View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9377_low_10 (Length: 394)

Name: NF9377_low_10
Description: NF9377
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9377_low_10
NF9377_low_10
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (37-384)||(15053032-15053379)
chr6 (16-384)||(15605830-15606198)
chr6 (16-377)||(11731505-11731863)
chr6 (26-384)||(14680145-14680503)
chr6 (81-384)||(28107122-28107425)
chr6 (76-374)||(19690775-19691073)
chr6 (34-257)||(34104319-34104542)
chr6 (174-384)||(30801985-30802195)
chr6 (124-376)||(29368000-29368252)
chr6 (20-220)||(21944468-21944668)
chr6 (42-269)||(27443029-27443258)
chr6 (97-197)||(3100415-3100512)
chr6 (16-86)||(3101261-3101330)
chr6 (16-69)||(19690339-19690392)
chr6 (23-99)||(20775195-20775271)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (16-384)||(42340113-42340481)
chr3 (24-384)||(53497015-53497375)
chr3 (16-276)||(34497208-34497468)
chr3 (20-382)||(55199496-55199858)
chr3 (16-276)||(27608739-27608999)
chr3 (16-323)||(647006-647306)
chr3 (16-382)||(2615478-2615834)
chr3 (16-283)||(31341561-31341832)
chr3 (19-353)||(11020020-11020353)
chr3 (16-319)||(2121129-2121432)
chr3 (16-244)||(19117556-19117784)
chr3 (96-384)||(46007285-46007570)
chr3 (16-185)||(26046870-26047039)
chr3 (19-208)||(55213484-55213673)
chr3 (98-246)||(27747603-27747751)
chr3 (138-296)||(24176841-24176999)
chr3 (16-167)||(48227568-48227719)
chr3 (16-114)||(24181783-24181881)
chr3 (276-377)||(647307-647408)
chr3 (97-207)||(1702806-1702916)
chr3 (315-384)||(27941129-27941198)
chr3 (65-167)||(49525079-49525181)
chr3 (231-340)||(48227440-48227550)
chr3 (22-115)||(15310817-15310910)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (16-384)||(16731916-16732284)
chr7 (16-384)||(17710050-17710418)
chr7 (16-384)||(29200792-29201159)
chr7 (13-353)||(22289255-22289595)
chr7 (16-376)||(9328438-9328798)
chr7 (16-353)||(16098504-16098844)
chr7 (16-377)||(30493446-30493806)
chr7 (16-377)||(1581605-1581968)
chr7 (19-333)||(3275068-3275383)
chr7 (16-291)||(3601728-3602003)
chr7 (16-376)||(17877399-17877749)
chr7 (16-185)||(24251621-24251787)
chr7 (16-185)||(44481269-44481438)
chr7 (21-245)||(30824336-30824559)
chr7 (16-185)||(33224396-33224565)
chr7 (19-227)||(47580015-47580222)
chr7 (16-157)||(24139221-24139362)
chr7 (16-167)||(35030494-35030641)
chr7 (195-274)||(44480893-44480972)
chr7 (180-260)||(24139138-24139218)
chr7 (13-167)||(35013759-35013913)
chr7 (65-161)||(6056262-6056358)
chr7 (262-368)||(30824557-30824661)
chr7 (65-165)||(43782922-43783022)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (16-384)||(40588566-40588934)
chr8 (19-377)||(477895-478253)
chr8 (16-384)||(13415006-13415374)
chr8 (54-358)||(7127232-7127536)
chr8 (99-384)||(23853915-23854200)
chr8 (37-384)||(8450980-8451327)
chr8 (16-280)||(598073-598337)
chr8 (16-296)||(11870335-11870615)
chr8 (22-377)||(185435-185787)
chr8 (26-275)||(33642610-33642859)
chr8 (19-352)||(9496797-9497125)
chr8 (55-296)||(3606612-3606855)
chr8 (36-372)||(37712074-37712398)
chr8 (16-185)||(36194457-36194626)
chr8 (16-158)||(28315316-28315457)
chr8 (21-108)||(34707886-34707973)
chr8 (97-158)||(4275914-4275975)
chr8 (83-167)||(8670217-8670301)
chr8 (16-59)||(32555083-32555126)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (16-376)||(25730799-25731159)
chr5 (16-377)||(20204945-20205306)
chr5 (16-384)||(12660299-12660667)
chr5 (16-384)||(4268082-4268454)
chr5 (16-382)||(8388071-8388437)
chr5 (16-382)||(26597302-26597659)
chr5 (26-384)||(15988593-15988953)
chr5 (16-384)||(27292417-27292784)
chr5 (22-353)||(41940578-41940909)
chr5 (19-384)||(11375361-11375717)
chr5 (16-384)||(22767109-22767461)
chr5 (51-384)||(27532777-27533110)
chr5 (16-375)||(34652097-34652448)
chr5 (19-279)||(32632603-32632862)
chr5 (60-248)||(23074951-23075139)
chr5 (84-272)||(30222744-30222930)
chr5 (16-201)||(30573513-30573698)
chr5 (16-167)||(26076480-26076632)
chr5 (241-375)||(37448117-37448251)
chr5 (104-204)||(31908320-31908420)
chr5 (16-86)||(40018894-40018964)
chr5 (16-69)||(3308181-3308234)
chr5 (19-68)||(23083639-23083688)
chr5 (16-69)||(26296365-26296418)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (16-382)||(48949560-48949926)
chr1 (16-377)||(25682641-25683002)
chr1 (16-384)||(44527236-44527605)
chr1 (16-384)||(5609322-5609690)
chr1 (16-384)||(36733679-36734041)
chr1 (19-353)||(44602766-44603095)
chr1 (16-377)||(4395149-4395509)
chr1 (16-340)||(51113342-51113666)
chr1 (16-376)||(16816633-16816995)
chr1 (16-277)||(2885313-2885578)
chr1 (28-265)||(21031251-21031488)
chr1 (52-384)||(52109437-52109768)
chr1 (26-384)||(48166220-48166568)
chr1 (16-268)||(24538586-24538839)
chr1 (20-234)||(14485149-14485357)
chr1 (20-167)||(4898460-4898607)
chr1 (39-167)||(17371648-17371776)
chr1 (16-135)||(5594266-5594385)
chr1 (100-161)||(23163357-23163418)
chr1 (16-147)||(23332649-23332781)
chr1 (100-197)||(38679016-38679113)
chr1 (16-59)||(3297036-3297079)
chr1 (16-58)||(23163419-23163461)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (16-384)||(32576884-32577252)
chr4 (16-384)||(49951296-49951664)
chr4 (22-384)||(37245694-37246056)
chr4 (19-384)||(2064836-2065201)
chr4 (16-384)||(29655502-29655870)
chr4 (16-384)||(41835148-41835515)
chr4 (16-384)||(21321510-21321881)
chr4 (16-384)||(51734808-51735175)
chr4 (19-382)||(56065614-56065981)
chr4 (16-384)||(18441983-18442349)
chr4 (16-384)||(28537619-28537989)
chr4 (16-342)||(26422438-26422764)
chr4 (16-377)||(28426173-28426534)
chr4 (16-377)||(49119236-49119597)
chr4 (16-382)||(51259365-51259732)
chr4 (16-377)||(55734999-55735366)
chr4 (16-276)||(44935918-44936178)
chr4 (16-384)||(43840161-43840511)
chr4 (16-340)||(47226168-47226490)
chr4 (16-274)||(24989770-24990027)
chr4 (15-219)||(8754298-8754502)
chr4 (22-180)||(23095401-23095559)
chr4 (16-108)||(10575285-10575377)
chr4 (16-113)||(6753955-6754051)
chr4 (18-166)||(51364567-51364710)
chr4 (108-161)||(40727169-40727222)
chr4 (65-197)||(53661187-53661318)
chr4 (108-161)||(21163372-21163425)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (16-361)||(34695740-34696085)
chr2 (16-361)||(34718152-34718497)
chr2 (16-385)||(12130474-12130843)
chr2 (16-384)||(88542-88910)
chr2 (16-336)||(1417826-1418137)
chr2 (16-280)||(9710042-9710306)
chr2 (19-353)||(26198707-26199030)
chr2 (19-275)||(11291904-11292157)
chr2 (16-321)||(14827126-14827430)
chr2 (96-384)||(44017234-44017522)
chr2 (19-275)||(13109711-13109964)
chr2 (19-230)||(35158681-35158895)
chr2 (31-300)||(22845603-22845859)
chr2 (16-200)||(25552312-25552496)
chr2 (88-218)||(18344202-18344332)
chr2 (304-384)||(9709912-9709992)
chr2 (39-218)||(36445377-36445557)
chr2 (102-167)||(10244492-10244557)
chr2 (254-337)||(18345561-18345644)
chr2 (124-185)||(43293835-43293896)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (19-382)||(171-538)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (65-268)||(149-352)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (42-269)||(44103-44332)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (31-195)||(20330-20494)
[»] scaffold0252 (1 HSPs)
scaffold0252 (76-167)||(13321-13410)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 37 - 384
Target Start/End: Original strand, 15053032 - 15053379
Alignment:
Q  37 aatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcct 136  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  15053032 aatgtacaatataagaaggataagaattaaaaatacggtgattaacctaggaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgtttgcttgtcttct 15053131  T
Q  137 aacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgataga 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15053132 aacaaacttcacctcgaaattggaatgtaaatataattgataaataatattataagcaacagcatagaattccgaatcaccatggcccgaagacgatagc 15053231  T
Q  237 gcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccct 336  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15053232 gtttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccttgtctcattttttcacgtcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccct 15053331  T
Q  337 ccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15053332 ccaacactatcatatttacccgctgtcatcttgtttgagcccgaataa 15053379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 15605830 - 15606198
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||||||    
T  15605830 aactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataataaatatggtgactagcccaagaataagccgccctagctaaagcatgagc 15605929  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||    
T  15605930 aaccatgttcgcttgtctgctaacaaaattcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagtgttctgaatca 15606029  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||    
T  15606030 ccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatttgttcccatcaacaaagtgaatggcatcga 15606129  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15606130 gtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatgttttcccgctgccattttgtttgagcccgaataa 15606198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 11731505 - 11731863
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11731505 aactattatcattaatcaacgaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatatggtgactagcccaagagcaggctgccctagctaaagtatgagc 11731604  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||| ||    
T  11731605 aaccatgttcgcttgcctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaatattactagaaacagtagcatagaactccgaacca 11731704  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| | ||  || ||||| ||||||||| | |||  |  ||||    
T  11731705 ccatggcccggagacaatagagcttgcactatattgaaagagtcggactcgaagacaacctgttcctatatgttctcatcagcaaagtgaagagtctcga 11731804  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    |  ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11731805 g--aggctgctgcct-cccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcc 11731863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14680503 - 14680145
Alignment:
Q  26 attaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  14680503 attaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgaaaataaaaaatacggtgactagcctgagaacaggccgccctagttaaagtatgagcaaccatgttc 14680404  T
Q  126 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||    
T  14680403 gcatgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattttgaatcaccactgcccg 14680304  T
Q  226 gagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctac 325  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||| || |||||||| ||||  ||| ||||  ||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||    
T  14680303 gagatgatagagcttgcaatagagtagacgagtcggaatcaaagacaactcggttccatctgtttgcatcagcagagtgaagggcctcgagtaaggctac 14680204  T
Q  326 tgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  14680203 tgcctccccctccaatactgtcatattttcccgctgccatttcatttgagccataataa 14680145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 81 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28107425 - 28107122
Alignment:
Q  81 acccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaa 180  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  28107425 acccaagaacaagttgccctagctaaagtatgagcaaccatgtttggttgtctcctaacaaactacagctcgaagttggaatgtaaagataactaataaa 28107326  T
Q  181 taatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtc 280  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  | ||    
T  28107325 taatactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaagacaacgtgatc 28107226  T
Q  281 tcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccaga 380  Q
     ||| | |||| ||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  28107225 ccatctattcatatttgcaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatctgtccgctgccatttcgtttgagcctga 28107126  T
Q  381 ataa 384  Q
    ||||    
T  28107125 ataa 28107122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 374
Target Start/End: Original strand, 19690775 - 19691073
Alignment:
Q  76 gactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattg 175  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| || |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||    
T  19690775 gactagcccaagaacaggtcgcccttgcaaaaacatgagcaatcatgttcgcttgtttcctaacaaacttcacctcaaagtttaaatgtaaagataactg 19690874  T
Q  176 ataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacc 275  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||     
T  19690875 ataaataatactagaaacaatgacatagaattccaaatcaccatgactcagagacgatagagcttgcactaaagtagctgagtcagactcgaagacaact 19690974  T
Q  276 cggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttga 374  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  19690975 cggtcacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaggctattgcctccccttccaaaacggtcatatttgtccgttgtcatttcgtttga 19691073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 257
Target Start/End: Original strand, 34104319 - 34104542
Alignment:
Q  34 atcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtct 133  Q
    |||| |||||||||   ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||| || ||| |||||||  ||||||||| |||| | ||||||||    
T  34104319 atcagtgttcaatacgagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccatagctaagctatgagcaaccatgtttgcttgtct 34104418  T
Q  134 cctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34104419 cctaacaaacttcacctcgaagttcgaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccggagacgat 34104518  T
Q  234 agagcttgcactagattagctgag 257  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  34104519 agcgcttgcactagagtagctgag 34104542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 174 - 384
Target Start/End: Original strand, 30801985 - 30802195
Alignment:
Q  174 tgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaa 273  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  30801985 tgataaataatactagaaacaataacatagaattccaagtcaccatggctcggaaacgatagagcttgcactaaagtagctgaatcggactcgaagacaa 30802084  T
Q  274 cccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttg 373  Q
    ||  ||| ||||| |||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  30802085 cctagtcccattttttcacatctgcaaagtaaatggcatctagtaaggctactgcctcccccaccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgttta 30802184  T
Q  374 agccagaataa 384  Q
    |||| ||||||    
T  30802185 agcccgaataa 30802195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 124 - 376
Target Start/End: Original strand, 29368000 - 29368252
Alignment:
Q  124 tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcc 223  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  29368000 tcgcttgtttcctaacaaactttaccttgaagttggaaggtaaagataactgataactaatactagaagcaatagcatagaattacgaatcactatgacc 29368099  T
Q  224 cggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggct 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||    |||| ||| | ||  ||||||||| | ||| ||| |||||||||| |    
T  29368100 cggagacgatagagcttgcactatagtagatgagtcggactcgaaaacagttaggtcccatctattagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggat 29368199  T
Q  324 actgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagc 376  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  29368200 attgcctccccctccaaaactgtcatatttatccgctgccatttcttttgagc 29368252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 21944468 - 21944668
Alignment:
Q  20 attatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatc 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| | |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||      
T  21944468 attatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcacaagaacctgctgctctaactaaagtatgagcaaca 21944567  T
Q  120 atgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccat 219  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21944568 atgatcgcttgtcttttaacaaacttcacatcgaagttggaatataaaaataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaattaccat 21944667  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  21944668 g 21944668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27443258 - 27443029
Alignment:
Q  42 tcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaa 141  Q
    |||||| | ||||||||  ||| |||||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27443258 tcaatagaagaaggatatgaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaa 27443159  T
Q  142 acttcacctcgaagt---tggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagc 238  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||| |||| ||| | |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  27443158 acttcacctcaaagttggtggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc 27443059  T
Q  239 ttgcactagattagctgagtcggactcgaag 269  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27443058 -tgcactagagtagctgagtccaactcgaag 27443029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3100512 - 3100415
Alignment:
Q  97 ccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt-aaatataattgataaataatattataaacaa 195  Q
