View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9401_low_106 (Length: 245)

Name: NF9401_low_106
Description: NF9401
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9401_low_106
NF9401_low_106
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (1-232)||(27187721-27187952)
chr6 (1-232)||(27261288-27261519)
chr6 (1-230)||(2874570-2874799)
chr6 (1-230)||(25112837-25113066)
chr6 (1-230)||(24312935-24313164)
chr6 (1-232)||(1542849-1543080)
chr6 (1-230)||(5838986-5839215)
chr6 (1-230)||(16626484-16626713)
chr6 (1-230)||(29591687-29591916)
chr6 (1-209)||(17032668-17032876)
chr6 (1-232)||(28262962-28263193)
chr6 (1-232)||(28292137-28292368)
chr6 (1-232)||(28341711-28341942)
chr6 (1-227)||(19864972-19865198)
chr6 (1-218)||(25609640-25609857)
chr6 (1-221)||(18407718-18407938)
chr6 (1-221)||(27331209-27331429)
chr6 (1-221)||(27391949-27392169)
chr6 (1-209)||(22078478-22078686)
chr6 (1-225)||(22434154-22434378)
chr6 (1-221)||(16927416-16927636)
chr6 (1-221)||(22762231-22762451)
chr6 (1-221)||(23078754-23078974)
chr6 (1-209)||(16963155-16963363)
chr6 (5-221)||(15896383-15896599)
chr6 (1-221)||(19879583-19879803)
chr6 (1-221)||(25768476-25768696)
chr6 (1-156)||(1641057-1641212)
chr6 (4-221)||(34645362-34645579)
chr6 (1-221)||(14381243-14381463)
chr6 (1-221)||(17415771-17415991)
chr6 (1-221)||(19453705-19453925)
chr6 (1-221)||(21563908-21564128)
chr6 (2-221)||(21569767-21569986)
chr6 (1-221)||(5296982-5297201)
chr6 (1-221)||(21471886-21472106)
chr6 (1-221)||(22796408-22796628)
chr6 (115-230)||(21836964-21837079)
chr6 (1-218)||(24364697-24364914)
chr6 (1-225)||(11280277-11280501)
chr6 (68-221)||(8762709-8762862)
chr6 (130-221)||(20637077-20637168)
chr6 (1-220)||(27559765-27559984)
chr6 (1-220)||(27560394-27560613)
chr6 (1-220)||(28282590-28282809)
chr6 (115-221)||(18197504-18197610)
chr6 (1-221)||(18794975-18795195)
chr6 (1-218)||(15459621-15459838)
chr6 (1-221)||(10468625-10468845)
chr6 (159-225)||(22442710-22442776)
chr6 (19-209)||(16382161-16382351)
chr6 (39-209)||(23996571-23996741)
chr6 (19-209)||(18837696-18837886)
chr6 (106-191)||(23027522-23027607)
chr6 (82-209)||(16098416-16098543)
chr6 (88-209)||(21927577-21927698)
chr6 (89-209)||(1648602-1648722)
chr6 (19-167)||(14625068-14625216)
chr6 (67-209)||(25742876-25743018)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-232)||(10868902-10869133)
chr2 (1-232)||(9610188-9610419)
chr2 (1-232)||(16982204-16982435)
chr2 (1-232)||(16999052-16999283)
chr2 (1-232)||(17063769-17064000)
chr2 (1-232)||(17067427-17067658)
chr2 (1-230)||(24710085-24710314)
chr2 (1-230)||(27371321-27371550)
chr2 (1-230)||(44385731-44385960)
chr2 (1-232)||(27218068-27218299)
chr2 (1-230)||(24262422-24262651)
chr2 (1-230)||(41608547-41608776)
chr2 (1-221)||(23189059-23189279)
chr2 (1-230)||(22325018-22325247)
chr2 (1-227)||(21325431-21325657)
chr2 (1-227)||(24707647-24707873)
chr2 (1-227)||(24675541-24675767)
chr2 (1-227)||(22756630-22756856)
chr2 (1-221)||(30211088-30211308)
chr2 (4-232)||(21145201-21145418)
chr2 (1-218)||(23064129-23064346)
chr2 (5-221)||(45529567-45529783)
chr2 (70-232)||(16923010-16923172)
chr2 (68-232)||(16925479-16925643)
chr2 (75-230)||(20442675-20442830)
chr2 (63-230)||(24876911-24877078)
chr2 (1-202)||(24825472-24825673)
chr2 (1-221)||(27365250-27365470)
chr2 (1-221)||(23294010-23294230)
chr2 (1-221)||(19652223-19652443)
chr2 (40-218)||(21125331-21125509)
chr2 (1-218)||(20828311-20828528)
chr2 (1-218)||(20833037-20833254)
chr2 (1-221)||(23276828-23277048)
chr2 (1-221)||(24948641-24948861)
chr2 (1-218)||(31830710-31830927)
chr2 (1-220)||(12574405-12574624)
chr2 (1-220)||(27787793-27788012)
chr2 (1-209)||(11358057-11358265)
chr2 (1-218)||(1063803-1064020)
chr2 (133-221)||(23107901-23107989)
chr2 (106-221)||(23110892-23111007)
chr2 (67-221)||(24641860-24642014)
chr2 (1-67)||(16925312-16925378)
chr2 (1-68)||(24878319-24878386)
chr2 (1-110)||(23087502-23087611)
chr2 (60-209)||(25128758-25128907)
chr2 (19-209)||(24569851-24570041)
chr2 (19-209)||(22276349-22276538)
chr2 (78-154)||(23817291-23817367)
chr2 (67-209)||(22761752-22761894)
chr2 (39-209)||(24831370-24831540)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-232)||(8386833-8387064)
chr4 (1-232)||(29038764-29038995)
chr4 (1-232)||(12477021-12477252)
chr4 (1-232)||(12524097-12524328)
chr4 (1-230)||(14303340-14303569)
chr4 (1-230)||(18297626-18297855)
chr4 (1-230)||(27711757-27711986)
chr4 (1-230)||(8052985-8053214)
chr4 (1-230)||(40473461-40473690)
chr4 (1-232)||(14680988-14681219)
chr4 (1-228)||(19778157-19778384)
chr4 (1-227)||(15147249-15147475)
chr4 (1-227)||(16251810-16252036)
chr4 (1-221)||(16354816-16355036)
chr4 (11-230)||(23956178-23956397)
chr4 (1-230)||(18226808-18227037)
chr4 (1-221)||(8706339-8706559)
chr4 (1-224)||(1639793-1640016)
chr4 (1-224)||(7090853-7091076)
chr4 (1-221)||(14850737-14850957)
chr4 (31-221)||(14691353-14691543)
chr4 (1-221)||(15414657-15414877)
chr4 (1-123)||(14266368-14266490)
chr4 (1-221)||(15078056-15078276)
chr4 (1-221)||(1648908-1649128)
chr4 (1-221)||(15246345-15246565)
chr4 (1-218)||(3264428-3264645)
chr4 (1-218)||(29453171-29453388)
chr4 (1-221)||(15002995-15003215)
chr4 (80-221)||(14159970-14160111)
chr4 (70-221)||(15319641-15319792)
chr4 (1-218)||(11206865-11207082)
chr4 (68-221)||(33223411-33223564)
chr4 (1-221)||(15358721-15358941)
chr4 (1-221)||(27900807-27901027)
chr4 (2-218)||(44661500-44661716)
chr4 (1-221)||(20891403-20891623)
chr4 (1-125)||(16146333-16146459)
chr4 (19-209)||(14997755-14997945)
chr4 (39-167)||(13248104-13248232)
chr4 (78-218)||(18549694-18549834)
chr4 (67-209)||(9291322-9291464)
chr4 (82-121)||(15423974-15424013)
chr4 (19-167)||(12342548-12342696)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-232)||(15589251-15589482)
chr3 (1-232)||(20061913-20062144)
chr3 (1-232)||(16635813-16636044)
chr3 (1-232)||(43163137-43163368)
chr3 (1-232)||(48425487-48425718)
chr3 (1-221)||(53384888-53385108)
chr3 (1-232)||(10005640-10005871)
chr3 (1-232)||(10906250-10906481)
chr3 (1-232)||(16756444-16756675)
chr3 (1-230)||(15348106-15348335)
chr3 (5-227)||(16371457-16371679)
chr3 (1-230)||(12498288-12498517)
chr3 (1-230)||(14876360-14876589)
chr3 (1-230)||(16806787-16807016)
chr3 (1-230)||(13252730-13252959)
chr3 (1-227)||(15061796-15062022)
chr3 (1-230)||(5424791-5425020)
chr3 (1-230)||(15402371-15402600)
chr3 (1-230)||(15724795-15725024)
chr3 (1-230)||(16412143-16412372)
chr3 (1-230)||(26792260-26792489)
chr3 (1-221)||(14126464-14126684)
chr3 (1-227)||(11564545-11564771)
chr3 (1-230)||(15339309-15339538)
chr3 (1-230)||(16692200-16692433)
chr3 (1-232)||(6600787-6601007)
chr3 (1-221)||(9522759-9522979)
chr3 (1-221)||(17489890-17490110)
chr3 (1-221)||(16492051-16492271)
chr3 (1-221)||(15248187-15248407)
chr3 (1-221)||(15208931-15209151)
chr3 (1-221)||(15227699-15227919)
chr3 (1-213)||(15015634-15015834)
chr3 (1-221)||(13971979-13972199)
chr3 (1-221)||(14086723-14086943)
chr3 (1-221)||(15952827-15953047)
chr3 (1-221)||(11303632-11303852)
chr3 (1-221)||(14573979-14574199)
chr3 (1-218)||(28754368-28754585)
chr3 (1-221)||(12850138-12850358)
chr3 (1-221)||(13322511-13322731)
chr3 (1-221)||(17492680-17492900)
chr3 (1-220)||(16836370-16836589)
chr3 (1-220)||(44777297-44777516)
chr3 (1-218)||(13942074-13942291)
chr3 (1-220)||(8758942-8759161)
chr3 (1-220)||(41177572-41177791)
chr3 (1-218)||(47123994-47124211)
chr3 (1-221)||(12360401-12360621)
chr3 (67-221)||(16828061-16828215)
chr3 (1-218)||(10384019-10384235)
chr3 (5-220)||(16380788-16381003)
chr3 (1-215)||(4678488-4678702)
chr3 (1-218)||(10419907-10420124)
chr3 (1-211)||(18134215-18134425)
chr3 (1-221)||(16329520-16329738)
chr3 (1-221)||(16338371-16338591)
chr3 (1-122)||(11960992-11961113)
chr3 (1-113)||(13001959-13002070)
chr3 (1-125)||(26008948-26009072)
chr3 (19-208)||(15576818-15577007)
chr3 (19-209)||(8274281-8274471)
chr3 (60-209)||(16742585-16742734)
chr3 (19-202)||(18748733-18748916)
chr3 (60-209)||(6152733-6152882)
chr3 (39-209)||(13967222-13967392)
chr3 (82-176)||(17193224-17193318)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-232)||(109434-109665)
scaffold0029 (1-221)||(95636-95856)
scaffold0029 (1-221)||(113011-113231)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (1-232)||(8199038-8199269)
chr7 (1-232)||(10871405-10871636)
chr7 (1-232)||(44790980-44791211)
chr7 (1-230)||(16947-17176)
chr7 (1-230)||(9596467-9596696)
chr7 (1-230)||(11236844-11237073)
chr7 (1-232)||(18178152-18178383)
chr7 (1-230)||(13686474-13686703)
chr7 (1-230)||(15160688-15160917)
chr7 (1-230)||(18551389-18551618)
chr7 (1-230)||(8708015-8708244)
chr7 (1-230)||(14332807-14333036)
chr7 (1-232)||(12687911-12688142)
chr7 (1-232)||(11552731-11552962)
chr7 (1-232)||(14955030-14955261)
chr7 (1-224)||(15154294-15154517)
chr7 (1-221)||(14040106-14040326)
chr7 (1-221)||(14350136-14350356)
chr7 (1-221)||(15624962-15625182)
chr7 (1-221)||(11771881-11772101)
chr7 (1-221)||(21662371-21662591)
chr7 (1-221)||(12206418-12206638)
chr7 (1-221)||(15102221-15102441)
chr7 (106-232)||(23203242-23203368)
chr7 (106-232)||(23509369-23509495)
chr7 (1-218)||(8211749-8211966)
chr7 (1-221)||(16071912-16072132)
chr7 (5-221)||(13021772-13021988)
chr7 (1-221)||(14263862-14264082)
chr7 (1-218)||(11305884-11306101)
chr7 (1-221)||(6413922-6414142)
chr7 (1-221)||(11388046-11388266)
chr7 (1-221)||(14285994-14286214)
chr7 (1-220)||(18053572-18053791)
chr7 (1-218)||(49152712-49152929)
chr7 (1-221)||(1025-1245)
chr7 (1-221)||(13665948-13666168)
chr7 (1-220)||(14130284-14130503)
chr7 (19-221)||(16950089-16950291)
chr7 (1-220)||(14434102-14434321)
chr7 (1-218)||(23505491-23505708)
chr7 (1-221)||(12456113-12456333)
chr7 (1-110)||(23516520-23516629)
chr7 (1-221)||(19147622-19147842)
chr7 (1-221)||(20747021-20747241)
chr7 (1-218)||(13968289-13968506)
chr7 (1-101)||(15204289-15204389)
chr7 (1-220)||(15340842-15341061)
chr7 (1-218)||(26118226-26118443)
chr7 (1-164)||(23199418-23199581)
chr7 (19-209)||(4440356-4440546)
chr7 (20-209)||(21674185-21674374)
chr7 (39-209)||(14936795-14936965)
chr7 (39-209)||(15364388-15364558)
chr7 (1-109)||(12457190-12457298)
chr7 (1-65)||(35964646-35964710)
chr7 (19-209)||(7824328-7824518)
chr7 (19-209)||(27107426-27107616)
chr7 (88-209)||(17924148-17924269)
chr7 (94-202)||(23641951-23642059)
chr7 (39-167)||(45147003-45147131)
chr7 (61-183)||(15171642-15171764)
chr7 (138-217)||(40790-40869)
chr7 (127-185)||(17144936-17144994)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (1-232)||(34566847-34567078)
chr5 (1-230)||(37291300-37291529)
chr5 (1-232)||(16356855-16357086)
chr5 (1-230)||(19770313-19770542)
chr5 (1-230)||(27685204-27685433)
chr5 (1-232)||(27518760-27518991)
chr5 (1-230)||(22332691-22332920)
chr5 (1-230)||(27668294-27668523)
chr5 (1-230)||(40709133-40709362)
chr5 (1-230)||(14999543-14999772)
chr5 (1-230)||(18776123-18776352)
chr5 (1-230)||(22135021-22135250)
chr5 (1-230)||(27610707-27610936)
chr5 (1-230)||(41771195-41771424)
chr5 (1-209)||(29475898-29476106)
chr5 (1-227)||(23574095-23574321)
chr5 (1-230)||(22348776-22349005)
chr5 (5-209)||(23516898-23517102)
chr5 (1-202)||(20799113-20799314)
chr5 (1-221)||(21339099-21339319)
chr5 (1-189)||(23440578-23440766)
chr5 (1-218)||(25423542-25423759)
chr5 (1-221)||(21497850-21498069)
chr5 (1-221)||(20467909-20468129)
chr5 (1-221)||(23471582-23471802)
chr5 (1-221)||(21563786-21564006)
chr5 (1-221)||(22235733-22235953)
chr5 (1-218)||(14886807-14887024)
chr5 (1-218)||(24716342-24716559)
chr5 (1-221)||(26738540-26738738)
chr5 (1-218)||(22503014-22503231)
chr5 (1-218)||(24620111-24620328)
chr5 (5-221)||(21890572-21890788)
chr5 (1-218)||(24749370-24749587)
chr5 (75-221)||(21831574-21831720)
chr5 (1-221)||(22381534-22381754)
chr5 (1-218)||(25848410-25848627)
chr5 (1-218)||(20342617-20342834)
chr5 (1-194)||(37545336-37545529)
chr5 (1-221)||(20821788-20822008)
chr5 (1-185)||(22462287-22462471)
chr5 (1-221)||(23079902-23080122)
chr5 (1-221)||(28916226-28916446)
chr5 (1-221)||(28923581-28923801)
chr5 (1-218)||(24798213-24798430)
chr5 (1-221)||(21496493-21496713)
chr5 (1-143)||(919-1061)
chr5 (107-221)||(21407597-21407711)
chr5 (1-209)||(20774095-20774302)
chr5 (1-111)||(21405175-21405285)
chr5 (1-91)||(21984248-21984338)
chr5 (1-221)||(28894755-28894975)
chr5 (1-220)||(17269148-17269366)
chr5 (61-209)||(25244175-25244323)
chr5 (61-209)||(25308327-25308475)
chr5 (19-209)||(21937013-21937203)
chr5 (39-209)||(27011457-27011627)
chr5 (1-55)||(21831722-21831776)
chr5 (39-209)||(24581584-24581753)
chr5 (61-122)||(16065604-16065665)
chr5 (60-176)||(23503837-23503952)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-230)||(14812-15041)
scaffold0044 (1-230)||(1072-1301)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-230)||(16350293-16350522)
chr1 (1-230)||(19106803-19107032)
chr1 (1-230)||(51333187-51333416)
chr1 (1-230)||(21837386-21837615)
chr1 (1-230)||(33390723-33390952)
chr1 (1-230)||(17044709-17044938)
chr1 (1-230)||(21830739-21830968)
chr1 (1-221)||(21749377-21749597)
chr1 (5-230)||(16078350-16078571)
chr1 (1-191)||(41354202-41354392)
chr1 (1-221)||(16369733-16369953)
chr1 (1-209)||(50619959-50620167)
chr1 (1-221)||(22361947-22362167)
chr1 (1-221)||(19760569-19760789)
chr1 (1-221)||(24099306-24099526)
chr1 (1-218)||(19854749-19854966)
chr1 (1-218)||(37677516-37677733)
chr1 (1-223)||(22432817-22433039)
chr1 (1-217)||(20939770-20939986)
chr1 (67-221)||(19662844-19662998)
chr1 (1-218)||(31539703-31539920)
chr1 (96-221)||(20139361-20139486)
chr1 (1-209)||(20856476-20856684)
chr1 (1-151)||(41308261-41308411)
chr1 (1-221)||(20835591-20835811)
chr1 (1-103)||(20137214-20137316)
chr1 (1-218)||(20294848-20295065)
chr1 (139-209)||(20250376-20250446)
chr1 (1-93)||(20250286-20250378)
chr1 (19-209)||(20831107-20831297)
chr1 (60-209)||(22135272-22135421)
chr1 (184-229)||(41353357-41353402)
chr1 (67-209)||(20914712-20914854)
chr1 (67-176)||(20184683-20184792)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-230)||(866-1095)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (1-230)||(17893-18122)
scaffold0106 (1-221)||(14491-14711)
scaffold0106 (1-221)||(31862-32082)
scaffold0106 (153-221)||(18489-18557)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (1-230)||(19113177-19113406)
chr8 (1-230)||(30313209-30313438)
chr8 (1-228)||(17674090-17674317)
chr8 (1-230)||(18857064-18857293)
chr8 (1-230)||(32600631-32600860)
chr8 (1-209)||(22133127-22133335)
chr8 (1-211)||(15533867-15534077)
chr8 (1-230)||(22046860-22047089)
chr8 (1-209)||(16408131-16408339)
chr8 (1-227)||(21166606-21166831)
chr8 (1-230)||(22120239-22120468)
chr8 (1-230)||(22040346-22040575)
chr8 (1-221)||(21921809-21922029)
chr8 (1-230)||(19978454-19978683)
chr8 (1-209)||(22164278-22164485)
chr8 (1-191)||(19484974-19485164)
chr8 (1-180)||(20017865-20018044)
chr8 (1-221)||(21251428-21251648)
chr8 (1-221)||(23650528-23650748)
chr8 (1-221)||(22377528-22377748)
chr8 (1-221)||(22383703-22383923)
chr8 (1-221)||(21393939-21394159)
chr8 (1-221)||(21788433-21788653)
chr8 (1-209)||(20388586-20388794)
chr8 (1-219)||(23949406-23949624)
chr8 (1-221)||(22987688-22987903)
chr8 (1-221)||(20396199-20396419)
chr8 (1-221)||(31416548-31416768)
chr8 (1-221)||(20975725-20975945)
chr8 (1-218)||(14565629-14565846)
chr8 (1-218)||(16271301-16271518)
chr8 (1-221)||(1266725-1266945)
chr8 (1-220)||(22051350-22051569)
chr8 (1-218)||(803750-803967)
chr8 (1-218)||(12305245-12305462)
chr8 (1-218)||(27355035-27355252)
chr8 (1-209)||(19851898-19852106)
chr8 (1-209)||(19857934-19858142)
chr8 (1-221)||(23655414-23655634)
chr8 (1-218)||(6604145-6604362)
chr8 (1-218)||(6679598-6679815)
chr8 (1-221)||(22061507-22061727)
chr8 (1-221)||(22371427-22371647)
chr8 (4-221)||(29303500-29303717)
chr8 (1-221)||(21840904-21841124)
chr8 (1-221)||(20009974-20010194)
chr8 (103-230)||(22129005-22129132)
chr8 (1-220)||(31570917-31571136)
chr8 (19-209)||(21850423-21850613)
chr8 (19-209)||(16877181-16877371)
chr8 (184-229)||(19484130-19484175)
chr8 (60-209)||(23900822-23900971)
chr8 (30-209)||(23157098-23157277)
chr8 (97-223)||(19863639-19863765)
chr8 (97-223)||(19868276-19868402)
chr8 (19-209)||(21196588-21196778)
chr8 (67-209)||(22315744-22315886)
chr8 (39-209)||(22982959-22983128)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (4-230)||(12942-13168)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-232)||(43606-43837)
scaffold0028 (1-230)||(15399-15617)
scaffold0028 (1-230)||(8937-9155)
scaffold0028 (1-221)||(50148-50368)
scaffold0028 (67-202)||(106226-106361)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-230)||(4030-4259)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-230)||(9048-9277)
scaffold0109 (1-230)||(33198-33427)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-230)||(8242-8471)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-230)||(7849-8078)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (1-227)||(4727-4953)
scaffold0761 (19-209)||(32-222)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-230)||(7391-7620)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-227)||(451-677)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (5-230)||(22323-22548)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-227)||(278458-278684)
scaffold0005 (1-220)||(260760-260979)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-230)||(65857-66086)
scaffold0042 (1-209)||(39466-39673)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (1-221)||(6824-7044)
scaffold0403 (1-216)||(3243-3458)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (5-227)||(63659-63881)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-227)||(197106-197332)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-226)||(6466-6691)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-221)||(19636-19856)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-221)||(148-368)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-227)||(3442-3668)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-221)||(16107-16327)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-221)||(6475-6695)
scaffold0120 (1-221)||(1158-1378)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (1-221)||(130600-130820)
scaffold0023 (1-224)||(4085-4308)
scaffold0023 (1-221)||(59206-59426)
scaffold0023 (71-227)||(29008-29163)
scaffold0023 (1-35)||(134694-134728)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-221)||(390834-391054)
scaffold0001 (1-221)||(90566-90786)
scaffold0001 (1-164)||(114632-114795)
scaffold0001 (136-221)||(89888-89973)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-221)||(5673-5893)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-230)||(7829-8047)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (11-221)||(49955-50165)
scaffold0081 (68-227)||(19121-19280)
scaffold0081 (127-227)||(34604-34704)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-209)||(6501-6709)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-223)||(1128-1350)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (39-221)||(25464-25646)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-221)||(113121-113341)
scaffold0040 (5-221)||(15333-15549)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-221)||(203102-203322)
scaffold0004 (1-221)||(112473-112693)
scaffold0004 (1-221)||(118020-118240)
scaffold0004 (1-221)||(386271-386491)
scaffold0004 (1-221)||(323156-323376)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (5-221)||(219051-219267)
scaffold0012 (5-221)||(229499-229715)
scaffold0012 (61-185)||(32667-32791)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-217)||(2373-2589)
scaffold0010 (1-218)||(41970-42187)
scaffold0010 (1-221)||(47033-47253)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (12-221)||(9806-10015)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-221)||(7963-8182)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-221)||(9422-9642)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-221)||(16050-16270)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-221)||(26167-26387)
scaffold0011 (1-221)||(195338-195557)
scaffold0011 (1-217)||(149022-149238)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-224)||(24702-24925)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (30-221)||(80128-80319)
scaffold0022 (1-143)||(126911-127053)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-221)||(14713-14933)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-217)||(4483-4699)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (5-221)||(328-544)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-221)||(25353-25573)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-221)||(116539-116759)
scaffold0037 (19-146)||(98485-98612)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (3-221)||(5225-5443)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-209)||(1451-1659)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-221)||(18839-19059)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-221)||(1360-1580)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-221)||(32387-32606)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (1-221)||(6871-7091)
scaffold0149 (1-221)||(11302-11522)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-221)||(3592-3812)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-227)||(180669-180877)
scaffold0020 (1-221)||(101186-101406)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (1-221)||(1717-1937)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-221)||(40190-40410)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (1-221)||(2509-2729)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-221)||(27677-27897)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-221)||(28402-28622)
scaffold0064 (1-221)||(40393-40613)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-221)||(33311-33531)
scaffold0076 (19-209)||(40728-40918)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (70-221)||(1988-2139)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (89-221)||(2914-3046)
scaffold0894 (1-98)||(1591-1688)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-221)||(20435-20655)
scaffold0298 (1-221)||(12995-13215)
scaffold0298 (1-221)||(16765-16985)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-221)||(43235-43455)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-221)||(249065-249285)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-199)||(12633-12831)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (1-221)||(4327-4547)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-221)||(321-541)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (1-221)||(11221-11441)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-221)||(6670-6890)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-221)||(10245-10465)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-221)||(47576-47796)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (1-221)||(48841-49061)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-221)||(19572-19792)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-221)||(51497-51717)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (67-220)||(844-997)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-170)||(10425-10594)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-221)||(41371-41589)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-218)||(16350-16567)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-221)||(2246-2466)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-221)||(5202-5422)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-221)||(6872-7092)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-221)||(6636-6856)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (1-221)||(18171-18391)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-221)||(5086-5306)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-221)||(51814-52033)
scaffold0067 (1-221)||(60848-61067)
scaffold0067 (1-221)||(67236-67455)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-221)||(13535-13755)
scaffold0034 (1-221)||(4587-4807)
scaffold0034 (76-221)||(67897-68042)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (1-208)||(4945-5152)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (1-209)||(1618-1826)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (1-221)||(26976-27196)
scaffold0192 (19-221)||(26612-26814)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (1-217)||(787-1003)
scaffold0139 (1-191)||(27971-28161)
scaffold0139 (67-191)||(34290-34414)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (1-221)||(43957-44177)
scaffold0114 (1-221)||(44969-45189)
scaffold0114 (1-164)||(20574-20737)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-101)||(46680-46780)
scaffold0007 (1-211)||(86154-86358)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (25-220)||(12420-12615)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (67-221)||(38-192)
scaffold0124 (1-221)||(11340-11560)
scaffold0124 (19-209)||(7456-7646)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (1-218)||(2992-3209)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (1-145)||(123-267)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (1-221)||(21305-21525)
scaffold0235 (39-167)||(26296-26424)
scaffold0235 (148-221)||(11091-11164)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-221)||(48668-48887)
scaffold0053 (1-161)||(57511-57671)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-221)||(5969-6191)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-208)||(37654-37861)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (115-221)||(12060-12166)
scaffold0483 (1-156)||(9782-9937)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (3-221)||(4884-5102)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-221)||(550-770)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-221)||(980-1200)
scaffold0104 (154-221)||(12582-12649)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-209)||(19301-19509)
scaffold0090 (1-209)||(23463-23671)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-221)||(3203-3423)
scaffold0035 (97-218)||(12833-12954)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (103-221)||(4425-4543)
scaffold0270 (103-221)||(11555-11673)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (1-221)||(5665-5885)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-209)||(25511-25719)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (19-221)||(68225-68427)
scaffold0066 (19-209)||(46624-46814)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-221)||(26713-26933)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (67-182)||(17877-17992)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (136-221)||(39645-39730)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-209)||(880-1088)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (5-221)||(32953-33169)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (148-221)||(8721-8794)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (148-227)||(24097-24176)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (94-217)||(81470-81593)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (1-183)||(341-523)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (19-209)||(3521-3711)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (60-202)||(11167-11309)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (19-209)||(23864-24054)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-112)||(13994-14105)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (67-209)||(5693-5835)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (19-209)||(9507-9697)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (39-209)||(18541-18711)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (60-209)||(7679-7828)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (94-209)||(33059-33174)
scaffold0021 (115-209)||(24529-24623)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (39-209)||(13398-13568)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (82-209)||(700-827)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (30-209)||(3565-3744)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (19-209)||(3629-3818)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (67-209)||(24398-24540)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (82-209)||(14670-14798)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (30-209)||(44019-44198)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (30-209)||(27912-28091)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (148-221)||(2187-2260)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (136-221)||(470-555)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (106-202)||(19-115)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (39-167)||(1112-1240)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 27187721 - 27187952
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27187721 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 27187820  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187821 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 27187920  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27187921 aacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27187952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27261519 - 27261288
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27261519 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 27261420  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261419 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 27261320  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27261319 aacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27261288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2874799 - 2874570
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874799 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 2874700  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2874699 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 2874600  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  2874599 aacaccatgcaagttcacaatctccttgat 2874570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 25112837 - 25113066
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25112837 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 25112936  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112937 aggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 25113036  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25113037 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 25113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24313164 - 24312935
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24313164 tgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 24313065  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24313064 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 24312965  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24312964 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24312935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1543080 - 1542849
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1543080 tgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 1542981  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1542980 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 1542881  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  1542880 aacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 1542849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5839215 - 5838986
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839215 tgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 5839116  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5839115 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaagg 5839016  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5839015 aacaccatgcaacttcacaatttccttgat 5838986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16626713 - 16626484
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16626713 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 16626614  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16626613 acgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 16626514  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16626513 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16626484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29591916 - 29591687
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29591916 tgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 29591817  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29591816 acgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 29591717  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
     |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  29591716 gacaccatgcaacttcacaatctccttgat 29591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17032668 - 17032876
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17032668 tgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgat 17032767  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032768 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 17032867  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  17032868 aacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28263193 - 28262962
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28263193 tgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgat 28263094  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263093 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 28262994  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28262993 aacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28262962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28292368 - 28292137
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28292368 tgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgat 28292269  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292268 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 28292169  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  28292168 aacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 28292137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28341942 - 28341711
