View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9389_low_18 (Length: 351)

Name: NF9389_low_18
Description: NF9389
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9389_low_18
NF9389_low_18
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (4-338)||(27126074-27126408)
chr6 (29-331)||(15891327-15891627)
chr6 (4-298)||(31733869-31734163)
chr6 (9-298)||(17318724-17319014)
chr6 (9-216)||(23150868-23151075)
chr6 (4-216)||(18708743-18708954)
chr6 (4-197)||(7827234-7827427)
chr6 (6-166)||(27318154-27318314)
chr6 (192-338)||(7825767-7825913)
chr6 (16-134)||(18702889-18703007)
chr6 (118-267)||(24441112-24441261)
chr6 (9-110)||(28947693-28947794)
chr6 (9-110)||(19655831-19655932)
chr6 (108-299)||(31735629-31735821)
chr6 (9-110)||(23491773-23491874)
chr6 (9-110)||(23497371-23497472)
chr6 (16-110)||(19773318-19773412)
chr6 (16-110)||(15705220-15705314)
chr6 (108-299)||(22212214-22212407)
chr6 (161-216)||(27322172-27322227)
chr6 (78-174)||(23655665-23655759)
chr6 (108-267)||(13751060-13751219)
chr6 (9-74)||(13285094-13285159)
chr6 (21-110)||(22806182-22806271)
chr6 (137-212)||(18658448-18658524)
chr6 (78-137)||(23655740-23655799)
chr6 (229-275)||(16245370-16245416)
chr6 (137-267)||(610927-611058)
chr6 (137-267)||(29848239-29848370)
chr6 (137-212)||(19444016-19444092)
chr6 (16-76)||(22556632-22556692)
chr6 (9-72)||(19234584-19234647)
chr6 (9-72)||(25921117-25921180)
chr6 (9-71)||(29044650-29044712)
chr6 (16-74)||(32259233-32259291)
chr6 (173-267)||(5110534-5110628)
chr6 (137-212)||(16133406-16133482)
chr6 (9-72)||(18585007-18585070)
chr6 (101-191)||(23497613-23497702)
chr6 (285-338)||(25920781-25920834)
chr6 (173-267)||(5289893-5289987)
chr6 (153-212)||(13764592-13764652)
chr6 (101-191)||(23492015-23492104)
chr6 (103-137)||(23655639-23655673)
chr6 (108-267)||(24266952-24267111)
chr6 (304-338)||(30674292-30674326)
chr6 (144-212)||(19829695-19829764)
chr6 (110-174)||(19773372-19773434)
chr6 (70-102)||(31735631-31735663)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (4-338)||(35065177-35065511)
chr3 (4-334)||(11258592-11258922)
chr3 (16-338)||(35353720-35354042)
chr3 (4-332)||(17519470-17519799)
chr3 (4-332)||(17534332-17534661)
chr3 (4-334)||(2842059-2842379)
chr3 (16-298)||(41172980-41173263)
chr3 (4-298)||(14508012-14508303)
chr3 (6-287)||(5206253-5206535)
chr3 (4-298)||(15932104-15932398)
chr3 (9-298)||(17693236-17693518)
chr3 (16-228)||(44273705-44273917)
chr3 (4-216)||(22307180-22307392)
chr3 (4-216)||(17538350-17538562)
chr3 (110-338)||(19884226-19884454)
chr3 (4-216)||(40807239-40807451)
chr3 (118-299)||(16728443-16728624)
chr3 (128-281)||(14153191-14153344)
chr3 (107-281)||(50348806-50348977)
chr3 (118-281)||(45531332-45531496)
chr3 (165-298)||(5215026-5215159)
chr3 (16-195)||(13519549-13519725)
chr3 (16-199)||(42353283-42353463)
chr3 (220-338)||(44269650-44269768)
chr3 (16-105)||(9511774-9511863)
chr3 (16-105)||(9519749-9519838)
chr3 (9-110)||(17046511-17046612)
chr3 (9-110)||(54876085-54876186)
chr3 (144-281)||(10562881-10563019)
chr3 (9-110)||(11192430-11192531)
chr3 (9-110)||(17685445-17685546)
chr3 (9-110)||(6156055-6156156)
chr3 (9-110)||(14441517-14441618)
chr3 (9-110)||(19568970-19569072)
chr3 (29-110)||(17691427-17691508)
chr3 (108-299)||(20417233-20417424)
chr3 (16-110)||(18700082-18700176)
chr3 (16-110)||(12470151-12470245)
chr3 (16-110)||(43889408-43889502)
chr3 (259-332)||(40811913-40811986)
chr3 (19-110)||(14671173-14671264)
chr3 (19-110)||(14682672-14682763)
chr3 (9-76)||(15565897-15565964)
chr3 (9-76)||(24546220-24546287)
chr3 (9-76)||(50755983-50756050)
chr3 (107-281)||(13179314-13179488)
chr3 (137-267)||(13523145-13523276)
chr3 (16-76)||(14153008-14153068)
chr3 (9-76)||(17207725-17207792)
chr3 (9-72)||(54330907-54330970)
chr3 (108-267)||(14818211-14818370)
chr3 (137-267)||(3394736-3394867)
chr3 (16-76)||(50348635-50348695)
chr3 (9-72)||(50351602-50351665)
chr3 (128-267)||(23395786-23395925)
chr3 (136-212)||(10550510-10550587)
chr3 (137-267)||(18367492-18367623)
chr3 (285-338)||(1208848-1208901)
chr3 (285-338)||(11258560-11258613)
chr3 (137-267)||(13520515-13520646)
chr3 (173-267)||(3803066-3803160)
chr3 (137-196)||(6819367-6819427)
chr3 (19-91)||(10542070-10542142)
chr3 (173-267)||(11850414-11850508)
chr3 (137-212)||(17548285-17548361)
chr3 (110-279)||(19569032-19569200)
chr3 (16-76)||(40812216-40812276)
chr3 (16-76)||(49900111-49900171)
chr3 (16-75)||(12511232-12511291)
chr3 (304-343)||(50756254-50756293)
chr3 (9-71)||(14568661-14568723)
chr3 (144-212)||(6158637-6158706)
chr3 (144-212)||(14642293-14642362)
chr3 (108-212)||(52338671-52338775)
chr3 (137-212)||(179441-179517)
chr3 (215-266)||(13516530-13516582)
chr3 (144-239)||(14250861-14250952)
chr3 (16-52)||(17937935-17937971)
chr3 (173-267)||(54520668-54520762)
chr3 (101-191)||(6155897-6155986)
chr3 (101-191)||(11192200-11192289)
chr3 (287-338)||(50351983-50352034)
chr3 (108-197)||(52213183-52213272)
chr3 (101-201)||(11562678-11562777)
chr3 (305-338)||(22842513-22842546)
chr3 (144-212)||(37038058-37038127)
chr3 (144-212)||(42324964-42325033)
chr3 (16-69)||(43928741-43928794)
chr3 (61-105)||(11562927-11562971)
chr3 (173-267)||(12275785-12275879)
chr3 (128-188)||(16050114-16050172)
chr3 (128-196)||(16059489-16059555)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (4-332)||(46386684-46387012)
chr7 (4-338)||(20585477-20585811)
chr7 (9-338)||(44374067-44374396)
chr7 (9-338)||(44382932-44383261)
chr7 (9-338)||(19282213-19282542)
chr7 (11-338)||(12465864-12466191)
chr7 (4-216)||(13148069-13148281)
chr7 (9-216)||(12127766-12127973)
chr7 (4-216)||(11066711-11066923)
chr7 (11-216)||(12371521-12371723)
chr7 (118-299)||(37785076-37785257)
chr7 (4-209)||(32434186-32434392)
chr7 (128-281)||(18875646-18875799)
chr7 (128-281)||(43277546-43277699)
chr7 (128-281)||(3287100-3287247)
chr7 (10-177)||(14928935-14929100)
chr7 (10-177)||(15352401-15352566)
chr7 (4-105)||(15720130-15720231)
chr7 (9-104)||(33001269-33001364)
chr7 (108-299)||(11053785-11053976)
chr7 (16-110)||(14258701-14258795)
chr7 (19-110)||(16580009-16580100)
chr7 (19-110)||(16585563-16585654)
chr7 (16-110)||(32301531-32301625)
chr7 (21-110)||(16460546-16460635)
chr7 (110-239)||(33001177-33001303)
chr7 (108-212)||(15281505-15281607)
chr7 (43-110)||(1489907-1489974)
chr7 (19-110)||(20487792-20487883)
chr7 (137-267)||(8757130-8757261)
chr7 (137-267)||(40555477-40555608)
chr7 (16-76)||(18875455-18875515)
chr7 (9-76)||(13745802-13745869)
chr7 (128-267)||(3289548-3289687)
chr7 (9-76)||(25941821-25941888)
chr7 (16-76)||(3287380-3287440)
chr7 (9-69)||(13894485-13894545)
chr7 (101-212)||(15096385-15096495)
chr7 (138-233)||(21735237-21735331)
chr7 (17-76)||(13745386-13745445)
chr7 (9-76)||(14161456-14161523)
chr7 (9-72)||(24270583-24270646)
chr7 (137-200)||(4325310-4325374)
chr7 (16-76)||(8851768-8851828)
chr7 (137-212)||(13408014-13408090)
chr7 (137-212)||(13865120-13865196)
chr7 (101-212)||(19558025-19558135)
chr7 (16-76)||(20619669-20619729)
chr7 (16-76)||(43277353-43277413)
chr7 (9-72)||(4691497-4691560)
chr7 (9-72)||(48213546-48213609)
chr7 (137-263)||(832757-832884)
chr7 (137-263)||(1197937-1198064)
chr7 (101-191)||(13133257-13133346)
chr7 (156-223)||(14161683-14161749)
chr7 (101-191)||(14219713-14219802)
chr7 (9-72)||(15576432-15576495)
chr7 (9-48)||(21675510-21675549)
chr7 (9-48)||(39292338-39292377)
chr7 (139-200)||(12755442-12755504)
chr7 (107-212)||(15139364-15139468)
chr7 (304-338)||(43747595-43747629)
chr7 (61-110)||(13133067-13133116)
chr7 (144-212)||(17071030-17071099)
chr7 (11-72)||(20252945-20253006)
chr7 (153-200)||(11309537-11309585)
chr7 (153-200)||(14191839-14191887)
chr7 (70-110)||(14219722-14219762)
chr7 (110-174)||(14258679-14258741)
chr7 (70-110)||(15096394-15096434)
chr7 (70-110)||(16077624-16077664)
chr7 (110-174)||(16460595-16460657)
chr7 (110-174)||(16579987-16580049)
chr7 (110-174)||(16585614-16585676)
chr7 (70-110)||(19558034-19558074)
chr7 (110-174)||(32301509-32301571)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (4-338)||(18-352)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (4-334)||(42874924-42875254)
chr4 (4-337)||(16997649-16997985)
chr4 (9-338)||(11425075-11425405)
chr4 (4-338)||(25090774-25091108)
chr4 (4-312)||(14548773-14549081)
chr4 (4-298)||(10357033-10357328)
chr4 (128-338)||(37018719-37018929)
chr4 (4-216)||(19609567-19609779)
chr4 (9-281)||(3485091-3485361)
chr4 (128-299)||(19435498-19435669)
chr4 (100-281)||(33243949-33244129)
chr4 (58-281)||(19734471-19734687)
chr4 (9-108)||(14630177-14630276)
chr4 (9-110)||(53631075-53631176)
chr4 (11-109)||(13036381-13036479)
chr4 (108-239)||(4615772-4615901)
chr4 (9-105)||(33243898-33243994)
chr4 (128-267)||(2584937-2585076)
chr4 (137-299)||(21061680-21061844)
chr4 (9-76)||(15344260-15344327)
chr4 (16-76)||(19435307-19435367)
chr4 (10-72)||(35660233-35660295)
chr4 (10-76)||(55582587-55582653)
chr4 (9-69)||(3337489-3337549)
chr4 (9-72)||(26922273-26922336)
chr4 (4-75)||(37019053-37019124)
chr4 (128-266)||(6511762-6511900)
chr4 (137-267)||(27027922-27028053)
chr4 (137-212)||(14933175-14933251)
chr4 (101-191)||(9638080-9638169)
chr4 (9-76)||(25513126-25513193)
chr4 (9-76)||(26445268-26445335)
chr4 (128-267)||(13446642-13446778)
chr4 (9-71)||(14508150-14508212)
chr4 (9-71)||(19566520-19566582)
chr4 (137-267)||(14942381-14942512)
chr4 (137-267)||(15448145-15448276)
chr4 (138-212)||(18229899-18229974)
chr4 (9-72)||(45314938-45315001)
chr4 (108-267)||(20899466-20899625)
chr4 (241-298)||(50160165-50160222)
chr4 (144-212)||(9638247-9638316)
chr4 (101-201)||(16026788-16026887)
chr4 (16-68)||(15114614-15114666)
chr4 (173-267)||(49547996-49548090)
chr4 (101-191)||(14629945-14630034)
chr4 (9-71)||(2425222-2425284)
chr4 (304-338)||(25512660-25512694)
chr4 (304-338)||(26922555-26922589)
chr4 (144-239)||(51992738-51992832)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (9-338)||(20179123-20179452)
chr8 (4-338)||(42818504-42818829)
chr8 (9-216)||(39936612-39936819)
chr8 (4-216)||(19140008-19140220)
chr8 (16-281)||(20084247-20084508)
chr8 (144-281)||(22259106-22259243)
chr8 (16-193)||(6102362-6102536)
chr8 (170-298)||(24713329-24713457)
chr8 (9-110)||(5760882-5760983)
chr8 (122-279)||(23947374-23947531)
chr8 (121-269)||(17217771-17217920)
chr8 (128-299)||(17907695-17907867)
chr8 (108-299)||(23888879-23889070)
chr8 (19-110)||(21346011-21346102)
chr8 (128-299)||(22244557-22244729)
chr8 (128-269)||(22584461-22584602)
chr8 (19-110)||(23914273-23914364)
chr8 (9-76)||(20517719-20517786)
chr8 (9-76)||(22344425-22344492)
chr8 (9-76)||(22356085-22356152)
chr8 (11-76)||(36305042-36305107)
chr8 (9-69)||(32949991-32950051)
chr8 (9-72)||(4381394-4381457)
chr8 (9-76)||(22483130-22483197)
chr8 (9-69)||(361814-361874)
chr8 (16-72)||(22474139-22474195)
chr8 (9-72)||(18817063-18817126)
chr8 (101-201)||(36728025-36728124)
chr8 (16-76)||(18833854-18833914)
chr8 (101-212)||(22318655-22318765)
chr8 (9-71)||(17979018-17979080)
chr8 (10-72)||(18815425-18815487)
chr8 (16-65)||(17437927-17437976)
chr8 (153-267)||(20454426-20454541)
chr8 (101-201)||(31723309-31723408)
chr8 (16-76)||(5082821-5082881)
chr8 (137-200)||(15635914-15635978)
chr8 (153-212)||(19882207-19882267)
chr8 (153-212)||(20455238-20455298)
chr8 (153-212)||(20460216-20460276)
chr8 (20-72)||(36733126-36733178)
chr8 (9-72)||(5080396-5080459)
chr8 (101-191)||(31723499-31723588)
chr8 (304-338)||(22344202-22344236)
chr8 (304-338)||(22355862-22355896)
chr8 (304-338)||(36304877-36304911)
chr8 (304-338)||(38988466-38988500)
chr8 (304-338)||(39019563-39019597)
chr8 (285-334)||(12577009-12577058)
chr8 (301-338)||(12577033-12577070)
chr8 (144-212)||(39695271-39695340)
chr8 (110-174)||(21346062-21346124)
chr8 (101-137)||(36727854-36727890)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (9-338)||(42912171-42912500)
chr1 (16-338)||(4596454-4596776)
chr1 (9-338)||(21046651-21046980)
chr1 (4-338)||(16058911-16059245)
chr1 (16-279)||(20634244-20634507)
chr1 (9-298)||(20587838-20588129)
chr1 (9-298)||(20592376-20592667)
chr1 (110-338)||(19675872-19676100)
chr1 (11-216)||(41227308-41227513)
chr1 (9-281)||(14238214-14238484)
chr1 (16-281)||(7052665-7052927)
chr1 (78-281)||(38887798-38887999)
chr1 (9-181)||(51082496-51082666)
chr1 (16-137)||(38887697-38887817)
chr1 (9-110)||(21239897-21239998)
chr1 (9-106)||(51323628-51323725)
chr1 (4-97)||(19676073-19676166)
chr1 (11-76)||(39060479-39060544)
chr1 (9-76)||(1642979-1643046)
chr1 (144-239)||(42696937-42697031)
chr1 (108-267)||(52983332-52983491)
chr1 (128-212)||(18275157-18275241)
chr1 (11-72)||(41226055-41226116)
chr1 (9-69)||(12710278-12710338)
chr1 (108-299)||(51476131-51476322)
chr1 (144-239)||(1642657-1642750)
chr1 (9-76)||(22824008-22824075)
chr1 (9-72)||(50544239-50544302)
chr1 (9-71)||(18120993-18121055)
chr1 (137-212)||(7792586-7792662)
chr1 (137-212)||(13528528-13528604)
chr1 (137-200)||(44822855-44822919)
chr1 (16-76)||(45496328-45496388)
chr1 (16-76)||(48301315-48301375)
chr1 (128-197)||(18270518-18270587)
chr1 (108-267)||(18823793-18823952)
chr1 (151-212)||(21181073-21181135)
chr1 (9-71)||(24720295-24720357)
chr1 (144-212)||(38057394-38057463)
chr1 (153-212)||(10813273-10813333)
chr1 (105-196)||(13302045-13302135)
chr1 (137-200)||(24815586-24815647)
chr1 (304-338)||(6833382-6833416)
chr1 (304-338)||(45496142-45496176)
chr1 (23-76)||(11809199-11809252)
chr1 (144-212)||(19761968-19762037)
chr1 (16-72)||(6833602-6833658)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (4-338)||(28653099-28653433)
chr2 (4-338)||(23969220-23969554)
chr2 (9-337)||(24515308-24515636)
chr2 (4-338)||(36839295-36839626)
chr2 (4-338)||(17306608-17306942)
chr2 (4-298)||(9975089-9975384)
chr2 (4-295)||(27485067-27485359)
chr2 (4-216)||(24781437-24781649)
chr2 (11-199)||(5031734-5031922)
chr2 (118-281)||(19358110-19358272)
chr2 (118-286)||(14693380-14693547)
chr2 (119-281)||(10897503-10897666)
chr2 (16-105)||(23069059-23069148)
chr2 (144-299)||(5985236-5985396)
chr2 (9-76)||(43707886-43707953)
chr2 (107-269)||(44071676-44071837)
chr2 (19-110)||(9784931-9785022)
chr2 (9-76)||(22686223-22686290)
chr2 (9-71)||(21316263-21316325)
chr2 (22-76)||(25587301-25587355)
chr2 (16-76)||(19201810-19201870)
chr2 (9-69)||(24273861-24273921)
chr2 (101-235)||(3538960-3539091)
chr2 (9-71)||(23609865-23609927)
chr2 (16-76)||(21368490-21368550)
chr2 (108-269)||(27860469-27860629)
chr2 (137-200)||(31520371-31520435)
chr2 (9-72)||(1384287-1384350)
chr2 (118-196)||(18391046-18391124)
chr2 (9-76)||(28345677-28345744)
chr2 (137-212)||(6478034-6478110)
chr2 (11-71)||(21336056-21336116)
chr2 (109-196)||(27851836-27851922)
chr2 (107-191)||(25141349-25141432)
chr2 (70-110)||(3539042-3539082)
chr2 (110-174)||(9784909-9784971)
chr2 (101-137)||(25141212-25141248)
chr2 (70-102)||(27851889-27851921)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (4-338)||(13133-13465)
scaffold0111 (4-338)||(19400-19732)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (4-298)||(5310-5604)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (11-338)||(1-327)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (4-326)||(19920767-19921089)
chr5 (78-281)||(36509487-36509688)
chr5 (9-137)||(32607927-32608054)
chr5 (16-137)||(36509386-36509506)
chr5 (9-110)||(20565903-20566004)
chr5 (162-281)||(21406443-21406562)
chr5 (78-235)||(32608035-32608188)
chr5 (144-299)||(25250632-25250789)
chr5 (144-299)||(25314417-25314574)
chr5 (16-76)||(20198197-20198257)
chr5 (9-76)||(30611936-30612003)
chr5 (144-213)||(23200299-23200368)
chr5 (137-212)||(24277340-24277416)
chr5 (137-212)||(24384797-24384873)
chr5 (9-76)||(21399605-21399672)
chr5 (9-76)||(30613896-30613963)
chr5 (10-71)||(16605206-16605267)
chr5 (16-76)||(23199998-23200058)
chr5 (16-76)||(33895491-33895551)
chr5 (9-72)||(22110987-22111050)
chr5 (10-68)||(1627983-1628041)
chr5 (140-267)||(8952787-8952915)
chr5 (9-71)||(18744038-18744100)
chr5 (173-267)||(41876320-41876414)
chr5 (9-71)||(14026409-14026471)
chr5 (101-163)||(20565701-20565762)
chr5 (153-212)||(17812638-17812698)
chr5 (108-191)||(22357664-22357747)
chr5 (304-338)||(22110893-22110927)
chr5 (144-212)||(10953214-10953283)
chr5 (304-336)||(8504636-8504668)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (4-298)||(57908-58203)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (4-298)||(327-620)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (4-216)||(7982-8195)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (9-216)||(9828-10035)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (9-281)||(10975-11245)
scaffold0546 (9-281)||(7155-7425)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (9-281)||(579-849)
scaffold0109 (9-281)||(5882-6152)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (4-210)||(8900-9106)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (33-281)||(33530-33776)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (11-298)||(145895-146180)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (43-216)||(9397-9567)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (144-338)||(23517-23711)
scaffold0146 (9-197)||(22322-22508)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (16-281)||(388-648)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (54-281)||(15156-15381)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (9-281)||(11340-11609)
scaffold0439 (17-110)||(3768-3861)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (118-281)||(47280-47442)
scaffold0042 (144-299)||(28433-28589)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (4-201)||(78322-78519)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (18-281)||(10541-10787)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (9-177)||(29442-29608)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (9-177)||(29894-30062)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (16-137)||(7542-7662)
scaffold0104 (16-137)||(14173-14293)
scaffold0104 (82-137)||(16575-16630)
scaffold0104 (82-137)||(18595-18650)
[»] scaffold1815 (1 HSPs)
scaffold1815 (150-281)||(1196-1326)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (190-286)||(1653-1749)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (9-108)||(1062-1161)
scaffold1186 (101-191)||(830-919)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (9-108)||(187107-187206)
scaffold0005 (101-191)||(187349-187438)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (11-109)||(39449-39547)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (9-110)||(1069-1170)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (9-110)||(15188-15289)
scaffold0061 (9-110)||(24246-24347)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (9-110)||(25865-25966)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (110-239)||(645-771)
scaffold0083 (110-239)||(5949-6075)
scaffold0083 (9-104)||(584-679)
scaffold0083 (9-104)||(5888-5983)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (17-110)||(168786-168879)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (108-212)||(34097-34201)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (144-281)||(20821-20958)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (16-110)||(6862-6956)
scaffold0292 (110-174)||(6840-6902)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (108-267)||(6807-6966)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (16-107)||(7116-7207)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (19-110)||(21001-21092)
scaffold0018 (110-174)||(20979-21041)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (16-105)||(21422-21511)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (19-110)||(5938-6029)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (109-265)||(3224-3380)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (16-99)||(13274-13357)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (16-99)||(120270-120353)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (119-269)||(411-562)
scaffold0409 (119-269)||(8666-8817)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (21-110)||(3619-3708)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (107-281)||(127500-127674)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (9-76)||(27683-27750)
scaffold0125 (285-338)||(27435-27488)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (108-267)||(297-456)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (108-267)||(10863-11022)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (136-267)||(370-502)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (18-76)||(62581-62639)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (107-269)||(66196-66357)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (9-69)||(1475-1535)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (136-239)||(6123-6225)
scaffold0309 (136-239)||(8275-8377)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (16-76)||(66641-66701)
scaffold0004 (128-212)||(59585-59669)
[»] scaffold0379 (3 HSPs)
scaffold0379 (17-76)||(10094-10153)
scaffold0379 (229-298)||(4616-4685)
scaffold0379 (229-298)||(14662-14731)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (21-76)||(16584-16639)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (13-76)||(18732-18795)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (9-76)||(36118-36185)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (136-267)||(40958-41090)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (136-212)||(5066-5143)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (137-267)||(8244-8375)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (16-76)||(1290-1350)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (150-267)||(1276-1394)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (16-76)||(11955-12015)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (9-69)||(28970-29030)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (9-69)||(9445-9505)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (16-72)||(16325-16381)
scaffold0123 (138-212)||(2013-2088)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (282-338)||(1970-2026)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (9-69)||(21123-21183)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (16-76)||(142996-143056)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (9-72)||(7904-7967)
scaffold0529 (101-222)||(7576-7695)
[»] scaffold0241 (4 HSPs)
scaffold0241 (9-72)||(5104-5167)
scaffold0241 (20-72)||(1951-2003)
scaffold0241 (101-191)||(1654-1743)
scaffold0241 (101-137)||(4860-4896)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (9-72)||(7383-7446)
scaffold0108 (144-212)||(5657-5726)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (156-223)||(764-830)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (128-239)||(127144-127252)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (137-238)||(2724-2824)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (19-69)||(7523-7573)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (9-67)||(3123-3181)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (137-267)||(2893-3024)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (61-105)||(390-434)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (137-200)||(1549-1613)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (173-267)||(143-237)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (137-200)||(6053-6117)
[»] scaffold1695 (2 HSPs)
scaffold1695 (101-191)||(625-714)
scaffold1695 (70-110)||(665-705)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (9-72)||(7455-7518)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (9-72)||(34652-34715)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (144-239)||(53378-53471)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (107-201)||(136323-136416)
scaffold0008 (153-267)||(12260-12375)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (110-148)||(63835-63873)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (61-110)||(3984-4033)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (144-212)||(8304-8373)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (16-76)||(7198-7258)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (16-76)||(2443-2503)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (121-196)||(2652-2727)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (286-338)||(18843-18894)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (137-212)||(3120-3196)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (150-212)||(16004-16067)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (9-72)||(18552-18615)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (304-338)||(10066-10100)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (144-212)||(19387-19456)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (305-338)||(4210-4243)
scaffold0174 (305-338)||(10332-10365)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (4-48)||(22388-22432)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (173-267)||(159723-159817)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 27126074 - 27126408
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27126074 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatttaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 27126173  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126174 atgttgttgttgaataatttgagttacataaatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 27126273  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27126274 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 27126373  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27126374 gtcaatgtctttaaagttgtaagttgttgtcgatg 27126408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Original strand, 15891327 - 15891627
Alignment:
Q  29 ctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891327 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatcttt--tggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 15891424  T
Q  129 acatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891425 acatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgt 15891524  T
Q  229 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagtt 328  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15891525 tgttgtctctgctatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagtt 15891624  T
Q  329 gtt 331  Q
    |||    
T  15891625 gtt 15891627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31734163 - 31733869
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31734163 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatagatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggataattagaaatacatatattatgtga 31734064  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31734063 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgat 31733964  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733963 gttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 31733869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Original strand, 17318724 - 17319014