    |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  3100512 ccctagctaaagtatga----tcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagttggaatgtaaaagataactgataaataatactataaacaa 3100417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3101330 - 3101261
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaa 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||    
T  3101330 aactattatcattaatcaa-caatgttcaatacaacaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaa 3101261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 19690339 - 19690392
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  19690339 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaa 19690392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20775271 - 20775195
Alignment:
Q  23 atcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccc 99  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||   || |||| ||||||||||| ||||    
T  20775271 atcattaatcgattaatgttcaatatatgaagagtaagaataaaaaatataatgattaactcaagaacaggccgccc 20775195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 42340113 - 42340481
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  42340113 aactattatcatttatcaaccaatcttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagccaaagaacaggccgccctatctaaagtgtgagc 42340212  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42340213 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagatagctgataaataatattagaaacaatagcatagaattctgaatca 42340312  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  42340313 ccatggcccggagacgacagagcttgcactaaagtagctgagtctgactcgaagacaactcggtcccatctgttcacatctgcaaagtgaatgacatcga 42340412  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42340413 gtagggctattgcctccccctccaacactgtcatatctgcccgctgccattttgtttgagcccgaataa 42340481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 53497375 - 53497015
Alignment:
Q  24 tcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgc 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  53497375 tcattaatcaagcaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcagccatgt 53497276  T
Q  124 tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcc 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53497275 tcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcc 53497176  T
Q  224 cggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggct 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| | ||| ||| || |||||||||    
T  53497175 cggagacgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctctagtaaggct 53497076  T
Q  324 actgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53497075 actgcctccccctcaaaaactgtcacatttgtccgctgtcattttgtttgagcccgaataa 53497015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 34497208 - 34497468
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34497208 aactattatcattaatcaaccagtgttcaatacatgaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaagctatgagc 34497307  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  34497308 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaggaacaatagcataaaattccgaatca 34497407  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaaccc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34497408 ccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 34497468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 55199858 - 55199496
Alignment:
Q  20 attatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatc 119  Q
    |||||||||||||||  | || ||| || | ||||||||| ||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |    
T  55199858 attatcattaatcaactagtgatcagtacaagaaggataagaataaaaaatatggtcactagcgcaagaacaggccgccgtagctaagctatgagcaacc 55199759  T
Q  120 atgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccat 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55199758 atgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagatgactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattccgaatcaccat 55199659  T
Q  220 ggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaa 319  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  || || ||| | ||||||||||||||||    
T  55199658 gacccgtagacgatagcgcttgcaccagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgtttccaacaacaaagtgaatggcatcgagtaa 55199559  T
Q  320 ggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  55199558 ggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttatcagctgtcatttcgtttgagcccgaat 55199496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 27608739 - 27608999
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||| || || | ||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||    
T  27608739 aactattatcattaattaaccagtattcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgctctagctaagctatgagc 27608838  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27608839 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattccgaatca 27608938  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaaccc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27608939 ccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccc 27608999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 323
Target Start/End: Original strand, 647006 - 647306
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||| || || ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  647006 aactattattattaatcaaccaatgttcaatacaagaaagataaaattcaaaaatacggtgattagtccaagaacaggccgccctaactaaagtatgagc 647105  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||        ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  647106 aaccatgttcgtttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgatac-------tataaacaacaacatagaattccgaatca 647198  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  647199 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcagactcgaagataactcggtcacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcga 647298  T
Q  316 gtaaggct 323  Q
    ||||||||    
T  647299 gtaaggct 647306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2615834 - 2615478
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | | ||||| |||| || || ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2615834 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaacgcttaaaataaaaattacggtgactagcccaagaacaggtcgccctagttaaagtatgagc 2615735  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2615734 aaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcatctcgaggttggaatgtaaaaataactgataaataatactaaaaacaatatcatagaattctgaatca 2615635  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |  |||||||        ||||  ||| ||||||||| | ||| | ||||||    
T  2615634 ccatggcacaaagacgatagagctcgcactagagtagttgagtcggattgaaagacaa--------catt--ttcccatcagcaaagtgaacgacatcga 2615545  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||    
T  2615544 gtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgcccgctgccaattcgtttgagcccgaat 2615478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 31341561 - 31341832
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  31341561 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaaccggctgccctaactaaggtatgagc 31341660  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || ||||   | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  31341661 aaccatgtcagtttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatagtataaaattctgaatca 31341760  T
Q  216 ccatggcccggagac----gatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctca 283  Q
    ||||| |||||||||    |||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  31341761 ccatgacccggagacgtaggatagagcttgcactagagtagtggagtcagattcgaagataacccggtctca 31341832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Original strand, 11020020 - 11020353
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||  | ||||| |||||| | ||| || |||||||||| |||||  ||     
T  11020020 tattatcattaatcaattaatgttcaatacaagaag-ataagaataaaaaatacagtgactagcccaaggataggttgtcctagctaaaatatgattaac 11020118  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11020119 catgttcgcttgtctccaaacaaacttcacatcgaggttgaaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcacagaattctgaatcacca 11020218  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagta 318  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  11020219 tggcccggagacgatagaccttacactggagtagttaagtcagactcgaagacaacccagttccatttgttcccatcagcaaagtaaatagcatcgagta 11020318  T
Q  319 aggctactgcctccccctccaacactatcatattt 353  Q
    | |||  || |||||||||||| | | ||||||||    
T  11020319 aagctgatgtctccccctccaaaagtgtcatattt 11020353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2121432 - 2121129
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  2121432 aactattatcatcaatcaaccaatgtgcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtaactaacccaagaacagaccgccctaactaaagtatgagc 2121333  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||||  |||| |    
T  2121332 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaactttacctcgaagttgagatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcacaaaattatgaataa 2121233  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
     |||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || ||||| || || ||| | |||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  2121232 tcatggcctagagacaatagagcttgcattagagtagttaagtcggactcaaaaacaacacgatcccatctattcatatcagcaaagtgaatgacatcga 2121133  T
Q  316 gtaa 319  Q
    ||||    
T  2121132 gtaa 2121129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 19117556 - 19117784
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  19117556 aactattatcatcaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgacctagctaagctatgagc 19117655  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    ||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19117656 aactatgttcgactgtctcctaacaaacttcacctcaaatttggaatgcaaaaataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattccgaatca 19117755  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcac 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19117756 ccatggcccggagacgatagcgcttgcac 19117784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46007570 - 46007285
Alignment:
Q  96 gccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaa 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||   || || ||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||    
T  46007570 gccctagttaaagtatgagcaatcatgttcatttgtcttctaacaaactttaccctaaaattagaatgtaaaaataactgataaataatgctagaaacaa 46007471  T
Q  196 tagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatc 295  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||  | ||| |||||| |||    
T  46007470 tagcataaaattccgaatcgccatggcccggagacgatatagtttgcactagagtagttgaatcggactcgaagaca-cccg--cccatctgttcatatc 46007374  T
Q  296 agcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
      ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || | | || ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  46007373 gacaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgtctccccctaaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataa 46007285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26047039 - 26046870
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  26047039 aactattatcattaatcaaccaatatttaatataagaaggataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataagccgccctagctaaagtatgagc 26046940  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataata 185  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26046939 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacgtcacctcaaagttagaatgtaaagataactgataaataata 26046870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 55213673 - 55213484
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||  | ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||     
T  55213673 tattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaagaataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaaccggccgccctagttaaagtataagcaac 55213574  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattc 208  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  55213573 catgttcgcttttctcctaacaaatttcacctcgaagttggaacgtaaagataactgatatataataccaaaaacaatagcatagaattc 55213484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 27747603 - 27747751
Alignment:
Q  98 cctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaata 197  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  27747603 cctagataaagtatgagcaactatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaata 27747702  T
Q  198 gcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcacta 246  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27747703 gcatagaattttgaatcaccatggcccggagacgataaagcctgcacta 27747751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24176999 - 24176841
Alignment:
Q  138 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagag 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24176999 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacttataaataatactagatacaatagcttagaattccgaatcaccatgacccagagacgatagag 24176900  T
Q  238 cttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatca 296  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  24176899 cttgcactagagtagttgtgtcagactcgaagacaacccaatctcatctgttcaaatca 24176841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48227719 - 48227568
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  48227719 aactattatcattaatcaaccattgttcaatacaagaaagataaaaataaaaaatatggcgaataacccaagaacaagtcgccctagctaaagtatgagg 48227620  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    || |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48227619 aaccatatttgcttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgtaaa 48227568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24181881 - 24181783
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgag 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24181881 aactattatgattaatcaatcaatgttcaatacaacaaggataaaaattaaaaatatggtgactaacccaagaacaggccgccctagctaaagtgtgag 24181783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 377
Target Start/End: Original strand, 647307 - 647408
Alignment:
Q  276 cggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgag 375  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  647307 cggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctgctgcctccccctccataactgtcatattagcccgctgccatttcgtttgag 647406  T
Q  376 cc 377  Q
    ||    
T  647407 cc 647408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 1702806 - 1702916
Alignment:
Q  97 ccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaat 196  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |  ||||||||| || ||| |||    
T  1702806 ccctagttaaagtatgagtaatcatattcgcttgtcttctaacaaacttcaccttgaagttcgaatgtaaagataactagtaaataatactaaaaataat 1702905  T
Q  197 agcatagaatt 207  Q
    |  ||||||||    
T  1702906 aaaatagaatt 1702916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 384
Target Start/End: Original strand, 27941129 - 27941198
Alignment:
Q  315 agtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  27941129 agtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgtccgctgccattttgtttgagtccgaataa 27941198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 167
Target Start/End: Original strand, 49525079 - 49525181
Alignment:
Q  65 aaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 164  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||| |  || ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  49525079 aaaaatatggtgactagtccaagaacagaccgccctagcaagggtgtgagcagccatgttcgcttgtcgcctaacaaactttacctcaaaattggaatgt 49525178  T
Q  165 aaa 167  Q
    |||    
T  49525179 aaa 49525181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48227550 - 48227440
Alignment:
Q  231 gatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcga-atggcatcgagtaaggctactgcc 329  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||   ||||||||||||| | ||   ||  |||||||||||||||||     
T  48227550 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaactcggttttatccattcacatcagcaaagtgatggggtctcgagtaaggctactgca 48227451  T
Q  330 tccccctccaa 340  Q
    |||| ||||||    
T  48227450 tcccactccaa 48227440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15310910 - 15310817
Alignment:
Q  22 tatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||| || || ||||||||| ||| |||||| || | || ||||  |||||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15310910 tatcattaattaaacattgttcaatacatgtaggatagaactcaataatacagcgactagtccaagaacaggccgccctagttaacgtatgagc 15310817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16732284 - 16731916
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16732284 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagctaaagtatgagc 16732185  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16732184 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattctgaatca 16732085  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||  | ||||||| ||||    
T  16732084 ccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtgaatggcctcga 16731985  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  16731984 gtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataa 16731916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17710418 - 17710050
