View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9402_low_1 (Length: 457)

Name: NF9402_low_1
Description: NF9402
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9402_low_1
NF9402_low_1
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (11-443)||(19773029-19773461)
chr5 (11-443)||(16359571-16360003)
chr5 (11-443)||(34569563-34569995)
chr5 (11-443)||(41773911-41774343)
chr5 (11-443)||(14996624-14997056)
chr5 (11-443)||(22329772-22330204)
chr5 (11-443)||(27682285-27682717)
chr5 (11-443)||(27521475-27521907)
chr5 (11-443)||(27613425-27613857)
chr5 (11-443)||(40711849-40712281)
chr5 (11-443)||(29472958-29473390)
chr5 (11-443)||(37288381-37288813)
chr5 (19-443)||(27665388-27665799)
chr5 (11-443)||(22137737-22138169)
chr5 (11-443)||(22350988-22351420)
chr5 (28-443)||(18782200-18782618)
chr5 (19-422)||(20803674-20804080)
chr5 (22-374)||(23461051-23461406)
chr5 (228-443)||(23537097-23537312)
chr5 (22-440)||(23526131-23526552)
chr5 (179-383)||(25429657-25429864)
chr5 (19-380)||(21882851-21883218)
chr5 (179-386)||(23077844-23078054)
chr5 (178-395)||(22505897-22506117)
chr5 (41-395)||(25851153-25851510)
chr5 (175-395)||(14883921-14884144)
chr5 (268-383)||(21331931-21332046)
chr5 (280-387)||(21870216-21870323)
chr5 (280-387)||(21874496-21874603)
chr5 (178-395)||(20345500-20345720)
chr5 (277-386)||(23474532-23474641)
chr5 (268-383)||(21631341-21631456)
chr5 (268-383)||(26735670-26735785)
chr5 (54-105)||(22505773-22505824)
chr5 (22-95)||(25429501-25429574)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (11-443)||(43165431-43165863)
chr3 (11-443)||(10008356-10008788)
chr3 (11-443)||(12889465-12889897)
chr3 (11-443)||(16638529-16638961)
chr3 (11-443)||(20058996-20059428)
chr3 (11-443)||(15345187-15345619)
chr3 (11-443)||(10908966-10909398)
chr3 (11-443)||(26790355-26790787)
chr3 (11-443)||(48428203-48428635)
chr3 (19-443)||(5421872-5422296)
chr3 (11-443)||(13255446-13255878)
chr3 (11-443)||(15712998-15713430)
chr3 (19-443)||(16753643-16754067)
chr3 (19-443)||(6603499-6603923)
chr3 (11-443)||(3688699-3689131)
chr3 (11-443)||(15399460-15399891)
chr3 (11-443)||(15586334-15586766)
chr3 (11-443)||(53381961-53382392)
chr3 (19-443)||(24185954-24186378)
chr3 (110-443)||(5110351-5110684)
chr3 (181-443)||(6596981-6597243)
chr3 (195-443)||(15358992-15359240)
chr3 (28-443)||(16803886-16804304)
chr3 (23-437)||(11861121-11861538)
chr3 (28-443)||(16694937-16695355)
chr3 (28-443)||(23414729-23415147)
chr3 (11-168)||(15358839-15358996)
chr3 (30-395)||(12501708-12502076)
chr3 (22-437)||(23078962-23079380)
chr3 (19-395)||(15065835-15066214)
chr3 (179-383)||(17497615-17497822)
chr3 (178-395)||(10408901-10409121)
chr3 (179-440)||(14873527-14873791)
chr3 (129-383)||(14578420-14578677)
chr3 (41-395)||(28757115-28757472)
chr3 (382-443)||(5108481-5108542)
chr3 (274-383)||(16326695-16326804)
chr3 (178-395)||(47126877-47127097)
chr3 (179-383)||(12843102-12843309)
chr3 (266-386)||(11958166-11958286)
chr3 (286-386)||(16825264-16825364)
chr3 (277-383)||(16831516-16831622)
chr3 (289-387)||(17189421-17189519)
chr3 (268-387)||(12857480-12857599)
chr3 (268-383)||(19727776-19727890)
chr3 (264-387)||(31692169-31692292)
chr3 (291-383)||(13028345-13028437)
chr3 (178-377)||(14290526-14290728)
chr3 (280-323)||(16384420-16384463)
chr3 (264-387)||(31941925-31942048)
chr3 (41-105)||(16326978-16327042)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (11-443)||(9338350-9338782)
chr2 (11-443)||(9486984-9487416)
chr2 (11-443)||(24712802-24713234)
chr2 (11-443)||(16984008-16984440)
chr2 (11-443)||(22322585-22323017)
chr2 (11-443)||(24265138-24265570)
chr2 (11-443)||(44382813-44383245)
chr2 (11-443)||(27374037-27374469)
chr2 (11-443)||(10871618-10872050)
chr2 (11-443)||(17001768-17002200)
chr2 (11-443)||(24873993-24874425)
chr2 (11-275)||(21139392-21139656)
chr2 (27-443)||(23116299-23116718)
chr2 (19-437)||(24704728-24705149)
chr2 (29-389)||(22462775-22463138)
chr2 (22-440)||(24678266-24678687)
chr2 (23-383)||(22742266-22742629)
chr2 (22-374)||(23028771-23029125)
chr2 (286-386)||(16931598-16931698)
chr2 (28-443)||(24656898-24657316)
chr2 (28-259)||(23205099-23205333)
chr2 (28-259)||(23676703-23676937)
chr2 (22-383)||(23105027-23105392)
chr2 (34-383)||(23039877-23040229)
chr2 (19-229)||(11351168-11351378)
chr2 (22-383)||(22733074-22733438)
chr2 (179-394)||(21320292-21320510)
chr2 (294-440)||(23029815-23029961)
chr2 (280-386)||(23274633-23274739)
chr2 (25-252)||(23065195-23065425)
chr2 (25-252)||(23074645-23074875)
chr2 (262-395)||(20848608-20848741)
chr2 (22-76)||(21322876-21322930)
chr2 (287-323)||(19716377-19716413)
chr2 (287-323)||(19720940-19720976)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (11-443)||(15157769-15158201)
chr7 (11-443)||(13689167-13689599)
chr7 (11-443)||(8710731-8711163)
chr7 (11-443)||(18180869-18181300)
chr7 (11-443)||(14335522-14335954)
chr7 (11-443)||(18586883-18587315)
chr7 (11-443)||(11233925-11234357)
chr7 (11-443)||(44788063-44788495)
chr7 (75-443)||(10873652-10874019)
chr7 (19-443)||(12690635-12691059)
chr7 (19-443)||(11549814-11550238)
chr7 (29-443)||(14957652-14958066)
chr7 (28-443)||(11984135-11984553)
chr7 (28-437)||(9591507-9591919)
chr7 (61-443)||(17703164-17703549)
chr7 (61-443)||(16726150-16726535)
chr7 (178-395)||(26091533-26091753)
chr7 (280-387)||(16947215-16947322)
chr7 (281-387)||(13004865-13004971)
chr7 (178-395)||(26115325-26115545)
chr7 (179-383)||(15145692-15145899)
chr7 (179-386)||(12459923-12460133)
chr7 (178-395)||(40924552-40924772)
chr7 (289-387)||(12712406-12712504)
chr7 (179-386)||(13024639-13024849)
chr7 (280-387)||(14260989-14261096)
chr7 (280-387)||(19150410-19150517)
chr7 (280-387)||(20749809-20749916)
chr7 (280-386)||(11385173-11385279)
chr7 (280-323)||(14145060-14145103)
chr7 (178-392)||(49155595-49155812)
chr7 (280-386)||(12798248-12798354)
chr7 (277-383)||(14283121-14283227)
chr7 (41-105)||(12459785-12459849)
chr7 (41-356)||(21755569-21755887)
chr7 (178-444)||(13965354-13965623)
chr7 (268-379)||(15627910-15628021)
chr7 (41-148)||(13965653-13965760)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (11-443)||(29589287-29589719)
chr6 (11-443)||(27205623-27206055)
chr6 (11-443)||(27243173-27243605)
chr6 (11-443)||(24292630-24293062)
chr6 (11-443)||(16574891-16575323)
chr6 (11-443)||(16620057-16620489)
chr6 (11-443)||(2871650-2872082)
chr6 (11-443)||(28312631-28313063)
chr6 (19-443)||(28260045-28260469)
chr6 (19-443)||(28285447-28285871)
chr6 (19-443)||(28338794-28339218)
chr6 (17-437)||(25115559-25115981)
chr6 (11-443)||(22829234-22829666)
chr6 (22-443)||(5836076-5836497)
chr6 (28-443)||(25756460-25756878)
chr6 (22-383)||(22436881-22437245)
chr6 (28-443)||(27558814-27559232)
chr6 (178-437)||(21764980-21765242)
chr6 (22-252)||(18404980-18405213)
chr6 (179-386)||(10465750-10465960)
chr6 (280-386)||(19438275-19438381)
chr6 (178-395)||(24367568-24367788)
chr6 (22-146)||(19867699-19867823)
chr6 (281-387)||(19881670-19881776)
chr6 (179-383)||(23081592-23081799)
chr6 (289-387)||(34642486-34642584)
chr6 (266-395)||(14376809-14376938)
chr6 (280-386)||(21566893-21566999)
chr6 (268-383)||(18182293-18182408)
chr6 (280-387)||(18797963-18798070)
chr6 (22-64)||(16924867-16924909)
chr6 (268-386)||(19456284-19456402)
chr6 (268-386)||(19466429-19466547)
chr6 (266-368)||(19867915-19868017)
chr6 (41-105)||(10466034-10466098)
chr6 (174-220)||(15462500-15462546)
chr6 (178-224)||(21474768-21474814)
chr6 (175-224)||(19456188-19456237)
chr6 (175-224)||(19466333-19466382)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (11-443)||(21833454-21833886)
chr1 (11-443)||(33387804-33388236)
chr1 (11-443)||(51330267-51330699)
chr1 (11-443)||(41350444-41350875)
chr1 (11-443)||(21842364-21842796)
chr1 (11-443)||(16347369-16347802)
chr1 (17-443)||(22400478-22400904)
chr1 (19-443)||(19109528-19109953)
chr1 (262-443)||(16354018-16354199)
chr1 (34-443)||(21228328-21228740)
chr1 (19-395)||(24784677-24785056)
chr1 (28-443)||(17041788-17042205)
chr1 (19-437)||(22435521-22435932)
chr1 (22-368)||(20081223-20081572)
chr1 (22-387)||(22401755-22402123)
chr1 (178-395)||(21176686-21176906)
chr1 (22-383)||(22496088-22496452)
chr1 (266-383)||(16379504-16379621)
chr1 (178-395)||(48426223-48426443)
chr1 (178-374)||(20074550-20074749)
chr1 (178-395)||(37680399-37680619)
chr1 (178-336)||(52989091-52989252)
chr1 (178-395)||(20297733-20297953)
chr1 (266-383)||(21752457-21752574)
chr1 (178-374)||(21961377-21961576)
chr1 (268-365)||(22117126-22117223)
chr1 (178-374)||(31536838-31537037)
chr1 (280-386)||(22015574-22015680)
chr1 (289-387)||(21742380-21742478)
chr1 (175-378)||(19857621-19857827)
chr1 (277-383)||(20921860-20921966)
chr1 (54-124)||(37680275-37680345)
chr1 (28-101)||(21176597-21176670)
chr1 (298-387)||(21738864-21738953)
chr1 (179-224)||(24096609-24096654)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (11-443)||(17671168-17671600)
chr8 (11-443)||(20015409-20015841)
chr8 (11-443)||(19115603-19116035)
chr8 (11-443)||(18859780-18860212)
chr8 (11-443)||(19481219-19481650)
chr8 (11-443)||(22126105-22126537)
chr8 (11-443)||(22117321-22117753)
chr8 (28-443)||(22043047-22043465)
chr8 (28-443)||(30310287-30310705)
chr8 (28-443)||(15536603-15537021)
chr8 (112-443)||(32603449-32603783)
chr8 (22-383)||(18880860-18881224)
chr8 (22-383)||(19981181-19981545)
chr8 (28-257)||(22031323-22031554)
chr8 (11-383)||(21391064-21391439)
chr8 (11-383)||(21780390-21780765)
chr8 (22-437)||(21163679-21164105)
chr8 (262-386)||(29300626-29300750)
chr8 (41-395)||(16268415-16268772)
chr8 (80-383)||(21671787-21672093)
chr8 (228-383)||(22421096-22421251)
chr8 (268-383)||(22523973-22524088)
chr8 (178-380)||(19985550-19985755)
chr8 (178-395)||(28984281-28984501)
chr8 (266-386)||(21928889-21929009)
chr8 (280-383)||(22027483-22027586)
chr8 (277-323)||(22054335-22054381)
chr8 (289-386)||(3274589-3274686)
chr8 (352-443)||(17830113-17830204)
chr8 (268-387)||(22374332-22374451)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (11-443)||(12479737-12480169)
chr4 (11-443)||(17091592-17092024)
chr4 (19-443)||(19775236-19775660)
chr4 (11-443)||(23958884-23959316)
chr4 (11-443)||(8050066-8050498)
chr4 (11-443)||(27714473-27714905)
chr4 (11-443)||(14300422-14300854)
chr4 (11-443)||(8389549-8389981)
chr4 (11-443)||(16233435-16233867)
chr4 (11-443)||(19635273-19635705)
chr4 (11-443)||(40476177-40476609)
chr4 (19-443)||(14683712-14684136)
chr4 (24-437)||(13513500-13513916)
chr4 (112-443)||(18604259-18604593)
chr4 (123-389)||(18223967-18224236)
chr4 (178-437)||(16248122-16248384)
chr4 (228-437)||(16350188-16350397)
chr4 (41-443)||(7357434-7357839)
chr4 (178-395)||(3261542-3261762)
chr4 (178-356)||(20893335-20893516)
chr4 (22-383)||(14162618-14162982)
chr4 (266-383)||(15144448-15144565)
chr4 (277-369)||(14697507-14697599)
chr4 (280-387)||(18259850-18259957)
chr4 (41-395)||(29450285-29450642)
chr4 (19-101)||(15144677-15144759)
chr4 (70-164)||(16250572-16250666)
chr4 (178-395)||(44658614-44658834)
chr4 (266-383)||(8431-8548)
chr4 (178-374)||(11204001-11204200)
chr4 (264-387)||(16151029-16151152)
chr4 (264-387)||(16155175-16155298)
chr4 (266-383)||(15536-15653)
chr4 (266-387)||(15073754-15073875)
chr4 (268-386)||(16219585-16219703)
chr4 (268-386)||(16222905-16223023)
chr4 (280-383)||(14993127-14993230)
chr4 (178-224)||(15073663-15073709)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (11-443)||(22413-22845)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (11-443)||(7402-7834)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (11-443)||(3590-4022)
scaffold0044 (28-442)||(17343-17760)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (17-443)||(10540-10965)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (11-443)||(41321-41753)
scaffold0109 (29-389)||(12881-13244)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (11-443)||(21163-21578)
scaffold0028 (11-443)||(11635-12050)
scaffold0028 (11-443)||(55170-55602)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (19-443)||(8432-8856)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (11-442)||(104-524)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (19-443)||(424482-424909)
scaffold0003 (280-383)||(203819-203922)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (17-443)||(48837-49263)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (230-443)||(107480-107693)
scaffold0029 (179-383)||(8548-8755)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (28-443)||(229555-229973)
scaffold0009 (187-386)||(251961-252163)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (28-443)||(33-450)
scaffold0008 (118-443)||(139313-139641)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (28-437)||(189-601)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (28-443)||(5181-5599)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (39-437)||(14750-15151)
scaffold0177 (39-437)||(11065-11466)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (22-437)||(36675-37093)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (28-443)||(14607-15025)
scaffold0010 (268-383)||(5341-5456)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (28-443)||(13733-14153)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (28-442)||(473-890)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (29-389)||(9996-10358)
scaffold0080 (29-389)||(12651-13013)
scaffold0080 (19-383)||(32053-32420)
scaffold0080 (22-383)||(54814-55178)
scaffold0080 (19-215)||(37519-37715)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (29-389)||(63-426)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (61-437)||(4-383)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (19-440)||(7363-7787)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (22-437)||(15288-15706)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (28-365)||(171301-171641)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (22-383)||(21781-22145)
scaffold0081 (22-383)||(37205-37569)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (28-380)||(7545-7900)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (22-395)||(291-667)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (22-440)||(36526-36947)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (112-410)||(3-304)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (22-383)||(217-581)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (22-383)||(17112-17476)
scaffold0114 (280-383)||(40496-40599)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (22-381)||(30464-30826)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (22-259)||(10045-10285)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (179-383)||(141-348)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (183-437)||(121885-122142)
scaffold0034 (274-386)||(11666-11778)
scaffold0034 (266-387)||(1711-1832)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (28-443)||(3047-3465)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (22-383)||(8587-8952)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (22-371)||(30349-30701)
scaffold0023 (55-383)||(43216-43547)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (23-383)||(69-432)
scaffold0490 (280-384)||(3303-3407)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (22-381)||(101-463)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (22-383)||(10643-11007)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (22-383)||(2166-2530)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (22-383)||(11441-11804)
scaffold0120 (22-368)||(14261-14610)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (22-383)||(8400-8764)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-383)||(15077-15452)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (22-437)||(16775-17193)
scaffold0017 (22-104)||(194883-194965)
scaffold0017 (230-323)||(194691-194784)
scaffold0017 (309-437)||(21297-21425)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (179-383)||(50108-50315)
scaffold0102 (25-104)||(50390-50469)
scaffold0102 (266-378)||(43122-43234)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (129-437)||(801-1112)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (179-369)||(9220-9413)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (22-380)||(9124-9485)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (22-368)||(3728-4077)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (53-383)||(4318-4651)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (22-367)||(1159-1507)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (22-383)||(194-558)
scaffold0621 (22-383)||(4611-4975)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (228-383)||(6886-7041)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (178-395)||(794-1014)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (179-386)||(1247-1457)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (179-386)||(30086-30296)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (178-383)||(1067-1275)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (130-443)||(28631-28947)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (179-383)||(23708-23915)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (178-374)||(514125-514324)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (268-383)||(11454-11569)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (34-395)||(330-694)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (178-395)||(23674-23894)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (22-383)||(40270-40634)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (265-395)||(30333-30463)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (178-395)||(42068-42288)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (22-383)||(110670-111034)
scaffold0040 (277-383)||(18280-18386)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (277-367)||(216199-216289)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (266-383)||(19822-19939)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (266-383)||(42056-42173)
scaffold0022 (266-383)||(75776-75893)
scaffold0022 (266-383)||(34534-34651)
scaffold0022 (19-101)||(34763-34845)
scaffold0022 (22-101)||(41809-41888)
scaffold0022 (22-101)||(75529-75608)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (22-284)||(2125-2390)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (268-383)||(14028-14143)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (268-383)||(15836-15951)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (280-387)||(62531-62638)
scaffold0053 (277-387)||(65081-65191)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (178-395)||(1358-1578)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (280-386)||(1608-1714)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (289-395)||(66859-66965)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (266-386)||(1071-1191)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (266-386)||(8168-8288)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (266-374)||(66302-66410)
scaffold0064 (19-205)||(69366-69551)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (280-383)||(17247-17350)
scaffold0348 (286-323)||(4672-4709)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (262-428)||(11461-11627)
scaffold0523 (295-387)||(5890-5982)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (280-386)||(305-411)
scaffold0476 (53-146)||(10994-11087)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (22-383)||(18827-19190)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (277-383)||(9550-9656)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (178-387)||(21147-21359)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (181-386)||(33132-33340)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (280-386)||(50543-50649)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (178-334)||(615-774)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (274-395)||(13805-13926)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (266-383)||(48154-48271)
scaffold0075 (266-383)||(55234-55351)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (289-386)||(98343-98440)
scaffold0020 (289-387)||(176434-176532)
scaffold0020 (178-226)||(176320-176368)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (277-377)||(53-152)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (184-383)||(104565-104767)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (274-377)||(29959-30062)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (280-386)||(5662-5768)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (289-383)||(17686-17780)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (179-383)||(9953-10160)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (286-383)||(2275-2372)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (274-395)||(11409-11530)
scaffold0310 (179-224)||(11311-11356)
scaffold0310 (41-105)||(11173-11237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (22-242)||(24616-24839)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (274-383)||(16372-16481)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (274-386)||(621-732)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (280-323)||(6080-6123)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (268-383)||(23296-23411)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (280-323)||(263664-263707)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (277-383)||(17740-17846)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (175-221)||(34667-34713)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (280-386)||(30062-30168)
scaffold0067 (280-323)||(49003-49046)
scaffold0067 (280-323)||(58037-58080)
scaffold0067 (280-323)||(64425-64468)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (290-383)||(5536-5629)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (264-325)||(9036-9097)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (289-374)||(17084-17169)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (178-386)||(51984-52195)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (280-387)||(3810-3917)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (289-387)||(7485-7583)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (280-326)||(116062-116108)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (277-374)||(13246-13343)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (280-385)||(8223-8328)
scaffold0235 (280-385)||(18437-18542)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (289-326)||(6251-6288)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (178-226)||(12130-12178)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 19773029 - 19773461
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19773029 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 19773128  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19773129 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 19773228  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773229 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 19773328  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19773329 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 19773428  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19773429 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19773461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 16359571 - 16360003
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  16359571 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 16359670  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359671 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 16359770  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359771 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 16359870  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359871 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 16359970  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359971 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16360003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 34569563 - 34569995
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  34569563 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 34569662  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569663 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 34569762  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569763 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 34569862  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569863 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 34569962  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34569963 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 34569995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 41773911 - 41774343
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41773911 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 41774010  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41774011 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 41774110  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41774111 aaacacacaatctcagcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 41774210  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41774211 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 41774310  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41774311 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 41774343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14997056 - 14996624
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14997056 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 14996957  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14996956 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 14996857  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14996856 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcaaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 14996757  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14996756 tctgctgtcccttgccctttctctcattcactacctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtctggaaaaactct 14996657  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14996656 caactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 14996624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22330204 - 22329772
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  22330204 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgcgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 22330105  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22330104 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 22330005  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22330004 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 22329905  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  22329904 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactct 22329805  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22329804 cagctgttggtacccaattgccctcttgatgtc 22329772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27682717 - 27682285
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27682717 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaacgtccgtacg 27682618  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27682617 attgcaatcagctacagcatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 27682518  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27682517 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggacgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 27682418  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27682417 tctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgtagctattaaccaaatcctgaaaaactct 27682318  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27682317 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 27521475 - 27521907
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  27521475 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 27521574  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27521575 attgcaatcagctacaacatgatctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 27521674  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27521675 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttagaccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 27521774  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27521775 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 27521874  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27521875 caactgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 27613425 - 27613857
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27613425 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgagcctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 27613524  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27613525 attgcaatcagctaccacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacattgctcttgtggcccttctcaccacaattg 27613624  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27613625 aaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccaccttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 27613724  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27613725 tctgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 27613824  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27613825 cagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27613857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 40711849 - 40712281
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40711849 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 40711948  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711949 attgcaatcagccaccacacgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 40712048  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40712049 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 40712148  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40712149 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactct 40712248  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40712249 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 40712281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29473390 - 29472958
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  29473390 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 29473291  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29473290 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacatcgaacacacttcttgatttcttcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattg 29473191  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29473190 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcggggacactgtacggcttaggacgac 29473091  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29473090 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcattcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactct 29472991  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472990 tagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 29472958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 37288813 - 37288381
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  37288813 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 37288714  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37288713 cttgcattcagctacaatgtgaactttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 37288614  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37288613 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggagcactgtacggcttaggacgac 37288514  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37288513 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 37288414  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37288413 cagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 37288381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27665799 - 27665388
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27665799 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtatgattgcaat 27665700  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||              
T  27665699 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaat---------- 27665610  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665609 ---ctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 27665513  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27665512 cccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgtt 27665413  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  27665412 gatacccaatcgccctcttgatgtc 27665388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 22137737 - 22138169
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22137737 aagcaaagactctaccagtattcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacacacaatgtccgtacg 22137836  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22137837 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattg 22137936  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137937 aaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 22138036  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22138037 tctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactct 22138136  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22138137 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22138169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 22350988 - 22351420
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  22350988 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgttcgtacg 22351087  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  22351088 cttgcattaagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttcatttcttcggggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacagttg 22351187  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22351188 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttatgacgac 22351287  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  22351288 tctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatctggaaaaactct 22351387  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22351388 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22351420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 18782200 - 18782618
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||| || || ||   ||| ||||||||||||||||    
T  18782200 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaacctcttcattacaattgaagcatacgatatcattacgcttgcaatcagctacaa 18782299  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  18782300 tatgacccttcttgccacaccggacacattttttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgc 18782399  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       ||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||    
T  18782400 aggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttggcccttg 18782499  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || |   | |||||||  | ||||||||| |    
T  18782500 gtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaattagggaaaactcggatctgttggtatc 18782599  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18782600 caatcgccctcttgatgtc 18782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Original strand, 20803674 - 20804080
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||  | ||||| |||| ||| |||| |||| | |||| ||| ||||||||||| ||   | | ||||| |    
T  20803674 acccttccagtagtcagcaccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgactctcttccttgccattgaagcacacaatatcactatgcttgcagt 20803773  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    |||||| |  |||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20803774 cagctaaagtatgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctcagggcaaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagac 20803873  T
Q  219 aatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 315  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  |||| ||     
T  20803874 aatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactttgt 20803973  T
Q  316 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagct 415  Q
    || |||||   ||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||  | ||    
T  20803974 tggcccttagtcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactcggatct 20804073  T
Q  416 gttggta 422  Q
    |||||||    
T  20804074 gttggta 20804080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 374
Target Start/End: Original strand, 23461051 - 23461406
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||| ||| | ||||||| | |||||||  || |||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  23461051 ctaccagtagtcggcgccttcttaggttgtttgcactgggaaccaatattaccctcttccttgcaatcgaaacacacaatatcaccatgcttgcattcag 23461150  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    ||| |  |||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23461151 ctaaagtatgactcttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaat 23461250  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
     || ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||| ||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  23461251 ttccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctattttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 23461350  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23461351 cccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcttcata 23461406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23537312 - 23537097
Alignment:
Q  228 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||  |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||   |    
T  23537312 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaggaggggcactatagggcatagggcgactctgctggcccttagtc 23537213  T
Q  328 ttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaa 427  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||||| || |    
T  23537212 ttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccga 23537113  T
Q  428 tcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||| |||||    
T  23537112 tcgccctcttaatgtc 23537097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 440
Target Start/End: Original strand, 23526131 - 23526552
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||  |    
T  23526131 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacggttgcaattgg 23526230  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| | || |||  | || |  ||   ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23526231 ctaatgcatgacccttcttaccacatctgaaacatctttttacctctctaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 23526330  T
Q  222 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||   ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||| ||| ||| || || |||||  | ||||| || |||||||  |||||||||||     
T  23526331 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctatttgcccttgtcagcaagagcactatagggcttagtgcgactctgctgg 23526430  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||    |||||||  | |||||    
T  23526431 cccttagtcttccactcattcacaatcttgtaatgagcctttgtgtcctcctcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgtt 23526530  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgat 440  Q
    |||| ||||| || ||||||||    
T  23526531 ggtatccaattgctctcttgat 23526552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 25429657 - 25429864
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| | || |  ||| ||| ||| ||    
T  25429657 cattgctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagtatccttcttcttaggccgcctatcttcaaccatcctctatttgcc 25429756  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  25429757 cttattagcaggggcactgtaaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataa 25429856  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    ||||||||    
T  25429857 atcctgca 25429864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 380
Target Start/End: Original strand, 21882851 - 21883218
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||   | | ||  | |    
T  21882851 accctaccagtagtcggcaccttcttaggctgcttacactgagaaccaatgtgaccttcttcattacaattgaagcacacaatgtcattatgtttctact 21882950  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggaca-cacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaca 217  Q
    ||||||   ||||||| ||||||||||| | || | ||  |||| |  ||  | || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21882951 cagctattgcatgacccttcttaccacatctgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacaga 21883050  T
Q  218 caatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg 314  Q
    ||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  21883051 caatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctg 21883150  T
Q  315 ctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagc--ctttgtatcctcttcatagatcct 380  Q
