View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9409_low_13 (Length: 335)

Name: NF9409_low_13
Description: NF9409
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9409_low_13
NF9409_low_13
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (16-335)||(8274743-8275066)
chr3 (16-335)||(15576223-15576546)
chr3 (16-335)||(16743047-16743370)
chr3 (16-275)||(13975389-13975648)
chr3 (16-332)||(6153183-6153503)
chr3 (64-335)||(6712792-6713067)
chr3 (16-335)||(17192567-17192890)
chr3 (16-335)||(18748143-18748461)
chr3 (16-269)||(267602-267855)
chr3 (148-272)||(21686515-21686639)
chr3 (16-113)||(21686644-21686741)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (16-333)||(21937475-21937796)
chr5 (16-335)||(11210981-11211304)
chr5 (16-335)||(27010843-27011165)
chr5 (16-335)||(24580969-24581292)
chr5 (17-234)||(23503306-23503523)
chr5 (16-248)||(24516409-24516640)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (16-335)||(1649034-1649357)
chr6 (16-335)||(16232917-16233240)
chr6 (16-333)||(16382623-16382944)
chr6 (16-335)||(23995956-23996279)
chr6 (16-335)||(18838158-18838481)
chr6 (16-335)||(25743337-25743660)
chr6 (16-335)||(18571359-18571682)
chr6 (3-335)||(15078601-15078937)
chr6 (58-335)||(14129168-14129449)
chr6 (16-335)||(25655191-25655514)
chr6 (108-332)||(21413345-21413571)
chr6 (16-189)||(16097909-16098081)
chr6 (185-335)||(16087039-16087193)
chr6 (121-271)||(23123963-23124113)
chr6 (119-272)||(17813498-17813651)
chr6 (276-335)||(14625301-14625360)
chr6 (169-304)||(19968716-19968855)
chr6 (183-271)||(16449835-16449923)
chr6 (16-93)||(21413188-21413265)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (16-335)||(46029-46352)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (16-335)||(20831569-20831892)
chr1 (16-332)||(20914072-20914392)
chr1 (30-335)||(22142232-22142541)
chr1 (16-203)||(46518716-46518903)
chr1 (16-331)||(21202464-21202783)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (16-333)||(40135-40456)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (16-333)||(7823735-7824056)
chr7 (16-333)||(27107888-27108209)
chr7 (16-335)||(15363773-15364096)
chr7 (16-335)||(14936180-14936503)
chr7 (16-335)||(45146390-45146711)
chr7 (16-335)||(12368690-12369012)
chr7 (16-335)||(21674647-21674970)
chr7 (16-334)||(13378532-13378854)
chr7 (16-331)||(17923517-17923837)
chr7 (16-335)||(4439761-4440084)
chr7 (16-312)||(12193412-12193712)
chr7 (17-331)||(13352988-13353306)
chr7 (23-272)||(23641419-23641666)
chr7 (147-272)||(20466682-20466807)
chr7 (24-216)||(17145380-17145572)
chr7 (146-271)||(11229174-11229299)
chr7 (172-248)||(41416-41492)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (16-335)||(22275754-22276077)
chr2 (16-335)||(12640564-12640887)
chr2 (16-335)||(24831832-24832155)
chr2 (16-335)||(24570313-24570636)
chr2 (16-331)||(28144442-28144761)
chr2 (16-335)||(22762214-22762537)
chr2 (16-272)||(23817738-23817994)
chr2 (16-322)||(25128135-25128445)
chr2 (16-301)||(21908936-21909232)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (16-335)||(1018-1341)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (16-335)||(97890-98213)
scaffold0037 (15-335)||(23573-23897)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (16-335)||(21850885-21851208)
chr8 (16-335)||(16877643-16877966)
chr8 (19-335)||(21197053-21197373)
chr8 (16-335)||(20652881-20653204)
chr8 (16-335)||(22982346-22982669)
chr8 (43-335)||(23150858-23151154)
chr8 (16-335)||(22315110-22315424)
chr8 (16-331)||(25282044-25282364)
chr8 (196-317)||(26135833-26135958)
chr8 (22-272)||(24818170-24818420)
chr8 (64-272)||(24094118-24094327)
chr8 (172-230)||(19863076-19863134)
chr8 (172-230)||(19867713-19867771)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (16-335)||(14997160-14997483)
chr4 (16-335)||(15293262-15293585)
chr4 (16-335)||(13247489-13247812)
chr4 (16-335)||(55375463-55375786)
chr4 (16-275)||(16445317-16445576)
chr4 (16-335)||(9290679-9291002)
chr4 (16-335)||(12132514-12132837)
chr4 (112-335)||(37955992-37956218)
chr4 (16-272)||(16685165-16685421)
chr4 (138-331)||(12343063-12343260)
chr4 (16-84)||(12342968-12343036)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (16-335)||(14532-14855)
scaffold0132 (17-335)||(43413-43735)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (16-335)||(33103-33425)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (16-335)||(494-817)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (20-335)||(23269-23588)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (16-335)||(7918-8242)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (40-335)||(44578-44877)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (16-335)||(106681-107004)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (16-335)||(23755-24078)
scaffold0008 (16-324)||(231444-231756)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (16-335)||(16279-16601)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (16-335)||(78737-79060)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (16-335)||(4052-4375)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (16-335)||(8999-9322)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (16-335)||(12783-13106)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (16-335)||(1162-1485)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (24-335)||(10425-10740)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (16-335)||(22576-22892)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (16-335)||(441-763)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (16-335)||(122058-122381)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (19-252)||(28377-28610)
scaffold0077 (247-335)||(36046-36138)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (16-335)||(13126-13449)
scaffold0021 (16-191)||(6333-6508)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (16-335)||(5627-5939)
scaffold0447 (16-335)||(10241-10553)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (16-335)||(8236-8548)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (16-335)||(8862-9185)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (16-335)||(3983-4290)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (16-248)||(14489-14721)