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17318724 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatatt 17318823  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318824 gttcttgaattatttgagttatatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 17318923  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17318924 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattatatcattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 17319014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 23150868 - 23151075
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23150868 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 23150967  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23150968 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttattattaattatgctat 23151067  T
Q  209 gttgtgaa 216  Q
    ||||||||    
T  23151068 gttgtgaa 23151075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18708954 - 18708743
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18708954 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 18708855  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18708854 atgttgttgttgaataatttgagttacatatagttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt-ttattattaatgat 18708756  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  18708755 gctatgttgtgaa 18708743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7827427 - 7827234
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7827427 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattggaaatacatatattatgtga 7827328  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827327 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattatt 7827234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 27318154 - 27318314
Alignment:
Q  6 tatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27318154 tatggtgtttaagagtatttaacctacgttgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaat 27318253  T
Q  106 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaata 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27318254 gttgttgttgaataatttaagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatataaaata 27318314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7825913 - 7825767
Alignment:
Q  192 attattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaag 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825913 attattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgattactaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaag 7825814  T
Q  292 ttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7825813 ttgtaagttgttgtcaatgttgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 7825767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18703007 - 18702889
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18703007 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 18702908  T
Q  116 aataatttgagttacatat 134  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18702907 aataatttgagttacatat 18702889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24441261 - 24441112
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  24441261 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatattgaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caag 24441163  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24441162 ttgct-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 24441112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28947794 - 28947693
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947794 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 28947695  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  28947694 gt 28947693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 19655831 - 19655932
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  19655831 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattcgagatacatatattatgtgaatatt 19655930  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  19655931 gt 19655932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Original strand, 31735629 - 31735821
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31735629 tgttgttggttaatttgaaatacatatatt-atgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaaattgttattattaatgttgct 31735727  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  31735728 atgtt-acaagttgttttatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 31735821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 23491773 - 23491874
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23491773 ggtgtttaagagtatctaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatatt 23491872  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  23491873 gt 23491874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 23497371 - 23497472
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23497371 ggtgtttaagagtatctaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatatt 23497470  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  23497471 gt 23497472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 19773318 - 19773412
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19773318 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttgattggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 19773412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 15705220 - 15705314
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15705220 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 15705314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Original strand, 22212214 - 22212407
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22212214 tgttgttggttaatttgagatacatatatt-atgtgaaaattgtatgatatagaaaataattttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgtt 22212312  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg-atgtattgatta-ttaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
     |||||  |||||||| |||||||||| |||||  | | ||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22212313 gtgttg-caagttgttttatgttgctgcctctgcttttgttgattatttatatcataaagttgcaagtgttggtctaagttgtctaagttgtaagt 22212407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Original strand, 27322172 - 27322227
Alignment:
Q  161 aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27322172 aaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatgatgctatgttgtgaa 27322227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23655759 - 23655665
Alignment:
Q  78 taatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  23655759 taatttaaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaatattttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 23655665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 13751060 - 13751219
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13751060 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgct 13751158  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  13751159 atgttg-caagttgct-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 13751219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13285159 - 13285094
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgtt 74  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13285159 ggtgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgtt 13285094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 22806271 - 22806182
Alignment:
Q  21 tatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22806271 tatttaacatgtgtggtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttaagatacatatattatgtgaatattgt 22806182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18658524 - 18658448
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18658524 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 18658448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23655799 - 23655740
Alignment:
Q  78 taatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23655799 taatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttaaaatacatatatt 23655740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16245416 - 16245370
Alignment:
Q  229 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtt 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16245416 tgctgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtt 16245370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 611058 - 610927
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  611058 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 610961  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  610960 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 610927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 29848239 - 29848370
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  29848239 ttatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 29848336  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  29848337 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 29848370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 19444016 - 19444092
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  19444016 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 19444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22556692 - 22556632
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22556692 aagagtatttaacctattttgtgatggatctaacttggtttaacgtgaatatctttgttgg 22556632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19234647 - 19234584
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19234647 ggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 19234584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25921180 - 25921117
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25921180 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaaactaacttggtttgacgtgaatatctttg 25921117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 29044712 - 29044650
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29044712 ggtgtttaagagtatataacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 29044650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 32259291 - 32259233
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  32259291 aagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctctgtt 32259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 5110534 - 5110628
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5110534 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 5110628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 16133406 - 16133482
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16133406 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 16133482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18585070 - 18585007
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18585070 ggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 18585007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 23497613 - 23497702
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23497613 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatata-aaaagagtgttgttcatatcattcaagttgtt 23497702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25920834 - 25920781
Alignment:
Q  285 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25920834 gttaaagttataagttgtggtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 25920781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 5289893 - 5289987
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5289893 ttatatcattcgagttgttattattaccgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 5289987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13764652 - 13764592
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13764652 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13764592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 23492015 - 23492104
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23492015 tgaattttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatata-aaaagagtgttgttcatatcattcaagttgtt 23492104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23655673 - 23655639
Alignment:
Q  103 aatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23655673 aatgttgttgttgaataatttgaggtacatatatt 23655639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24267111 - 24266952
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  24267111 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtgaaaaatgtatgatataaaaaatgtccttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 24267013  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24267012 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 24266952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Original strand, 30674292 - 30674326
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30674292 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 30674326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 19829695 - 19829764
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  19829695 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgatattattgatgttgctatgttg 19829764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 19773372 - 19773434
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  19773372 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 19773434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 102
Target Start/End: Original strand, 31735631 - 31735663
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtg 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31735631 ttgttggttaatttgaaatacatatattatgtg 31735663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 35065177 - 35065511
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35065177 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 35065276  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35065277 atgttgttgttgaacaatttgagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgat 35065376  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  35065377 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 35065476  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35065477 gtcaatgtcgttaaagttataagttgttgtcgatg 35065511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11258922 - 11258592
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11258922 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatagatataatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 11258823  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11258822 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 11258723  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11258722 gttatgttgtgaagttgtagtatgttgatgtttctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 11258623  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11258622 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtc 11258592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35354042 - 35353720
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35354042 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 35353943  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35353942 aataattttagttacatatatttatgtggaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttataccttttaagttgttattattaattatgctatgttgtga 35353843  T
Q  216 agttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgtt 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35353842 agttgttgtatgttgttgtctctgttgtatttattattaaatcattaagttgtatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgtt 35353743  T
Q  316 aaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  35353742 aaagttgtaagttgttatcgatg 35353720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 17519470 - 17519799
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17519470 actaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 17519569  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519570 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgat 17519669  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattga-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtt 302  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  17519670 gttatattgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgatttattaaatcattaagttgcatatgttggtgaagttgttaaagttgtaagttgt 17519769  T
Q  303 tgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 332  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17519770 tttcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 17519799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 17534332 - 17534661
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17534332 actaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 17534431  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17534432 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgat 17534531  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattga-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtt 302  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  17534532 gttatattgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgatttattaaatcattaagttgcatatgttggtgaagttgttaaagttgtaagttgt 17534631  T
Q  303 tgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 332  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17534632 tttcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 17534661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 2842059 - 2842379
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2842059 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatatgaaatacatatattatgtga 2842158  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2842159 atgttgttgttgaataatttgtgttacacatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagtttttattattaatgat 2842258  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2842259 gctatgttgtgaagttgt----------tgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 2842348  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 334  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2842349 gtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtc 2842379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 298
Target Start/End: Original strand, 41172980 - 41173263
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172980 aagagtatttaacctatgttgtgatggatgtaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 41173079  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41173080 aagaatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 41173179  T
Q  216 agttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41173180 agttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 41173263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14508303 - 14508012
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14508303 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtga 14508204  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508203 atgttgttg---aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtattatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 14508107  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508106 gctatgttgtgaagttgttgtatgtttttgtcttttttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 14508012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 287
Target Start/End: Original strand, 5206253 - 5206535
Alignment:
Q  6 tatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206253 tatggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 5206352  T
Q  106 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206353 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 5206452  T
Q  206 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5206453 tatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatattggtctaagttgtt 5206535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Original strand, 15932104 - 15932398
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15932104 actagggtgtttaagagtatttcatctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 15932203  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932204 atgttgttgttgaataatttgagttacatatgtttatgtggaaattgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 15932303  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15932304 gctatgttgtgaagttgttgtatgctgctgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgtatatgttggtcaagttgtttaaattgtaag 15932398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17693518 - 17693236
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693518 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 17693419  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693418 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatataccattcaagttgttattattaatgatgctat 17693319  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17693318 gttgtgaagttgttgtatgttgatgtct--------ttgattattaaattattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 17693236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44273917 - 44273705
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44273917 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 44273818  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44273817 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgg 44273718  T
Q  216 agttgttgtatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  44273717 agttgttgtatgt 44273705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 22307180 - 22307392
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22307180 actagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 22307279  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307280 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 22307379  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  22307380 gctatgttgtgaa 22307392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17538562 - 17538350
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17538562 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 17538463  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17538462 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttgttattattaatgaa 17538363  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  17538362 gctatgttgtgaa 17538350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 110 - 338
Target Start/End: Original strand, 19884226 - 19884454
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19884226 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgttatg 19884325  T
Q  210 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaat 309  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19884326 ttatggagttgttgtatgttgatgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaat 19884425  T
Q  310 gtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  19884426 gtcgtcaaagttttaagttgttgtcgatg 19884454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40807451 - 40807239
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40807451 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 40807352  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40807351 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttattattattaatgat 40807252  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  40807251 gctatgttgtgaa 40807239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16728624 - 16728443
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16728624 taatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaag 16728525  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  16728524 ttgttgtatgttgttgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaaggttgtcaagttgtaagt 16728443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 281
Target Start/End: Original strand, 14153191 - 14153344
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14153191 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 14153290  T
Q  228 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14153291 ttactgtctctgatgtattcattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 14153344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 281
Target Start/End: Original strand, 50348806 - 50348977
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    |||||||||  |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50348806 ttgttgttggttaatgtgaaatacatgtatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataccattcaagttgttattattaatgatgct 50348905  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50348906 atgttgtgaa---gttgtatgttgctgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 50348977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 281
Target Start/End: Original strand, 45531332 - 45531496
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45531332 taatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatataaaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaag 45531431  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45531432 ttgttgtatgttattgtctctgctgttattgattatttaatcattaagttgcatatgtaggtcaa 45531496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5215159 - 5215026
Alignment:
Q  165 taatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5215159 taatgttgttataccattcaagttgttattatttatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaag 5215060  T
Q  265 ttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215059 ttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 5215026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13519725 - 13519549
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13519725 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtgaatatctttgttggcgaatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttg 13519627  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttatta 195  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13519626 aataatttgaggtacatata-ttatgtgaatatcgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttatta 13519549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 42353283 - 42353463
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42353283 aagagtatttaacgtatgttgtgatggatctaatggg-tttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 42353381  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42353382 aataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaa 42353463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44269768 - 44269650
Alignment:
Q  220 gttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaat 319  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  44269768 gttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaag 44269669  T
