0064 (76-415)||(40198-40537)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (72-433)||(2318-2679)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (72-433)||(3315-3676)
scaffold0403 (72-405)||(6896-7229)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (72-395)||(2336-2657)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (75-433)||(249140-249498)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (72-425)||(43307-43660)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (74-434)||(19375-19735)
scaffold0090 (74-434)||(23537-23897)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (72-350)||(11412-11690)
scaffold0124 (72-253)||(5-186)
scaffold0124 (346-434)||(12996-13084)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (212-434)||(528-750)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (72-434)||(24492-24853)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (72-433)||(16134-16495)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (225-434)||(5-210)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (184-433)||(14618-14867)
scaffold0261 (184-433)||(22797-23046)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (72-433)||(17883-18233)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (72-434)||(32739-33101)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (72-433)||(26785-27146)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (213-385)||(49437-49609)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (135-434)||(12081-12380)
scaffold0483 (72-155)||(9782-9865)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (68-433)||(1428-1793)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (72-400)||(19126-19454)
scaffold0081 (72-273)||(50017-50218)
scaffold0081 (135-400)||(34613-34878)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (68-415)||(25158-25505)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (74-433)||(218838-219197)
scaffold0012 (68-400)||(229563-229895)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (72-433)||(4555-4916)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (73-405)||(19451-19783)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (72-400)||(32207-32534)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (72-405)||(6573-6906)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (68-433)||(3660-4025)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (72-391)||(1991-2310)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (72-411)||(15859-16198)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (250-433)||(20096-20279)
scaffold0104 (250-433)||(22916-23099)
scaffold0104 (72-253)||(1052-1233)
scaffold0104 (153-253)||(12582-12682)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (70-387)||(3872-4189)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (70-387)||(9118-9435)
scaffold0109 (70-388)||(33039-33357)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (68-424)||(9490-9846)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (72-388)||(160-476)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (72-400)||(14884-15212)
scaffold0044 (72-388)||(1144-1460)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (209-425)||(28718-28934)
scaffold0026 (72-214)||(37726-37868)
scaffold0026 (182-400)||(29578-29797)
[»] scaffold0600 (2 HSPs)
scaffold0600 (72-246)||(4399-4573)
scaffold0600 (353-434)||(4581-4662)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (135-400)||(39465-39730)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (72-400)||(277-605)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (72-400)||(63485-63813)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (72-411)||(14522-14861)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (76-400)||(3911-4232)
scaffold0023 (72-249)||(130672-130849)
scaffold0023 (72-271)||(28963-29161)
scaffold0023 (81-207)||(59287-59413)
scaffold0023 (336-400)||(28826-28890)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (72-433)||(15401-15762)
scaffold0040 (75-388)||(112953-113266)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (72-400)||(3268-3596)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (72-272)||(13011-13211)
scaffold0293 (336-388)||(13256-13308)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (72-400)||(220-548)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (72-388)||(7921-8237)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (72-400)||(4553-4881)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (72-388)||(7463-7779)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (72-400)||(16179-16507)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (72-298)||(18761-18987)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (72-405)||(25498-25831)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (282-434)||(482-633)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (72-248)||(622-798)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (88-400)||(2914-3226)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (345-433)||(7566-7654)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (72-388)||(7890-8206)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (72-388)||(22391-22707)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (148-400)||(8541-8793)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (76-388)||(65933-66245)
scaffold0042 (72-400)||(39274-39601)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (72-246)||(68199-68373)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (102-399)||(4425-4722)
scaffold0270 (102-399)||(11555-11852)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (72-388)||(938-1254)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (69-400)||(1197-1528)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (68-391)||(116368-116691)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (72-391)||(196941-197260)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (72-400)||(6538-6866)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (72-388)||(8314-8630)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (72-391)||(5745-6064)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (72-273)||(80075-80276)
scaffold0022 (68-100)||(126953-126985)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (212-400)||(7345-7533)
scaffold0379 (68-184)||(12647-12763)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (357-433)||(20862-20938)
scaffold0077 (357-391)||(27729-27763)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (72-219)||(844-991)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (228-434)||(10228-10434)
scaffold0130 (72-166)||(10428-10522)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (72-388)||(7797-8110)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (81-415)||(5031-5364)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (72-298)||(9867-10093)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (75-199)||(4953-5077)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (148-400)||(24098-24350)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (74-400)||(1791-2117)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (72-211)||(1523-1662)
scaffold0413 (336-400)||(1681-1745)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (334-433)||(17467-17566)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (375-434)||(34015-34074)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (212-433)||(11618-11839)
scaffold0018 (212-433)||(17810-18031)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (151-434)||(85938-86213)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (357-398)||(880-921)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (236-307)||(17524-17595)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (159-246)||(71830-71917)
scaffold0021 (93-246)||(33021-33174)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (357-391)||(3338-3372)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (357-391)||(3967-4001)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (357-391)||(24203-24237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (357-407)||(3391-3441)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (357-391)||(44347-44381)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (81-246)||(182-347)
[»] scaffold1701 (1 HSPs)
scaffold1701 (33-65)||(28-60)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (72-112)||(195-235)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 20774166 - 20774528
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774166 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttg 20774265  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774266 ggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 20774365  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20774366 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcgaagtattaggtaaacttgacacaaaatccatagaa 20774465  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20774466 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 20774528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 69 - 434
Target Start/End: Original strand, 22462356 - 22462721
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22462356 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 22462455  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462456 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaactccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 22462555  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462556 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 22462655  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462656 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 22462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28894903 - 28894541
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28894903 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28894804  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894803 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28894704  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28894703 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28894604  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28894603 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28894541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28916374 - 28916012
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28916374 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28916275  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28916274 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28916175  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28916174 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28916075  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28916074 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28916012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28923729 - 28923367
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28923729 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28923630  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923629 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28923530  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28923529 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28923430  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28923429 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28923367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 20821860 - 20822222
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20821860 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcg 20821959  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20821960 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataacttatattaat 20822059  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20822060 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 20822159  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20822160 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcctctgatgt 20822222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22235881 - 22235519
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  22235881 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttg 22235782  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  22235781 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactaagctaccgaataactaatattaat 22235682  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22235681 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaaccaatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22235582  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22235581 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatgt 22235519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21890717 - 21890359
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  21890717 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 21890618  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||     
T  21890617 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgg 21890518  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21890517 aataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatagacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattttgtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 21890418  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21890417 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatg 21890359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17269294 - 17268934
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||   | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  17269294 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 17269196  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17269195 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 17269096  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17269095 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 17268996  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  17268995 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggtttctgatg 17268934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21563934 - 21563591
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21563934 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21563835  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  21563834 gatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaat 21563735  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21563734 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcgtgccctcttggagtattcggtaaacttgtcacaaaatccatggat 21563635  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21563634 atgctatcccatttccactccggcacatccaatggtgtcaacaa 21563591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24716487 - 24716126
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24716487 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24716388  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24716387 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24716288  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24716287 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24716188  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24716187 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24716126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24620256 - 24619895
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24620256 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24620157  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24620156 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24620057  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24620056 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24619957  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24619956 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24619895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 22503086 - 22503447
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  22503086 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 22503185  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22503186 gatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 22503285  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503286 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctttcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22503385  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22503386 atactgtcccacttccactccgatacatccaacggtgacaacaaccctgcaggcttctgatg 22503447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 25848482 - 25848843
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  25848482 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 25848581  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25848582 gatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctactggataactgatattgat 25848681  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||| || |  |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  25848682 aggaataaagtgtgccgacttcatcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgctctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 25848781  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25848782 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25848843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24749515 - 24749154
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24749515 tccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24749416  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24749415 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24749316  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24749315 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24749216  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24749215 ataatgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24749154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14886952 - 14886591
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  14886952 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 14886853  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14886852 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 14886753  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  14886752 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 14886653  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14886652 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14886591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21831720 - 21831360
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |     
T  21831720 cgactgaccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcga 21831621  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| |  |||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || |    
T  21831620 tctctatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgattg 21831521  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||    
T  21831520 gaataaagtgcgccgacttcgacaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaatcttgttacaaaatccatgcatat 21831421  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  21831420 gctatctcattttcactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagtaggcttctgatgt 21831360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 20342689 - 20343051
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20342689 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20342788  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20342789 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 20342888  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20342889 aggaatgaagtgtgccgacttcctcaaccggtcgacaacgacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20342988  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20342989 atactgtcccacttccactccggtacgtccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20343051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24798361 - 24797997
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  24798361 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24798262  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24798261 tcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 24798162  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||||     
T  24798161 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatg 24798062  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24798061 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24797997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23080050 - 23079688
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  23080050 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 23079951  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      || ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23079950 aatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 23079851  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
       |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23079850 atgaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 23079751  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23079750 atattgtccgacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23079688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 373
Target Start/End: Original strand, 22381606 - 22381907
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22381606 tccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22381705  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22381706 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaacataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22381805  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22381806 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctatcaaccagaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 22381905  T
Q  372 at 373  Q
    ||    
T  22381906 at 22381907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 19770385 - 19770701
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19770385 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19770484  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19770485 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19770584  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  19770585 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 19770684  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  19770685 atactatcccatttcca 19770701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27668451 - 27668135
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27668451 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27668352  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27668351 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27668252  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27668251 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27668152  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27668151 atactatcccatttcca 27668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 391
Target Start/End: Original strand, 25423619 - 25423933
Alignment:
Q  77 ctgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25423619 ctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatct 25423718  T
Q  177 ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaa 276  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||| ||    
T  25423719 ctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaatcggaa 25423818  T
Q  277 tgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgct 376  Q
      || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  25423819 gaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatact 25423918  T
Q  377 atcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||    
T  25423919 atcccatttccactc 25423933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 23471654 - 23472015
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  23471654 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 23471753  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  23471754 gatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaatattgcgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatattaat 23471853  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23471854 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacacaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23471953  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  23471954 atgctatcccatttccactatggtatatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 23472015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14999700 - 14999384
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14999700 tccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14999601  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14999600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 14999501  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14999500 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14999401  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  14999400 atactatcccatttcca 14999384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 34566919 - 34567235
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  34566919 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 34567018  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  34567019 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 34567118  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  34567119 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 34567218  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  34567219 atactatcccatttcca 34567235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 37291457 - 37291141
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  37291457 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 37291358  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  37291357 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 37291258  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||     
T  37291257 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 37291158  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  37291157 atactatcccatttcca 37291141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20468060 - 20467739
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20468060 ctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 20467961  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20467960 tcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgtcaactgagatacaggacaactgatatt 20467861  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20467860 aatcggaatgaa-tgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatg 20467762  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  20467761 gatatactatcccatttccactc 20467739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 16356927 - 16357243
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16356927 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16357026  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16357027 gatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16357126  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16357127 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16357226  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16357227 atactatcccatttcca 16357243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22332848 - 22332520
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22332848 tccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22332749  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22332748 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22332649  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22332648 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22332549  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22332548 atactatcccacttccattccggcacatc 22332520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 22348848 - 22349164
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22348848 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22348947  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22348948 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22349047  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||  || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22349048 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataaccctaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22349147  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  22349148 atactatcccatttcca 22349164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 27610779 - 27611095
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27610779 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27610878  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27610879 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27610978  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27610979 aggtagaaaatgagctgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27611078  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27611079 atactatcccatttcca 27611095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27685361 - 27685045
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27685361 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27685262  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27685261 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27685162  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27685161 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27685062  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27685061 atactatcccatttcca 27685045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 40709205 - 40709521
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40709205 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40709304  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  40709305 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 40709404  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  40709405 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40709504  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  40709505 atactatcccatttcca 40709521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21339247 - 21339046
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  21339247 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 21339148  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21339147 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 21339048  T
Q  272 cg 273  Q
    ||    
T  21339047 cg 21339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 37543218 - 37542981
Alignment:
Q  196 acggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgt 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  37543218 acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgactttgt 37543119  T
Q  296 caacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggt 395  Q
    ||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||    
T  37543118 caaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagataatgtcccacttccactctggt 37543019  T
Q  396 acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37543018 acatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37542981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 41771267 - 41771583
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41771267 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41771366  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||    
T  41771367 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatactaat 41771466  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41771467 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41771566  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  41771567 atactatcccatttcca 41771583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 27518832 - 27519148
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27518832 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27518931  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27518932 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27519031  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27519032 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27519131  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27519132 atactatcccatttcca 27519148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29476034 - 29475718
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||| |  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29476034 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29475935  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | || ||| || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  29475934 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttaatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 29475835  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29475834 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29475735  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  29475734 atactatcccatttcca 29475718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 22135093 - 22135409
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22135093 tccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22135192  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  22135193 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 22135292  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22135293 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22135392  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  22135393 atactatcccatttcca 22135409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 23574167 - 23574490
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  23574167 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 23574266  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  23574267 gatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctgccaactgggcaaccggaaaactaatattaat 23574366  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||     || || |  |||||  | |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23574367 cggtagaaaatgagccgacttcgtca-----tcaacaatcacccaatttgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23574461  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23574462 atactatcccatttccactctggcacatc 23574490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21497997 - 21497772
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||| || |||||||||  |||||||| ||||    
T  21497997 tccggctgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttg 21497898  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21497897 gatctctatctgacacaatgctcga-agaacaccatgcaacttcacaatatcatgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21497799  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  21497798 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 21497772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 267
Target Start/End: Original strand, 21496569 - 21496760
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||   ||| ||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21496569 actgaccatctatttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatc 21496668  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21496669 tctatccgacacaatacttgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatatccgccaactgagctaccggaaaactaatat 21496760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26738600 - 26738360
Alignment:
Q  160 aagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggata 259  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||| ||||  || ||| |    
T  26738600 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaattgagaaacaggaaa 26738501  T
Q  260 actgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcaca 359  Q
    | ||||||||||   || ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||    
T  26738500 attgatattaattagaaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcaca 26738401  T
Q  360 aaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26738400 aaatccatggatatgctatcacatttccactctggtacatc 26738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 273
Target Start/End: Original strand, 18776198 - 18776396
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18776198 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggat 18776297  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||    
T  18776298 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgatttaaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatattaatcg 18776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 23516966 - 23517114
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||    
T  23516966 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttg 23517065  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  23517066 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaat 23517114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 418
Target Start/End: Original strand, 21407643 - 21407909
Alignment:
Q  152 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 251  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| |    
T  21407643 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagat 21407742  T
Q  252 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 351  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |   | || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| || ||||    
T  21407743 acaggaaaactgatgttaatcggaataaaatgggccgacttcgttagtgtatccacaattacccaaatcgcataatgtccttttggagtattcggaaaac 21407842  T
Q  352 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacc 418  Q
    | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||||||||    
T  21407843 tcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaaacc 21407909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Original strand, 20799185 - 20799314
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  20799185 tccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 20799284  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 201  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20799285 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 23440650 - 23440762
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  23440650 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 23440749  T
Q  172 ggtctctatctga 184  Q
    | |||||||||||    
T  23440750 gatctctatctga 23440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21680436 - 21680377
Alignment:
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21680436 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 21680377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37545457 - 37545328
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||| || |||| || || ||||| ||||| |    
T  37545457 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcg 37545358  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 201  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||    
T  37545357 gatctctatccgacacaatgctagacggaa 37545328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 922
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||    
T  989 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttg 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 23440899 - 23440963
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23440899 ggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23440963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26738666 - 26738611
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  26738666 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacc 26738611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 400
Target Start/End: Original strand, 20799999 - 20800201
Alignment:
Q  198 ggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtca 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| | || ||||||||||  |  || || |||||||| ||||    
T  20799999 ggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaacctaatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtca 20800098  T
Q  298 acctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtac 397  Q
    | || || |  | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  20800099 atctatcaataataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggtaaacgcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcac 20800198  T
Q  398 atc 400  Q
    |||    
T  20800199 atc 20800201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21338993 - 21338942
Alignment:
Q  337 gagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21338993 gagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttcca 21338942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 391
Target Start/End: Original strand, 23517215 - 23517270
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23517215 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 23517270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21936864 - 21936830
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21936864 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 21936830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Original strand, 24581902 - 24581936
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24581902 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24581936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 69 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 654
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  1019 ctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaact 920  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  919 ttgggtctctatttgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgctaactgagctactggataactgatatt 820  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  819 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 720  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  719 gaaatgttatcccatttccactctggtacttccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 69 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20856615 - 20856250
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20856615 ctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 20856516  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856515 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 20856416  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856415 aatcagaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 20856316  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856315 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 20856250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20835739 - 20835377
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||| | ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20835739 tccgattgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 20835640  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20835639 gatccctatccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 20835540  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20835539 cggaataaaatgcgtcgactttgtcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20835440  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20835439 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22432967 - 22432605
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || ||  |||| ||||| |    
T  22432967 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcg 22432868  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22432867 gatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattttctgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22432768  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432767 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22432668  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22432667 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22432605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19662992 - 19662626
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19662992 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19662893  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19662892 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19662793  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||    
T  19662792 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccacatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccataaaa 19662693  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggt----acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19662692 atgctataccacttccactccggccggcacatccaacggtgtcaacaactctgcaggcttctgatgt 19662626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20939914 - 20939552
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20939914 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20939815  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20939814 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcattatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccgaataattgatattaat 20939715  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20939714 cgaaataaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagcgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20939615  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20939614 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20939552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 19854821 - 19855174
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  19854821 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 19854920  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19854921 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcaccatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 19855020  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||||||||        |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19855021 cggaataaagtgcgccgactt--------tgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19855112  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  19855113 atgctatcccacttccactctggcacatccaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 19855174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 31539848 - 31539487
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31539848 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31539749  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31539748 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 31539649  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||     
T  31539648 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagag 31539549  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31539548 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31539487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24099454 - 24099093
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24099454 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24099355  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24099354 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattgat 24099255  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24099254 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatagcatcatgccctctcgtagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 24099155  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24099154 atactgtcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24099093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 37677588 - 37677949