scaffold0357 (276-335)||(7415-7474)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (118-335)||(5370-5590)
scaffold0310 (16-186)||(14845-15014)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (16-219)||(8090-8293)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (16-317)||(10549-10854)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (131-335)||(1061-1269)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (16-301)||(14039-14328)
[»] scaffold0554 (2 HSPs)
scaffold0554 (16-203)||(3170-3357)
scaffold0554 (178-335)||(2991-3152)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (58-322)||(13849-14116)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (16-298)||(370248-370533)
[»] scaffold0615 (2 HSPs)
scaffold0615 (70-200)||(5189-5319)
scaffold0615 (226-335)||(5315-5428)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (148-335)||(78224-78415)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (16-300)||(73811-74098)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (197-328)||(202903-203038)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (215-332)||(21237-21358)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (148-271)||(1007-1130)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (250-335)||(1-90)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (226-335)||(33897-34010)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (16-104)||(7278-7366)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (172-230)||(13459-13517)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 8274743 - 8275066
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8274743 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 8274842  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274843 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 8274942  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8274943 gcatgatgcttctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtcagagataatttgaccgttgagacttggccagttaggattgaggatcgtgagttgaag 8275042  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  8275043 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 8275066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15576546 - 15576223
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15576546 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggctgtttgatg 15576447  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15576446 tgattgagaaggttggggttgtagcataccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 15576347  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15576346 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagggataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 15576247  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  15576246 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 15576223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 16743047 - 16743370
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16743047 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 16743146  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16743147 tcattgagaaggttggggttgtagcgtattggattgtgttaccactgtctttgtccaatcttcataatgtttttcatgtgtcttagttgaggaagtatgt 16743246  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16743247 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccagttatgattgaggatcgtgagttgaag 16743346  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  16743347 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 16743370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 13975389 - 13975648
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  13975389 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcctcgtttcgttgggccgtttgatg 13975488  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975489 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 13975588  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt 275  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13975589 gcatgatgcgtctcatgtcattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggt 13975648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 332
Target Start/End: Original strand, 6153183 - 6153503
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| | || | ||||||||    
T  6153183 gttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgcagaaagttgactcctcgttttgtcggaccgtttgatg 6153282  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6153283 ttattgagaaggtcgaggttgtagcgtatcggattgcattgccaccatctttttcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 6153382  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  6153383 gcatgatgcgtctcatgtgatccaagtggatgagttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaagatcgtgagatgaag 6153482  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagatt 332  Q
     |||||| |||||| ||||||    
T  6153483 tgtttgcatggcaaagagatt 6153503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 335
Target Start/End: Original strand, 6712792 - 6713067
Alignment:
Q  64 cgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgt 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  6712792 cgtgctttgaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttggtccgtttgagattattgagaaggttggggttgtagcgtatcagattgtgttaccaccgt 6712891  T
Q  164 ctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagaga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6712892 ctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgactcagttgcggaagtatgtgtatgatacgtctcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaaaaga 6712991  T
Q  264 taatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6712992 taatttgaccgttgagacttggccagttaggattgaagatcgcgaagtgaagcgtttgcgtggcaaagagattgtt 6713067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17192890 - 17192567
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||   |||||  || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17192890 gttggtgatcatgtgttttttagagtgaatcttgtaaccaatgttggatgttctctgaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttgggccttttgatg 17192791  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17192790 ttgttgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgctaccactgtctttgtcaaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcaattgaggaagtatgt 17192691  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||    