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28341942 tgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgat 28341843  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341842 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 28341743  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28341742 aacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28341711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 19864972 - 19865198
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864972 tgactagcccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatgat 19865071  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19865072 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtagg 19865171  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19865172 aacaccatgaaacttcacaatctcctt 19865198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25609857 - 25609640
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25609857 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 25609758  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25609757 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaagg 25609658  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  25609657 aacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18407938 - 18407718
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18407938 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatgat 18407839  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18407838 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 18407739  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  18407738 aacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27331429 - 27331209
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27331429 tgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgat 27331330  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27331329 acgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaag 27331230  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  27331229 aacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27392169 - 27391949
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27392169 tgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgat 27392070  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27392069 acgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaag 27391970  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  27391969 aacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22078686 - 22078478
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22078686 tgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaaatcttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgat 22078587  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22078586 acgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaagg 22078487  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  22078486 aacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22434154 - 22434378
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22434154 tgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctctccgactaatcatctgtctgcggatgat 22434253  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434254 acgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 22434353  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcc 225  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||    
T  22434354 aacaccatgcaacttcactatttcc 22434378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16927636 - 16927416
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927636 tgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 16927537  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16927536 acgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaagg 16927437  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    || |||||| | |||||||||    
T  16927436 aataccatgcaacttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22762451 - 22762231
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  22762451 tgactatctcaagttcctccttcctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgat 22762352  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22762351 acgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 22762252  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22762251 aacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23078754 - 23078974
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23078754 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtattccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacgat 23078853  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||  | || |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078854 acgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 23078953  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  23078954 aacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16963363 - 16963155
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963363 tgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaattctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 16963264  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16963263 acgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaagg 16963164  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  16963163 aacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19879583 - 19879803
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19879583 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgat 19879682  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19879683 aagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 19879782  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  19879783 aacaccatgcaacttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25768476 - 25768696
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25768476 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttagcaaatcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgat 25768575  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  25768576 aagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatactcgatgg 25768675  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  25768676 aactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 1641057 - 1641212
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1641057 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 1641156  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 156  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1641157 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34645579 - 34645362
Alignment:
Q  4 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 103  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34645579 ctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataag 34645480  T
Q  104 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 203  Q
    | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  34645479 ctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttggatccctatctgatacaatactcgacggaac 34645380  T
Q  204 accatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||| | |||||||||    
T  34645379 accatgcaacttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14381463 - 14381243
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14381463 tgactgtcccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 14381364  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  14381363 aagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacgg 14381264  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || |||||||||||||||||    
T  14381263 tactccatgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17415771 - 17415991
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415771 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgat 17415870  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  17415871 aagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 17415970  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  17415971 tacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19453705 - 19453925
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453705 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 19453804  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  19453805 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacgg 19453904  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19453905 tacaccatgtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21564128 - 21563908
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564128 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 21564029  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |    
T  21564028 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccg 21563929  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  21563928 tacaccatgaagcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  2 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  102 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 201  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  202 acaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5297201 - 5296982
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5297201 tgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 5297103  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  5297102 aagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 5297003  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5297002 aactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21471886 - 21472106
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  || |||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21471886 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaagtcctctaatgactgaatagttctctcccactgaccatctgtttgcggatgat 21471985  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  21471986 aagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 21472085  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  21472086 aactccatgaaacttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22796628 - 22796408
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  22796628 tgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctgacgattgaatcgttctctccgactgaccatatgtttgcgaatgat 22796529  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  22796528 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 22796429  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  22796428 aactccatgcaacttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836964
Alignment:
Q  115 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  215 tcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21836979 tcacaatctccttgat 21836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 24364697 - 24364914
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24364697 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 24364796  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  24364797 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacgg 24364896  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  24364897 aacaccatgaagtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11280501 - 11280277
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  11280501 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcattgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggt 11280402  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  11280401 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgatgt 11280302  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcc 225  Q
    || |||||| | |||||||||||||    
T  11280301 aataccatgcaacttcacaatttcc 11280277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  68 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  168 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  130 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27559984 - 27559765
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27559984 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27559885  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  27559884 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 27559785  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27559784 aactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27560613 - 27560394
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27560613 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27560514  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  27560513 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 27560414  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27560413 aactccatgtagcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28282809 - 28282590
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28282809 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 28282710  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  28282709 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 28282610  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  28282609 aactccatgtagcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  115 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  215 tcacaat 221  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 18794975 - 18795195
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18794975 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgattgaccatccgtatgaggatgat 18795074  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  18795075 aagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatctgacacagtactcgacgg 18795174  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  18795175 aacaccatgcatcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15459621 - 15459838
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15459621 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgat 15459720  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  |||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  15459721 aagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacgg 15459820  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  15459821 aacaccatgcaacttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10468845 - 10468625
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10468845 tgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 10468746  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  10468745 aagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 10468646  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  10468645 tacaccgtgcagcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 225
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442776
Alignment:
Q  159 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22442776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16382351 - 16382161
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  16382351 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 16382252  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382251 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 23996571 - 23996741
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  23996571 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 23996670  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996671 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18837886 - 18837696
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  18837886 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactca 18837787  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837786 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  106 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 191  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 16098416 - 16098543
Alignment:
Q  82 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 181  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  16098416 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 16098515  T
Q  182 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098516 ctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  88 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 187  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  188 caatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  89 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 188  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  189 aatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25743018 - 25742876
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  25743018 gtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaa 25742919  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    | ||  |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742918 acctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10868902 - 10869133
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10868902 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 10869001  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869002 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 10869101  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10869102 aacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10869133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 9610188 - 9610419
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9610188 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 9610287  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610288 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 9610387  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  9610388 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 9610419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16982204 - 16982435
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16982204 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 16982303  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982304 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16982403  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16982404 aacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16982435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16999052 - 16999283
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16999052 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 16999151  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999152 atgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16999251  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16999252 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17063769 - 17064000
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17063769 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 17063868  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063869 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 17063968  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17063969 aacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17064000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17067427 - 17067658
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17067427 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 17067526  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067527 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 17067626  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17067627 aacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24710085 - 24710314
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24710085 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 24710184  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24710185 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaagg 24710284  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24710285 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24710314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27371321 - 27371550
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27371321 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgat 27371420  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27371421 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 27371520  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27371521 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27371550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44385960 - 44385731
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44385960 tgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgat 44385861  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385860 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 44385761  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  44385760 aacaccatgcaacttcacaatccccttgat 44385731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 27218068 - 27218299
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27218068 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatgat 27218167  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218168 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 27218267  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27218268 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27218299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24262422 - 24262651
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  24262422 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgat 24262521  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24262522 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 24262621  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24262622 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24262651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41608776 - 41608547
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41608776 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgat 41608677  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41608676 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaagg 41608577  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  41608576 aacaccatgcaacttcacaatccccttgat 41608547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23189059 - 23189279
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23189059 tgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaatcctctagcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgat 23189158  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189159 aagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 23189258  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  23189259 aacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22325247 - 22325018
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22325247 tgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 22325148  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22325147 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 22325048  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22325047 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22325018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21325657 - 21325431
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325657 tgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 21325558  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  21325557 acgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgacag 21325458  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  21325457 aacaccatgcaacttcacaatttcctt 21325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24707873 - 24707647
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707873 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaatcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 24707774  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707773 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 24707674  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24707673 aacaccatgcaacttcataatttcctt 24707647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 24675541 - 24675767
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675541 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaatcctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 24675640  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24675641 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaag 24675740  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24675741 aacaccatgcaacttcacaatctcctt 24675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22756856 - 22756630
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22756856 tgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatgat 22756757  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756756 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 22756657  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22756656 aacaccatgcaacttcacaatctcctt 22756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30211308 - 30211088
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30211308 tgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgat 30211209  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  30211208 acaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatgg 30211109  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30211108 aacaccatgtagcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21145418 - 21145201
Alignment:
Q  4 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  21145418 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat-----------cctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacg 21145330  T
Q  104 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21145329 ccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaac 21145230  T
Q  204 accatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  21145229 accatgcaacttcacaatctccttaatgt 21145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 23064129 - 23064346
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064129 tgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 23064228  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23064229 aagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaagg 23064328  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  23064329 aacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 45529567 - 45529783
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45529567 tatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgc 45529666  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  45529667 cgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatgcaaca 45529766  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  45529767 ccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923172
Alignment:
Q  70 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  170 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16923172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925643
Alignment:
Q  68 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  168 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16925643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442675
Alignment:
Q  75 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  175 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaatctccttgat 20442675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876911
Alignment:
Q  63 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  163 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24876911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24825673 - 24825472
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24825673 tgactatcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatgat 24825574  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825573 acgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 24825474  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  24825473 aa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27365470 - 27365250
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27365470 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27365371  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27365370 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 27365271  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  27365270 aacaccatgcaacttcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23294010 - 23294230
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23294010 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaaccctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 23294109  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  23294110 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 23294209  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  23294210 tacaccatgtagcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19652443 - 19652223
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19652443 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 19652344  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  19652343 aagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccttatccgacacaatactcgacgg 19652244  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || |||| || |||||||||    
T  19652243 tactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  40 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 139  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  140 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20828311 - 20828528
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20828311 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20828410  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20828411 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 20828510  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  20828511 aacaccatgaagtttcac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20833037 - 20833254
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20833037 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20833136  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20833137 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 20833236  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  20833237 aacaccatgaagtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23276828 - 23277048
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | ||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23276828 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 23276927  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  23276928 aagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacgg 23277027  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  23277028 tacaccatgcagcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 24948641 - 24948861
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24948641 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 24948740  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  24948741 aagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacgg 24948840  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  24948841 tacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31830710 - 31830927
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31830710 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 31830809  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  31830810 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 31830909  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  31830910 aacaccatgaagtttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12574405 - 12574624
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12574405 tgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 12574504  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12574505 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaagg 12574604  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  12574605 aactccatgtagcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27787793 - 27788012
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27787793 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27787892  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  27787893 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 27787992  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27787993 aactccatgtagcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11358265 - 11358057
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11358265 tgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 11358166  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||    
T  11358165 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacgg 11358066  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  11358065 aacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 1063803 - 1064020
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1063803 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 1063902  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  1063903 aagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactagacgg 1064002  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  1064003 aacaccatgaagtttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  133 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  106 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 205  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  206 catgtagcttcacaat 221  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 16925312 - 16925378
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925312 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 24878386 - 24878319
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24878386 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 23087502 - 23087611
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23087502 tgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgccgatgat 23087601  T
Q  101 atgccgaact 110  Q
    | || |||||    
T  23087602 aagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Original strand, 25128758 - 25128907
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| ||||||||   ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||    
T  25128758 ctgaatagtcctctctatctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaactta 25128857  T
Q  160 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128858 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24570041 - 24569851
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  24570041 ccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccatcggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctca 24569942  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569941 acttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 22276349 - 22276538
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  22276349 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatcagtctggggatggtaagcagaactcaatctca 22276448  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22276449 acttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gacacaatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23817367 - 23817291
Alignment:
Q  78 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 154  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817367 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22761894 - 22761752
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  22761894 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 22761795  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761794 acctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24831540 - 24831370
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   ||    
T  24831540 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagct 24831441  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831440 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8386833 - 8387064
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8386833 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 8386932  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386933 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 8387032  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8387033 aacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 8387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29038995 - 29038764
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29038995 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 29038896  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038895 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 29038796  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  29038795 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 29038764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12477021 - 12477252
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12477021 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 12477120  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477121 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 12477220  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  12477221 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 12477252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12524097 - 12524328
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12524097 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 12524196  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524197 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 12524296  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12524297 aacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 12524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14303569 - 14303340
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14303569 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgat 14303470  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303469 atgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 14303370  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  14303369 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 14303340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18297626 - 18297855
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18297626 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 18297725  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297726 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 18297825  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18297826 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18297855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27711757 - 27711986
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27711757 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgat 27711856  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27711857 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 27711956  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27711957 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27711986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8053214 - 8052985
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8053214 tgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 8053115  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8053114 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 8053015  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8053014 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8052985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40473461 - 40473690
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40473461 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 40473560  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40473561 acgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 40473660  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  40473661 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 40473690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 14680988 - 14681219
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14680988 tgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 14681087  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14681088 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaagg 14681187  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    || |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  14681188 aataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 14681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19778384 - 19778157
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19778384 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 19778285  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19778284 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 19778185  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttg 228  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  19778184 aacaccatgcaacttcacaatctccttg 19778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15147475 - 15147249
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147475 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 15147376  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147375 acgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 15147276  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  15147275 aacaccatgcaacttcacaatttcctt 15147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16252036 - 16251810
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16252036 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatgat 16251937  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251936 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16251837  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16251836 aacaccatgtaacctcacaatctcctt 16251810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16355036 - 16354816
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16355036 tgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgat 16354937  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16354936 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaagg 16354837  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  16354836 aacaccatgaaacttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 23956178 - 23956397
Alignment:
Q  11 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23956178 aagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaact 23956277  T
Q  111 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 210  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23956278 taatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgc 23956377  T
Q  211 agcttcacaatttccttgat 230  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  23956378 aacttcacaatctccttgat 23956397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18227037 - 18226808
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18227037 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatgat 18226938  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18226937 aagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaagg 18226838  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
     |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18226837 cacaccatgtaacctcacaatctccttgat 18226808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 8706339 - 8706559
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8706339 tgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 8706438  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8706439 aagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacgg 8706538  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  8706539 aacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1640016 - 1639793
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1640016 tgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgat 1639917  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1639916 acgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaagg 1639817  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttc 224  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  1639816 aacaccatgcaacttcacaatttc 1639793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 7090853 - 7091076
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7090853 tgactatcccaagttcctccttgctaaagaacccaaaccctcaacaaatcttctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgat 7090952  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7090953 atgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 7091052  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttc 224  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  7091053 aacaccatgcaacttcacaatttc 7091076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14850957 - 14850737
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14850957 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 14850858  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14850857 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaagg 14850758  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  14850757 aacaccatgtaacttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  31 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 130  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  131 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15414877 - 15414657
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  15414877 tgactatcccaaactccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcatctaacgattgaatcgttctctccgactggctatctgtttgcggatgat 15414778  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||    
T  15414777 aagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatacttgacgg 15414678  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15414677 aacaccatgcagcttcacaat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14266490 - 14266368
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14266490 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatgat 14266391  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttc 123  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  14266390 acgccgaactcaatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15078056 - 15078276
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15078056 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctcttcgactgaccatttgtttgcggatgat 15078155  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  15078156 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 15078255  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  15078256 aaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1649128 - 1648908
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1649128 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 1649029  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  1649028 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 1648929  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  1648928 tacaccatgaagcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15246345 - 15246565
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15246345 tgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaatcctctaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctggggatgat 15246444  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| |     
T  15246445 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgatacaatactcgacga 15246544  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  15246545 aactccatgtaacttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3264645 - 3264428
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3264645 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 3264546  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  3264545 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 3264446  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  3264445 aacaccatgaagtttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29453388 - 29453171
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29453388 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 29453289  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  29453288 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 29453189  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  29453188 aacaccatgaagtttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15003215 - 15002995
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15003215 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacgcttagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 15003116  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||    
T  15003115 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacgg 15003016  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  15003015 aactccatgcaacttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  80 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 179  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  180 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  70 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  170 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11207082 - 11206865
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11207082 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 11206983  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  11206982 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacgg 11206883  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  11206882 aacaccatgaagcttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 33223411 - 33223564
Alignment:
Q  68 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  33223411 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaa 33223510  T
Q  168 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33223511 cctcggatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15358941 - 15358721
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15358941 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctctctgaggatgat 15358842  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  15358841 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 15358742  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  15358741 tacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 27900807 - 27901027
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27900807 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatcctctaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgat 27900906  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| || || || ||||| ||    
T  27900907 aagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacgg 27901006  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  27901007 aacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44661716 - 44661500
Alignment:
Q  2 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 101  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  44661716 gactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtttgaggatgata 44661617  T
Q  102 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 201  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  44661616 agccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgga 44661517  T
Q  202 acaccatgtagcttcac 218  Q
    |||||||| || |||||    
T  44661516 acaccatgaagtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20891403 - 20891623
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20891403 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 20891502  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  20891503 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctttatccgacacaatacttgacgg 20891602  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| || | |||||||||    
T  20891603 tacaccgtgcaacttcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 16146333 - 16146459
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc--aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 98  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||  |  |||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16146333 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcttagtaaatcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatg 16146432  T
Q  99 atatgccgaactcaatctcaacttcga 125  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16146433 ataagccgaactcaaccccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 14997755 - 14997945
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14997755 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14997854  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997855 actttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 13248104 - 13248232
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  13248104 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 13248203  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    |||||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  13248204 tgcaaactctcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  78 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 177  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  178 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Original strand, 9291322 - 9291464
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  9291322 gtcctctccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 9291421  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291422 acctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  82 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 121  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12342696 - 12342548
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||||||  ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || |    
T  12342696 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcaaaactctgaatattcctctccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaacctta 12342597  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  12342596 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15589482 - 15589251
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15589482 tgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 15589383  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589382 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 15589283  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15589282 aacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 15589251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20062144 - 20061913
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20062144 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 20062045  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20062044 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaagg 20061945  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20061944 aacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 20061913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16635813 - 16636044
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16635813 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 16635912  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635913 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16636012  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16636013 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43163137 - 43163368
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43163137 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 43163236  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163237 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 43163336  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  43163337 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 43163368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 48425487 - 48425718
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48425487 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 48425586  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425587 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 48425686  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  48425687 aacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 48425718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53385108 - 53384888
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  53385108 tgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgat 53385009  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385008 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 53384909  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  53384908 aacaccatgcagcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10005640 - 10005871
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10005640 tgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 10005739  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005740 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 10005839  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10005840 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10906250 - 10906481
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10906250 tgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 10906349  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906350 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 10906449  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10906450 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10906481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16756675 - 16756444
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16756675 tgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgat 16756576  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756575 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16756476  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16756475 aacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 16756444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15348335 - 15348106
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15348335 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 15348236  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15348235 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 15348136  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  15348135 aacaccatgcaacttcataatctccttgat 15348106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 16371457 - 16371679
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16371457 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgc 16371556  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371557 cgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 16371656  T
Q  205 ccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  16371657 ccatgcagcttcacaatttcctt 16371679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12498288 - 12498517
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12498288 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 12498387  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12498388 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaagg 12498487  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  12498488 aacaccatgcaacttcacaatctctttgat 12498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14876589 - 14876360
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876589 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 14876490  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876489 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 14876390  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  14876389 aacaccatgcaatctcacaatctccttgat 14876360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16807016 - 16806787
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807016 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 16806917  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16806916 aagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16806817  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  16806816 aacaccatgtaacctcacgatctccttgat 16806787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 13252730 - 13252959
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13252730 tgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 13252829  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13252830 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 13252929  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13252930 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13252959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15061796 - 15062022
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15061796 tgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcgtatgat 15061895  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061896 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 15061995  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15061996 aacaccatgcagcttcacaatttcctt 15062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5425020 - 5424791
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5425020 tgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 5424921  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5424920 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 5424821  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  5424820 aacaccatgcaactttacaatctccttgat 5424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15402600 - 15402371
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  15402600 tgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatgat 15402501  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15402500 acgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaggg 15402401  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15402400 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15725024 - 15724795
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15725024 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgat 15724925  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  15724924 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaagg 15724825  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  15724824 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 15724795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16412372 - 16412143
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  16412372 tgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttgat 16412273  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16412272 actccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 16412173  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16412172 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16412143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26792489 - 26792260
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  26792489 tgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgat 26792390  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26792389 acgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaagg 26792290  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26792289 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 26792260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14126684 - 14126464
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14126684 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgat 14126585  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14126584 aagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 14126485  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  14126484 aacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11564771 - 11564545
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11564771 tgactatcccaagttcctcctttctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatgat 11564672  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564671 acgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 11564572  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11564571 aacaccatgtaacttcacaatctcctt 11564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15339309 - 15339538
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  15339309 tgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatgat 15339408  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15339409 acgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaggg 15339508  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15339509 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15339538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16692200 - 16692433
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16692200 tgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgat 16692299  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcct----cttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 196  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16692300 aagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcg 16692399  T
Q  197 aaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  16692400 aaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgat 16692433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 6600787 - 6601007
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6600787 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 6600875  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600876 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 6600975  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6600976 aacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 6601007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9522759 - 9522979
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522759 tgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 9522858  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522859 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 9522958  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  9522959 aacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17489890 - 17490110
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489890 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacagatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 17489989  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17489990 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaagg 17490089  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  17490090 aacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16492271 - 16492051
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16492271 tgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 16492172  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16492171 acaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 16492072  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  16492071 aacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15248187 - 15248407
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15248187 tgactatcccaagttcctccttgctcaattacacaaactctcaacaaatcctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatgat 15248286  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15248287 acgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaagg 15248386  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  15248387 aacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15208931 - 15209151
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15208931 tgactatcccaagttcctccttgctcaaatacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatgat 15209030  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  15209031 acgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaagg 15209130  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  15209131 aacaccatgcaacttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15227699 - 15227919
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15227699 tgactatcccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaattgtttgcggatgat 15227798  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15227799 aagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgatacaatactcgatgg 15227898  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  15227899 aacaccatgcagcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15015834 - 15015634
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||            ||||||||    