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  37677588 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 37677687  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37677688 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 37677787  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  37677788 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactagttacaaaatccatagag 37677887  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37677888 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37677949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 20294920 - 20295281
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||| |||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20294920 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20295019  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  20295020 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgagtaactgatattaat 20295119  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || | |||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  20295120 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaataacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 20295219  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20295220 ataatgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20295281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 21749449 - 21749777
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21749449 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21749548  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21749549 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21749648  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  21749649 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 21749748  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21749749 atactatcccatttccactctggcacatc 21749777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 50620099 - 50619767
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  50620099 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 50620000  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    ||| || ||||| ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  50619999 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatttcacaatatcacaaatataaatctctgccaactgagaaacaagaaaactgatat 50619900  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    ||||||  ||||| || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  50619899 taatcgggatgaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 50619800  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50619799 ggatatactatcccatttccactctggtacatc 50619767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16350450 - 16350134
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16350450 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16350351  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  16350350 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 16350251  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  16350250 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16350151  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16350150 atactatcccatttcca 16350134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22362095 - 22361767
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || |  ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22362095 tccgactgaccatatgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22361996  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |   || ||| |||| ||||||||    
T  22361995 ggtctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctccgccaactaataaacaggaaaactaatattaat 22361896  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22361895 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22361796  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22361795 atactatcccatttccactctggcacatc 22361767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 51333344 - 51333028
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51333344 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 51333245  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  51333244 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 51333145  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  51333144 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 51333045  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  51333044 atactatcccatttcca 51333028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 21837458 - 21837774
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21837458 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21837557  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  21837558 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 21837657  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21837658 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctgggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21837757  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  21837758 atactatcccatttcca 21837774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33390880 - 33390564
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  33390880 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 33390781  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  33390780 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 33390681  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  33390680 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 33390581  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  33390580 atactatcccatttcca 33390564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 21830811 - 21831127
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21830811 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21830910  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  21830911 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 21831010  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21831011 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 21831110  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  21831111 atactatcccatttcca 21831127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17044866 - 17044550
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  17044866 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 17044767  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||    
T  17044766 gatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacaggaaaactaatattaat 17044667  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17044666 cggtagaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17044567  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  17044566 atactatcccatttcca 17044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Original strand, 16369805 - 16370031
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  | || ||  | ||||| ||||   |||||||||| |||||||| || |    
T  16369805 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcg 16369904  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16369905 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagctataggaaaactgatattaat 16370004  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  16370005 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 16370031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 19106875 - 19107023
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||    
T  19106875 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattg 19106974  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19106975 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19107023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 391
Target Start/End: Original strand, 20139401 - 20139657
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 234  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  20139401 tcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcccaaatgtaaa 20139500  T
Q  235 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 334  Q
    | || |||||| |||  || ||  |||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  20139501 tttctgccaaccgagaaacagggaaactaatattaatcggaagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgtgtcattccctct 20139600  T
Q  335 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20139601 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 20139657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19760721 - 19760389
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| || ||||||    
T  19760721 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaac 19760622  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    || || | |||||| || || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||     ||||| |||||||| |||| || |||  || |||||||||    
T  19760621 ctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcagatgtaaatctccgctaactaagatacatgaaaactgatat 19760522  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| || |  ||||  ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19760521 taatcgaaattaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatagcgtcatttcctttcggagtactcggcaaacttgtcacaaaatccat 19760422  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19760421 ggatatactatctcatttccactctggcacatc 19760389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 333 - 433
Target Start/End: Original strand, 21951678 - 21951778
Alignment:
Q  333 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 432  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21951678 ctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 21951777  T
Q  433 g 433  Q
    |    
T  21951778 g 21951778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 400
Target Start/End: Original strand, 20250379 - 20250638
Alignment:
Q  141 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccg 240  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||   |||| || ||||| |    
T  20250379 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgccaattcacaatatcacgaatataaatctctg 20250478  T
Q  241 ccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 340  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||    
T  20250479 ccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtaattccctttaggagt 20250578  T
Q  341 attaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||    
T  20250579 attcggaaaactcgtcacaaaatccatgtatatactatcccatttccactctggcacatc 20250638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16078503 - 16078391
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16078503 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16078404  T
Q  172 ggtctctatctga 184  Q
    | |||||||||||    
T  16078403 gatctctatctga 16078391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41354320 - 41354208
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41354320 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41354221  T
Q  172 ggtctctatctga 184  Q
    | |||||||||||    
T  41354220 gatctctatctga 41354208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Original strand, 41308333 - 41308406
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaact 145  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||    
T  41308333 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20830958 - 20830924
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20830958 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 20830924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16078243 - 16078191
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16078243 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 16078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Original strand, 20937686 - 20937738
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20937686 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20937738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41353249 - 41353197
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41353249 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 41353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 69 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 95787 - 95422
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95787 ctttccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaacc 95688  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  95687 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctggatgtagatttccgccaactgagctactgggtaacttatatt 95588  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  95587 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacgaaatccata 95488  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  95487 gaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 95422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 434
Target Start/End: Original strand, 113087 - 113445
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| |  ||    
T  113087 actgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatc 113186  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| || ||||| |||||||| || || | | |||||||||| || | |    
T  113187 tctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatgtcccgaatataaatctctgccaactgcgccaccgtaaaactgatatttattgga 113286  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  113287 ataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatattgaatcatgtcctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatac 113386  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  113387 tatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 113445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 109593 - 109277
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  109593 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 109494  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  109493 gttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 109394  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  109393 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatcgat 109294  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  109293 atactatcccatttcca 109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 27900879 - 27901240
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  27900879 tccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccg 27900978  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27900979 ggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaat 27901078  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901079 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27901178  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27901179 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 27901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15003143 - 15002782
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  15003143 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 15003044  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||    
T  15003043 ggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaaccgagctaccggataactaacattgat 15002944  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  15002943 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 15002844  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  15002843 atgatctcccacttccgctctggcacatctaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatg 15002782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 15246417 - 15246778
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15246417 tccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15246516  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  15246517 aatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattgtgaatataaatctctgccaactgagctattggataactaatattgat 15246616  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  15246617 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 15246716  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15246717 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15246778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1649056 - 1648695
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  || ||||||| ||||| ||||| |    
T  1649056 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcg 1648957  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1648956 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaatatgatgaatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatattaat 1648857  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1648856 aggaatgaaatgtgccgacttagtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtattaggtaaactcgttacaaaatccatagaa 1648757  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1648756 atgctgtcccatttccactccagtatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 1648695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Original strand, 15078130 - 15078490
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  15078130 cgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgga 15078229  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  15078230 tctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactaagctaccggaaaactaatattgatcg 15078329  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15078330 gaataaaatgcgccgacttcatcaacctttcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaatccatggaaat 15078429  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    | | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  15078430 gttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcattaaccctgcaggcttctgatgt 15078490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 8706411 - 8706773
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8706411 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8706510  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||    
T  8706511 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgat 8706610  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8706611 tggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 8706710  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  8706711 atgctatctcatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 8706773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15358869 - 15358537
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||||| |    
T  15358869 tccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcg 15358770  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358769 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 15358670  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  15358669 tggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcagaaaatccatagaa 15358570  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaac 404  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15358569 atactgtcccatttccactccggcacatccaac 15358537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 432
Target Start/End: Original strand, 15319644 - 15320004
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  15319644 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 15319743  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  15319744 gatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatttccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 15319843  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  || || ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  15319844 cgggataaaatgccccgagttcgtcaacctatcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 15319943  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 432  Q
    ||| | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15319944 atgttgtcccacttccactctcgcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 15320004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3264573 - 3264212
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  3264573 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 3264474  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3264473 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 3264374  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  3264373 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 3264274  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3264273 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 3264212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 33223416 - 33223778
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  33223416 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 33223515  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  33223516 gatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 33223615  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  33223616 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 33223715  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33223716 atactgtcccacttccattccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 33223778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11207010 - 11206649
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  || | || || ||||| |||||      
T  11207010 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctca 11206911  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11206910 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtatatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 11206811  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11206810 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaatcggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11206711  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11206710 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11206649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29453316 - 29452955
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  29453316 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 29453217  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29453216 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatgttaat 29453117  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  29453116 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 29453017  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29453016 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 29452955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 434
Target Start/End: Original strand, 14691391 - 14691757
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14691391 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14691490  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  14691491 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaatctccaccaactgaggtacaggaaaactgatat 14691590  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14691591 tactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 14691690  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  14691691 ggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 14691757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 20891475 - 20891836
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20891475 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20891574  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20891575 gatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 20891674  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  20891675 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacgaaatccatagag 20891774  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20891775 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20891836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 44661643 - 44661284
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||     
T  44661643 cgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcgga 44661544  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || |    
T  44661543 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattgatag 44661444  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44661443 gaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagat 44661344  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  44661343 actatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 44661284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15414805 - 15414443
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15414805 tccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15414706  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||  || || | | |||| ||||||||    
T  15414705 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactatgccaccgaaaaactaatattaat 15414606  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| || |||||||| || || || || || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15414605 cggaataaagtgtgctgacttcgttaatctatcaacaaccagccatatggcatcatgccctctcgaagtattcagtaaacttgttacaaagtccatggat 15414506  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| ||| || |||||| ||||||||    
T  15414505 atgctatcccatttccactctggcacatctaatggtttcagcaacccagcaggcttctgatgt 15414443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14850889 - 14850524
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14850889 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14850790  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||  || ||| |||| ||||    
T  14850789 ctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaattcccgccaactgagaaacaggaaaactcatat 14850690  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  || ||||||| || |||||  ||||||||| |||    
T  14850689 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttctgagtattcggaaaactcatcacaaaatacat 14850590  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  14850589 ggatatgttatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 14850524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16251961 - 16251648
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16251961 gactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16251862  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  16251861 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 16251762  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||     
T  16251761 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgaatata 16251662  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  16251661 ctatcccatttcca 16251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8053142 - 8052826
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8053142 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8053043  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| || ||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8053042 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaactgggcaacagggaaactaatattaat 8052943  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || ||||||||||||||||| || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8052942 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8052843  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  8052842 atactatcccatttcca 8052826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 8386905 - 8387221
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8386905 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8387004  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8387005 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8387104  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8387105 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8387204  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  8387205 atactatcccatttcca 8387221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 12477093 - 12477409
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12477093 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12477192  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  12477193 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 12477292  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12477293 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12477392  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  12477393 atactatcccatttcca 12477409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 14681060 - 14681376
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14681060 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14681159  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  14681160 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 14681259  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14681260 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14681359  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||| ||||||    
T  14681360 atactatcccttttcca 14681376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 27711829 - 27712145
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27711829 tccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27711928  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27711929 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27712028  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27712029 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27712128  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27712129 atactatcccatttcca 27712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29038923 - 29038607
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29038923 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29038824  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29038823 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29038724  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29038723 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 29038624  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  29038623 atactatcccatttcca 29038607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1639948 - 1639620
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  1639948 tctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 1639849  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 266  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  1639848 cttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcggatataaatctctgtcaactgagctacgggaaaactgata 1639750  T
Q  267 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 366  Q
    ||||||| ||  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1639749 ttaatcggaagaaaatgagccgtcttcgtcaatctatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatcca 1639650  T
Q  367 tagaaatgctatcccatttccactccggta 396  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1639649 tggatatgctatcccacttccactctggta 1639620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 7090925 - 7091253
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| || ||||||| ||||||||  |||    
T  7090925 tccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttg 7091024  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||    
T  7091025 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcgaatatagatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaa 7091123  T
Q  271 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 370  Q
    ||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||  ||||  |||| |||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  7091124 tcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccctaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaacttgtcacaaaatccatgga 7091223  T
Q  371 aatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7091224 tatactatcccatttccactctggcacatc 7091253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 12524169 - 12524485
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  12524169 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 12524268  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12524269 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgctaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12524368  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12524369 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12524468  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  12524469 atactatcccatttcca 12524485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15147403 - 15147076
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  15147403 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 15147304  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  15147303 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctaccaactaggcaataggaaaactgatattaat 15147204  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  15147203 cg-tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 15147105  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15147104 atactatcccatttccactctggcacatc 15147076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 40473533 - 40473849
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40473533 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40473632  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||  |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  40473633 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctttgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 40473732  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  40473733 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40473832  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  40473833 atactatcccatttcca 40473849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 18297698 - 18298014
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18297698 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttg 18297797  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18297798 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18297897  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||     
T  18297898 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaattcatggat 18297997  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  18297998 atactatcccatttcca 18298014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19778312 - 19777996
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19778312 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19778213  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19778212 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19778113  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19778112 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19778013  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  19778012 atactatcccatttcca 19777996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 23956240 - 23956556
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23956240 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23956339  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  23956340 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 23956439  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23956440 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 23956539  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  23956540 atactatcccatttcca 23956556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14303497 - 14303181
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14303497 tccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14303398  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14303397 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 14303298  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14303297 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14303198  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  14303197 atactatcccatttcca 14303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16354964 - 16354631
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16354964 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16354865  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16354864 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16354765  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16354764 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16354665  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16354664 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 16354631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18226962 - 18226649
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18226962 gactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggat 18226863  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||     
T  18226862 ctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaatcgg 18226763  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18226762 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 18226663  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  18226662 ctatcccatttcca 18226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 396
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160287
Alignment:
Q  79 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 178  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  179 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 278  Q
     ||| | || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || || ||||||||||  || ||| |||| |||||||| | || |    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatttctgccaactgagacacaggaaaactaatattaattggaagg 14160169  T
Q  279 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 378  Q
    || || |||||||| ||||  || |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  14160170 aaatgagccgacttagtcagtctatagacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatgctat 14160269  T
Q  379 cccatttccactccggta 396  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14160270 cccatttccactctggta 14160287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18549770 - 18549694
Alignment:
Q  141 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 217  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18549770 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15292652 - 15292618
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15292652 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 15292618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 112
Target Start/End: Original strand, 16146409 - 16146447
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16146409 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaa 16146447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68255
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcgg 68096  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68097 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaagtccatagaaatg 68196  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  68197 ttgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcctctgatg 68255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4373
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  4735 tccgactgaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcg 4636  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4635 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaatattatgaatataaatctccgccaactgagccaccggataactaatattaat 4536  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4535 cggaataaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4436  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  4435 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttttgatgt 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13322
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  13683 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctct 13584  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13583 gattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgactataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13484  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13483 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttgttacaaaatccatagaa 13384  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  13383 atattgtcccacttccactccggcacatctaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 15459693 - 15460055
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15459693 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 15459792  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15459793 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctctgccagctgagctactggataacttatattaat 15459892  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15459893 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 15459992  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15459993 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 15460055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34645510 - 34645148
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34645510 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttg 34645411  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||| ||||| || || || ||| |||||||||| ||    
T  34645410 gatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctctgccaattgcgccaccggaaaactgatatttat 34645311  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34645310 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 34645211  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34645210 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 34645148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21564056 - 21563694
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21564056 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21563957  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21563956 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctacctgataactgatattgat 21563857  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21563856 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21563757  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21563756 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21563694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21569915 - 21569553
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21569915 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21569816  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21569815 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctaccagataactgatattgat 21569716  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21569715 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21569616  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21569615 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21569553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 25768548 - 25768909
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  25768548 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcg 25768647  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  25768648 gatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattataaatgtaaatctccgccaactgagctactggaaaactaatattgat 25768747  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | || || |||||||| || | |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  25768748 cgaaataaaatgcgccgacttcgtcaacgtatcgacgacaacccaaatggcatcatgtcccctcgaagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 25768847  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25768848 atactgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25768909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 19453777 - 19454139
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19453777 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19453876  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19453877 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19453976  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453977 cggaataaagtgcgctgactttgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19454076  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19454077 atgatatcccaattccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacttctgatgt 19454139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 76 - 434
Target Start/End: Original strand, 21471962 - 21472320
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21471962 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatc 21472061  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||      
T  21472062 tctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaataatatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggg 21472161  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |    
T  21472162 ataaaatgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcgcaaaattcatggagatac 21472261  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21472262 tgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 21472320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8762857 - 8762496
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  8762857 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 8762758  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  8762757 gatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaatatcatgaatatagatctccgccaactgagctaccggataattgatatcaat 8762658  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8762657 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctctgagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatataa 8762558  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8762557 atgtcgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 8762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14381391 - 14381029
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14381391 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14381292  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  14381291 gatctctattcgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctcccccaactgagctaccaggtaactaatattaat 14381192  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381191 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 14381092  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381091 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcctctgatgt 14381029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5297130 - 5296769
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  5297130 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 5297031  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  5297030 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctacccgataattgatgttaat 5296931  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5296930 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactagtcacaaaatccatagaa 5296831  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5296830 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5296769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 411
Target Start/End: Original strand, 17415845 - 17416182
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  17415845 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgga 17415944  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17415945 tccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 17416044  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17416045 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgactactacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaat 17416144  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 411  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17416145 gttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtca 17416182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27560541 - 27560179