Q  320 ttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44269668 ttgtaagttgttgtcgatg 44269650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 9511774 - 9511863
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511774 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 9511863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 9519749 - 9519838
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9519749 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 9519838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17046612 - 17046511
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17046612 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 17046513  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  17046512 gt 17046511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 54876085 - 54876186
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  54876085 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 54876184  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  54876185 gt 54876186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10563019 - 10562881
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg 242  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  10563019 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcgttcaagttgttatttttaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttatctctgctg 10562920  T
Q  243 tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10562919 tattgatgattaaatcattaagtttcatatgttagtcaa 10562881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11192531 - 11192430
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  11192531 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatttattatgtgaatatt 11192432  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  11192431 gt 11192430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 17685445 - 17685546
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17685445 ggtgtttaagagtatttaatctatcttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattagaaatacatatattatgtgaatatt 17685544  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  17685545 gt 17685546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6156156 - 6156055
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  6156156 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatgttatgtgaatatt 6156057  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  6156056 gt 6156055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14441618 - 14441517
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14441618 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaattagtttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 14441519  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  14441518 gt 14441517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 19568970 - 19569072
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatct-aatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgt 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19568970 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggaccttaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatat 19569069  T
Q  108 tgt 110  Q
    |||    
T  19569070 tgt 19569072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 17691427 - 17691508
Alignment:
Q  29 ctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17691427 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgatatacatatattatgtgaatattgt 17691508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20417424 - 20417233
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  20417424 tgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatataaaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgat 20417326  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  20417325 atgttg-caagttgtt-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 20417233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 18700082 - 18700176
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18700082 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 18700176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12470245 - 12470151
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12470245 aagagtatttaacatgtgttgtgattgatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 12470151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 43889408 - 43889502
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43889408 aagagtatttaacatgtgttgtcatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 43889502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40811986 - 40811913
Alignment:
Q  259 attaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40811986 attaagttgtatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 40811913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14671264 - 14671173
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14671264 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14671173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14682763 - 14682672
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14682763 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14682672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15565964 - 15565897
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15565964 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaacttggtttgacgtaaatatctttgttgg 15565897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24546287 - 24546220
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24546287 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 24546220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 50755983 - 50756050
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50755983 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 50756050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13179488 - 13179314
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 205  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |  |      
T  13179488 ttgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttg 13179390  T
Q  206 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13179389 tatgttg-caagttgttg-atgttgctatctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaa 13179314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 13523145 - 13523276
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13523145 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtc 13523242  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13523243 tctgctgttgttgattagtaatatcattaagttg 13523276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 14153008 - 14153068
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14153008 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 14153068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17207792 - 17207725
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17207792 ggtgtttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 17207725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 54330907 - 54330970
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54330907 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttgatttgacgtgaatatctttg 54330970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14818370 - 14818211
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14818370 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgct 14818272  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
     | |||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  14818271 gtattg-caagttgct-tatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 14818211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 3394736 - 3394867
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  3394736 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 3394833  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3394834 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 3394867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 50348635 - 50348695
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50348635 aagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 50348695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 50351602 - 50351665
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50351602 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgttatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 50351665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 267
Target Start/End: Original strand, 23395786 - 23395925
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| |||  |||||||| |||    
T  23395786 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatattg-caagttgtt-tat 23395882  T
Q  227 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23395883 gttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcatgaagttg 23395925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10550587 - 10550510
Alignment:
Q  136 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10550587 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaattatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10550510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 18367492 - 18367623
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  18367492 ttatgtggaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgttatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 18367589  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | || |||||||| ||||||||||||    
T  18367590 tctgctgttgttaattattaatatcattaagttg 18367623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 338
Target Start/End: Original strand, 1208848 - 1208901
Alignment:
Q  285 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1208848 gttaaagttgtaagttggtgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 1208901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11258613 - 11258560
Alignment:
Q  285 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11258613 gttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgacgatg 11258560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 13520515 - 13520646
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  13520515 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 13520612  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13520613 tctgctgttgttgattagtaatatcattaagttg 13520646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3803160 - 3803066
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3803160 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 3803066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6819427 - 6819367
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6819427 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattat 6819367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 10542070 - 10542142
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaataca 91  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  10542070 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaacttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagataca 10542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 11850414 - 11850508
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  11850414 ttatatcattctagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 11850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 17548285 - 17548361
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17548285 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaaaatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 17548361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 279
Target Start/End: Original strand, 19569032 - 19569200
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  | |||||| || |||    
T  19569032 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttattgctgttaatgttgttat 19569129  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc 279  Q
    | ||  |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  19569130 gatg-caagttgttat-tgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtc 19569200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 40812276 - 40812216
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  40812276 aagagtatttaacctatgtggtgatgtatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 40812216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 49900171 - 49900111
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  49900171 aagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgcgaatatccttgttgg 49900111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12511291 - 12511232
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttg 75  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  12511291 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaagatctttgttg 12511232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 343
Target Start/End: Original strand, 50756254 - 50756293
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatgatgtc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50756254 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatgttgtc 50756293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 14568661 - 14568723
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  14568661 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14568723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6158706 - 6158637
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6158706 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 6158637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 14642293 - 14642362
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14642293 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 14642362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 52338671 - 52338775
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtt-gttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  52338671 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttatttatatcattcaagttgttgttattaatattgct 52338769  T
Q  207 atgttg 212  Q
    ||||||    
T  52338770 atgttg 52338775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 179441 - 179517
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  179441 ttatgtgcaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttactattaatattgctatgttg 179517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13516582 - 13516530
Alignment:
Q  215 aagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagtt 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13516582 aagttcttgtatgttgctgtctctgctgttattggttattaaatcattaagtt 13516530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Original strand, 14250861 - 14250952
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  14250861 gaaaatgtatgatatggaaattattattgttata--attcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 14250952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 17937971 - 17937935
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttg 52  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17937971 aagagtatttaacctaggttgtgttggatctaatttg 17937935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 54520762 - 54520668
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  54520762 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctttgttgttgttgattattaatatcattaagttg 54520668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6155986 - 6155897
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6155986 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatat-gttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 6155897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11192289 - 11192200
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  11192289 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgttcatatcattcaagttgtt 11192200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 338
Target Start/End: Original strand, 50351983 - 50352034
Alignment:
Q  287 taaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50351983 taaagttataagttgttgtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 50352034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Original strand, 52213183 - 52213272
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattatt 197  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  52213183 tgttgttggttaatttaagttgtatatatt-atgtggaaaatgtattatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattatt 52213272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11562777 - 11562678
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  11562777 tgaatattgttgttgaataattagagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaa 11562680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Original strand, 22842513 - 22842546
Alignment:
Q  305 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22842513 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22842546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37038127 - 37038058
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37038127 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaaattgttattattgatgttgctatgttg 37038058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 42324964 - 42325033
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42324964 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattcatgttgctatgttg 42325033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43928794 - 43928741
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43928794 aagagtatttaacatatgttctgatgaatcttatttggtttgacgtgaatatct 43928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11562971 - 11562927
Alignment:
Q  61 tgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11562971 tgaatattgttgttgactaatttgagatacatatattatgtgaat 11562927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12275879 - 12275785
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||| || | || |||||||| ||||||||||||    
T  12275879 ttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgtt-tcaagttgct-tatgttgctgtttctgctgttgttaattattaatatcattaagttg 12275785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16050172 - 16050114
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt 188  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  16050172 tacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatagaaa-tgatgttgttatatcattcaagtt 16050114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16059555 - 16059489
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattat 196  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16059555 tacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatag-aaatgatgttgttaaatcattcaagttattattat 16059489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 46386684 - 46387012
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  46386684 actatggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcga 46386783  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46386784 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 46386883  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  46386884 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattaattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 46386983  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  46386984 gtcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 46387012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20585811 - 20585477
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20585811 actagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaacatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 20585712  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20585711 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 20585612  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20585611 gctatgtcgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 20585512  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20585511 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 20585477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44374396 - 44374067
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374396 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 44374297  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44374296 gttgttgaataatttgagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 44374197  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  44374196 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaa 44374097  T
Q  309 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44374096 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 44374067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44383261 - 44382932
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383261 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 44383162  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44383161 gttgttgaataatttgagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 44383062  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  44383061 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaa 44382962  T
Q  309 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44382961 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 44382932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19282542 - 19282213
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19282542 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaatggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 19282443  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19282442 gttgttgaataatttgagttacatatatttatatggaaaagatataatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaacgatgctat 19282343  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  19282342 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtttgtcaagttgttaaaattgtaagttgttgtcaa 19282243  T
Q  309 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19282242 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 19282213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 12465864 - 12466191
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465864 tgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 12465963  T
Q  111 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12465964 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagtaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgt 12466063  T
Q  211 tgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatg 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12466064 tgttaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgattaataaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatg 12466163  T
Q  311 tcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12466164 tcgttaaagttgcaagttgttgtcgatg 12466191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 13148069 - 13148281
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13148069 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 13148168  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13148169 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgcggaaaaggtatgatatagaaaataatatttttataccattcaagttgttattattaatgat 13148268  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  13148269 gctatgttgtgaa 13148281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 12127766 - 12127973
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12127766 ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacacatattatgtgaatgtt 12127865  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12127866 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactat 12127965  T
Q  209 gttgtgaa 216  Q
    ||||||||    
T  12127966 gttgtgaa 12127973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11066923 - 11066711
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11066923 actagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaagtacatatattatgtga 11066824  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066823 atgttgtcgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatggaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 11066724  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  11066723 gctatgttgtgaa 11066711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12371723 - 12371521
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371723 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 12371624  T
Q  111 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 210  Q
    ||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371623 tg---aataatttgagttatatatatttacgtggaaaaagtatgatatagaaaataaagtttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 12371527  T
Q  211 tgtgaa 216  Q
    ||||||    
T  12371526 tgtgaa 12371521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 118 - 299
Target Start/End: Original strand, 37785076 - 37785257
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37785076 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 37785175  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  37785176 ttgttgtatgttgctgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaagattgtcaagttgtaagt 37785257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 32434186 - 32434392
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgtt-ggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtg 102  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32434186 actagggtgtttaagagtatttaatctatgttatgaaaggatctaatttggtttgacgtgaatatatttgttggataatttgaaatacatatattatgtg 32434285  T
Q  103 aatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatga 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32434286 aatattgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatga 32434385  T
Q  203 tgctatg 209  Q
    || ||||    
T  32434386 tgttatg 32434392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 281
Target Start/End: Original strand, 18875646 - 18875799
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875646 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 18875745  T
Q  228 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18875746 ttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 18875799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 281
Target Start/End: Original strand, 43277546 - 43277699
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43277546 tacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 43277645  T
Q  228 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43277646 ttactgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 43277699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3287247 - 3287100
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3287247 tacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 3287148  T