T  15015834 tgactatcccaagttccgccttgctcaagtacacaaattctcaacaagtcctccaacgtctgaattgtcctctccgactg------------cggatgat 15015747  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15015746 atgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacgg 15015647  T
Q  201 aacaccatgtagc 213  Q
    |||||||||||||    
T  15015646 aacaccatgtagc 15015634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13972199 - 13971979
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13972199 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgat 13972100  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13972099 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 13972000  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  13971999 aacaccatgcaacttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14086723 - 14086943
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14086723 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 14086822  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14086823 aagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 14086922  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  14086923 aacaccatgcaacttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15953047 - 15952827
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15953047 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaactcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatatgtttgcggatgat 15952948  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  15952947 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 15952848  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  15952847 aactccatgtaacttcacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11303852 - 11303632
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11303852 tgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 11303753  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  11303752 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 11303653  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11303652 tacaccatgtagcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14573979 - 14574199
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14573979 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgat 14574078  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| ||||| |     
T  14574079 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatactcgacga 14574178  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  14574179 aactccatgtaacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28754368 - 28754585
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28754368 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 28754467  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  28754468 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatctgacacaatactagacgg 28754567  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28754568 aacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12850358 - 12850138
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12850358 tgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctacggattat 12850259  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||||| || ||    
T  12850258 aagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgcttgatgg 12850159  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  12850158 gacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13322731 - 13322511
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13322731 tgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaatcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13322632  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  13322631 aagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctcagatccctatctgacacaatactcgacgg 13322532  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13322531 tacaccatgtagcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 17492680 - 17492900
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17492680 tgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 17492779  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||  | | | ||    
T  17492780 aagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgaaacaacacacaacgg 17492879  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  17492880 aacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16836589 - 16836370
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16836589 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaacaaatcctccaaggattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 16836490  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  16836489 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatccgatgcaatactcgacgg 16836390  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  16836389 aactccatgaagcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 44777297 - 44777516
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44777297 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 44777396  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  44777397 aagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 44777496  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44777497 aacaccatgtagcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 13942074 - 13942291
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13942074 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13942173  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  13942174 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 13942273  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13942274 aactccatgtagcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8759161 - 8758942
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8759161 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 8759062  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  8759061 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 8758962  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  8758961 aactccatgtagcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 41177572 - 41177791
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41177572 tgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 41177671  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  41177672 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 41177771  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  41177772 aactccatgtagcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 47123994 - 47124211
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47123994 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 47124093  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  47124094 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 47124193  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  47124194 aacaccatgaagtttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12360621 - 12360401
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360621 tgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaatcctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 12360522  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | ||    
T  12360521 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactctacgg 12360422  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  12360421 tacaccatgtagcttcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 10384019 - 10384235
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10384019 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 10384118  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  10384119 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact-aacgg 10384217  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  10384218 aacaccatgaagcttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16381003 - 16380788
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  16381003 tatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccatctgtctgagaatgataagc 16380904  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||| || ||||||||     
T  16380903 cgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccgacacaatacttgaaggaact 16380804  T
Q  205 ccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  16380803 ccatgtagcttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4678488 - 4678702
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4678488 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 4678587  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4678588 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 4678687  T
Q  201 aacaccatgtagctt 215  Q
    ||| |||||||||||    
T  4678688 aactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10420124 - 10419907
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10420124 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgat 10420025  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  10420024 aagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacgg 10419925  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  10419924 aacaccatgcaacttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18134425 - 18134215
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18134425 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgat 18134326  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  18134325 aagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 18134226  T
Q  201 aacaccatgta 211  Q
     ||||||||||    
T  18134225 tacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16329738 - 16329520
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  16329738 tgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactaaccatctgtttgaggatgat 16329641  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  16329640 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 16329541  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16329540 tacaccgtgcagcttcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11961113 - 11960992
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11961113 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgat 11961014  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaactt 122  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  11961013 aagccgaactcaacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 13001959 - 13002070
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  13001959 tgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactctcatcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtgat 13002057  T
Q  101 atgccgaactcaa 113  Q
    | |||||||||||    
T  13002058 aagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26009072 - 26008948
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26009072 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 26008973  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcga 125  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||    
T  26008972 aagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 15576818 - 15577007
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  15576818 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 15576917  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 208  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  15576918 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8274471 - 8274281
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  8274471 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 8274372  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274371 acttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16742734 - 16742585
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  16742734 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 16742635  T
Q  160 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742634 gaagtaaacctgggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 18748733 - 18748916
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  18748733 ccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctca 18748832  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||   |||||| ||||| || |||||||    
T  18748833 atttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  160 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  82 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 176  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 109665 - 109434
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  109665 tgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 109566  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  109565 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaagg 109466  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  109465 aacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 95856 - 95636
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  95856 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctttccgactgaccatcagtctgcggatgat 95757  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  95756 aagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacgg 95657  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  95656 aacaccatgcaacttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 113011 - 113231
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||||||| ||| ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  113011 tgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacagatcttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgat 113110  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  113111 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacgg 113210  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  113211 aacaccatgcagcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 8199038 - 8199269
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8199038 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 8199137  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199138 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 8199237  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  8199238 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 8199269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10871405 - 10871636
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10871405 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 10871504  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871505 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 10871604  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    || |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10871605 aataccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10871636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44791211 - 44790980
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44791211 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 44791112  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791111 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 44791012  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  44791011 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 44790980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17176 - 16947
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17176 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgat 17077  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17076 aagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16977  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16976 aacaccatgtagcctcacaatctccttgat 16947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9596467 - 9596696
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596467 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 9596566  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596567 aagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 9596666  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
     |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9596667 gacaccatgtaacctcacaatctccttgat 9596696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11237073 - 11236844
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237073 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 11236974  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11236973 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 11236874  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  11236873 aacaccatgcaacctcacaatctccttgat 11236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 18178152 - 18178383
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18178152 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacagatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 18178251  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18178252 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaagg 18178351  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18178352 aacaccatgtagcttcacaatctccttgatgt 18178383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 13686474 - 13686703
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13686474 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 13686573  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13686574 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 13686673  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13686674 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13686703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15160917 - 15160688
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15160917 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 15160818  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15160817 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 15160718  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15160717 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18551618 - 18551389
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18551618 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 18551519  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18551518 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 18551419  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18551418 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18551389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 8708015 - 8708244
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8708015 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 8708114  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8708115 acgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 8708214  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8708215 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8708244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14332807 - 14333036
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14332807 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 14332906  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14332907 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 14333006  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14333007 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14333036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12687911 - 12688142
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12687911 tgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 12688010  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12688011 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaagg 12688110  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    || |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  12688111 aataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 12688142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11552962 - 11552731
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  11552962 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacggatcctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgat 11552863  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552862 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 11552763  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  11552762 aacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 11552731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 14955030 - 14955261
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14955030 tgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 14955129  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14955130 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaagg 14955229  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    || |||||| | | ||||||| ||||| ||||    
T  14955230 aataccatgcaacgtcacaatctccttaatgt 14955261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15154517 - 15154294
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154517 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 15154418  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15154417 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaagg 15154318  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  15154317 aacaccatgtaacttcacaatttc 15154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14040106 - 14040326
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14040106 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 14040205  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040206 acgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 14040305  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  14040306 aacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14350136 - 14350356
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14350136 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 14350235  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14350236 acgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 14350335  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  14350336 aacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15624962 - 15625182
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15624962 tgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttctttccgactgaccatctgtttgcggatgat 15625061  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  15625062 acgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcgg 15625161  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15625162 aacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11772101 - 11771881
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11772101 tgactatcccaagtttctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgat 11772002  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11772001 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 11771902  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  11771901 aacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21662371 - 21662591
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21662371 tgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgat 21662470  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
T  21662471 acgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatgg 21662570  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  21662571 aacaccatgtaacttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12206638 - 12206418
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12206638 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 12206539  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||    
T  12206538 aagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttggatctctatccaacacaatactcgacgg 12206439  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  12206438 aacaccatgcagcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15102441 - 15102221
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15102441 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 15102342  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  15102341 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatattcgatgg 15102242  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  15102241 taaaccatgtagcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203242
Alignment:
Q  106 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  206 catgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23203242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509369
Alignment:
Q  106 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  206 catgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8211966 - 8211749
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8211966 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 8211867  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  8211866 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacgg 8211767  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  8211766 aacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16072132 - 16071912
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16072132 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgat 16072033  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16072032 aagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 16071933  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  16071932 aactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 13021772 - 13021988
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  13021772 tatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagc 13021871  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  13021872 cgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtaca 13021971  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    || || |||||||||||    
T  13021972 ccgtgcagcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14264082 - 14263862
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14264082 tgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaatcctctaacgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 14263983  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||    
T  14263982 aagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatttctatccgacacaatactcgatgg 14263883  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  14263882 aacaccatgcaacttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11306101 - 11305884
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11306101 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgat 11306002  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  11306001 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 11305902  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  11305901 aacaccatgaagtttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6413922 - 6414142
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6413922 tgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccttctgtctgaggatgat 6414021  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  6414022 aagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgacgg 6414121  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6414122 tacaccatgtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11388266 - 11388046
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11388266 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 11388167  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  11388166 aagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 11388067  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  11388066 aacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14286214 - 14285994
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14286214 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgat 14286115  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14286114 aagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 14286015  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  14286014 tacaccatgtagcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18053791 - 18053572
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18053791 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 18053692  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18053691 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatactcgaagg 18053592  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18053591 aactccatgtagcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 49152712 - 49152929
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  49152712 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 49152811  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  49152812 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 49152911  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  49152912 aacaccatgaagcttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1245 - 1025
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1245 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttttccgactaaccatctgtctgaggatgat 1146  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  1145 aagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttgtatccctatccgacacaatactcgacgg 1046  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || |||||||||||||||||    
T  1045 tactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 13665948 - 13666168
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13665948 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgat 13666047  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |     
T  13666048 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacga 13666147  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13666148 tacaccatgtagcttcacaat 13666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14130284 - 14130503
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14130284 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 14130383  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  14130384 aagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaagg 14130483  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  14130484 aactccatgtagcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16950291 - 16950089
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  16950291 ccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctca 16950192  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||||||    
T  16950191 acttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcac 16950092  T
Q  219 aat 221  Q
    |||    
T  16950091 aat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14434102 - 14434321
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14434102 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 14434201  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  14434202 aagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaagg 14434301  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  14434302 aactccatgtagcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23505708 - 23505491
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23505708 tgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 23505609  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  23505608 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacacgaagg 23505509  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  23505508 aactccatgtagcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 12456113 - 12456333
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12456113 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaattcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgat 12456212  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  12456213 aagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 12456312  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  12456313 tacaccgtgtagcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23516629 - 23516520
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23516629 tgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatgctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatgat 23516530  T
Q  101 atgccgaact 110  Q
    | ||||||||    
T  23516529 acgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19147622 - 19147842
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19147622 tgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 19147721  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19147722 aagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatgg 19147821  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  19147822 aactccatgcaacttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20747021 - 20747241
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20747021 tgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 20747120  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20747121 aagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatgg 20747220  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  20747221 aactccatgcaacttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13968506 - 13968289
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13968506 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 13968407  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  13968406 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 13968307  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
     |||||||| ||||||||    
T  13968306 tacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 15204289 - 15204389
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204289 tgactattccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 15204388  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  15204389 a 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 15340842 - 15341061
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |   | |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15340842 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaattatttgatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgat 15340941  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  15340942 aagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaagg 15341041  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  15341042 aactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26118443 - 26118226