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27560541 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27560442  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  27560441 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 27560342  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27560341 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27560242  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27560241 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 27560179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22796556 - 22796195
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  22796556 tccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 22796457  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  22796456 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactaataatgat 22796357  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |     
T  22796356 cggaataaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatgtat 22796257  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | | ||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22796256 atgttgttccacttccactttggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 18795047 - 18795408
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| ||||   |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  18795047 tccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcg 18795146  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |   | || || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  18795147 gatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaatgtcacggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactgatatttat 18795246  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18795247 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaaattgtcacaaaatccatagaa 18795346  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  18795347 atgttgtcccacttccactctggaacatctaatggtatcaacaaccctgcaggcttctgatg 18795408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 28282737 - 28282385
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  28282737 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 28282638  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  28282637 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 28282538  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28282537 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28282438  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28282437 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 28282385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 434
Target Start/End: Original strand, 19879658 - 19880017
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  19879658 gactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 19879757  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |   || || |||||||||||||| || |  ||| |||||||||| ||||     
T  19879758 ctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccagatataaatctccgccaactgcgccatcggaaaactgatatttatcgg 19879857  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19879858 aataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatattgaatcatatcccctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatg 19879957  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19879958 ctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19880017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10468773 - 10468411
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| || || || ||||| |    
T  10468773 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcg 10468674  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10468673 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatattatggacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 10468574  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  10468573 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaattgcttcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatctatagag 10468474  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10468473 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 10468411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 24364769 - 24365130
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24364769 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24364868  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| ||    
T  24364869 gatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctgccggataattgatattgat 24364968  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  24364969 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagat 24365068  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24365069 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24365130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1543008 - 1542692
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1543008 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1542909  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1542908 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 1542809  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||  | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1542808 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatatttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 1542709  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  1542708 atactatcccatttcca 1542692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18407866 - 18407538
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18407866 tccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttg 18407767  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  18407766 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaacagagaaacaggaaaactgatattaat 18407667  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18407666 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 18407567  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  18407566 atactatcccatttccactctggcacatc 18407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24313092 - 24312776
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24313092 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24312993  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  24312992 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactgatattaat 24312893  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24312892 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24312793  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  24312792 atactatcccatttcca 24312776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5839143 - 5838810
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  5839143 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 5839044  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  |||||||||  || ||| |||| ||||| ||    
T  5839043 gatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgatataaatctctaccaactgagaaacaggaaaactaatatttat 5838944  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||||||||| || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  5838943 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactagtcacaaaatccatggat 5838844  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5838843 atactatcccatttccattccggcacatctaacg 5838810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 400
Target Start/End: Original strand, 15896447 - 15896779
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||    
T  15896447 tctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatac 15896546  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15896547 ctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatat 15896646  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||     ||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15896647 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaataacgccattccctttcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccat 15896746  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     || || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15896747 ggatatactatcccatttccactttggtacatc 15896779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 19865044 - 19865372
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19865044 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19865143  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  19865144 gatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacacgaaaactgatattaat 19865243  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19865244 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19865343  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19865344 atactatcccatttccactctggcacatc 19865372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28263121 - 28262790
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28263121 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28263022  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28263021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28262922  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28262921 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28262822  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 403  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28262821 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28262790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28341870 - 28341539
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28341870 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28341771  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28341770 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28341671  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28341670 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28341571  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 403  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28341570 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28341539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16626641 - 16626325
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16626641 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16626542  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16626541 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 16626442  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16626441 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16626342  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16626341 atactatcccatttcca 16626325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29591844 - 29591528
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29591844 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29591745  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29591744 gatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29591645  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  29591644 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29591545  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  29591544 atactatcccatttcca 29591528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20637162 - 20636909
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 234  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  20637162 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataga 20637063  T
Q  235 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 334  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  20637062 tctctgccaactgagaaacaggataactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 20636963  T
Q  335 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20636962 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20636909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2874727 - 2874411
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  2874727 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2874628  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||  |||| ||||||||    
T  2874627 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacagggaaactaatattaat 2874528  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  2874527 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 2874428  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  2874427 atactatcccatttcca 2874411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22762379 - 22762051
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22762379 tccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22762280  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  22762279 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 22762180  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |  ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22762179 cataagaaaatgagccgacttagtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22762080  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22762079 atactatcccatttccactctggcacatc 22762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28292292 - 28291965
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28292292 actgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 28292193  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |      
T  28292192 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggt 28292093  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  28292092 aggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatac 28291993  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatccaa 403  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28291992 tatcccatttccattccggcacatccaa 28291965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27392090 - 27391769
Alignment:
Q  79 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 178  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27392090 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27391991  T
Q  179 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 278  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27391990 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27391891  T
Q  279 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 378  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27391890 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatttggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27391791  T
Q  379 cccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27391790 cccatttctactctggcacatc 27391769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 25112909 - 25113237
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25112909 tccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25113008  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  25113009 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 25113108  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  25113109 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 25113208  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  25113209 atactatcccatttccattctggtacatc 25113237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27331350 - 27331029
Alignment:
Q  79 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 178  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27331350 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27331251  T
Q  179 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 278  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27331250 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27331151  T
Q  279 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 378  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27331150 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatagggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27331051  T
Q  379 cccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27331050 cccatttctactctggcacatc 27331029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22078614 - 22078286
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || || ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22078614 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22078515  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||||||| | ||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  22078514 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatatctcgaatatagatctctgtcaactgagaaacaggaaaactgatattaac 22078415  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || ||||||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || |||||  ||||||||||||  ||     
T  22078414 cggaagaaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccacggat 22078315  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22078314 atactatcccacttccactctggcacatc 22078286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25609788 - 25609469
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  25609788 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 25609689  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    |||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||| || |  | ||  || ||||| ||||| ||||  || ||| |||||||| |    
T  25609688 ttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcacgatctctttaacataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactgatact 25609589  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||     
T  25609588 aatcgccagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtaatcggcaaactcgtcacgaaatccatg 25609489  T
Q  369 gaaatgctatcccatttcca 388  Q
    || || ||||||||||||||    
T  25609488 gatatactatcccatttcca 25609469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16927564 - 16927236
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16927564 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16927465  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| |  | ||| || | ||| |||||||  || || ||| ||||||| |||||    
T  16927464 ggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctctttaatataaacctctgccaactatgcaacaggaaaactgatgttaat 16927365  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16927364 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16927265  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16927264 atactatcccatttccactctggcacatc 16927236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 23078826 - 23079154
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||    |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  23078826 tccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttg 23078925  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  23078926 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatctcgaatataaatttccgccaactgagacacatgaaaactgatattaat 23079025  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| | |  | ||||||||    ||||| |||||||||||||| ||     
T  23079026 cggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattcactttaggagtattctaaaaactcgtcacaaaatccatggat 23079125  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23079126 atactatctcatttccactctggtacatc 23079154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 27187793 - 27188109
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27187793 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27187892  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27187893 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27187992  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27187993 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27188092  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27188093 atactatcccatttcca 27188109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27261447 - 27261131
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27261447 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27261348  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27261347 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27261248  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27261247 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27261148  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27261147 atactatcccatttcca 27261131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 391
Target Start/End: Original strand, 22434226 - 22434545
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||    
T  22434226 tccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttg 22434325  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22434326 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22434425  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22434426 cagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22434525  T
Q  372 atgctatcccatttccactc 391  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22434526 atactatcccatttccactc 22434545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11280426 - 11280161
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  11280426 gactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 11280327  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||  ||||||||||||||||| | | | || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||| ||||     
T  11280326 ctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcccggatataaatctctgccaactgtgccaccggaaaactgatatttatcgg 11280227  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 340  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |  || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11280226 aataaagtgcgccaacttcgtcaatccatcgactacaaccaatattgaatcatgtcccctcggagt 11280161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 208
Target Start/End: Original strand, 17032737 - 17032876
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  17032737 ctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 17032836  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatg 208  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  17032837 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18197589 - 18197291
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 234  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |    
T  18197589 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaa 18197490  T
Q  235 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 334  Q
    |||| || ||||||| |||   | ||||||| ||||||| |||||| ||  | |||||||||||  | || || |  ||||| || |  || | |||  |    
T  18197489 tctctgctaactgagatacaaaaaaactgatgttaatcggaatgaaatgatctgacttcgtcaatttatccacaatcacccaaatagcgtcgttcccttt 18197390  T
Q  335 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  18197389 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcatatgctatcccatttccactctggtatatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 18197291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 1641129 - 1641212
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  1641129 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16963291 - 16963148
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16963291 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16963192  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttc 215  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16963191 ggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttc 16963148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 434
Target Start/End: Original strand, 19435653 - 19435721
Alignment:
Q  366 atagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19435653 atagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19435721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 391
Target Start/End: Original strand, 22442711 - 22442943
Alignment:
Q  159 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggat 258  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || |||     
T  22442711 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaa 22442810  T
Q  259 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 358  Q
    ||||||||||||||   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  22442811 aactgatattaatcagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcac 22442910  T
Q  359 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22442911 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 22442943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27559912 - 27559765
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27559912 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27559813  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 219  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  27559812 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21837058 - 21836973
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21837058 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21836973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1648453 - 1648419
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648453 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 1648419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18967114 - 18966984
Alignment:
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  |||||  ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |    
T  18967114 cttggatctctatctgacataatgatcgacaaaacaccatgtaccttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaagaaaactgatgt 18967015  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  18967014 taatcggaatgaaatgagccgacgtcgtcaa 18966984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 391
Target Start/End: Original strand, 23996893 - 23996924
Alignment:
Q  360 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996893 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 23996924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16382012 - 16381978
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382012 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16381978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19488893 - 19488843
Alignment:
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  19488893 ctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggc 19488843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 6708 - 7069
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  6708 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttg 6807  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808 ggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6907  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6908 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatggaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 7007  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  7008 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaactttcctgcaggcctctgatg 7069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10420052 - 10419690
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10420052 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 10419953  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10419952 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctccgccagctgagctactggataacttatattaat 10419853  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10419852 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 10419753  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10419752 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcttctgatgt 10419690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13322659 - 13322298
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||      
T  13322659 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctca 13322560  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13322559 gatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctaccggataactgatattaat 13322460  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13322459 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13322360  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  13322359 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacctccgatg 13322298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 14086795 - 14087157
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14086795 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14086894  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  14086895 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 14086994  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14086995 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14087094  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  14087095 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 14087157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13972127 - 13971765
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  13972127 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 13972028  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  13972027 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 13971928  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971927 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 13971828  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13971827 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13971765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 17492752 - 17493114
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  17492752 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 17492851  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| || || | || | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17492852 gatctctatccgaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataattgatattaat 17492951  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| || || || | ||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17492952 tggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcgacaataacccatatggcatcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 17493051  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17493052 atgctatcccacttcaactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 17493114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18134353 - 18133991
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||    || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  18134353 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 18134254  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18134253 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtaaccttacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 18134154  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18134153 cggaataaagtgcgccgaattcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccattgaa 18134054  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  18134053 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctaatgt 18133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12360549 - 12360196
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  12360549 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcg 12360450  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  12360449 gatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctatcggatatttgatattaat 12360350  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12360349 cggaataaagtgcgccaactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12360250  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 425  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12360249 atgttatcccacttccactccggcacatccaactgtgtcaacaaccctgcaggc 12360196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16828209 - 16827849
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  16828209 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtgaacctcg 16828110  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16828109 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 16828010  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16828009 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcca-cacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 16827911  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16827910 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16827849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16836517 - 16836156
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  16836517 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcg 16836418  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16836417 gatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaacattatgaatgtaaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16836318  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16836317 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctcttggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 16836218  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16836217 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16836156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 13942146 - 13942508
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13942146 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13942245  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13942246 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 13942345  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13942346 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 13942445  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  13942446 atgctatcccatttccactccggtacatccaatgatgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 13942508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 14574054 - 14574406
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||    |    
T  14574054 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaat 14574153  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||         
T  14574154 ctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactg--atta----g 14574247  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14574248 aataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 14574347  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14574348 ctatcccacttccactctggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14574406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8759089 - 8758737
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  8759089 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 8758990  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  8758989 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 8758890  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8758889 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 8758790  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8758789 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 8758737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Original strand, 41177644 - 41177996
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  41177644 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 41177743  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  41177744 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 41177843  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41177844 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 41177943  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41177944 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 41177996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11303780 - 11303419
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || || |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  11303780 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 11303681  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  11303680 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccagataactaatattgat 11303581  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  11303580 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacgacgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 11303481  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  11303480 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaagcttctgatg 11303419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 28754440 - 28754801
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  28754440 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 28754539  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28754540 gatctctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 28754639  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||     
T  28754640 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggggtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 28754739  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28754740 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 28754801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 47124066 - 47124427
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  47124066 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 47124165  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47124166 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 47124265  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  47124266 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgcctcctcggagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagag 47124365  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47124366 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 47124427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Original strand, 4678560 - 4678912
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  4678560 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 4678659  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| || | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4678660 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 4678759  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4678760 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4678859  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4678860 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 4678912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 44777369 - 44777731
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  44777369 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 44777468  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||||| | | || || || || || |||||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  44777469 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaacactatgtatataaatttcagccaactgagctaccggataattgatgttgat 44777568  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44777569 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccttcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 44777668  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  44777669 atgctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcgggcttctgatgt 44777731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15952975 - 15952671
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15952975 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15952876  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  15952875 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataagcaatattgat 15952776  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  15952775 cggaataaagtgtgccgacttcgtcagcctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaa 15952676  T
Q  372 atgct 376  Q
    |||||    
T  15952675 atgct 15952671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 10384091 - 10384451
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||| | |||| || || ||||| ||||| |    
T  10384091 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcg 10384190  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10384191 gatctctatccgacacaatacta-acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 10384289  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  10384290 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 10384389  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10384390 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10384451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16380935 - 16380582
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||| | |    
T  16380935 tccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcg 16380836  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16380835 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16380736  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || |||||||| | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16380735 aggaataaaatgtgccgactttgacaatctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaagcttgtcacgaaatccatagaa 16380636  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 425  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16380635 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggc 16380582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16338519 - 16338158
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16338519 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcg 16338420  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16338419 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16338320  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  16338319 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 16338220  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16338219 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtgaacaaccctgcaggcttctgatg 16338158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 387
Target Start/End: Original strand, 15227771 - 15228086
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15227771 tccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15227870  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    |||||| ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||||    
T  15227871 gatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaatatcacaaatgtaaatctctgccaactgtgccaccagaaaactaatattaat 15227970  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15227971 cggaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaacaactacccatatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaagtccatggat 15228070  T
Q  372 atgctatcccatttcc 387  Q
    ||||||||||||||||    
T  15228071 atgctatcccatttcc 15228086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 9522831 - 9523192
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9522831 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9522930  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  9522931 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactaagaaataggaaaactgatattaat 9523030  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  9523031 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgggtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 9523130  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| || ||| |||||  |||||||    
T  9523131 atactatcccatttccactctggcacatctaatggtatcatcataccagcaggtttctgatg 9523192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16329668 - 16329324
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16329668 tccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcg 16329569  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16329568 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattgat 16329469  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  16329468 aggaatgaagtgtgctgacttcgtcaaccggttgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagag 16329369  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatcc-aacggtgtcaacaa 415  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16329368 atactgtcccacttccactccggtacatcctaacggtgtcaacaa 16329324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Original strand, 12498360 - 12498693
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12498360 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12498459  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12498460 gatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12498559  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  12498560 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatagat 12498659  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12498660 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 12498693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16492199 - 16491866
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  16492199 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttg 16492100  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  16492099 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 16492000  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||  || ||| | |||||||||||||| ||     
T  16491999 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatgcggaaaaatcgtcacaaaatccatggat 16491900  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16491899 atattatcccatttccactctggcacatctaacg 16491866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 10005712 - 10006028
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10005712 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10005811  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10005812 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10005911  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10005912 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10006011  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  10006012 atactatcccatttcca 10006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 17489962 - 17490290
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17489962 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17490061  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  17490062 gatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatatagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 17490161  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| || |  |||| |||  |  ||||||| || ||||| | |||||||||||| ||     
T  17490162 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaattgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgacacaaaatccatggat 17490261  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  17490262 atgctatctcatttccactctggcacatc 17490290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Original strand, 6600848 - 6601179
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6600848 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6600947  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6600948 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6601047  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  6601048 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccatcgat 6601147  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 403  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6601148 atactatcccatttccattccggcacatccaa 6601179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 285 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11960963 - 11960814
Alignment:
Q  285 gccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatt 384  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  11960963 gccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggaaaactcgtcacaaaatccatagaaatactgtctcatt 11960864  T