Q  228 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    |||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3287147 ttgctgt------tgtattgattattaaatcattaagtttcatatgttagtcaa 3287100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Original strand, 14928935 - 14929100
Alignment:
Q  10 gtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttg 109  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14928935 gtgtttaaaagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataacttgaaatacatatattatgtgaatgttg 14929034  T
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14929035 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 14929100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Original strand, 15352401 - 15352566
Alignment:
Q  10 gtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttg 109  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15352401 gtgtttaaaagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataacttgaaatacatatattatgtgaatgttg 15352500  T
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15352501 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 15352566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15720231 - 15720130
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15720231 actagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattaagtga 15720132  T
Q  104 at 105  Q
    ||    
T  15720131 at 15720130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 33001364 - 33001269
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaa 104  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33001364 ggtgtttaagagaatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaa 33001269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11053976 - 11053785
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11053976 tgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgct 11053878  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    || |||  ||||| || ||||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11053877 atattg-caagttctt-tatgttgttgtctatgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 11053785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14258795 - 14258701
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14258795 aagagtatttaacatttgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14258701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16580100 - 16580009
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16580100 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16580009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Original strand, 16585563 - 16585654
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16585563 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16585654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32301625 - 32301531
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32301625 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatatttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 32301531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 16460546 - 16460635
Alignment:
Q  21 tatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16460546 tatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16460635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33001303 - 33001177
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| || ||||||| | |||||||    
T  33001303 ttgttggataatttgagatacatatatt-atgtg-aaaatgtatgatatagaaaattatgttgttgtatcatccaagttattgttattaacgttgctatg 33001206  T
Q  210 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  33001205 ttg-caagttgttttatgttgctgtctctg 33001177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15281607 - 15281505
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 207  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  15281607 tgttgttggttattttgaattacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttatta-taatgttgcta 15281510  T
Q  208 tgttg 212  Q
    |||||    
T  15281509 tgttg 15281505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Original strand, 1489907 - 1489974
Alignment:
Q  43 atctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1489907 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgatatacatatattatgtgaatattgt 1489974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20487883 - 20487792
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20487883 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttgctcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 20487792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 8757130 - 8757261
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  8757130 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 8757227  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8757228 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 8757261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 40555477 - 40555608
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  40555477 ttatatggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 40555574  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  40555575 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 40555608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 18875455 - 18875515
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18875455 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 18875515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 13745802 - 13745869
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13745802 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttcacgtgaatatctttgttgg 13745869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 267
Target Start/End: Original strand, 3289548 - 3289687
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||| |||    
T  3289548 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattgacgttgctatgttg-caagttgtt-tat 3289644  T
Q  227 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||    
T  3289645 gttgttgtctctgttgttgttgattattaataccattaagttg 3289687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25941888 - 25941821
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25941888 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggaactaacttggtttgacgtgaatatctttattgg 25941821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3287440 - 3287380
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3287440 aagaatatttaacgtatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 3287380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13894545 - 13894485
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13894545 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggcttgacgtgaatatct 13894485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 15096385 - 15096495
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  15096385 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 15096482  T
Q  200 tgatgctatgttg 212  Q
    || || |||||||    
T  15096483 tgttgttatgttg 15096495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 21735237 - 21735331
Alignment:
Q  138 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctg 233  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  21735237 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctg 21735331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 13745386 - 13745445
Alignment:
Q  17 agagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13745386 agagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttgg 13745445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 14161456 - 14161523
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14161456 ggtgtttaagattatttaacctatgttttgatggatcttacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 14161523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 24270583 - 24270646
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24270583 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatttaacttggtttgacgtgaatatctttg 24270646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4325374 - 4325310
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4325374 ttatgttgaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 4325310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 8851768 - 8851828
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  8851768 aagattatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatcgttgttgg 8851828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13408090 - 13408014
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13408090 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13408014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 13865120 - 13865196
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13865120 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattgaagttgttattattaatattgctatgttg 13865196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 19558025 - 19558135
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |    
T  19558025 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatatagttgttcatatcattcaagttgttgttattga 19558122  T
Q  200 tgatgctatgttg 212  Q
    || || |||||||    
T  19558123 tgttgttatgttg 19558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20619729 - 20619669
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20619729 aagagtatttaacctacgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 20619669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 43277353 - 43277413
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  43277353 aagagtatttaacatatgttgtgatggatctaacttggtttagcgtgaatatctttgttgg 43277413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 4691497 - 4691560
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  4691497 ggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtgatgaatctaactaggtttgacgtgaatatctttg 4691560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 48213546 - 48213609
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  48213546 ggtgtttaagaatatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgcgaatatctttg 48213609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Original strand, 832757 - 832884
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  832757 ttatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 832854  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaa 263  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  832855 tctgttgttgttgattattaatatcattaa 832884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Original strand, 1197937 - 1198064
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  1197937 ttatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 1198034  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaa 263  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  1198035 tctgttgttgttgattattaatatcattaa 1198064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 13133257 - 13133346
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  13133257 tgaatattgttgctgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 13133346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 223
Target Start/End: Original strand, 14161683 - 14161749
Alignment:
Q  156 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  14161683 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgtcatgttgt-aagttgttg 14161749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 14219713 - 14219802
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14219713 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aagtattgttgttcatatcattcaagttgtt 14219802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 15576432 - 15576495
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15576432 ggtgtttaagggtatttaacttatgttgtgattaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 15576495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 21675510 - 21675549
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaa 48  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21675510 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaa 21675549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 39292338 - 39292377
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaa 48  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39292338 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaa 39292377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 12755442 - 12755504
Alignment:
Q  139 atgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12755442 atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatataattcaagttgttatgattaat 12755504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15139468 - 15139364
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 205  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |  |||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| | |||||| ||     
T  15139468 ttgttgttggataatttgagatacatatatt-atgtgaacattgtatgatatagaaa-tattgttgtttatatcaatcaagttgttagtgttaatgttgt 15139371  T
Q  206 tatgttg 212  Q
    |||||||    
T  15139370 tatgttg 15139364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43747629 - 43747595
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43747629 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 43747595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Original strand, 13133067 - 13133116
Alignment:
Q  61 tgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13133067 tgaatatcgttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 13133116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 17071030 - 17071099
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17071030 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 17071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 20252945 - 20253006
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||| | ||||||||||    
T  20252945 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacataaatatctttg 20253006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11309585 - 11309537
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11309585 tgatatagaaaatattgttgtttatattattcaagttgttattattaat 11309537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 200
Target Start/End: Original strand, 14191839 - 14191887
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14191839 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 14191887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Original strand, 14219722 - 14219762
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14219722 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14219762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14258741 - 14258679
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14258741 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 14258679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Original strand, 15096394 - 15096434
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15096394 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 15096434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16077664 - 16077624
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16077664 ttgttggataatttgaaatacatgtattatgtgaatattgt 16077624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 16460595 - 16460657
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16460595 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16460657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16580049 - 16579987
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16580049 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16579987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 16585614 - 16585676
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16585614 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16585676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Original strand, 19558034 - 19558074
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19558034 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 19558074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32301571 - 32301509
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  32301571 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 32301509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 18 - 352
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgttaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 117  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  118 atgttgttgttgaataatttgagttacatataattttgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgat 217  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  218 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 317  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  318 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42875254 - 42874924
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42875254 actagggtgtttaggagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 42875155  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875154 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 42875055  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42875054 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgttatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 42874955  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42874954 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttggtgtc 42874924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16997985 - 16997649
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16997985 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 16997886  T
Q  104 atgttgttgttg---aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16997885 atgttgttgttgttgaataatttgagttacttatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaat 16997786  T
Q  201 gatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16997785 gatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcacatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtt 16997686  T
Q  301 tttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgat 337  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16997685 gttgtcaatgtcattaaagttgtaagttgttgtcgat 16997649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11425405 - 11425075
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11425405 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgtatgtt 11425306  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaa-taatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11425305 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaataggtatgatatagaaaaataatattgttatatcattcatgttgttattattaatgatgcta 11425206  T
Q  208 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtca 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11425205 tgttgtgaagttgatgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtca 11425106  T
Q  308 atgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11425105 atgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 11425075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25091108 - 25090774
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25091108 actagggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtgatggatctaatttgctttgacgtgaatatctttgttagataatttgaaatacatatattatgtga 25091009  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25091008 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgat 25090909  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25090908 gttatgttgtgaagttgttgtgtgttgttttctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 25090809  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25090808 gtcattgtcattaaagttgtaagttgttgtcgatg 25090774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14549081 - 14548773
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14549081 actagggtgtttaagagtatttagcctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatgtga 14548982  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14548981 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatgtatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 14548882  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||  ||    
T  14548881 gttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatttgttgtttatgttgttaaagttgtaagttgtt 14548782  T
Q  304 gtcaatgtc 312  Q
    ||| |||||    
T  14548781 gtcgatgtc 14548773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Original strand, 10357033 - 10357328
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10357033 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatcttatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 10357132  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357133 atgttgttgatgaataatttgagttacatatatttacgtagaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 10357232  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10357233 gttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 10357328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37018929 - 37018719
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37018929 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 37018830  T
Q  228 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagt 327  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37018829 ttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtccagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagt 37018730  T
Q  328 tgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||    
T  37018729 tgttgtcgatg 37018719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19609779 - 19609567
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19609779 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgcgaatatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 19609680  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19609679 atgttgttgttgaataatttgagtgacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttaaaccattcaagttgttattattaatgat 19609580  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  19609579 gctatgttgtgaa 19609567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3485361 - 3485091
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485361 ggtgtttaagagtatctagcatatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 3485262  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3485261 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctat 3485164  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | | | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485163 gat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 3485091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 299
Target Start/End: Original strand, 19435498 - 19435669
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19435498 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 19435597  T
Q  228 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||    
T  19435598 ttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaaatttgtcaagttgtaagt 19435669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 33243949 - 33244129
Alignment:
Q  100 gtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33243949 gtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatattg-tgtgaataaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 33244047  T
Q  200 tgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33244048 tgatgctatgttgtgaagttattgtatgttgatgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 33244129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19734687 - 19734471
Alignment:
Q  58 acgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgata 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||     
T  19734687 acgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgat- 19734590  T
Q  158 tagaaaataatgttgttataccattc-aagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa 255  Q
          |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  19734589 ------ataatgttgttataccatccaaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctgttgttattgattattaa 19734497  T
Q  256 atcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  19734496 atcattaagttgcatatgatggtcaa 19734471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14630276 - 14630177
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14630276 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 14630177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 53631075 - 53631176
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  53631075 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 53631174  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  53631175 gt 53631176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 13036381 - 13036479
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttg 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13036381 tgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttaaaatacatatattatgtgaatgttg 13036479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Original strand, 4615772 - 4615901
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4615772 tgttgttggttaatttgagttacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgct 4615870  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    ||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  4615871 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctg 4615901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 33243898 - 33243994
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33243898 ggtgtttaagagtagctaacctatgttgtgatggatctaatttgatttgacgtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatattgtgtgaat 33243994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 267
Target Start/End: Original strand, 2584937 - 2585076
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||  |||||||| |||    
T  2584937 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg-caagttgtt-tat 2585033  T
Q  227 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  2585034 gttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 2585076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21061844 - 21061680
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  21061844 ttatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgatgtttatatcattcaagttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtc 21061746  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    |||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  21061745 tctactgttattgattattaatatcgttaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 21061680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15344327 - 15344260
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15344327 ggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgg 15344260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 19435307 - 19435367