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26118443 tgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 26118344  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||    
T  26118343 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccgg 26118244  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  26118243 aacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23199581 - 23199418
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23199581 tgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 23199482  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 164  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23199481 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 4440356 - 4440546
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  4440356 ccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctca 4440455  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440456 acttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21674374 - 21674185
Alignment:
Q  20 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 119  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||    
T  21674374 cttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaa 21674275  T
Q  120 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674274 cttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 14936795 - 14936965
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  14936795 tctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagct 14936894  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  14936895 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 15364388 - 15364558
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  15364388 tctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagct 15364487  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  15364488 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 12457190 - 12457298
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| ||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12457190 tgactatctcaagttccaccttgctcaagcacagacactctcaataaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 12457289  T
Q  101 atgccgaac 109  Q
    | |||||||    
T  12457290 aagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 35964710 - 35964646
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35964710 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 7824328 - 7824518
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  7824328 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 7824427  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7824428 acttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27107616 - 27107426
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  27107616 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 27107517  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27107516 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  88 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 187  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  188 caatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  94 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 193  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  194 tcgaaggaa 202  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 45147003 - 45147131
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  ||    
T  45147003 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagct 45147102  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147103 tgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  61 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 160  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  161 aagtaaatcttggatctctatct 183  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40869 - 40790
Alignment:
Q  138 ttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 217  Q
    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40869 ttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  127 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 185  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 34566847 - 34567078
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34566847 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 34566946  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566947 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 34567046  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  34567047 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 34567078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37291529 - 37291300
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291529 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 37291430  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37291429 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 37291330  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  37291329 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 37291300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16356855 - 16357086
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16356855 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 16356954  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16356955 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaagg 16357054  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16357055 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16357086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19770313 - 19770542
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19770313 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 19770412  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19770413 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 19770512  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19770513 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19770542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27685433 - 27685204
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27685433 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 27685334  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27685333 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 27685234  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27685233 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27685204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 27518760 - 27518991
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27518760 tgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 27518859  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518860 acgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 27518959  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27518960 aacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27518991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22332920 - 22332691
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22332920 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatgat 22332821  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22332820 atgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 22332721  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22332720 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22332691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27668523 - 27668294
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27668523 tgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 27668424  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27668423 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 27668324  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27668323 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27668294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40709133 - 40709362
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40709133 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 40709232  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40709233 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 40709332  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  40709333 aacaccatgcaacttaacaatctccttgat 40709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14999772 - 14999543
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  14999772 tgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatgat 14999673  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14999672 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 14999573  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14999572 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14999543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18776123 - 18776352
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18776123 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgat 18776222  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776223 aagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 18776322  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  18776323 aacaccatgtaacctcataatctccttgat 18776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22135021 - 22135250
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22135021 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaattctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgat 22135120  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22135121 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 22135220  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22135221 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22135250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27610707 - 27610936
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27610707 tgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 27610806  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27610807 acaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 27610906  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27610907 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27610936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 41771195 - 41771424
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41771195 tgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 41771294  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41771295 acgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 41771394  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41771395 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 41771424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29476106 - 29475898
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476106 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 29476007  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29476006 acgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 29475907  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  29475906 aacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 23574095 - 23574321
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574095 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 23574194  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  23574195 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaagg 23574294  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  23574295 aacaccatgcaacttcacaatttcctt 23574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22348776 - 22349005
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22348776 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaatcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 22348875  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22348876 aagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaagg 22348975  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22348976 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22349005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 23516898 - 23517102
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23516898 tatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgc 23516997  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516998 cgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 23517097  T
Q  205 ccatg 209  Q
    |||||    
T  23517098 ccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 20799113 - 20799314
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20799113 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataat 20799212  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799213 aagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 20799312  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  20799313 aa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21339319 - 21339099
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21339319 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 21339220  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339219 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 21339120  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21339119 aacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 23440578 - 23440766
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440578 tgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 23440677  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 189  Q
    |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440678 acaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25423542 - 25423759
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25423542 tgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatgat 25423641  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25423642 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 25423741  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  25423742 aacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21498069 - 21497850
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21498069 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatctgcggatgat 21497970  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21497969 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaa-g 21497871  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21497870 aacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20468129 - 20467909
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||    
T  20468129 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaagtcctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataat 20468030  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  20468029 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgacag 20467930  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20467929 aacaccatgtagcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23471582 - 23471802
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23471582 tgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatgat 23471681  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23471682 acgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaagg 23471781  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23471782 aaaaccatgtagcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21564006 - 21563786
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21564006 tgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatatgtttgcggatgat 21563907  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  21563906 aagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgatgg 21563807  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  21563806 aacaccatgcagcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22235953 - 22235733
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22235953 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 22235854  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  22235853 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacgg 22235754  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  22235753 tacaccatgtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14887024 - 14886807
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14887024 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 14886925  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14886924 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacgg 14886825  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14886824 aacaccatgaagcttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24716559 - 24716342
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24716559 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgct 24716460  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24716459 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacgg 24716360  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24716359 aacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26738738 - 26738540
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738738 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 26738639  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||                      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738638 atgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcc----------------------tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 26738561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22503014 - 22503231
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22503014 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 22503113  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  22503114 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatgg 22503213  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22503214 aacaccatgaagcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24620328 - 24620111
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24620328 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgct 24620229  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24620228 aagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacgg 24620129  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24620128 aacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21890788 - 21890572
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21890788 tatcccaagctccacgttgctcaagtgcacacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagc 21890689  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  21890688 cgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaact 21890589  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||| | |||||||||    
T  21890588 ccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24749587 - 24749370
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  24749587 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgct 24749488  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24749487 aagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacgg 24749388  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24749387 aacaccatgaagcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21831720 - 21831574
Alignment:
Q  75 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21831720 cgactgaccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcga 21831621  T
Q  175 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831620 tctctatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22381534 - 22381754
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22381534 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgcctaaggatgat 22381633  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22381634 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 22381733  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  22381734 aactccatgtagcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25848410 - 25848627
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25848410 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaaatcttccaatgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 25848509  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| | ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  25848510 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacgg 25848609  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  25848610 aacaccatgaagcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20342617 - 20342834
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20342617 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20342716  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  20342717 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacgg 20342816  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
     |||||||| ||||||||    
T  20342817 tacaccatgaagcttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37545529 - 37545336
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37545529 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 37545430  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 194  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37545429 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20821788 - 20822008
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20821788 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgat 20821887  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||    
T  20821888 aagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatctgacactatactcgacgg 20821987  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  20821988 aacaccatgcaacttcacaat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 22462287 - 22462471
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462287 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 22462386  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 185  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22462387 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23080122 - 23079902
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23080122 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgat 23080023  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23080022 aagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacgg 23079923  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  23079922 tacaccgtgcagcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28916446 - 28916226
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28916446 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgat 28916347  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  28916346 aagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacgg 28916247  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||  ||||| | |||||||||    
T  28916246 aatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28923801 - 28923581
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28923801 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgat 28923702  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  28923701 aagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacgg 28923602  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||  ||||| | |||||||||    
T  28923601 aatcccatgcaacttcacaat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24798430 - 24798213
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  24798430 tgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgat 24798331  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||    
T  24798330 aagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacgg 24798231  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24798230 aacaccatgaagcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21496493 - 21496713
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  21496493 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatctatttgcgaatgat 21496592  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  21496593 aagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgatgg 21496692  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  21496693 aaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1061 - 919
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061 tgactatcctaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 962  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 143  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  961 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  107 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 206  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  207 atgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20774095 - 20774302
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774095 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggat-gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgat 20774193  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||    
T  20774194 aagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtctgacactatactcgacgg 20774293  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    ||| |||||    
T  20774294 aaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 21405175 - 21405285
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  21405175 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatgat 21405274  T
Q  101 atgccgaactc 111  Q
    | |||||||||    
T  21405275 acgccgaactc 21405285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21984338 - 21984248
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984338 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28894975 - 28894755
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||| | |||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28894975 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaattcactaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgat 28894876  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || ||||||||| |||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  28894875 aagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacgg 28894776  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||  ||||| | |||||||||    
T  28894775 aatcccatgcaacttcacaat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17269366 - 17269148
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17269366 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 17269267  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||| | | |||||| ||||| |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  17269266 aagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 17269168  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17269167 aactccatgtagcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  61 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 160  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  161 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  61 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 160  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  161 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21937203 - 21937013
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  21937203 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 21937104  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21937103 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 27011457 - 27011627
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  27011457 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaact 27011556  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27011557 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 21831776 - 21831722
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcta 55  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21831776 tgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctcta 21831722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 24581584 - 24581753
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  24581584 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 24581682  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581683 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccaatccgacacaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  61 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 122  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 23503837 - 23503952
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  23503837 ctgaatagtcctctccgtctgcctatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag-ttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 23503935  T
Q  160 gaagtaaatcttggatc 176  Q
    |||||||| || |||||    
T  23503936 gaagtaaacctcggatc 23503952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14812 - 15041
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14812 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 14911  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14912 aagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 15011  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15012 aaccccatgtaacctcacaatctccttgat 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1072 - 1301
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072 tgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 1171  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1172 acgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 1271  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  1272 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16350522 - 16350293
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16350522 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 16350423  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16350422 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 16350323  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16350322 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16350293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19106803 - 19107032
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19106803 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 19106902  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106903 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaagg 19107002  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19107003 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19107032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51333416 - 51333187
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51333416 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 51333317  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333316 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 51333217  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  51333216 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 51333187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21837386 - 21837615
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21837386 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 21837485  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21837486 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 21837585  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21837586 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 21837615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33390952 - 33390723
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33390952 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 33390853  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33390852 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 33390753  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33390752 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 33390723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17044938 - 17044709
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17044938 tgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgat 17044839  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17044838 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaagg 17044739  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17044738 aacaccatgtaacctcacaatctccttgat 17044709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21830739 - 21830968
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830739 tgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 21830838  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21830839 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 21830938  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  21830939 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 21830968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21749377 - 21749597
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749377 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 21749476  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749477 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 21749576  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21749577 aacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16078571 - 16078350
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16078571 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagc 16078472  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  16078471 cgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag----a 16078376  T
Q  205 ccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16078375 ccatgtaacctcacaatctccttgat 16078350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41354392 - 41354202
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41354392 tgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgat 41354293  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354292 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16369733 - 16369953
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369733 tgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 16369832  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369833 acgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16369932  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16369933 aacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50620167 - 50619959
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620167 tgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 50620068  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620067 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 50619968  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  50619967 aacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19760789 - 19760569
