View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9370_low_1 (Length: 537)

Name: NF9370_low_1
Description: NF9370
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9370_low_1
NF9370_low_1
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (16-292)||(21402259-21402535)
chr4 (295-463)||(54897328-54897495)
chr4 (295-464)||(789528-789696)
chr4 (295-462)||(32202481-32202646)
chr4 (301-431)||(28755646-28755774)
chr4 (295-462)||(7768958-7769124)
chr4 (295-462)||(29591209-29591375)
chr4 (296-463)||(43944528-43944693)
chr4 (293-455)||(50619104-50619264)
chr4 (303-463)||(12356272-12356431)
chr4 (295-462)||(16536068-16536234)
chr4 (305-432)||(37987965-37988091)
chr4 (301-456)||(54655883-54656036)
chr4 (301-435)||(24679670-24679802)
chr4 (295-463)||(4268821-4268988)
chr4 (295-412)||(15186263-15186378)
chr4 (299-416)||(39843931-39844046)
chr4 (295-462)||(18067879-18068045)
chr4 (295-462)||(32217065-32217230)
chr4 (301-463)||(6164120-6164280)
chr4 (296-462)||(33108673-33108837)
chr4 (301-434)||(4089168-4089300)
chr4 (306-462)||(4220226-4220380)
chr4 (303-435)||(19503132-19503263)
chr4 (295-462)||(43202384-43202549)
chr4 (301-432)||(42898774-42898906)
chr4 (295-453)||(47231881-47232038)
chr4 (301-416)||(54945826-54945938)
chr4 (305-462)||(36395129-36395285)
chr4 (332-456)||(30387140-30387265)
chr4 (302-453)||(53655887-53656037)
chr4 (302-416)||(31680510-31680622)
chr4 (309-434)||(46148973-46149097)
chr4 (292-463)||(5091611-5091779)
chr4 (295-434)||(30154191-30154328)
chr4 (301-404)||(54054574-54054675)
chr4 (302-412)||(52533836-52533944)
chr4 (301-420)||(49915185-49915303)
chr4 (298-393)||(42815132-42815225)
chr4 (296-429)||(3783534-3783666)
chr4 (341-463)||(39877246-39877371)
chr4 (296-405)||(55882705-55882811)
chr4 (463-519)||(21402199-21402255)
chr4 (342-462)||(16820917-16821038)
chr4 (301-404)||(46688264-46688370)
chr4 (302-435)||(50603254-50603387)
chr4 (301-373)||(50167617-50167685)
chr4 (301-460)||(1432550-1432702)
chr4 (319-398)||(53268764-53268840)
chr4 (306-430)||(52697083-52697205)
chr4 (339-434)||(31517227-31517324)
chr4 (77-168)||(21402517-21402607)
chr4 (356-462)||(53003956-53004063)
chr4 (332-374)||(41265514-41265556)
chr4 (352-410)||(8133782-8133840)
chr4 (391-462)||(28119906-28119978)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (295-463)||(29993486-29993653)
chr7 (301-464)||(24798401-24798563)
chr7 (295-463)||(24438497-24438664)
chr7 (294-434)||(23363195-23363334)
chr7 (301-456)||(1737006-1737159)
chr7 (296-430)||(5239306-5239439)
chr7 (295-410)||(30810675-30810788)
chr7 (296-462)||(34606282-34606447)
chr7 (298-435)||(8754612-8754748)
chr7 (303-461)||(11686324-11686482)
chr7 (296-432)||(47083076-47083211)
chr7 (295-462)||(34333304-34333469)
chr7 (302-432)||(28587936-28588065)
chr7 (295-456)||(18485981-18486141)
chr7 (301-464)||(4628592-4628754)
chr7 (295-434)||(12218464-12218602)
chr7 (295-434)||(43594064-43594202)
chr7 (302-464)||(525074-525234)
chr7 (304-434)||(45045799-45045928)
chr7 (294-412)||(47839511-47839627)
chr7 (294-461)||(5729365-5729531)
chr7 (301-434)||(47657006-47657136)
chr7 (301-462)||(42044294-42044453)
chr7 (305-434)||(13064904-13065033)
chr7 (306-404)||(34546373-34546469)
chr7 (302-434)||(7689228-7689359)
chr7 (301-398)||(27456178-27456273)
chr7 (307-434)||(18117175-18117301)
chr7 (297-412)||(46716660-46716773)
chr7 (302-434)||(33636479-33636610)
chr7 (296-398)||(37631607-37631707)
chr7 (332-398)||(37674169-37674235)
chr7 (320-410)||(22739868-22739957)
chr7 (306-432)||(28262062-28262182)
chr7 (298-461)||(23357711-23357870)
chr7 (302-374)||(4087650-4087720)
chr7 (305-388)||(29835779-29835860)
chr7 (301-375)||(4100612-4100684)
chr7 (301-410)||(18469993-18470099)
chr7 (306-374)||(3021922-3021988)
chr7 (339-418)||(13556474-13556553)
chr7 (303-374)||(36437405-36437474)
chr7 (352-411)||(47118041-47118100)
chr7 (306-462)||(38128322-38128478)
chr7 (306-374)||(18220527-18220593)
chr7 (319-374)||(18220759-18220812)
chr7 (304-370)||(18220624-18220688)
chr7 (391-463)||(6097451-6097524)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (293-457)||(2350670-2350833)
chr6 (295-462)||(392116-392282)
chr6 (301-463)||(12145116-12145277)
chr6 (296-462)||(23402159-23402324)
chr6 (301-462)||(26467124-26467284)
chr6 (295-462)||(32929508-32929674)
chr6 (295-462)||(4215715-4215881)
chr6 (301-463)||(3515792-3515953)
chr6 (301-462)||(18276612-18276775)
chr6 (303-462)||(2580980-2581138)
chr6 (301-455)||(13416967-13417122)
chr6 (305-456)||(32985199-32985349)
chr6 (307-434)||(34851877-34852003)
chr6 (295-462)||(27433512-27433678)
chr6 (303-464)||(1391176-1391336)
chr6 (302-464)||(35043917-35044076)
chr6 (301-430)||(7851191-7851319)
chr6 (301-431)||(29451146-29451275)
chr6 (299-434)||(1840275-1840409)
chr6 (301-456)||(3026015-3026169)
chr6 (303-430)||(12525747-12525873)
chr6 (299-461)||(5323424-5323585)
chr6 (301-404)||(20897974-20898075)
chr6 (301-412)||(21878398-21878507)
chr6 (301-404)||(34477609-34477710)
chr6 (305-462)||(25165413-25165569)
chr6 (307-435)||(9661018-9661145)
chr6 (306-394)||(34396596-34396682)
chr6 (301-434)||(11115125-11115255)
chr6 (295-398)||(23629641-23629742)
chr6 (317-438)||(961051-961171)
chr6 (306-412)||(28225252-28225355)
chr6 (302-433)||(29978259-29978389)
chr6 (301-376)||(13529481-13529554)
chr6 (316-463)||(31280362-31280502)
chr6 (463-507)||(2516309-2516353)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (295-461)||(30675574-30675738)
chr8 (294-462)||(9063052-9063219)
chr8 (294-462)||(4648213-4648380)
chr8 (295-430)||(33357161-33357295)
chr8 (301-464)||(34228708-34228870)
chr8 (296-462)||(168487-168652)
chr8 (296-462)||(27988500-27988664)
chr8 (296-462)||(28045802-28045966)
chr8 (295-430)||(42035013-42035147)
chr8 (301-463)||(16888543-16888704)
chr8 (293-462)||(29444140-29444308)
chr8 (302-431)||(36730471-36730599)
chr8 (301-455)||(21595872-21596025)
chr8 (302-455)||(2805267-2805419)
chr8 (302-462)||(11112666-11112825)
chr8 (296-462)||(4537744-4537909)
chr8 (303-472)||(9537813-9537982)
chr8 (301-463)||(40831303-40831464)
chr8 (295-462)||(13643032-13643197)
chr8 (295-462)||(13743457-13743622)
chr8 (307-416)||(16890527-16890634)
chr8 (302-434)||(20831581-20831712)
chr8 (296-462)||(32113929-32114095)
chr8 (308-463)||(7304517-7304671)
chr8 (295-465)||(16394058-16394227)
chr8 (295-456)||(9253908-9254067)
chr8 (302-459)||(37373232-37373388)
chr8 (306-434)||(12203885-12204012)
chr8 (306-434)||(12448313-12448440)
chr8 (301-465)||(43119243-43119405)
chr8 (301-456)||(28626794-28626947)
chr8 (301-434)||(3930261-3930393)
chr8 (294-463)||(29235254-29235422)
chr8 (301-431)||(16785112-16785241)
chr8 (305-412)||(10870382-10870487)
chr8 (302-377)||(9278239-9278312)
chr8 (309-392)||(34192809-34192890)
chr8 (304-410)||(42433597-42433700)
chr8 (302-398)||(17467630-17467724)
chr8 (349-464)||(24843278-24843393)
chr8 (301-377)||(10618044-10618118)
chr8 (298-354)||(12652653-12652707)
chr8 (340-412)||(39406905-39406977)
chr8 (333-412)||(22956761-22956840)
chr8 (340-410)||(22451847-22451916)
chr8 (332-398)||(30933387-30933452)
chr8 (301-335)||(36923789-36923823)
chr8 (305-374)||(33124581-33124650)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (295-462)||(13661828-13661994)
chr5 (301-462)||(34650833-34650993)
chr5 (302-462)||(35504241-35504399)
chr5 (306-463)||(21547393-21547549)
chr5 (302-462)||(35132549-35132707)
chr5 (295-462)||(8787359-8787525)
chr5 (308-462)||(40564404-40564557)
chr5 (298-434)||(12506319-12506454)
chr5 (302-430)||(20175254-20175381)
chr5 (296-459)||(6283583-6283745)
chr5 (295-462)||(11957967-11958133)
chr5 (295-416)||(10054400-10054518)
chr5 (301-414)||(13470177-13470288)
chr5 (309-434)||(11846106-11846230)
chr5 (338-462)||(10956013-10956137)
chr5 (296-404)||(19647717-19647823)
chr5 (303-412)||(9721658-9721765)
chr5 (295-404)||(10069989-10070095)
chr5 (302-411)||(39066987-39067095)
chr5 (303-443)||(31909659-31909793)
chr5 (308-463)||(40057340-40057494)
chr5 (295-377)||(4837277-4837357)
chr5 (338-462)||(4268623-4268747)
chr5 (301-425)||(39069407-39069527)
chr5 (302-385)||(2619635-2619716)
chr5 (302-411)||(19436890-19436995)
chr5 (302-374)||(6284822-6284892)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (301-462)||(15227765-15227925)
chr1 (296-462)||(47010014-47010179)
chr1 (301-455)||(3784720-3784873)
chr1 (307-462)||(19031815-19031969)
chr1 (295-462)||(29657791-29657957)
chr1 (295-462)||(14350279-14350443)
chr1 (296-461)||(38162871-38163035)
chr1 (295-431)||(30294412-30294547)
chr1 (302-462)||(51065748-51065907)
chr1 (296-462)||(5694342-5694507)
chr1 (296-462)||(18043183-18043348)
chr1 (295-456)||(12072068-12072228)
chr1 (295-464)||(24178461-24178629)
chr1 (295-456)||(42769996-42770156)
chr1 (295-435)||(3097679-3097818)
chr1 (301-463)||(9266727-9266888)
chr1 (295-434)||(35985649-35985787)
chr1 (308-438)||(6770370-6770499)
chr1 (303-431)||(48071510-48071637)
chr1 (301-462)||(17333284-17333442)
chr1 (293-462)||(38701937-38702101)
chr1 (308-434)||(45431311-45431436)
chr1 (308-462)||(50128172-50128325)
chr1 (296-404)||(29210434-29210540)
chr1 (303-434)||(51368813-51368943)
chr1 (301-434)||(36446353-36446484)
chr1 (305-431)||(23473495-23473620)
chr1 (302-434)||(43286749-43286880)
chr1 (293-463)||(30657626-30657789)
chr1 (301-463)||(41730331-41730495)
chr1 (307-464)||(47532669-47532824)
chr1 (307-434)||(12306950-12307075)
chr1 (295-434)||(29683215-29683354)
chr1 (302-411)||(38335196-38335303)
chr1 (295-434)||(13961232-13961369)
chr1 (305-434)||(8472942-8473070)
chr1 (293-432)||(48383141-48383279)
chr1 (305-416)||(52749632-52749741)
chr1 (305-434)||(45449272-45449400)
chr1 (303-386)||(15282591-15282672)
chr1 (295-377)||(26228213-26228293)
chr1 (294-398)||(39497326-39497428)
chr1 (332-460)||(52431636-52431765)
chr1 (303-434)||(35700680-35700808)
chr1 (302-462)||(3838777-3838936)
chr1 (319-416)||(37315315-37315409)
chr1 (301-465)||(39081827-39081989)
chr1 (301-374)||(39912368-39912439)
chr1 (301-416)||(30217786-30217901)
chr1 (294-351)||(19011108-19011163)
chr1 (304-377)||(28481873-28481940)
chr1 (321-374)||(37503260-37503311)
chr1 (338-373)||(19011057-19011092)
chr1 (301-357)||(10976008-10976062)
chr1 (303-335)||(14881092-14881124)
chr1 (356-406)||(14881036-14881086)
chr1 (422-463)||(38595751-38595792)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (295-462)||(52520701-52520867)
chr3 (295-463)||(272240-272407)
chr3 (295-463)||(46352654-46352821)
chr3 (302-464)||(10617282-10617443)
chr3 (295-455)||(49893351-49893510)
chr3 (303-462)||(4168211-4168369)
chr3 (295-462)||(39074439-39074604)
chr3 (301-455)||(858615-858768)
chr3 (295-410)||(41553993-41554106)
chr3 (296-462)||(43786892-43787057)
chr3 (301-434)||(48725297-48725429)
chr3 (296-462)||(42964249-42964414)
chr3 (301-418)||(2119457-2119571)
chr3 (295-462)||(18014692-18014858)
chr3 (295-434)||(49529294-49529435)
chr3 (302-464)||(7468438-7468597)
chr3 (297-462)||(43269739-43269903)
chr3 (295-432)||(53489854-53489990)
chr3 (303-462)||(2938040-2938198)
chr3 (301-456)||(22248912-22249066)
chr3 (296-434)||(20924013-20924150)
chr3 (296-434)||(40362608-40362745)
chr3 (296-456)||(41304026-41304183)
chr3 (301-434)||(42548121-42548253)
chr3 (305-434)||(2505379-2505507)
chr3 (307-456)||(13159929-13160076)
chr3 (332-461)||(33140940-33141070)
chr3 (301-453)||(50359195-50359346)
chr3 (302-462)||(50395563-50395721)
chr3 (339-463)||(6842681-6842806)
chr3 (307-429)||(29241669-29241790)
chr3 (298-456)||(41993626-41993782)
chr3 (302-432)||(11308241-11308369)
chr3 (302-412)||(28139336-28139444)
chr3 (296-392)||(52246603-52246697)
chr3 (307-431)||(38852246-38852372)
chr3 (301-426)||(24488392-24488516)
chr3 (303-435)||(50298972-50299103)
chr3 (313-440)||(31514829-31514954)
chr3 (301-358)||(2391633-2391688)
chr3 (301-358)||(2393394-2393449)
chr3 (293-362)||(52718186-52718252)
chr3 (319-464)||(21010041-21010181)
chr3 (338-376)||(6842604-6842642)
chr3 (352-463)||(52552549-52552659)
chr3 (293-336)||(2362819-2362862)
chr3 (323-404)||(2362880-2362958)
chr3 (463-509)||(20402466-20402512)
chr3 (339-372)||(6842641-6842674)
chr3 (196-248)||(8803105-8803157)
chr3 (474-510)||(53666434-53666470)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (295-465)||(30486230-30486399)
chr2 (295-456)||(561524-561684)
chr2 (301-462)||(20552957-20553117)
chr2 (293-462)||(31438664-31438832)
chr2 (295-434)||(4381815-4381953)
chr2 (296-463)||(22887771-22887937)
chr2 (302-462)||(3668113-3668272)
chr2 (307-434)||(26387092-26387218)
chr2 (295-462)||(27856396-27856562)
chr2 (302-462)||(22567629-22567788)
chr2 (294-461)||(2898090-2898256)
chr2 (295-462)||(44587922-44588088)
chr2 (301-434)||(6580215-6580347)
chr2 (302-431)||(43637191-43637319)
chr2 (301-456)||(8969413-8969567)
chr2 (295-462)||(22068320-22068485)
chr2 (296-431)||(31390033-31390167)
chr2 (307-434)||(34442560-34442686)
chr2 (295-465)||(32360866-32361035)
chr2 (297-418)||(5093583-5093703)
chr2 (301-434)||(32860128-32860259)
chr2 (297-412)||(11021273-11021386)
chr2 (305-434)||(1859192-1859320)
chr2 (301-434)||(28600993-28601124)
chr2 (301-454)||(38590883-38591034)
chr2 (302-455)||(25782840-25782989)
chr2 (303-461)||(4022480-4022636)
chr2 (302-404)||(26891722-26891822)
chr2 (303-431)||(13574060-13574187)
chr2 (306-411)||(27584769-27584872)
chr2 (301-410)||(38296203-38296310)
chr2 (301-432)||(35851781-35851911)
chr2 (319-463)||(39531868-39532009)
chr2 (294-410)||(5881236-5881354)
chr2 (319-410)||(15079012-15079100)
chr2 (302-437)||(25772137-25772272)
chr2 (305-432)||(29102313-29102439)
chr2 (319-430)||(34123057-34123166)
chr2 (339-441)||(15146694-15146796)
chr2 (339-410)||(10820546-10820615)
chr2 (301-335)||(43993180-43993214)
chr2 (292-334)||(44854467-44854509)
chr2 (405-457)||(34123153-34123205)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (296-434)||(846-983)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (295-464)||(68288-68456)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (295-434)||(22981-23119)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (295-463)||(14916-15083)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (296-463)||(40940-41106)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (295-462)||(53685-53851)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (301-462)||(6110-6270)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (301-463)||(318-479)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (299-465)||(702-866)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (301-404)||(7956-8057)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (301-404)||(7314-7415)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (296-434)||(50569-50706)
scaffold0045 (302-392)||(53417-53505)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (307-456)||(146912-147059)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (295-412)||(116224-116339)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (302-404)||(11029-11129)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (306-412)||(25750-25853)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (338-463)||(10771-10897)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (301-434)||(69252-69383)
scaffold0050 (297-374)||(33770-33845)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (301-416)||(17518-17630)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (306-463)||(19584-19740)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (303-438)||(95609-95742)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (342-475)||(233918-234052)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (306-374)||(5070-5136)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (303-410)||(74526-74632)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21402535 - 21402259
Alignment:
Q  16 aggatcattatttcctccacacctaacatccttatttgcatgccttaaatcagaccaaaactaggagctgatttcttaatgttacttggcaatggttttg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21402535 aggatcattatttcctccacacctaacatccttatttgcatgccttaaatcagaccaaaactaggaactgatttcttaatgttacttggcaatggttttg 21402436  T
Q  116 accgagataaatttttaactcgactagtgacaatatgatcattctttcctccatgcttcttgcatcccttacatcagacctaaaccgagaatttctacct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21402435 accgagataaatttttaactcgactagtgacaatatgatcattctttcctccatgcttcttgcatgccataaatcagacctaaaccgagaatttctacct 21402336  T
Q  216 cctaatttattacgaaccctagtttgtgagttatggcctaattcaaaggttggcaagttgccgttccctttatatca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21402335 cctaatttattacgaaccctagtttgtgagttatggcctaattcaaaggttagcaagttgtcgttccctttatatca 21402259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Original strand, 54897328 - 54897495
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  54897328 cccggggcactggttaaggatatgagaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttcc 54897425  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54897426 ttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccggttagcaggaccca 54897495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 789696 - 789528
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  789696 cccggggcacgggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 789599  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||    
T  789598 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtagcccagaggcaccggttagcgggacccaa 789528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 32202646 - 32202481
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  32202646 cccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 32202549  T
Q  395 ttttgtggtaataattccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||  |||||||| |||| || |||||    
T  32202548 ttttatgataataattccttttatgatatgcttaatcaatgtcccagaggcaccagttaacaggaccc 32202481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 301 - 431
Target Start/End: Original strand, 28755646 - 28755774
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |    
T  28755646 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagttagaaacagtttccttttat 28755743  T
Q  401 ggtaataattccttttataatatgcttaacc 431  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28755744 gataatacttccttttatagtatgcttaacc 28755774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 7768958 - 7769124
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7768958 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttcc 7769055  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||||||| |||||||   || ||||||| ||  || || |||||||||||||| |||||    
T  7769056 ttttatggtaataattctcttttatggcatacttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 7769124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 29591209 - 29591375
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  29591209 cccggggcactggttaagaatatgaataaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 29591306  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||  || || |||||||||||||| |||||    
T  29591307 ttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 29591375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 463
Target Start/End: Original strand, 43944528 - 43944693
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  43944528 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 43944625  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||  || |  |||||||||||||| ||||||    
T  43944626 tttatggtaataattcccttgtatggtatgcttaaccagt-gcccgagggcaccggttagcaagaccca 43944693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 293 - 455
Target Start/End: Original strand, 50619104 - 50619264
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    
T  50619104 ctcccggggcactgattaagaatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaagtaaaaaacagttt 50619201  T
Q  393 ccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  50619202 ccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccagg-ggcaccggttagc 50619264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 303 - 463
Target Start/End: Original strand, 12356272 - 12356431
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||     
T  12356272 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattatataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatga 12356369  T
Q  403 taataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||    
T  12356370 taataattctcttttatggtatgcttaaccagtgttccgggggcaccggttagcaggaccca 12356431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 16536068 - 16536234
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  16536068 cccggggcacggattaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 16536165  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  16536166 ttttatggtaataattctattttatggtattcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16536234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 305 - 432
Target Start/End: Original strand, 37987965 - 37988091
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||    
T  37987965 tggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataatgttaaaaacagtttccttttattgta 37988062  T
Q  405 ataattc-cttttataatatgcttaacca 432  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37988063 ataattctcttttatagtatgcttaacca 37988091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 54656036 - 54655883
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||      
T  54656036 gcactggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttag 54655939  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    | ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  54655938 gataataattctctcttatgatatgcttaaccagtgtcccgg-ggcaccggttagca 54655883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24679802 - 24679670
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  24679802 gcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacaatttcc-tttat 24679706  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagta 435  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  24679705 ggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagta 24679670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4268988 - 4268821
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||     
T  4268988 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttct 4268891  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||  || |  |||||||||||||| ||||||    