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17710418 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagctaaagtatgagc 17710319  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17710318 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattctgaatca 17710219  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||  | ||||||| ||||    
T  17710218 ccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtgaatggcctcga 17710119  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  17710118 gtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataa 17710050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 29200792 - 29201159
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29200792 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaag-ataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagc 29200890  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29200891 aaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 29200990  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  29200991 ccatggcccagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgaagacaacccgtttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcaa 29201090  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||   | || ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29201091 gtaaacatgctacctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgtcatttcgtttgagcccgaataa 29201159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22289595 - 22289255
Alignment:
Q  13 atcaactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||||   ||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  22289595 atcaactattatcattaatcaactagtgttcaatataagaaggataaaaataaaaaatacggtaactagttcaagaacaggccgccctagctaagctatg 22289496  T
Q  113 agcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaa 212  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||    
T  22289495 agcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacatcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattctgaa 22289396  T
Q  213 tcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||| | |||||||||    
T  22289395 tcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacagcccggtcccatttgttcccaacggcaaagtgaatggcat 22289296  T
Q  313 cgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatattt 353  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22289295 cgagtaaggcaaccacctccccctccaaaactgtcatattt 22289255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Original strand, 9328438 - 9328798
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  | | ||||||||||||||||    
T  9328438 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggacgtcgtagctaaagtatgagc 9328537  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  9328538 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaaacgcatagaattctgaatta 9328637  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||    
T  9328638 ccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactccaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcga 9328737  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  9328738 gtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatattttcccgttgccatttcgtttgagc 9328798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16098844 - 16098504
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa---tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatg 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||   || || ||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16098844 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaaaaatacggtgactagctcatgaacaggccgccctagctaaaatatg 16098745  T
Q  113 agcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaa 212  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  16098744 agcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataactaatactagaaacaatatcatagaattctgaa 16098645  T
Q  213 tcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||   ||| ||| |    
T  16098644 tcaccatggcccggagacgatggagcttgtactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatttgttagcatcagcaaattgaagggcct 16098545  T
Q  313 cgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatattt 353  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||    
T  16098544 ctagtaaggctactacctctccctccaaaattgtcatattt 16098504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 30493446 - 30493806
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  30493446 aactattatcagtaatcaacaaatattcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgaac 30493545  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| | | |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30493546 aaccatgtttggttgtctcctaacaaacttcactatgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcataaaattctgaatca 30493645  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| | | ||| | |||| |    
T  30493646 ccatggcccgaagacgatagagcttgcactagagtaattgagtcggactcgaagacaacctggtctcatctgttcatatcagctaagtgaacgacatcaa 30493745  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||  | |||| ||||| |||||||||    
T  30493746 gtaaggctactgcct-cccctccaaaactgtcatacttgtctgctgccatttcgtttgagcc 30493806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1581968 - 1581605
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || | ||  || |||||||| |||||||    
T  1581968 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaaaaataagcctccttagctaaactatgagc 1581869  T
Q  116 aatc-atgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatc 214  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1581868 accccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatattataaacaatggcatagaatttcgaatc 1581769  T
Q  215 accatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||| || | |||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| ||| |||    
T  1581768 accatggtccggagacgatagagtttgcattagtgtagatgagttggactccaatagaacccgatctcatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcg 1581669  T
Q  315 agtaaggctactgcct-ccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||    
T  1581668 agtaaggctactgcatcccccctcaaaaactataatatttgccctctgccatttcgtttgagcc 1581605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3275383 - 3275068
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaag-tatgagcaa 117  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  3275383 tattatcattaatcaaacactgtttaatataagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgccctagcttaagctatgatcaa 3275284  T
Q  118 tcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacc 217  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  3275283 ccatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattatgaatcatc 3275184  T
Q  218 atggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagt 317  Q
     |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| || |||||| | |||| |||| ||||    
T  3275183 gtggcctagagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccagtcctatatgttcccaacagcaaagtgaatagcattgagt 3275084  T
Q  318 aaggctactgcctccc 333  Q
    || |  ||||||||||    
T  3275083 aaagtaactgcctccc 3275068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3602003 - 3601728
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||| || ||| | ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  3602003 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatgcaagaaggataagaataaaaaatacggtgacaagcccaacaacagcccgccctagctaaactatgagc 3601904  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3601903 aaccatgttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaatttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataaaattctgaatca 3601804  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttca 291  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  3601803 ccatggtccagagacgataaagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaaacaacccgatcttatatgttca 3601728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17877749 - 17877399
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||| || | |||| |||||||||||||    
T  17877749 aactattatcattaattaatcaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaataacatgccgtcctacctaaagtatgagc 17877650  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  17877649 aaccatggtcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaaattgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattacgaatca 17877550  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| |||  | ||||||||||||||||          ||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||  | || | ||| ||| | ||    
T  17877549 ccatgacccataaacgatagagcttgcac----------gagtcagactcgaagacaacccgattccatctgttcgcatttgtaaagtgaagggccttga 17877460  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  17877459 gtaaggctacttcctccccctccaatactgtcatatttccccgctgcgatttcgtttgagc 17877399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24251787 - 24251621
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24251787 aactattatcattaatcaaccaatgttcaataca---aggataagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 24251691  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataata 185  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24251690 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataata 24251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44481438 - 44481269
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44481438 aactattatcattaatcaacccatgttcaatacaagatggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 44481339  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataata 185  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  44481338 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgtaaagataactggtaaataata 44481269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 30824336 - 30824559
Alignment:
Q  21 ttatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatca 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |  || ||  ||| |||||||||| ||    
T  30824336 ttatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaagataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacagaccacc-taattaaggtatgagcaacca 30824434  T
Q  121 tgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatg 220  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30824435 tgttcgcttatctcctaacaaacttcacttcaaagttggaatgtaaagataactgataaataagactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatg 30824534  T
Q  221 gcccggagacgatagagcttgcact 245  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||    
T  30824535 acccagagacgatagagcatgcact 30824559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 33224396 - 33224565
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  33224396 aactattatcattaatcaaccagtgttcaatacaagaatgataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagataagttatgagc 33224495  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataata 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  33224496 aatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataata 33224565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47580222 - 47580015
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| | | || || ||| ||||||||     
T  47580222 tattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgagaat-aaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgtcttaactgaagaatgagcaac 47580124  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || |  ||||||||||| | || |||||||||    
T  47580123 catgttcgcttgtctcctaccaaacttcacctcgaagttggaatataaagataactgataaataatactagatccaatagcataggactctgaatcacca 47580024  T
Q  219 tggcccgga 227  Q
    |||||||||    
T  47580023 tggcccgga 47580015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24139362 - 24139221
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24139362 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 24139263  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagtt 157  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24139262 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagtt 24139221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Original strand, 35030494 - 35030641
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| |   |||||||   | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35030494 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatactagaaagatata---taaaaatccagtgactaacc-aagaacaggttgctctagctaaagtatgagc 35030589  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35030590 aattatgttcgcttgtctcttcgcaaacttcacctcaaagttggaatgtaaa 35030641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44480972 - 44480893
Alignment:
Q  195 atagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaac 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44480972 atagcataaaattccgaatcaccatgacccggagacgataacgtttgcagtagagtagcggagtcggactcgaagacaac 44480893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24139218 - 24139138
Alignment:
Q  180 ataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcg 260  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24139218 ataatactagaaacaatagcataaaatttcaaatcaacatgacccggagacgacagagcttgcactagagtagctgagtcg 24139138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35013913 - 35013759
Alignment:
Q  13 atcaactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatg 112  Q
    |||||||| |||||||||| |   | ||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||| |    
T  35013913 atcaactaatatcattaattacatattgttcaatacatggaggatagaactcaaaaacacggcgactagccgaagaataggtcgccctagctaaagtacg 35013814  T
Q  113 agcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    ||| | |||  | ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||    
T  35013813 agcgaccatatttgcttgtctcctaataaacttcaacttgaaattggaatgtaaa 35013759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 161
Target Start/End: Original strand, 6056262 - 6056358
Alignment:
Q  65 aaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 161  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| || |||||||| |  |||||| ||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6056262 aaaaacatggcgactaggccaagaacatgccgccctagcaatcgtatgaacaaccatgttcgcttgacgcccaacaaacttcacctcaaagttggaa 6056358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 368
Target Start/End: Original strand, 30824557 - 30824661
Alignment:
Q  262 actcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctg 361  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||| ||| || || | ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  30824557 actcgaagacaacctgatcccatctgttcgcattagaaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcct--cccttcaaaactgtcatatttatccgctg 30824654  T
Q  362 tcatttt 368  Q
    || ||||    
T  30824655 tcttttt 30824661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 165
Target Start/End: Original strand, 43782922 - 43783022
Alignment:
Q  65 aaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 164  Q
    ||||| |||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||||  ||   |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  43782922 aaaaacatggtgactagcccatgaaccggccgccctcgctaaagagtgagcaactatatccgcttgtcgccgaataaactttacctcgaagttggaatgt 43783021  T
Q  165 a 165  Q
    |    
T  43783022 a 43783022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 40588566 - 40588934
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40588566 aactattatcattaatcaactaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgtgc 40588665  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40588666 aatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcatagaattcagaatca 40588765  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
     |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||  |||| ||| ||||    
T  40588766 tcatggcccggggacgatagagtttacactagagtagatgaatcagactcaaagacaacccggtctcatctgtttgcatccgcaaaacgaagggcctcga 40588865  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  40588866 gtacggctactgcctccccctccaaaactgttatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataa 40588934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 377
Target Start/End: Original strand, 477895 - 478253
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||     
T  477895 tattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaacaggacgccctagctaaggtatgagcaac 477994  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  477995 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatatcataaaataccgaatcacca 478094  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagta 318  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  478095 taacccggagacgatagagcttgcactagagtagtagagtcagattcgaagataacccggtcccatctattcacattagcaaagtgaatggcatcgagta 478194  T
Q  319 aggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  478195 aggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccattttgtttgagcc 478253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13415374 - 13415006