    ||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  21883151 ctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctcttagtatcctcctcatagatcct 21883218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23078054 - 23077844
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| |||||    
T  23078054 cattgcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccc 23077955  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| || || || || |||||     
T  23077954 tttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatat 23077855  T
Q  376 atcctgcagct 386  Q
    |||||||||||    
T  23077854 atcctgcagct 23077844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 22505897 - 22506117
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  22505897 acattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttc 22505996  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || ||||||||    
T  22505997 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcata 22506096  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
     || ||||| || ||||||||    
T  22506097 aattctgcacctgttaaccaa 22506117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 395
Target Start/End: Original strand, 25851153 - 25851510
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 140  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||   ||| ||| | ||||||| |   ||||| ||||     
T  25851153 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttgtattcagctagactgtgacccttctg 25851252  T
Q  141 accacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttc 237  Q
    |||||||| ||  |||||| |    || | |   || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||   |||||  ||    
T  25851253 accacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaagagcatctctc 25851352  T
Q  238 ttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcat 337  Q
     |||| |||| |||| ||||    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||     
T  25851353 ctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcac 25851452  T
Q  338 tcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  25851453 tcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcacctattaaccaa 25851510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14884144 - 14883921
Alignment:
Q  175 cagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtt 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||    ||| |||| |    
T  14884144 cagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgct 14884045  T
Q  272 tccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttc 371  Q
    | ||||| ||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || |||||    
T  14884044 ttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttc 14883945  T
Q  372 atagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  14883944 atagattctgcacctattaaccaa 14883921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21332046 - 21331931
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||    
T  21332046 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgcctttcctctcattcacaatcctgtaatgagccttagtatcct 21331947  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| ||||||||    
T  21331946 cctcataaatcctgca 21331931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21870323 - 21870216
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21870323 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 21870224  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  21870223 tgcagcta 21870216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21874603 - 21874496
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21874603 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 21874504  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  21874503 tgcagcta 21874496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 20345500 - 20345720
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  20345500 acattactcttgtgggctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 20345599  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || |||||    
T  20345600 ctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcata 20345699  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
     || ||||| |||||||||||    
T  20345700 aattctgcacctattaaccaa 20345720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 386
Target Start/End: Original strand, 23474532 - 23474641
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||  |    
T  23474532 ttatcagcaggagcaatgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcatgta 23474631  T
Q  377 tcctgcagct 386  Q
    | ||||||||    
T  23474632 ttctgcagct 23474641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21631456 - 21631341
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  21631456 tgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatctt 21631357  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | |||||||| |||||    
T  21631356 cctcatagattctgca 21631341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 26735785 - 26735670
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||||    
T  26735785 tgttttcctttatcagtaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcct 26735686  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| || |||||    
T  26735685 cctcataaattctgca 26735670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Original strand, 22505773 - 22505824
Alignment:
Q  54 acactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  22505773 acactgtgaactgatgtgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtcc 22505824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Original strand, 25429501 - 25429574
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagca 95  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  25429501 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcattgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagca 25429574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 43165431 - 43165863
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  43165431 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 43165530  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165531 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 43165630  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165631 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 43165730  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165731 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 43165830  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43165831 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 43165863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 10008356 - 10008788
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  10008356 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 10008455  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10008456 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 10008555  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10008556 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 10008655  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10008656 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaactaagtcctgaaaaactct 10008755  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008756 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10008788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 12889465 - 12889897
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  12889465 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 12889564  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889565 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 12889664  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889665 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 12889764  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12889765 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 12889864  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12889865 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12889897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 16638529 - 16638961
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16638529 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccttctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 16638628  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638629 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcttcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 16638728  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638729 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 16638828  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638829 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 16638928  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16638929 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16638961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20059428 - 20058996
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  20059428 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 20059329  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20059328 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 20059229  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20059228 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 20059129  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059128 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 20059029  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20059028 cagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 20058996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15345619 - 15345187
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15345619 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 15345520  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15345519 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 15345420  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15345419 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggaggac 15345320  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15345319 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 15345220  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15345219 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 10908966 - 10909398
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  10908966 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgggaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 10909065  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10909066 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 10909165  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10909166 aaacacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 10909265  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10909266 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaactaagtcctgaaaaactct 10909365  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909366 aagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10909398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26790787 - 26790355
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  26790787 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccgtcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaacgtccgtacg 26790688  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790687 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggtagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 26790588  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26790587 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcattgggggcactgtacggcttaggacgac 26790488  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26790487 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 26790388  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26790387 cagttgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 26790355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 48428203 - 48428635
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  48428203 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 48428302  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428303 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 48428402  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428403 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 48428502  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48428503 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactct 48428602  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48428603 cagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 48428635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5422296 - 5421872
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5422296 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 5422197  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5422196 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 5422097  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422096 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 5421997  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  5421996 cccttgcccttcctctcgttcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgtt 5421897  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  5421896 gatacccaatcgccctcttgatgtc 5421872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 13255446 - 13255878
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  13255446 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 13255545  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255546 gttgcaatcagctaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaagcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 13255645  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255646 aagcacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 13255745  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255746 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 13255845  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255846 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 13255878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15713430 - 15712998
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  15713430 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 15713331  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15713330 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 15713231  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713230 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgcttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 15713131  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15713130 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactct 15713031  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713030 cagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 15712998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16754067 - 16753643
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16754067 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacattgagaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 16753968  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16753967 cagctacaacatgacccttcttaccacaccagacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 16753868  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16753867 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactatgctgt 16753768  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16753767 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctagaaaaactctcagctgtt 16753668  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16753667 gatacccaatcgccctcttgatgtc 16753643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 6603499 - 6603923
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6603499 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagagctaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 6603598  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6603599 cagctacaacatgatccttcttaccacaccggacacagttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacac 6603698  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603699 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 6603798  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  6603799 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgtt 6603898  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    
T  6603899 gatacccgatcgccctcttgatgtc 6603923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 3688699 - 3689131
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  3688699 aagcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaagcacacaatgtctgcacg 3688798  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688799 attacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 3688898  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688899 aagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 3688998  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3688999 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 3689098  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3689099 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 3689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15399891 - 15399460
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  15399891 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaacta-tgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 15399793  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15399792 cttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattg 15399693  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15399692 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 15399593  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  15399592 tctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgaaccttggtatcctcttcctagatcctgcagctattgaccaaattctgaaaaactct 15399493  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15399492 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15399460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15586766 - 15586334
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15586766 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 15586667  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586666 gttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 15586567  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586566 aagcacacaatctccgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 15586467  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15586466 tttgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctttgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 15586367  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15586366 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15586334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 53382392 - 53381961
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  53382392 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctgcattgcaattaaagcacacagtgtctgtacg 53382293  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  53382292 attgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacagacgttgctcttgtggcctttctcgccacagttg 53382193  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53382192 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag-gggggcactgtacggcttaggacgac 53382094  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  53382093 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatccttctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactct 53381994  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53381993 cagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 53381961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 24185954 - 24186378
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  24185954 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 24186053  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24186054 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacac 24186153  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186154 aatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgtgggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 24186253  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||    
T  24186254 cccttgcccttccactcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaattctggaaaaactctaatctgtt 24186353  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  24186354 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 24186378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 110 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5110684 - 5110351
Alignment:
Q  110 gattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5110684 gattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttaatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaatt 5110585  T
Q  210 gaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacga 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5110584 gaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggctgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcggggacactgtacggcttaggacga 5110485  T
Q  310 ctctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactc 409  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5110484 ctctattgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactc 5110385  T
Q  410 tcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5110384 tcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5110351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 181 - 443
Target Start/End: Original strand, 6596981 - 6597243
Alignment:
Q  181 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  6596981 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgt 6597080  T
Q  281 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcct 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6597081 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 6597180  T
Q  381 gcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6597181 gcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6597243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 195 - 443
Target Start/End: Original strand, 15358992 - 15359240
Alignment:
Q  195 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactg 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15358992 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttcactttatcagcgggggcactg 15359091  T
Q  295 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15359092 tacggcttagggcgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 15359191  T
Q  395 agtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15359192 aatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16804304 - 16803886
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  16804304 gtagtaggcgacttcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattaaaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 16804205  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16804204 tatgacctttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 16804105  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16804104 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttg 16804005  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||  | |||||||||      
T  16804004 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatt 16803905  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  16803904 cgatcgccctcttaatgtc 16803886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 437
Target Start/End: Original strand, 11861121 - 11861538
Alignment:
Q  23 taccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||   | | |||||||||||    
T  11861121 taccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttccttggaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaatcagc 11861220  T
Q  123 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 222  Q
    || |  |||||| ||||||||||||| || ||| ||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11861221 taaagtatgacccttcttaccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatc 11861320  T
Q  223 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 319  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || |    
T  11861321 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggc 11861420  T
Q  320 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttg 419  Q
    |||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||  | ||||||    
T  11861421 ccttactcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttcctcatagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactcagatctgttg 11861520  T
Q  420 gtacccaatcgccctctt 437  Q
    ||| || || ||||||||    
T  11861521 gtatccgattgccctctt 11861538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 16694937 - 16695355
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||    || ||||||||||||||||    
T  16694937 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacagttgaagcacacaatgtcatttcgcttgcaatcagctacaa 16695036  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||    
T  16695037 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctccaccggacaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagc 16695136  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  16695137 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggcccttg 16695236  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||  | ||||||||| |    
T  16695237 gtcttccactcatttacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatc 16695336  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16695337 cgatcgccctcttgatgtc 16695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23415147 - 23414729
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  23415147 gtagtaggcaccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 23415048  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||    
T  23415047 tatgacccttcttgtcacaccggacacatttcttgatctctttaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgc 23414948  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || ||||||    
T  23414947 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctattggcccttg 23414848  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||  | |||||||  ||||||||||| |    
T  23414847 gtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcctcctcgtagattctgcaggtattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatc 23414748  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | || ||||||||||||||    
T  23414747 cgattgccctcttgatgtc 23414729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 15358839 - 15358996
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  15358839 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtctgtacg 15358938  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcc 168  Q
     ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15358939 cttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcc 15358996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 395
Target Start/End: Original strand, 12501708 - 12502076
Alignment:
Q  30 agtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaaca 129  Q
    ||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||| |  |||||| | |||||||| || |||||||| ||   | | |||||||||||||         
T  12501708 agtcggcgccctcttcggctgcttgcactgagaaccaatatttccctcttccttgcaattgaaacacacaatatcaccatgcttgcaatcagctaatgtg 12501807  T
Q  130 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 229  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||    
T  12501808 tgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagcag 12501907  T
Q  230 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 326  Q
       ||||||||||||||||||| ||  | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||      
T  12501908 gaacatccttcttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctactggcccttggt 12502007  T
Q  327 cttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  12502008 cttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcctcatagattctacagctattcaccaa 12502076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23079380 - 23078962
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| | | | ||  || |||| ||||||||||||  | | || || ||||    
T  23079380 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctttgtacactgtgaaccaatatgaccttgttctttagaactaaaacacacaatgtccttatgcttacactcag 23079281  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||| | ||||||||| | || | |||  |||| |  ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23079280 ctagtgcatgaaccttcttaccatagcgaaaacatctctttacctcccccggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaat 23079181  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    | | ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  23079180 cacagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgg 23079081  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||    |||||||  | |||||    
T  23079080 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcgaatctgtt 23078981  T
Q  419 ggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  23078980 ggtacctaattgccctctt 23078962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 395
Target Start/End: Original strand, 15065835 - 15066214
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||   | | |||||||    
T  15065835 accctacctgtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttctttgcaattgaagaacacaatatcattatgcttgcaat 15065934  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||| ||   ||||||| |||||||||||||||| |||  | || |  || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15065935 cagttaatgcatgacccttcttaccacaccggaaacatctttttacctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagac 15066034  T
Q  219 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 315  Q
    |||| | ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  15066035 aatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggaactatagggcttagggcgactctgc 15066134  T
Q  316 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  15066135 tggcccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaattctacagctgttcaccaa 15066214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 17497615 - 17497822
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||   ||| | ||||  ||||||||||| ||    
T  17497615 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggctatctatcttcgaccatcttctgtttgcc 17497714  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  17497715 cttatcagcaagggtactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcctag 17497814  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    ||||||||    
T  17497815 atcctgca 17497822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 10408901 - 10409121
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||    ||||||||||| |    
T  10408901 acattactcttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgtttac 10409000  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  10409001 ccttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 10409100  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  10409101 gattctgcacctattaaccaa 10409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14873791 - 14873527
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||| ||||||| ||    
T  14873791 cattgctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcc 14873692  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     ||||||||  ||||| | || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| | ||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  14873691 cttatcagcaagggcattatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgcacattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatat 14873592  T
Q  376 atcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgat 440  Q
    |||||||| || || ||||| ||    |||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||    
T  14873591 atcctgcaactgttcaccaactcagagaaaactcggatctattggtatccaattgccctcttgat 14873527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14578677 - 14578420
Alignment:
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca 228  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||  ||    
T  14578677 atgacctttcttaccacaacggaaacacctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagcatagcacacaatctcaaca 14578578  T
Q  229 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
    |   |||| |||||  |||| |||||| |||| |  ||  ||||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||     
T  14578577 ggagcatctttctttctagggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcggcaggagcattgtaaggcttaggacggctctgctgacccttgg 14578478  T
Q  326 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14578477 ccttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataaatcctgca 14578420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 395
Target Start/End: Original strand, 28757115 - 28757472
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 140  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||  ||| ||||| ||||||| |   ||||| ||||     
T  28757115 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctg 28757214  T
Q  141 accacaccggacacacttcttg--atttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catcct 235  Q
    |||||||| ||  |||||| |   || || ||    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||      
T  28757215 accacacctgaagcacttcctatcatctcttcca--caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctc 28757312  T
Q  236 tcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctc 335  Q
    || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  28757313 tcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctc 28757412  T
Q  336 attcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    | ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28757413 actcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 28757472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5108542 - 5108481
Alignment:
Q  382 cagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5108542 cagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5108481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16326804 - 16326695
Alignment:
Q  274 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcat 373  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||    
T  16326804 cctttgtcagcaggagcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcat 16326705  T
Q  374 agatcctgca 383  Q
    | ||||||||    
T  16326704 aaatcctgca 16326695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 47126877 - 47127097
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    ||| |||| || |    
T  47126877 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttc 47126976  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||    
T  47126977 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcata 47127076  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  47127077 gattctgcacctattaaccaa 47127097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12843309 - 12843102
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||| ||||||||||  |||| |  ||  ||||||| ||    
T  12843309 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattctctgtttgcc 12843210  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  12843209 cttatcagcaggagcactataaagctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataa 12843110  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    ||||||||    
T  12843109 atcctgca 12843102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11958286 - 11958166
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||  |||||||| ||| | ||||| ||    
T  11958286 tctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgaacttttgtgtc 11958187  T
Q  366 ctcttcatagatcctgcagct 386  Q
     || ||||| |||| ||||||    
T  11958186 ttcctcataaatcccgcagct 11958166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16825364 - 16825264
Alignment:
Q  286 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagc 385  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16825364 ggggcactatacggcttcggacgactcagctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagc 16825265  T
Q  386 t 386  Q
    |    
T  16825264 t 16825264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16831622 - 16831516
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  16831622 ttatcagcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcataga 16831523  T
Q  377 tcctgca 383  Q
    |||||||    
T  16831522 tcctgca 16831516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Original strand, 17189421 - 17189519
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  17189421 gcactgtacggcttcggacgactctgctggcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcttcatagattctacagcta 17189519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12857599 - 12857480
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  12857599 tgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttttggacgactctactgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcct 12857500  T
Q  368 cttcatagatcctgcagcta 387  Q
    | |||||||| || ||||||    
T  12857499 cctcatagattctacagcta 12857480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Original strand, 19727776 - 19727890
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  19727776 tgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggaagactttgctgacc-ttgccttttctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatctt 19727874  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| || |||||    
T  19727875 cctcatatattctgca 19727890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31692292 - 31692169
Alignment:
Q  264 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgta 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |  ||| |||  ||||| || ||||| || ||     
T  31692292 cttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtg 31692193  T
Q  364 tcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  31692192 tcctcctcatagattctgcagcta 31692169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13028437 - 13028345
Alignment:
Q  291 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || || | | || |||||||||||| |||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  13028437 actgtaaggctttggacgactctgctggcctttactcctcttctcattcactatcttgaaatgagctttggtatcctcctcctagatcctgca 13028345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14290728 - 14290526
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||  ||||    | | ||||||| |    
T  14290728 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttac 14290629  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  || || || ||||| || ||||||||||||||    
T  14290628 ctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcata 14290529  T
Q  375 gat 377  Q
    |||    
T  14290528 gat 14290526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16384463 - 16384420
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16384463 tcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgttgtccctt 16384420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 387
Target Start/End: Original strand, 31941925 - 31942048
Alignment:
Q  264 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgta 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| | | |  ||| |||  ||||| || ||||| || ||     
T  31941925 cttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctatcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtg 31942024  T
Q  364 tcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  31942025 tcctcctcatagattctgcagcta 31942048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16327042 - 16326978
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 105  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  16327042 tcttcggcttagtacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtcc 16326978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 9338350 - 9338782
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  9338350 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 9338449  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338450 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 9338549  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338550 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 9338649  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338650 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 9338749  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9338750 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9338782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 9486984 - 9487416