Q  385 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11960863 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 11960814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5424948 - 5424632
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5424948 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5424849  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  5424848 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 5424749  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  5424748 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatcgat 5424649  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  5424648 atactatcccatttcca 5424632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 10906322 - 10906638
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10906322 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10906421  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10906422 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10906521  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10906522 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10906621  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  10906622 atactatcccatttcca 10906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 13252802 - 13253118
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13252802 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13252901  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  13252902 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 13253001  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13253002 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 13253101  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  13253102 atactatcccatttcca 13253118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 16635885 - 16636201
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16635885 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16635984  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16635985 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16636084  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16636085 aggcaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16636184  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16636185 atactatcccatttcca 16636201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 43163209 - 43163525
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43163209 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43163308  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43163309 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43163408  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43163409 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 43163508  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  43163509 atactatcccatttcca 43163525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 53385036 - 53384705
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  53385036 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 53384937  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatat-tctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||    
T  53384936 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctctg-atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaa 53384838  T
Q  271 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 370  Q
    | |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  53384837 taggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcga 53384738  T
Q  371 aatgctatcccatttccactccggtacatccaa 403  Q
     || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  53384737 tatactatcccatttccattccgacacatccaa 53384705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 48425559 - 48425875
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  48425559 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 48425658  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  48425659 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 48425758  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  48425759 aggtaggaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 48425858  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  48425859 atactatcccatttcca 48425875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14126611 - 14126464
Alignment:
Q  73 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  14126611 ccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14126512  T
Q  173 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14126511 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15348263 - 15347947
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15348263 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15348164  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15348163 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15348064  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15348063 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15347964  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  15347963 atactatcccatttcca 15347947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20062072 - 20061756
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20062072 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20061973  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  20061972 gatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 20061873  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  20061872 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 20061773  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  20061772 atactatcccatttcca 20061756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 400
Target Start/End: Original strand, 16371522 - 16371853
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  16371522 ctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16371621  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || | |||||| || ||  || |||| |||||    
T  16371622 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctggcaactgggcaacatgaaaactaatatt 16371721  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  16371722 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 16371821  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16371822 gatatactatcccatttccactctggcacatc 16371853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12850286 - 12850104
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  12850286 tccgactgaccatctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 12850187  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctact 254  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12850186 gatctctatccgacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctact 12850104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16412297 - 16411984
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| || || || |||||  ||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16412297 gactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16412198  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  16412197 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 16412098  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16412097 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 16411998  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  16411997 ctatcccatttcca 16411984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14876520 - 14876188
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  14876520 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 14876421  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataact-gatat 267  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| ||| |||| || || ||| ||||  ||||    
T  14876420 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgcctactgggcaacaggaaaactaaatat 14876321  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    ||||||  |  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  14876320 taatcggtagaaaatgagccggcttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcattccctctaggagtattctgcaaactcgtcacaaaatccat 14876221  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  14876220 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 14876188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15589410 - 15589094
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15589410 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15589311  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15589310 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15589211  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15589210 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 15589111  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  15589110 atactatcccatttcca 15589094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16756600 - 16756272
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16756600 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16756501  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |     
T  16756500 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatagg 16756401  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16756400 tagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 16756301  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaa 403  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16756300 ctatcccatttccattccagcacatccaa 16756272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 15061865 - 15062163
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |    
T  15061865 ctttccgactgaccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatc 15061964  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || ||||| || || || ||| |||| |||||    
T  15061965 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctgccaattgggcaacaggaaaactaatatt 15062064  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15062065 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 15062163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 388
Target Start/End: Original strand, 15339383 - 15339697
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  15339383 cgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 15339482  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || |   |||| ||||||||||    
T  15339483 tctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagtgaaactaatattaatcg 15339582  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15339583 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 15339682  T
Q  374 gctatcccatttcca 388  Q
     ||||||||||||||    
T  15339683 actatcccatttcca 15339697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26792414 - 26792101
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  26792414 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 26792315  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| |||||||| |     
T  26792314 ctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaaatgggcaacggggaaactaatattaattgg 26792215  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     || || || ||| |||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  26792214 tataaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 26792115  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  26792114 ctatcccatttcca 26792101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15402528 - 15402212
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15402528 tccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15402429  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  || | ||||||||    
T  15402428 gatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaagtaatattaat 15402329  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||     
T  15402328 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcatactcgtcacaaaatccatggat 15402229  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  15402228 atactatcccatttcca 15402212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16806944 - 16806628
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  16806944 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 16806845  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16806844 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16806745  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||| | || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  16806744 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacctaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaagtccatggat 16806645  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16806644 atactatcccatttcca 16806628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 400
Target Start/End: Original strand, 15209006 - 15209331
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |  || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||| ||    |    
T  15209006 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatat 15209105  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || || ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||     
T  15209106 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataacgtggatataaatttctgccaactaagacacaggaaaactgatattaatcgg 15209205  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    |||||| |  |||||||| ||||| || || || |  | ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  15209206 aatgaaataagccgactttgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 15209305  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15209306 ctatcccatttccactctggtacatc 15209331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15724949 - 15724636
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  15724949 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggat 15724850  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||||     
T  15724849 ctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaataataatcgg 15724750  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  15724749 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 15724650  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  15724649 ctatcccatttcca 15724636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Original strand, 16692272 - 16692502
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatct----tgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||    || |||||| |||||||||| ||||||||     
T  16692272 tccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 16692371  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  16692372 cttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatat 16692471  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    ||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  16692472 taatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaa 16692502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 400
Target Start/End: Original strand, 15248263 - 15248587
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    ||    
T  15248263 actgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatc 15248362  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    ||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   | || || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  15248363 tctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcgga 15248462  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  15248463 atgaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatacggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 15248562  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    | ||||||||||||||  |||||||    
T  15248563 tgtcccatttccactctagtacatc 15248587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11564699 - 11564551
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||  ||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11564699 tccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttg 11564600  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11564599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 11564551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15015762 - 15015573
Alignment:
Q  84 tccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctg 183  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15015762 tccgactgcggatgatatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctg 15015663  T
Q  184 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    | || |||||||||||||| ||||| | | ||| ||| |   |||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15015662 atacaatactcgacggaacaccatgtagcctcaaaatctcacgaatataaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcg 15015573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11961044 - 11960986
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11961044 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacc 11960986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14685210 - 14685174
Alignment:
Q  33 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685210 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 14685174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31694887 - 31694831
Alignment:
Q  378 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31694887 tcccacttccactccggcacatttaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 31694831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 434
Target Start/End: Original strand, 31939331 - 31939387
Alignment:
Q  378 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31939331 tcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgaaggcttctgatgt 31939387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 26009000 - 26008961
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26009000 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 26008961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8274132 - 8274098
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8274132 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 8274098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13967073 - 13967039
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13967073 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 13967039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Original strand, 30138213 - 30138247
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30138213 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30138247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Original strand, 30147764 - 30147798
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30147764 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30147798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16742436 - 16742359
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  16742436 acaaaatccatagaaatgctattccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacctgacggtctctgatgt 16742359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 10790579 - 10790615
Alignment:
Q  33 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 69  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10790579 ttgatagctgtacacaccataggggcttccagcggtc 10790615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 245
Target Start/End: Original strand, 18748796 - 18748960
Alignment:
Q  81 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || ||   ||    
T  18748796 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgat 18748895  T
Q  181 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 245  Q
    ||||||| ||||| || ||||   |||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  18748896 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 18748960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 133 - 433
Target Start/End: Original strand, 468 - 768
Alignment:
Q  133 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 232  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  468 catcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgta 567  T
Q  233 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgcccc 332  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  568 aatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgatttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccct 667  T
Q  333 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 432  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  668 cttggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggcctctgat 767  T
Q  433 g 433  Q
    |    
T  768 g 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20975873 - 20975511
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20975873 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 20975774  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20975773 gatctccatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactgatattaat 20975674  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20975673 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtatgtggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 20975574  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  20975573 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatgt 20975511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 1266797 - 1267158
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  1266797 tccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcg 1266896  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1266897 gatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgtgctacaggataactgatattaat 1266996  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1266997 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctaagagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 1267096  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1267097 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1267158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 425
Target Start/End: Original strand, 21840976 - 21841329
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21840976 tccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21841075  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  21841076 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgctaactgagctactggaaaactaatattgat 21841175  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  21841176 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaccaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 21841275  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 425  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21841276 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 21841329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 31416696 - 31416335
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  31416696 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 31416597  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31416596 gatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 31416497  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31416496 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31416397  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31416396 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 23655489 - 23655847
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |  ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |    
T  23655489 gactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggat 23655588  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  23655589 ctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactaagctaccggataactaatattaatcaa 23655688  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23655689 aatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaaatg 23655788  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  23655789 ttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgttaataaccctgcaggcttctgatg 23655847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22061653 - 22061293
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || | |||  |||| || || ||||| ||||||||     
T  22061653 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttgga 22061554  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |    
T  22061553 tccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggatacttgatgttaatag 22061454  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22061453 gaatgaagtgcgccgactttctcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctcgtagtgtttggtaaactcatcacaaaatccatagaaat 22061354  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  22061353 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaataaccctgcaggcttctgatgt 22061293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 20388658 - 20389020
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20388658 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20388757  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  20388758 gatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatgcaactttacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccactggaaaactaatattgat 20388857  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||     
T  20388858 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgtcacacaatccatggat 20388957  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  20388958 atgctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 20389020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 22371499 - 22371861
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  22371499 tccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 22371598  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22371599 gatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgtcaaatgagctaccggaaaactaatattgat 22371698  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  22371699 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 22371798  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22371799 atgttgtcccacttccactcaggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22371861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 19851970 - 19852331
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19851970 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19852069  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19852070 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19852169  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19852170 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19852269  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19852270 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19852331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 19858006 - 19858367
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19858006 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19858105  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19858106 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19858205  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19858206 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19858305  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19858306 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19858367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 803895 - 803534
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  803895 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 803796  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  803795 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactatgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 803696  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||     
T  803695 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccgtagag 803596  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  803595 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 803534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 6679670 - 6680031
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6679670 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6679769  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6679770 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 6679869  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6679870 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6679969  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6679970 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6680031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 31571064 - 31570712
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  31571064 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 31570965  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| | |||||| || || ||    
T  31570964 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatgttgat 31570865  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31570864 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31570765  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31570764 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 31570712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16271446 - 16271085
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16271446 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcg 16271347  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16271346 gatccctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacattgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16271247  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16271246 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16271147  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  16271146 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatg 16271085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 22051422 - 22051783
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22051422 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22051521  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22051522 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 22051621  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| ||  |||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22051622 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcacccacaacccaaatagaatcatgtcttctcggagtgtttagtaaacttgtcacaaaatccatagaa 22051721  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  22051722 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22051783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 6604217 - 6604578
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6604217 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6604316  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6604317 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 6604416  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6604417 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6604516  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6604517 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6604578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 27355107 - 27355468
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27355107 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27355206  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  27355207 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactatgaatgtaaatctctgccaactgttctaccggataactgatattgat 27355306  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||||||     
T  27355307 gggaatgaagtgtgtcgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaattcgtcacaaaatccatagag 27355406  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  27355407 atactgtcccacttccactccagtacatctaacggtgtcaaaaaccctgcaggcttctgatg 27355468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29303648 - 29303286
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  29303648 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 29303549  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || | ||  || ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29303548 gatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctctgccaattgtgctaccgaataactgatattaat 29303449  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||||||     
T  29303448 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgaagtgtttggtaaattcgtcacgaaatccatagag 29303349  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29303348 atactatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 29303286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Original strand, 14565698 - 14566062
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  14565698 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 14565797  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14565798 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 14565897  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  14565898 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 14565997  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14565998 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14566062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 12305317 - 12305678
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    || ||||||||  |||| ||  | ||||| ||||| |    
T  12305317 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcg 12305416  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12305417 gatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 12305516  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||| || || |  |||| ||| |||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||     
T  12305517 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaactcaaatagtgtcataccctctcggagtgttcggtaaggtcgtcacgaaatccatagag 12305616  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12305617 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 12305678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20396351 - 20395986
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||  || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  20396351 tctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 20396252  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  20396251 cttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaatctggcgaatgtaaatctccgccaactgagatagaggaaaactgatat 20396152  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    ||| || |||||| || || |||||||| || || || || |  ||||| || |   ||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20396151 taaccggaatgaaatgagctgacttcgttaatctatccacaatcacccaaatagcggcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 20396052  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  20396051 ggatatactatcccattttcactctggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 20395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22377680 - 22377315
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22377481  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22377480 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22377381  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22377380 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22377315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22383855 - 22383490
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22383656  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22383655 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22383556  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22383555 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22383490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 390
Target Start/End: Original strand, 23949476 - 23949796
Alignment:
Q  70 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 169  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || | ||| | |||  |||||||||| |||||||||||    
T  23949476 tttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacct 23949575  T
Q  170 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 269  Q
     || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  23949576 cggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacagtatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgtta 23949675  T
Q  270 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 369  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23949676 atcggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattccctcttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatgg 23949775  T
Q  370 aaatgctatcccatttccact 390  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  23949776 atatattatcccatttccact 23949796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 19113249 - 19113565
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19113249 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19113348  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  19113349 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 19113448  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  19113449 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 19113548  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  19113549 atactatcccatttcca 19113565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16408267 - 16407949
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  16408267 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttg 16408168  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||    
T  16408167 ggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttc-caatctccttaatataaatctctgccaactgggccacaggaaaactaatatttat 16408069  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || |  | |||||| || |  | || ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16408068 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaattataacccaaattgcgtaattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16407969  T
Q  372 atgctatcccatttccactc 391  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16407968 atactatcccatttccactc 16407949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21394087 - 21393769
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21394087 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21393988  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21393987 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21393888  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21393887 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21393788  T
Q  372 atgctatcccatttccact 390  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21393787 atactatcccatttccact 21393769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21788581 - 21788263
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21788581 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21788482  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21788481 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21788382  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21788381 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21788282  T
Q  372 atgctatcccatttccact 390  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21788281 atactatcccatttccact 21788263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Original strand, 21251500 - 21251833
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21251500 tccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21251599  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  21251600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacaaatgtaaatctccgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 21251699  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21251700 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21251799  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || | |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  21251800 atacgatcccatttccaatctggcacatctaacg 21251833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 32600703 - 32601019
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  32600703 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 32600802  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  32600803 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 32600902  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32600903 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32601002  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||| ||||||||    
T  32601003 atactatctcatttcca 32601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20010122 - 20009780
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  20010122 tccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctga 20010023  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |                
T  20010022 aatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgggctaccggaaa------------ 20009935  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
           || |||| ||| ||||||||||  || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  20009934 -------aaatgcgtcgaattcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcattccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 20009842  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20009841 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20009780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21921955 - 21921630
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  21921955 cgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 21921856  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21921855 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcttccaattgagaaacaggaaaactgatattaatcg 21921756  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||   | ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  21921755 gaagaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccgtttaggagt-ttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 21921657  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
      |||||||||||||||| || |||||    
T  21921656 attatcccatttccactctggcacatc 21921630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17674245 - 17673929
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17674245 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17674146  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17674145 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17674046  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17674045 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17673946  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  17673945 atactatcccatttcca 17673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 18857136 - 18857452
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18857136 tccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18857235  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  18857236 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 18857335  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  18857336 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 18857435  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  18857436 atactatcccatttcca 18857452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21166759 - 21166432
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21166759 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21166660  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || ||| || ||||| || ||||  || || ||| |||||||||||||    
T  21166659 gatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttaatataaatctctgctaactaggcaacaggaaaactgatattaat 21166561  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21166560 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21166461  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    ||  ||||||| |||||||| || |||||    
T  21166460 atattatcccacttccactctggcacatc 21166432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 400
Target Start/End: Original strand, 22040422 - 22040746
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  22040422 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatc 22040521  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||| ||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  22040522 tctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccagctgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 22040621  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22040622 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22040721  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  22040722 tatcccatttccattccggcacatc 22040746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30313362 - 30313050
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30313362 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 30313263  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || |||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  30313262 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctccaccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 30313163  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  30313162 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 30313063  T
Q  376 tatcccatttcca 388  Q
    |||||||||||||    
T  30313062 tatcccatttcca 30313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 23650600 - 23650928
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23650600 tccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23650699  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | ||||||||    
T  23650700 gatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaaatgagaaacaagaaaaataatattaat 23650799  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |  ||  || || ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||   ||     
T  23650800 cagaagaaaatgagccgaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatcctgggat 23650899  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23650900 atactatcccatttccactctggcacatc 23650928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 19978526 - 19978854
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19978526 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19978625  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| ||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19978626 gatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19978725  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || ||    ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  19978726 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacagtcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccatggat 19978825  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19978826 atactatcccatttccactctggcacatc 19978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 22046932 - 22047080
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22046932 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22047031  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  22047032 gatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 22047080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 15533943 - 15534084
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15533943 actgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 15534042  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 217  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  15534043 tctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcac 15534084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22164411 - 22164098