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19760789 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 19760690  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| ||    
T  19760689 acgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatgg 19760590  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19760589 aacaccatgtagcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24099526 - 24099306
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24099526 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 24099427  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  24099426 aagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 24099327  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  24099326 tacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19854749 - 19854966
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19854749 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaatcctccagtgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 19854848  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  19854849 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 19854948  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
     |||||||||||||||||    
T  19854949 tacaccatgtagcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 37677516 - 37677733
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37677516 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 37677615  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  37677616 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 37677715  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37677716 aacaccatgaagcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22433039 - 22432817
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22433039 tgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 22432940  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22432939 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 22432840  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaattt 223  Q
    |||  |||| |||||||||||||    
T  22432839 aacttcatgcagcttcacaattt 22432817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20939986 - 20939770
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20939986 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 20939887  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | |||||||   ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  20939886 aagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacgg 20939787  T
Q  201 aacaccatgtagcttca 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  20939786 tacaccatgtagcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19662998 - 19662844
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  19662998 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 19662899  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19662898 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 19662844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31539920 - 31539703
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31539920 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 31539821  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  31539820 aagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 31539721  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  31539720 aacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  96 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 195  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  196 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20856684 - 20856476
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20856684 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatatgtctgcggatgat 20856585  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  20856584 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatacttgacgg 20856485  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  20856484 aacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 41308261 - 41308411
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41308261 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 41308360  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 151  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  41308361 aagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20835811 - 20835591
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  ||  | || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20835811 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaggatggtatcgttctctccgattgaccgtctgtctgaggatgat 20835712  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20835711 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaattctcgacgg 20835612  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  20835611 tacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 20137214 - 20137316
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20137214 tgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatgat 20137313  T
Q  101 atg 103  Q
    |||    
T  20137314 atg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20294848 - 20295065
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20294848 tgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20294947  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | ||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20294948 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 20295047  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
     |||||||| ||||||||    
T  20295048 tacaccatgaagcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 20250286 - 20250378
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250286 tgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20831297 - 20831107
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  20831297 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 20831198  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20831197 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  160 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353357
Alignment:
Q  184 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 41353357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Original strand, 20914712 - 20914854
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||    
T  20914712 gtcctctcagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaa 20914811  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914812 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  167 atcttggatc 176  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 866 - 1095
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  866 tgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgat 965  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  966 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 1065  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  1066 aacaccatgcaacttcacaatccccttgat 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17893 - 18122
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17893 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 17992  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 18092  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  18093 aacaccgtgtaacctcacaatctccttgat 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 14491 - 14711
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  14491 tgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctgat 14590  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14591 acgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaatg 14690  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  14691 aacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 31862 - 32082
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31862 tgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgat 31961  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  31962 aagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 32061  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  32062 aactccatgcaacttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  153 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19113177 - 19113406
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19113177 tgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 19113276  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19113277 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 19113376  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19113377 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19113406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30313438 - 30313209
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30313438 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatgat 30313339  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313338 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 30313239  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30313238 aacaccatgtaacctcacaatctccttgat 30313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17674317 - 17674090
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17674317 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 17674218  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17674217 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 17674118  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttg 228  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  17674117 aacaccatgcaacttcacaatctccttg 17674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18857064 - 18857293
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18857064 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcgggtgat 18857163  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18857164 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 18857263  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  18857264 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 18857293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 32600631 - 32600860
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32600631 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 32600730  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600731 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 32600830  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32600831 aacaccatgtaacctcacaatctccttgat 32600860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22133335 - 22133127
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133335 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 22133236  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22133235 acgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaagg 22133136  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  22133135 aacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 15533867 - 15534077
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  15533867 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatgat 15533966  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15533967 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaagg 15534066  T
Q  201 aacaccatgta 211  Q
    |||||||||||    
T  15534067 aacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22046860 - 22047089
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046860 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 22046959  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22046960 aagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaagg 22047059  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22047060 aacaccatgtaacctcacaatctccttgat 22047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16408339 - 16408131
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408339 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 16408240  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16408239 aagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaagg 16408140  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  16408139 aacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21166831 - 21166606
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166831 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 21166732  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21166731 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaagg 21166633  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  21166632 aacaccatgcaactttacaatctcctt 21166606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22120468 - 22120239
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22120468 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgat 22120369  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22120368 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 22120269  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    || |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22120268 aataccatgcaacctcacgatctccttgat 22120239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22040346 - 22040575
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22040346 tgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgat 22040445  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22040446 aagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaagg 22040545  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22040546 aacaccatgtaacctcacaatctccttgat 22040575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21922029 - 21921809
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21922029 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatgat 21921930  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21921929 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 21921830  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21921829 aacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19978454 - 19978683
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978454 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 19978553  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19978554 acgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaagg 19978653  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  19978654 aacaccatgcaacttcacaatttcattgat 19978683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22164485 - 22164278
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  22164485 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgac 22164387  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22164386 acgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaagg 22164287  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  22164286 aacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19485164 - 19484974
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19485164 tgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgat 19485065  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485064 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20018044 - 20017865
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20018044 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 20017945  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 180  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017944 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21251428 - 21251648
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21251428 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatgat 21251527  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251528 acgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 21251627  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21251628 aacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23650528 - 23650748
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23650528 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatgat 23650627  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23650628 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaagg 23650727  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  23650728 aacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22377748 - 22377528
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377748 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 22377649  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377648 acgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 22377549  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22377548 aacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22383923 - 22383703
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383923 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 22383824  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383823 acgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 22383724  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22383723 aacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21394159 - 21393939
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21394159 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 21394060  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21394059 acgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 21393960  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21393959 aacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21788653 - 21788433
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21788653 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 21788554  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21788553 acgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 21788454  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  21788453 aacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20388586 - 20388794
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20388586 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaaatcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 20388685  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  20388686 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattatcgacgg 20388785  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  20388786 aacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23949406 - 23949624
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23949406 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatgat 23949505  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23949506 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacgg 23949605  T
Q  201 aacaccatgtagcttcaca 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23949606 aacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22987688 - 22987903
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22987688 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 22987787  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22987788 aagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaagg 22987882  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22987883 aacaccatgcaacttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20396419 - 20396199
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20396419 tgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatgat 20396320  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  20396319 acgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcag 20396220  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  20396219 gacaccatgcaacttcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31416768 - 31416548
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31416768 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 31416669  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  31416668 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 31416569  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || |||||||||||||||||    
T  31416568 tactccatgtagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20975945 - 20975725
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20975945 tgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 20975846  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  20975845 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctccatctgacacaatactcgacgg 20975746  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  20975745 tacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 14565629 - 14565846
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  14565629 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgat 14565728  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  14565729 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 14565828  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14565829 aacaccatgaagcttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16271518 - 16271301
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16271518 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16271419  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16271418 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgacgg 16271319  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  16271318 aacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1266725 - 1266945
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  1266725 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattggatcgtcctctccgaccgaccatctgtttgaggatgat 1266824  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  1266825 aagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacgg 1266924  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  1266925 tacaccatgcagcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 22051350 - 22051569
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22051350 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 22051449  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22051450 aagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 22051549  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  22051550 aactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 803967 - 803750
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  803967 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 803868  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  803867 aagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 803768  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  803767 aacaccatgaagtttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12305245 - 12305462
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12305245 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 12305344  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  12305345 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatgctcgacgg 12305444  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  12305445 aacaccatgaagcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19851898 - 19852106
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19851898 tgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 19851997  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19851998 aagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 19852097  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  19852098 aacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19857934 - 19858142
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19857934 tgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 19858033  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19858034 aagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 19858133  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  19858134 aacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23655414 - 23655634
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23655414 tgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgat 23655513  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  23655514 aacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 23655613  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  23655614 tacaccatgcaacttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6604145 - 6604362
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6604145 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 6604244  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  6604245 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 6604344  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  6604345 aacaccatgaagtttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6679598 - 6679815
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6679598 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 6679697  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  6679698 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 6679797  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  6679798 aacaccatgaagtttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22061727 - 22061507
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22061727 tgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaatactccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgat 22061628  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  22061627 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacgg 22061528  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  22061527 aactccatgtagtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22371427 - 22371647
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  22371427 tgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctgtttgcggattat 22371526  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  22371527 aagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatactcgatgg 22371626  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||  ||||| | |||||||||    
T  22371627 aagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29303717 - 29303500
Alignment:
Q  4 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 103  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29303717 ctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaaatcatccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataag 29303618  T
Q  104 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 203  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  29303617 ccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaac 29303518  T
Q  204 accatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||||||||||||    
T  29303517 cccatgtagcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 21840904 - 21841124
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  21840904 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatgat 21841003  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
      ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  21841004 gagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatgg 21841103  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  21841104 aactccatgcaacttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20010194 - 20009974
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20010194 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatgat 20010095  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| ||    
T  20010094 aagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatgg 20009995  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  20009994 aacaccatgcaacttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129005
Alignment:
Q  103 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  203 caccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
     |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22129032 taccatgcaacctcacgatctccttgat 22129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31571136 - 31570917
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31571136 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 31571037  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  31571036 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 31570937  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  31570936 aactccatgtagcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21850613 - 21850423
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  21850613 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 21850514  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850513 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16877371 - 16877181
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  16877371 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctta 16877272  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877271 acttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484130
Alignment:
Q  184 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 19484130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  160 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23157277 - 23157098
Alignment:
Q  30 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || |||||| | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  |||    
T  23157277 aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgtcggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttccc 23157178  T
Q  130 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157177 aaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863765
Alignment:
Q  97 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 196  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  197 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 223  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868402
Alignment:
Q  97 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 196  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  197 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 223  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19868402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21196778 - 21196588
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||  | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  21196778 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctctatgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctca 21196679  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21196678 acttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcggattccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Original strand, 22315744 - 22315886
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  22315744 gtcctctccgtctgcccatcactctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaa 22315843  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315844 acctcggatcccgatccgacacaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 22982959 - 22983128
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  22982959 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 22983058  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983059 tgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13168
Alignment:
Q  4 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12942 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataag 13041  T
Q  104 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042 ccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 13141  T
Q  204 accatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13142 accatgtaacttcacaatctccttgat 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 43606 - 43837
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43606 tgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 43705  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43706 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaagg 43805  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  43806 aacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15399 - 15617
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15399 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 15487  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15488 acgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaagg 15587  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15588 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 8937 - 9155
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8937 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat-----------cctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 9025  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9026 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaagg 9125  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  9126 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 9155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50368 - 50148
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||  || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  50368 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctttaaggattgtatcgttctctccgactgaccatccgtctgaggatgat 50269  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  50268 aagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatttgatacaatactcgacgg 50169  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  50168 aacaccatgcaacttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 106361 - 106226
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||    
T  106361 gtcctcttcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaa 106262  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  106261 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4030
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4259 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgat 4160  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4159 atgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaagg 4060  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  4059 aacaccatgcaatctcacaatctccttgat 4030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9048 - 9277
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9048 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgat 9147  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9148 atgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaagg 9247  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  9248 aacaccatgcaatctcacaatctccttgat 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33427 - 33198