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13415374 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagc 13415275  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13415274 aaccatgttcgcttgtctcctagcaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagcataaaattcagaatca 13415175  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  || |||||||| |||||||| || || ||| ||||  |||| ||||   ||| ||| ||||    
T  13415174 ccatggcccggggacgatataccttgcactagagtagaagaatcggactcaaagacaactcgatcccatctgtttgcatccgcaaaaggaagggcctcga 13415075  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  13415074 gtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccgaataa 13415006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7127536 - 7127232
Alignment:
Q  54 ggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcga 153  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7127536 ggataagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcaa 7127437  T
Q  154 agttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagc 253  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  7127436 agttggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaataacatagaatactaaatcaccatggcccggagacgaaagagcttgcactaaagtagc 7127337  T
Q  254 tgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatattt 353  Q
      |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7127336 atagtcagactcgaaggcaacccggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactacctccccctccaaaactttcatattt 7127237  T
Q  354 acccg 358  Q
     ||||    
T  7127236 gcccg 7127232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 99 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23854200 - 23853915
Alignment:
Q  99 ctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatag 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  23854200 ctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaagttcaccttgaagttggaatgtaaagataacggataactaatactagaaacaatag 23854101  T
Q  199 catagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagc 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |    
T  23854100 catagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagttgatgagtcggactcgaagacaactcagtctcatctgttagcatcaac 23854001  T
Q  299 aaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    || | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  23854000 aaagtgaatggcctcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatttttccgctgtcatttcgtttgaacccgaataa 23853915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 384
Target Start/End: Original strand, 8450980 - 8451327
Alignment:
Q  37 aatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcct 136  Q
    ||||||| ||| | |||||||||  || ||||||| || ||||| || ||||   ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| |    
T  8450980 aatgttccatacaagaaggataaggataaaaaatacggtgactagcctaagacagggccgccctaactagagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcnt 8451079  T
Q  137 aacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgataga 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  8451080 aacaaacttcacctcgaagtttgaatgtaaagataactgatanataatactagacacaataacataaaattccgaatcaccatgacctggagacgataaa 8451179  T
Q  237 gcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccct 336  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8451180 gcttgcactaaagtagatgagtcagactcgaagacaacccggtcccatccgttcacatcagcgaagtgaatggaatcgagtaaagctactgcctccccct 8451279  T
Q  337 ccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  8451280 ccaacactgtcatatttgcccgcttcctttttgtttgagcccgaataa 8451327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Original strand, 598073 - 598337
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  598073 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcctaagaacagaccgccttagctaaagtatgagc 598172  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||    
T  598173 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaatttcaccacgaagttgaaatgtaaagataactaataaataatactagaaacaatagcatagaacttcgaatca 598272  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtc 280  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  598273 ccatgacctgaagacgatagagcttgcactagagtagctaagtccgacttgaagacaacccggtc 598337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11870615 - 11870335
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11870615 aactattattattaaccaacaaatgttcaatacaagtaggataagaataaaaaatatggtgattagcccaagaacaggttgccctagctaaagtatgagc 11870516  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  11870515 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaaatccgaatca 11870416  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatca 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |  || || ||||||| ||||| |||||    
T  11870415 ccatggctccgagacaatagagcttgcacaagagtagctgagtcagactcgatggaaatccagtctcatctgttcccatca 11870335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Original strand, 185435 - 185787
Alignment:
Q  22 tatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcat 121  Q
    |||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||  || ||||| || |||| ||||  |||||||||||| ||||| |||  ||    
T  185435 tatcattaattaaccaatgtgcaatacaagaaggataagaattaaaaatgcggtgactatcc-aagatcaggtcgccctagctaaactatgaccaactat 185533  T
Q  122 gctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatgg 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  185534 gttcgcttgtctcctaacaaactacacctcgaatgtg-aatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgg 185632  T
Q  222 cccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaagg 321  Q
     |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||    
T  185633 tccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgtagacaacccggttccatctattcacatcaacaaagtgaatagtatcgagtaagg 185732  T
Q  322 ctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |  ||||| |||||||||    
T  185733 ctacttcct-cccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgagcc 185787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Original strand, 33642610 - 33642859
Alignment:
Q  26 attaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctc 125  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  33642610 attaatcaactaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccaccctagctaaagtatgaacaaccatgttc 33642709  T
Q  126 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccg 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33642710 gcttgtctcctaacaaacttcgccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatatcattgaattctgaatcaccatggcccg 33642809  T
Q  226 gagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacc 275  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  33642810 gagacgacagagcttgcattagagtagatgagttggacttgaagacaacc 33642859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9497125 - 9496797
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  || ||||| ||| ||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  9497125 tattatcattaatcaatcaatgttcaacc-agaaaagataagaataaaaaatacggtgactagtccaagaacaggccgccctagctaaagtataagcaac 9497027  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  9497026 tatgttcgcttgtctcctaataaacttcactctgaagttgggatgtaaatatcacagataaataatgttagcaacaataacatagaattccaagtcacca 9496927  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagta 318  Q
    || | || ||||||||||| ||||||||   | ||||| | |||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| ||| | ||||| |||| ||||    
T  9496926 tgactcgaagacgatagagattgcacta---tggctgaattggactcaaagacaacacggtccca-tagttcacatcaacaaagtgaatgtcatcaagta 9496831  T
Q  319 aggctactgcctccccctccaacactatcatatt 352  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  9496830 aggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatt 9496797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 296
Target Start/End: Original strand, 3606612 - 3606855
Alignment:
Q  55 gataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgc--cctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcg 152  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |  |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3606612 gataagaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggcgtcaccctagctaaagtatgaacaaccatattcgcttgtctcctaacaaacttcacctcg 3606711  T
Q  153 aagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattag 252  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| | | |    
T  3606712 aagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattccaagtcaccatgaccctgagacgatagagtttgtactaaagttg 3606811  T
Q  253 ctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatca 296  Q
     ||||||||||| ||| |||||  |||  ||| |||||||||||    
T  3606812 ttgagtcggacttgaaaacaacttggttccatctgttcacatca 3606855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37712398 - 37712074
Alignment:
Q  36 caatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcc 135  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| | ||||||  ||||| || || |||||||      ||||||||| |||| | || ||||||     
T  37712398 caatgttcaatataaaaaggataataataaaaaatatagtgactaattcaagagcatgccgccctag------tatgagcaaccatgtttgcatgtctct 37712305  T
Q  136 taacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatag 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||| ||||    
T  37712304 taacagacttcacatcgaagttagaatgtaaagataactcataaataatactagaaacaatagcatagtattctgaatcaccat-gtccgaagacaatag 37712206  T
Q  236 agcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccc 335  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||  ||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    ||| |||||| ||| ||||    
T  37712205 agcttacactagagtagcagggtcaaactagaagataacctgatctcatctgttcacatcaacaaagtgaatggcat----taaagctactacct-cccc 37712111  T
Q  336 tccaacactatcatatttacccgctgtcattttgttt 372  Q
    | ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37712110 ttcaaaactgtcatattttcccgctgtcatttcgttt 37712074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 36194457 - 36194626
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||| |   ||||||||||| |||||||    
T  36194457 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacatgtcaccctagctaaactatgagc 36194556  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataata 185  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  36194557 aaccatgttttcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattgaaatataaagataatcgataaataata 36194626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28315457 - 28315316
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  28315457 aactattatcattaatcaattaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaa-acggcgactagcccaggaacagaccgccctagctaaaatatgagc 28315359  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttg 158  Q
    || |||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28315358 aaccatgtttgcttatctgctaacaaacttcgcctcgaagttg 28315316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 34707886 - 34707973
Alignment:
Q  21 ttatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||| |  |||||| | ||||| |||| || ||||||||||    
T  34707886 ttatcattaatcaatcaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatacgatgactaatctaagaataggccgctctagctaaag 34707973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4275975 - 4275914
Alignment:
Q  97 ccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttg 158  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  4275975 ccctaactaaattatgagcaaccatactcgcttgtcgcctaataaacttcacctcaaagttg 4275914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Original strand, 8670217 - 8670301
Alignment:
Q  83 ccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||| ||||||| |||| | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  8670217 ccaagaacaggccgccctagtaagagtgtgagcaaccatgtttgtttgtcgcctaacaaactttacctcaaagttgggatgtaaa 8670301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 32555126 - 32555083
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataa 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  32555126 aactattatcattaatcaaccaatgttcaataaaagaaggataa 32555083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25731159 - 25730799
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25731159 aactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 25731060  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||    
T  25731059 aaccatgttcgcttatctcctaacaaacttcacctggaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaacaataacatagaattcttaatca 25730960  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||| | ||| ||| ||||    
T  25730959 ccatgaccctgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcagtcccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcga 25730860  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  25730859 gtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagc 25730799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20205306 - 20204945
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20205306 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacgttgactggcccaagaataggctgccctagctaaagtatgagc 20205207  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  20205206 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctagaagttggaatgtaaagataactgatatataatactagaaacaatagcatagaattttgaatca 20205107  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| || || ||| | ||||||| ||||    
T  20205106 ccatgacccggagaggatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcaacaacaaagtgaatggcctcga 20205007  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  20205006 gtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcc 20204945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12660667 - 12660299
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||| |||||||||  || || | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12660667 aactattatcattaatcaatcaatgtttaatacaaaaaagataaaaataaaaaatatgttgattagctcaagaacaggccgtcctagctaaagtatgagc 12660568  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  12660567 agtcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagttagaatgtaaacataactgaaaaataatactagaaacaatatcatagaattctgaatca 12660468  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  12660467 ccgtggcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgacgataacacggtctcatttgttcacattagcaaagtgaatgacatcga 12660368  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  12660367 gtaagactactgcctcccgctctaacactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataa 12660299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4268454 - 4268082
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataa----aaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtat 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    |||  ||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4268454 aactattatcattaatcaaacaatgctcaatacaagaaggataataataaaaaaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccctagataaagtat 4268355  T
Q  112 gagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4268354 gagcaaccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgagaattaatactagaaacaatagcatagaattccga 4268255  T
Q  212 atcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggca 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||  ||||||||| | ||| |||     
T  4268254 atcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagaaaacccggtcccacctgttagcatcagcaaagtgaagggcc 4268155  T
Q  312 tcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4268154 tctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcctgaataa 4268082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8388437 - 8388071
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||  |  ||||||||||  |||||||    
T  8388437 aactattatcattaatcaaccagtgtttaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaaaccaccctagctaagctatgagc 8388338  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8388337 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcccctcgaagttggaatgtaaagaaaactgaaaaataatactggaaacaatagcataaaattctgaatca 8388238  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||| | ||||||||||||    
T  8388237 ccatggcctggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaaccgcaaagtgaatggcatcga 8388138  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||   || || ||||| ||||||||| ||||    
T  8388137 gtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaat 8388071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 382
Target Start/End: Original strand, 26597302 - 26597659
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||| || || ||  |||||||||||||||||||         |||||    
T  26597302 aactattatcattaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaatcaaatatacggtgattagtccaagaacaggctgcccta---------tgagc 26597392  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  26597393 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgaaaaataatactagaaacaataacataaaattccgaatca 26597492  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | |||| | ||||||||||||    