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22164411 gactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 22164312  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    |||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  22164311 ctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 22164212  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  22164211 taggaattgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 22164112  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  22164111 ctatcccatttcca 22164098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22120392 - 22120080
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22120392 actgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatc 22120293  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||||      
T  22120292 tctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaatcggt 22120193  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    |  || || |||||||| ||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22120192 agaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22120093  T
Q  376 tatcccatttcca 388  Q
    | |||||||||||    
T  22120092 tgtcccatttcca 22120080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22133263 - 22132947
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22133263 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22133164  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || |||||   |||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22133163 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctttcaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22133064  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  22133063 cggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcatcacaaaatccatggat 22132964  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  22132963 atactatcccatttcca 22132947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 391
Target Start/End: Original strand, 22987757 - 22988074
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  ||||||||||     |||| |    
T  22987757 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatc 22987851  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | |  ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  22987852 tcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatatt 22987951  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    |||||  || || ||  ||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  22987952 aatcggtataaaatgatccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 22988051  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    || ||| ||||||||||| ||||    
T  22988052 gatatgttatcccatttctactc 22988074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20017972 - 20017865
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20017972 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20017873  T
Q  172 ggtctcta 179  Q
    | ||||||    
T  20017872 gatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19485092 - 19484980
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19485092 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19484993  T
Q  172 ggtctctatctga 184  Q
    | |||||||||||    
T  19484992 gatctctatctga 19484980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22248357 - 22248278
Alignment:
Q  354 gtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  22248357 gtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 22248278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Original strand, 19863684 - 19863760
Alignment:
Q  141 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 217  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19863684 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19863760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Original strand, 19868321 - 19868397
Alignment:
Q  141 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 217  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19868321 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21850274 - 21850241
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850274 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 21850241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 21043268 - 21043332
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21043268 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 21043332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129017
Alignment:
Q  102 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 201  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  202 ccccatgcaacttcac 217  Q
      ||||||||| ||||    
T  22129032 taccatgcaacctcac 22129017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16877032 - 16876998
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16877032 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16876998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 69
Target Start/End: Original strand, 1733390 - 1733422
Alignment:
Q  37 tagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 69  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733390 tagctgtacacaccatatgggcttccagcggtc 1733422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19484022 - 19483970
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19484022 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 19483970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33459 - 33097
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  33459 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 33360  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  33359 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 33260  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 33160  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33159 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 33097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 56520 - 56320
Alignment:
Q  234 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 333  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  56520 atctccgccaactgtgctaccggataactaatattaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcataccctc 56421  T
Q  334 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  56420 tcgaagtgtttggtaaacttggctccaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 56321  T
Q  434 t 434  Q
    |    
T  56320 t 56320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Original strand, 41067 - 41101
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41067 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 41101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 50296 - 49934
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  50296 tccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 50197  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  50196 gatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 50097  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50096 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattatgtaaacttgtcacaaaatccatagaa 49997  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49996 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 49934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 43678 - 43994
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43678 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43777  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43778 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43877  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43878 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 43977  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  43978 atactatcccatttcca 43994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9314
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8998 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9097  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  9098 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 9197  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9198 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 9297  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  9298 atactatcccatttcca 9314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 15460 - 15608
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15460 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15559  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15560 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7020 - 6658
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | || ||||| ||||| ||||| |    
T  7020 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcg 6921  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6920 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtagatttccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6821  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6820 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6721  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6720 atgctatcccacttccactccggtacatccagcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 51962 - 51600
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  51962 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 51863  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51862 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 51763  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51762 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 51663  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51662 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 51600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 60996 - 60634
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  60996 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 60897  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  60896 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 60797  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  60796 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 60697  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  60696 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 60634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 67384 - 67022
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  67384 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 67285  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  67284 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 67185  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  67184 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 67085  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  67084 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 67022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 118092 - 118454
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  118092 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 118191  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  118192 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 118291  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  118292 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 118391  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  118392 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 118454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 422
Target Start/End: Original strand, 323228 - 323578
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  323228 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 323327  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  323328 gatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 323427  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  323428 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 323527  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 422  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  323528 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgca 323578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 203250 - 202888
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  203250 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttg 203151  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| || || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  203150 gatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatttctgccaactgagccactggaaaactaatattgat 203051  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  203050 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 202951  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  202950 atgctatcctatttccactccggcacatctaacgatgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 202888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 386343 - 386544
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  386343 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 386442  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  386443 gatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaattctccgctaactgagctaccggaaaactaatattgat 386542  T
Q  272 cg 273  Q
    ||    
T  386543 cg 386544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 298
Target Start/End: Original strand, 112542 - 112771
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  112542 cttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 112641  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    |  | ||||||||||| || || || | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  112642 tcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgtggatgtaaatatccgccaactgagatataggaaaactgatatt 112741  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  112742 aatcggaatgaaatgagcccacttcgtcaa 112771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27365398 - 27365036
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27365398 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27365299  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  27365298 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 27365199  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365198 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27365099  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27365098 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 27365036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19652371 - 19652009
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  19652371 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 19652272  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19652271 gatccttatccgacacaatactcgacggtactccatataacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 19652172  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19652171 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtctacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtatacttgtcactaaatccatagaa 19652072  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19652071 atactgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 19652009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 24641866 - 24642227
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  24641866 tccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 24641965  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24641966 gacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgaatatgaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24642065  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24642066 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24642165  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  24642166 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 24642227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 225 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 27210338 - 27210130
Alignment:
Q  225 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27210338 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaat 27210239  T
Q  325 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27210238 catgccccctcggagtattaggtaaacttatcacaaaatccatataaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcagg 27210139  T
Q  425 cctctgatg 433  Q
    |||||||||    
T  27210138 cctctgatg 27210130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 23276900 - 23277262
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23276900 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 23276999  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23277000 aatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 23277099  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23277100 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctcttggagtgttcggtaaaatcgtcacaaaatccatagaa 23277199  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23277200 atgctatcccacttccattccggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23277262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 24948713 - 24949075
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||  ||||||| |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  24948713 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 24948812  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24948813 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24948912  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24948913 cggaataaagtgcgccaacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24949012  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24949013 atcctatcccatttcaactccggcacatccaacgatatcaacaaccctgcaggcttctgatgt 24949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Original strand, 12574477 - 12574829
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12574477 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 12574576  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  12574577 gatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 12574676  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12574677 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccactacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12574776  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12574777 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 12574829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 1063875 - 1064236
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  1063875 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 1063974  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  1063975 gatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattgat 1064074  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  1064075 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 1064174  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1064175 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1064236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 20828383 - 20828744
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20828383 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20828482  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20828483 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20828582  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20828583 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20828682  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20828683 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20828744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 20833109 - 20833470
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20833109 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20833208  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20833209 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20833308  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20833309 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20833408  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20833409 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20833470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21125476 - 21125130
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21125476 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21125377  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  21125376 gatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcacgat--tatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 21125279  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || | | |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21125278 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaaaacaacccaaatggcaccatgtcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 21125179  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctg 420  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21125178 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctg 21125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Original strand, 27787865 - 27788217
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27787865 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27787964  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  27787965 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 27788064  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27788065 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacgacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 27788164  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27788165 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 27788217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 31830782 - 31831143
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31830782 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31830881  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31830882 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 31830981  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  31830982 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 31831081  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31831082 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31831143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 304
Target Start/End: Original strand, 23294082 - 23294314
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23294082 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 23294181  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23294182 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgattttaat 23294281  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 304  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23294282 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 23294314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 434
Target Start/End: Original strand, 23110907 - 23111221
Alignment:
Q  120 tttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 219  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23110907 tttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacacaatgcaacttcacaa 23111006  T
Q  220 tattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatat 319  Q
    |||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  || || |||||  |||||||||| || || || || ||||| ||    
T  23111007 tatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgggataaaatgcgctaacttcgtcaatctatcgacaactacccaaat 23111106  T
Q  320 cgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacct 419  Q
     | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  23111107 agcatcatgccctcttggagtattgggtaaacttgttacaaaatccatggatatgttatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccca 23111206  T
Q  420 gcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||| ||||||||    
T  23111207 gcaggcttctgatgt 23111221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11358193 - 11357832
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11358193 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 11358094  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  || || | | |  |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  11358093 gatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagttttaccacactgcgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattaat 11357994  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11357993 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11357894  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11357893 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 11357832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 24675613 - 24675941
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  24675613 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 24675712  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||    
T  24675713 gatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaat 24675812  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24675813 cggtagaaaatgggccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24675912  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  24675913 atgctattccatttccactctggcacatc 24675941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Original strand, 27371396 - 27371709
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27371396 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 27371495  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| |     
T  27371496 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaatagg 27371595  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  27371596 tagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 27371695  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  27371696 ctatcccatttcca 27371709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 9610260 - 9610576
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9610260 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9610359  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  9610360 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 9610459  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9610460 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 9610559  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  9610560 atactatcccatttcca 9610576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21325585 - 21325257
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21325585 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21325486  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  21325485 gatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 21325386  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||   ||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  21325385 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatctcgtcatatcctctaggagtattcggaaaactcgtcacgaaatccatggat 21325286  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21325285 atactatcccatttccactctggcacatc 21325257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 27218140 - 27218456
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27218140 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27218239  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27218240 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27218339  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27218340 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27218439  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  27218440 atactatcccatttcca 27218456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 16923013 - 16923329
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16923013 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16923112  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16923113 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16923212  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16923213 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16923312  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16923313 atactatcccatttcca 16923329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 16982276 - 16982592
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16982276 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16982375  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16982376 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16982475  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16982476 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16982575  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16982576 atactatcccatttcca 16982592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 17063841 - 17064157
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17063841 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17063940  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17063941 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17064040  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17064041 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17064140  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  17064141 atactatcccatttcca 17064157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 17067499 - 17067815
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17067499 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17067598  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17067599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17067698  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17067699 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17067798  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  17067799 atactatcccatttcca 17067815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22325175 - 22324859
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22325175 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22325076  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  22325075 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 22324976  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22324975 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22324876  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  22324875 atactatcccatttcca 22324859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24707801 - 24707485
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  24707801 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 24707702  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  24707701 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 24707602  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24707601 cgctagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24707502  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  24707501 atactatcccatttcca 24707485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23107986 - 23107721
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 234  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  23107986 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaga 23107887  T
Q  235 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 334  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  |    
T  23107886 tctcggccaactgaggaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttccttt 23107787  T
Q  335 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23107786 aggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23107721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Original strand, 24262497 - 24262810
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  24262497 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 24262596  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  24262597 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 24262696  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  24262697 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 24262796  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  24262797 ctatcccatttcca 24262810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 10868974 - 10869290
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10868974 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10869073  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10869074 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10869173  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| ||||  ||   ||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10869174 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaatcgcgtcgctccctctcggagtactcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10869273  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  10869274 atactatcccatttcca 10869290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 16925484 - 16925800
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16925484 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16925583  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16925584 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16925683  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16925684 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16925783  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16925784 atactatcccatttcca 16925800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 16999124 - 16999440
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16999124 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16999223  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16999224 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16999323  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16999324 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16999423  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  16999424 atactatcccatttcca 16999440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22756784 - 22756456
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||    
T  22756784 tccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttg 22756685  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22756684 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22756585  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || |  |  |||||  |||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||     
T  22756584 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaaaaatcacccaagtcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcgcaaaatccatggat 22756485  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22756484 atactatcccatttccactctggcacatc 22756456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Original strand, 23064201 - 23064427
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23064201 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttg 23064300  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  23064301 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 23064400  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  23064401 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 23064427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21145357 - 21145044
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21145357 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 21145258  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| || || |||||||  || || ||  |||| ||||| ||||     
T  21145257 ctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatttctgccaacttggcaacagggaaactaatattgatcgg 21145158  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||     
T  21145157 tagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatata 21145058  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  21145057 ctatcccatttcca 21145044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41608704 - 41608391
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41608704 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41608605  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  41608604 gatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 41608505  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41608504 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41608405  T
Q  372 atgctatcccattt 385  Q
    || |||||||||||    
T  41608404 atactatcccattt 41608391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24877068 - 24876752
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  24877068 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaagtaaatcttg 24876969  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  24876968 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 24876869  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  | ||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  24876868 cggtaggaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 24876769  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  24876768 atactatcccatttcca 24876752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 328 - 434
Target Start/End: Original strand, 23294315 - 23294421
Alignment:
Q  328 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 427  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23294315 gccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccactttcactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggctt 23294414  T
Q  428 ctgatgt 434  Q
    |||||||    
T  23294415 ctgatgt 23294421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 24710157 - 24710305
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24710157 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24710256  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||    
T  24710257 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 24710305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44385888 - 44385740
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44385888 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44385789  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44385788 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 44385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442684
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaat 20442684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 23189131 - 23189279
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23189131 tccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23189230  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  23189231 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 434
Target Start/End: Original strand, 45529644 - 45529997
Alignment:
Q  81 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 180  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  45529644 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 45529743  T
Q  181 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 280  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||   ||||||||  || ||| ||||||| |||||   ||| ||    
T  45529744 ctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaatctctcggatataaatctctatcaactgagacacaggaaaactgatgttaattagaataaa 45529843  T
Q  281 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 380  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  45529844 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggacatactatcc 45529943  T
Q  381 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || ||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  45529944 cacttccactctagaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 45529997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30211236 - 30211037
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  30211236 tccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 30211137  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  30211136 gatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 30211037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24819865 - 24819644
Alignment:
Q  212 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 311  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  24819865 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 24819766  T
Q  312 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 411  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  24819765 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 24819666  T
Q  412 acaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  24819665 tcaaccctgcaggtttctgatg 24819644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24825605 - 24825472
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  24825605 tctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 24825506  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 201  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24825505 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21890875 - 21890709
Alignment:
Q  234 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 333  Q
    ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||      
T  21890875 atctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctt 21890776  T
Q  334 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    | ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  21890775 taggattattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccttttccactctggcacatc 21890709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 388
Target Start/End: Original strand, 22276687 - 22276718
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276687 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 22276718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 388
Target Start/End: Original strand, 24710415 - 24710474
Alignment:
Q  329 ccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24710415 ccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 24710474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44385627 - 44385572
Alignment:
Q  333 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  44385627 ctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 44385572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12640267 - 12640234
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12640267 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccact 12640234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 25128792 - 25128945
Alignment:
Q  93 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 192  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||  ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  25128792 ggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 25128891  T
Q  193 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 246  Q
    | || ||||  ||||||||| | ||||| |  | |||||||||| | |||||||    
T  25128892 tagaaggaataccatgcaacctaacaatctgttcaatgtagatcccagccaact 25128945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14286140 - 14285780
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || ||  ||| |||||| || || ||||| ||     
T  14286140 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcgga 14286041  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14286040 tctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtagatctccgctaactgtgctaccggataactgatgttaatcg 14285941  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14285940 gaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgttacaaaatccatagaaat 14285841  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14285840 actgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14285780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 75 - 434
Target Start/End: Original strand, 13666023 - 13666382
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  13666023 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggat 13666122  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  13666123 ccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactgagctaccggataactgatattgatcgg 13666222  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13666223 aataaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatg 13666322  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13666323 ctatcccacttccactccggcacatccatcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13666382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 6413994 - 6414356
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  6413994 tccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 6414093  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  6414094 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctctgctaactgagctatcggataactgatattgat 6414193  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6414194 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6414293  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6414294 atactatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6414356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 13021840 - 13022201
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||| |||| || || || || ||||| |    
T  13021840 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcg 13021939  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13021940 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13022039  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  13022040 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccccctcggagtgtttggttaactcgtcacgaaatccatagaa 13022139  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13022140 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13022201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 19147694 - 19148055
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  19147694 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 19147793  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19147794 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 19147893  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  19147894 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctctaggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 19147993  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19147994 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 19148055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 20747093 - 20747454
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  20747093 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 20747192  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  20747193 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 20747292  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  20747293 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 20747392  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20747393 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20747454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15102369 - 15102008
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15102369 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15102270  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102269 gatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 15102170  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15102169 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccgtctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 15102070  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15102069 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15102008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11306032 - 11305668