T  4268890 ttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccca 4268821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 412
Target Start/End: Original strand, 15186263 - 15186378
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  15186263 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 15186360  T
Q  395 ttttgtggtaataattcc 412  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15186361 ttttatggtaataattcc 15186378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 416
Target Start/End: Original strand, 39843931 - 39844046
Alignment:
Q  299 gagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  39843931 gagcattggttaaggatatgaaaaatgaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctttt 39844028  T
Q  399 gtggtaataattcctttt 416  Q
     |||||||||||||||||    
T  39844029 atggtaataattcctttt 39844046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18068045 - 18067879
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||    
T  18068045 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaatagtttcc 18067948  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||  || || |||||||||||||| |||||    
T  18067947 ttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccc 18067879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 32217065 - 32217230
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||      
T  32217065 cccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttt-t 32217161  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  || |||||||||||||| || |||||    
T  32217162 ttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccggaggcaccggttaacaggaccc 32217230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Original strand, 6164120 - 6164280
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |    
T  6164120 gcactggttaaggatatcaaaa-gaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagcaaaaaacagtttccttttat 6164216  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |  | |||||||||||| ||||||    
T  6164217 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccgaggacaccggttagcaggaccca 6164280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 33108837 - 33108673
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  33108837 ccggggcactggttaag-atatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaatagtataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 33108741  T
Q  396 tttgtggtaataattcc-ttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  33108740 tttatggtaataattcctttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 33108673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 4089168 - 4089300
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  4089168 gcactgattaagggtatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 4089265  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  4089266 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 4089300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 306 - 462
Target Start/End: Original strand, 4220226 - 4220380
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||    
T  4220226 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttat-gtaa 4220322  T
Q  406 taatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  ||   | | |||||||||||||||||||||    
T  4220323 taattcccttttatggtatgcttaacatgtgctccgtaggcaccggttagcatgaccc 4220380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19503263 - 19503132
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |    
T  19503263 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatac--tagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttattg 19503166  T
Q  403 taataatt-ccttttataatatgcttaaccagta 435  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  19503165 taataattcccttttatggtatgcttaactagta 19503132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43202549 - 43202384
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  43202549 cccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttc 43202452  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  43202451 ttttatggtaataattctcttttatggtaagcttaaccagt-gcccgggggcaccggttagcaggaccc 43202384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42898906 - 42898774
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttt--t 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||  |    
T  42898906 gcactggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttctttttat 42898809  T
Q  399 gtggtaataattc-cttttataatatgcttaacca 432  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  42898808 gtggtaataattctcttttatggtatgcttaacca 42898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47232038 - 47231881
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  47232038 cccggagcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 47231941  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggtta 453  Q
    |||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||| || || ||| ||||||||||    
T  47231940 ttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccaataccccggaagcaccggtta 47231881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 54945938 - 54945826
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |    
T  54945938 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagc--agttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcgttttat 54945841  T
Q  401 ggtaataattcctttt 416  Q
    ||| ||||||||||||    
T  54945840 ggt-ataattcctttt 54945826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 462
Target Start/End: Original strand, 36395129 - 36395285
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| || ||    
T  36395129 tggttaaaaatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgata 36395226  T
Q  405 ataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||| ||||||| |||||    
T  36395227 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccagttagcaggaccc 36395285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 332 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30387265 - 30387140
Alignment:
Q  332 tatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattcc-ttttataatatgcttaac 430  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  30387265 tatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatgatatgcttaat 30387166  T
Q  431 cagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    || || || |||  ||||||||||||    
T  30387165 caataccctggaaacaccggttagca 30387140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 302 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 53656037 - 53655887
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||    
T  53656037 cacttgttaaggatatgaaaaaagaaattatataa--tagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaataattttattttatg 53655940  T
Q  402 gtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggtta 453  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||  |  ||||||||||||||    
T  53655939 gtaataatttcattttatggtatgcttaatcagtgcctcggaggcaccggtta 53655887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31680622 - 31680510
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  31680622 cactggttaagggtatgaaaaagaaagttacataa--tagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatg 31680525  T
Q  402 gtaataattcctttt 416  Q
    |||||||||| ||||    
T  31680524 gtaataattcatttt 31680510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 434
Target Start/End: Original strand, 46148973 - 46149097
Alignment:
Q  309 taaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  46148973 taagaatatgaaaaaggaaattatataa--taattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttctttttatggtaataa 46149070  T
Q  409 ttc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||| |||||||  |||| |||||||||    
T  46149071 ttctcttttatggtatgtttaaccagt 46149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 5091779 - 5091611
Alignment:
Q  292 actcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatt 391  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||   || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||    
T  5091779 actcccggggcactggttaagaatatgaaaaataaaattatataa--taattaatatattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcataaacagtt 5091682  T
Q  392 tccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  5091681 tccttttatagtaataattcccttttat-gtatgcttaaccagtgtccggga-gcaccggttagcaggaccca 5091611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 30154328 - 30154191
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  30154328 cccggggcactagttaag-atatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttcc 30154232  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    || | || ||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  30154231 ttatatgataataattctcttttatggtgtgcttaaccagt 30154191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Original strand, 54054574 - 54054675
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  54054574 gcaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatataa--tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaacaatttccttttat 54054671  T
Q  401 ggta 404  Q
    ||||    
T  54054672 ggta 54054675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 302 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 52533944 - 52533836
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||| ||    
T  52533944 cactggttaagaatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcactgaaattgaataattaattgataataaagtcgaaaacagtttccttttatg 52533847  T
Q  402 gtaataattcc 412  Q
    |||||||||||    
T  52533846 gtaataattcc 52533836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 420
Target Start/End: Original strand, 49915185 - 49915303
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  49915185 gcactgattaaggatatgaaaaagaaatttatata--gtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaacagtttccttttat 49915282  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataa 420  Q
      |||||| ||||||||||||    
T  49915283 aataataatttccttttataa 49915303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 393
Target Start/End: Original strand, 42815132 - 42815225
Alignment:
Q  298 ggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  42815132 ggagtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatat--catagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttc 42815225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3783666 - 3783534
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||    
T  3783666 ccggggcaccggttaaacatatgaaaaatgaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtttaattaattgataataaagtcaaaaacagttttct 3783569  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaa 429  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  3783568 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaa 3783534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 39877371 - 39877246
Alignment:
Q  341 gttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattc-cttttat--aatatgcttaaccagtatc 437  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||   |||||||||||||||  |    
T  39877371 gttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattctcttttatggtatatgcttaaccagtgcc 39877272  T
Q  438 caggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||    
T  39877271 ccggaggcacgggttagcaggaccca 39877246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 405
Target Start/End: Original strand, 55882705 - 55882811
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  55882705 ccggggcactcgttaaggatatgaaaaaa-aaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttct 55882801  T
Q  396 tttgtggtaa 405  Q
    ||| ||||||    
T  55882802 tttatggtaa 55882811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 463 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 21402255 - 21402199
Alignment:
Q  463 aatctttatttataatgacttcatcaatattaataaatttacttgcatcttcgtgat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21402255 aatctttatttataatgacttcatcaatattaataaatttacttgcattttcgtgat 21402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 462
Target Start/End: Original strand, 16820917 - 16821038
Alignment:
Q  342 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccag 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  || |    
T  16820917 ttaatgcattgaaattctgtaattaacttataataaagtcatacgcagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccg 16821016  T
Q  441 gaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16821017 ggggcaccggttagcaggaccc 16821038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 46688370 - 46688264
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaa-----ggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||     | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||    
T  46688370 gcactggttaaggatatgaaaaattaaagaaaattataca--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcct 46688273  T
Q  396 tttgtggta 404  Q
    ||| |||||    
T  46688272 tttatggta 46688264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 435
Target Start/End: Original strand, 50603254 - 50603387
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaaca-atttccttttgt 400  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||  |||| |    
T  50603254 cactggttaagggtgtggaaaaggaaattgtataa--taattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttttttttat 50603351  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagta 435  Q
    | ||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  50603352 gataataattctcttttatggtatgcttaaccagta 50603387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Original strand, 50167617 - 50167685
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167617 gcactggttaaagatatgaaaaagaaaattata----gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 50167685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1432702 - 1432550
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    ||   ||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| |    
T  1432702 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--atagttaatacattg----tg---aattaatttataataaaataaaaaacagttt-cttttat 1432613  T
Q  401 ggtaat--aattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgac 460  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||    
T  1432612 gataataaaattctcttttataatatgcttaaccagtacctcagaagcaccggttagcatgac 1432550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 398
Target Start/End: Original strand, 53268764 - 53268840
Alignment:
Q  319 aaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  53268764 aaaaaagaaattatatat--tagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaattttctttt 53268840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 430
Target Start/End: Original strand, 52697083 - 52697205
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| | ||||    
T  52697083 ggttaaggatatgaaaaacaaaattatata--gtagttaatacattaaaattatataa-taatttataataaagtcaaaaataattttcctttattgtaa 52697179  T
Q  406 taattc-cttttataatatgcttaac 430  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  52697180 taattctcttttatgatatgtttaac 52697205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 434
Target Start/End: Original strand, 31517227 - 31517324
Alignment:
Q  339 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaat-ttccttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||  |||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  31517227 tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaataatgttttttttatggtaataattctcttatatggtatgcttaaccagt 31517324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21402607 - 21402517
Alignment:
Q  77 taggagctgatttcttaatgttacttggcaatggttttgaccgagataaatttttaactcgactagtgacaatatgatcattctttcctcca 168  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21402607 taggaactgattccttaat-ttactcggcaatggatttgaccgagattcaattttagctagactaatgacaataggatcattatttcctcca 21402517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 53004063 - 53003956
Alignment:
Q  356 ttgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttag 454  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||  | | ||||||||||    
T  53004063 ttgtgtaattaatgtataataaagtcaaaaataatttccttttaaaataataattctcttttatgatatgcttaatcagtgtccccgggacaccggttag 53003964  T
Q  455 catgaccc 462  Q
    || |||||    
T  53003963 caggaccc 53003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Original strand, 41265514 - 41265556
Alignment:
Q  332 tatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41265514 tatatagtagttaatgcagtgaaattgtgtaattaatttataa 41265556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 410
Target Start/End: Original strand, 8133782 - 8133840
Alignment:
Q  352 gaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  8133782 gaaaatgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataatt 8133840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 391 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28119978 - 28119906
Alignment:
Q  391 ttccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  28119978 ttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggagacaccggttagcatgaccc 28119906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29993653 - 29993486
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29993653 cccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcaatttcc 29993556  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  29993555 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggaggcatcggttagcaggaccca 29993486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 301 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24798563 - 24798401
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  24798563 gcacttgttgaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 24798466  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || |||||| ||||||| |||||||    
T  24798465 ggtaataattcccttttatagtatgcttaaccagtgccccgggggcaccagttagcaggacccaa 24798401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Original strand, 24438497 - 24438664
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  24438497 cccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaactatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 24438594  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||    
T  24438595 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccca 24438664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23363334 - 23363195
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23363334 tcccggagcactcgttaaggataagaaaaaggaaattgtata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttc 23363237  T
Q  394 cttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| |||||||||    
T  23363236 cttttatggtaatatttctcttttatggtatgtttaaccagt 23363195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 456
Target Start/End: Original strand, 1737006 - 1737159
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |    
T  1737006 gcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatataa--tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagttaaaaacattttccatttat 1737103  T
Q  401 ggtaataattccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  1737104 gataataattcattttatggtatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagca 1737159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 430
Target Start/End: Original strand, 5239306 - 5239439
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |    
T  5239306 ccggagcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttctt 5239403  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaac 430  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  5239404 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 5239439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 30810675 - 30810788
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  30810675 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttc 30810772  T
Q  395 ttttgtggtaataatt 410  Q
    |||| |||||||||||    
T  30810773 ttttatggtaataatt 30810788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 34606282 - 34606447
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||    
T  34606282 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcct 34606379  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  || ||  ||||||||||||| |||||    
T  34606380 tttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggagcaccggttagcaggaccc 34606447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 298 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8754748 - 8754612
Alignment:
Q  298 ggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||    
T  8754748 ggagcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttgttt 8754651  T
Q  398 tgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagta 435  Q
    | ||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  8754650 tatggtaataatttccttttatggtatgcttaactagta 8754612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 303 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 11686482 - 11686324
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaaca--atttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||  |||| |    
T  11686482 actggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttttttat 11686385  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  11686384 ggtaataattctcttttatgatatgcttaacctgta-cccggaggcaccggttagcaggacc 11686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Original strand, 47083076 - 47083211
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  47083076 ccggaacaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagttaaaaacagtttcct 47083173  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaacca 432  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  47083174 tttatggtaataattcccttttatgatatgtttaacca 47083211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 34333304 - 34333469
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  34333304 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg-tcaaaacagtttcc 34333400  T
Q  395 ttttgtggtaataattcc-ttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||  || || |||||||||||||| |||||    