T  26597493 ccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatctattcccaactgcaaagtgaatggcatcga 26597592  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||| | || || ||||| ||||||||| ||||    
T  26597593 gtaaggcaactgcctccccctccaaaattgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaat 26597659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Original strand, 15988593 - 15988953
Alignment:
Q  26 attaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa--tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgc 123  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||     
T  15988593 attaatcaactaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaaaatatggtgactagcccaatagcaggccgccttagctaaagtatgagcaaccatgt 15988692  T
Q  124 tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcc 223  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15988693 ctgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgtaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggcc 15988792  T
Q  224 cggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggct 323  Q
     | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |  || ||| |||||||||| |    
T  15988793 tgaagacgatagagattgcactagagtagctgagacggacttgaagacaacccggtcccatatgttcgcatcagcaaagtaaagggcctcgagtaaggtt 15988892  T
Q  324 actgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  15988893 actgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccgaataa 15988953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27292784 - 27292417
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  27292784 aactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatg-tcccctagctaaagtatgagc 27292686  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  27292685 aaccatgttcgcttgtctcctgataaacttcactttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcataaaattccaaatca 27292586  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| | ||| |||||| |    
T  27292585 ccatggcctggagacgatagagtttgcactagagcagatgagtcgaactcgaagacaacccggtcccatctgttatcatcagcaaagtgaagggcatcta 27292486  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27292485 gtaaggctattgcctcccccttcaaaacaataatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataa 27292417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 353
Target Start/End: Original strand, 41940578 - 41940909
Alignment:
Q  22 tatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa-tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatca 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  41940578 tatcattaatcaaccaatgttcaataaaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaataacaagcagtcctagctaaagtattagcaatca 41940677  T
Q  121 tgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatg 220  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41940678 tgttctcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataaccggtaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacaatg 41940777  T
Q  221 gcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaag 320  Q
    | || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||    
T  41940778 gtccagagacgatagagtttgcactagagtagttgagtcggactcgaagacaacccggtc-cagttgttcacatgagcaaagtgaatgacattgagtaag 41940876  T
Q  321 gctactgcctccccctccaacactatcatattt 353  Q
    |||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  41940877 gctattgtctccccctccaaaactgtcatattt 41940909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Original strand, 11375361 - 11375717
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11375361 tattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgaatagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagcaac 11375460  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||       || | ||  ||||||||||||||||||    
T  11375461 tatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcggagttggaatgtaaagataactcataaataat-------acgagag--tagaattccgaatcacca 11375551  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagta 318  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||   ||| ||| |||||||    
T  11375552 tggaccggagacgatagagcttgcactagaatagatgaatcagactcaaagacaacccggtcccatatatttgcatccgcaaaatgaagggcctcgagta 11375651  T
Q  319 aggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  11375652 aggctactgtctccccctccaaaactgtcatatttactcgctgccatttcgtttgagtccgaataa 11375717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 22767109 - 22767461
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  22767109 aactattatcattcatcaaccaatgttcaacacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccttagctaaagtatgagc 22767208  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||                ||||| ||||||||||| |||| |    
T  22767209 aaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactg----------------acaatcgcatagaattctgaatta 22767292  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||    
T  22767293 ccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcaaactcgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcga 22767392  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  22767393 gtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataa 22767461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 384
Target Start/End: Original strand, 27532777 - 27533110
Alignment:
Q  51 gaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacct 150  Q
    ||||||||| ||| |||||||  | || || |||||||||| |   ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27532777 gaaggataagaataaaaaatacagtgattagcccaagaacatgtcaccctagctaaagtataagtaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacct 27532876  T
Q  151 cgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagatt 250  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |      
T  27532877 cgaagttggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaatagcaaagaattctgaatcaccatgacccggagacgataaagtctgcactaaaga 27532976  T
Q  251 agctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcata 350  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||    
T  27532977 agcaaagtcggactcgaaaacaacccggtcccatctattcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaagctattgcctccccctccaaaactgttata 27533076  T
Q  351 tttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||| || |||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  27533077 ttttcctgctaccatttcgtttgagcccgaataa 27533110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Original strand, 34652097 - 34652448
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtat--ga 113  Q
    ||||||| || |||||||| |||| ||||||| | ||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| | ||   ||||| ||||||||  ||    
T  34652097 aactattgtccttaatcaaccaatattcaatacaagaaagataagaataaaaaatacggtgactaacccaagaataagccatcctagttaaagtatatga 34652196  T
Q  114 gcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaat 213  Q
    |||| |||| ||||||||||    ||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||    
T  34652197 gcaaccatgttcgcttgtct----acaaac-----ctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaataacatataattctgaat 34652287  T
Q  214 caccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatc 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  34652288 caccatggcccagagacggtagagcttgcactagagtagtcgagtcgggctcgaagacaacccgatcccatctgttcacatcggcaaagtgaatggcatc 34652387  T
Q  314 gagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgag 375  Q
    |||||||| || |  |||||| | ||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  34652388 gagtaaggttattatctccccttacaacactgtcatatttgctcgctg-ccttttgtttgag 34652448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32632862 - 32632603
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||     
T  32632862 tattatcattaatcaaccaatgttcaatccaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgcc-tagctaaagtatgggcaac 32632764  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
     ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  32632763 tatgttcgcttgtctcataataaacgtcacctcgaagttagaatgtaaagataacaaataaataatattagaaacaatgtcatagaattctgaatcacta 32632664  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggt 279  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  32632663 tggctcggagacgataaagcttacactaaagtagatgagtcagactcaaagacaacccggt 32632603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23075139 - 23074951
Alignment:
Q  60 aaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgg 159  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||||||||| |  | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23075139 aaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgtcgtcctagctaaactatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttaaagttgg 23075040  T
Q  160 aatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactaga 248  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  23075039 aatgtaaacataactgataaataatactataaacaataacatagaattatgaatcaccatggaccgaagacgataaagcttgcactaga 23074951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 272
Target Start/End: Original strand, 30222744 - 30222930
Alignment:
Q  84 caagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataa 183  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  30222744 caagaacaggccgccctaattaaagtatgagcaatcatgtttgcatgtctcttaacaaacttcacatcaaagttagaatgtaaagataattgataaa--a 30222841  T
Q  184 tattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagaca 272  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  30222842 ttctataaacaatagcatagaattccgaatcaccgtgacccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcagattcgaagaca 30222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Original strand, 30573513 - 30573698
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |    
T  30573513 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacccaaaaacagaccgccttagctaaaatatgaac 30573612  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcat 201  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  30573613 aaccatgttcgcttgtcttctaacaaatttcacctcaaaattaaaatataaagataactgataaataatactaaaaacaatagcat 30573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26076632 - 26076480
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaag-tatgag 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||  | || || |||||||||||||| ||||  |||||  ||||||    
T  26076632 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatacagtgattatcccaagaacaggctaccctgactaaaaatatgag 26076533  T
Q  115 caatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26076532 caaccatgtttgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaa 26076480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37448251 - 37448117
Alignment:
Q  241 gcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaa 340  Q
    |||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  37448251 gcactagagtagttgaattgaactcgaagacaacccggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctaccgcctcccctttcaa 37448152  T
Q  341 cactatcatatttacccgctgtcattttgtttgag 375  Q
    |||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  37448151 cactgtcatgtttgcacgctgccattttgtttgag 37448117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 204
Target Start/End: Original strand, 31908320 - 31908420
Alignment:
Q  104 taaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatag 203  Q
    |||||||||||||| |||| | | || ||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31908320 taaagtatgagcaaccatgtttgtttatcgactaacaaacttcatctcaaagttgaaatgtgaagataactgataaataatattataaacaatagcatag 31908419  T
Q  204 a 204  Q
    |    
T  31908420 a 31908420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 40018964 - 40018894
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaa 86  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  40018964 aactattatcattaatcaattaatgtttaatataaaaaggataataataaaaaatacggcgactaatccaa 40018894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 3308181 - 3308234
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa 69  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||    
T  3308181 aactattatcattaatcgatcaatgttcaatacaagaaggagaaaaataaaaaa 3308234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23083688 - 23083639
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaa 68  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  23083688 tattatcattaatcaatcaatattcaatacaagaaggataaaaataaaaa 23083639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26296418 - 26296365
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  26296418 aactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa 26296365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 382
Target Start/End: Original strand, 48949560 - 48949926
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  48949560 aactattatctttaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagctaagctatgagt 48949659  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48949660 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattccgaatca 48949759  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||| | |||| |||||||    
T  48949760 ccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagttgaactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatcgcatcga 48949859  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| ||||||||| ||||    
T  48949860 gtaaggcaactgcctccccctccaaaactttcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaat 48949926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25683002 - 25682641
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||||| || || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25683002 aactattatcattaatcaacaaatgttcaatataagaaagataggaattaaaagtacggtgactaacccaagaacatgcctccctagctaaagtatgagc 25682903  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||    
T  25682902 aaccatgctcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttagaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagtatagaattctaaatca 25682803  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  25682802 ctgtggcccggagacgatagagcttgtactagagtagctgagtcaaactcgaagacagcccggtcccatctgttcacattagcaaagtgaatgacatcga 25682703  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  25682702 gtaaggctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcc 25682641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44527605 - 44527236
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa-tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgag 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44527605 aactattatcattaatcaagcaatgttcaatacaaaaaggataataataaaaaaatacggtgattaacccaagaacaggccgccctagttaaagtatgag 44527506  T
Q  115 caatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatc 214  Q
    ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44527505 cagccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactaataattaatactagaaacaatagcatagaattccgaatc 44527406  T
Q  215 accatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcg 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| | ||| ||| ||     
T  44527405 accatggcccggagatgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctct 44527306  T
Q  315 agtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44527305 agtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataa 44527236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5609690 - 5609322
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||  | ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5609690 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacatgccgccctagctaatgtatgagc 5609591  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5609590 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 5609491  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| | ||| | | ||||    
T  5609490 ccatgaccctgagacgatagagtttgcactagagtagatgagtcgaactcgaagacaacccgatctcatctgttcgcaacatcaaagtgaaggacctcga 5609391  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  5609390 gtaaggctactgcctcccccttcaaaactatcatatttgtccgctgtcatagagtttgagcccgaataa 5609322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36734041 - 36733679
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  36734041 aactattatcattaatcaaccaatattcaatacaagaaggataagaattaaaaatacgatgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatg--- 36733945  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
       |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||||    
T  36733944 ---catgttcgcttgtctcgtaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaataacatagaattatgaatca 36733848  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||    
T  36733847 tcatggcccggagacgatatagcttgcactagagttatagagtcagactcgaagacaacccggtcccatttgttcacatcagcaaagtgaataacattga 36733748  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36733747 gtaagactactgcctccccctccaaaactgccatatttacccgttgtcattttgtttgagcccgaataa 36733679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44603095 - 44602766
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||     ||||||||| |     