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19435307 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 19435367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 35660295 - 35660233
Alignment:
Q  10 gtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35660295 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 35660233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 55582653 - 55582587
Alignment:
Q  10 gtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  55582653 gtgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatctaacttgatttgatgtgaatatctttgttgg 55582587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3337549 - 3337489
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3337549 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 3337489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 26922273 - 26922336
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26922273 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 26922336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 37019124 - 37019053
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttg 75  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  37019124 actaaggtgtttaagagtatttaacctatgctgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatttttgttg 37019053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6511900 - 6511762
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| || | |||||||| |||    
T  6511900 tacatatatt-atgtagaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatatt-tcaagttgtt-tat 6511804  T
Q  227 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagtt 266  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  6511803 gttgttgcctctgttgttgttgattattaatatcattaagtt 6511762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27028053 - 27027922
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  27028053 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 27027956  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27027955 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 27027922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 14933175 - 14933251
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14933175 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 14933251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9638169 - 9638080
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9638169 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 9638080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25513193 - 25513126
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25513193 ggtgtttaagaatatttaacctatgttgtgatagatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttgg 25513126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26445335 - 26445268
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26445335 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatatatcttggtttgacgtgaatatctttattgg 26445268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13446778 - 13446642
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | |||    
T  13446778 tacatatatt-atgtgaaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgct-tat 13446682  T
Q  227 gttgctgtctctgatgtattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13446681 gttgttgtctctgttg--ttgattattaatatcattaagttg 13446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14508212 - 14508150
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  14508212 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14508150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 19566520 - 19566582
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19566520 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgataaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 19566582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 14942381 - 14942512
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  14942381 ttatgtggaaaatgtatgatctagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 14942478  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  14942479 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 14942512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Original strand, 15448145 - 15448276
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  15448145 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagtttttattattaatatttctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 15448242  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||| || |  |||||||||| ||||||||||||    
T  15448243 tctgctgttgctgattattaatatcattaagttg 15448276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18229974 - 18229899
Alignment:
Q  138 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  18229974 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttaatattaatattgctatgttg 18229899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 45314938 - 45315001
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45314938 ggtgtttaagagtatttaacctatgttaagatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 45315001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 20899466 - 20899625
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  20899466 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 20899564  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  20899565 atgttg-caagttgct-tatgttgttgtctctactgttgttgattattaatatcattaagttg 20899625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50160222 - 50160165
Alignment:
Q  241 tgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  50160222 tgtattgattattaaatcattaaattgcatatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 50160165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9638316 - 9638247
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9638316 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 9638247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 16026788 - 16026887
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||    
T  16026788 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtgtgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgctattgttaa 16026885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15114666 - 15114614
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatc 68  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15114666 aagagtatttaacctatgtgctgatggatctaatttggtttgatgtgaatatc 15114614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 49547996 - 49548090
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||    
T  49547996 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatattattaagttg 49548090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14630034 - 14629945
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  14630034 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 14629945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 2425222 - 2425284
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||| ||||| ||||||||||||    
T  2425222 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatcaatcttggtttgatgtgaatatcttt 2425284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25512694 - 25512660
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25512694 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 25512660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Original strand, 26922555 - 26922589
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26922555 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 26922589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51992832 - 51992738
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  51992832 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 51992738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 20179123 - 20179452
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20179123 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 20179222  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20179223 gttgttgaataatttgagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 20179322  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  20179323 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaa 20179422  T
Q  309 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20179423 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 20179452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 42818504 - 42818829
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42818504 actagggtgtttaagagtatttaatctatggtgtgatggatctaatttgatttgacgtgaatttatttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 42818603  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42818604 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgaggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtttttattattaacgat 42818703  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||       ||    
T  42818704 gatatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctagtgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt--aagttg-------tt 42818794  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42818795 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 42818829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 39936612 - 39936819
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936612 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 39936711  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936712 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtggttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 39936811  T
Q  209 gttgtgaa 216  Q
    ||||||||    
T  39936812 gttgtgaa 39936819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19140220 - 19140008
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19140220 actagggtgtttaacagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 19140121  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19140120 atgttcttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 19140021  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  19140020 gctatgttgtgaa 19140008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 281
Target Start/End: Original strand, 20084247 - 20084508
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  20084247 aagattatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtgaatatctttgttgaataatttgaaatacatatactatatgaatgttcttgttg 20084345  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| | | |    
T  20084346 aataatttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatata-aaaataatgttgttatacca-tcaagtggttattattaatgttgttatgat-tca 20084441  T
Q  216 agttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20084442 agttgttgtatgttgttgtctctgctgttattgattattaaattattaagttgcatatgttggtcaa 20084508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Original strand, 22259106 - 22259243
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22259106 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgccatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgt 22259205  T
Q  244 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22259206 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 22259243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 6102362 - 6102536
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6102362 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttattg 6102460  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttat 193  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6102461 aataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttat 6102536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24713457 - 24713329
Alignment:
Q  170 ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgca 269  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713457 ttgttatatcattcaaattgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgca 24713358  T
Q  270 tatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24713357 tatgttggtcaagttgtttaagttgtaag 24713329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 5760983 - 5760882
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5760983 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaaattggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 5760884  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  5760883 gt 5760882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23947531 - 23947374
Alignment:
Q  122 ttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 220  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  23947531 ttgagctacatatatt-atgtggaaatg-tatgatatagaaaatattattgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttg 23947435  T
Q  221 ttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc 279  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  23947434 ttttatgttgctgtctctgctgttattgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtc 23947374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17217920 - 17217771
Alignment:
Q  121 tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 220  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  17217920 tttgaattacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatctaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttg 17217823  T
Q  221 ttgtatgttgctgtctctgatg-tattg-attattaa-atcattaagttgca 269  Q
    || |||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17217822 ttttatgttgctgtctctgctgttgttgaattattaatatcattaagttgca 17217771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 299
Target Start/End: Original strand, 17907695 - 17907867
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||    
T  17907695 tacatatatt-atgtggaaaaagtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgatattattaatgttgctatgttg-caagttgttttat 17907792  T
Q  227 gttgctgtctctgatg-tattgattatt-aaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  17907793 gttgttgtctctgctgttgttgattattgatatcattaagttgcaaatgttagtctaagttg-caaagttgtaagt 17907867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23889070 - 23888879
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||    
T  23889070 tgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcgttcaagttgttattattaatgtagct 23888972  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  23888971 gtgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctattgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 23888879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Original strand, 21346011 - 21346102
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21346011 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 21346102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22244729 - 22244557
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||    
T  22244729 tacatatatt-atgttgaaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatctttcaagttgttattattaatgtttctatgttg-caagttgttttat 22244632  T
Q  227 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  22244631 gttgatgtctctgctgttattgattattaatatcattaaattgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 22244557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 269
Target Start/End: Original strand, 22584461 - 22584602
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 226  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||    
T  22584461 tacatatatt-atgtgaaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagtggttattattaatgttgctatgttg-caagttgtt-tat 22584557  T
Q  227 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 269  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22584558 gttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 22584602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23914364 - 23914273
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23914364 agtatttaacatgtgttatgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatgttgt 23914273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 20517719 - 20517786
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20517719 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgcgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 20517786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22344492 - 22344425
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22344492 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 22344425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22356152 - 22356085
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22356152 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 22356085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 36305107 - 36305042
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36305107 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatacctttgttgg 36305042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 32950051 - 32949991
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32950051 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgttgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 32949991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 4381394 - 4381457
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4381394 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 4381457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22483197 - 22483130
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22483197 ggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttgg 22483130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 361814 - 361874
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  361814 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgatgtgaatatct 361874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22474195 - 22474139
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22474195 aagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 22474139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 18817063 - 18817126
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18817063 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatgtaacttggtttgacgtgaatatctttg 18817126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 36728025 - 36728124
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  36728025 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 36728122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18833914 - 18833854
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18833914 aagagtatttaacctatatggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 18833854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 22318655 - 22318765
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  22318655 tgaatattgttgttggataatttgagatacatatatt-acgtggatattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 22318752  T
Q  200 tgatgctatgttg 212  Q
    || || |||||||    
T  22318753 tgttgttatgttg 22318765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 17979018 - 17979080
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  17979018 ggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 17979080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 18815425 - 18815487
Alignment:
Q  10 gtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||| ||||    
T  18815425 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttcacgtgaatatatttg 18815487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 17437927 - 17437976
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaat 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17437927 aagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaat 17437976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20454541 - 20454426
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgatt 250  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||| ||| || | ||||||    
T  20454541 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtccctgctgttgttgatt 20454444  T
Q  251 attaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  20454443 attaatatcattaagttg 20454426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 31723309 - 31723408
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  31723309 tgaatattgttgttaaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaa 31723406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 5082821 - 5082881
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5082821 aagagtatttaacttatgcggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 5082881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Original strand, 15635914 - 15635978
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15635914 ttatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 15635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19882267 - 19882207
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19882267 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 19882207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20455298 - 20455238
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20455298 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20455238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20460276 - 20460216
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20460276 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20460216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Original strand, 36733126 - 36733178
Alignment:
Q  20 gtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  36733126 gtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgttaatatctttg 36733178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5080459 - 5080396
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  5080459 ggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatcttacttggtttgacgtgaatatatttg 5080396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 31723499 - 31723588
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  31723499 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatctgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 31723588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22344236 - 22344202
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22344236 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22344202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22355896 - 22355862
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22355896 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22355862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36304911 - 36304877
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36304911 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 36304877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38988500 - 38988466
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38988500 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 38988466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39019597 - 39019563
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39019597 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 39019563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12577058 - 12577009
Alignment:
Q  285 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 334  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12577058 gttaaagttgtaagttgttgtcgatgtcgataaagttgtaagttgttgtc 12577009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12577070 - 12577033
Alignment:
Q  301 tttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12577070 tttgtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 12577033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 39695271 - 39695340
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39695271 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 39695340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 21346062 - 21346124
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21346062 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 21346124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 137
Target Start/End: Original strand, 36727854 - 36727890
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36727854 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatatt 36727890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42912500 - 42912171
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42912500 ggtgtttaagagtatttaatatatgttgtgattgatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 42912401  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42912400 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 42912301  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42912300 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctttgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 42912201  T
Q  309 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42912200 tgtcattaaagttgtaagttgttgtcgatg 42912171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 338
Target Start/End: Original strand, 4596454 - 4596776
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4596454 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgttgttg 4596553  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596554 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaactaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 4596653  T
Q  216 agttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgtt 315  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  4596654 aattgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttgatcgagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatttcgtt 4596753  T
Q  316 aaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4596754 aaagttgtaagttgttgtcgatg 4596776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 21046651 - 21046980
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21046651 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatataatttggtttgatgtgaatatctttgttagataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 21046750  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21046751 gttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctat 21046850  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21046851 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctcttctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 21046950  T
Q  309 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21046951 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 21046980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 16058911 - 16059245
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16058911 actagggtgtttaagattatttaagctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 16059010  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16059011 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 16059110  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16059111 gctatgttgtgaagttggtgtatgtgtttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 16059210  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  16059211 gtcaatgtagttaaagttgtaagttgttatcgatg 16059245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Original strand, 20634244 - 20634507