T  34333401 ttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 34333469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 302 - 432
Target Start/End: Original strand, 28587936 - 28588065
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  28587936 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagtcaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatg 28588033  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaacca 432  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  28588034 gtaataattcccttttatggtatgtttaacca 28588065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 456
Target Start/End: Original strand, 18485981 - 18486141
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18485981 cccggggcactggttaaggatattgaaaaggaaattatata--gtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcc 18486078  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||  || | || ||||||||||||    
T  18486079 ttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaacccgtgccccgaagacaccggttagca 18486141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 464
Target Start/End: Original strand, 4628592 - 4628754
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||| |    
T  4628592 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtttaattaatttataataaagtcagaaacagtttacttttat 4628689  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |   | |||||||||||||| |||||||    
T  4628690 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccttaggggcaccggttagcaggacccaa 4628754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12218602 - 12218464
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||    
T  12218602 cccggggcactggataagtatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaaataaaaaatagtttcc 12218505  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  12218504 ttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 12218464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43594202 - 43594064
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  43594202 cccggaacactggttaaggatataaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 43594105  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    | || || ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43594104 tcttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagt 43594064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 302 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 525234 - 525074
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||    
T  525234 cactggttaaagatatgaaaaagaaaagtataca--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatg 525137  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  525136 gtaataattctcttttatgatatgtttaaccagtactccgga-gcaccggttagcaggacccaa 525074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 304 - 434
Target Start/End: Original strand, 45045799 - 45045928
Alignment:
Q  304 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggt 403  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |    
T  45045799 ctggttaagggtatgaaaaatgaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgat 45045896  T
Q  404 aataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  45045897 aataattcccttttatggtatgcttaaccagt 45045928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 412
Target Start/End: Original strand, 47839511 - 47839627
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  47839511 tcccggggtactggttaaggatatgaaaaaggaatttatataa--tagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttc 47839608  T
Q  394 cttttgtggtaataattcc 412  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  47839609 cttttatggtaataattcc 47839627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 461
Target Start/End: Original strand, 5729365 - 5729531
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||     
T  5729365 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--atagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaataatttt 5729462  T
Q  394 cttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||   |||||||||||||  |  |||||||| |||||||| ||||    
T  5729463 cttttatagtaataattctcttttatggcatgcttaaccagtgcctcggaggcacaggttagcaggacc 5729531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 47657006 - 47657136
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||| |    
T  47657006 gcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagttt--ttttat 47657101  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||    
T  47657102 ggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagt 47657136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 42044453 - 42044294
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| |||||| | ||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  42044453 gcaccggttaaaggtatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatagattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttat 42044356  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  42044355 ggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgccccgg-ggcaccggttagcatgaccc 42044294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13065033 - 13064904
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggt-taaaaacaatttccttttgtggt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  13065033 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--atatttaatgtattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaaacagtttccttttatggt 13064936  T
Q  404 aataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  13064935 aataattcccttttatggtatgcttaaccagt 13064904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34546469 - 34546373
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||||    
T  34546469 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttatagtaaagtcaaaaacagtttacttttatggta 34546373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7689359 - 7689228
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||    
T  7689359 cactgattaaggatataaaaaaggaaattttaca--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 7689262  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  7689261 gtaataattctcttttatggtatacttaaccagt 7689228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27456273 - 27456178
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  27456273 gcactggttaaggatatggaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttcctttt 27456178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 307 - 434
Target Start/End: Original strand, 18117175 - 18117301
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||| | |||||    
T  18117175 gttaagtatatgaaagaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttttatagtaat 18117272  T
Q  407 aa-ttccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    || ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18117273 aatttcattttatggtatgcttaaccagt 18117301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 297 - 412
Target Start/End: Original strand, 46716660 - 46716773
Alignment:
Q  297 cggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctt 396  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||   || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  46716660 cggagcattggttaaagatataaaaaaggaaattatataa--tacttaatgcactgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaatattttcctt 46716757  T
Q  397 ttgtggtaataattcc 412  Q
    || || ||||||||||    
T  46716758 ttatgataataattcc 46716773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 434
Target Start/End: Original strand, 33636479 - 33636610
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  |||| ||    
T  33636479 cactagttaagaatatgaaaaagaaaattatataa--taattaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaatagtttatttttatg 33636576  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  33636577 gtaataattctattttatggtatgcttaaccagt 33636610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37631707 - 37631607
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  37631707 ccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatataa--taattaatgcattaaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttcct 37631610  T
Q  396 ttt 398  Q
    |||    
T  37631609 ttt 37631607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37674235 - 37674169
Alignment:
Q  332 tatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  37674235 tatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttctttt 37674169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 410
Target Start/End: Original strand, 22739868 - 22739957
Alignment:
Q  320 aaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat-aataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt 410  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  22739868 aaaaggaaagtatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataaaaaaaattaaaaacagttttcttttatggtaataatt 22739957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 432
Target Start/End: Original strand, 28262062 - 28262182
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     |||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||| | ||||    
T  28262062 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagtta-----ttgaaattatgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttccttttatagtaa 28262154  T
Q  406 taattc-cttttataatatgcttaacca 432  Q
    ||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  28262155 taattcttttttatggtatgcttaacca 28262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 23357870 - 23357711
Alignment:
Q  298 ggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttt 397  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||  |   || |||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||    
T  23357870 ggagtactcgttaaggatatgaaaaagaaaattgtata--gtagttaatgcatttca---gtataattaatttataaaaaagtcaaaaacagtttccatt 23357776  T
Q  398 tgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    | || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  || |||| ||||| |||||| ||||    
T  23357775 tatgataataattctcttctatgatatgcttaaccagtgccccggagacaccgattagcaagacc 23357711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Original strand, 4087650 - 4087720
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4087650 cactggttaagcatactaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaatagtgtgattaatttataa 4087720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 305 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29835860 - 29835779
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaaca 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29835860 tggttaaagatatgaaaaaggaagttatatac--tagttaatgtattaaaattgcgtaattaatttgtaataaagttaaaaaca 29835779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4100684 - 4100612
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  4100684 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgtattaaaattatgttattaatttataat 4100612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18470099 - 18469993
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||| || | |||| |    
T  18470099 gcaccggttaagcatactaaaaaggaaattatatagc--agttaatacattgaaattgtgtaattaatttatga-aaagtcaaaaacagttacattttat 18470003  T
Q  401 ggtaataatt 410  Q
    ||||||||||    
T  18470002 ggtaataatt 18469993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 374
Target Start/End: Original strand, 3021922 - 3021988
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3021922 ggttaagcatattaaaaaggaaattatatac--tagttaatacattgaaattgtataattaatttataa 3021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 418
Target Start/End: Original strand, 13556474 - 13556553
Alignment:
Q  339 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttccttttat 418  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13556474 tagtcaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaataacaatatctttttatggtaataatttccttttat 13556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 36437405 - 36437474
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36437405 actggttaaggatactaaaaaggtaattatata--gtaggtaattcattgaaattgtttaattaatttataa 36437474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47118100 - 47118041
Alignment:
Q  352 gaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || | || ||||||||| ||||||||||||    
T  47118100 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaagagcagtttccttttatggtaataattc 47118041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 462
Target Start/End: Original strand, 38128322 - 38128478
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||  || ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||  | || || || || |||||||| |||||    
T  38128322 ggttaaggataataaaaaggaaaat-tatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaa-aacttccttttatggta 38128419  T
Q  405 ataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    | |||| |||||| |  ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  38128420 agaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccc 38128478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18220593 - 18220527
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18220593 ggttaaggatactaaaaagaaaattatata--gtaattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataa 18220527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18220812 - 18220759
Alignment:
Q  319 aaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18220812 aaaaaggaaattatata--gtaattaatgtatagaaattgtgtaattaatttataa 18220759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18220688 - 18220624
Alignment:
Q  304 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattt 370  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18220688 ctggttaagaatactaaaaaggaaattatata--gtaattactgtattgaaattgtgtaattaattt 18220624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 463
Target Start/End: Original strand, 6097451 - 6097524
Alignment:
Q  391 ttccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  6097451 ttccttttatggtaagaatttcctttttttatatgcttaacccgtgccccggaggcactggttagcatgaccca 6097524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 293 - 457
Target Start/End: Original strand, 2350670 - 2350833
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  2350670 ctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttt 2350767  T
Q  393 ccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcat 457  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  2350768 ccttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcat 2350833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 392116 - 392282
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  392116 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 392213  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  392214 ttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 392282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12145277 - 12145116
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  12145277 gcacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 12145180  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||    
T  12145179 gataataatttccttttatagtatgcttaaccagtgctccggaggcaccggttagcaggaccca 12145116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 23402159 - 23402324
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23402159 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcct 23402256  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  23402257 tttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 23402324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 26467284 - 26467124
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |    
T  26467284 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttat 26467187  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  26467186 ggtaataattcccttttatggtatgtctaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccc 26467124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 32929674 - 32929508
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  32929674 cccggggcaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatat--taattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 32929577  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  32929576 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 32929508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 4215715 - 4215881
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  4215715 cccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 4215812  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  || || |||| ||||||||| |||||    
T  4215813 ttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccc 4215881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Original strand, 3515792 - 3515953
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  3515792 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 3515889  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||  ||  | |||||||||||||| ||||||    
T  3515890 ggtaataattcccttttatggtatgtttaacctgtgccccaggggcaccggttagcaggaccca 3515953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18276775 - 18276612
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  18276775 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaatttgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 18276678  T
Q  401 ggtaataa-ttcctttta---taatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||| |||||||||   || ||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||    
T  18276677 ggtaataatttccttttatggtattatgcttaaccagtgcccctggggcaccggttagcaggaccc 18276612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 303 - 462
Target Start/End: Original strand, 2580980 - 2581138
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  2580980 actggttaatgatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatgg 2581077  T
Q  403 taataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| || || ||  ||||||||||||| |||||    
T  2581078 taataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgggagcaccggttagcaggaccc 2581138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13417122 - 13416967
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata---ataaggttaaaaacaatttccttt 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||| ||| ||||    
T  13417122 gcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatat--tagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataataaagtcaaaaacagttttcttt 13417025  T
Q  398 tgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13417024 tatggtaataattctcttttataatatgcttaaccagt-gcccggaggcaccggttagc 13416967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 305 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32985349 - 32985199
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||    
T  32985349 tggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgata 32985252  T
Q  405 ataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  32985251 ataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagca 32985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 307 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34852003 - 34851877
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||    
T  34852003 gttaaagatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaataatttccttttatagtaat 34851906  T
Q  407 aattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34851905 aattctcttttataatatgcttaaccagt 34851877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 27433512 - 27433678
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||    
T  27433512 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaatagtttcc 27433609  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||  || || |||||||||||||| |||||    
T  27433610 ttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccc 27433678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 303 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 1391336 - 1391176
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||     
T  1391336 actgattaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 1391239  T
Q  403 taataatt-ccttttataatatgcttaaccagt-atccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  1391238 taataattcccttttatggtatgcttaaccagtgttccagga-acaccggttagcaggacccaa 1391176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 302 - 464
Target Start/End: Original strand, 35043917 - 35044076
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||    
T  35043917 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaattcattgaaattgtgt-attaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 35044013  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||    
T  35044014 gtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgg-ggcaccggttaacatgacccaa 35044076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7851319 - 7851191
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  7851319 gcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 7851222  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaac 430  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  7851221 ggtaataattcccttttatggtatgcttaac 7851191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29451275 - 29451146
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||| |    
T  29451275 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaattataataaagtcaaacacagtttccttttat 29451178  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaacc 431  Q
    | |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  29451177 gataataattcccttttatggtatgcttaacc 29451146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 299 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1840409 - 1840275
Alignment:
Q  299 gagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  1840409 gagcactggttaaggatataaaaaaagaaattatataa--taattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcctttc 1840312  T
Q  399 gtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  1840311 atggtaataattcccttttatgatatgtttaaccagt 1840275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 301 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3026169 - 3026015