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33427 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatgat 33328  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33327 atgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaagg 33228  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  33227 aacaccatgcaatctcacaatctccttgat 33198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 8242 - 8471
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8242 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 8341  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8342 aagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 8441  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    || |||||||| | |||||||  |||||||    
T  8442 aataccatgtaacctcacaatcaccttgat 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7849 - 8078
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7849 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 7948  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7949 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 8048  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  8049 aacaccatacaacttcacaatctccttgat 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4953 - 4727
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4953 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 4854  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4853 acgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 4754  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4753 aacaccatgcaacttcacaatctcctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 32
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  222 ccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 123  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  122 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7391 - 7620
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7391 tgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 7490  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7491 acgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 7590  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  7591 aacaccatgcaacctcacgatctccttgat 7620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 677 - 451
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  677 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaatcctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatgat 578  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  577 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 478  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  477 aacaccatgcaacttcacaatctcctt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22548
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22323 tatcccaagttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagc 22422  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22423 cgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagaaaca 22522  T
Q  205 ccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22523 ccatgtaacctcacaatctccttgat 22548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 278684 - 278458
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278684 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 278585  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278584 acgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 278485  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  278484 aacaccatgcaacttcacaatctcctt 278458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 260760 - 260979
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  260760 tgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattagatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgat 260859  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  260860 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaagg 260959  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  260960 aactccatgtagcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 65857 - 66086
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  65857 tgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatgat 65956  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  65957 aagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaagg 66056  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  66057 aacaccatgtaacctcacgatctccttgat 66086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39673 - 39466
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39673 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgac-atctgtctgtggatgat 39575  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39574 acgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 39475  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  39474 aacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6824 - 7044
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6923  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6924 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 7023  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  7024 aacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 3243 - 3458
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3243 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 3342  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  3343 aagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacgg 3442  T
Q  201 aacaccatgtagcttc 216  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3443 aacaccatgtaacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 63881 - 63659
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  63881 tatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgc 63782  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  63781 cgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaaggaaca 63682  T
Q  205 ccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  63681 ccatgcaacttcacaatctcctt 63659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 197332 - 197106
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  197332 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgat 197233  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  197232 acgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaagg 197133  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||| ||||  | ||||||||| |||||    
T  197132 aacgccatacaacttcacaatctcctt 197106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 6466 - 6691
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6466 tgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatgat 6565  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6566 acgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 6665  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcct 226  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6666 aacaccatgcaacttcacaatctcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19856 - 19636
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19856 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactgaccatctgtctgcggatgat 19757  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19756 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 19657  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  19656 aacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 148 - 368
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 247  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  248 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 347  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  348 aacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3668 - 3442
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3668 tgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 3569  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3568 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaagg 3469  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | | ||||||| |||||    
T  3468 aacaccatgcaacctcacaatctcctt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16107 - 16327
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16107 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 16206  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  16207 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaagg 16306  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  16307 aacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6475 - 6695
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6574  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6575 acgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 6674  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  6675 aacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1158
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1378 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 1279  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || || || || || ||||| ||    
T  1278 aagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctgtccgacacgatactcgacgg 1179  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  1178 tacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 130600 - 130820
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  130600 tgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacataccctcagcaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 130699  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  130700 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 130799  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  130800 aacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4308 - 4085
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4308 tgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgat 4209  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4208 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagg 4109  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttc 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  4108 aacaccatgtaacttcacaatttc 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 59206 - 59426
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  59206 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgat 59305  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  59306 acgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatacttgacgg 59405  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||| ||| || |||||    
T  59406 aacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29008
Alignment:
Q  71 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  171 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 29008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 134694 - 134728
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 35  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  134694 tgactatcccaagttcatccttgctcaagaacaca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 391054 - 390834
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  391054 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 390955  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  390954 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatacaatgctcgatgg 390855  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  390854 aacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 90786 - 90566
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90786 tgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 90687  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  90686 aagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacgg 90587  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  90586 aaccccatgcaacttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 114632 - 114795
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  114632 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccactccgactgaccatctgtctgaggatgat 114731  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 164  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114732 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  136 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 5673 - 5893
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  5673 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatgat 5772  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5773 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 5872  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  5873 aacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7829 - 8047
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  7829 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atcctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgat 7917  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7918 acgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaagg 8017  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttccttgat 230  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8018 aacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 49955 - 50165
Alignment:
Q  11 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49955 aagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcttcttacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaact 50054  T
Q  111 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 210  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  50055 caacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgc 50154  T
Q  211 agcttcacaat 221  Q
    | |||||||||    
T  50155 aacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19280
Alignment:
Q  68 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  168 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 227
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34704
Alignment:
Q  127 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  227 t 227  Q
    |    
T  34704 t 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 6501 - 6709
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  6501 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatgat 6600  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6601 atgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaagg 6700  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  6701 aacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 1128 - 1350
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||    
T  1128 tgactatcccaagttccttcttgctcaagtacgcaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatgat 1227  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1228 acgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaagg 1327  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaattt 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  1328 aacaccatgtaacttcacaattt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 113341 - 113121
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  113341 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctgtctgcggatgac 113242  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113241 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 113142  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  113141 aacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 15333 - 15549
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15333 tatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaagtccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgt 15432  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15433 cgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 15532  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  15533 ccatgtaactttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 203322 - 203102
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  203322 tgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaatggcagaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 203223  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  203222 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgacgg 203123  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  203122 aacaccatgtagcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 112473 - 112693
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  112473 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatgat 112572  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  ||    
T  112573 acgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcgg 112672  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  112673 aacaccatgtagcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 118020 - 118240
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  118020 tgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 118119  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  118120 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 118219  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  118220 tacaccatgtagcttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 386271 - 386491
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  386271 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatgat 386370  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  386371 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 386470  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  386471 aaccccatgcaacttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 323156 - 323376
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323156 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 323255  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  323256 aagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacaaaatactcgacgg 323355  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  323356 tacaccatgcaacttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 219267 - 219051
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  219267 tatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccc 219168  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  219167 cgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaaca 219068  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||  |||||||||    
T  219067 ccatgtcacttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 229499 - 229715
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  229499 tatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgc 229598  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229599 cgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 229698  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||| | |||||||||    
T  229699 ccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32791 - 32667
Alignment:
Q  61 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 160  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||    
T  32791 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 32692  T
Q  161 aagtaaatcttggatctctatctga 185  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||    
T  32691 aagtaaacctcggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 2373 - 2589
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2373 tgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 2472  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2473 acgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcggatctctatctgatacattgctcgaagg 2572  T
Q  201 aacaccatgtagcttca 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  2573 aacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42187 - 41970
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42187 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 42088  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  42087 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 41988  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| || |||||    
T  41987 aacaccatgaagtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47253 - 47033
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47253 tgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 47154  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  47153 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatacttgacgg 47054  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  47053 tacaccatgcagcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 9806 - 10015
Alignment:
Q  12 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9806 agttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaagtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactc 9905  T
Q  112 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 211  Q
    || |||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9906 aacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 10005  T
Q  212 gcttcacaat 221  Q
     |||||||||    
T  10006 acttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8182 - 7963
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||    
T  8182 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatttttctttggatgat 8083  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8082 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacgg 7984  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  7983 aacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 9422 - 9642
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9422 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaagtcttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatgat 9521  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9522 atgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaatg 9621  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9622 aacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16270 - 16050
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16270 tgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatgat 16171  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16170 acgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16071  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  16070 aacaccatgtaacttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26387 - 26167
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26387 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatgat 26288  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 26188  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26187 aacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 195557 - 195338
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||||||  |  || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  195557 tgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaatccttcaaagattgtatcgtcctctccgac-gaccatctgtctgaggatggt 195459  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  195458 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 195359  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  195358 tacaccatgcagcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 149022 - 149238
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  149022 tgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctttctgaggatgat 149121  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  149122 aagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacgg 149221  T
Q  201 aacaccatgtagcttca 217  Q
     ||||||||||||||||    
T  149222 tacaccatgtagcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24925 - 24702
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24925 tgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatgat 24826  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  24825 aagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacgg 24726  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttc 224  Q
    ||||||||| | || |||||||||    
T  24725 aacaccatgcaactacacaatttc 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  30 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  130 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 127053 - 126911
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  127053 tgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 126954  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 143  Q
    | |  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  126953 acgttgaactcaacctcaacttagaacataaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14933 - 14713
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14933 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgat 14834  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || ||    
T  14833 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacgg 14734  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14733 aacaccatgtagcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 4483 - 4699
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483 tgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaagtccttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgat 4582  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583 acgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 4682  T
Q  201 aacaccatgtagcttca 217  Q
    ||||||||||| |||||    
T  4683 aacaccatgtaacttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 544 - 328
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  544 tatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacac 445  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |    
T  444 cgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaata 345  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||| | |||||||||    
T  344 ccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25573 - 25353
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||    
T  25573 tgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgat 25474  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  25473 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacgg 25374  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25373 aacaccatgtagcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 116759 - 116539
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  116759 tgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatgat 116660  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  116659 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacga 116560  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  116559 aacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 98485 - 98612
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  98485 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 98584  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaact 146  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98585 acttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5443 - 5225
Alignment:
Q  3 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||     
T  5443 actatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaatcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatac 5344  T
Q  103 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5343 gtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaa 5244  T
Q  203 caccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5243 caccatgtagcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1659
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1451 tgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaatcttctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 1550  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1551 acgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaagg 1650  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  1651 aacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19059 - 18839
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19059 tgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 18960  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||| ||| |||||||| || |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18959 acgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaagg 18860  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  18859 aacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1360 - 1580
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1360 tgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatgat 1459  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  1460 acaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatgg 1559  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  1560 aacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32606 - 32387
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32606 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 32507  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |    
T  32506 acgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaag 32408  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  32407 aacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11522 - 11302
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11522 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 11423  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  11422 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 11323  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  11322 aactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3592 - 3812
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |  | ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3592 tgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaagtctttcaacgactaaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcagatgat 3691  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaagg 3791  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  3792 aacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 180669 - 180877
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||| ||||||    
T  180669 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacccaaactctcaacaaatcctctagcgac------------------tgaccatctgtctgctgatgat 180750  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  180751 acgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaagg 180850  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  180851 aacaccatgcaacttcacaatctcctt 180877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 101406 - 101186
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  101406 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgat 101307  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  101306 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatgg 101207  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  101206 aactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1717 - 1937
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |   | |||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  1717 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaaaaaatcatcaaaaaaatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatgat 1816  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  1817 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaagg 1916  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  1917 aacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 40190 - 40410
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40190 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctccaatgactgaatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatgat 40289  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  40290 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 40389  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  40390 aactccatgtaacttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2729 - 2509
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2729 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 2630  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  2629 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgatacaatactcgacgg 2530  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  2529 tacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 27677 - 27897
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27677 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgat 27776  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27777 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27876  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  27877 tacaccatgtagcttcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28622 - 28402
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28622 tgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgat 28523  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  28522 aagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacgg 28423  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  28422 aacaccatgcaacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40613 - 40393
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40613 tgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgat 40514  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  40513 aagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacgg 40414  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  40413 aacaccatgcaacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33531 - 33311
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33531 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 33432  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33431 aagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 33332  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  33331 aacaccatgcaacttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 40728 - 40918
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  40728 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 40827  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  40828 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  70 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  170 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 221
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  89 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  189 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1688