T  44603095 tattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgcccta-----agtatgagccac 44603001  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44603000 catgttcgcttgtcccctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattttgaatcacca 44602901  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagta 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||    
T  44602900 tggcccggagatgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaaggcaacccggtctcatctgttcacatcagtaaagtgaatgacatcgagta 44602801  T
Q  319 aggctactgcctccccctccaacactatcatattt 353  Q
    || ||| || |||||||||||| | | ||||||||    
T  44602800 agactaatgtctccccctccaaaattgtcatattt 44602766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4395509 - 4395149
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4395509 aactattatcgttaatcaactaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 4395410  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4395409 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaataggatagaattctgaatca 4395310  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||| | ||| ||||||||| | ||| ||| ||||    
T  4395309 ccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagttggactcgaagataacctggtcccatctattcgcatcagcaaagtgaagggcctcga 4395210  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  4395209 gtaaggctagtgcct-ccccttcaaaactctcatatttgcccgctgccatttcgattgagcc 4395149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51113666 - 51113342
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  51113666 aactattatcattaatcaaccagtattcaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactaacccaagaacaggtcgccctagctaagctatgagc 51113567  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  51113566 aaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgttaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaactccgaatca 51113467  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||| | ||||| ||||||    
T  51113466 ccatggcccagagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaagtgaatgacatcga 51113367  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaa 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  51113366 gtaaggcaactgcctccccctccaa 51113342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Original strand, 16816633 - 16816995
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||  || ||||||| || ||||| |||||||| | |  |||||| |||||||||||||    
T  16816633 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacgagatggataaggataaaaaatacggtgactagcccaagaataagtcgccctaactaaagtatgagc 16816732  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  16816733 aaccatgttctcttctctcctaacaaacttcaccttaaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcgtagaattccgaatca 16816832  T
Q  216 ---ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcat 312  Q
       ||||||| |||||||| |||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||   ||| ||| |    
T  16816833 cgtccatggctcggagacggtagaacttgaactagagtagacgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatcagcaaaatgaagggcct 16816932  T
Q  313 cgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  16816933 cgagtaaggctactgcct-cccctccaaaattgtcatatttgcccactgccattttgattgagc 16816995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2885578 - 2885313
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa-tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgag 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2885578 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacaggtcgccctagctaaagtatgag 2885479  T
Q  115 caatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataatt----gataaataatattataaacaatagcatagaattccg 210  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||| || ||||||||||||| || ||||    
T  2885478 caa-catgttcgcttgtatcctaacaaacttcaccacgaagttgaaatgtaaagataattaactgataaataatactagaaacaatagcatataactccg 2885380  T
Q  211 aatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccg 277  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2885379 aatcaccatagcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtctgactcgaagacaacccg 2885313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21031488 - 21031251
Alignment:
Q  28 taatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgc 127  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  21031488 taatcaaccaatgttcaatacgagaaggataagaataaaacatacggtaactaacccaaaaacaggctgccctggctaaactatgagcaatcatgttcgc 21031389  T
Q  128 ttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccgga 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  21031388 ttgtctcctaaaaaacttcacctcgaagttaggatgtaaagataattgataaataatactagaaactataacataaaattccgaatcaccatagtccgga 21031289  T
Q  228 gacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactc 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21031288 gacgatagagcttgcactagaatagctgagtcagactc 21031251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52109768 - 52109437
Alignment:
Q  52 aaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctc 151  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||  ||| | | ||||||| |||||||||| ||||     
T  52109768 aaggataagaattaaaaatacggtgactagtccaagaacatgtcgccctatctaaagtatgaacaactatgtttgtttgtctcataacaaactttacctt 52109669  T
Q  152 gaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagatta 251  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  52109668 gaagttagaatgtaaagataactgataactaatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggtccggagacaatagagcttgtactagagta 52109569  T
Q  252 gctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatat 351  Q
    | ||| ||  |||| ||||||||||  || ||| ||||  ||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||    
T  52109568 gatgaatcacactcaaagacaaccc-atcccatctgttagcatcagcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaatgatcatat 52109470  T
Q  352 ttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  52109469 ttgcccgctgccatttcgtttgagcctgaataa 52109437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48166568 - 48166220
Alignment:
Q  26 attaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctc 125  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||  |||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  48166568 attaatcaaccaatattcaatacaagaaggataaaaatcaaagatacggtgactagcccaagagtaggccgctctagttaaagtacgagcaatcatgttc 48166469  T
Q  126 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccg 225  Q
    | |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||  ||||||||           ||||||||||||||| | |||||||| | ||     
T  48166468 gtttgtttcctaacaaacttcatcttgaagttgaaatgtaaagataacagataaatat----------aatagcatagaattctgtatcaccatcgtccc 48166379  T
Q  226 gagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctac 325  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  48166378 aagactatagagcttgcaatagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgatcccatatattcacataagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctat 48166279  T
Q  326 tgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    || ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  48166278 tgtctcccactccaaaactgtcatatttgctcgctgccatttcatttgagcccgaataa 48166220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24538839 - 24538586
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa-tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgag 114  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  24538839 aactattatcattaatcaactaatgtttaatacaagaaggataaaaaaaaaaaaatatggtgactagccgaagaacatgttgtcctagcaaaagtatgag 24538740  T
Q  115 caatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatc 214  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||    
T  24538739 caatcatgttcgcttgtttcctaacgaacttcacctcaaagttagaatgtaaagataacagataaataatactagaaataatagcgtagaattctgaatc 24538640  T
Q  215 accatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaa 268  Q
    || ||| |||| ||  |||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  24538639 actatgacccgaagcagatagatcttgcactagagtagaagagtcagactcgaa 24538586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14485357 - 14485149
Alignment:
Q  20 attatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatc 119  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||| | ||||||||| ||| |||||||||   |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  14485357 attatcattaatctaccaataatcaatacaagaaggataagaataaaaaatatgattactagctcaagaacaagccgccctagctaaagtatgagcaact 14485258  T
Q  120 atgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccat 219  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||      |||||||||| ||||||||||    
T  14485257 atgttcgtttgtctcctaatgaacttcaccttaaagttggaatgtaaaaataactgataaacaatactaaaaa------catagaattctgaatcaccat 14485164  T
Q  220 ggcccggagacgata 234  Q
    | | | |||||||||    
T  14485163 gactcagagacgata 14485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 4898460 - 4898607
Alignment:
Q  20 attatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatc 119  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||| | ||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  4898460 attatcattagtcaaccaatgtttaatataagaatgatgagaataaaaaatacagcgtctaactcaagaacaggtcggcctaactaaagtatgagcaatc 4898559  T
Q  120 atgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  4898560 atattcgtttgtctcctaacaaactttacatcgaagttgaaatgtaaa 4898607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17371776 - 17371648
Alignment:
Q  39 tgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaa 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| || | ||||||| || ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||    
T  17371776 tgttcaatacatggaggatataactcaaaaatacggtgactagctcaagaacatgccgccctagctaaggtatgagcgaccatattcgcttgtctcctaa 17371677  T
Q  139 caaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17371676 taaacttcaccttgaagttggaatgtaaa 17371648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5594385 - 5594266
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| ||||||| || || ||  ||||||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  5594385 aactattatcattaatcaatcaatatttaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagtccaagaacatgccgtcctagttaaagtatgagc 5594286  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcc 135  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  5594285 aaccatgttcgcttgtctcc 5594266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23163418 - 23163357
Alignment:
Q  100 tagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23163418 tagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtcttctaacaaactttatctcgaagttggaa 23163357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23332781 - 23332649
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaa-ggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgag 114  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||| || ||   ||||| |||||| | |    ||||||| |||||||||    
T  23332781 aactattattattaatcaaacaatgttcaatacaagaaaggataaaaataaaaattacggtagctaactcaagaatacgtcatcctagctcaagtatgag 23332682  T
Q  115 caatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttca 147  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23332681 caaccatgctcgcttgtcttctaacaaatttca 23332649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 197
Target Start/End: Original strand, 38679016 - 38679113
Alignment:
Q  100 tagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaata 197  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  38679016 tagctaaggtatgagtaatcatattcatttttcgcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagctaccttataaataatattagaaacaata 38679113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 59
Target Start/End: Original strand, 3297036 - 3297079
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataa 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  3297036 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataa 3297079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23163461 - 23163419
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggata 58  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23163461 aactattattattaatcaatcaatgttcaatacaagaaggata 23163419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 32576884 - 32577252
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32576884 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaaacaaaaatacagtgactagcccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 32576983  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32576984 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatcgcatagaattctgaatca 32577083  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||| |  ||| ||| |||    
T  32577084 ccatgtcccgctgacgattgagcttgcactagagtagcagagtcagactcgaagacaacccagtcccatatgtttacatcagcaaagtaaatagcagcga 32577183  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  32577184 gtaaggctagtacctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataa 32577252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49951664 - 49951296
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49951664 aactattatcattaatcaactaatgttcaatacaataaggataagaataaaaaatacaatgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 49951565  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49951564 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattctgaatca 49951465  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||| | ||| ||| ||||    
T  49951464 ccacggcccgaagatgataaagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctcga 49951365  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  49951364 gtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataa 49951296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 37245694 - 37246056
Alignment:
Q  22 tatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcat 121  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||  || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  37245694 tatcattaatcaactaatgtgcaatacaagaaggataagagttaaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaaccat 37245793  T
Q  122 gctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatgg 221  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37245794 gttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgg 37245893  T
Q  222 cccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaagg 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  37245894 cccagagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgaagacaacccggtcccatctgttcacataagcaaagtgaatagcatcgagtaagg 37245993  T
Q  322 ctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |  ||||| ||||| ||| ||||||    
T  37245994 ctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgtgcccgaataa 37246056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2065201 - 2064836
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  2065201 tattatcatcaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgctaccctagctaaagtatgagcaac 2065102  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2065101 catgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatataatttcgaatcacca 2065002  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagta 318  Q
    || || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    ||| ||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||    
T  2065001 tgacctggagacgatagagcttgggctagagtagatgagtccgactcaaagacaacccgactccatctgttctcatcagcaaagtgaagggcgtcgagta 2064902  T
Q  319 aggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2064901 aggctactgcctcccccttcaatactgtcatatttgcccgctgtcattttgtttgagcccgaataa 2064836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 29655502 - 29655870
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||  || || || || |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29655502 aactattattattaatcaatcaatgttcaataaaagaatgataagaataaaaaatgcggtgattagccaaagaacaggtcgccctagctaaagtatgagc 29655601  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  29655602 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagtggaaatgtaaagatagctgataaataatactagaaacaataacatagaattctgaatca 29655701  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  29655702 ccatggcccgaagatgatagagcttgcactagagtagcgtagtcagactcgaagacaacacggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcga 29655801  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29655802 gtaaggctactgcctctccctccaaaacagtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccgaataa 29655870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 41835148 - 41835515
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||     
T  41835148 aactattatcattaatcaaccaatgt-caatacaagaaagataagaataaaaaatatagtgactagcccaagaacaggccgccctatctaaactatgagg 41835246  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  41835247 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataggattccgaatca 41835346  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||   ||| ||  ||||    