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  20634244 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatgcatatattatgtgaatgttgttgtta 20634343  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634344 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggcatgatataaaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 20634443  T
Q  216 agttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634444 agttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc 20634507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20588129 - 20587838
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20588129 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaagacatatattatgtgaatgtt 20588030  T
Q  109 gttgttgaataa-tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20588029 gttgttgaataaatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatacta 20587930  T
Q  208 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  20587929 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctatattgattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttgtttaagctgtaag 20587838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20592667 - 20592376
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20592667 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaagacatatattatgtgaatgtt 20592568  T
Q  109 gttgttgaataa-tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20592567 gttgttgaataaatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatacta 20592468  T
Q  208 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  20592467 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctatattgattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttgtttaagctgtaag 20592376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 110 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19676100 - 19675872
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 209  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676100 ttgttggataatttgaaatacatatatttatgtgcaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 19676001  T
Q  210 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaat 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19676000 ttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaat 19675901  T
Q  310 gtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19675900 gtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 19675872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 41227308 - 41227513
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41227308 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgatggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 41227407  T
Q  111 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41227408 tgttgaataatttgagttacatacaattatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaatttgttatcattaatgatgctatgt 41227507  T
Q  211 tgtgaa 216  Q
    ||||||    
T  41227508 tgtgaa 41227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 14238214 - 14238484
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238214 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaattttgtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 14238313  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||    
T  14238314 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgttat 14238411  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238412 gat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 14238484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 281
Target Start/End: Original strand, 7052665 - 7052927
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052665 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 7052763  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |    
T  7052764 aataatttgagatacatatatt-aggtgaatattgtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tca 7052860  T
Q  216 agttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052861 agttgttgtatgttgctgtctgtgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 7052927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Original strand, 38887798 - 38887999
Alignment:
Q  78 taatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38887798 taatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 38887895  T
Q  178 ccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttg 276  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38887896 ccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtttctgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttg 38887994  T
Q  277 gtcaa 281  Q
    |||||    
T  38887995 gtcaa 38887999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 51082666 - 51082496
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51082666 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 51082567  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccat 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51082566 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccat 51082496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 38887697 - 38887817
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38887697 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtggatatctttgttggataagttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttg 38887795  T
Q  116 aataatttgagttacatatatt 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  38887796 aataatttgaaatacatatatt 38887817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 21239897 - 21239998
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239897 ggtgtttaagaatttttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 21239996  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  21239997 gt 21239998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 51323725 - 51323628
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51323725 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatg 51323628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19676166 - 19676073
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatatt 97  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19676166 actagggtgtttaagagtatttaatatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatatt 19676073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 39060544 - 39060479
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39060544 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgg 39060479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1643046 - 1642979
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1643046 ggtgtttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttgatttgacgtgaatatctttgttgg 1642979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42697031 - 42696937
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  42697031 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgctacgttg-caagttgttttatgttgttgtctctg 42696937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 52983491 - 52983332
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  52983491 tgttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgtt 52983393  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg-atgtattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  52983392 atgttg-caagttgct-tatgttgatgtctctgcagttgttgattattaatatcattaagttg 52983332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18275241 - 18275157
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18275241 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaacgttgctatgttg 18275157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 41226055 - 41226116
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41226055 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 41226116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12710338 - 12710278
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12710338 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatct 12710278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51476322 - 51476131
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51476322 tgttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagataataccgttgtttatattattcaagttgttattattaatgttgct 51476224  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| | |||||  || | ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  51476223 atgttg-caagttgtt-tatgttgttctctctactgttgttgattattaatatcattaagctgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 51476131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1642750 - 1642657
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  1642750 gaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctg 1642657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 22824008 - 22824075
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  22824008 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatggatctaacttagtttgacgtgaatatctttgttgg 22824075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 50544302 - 50544239
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  50544302 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatatttg 50544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18121055 - 18120993
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  18121055 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 18120993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 7792586 - 7792662
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7792586 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaaatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 7792662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 13528528 - 13528604
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  13528528 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 13528604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Original strand, 44822855 - 44822919
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44822855 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 44822919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 45496388 - 45496328
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  45496388 aagagtatttaacctatgttgtgattaatctaacttggtttgacatgaatatctttgttgg 45496328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 48301375 - 48301315
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  48301375 aagagtatttaacctatgtggtgatagatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 48301315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18270587 - 18270518
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattatt 197  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18270587 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattctagttgttattatt 18270518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18823952 - 18823793
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  18823952 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatatatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 18823854  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| |||||||    
T  18823853 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcagtaagttg 18823793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Original strand, 21181073 - 21181135
Alignment:
Q  151 tatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21181073 tatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 21181135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 24720295 - 24720357
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  24720295 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgcgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 24720357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 38057394 - 38057463
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38057394 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 38057463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Original strand, 10813273 - 10813333
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10813273 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10813333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13302135 - 13302045
Alignment:
Q  105 tgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 196  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13302135 tgttgttgttgtttaatttgagatctatatatt-atgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 13302045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Original strand, 24815586 - 24815647
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24815586 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgtt--tatatcattcaagttgttattattaat 24815647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6833416 - 6833382
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6833416 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 6833382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45496176 - 45496142
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45496176 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 45496142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Original strand, 11809199 - 11809252
Alignment:
Q  23 tttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  11809199 tttaacctatgttgtgatgaatctaacttgggttgacgtgaatatcattgttgg 11809252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 19761968 - 19762037
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19761968 gaaaatgtatgatatggaaattattattgattatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 19762037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 6833658 - 6833602
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  6833658 aagagtatataacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgatgtgaatatatttg 6833602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 28653099 - 28653433
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28653099 actagggtgtttaagagtatttaacatatcttgtgatggatctaatttggtttcacgtgaatatctttgttggataatttgaaatgcatatattacgtga 28653198  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653199 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagataataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 28653298  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28653299 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 28653398  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28653399 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 28653433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 23969220 - 23969554
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23969220 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgattgatctaatttggtttgacgtaaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 23969319  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969320 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 23969419  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  23969420 gatatgttgtgaagttgtagtatgttgatgtatctgctatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtaaagttgttaaagttgtaagttgtt 23969519  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969520 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 23969554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24515636 - 24515308
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515636 ggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 24515537  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24515536 gttgttgaataatttcagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattgaagttgttatgattaatgatgctat 24515437  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 308  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24515436 gttgcgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 24515337  T
Q  309 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgat 337  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24515336 tgtcgttaaagttgcaagttgttgtcgat 24515308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36839626 - 36839295
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36839626 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtga 36839527  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36839526 atgttgttg---aataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatagtgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 36839430  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36839429 gctatgttgtgaagttgtcgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 36839330  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36839329 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 36839295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17306942 - 17306608
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17306942 actaaggtgtttaagatcatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtga 17306843  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17306842 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataaaattcaagttgttattattaatgat 17306743  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  17306742 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattaattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtatgttgtt 17306643  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17306642 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 17306608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9975384 - 9975089
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaat-acatatattatgtg 102  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  9975384 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaattacatatgttatgtg 9975285  T
Q  103 aatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975284 aatgttgttgttgaataatttgagttacatatatatatgtggaaaatgtatggtatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatga 9975185  T
Q  203 tgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9975184 tgctatgttgtaaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttacatatgttggtcaaattgttaaagttgtaag 9975089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Original strand, 27485067 - 27485359
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27485067 actagggtgtttaagagtatttaacatatgttttgatggatctaatttggtttgacgtgaatatatttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 27485166  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485167 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 27485266  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattg-attattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgt 295  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27485267 gctatgttgtgaagttgtgatatgttgatgtctctgttgtattgaattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttg-taaagttgt 27485359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 24781437 - 24781649
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24781437 actagggtgtttaagaatatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 24781536  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781537 atgttattgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 24781636  T
Q  204 gctatgttgtgaa 216  Q
    |||||||||||||    
T  24781637 gctatgttgtgaa 24781649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 5031734 - 5031922
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5031734 tgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 5031833  T
Q  111 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5031834 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaa 5031922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19358272 - 19358110
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19358272 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaag 19358173  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358172 ttgttgtatgttgatgtctctactgtattg-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 19358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14693547 - 14693380
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | |||    
T  14693547 taatttgagctatatacaattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgatgttatatcattcaagttgttatgattaatgttgctatgat-tcaag 14693449  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 286  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14693448 ttgttgtatg-tgatgtctctgccgttattgattatttaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 14693380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 281
Target Start/End: Original strand, 10897503 - 10897666
Alignment:
Q  119 aatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||    
T  10897503 aatttgagctacatatatttatgtggaaaagatatgttatacaaaatattcatgtttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaag 10897601  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10897602 ttgttgtatgttgttgtctctgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatattggtcaa 10897666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 23069059 - 23069148
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23069059 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaat 23069148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5985396 - 5985236
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatg---ctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||   |||||| |  |||||||| | ||||||||||||||     
T  5985396 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttgttattattgatgttgctatgtggc-aagttgttttctgttgctgtctctgt 5985298  T
Q  241 tg-tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5985297 tgttgttgaattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 5985236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 43707886 - 43707953
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43707886 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgg 43707953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44071837 - 44071676
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 205  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||     
T  44071837 ttgttgttggataatttgagatacatatatt-atgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcgttcaagttgttattattagtgttgt 44071740  T
Q  206 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 269  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44071739 tatgttg-caagttgttg-atgttgttgtctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 44071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 9785022 - 9784931
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9785022 agtatttaacatgtgttgtgatgaatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 9784931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22686290 - 22686223
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22686290 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaataactttgttgg 22686223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 21316263 - 21316325
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21316263 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttgatttgacgtgaatatcttt 21316325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 76
Target Start/End: Original strand, 25587301 - 25587355
Alignment:
Q  22 atttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25587301 atttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 25587355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 19201810 - 19201870
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  19201810 aagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 19201870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 24273861 - 24273921
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24273861 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 24273921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3539091 - 3538960
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || || |    
T  3539091 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttga 3538994  T
Q  200 tgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    || || |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3538993 tgttgttatgttg-caagttgttgt-tgttgctgtc 3538960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23609927 - 23609865
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23609927 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtggtaaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 23609865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21368550 - 21368490
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  21368550 aagagtatttaacctatgtggtaatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 21368490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27860629 - 27860469
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  ||| ||||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | || || |    
T  27860629 tgttgttggttaaattgagatagatatatt-atgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgtt 27860532  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 269  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27860531 atgttg-caagttgttg-atgttgttgtctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 27860469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31520435 - 31520371
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31520435 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgttattatcattcaagttgttattattaat 31520371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 1384287 - 1384350
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1384287 ggtgtttacgagtatttaacctatgctgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 1384350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 196
Target Start/End: Original strand, 18391046 - 18391124
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 196  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18391046 taatttgagctacatatatt-atgtggaaaatatatgatatcggaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 18391124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 28345677 - 28345744
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28345677 ggtgtttaatagtacttaatctatgttgtgatggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttgg 28345744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 6478034 - 6478110
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6478034 ttatgtggaaaatggatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 6478110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 21336056 - 21336116
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  21336056 tgtttaagagtatttaacctatgttgggatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 21336116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27851922 - 27851836