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  3026169 gcactggttaagggtatgaaaaatgaaattataca--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttat 3026072  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
     |||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||    
T  3026071 cgtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgtcccgagggcaccggttagca 3026015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 303 - 430
Target Start/End: Original strand, 12525747 - 12525873
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||| |||    
T  12525747 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaaatgtgtaattaatttataataatgtcaaacacagtttcattttatgg 12525844  T
Q  403 taataatt-ccttttataatatgcttaac 430  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12525845 taataattcccttttatgatatgcttaac 12525873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 461
Target Start/End: Original strand, 5323424 - 5323585
Alignment:
Q  299 gagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5323424 gagcactgattaagaatataaaaaaggaaattatata--gtaattaaagcattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcctttt 5323521  T
Q  399 gtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
     ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||  || |||||||||| ||| |||||||    
T  5323522 atggtaataattcccttttatggtatgcgtaaccggtgccctggaggcaccgattaacatgacc 5323585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Original strand, 20897974 - 20898075
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| |    
T  20897974 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttat 20898071  T
Q  401 ggta 404  Q
    ||||    
T  20898072 ggta 20898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21878507 - 21878398
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |    
T  21878507 gcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 21878410  T
Q  401 ggtaataattcc 412  Q
    ||||||||||||    
T  21878409 ggtaataattcc 21878398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34477710 - 34477609
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| |    
T  34477710 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttat 34477613  T
Q  401 ggta 404  Q
    ||||    
T  34477612 ggta 34477609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 25165569 - 25165413
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || ||    
T  25165569 tggttaaggatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgata 25165472  T
Q  405 ataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| |  || ||  ||||||||||||| |||||    
T  25165471 ataattctcttttacgatatgcttaaccaatgccctgggagcaccggttagcaggaccc 25165413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 307 - 435
Target Start/End: Original strand, 9661018 - 9661145
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||    
T  9661018 gttaaggatatgaaaaaagaaattacataa--tagttaatgcattgaaattgtataattaatttaaaataaagttaaaagcagtttccttttatggtaat 9661115  T
Q  407 aattcc-ttttataatatgcttaaccagta 435  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9661116 aattccattttataatatgtttaatcagta 9661145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 306 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34396682 - 34396596
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  34396682 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 34396596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11115255 - 11115125
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |    
T  11115255 gcactggttaaggatataaaaaaggaaattatataa--tagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa--tcaaaaatagttttcttttat 11115160  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  11115159 ggtaataattcccttttatgatatgtttaaccagt 11115125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23629742 - 23629641
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  23629742 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattactttataataaagtcaaaaacaatttcc 23629645  T
Q  395 tttt 398  Q
    ||||    
T  23629644 tttt 23629641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 961051 - 961171
Alignment:
Q  317 tgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattc-cttt 415  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  961051 tgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacaatttccttttatgataataattctcttt 961148  T
Q  416 tataatatgcttaaccagtatcc 438  Q
    |||  ||||||||||| ||||||    
T  961149 tatggtatgcttaacccgtatcc 961171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 412
Target Start/End: Original strand, 28225252 - 28225355
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28225252 ggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatata--gtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaa 28225348  T
Q  406 taattcc 412  Q
    |||||||    
T  28225349 taattcc 28225355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 433
Target Start/End: Original strand, 29978259 - 29978389
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||| |||  |||| ||    
T  29978259 cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtatttaatgtattgaaattatgtaatatatttataataaagtcaaaaacagtttaattttatg 29978356  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccag 433  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29978357 gtaataattcccttttatgatatgcttaaccag 29978389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Original strand, 13529481 - 13529554
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 376  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13529481 gcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 13529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 463
Target Start/End: Original strand, 31280362 - 31280502
Alignment:
Q  316 atgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattccttt 415  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| | ||||||||||        
T  31280362 atgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataatgtcaaaaacggtttccttttatagtaataattc---- 31280455  T
Q  416 tataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||  |||||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  31280456 tatggtatgcttaacgagt-gcccggaggcaccggttagcaggaccca 31280502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 2516353 - 2516309
Alignment:
Q  463 aatctttatttataatgacttcatcaatattaataaatttacttg 507  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2516353 aatctttatctataatgacattatcaatattaataaatttacttg 2516309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 30675738 - 30675574
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  30675738 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 30675641  T
Q  395 ttttgtggtaataattccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  || || | |||||||||||| ||||    
T  30675640 ttttatggtaataattccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggacc 30675574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 9063219 - 9063052
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||     
T  9063219 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaatcgtgcaattaatttataataaagtcaaaaacaatttt 9063122  T
Q  394 cttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||||    
T  9063121 cttttatggtaataattcccttttgtgatatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcaggaccc 9063052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 294 - 462
Target Start/End: Original strand, 4648213 - 4648380
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  4648213 tcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttc 4648310  T
Q  394 cttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
     |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  4648311 ttttgatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtatcttgggagcaccggttagcatgaccc 4648380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 33357295 - 33357161
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  33357295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 33357198  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaac 430  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33357197 ttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaac 33357161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 301 - 464
Target Start/End: Original strand, 34228708 - 34228870
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  34228708 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 34228805  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||    
T  34228806 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccaa 34228870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 168487 - 168652
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  168487 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 168584  T
Q  396 tttgtggtaataattcc-ttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |  || || |||||||||||||| |||||    
T  168585 tttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 168652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 27988664 - 27988500
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  27988664 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcct 27988567  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  27988566 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt-gcccgggggcaccggttagcaggaccc 27988500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28045966 - 28045802
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  28045966 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcct 28045869  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  28045868 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt-gcccgggggcaccggttagcaggaccc 28045802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 42035147 - 42035013
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  42035147 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttc 42035050  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaac 430  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  42035049 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 42035013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16888704 - 16888543
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  16888704 gcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 16888607  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||    
T  16888606 ggtaataattctcttttgtggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccca 16888543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 293 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29444308 - 29444140
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  29444308 ctcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaacgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttt 29444211  T
Q  393 ccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||    
T  29444210 tcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccgattaacaggaccc 29444140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 302 - 431
Target Start/End: Original strand, 36730471 - 36730599
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  36730471 cactagttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 36730568  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaacc 431  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36730569 gtaataattctcttttatagtatgcttaacc 36730599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 301 - 455
Target Start/End: Original strand, 21595872 - 21596025
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  21595872 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--ggagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 21595969  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  21595970 ggtattaattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacactggttagc 21596025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 302 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2805419 - 2805267
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || ||||||||| ||    
T  2805419 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaacctataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 2805322  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  2805321 gtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagc 2805267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Original strand, 11112666 - 11112825
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||    
T  11112666 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 11112763  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||  || || ||||| |||||||| |||||    
T  11112764 ataataattcacttttatggtatgcttaacctgtgccctgggggcactggttagcaggaccc 11112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4537909 - 4537744
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  4537909 ccggggcactggttaaggatataaaataggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 4537812  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||    
T  4537811 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccagaggcaccggttagcaggaccc 4537744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 303 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9537982 - 9537813
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||| |||| | |    
T  9537982 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaggagtttctttttatag 9537885  T
Q  403 taataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca-atctttatt 472  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9537884 taataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttagcaggacccatatctttatt 9537813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Original strand, 40831303 - 40831464
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  40831303 gcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttat 40831400  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  40831401 ggtaataattttcttttatagtatgcataatctgtaccctggagacaccggttagcaggaccca 40831464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 13643032 - 13643197
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  13643032 cccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaa-aaattcc 13643128  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatcc-aggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||    
T  13643129 ttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctagga-gcaccggttagcaggaccc 13643197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 13743457 - 13743622
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  13743457 cccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaa-aaattcc 13743553  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatcc-aggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||    
T  13743554 ttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctagga-gcaccggttagcaggaccc 13743622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16890634 - 16890527
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  16890634 gttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 16890537  T
Q  407 aattcctttt 416  Q
    ||||||||||    
T  16890536 aattcctttt 16890527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 302 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20831712 - 20831581
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| ||    
T  20831712 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaatagtataattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatg 20831615  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  20831614 gtaataattctcttttatggtatgcttaatcagt 20831581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 32113929 - 32114095
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt-cc 394  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  32113929 ccggagtattggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtaaaaaacagtttccc 32114026  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt-atccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  32114027 ttttatgataataattcccttttatagtatgtttaaccagtgctcca-gagccaccggttagcaggaccc 32114095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 308 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 7304671 - 7304517
Alignment:
Q  308 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaata 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  7304671 ttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgaaaata 7304574  T
Q  408 attc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||   | || |||||||||||| | ||||||    
T  7304573 attctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagtaggaccca 7304517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16394227 - 16394058
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  16394227 cccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataa--tagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 16394130  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaat 465  Q
    |||| || ||||||||| |||||||  |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  16394129 ttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggacccaat 16394058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 9254067 - 9253908
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |||||    
T  9254067 cccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataataaagtcaaaaacagtttcc 9253971  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||  | ||||||||||||||    
T  9253970 ttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggggcaccggttagca 9253908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 302 - 459
Target Start/End: Original strand, 37373232 - 37373388
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| ||||| ||    
T  37373232 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcgaaaacagttttcttttatg 37373329  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatga 459  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||||    
T  37373330 gtaataattccctttcatggtatgcttaacccgtgtcccggagacaccgattaacatga 37373388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Original strand, 12203885 - 12204012
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||    
T  12203885 ggttaagggtatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataa 12203982  T
Q  406 taatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  12203983 taattcccttttatggtatgctgaaccagt 12204012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 306 - 434
Target Start/End: Original strand, 12448313 - 12448440
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||    
T  12448313 ggttaagggtatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataa 12448410  T
Q  406 taatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  12448411 taattcccttttatggtatgctgaaccagt 12448440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 465
Target Start/End: Original strand, 43119243 - 43119405
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  43119243 gcactgattaaagatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttat 43119340  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaat 465  Q
    ||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  43119341 ggtgataattctcttttatggtatgcttaaccaatggcccgg-ggcaccggttagcaggacccaat 43119405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 301 - 456
Target Start/End: Original strand, 28626794 - 28626947
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |    
T  28626794 gcaccggttaaggatgtgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 28626891  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  28626892 gataataattcccttttatggtatgcttaatcagtgtccggga-gcaccggttagca 28626947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3930393 - 3930261
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  3930393 gcactagttaataatatgaaagaggaaattatata--gtagttaatgcattgaagttgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcctttttt 3930296  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3930295 gataataatttccttttatgatatgcttaaccagt 3930261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 463
Target Start/End: Original strand, 29235254 - 29235422
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||| |  |||    
T  29235254 tcccggagcattgattaaggatataaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattaaatttgtgtaattaatttataataaaatcaaaaataggttc 29235351  T
Q  394 cttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||    
T  29235352 cttttatgataataatttccttttataggatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcatgaccca 29235422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 431
Target Start/End: Original strand, 16785112 - 16785241
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  16785112 gcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagc--agttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 16785209  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaacc 431  Q
      ||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  16785210 aataataattctcttttatggtatgattaacc 16785241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 412
Target Start/End: Original strand, 10870382 - 10870487
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    
T  10870382 tggttaatgatataaaaaagaaaattatataa--tagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggta 10870479  T
Q  405 ataattcc 412  Q
    ||||||||    
T  10870480 ataattcc 10870487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 9278239 - 9278312
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 377  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9278239 cactcgttaaagatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 9278312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 309 - 392
Target Start/End: Original strand, 34192809 - 34192890
Alignment:
Q  309 taaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  34192809 taagaatatgaaaaaggaaattatatac--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataattt 34192890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42433700 - 42433597
Alignment:
Q  304 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggt 403  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| ||||    