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  9486984 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 9487083  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487084 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 9487183  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487184 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 9487283  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487284 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 9487383  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9487384 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9487416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 24712802 - 24713234
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24712802 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 24712901  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24712902 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 24713001  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713002 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 24713101  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24713102 tctgctgtcccttgccctttctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 24713201  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24713202 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24713234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 16984008 - 16984440
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  16984008 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 16984107  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984108 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 16984207  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984208 aaacacacaatctctgcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 16984307  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16984308 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactct 16984407  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16984408 cagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 16984440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22323017 - 22322585
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22323017 aagcaaagatcctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 22322918  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22322917 attgcaatcagctataacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 22322818  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322817 aaacacacaatctccgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 22322718  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22322717 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 22322618  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22322617 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22322585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 24265138 - 24265570
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24265138 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaacgtccgtacg 24265237  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24265238 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 24265337  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24265338 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 24265437  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  24265438 tctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagtctgaaaaaactct 24265537  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24265538 cagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 24265570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44383245 - 44382813
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44383245 aagcaaagaccctacccgtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaacgtccgtacg 44383146  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383145 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 44383046  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383045 aagcacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 44382946  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  44382945 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactct 44382846  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44382845 cagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 44382813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 27374037 - 27374469
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  27374037 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 27374136  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374137 attgcaatcagctaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 27374236  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374237 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 27374336  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27374337 tctgcagtcccttgcccttcctttcattcactaccttatagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 27374436  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27374437 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27374469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 10871618 - 10872050
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  10871618 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtgcg 10871717  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10871718 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 10871817  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10871818 aaacacacaagctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 10871917  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10871918 tctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 10872017  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10872018 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 10872050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 17001768 - 17002200
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  17001768 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 17001867  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17001868 gttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattg 17001967  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17001968 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 17002067  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17002068 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 17002167  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17002168 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17002200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24874425 - 24873993
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  24874425 aagcaaagaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatttgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 24874326  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  24874325 cttgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacatttcttaatttcttcatggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacagttg 24874226  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24874225 aaacacacaatctcagtaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttagaacgac 24874126  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  24874125 tctgccgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactatttaccaaatctggaaaaactct 24874026  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24874025 aagctgttgatacccaatcgcccttttgatgtc 24873993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21139656 - 21139392
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||    
T  21139656 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctattaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtcttcacg 21139557  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21139556 cttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacggttcttgatctcttcacgacagacattgcttttgtggccttttccaccacaattg 21139457  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  21139456 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccc 21139392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23116718 - 23116299
Alignment:
Q  27 agtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||     
T  23116718 agtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttatgcttgcaatcagctacg 23116619  T
Q  127 acatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctct- 225  Q
    | ||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||     
T  23116618 atatgacccctcttgctacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctg 23116519  T
Q  226 --gcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
      | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||    
T  23116518 aaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgccctt 23116419  T
Q  324 gcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtac 423  Q
       |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||  | |||||||  || ||||||||     
T  23116418 agtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtat 23116319  T
Q  424 ccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    || |||||||||||||||||    
T  23116318 ccgatcgccctcttgatgtc 23116299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24705149 - 24704728
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||| |||||||    
T  24705149 accctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaat 24705050  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    |||||| |   ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24705049 cagctaaagtgtgacccttcttgccacactggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagat 24704950  T
Q  219 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 315  Q
    |||||| ||||   |||||||||||||||| || ||  | ||||  ||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||    
T  24704949 aatctcagcaggaacatccttcttcttaggtcgtctttcctcgaccatcctatgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgc 24704850  T
Q  316 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagct 415  Q
    || |||||   ||||  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| |  | ||    
T  24704849 tggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcctcatagattctacagctattcaccaaatctggaaaaacacgtatct 24704750  T
Q  416 gttggtacccaatcgccctctt 437  Q
    ||||||| |  |||||||||||    
T  24704749 gttggtatctgatcgccctctt 24704728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22463138 - 22462775
Alignment:
Q  29 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |     
T  22463138 tagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacgat 22463039  T
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc- 227  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  22463038 atgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgca 22462939  T
Q  228 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
      |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||  ||||||  || |||| ||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  22462938 ggagcatccttcttcttaggccacctatcatcgaccattctctgttcgcccttattagaaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttgg 22462839  T
Q  326 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctatt 389  Q
     ||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  22462838 tcttccgctcatttacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagattctgcagctatt 22462775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 440
Target Start/End: Original strand, 24678266 - 24678687
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||  ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||||    
T  24678266 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgactctcttcaatgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcactcag 24678365  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  24678366 ctagtgcatgacccttcttaccacaacggaaacatctcttaacctctcccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 24678465  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||  ||     
T  24678466 ctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctattgg 24678565  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||   ||||||||  | || ||    
T  24678566 cccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcgtcataaattctgcaactgttcaccaactcgcaaaaaactcggatctatt 24678665  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgat 440  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  24678666 ggtatccaattgccctcttgat 24678687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22742629 - 22742266
Alignment:
Q  23 taccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagc 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   | | ||||| |||||    
T  22742629 taccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattatgtttgcactcagc 22742530  T
Q  123 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 222  Q
    ||   ||||||| |||||||| || |||| |||  | || |  ||  | || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  22742529 tagtgcatgacccttcttaccgcatcggaaacatctatttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcatttctcaccacaattaaagcagacaatc 22742430  T
Q  223 tctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 319  Q
    ||  |||||   ||||||||| | ||||| ||| | || |  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  22742429 tcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgac 22742330  T
Q  320 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22742329 ccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcttcgtaaatcctgca 22742266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23029125 - 23028771
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  23029125 ctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatgtttgcaatcag 23029026  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  23029025 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaata-aaacagacaat 23028927  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  23028926 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 23028827  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    || ||    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23028826 cctttagtattccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcata 23028771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 286 - 386
Target Start/End: Original strand, 16931598 - 16931698
Alignment:
Q  286 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16931598 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagc 16931697  T
Q  386 t 386  Q
    |    
T  16931698 t 16931698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24657316 - 24656898
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | |||| |||||| ||||| || ||   | | |||||||||||||       
T  24657316 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgccattaaaacacacgatatcaccatgtttgcaatcagctaatg 24657217  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
      ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  24657216 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 24657117  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||||||| ||||||||||| ||  | ||||  ||| ||||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  24657116 aggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 24657017  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||  |||||||||  | ||||||||| |    
T  24657016 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagattctgcagctattcatcaaatctggaaaaactcggatctgttggtatc 24656917  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  24656916 cgatcgccctcttaatgtc 24656898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 23205099 - 23205333
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||    
T  23205099 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaa 23205198  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc--- 224  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||       
T  23205199 tatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccga 23205298  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcga 259  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23205299 aggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcga 23205333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 23676703 - 23676937
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||    
T  23676703 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaa 23676802  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc--- 224  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||       
T  23676803 tatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccga 23676902  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcga 259  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23676903 aggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcga 23676937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23105392 - 23105027
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgacc-ctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatca 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| |||    
T  23105392 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgacctctcttcattgcaattgaagcacacaatatcatcatgtttgcactca 23105293  T
Q  121 gctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaa 220  Q
    ||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  || | ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||    
T  23105292 gctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtcttaaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagagaaacaaataa 23105193  T
Q  221 tctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 317  Q
    |||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23105192 tctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggtgcactgtaaggcttagggcggctctgctg 23105093  T
Q  318 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
     |||||   ||||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  23105092 gcccttagtcttctgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 23105027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23040229 - 23039877
Alignment:
Q  34 ggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgac 133  Q
    |||||| |||||||||   | |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| || || || ||   | | ||||| |||||||   ||||||    
T  23040229 ggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgacgctcttcattgcagttaaaacatactatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgac 23040130  T
Q  134 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---c 230  Q
    | ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||   |    
T  23040129 ccttctttccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacagacaatctctgtaggagc 23040030  T
Q  231 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttc 330  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||   ||||    
T  23040029 atccttcttcttaggccgtctaccttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagtcttc 23039930  T
Q  331 ctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  23039929 cgctcattcacaatcttgtaatgagccttaatatcctcctcgtagatcctgca 23039877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11351378 - 11351168
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | |||||||    
T  11351378 accctaccagtagtcggcaccctcttaggctgcttggactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaat 11351279  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||    |||||| ||||| ||||||| || ||| ||||  |  ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11351278 cagctaatgtatgacccttcttgccacaccagaaacatttctctacctcctttggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagac 11351179  T
Q  219 aatctctgcag 229  Q
    |||||| ||||    
T  11351178 aatctccgcag 11351168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22733438 - 22733074
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||  | ||   | | ||||| ||||    
T  22733438 ctaccagtagtcggcaccttcttaggtttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactttatcatcatgtttgcactcag 22733339  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| |||||  | | |||  ||||| | ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22733338 ctagtgcatgacccttctttccacattgtaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaat 22733239  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
     |||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||  ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||     
T  22733238 ttctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttatcagcaggggcactgtaaagcttagggcgactctgctga 22733139  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22733138 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 22733074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21320510 - 21320292
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||  | ||||| ||    
T  21320510 cattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagggacatccttcttcttaggccgcctatcctcgaccattctttgtttgcc 21320411  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||||||| ||||  || || |||||||| | ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  21320410 cttatcagcaggggtgctataaggcttagggcaactctgctggcccctagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataa 21320311  T
Q  376 atcctgcagctattaacca 394  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  21320310 attctgcagctattcacca 21320292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Original strand, 23029815 - 23029961
Alignment:
Q  294 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 393  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | |||    
T  23029815 gtacggcttaggacgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgcaactactcacc 23029914  T
Q  394 aagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgat 440  Q
    || ||    |||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||    
T  23029915 aactcggagaaaactcgaatcttttggtaaccaatcgcccttttgat 23029961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 23274633 - 23274739
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23274633 tcagcaggagcactatactgcttcggacgactctgttgtcccttgcccctacgttcactcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcatagatcc 23274732  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  23274733 tacagct 23274739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 23065195 - 23065425
Alignment:
Q  25 ccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||| |    
T  23065195 ccagtagtcggcgccttcttaggctttttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcattcagcca 23065294  T
Q  125 caacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
       ||||||| ||||| ||||| || | |||  | ||||  ||| |||| ||   || |||||||||||| ||||||||| || | ||| | ||||||||    
T  23065295 gtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatcttttgacatccccaggacaagaatagctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctc 23065394  T
Q  225 tgcag---catccttcttcttaggccgccta 252  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  23065395 tgcaggaccatccttcttcttaggccgccta 23065425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 23074645 - 23074875
Alignment:
Q  25 ccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||| |    
T  23074645 ccagtagtcggcgccttcttaggctttttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcattcagcca 23074744  T
Q  125 caacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
       ||||||| ||||| ||||| || | |||  | ||||  ||| |||| ||   || |||||||||||| ||||||||| || | ||| | ||||||||    
T  23074745 gtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatcttttgacatccccaggacaagaatagctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctc 23074844  T
Q  225 tgcag---catccttcttcttaggccgccta 252  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  23074845 tgcaggaccatccttcttcttaggccgccta 23074875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 395
Target Start/End: Original strand, 20848608 - 20848741
Alignment:
Q  262 atcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttg 361  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || |    
T  20848608 atcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttgg 20848707  T
Q  362 tatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    | || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20848708 tgtcttcttcataaattctgcacctgttaaccaa 20848741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 21322930 - 21322876
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccct 76  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  21322930 ctaccagtagttggcgccttcttaggttgcgtacattgtgaaccaatgtgaccct 21322876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19716413 - 19716377
Alignment:
Q  287 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19716413 gggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19716377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19720976 - 19720940
Alignment:
Q  287 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19720976 gggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19720940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15158201 - 15157769
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15158201 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 15158102  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15158101 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 15158002  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15158001 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 15157902  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15157901 tctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 15157802  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15157801 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 13689167 - 13689599
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13689167 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctatccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 13689266  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13689267 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 13689366  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13689367 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagtaggggcactgtacggcttaggacgac 13689466  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13689467 tctggtgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtctggaaaaactct 13689566  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13689567 cagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 13689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 8710731 - 8711163
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  8710731 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 8710830  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8710831 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 8710930  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710931 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 8711030  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8711031 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 8711130  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  8711131 cagctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 8711163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 18180869 - 18181300
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18180869 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 18180968  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18180969 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctttcgtggcctttctcgccacaattg 18181068  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18181069 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggaagac 18181168  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18181169 tctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactct 18181268  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  18181269 cagttgttaat-cccaatcgccctcttgatgtc 18181300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 14335522 - 14335954
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  14335522 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 14335621  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335622 attgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 14335721  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14335722 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcattgtacggcttaggacgac 14335821  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14335822 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 14335921  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14335922 cagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 14335954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18587315 - 18586883
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18587315 aagcaaagaccctactagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtccgtacg 18587216  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587215 attgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 18587116  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18587115 aagcacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcattgtacggcttaggacgac 18587016  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18587015 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 18586916  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18586915 cagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 18586883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11234357 - 11233925
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  11234357 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 11234258  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11234257 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 11234158  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234157 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 11234058  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11234057 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactct 11233958  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11233957 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 11233925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44788495 - 44788063
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  44788495 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 44788396  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44788395 gttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattg 44788296  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44788295 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagtaggggcactgtacggcttaggacgac 44788196  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788195 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 44788096  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44788095 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 44788063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 75 - 443
Target Start/End: Original strand, 10873652 - 10874019
Alignment:
Q  75 ctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggg 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10873652 ctctccatt-caattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagga 10873750  T
Q  175 cagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10873751 caggcgttgctcttgtggtctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcc 10873850  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10873851 ctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccctgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 10873950  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10873951 gatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 10874019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 12690635 - 12691059
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| |||||||    
T  12690635 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaatacacaatgtccttacgcttgcaat 12690734  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12690735 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggactttcacaccacaattgaaacacac 12690834  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690835 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 12690934  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||    
T  12690935 cccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgtt 12691034  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  12691035 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 12691059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 11550238 - 11549814
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  11550238 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 11550139  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    || |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11550138 caactacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacac 11550039  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11550038 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgt 11549939  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  11549938 cccttccccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgtt 11549839  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  11549838 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 11549814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 29 - 443
Target Start/End: Original strand, 14957652 - 14958066
Alignment:
Q  29 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||     
T  14957652 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaat 14957751  T
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca 228  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14957752 atgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggta 14957851  T
Q  229 gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 328  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14957852 gtatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgaccctactgtcccttgccct 14957951  T
Q  329 tcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaat 428  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  14957952 tcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaat 14958051  T
Q  429 cgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||| |||||    
T  14958052 caccctcttaatgtc 14958066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 11984135 - 11984553
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  11984135 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgaaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 11984234  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---c 224  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   |    
T  11984235 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcagtacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 11984334  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11984335 tggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttg 11984434  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||  |||||||||  |  |||||||| |    
T  11984435 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcttcgtagatcctacaactgttaaccaaatcaggaaaaactcggatttgttggtatc 11984534  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  11984535 cgatcgccctcttaatgtc 11984553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 437
Target Start/End: Original strand, 9591507 - 9591919
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||| ||    
T  9591507 gtagtaggctccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctataa 9591606  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9591607 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgc 9591706  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||  |||| || || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9591707 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 9591806  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||  | ||||||||| |    
T  9591807 gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 9591906  T
Q  425 caatcgccctctt 437  Q
    | |||||||||||    
T  9591907 cgatcgccctctt 9591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17703549 - 17703164
Alignment:
Q  61 gaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttct 160  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  17703549 gaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttct 17703450  T
Q  161 tgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatc 257  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17703449 tgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatc 17703350  T
Q  258 gaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcc 357  Q
    ||  ||  ||||||| || |||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  17703349 gaccattctctgtttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagct 17703250  T
Q  358 tttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |     |||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17703249 ctggtatcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16726535 - 16726150
Alignment:
Q  61 gaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttct 160  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  16726535 gaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttct 16726436  T
Q  161 tgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatc 257  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16726435 tgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatc 16726336  T
Q  258 gaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcc 357  Q
    ||  ||  ||||||| || |||||||  |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||| |||||||| |||||     
T  16726335 gaccattctctgtttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagct 16726236  T
Q  358 tttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |     |||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16726235 ctggtatcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16726150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26091753 - 26091533
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  26091753 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 26091654  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  26091653 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 26091554  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  26091553 gattctgcacctattaaccaa 26091533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16947322 - 16947215
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  16947322 tcagcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagattc 16947223  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  16947222 tgcagcta 16947215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Original strand, 13004865 - 13004971
Alignment:
Q  281 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcct 380  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  13004865 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 13004964  T
Q  381 gcagcta 387  Q
    |||||||    
T  13004965 gcagcta 13004971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26115545 - 26115325
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  26115545 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagccggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcactcatcttctgctttc 26115446  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  26115445 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 26115346  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| || || || ||||||||    
T  26115345 gattctacacctgttaaccaa 26115325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15145899 - 15145692
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||  | |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||| |  |   ||||||| ||    
T  15145899 cattactcctgtggcctttctcaccacaagtaaagaagacaatctcagcaggagcatccttcttcttagggcgcctatcatcaactactctctgtttgcc 15145800  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| || ||| ||    
T  15145799 cttatcagcagggggactataaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcaaag 15145700  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    ||||||||    
T  15145699 atcctgca 15145692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 386
Target Start/End: Original strand, 12459923 - 12460133
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    || ||||| || ||    
T  12459923 cattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcc 12460022  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     || |||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  12460023 cttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatat 12460122  T
Q  376 atcctgcagct 386  Q
    |||||||||||    
T  12460123 atcctgcagct 12460133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40924772 - 40924552
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  40924772 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 40924673  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||    