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  11306032 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11305933  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11305932 tcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatatt 11305833  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  11305832 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 11305733  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11305732 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11305668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18053719 - 18053367
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  18053719 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 18053620  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  18053619 gatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 18053520  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18053519 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 18053420  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18053419 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 18053367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 14130356 - 14130718
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14130356 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14130455  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14130456 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14130555  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14130556 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14130655  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14130656 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14130718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23505636 - 23505274
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  23505636 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 23505537  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23505536 gatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 23505437  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23505436 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 23505337  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23505336 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 23505274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 14434174 - 14434536
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14434174 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14434273  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14434274 gatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14434373  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14434374 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14434473  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14434474 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14434536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14264010 - 14263649
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  14264010 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 14263911  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  14263910 gatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 14263811  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||    
T  14263810 cggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaacaacgcaaatggcatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaattcatggaa 14263711  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  14263710 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccacgcaggcttctgatg 14263649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 49152784 - 49153145
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  49152784 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 49152883  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49152884 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 49152983  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  49152984 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 49153083  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  49153084 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 49153145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16072057 - 16071699
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| || |    
T  16072057 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggat 16071958  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  16071957 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 16071858  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||  |||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16071857 aagaaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctttgagtgttcgataaactcgtcacaaaatccatggaaatg 16071758  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16071757 ttgtcccacttccactctagcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16071699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 204 - 434
Target Start/End: Original strand, 19613290 - 19613520
Alignment:
Q  204 ccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgt 303  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || | | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  19613290 ccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccgaaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctat 19613389  T
Q  304 ctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaa 403  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613390 caaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaa 19613489  T
Q  404 cggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19613490 tggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19613520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16950237 - 16949876
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16950237 tccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 16950138  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16950137 aatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 16950038  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  16950037 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtagactcgtcacgaaatccatagaa 16949938  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16949937 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgttaacaaccctgcaggcttctgatg 16949876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11388194 - 11387832
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  11388194 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 11388095  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     | ||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||    
T  11388094 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatggcacggatgtaaatctccgccagctgaggtaccggaaaactgatatttat 11387995  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||| || | |||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  11387994 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccacaaaaacccaaatagcatcatgccctatcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccgtagaa 11387895  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11387894 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11387832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 69 - 434
Target Start/End: Original strand, 15340911 - 15341276
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  15340911 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacc 15341010  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15341011 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgtt 15341110  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
     || | ||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||||||||||    
T  15341111 gataggaataaagtgtgccaactttgtcaacctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggggtgtttggtaaactcgtcataaaatccata 15341210  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15341211 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15341276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12206566 - 12206204
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  12206566 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttg 12206467  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  12206466 gatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgtgccactggaaaactaatattaat 12206367  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| || |||||| |||| || || || || | ||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  12206366 tggaataaagtgtgctgacttcttcaatctatcaacaaccatccatatgacatcatgccctctcagagtatttggtaaacttgttacaaagtccatggat 12206267  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  12206266 atgctatcccatttccattctggaacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 12206204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 391
Target Start/End: Original strand, 15625030 - 15625353
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  15625030 tctttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 15625129  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  15625130 cttggatctctatctgacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtagatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 15625229  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || || |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15625230 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagagtcattcccttttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccat 15625329  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactc 391  Q
     || ||  ||||||||||||||||    
T  15625330 ggatatagtatcccatttccactc 15625353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8211894 - 8211533
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  8211894 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 8211795  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  8211794 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaattgcgctaccggataactgatattgat 8211695  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||     
T  8211694 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagag 8211595  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  8211594 atactgtctcacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 8211533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1175 - 812
Alignment:
Q  70 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 169  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  1175 tttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 1076  T
Q  170 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 269  Q
    ||  || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  1075 tgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccagataactgatattg 976  T
Q  270 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 369  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  975 atcggaatgaaatgtgctgacttcgtcaacctgtcgacaatgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttggcacgaaatccatag 876  T
Q  370 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  875 aaatattgtcccacttccactccggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 12456185 - 12456546
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || || |||||  ||||||||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12456185 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 12456284  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | |||||||||  | | ||  || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12456285 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctataaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattgat 12456384  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12456385 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12456484  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  12456485 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 12456546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13968434 - 13968073
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13968434 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13968335  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13968334 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataacttatattaat 13968235  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  13968234 aggaataaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13968135  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13968134 atactgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13968073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11772031 - 11771677
Alignment:
Q  70 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 169  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11772031 tttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaacct 11771932  T
Q  170 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 269  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || |||||||||||||  ||  || ||||||||||     
T  11771931 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgagacacaagaaaactgatattt 11771832  T
Q  270 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 369  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  11771831 atcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 11771732  T
Q  370 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  11771731 atatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcagg 11771677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26118371 - 26118010
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||||   |||| || || ||||| ||||| |    
T  26118371 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcg 26118272  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  26118271 gatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcactacactgtgaatataaatttctgctaactgcgctaccggataattgatattgat 26118172  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  26118171 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 26118072  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26118071 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 26118010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 12687983 - 12688299
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12687983 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12688082  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  12688083 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 12688182  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12688183 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12688282  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  12688283 atactatcccatttcca 12688299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Original strand, 12457300 - 12457485
Alignment:
Q  249 gctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggta 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||| |||||||| ||  |||    
T  12457300 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtctacaacaacctaaatagcatcatgccctctcggagtgttccgta 12457399  T
Q  349 aacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12457400 aactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 12457485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 9596539 - 9596855
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9596539 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9596638  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  9596639 gatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 9596738  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  9596739 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaagtccatggat 9596838  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  9596839 atactatcccatttcca 9596855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18551546 - 18551230
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18551546 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18551447  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  18551446 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 18551347  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  18551346 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 18551247  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  18551246 atactatcccatttcca 18551230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 8199110 - 8199426
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8199110 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8199209  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8199210 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8199309  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8199310 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8199409  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  8199410 atactatcccatttcca 8199426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 44791139 - 44790823
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44791139 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44791040  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  44791039 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 44790940  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  44790939 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 44790840  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  44790839 atactatcccatttcca 44790823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 399
Target Start/End: Original strand, 14040178 - 14040504
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14040178 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14040277  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14040278 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14040377  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14040378 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14040476  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacat 399  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14040477 atactatcccatttccactctggtacat 14040504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 399
Target Start/End: Original strand, 14350208 - 14350534
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14350208 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14350307  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14350308 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14350407  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14350408 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14350506  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacat 399  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14350507 atactatcccatttccactctggtacat 14350534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11237001 - 11236685
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  11237001 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 11236902  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  11236901 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 11236802  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  11236801 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattttgcaaactcgtcacaaaatccatggat 11236702  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  11236701 atactatcccatttcca 11236685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 8708087 - 8708403
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8708087 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8708186  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  8708187 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 8708286  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |  ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8708287 aggtagaaaatgagttgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8708386  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  8708387 atactatcccatttcca 8708403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 10871477 - 10871793
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10871477 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10871576  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10871577 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10871676  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10871677 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10871776  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  10871777 atactatcccatttcca 10871793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11552890 - 11552574
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11552890 tccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttg 11552791  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  11552790 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 11552691  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  11552690 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccattgat 11552591  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  11552590 atactatcccatttcca 11552574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 13686546 - 13686862
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13686546 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13686645  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  ||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  13686646 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctaccaactgggcaacggggaaactaatattaat 13686745  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13686746 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 13686845  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  13686846 atactatcccatttcca 13686862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 14332879 - 14333195
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14332879 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14332978  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||  | ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  14332979 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgataaaaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 14333078  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14333079 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14333178  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  14333179 atactatcccatttcca 14333195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15160845 - 15160529
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15160845 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15160746  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15160745 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 15160646  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||     
T  15160645 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcaaaaaatccatggat 15160546  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  15160545 atactatcccatttcca 15160529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15154449 - 15154117
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | |  || |||||| |||||||||| ||||| ||     
T  15154449 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaat 15154350  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||    
T  15154349 cttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaattgatat 15154250  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||| |||| |||  | |||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  15154249 taatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgagtcattccctttaggagtattcggcaaactcgttaaaaaatccat 15154150  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15154149 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 15154117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 18178224 - 18178540
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  18178224 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 18178323  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18178324 gatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18178423  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  18178424 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatagat 18178523  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  18178524 atactatcccatttcca 18178540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17100 - 16788
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17100 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 17001  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  17000 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 16901  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    |  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  16900 agaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacgatgacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatac 16801  T
Q  376 tatcccatttcca 388  Q
    |||||||||||||    
T  16800 tatcccatttcca 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 415
Target Start/End: Original strand, 21662452 - 21662786
Alignment:
Q  81 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 180  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| | || |  |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  21662452 ccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 21662551  T
Q  181 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 280  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   | || || ||||   ||||||||| ||| ||| || |||| ||||||| ||| ||    
T  21662552 ctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatctcacggatataaatcttttccaactgagatacaggaaaattgatgttaatcggaataaa 21662651  T
Q  281 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 380  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  21662652 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcc 21662751  T
Q  381 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 415  Q
    ||  ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  21662752 cacgtccactctggaacatctaaaggtgtcaacaa 21662786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Original strand, 14955102 - 14955275
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | | ||| |||||| |  |||  || |||||||| ||||    
T  14955102 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttg 14955201  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 245  Q
    | ||||||||  | || || ||||| ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  14955202 gatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgtaaatctccgccaac 14955275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203085
Alignment:
Q  105 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 204  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  205 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 304  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23203169  T
Q  305 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23203168 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23203085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509212
Alignment:
Q  105 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 204  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  205 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 304  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23509296  T
Q  305 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23509295 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23509212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 321638 - 321506
Alignment:
Q  259 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 358  Q
    |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||    
T  321638 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcac 321539  T
Q  359 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  321538 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 321506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 245
Target Start/End: Original strand, 4440419 - 4440583
Alignment:
Q  81 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||    
T  4440419 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 4440518  T
Q  181 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 245  Q
    ||||||| ||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  4440519 ctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 4440583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23199509 - 23199451
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 130  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  23199509 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaa 23199451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27107277 - 27107243
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27107277 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27107243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 108
Target Start/End: Original strand, 12457262 - 12457298
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12457262 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14325775 - 14325743
Alignment:
Q  33 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 65  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14325775 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 14325743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 19644 - 20006
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  19644 tccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 19743  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19744 gatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaatgttctgaatataaatctccgccaactgagctacgagataactgatattaat 19843  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19844 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctttcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 19943  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19944 atgctatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 27749 - 28110
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  27749 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 27848  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27849 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaacggataactgatattaat 27948  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27949 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28048  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  28049 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccgtgcaggcttctgatg 28110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 41443 - 41803
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  41443 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaac--aacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccg 41540  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41541 gatctctattcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 41640  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41641 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 41740  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41741 atgctatcccacttccactccggcatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 41803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21453 - 21091
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  21453 tccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 21354  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21353 gatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 21254  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21253 cgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggtagactcgtcacaaaatccatagaa 21154  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21153 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 21091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 148 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11163 - 10877
Alignment:
Q  148 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  11163 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactg 11064  T
Q  248 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11063 agctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggt 10964  T
Q  348 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10963 agactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 20507 - 20868
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20507 tccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20606  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20607 gatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccacaaactgagctaccgggtaactgatattaat 20706  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20707 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccaaatggaatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcataaaatccatagaa 20806  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20807 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13143 - 12865
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  13143 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 13044  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13043 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 12944  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  12943 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 12865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16913 - 16635
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  16913 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 16814  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16813 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 16714  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  16713 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11565 - 11477
Alignment:
Q  346 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11565 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15335 - 15247
Alignment:
Q  346 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15335 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 425
Target Start/End: Original strand, 40262 - 40615
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  40262 tccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 40361  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40362 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 40461  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  40462 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 40561  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 425  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40562 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 40615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 79 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25285
Alignment:
Q  79 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 178  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  25640 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctct 25541  T
Q  179 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 278  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||     
T  25540 atccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcataaaattatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgataataattggaata 25441  T
Q  279 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25440 aagtgcgctgacttcgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgtttt 25341  T
Q  379 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  25340 cccacttccactccggcacatccaacggtgtcaaaaaccctgcagacttctgatgt 25285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48989 - 48627
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  48989 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 48890  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  48889 gattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccagataactgatgttaat 48790  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48789 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcactaaatccatagaa 48690  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48689 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatgt 48627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 47181 - 46819
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||| |||||||    
T  47181 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttg 47082  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  47081 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactaagctatcggataattgatattaat 46982  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46981 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctgttgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 46882  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  46881 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatgt 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42115 - 41754
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  42115 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 42016  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42015 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 41916  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  41915 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 41816  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41815 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 41754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2806
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| | |||  |||||||||| || |||||||| |    
T  2445 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcg 2544  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||   |||| || || | |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  2545 gatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttcataatatcgcgaatataaattttcgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 2644  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||| || |||||||||||||| || || || |  | ||| || |   ||| |||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||  ||     
T  2645 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcagccaaattgcgccattccctttaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccacggat 2744  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  2745 atgctatcccatttccattctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 2806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10678
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  10317 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 10416  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  10417 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctcctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 10516  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||   ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  10517 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggactattcggtaaactcgtcacaaaatccatgaaa 10616  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10617 atgctatcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 27048 - 27409
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  27048 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 27147  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  27148 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 27247  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27248 cggaataaaatgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 27347  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27348 atgctatcccacttccactctggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 250
Target Start/End: Original strand, 26666 - 26844
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  26666 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 26765  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 250  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26766 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagc 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18317 - 17958
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||     
T  18317 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgga 18218  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18217 tctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctactggataactaatattgatcg 18118  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||    
T  18117 gaataaagtgtgccgactttgtcaacttgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacgaaatccatggaaat 18018  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18017 gctgtcccactttcactctgccacatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatg 17958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3636
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| | |||  |||||||||| ||||| |||||  |     
T  3277 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcaga 3376  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3377 tcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 3476  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3477 gaataaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 3576  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  3577 gctgtcccacttccattccgccacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12909 - 12833
Alignment:
Q  141 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 217  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12909 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacgaaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 195479 - 195124
Alignment:
Q  79 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  195479 gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 195380  T
Q  179 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 278  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  195379 atccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaacctctgctaactgagctaccggataaatgatattaatcggaata 195280  T
Q  279 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  195279 aagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctat 195180  T
Q  379 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  195179 ccaacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgatgt 195124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Original strand, 149091 - 149455
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||  ||||||| | |||  |||||||||| ||||| ||||    
T  149091 ctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacc 149190  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||| ||| || | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  149191 tcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcaaaatgttatcaatataaatctcctccaactgagctaccggataactgatatt 149290  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  149291 aatcggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatggaatcatgccctctcggagtgttcagtaaactcgtcacaaaatccata 149390  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  149391 gaaatgctgtcccaattacactccagcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 149455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26317 - 25965
Alignment:
Q  70 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26317 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 26218  T
Q  170 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 269  Q
     || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26217 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgggatacaggaaaactgatatta 26118  T
Q  270 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 369  Q
    |||| ||| || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  26117 atcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 26018  T
Q  370 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 422  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  26017 atatgctatgccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgca 25965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5234 - 4872
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| || || ||||| |||||      
T  5234 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 5135  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5134 aatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5035  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5034 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaatccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4935  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4934 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 165 - 433
Target Start/End: Original strand, 5830 - 6098
Alignment:
Q  165 aaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactga 264  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  5830 aaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctacaggataactaa 5929  T
Q  265 tattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatc 364  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5930 tgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatc 6029  T
Q  365 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6030 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcttctgatg 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 5757
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  6117 tccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctca 6018  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6017 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatcttagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5918  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5917 aggaatgaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 5818  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  5817 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgat 5757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 75 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 101331 - 100972
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  101331 gactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 101232  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||     
T  101231 ccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccagaaaactaatatttatcgg 101132  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  101131 gataaaatgtgccgacttcgtcaacctatctaccacgacccaaatggcatcatgccctcttggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatagaaata 101032  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  101031 ttgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 100972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 400
Target Start/End: Original strand, 180725 - 181051
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  180725 cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttgga 180824  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||||||||    
T  180825 tctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaagaggaaaactgatattaatcg 180924  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  180925 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 181024  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  181025 actatcccatttccactctggcacatc 181051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 944
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  1306 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 1207  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || || || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1206 gatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttataaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 1107  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1106 cggaatatagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 1007  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1006 attaggtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 6547 - 6863