T  42433700 ctggttaagcatactaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagttttcttttatggt 42433604  T
Q  404 aataatt 410  Q
    |||||||    
T  42433603 aataatt 42433597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 398
Target Start/End: Original strand, 17467630 - 17467724
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  17467630 cactagttaatgatatgaaaaaggaaattatgca--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaaatcaaaaacaatttcctttt 17467724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24843393 - 24843278
Alignment:
Q  349 attgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcac 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||||| |||||| | ||| ||||    
T  24843393 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttccttttatgacaataattctcttttatggtatgcttaatcagtattcggga-gcac 24843295  T
Q  448 cggttagcatgacccaa 464  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24843294 cggttagcaggacccaa 24843278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 377
Target Start/End: Original strand, 10618044 - 10618118
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  10618044 gcacaggttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcaattaaattgtgtaattaattgataataa 10618118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Original strand, 12652653 - 12652707
Alignment:
Q  298 ggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12652653 ggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaa 12652707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 412
Target Start/End: Original strand, 39406905 - 39406977
Alignment:
Q  340 agttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattcc 412  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  39406905 agttaatgcgttaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcc 39406977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 22956761 - 22956840
Alignment:
Q  333 atatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattcc 412  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  22956761 atatggtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaaaaattcc 22956840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 22451847 - 22451916
Alignment:
Q  340 agttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  22451847 agttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaatagcttccttttatggtaataatt 22451916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 30933452 - 30933387
Alignment:
Q  332 tatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  30933452 tatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagttaaaaacatttttctttt 30933387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36923823 - 36923789
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36923823 gcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatata 36923789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33124650 - 33124581
Alignment:
Q  305 tggttaaggata-tgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaa-ttgtgtaattaatttataa 374  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33124650 tggttaaggatacttaaaaaggaagttatata--gtagttattgcattgaaaattgtgtaatcaatttataa 33124581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 13661828 - 13661994
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||    
T  13661828 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcc 13661925  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  13661926 ttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 13661994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 34650993 - 34650833
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  34650993 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 34650896  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  34650895 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 34650833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 35504399 - 35504241
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||    
T  35504399 cactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttcccttttatg 35504302  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    | ||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||    
T  35504301 gcaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgtcc-gggggcaccggttagcaggaccc 35504241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 306 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21547549 - 21547393
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||  | |||    
T  21547549 ggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttaagttaa 21547452  T
Q  406 taattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||||| | |||||  ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  21547451 taattctcatttatggtatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcaggaccca 21547393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Original strand, 35132549 - 35132707
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||| ||    
T  35132549 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttc-tttatg 35132645  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||| |  || || |||||||||||||| |||||    
T  35132646 gtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 35132707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 8787359 - 8787525
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  8787359 cccggggcattggttaagggtatgaaaaatgaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttcc 8787456  T
Q  395 ttttgtggtaataattcc-ttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  || || |||||||||||||| |||||    
T  8787457 ttttatgataataattccattttatggtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 8787525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 308 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 40564557 - 40564404
Alignment:
Q  308 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaata 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  40564557 ttaaggatttgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttttttttatggtaata 40564460  T
Q  408 attc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| || ||    |||||||||||||| |||||    
T  40564459 attctcttttatggtatgcttaaccaataccccaagggcaccggttagcaggaccc 40564404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 298 - 434
Target Start/End: Original strand, 12506319 - 12506454
Alignment:
Q  298 ggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttt 397  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12506319 ggagcactcgttaagagtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttt 12506416  T
Q  398 tgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    | | |||||||||| |||||||   |||||||||||||    
T  12506417 tatagtaataattctcttttatggaatgcttaaccagt 12506454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 302 - 430
Target Start/End: Original strand, 20175254 - 20175381
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  20175254 cactggttaaaaatataaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatg 20175351  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaac 430  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20175352 ataataattcccttttataatatgcttaac 20175381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 459
Target Start/End: Original strand, 6283583 - 6283745
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  6283583 ccggggcactagttaaagatatgaaaaagaaaattatataa--taattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttct 6283680  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatga 459  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||    
T  6283681 tttatggtaataattcatttttatggtatgcttaaccagtgccctaggggcaccggttagcatga 6283745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11958133 - 11957967
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  11958133 cccggggcacaggttaaagatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcaatgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 11958036  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||    
T  11958035 ttttatggtaataattcccttttatggcatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 11957967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10054518 - 10054400
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  10054518 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataa--taattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg-tcaaaacagtttcc 10054422  T
Q  395 ttttgtggtaataattcctttt 416  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10054421 ttttatggtaataattcctttt 10054400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 414
Target Start/End: Original strand, 13470177 - 13470288
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  13470177 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaataatata--gtagtcaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 13470274  T
Q  401 ggtaataattcctt 414  Q
    ||||||||| ||||    
T  13470275 ggtaataatacctt 13470288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 309 - 434
Target Start/End: Original strand, 11846106 - 11846230
Alignment:
Q  309 taaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat-a 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||| ||||||| |    
T  11846106 taaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagtagtttccttttatggtaataa 11846203  T
Q  408 attccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||    
T  11846204 atcccttttatagtatgcttaaccagt 11846230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 338 - 462
Target Start/End: Original strand, 10956013 - 10956137
Alignment:
Q  338 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtat 436  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  10956013 gtagttaatgcattgaaattgt-taattaatttataacaaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaaccagtac 10956111  T
Q  437 ccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    || | | | ||||||||||| |||||    
T  10956112 cccgaatgtaccggttagcaagaccc 10956137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19647823 - 19647717
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||    
T  19647823 ccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcataaacagtttcct 19647726  T
Q  396 tttgtggta 404  Q
    ||| |||||    
T  19647725 tttatggta 19647717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 303 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9721765 - 9721658
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||     
T  9721765 actggttaagaatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatga 9721668  T
Q  403 taataattcc 412  Q
    ||||||||||    
T  9721667 taataattcc 9721658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 404
Target Start/End: Original strand, 10069989 - 10070095
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||     
T  10069989 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataataaagtcaaaaacagtttct 10070085  T
Q  395 ttttgtggta 404  Q
    |||| |||||    
T  10070086 ttttatggta 10070095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39067095 - 39066987
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  39067095 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatataat-tagttaatatattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatatccttttatg 39066997  T
Q  402 gtaataattc 411  Q
    ||||||||||    
T  39066996 gtaataattc 39066987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 303 - 443
Target Start/End: Original strand, 31909659 - 31909793
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||     ||     
T  31909659 actggttaaggatattaaaagggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaacagtttcc-----tga 31909751  T
Q  403 taataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggag 443  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  31909752 taataattttcttttatggtatgcttaaccagtatcccggag 31909793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 308 - 463
Target Start/End: Original strand, 40057340 - 40057494
Alignment:
Q  308 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||| || ||| ||||| | ||||||    
T  40057340 ttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttagtgcattgaaatagtataattaatttataataaaatcaaaagcagttttcttttatagtaata 40057437  T
Q  408 att-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
     || |||||||| || || |||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40057438 tttcccttttatgatgtgtttaaccagtgacctcgaggcaccggttagcaggaccca 40057494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Original strand, 4837277 - 4837357
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 377  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837277 cccggggcaccggttaagaatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 4837357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 462
Target Start/End: Original strand, 4268623 - 4268747
Alignment:
Q  338 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtat 436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |    
T  4268623 gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaaataaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatgcttaacccgtgt 4268721  T
Q  437 ccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||    
T  4268722 ccagggggcaccggttagtatgaccc 4268747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 425
Target Start/End: Original strand, 39069407 - 39069527
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa-ggttaaaaacaatttccttttg 399  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||  || |||||||||||||||||     
T  39069407 gcactggttaagggtatgaaaa-ggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaatta---tataataattgtgaaaaacaatttcctttta 39069500  T
Q  400 tggtaataattc-cttttataatatgc 425  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39069501 tggtaataattctcttttatgatatgc 39069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2619716 - 2619635
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaa 385  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2619716 cacttgttaaggatatgaaaaagaaaattattta--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaa 2619635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19436995 - 19436890
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||  |||| ||    
T  19436995 cactcgttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtggttaaagcattgaaattgtataattaatttat-ataaagttaaaaatagttt-tttttatg 19436900  T
Q  402 gtaataattc 411  Q
    ||||||||||    
T  19436899 gtaataattc 19436890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Original strand, 6284822 - 6284892
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6284822 cactggttaaggatactaaaaaggaaattatata--gtaattaatgtattgaaattgtataattaatttataa 6284892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Original strand, 15227765 - 15227925
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  15227765 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 15227862  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  15227863 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaagaccc 15227925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 47010014 - 47010179
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  47010014 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaacagtttcct 47010111  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt-atccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  47010112 tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccagg-ggcaccggttagcaggaccc 47010179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 301 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3784873 - 3784720
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  3784873 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacaattttcttttat 3784776  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  3784775 ggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgtcccgggggcaccggttagc 3784720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 307 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19031969 - 19031815
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  19031969 gttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaaaacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 19031872  T
Q  407 aa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    || |||||||||| |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  19031871 aatttccttttatgatatgcttaacccgtaccccggagacaccggttagcaggaccc 19031815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 29657791 - 29657957
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  29657791 cccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 29657888  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  29657889 ttttttggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccggttagcaggaccc 29657957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14350443 - 14350279
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14350443 cccggagcaccggttaagggtatgaaaaaggaaattatatt--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacaatttcc 14350346  T
Q  395 ttttgtggtaataattccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  14350345 ttttatggtaataattcccttaatggtatgcttaaccagtgccccgg-ggcaccggttagcaggaccc 14350279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 461
Target Start/End: Original strand, 38162871 - 38163035
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  38162871 ccggggcactggttaagggtatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 38162968  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  || || |||||||||||||| ||||    
T  38162969 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacc 38163035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30294547 - 30294412
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||     
T  30294547 cccggagcattggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttct 30294450  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaacc 431  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  30294449 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 30294412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 51065907 - 51065748
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  51065907 cactggttaaggatatgaaaaagtaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatg 51065810  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||    
T  51065809 gtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 51065748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 5694342 - 5694507
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  5694342 ccggggcactggttaaggatataaaaagggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 5694439  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||   | || |||||||||||||| |||||    
T  5694440 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagcaggaccc 5694507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 18043183 - 18043348
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  18043183 ccggggcactggttaagggtataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttct 18043280  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  18043281 tttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 18043348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12072228 - 12072068
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |    
T  12072228 cccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatgta--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttc 12072131  T
Q  395 ttttgtggtaataattcc-ttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  12072130 ttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagca 12072068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24178629 - 24178461
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||    
T  24178629 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataataaagtcaaaagcagtttcc 24178532  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||  |||||||    
T  24178531 ttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagccggacccaa 24178461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 42770156 - 42769996
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  42770156 cccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttcc 42770059  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  42770058 ttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagca 42769996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 435
Target Start/End: Original strand, 3097679 - 3097818
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  3097679 cccggagtcctggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttc 3097776  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagta 435  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3097777 ttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagta 3097818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9266888 - 9266727
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  9266888 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtatttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaacagtttccttttat 9266791  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt-atccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9266790 ggtaataattcgcttttatggtatacttaaccagtgctcca-gaagcaccggttagcaggaccca 9266727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35985787 - 35985649
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  35985787 cccggatcactgtttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtgaaaaacagtttcc 35985690  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  35985689 ttttatggtaataattcccatttatagtatacttaaccagt 35985649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 308 - 438
Target Start/End: Original strand, 6770370 - 6770499
Alignment:
Q  308 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| || |||||    
T  6770370 ttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatgataata 6770467  T
Q  408 att-ccttttataatatgcttaaccagtatcc 438  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6770468 attcccttttatgatatgcttaaccagtatcc 6770499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 431
Target Start/End: Original strand, 48071510 - 48071637