T  40924672 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcata 40924573  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  40924572 gattctgcacctattaaccaa 40924552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12712504 - 12712406
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||| | |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  12712504 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttggaatgagcctttgaatcttcctcatagattctgcagcta 12712406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 386
Target Start/End: Original strand, 13024639 - 13024849
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    ||| |||| |||||    
T  13024639 cattgcttttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccc 13024738  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || |||||     
T  13024739 tttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatat 13024838  T
Q  376 atcctgcagct 386  Q
    |||||||||||    
T  13024839 atcctgcagct 13024849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14261096 - 14260989
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || || | |||| | |  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14261096 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttacctttgcgctcactgatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcc 14260997  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  14260996 tgcagcta 14260989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Original strand, 19150410 - 19150517
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  19150410 tcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 19150509  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  19150510 tgcagcta 19150517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Original strand, 20749809 - 20749916
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  20749809 tcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 20749908  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  20749909 tgcagcta 20749916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11385279 - 11385173
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||  | |||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |    
T  11385279 tcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcatcttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 11385180  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    |||||||    
T  11385179 tgcagct 11385173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Original strand, 14145060 - 14145103
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14145060 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 14145103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 392
Target Start/End: Original strand, 49155595 - 49155812
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| | ||    ||| |||| || |    
T  49155595 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcctcacccatcctctgctttc 49155694  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||    
T  49155695 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcata 49155794  T
Q  375 gatcctgcagctattaac 392  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  49155795 gattctgcatctattaac 49155812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12798354 - 12798248
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||    
T  12798354 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaaagagctttcgtatcctcttcataaatcc 12798255  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  12798254 tacagct 12798248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14283227 - 14283121
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   | | |||||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  14283227 ttatcagcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcctcctcataga 14283128  T
Q  377 tcctgca 383  Q
    |||||||    
T  14283127 tcctgca 14283121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Original strand, 12459785 - 12459849
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  12459785 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtcc 12459849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 356
Target Start/End: Original strand, 21755569 - 21755887
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 140  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||  ||| || || ||||||| |   ||||| ||||     
T  21755569 tcttcggctcaggacactgtgagctaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgacccttctg 21755668  T
Q  141 accacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttc 237  Q
    |||||||| || ||||||| |    || | |   || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |    ||||||  ||    
T  21755669 accacacctgaaacacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagagggagcatctctc 21755768  T
Q  238 ttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcat 337  Q
     ||||||||| | |  ||||    || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| ||||||||     
T  21755769 ctcttaggcctcatgtcatcactcatattctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccctcctctcac 21755868  T
Q  338 tcactaccttgtagtgagc 356  Q
    ||| || |||||| |||||    
T  21755869 tcattatcttgtaatgagc 21755887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13965623 - 13965354
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  13965623 acattactcttgtggtctttctcaccacacttgtagcaatcaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 13965524  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| ||| || || ||| ||||| || || || ||||||||    
T  13965523 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcattatctggtaatgagctttggtgtcttcttcata 13965424  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtcc 444  Q
     ||||  || || |||||||| ||   ||| ||||| | ||| || |||||||| || || |||||||||    
T  13965423 aatccaacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcc 13965354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 379
Target Start/End: Original strand, 15627910 - 15628021
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||    
T  15627910 tgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgttgactcttacttttcctctcattcataaccttgtaatgagctttcgtatcct 15628009  T
Q  368 cttcatagatcc 379  Q
    | ||||||||||    
T  15628010 cctcatagatcc 15628021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13965760 - 13965653
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 140  Q
    |||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||| |   ||||| ||||     
T  13965760 tcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctagactgtgacccttctg 13965661  T
Q  141 accacacc 148  Q
    ||||||||    
T  13965660 accacacc 13965653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29589719 - 29589287
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  29589719 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 29589620  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589619 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 29589520  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29589519 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagtgggggcactgtacggcttaggacgac 29589420  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589419 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 29589320  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29589319 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 29589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 27205623 - 27206055
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27205623 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaagcacacaatgtccgaacg 27205722  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27205723 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 27205822  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27205823 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcactgtacggcttaggacgac 27205922  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27205923 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcttgaaaaactct 27206022  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27206023 cagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27206055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27243605 - 27243173
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27243605 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaagcacacaatgtccgaacg 27243506  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243505 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 27243406  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27243405 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcactgtacggcttaggacgac 27243306  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27243305 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcttgaaaaactct 27243206  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27243205 cagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27243173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24293062 - 24292630
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24293062 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 24292963  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24292962 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattg 24292863  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24292862 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 24292763  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24292762 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 24292663  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24292662 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24292630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 16574891 - 16575323
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  16574891 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 16574990  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574991 attgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 16575090  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575091 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 16575190  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16575191 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 16575290  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16575291 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16575323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16620489 - 16620057
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  16620489 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 16620390  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620389 attgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 16620290  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620289 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 16620190  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16620189 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 16620090  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16620089 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16620057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2872082 - 2871650
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2872082 aagcaaagactctaccagtagtcggtgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtaca 2871983  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2871982 attgcagtcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 2871883  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2871882 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacagcttaggacgac 2871783  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2871782 tctgttgtcccttgcccttcctctcattcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactct 2871683  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2871682 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 2871650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 28312631 - 28313063
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28312631 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 28312730  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312731 attgcaatcagctactacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcctcggaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 28312830  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312831 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 28312930  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312931 tctgctgtcccttacccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 28313030  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28313031 cagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 28313063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28260469 - 28260045
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28260469 accctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtccgtgcgattgcaat 28260370  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28260369 cagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacac 28260270  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28260269 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgc 28260170  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260169 cccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 28260070  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  28260069 gatacccaagcgccctcttgatgtc 28260045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 28285447 - 28285871
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28285447 accctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtccgtgcgattgcaat 28285546  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28285547 cagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacac 28285646  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28285647 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgc 28285746  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285747 cccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 28285846  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  28285847 gatacccaagcgccctcttgatgtc 28285871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28339218 - 28338794
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28339218 accctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtccgtgcgattgcaat 28339119  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28339118 cagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacac 28339019  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28339018 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgc 28338919  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28338918 cccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 28338819  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  28338818 gatacccaagcgccctcttgatgtc 28338794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 437
Target Start/End: Original strand, 25115559 - 25115981
Alignment:
Q  17 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25115559 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatatccgtacgattgca 25115658  T
Q  117 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacac 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25115659 atcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacac 25115758  T
Q  217 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 316  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115759 acaatctcagtagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgct 25115858  T
Q  317 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcc-tgaaaaactct-cagc 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||     
T  25115859 gtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccgggaaaaactctccagt 25115958  T
Q  415 tgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||||||| ||||| ||||||||    
T  25115959 tgttggtatccaattgccctctt 25115981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22829666 - 22829234
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||    
T  22829666 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacacggtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccttacg 22829567  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  22829566 cttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggccttttccaccacaattg 22829467  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22829466 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 22829367  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  22829366 tctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactct 22829267  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22829266 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5836497 - 5836076
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |    
T  5836497 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcgttgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaatcgg 5836398  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5836397 ctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttctggacaaacattgctttcgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaat 5836298  T
Q  222 ctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccc 321  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5836297 ctcagcagcatccttcttcttgggtcgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactatacggcttaggacgactctgttgtccc 5836198  T
Q  322 ttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggt 421  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||    
T  5836197 ttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctcttcgtaaatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctaatctattggt 5836098  T
Q  422 acccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5836097 acccaatcgccctcttaatgtc 5836076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25756878 - 25756460
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |    
T  25756878 gtagtaggcgccctcttaggctgtttgcattgggaaccaatatgaccctcctcattgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacta 25756779  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  25756778 tatgacccttcttgccgcaccggacacatttctttatctcttctggaaaaacattgcacttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgc 25756679  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||| |  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  25756678 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaactagggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 25756579  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      |||||  ||||| || |||||||| |||||    || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||   | ||||||||| |    
T  25756578 gtcttccggtcattaaccaccttgtaatgagctcgggtgtcctcctcatagatcctgcagctattcactaaatcctgaaaaacttggacctgttggtatc 25756479  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  25756478 ctatcgccctcttaatgtc 25756460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 22436881 - 22437245
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||||    
T  22436881 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccatcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgtttgcactcag 22436980  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  22436981 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctcacccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 22437080  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||  | |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||     
T  22437081 ctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctatttggccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctgg 22437180  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||   ||| | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22437181 cccttagtctttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgca 22437245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27559232 - 27558814
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | | | ||||| |||||||       
T  27559232 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaagcacacgatgtcagcatgcttgcagtcagctaatg 27559133  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
      ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  27559132 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 27559033  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||| ||| ||||||||||| ||  | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  27559032 aggaacatgctttttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 27558933  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||  |||||||||  |  |||||||| |    
T  27558932 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcataaattctgcagctattctccaaatctggaaaaactcggatttgttggtatc 27558833  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  27558832 cgatcgccctcttaatgtc 27558814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 437
Target Start/End: Original strand, 21764980 - 21765242
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||  || |    
T  21764980 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctaattgc 21765079  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||     |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  21765080 ccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctcagtgttccactcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcata 21765179  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||  | ||||| || ||||| ||   ||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  21765180 gattttacagctgttcaccaaatcagcaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 21765242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18405213 - 18404980
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| || || |||  | | ||||| ||||    
T  18405213 ctaccagtagtcgacgccttcttaggcttcttgcactgagaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagcatactatatcctcatgtttgcactcag 18405114  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18405113 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttaacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtgaaacagacaat 18405014  T
Q  222 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgccta 252  Q
    || |||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  18405013 ctttgcaggagcatccttcttgttaggccgccta 18404980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10465960 - 10465750
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    || ||||| || ||    
T  10465960 cattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcc 10465861  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     || |||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  10465860 cttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatat 10465761  T
Q  376 atcctgcagct 386  Q
    |||||||||||    
T  10465760 atcctgcagct 10465750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 19438275 - 19438381
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  19438275 tcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctcctttcactcactaccttgtaataagccttcgtatcctcttcatagatcc 19438374  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  19438375 tacagct 19438381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 24367568 - 24367788
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||   |||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  24367568 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 24367667  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||| |||    
T  24367668 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttgata 24367767  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| || || || ||||||||    
T  24367768 gattctacacctgttaaccaa 24367788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Original strand, 19867699 - 19867823
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  19867699 ctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatgtttgcactcag 19867798  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccaca 146  Q
    |||   ||||||| |||||||||||    
T  19867799 ctagtgcatgacccttcttaccaca 19867823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Original strand, 19881670 - 19881776
Alignment:
Q  281 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcct 380  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  19881670 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactttgttgttccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 19881769  T
Q  381 gcagcta 387  Q
    |||||||    
T  19881770 gcagcta 19881776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 23081592 - 23081799
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaa-tcttctgtttcc 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||| ||||||||||  ||||   || |||| || || |    
T  23081592 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctt-tgctttc 23081690  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23081691 ctttatcagcagcagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcata 23081790  T
Q  375 gatcctgca 383  Q
     || |||||    
T  23081791 aattctgca 23081799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34642584 - 34642486
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  34642584 gcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcccttgaatcttcttcatagattctgcagcta 34642486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14376938 - 14376809
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||    
T  14376938 tctgttttcccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtc 14376839  T
Q  366 ctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14376838 ctcctcatagatcctgcagctactaaccaa 14376809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21566999 - 21566893
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |||| |||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |    
T  21566999 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 21566900  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  21566899 tacagct 21566893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18182408 - 18182293
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    |||||| | |||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||     
T  18182408 tgtttctccttatcagcaggagcacggtaaggcttaggatgactctgctgacctttacctttcctctcattcacaaccttctaatgagccttagtatccg 18182309  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| || |||||    
T  18182308 cctcataaattctgca 18182293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Original strand, 18797963 - 18798070
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |    
T  18797963 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttctgtgtcctcttcatagattc 18798062  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  18798063 tgcagcta 18798070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16924909 - 16924867
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaac 64  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16924909 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactgtgaac 16924867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 386
Target Start/End: Original strand, 19456284 - 19456402
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  19456284 tgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatcct 19456383  T
Q  368 cttcatagatcctgcagct 386  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19456384 cttcatatatcctgcagct 19456402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 386
Target Start/End: Original strand, 19466429 - 19466547
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  19466429 tgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatcct 19466528  T
Q  368 cttcatagatcctgcagct 386  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19466529 cttcatatatcctgcagct 19466547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 368
Target Start/End: Original strand, 19867915 - 19868017
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   || || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19867915 tctgtttgcccttatcagcaggggctctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtctgccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatc 19868014  T
Q  366 ctc 368  Q
    |||    
T  19868015 ctc 19868017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10466098 - 10466034
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  10466098 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtcc 10466034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Original strand, 15462500 - 15462546
Alignment:
Q  174 gcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaa 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  15462500 gcagacattactcttgtggcctttcgcaccacacttgtaacacacaa 15462546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 21474768 - 21474814
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21474768 acattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctc 21474814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Original strand, 19456188 - 19456237
Alignment:
Q  175 cagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  19456188 cagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctc 19456237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Original strand, 19466333 - 19466382
Alignment:
Q  175 cagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  19466333 cagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctc 19466382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 21833454 - 21833886
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21833454 aagcaaagaccctacgagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 21833553  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21833554 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 21833653  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833654 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 21833753  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21833754 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctccatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 21833853  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21833854 tagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 21833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33388236 - 33387804
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33388236 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 33388137  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33388136 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctccgggcaaacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 33388037  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388036 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 33387937  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  33387936 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaattcggaaaaactct 33387837  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33387836 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 33387804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 51330699 - 51330267
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  51330699 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 51330600  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  51330599 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctctctctccacaattg 51330500  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51330499 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctgacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 51330400  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330399 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 51330300  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  51330299 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 51330267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41350875 - 41350444
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  41350875 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaagcacacaatgtctgcacg 41350776  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350775 attgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 41350676  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350675 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 41350576  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41350575 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaaccaagtcctgaaaaactct 41350477  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41350476 cagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 41350444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 21842364 - 21842796
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  21842364 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 21842463  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21842464 cttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacatcggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattg 21842563  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842564 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 21842663  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21842664 tctgatgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactct 21842763  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21842764 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21842796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16347802 - 16347369
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  16347802 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaagcacacaatgtctgcacg 16347703  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347702 attacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 16347603  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347602 aagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 16347503  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc-aagtcctgaaaaactc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16347502 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaaatcctgaaaaactc 16347403  T
Q  410 tcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16347402 tcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16347369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 22400478 - 22400904
Alignment:
Q  17 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  22400478 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacgatgtccgtacgcttgca 22400577  T
Q  117 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacac 216  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  22400578 atccgctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcagggcagacattacttttatggcctttccctccacaattgaaacac 22400677  T
Q  217 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 316  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22400678 acaatctcagtagcatccatcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacagcttaggacgactctgct 22400777  T
Q  317 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctg 416  Q
     |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  22400778 ctcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccagaaaaactctaagctg 22400877  T
Q  417 ttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22400878 ttggcatccaatcgcccttttgatgtc 22400904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 19109528 - 19109953
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  19109528 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 19109627  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg--aaacac 216  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||  ||||||    
T  19109628 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgctttagtgacctttcacacaacaattgaaaaacac 19109727  T
Q  217 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 316  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19109728 acaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgtt 19109827  T
Q  317 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctg 416  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| | |||    
T  19109828 gtcccttgcccttcctctcattgacaatcttacagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcc-ggaaaactctaatctg 19109926  T
Q  417 ttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||    
T  19109927 ttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19109953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 262 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16354199 - 16354018
Alignment:
Q  262 atcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttg 361  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16354199 atcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcg 16354100  T
Q  362 tatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16354099 tatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16354018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21228740 - 21228328
Alignment:
Q  34 ggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgac 133  Q
    |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||  ||||    
T  21228740 ggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatttgac 21228641  T
Q  134 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---c 230  Q
    | ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  || | || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   |    
T  21228640 ccttcttgccacacctgacacatttcttgatctctacaagacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagc 21228541  T
Q  231 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttc 330  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||    
T  21228540 atccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttacccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttc 21228441  T
Q  331 ctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcg 430  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||  | ||||||||| || ||||    
T  21228440 tgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgcagctattaactaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcg 21228341  T
Q  431 ccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||| |||||    
T  21228340 ccctcttaatgtc 21228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24785056 - 24784677
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||   ||| ||||| |    
T  24785056 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaaacacacaatatcattacgcttgcagt 24784957  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    |||||||   |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24784956 cagctaccgtatgacccttcttgccacaccgggcacatttctttatctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagac 24784857  T
Q  219 aatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 315  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| | |||||| || ||||||||  |||||||     
T  24784856 aatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcagaggcactatagggcttagggagactctgt 24784757  T
Q  316 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  24784756 tggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctcctcatagattctacagctgttcaccaa 24784677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17042205 - 17041788
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||| |||||| |||||  | ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||    
T  17042205 gtagtaggcgtcctcttcggctgcttgcactgggaacttatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaa 17042106  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||| |     
T  17042105 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggataaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaa-aatctccga 17042007  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  17042006 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta 17041907  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||  || |||||||| |    
T  17041906 gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatc 17041807  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17041806 cgatcgccctcttgatgtc 17041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22435932 - 22435521
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | |||||||    
T  22435932 accctaccagtagtcggcgccctcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaat 22435833  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||    |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22435832 cagctaatgtatgacccttcttgccacatcggaaacatttctttacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagac 22435733  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||  |||| | | | |||||       |||| ||| ||  ||  ||||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  22435732 aatcttcgcaggagcatccttct-------cctatcattgaccattctctgttttcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 22435640  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||  ||||||||   | |||||    