T  17192690 gtatgttgtgtctcacgtgattcaagtggatgatttggaagtatgagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggaccgtgaagtgaag 17192591  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17192590 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 17192567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18748461 - 18748143
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| | ||||||      
T  18748461 gttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgctttgaagtgtcgaaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgaga 18748362  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||| |||||||| ||||||     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18748361 ttattaagaaggttagggttg-----tatcggattgcgttagcaccgtctttgtcgaatctgcatggtgtgtttcatgtgtctcagttgcgaaagtatgt 18748267  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  18748266 gtatgatgtgtctcatgtgattcaagtgaatgagttggaagtaagggataatttaaccgttgagacttggccagttaggattgaggatcgtgaagtgaag 18748167  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  18748166 cgtttgcgtggcaaggaaattgtt 18748143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Original strand, 267602 - 267855
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||  | || |||||||||||||| | |  | ||  ||||| |||| | ||||||      
T  267602 gttggagatcatgtgtttttgagggttaatccagtaatcggtgttgaacatgatttgaagtgtaggaggttaacaccgtgttttgttggaccgtttgaga 267701  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |||||||||||||| |    | ||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  267702 ttattgagaaggttagatcagtagcgtatcggattgcgctaccgccgtcgttgccgaatcttcattatttgtttcatgtgtctaagctgaggaagtatgt 267801  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataattt 269  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  267802 gtatgattcgtcgcatgtgattcaagtggatgatttggtagtaggggataattt 267855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21686639 - 21686515
Alignment:
Q  148 attgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatg 247  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||| || ||||| ||||||    
T  21686639 attgcgttaccgtcgtcgttgtctaatcttcatgatgtgtttcatgtatctcagttgaggaagtatgtgcacagcccgtctcatatgattcaattggatg 21686540  T
Q  248 aattggaagtaagagataatttgac 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  21686539 aattggaagtaagggataatttgac 21686515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21686741 - 21686644
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttga 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||| | ||| || | ||| ||||| |||| ||||||||    
T  21686741 gttggtgatcatgtattttttagagtgaatcatgtaaccgatgttggacgtgctttgaagtgtcgaaagttgacaccttgttttgttggactgtttga 21686644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 21937475 - 21937796
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21937475 gttggtgatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggctgtttgatg 21937574  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21937575 tcattgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 21937674  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  21937675 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccgattaggattgaggatcgcgagttgaag 21937774  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21937775 cgtttgcgtggcaaggagattg 21937796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 11210981 - 11211304
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  11210981 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 11211080  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11211081 ttattgagaaggttggggttgtggcgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcacaatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 11211180  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11211181 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgaccgttgagacttgcccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 11211280  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11211281 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 11211304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27011165 - 27010843
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  27011165 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggcc-gtttgatg 27011067  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011066 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcagattgcgttaccaccgtctttgtcaaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 27010967  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27010966 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagacttggccggttaggattgaggatcgagagttgaag 27010867  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  27010866 cgtttacgtggcaaggagattgtt 27010843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24581292 - 24580969
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24581292 gttggtgatcacgtgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 24581193  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24581192 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcagattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctgagttgaggaagtatgt 24581093  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24581092 gcatgatgcatctcatgtgatccaagtggatgaattggaagtaagggataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 24580993  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  24580992 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 24580969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23503523 - 23503306
Alignment:
Q  17 ttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| | |||||||||    
T  23503523 ttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtcctttgaagtgtaggaagttgaatcctcgttttgttggaccgtttgatgt 23503424  T
Q  117 tattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtg 216  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23503423 tattgagaaggttagggttgtagtgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtg 23503324  T
Q  217 catgatgcgtctcatgtg 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23503323 catgatgcgtctcatgtg 23503306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24516640 - 24516409