Alignment:
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 196  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27851922 gttgttggttaatttgaaatacatatatt-atgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 27851836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25141432 - 25141349
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |   |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  25141432 ttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattttatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 25141349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3539082 - 3539042
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3539082 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 3539042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9784971 - 9784909
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  9784971 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 9784909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25141248 - 25141212
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25141248 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatatatt 25141212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27851921 - 27851889
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtg 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27851921 ttgttggttaatttgaaatacatatattatgtg 27851889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 13133 - 13465
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  13133 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaa--catatattatgtga 13230  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13231 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgat 13330  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13331 gctatgttgtgaagttgttgtatgttattgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 13430  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  13431 gtcaatgtcattaaagctgtaagttgttgtcgatg 13465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 19400 - 19732
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  19400 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaa--catatattatgtga 19497  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgat 19597  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19598 gctatgttgtgaagttgttgtatgttcttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 19697  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  19698 gtcaatgtcattaaagctgtaagttgttgtcgatg 19732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Original strand, 5310 - 5604
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5310 actagggtgtttaagagtatttaaactatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 5409  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5410 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgtt 5509  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5510 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgtttaagttgtaag 5604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 1 - 327
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tgtttaagggtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggatcatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 100  T
Q  111 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgctatgt 200  T
Q  211 tgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatg 310  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  201 tgtgaaattgttgtatgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcatgtt-ttaaagttgtaagttgttgtcaatg 299  T
Q  311 tcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||    
T  300 tagttaaagttttaagttgttgtcgatg 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19921089 - 19920767
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19921089 actagggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 19920990  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19920989 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaactatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttattattattaatgat 19920890  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgttt 303  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19920889 gatatgttgtgaagttgttgtgtgttgctgtctctgctgtattgtttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgtt 19920790  T
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaag 326  Q
    |||||| | ||| || |||||||    
T  19920789 gtcaatattgtttaagttgtaag 19920767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Original strand, 36509487 - 36509688
Alignment:
Q  78 taatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  36509487 taatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatata-ttatgtgaatatcgtatgatatag-aaataacgttattata 36509584  T
Q  178 ccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttg 276  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36509585 ccatccaagtgattattattaatgttgccatgat-tcaagttgttgtacgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgtta 36509683  T
Q  277 gtcaa 281  Q
    |||||    
T  36509684 gtcaa 36509688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 32607927 - 32608054
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32607927 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattggctt-gacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgtt 32608025  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32608026 gttgttgaataatttgaaatacatatatt 32608054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 36509386 - 36509506
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36509386 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtgaatatttttgttggataatttgaagtacatatattatatgaatgttgttgttg 36509484  T
Q  116 aataatttgagttacatatatt 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  36509485 aataatttgaaatacatatatt 36509506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20566004 - 20565903
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20566004 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctatgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 20565905  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  20565904 gt 20565903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 281
Target Start/End: Original strand, 21406443 - 21406562
Alignment:
Q  162 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcat 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21406443 aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgctgttattgattattaaatcat 21406541  T
Q  261 taagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21406542 ttagttgcatatgttggtcaa 21406562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Original strand, 32608035 - 32608188
Alignment:
Q  78 taatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32608035 taatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataattttagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 32608132  T
Q  178 ccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  32608133 tcatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgta-gttgctgtc 32608188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 25250632 - 25250789
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgat-g 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |      
T  25250632 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctctactat 25250730  T
Q  243 tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25250731 tgttgaattattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 25250789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 25314417 - 25314574
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgat-g 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |      
T  25314417 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctctactat 25314515  T
Q  243 tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25314516 tgttgaattattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 25314574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 20198197 - 20198257
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20198197 aagagtatttaacctatgttttgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgg 20198257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 30612003 - 30611936
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  30612003 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttgg 30611936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 213
Target Start/End: Original strand, 23200299 - 23200368
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  23200299 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt 23200368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 24277340 - 24277416
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24277340 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24277416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24384873 - 24384797
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24384873 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24384797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 21399605 - 21399672
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21399605 ggtgtttaagagtatttaacctattttgtgatgaatctaatttggttagacgtgaatatctttgttgg 21399672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 30613963 - 30613896
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  30613963 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttgg 30613896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Original strand, 16605206 - 16605267
Alignment:
Q  10 gtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16605206 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 16605267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 23199998 - 23200058
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23199998 aagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatcgttgttgg 23200058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 33895491 - 33895551
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33895491 aagagtatttaacctatgcggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttgg 33895551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22111050 - 22110987
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22111050 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaatatctttg 22110987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Original strand, 1627983 - 1628041
Alignment:
Q  10 gtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatc 68  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||    
T  1627983 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaaattggtttgacgtgaatatc 1628041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Original strand, 8952787 - 8952915
Alignment:
Q  140 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctct 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||    
T  8952787 tgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtctct 8952884  T
Q  239 gatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    | || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8952885 gttgttgttgattattaatatcattaagttg 8952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18744100 - 18744038
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  18744100 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 18744038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 41876320 - 41876414
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41876320 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 41876414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 14026409 - 14026471
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatcttt 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  14026409 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14026471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20565762 - 20565701
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||    
T  20565762 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatagaaa 20565701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17812698 - 17812638
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17812698 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 17812638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Original strand, 22357664 - 22357747
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22357664 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatgttgttgtttatatcattcaagttgtt 22357747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22110927 - 22110893
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22110927 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22110893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10953283 - 10953214
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  10953283 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttataccattcaagttgttattgttgatgttgctatgttg 10953214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 336
Target Start/End: Original strand, 8504636 - 8504668
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcga 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8504636 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcga 8504668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 58203 - 57908
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  58203 actagggtgtttaagagtatttaacctgtgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 58104  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58103 atgttgttgttgaagaatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 58004  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  58003 gctatgtcgtgaagttgttgtatgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 57908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 4 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 327
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  620 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 521  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatatggaaaaggtatgatatagaaaataacgtttttataccattcaagttgttattattaatgat 421  T
Q  204 gctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 298  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  420 gatatgttgtgaagttgttgtacgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgtt-aagttgtaag 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 7982 - 8195
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7982 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaacatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 8081  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8082 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatga 8181  T
Q  203 tgctatgttgtgaa 216  Q
    ||||||||||||||    
T  8182 tgctatgttgtgaa 8195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 9828 - 10035
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9828 ggtgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 9927  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9928 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttattattaattatgctat 10027  T
Q  209 gttgtgaa 216  Q
    ||||||||    
T  10028 gttgtgaa 10035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11245 - 10975
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11245 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 11146  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11145 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgacatag-aaataatgttgttataccatcgaagtggttattattaatgttgctat 11048  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11047 gat-tcaagttgttgtatgttgctttctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7425 - 7155
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425 ggtgtttaagagtatcaaacctatgctgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 7326  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7325 gttgttgaataatttgagatacata-aattatgtgaatattgtatgatat-ggaaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctat 7228  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7227 gat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 7155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 579 - 849
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  579 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 678  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  679 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgacatag-aaataatgttgttataccatcgaagtggttattattaatgttgctat 776  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  777 gat-tcaagttgttgtatgttgctttctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 5882 - 6152
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882 ggtgtttaagagtatcaaacctatgctgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 5981  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5982 gttgttgaataatttgagatacata-aattatgtgaatattgtatgatat-ggaaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctat 6079  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6080 gat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 6152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 8900 - 9106
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  8900 actagggtgtttaagagtatttaaactataatgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttagatagtttgaaatacatatattatgtga 8999  T
Q  104 atgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgat 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9000 atgttgttgttgaataaattgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgat 9099  T
Q  204 gctatgt 210  Q
    |||||||    
T  9100 gctatgt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33776 - 33530
Alignment:
Q  33 gttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacat 132  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33776 gttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatacattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacat 33677  T
Q  133 atatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgct 232  Q
    ||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |    
T  33676 ata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgat 33580  T
Q  233 gtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33579 gtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 146180 - 145895
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146180 tgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 146082  T
Q  111 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 210  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |     
T  146081 tgttgattaatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctacgg 145984  T
Q  211 tgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    | | |||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  145983 t-tcaagttgttgtatgttgttgtcattgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 145895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 43 - 216
Target Start/End: Original strand, 9397 - 9567
Alignment:
Q  43 atctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9397 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt---gttgaataatttgagttacatatatttatgt 9493  T
Q  143 ggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494 ggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacctttcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 9567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23711 - 23517
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||    
T  23711 gaaaaggtatgatgtagaaaataatgttgttataccatttaagttgttatcattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctcaattgt 23612  T
Q  244 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23611 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttttaagttgttgtcgatg 23517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22508 - 22322
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22508 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 22409  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattatt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22408 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattatt 22322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 648 - 388
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  648 aagagtatttaacctattttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattttgtgaatgtt---gttg 552  T
Q  116 aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtga 215  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| | | |    
T  551 aataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatattgttataccatccaagtggttattattaatgtttctatgat-tca 455  T
Q  216 agttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  454 agttgttgtatattggtgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 281
Target Start/End: Original strand, 15156 - 15381
Alignment:
Q  54 tttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||    
T  15156 tttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtat 15254  T
Q  154 gatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattat 252  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  15255 gatatag-aaataatgtttttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgatgtctctgttgttattgattat 15352  T
Q  253 taaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353 taaatcattaagttgcatatgttggtcaa 15381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11609 - 11340
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11609 ggtgtttaagagtatttgacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtaaatatctttgctagataatttgaaatacatatattatatgaatgtt 11511  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  11510 gttgttgaataatttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaaatggttattattaatgttgctat 11413  T
Q  209 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | | | |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11412 ggt-tcaagttgttgtatgttgttgtctgtgctgttattgattgttaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 11340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3861 - 3768
Alignment:
Q  17 agagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3861 agagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttcgtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgt 3768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 281
Target Start/End: Original strand, 47280 - 47442
Alignment:
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47280 taatttgggttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaa-aatgttgttataccattcaagttgttataattaatgatgctatgttgtgaag 47378  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47379 ttgttgtatgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 47442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28589 - 28433
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg- 242  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| ||     
T  28589 gaaaatgtatgatacagaaactaatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgtgactatgctg-caagttgttttatgttgctatctctgctgt 28491  T
Q  243 tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 299  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  28490 tattgattattaacatcatttagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 28433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 78519 - 78322
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtga 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  78519 actaaggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaattgg-tttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtga 78421  T
Q  104 atgttgtt---gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaat 200  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  78420 atgttgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatggtatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaat 78323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 281
Target Start/End: Original strand, 10541 - 10787
Alignment:
Q  18 gagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaa 117  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10541 gagtatttaacctacgttgtgatggatctaattgg-tttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttattgaa 10639  T
Q  118 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||              | |  ||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  10640 taatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatg--------------atgcggttattattaatgttgctatgat-tgaag 10722  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10723 ttgttgtatgttgttgtctctgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29608 - 29442
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 29509  T
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29508 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 29442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30062 - 29894
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaa---t 105  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |    
T  30062 ggtgtttaagagtatctaacttatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataa-ttgaaatacatatattatgtgaatgtt 29964  T
Q  106 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29963 gttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 29894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7542
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7662 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgatgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttg 7564  T
Q  116 aataatttgagttacatatatt 137  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  7563 aataatttgaggtacgtatatt 7542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14293 - 14173
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14293 aagagtatttaacctatgttgtgatggatctaattgg-tttgatgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttg 14195  T
Q  116 aataatttgagttacatatatt 137  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    
T  14194 aataatttgaggtacgtatatt 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16630 - 16575
Alignment:
Q  82 ttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  16630 ttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgtggtacgtatatt 16575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18650 - 18595
Alignment:
Q  82 ttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  18650 ttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgtggtacgtatatt 18595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1196
Alignment:
Q  150 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  1326 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctgtgctgttattga 1229  T