T  22435639 cccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctacagttgttcaccaactcgggaaaaacttggatctgtt 22435540  T
Q  419 ggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22435539 ggtatccaatcgccctctt 22435521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20081572 - 20081223
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| || || ||||    
T  20081572 ctaccagtagtcggcgccttcttaggccgcgtacactgcgaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttacactcag 20081473  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
     ||    |||||| ||||| ||||| || | |||  |||| |  ||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  20081472 atagtgtatgacccttctttccacagcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 20081373  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| |||    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||     
T  20081372 ctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttaaggcgactctgctgg 20081273  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctc 368  Q
    || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  20081272 ccgttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctc 20081223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 387
Target Start/End: Original strand, 22401755 - 22402123
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  22401755 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 22401854  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||| | ||||| ||||| || | |||  ||||| | ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||    
T  22401855 ctagtgcatgatccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagaaaat 22401954  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
     |||||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  22401955 ttctgcaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctga 22402054  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    |||||   ||||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22402055 cccttagtcttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgcagcta 22402123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 21176686 - 21176906
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| |    
T  21176686 acattgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgc 21176785  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    | |||||||| |||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21176786 ccttatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcata 21176885  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| || || ||||| |||||    
T  21176886 gattctacaactattcaccaa 21176906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22496452 - 22496088
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  22496452 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaactaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatgtttgcactcag 22496353  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   | ||||| ||||||||||| || | |||  |||| |  ||  | || ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  22496352 ctagtgcgtgacccttcttaccacatcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcatcgctcttgtggcctttctcaccataattaaagcagacaat 22496253  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||  |||   ||||||||||| | ||||| |||   ||||  ||  ||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| ||     
T  22496252 ctcaacaggaacatccttcttccttggccgtctatactcgaccattctctgttttcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctggtgg 22496153  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22496152 cccttcgtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 22496088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 16379504 - 16379621
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16379504 tctgtttgcccttatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatc 16379603  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  16379604 ctcctcataaatcctgca 16379621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 48426223 - 48426443
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  48426223 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 48426322  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  48426323 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 48426422  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  48426423 gattctgcacctattaaccaa 48426443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20074749 - 20074550
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    ||||||  || ||||| ||| |||  ||||    |||||||| || |    
T  20074749 acattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacacacaatctcagtgggagcatctctcctcttaagcctcctgtcatcactcatcttctgctttc 20074650  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  20074649 ctttgtcagcagaagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 20074550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 37680399 - 37680619
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||| |   ||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  37680399 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagtatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 37680498  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  37680499 ctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 37680598  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  37680599 gattctgcacctattaaccaa 37680619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 336
Target Start/End: Original strand, 52989091 - 52989252
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  52989091 acattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttc 52989190  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctca 336  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  52989191 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccctcctctca 52989252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 20297733 - 20297953
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||  ||||    ||||||||||| |    
T  20297733 acattactcttgtggcatttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctgtcatcacccatcttctgttttc 20297832  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    | || ||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  20297833 ccttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgatgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 20297932  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
     || || || || ||||||||    
T  20297933 aattctacacctgttaaccaa 20297953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 21752457 - 21752574
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  21752457 tctgttttcccttatcagcagtggcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatc 21752556  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
     || ||||| ||||||||    
T  21752557 ttcctcataaatcctgca 21752574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 21961377 - 21961576
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || |||| || | |||| ||||    |||||||| || |    
T  21961377 acattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttc 21961476  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  21961477 ctttgtcagaaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 21961576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 365
Target Start/End: Original strand, 22117126 - 22117223
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  22117126 tgttttcccttatcagcaggaacactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcaaaaccttgtaatgagccttagtatc 22117223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31537037 - 31536838
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| | ||   ||||  || |||| || | |||| ||||    ||| |||| || |    
T  31537037 acattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcctctgctttc 31536938  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  31536937 ctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 31536838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22015680 - 22015574
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  22015680 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtccctttcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtaacttcttcatagatcc 22015581  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  22015580 tacagct 22015574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21742478 - 21742380
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21742478 gcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 21742380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 378
Target Start/End: Original strand, 19857621 - 19857827
Alignment:
Q  175 cagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtt 271  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    | ||||||  || ||||||||| |||  ||||    | | |||| |    
T  19857621 cagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcggtagaagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgct 19857720  T
Q  272 tccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttc 371  Q
    | || || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19857721 tacccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagccttagtatcctcttc 19857820  T
Q  372 atagatc 378  Q
    |||||||    
T  19857821 atagatc 19857827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 383
Target Start/End: Original strand, 20921860 - 20921966
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| |||||| | ||| | ||  | ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20921860 ttatcagcgggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgattcttacccttcttttcacttacagctttgtaatgtgctttggtatcctcttcataga 20921959  T
Q  377 tcctgca 383  Q
    | |||||    
T  20921960 ttctgca 20921966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 37680275 - 37680345
Alignment:
Q  54 acactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagcta 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  37680275 acactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagcta 37680345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 21176597 - 21176670
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21176597 gtagtaggcgtcctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaat 21176670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21738953 - 21738864
Alignment:
Q  298 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21738953 ggcttcggacgactctgttgtcccttacctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 21738864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24096654 - 24096609
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24096654 cattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctc 24096609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17671600 - 17671168
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17671600 aagcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 17671501  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17671500 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccagacacacttcttgatttcctccgggcagacattgcttttgtggcctttctcaccacaattg 17671401  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671400 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 17671301  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17671300 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 17671201  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17671200 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17671168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20015841 - 20015409
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20015841 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 20015742  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20015741 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttactcttgtggcccttctcaccacaattg 20015642  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20015641 aaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 20015542  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20015541 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactct 20015442  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20015441 cagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 20015409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 19115603 - 19116035
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19115603 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctctttggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 19115702  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19115703 attgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcgccacaattg 19115802  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19115803 aagcacacaacctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 19115902  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115903 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 19116002  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19116003 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19116035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 18859780 - 18860212
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  18859780 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacacacaatgtctgtacg 18859879  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18859880 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggcctttcccaccacaattg 18859979  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859980 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcccctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 18860079  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18860080 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctattaaccaaatccggaaaaactct 18860179  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18860180 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 18860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19481650 - 19481219
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  19481650 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaagcacacaatgtctgcacg 19481551  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481550 attgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 19481451  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481450 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 19481351  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19481350 tctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaaccaagtcctgaaaaactct 19481252  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19481251 cagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 19481219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22126537 - 22126105
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  22126537 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgactttctccattgcagttaaaacacacaatgtctgtacg 22126438  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22126437 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcaaggaagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 22126338  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126337 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 22126238  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22126237 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 22126138  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22126137 aagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22117753 - 22117321
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  22117753 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 22117654  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22117653 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacgattg 22117554  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22117553 aaacacacaatctctatagcatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagtgggggcactgtacggcttaggacgac 22117454  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22117453 tttgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 22117354  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22117353 aagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22117321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 22043047 - 22043465
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  22043047 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 22043146  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc--- 224  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||       
T  22043147 tatgacccttcttgccacaccgaacacatttcttgatctcttctggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagt 22043246  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || || ||||  |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22043247 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggcccttg 22043346  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||  | ||||||||| |    
T  22043347 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcatctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatc 22043446  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  22043447 cgatcgccctcttaatgtc 22043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30310705 - 30310287
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  |||| || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  30310705 gtagtaggcgccttcttcggctgcttacattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 30310606  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  30310605 tatgacccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgc 30310506  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  30310505 aggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttg 30310406  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||  | |||||||  || |||||||| |    
T  30310405 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagattctgcaactattcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatc 30310306  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
      |||||||||||||||||    
T  30310305 tgatcgccctcttgatgtc 30310287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 15536603 - 15537021
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||    || ||||||||||||||||    
T  15536603 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacagtatcatttcgcttgcaatcagctacaa 15536702  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc--- 224  Q
     |||||| || || |||||||||||||| |||||||| || | ||| || ||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||| | ||||||       
T  15536703 tatgaccctttttgccacaccggacacatttcttgatctctttaggacaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccga 15536802  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| || || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15536803 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcggcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 15536902  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||||||| || || ||  | |||||||  || |||||||| |    
T  15536903 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatc 15537002  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15537003 cgatcgccctcttgatgtc 15537021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 443
Target Start/End: Original strand, 32603449 - 32603783
Alignment:
Q  112 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32603449 ttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttga 32603548  T
Q  212 aacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 308  Q
    |||| ||||| ||    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||  |||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  32603549 aacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcg 32603648  T
Q  309 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaact 408  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||    
T  32603649 actctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaact 32603748  T
Q  409 ctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |  || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  32603749 cggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 32603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18881224 - 18880860
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  18881224 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 18881125  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| |||||  | | |||  ||||| | ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  18881124 ctagtgcatgacccttctttccacagtgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaat 18881025  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
     | |||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  18881024 ttttgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctga 18880925  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||   ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18880924 cccttagtcttccgctcattcactatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgca 18880860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 19981181 - 19981545
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   | | ||||| ||||    
T  19981181 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattatgtttgcactcag 19981280  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttc-ctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaa 220  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  | || |  || ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  19981281 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatcttttcacctctctc-ggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagaagacaa 19981379  T
Q  221 tctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 317  Q
    |||| ||||   ||||||||||| | || |||||| | ||||  ||| ||| ||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  19981380 tctcagcaggaacatccttcttccttggtcgcctatcttcgaccatcctctatttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctg 19981479  T
Q  318 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
     |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  19981480 gcccttagtcttccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 19981545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 257
Target Start/End: Original strand, 22031323 - 22031554
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  22031323 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccttcttcattacaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 22031422  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---c 224  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || | ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||   |    
T  22031423 tatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctctttaggacaaacattgctcttatggccttt-tcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 22031521  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatc 257  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22031522 tggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 22031554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21391439 - 21391064
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | |    
T  21391439 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatg 21391340  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||       
T  21391339 tttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaa 21391240  T
Q  211 aaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggac 307  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||  ||| ||| || |||||| |  ||||||| || |||||||| |    
T  21391239 aaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggc 21391140  T
Q  308 gactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  21391139 gactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21391064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21780765 - 21780390
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   | |    
T  21780765 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatatcatcatg 21780666  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||       
T  21780665 tttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaa 21780566  T
Q  211 aaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggac 307  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||  ||| ||| || |||||| |  ||||||| || |||||||| |    
T  21780565 aaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggc 21780466  T
Q  308 gactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  21780465 gactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21780390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21164105 - 21163679
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||  | || || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||    
T  21164105 ctaccagtagttggcgccttcttaggttgcttgcattgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattacagttgcaatcag 21164006  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcct--------cagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaa 213  Q
    | |   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || || |        || | ||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  21164005 ccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctttatctctccatgacaagcattgctcttgtggtctttctcgccacaattaaaa 21163906  T
Q  214 cacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || |||||||| ||||   ||||||||||| | || || ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  21163905 cagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggtcgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgac 21163806  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    | || || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||    |||||||     
T  21163805 tttgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcg 21163706  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
     | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  21163705 gatctgttggtatccaattgccctctt 21163679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29300750 - 29300626
Alignment:
Q  262 atcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttg 361  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  29300750 atcttctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagcttttg 29300651  T
Q  362 tatcctcttcatagatcctgcagct 386  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||    
T  29300650 tgtcctcctcatatatcctgcagct 29300626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16268772 - 16268415
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 140  Q
    |||| |||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  ||| ||||| |||||||    |||||| ||||     
T  16268772 tcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctaggctatgacccttctg 16268673  T
Q  141 accacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttc 237  Q
    |||||||| ||  |||||| |    || | |   || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  ||    
T  16268672 accacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctc 16268573  T
Q  238 ttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcat 337  Q
    |||||||||| |||  ||||    |||||||| || ||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||     
T  16268572 ttcttaggcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaagagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcac 16268473  T
Q  338 tcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||  ||||| ||||| || || || |||||||| || || || |||||||||||    
T  16268472 tcattatattgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacaactattaaccaa 16268415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 383
Target Start/End: Original strand, 21671787 - 21672093
Alignment:
Q  80 cattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagac 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |   ||||| |||||||   ||||||| || |||||||| || | |||| |||| |  ||| |||| ||  |    
T  21671787 cattgcaattaaagcacacaatatcatcatctttgcactcagctagtgcatgaccctttttaccacagcgaaaacacctcttcacatccccaggacaagc 21671886  T
Q  180 attgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccct 276  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||  |||  |||||| |||| |  ||  ||||||| ||     
T  21671887 attactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagagcgcctatcatctaccattctctgtttaccc 21671986  T
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| | |||||| ||||| |    
T  21671987 ttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggcatcctcctcataaa 21672086  T
Q  377 tcctgca 383  Q
    |||||||    
T  21672087 tcctgca 21672093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22421251 - 22421096
Alignment:
Q  228 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 327  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||| |  ||  ||||||| || |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |     
T  22421251 agcatctttcttcctaggccgcctctcatcaaccattctctgtttgcccttattagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgact 22421152  T
Q  328 ttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22421151 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgca 22421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Original strand, 22523973 - 22524088
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  22523973 tgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcct 22524072  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | | ||| ||||||||    
T  22524073 ccttataaatcctgca 22524088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 380
Target Start/End: Original strand, 19985550 - 19985755
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||  |||| |  ||| ||||||| |    
T  19985550 acattactcttgtggcttttttcgccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcaatcatcctctgtttac 19985649  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    | || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19985650 ccttgtccgcaggggcactatacggcttcggacgactctgctatcccttgccactgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcata 19985749  T
Q  375 gatcct 380  Q
     |||||    
T  19985750 tatcct 19985755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 28984281 - 28984501
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||   || ||||||  || |||| |||| |||| ||||    ||| |||| || |    
T  28984281 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttc 28984380  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    | || || || || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  28984381 ccttgtccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 28984480  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
     ||||| || || ||||||||    
T  28984481 aatcctacacctgttaaccaa 28984501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 386
Target Start/End: Original strand, 21928889 - 21929009
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||    
T  21928889 tctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggacgactctgttgtcccttacctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatc 21928988  T
Q  366 ctcttcatagatcctgcagct 386  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  21928989 ctcttcatagattctacagct 21929009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22027586 - 22027483
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  22027586 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttaccacttcgctcactcatcaccttataatgatcttttgtgtcctcctcatagatcc 22027487  T
Q  380 tgca 383  Q
    ||||    
T  22027486 tgca 22027483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 323
Target Start/End: Original strand, 22054335 - 22054381
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22054335 ttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtccctt 22054381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 386
Target Start/End: Original strand, 3274589 - 3274686
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagct 386  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  || ||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3274589 gcactgtaaggctttggacgactttgctggcctttacctctcttctcattcactattttgtaatgagctcttgtatcctcctcatagattctgcagct 3274686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17830204 - 17830113
Alignment:
Q  352 tgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||  | |||||||  |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  17830204 tgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttgatatccgatcgcactcttgatgtc 17830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 387
Target Start/End: Original strand, 22374332 - 22374451
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22374332 tgtttacctttgacagcaggggcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcct 22374431  T
Q  368 cttcatagatcctgcagcta 387  Q
    | | ||||||||| ||||||    
T  22374432 cctgatagatcctacagcta 22374451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 12479737 - 12480169
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  12479737 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 12479836  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12479837 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttatggcctttctcaccacaattg 12479936  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479937 aaacacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 12480036  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12480037 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 12480136  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12480137 cagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 12480169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17092024 - 17091592
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  17092024 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 17091925  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091924 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 17091825  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091824 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 17091725  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17091724 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactct 17091625  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17091624 cagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 17091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19775660 - 19775236
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19775660 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaat 19775561  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19775560 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaatcacac 19775461  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775460 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 19775361  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19775360 cccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgtt 19775261  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  19775260 gatacccaatcgccctcttgatgtc 19775236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 23958884 - 23959316
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  23958884 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatatctgtacg 23958983  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958984 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 23959083  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959084 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 23959183  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23959184 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 23959283  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23959284 cagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 23959316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8050498 - 8050066
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8050498 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtctgtacg 8050399  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8050398 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcccttctcaccacaattg 8050299  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8050298 aaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 8050199  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8050198 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactct 8050099  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050098 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 8050066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 27714473 - 27714905
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27714473 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttagactgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgtacg 27714572  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714573 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 27714672  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714673 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 27714772  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27714773 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 27714872  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27714873 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27714905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14300854 - 14300422
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14300854 aagcaaagactctacctgtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtccgtacg 14300755  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14300754 attgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcaaggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaattg 14300655  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14300654 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 14300555  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14300554 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcttgaaaaactct 14300455  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14300454 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 14300422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 8389549 - 8389981
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  8389549 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 8389648  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389649 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 8389748  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389749 aagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 8389848  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8389849 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaatcctgaaaaactct 8389948  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8389949 cagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 8389981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16233867 - 16233435
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  16233867 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 16233768  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233767 gttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 16233668  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233667 aagtacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 16233568  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16233567 tctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcttcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 16233468  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16233467 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16233435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 19635273 - 19635705
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  19635273 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 19635372  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19635373 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggcctttcccaccacaattg 19635472  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19635473 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacaac 19635572  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19635573 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactattaaccaaatccggaaaaactct 19635672  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635673 cagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 19635705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 40476177 - 40476609