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  48071510 actggttaaggatatgtaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgg 48071607  T
Q  403 taataatt-ccttttataatatgcttaacc 431  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  48071608 taataattatcttttatagtatgcttaacc 48071637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17333442 - 17333284
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  17333442 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaacagtttccttttat 17333345  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    | ||||| || ||||||||  ||  |||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||    
T  17333344 gataatacttcccttttatggta--cttaaccaatgccccggaggcaccggttagcaggaccc 17333284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 293 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38702101 - 38701937
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  38702101 ctcccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttt 38702004  T
Q  393 ccttttgtggtaataattccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
     ||||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||  || |  |||||||||||||| |||||    
T  38702003 tcttttatggtaataattc---ttatggtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccc 38701937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 308 - 434
Target Start/End: Original strand, 45431311 - 45431436
Alignment:
Q  308 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  45431311 ttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaata 45431408  T
Q  408 attc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  45431409 attctcttttatgatatacttaaccagt 45431436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 308 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 50128325 - 50128172
Alignment:
Q  308 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaata 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  50128325 ttaaggatatgaaaaagaaaattacata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagtttcattttatggtaata 50128228  T
Q  408 attc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||  ||  |||||||||||| |||||    
T  50128227 attctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccagaaacaccggttagcaggaccc 50128172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Original strand, 29210434 - 29210540
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  29210434 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcct 29210531  T
Q  396 tttgtggta 404  Q
    ||| |||||    
T  29210532 tttatggta 29210540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 303 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 51368943 - 51368813
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| | |    
T  51368943 actggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtagttaatttataataatgtcaaaaatagtttccttttatag 51368846  T
Q  403 taataattcc-ttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  51368845 taataattccattttatggtatgcttaaccagt 51368813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36446484 - 36446353
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  36446484 gcactggttaagaatat-aaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 36446388  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
     ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  36446387 agtaataattcccttttatggtatgtttaaccagt 36446353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23473620 - 23473495
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||    
T  23473620 tggttaaggatatgaaaaaggagattatatagc--agttaatgtattgaaattgtataattaatttataataaagtttaaagcagtttccttttatggta 23473523  T
Q  405 ataa-ttccttttataatatgcttaacc 431  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23473522 ataatttctttttataatatgcttaacc 23473495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 302 - 434
Target Start/End: Original strand, 43286749 - 43286880
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |     
T  43286749 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgttttgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttata 43286846  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43286847 gtaataattctcttttatggtatgcttaaccagt 43286880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 293 - 463
Target Start/End: Original strand, 30657626 - 30657789
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||        
T  30657626 ctcccggggcactagttaagcatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaaca---- 30657719  T
Q  393 ccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
       ||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  30657720 --gtttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgattagcaggaccca 30657789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Original strand, 41730331 - 41730495
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata-tcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttg 399  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  41730331 gcacgggttaagaatatgaaaaaagaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcctttta 41730430  T
Q  400 tggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    || |||||||| ||||||||  |||||||||| |||  ||  || |||| |||||||| ||||||    
T  41730431 tgataataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccagaagcactggttagcaggaccca 41730495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 307 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 47532824 - 47532669
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  47532824 gttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa-tgataataaagtcaaaaataatttccttttataataat 47532728  T
Q  407 aatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |  || | || |||||||||||| |||||||    
T  47532727 aattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgaagacaccggttagcaagacccaa 47532669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 307 - 434
Target Start/End: Original strand, 12306950 - 12307075
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||    
T  12306950 gttaatgatacgaaaaagaaaattatat---gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattccttttatggtaat 12307046  T
Q  407 aattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12307047 aattctcttttatggtatgcttaaccagt 12307075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Original strand, 29683215 - 29683354
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaa-ggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  29683215 cccggggcactggttaaagatataaaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaatcgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttc 29683312  T
Q  394 cttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
     |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  29683313 attttatagtaataattcacttttatggtatgcttaaccagt 29683354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 411
Target Start/End: Original strand, 38335196 - 38335303
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||    
T  38335196 cactggttaaagatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgtaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatg 38335293  T
Q  402 gtaataattc 411  Q
     |||||||||    
T  38335294 ataataattc 38335303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Original strand, 13961232 - 13961369
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  13961232 cccggggcacgggttaaggatataaaaaaa-aaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttca 13961328  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  13961329 ttttatggtaataattttcttttatggtatgcttaaccagt 13961369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8473070 - 8472942
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |  ||    
T  8473070 tggttaaggatataaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttataata 8472973  T
Q  405 ataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  8472972 ataattctcttttatggtatacttaaccagt 8472942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 293 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48383279 - 48383141
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||     |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||| |||    
T  48383279 ctcccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatatgaa--agttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttt 48383182  T
Q  393 ccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaacca 432  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  48383181 ccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacca 48383141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 416
Target Start/End: Original strand, 52749632 - 52749741
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||    
T  52749632 tggttaaagatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgtattgaaattgtatactaaatttacaataaagttaaaaacaatttttttttatggta 52749729  T
Q  405 ataattcctttt 416  Q
    ||||||||||||    
T  52749730 ataattcctttt 52749741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 305 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45449400 - 45449272
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  45449400 tggttaaagatataaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattaaaatagtgtaattaaattataataaagtcaaaagcagtttccttttatggta 45449303  T
Q  405 ataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  45449302 ataattgccttttatggtatgtttaaccagt 45449272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15282672 - 15282591
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaa 386  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15282672 actggttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaa 15282591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Original strand, 26228213 - 26228293
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 377  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26228213 cccgaagcactggttaaggagataaaaaatgaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataa 26228293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 398
Target Start/End: Original strand, 39497326 - 39497428
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||     
T  39497326 tcccagagcattgattaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattaaaattatataattaatttataataaagtcaaaaataatttt 39497423  T
Q  394 ctttt 398  Q
    |||||    
T  39497424 ctttt 39497428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 460
Target Start/End: Original strand, 52431636 - 52431765
Alignment:
Q  332 tatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt--ccttttataatatgcttaa 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| |||||||||||  | |||| |  |||||||||    
T  52431636 tatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaattttcttttatggtaataatttcctttttttggtatgcttaa 52431734  T
Q  430 ccagtatccaggaggcaccggttagcatgac 460  Q
    |||||  ||  | | ||||||||||||||||    
T  52431735 ccagtgccccagggacaccggttagcatgac 52431765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 303 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35700808 - 35700680
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||  |||| ||     
T  35700808 actggttaaggatactaaaaaggaaattataca--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataaaaagtcaaaaaaaaattt--ttttatga 35700713  T
Q  403 taataa-ttccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  35700712 taataacttccttttttgatatccttaaccagt 35700680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 3838936 - 3838777
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||  |||| ||    
T  3838936 cactggttaagcatactaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaatttttttttatg 3838840  T
Q  402 gtaataatt--ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    | |||||||  | |||| || ||||||||| ||||| || |  |||||| |||||||| ||||    
T  3838839 gcaataatttcctttttttagtatgcttaatcagtaccccgagggcaccagttagcataaccc 3838777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37315409 - 37315315
Alignment:
Q  319 aaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattcctttt 416  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| ||| ||| ||||| || |||||||| |||||    
T  37315409 aaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa-aaagtcaaagacagttttcttttatgctaataatttctttt 37315315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 465
Target Start/End: Original strand, 39081827 - 39081989
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||| |    
T  39081827 gcactggttaagcatactaaaaatgaaattatatac--tagttaatgtattgaaattttataattaatttataa-aatattaaaagcagtttcattttat 39081923  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaat 465  Q
    | |||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |  || || |||||||||||||| |||||    
T  39081924 gataataattttcttttttaatatgcttaatcagtacctcgggggtaccggttagcatgatccaat 39081989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39912439 - 39912368
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39912439 gcactgattaaggatataaaaagggaaattatatac--tagttaatgcattgaaattgtgtgattaatttataa 39912368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 416
Target Start/End: Original strand, 30217786 - 30217901
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaa--ggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||    
T  30217786 gcactggctaaggatatgaaaaaaagggaattagaga--gtagttaatgcatttaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaatagttttctttt 30217883  T
Q  399 gtggtaataattcctttt 416  Q
     ||||||||||| |||||    
T  30217884 atggtaataatttctttt 30217901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19011163 - 19011108
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcatt 351  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19011163 tcccggggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcatt 19011108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Original strand, 28481873 - 28481940
Alignment:
Q  304 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28481873 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatacag------taatgcattaaaattgtgtaattaatttataataa 28481940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 374
Target Start/End: Original strand, 37503260 - 37503311
Alignment:
Q  321 aaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37503260 aaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa 37503311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19011092 - 19011057
Alignment:
Q  338 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19011092 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 19011057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10976062 - 10976008
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaatt 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10976062 gcacttgttaaggatatgaaaaaggagattatata--gtagttaatgcattaaaatt 10976008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14881124 - 14881092
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881124 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 14881092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14881086 - 14881036
Alignment:
Q  356 ttgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  14881086 ttgtataattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaat 14881036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38595792 - 38595751
Alignment:
Q  422 atgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  38595792 atgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccca 38595751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 52520701 - 52520867
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  52520701 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 52520798  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  52520799 ttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 52520867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Original strand, 272240 - 272407
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  272240 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttcc 272337  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||  || || |||||||||||||| ||||||    
T  272338 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcggtgccccgggggcaccggttagcaggaccca 272407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Original strand, 46352654 - 46352821
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||    
T  46352654 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattataca--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcc 46352751  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||    
T  46352752 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccca 46352821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 302 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 10617443 - 10617282
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  10617443 cactgattaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatg 10617346  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  || || |||||||||||||| |||||||    
T  10617345 gtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacccaa 10617282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 455
Target Start/End: Original strand, 49893351 - 49893510
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  49893351 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataataaagtcaaaaacagtttcc 49893448  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||  || || |||||||||||||    
T  49893449 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccggttagc 49893510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 303 - 462
Target Start/End: Original strand, 4168211 - 4168369
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||    
T  4168211 actggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgg 4168308  T
Q  403 taataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||    
T  4168309 taataattctcttttatggtatgcttaacccgtaccccgggggcaccggttagcaggaccc 4168369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 39074439 - 39074604
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  39074439 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg-tcaaaacagtttcc 39074535  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| |||||    
T  39074536 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccc 39074604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 301 - 455
Target Start/End: Original strand, 858615 - 858768
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  858615 gcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 858712  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  || || |||||||||||||    
T  858713 ggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagc 858768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41554106 - 41553993
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  41554106 cccggtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 41554009  T
Q  395 ttttgtggtaataatt 410  Q
    |||| |||||||||||    
T  41554008 ttttatggtaataatt 41553993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 43786892 - 43787057
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  43786892 ccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttcct 43786989  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  43786990 tttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 43787057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 48725297 - 48725429
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  48725297 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 48725394  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  48725395 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt 48725429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 42964414 - 42964249
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  42964414 ccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttct 42964317  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatc-caggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| |||||    
T  42964316 tttatagtaataattcacttttatgatatgcttaaccagtgtctcagg-gacaccggttagcaggaccc 42964249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 301 - 418
Target Start/End: Original strand, 2119457 - 2119571
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  2119457 gcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgagtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttat 2119554  T
Q  401 ggtaataattccttttat 418  Q
     |||||||||||||||||    
T  2119555 -gtaataattccttttat 2119571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 18014692 - 18014858
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  18014692 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagtaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcc 18014789  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  || || |||||| ||||||| |||||    
T  18014790 ttttatgataataatttccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccagttagcaagaccc 18014858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 49529435 - 49529294
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata-tcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  49529435 cccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatactagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacattttc 49529336  T
Q  394 cttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  49529335 cttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagt 49529294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 302 - 464
Target Start/End: Original strand, 7468438 - 7468597
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| ||    
T  7468438 cactggttaaggaaatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatg 7468535  T
Q  402 gtaataattccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
     ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  7468536 ataataatcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgga-gcaccggttagcaggacccaa 7468597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43269903 - 43269739
Alignment:
Q  297 cggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||    
T  43269903 cggagcactggttaaggatatgaaaagggaaattacata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaacacagtttcctt 43269806  T
Q  397 ttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    || | |||||||||  | |||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  43269805 ttatagtaataattatcctttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 43269739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 53489990 - 53489854
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  53489990 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 53489893  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaacca 432  Q
    |||| || |||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  53489892 ttttatgataataattctattttatggtatgcttaacca 53489854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 303 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 2938198 - 2938040
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||    
T  2938198 actggttaaagatataaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcactgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacaatttcattttatgg 2938101  T
Q  403 taataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| |||| || |  |||||||||||||| |||||    
T  2938100 taataattcacttttatggtatgcttaacgagtaccccgagggcaccggttagcaggaccc 2938040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 456
Target Start/End: Original strand, 22248912 - 22249066
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  22248912 gcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttattgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 22249009  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||  || |||||||||||||    
T  22249010 ggtaataattcccttttatagtatgcttgaccaataccctagaagcaccggttagca 22249066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 434
Target Start/End: Original strand, 20924013 - 20924150
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  20924013 ccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataatatcaaaaacagtttcct 20924110  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||  ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  20924111 tttaaggtaataattctcttttatggtatacttaaccagt 20924150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40362745 - 40362608
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||    
T  40362745 ccggggcactgattaaggatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttct 40362648  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40362647 tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagt 40362608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 456
Target Start/End: Original strand, 41304026 - 41304183
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  41304026 ccggggcagtggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaat--tgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcct 41304121  T
Q  396 tttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |  || |||| ||||||||||||    
T  41304122 tttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccaatgccccggagacaccggttagca 41304183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 42548121 - 42548253
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |    
T  42548121 gcactgcttaaagatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttcattttat 42548218  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  42548219 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt 42548253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 434
Target Start/End: Original strand, 2505379 - 2505507
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  2505379 tggttaaagatatgaaaaaggaaattatata--gtagttagtgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaatagtttccttttatggta 2505476  T
Q  405 ataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  2505477 ataattcccttttatggtatgtttaaccagt 2505507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 456
Target Start/End: Original strand, 13159929 - 13160076
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| || ||  ||||||    
T  13159929 gttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctattacggtaat 13160026  T
Q  407 aa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    || ||| ||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  13160027 aatttctttttatggtatgcttaatcagtatccacga-gcaccggttagca 13160076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 461
Target Start/End: Original strand, 33140940 - 33141070
Alignment:
Q  332 tatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaac 430  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  33140940 tatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaat 33141039  T
Q  431 cagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  33141040 cagtaccccggaagcaccggttagcaagacc 33141070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 50359346 - 50359195
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  50359346 gcactggttaaggttaagaaaaaaaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgggtaattaatatataataaagtcaaaaacagttttcttttgt 50359249  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggtta 453  Q
    ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  50359248 ggtaataattatcttctatggtatgcttaaccagtgtcccggaagcaccggtta 50359195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 50395721 - 50395563
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  50395721 cactggttagggatatgaaaaagaaaattataca--gtagttaatgcatagaaattgtgtaattaattgataataaag-tcaaaacaatttccttttatg 50395625  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||  | |||| ||||| |||||| |||||    
T  50395624 gtaataattctcttttatgatatgattaatcagtacaccggagacaccgattagcaggaccc 50395563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 339 - 463
Target Start/End: Original strand, 6842681 - 6842806
Alignment:
Q  339 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||  |    
T  6842681 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgcc 6842780  T
Q  438 caggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||    
T  6842781 ccgggggcagcggttagcaggaccca 6842806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 429
Target Start/End: Original strand, 29241669 - 29241790
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| || ||||    
T  29241669 gttaaggatatgaaaatggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattctttttatgataat 29241766  T
Q  407 aattcc-ttttataatatgcttaa 429  Q
    |||||| ||||||| |||||||||    
T  29241767 aattccgttttatagtatgcttaa 29241790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41993782 - 41993626
Alignment:
Q  298 ggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttt 397  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41993782 ggagcattcgttaagtatattaaaaatgaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttt 41993685  T
Q  398 tgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    | |  ||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||    
T  41993684 tat-ataataattctcttttatggtatgcttaactagtaccctaaaggcaccggttagca 41993626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11308369 - 11308241
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  | ||||| | ||||||||| ||    
T  11308369 cactgattaaggatgtgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaaatcaaaaatagtttccttttatg 11308272  T
Q  402 gtaataattccttttataatatgcttaacca 432  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11308271 gtaataattccttttatggtatgcttaacca 11308241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 412
Target Start/End: Original strand, 28139336 - 28139444
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||| ||    
T  28139336 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattaaata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagattccttttatg 28139433  T
Q  402 gtaataattcc 412  Q
    |||||||||||    
T  28139434 gtaataattcc 28139444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Original strand, 52246603 - 52246697
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52246603 ccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatata--gttgttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaattt 52246697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 307 - 431
Target Start/End: Original strand, 38852246 - 38852372
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatata-tcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||| || |||    
T  38852246 gttaaggatataaaaaatgaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttattttatgataa 38852345  T
Q  406 taattc-cttttataatatgcttaacc 431  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||    
T  38852346 taattcacttttatggtatgtttaacc 38852372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 426
Target Start/End: Original strand, 24488392 - 24488516
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||| |||| |||| |    
T  24488392 gcactggttaagaatgtaaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcatggaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttctttttat 24488489  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgct 426  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24488490 ggtaataattctcttttatgatatgct 24488516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 50299103 - 50298972
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||| |||| ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||     
T  50299103 actgattaaagatataaaaaggaaaattatata--gtagttaatgcactgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatga 50299006  T
Q  403 taataattc-cttttataatatgcttaaccagta 435  Q
    ||||||||| || ||||  ||| |||||||||||    
T  50299005 taataattcactcttatggtatacttaaccagta 50298972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 440
Target Start/End: Original strand, 31514829 - 31514954
Alignment:
Q  313 gatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttc 411  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||| | ||||||| |||    
T  31514829 gatatgaaaaataaaattatata--gtagttaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacaattt-tttttatagtaataatttc 31514925  T
Q  412 cttttataatatgcttaaccagtatccag 440  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31514926 cttttatagtatacttaaccagtacccag 31514954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 358
Target Start/End: Original strand, 2391633 - 2391688
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattg 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2391633 gcactggttaaggataagaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattg 2391688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 358
Target Start/End: Original strand, 2393394 - 2393449
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattg 358  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2393394 gcactggttaaggataagaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattg 2393449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 362
Target Start/End: Original strand, 52718186 - 52718252
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgta 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  52718186 ctcccgga-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattaaaattgtgta 52718252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 464
Target Start/End: Original strand, 21010041 - 21010181
Alignment:
Q  319 aaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttcctttta 417  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||     
T  21010041 aaaaaggaaattatata--gtagttaa--cattgaaattgtataattaatttataaaaag--tcaaaaaagtttctttttatggtaataacttccttttt 21010134  T
Q  418 taatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    |||||| |||||| | |||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  21010135 taatatccttaacaaatatccctggaacaccggttagcatgacccaa 21010181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 338 - 376
Target Start/End: Original strand, 6842604 - 6842642
Alignment:
Q  338 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6842604 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 463
Target Start/End: Original strand, 52552549 - 52552659
Alignment:
Q  352 gaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccgg 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||  |||  ||||||||| ||| || | || |||    
T  52552549 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtat-cttttatggtaataattctcttttatggtatatttaaccagtgtcc-ggggacatcgg 52552646  T
Q  451 ttagcatgaccca 463  Q
    |||||||||||||    
T  52552647 ttagcatgaccca 52552659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 336
Target Start/End: Original strand, 2362819 - 2362862
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatat 336  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362819 ctcccggtgcaatggttaaggatatgaaaaaggaaattatatat 2362862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 404
Target Start/End: Original strand, 2362880 - 2362958
Alignment:
Q  323 aggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||| ||| ||||| |||||    
T  2362880 aggaaattatatat---agttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagttttcttttatggta 2362958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20402512 - 20402466
Alignment:
Q  463 aatctttatttataatgacttcatcaatattaataaatttacttgca 509  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20402512 aatctttatgtataatgacctcaccaatattaataaatttaattgca 20402466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 372
Target Start/End: Original strand, 6842641 - 6842674
Alignment:
Q  339 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6842641 tagttaattcattgaaattgtgtaattaatttat 6842674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8803157 - 8803105
Alignment:
Q  196 taaaccgagaatttctacctcctaatttattacgaaccctagtttgtgagtta 248  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8803157 taaaccaaggatttctacctcttaatttactacggaccctagtttgagagtta 8803105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 474 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 53666470 - 53666434
Alignment:
Q  474 ataatgacttcatcaatattaataaatttacttgcat 510  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53666470 ataatgacatcatcaatattagtaaatttacttgcat 53666434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 465
Target Start/End: Original strand, 30486230 - 30486399
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||    
T  30486230 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagtcaaaaacagtttcc 30486327  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaat 465  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  30486328 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccaat 30486399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 561684 - 561524
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  561684 cccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttcc 561587  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  561586 ttttataataataattctcttttatggtatgcttaatcagtaccccggaggcaccggttagca 561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Original strand, 20552957 - 20553117
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  20552957 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttat 20553054  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||    
T  20553055 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 20553117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 293 - 462
Target Start/End: Original strand, 31438664 - 31438832
Alignment:
Q  293 ctcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  31438664 ctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattataca--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttt 31438761  T
Q  393 ccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || | |||||||||||| |||||    
T  31438762 ccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggaccc 31438832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Original strand, 4381815 - 4381953
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  4381815 cccggtgcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 4381912  T
Q  395 ttttgtggtaataattcc-ttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  4381913 ttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccagt 4381953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 296 - 463
Target Start/End: Original strand, 22887771 - 22887937
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22887771 ccggggcagtggttaaggatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcct 22887868  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||   | || ||||||| |||||||||||||    
T  22887869 tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccgattagcatgaccca 22887937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 3668272 - 3668113
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  3668272 cactggttaagggtatggaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatg 3668175  T
Q  402 gtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |  |||||||||||||| |||||    
T  3668174 gtaataatttccttttatagtatgtttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaagaccc 3668113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 307 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26387218 - 26387092
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26387218 gttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaat 26387121  T
Q  407 aatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  26387120 aattcccttttatggtatgcttaaccagt 26387092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 27856562 - 27856396
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  27856562 cccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcc 27856465  T
Q  395 ttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  || || |||| ||||||||| |||||    
T  27856464 ttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggaccc 27856396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 302 - 462
Target Start/End: Original strand, 22567629 - 22567788
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  22567629 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccttttatg 22567726  T
Q  402 gtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt-atccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22567727 gtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgctccagg-ggcaccggttagcaggaccc 22567788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 461
Target Start/End: Original strand, 2898090 - 2898256
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttc 393  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||     
T  2898090 tcccggaacactggttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttt 2898187  T
Q  394 cttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    ||| | |  ||||||||| |||||||  |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2898188 cttctatcataataattctcttttatggtatgtttaatcagtgtcccggaggcaccggttagcaggacc 2898256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 44587922 - 44588088
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  44587922 cccggggcaccggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaacagtttcc 44588019  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||  || || || ||||||||||| |||||    
T  44588020 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 44588088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 6580215 - 6580347
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  6580215 gcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttat 6580312  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  6580313 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt 6580347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 302 - 431
Target Start/End: Original strand, 43637191 - 43637319
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  43637191 cactggttaaggatatgaataaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttctttttatg 43637288  T
Q  402 gtaataa-ttccttttataatatgcttaacc 431  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  43637289 gtaataatttccttttacagtatgtttaacc 43637319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 301 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 8969567 - 8969413
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |    
T  8969567 gcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaatagtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttat 8969470  T
Q  401 ggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||  | ||||||||||||||    
T  8969469 ggtaataatttccttttatagtatgcttaactagtgcccctggggcaccggttagca 8969413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 22068485 - 22068320
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  22068485 cccggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattatata--gtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 22068389  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || || ||||||| |||||| |||||    
T  22068388 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccgattagcaggaccc 22068320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 431
Target Start/End: Original strand, 31390033 - 31390167
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  31390033 ccggggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcct 31390130  T
Q  396 tttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaacc 431  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  31390131 tttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacc 31390167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 307 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34442686 - 34442560
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  34442686 gttaaggatatgaaaaagaagattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaat 34442589  T
Q  407 aatt-ccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  34442588 aattcccttttatggtatgcttaaccagt 34442560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 32361035 - 32360866