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| || | || | |||| || | | ||||||      
T  24516640 gttggtgatcatgtgctctttagagtaaatcatgtaaccggtgttggacgtgctttgaagtatcggaagttgacaccacattttgtttgaccgtttgaga 24516541  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || ||||||||||||| |||| | ||| | || |||||||| | |  || || |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||  ||||||||||    
T  24516540 ttgttgagaaggttggagttgtaacgtgtcgg-ttgcgttatcgctatcgttatcgaatcttcatgatgcgtttcttgtgtcctagttacggaagtatgt 24516442  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatga 248  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24516441 gtatgatgcgtctcacgtgattcaagtggatga 24516409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 1649034 - 1649357
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1649034 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtgggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 1649133  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1649134 tgattgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 1649233  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1649234 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagggataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 1649333  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  1649334 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 1649357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16233240 - 16232917
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| |||| | ||||||||    
T  16233240 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgttgaagtgtaggaagttgacacctcgttttgttggaccgtttgatg 16233141  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233140 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 16233041  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16233040 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgcgagttgaag 16232941  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  16232940 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 16232917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 16382623 - 16382944
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16382623 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 16382722  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382723 tcattgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 16382822  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16382823 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccgattaggattgaggatcgcgagttgaag 16382922  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16382923 cgtttgcgtggcaaggagattg 16382944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23996279 - 23995956
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23996279 gttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 23996180  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996179 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 23996080  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23996079 gcatgatgcgtctcatatgattcaagtggatgaattggaagtaagggataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 23995980  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  23995979 cgtttgcgtggcaaatagattgtt 23995956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 18838158 - 18838481
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18838158 gttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 18838257  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18838258 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgcctaagttgaggaagtatgt 18838357  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18838358 gcatgatgcgtctcatgtgattcgagtggatgatttggaagtaagagataatttgacggttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 18838457  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  18838458 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 18838481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 25743337 - 25743660
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  |  |||||||    
T  25743337 gttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgcaccatttgatg 25743436  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25743437 ttattgagaaggttggggttgtagcatatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcatcatatgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 25743536  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25743537 acatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagaaataatttgaccgttgagacttggccgattaggattgaggatcgagagatgaag 25743636  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  25743637 cgtttgtgtggcaaggagattgtt 25743660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18571682 - 18571359
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18571682 gttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccgatgttggtcgtgctttgaagtataggaagtagactcctcgttttgttggaccgtttgatg 18571583  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18571582 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtagaatcttcataatgtatttaatgtgtctcagttgaggaagtatgt 18571483  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18571482 gcatgatgtgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagataatctgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagatgaag 18571383  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    || |||||||| || |||||||||    
T  18571382 cggttgcgtgggaaagagattgtt 18571359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Original strand, 15078601 - 15078937
Alignment:
Q  3 tatcgagtttggtgttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttatt 102  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  15078601 tatcgagtttcaggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgtt 15078700  T
Q  103 gggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagt 202  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15078701 ggaccgtttgatgttgttgagaaggttggggttgtagcgtatcagattgcgttaccaccgtctttgtcaaatcttcatgatgtgtttcatgtatctcagt 15078800  T
Q  203 tgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgagga 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||    