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6547 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttg 6646  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  6647 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 6746  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||||||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  6747 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccatatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgttacaaaatccatggat 6846  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  6847 atactatcccatttcca 6863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Original strand, 12846 - 12898
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12846 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 12898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 415
Target Start/End: Original strand, 114704 - 115052
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  114704 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 114803  T
Q  172 ggtct-----ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 266  Q
    | ||      |||||  |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  114804 gatcggatccctatccaacacaatactcgacggtacaccatgcagctttacaatattatgactgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgata 114903  T
Q  267 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 366  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  114904 ttaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatcca 115003  T
Q  367 tagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 415  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  115004 tagaaatgctattccacttccactccagcacatccaacggtgtcaacaa 115052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 90714 - 90513
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  90714 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 90615  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  90614 gatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctactagataactaatattgat 90515  T
Q  272 cg 273  Q
    ||    
T  90514 cg 90513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 390986 - 390663
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  390986 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 390887  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||    
T  390886 cttggatctttatctgatacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctcagccaactgagaaataggaaaactgatat 390787  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| ||| || || | | |||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  390786 taatcggaataaaatgagtcaacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcatcccctttaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccat 390687  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactc 391  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  390686 ggatatactatcccatttccactc 390663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 89975 - 89835
Alignment:
Q  133 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 232  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  89975 catcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatata 89876  T
Q  233 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  89875 aatctctgccaactgagctactagataactaatattgatcg 89835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7019 - 6660
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  7019 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 6920  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  6919 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 6820  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 370  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  6819 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 6720  T
Q  371 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 430  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6719 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 6660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11091
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  11450 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 11351  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  11350 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 11251  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 370  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11250 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 11151  T
Q  371 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 430  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  11150 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 44029 - 44391
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  44029 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 44128  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  44129 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 44228  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  44229 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 44328  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44329 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 44391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 45041 - 45403
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  45041 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 45140  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  45141 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 45240  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  45241 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 45340  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45341 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 45403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 47651 - 48009
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  47651 gactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggt 47750  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  47751 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcccccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 47850  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || | |||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47851 aataaagtgtgccgacttagtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcagggcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 47950  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  47951 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggggtcaacaaccctgtaggcttctgatg 48009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6456
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  6818 tccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 6719  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  6718 gatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 6619  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  6618 cgggataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 6519  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||| ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  6518 atgctgtcccacttccactctggaaaatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctcatgt 6456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 148 - 433
Target Start/End: Original strand, 2188 - 2473
Alignment:
Q  148 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 247  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2188 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaatattatgaatgtagatctccgccaactg 2287  T
Q  248 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||    
T  2288 agctaccggataactgatattaatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggt 2387  T
Q  348 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||||||    
T  2388 aaacttgtcacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatcaaacggtgtcaaaaacccaacaggcttctgatg 2473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 51645 - 51284
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||  |||| |||||      
T  51645 tccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctca 51546  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  51545 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 51446  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  51445 cggaataaagtgtgacgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccttctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 51346  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51345 atgctgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 51284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81252
Alignment:
Q  93 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 192  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || || ||  |||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  193 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgactt 292  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||| || ||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttcaaaatattatgaatataaatctaagtcaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactt 81394  T
Q  293 cgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 392  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81393 tgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 81294  T
Q  393 ggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  81293 ggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 81252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12570 - 12215
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| || || ||||    
T  12570 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacc 12471  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  12470 tcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataattgatgtt 12371  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
     ||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| |||||||||    
T  12370 gataccaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaaatcgtcacgaaatccata 12271  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12270 gaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacgg-gtcaacaaccctgcaggc 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 174 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13979 - 13719
Alignment:
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13979 tctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatgttaatcg 13880  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13879 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 13780  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13779 gctatcccacttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatgt 13719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11655
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11293 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcg 11392  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11393 gatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 11492  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11493 aggaatgaagtgtaccgactttgtcaacctatcgaccacaaaccatatagaatcaaaccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 11592  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11593 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 215 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 57486 - 57268
Alignment:
Q  215 cacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacc 314  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57486 cacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacc 57387  T
Q  315 catatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 414  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57386 caaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 57287  T
Q  415 aacctgcaggcctctgatg 433  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  57286 accctgcaggcttctgatg 57268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 48819 - 48455
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  48819 ctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacc 48720  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  48719 tcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatatt 48620  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
     |||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  48619 gatcggaagaaagtttgccgacttcgtcaacctatcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatcaatg 48520  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||| | ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48519 gaaatgttgtcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 48455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 57599 - 57541
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 130  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||    
T  57599 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaa 57541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1754 - 1393
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  1754 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcg 1655  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||    
T  1654 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttaaaaatatgatgaatataaatctccgccaactaagctaccggaaaactaatattgat 1555  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || || ||| ||||||||||||| || ||  ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  1554 cggaataaaatgtgcctacttcgtcaacctatcgacagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccatggaa 1455  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1454 atgctatcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 4954 - 5315
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |   |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  4954 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 5053  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||    
T  5054 aatctctatccgacacgatgctcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatattgat 5153  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  5154 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 5253  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5254 atgttgtcccacttccactatggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 393 - 754
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  393 tccgactgaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 492  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  493 gatctctatccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 592  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || | | |||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  593 cggaataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatcgacaaaatcccaaatggcatcatgccctctcagagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 692  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||||||  || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  693 atgttgtcccacttccactttggcaaatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 5274 - 5635
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  5274 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 5373  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
      |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5374 aatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgctaactgagctaccggataactgatattaat 5473  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5474 aggaatgaagtgtgccaacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtattattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 5573  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5574 atgttgtcccacttccagtctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 931 - 570
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  931 tccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 832  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  || |||| ||||| ||    
T  831 gatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttcataatattatgaatataaatctcagccaattgagctaccagaaaactaatattgat 732  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  731 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcagtaaactcgtcacaaaatccatggaa 632  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  631 atgctatcccactttcactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 199
Target Start/End: Original strand, 28043 - 28170
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  28043 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 28142  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacgg 199  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28143 gatctctatctgacacaatacttgacgg 28170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 199
Target Start/End: Original strand, 34296 - 34423
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  34296 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 34395  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacgg 199  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  34396 gatctctatctgacacaatacttgacgg 34423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 69 - 434
Target Start/End: Original strand, 260829 - 261194
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  260829 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacc 260928  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  260929 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaattgagctatcggataactgatgtt 261028  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
     || | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  261029 gataggaataaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcagagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccata 261128  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  261129 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 261194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 278612 - 278296
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||| || |||||||| ||||    
T  278612 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttg 278513  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| ||| || | || || ||| |||||||||||||    
T  278512 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgcctacagggcgacaggaaaactgatattaat 278413  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||     || || |||||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  278412 cggtggaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 278313  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  278312 atactatcccatttcca 278296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 148 - 434
Target Start/End: Original strand, 7660 - 7946
Alignment:
Q  148 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  7660 tccagaatctagaagtgaacatcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccacgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactg 7759  T
Q  248 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 347  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||    
T  7760 agctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggt 7859  T
Q  348 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7860 aaactcgtcacaaaatccagagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 7946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2775
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  3137 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 3038  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||  || |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  3037 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcactatgttatgaacataaatctccgccaactatgctaccagataactgatattaat 2938  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| | ||| ||||| || ||||| || | || ||| |||||||||| |||||||    
T  2937 aggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgataacaacctatatagcatcgtgccctcttggagtgtttgctatactcgtcacaaaattcatagaa 2838  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  2837 atactatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttcttatgt 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 414
Target Start/End: Original strand, 31934 - 32276
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  31934 tccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 32033  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  32034 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaattgagctaccggataactgatattgat 32133  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||| || ||||||| || ||||| || |  |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32134 tggaataaagagcaccgactttgttaacctatcaaaaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 32233  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 414  Q
    ||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32234 atgttgtcccacttccactcctgcacatccaacggtgtcaaca 32276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Original strand, 14563 - 14896
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14563 tccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14662  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  14663 gatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 14762  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||     
T  14763 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattaggcaaactcttcacaaaatccatggat 14862  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14863 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 14896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 17965 - 18113
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  17965 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 18064  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 220  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  18065 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaat 18113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18321
Alignment:
Q  152 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 251  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||      
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagaa 18458  T
Q  252 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 351  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||   ||| |||  | |||||||| | |||||    
T  18457 acaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcggcattccctttaggagtattcgttaaac 18358  T
Q  352 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  18357 tcgtcacaaaatacatggatatactatcccatttcca 18321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28546 - 28207
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28546 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 28447  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  28446 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 28347  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  28346 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 28247  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 415  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  28246 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 28207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40537 - 40198
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40537 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 40438  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  40437 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 40338  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  40337 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 40238  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 415  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  40237 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 2318 - 2679
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||| |    
T  2318 tccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcg 2417  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  2418 gatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaccggataactattattgat 2517  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  2518 cggaataaagtgtgttgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcgtgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 2617  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2618 atgttgtcccacttctactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 2679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 3315 - 3676
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  3315 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 3414  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  3415 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgtaacttcttaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactaatattgat 3514  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  3515 cggaataaagtgcgcggactttgtcaacctatcgacaaccacccaaatggcatcacgccctctgggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 3614  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  3615 atgttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatg 3676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Original strand, 6896 - 7229
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6896 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6995  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6996 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 7095  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||     
T  7096 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattagacaaactcgtcacaaaatccatggat 7195  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  7196 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2657 - 2336
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2657 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 2558  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2557 gatctctatccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgactataaatctccgcc--ctgagctaccggataattgatattaat 2460  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2459 tggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 2360  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggt 395  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||    
T  2359 atgccgtcccacttccactccggt 2336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 249140 - 249498
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || |||||||| || |    
T  249140 gactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggat 249239  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  249240 ccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattaattgg 249339  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  249340 aatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaata 249439  T
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  249440 ctgtcccacttcgactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 249498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 425
Target Start/End: Original strand, 43307 - 43660
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  43307 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 43406  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || || | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  43407 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccagataactgatattaat 43506  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43507 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 43606  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 425  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43607 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggc 43660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Original strand, 19375 - 19735
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  19375 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 19474  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  19475 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 19574  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19575 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 19674  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19675 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 434
Target Start/End: Original strand, 23537 - 23897
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  23537 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 23636  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  23637 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 23736  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23737 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 23836  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23837 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 350
Target Start/End: Original strand, 11412 - 11690
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  11412 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 11511  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11512 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 11611  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  11612 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 186 - 5
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  186 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 87  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 253  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  86 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Original strand, 12996 - 13084
Alignment:
Q  346 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12996 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 434
Target Start/End: Original strand, 528 - 750
Alignment:
Q  212 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 311  Q
    |||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  528 cttcacaatattatcgatataaatctccgccaactgagctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccaca 627  T
Q  312 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 411  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  628 acccatatagtatcatgccctctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccacttcggcacatccaacggtgaca 727  T
Q  412 acaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  728 acaaccctgcaggcttctgatgt 750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24853 - 24492
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| || || |||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24853 tccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24754  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||| || ||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||| ||    
T  24753 gatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttcacgaatataaatctccgccaaatgagccaccataaaactaatattgat 24654  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||| || |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  24653 tggaataaattgcgtcgacttcgtcaatctatctacaaccacccaaatggtatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccat-gga 24555  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  24554 atactatcccatttccacttcggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 24492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16495 - 16134
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16495 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 16396  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||| ||    
T  16395 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactacgctaccggataattgatattgat 16296  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  | |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16295 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgttatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16196  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16195 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 225 - 434
Target Start/End: Original strand, 5 - 210
Alignment:
Q  225 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 324  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5 tgaatataaatctcagccaactgagc----ggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 100  T
Q  325 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  101 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctacagg 200  T
Q  425 cctctgatgt 434  Q
    | ||||||||    
T  201 cttctgatgt 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14618
Alignment:
Q  184 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 283  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  14867 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 14768  T
Q  284 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 383  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  14767 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 14668  T
Q  384 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  14667 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 14618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23046 - 22797
Alignment:
Q  184 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 283  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  23046 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 22947  T
Q  284 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 383  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  22946 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 22847  T
Q  384 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  22846 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccagcagtcttctgatg 22797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 17883 - 18233
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  17883 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaatctcg 17982  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17983 gatctctatcccacacaatactcgatagaactccatgcaactttacaatattatgaatataaacctccgccgactgagctactggataactaatattgat 18082  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||           |||||||| || | ||||||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18083 cggaataaagtgtgccgacttcgtca-----------acaacccaaatggcatcatgctctcacggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 18171  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  18172 atgatgtcccacttccactctggcacatctaacggagtcaacaaccctgaaggcttctgatg 18233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33101 - 32739
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  33101 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 33002  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| |||   ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  33001 gatccctatccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccgggtaactgacattaat 32902  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| |   ||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32901 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgatagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 32802  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32801 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 32739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 26785 - 27146
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  26785 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 26884  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  26885 gatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 26984  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  26985 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaacagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 27084  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27085 atactgtcccacttccactacggtacatcaaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 385
Target Start/End: Original strand, 49437 - 49609
Alignment:
Q  213 ttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaa 312  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49437 ttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggttaactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaa 49536  T
Q  313 cccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccattt 385  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49537 cccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgccacaaaatccatagaaatgctatcccattt 49609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 434
Target Start/End: Original strand, 12081 - 12380
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 234  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |    
T  12081 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaa 12180  T
Q  235 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 334  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  12181 tctccaccaactgaggtacaggaaaactgatattactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 12280  T
Q  335 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  12281 cgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9865 - 9782
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  9865 tccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1793
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1428 tcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 1527  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || | ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  1528 cttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaatctcgtgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgt 1627  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||  |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1628 taatcagaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgtcctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 1727  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
      | || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  1728 gtatatactatcccatttccattctagcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 1793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 19126 - 19454
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19126 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19225  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19226 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19325  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19326 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19425  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19426 atactatctcatttccactctggcacatc 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 50017 - 50218
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  50017 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 50116  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  50117 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcaagaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 50216  T
Q  272 cg 273  Q
    ||    
T  50217 cg 50218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 400
Target Start/End: Original strand, 34613 - 34878
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 234  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |    
T  34613 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaa 34712  T
Q  235 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 334  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  34713 tctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctct 34812  T
Q  335 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  34813 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 34878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25505 - 25158
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  25505 tctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 25406  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    | |||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| |   ||||||| ||||| |||||||||| |||  || ||||||| |    
T  25405 catggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacgaatgtaaatctctgccaactgagatacaagaaaactgatgt 25306  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25305 taattggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtgacaaaatccat 25206  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 415  Q
     || |  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25205 ggatacactatcccatttccactacggcacatctaacggtgtcaacaa 25158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 219197 - 218838
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  219197 cgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttgga 219098  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  219097 tctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcg 218998  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  || || |||||||||||||| || ||    
T  218997 gaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaagctcgtcacaaaatccatggatat 218898  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  218897 gctatcccatttccactctggtatatctaatggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 218838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 400
Target Start/End: Original strand, 229563 - 229895
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||| |||  |||||||     
T  229563 tctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaat 229662  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  229663 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatat 229762  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  229763 taatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 229862  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     || || ||||| || |||||||| || |||||    
T  229863 ggatatactatcacaattccactctggcacatc 229895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4916
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  4555 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 4654  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4655 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcataatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 4754  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  4755 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttatgagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 4854  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||  || ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4855 atgctatcccatttccactctagaacatataaaggtgtcatcaaacctgcaggtttctgatg 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19783 - 19451
Alignment:
Q  73 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  19783 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttgg 19684  T
Q  173 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatc 272  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||    
T  19683 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatc 19584  T
Q  273 gaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaa 372  Q
    | ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||| |  | ||| |||||||||||||| || |    
T  19583 ggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatttgtcatactcgtcacaaaatccatggata 19484  T
Q  373 tgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19483 tactatcccatttccactctggaacatctaacg 19451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32534 - 32207
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  32534 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 32435  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  32434 gatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 32336  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32335 cggaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32236  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32235 atgctatcccatttccactctggtacatc 32207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Original strand, 6573 - 6906
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6573 tccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6672  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6673 gatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcagaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 6772  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || |  |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  6773 cggaagaaaataagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 6872  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6873 atactatcccatttccactcaggcacatctaacg 6906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Original strand, 3660 - 4025
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  3660 tctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 3759  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  3760 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 3859  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| |||||| || ||||||||   ||| || ||||| |  ||| | ||||  |||| |||  ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  3860 taatcggaatgaaatgagccgacttgtgcaatctatctacaatcacctaaatcgcgtcattccctttcggagtgttcgaaaaactcgtcacaaaatccat 3959  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||  ||||||||  |||||||    
T  3960 ggatatactatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcagccctgcaggtttctgatg 4025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 391
Target Start/End: Original strand, 1991 - 2310
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1991 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2090  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  2091 ggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaag 2190  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||     
T  2191 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaactcgttacaaaatccatggat 2290  T
Q  372 atgctatcccatttccactc 391  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2291 atgctatcccatttccactc 2310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16198 - 15859
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  16198 tccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 16099  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  16098 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaacttagacataggaaaactgatattaat 15999  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  15998 cggaataaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15899  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15898 atgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtca 15859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 433
Target Start/End: Original strand, 20096 - 20279
Alignment:
Q  250 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 349  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  20096 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 20195  T
Q  350 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20196 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 433
Target Start/End: Original strand, 22916 - 23099
Alignment:
Q  250 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 349  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  22916 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 23015  T
Q  350 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23016 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 23099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1233
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||  ||||| ||||| |||||      