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  32361035 cccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataa--tagttaatgcattgaaataatataattaattgataataaagtcaaaaacagtttcc 32360938  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaat 465  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  32360937 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggacccaat 32360866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5093703 - 5093583
Alignment:
Q  297 cggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctt 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  5093703 cggagcactagttaaggatatgaaaaaggaaattaaata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcaatttcctt 5093606  T
Q  397 ttgtggtaataa-ttccttttat 418  Q
    || || |||||| ||||||||||    
T  5093605 ttatgataataatttccttttat 5093583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 32860128 - 32860259
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  32860128 gcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtatttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttat 32860225  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
     |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32860226 -gtaataattctcttttatggtatgcttaaccagt 32860259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 297 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11021386 - 11021273
Alignment:
Q  297 cggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctt 396  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||    
T  11021386 cggagcactgattaaagatatgaaaaaagaaattatatg--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatatataataaagtcaaaaacagttttctt 11021289  T
Q  397 ttgtggtaataattcc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  11021288 ttgtggtaataattcc 11021273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 434
Target Start/End: Original strand, 1859192 - 1859320
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||    
T  1859192 tggttaaggatataaaaaaagaaattgtata--gtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggta 1859289  T
Q  405 ataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1859290 ataattctcttttatggtatgcttaaccagt 1859320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 28600993 - 28601124
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |    
T  28600993 gcactggttaaggatatgaaaaagggaattataaa--gtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagttaaaaacagtttctttttat 28601089  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  28601090 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagt 28601124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 38591034 - 38590883
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  38591034 gcactggttaagaatatgaaaaaggaaattataca--gtagttaatgtattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 38590937  T
Q  401 ggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttag 454  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  38590936 ggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaata-ccccgaggcaccggttag 38590883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 302 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25782989 - 25782840
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  25782989 cactagttaagaatatgaaaaaggaaattatata-----gttaatgcattgaaattgtgtaattattttataataaagtcaaaaacaattttcttttatg 25782895  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagc 455  Q
     |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| || | || ||||||||    
T  25782894 ataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggggacatcggttagc 25782840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 4022636 - 4022480
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||   || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||     
T  4022636 actgattaagaatatgaaaaaagaaatta---atagtagttaatgtattgaaattctgtaattaatttataataaagtcagaaacagtttccttttatga 4022540  T
Q  403 taataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacc 461  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  4022539 taataatttccttttatgatatgtttaaccagtgtcccgggggcaccggttagcaggacc 4022480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26891822 - 26891722
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||    
T  26891822 cactgattaaggatataaaaaaggaaattatatat--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttatg 26891725  T
Q  402 gta 404  Q
    |||    
T  26891724 gta 26891722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 303 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13574187 - 13574060
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||    
T  13574187 actggttaaggatatgaaaaaggaaaatatataaa--aattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttatgg 13574090  T
Q  403 taataa-ttccttttataatatgcttaacc 431  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  13574089 taataatttccttttatggtatgcttaacc 13574060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 411
Target Start/End: Original strand, 27584769 - 27584872
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||| ||||||    
T  27584769 ggttaaggatatgaaaagggaaattatata--gtagttaaagcattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaagcagtttccttttatggtaa 27584866  T
Q  406 taattc 411  Q
    ||||||    
T  27584867 taattc 27584872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Original strand, 38296203 - 38296310
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |    
T  38296203 gcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatata--gtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 38296300  T
Q  401 ggtaataatt 410  Q
    ||||||||||    
T  38296301 ggtaataatt 38296310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35851911 - 35851781
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||| |    
T  35851911 gcaccggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataa--tagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcattttat 35851814  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaacca 432  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  35851813 ggtaataattctcttttatggtatgcttaacca 35851781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 463
Target Start/End: Original strand, 39531868 - 39532009
Alignment:
Q  319 aaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataattccttttat 418  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| || ||| ||||| |||||||| || |||||      
T  39531868 aaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-agagtcaaaaccagttttcttttatggtaatattttctttttc 39531964  T
Q  419 aatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
     ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  39531965 gatatgcttaaccagtgtctcagaggcaccggttagcatgaccca 39532009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 410
Target Start/End: Original strand, 5881236 - 5881354
Alignment:
Q  294 tcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagtta----atgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaa 389  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |     
T  5881236 tcccggagcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaagag 5881333  T
Q  390 tttccttttgtggtaataatt 410  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  5881334 tttccttttatgataataatt 5881354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15079100 - 15079012
Alignment:
Q  319 aaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt 410  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15079100 aaaaaggaaattatata--gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaatttccttttatgataataatt 15079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 437
Target Start/End: Original strand, 25772137 - 25772272
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||    
T  25772137 cactagttaagaatatgaaaaaggaaattataaaaa-taattaatgcaatgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccctttatg 25772235  T
Q  402 gtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatc 437  Q
     |||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  25772236 ataataattcccttttatggtatacttaatcagtatc 25772272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29102439 - 29102313
Alignment:
Q  305 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggta 404  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| | |||    
T  29102439 tggttaagaatatcaaaaagaaaattatatagcg--gttaatacattgaaattttataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatagta 29102342  T
Q  405 ataatt-ccttttataatatgcttaacca 432  Q
    ||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  29102341 ataattatcttttatgatatgtttaacca 29102313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 34123166 - 34123057
Alignment:
Q  319 aaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttcctttta 417  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||     
T  34123166 aaaaaagaaattatataa--tagttaatgctttgaatttgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagtttccttttatggtcataattttcttttt 34123070  T
Q  418 taatatgcttaac 430  Q
    |||||||||||||    
T  34123069 taatatgcttaac 34123057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 441
Target Start/End: Original strand, 15146694 - 15146796
Alignment:
Q  339 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa--ttccttttataatatgcttaaccagtat 436  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||  |||||||| |  |||| |||||||||||    
T  15146694 tagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaataatttccttttatgataataattttcctttt-tggtatgtttaaccagtat 15146791  T
Q  437 ccagg 441  Q
    |||||    
T  15146792 ccagg 15146796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 410
Target Start/End: Original strand, 10820546 - 10820615
Alignment:
Q  339 tagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt 410  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10820546 tagttaatacattgagattgt-taattaatttataaaaag-ttaaaaacagtttccttttatggtaataatt 10820615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 335
Target Start/End: Original strand, 43993180 - 43993214
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43993180 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 43993214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44854509 - 44854467
Alignment:
Q  292 actcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatat 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44854509 actcccggggcactggttaaggataataaaaaggaaattatat 44854467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 457
Target Start/End: Original strand, 34123153 - 34123205
Alignment:
Q  405 ataattccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcat 457  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34123153 ataatttcttttttagtatgctcaaccagtaccccggaggcaccggttagcat 34123205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 434
Target Start/End: Original strand, 846 - 983
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  846 ccggagcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcaatttcct 943  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  944 tttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagt 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 68456 - 68288
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  68456 cccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaaataaattataataaagttaaaatcagtttcc 68359  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaa 464  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||||    
T  68358 ttttaaggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccgaaggcatcggttagcaggacccaa 68288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 434
Target Start/End: Original strand, 22981 - 23119
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  22981 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 23078  T
Q  395 ttttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||| || ||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  23079 ttttatgttaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 23119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 463
Target Start/End: Original strand, 14916 - 15083
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  14916 cccggggcactggttaaagatataaaaaaagaaattatata--gtagttaatgcactgaaattgtgtagttaatttataataaagtcaaaaacagtttcc 15013  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  || |||||||| ||||| || ||||||    
T  15014 ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcactggttaacaggaccca 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 463
Target Start/End: Original strand, 40940 - 41106
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  40940 ccggagcaccgattaagaatatgaaaaatgaaattatataa--tagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataatgaagtcaaaaacagtttcct 41037  T
Q  396 tttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||    
T  41038 tttatgataataatttccttttatgatatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttggcaggaccca 41106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 53851 - 53685
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||    
T  53851 cccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcataatgtcaaaaatagtttcc 53754  T
Q  395 ttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||  || || |||||||||||||| |||||    
T  53753 ttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccc 53685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 6270 - 6110
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  6270 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaactatata--gtagttaatgcattggaattgtgtaattaaattataataaagtcaaaaacagtttccttttat 6173  T
Q  401 ggtaataat-tccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccc 462  Q
    |||||||||  ||||||||  |||| |||||| ||  || || |||||||||||||| |||||    
T  6172 ggtaataatccccttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 6110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 463
Target Start/End: Original strand, 318 - 479
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| |      
T  318 gcactggttaagcatatgaaaaagaaaattatataa--tagttaatgcattgaaattgtgtaataaatttataataaagtcaaaaacagtttccttctac 415  T
Q  401 ggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | | |||||||| ||||||    
T  416 ggtaataattctcttttatgatatgattaatcagtatcctggaaactctggttagcaggaccca 479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1152 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 465
Target Start/End: Original strand, 702 - 866
Alignment:
Q  299 gagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcctttt 398  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||    
T  702 gagcacgggttaaagatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaactgttttctttt 799  T
Q  399 gtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgacccaat 465  Q
     |||| ||||||| |||||||  |||||||||| | || || || |||||||||||| | ||||||||    
T  800 atggtgataattctcttttatggtatgcttaactaatagcccgg-ggcaccggttagtaggacccaat 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8057 - 7956
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| |    
T  8057 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttat 7960  T
Q  401 ggta 404  Q
    ||||    
T  7959 ggta 7956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Original strand, 7314 - 7415
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| |    
T  7314 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttccttttat 7411  T
Q  401 ggta 404  Q
    ||||    
T  7412 ggta 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 296 - 434
Target Start/End: Original strand, 50569 - 50706
Alignment:
Q  296 ccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcct 395  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||    
T  50569 ccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgttttgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaatcaattttct 50666  T
Q  396 tttgtggtaataattc-cttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    ||| || ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50667 tttatgataataattctcttttatagtatgtttaaccagt 50706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53505 - 53417
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaattt 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  53505 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaattt 53417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 147059 - 146912
Alignment:
Q  307 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaat 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| || ||  ||||||    
T  147059 gttaaggatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttctattacggtaat 146962  T
Q  407 aa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagca 456  Q
    || ||| ||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  146961 aatttctttttatggtatgcttaatcagtatccacga-gcaccggttagca 146912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 412
Target Start/End: Original strand, 116224 - 116339
Alignment:
Q  295 cccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttcc 394  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||    
T  116224 cccggggcacaggttaaagatatgaaaaaggaaattatata--gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcc 116321  T
Q  395 ttttgtggtaataattcc 412  Q
    |||| || ||||||||||    
T  116322 ttttatgataataattcc 116339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11129 - 11029
Alignment:
Q  302 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||| |||| ||    
T  11129 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatat--tagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataataaagtcaaaaacagtttcattttatg 11032  T
Q  402 gta 404  Q
    |||    
T  11031 gta 11029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 306 - 412
Target Start/End: Original strand, 25750 - 25853
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  25750 ggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatata--gtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaa 25846  T
Q  406 taattcc 412  Q
    |||||||    
T  25847 taattcc 25853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 463
Target Start/End: Original strand, 10771 - 10897
Alignment:
Q  338 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataatt-ccttttataatatgcttaaccagtat 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||      
T  10771 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgc 10870  T
Q  437 ccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    |  || |||| ||||||||| ||||||    
T  10871 ctcgggggcagcggttagcaggaccca 10897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 434
Target Start/End: Original strand, 69252 - 69383
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| || |||  ||||      
T  69252 gcactcgttaaggatatgaaaaagtaaattatata--gtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttttttttaa 69349  T
Q  401 ggtaataattccttttataatatgcttaaccagt 434  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  69350 ggtaataatttcttttatggtatgcttaaccagt 69383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33845 - 33770
Alignment:
Q  297 cggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33845 cggagcacttgttaagtatattaaaatggaaattatataa--tagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa 33770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 17630 - 17518
Alignment:
Q  301 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgt 400  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  17630 gcactgtttacggatatgaaaaagaaaattatata--gtagctaatgcattgaaattgtg-aattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttat 17534  T
Q  401 ggtaataattcctttt 416  Q
    | ||||||||||||||    
T  17533 gataataattcctttt 17518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19740 - 19584
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaa 405  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||  | |||    
T  19740 ggttaagcatatgaaaaaagaaattatataa--taattaatgcattgaaattgtgtaatgaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttacgataa 19643  T
Q  406 taattc-cttttataatatgcttaaccagtatccaggaggcaccggttagcatgaccca 463  Q
    || ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||| |||  | |||||||||| ||||||    
T  19642 tagttctcttttatgatatgattaatcagtgtcccggaaactccggttagcaggaccca 19584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 95742 - 95609
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtgg 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||| |||    
T  95742 actggttaagaatatgaaaaaggaaattatata--ataattaatgaattgaaattatgtaattaatttataataaag-tcaaaacagttttcttttatgg 95646  T
Q  403 taataatt-ccttttataatatgcttaaccagtatcc 438  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  95645 taataattcccttttatggtatgtttaaccggtatcc 95609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Original strand, 233918 - 234052
Alignment:
Q  342 ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtggtaataa-ttccttttataatatgcttaaccagtatccag 440  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| ||  ||||| ||||||||||  |||| |||||| |||  | |    
T  233918 ttaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgaaaataatttccttttatggtatgtttaaccggtactccg 234017  T
Q  441 gaggcaccggttagcatgacccaatctttatttat 475  Q
    | |||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  234018 ggggcaccggttagcaggaccccttatttatttat 234052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 374
Target Start/End: Original strand, 5070 - 5136
Alignment:
Q  306 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 374  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5070 ggttaagaatattaaaaaaaaaattatata--gtagttaatttattgaaattgtgtaattaatttataa 5136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 74632 - 74526
Alignment:
Q  303 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatatcgtag-ttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaggttaaaaacaatttccttttgtg 401  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||||  |||  |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  74632 actgattaaagatatgaaaaaaaaaattatata--gtaaattaatgtagtgaaattgtataattaattgataataaattaaaaaacaaatttcttttatg 74535  T
Q  402 gtaataatt 410  Q
    |||||||||    
T  74534 gtaataatt 74526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University