T  41835347 ccatggcccggagacgatagcgtttgcactagagtagatgaatcgaactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatccgcaaaatgaagggtctcga 41835446  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41835447 gtaaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgccagctgtcattttgtttgagcccgaataa 41835515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21321881 - 21321510
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21321881 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 21321782  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataa-acaatagcatagaattccgaatc 214  Q
    || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||||    
T  21321781 aaccatgatcgcttgtctcttaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatattggaacacaataacatagaattctgaatc 21321682  T
Q  215 accatggcccggagacgatagagc--ttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcat 312  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| || | ||| ||| |    
T  21321681 accatgaccctgagacaatagagcaattgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagaaaagtgaagggcct 21321582  T
Q  313 cgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  21321581 cgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataa 21321510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 51734808 - 51735175
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| ||| ||| ||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51734808 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaatcaaagatacggtaattagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 51734907  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||||    
T  51734908 aaccatgttcacttgtcacctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacagataaataatactagaaacaatatcatagaattatgaatca 51735007  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||| | |||  || | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  51735008 ccatggtccagagacgatagagcttgcactagagtagaggagcctgactcgaagacaactc-gtcctatctattcacatcagcaaagtgaatggcatcga 51735106  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  51735107 gtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcacgctgtcatttcgtttaagcccgaataa 51735175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 56065981 - 56065614
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| |||| ||| ||||||| || ||||| |||||  | |||| |||||||||||  |||||||||     
T  56065981 tattatcattaatcaatcagtgtttaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaac 56065882  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccg----aatc 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||    
T  56065881 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatc 56065782  T
Q  215 accatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcg 314  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||| | |||||||||||    
T  56065781 accatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcg 56065682  T
Q  315 agtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||    
T  56065681 agtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaat 56065614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 18441983 - 18442349
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18441983 aactattatcaataatgaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaaatatgagc 18442082  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18442083 aaccattttcgtttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatataaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 18442182  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||| ||  |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||| ||||| || |||||| | | | ||| ||||    
T  18442183 ccatgggccaaagacgatatagcttgcactag--tagatgagtcgcactcgaaaataacccggttccatctgttcgcaacagcaaagtgtagggcctcga 18442280  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  18442281 gtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgcttccatttcgtttgagcccgaataa 18442349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 28537619 - 28537989
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa--tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaag--tat 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||| |||||  ||||| |||||| |||||||||| |   |||    
T  28537619 aactattatcattaatcaaccaatattcaatataagaaggataagaataaaaaaaatatggtgactagtccaaggacaggccgccctagctatatactat 28537718  T
Q  112 gagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccga 211  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||  ||    
T  28537719 gagcaaccatgttcgcttgtcttctaccaaacttcacctcgaagttggaatgtaatgataactgattaataatactagaaacaatagcatagaattttga 28537818  T
Q  212 atcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggca 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | ||| |||     
T  28537819 atcaccatggcccagagacgatagagcttgcactaaagtagatgagtcggacttgaacacaacccggtcccatctgttcgcatcaacaaagtgaagggcc 28537918  T
Q  312 tcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  28537919 tcgagtaaggctactgcctccccctc--aaactatcatattttcccgctgccatttcgtttgagcccgaataa 28537989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 26422438 - 26422764
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  26422438 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggccgccgtagttaaagtatgagc 26422537  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26422538 aaccatgtttgtctgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactaaaaacaatcgcatagaattctgaatca 26422637  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    | ||| ||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |  ||| |||||||    
T  26422638 ctatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactcgaagacaacccgatcccatctgtttacatcagcaaagtaaatagcatcga 26422737  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaaca 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26422738 gtaaggctactgcctccctctccaaca 26422764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28426534 - 28426173
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  28426534 aactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccaccttagctaaagtatgagc 28426435  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||  ||| |    
T  28426434 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcatataattctaaatta 28426335  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| |||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||    
T  28426334 ccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcga 28426235  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || | || ||||| |||||||||    
T  28426234 gtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcc 28426173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Original strand, 49119236 - 49119597
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  49119236 aactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccaccttagctaaagtatgagc 49119335  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||  ||| |    
T  49119336 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcatataattctaaatta 49119435  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| |||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||    
T  49119436 ccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaagtgaatagcagcga 49119535  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || | || ||||| |||||||||    
T  49119536 gtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcc 49119597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 382
Target Start/End: Original strand, 51259365 - 51259732
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || |||| |||||||||||  |||||||    
T  51259365 aactattatcattaatcaaccagttttcaatacaaaaaggataataataaaaaatacggtgactagcccaaaaataggccgccctagctaagctatgagc 51259464  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  51259465 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaataacataaaattctgaatca 51259564  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |  || || || |||||| | ||||| ||||||    
T  51259565 ccatggcccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacctggtccgaactgatcccaacagcaaagtgaatgacatcga 51259664  T
Q  316 gtaaggctactgcct-ccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| ||||||||| ||||    
T  51259665 gtaaggcaactgcctcccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaat 51259732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 55735366 - 55734999
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| || ||   ||| ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  55735366 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgagaattaaaaatatggtgattagatcaaaaacagaccgccctagctaaactatgagc 55735267  T
Q  116 aatcatgctcgcttgt------ctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattcc 209  Q
    || |||  | ||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||     
T  55735266 aaccatatttgcttgtagttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgttaagataactgatcaataatactagaaacaatagcatagaattct 55735167  T
Q  210 gaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatgg 309  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| || || ||| | ||| ||    
T  55735166 gaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcactagagtagatgaatcggactcgaaaataacccggttccatgtgttcgcaacaacaaagtgaaggg 55735067  T
Q  310 catcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagcc 377  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  55735066 cctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgctcgcttccatttcgtttgagcc 55734999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 44935918 - 44936178
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||    
T  44935918 aactattatcattaatcaatcaatattcaatacaagaaggataaaaaaaaaaaatacggtgactaacccaagaacatgccgtcatagctaaactatgagc 44936017  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||    
T  44936018 aaccatgttcgcttgtctgctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataataatagaaacaataacatagaattctaaatca 44936117  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaaccc 276  Q
    || ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  44936118 ccgtggcccgaaaacgatagagtttgcactagagtaaatgagtcggactcgaacacaaccc 44936178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 43840161 - 43840511
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  || |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  43840161 aactattatcgttaatcaaataattttcaatacatgaaagataagaataaaaaatacgatgattaattcaagaacagactgccctagttaaagtatgaac 43840260  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||                   |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43840261 aaccatgttcgtttgtttcctaaccaacttcactttaaagttggaat-------------------aatactagaaacaatagcatagaattccgaatca 43840341  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43840342 ccatggtccgaagacgatagagcttgcattagagtagctgagtcgaactcgaagacaaaccggtctcatttgttcacatcagcaaagtgaatggcatcga 43840441  T
Q  316 gt-aaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    || |||| |  || |||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  43840442 gtaaaggttgttgtctccccctccaacactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgaccccgaataa 43840511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 340
Target Start/End: Original strand, 47226168 - 47226490
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||| ||| ||||||| || || || |||||||| | |  ||||||| ||   ||| |||    
T  47226168 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaagataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaaaatgtcgccctagttac--tataagc 47226265  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||    
T  47226266 aatcatgtttgcttgtcgcctaacattcttcactttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcatataaatctgaatca 47226365  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| | |||  || ||||    
T  47226366 ccatggcctgaagacgatagagcttgctctaaagtagatgagtcggactcgaacacaactcgatctcatctgttcgcatcagcaaagtgaaaagcctcga 47226465  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaa 340  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||    
T  47226466 gtaagactattacctccccctccaa 47226490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Original strand, 24989770 - 24990027
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||| |||| || || || || | ||| ||||     |||||| |||||||| |||    
T  24989770 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaaaaagaataagaataaaaagtacggtgattagctcaaaaacatatcaccctagataaagtataagc 24989869  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||  ||||||    
T  24989870 aaccgtgttcgtttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaac-ataacatagaattttgaatca 24989968  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaac 274  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24989969 ccgtggcccagagacggtagagcttgcactagagtagctgagtcagactcaaagacaac 24990027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 8754298 - 8754502
Alignment:
Q  15 caactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||  |||| ||| ||||||| || ||||| || |||||||| | || ||| |||||||| |||    
T  8754298 caactattatcattaatcaaataatgttgaatacaagaaaaataagaataaaaaatacggtgactatccaaagaacagaccgctctatctaaagtacgag 8754397  T
Q  115 caatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatc 214  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||    
T  8754398 caaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagtatagaattccaaatc 8754497  T
Q  215 accat 219  Q
    |||||    
T  8754498 accat 8754502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23095559 - 23095401
Alignment:
Q  22 tatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcat 121  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  23095559 tatcattaatcaactaatgtgcaatacaaaaatgataagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccaccctagctaaaatatgagtaatcat 23095460  T
Q  122 gctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaa 180  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23095459 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaa 23095401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 10575285 - 10575377
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaag 108  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10575285 aactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatatggtgactagcccaaaaacaggccgccctagctaaag 10575377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Original strand, 6753955 - 6754051
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatga 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  6753955 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgact-agccaagaacaggccaccttagctaaagtatga 6754051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 51364567 - 51364710
Alignment:
Q  18 ctattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa-tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagca 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||  |||||||| ||||| || || |||   ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51364567 ctattatcattaatcaaccaatgttcaatacaacaacaataaaaataaaaaaatacggtgacg--cccaagggcaggttgccctagctaaagtatgagca 51364664  T
Q  117 atcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaa 166  Q
    |  ||  ||| |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  51364665 acaatattcgtttgtcttctaacaaacttcac----aagttggaatgtaa 51364710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40727222 - 40727169
Alignment:
Q  108 gtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 161  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40727222 gtatgagcaactatgctcgcttgacgcctaacaaacttcacctcaaagttggaa 40727169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 53661318 - 53661187
Alignment:
Q  65 aaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||  || |||||||||| | ||||| ||| || ||  |||| ||  || |||||||||||| |||||    
T  53661318 aaaaatatggtgactaacccaagaacatgccgcccgtgc-aaagtatgagtagtcatgttcgtttatcgtctaataatttttacctcgaagttgaaatgt 53661220  T
Q  165 aaatataattgataaataatattataaacaata 197  Q
    |||  ||| | ||||||||||| | ||||||||    
T  53661219 aaagctaactcataaataatataagaaacaata 53661187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 21163372 - 21163425
Alignment:
Q  108 gtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 161  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21163372 gtatgagcagtcatgttcgcttgacgcctgacaaacttcacctcaaagttggaa 21163425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 361
Target Start/End: Original strand, 34695740 - 34696085
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||  || ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34695740 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgccctagctaaagtatgagc 34695839  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34695840 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcataaaattctgaatca 34695939  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||| | ||||||| | ||    
T  34695940 ccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaagtgaatggccttga 34696039  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  34696040 gtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctg 34696085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 361