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1591 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20435 - 20655
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20435 tgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgat 20534  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20535 aaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacgg 20634  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  20635 aactccatgcaacttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13215 - 12995
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13215 tgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13116  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  13115 aagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 13016  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13015 tacaccatgtagcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16985 - 16765
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16985 tgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgat 16886  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  16885 aagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 16786  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16785 tacaccatgtagcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 43235 - 43455
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43235 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 43334  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  43335 aagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacgg 43434  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  43435 tacaccgtgtagcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 249065 - 249285
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  249065 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgat 249164  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  249165 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacgg 249264  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || |||||||||||||||||    
T  249265 tactccatgtagcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12831 - 12633
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12831 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatgat 12732  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 199  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12731 acgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 4327 - 4547
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4327 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggatgat 4426  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||    
T  4427 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctttccgacacaatactcgatgg 4526  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  4527 aacaccatgcaacttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 321 - 541
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  321 tgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgtggatgat 420  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  421 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 520  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||| |||| | |||||||||    
T  521 tacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 11221 - 11441
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11221 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 11320  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  11321 aagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcggatctccatccgacacaatactcgaagg 11420  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  11421 aactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6890 - 6670
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6890 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacggctgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcggatgat 6791  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||| |||| ||    
T  6790 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgttcgatgg 6691  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6690 aaccccatgtaacttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 10245 - 10465
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10245 tgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 10344  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  10345 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatgg 10444  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  10445 aactccatgcaacttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 47576 - 47796
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47576 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgat 47675  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  47676 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatgg 47775  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  47776 aactccatgcaacttcacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49061 - 48841
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49061 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 48962  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  48961 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggattcctatccgacacaatactcgaagg 48862  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  48861 aactccatgtagctttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19572 - 19792
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19572 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcgtctccgactgaccatctgtctgaggatcat 19671  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  19672 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcagacacaatactcgacgg 19771  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  19772 aactccatgtagcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51717 - 51497
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51717 tgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatgat 51618  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  51617 aagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatgg 51518  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  51517 aacaccatgtaacttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10594 - 10425
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10594 tgactattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 10495  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 170  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10494 aagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 41371 - 41589
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41371 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 41470  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  41471 aagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctctattcgacacaatactcgacgg 41568  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  41569 tacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16567 - 16350
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16567 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16468  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16467 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 16368  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  16367 aacaccatgaagcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2246 - 2466
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2246 tgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattaaatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgat 2345  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||    
T  2346 atgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcggatgtctatccgacacaatactcgatgg 2445  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||  ||||||| |||||||||    
T  2446 aagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 5202 - 5422
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5202 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcggaaaatcctctaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgat 5301  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  5302 aagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatgg 5401  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  5402 tacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6872
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgat 6993  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  6992 aagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacgg 6893  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6892 tacaccatgtagcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6636 - 6856
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6636 tgactatcccaaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6735  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  6736 aagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggacactatactcgaggg 6835  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     | |||||| | |||||||||    
T  6836 gataccatgcaacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18391 - 18171
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | | | | |||||||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18391 tgactatcccaagctccaccttgctcatgtacacacacttttagcaaatcctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgat 18292  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  18291 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacgg 18192  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  18191 aactccatgaaacttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5306 - 5086
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5306 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 5207  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||| || ||   ||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  5206 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcaaatccctatccgacacaatactcgaaag 5107  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5106 aactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52033 - 51814
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52033 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 51935  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  51934 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 51835  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  51834 aactccatgtagcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 61067 - 60848
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  61067 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 60969  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  60968 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 60869  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  60868 aactccatgtagcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 67455 - 67236
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  67455 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 67357  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  67356 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 67257  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  67256 aactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13755 - 13535
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13755 tgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13656  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||  ||||| || ||||| ||||| ||    
T  13655 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgacacaatactcgacgg 13556  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13555 tacaccatgtagcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4807 - 4587
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4807 tgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggacgat 4708  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  4707 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacgg 4608  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  4607 tacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  76 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  176 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5152 - 4945
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||  |||| |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5152 tgactatcccaagctccaacttgctcaagaacacacactctcagtaaatactctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgat 5053  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  5052 aagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 4953  T
Q  201 aacaccat 208  Q
     |||||||    
T  4952 tacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1826 - 1618
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1826 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 1727  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  1726 atgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatgg 1627  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    ||| |||||    
T  1626 aactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 26976 - 27196
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26976 tgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 27075  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27076 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatgg 27175  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  27176 tacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 26612 - 26814
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  26612 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctca 26711  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 218  Q
    |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||||||    
T  26712 actttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcac 26811  T
Q  219 aat 221  Q
    |||    
T  26812 aat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1003 - 787
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1003 tgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcagatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacgat 904  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |     
T  903 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatga 804  T
Q  201 aacaccatgtagcttca 217  Q
    ||||||||||| |||||    
T  803 aacaccatgtaacttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27971 - 28161
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27971 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 28070  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 191  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28071 aagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaat 191  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 43957 - 44177
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43957 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgat 44056  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  44057 aagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 44156  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  44157 aactccatgtagcttcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 44969 - 45189
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  44969 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgat 45068  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  45069 aagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 45168  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  45169 aactccatgtagcttcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 20574 - 20737
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||    
T  20574 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgat 20673  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 164  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20674 aagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactcttccagaaactagaagt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 46680 - 46780
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46680 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgat 46779  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  46780 a 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 86358 - 86154
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||    
T  86358 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatgat 86259  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    |  ||    ||  ||  |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  86258 acacc----tccgtc--aacttataacccaacgcctcctgcaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacgg 86165  T
Q  201 aacaccatgta 211  Q
    |||||||||||    
T  86164 aacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12615 - 12420
Alignment:
Q  25 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 124  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12615 tcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcg 12516  T
Q  125 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 220  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12515 aacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 38
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  192 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 93  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  92 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 11340 - 11560
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11340 tgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgat 11439  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  11440 aagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 11539  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11540 tacaccatgtagcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7646 - 7456
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  7646 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 7547  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7546 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3209 - 2992
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |  || || || || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3209 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatcgtgccctccgactgaccatctgtctgcggatgat 3110  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  3109 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 3010  T
Q  201 aacaccatgtagcttcac 218  Q
     |||||||||||||||||    
T  3009 tacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 123 - 267
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  123 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcatcaaaagactgaaacgtactatccgactaaccatctgtctgcggatgat 222  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 145  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  223 acgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21525 - 21305
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  21525 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtctgtttgaggatgat 21426  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  |    
T  21425 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacag 21326  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  21325 cacaccatgtagcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 26296 - 26424
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  ||    
T  26296 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagct 26395  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26396 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  148 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48887 - 48668
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48887 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa-tcctctaatgattgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatgat 48789  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  48788 aagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacctcggatctttatccgacacaatactcgacgg 48689  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  48688 aaccccatgtaacttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 57671 - 57511
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  57671 tgactatcccaagctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgat 57572  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 161  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || |||||    
T  57571 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactcttccagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6191 - 5969
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 98  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6191 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctatctgaggatg 6092  T
Q  99 atatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaa 198  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  6091 ataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgaa 5992  T
Q  199 ggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5991 ggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 37654 - 37861
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37654 tgactatctcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctagtgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 37753  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  37754 aggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgatgg 37853  T
Q  201 aacaccat 208  Q
    ||| ||||    
T  37854 aaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  115 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 214  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  215 tcacaat 221  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9937 - 9782
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9937 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 9838  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 156  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  9837 aagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  3 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 102  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  103 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  203 caccatgtagcttcacaat 221  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 550 - 770
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  550 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaaagattggatcatcctctccgtctgaccatctgtctgaggatgat 649  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    ||||| ||||| ||    
T  650 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccaccacaatactcgatgg 749  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  750 tacaccatgcaacttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 980 - 1200
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  980 tgactatcgcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 1079  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  1080 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacgg 1179  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     || |||||||||||||||||    
T  1180 taccccatgtagcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  154 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19301 - 19509
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19301 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgat 19400  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19401 aagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacgg 19500  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  19501 aacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23463 - 23671
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  23463 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgat 23562  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  23563 aagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacgg 23662  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  23663 aacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 3203 - 3423
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3203 tgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggattgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgat 3302  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  3303 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatcactatccgacacaatactcgacgg 3402  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  3403 aacaccatgcaacttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  97 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 196  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  197 aaggaacaccatgtagcttcac 218  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  103 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  203 caccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  103 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  203 caccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 5665 - 5885
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  5665 tgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgactaaccatctttctgacgatgat 5764  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||| | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  5765 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaagctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatccgacacaatactagaagg 5864  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5865 aactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25719 - 25511
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||||  |||||||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25719 tgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaatcctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatctgtctgaggatgat 25620  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  25619 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 25520  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    |||||||||    
T  25519 aacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 218  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  219 aat 221  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 46624 - 46814
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  |||||||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  46624 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctca 46723  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  46724 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 26713 - 26933
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26713 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 26812  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |     
T  26813 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacga 26912  T
Q  201 aacaccatgtagcttcacaat 221  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  26913 tacaccgtgcagcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 182
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  167 atcttggatctctatc 182  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  136 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1088 - 880
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1088 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatcctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctgcggatgat 989  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 200  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||| ||    
T  988 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactatactcgacgg 889  T
Q  201 aacaccatg 209  Q
    ||| |||||    
T  888 aaccccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33169 - 32953
Alignment:
Q  5 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  33169 tatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagt 33070  T
Q  105 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 204  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||   ||| ||||| || |||    
T  33069 cgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacgaaatactcgacggtaca 32970  T
Q  205 ccatgtagcttcacaat 221  Q
    || || |||||||||||    
T  32969 ccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  148 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24176
Alignment:
Q  148 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  94 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 193  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  194 tcgaaggaacaccatgtagcttca 217  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 341 - 523
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  341 tgactatcccaagctccacattgctcaagcacacacactcttactaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccatttgaccatctgtgtgcggatgat 440  T
Q  101 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 183  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  441 aagccgaactcagcctcaacttcgatcctaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3711 - 3521
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  3711 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 3612  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  3611 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 202
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  160 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 23864 - 24054
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  23864 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 23963  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23964 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13994
Alignment:
Q  1 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  || || || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14105 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaatcctccaaagattggatcgttctcttcgactgaccatctgtctacggatgat 14006  T
Q  101 atgccgaactca 112  Q
    | || |||||||    
T  14005 aagctgaactca 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Original strand, 7679 - 7828
Alignment:
Q  60 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 159  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  7679 ctgaatagtcctctcggtctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacata 7778  T
Q  160 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7779 gaagtaaacctcggatccggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  94 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 193  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  194 tcgaaggaacaccatg 209  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  115 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 13398 - 13568
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||  || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||    
T  13398 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagct 13497  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  13498 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  82 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 181  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  182 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  30 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 129  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  130 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3818
Alignment:
Q  19 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 118  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  |||    
T  3629 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctctctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtca 3727  T
Q  119 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3728 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Original strand, 24398 - 24540
Alignment:
Q  67 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 166  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| |    
T  24398 gtcctctccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtga 24497  T
Q  167 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24498 accttggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 14670 - 14798
Alignment:
Q  82 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa-gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 180  Q
    ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |    
T  14670 ccatctgtcttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccga 14769  T
Q  181 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    ||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  14770 tctaacacaatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 44019 - 44198
Alignment:
Q  30 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 129  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||    
T  44019 aacacaagctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccc 44118  T
Q  130 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44119 aaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28091 - 27912
Alignment:
Q  30 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 129  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  |||    
T  28091 aacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttccc 27992  T
Q  130 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 209  Q
    |||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27991 aaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  148 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  136 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 221  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Original strand, 19 - 115
Alignment:
Q  106 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  19 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 1112
Alignment:
Q  39 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 138  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | |||  |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  1240 tctcaacaaatcctccaaactctgaatcgtcctctctgtctgctcatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaagcagct 1141  T
Q  139 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 167  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||||||    
T  1140 ttcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 1112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University