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  40476177 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggccgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 40476276  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40476277 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacactgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 40476376  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40476377 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 40476476  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40476477 tccgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactct 40476576  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476577 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 40476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 14683712 - 14684136
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  14683712 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 14683811  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14683812 cagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacatagcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacac 14683911  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14683912 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgctgt 14684011  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||    
T  14684012 cccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcaactattgaccaaatctggaaaaactctaatctgtt 14684111  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  14684112 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 14684136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 437
Target Start/End: Original strand, 13513500 - 13513916
Alignment:
Q  24 accagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagct 123  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||    
T  13513500 accagtagtaggcaccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagct 13513599  T
Q  124 acaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct 223  Q
    | || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13513600 ataatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatct 13513699  T
Q  224 ctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcc 320  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||  |||| || || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  13513700 ctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcc 13513799  T
Q  321 cttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttgg 420  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||  | |||||||    
T  13513800 cttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttgg 13513899  T
Q  421 tacccaatcgccctctt 437  Q
    || || |||||||||||    
T  13513900 tatccgatcgccctctt 13513916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18604593 - 18604259
Alignment:
Q  112 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattga 211  Q
    |||||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  18604593 ttgcaatcagctacaataagaccctttttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttaa 18604494  T
Q  212 aacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 308  Q
    |||| | ||||||    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| || || |||||||| |||||| | || |||||||| ||    
T  18604493 aacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagggcg 18604394  T
Q  309 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaact 408  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||    
T  18604393 actctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaact 18604294  T
Q  409 ctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |  || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  18604293 cggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 18604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 123 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18224236 - 18223967
Alignment:
Q  123 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 222  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18224236 tacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatc 18224137  T
Q  223 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 319  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  18224136 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggc 18224037  T
Q  320 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctatt 389  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18224036 ccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctatt 18223967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16248384 - 16248122
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||  |    
T  16248384 acattactcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgttggc 16248285  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  16248284 ccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctccttata 16248185  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  | ||||||||| |  |||||||||||    
T  16248184 gatcctgcagctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctctt 16248122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16350397 - 16350188
Alignment:
Q  228 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  16350397 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtc 16350298  T
Q  328 ttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaa 427  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||  |||||||||  | ||||||||| ||||    
T  16350297 ttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaa 16350198  T
Q  428 tcgccctctt 437  Q
    | ||||||||    
T  16350197 ttgccctctt 16350188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 443
Target Start/End: Original strand, 7357434 - 7357839
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 140  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||| |   ||||| ||||     
T  7357434 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttgcattcagctaaattgtgacccttctg 7357533  T
Q  141 accacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttc 237  Q
    |||||||| ||  |||||| |    || | |    | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||   ||||  ||    
T  7357534 accacacctgaagcacttcctctcatctttaccataaacattgctcttgtggcctttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctc 7357633  T
Q  238 ttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcat 337  Q
     |||| |||| |||| ||||    |||||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||     
T  7357634 ctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcac 7357733  T
Q  338 tcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
    ||| || |||||| |||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| ||   ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||    
T  7357734 tcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatacccaatagctctttt 7357833  T
Q  438 gatgtc 443  Q
    ||||||    
T  7357834 gatgtc 7357839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3261762 - 3261542
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  3261762 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 3261663  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  3261662 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 3261563  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  3261562 gattctgcacctattaaccaa 3261542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 356
Target Start/End: Original strand, 20893335 - 20893516
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  20893335 acattgctcttgttgcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttc 20893434  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagc 356  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||    
T  20893435 ctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagc 20893516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 14162618 - 14162982
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||   | | || || ||||    
T  14162618 ctaccagtagtctgcgccttcttaggctgtttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaacatcttcatgcttacactcag 14162717  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    | |    |||||||||||||||||| || | |||  |||| |  ||| |||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||    | || |||||    
T  14162718 caagtgtatgacctttcttaccacagcgaaaacatctcttcacatccccaggacaagcatcactcttgtggcctttcacaccacaagcatagcagacaat 14162817  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||  |||   |||| ||| |  |||| |||||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14162818 ctcaacaggagcatctttccttctagggcgcctatcctcgaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgt 14162917  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||  | |||   || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  14162918 cccttaactttctgttcgttcacaaccttgtagtgagccttagtatccttttcataaatcctgca 14162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15144565 - 15144448
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  15144565 tctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatc 15144466  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| || || ||||||||    
T  15144465 ctcctcgtaaatcctgca 15144448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 369
Target Start/End: Original strand, 14697507 - 14697599
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctct 369  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  14697507 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttggtatcctct 14697599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Original strand, 18259850 - 18259957
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||  |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  18259850 tcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagattttgtatcttcttcatagatcc 18259949  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    || |||||    
T  18259950 tgtagcta 18259957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29450642 - 29450285
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttctt 140  Q
    |||| |||| || |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||  | || |||||||||  ||| ||||| ||||||| |   ||||| ||||     
T  29450642 tcttcggctcaggacactgtgaactgatgtgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctg 29450543  T
Q  141 accacaccggacacacttcttg--atttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catcct 235  Q
    |||||||| || ||||||| |   || |||||    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||      
T  29450542 accacacctgaaacacttcctatcatctcctcca--caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctc 29450445  T
Q  236 tcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctc 335  Q
    || ||||||||| |||| ||||    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  29450444 tcctcttaggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctc 29450345  T
Q  336 attcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    | |||  | ||| || ||||| || || || |||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  29450344 actcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattttgcacctattaaccaa 29450285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15144759 - 15144677
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  15144759 accctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaat 15144677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16250666 - 16250572
Alignment:
Q  70 tgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgat 164  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16250666 tgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcaactacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgat 16250572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 44658834 - 44658614
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| |||     |||||||| || |    
T  44658834 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatgacccatcttctgctttc 44658735  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| || || || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  44658734 ctttgtccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 44658635  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| || || || ||||||||    
T  44658634 gattctacacctgttaaccaa 44658614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 8431 - 8548
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  8431 tctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatc 8530  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  8531 ctcctcataaattctgca 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11204200 - 11204001
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| | ||   ||||  || |||| || | |||| ||||    |||||||  || |    
T  11204200 acattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctactttc 11204101  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  11204100 ctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 11204001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 387
Target Start/End: Original strand, 16151029 - 16151152
Alignment:
Q  264 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgta 363  Q
    |||||| || ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| |||||     
T  16151029 cttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtg 16151128  T
Q  364 tcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  16151129 tcctcctcatagattctgcagcta 16151152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 387
Target Start/End: Original strand, 16155175 - 16155298
Alignment:
Q  264 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgta 363  Q
    |||||| || ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| |||||     
T  16155175 cttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtg 16155274  T
Q  364 tcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  16155275 tcctcctcatagattctgcagcta 16155298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15653 - 15536
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  15653 tctgtttacccttatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatc 15554  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  15553 ctcctcataaattctgca 15536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 387
Target Start/End: Original strand, 15073754 - 15073875
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  15073754 tctgtttaactttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactcagctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatc 15073853  T
Q  366 ctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  15073854 ctcttcatagatcctacagcta 15073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 386
Target Start/End: Original strand, 16219585 - 16219703
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||| | ||| || ||| |||| ||||| |    
T  16219585 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatctt 16219684  T
Q  368 cttcatagatcctgcagct 386  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  16219685 ccacatagattctgcagct 16219703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 386
Target Start/End: Original strand, 16222905 - 16223023
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||| | ||| || ||| |||| ||||| |    
T  16222905 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatctt 16223004  T
Q  368 cttcatagatcctgcagct 386  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  16223005 ccacatagattctgcagct 16223023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14993230 - 14993127
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||  ||||||||||||| || |    
T  14993230 tcagcaggggcactatacggcttcagacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcatatcctcttcataaattc 14993131  T
Q  380 tgca 383  Q
    ||||    
T  14993130 tgca 14993127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 15073663 - 15073709
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15073663 acattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctc 15073709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 22413 - 22845
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  22413 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 22512  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 22612  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22613 aaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 22712  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22713 tctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 22812  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22813 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 7402 - 7834
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  7402 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaacaatgtctgtacg 7501  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7502 gttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattg 7601  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7602 aaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 7701  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7702 tctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactct 7801  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7802 cagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 7834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 3590 - 4022
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3590 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacacacaatgtccgtacg 3689  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3690 cttgcattcagctacaataggacctttcttaccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 3789  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790 aaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 3889  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3890 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataggtcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactct 3989  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3990 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 4022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 17343 - 17760
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |   |||||||||| |    
T  17343 gtagtaggcgccctcttaggttgtttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacgctaaaaatcagctacta 17442  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17443 tatgacccttattgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgc 17542  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  17543 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctatgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 17642  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||||| |    
T  17643 gtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 17742  T
Q  425 caatcgccctcttgatgt 442  Q
    | || |||||||| ||||    
T  17743 cgattgccctcttaatgt 17760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 10540 - 10965
Alignment:
Q  17 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  10540 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccattgcagttaaaacacataatgtccgtacgcttgca 10639  T
Q  117 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacac 216  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10640 ttcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacac 10739  T
Q  217 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 316  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10740 acaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgct 10839  T
Q  317 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctg 416  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  10840 gtcccttgcccttcccctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcc-ggaaaactctaagctg 10938  T
Q  417 ttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10939 ttggtatccaatcgccctcttgatgtc 10965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 41321 - 41753
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  41321 aagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 41420  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41421 cttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgctctcttcaggacaaacattgcttttgtggcctttcccaccacaattg 41520  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  41521 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttattagcaggggcaatgtacggcttaggacaac 41620  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  41621 tctgctgtccattgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtattctcttcatagatcctgcagctattgaccaaattcggaaaaactct 41720  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41721 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 41753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13244 - 12881
Alignment:
Q  29 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||     
T  13244 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaat 13145  T
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc- 227  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||     
T  13144 atgacccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgca 13045  T
Q  228 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
      ||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||  |||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||     
T  13044 ggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttgg 12945  T
Q  326 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctatt 389  Q
     |||| ||||||| || | |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12944 tcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctatt 12881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 21163 - 21578
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  21163 aagcaaagaccctactagtagtcggcgtcctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 21262  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21263 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 21362  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||                 | |||||||||||||||||||||||||    
T  21363 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactgtacggcttaggacgac 21445  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21446 tctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccggaaaaactct 21545  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21546 aagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 11635 - 12050
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  11635 aagcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 11734  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11735 cttgcattcagctacaatatgacctttcttgcgacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaattg 11834  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||                 | |||||||||||||||||||||||||    
T  11835 aaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactgtacggcttaggacgac 11917  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  11918 tctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccggaaaaactct 12017  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12018 aatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 443
Target Start/End: Original strand, 55170 - 55602
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| || |||||||||  |||    
T  55170 aagcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacatacaatgtcctgacg 55269  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     |||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  55270 cttgcaatcagatactatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggccttttccaccacagttg 55369  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    || |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55370 aagcacacaatttcagaaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgac 55469  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||    
T  55470 tctgttgtcctttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaaccaaatccggaaaaatcct 55569  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     | |||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  55570 aatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 55602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 8432 - 8856
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  8432 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcatcattgtagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaat 8531  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8532 cagctacaatatgacccttcttgccacactggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctctcccaccacaattgaaacacac 8631  T
Q  219 aatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8632 aatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagttggggcactgtacggcttaggacgactctgatgt 8731  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  8732 cccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgtt 8831  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  8832 ggtatccaatcgccctcttaatgtc 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Original strand, 104 - 524
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  104 aagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgtacg 203  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  204 cttgcaatcagctacaaaatgacccttcttgccacaccggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggcctttcccaccataattg 303  T
Q  211 aaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 310  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||           |||||||||||||||    
T  304 aaacacacaatttcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttcccttcatcagc-----------acggcttaggacgac 392  T
Q  311 tctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactct 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  393 tctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctacagatattgaccaaatctggaaaaactct 492  T
Q  411 cagctgttggtacccaatcgccctcttgatgt 442  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  493 aagctgttggtatccaatcgccctcttaatgt 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 443
Target Start/End: Original strand, 424482 - 424909
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  424482 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactgatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtcctcacgcttgcaat 424581  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  424582 cagctacaatatgacccttcttgccacatcggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggcctttcacaccacagttgaagcacac 424681  T
Q  219 aatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 315  Q
    ||||||    | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  424682 aatctcagtaggagcacccttcttcgtaggccgcctatcatcgaccatattttgtttccctttatcagcaggggcattgtacggcttaggacgactatgc 424781  T
Q  316 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagct 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  424782 tgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctattaaccaaatccagaaaaactctaatct 424881  T
Q  416 gttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||    
T  424882 gttgatatccaatcgccctcttaatgtc 424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Original strand, 203819 - 203922
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  203819 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcc 203918  T
Q  380 tgca 383  Q
    ||||    
T  203919 tgca 203922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 48837 - 49263
Alignment:
Q  17 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||   ||| |||||    
T  48837 agaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatttgtccctcttcattgcagttaaaacatacaatgtcttgacgcttgca 48936  T
Q  117 atcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacac 216  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  48937 atcagctactatatgacccttcttgccacattggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggcctttcccaccatagttgaaacac 49036  T
Q  217 acaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgct 316  Q
    | ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49037 aaaatttcagaagcatccttcttcttaggccgcctatcatcggccattctctgtttccctttatcagtaggggcattgtacggtttaggacgactctgct 49136  T
Q  317 gtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctg 416  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||  || | |||    
T  49137 gtcccttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaaccaaatccgtaaaaatcctaatctg 49236  T
Q  417 ttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | | | ||||||||||||||| |||||    
T  49237 tcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 49263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 230 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 107693 - 107480
Alignment:
Q  230 catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  107693 catctttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgccctt 107594  T
Q  330 cctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatc 429  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  107593 cctctcattcactatctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatc 107494  T
Q  430 gccctcttgatgtc 443  Q
     |||||||||||||    
T  107493 tccctcttgatgtc 107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 8548 - 8755
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||   || ||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||| ||||||| ||    
T  8548 cattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttcttctttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcc 8647  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  8648 cttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataa 8747  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    || |||||    
T  8748 attctgca 8755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 229973 - 229555
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | |||||||||||||  |    
T  229973 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcattaagcttgcaatcagctatta 229874  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  229873 tatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgc 229774  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||     
T  229773 aggagcatccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggtcctta 229674  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||||| |    
T  229673 gtcttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 229574  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
      ||||||||||| |||||    
T  229573 tgatcgccctcttaatgtc 229555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 251961 - 252163
Alignment:
Q  187 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcag 283  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |   ||||||  || |||| |||| |||| ||||    ||||| ||||| ||| |  |||    
T  251961 ttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttatgttttcctgtggcag 252060  T
Q  284 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    | || |||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||    
T  252061 caggagcactgtaaggtttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgca 252160  T
Q  384 gct 386  Q
    |||    
T  252161 gct 252163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 33 - 450
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  33 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 132  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---c 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||   |    
T  133 catgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcaac 232  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  233 tggagcatccctcttcttagggcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggctta-gacgactctgctggcccttg 331  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||  | |||||||  ||||||||||| |    
T  332 gtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagcctttgtttcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatc 431  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | |||||||||||||||||    
T  432 cgatcgccctcttgatgtc 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 139641 - 139313
Alignment:
Q  118 tcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaca 217  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  139641 tcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaag 139542  T
Q  218 caatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg 314  Q
     |||||| ||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  139541 taatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctg 139442  T
Q  315 ctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagc 414  Q
    ||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||  | |||| ||  |||    
T  139441 ctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagc 139342  T
Q  415 tgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||    
T  139341 tgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 189
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||    || ||||||||| ||||||    
T  601 gtagtaggcgccctctttggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattaaaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcatctacaa 502  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc--- 224  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||       
T  501 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgt 402  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  | ||||| || |||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  401 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcaggggcaatataaggcttagggcgactctgctggcccttg 302  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||  |||||||||  |  ||||| ||||    
T  301 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcttcatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacc 202  T
Q  425 caatcgccctctt 437  Q
    |||| ||||||||    
T  201 caattgccctctt 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 5181 - 5599
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  5181 gtagtaggtgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaaccacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 5280  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  5281 tatgacccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgc 5380  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5381 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 5480  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||  | ||||||||| |    
T  5481 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcatcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 5580  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  5581 cgatcgccctcttaatgtc 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15151 - 14750
Alignment:
Q  39 cctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttc 138  Q
    ||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||   ||| |||||||||||||| | |||||| |||    
T  15151 cctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaatcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttc 15052  T
Q  139 ttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatcct 235  Q
    || |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    | ||||||||    
T  15051 ttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatcct 14952  T
Q  236 tcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctc 335  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||    
T  14951 tcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctc 14852  T
Q  336 attcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctc 435  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| ||  |||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||    
T  14851 attcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctc 14752  T
Q  436 tt 437  Q
    ||    
T  14751 tt 14750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11466 - 11065
Alignment:
Q  39 cctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttc 138  Q
    ||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||   ||| |||||||||||||| | |||||| |||    
T  11466 cctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaatcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttc 11367  T
Q  139 ttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatcct 235  Q
    || |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    | ||||||||    
T  11366 ttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatcct 11267  T
Q  236 tcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctc 335  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||   ||| || || |||||   ||||| |||    
T  11266 tcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggtaactttgttggcccttagtcttccgctc 11167  T
Q  336 attcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctc 435  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| ||  |||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||    
T  11166 attcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctc 11067  T
Q  436 tt 437  Q
    ||    
T  11066 tt 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 437
Target Start/End: Original strand, 36675 - 37093
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  | || || |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||    
T  36675 ctaccagtagtcggcgccctcttaaactgcttgcattgagaaccaatatgaccctcttccttgcaattaaagcacacaatatcactacgcttgcaatcag 36774  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36775 ctaacgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacgat 36874  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||     
T  36875 ctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactctgctgg 36974  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||   ||||| |||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||  |||||||||  | |||||    
T  36975 cccttagtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgtt 37074  T
Q  419 ggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  37075 ggtatccaattgccctctt 37093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 14607 - 15025
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || || ||   ||| ||||||||||||||||    
T  14607 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcatacgatatcattacgcttgcaatcagctacaa 14706  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14707 tatgactcttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgc 14806  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   |||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14807 aggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttg 14906  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||  |||||||||  | ||||||||| |    
T  14907 gtcttccgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatc 15006  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  15007 cgatcgccctcttaatgtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Original strand, 5341 - 5456
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  5341 tgtttgcccttatcagcaggagcaccgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatctt 5440  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| || |||||    
T  5441 cctcatatattctgca 5456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14153 - 13733
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |    
T  14153 gtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacta 14054  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  14053 tacgacccttcttgccacacctgacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgc 13954  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||     
T  13953 aggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcatcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggccctta 13854  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt--ggta 422  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||  |||||||||  | |||||  ||||    
T  13853 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagatcctgcagctattcactaaatctggaaaaactcgaatctgttgcggta 13754  T
Q  423 cccaatcgccctcttgatgtc 443  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  13753 tccaatcgccctcttaatgtc 13733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 890 - 473
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||    || ||||||||||||||||    
T  890 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaa 791  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  790 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 691  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||   |||||    
T  690 tggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgtccttg 591  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||| || || |   | |||||||  || |||||||| |    
T  590 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagatcctgcagttattcactaaataagggaaaactcggagttgttggtatc 491  T
Q  425 caatcgccctcttgatgt 442  Q
    | ||||||||||||||||    
T  490 cgatcgccctcttgatgt 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10358 - 9996