Q  249 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1228 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1749 - 1653
Alignment:
Q  190 ttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1749 ttattattaatgatgctatgttgttaagttgttgtattttgctatctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 1653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1062
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1161 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 919 - 830
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  919 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 187107 - 187206
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  187107 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 187206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 187349 - 187438
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  187349 tgaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 187438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39547 - 39449
Alignment:
Q  11 tgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttg 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39547 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgttg 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 1069 - 1170
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1069 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 1168  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  1169 gt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 15188 - 15289
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15188 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 15287  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  15288 gt 15289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 24246 - 24347
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24246 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 24345  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  24346 gt 24347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25966 - 25865
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25966 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttttatgtaaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 25867  T
Q  109 gt 110  Q
    ||    
T  25866 gt 25865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 645 - 771
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  645 ttgttggataatttgagatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 742  T
Q  210 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  743 ttg-gaagttgttttatgttgctctctctg 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 5949 - 6075
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  5949 ttgttggataatttgagatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 6046  T
Q  210 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6047 ttg-gaagttgttttatgttgctctctctg 6075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 584 - 679
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaa 104  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  584 ggtgtttaagagaatttaatctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgagtatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaa 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 5888 - 5983
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaa 104  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5888 ggtgtttaagagaatttaatctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgagtatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaa 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 168879 - 168786
Alignment:
Q  17 agagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  168879 agagtatttaacttatgttgtgatggttctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgttaatattgt 168786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 212
Target Start/End: Original strand, 34097 - 34201
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34097 tgttgttggttaatttgagttacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgct 34195  T
Q  207 atgttg 212  Q
    ||||||    
T  34196 atgttg 34201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20958 - 20821
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg 242  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||| |||| ||    
T  20958 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgc-aagatgtt-tatgttgttgtttctgctg 20861  T
Q  243 t-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20860 ttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 20821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 6956 - 6862
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6956 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 6862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6902 - 6840
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  6902 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 6840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6966 - 6807
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6966 tgttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcatttgagttgttattattaatgttgct 6868  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  6867 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 7116 - 7207
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7116 aagagtatttaacctatgttgtgataaatctcatttggattgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgt 7207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21092 - 21001
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21092 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 21001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21041 - 20979
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21041 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 20979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21511 - 21422
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21511 aagagtatttaacatgtgttgtaatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaat 21422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Original strand, 5938 - 6029
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5938 agtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 6029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3380 - 3224
Alignment:
Q  109 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 207  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  3380 gttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataacattcaagttgttattgttaatattgcta 3282  T
Q  208 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagt 265  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  3281 tgttg-caagttgtt-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagt 3224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Original strand, 13274 - 13357
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattat 99  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13274 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattat 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 120353 - 120270
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattat 99  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  120353 aagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattat 120270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 562 - 411
Alignment:
Q  119 aatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  562 aatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aag 465  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 269  Q
    ||||| ||||||| |||||||  || || |||||||||| |||| |||||||||    
T  464 ttgttttatgttgttgtctctactgttactgattattaatatcactaagttgca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8817 - 8666
Alignment:
Q  119 aatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 217  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  8817 aatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aag 8720  T
Q  218 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 269  Q
    ||||| ||||||| |||||||  || || |||||||||| |||| |||||||||    
T  8719 ttgttttatgttgttgtctctactgttactgattattaatatcactaagttgca 8666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3708 - 3619
Alignment:
Q  21 tatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3708 tatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 3619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 281
Target Start/End: Original strand, 127500 - 127674
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 205  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |  |      
T  127500 ttgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttg 127598  T
Q  206 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtcaa 281  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  127599 tatgttg-caagttgttg-atgttgctatctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaa 127674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 27750 - 27683
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27750 ggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatccaatttggtttgacgtgaatatctttgttgg 27683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27488 - 27435
Alignment:
Q  285 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27488 gttaaagttgtaagttgttgtcaatgtagttaaagttgtaagttgttatcgatg 27435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 456 - 297
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  456 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgct 358  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  357 atgttg-caagttgct-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11022 - 10863
Alignment:
Q  108 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 206  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11022 tgttgttggttaatttgagttacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatatatgatattgttctttatatcattcaagttgttattattaatgtttct 10924  T
Q  207 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||| |||||    
T  10923 atgttg-caagttg-tctatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattgagttg 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 370 - 502
Alignment:
Q  136 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 234  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  370 tttatgtgaaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgt 467  T
Q  235 ctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  468 ctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 76
Target Start/End: Original strand, 62581 - 62639
Alignment:
Q  18 gagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  62581 gagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 62639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 66357 - 66196
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 205  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  66357 ttgttgttggttaatttgagatacatatatg-atgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattaaagttgttattattaatgttgt 66260  T
Q  206 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 269  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  66259 tatgttg-caagttgttg-atgttgttgtctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 66196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1475
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1535 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6225 - 6123
Alignment:
Q  136 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  6225 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttgt 6128  T
Q  235 ctctg 239  Q
    |||||    
T  6127 ctctg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8377 - 8275
Alignment:
Q  136 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  8377 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttgt 8280  T
Q  235 ctctg 239  Q
    |||||    
T  8279 ctctg 8275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 66641 - 66701
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  66641 aagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 66701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 59669 - 59585
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  59669 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg 59585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 10153 - 10094
Alignment:
Q  17 agagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10153 agagtatttaacctatgttgtggtggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttgg 10094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 4616 - 4685
Alignment:
Q  229 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  4616 tgctgtctctgctgtattgattaataaatcattaagttgcttatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 4685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 14662 - 14731
Alignment:
Q  229 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 298  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  14662 tgctgtctctgctgtactgattaataaatcattaagttgcttatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 14731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 16584 - 16639
Alignment:
Q  21 tatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16584 tatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgg 16639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Original strand, 18732 - 18795
Alignment:
Q  13 ttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  18732 ttaaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttaacgtaaatatctttgttgg 18795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Original strand, 36118 - 36185
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  36118 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaactttgtttgacgtgaatatctttgttgg 36185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 40958 - 41090
Alignment:
Q  136 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | |||||||||||    
T  40958 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatgttg-caagttgct-tatgttgctgt 41055  T
Q  235 ctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    | ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41056 cactgctgttgttgattattaatatcattaagttg 41090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 5066
Alignment:
Q  136 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5143 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8375 - 8244
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  8375 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 8278  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
     ||| || | ||||||||||| |||| |||||||    
T  8277 cctgctgttgttgattattaatatcaataagttg 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 1350 - 1290
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  1350 aagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 267
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1394
Alignment:
Q  150 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattg 247  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || | |||    
T  1276 gtatgatatataaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgt-aagttgct-tatgttgctgtctctactgttgttg 1373  T
Q  248 attattaa-atcattaagttg 267  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  1374 attattaatatcattaagttg 1394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 11955 - 12015
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11955 aagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttgg 12015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 28970 - 29030
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28970 ggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 9505 - 9445
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9505 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16381 - 16325
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16381 aagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 16325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2088
Alignment:
Q  138 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2013 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2026 - 1970
Alignment:
Q  282 gttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2026 gttgttaaagttgtaagttgtcgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21183 - 21123
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21183 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgagtctaatttggtttgacgtgaatatct 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 143056 - 142996
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  143056 aagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 142996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7967 - 7904
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7967 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 7904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7695 - 7576
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  7695 tgaatgttgttgttgaataattcgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaa 7598  T
Q  200 tgatgctatgttgtgaagttgtt 222  Q
    || || |||| || |||||||||    
T  7597 tgttgttatgatg-gaagttgtt 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5167 - 5104
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5167 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 5104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2003 - 1951
Alignment:
Q  20 gtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  2003 gtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 1951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1743 - 1654
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  1743 tgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ctatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgtt 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4896 - 4860
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4896 tgaatgttgttgttgattaatttgagatacatatatt 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 7383 - 7446
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7383 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaatatctttg 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5726 - 5657
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5726 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatataattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 830 - 764
Alignment:
Q  156 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  830 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgctgctatgttgt-aagttgttg 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 127144 - 127252
Alignment:
Q  128 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 227  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  127144 tacatatatt-atgtggaaa-ggtatgatagggaaaataatgttattatatcatccaagttgttgttattaaagttgctatgttg-caagctgttttatg 127240  T
Q  228 ttgctgtctctg 239  Q
    ||| ||||||||    
T  127241 ttgttgtctctg 127252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 2724 - 2824
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  2724 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgtttatatcattcaagttgttatttttaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 2821  T
Q  236 tct 238  Q
    |||    
T  2822 tct 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7573 - 7523
Alignment:
Q  19 agtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatct 69  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7573 agtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 7523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Original strand, 3123 - 3181
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatat 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  3123 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatat 3181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3024 - 2893
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 235  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  3024 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattactatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 2927  T
Q  236 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  2926 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 2893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 434 - 390
Alignment:
Q  61 tgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaat 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  434 tgaatatctttgttggataatttgaaatacttatattatgtgaat 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Original strand, 1549 - 1613
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1549 ttatgtggaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 143 - 237
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  143 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 6053
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6117 ttatgtggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 6053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 625
Alignment:
Q  101 tgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  714 tgaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 665
Alignment:
Q  70 ttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  705 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 7455 - 7518
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7455 ggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 7518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 34715 - 34652
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  34715 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgagtatctttg 34652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Original strand, 53378 - 53471
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 239  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  53378 gaaaatgtatgatatggaaattattatttttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 53471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 201
Target Start/End: Original strand, 136323 - 136416
Alignment:
Q  107 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatg 201  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  136323 ttgtagttggataatttgagatacatatatt-atgtgaaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttattaatg 136416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 267
Target Start/End: Original strand, 12260 - 12375
Alignment:
Q  153 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgatt 250  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||| ||| || | ||||||    
T  12260 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtccctgctgttgttgatt 12357  T
Q  251 attaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12358 attaatatcattaagttg 12375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 148
Target Start/End: Original strand, 63835 - 63873
Alignment:
Q  110 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  63835 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaa 63873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4033 - 3984
Alignment:
Q  61 tgaatatctttgttggctaatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 110  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4033 tgaatattgttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgt 3984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8373 - 8304
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8373 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 7198 - 7258
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  7198 aagagtatttaacctacgtggtgatggatctaatttggtttcatgtgaatatccttgttgg 7258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 2443 - 2503
Alignment:
Q  16 aagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttgg 76  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  2443 aagagtatttaacctaaatggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 2503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 196
Target Start/End: Original strand, 2652 - 2727
Alignment:
Q  121 tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 196  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  2652 tttgagatacatatatt-atgtggaaattgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaaatcgttattat 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18894 - 18843
Alignment:
Q  286 ttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18894 ttaaagttgtaagttgttatcaatgtcgttaaa-ttgtaagttgttgtcgatg 18843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3196 - 3120
Alignment:
Q  137 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3196 ttatggggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 3120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16067 - 16004
Alignment:
Q  150 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16067 gtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 16004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18615 - 18552
Alignment:
Q  9 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaatttgatttgacgtgaatatctttg 72  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  18615 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatgaatctatctcggtttgacgtgaatatctttg 18552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 338
Target Start/End: Original strand, 10066 - 10100
Alignment:
Q  304 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10066 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 10100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 19387 - 19456
Alignment:
Q  144 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 212  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  19387 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttg 19456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4243 - 4210
Alignment:
Q  305 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4243 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10365 - 10332
Alignment:
Q  305 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 338  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10365 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 10332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 22388 - 22432
Alignment:
Q  4 actatggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaa 48  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22388 actagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgaaggatctaa 22432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 267
Target Start/End: Original strand, 159723 - 159817
Alignment:
Q  173 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  159723 ttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgctgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 159817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University