Target Start/End: Original strand, 34718152 - 34718497
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||  || ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34718152 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgccctagctaaagtatgagc 34718251  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34718252 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcataaaattctgaatca 34718351  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||| | ||||||| | ||    
T  34718352 ccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaagtgaatggccttga 34718451  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  34718452 gtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctg 34718497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 385
Target Start/End: Original strand, 12130474 - 12130843
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||  |||| | |||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  12130474 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtaactagctcaagaataggccctcctagctaaagtatgagc 12130573  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12130574 aaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaataatagcatagaattctgaatca 12130673  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |  ||| | ||  ||||||||| | |||  || || |    
T  12130674 ccatgtcccgaagatgatagagcttggactagagtagatgagtcagactcgaagataacccgattccatctatttgcatcagcaaagtgaagagcctcaa 12130773  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataat 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12130774 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttgctcgctgtcatttcgtttgagcccgaataat 12130843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 88910 - 88542
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  88910 aactattatcattaatcaaccaatgctcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatgagc 88811  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  88810 aaccatgttcgcttgtctccaaataaacttcacgttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatactggaaacaatagcatagaattctgaatca 88711  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||| | ||| ||| ||||    
T  88710 ccatgatcttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcaacaaagtgaagggcctcga 88611  T
Q  316 gtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  || |||||  |||||||| ||||||    
T  88610 gtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccattgccatttcatttgagcccgaataa 88542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 336
Target Start/End: Original strand, 1417826 - 1418137
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaa-tatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  1417826 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacagcctgccctagctaaactatga- 1417924  T
Q  115 caatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatc 214  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  1417925 ---------tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatc 1418015  T
Q  215 accatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcg 314  Q
    ||||| | || ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||  | |||  | |||    
T  1418016 accatagtccagagacaatagagcttgaactagagtagatgagtcagactcgaagacaacccagtcccatctgtttgcatcagcaaatcaaattacctcg 1418115  T
Q  315 agtaaggctactgcctccccct 336  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  1418116 agtaaggctactgtctctccct 1418137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9710306 - 9710042
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||  |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  9710306 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaactaaaaatacggttactagcccaagaacagaccgtcttagctaaagtatgagc 9710207  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||  |||| |    
T  9710206 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaattgcatagaattatgaatta 9710107  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtc 280  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  9710106 ccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcaaagtcagactcgaagacaacccggtc 9710042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26199030 - 26198707
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| | |||||| | |   |||||||||||||||||| ||     
T  26199030 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaatgataagaataaaaaatgcggtgactagctcaagaagaagtcaccctagctaaagtatgagaaac 26198931  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    |||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||    
T  26198930 catgttcacttgttacctaacaaacttcacctcaaagttgaaatgtaaagataactggtaaataatactagaaacaatagcatagaatttcaattcacca 26198831  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagta 318  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||        |||||||| ||||| |  ||||||||| || |    
T  26198830 tgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagac--cccgg--------gttcacattagcaaagtaaatggcatcaag-a 26198742  T
Q  319 aggctactgcctccccctccaacactatcatattt 353  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26198741 aggctactgcatccccctccaaaactgtcatattt 26198707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Original strand, 11291904 - 11292157
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||     
T  11291904 tattatcattaatcaaccaatgtt-aatacaggaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaagccgacctagctaaagtatgagcaaa 11292002  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||| ||    
T  11292003 catgttcgctcgtctcctaacaaacttcaccttgaagtt-gaatgtatagataactgataaataatactataaacaataacataaaattttgaatcatca 11292101  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacc 275  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11292102 tgg-ccgaaaacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaacc 11292157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14827430 - 14827126
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||| |||  |||||  || ||||| |||||||| | |  ||||||| ||||||||||||    
T  14827430 aactaatatcattaatcaactaatgttcaatacaagaagaataagaatagaaaatgcggtgactagcccaagaatatgtcgccctagataaagtatgagc 14827331  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
    || |||| ||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14827330 aaccatgttcgtttgt-tcttaactaactttacctcgaagttggaatgtaaagataactaatacataatattataaataatagcatagaatttcgaatca 14827232  T
Q  216 ccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcga 315  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||| || |||||| | |||| ||||| || | ||||| ||||||    
T  14827231 ccatgacccaaacacgatagagcttgcactagagtagctaagtcagattcaaagacaactcgatctcatctattcatatcagtaaagtgaatgacatcga 14827132  T
Q  316 gtaagg 321  Q
    ||||||    
T  14827131 gtaagg 14827126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 384
Target Start/End: Original strand, 44017234 - 44017522
Alignment:
Q  96 gccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaa 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||  | ||||||    
T  44017234 gccctagttaaagtatgagcaactatgtttacttgtctcctaacacacttcatatcgaagttagaatgaaaagataactgataaataatacaagaaacaa 44017333  T
Q  196 tagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatc 295  Q
    | ||||| |||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||     
T  44017334 tggcatataattcttaatgaccatgtttcggagacgatagagcttgcactaaagtaacggagtcagactcgaagacaacttggtctcatatgttcacatt 44017433  T
Q  296 agcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44017434 agcaacgtgaatggcatcgagtaaggttgttgtctccccctccaaaactgtcatatttgcacggtgtcattttatttgagcccgaataa 44017522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Original strand, 13109711 - 13109964
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||| | ||||||||| | | ||||||| || |||||| ||||   || |  |||||||||||||||||| |||     
T  13109711 tattatcgtaaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagagtaaaaaatacggtgactaaaccaa---catgtcgccctagctaaagtatgaacaac 13109807  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
     ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  13109808 tatgttcgtttgtctcctgacaaacttcacctcaacgttggaatgtaaagataactgataaataatactggaaacaatagcttataattccaaatcacca 13109907  T
Q  219 tggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacc 275  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13109908 tggcccgaagacgatagagcttccactagagtagaagagtcggactcgaagacaacc 13109964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 35158681 - 35158895
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatc-aatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaa 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  35158681 tattatcattaatcaaaccaatgttcaatataaaaagcataagaataaaaaatacggtgcctagcccaagaacaggccgccctagcgaaactatgagcaa 35158780  T
Q  118 tcatgctcgcttgtctcctaacaaacttca--cctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatca 215  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35158781 ctatgttcgcttgtctcataacaaacttcatgccttgaagttggaatgtaaaaataattgataaataataatagaaacaatagcatagaattctgaatca 35158880  T
Q  216 ccatggcccggagac 230  Q
     ||||||||| ||||    
T  35158881 tcatggcccgaagac 35158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22845859 - 22845603
Alignment:
Q  31 tcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttg 130  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22845859 tcaaccaaagttcaatacaagaaggataagaataaaaaatatggtgactagcttaagaacaggtcgccctagctaaagtatgagcaa--atgttcgcttg 22845762  T
Q  131 tctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagac 230  Q
    | |||||||||||||||| | |||||||||| | |||          | |||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  22845761 t-tcctaacaaacttcacattgaagttggaaagcaaa----------agataatactagaaacaatagcctagaattctgaatcaccatgatctggagac 22845673  T
Q  231 gatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaa 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  22845672 gatagagcttgcactagagtagattagttggactcgaagacaacccggtcccatctgttcgcatcagcaa 22845603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25552496 - 25552312
Alignment:
Q  16 aactattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||    
T  25552496 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacctaagaacaggtcttcctaactaaagtatgagc 25552397  T
Q  116 aatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagca 200  Q
    || |||| || |||||||| ||||||| |||| ||  || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25552396 aaccatgttcacttgtctcttaacaaatttcatcttaaaattgaaatgtaaaaataactgataaataatattagaaataatagca 25552312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 218
Target Start/End: Original strand, 18344202 - 18344332
Alignment:
Q  88 aacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatatt 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  18344202 aacaggccgccctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaatttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatact 18344301  T
Q  188 ataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18344302 agaaacaatatcatagaattctaaatcacca 18344332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9709992 - 9709912
Alignment:
Q  304 gaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaataa 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||   || || ||||| ||||||||| ||||||    
T  9709992 gaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaataa 9709912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 36445377 - 36445557
Alignment:
Q  39 tgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccct-agctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctccta 137  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| |||||| | || | || | || ||| || ||||| ||||||||  ||| ||| ||||    ||    
T  36445377 tgttcaatataagtaggataaaactaaaaaatatggtgactaatctaaaatcatgttgtccttagttaaagaatgagcaactatgttcgtttgttgttta 36445476  T
Q  138 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcacca 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||| | || |||| || |||||||||    
T  36445477 ataaacttcacctcgaagttggaatgtaaagagaattgaaaaataatatgagaaacaacaacaaagaactcggaatcacca 36445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 167
Target Start/End: Original strand, 10244492 - 10244557
Alignment:
Q  102 gctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10244492 gctaaagtatgagcaatcatgttcacttgccgcttaataaacttcacctcgaagttggaatctaaa 10244557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 337
Target Start/End: Original strand, 18345561 - 18345644
Alignment:
Q  254 tgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctc 337  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || ||| ||||  ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18345561 tgagtcggattcgaagacaattcgatcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctc 18345644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43293896 - 43293835
Alignment:
Q  124 tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataata 185  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  43293896 tcgcttgtcgcctaataagcttcacctcgaggttgaaatgtaaagataattgagcaataata 43293835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 538 - 171
Alignment:
Q  19 tattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| |||| ||| ||||||| || ||||| |||||  | |||| |||||||||||  |||||||||     
T  538 tattatcattaatcaatcagtgtttaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaac 439  T
Q  119 catgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccg----aatc 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||    
T  438 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatc 339  T
Q  215 accatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatttgttcacatcagcaaggcgaatggcatcg 314  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||| | |||||||||||    
T  338 accatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcg 239  T
Q  315 agtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttacccgctgtcattttgtttgagccagaat 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||    
T  238 agtaaggcaactgcctccccctcccaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaat 171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Original strand, 149 - 352
Alignment:
Q  65 aaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 164  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| |  | ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  149 aaaaatacggtgactagcccaagaacaagtcgtcctagttaaagtatgagcaaccgtgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaatgt 248  T
Q  165 aaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagattagctgagtcggact 264  Q
    ||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  249 aaggataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaattaccatgacctggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggact 348  T
Q  265 cgaa 268  Q
    ||||    
T  349 cgaa 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Original strand, 44103 - 44332
Alignment:
Q  42 tcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaa 141  Q
    |||||| | ||||||||  ||| |||||||  | ||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  44103 tcaatagaagaaggatatgaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaa 44202  T
Q  142 acttcacctcgaagt---tggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaatagcatagaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagc 238  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||| |||| ||| | |||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  44203 acttcacctcaaagttggtggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc 44302  T
Q  239 ttgcactagattagctgagtcggactcgaag 269  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44303 -tgcactagagtagctgagtccaactcgaag 44332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20494 - 20330
Alignment:
Q  31 tcaatcaatgttcaatatatgaaggataaaaattaaaaatatggcgactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttg 130  Q
    |||||||||| | |||| | ||| ||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20494 tcaatcaatgattaatacaagaatgataagaataaaaaatacgatgactagcccaagaacaggttgccctagctaaagtatgagtaatcatattcgcttg 20395  T
Q  131 tctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataattgataaataatattataaacaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  20394 tctcctaacaaacttcacctcaaagttgacatgtaaagataactgataaataatactagaaacaa 20330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0252 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0252
Description:

Target: scaffold0252; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13410 - 13321
Alignment:
Q  76 gactaacccaagaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgctcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 167  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||  |||||  |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  13410 gactagcccaagaacaggccgccctagcaagagt--gagcagccatgttcgcttgtcgtctaacaaactttacctcaaagttgggatgtaaa 13321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University