Alignment:
Q  29 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||||||||     
T  10358 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgtgaaccaatgtgacc-tcttcattacaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaat 10260  T
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc- 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||| || ||     
T  10259 atgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgca 10160  T
Q  228 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  |||| || || ||||||||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||     
T  10159 ggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttgg 10060  T
Q  326 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctatt 389  Q
     || | ||||||| || | |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10059 tctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctgcagctatt 9996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13013 - 12651
Alignment:
Q  29 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||||||||     
T  13013 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgtgaaccaatgtgacc-tcttcattacaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaat 12915  T
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc- 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||| || ||     
T  12914 atgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgca 12815  T
Q  228 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  |||| || || ||||||||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||     
T  12814 ggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttgg 12715  T
Q  326 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctatt 389  Q
     || | ||||||| || | |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714 tctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctgcagctatt 12651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 383
Target Start/End: Original strand, 32053 - 32420
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||  || |||||||| ||   | | |||||||    
T  32053 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaacacacaatatcattatgtttgcaat 32152  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    ||||||   ||||||  |||||||||||||||| |||  | || |  ||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  32153 cagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagac 32252  T
Q  219 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 315  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  | ||||| || ||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||    
T  32253 aatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcaagggcgctatagggcttagggcgactctgc 32352  T
Q  316 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  32353 tggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgca 32420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 54814 - 55178
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||   ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  54814 ctactagtagccggcgccttcttaggcttcttacactacgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacacacaatatcatcatgtttgcactcag 54913  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    ||    ||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  |||  ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||   ||||| |||||    
T  54914 ctcgtgcatgacctttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccctaggacaaccattactcttgtggcccttctcacaataagaaaaacaaacaat 55013  T
Q  222 ct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||   | | ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||| ||||||| |  |||||||| |||||||| || |||||| | ||||| || ||     
T  55014 cttagcaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgctcttatcagcaggggcactataaggcttatggcgactttgttgg 55113  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    | |||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  55114 cacttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 55178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 37519 - 37715
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||  || |||||||| ||   | | |||||||    
T  37519 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaacacacaatatcattatgtttgcaat 37618  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaaca 215  Q
    ||||||   ||||||  |||||||||||||||| |||  | || |  ||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37619 cagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaaca 37715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 389
Target Start/End: Original strand, 63 - 426
Alignment:
Q  29 tagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaac 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||     
T  63 tagtaggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaat 162  T
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc- 227  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||     
T  163 atgacccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgca 262  T
Q  228 --agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
      ||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||  |||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||     
T  263 ggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttgg 362  T
Q  326 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctatt 389  Q
     |||| ||||||| || | |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  363 tcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctatt 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 437
Target Start/End: Original strand, 4 - 383
Alignment:
Q  61 gaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttct 160  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||    |||||||||||| |||| ||| | ||  ||||    
T  4 gaaccaatatgaccctcctcattgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaatcaactaatgtatgacctttcttgccacgccgaaaacttttct 103  T
Q  161 tgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatc 257  Q
    | |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  104 tcacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 203  T
Q  258 gaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcc 357  Q
    ||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  204 gaccattctctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagct 303  T
Q  358 tttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |   |||||||||  | |||||| || ||||| ||||||||    
T  304 ttggtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaattaggaaaaactcggatctgttgatatccaattgccctctt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7787 - 7363
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||| |    
T  7787 accctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcaccgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattaagtttgcact 7688  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacac 218  Q
    || |||   ||||||| ||||||||||| |||| | |  |||| |  || || || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  7687 catctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaatatctctttacctcttccggacaaatattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagac 7588  T
Q  219 aatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 315  Q
    |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7587 aatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgc 7488  T
Q  316 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagct 415  Q
    || || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||    |||||||  | ||    
T  7487 tggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatct 7388  T
Q  416 gttggtacccaatcgccctcttgat 440  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7387 gttggtaaccaattgccctcttgat 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15706 - 15288
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     | ||||||||||    
T  15706 ctaccagtagttggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccgatatgaccctcatcattgcaattgaagcacacaatgtcattgtgcttgcaatcag 15607  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  15606 ctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacacttctttgcctcctctggacaaaaattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagatgat 15507  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||     
T  15506 ctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagctggggcactatagggcttagggcaactctgctgg 15407  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    | |||   ||||| |||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||  |||||||||  | |||||    
T  15406 cgcttagtcttccactcatttacaacattgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactcagatctgtt 15307  T
Q  419 ggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  15306 ggtatccaattgccctctt 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Original strand, 171301 - 171641
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||||||||| |||| || || |||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  171301 gtagtaggcgccctcttcggctgcgtgcattgggaaccgatatgaccctcttcattacagttgaagcacgcaatatcattacgcttgcaatcagctacaa 171400  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---c 224  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||   |    
T  171401 tatgacctttcttgccacaccgaacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgtaacaagtaatctcaac 171500  T
Q  225 tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||  ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  171501 tggagcatccttcttctttggccgcctatcaacgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctgctggcccttg 171600  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  171601 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatc 171641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 21781 - 22145
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  21781 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatggttgcaatcag 21880  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || ||   ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21881 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 21980  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||  ||| ||||||| || |||  ||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||     
T  21981 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggcactatagggcttaagacgactcagctgg 22080  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22081 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 22145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 37205 - 37569
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  37205 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattatggttgcaatcag 37304  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || ||   ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37305 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 37404  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||  ||| ||||||| || |||  ||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||     
T  37405 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggcactatagggcttaagacgactcagctgg 37504  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  37505 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 37569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7900 - 7545
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | || || |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||   ||  ||||||||||||| ||    
T  7900 gtagtaggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacttttgcaatcagctataa 7801  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  7800 tatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgc 7701  T
Q  228 ---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
       || | |||| ||||| ||||||||| | ||||  ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  7700 aggagtagccttattctttggccgcctatcgtcgaccattctctatttgcctttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttg 7601  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcct 380  Q
      ||||| ||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  7600 gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcct 7545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 395
Target Start/End: Original strand, 291 - 667
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | ||||||||||    
T  291 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaactaatatgaccctcttctttgcaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcag 390  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |  || |  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  391 ctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctctttcggaaaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 490  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||     
T  491 ctcagcaggagcattcttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggagcactatagggcttagggcgactctgctgg 590  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  591 cccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcgtcataaattctacagctgttcaccaa 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36947 - 36526
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||| |    
T  36947 ctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattacggttgcaatcgg 36848  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    | |   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||  || ||   ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36847 ccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctgtatctctctaggacaagcattgctcttatggcctttctcgccacaattaaaacagacaat 36748  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||  ||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  36747 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctttgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctgg 36648  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    ||||| | ||||| || |||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||    |||||||  | |||||    
T  36647 cccttactcttccgctaattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcagatctgtt 36548  T
Q  419 ggtacccaatcgccctcttgat 440  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  36547 ggtatccaattgccctcttgat 36526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 410
Target Start/End: Original strand, 3 - 304
Alignment:
Q  112 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattga 211  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3 ttgcaatcagctaaagtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctttggacaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaatga 102  T
Q  212 aacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 308  Q
    |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  103 aacagacaatctccgcaagagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcg 202  T
Q  309 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaact 408  Q
    ||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||  ||||| || || || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||    
T  203 actctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtgatgagctttggtgtcttcctcataaatcctacagctgttcaccaaatcaggaaaaact 302  T
Q  409 ct 410  Q
    ||    
T  303 ct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 217 - 581
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||   | | ||||| ||||    
T  217 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattatgtttgcactcag 316  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggg-cagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaa 220  Q
    |||    |||||| ||||||||| | |||| |||  | || |  || ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  317 ctagtgaatgacccttcttaccaaatcggaaacatcttttaacctc-tcacggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaa 415  T
Q  221 tctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 317  Q
    |||| ||||   ||||||||||| | ||||||||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  416 tctcagcaggaacatccttcttccttggccgcctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctg 515  T
Q  318 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
     |||||   ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  516 gcccttagtcttccgctcatacacaaccttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgca 581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17476 - 17112
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||   | | ||||| ||||    
T  17476 ctaccagtagtcggcgcctgcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactcag 17377  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||    
T  17376 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaat 17277  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||||| ||   |||||||||||||||| || ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||     
T  17276 ctctgtaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttga 17177  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17176 cccttagctttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 17112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Original strand, 40496 - 40599
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  40496 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgttgtcccatacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctctttatagattc 40595  T
Q  380 tgca 383  Q
    ||||    
T  40596 tgca 40599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Original strand, 30464 - 30826
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||  | | ||| ||||| ||||||||||||  | | || || ||||    
T  30464 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctccgtacactgtgaaccaatatgaccttcctcttcgcagttaaaacacacaatgtccttatgcttacactcag 30563  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||    |||||| ||||||||||| || | |||  |||| |  ||  | || ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||    
T  30564 ctagtgtatgacccttcttaccacagcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcattgctcttgtggtctttctcaccacaattaaagcagacaat 30663  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30664 ctcagcaggaacatccttcttcttagaccgcctatcctcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgt 30763  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctg 381  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||||||    
T  30764 cccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcctcctcataaatcctg 30826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10285 - 10045
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||   | | || |||||||    
T  10285 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttacaatcag 10186  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10185 ctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctagacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaat 10086  T
Q  222 ctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcga 259  Q
    |||    | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10085 ctccgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcga 10045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 348 - 141
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||| ||    
T  348 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcc 249  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  248 cttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttctgacccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcatcataa 149  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    ||||||||    
T  148 atcctgca 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 122142 - 121885
Alignment:
Q  183 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcccttta 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||    
T  122142 gctcttgtggcctttttcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccctta 122043  T
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || |||||   | ||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  122042 tcagcaggggcactatagggcttagggcgactctattggcccttagtcgtccgctcatttacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattc 121943  T
Q  380 tgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||  | ||||||||| || || ||||||||    
T  121942 tgcagctattcaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctctt 121885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11778 - 11666
Alignment:
Q  274 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcat 373  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||  ||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  11778 cctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttctctcactcatcaccttataatgagccttagtgtcctcttcat 11679  T
Q  374 agatcctgcagct 386  Q
    | |||||||||||    
T  11678 atatcctgcagct 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1832 - 1711
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||    
T  1832 tctgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggatgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtatc 1733  T
Q  366 ctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
     |||||||| ||| ||| ||||    
T  1732 ttcttcatatatcatgctgcta 1711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3465
Alignment:
Q  28 gtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaa 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||       
T  3047 gtagtaggcgccctattaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaagcacacgatgtcagcatgtttgcaatcagctaatg 3146  T
Q  128 catgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc 227  Q
      ||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |  |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||    
T  3147 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttctccacctcctcaggacaagcagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaagaagtaatctcagc 3246  T
Q  228 ag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 324  Q
    ||   ||||||| ||||||||||| ||  | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  3247 aggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta 3346  T
Q  325 cccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacc 424  Q
      ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| | ||| || ||| || |||| ||||| ||  |||||||||  | ||||||||| |    
T  3347 gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctccttataaattctgtagttattcaccaaatctggaaaaactcggatctgttggtatc 3446  T
Q  425 caatcgccctcttgatgtc 443  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  3447 cgatcgccctcttaatgtc 3465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 8587 - 8952
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagta-cactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatca 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||   | | ||||| |||    
T  8587 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactca 8686  T
Q  121 gctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaa 220  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||| | |||  ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||    
T  8687 gctagagcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaa 8786  T
Q  221 tctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctg 317  Q
    |||| | || |   |||||||||||||| || ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  8787 tctcagtaggagtatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgttg 8886  T
Q  318 tcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
     |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8887 acccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatccttctcatagatcctgca 8952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30701 - 30349
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||  | ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | | ||||||||||    
T  30701 ctactagtagtcggcgccttcttagattgcttgcactgagaaccaatgtaaccctcttcattgcaattgaagcacacaaggtcattatgtttgcaatcag 30602  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30601 ctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctcctggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 30502  T
Q  222 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||   ||||||||||||| | |||||  || | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||||||     
T  30501 ctcagcaggagcatccttcttccttggccgtttatcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggtactatagggcctagggcgactctgctgg 30402  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttc 371  Q
    || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  30401 cctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttc 30349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43547 - 43216
Alignment:
Q  55 cactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacac 154  Q
    |||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||  | | ||    
T  43547 cactgtgaaccaatgtgacctttctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacctttcttaccacaatgaaaac 43448  T
Q  155 acttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcct 251  Q
    ||  ||| |  ||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| || ||   | |||| |||||||| ||||||||    
T  43447 accacttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatttcagcaagaccatctttcttcttgggccgcct 43348  T
Q  252 aacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtag 351  Q
    | |||| |  ||  ||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||  || |||   |||| ||||||||| | ||||||     
T  43347 atcatcaactattctctgtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagggcgactctgcttacctttggttttccgctcattcacaatcttgtat 43248  T
Q  352 tgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  43247 tgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 43216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 383
Target Start/End: Original strand, 69 - 432
Alignment:
Q  23 taccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagc 122  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||   | | ||||| |||||    
T  69 taccagtagtcggcgtcttcttaggcttcttgcactgggaaccaatgtgaccatcttcattacaattgaagcatactatatcatcatgtttgcactcagc 168  T
Q  123 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 222  Q
    ||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||    
T  169 tagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatc 268  T
Q  223 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 319  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |    
T  269 tctgcaggagcatccttcttctttggccgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgac 368  T
Q  320 ccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  369 ccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcatagatcctgca 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 384
Target Start/End: Original strand, 3303 - 3407
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  3303 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttataatgagctttcgtatcctcttcatatatcc 3402  T
Q  380 tgcag 384  Q
    |||||    
T  3403 tgcag 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Original strand, 101 - 463
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  | | ||| ||||  |||||||||||   | | || || ||||    
T  101 ctaccagtagtcggcaccttcttaggcttcgtacactgtgaactaatatgaccttcctcttcgcagttaagacacacaatgtctttatgcttacactcag 200  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||  |||| |  ||  |  | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  201 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacatctctttacctctcccagacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaat 300  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  301 ctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctattgt 400  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctg 381  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || || || ||||| ||||||    
T  401 cccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcatcctcataaatcctg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11007 - 10643
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||   | | ||||| ||||    
T  11007 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactcag 10908  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||    
T  10907 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctgttggtatccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaat 10808  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||||| ||  | ||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||     
T  10807 ctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctgtcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttttga 10708  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  10707 cccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgaatcttggtatcctcctcatagatcttgca 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 2166 - 2530
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||  | | ||||| ||||    
T  2166 ctaccagtagtctgcgcattcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaaacacacaatatcctcatgtttgcactcag 2265  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||| | || |  ||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||    
T  2266 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctattaacatccccatgacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcacacaat 2365  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| | ||   |||| ||||||||||| || ||| |||| |  ||  ||| ||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  2366 ctcagtaggaacatctttcttcttagggcgtctatcatcaaccattctctattttcccttatcagcaagggcactgtaaggcttaggacgactctgttga 2465  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||    
T  2466 cccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgca 2530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 11441 - 11804
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||   | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| || || || ||   | | ||||| ||||    
T  11441 ctaccagtagccggcaccttcttaggcttcttgcactgggaaccaatgtg-ccctcttcattgcaattaaaacatactatatcatcatgtttgcactcag 11539  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| || | ||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  11540 ctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacatccccaagacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaat 11639  T
Q  222 ctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||  ||||||| || |||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  11640 ctctgcatgagcatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggagcactgtaaggcttagggcgactctgctga 11739  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11740 cccttagctttccgctcattcacaatcttgaaatgagccttggtatcctcctcataaattctgca 11804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Original strand, 14261 - 14610
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||   | | || || ||||    
T  14261 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacatactatatcaacatgcttacactcag 14360  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||    |||||| ||||| ||||| || | |||  |||| |  ||| || | ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  14361 ctagtgtatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttaacatccccaagacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtaaaacagacaat 14460  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||  ||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||| |||||||| ||     
T  14461 ctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcattgaccattctctgtttgcccttatcagcagaggcactataaggcttagggcgactctgttga 14560  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctc 368  Q
    |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  14561 cccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctc 14610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 8400 - 8764
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  8400 ctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttccactgtgaaccaatgtgaccttcttcatcgcaattaaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 8499  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| || | |||| |||| |  |||  ||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||| | || || |||||    
T  8500 ctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacacctcttaacatccctaggacaagcattactcttgtggcctttctgaccacaagtaaagcagacaat 8599  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    || |||||   |||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||||||| || ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  8600 ctttgcaggagcatccttcttcttaggccgcctattatcgaccattctctgtttgcccttatcggcaagagcactgtaaggcttagggcgactctgctga 8699  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  8700 cccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaattctgca 8764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 383
Target Start/End: Original strand, 15077 - 15452
Alignment:
Q  11 aagcagagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacg 110  Q
    ||||| |||| |||||||||| || |||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    | |    
T  15077 aagcaaagactctaccagtagccgacgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatattatcatg 15176  T
Q  111 attgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattg 210  Q
     ||||| |||||||   ||| ||| ||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  ||| ||  |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  15177 tttgcactcagctagtgcataacccttcttcccacatcggaaacatctattggtatccctaggacaagcattacccttgtggcccttctcaccacaagaa 15276  T
Q  211 aaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggac 307  Q
    ||| | |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15277 aaaaaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggc 15376  T
Q  308 gactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||||||| || |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15377 gactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 15452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 17193 - 16775
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| ||||||||| | ||||| || || ||||| || ||   | | ||||| ||||    
T  17193 ctacccgtagtcggcgccctcttaggctgcttacactgggacccaatatgaccctcttctttgcagttgaaacacacgatatcaccatgcttgcagtcag 17094  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||     ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| |  ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17093 ctaatgtgtgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacagtgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaat 16994  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   ||||||| |||||||| ||  |  | ||||  ||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||     
T  16993 ctcagcaggaacatcctttttcttaggtcgtttctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatatggcttagggctactctgctgg 16894  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgtt 418  Q
    |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||   | |||||    
T  16893 cccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaactgggatctgtt 16794  T
Q  419 ggtacccaatcgccctctt 437  Q
    |||| || |||||||||||    
T  16793 ggtatccgatcgccctctt 16775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 194965 - 194883
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  194965 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcgtacactacgaaccaatgtgaccctccttattgcaattaaagcacacaatgtc 194883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 194784 - 194691
Alignment:
Q  230 catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  194784 catccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt 194691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21425 - 21297
Alignment:
Q  309 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaact 408  Q
    ||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||    
T  21425 actctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaact 21326  T
Q  409 ctcagctgttggtacccaatcgccctctt 437  Q
       | ||||||||| || |||||||||||    
T  21325 gggatctgttggtatccgatcgccctctt 21297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 50315 - 50108
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| ||    
T  50315 cattgcttttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcc 50216  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||||||| ||||| || || ||||||||  |||||||||  ||| |  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||     
T  50215 cttatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctgctagcccatagccttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaa 50116  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    ||||||||    
T  50115 atcctgca 50108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 50469 - 50390
Alignment:
Q  25 ccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtc 104  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  50469 ccagtagtcggcgcctttttaggcttcgtacattgtgaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtc 50390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 378
Target Start/End: Original strand, 43122 - 43234
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    | || | |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  43122 tctgtttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttgcctcggcgcttactcatcaccttgtaatgagcttttgtatc 43221  T
Q  366 ctcttcatagatc 378  Q
    ||| |||||||||    
T  43222 ctcatcatagatc 43234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1112 - 801
Alignment:
Q  129 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca 228  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||| | |    
T  1112 atgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctggacaaacaatgctcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagta 1013  T
Q  229 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||  | || |  ||| ||||| | |  |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || |||||      
T  1012 ggaacatccttcttcttaggccgtctttcctctaccatcctctgtgtgcgcttatcagcaggggcactatagggcttagggcaactctgttggcccttag 913  T
Q  326 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtaccc 425  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |   |||||||||  | ||||||||| ||    
T  912 tcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcatcatagattctacagctattcaccaaatatggaaaaactcggatctgttggtatcc 813  T
Q  426 aatcgccctctt 437  Q
    || |||||||||    
T  812 aaacgccctctt 801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9413 - 9220
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||  || |||| ||    
T  9413 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttctaaggccgcctatcttcgaccattctcggtttgcc 9314  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctct 369  Q
     |||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||    
T  9313 cttatcagcaggggcactataaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttcggctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctct 9220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 380
Target Start/End: Original strand, 9124 - 9485
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||   | | ||||| |||     
T  9124 ctaccagtagccggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcgtacaatatcatcatgtttgcactcaa 9223  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||    
T  9224 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaat 9323  T
Q  222 ctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    || |||   ||||||||||||||||||    ||| | ||||  ||| ||||||| || |||||| | |||||||| || || ||||  |||||||| ||     
T  9324 ctttgcaggagcatccttcttcttaggttatctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcaccaggggcactataaggattagcgcgactctgttga 9423  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcct 380  Q
    |||||  | |||| ||| ||||| | || ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  9424 cccttagctttccgctccttcacaatctagtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcct 9485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 368
Target Start/End: Original strand, 3728 - 4077
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   |   ||||| ||||    
T  3728 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatttttgcactcag 3827  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||||||||||||||| || | |||| |||| |  ||| |||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||| || |  | || |||||    
T  3828 ctagtgcatgacctttcttaccacaacgaaaacacctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggtctttcacaccataagtatagcagacaat 3927  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
     || ||||   |||| |||||||||||||||||| |||| |  ||  ||||||| || |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||     
T  3928 ttcagcaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaagacttaggacgactctgctga 4027  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctc 368  Q