T  1052 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctca 1151  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 253  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  1152 gatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatcaatataaatctccgccaactgtgctac 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 253
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12682
Alignment:
Q  153 aatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagcta 252  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgcta 12681  T
Q  253 c 253  Q
    |    
T  12682 c 12682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3872
Alignment:
Q  70 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  4189 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 4090  T
Q  170 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 269  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  4089 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 3990  T
Q  270 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 369  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  3989 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 3890  T
Q  370 aaatgctatcccatttcc 387  Q
    | || |||||||||||||    
T  3889 atatactatcccatttcc 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 387
Target Start/End: Original strand, 9118 - 9435
Alignment:
Q  70 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  9118 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 9217  T
Q  170 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 269  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  9218 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 9317  T
Q  270 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 369  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  9318 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 9417  T
Q  370 aaatgctatcccatttcc 387  Q
    | || |||||||||||||    
T  9418 atatactatcccatttcc 9435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33357 - 33039
Alignment:
Q  70 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 169  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  33357 tttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 33258  T
Q  170 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 269  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||    
T  33257 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaagaaaactaatatta 33158  T
Q  270 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 369  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  33157 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 33058  T
Q  370 aaatgctatcccatttcca 388  Q
    | || ||||||||||||||    
T  33057 atatactatcccatttcca 33039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 424
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9846
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  9490 tctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 9589  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||| |||||||||  || ||| |||||||||    
T  9590 cttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtaaatttcctccaactgagacacaggaaaactgatat 9689  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    |||||| |||||| || || || ||||| || || || || |  ||||| |||  ||||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9690 taatcggaatgaaatgagctgatttcgttaatctatcaacaattacccaaatcacatcattccctttcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccat 9789  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 424  Q
     || || |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  9790 ggatatactatcctatttccactctggcacatctaacggtgtcatcaaccctgcagg 9846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 160
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||  || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  476 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 377  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||  |||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||    
T  376 gatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaataggaaaactaatattaat 277  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  276 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 177  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  176 atactatcccatttcca 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 14884 - 15212
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14884 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14983  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||| ||||||||    
T  14984 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactaatattaat 15083  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  | ||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15084 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattagccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15183  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  15184 atactatcccatttccattctggtacatc 15212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1460
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1144 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1243  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1244 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1343  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || | |||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  1344 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgttccctctagaagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 1443  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  1444 atactatcccatttcca 1460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 425
Target Start/End: Original strand, 28718 - 28934
Alignment:
Q  209 caacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctacc 308  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||| |  ||     
T  28718 caacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatagaca 28817  T
Q  309 acaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtg 408  Q
    |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||| |||    
T  28818 acaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacagtg 28917  T
Q  409 tcaacaaacctgcaggc 425  Q
    | ||||| |||||||||    
T  28918 ttaacaaccctgcaggc 28934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 37726 - 37868
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  37726 tccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 37825  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaactt 214  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  37826 gatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccatacaactt 37868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 400
Target Start/End: Original strand, 29578 - 29797
Alignment:
Q  182 tgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaag 281  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  ||     
T  29578 tgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaa 29677  T
Q  282 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccatagaaatgctatcc 380  Q
    || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  29678 tgagccgacttcgtcaatctttcaacaatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtatcatgcaaactcgtcacaaaaatccatggatatactatcc 29777  T
Q  381 catttccactccggtacatc 400  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  29778 catttccactctggcacatc 29797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Original strand, 4399 - 4573
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  4399 tccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 4498  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 246  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4499 gatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaact 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 434
Target Start/End: Original strand, 4581 - 4662
Alignment:
Q  353 tgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4581 tgtcacaaaatccatggatatgctataccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39465
Alignment:
Q  135 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 234  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaa 39631  T
Q  235 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 334  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  39630 tctctgccaactgagaaacaggaaaactgatactaatcgaaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 39531  T
Q  335 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  39530 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 39465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 277
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  605 tccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 506  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  505 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 406  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || |  ||||| ||||  |||| | | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  405 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattctctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaactccatggat 306  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || || |||||||||||||| || |||||    
T  305 atactgtcccatttccactctggcacatc 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 63813 - 63485
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||   | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  63813 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 63714  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||| | ||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  63713 gatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctttatataaatctctgccaactgagcaacaggaaaactgatattaat 63614  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||| ||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |     
T  63613 cggtagaaaatgagccgacgtcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcat 63514  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  63513 atactatcccatttccactctggcacatc 63485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14861 - 14522
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  14861 tccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcg 14762  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  14761 gatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctctgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 14662  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || |||||| || ||||||||||| || || ||||| |  ||||| || |  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14661 cggaatgaaatgagccgacttcgttaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattcccattcggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatggat 14562  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 411  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  14561 atactatctcatttccactctggcacatctaaaggtgtca 14522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4232 - 3911
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  4232 actgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatc 4133  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  4132 tctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcgcgaatgtaaatctccgccaactaagacacgggaaaactgatattaatcgga 4033  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    || || |  || ||||||||||| || |   | |||| ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  4032 ataaactaagctgacttcgtcaatctat---caacaatccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 3936  T
Q  376 tatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  3935 tatcccatttccactctggaacatc 3911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 249
Target Start/End: Original strand, 130672 - 130849
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  130672 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 130771  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgag 249  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  130772 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgag 130849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29161 - 28963
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  29161 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatcttg 29063  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||    
T  29062 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgctaactgggcaacaggaaaactgatattaat 28963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Original strand, 59287 - 59413
Alignment:
Q  81 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 180  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  59287 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 59386  T
Q  181 ctgacactatactcgacggaaccccat 207  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  59387 ctgatacaatacttgacggaacaccat 59413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28890 - 28826
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  28890 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 433
Target Start/End: Original strand, 15401 - 15762
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  15401 tccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 15500  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||   | || || |||||||| |||||||  || ||| |||  || |||||    
T  15501 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaatatcacggatataaatctccgcgaactgagacacaggagaaccaatgttaat 15600  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||| || || ||||||||| |||| |  || || |  ||||| ||||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15601 cggaataaaatgagccgacttcatcaatccatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 15700  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  15701 atgctatcccatttccactatggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 15762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 113266 - 112953
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  113266 gactgaccatctgtctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggat 113167  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 274  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || || ||  |||||||||  || ||| |||| |||||||| |     
T  113166 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctggaatataaatttcttccaactgagaaacaggaaaactaatattaattgg 113067  T
Q  275 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 374  Q
    || ||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  113066 aaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 112967  T
Q  375 ctatcccatttcca 388  Q
    ||||||||||||||    
T  112966 ctatcccatttcca 112953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3268
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  3596 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttg 3497  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  ||  || |||||||||||||    
T  3496 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttaatatatatctctgccaactgggtaacaagaaaactgatattaat 3397  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||   |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  3396 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcccgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 3297  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3296 atactatctcatttccactctggcacatc 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 13011 - 13211
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13011 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13110  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  13111 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 13210  T
Q  272 c 272  Q
    |    
T  13211 c 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 388
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13308
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13256 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 220 - 548
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  220 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 319  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||| || ||||| ||||||||||  || |||  ||||||||||||    
T  320 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataccacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaagactgatattaat 419  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |      
T  420 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaattcatgggt 519  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  520 atactatcccatttccactctggcacatc 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 7921 - 8237
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7921 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8020  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||  || || ||||| || ||| | || ||  || |||| ||||||||    
T  8021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaacagggcaacaagaaaactaatattaat 8120  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||||||| ||||||| || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  8121 cggtagaaaatgagccgacttcatcaacctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccattgat 8220  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  8221 atactatcccatttcca 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4881 - 4553
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  4881 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 4782  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  || ||  |||| ||||||||    
T  4781 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggaaacagggaaactaatattaat 4682  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||     
T  4681 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggat 4582  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  4581 atactatcccatttccactctggcacatc 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 7463 - 7779
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7463 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7562  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  7563 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 7662  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7663 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 7762  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  7763 atactatcccatttcca 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 16179 - 16507
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  16179 tccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttg 16278  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| |||  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  16279 gatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 16378  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  16379 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcatcattcccattaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatcgatggat 16478  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16479 atactatcgcatttccactctggcacatc 16507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18987 - 18761
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||  ||  | ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||      
T  18987 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctca 18888  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  18887 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagatacaagaaaactgatattaat 18788  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  18787 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 18761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 405
Target Start/End: Original strand, 25498 - 25831
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25498 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25597  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  25598 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 25697  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  25698 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 25797  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 405  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  25798 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 25831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 282 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 482
Alignment:
Q  282 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatccc 381  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  633 tgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaaccctaatggtgtcatgccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggaaatgctatccc 534  T
Q  382 atttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  533 acttccactcaggtacatctaacggtgtcaac-aacctgcatgcttctgatgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Original strand, 622 - 798
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  622 tccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 721  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactga 248  Q
    | ||||||||   ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  722 gatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactga 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 400
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3226
Alignment:
Q  88 tctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacac 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  188 tatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgcc 287  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | |||||||||| ||  || || |||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaagaaaattaatattaatcggaagaaaatgagcc 3113  T
Q  288 gacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcc 387  Q
    || |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  3114 gaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcc 3213  T
Q  388 actccggtacatc 400  Q
    |||| || |||||    
T  3214 actctggcacatc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 345 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7566
Alignment:
Q  345 ggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7654 ggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 7566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 7890 - 8206
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7890 tccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7989  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    |  |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  7990 gacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8089  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8090 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 8189  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  8190 atactatcccatttcca 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 22391 - 22707
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22391 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22490  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22491 gatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22590  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || |  || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22591 cggtagaaaataagcagacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgtcccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22690  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  22691 atactatcccatttcca 22707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8793 - 8541
Alignment:
Q  148 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 247  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||||    
T  8793 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctaccaactg 8694  T
Q  248 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 347  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | |||||||| ||     
T  8693 agaaacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggc 8594  T
Q  348 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8593 aaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggtacatc 8541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 388
Target Start/End: Original strand, 65933 - 66245
Alignment:
Q  76 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  65933 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 66032  T
Q  176 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 275  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| ||||  |||||||||      
T  66033 cctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactattattaatcggt 66132  T
Q  276 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 375  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | |||   |||  | |||||||| || || || |||||||||||||| || || |    
T  66133 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgctccctttaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggatatac 66232  T
Q  376 tatcccatttcca 388  Q
    |||||||||||||    
T  66233 tatcccatttcca 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39601 - 39274
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  39601 tccgactgac-atctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttg 39503  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||| | || ||| || |||||  | ||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  39502 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaactttgcaatctccttaatataaatctctactaactgggcaataggaaaactgatattaat 39403  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  39402 tggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccatggat 39303  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  39302 atactatcccatttccactctggcacatc 39274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 68373 - 68199
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||||||||  | || || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  68373 tccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctcaactttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 68274  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 246  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  68273 gatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaact 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 399
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4722
Alignment:
Q  102 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 201  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  202 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 301  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  4525 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 4624  T
Q  302 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 399  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4625 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 399
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11852
Alignment:
Q  102 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 201  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  202 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 301  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  11655 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 11754  T
Q  302 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 399  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11755 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 938 - 1254
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  938 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1037  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1038 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1137  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || |  ||||| || |  ||   ||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1138 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaattgtgtcgctccatctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 1237  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  1238 atactatcccatttcca 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 400
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1528
Alignment:
Q  69 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 168  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  1197 ctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 1296  T
Q  169 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 268  Q
    || | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || | | |||||||| |    
T  1297 ttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttgacgaatatatatctctgccaactgagacacagaaaaactgatact 1396  T
Q  269 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 368  Q
    ||||| ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||  | |||||||| || ||| | ||||||||||||||     
T  1397 aatcggaagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctttaggagtattcggcaaagtcgtcacaaaatccatg 1496  T
Q  369 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  1497 gatatactatcccatttccactctggcacatc 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 116691 - 116368
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  116691 tcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 116592  T
Q  168 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 267  Q
    || || ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||  ||  || || | |    
T  116591 ctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgggatagaggtaaattgttgt 116492  T
Q  268 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 367  Q
    ||||   |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  116491 taatatgaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctctccacaatcacccaaatagcgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 116392  T
Q  368 agaaatgctatcccatttccactc 391  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  116391 ggatatactatcccatttccactc 116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 197260 - 196941
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  197260 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 197161  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  197160 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 197061  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  197060 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggctaactcgtcacaaaatccatggat 196961  T
Q  372 atgctatcccatttccactc 391  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  196960 atattatcccatttcgactc 196941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Original strand, 6538 - 6866
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||    
T  6538 tccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttg 6637  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||  || || || |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6638 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctaaaaataaatatctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6737  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  6738 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctataggagtaatcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 6837  T
Q  372 atgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  6838 atactatcccatttccactctggcacatc 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Original strand, 8314 - 8630
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  8314 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttg 8413  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||| |||||||   ||  || || ||||| |||||||| || |  ||| |||| ||||||||    
T  8414 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaatcaccttgatataaatctctgccaactgggcaataggaaaactaatattaat 8513  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |   |||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8514 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattgcccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8613  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||||||||||||    
T  8614 atactatcccatttcca 8630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 391
Target Start/End: Original strand, 5745 - 6064
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5745 tccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5844  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  ||||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  5845 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattacgaatataaatctatgccaacttagaaacaggaaaactgatattaat 5944  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    || ||  || ||  ||||||||||||| ||  | |  |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  5945 cggaagaaaatgaaccgacttcgtcaatctacccataatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgggt 6044  T
Q  372 atgctatcccatttccactc 391  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6045 atactatcccatttccactc 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 80276 - 80075
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  80276 tccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttg 80177  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| |  | ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  80176 gatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 80077  T
Q  272 cg 273  Q
    ||    
T  80076 cg 80075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 126985 - 126953
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126985 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 126953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7533 - 7345
Alignment:
Q  212 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 311  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || || |      
T  7533 cttcacaatatcgcgaatgtaaatctccgccaactgagacacgggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagtcgacttcgtcaacctatcaacaatc 7434  T
Q  312 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7433 acccaaatagcgtcattccctttgggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12763 - 12647
Alignment:
Q  68 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 167  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  12763 tctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 12664  T
Q  168 cttgggtctctatctga 184  Q
    ||  | |||||||||||    
T  12663 ctcagatctctatctga 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 357 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20938 - 20862
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20938 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27763 - 27729
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27763 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 844
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  991 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 892  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 219  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  891 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 10228
Alignment:
Q  228 atgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcat 327  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||   ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| | | |||||    
T  10434 atgtaaatctctgccaattgtgccaccggaaaactaatattaattagaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaaccaccacccatgtggcatcat 10335  T
Q  328 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 427  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  10334 gccctctcgaggtatttggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttccattctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggctt 10235  T
Q  428 ctgatgt 434  Q
    |||||||    
T  10234 ctgatgt 10228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10522 - 10428
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaa 166  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  10522 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaa 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 7797
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||   |||  |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8110 tccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaa-cttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8012  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||   || ||| |||| ||||||||    
T  8011 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactga--aacaggaaaactaatattaat 7914  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 371  Q
    |  ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7913 cagaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtctttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 7814  T
Q  372 atgctatcccatttcca 388  Q
    || ||||| ||||||||    
T  7813 atactatctcatttcca 7797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5364 - 5031
Alignment:
Q  81 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 180  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||  || ||||||||| | || || ||||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5364 ccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 5265  T
Q  181 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 280  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |    ||| || |||||||||| ||||| |||  || |||| || ||||||  ||| ||    
T  5264 ctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacaaatataaatctccgccacctgagatacaagaaaactaatgttaatcagaataaa 5165  T
Q  281 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 380  Q
     || ||||| |||||||  || || |  |  ||||| |||| |||||| || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  5164 atgagccgaattcgtcagtctatccataattacccaaatcgcatcatgtcctctttgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat-gatatactatcc 5066  T
Q  381 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 415  Q
    || |||||||| || | ||| || |||||||||||    
T  5065 cacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaa 5031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 298
Target Start/End: Original strand, 9867 - 10093
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||  ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9867 tccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9966  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 271  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  9967 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctcccaactcagaaacaggaaaactgatattaat 10066  T
Q  272 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 298  Q
    || ||  || || | ||||||||||||    
T  10067 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaa 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 4953
Alignment:
Q  75 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  5077 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggat 4978  T
Q  175 ctctatctgacactatactcgacgg 199  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  4977 ctctatccgacacaatactcgacgg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 400
Target Start/End: Original strand, 24098 - 24350
Alignment:
Q  148 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 247  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |||| |||||||||    
T  24098 tccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatcttcgccaactg 24197  T
Q  248 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 347  Q
     || || ||| |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | |||||| |      
T  24198 ggcaacaggaaaactgatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctatagaagtattcgac 24297  T
Q  348 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  24298 aaactcatcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 24350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 400
Target Start/End: Original strand, 1791 - 2117
Alignment:
Q  74 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 173  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||     
T  1791 cgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttgga 1890  T
Q  174 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 273  Q
    ||| ||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  |  ||| |||| |||||||||     
T  1891 tctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaataggaaaactaatattaatct 1990  T
Q  274 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 373  Q
     ||  || || ||||||| ||||||  || | || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  1991 gaagaaaatgagccgactacgtcaatatgccaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 2090  T
Q  374 gctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  2091 actatcccatttccactctggcacatc 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1662
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||      
T  1523 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaactaa 1622  T
Q  172 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaa 211  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1623 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1745
Alignment:
Q  336 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 400  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||    
T  1681 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccactctggcacatc 1745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 433
Target Start/End: Original strand, 17467 - 17566
Alignment:
Q  334 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  17467 tcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggaacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 17566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 434
Target Start/End: Original strand, 34015 - 34074
Alignment:
Q  375 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  34015 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggattctgatgt 34074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11839 - 11618
Alignment:
Q  212 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 311  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  11839 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 11740  T
Q  312 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 411  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  11739 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 11640  T
Q  412 acaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  11639 tcaaccctgcaggtttctgatg 11618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18031 - 17810
Alignment:
Q  212 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 311  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  18031 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 17932  T
Q  312 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 411  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  17931 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 17832  T
Q  412 acaaacctgcaggcctctgatg 433  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  17831 tcaaccctgcaggtttctgatg 17810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 86213 - 85938
Alignment:
Q  151 aaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||  ||||        |||| || ||||||||||||||||     
T  86213 aaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgtaatctcac--------gaatataaatctccgccaactgaga 86122  T
Q  251 tactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 350  Q
    ||  ||| || |||| ||||| | ||| || || ||||||||| |||  || || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| ||  ||    
T  86121 tagaggaaaattgatgttaattggaataaaatgggccgacttcatcagtctatccacaattacccaaatcgcattatgtccttttggagtattcggacaa 86022  T
Q  351 cttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 434  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  86021 ctcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactttggaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 85938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 880
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtaca 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  921 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtaca 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17595 - 17524
Alignment:
Q  236 ctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctac 307  Q
    ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  17595 ctccgccaactaagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctac 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 71830 - 71917
Alignment:
Q  159 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 246  Q
    |||||||||||| | || | ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  71830 gaagtaaaccttagatcccgatccgacacaatactagacggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 71917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33021
Alignment:
Q  93 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 192  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  193 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 246  Q
    | || ||||  ||||||||  ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  33074 tagaaggaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 33021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3372 - 3338
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3372 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 3338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4001
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3967 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24237
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3391
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  3441 acaaagtccatagaaatgctatcccacttccactccggcacaaacaacggt 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 391
Target Start/End: Original strand, 44347 - 44381
Alignment:
Q  357 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44347 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 44381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 182 - 347
Alignment:
Q  81 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatctt-gaagtaaaccttgggtctcta 179  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||   | |||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| || || | |    
T  182 ccatcggtctggcgatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagtagcttgcaaactt-tccaaaaacttagaactaaacctcggatcccga 280  T
Q  180 tctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 246  Q
    |||||||| | ||| || ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  281 tctgacacaagactagaaggaataccatgcaacctcacaatatgctcaatgtagatctcagccaact 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1701 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1701
Description:

Target: scaffold1701; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 65
Target Start/End: Original strand, 28 - 60
Alignment:
Q  33 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 65  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 60  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 112
Target Start/End: Original strand, 195 - 235
Alignment:
Q  72 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  195 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaa 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University