    || |||   ||||||||||| || | |||||| |||| ||  ||||||||    
T  4028 cctttggttttcctctcatttacaatcttgtaatgagtctaggtatcctc 4077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4651 - 4318
Alignment:
Q  53 tacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggac 152  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| || |     
T  4651 tacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacaacgaaa 4552  T
Q  153 acacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgc 249  Q
    |||  |||| |  ||| |||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||||||||||||    
T  4551 acatctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttttcaccacaagtatagcagacaatctccacaggagcatctttcttcttaggccgc 4452  T
Q  250 ctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgt 349  Q
    ||| |||| |  ||  |||||||  | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||   |||| ||||||||| | |||||    
T  4451 ctatcatcaaccattctctgtttatccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggttttccgctcattcacaatcttgt 4352  T
Q  350 agtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    | | || ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4351 aataagtcttggtatcctcctcatatatcctgca 4318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 367
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1507
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     | || || ||||    
T  1159 ctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttacactgtgaaccaatgtgaccctcctaattgcaattaaagcacacaatgtcatcgtgcttacactcag 1258  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||    ||||||||||||||||||  | | |||  |||| |  ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  1259 ctagtgtatgacctttcttaccacagggaaaacatctctttacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaat 1358  T
Q  222 ct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||   | | ||| ||| ||||  | || |||||| |||| |  ||  ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  1359 ctcaacaggagcttccatctttctcgggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttagggcgactctgttgg 1458  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  1459 cccttggtcttccgttcattcacaatcttgtaatgagccttcgtatcct 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 194 - 558
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||| | ||||    
T  194 ctaccagtagcctgcgccttcttaggcttcttacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttggactcag 293  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || |  ||  |||| |  ||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  | || |||||    
T  294 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaccatctcttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 393  T
Q  222 ctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||  ||   ||||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||  || |||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  394 ctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctga 493  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    || ||| | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  494 cctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 4611 - 4975
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||| | ||||    
T  4611 ctaccagtagcctgcgccttcttaggcttcttacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttggactcag 4710  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || |  ||  |||| |  ||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  | || |||||    
T  4711 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaccatctcttcacatctccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 4810  T
Q  222 ctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||  ||   ||||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||  || |||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4811 ctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctga 4910  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    || ||| | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4911 cctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcctgca 4975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 383
Target Start/End: Original strand, 6886 - 7041
Alignment:
Q  228 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 327  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  6886 agcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcacttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtc 6985  T
Q  328 ttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  6986 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagatcctgca 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 794 - 1014
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| |||| |  | |||||  || |    
T  794 acattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcaatcaacttctactttc 893  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  894 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 993  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
     || ||||| || ||||||||    
T  994 aattctgcatctgttaaccaa 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1457 - 1247
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    || |||||||| ||    
T  1457 cattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttcc 1358  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  1357 cttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatat 1258  T
Q  376 atcctgcagct 386  Q
    ||||| |||||    
T  1257 atcctacagct 1247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30296 - 30086
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||   |||| ||| |||| |||| |||  ||||    ||||||||||||||    
T  30296 cattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggagcatctttcctcttgggcctcctgtcatcattcatcttctgtttccc 30197  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||| || || ||| ||||| ||||| ||||| |||||     
T  30196 tttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatctagtaatgagcttttgtgtcctcctcatat 30097  T
Q  376 atcctgcagct 386  Q
    |||||||||||    
T  30096 atcctgcagct 30086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1275 - 1067
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| || | |||| ||||    |||||||| || |    
T  1275 acattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttc 1176  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  1175 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcgta 1076  T
Q  375 gatcctgca 383  Q
     ||||||||    
T  1075 aatcctgca 1067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28947 - 28631
Alignment:
Q  130 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 229  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||    
T  28947 tgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctccttaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagcag 28848  T
Q  230 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 326  Q
       ||||||||||||||||||| ||  | ||||  ||  ||||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| | || |||||| |||||       
T  28847 gaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactatatggcttagggcaacactgctggcccttagt 28748  T
Q  327 cttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtaccca 426  Q
    ||||  |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| || ||||| |||||||| || || || ||  |||||| ||  | ||||||||| ||     
T  28747 cttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagattctgcagctgttcactaaatctggaaaaattcggatctgttggtatccg 28648  T
Q  427 atcgccctcttgatgtc 443  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28647 atcgccctcttaatgtc 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23915 - 23708
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||   | ||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||  ||||||| ||    
T  23915 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacagacaatctcaacatgagtatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctctgtttgcc 23816  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  23815 cttatcagcaggagcactgtatggcttaggacgactctgctgacctttagctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcataa 23716  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    ||||||||    
T  23715 atcctgca 23708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 514324 - 514125
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||    |||||||  || |    
T  514324 acattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttcttctttc 514225  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  514224 ctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 514125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Original strand, 11454 - 11569
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  11454 tgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttgggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatctt 11553  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| || |||||    
T  11554 cctcatatattctgca 11569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 395
Target Start/End: Original strand, 330 - 694
Alignment:
Q  34 ggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgac 133  Q
    |||||| ||||||||||  | || || |||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||||| |||     ||||    
T  330 ggcgccttcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcctctttgcaattaaagcacacgatgtcagcatgcttgcaatcaactaatgtgtgac 429  T
Q  134 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---c 230  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||| |  |||||| | ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||   |    
T  430 ccttcttgccacaccggaaacactccttcacctcctcacgacaagcagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcaacaggaac 529  T
Q  231 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttc 330  Q
    |||||| ||||| || || ||  | ||||  ||| ||||||| || |||||| | |||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||    
T  530 atcctttttcttgggtcgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcaacaggggaactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttc 629  T
Q  331 ctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    | |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  630 cgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcataaattctgcaactattcaccaa 694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23894 - 23674
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  23894 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 23795  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||  || || || ||||||||    
T  23794 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagttttggtgtcttcttcata 23695  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  23694 gattctgcacctattaaccaa 23674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 40634 - 40270
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| || | || |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||   | | ||||| ||||    
T  40634 ctaccagtagccgacaccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacatactatatcatcatgtttgcactcag 40535  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |  | |||  |||| |  ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |  ||||    
T  40534 ctagtgcatgacccttctttccacagcaaaaacatctcttaacatccccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagaattcaat 40435  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    ||| ||||   |||| |||||  | || |||||| |||| |  |   ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  40434 ctcagcaggagcatctttctttctcgggcgcctatcatcaaccactctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttaggacgactctgttga 40335  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||    
T  40334 cccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcctgca 40270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 395
Target Start/End: Original strand, 30333 - 30463
Alignment:
Q  265 ttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtat 364  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||| ||||| || || |    
T  30333 ttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgt 30432  T
Q  365 cctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  30433 cttcttcataaattctgcaactgttaaccaa 30463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Original strand, 42068 - 42288
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  42068 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttc 42167  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||    
T  42168 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcata 42267  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  42268 gattctgcacctattaaccaa 42288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 111034 - 110670
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||   | | || || ||||    
T  111034 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcatactatatcatcatgtttacactcag 110935  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||    |||||||||||||||||| || | |||  |||| || ||| || | ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  | || |||||    
T  110934 ctagtgtatgacctttcttaccacatcgaaaacatctcttcatgtccccaagacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 110835  T
Q  222 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
    |||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |  ||  |||| ||||| ||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  110834 ctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgcttccccttatcggcaggagcactgtgaggcttaggacggctctgctga 110735  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  110734 cctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 110670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 383
Target Start/End: Original strand, 18280 - 18386
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| | ||| || || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |    
T  18280 ttatcagcaggagcattgtaaggctttggacgacttttctgacctttacctttcctctcattcacagccttgtaatgagctttggtatcttcttcataaa 18379  T
Q  377 tcctgca 383  Q
    | |||||    
T  18380 ttctgca 18386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 216289 - 216199
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  216289 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 216199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 19822 - 19939
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  19822 tctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatc 19921  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  19922 ctcctcatagatcctgca 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 42056 - 42173
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  42056 tctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatc 42155  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  42156 ctcctcatagatcctgca 42173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 75776 - 75893
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  75776 tctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatc 75875  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  75876 ctcctcatagatcctgca 75893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 34651 - 34534
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  34651 tctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatc 34552  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| || || ||||||||    
T  34551 ctcctcgtaaatcctgca 34534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 34845 - 34763
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  34845 accctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaat 34763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 41809 - 41888
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 101  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  41809 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaat 41888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Original strand, 75529 - 75608
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaat 101  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||   | ||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  75529 ctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaat 75608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2390 - 2125
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||   | | ||||| ||||    
T  2390 ctaccagtagccggcaccttcttaggctacttacactatgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaagcatacaatatcatcatgtttgcactcag 2291  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||||   ||||| |||||    
T  2290 ctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttgtcaccacaagaaaaacaaacaat 2191  T
Q  222 ctct---gcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagc 284  Q
    ||||   | ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||| ||||||| || ||||||||    
T  2190 ctctacaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagc 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14143 - 14028
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  14143 tgttttcccttatcatcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatctt 14044  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| || |||||    
T  14043 cctcatatattctgca 14028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Original strand, 15836 - 15951
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| |   |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  15836 tgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgcggaaacttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 15935  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | |||||||| |||||    
T  15936 cctcatagattctgca 15951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 62638 - 62531
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  62638 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgccccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 62539  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  62538 tgcagcta 62531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 65191 - 65081
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||   | | |||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  65191 ttatcagcaggggcactatatggcttcgggcgactctgttgtccattattccttctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 65092  T
Q  377 tcctgcagcta 387  Q
    | |||||||||    
T  65091 ttctgcagcta 65081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1578 - 1358
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  1578 acattactcttgtgtcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcactcatcttctgctttc 1479  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||| || || || ||||||||    
T  1478 ctttgtcagcaggagcactgtaaggcttatgacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatgttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 1379  T
Q  375 gatcctgcagctattaaccaa 395  Q
     || || || || ||||||||    
T  1378 aattctacacctgttaaccaa 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1714 - 1608
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |    
T  1714 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttttcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 1615  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    |||||||    
T  1614 tgcagct 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 66965 - 66859
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagctat 388  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||||| |    
T  66965 gcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgt 66866  T
Q  389 taaccaa 395  Q
    | |||||    
T  66865 ttaccaa 66859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1191 - 1071
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||    
T  1191 tctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatc 1092  T
Q  366 ctcttcatagatcctgcagct 386  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  1091 ctcttcatagatcctacagct 1071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 386
Target Start/End: Original strand, 8168 - 8288
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||    
T  8168 tctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatc 8267  T
Q  366 ctcttcatagatcctgcagct 386  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  8268 ctcttcatagatcctacagct 8288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 66410 - 66302
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  66410 tctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatc 66311  T
Q  366 ctcttcata 374  Q
     || |||||    
T  66310 ttcctcata 66302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 69551 - 69366
Alignment:
Q  19 accctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaat 118  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   | ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |    | | |||||||    
T  69551 accctaccagtagtcggcaccttcttaggctacttgcactgagaaccaatgtgaccctcttctttgcaattgaagcacacaatat-attatgcttgcaat 69453  T
Q  119 cagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccac 205  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |  || || || ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  69452 cagctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctcttccggacaagcattgctcttgtggcctttctcaccac 69366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17247
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17350 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcc 17251  T
Q  380 tgca 383  Q
    ||||    
T  17250 tgca 17247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4672
Alignment:
Q  286 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4709 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11627 - 11461
Alignment:
Q  262 atcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttg 361  Q
    |||||||| || ||||| |||||  | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || |    
T  11627 atcttctgctttcctttgtcagcaagagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttgg 11528  T
Q  362 tatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaat 428  Q
    | || |||||||| ||||| || || |||||||| |||  ||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  11527 tgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactccgaaaagactctgatctgttgatacccaat 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 387
Target Start/End: Original strand, 5890 - 5982
Alignment:
Q  295 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5890 tacggcttcggacgactatgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaataagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 5982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 305
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| |    
T  411 tcagcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattc 312  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    |||||||    
T  311 tgcagct 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 146
Target Start/End: Original strand, 10994 - 11087
Alignment:
Q  53 tacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccaca 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| |||||||   ||||||| |||||||||||    
T  10994 tacactgcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccaca 11087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 18827 - 19190
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||   ||||| | |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||   | | ||||| ||||    
T  18827 ctaccaatagtctgcgccttcttaggcttcttacacagcgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcacacaatatcatcatgtttgcactcag 18926  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |  | || |||||    
T  18927 ctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttcacatccccgggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaat 19026  T
Q  222 ct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgt 318  Q
     |   | | ||| || ||||| || || |||||| |||| |  ||  ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |     
T  19027 ttcaacaggagcttctttctttttggggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactttgc-ga 19125  T
Q  319 cccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    || ||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19126 cctttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaatcctgca 19190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9656 - 9550
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  9656 ttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcataga 9557  T
Q  377 tcctgca 383  Q
    |||||||    
T  9556 tcctgca 9550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 387
Target Start/End: Original strand, 21147 - 21359
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||  ||||    | | ||||||| |    
T  21147 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttc 21246  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||  |||||||| ||||| ||  |||| || |||||    
T  21247 ctttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgactctactgtcccttgcctttacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcctatcttcctcata 21346  T
Q  375 gatcctgcagcta 387  Q
     || |||||||||    
T  21347 tattctgcagcta 21359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 33340 - 33132
Alignment:
Q  181 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctt 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  |||   ||||  || |||| |||| |||  ||||    ||| ||||||| ||||    
T  33340 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcctt 33241  T
Q  278 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagat 377  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  33240 tgtcagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatat 33141  T
Q  378 cctgcagct 386  Q
    |||||||||    
T  33140 cctgcagct 33132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 50543 - 50649
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  50543 tcagcaggggcactatacggcttcggaccactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcc 50642  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  50643 tacagct 50649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 774 - 615
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||    | ||||||  || ||||||||| |||| ||||    |||||||| || |    
T  774 acattgctcttgtggcctttctcaccaaacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttc 675  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctct 334  Q
    |||| |||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  674 ctttgtcaataggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctct 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13926 - 13805
Alignment:
Q  274 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcat 373  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || |||||||    
T  13926 cctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtcttcttcat 13827  T
Q  374 agatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    |||| || || || ||||||||    
T  13826 agattctacacctgttaaccaa 13805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Original strand, 48154 - 48271
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  48154 tctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatc 48253  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  48254 ctcctcataaattctgca 48271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 55351 - 55234
Alignment:
Q  266 tctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatc 365  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  55351 tctgtttacccttatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgtcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatc 55252  T
Q  366 ctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  55251 ctcctcataaattctgca 55234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 98440 - 98343
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagct 386  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  98440 gcactatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctcctttcactcattaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcattgatcctacagct 98343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Original strand, 176434 - 176532
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  176434 gcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacagcta 176532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Original strand, 176320 - 176368
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctg 226  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  176320 acattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctg 176368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Original strand, 53 - 152
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  53 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacc-ttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttggtatcttcctcataga 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 383
Target Start/End: Original strand, 104565 - 104767
Alignment:
Q  184 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccctttat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||  ||||||||||  |||| |  ||  ||||||| || ||||    
T  104565 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggccgcctctcatcaatcattctctgttttcccttat 104664  T
Q  281 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcct 380  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  104665 cagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttagtatcctcctcataaatcct 104764  T
Q  381 gca 383  Q
    |||    
T  104765 gca 104767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 377
Target Start/End: Original strand, 29959 - 30062
Alignment:
Q  274 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcat 373  Q
    ||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29959 cctttgtcagcaggagcactagacggtttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcctttgtatcctcttcat 30058  T
Q  374 agat 377  Q
    ||||    
T  30059 agat 30062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5768 - 5662
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5768 tcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcc 5669  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  5668 tacagct 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 383
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17780
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || |||||||| || |||||    
T  17686 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgca 17780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 9953 - 10160
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttccc 275  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||| |||| |||||  |||| |  ||  | ||||| ||    
T  9953 cattactcttatggcctttctcaccacaagtacaacatacaatctcgacaggagcatctttcttcctagggcgcctctcatcaaccattctttgtttacc 10052  T
Q  276 tttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatag 375  Q
     |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||  || | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| |||||     
T  10053 cttattagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctgtggctttccgctcattcacgatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataa 10152  T
Q  376 atcctgca 383  Q
    || |||||    
T  10153 attctgca 10160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 383
Target Start/End: Original strand, 2275 - 2372
Alignment:
Q  286 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  2275 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcttgca 2372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 395
Target Start/End: Original strand, 11409 - 11530
Alignment:
Q  274 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcat 373  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||    
T  11409 cctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcat 11508  T
Q  374 agatcctgcagctattaaccaa 395  Q
    | ||||||||||| || |||||    
T  11509 aaatcctgcagctgtttaccaa 11530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Original strand, 11311 - 11356
Alignment:
Q  179 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  11311 cattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctc 11356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Original strand, 11173 - 11237
Alignment:
Q  41 tcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtcc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||    
T  11173 tcttcggctgagtacactgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtcc 11237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24839 - 24616
Alignment:
Q  22 ctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaatgtccgaacgattgcaatcag 121  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||| || || ||   | | ||||| ||||    
T  24839 ctacaagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgacgctcctcattgcagttaaagcatactatatcatcatgtttgcactcag 24740  T
Q  122 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||   ||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||   ||| || |||||||| ||||||||||||   ||||| |||||    
T  24739 ctagtgcatgacctttctttccacaacggaaacatctcttggtatccccaggacaagaattacttttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaat 24640  T
Q  222 ctct---gcagcatccttcttctt 242  Q
    ||||   | |||||||||||||||    
T  24639 ctctgtaggagcatccttcttctt 24616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16481 - 16372
Alignment:
Q  274 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcat 373  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  16481 cctttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcctcat 16382  T
Q  374 agatcctgca 383  Q
    ||||||||||    
T  16381 agatcctgca 16372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 732 - 621
Alignment:
Q  274 cctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcat 373  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  732 cctttgtcagcaggagcactgtacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacactcactcatcaccttat-gtgagcttttgtatcctcttcat 634  T
Q  374 agatcctgcagct 386  Q
    | ||||| |||||    
T  633 aaatcctacagct 621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6123 - 6080
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6123 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23411 - 23296
Alignment:
Q  268 tgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcct 367  Q
    ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | | ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |    
T  23411 tgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgagtttactgacctttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgacccttagtatctt 23312  T
Q  368 cttcatagatcctgca 383  Q
    | ||||| || |||||    
T  23311 cctcatatattctgca 23296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Original strand, 263664 - 263707
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  263664 tcagcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtccctt 263707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17846 - 17740
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcataga 376  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| |    
T  17846 ttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctaacctttggcttttcgctcattcacgatcttgtaatgagtcttagtatcctcctcataaa 17747  T
Q  377 tcctgca 383  Q
    | |||||    
T  17746 ttctgca 17740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Original strand, 34667 - 34713
Alignment:
Q  175 cagacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34667 cagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacaaacaat 34713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 30062 - 30168
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  30062 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcc 30161  T
Q  380 tgcagct 386  Q
    | |||||    
T  30162 tacagct 30168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 49046 - 49003
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49046 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 49003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 58080 - 58037
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  58080 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 58037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 64468 - 64425
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 323  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64468 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 64425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Original strand, 5536 - 5629
Alignment:
Q  290 cactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgca 383  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  5536 cactgtaaggctttagacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatcttcctcatagattctgca 5629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Original strand, 9036 - 9097
Alignment:
Q  264 cttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 325  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9036 cttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgc 9097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 374
Target Start/End: Original strand, 17084 - 17169
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  17084 gcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctttgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtattctcttcata 17169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 386
Target Start/End: Original strand, 51984 - 52195
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaaaatcttctgtttcc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    | ||||||  || || |||||| |||  ||||    | | ||||||| |    
T  51984 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacagataatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctctgtttac 52083  T
Q  275 ctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||  | | |||| |||  || || || |||||||||||||||||||||||    
T  52084 ctttgtcagcaggagcactatacagtttcggacggctctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcctttgtatcctcttcata 52183  T
Q  375 gatcctgcagct 386  Q
     ||||| |||||    
T  52184 aatcctacagct 52195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3917 - 3810
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  3917 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattc 3818  T
Q  380 tgcagcta 387  Q
    ||||||||    
T  3817 tgcagcta 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Original strand, 7485 - 7583
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcctgcagcta 387  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||    
T  7485 gcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagcta 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 326
Target Start/End: Original strand, 116062 - 116108
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 326  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116062 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcc 116108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13343 - 13246
Alignment:
Q  277 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcata 374  Q
    |||||||| || |||||| | | ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||| || |||||    
T  13343 ttatcagcaggagcactgcaagactttggacaactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaacctcgtaacgagccttagtatcttcctcata 13246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8328 - 8223
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| |    
T  8328 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattc 8229  T
Q  380 tgcagc 385  Q
    ||||||    
T  8228 tgcagc 8223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18542 - 18437
Alignment:
Q  280 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctttgtatcctcttcatagatcc 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| |    
T  18542 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattc 18443  T
Q  380 tgcagc 385  Q
    ||||||    
T  18442 tgcagc 18437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 326
Target Start/End: Original strand, 6251 - 6288
Alignment:
Q  289 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 326  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6251 gcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcc 6288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Original strand, 12130 - 12178
Alignment:
Q  178 acattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctg 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  12130 acattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctctg 12178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University