T  15078801 tgaggaagtatgtgtatgatgcgtctcatgtgatccaagtgaatgaattggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgagga 15078900  T
Q  299 tcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    | | ||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15078901 tagtgaagagaagcgtttgcgtggcaaagagattgtt 15078937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14129449 - 14129168
Alignment:
Q  58 gttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttac 157  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14129449 gttggtcgtgctttgaagtgtcgaaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatgttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttac 14129350  T
Q  158 caccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagt 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14129349 caccgtctttgttgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgtatgatgtgtctcatgtaattcaagtggatgatttggaagt 14129250  T
Q  258 aagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||| ||||||||||| ||    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14129249 aagggataatttgaccgttgagacttggccggttagaattgaggatcgcgaagtgaagcgattgcgtggcaaagagattgtt 14129168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25655514 - 25655191
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||   | || || ||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||| |  |||||      
T  25655514 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatctgataactggtgttggtcgtgctttgaactgtcggaagttaactccccgttttgttggaccatttgaga 25655415  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25655414 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgttgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 25655315  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||    ||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||    
T  25655314 gtatgatgcgtctcatgtgattcaagtgggtgatttggaaataagagataatttgatcgttgagacttggccagtaaggattgaggatagtgaagtgaag 25655215  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  25655214 cggttgcgtggcaaggagattgtt 25655191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 332
Target Start/End: Original strand, 21413345 - 21413571
Alignment:
Q  108 gtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgagg 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21413345 gtttgatgttgttgagaaggttggggttgtagcgtatcgcattgcgttgccaccatatttgtcgaatcttcatgatgtgtttca--tgtctcagttgagg 21413442  T
Q  208 aagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgag 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||    |||||||  |||||||||||||| || |    
T  21413443 aagtatgtgtatgatgcgtctcatgcgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatatgatcgttgagacttggctggttaggattgaggaccgtg 21413542  T
Q  304 agttgaagcgtttgcgtggcaaggagatt 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21413543 aagtgaagcgtttgcgtggcaaggagatt 21413571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16098081 - 16097909
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16098081 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggac-gtttgatg 16097983  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgttt 189  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097982 tgattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgtgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgttt 16097909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16087193 - 16087039
Alignment:
Q  185 tgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttg 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||    
T  16087193 tgtttcatgtgtctcagttgagaaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtgatccaagtggatgatttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttg 16087094  T
Q  281 gccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16087093 gccagttaggattgaggaccgtgaagtgaaacgtttgcgtggcaaggagattgtt 16087039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23124113 - 23123963
Alignment:
Q  121 gagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatg 220  Q
    |||||||| || |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  23124113 gagaaggtgggagttgtagcgtatcggattgtattacctccgtcgttatcgaatctccatgatgtgtttcatgtatctcagttgaggaagtatgtctatg 23124014  T
Q  221 atgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttga 271  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23124013 atccgtctcacgtgattcaagtggatgatttggaagtaagagataatttga 23123963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17813651 - 17813498
Alignment:
Q  119 ttgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgca 218  Q
    ||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||| |    
T  17813651 ttgagaaggttggagtggtagcgtatcggattgcattactaccgtcgttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtcgtagtcatggaagtatgtgta 17813552  T
Q  219 tgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac 272  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17813551 tgatgcgtctcacgtaattcaagtggatgatttggaaataagggataatttgac 17813498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 335
Target Start/End: Original strand, 14625301 - 14625360
Alignment:
Q  276 acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625301 actttgccggttaggattgaggatcgtgagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 14625360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 304
Target Start/End: Original strand, 19968716 - 19968855
Alignment:
Q  169 tcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatt 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| || | |  || ||||||||||||| ||||||||||  || ||||    
T  19968716 tcgaatcttcataatgtgtttcatgtatctcagttgaagaagtatgtgtacgatgtgtatgacctgattcaagtggatgatttggaagtaaatgacaatt 19968815  T
Q  269 tgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgaga 304  Q
    |||| ||    || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  19968816 tgaccgttgagacctggctagtcaggattgaggatcgaga 19968855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16449923 - 16449835
Alignment:
Q  183 tgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttga 271  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||    
T  16449923 tgtgtttcatgtgtctcagttgcgaaagtatgtgtatgacccgtcacatgtgattcaagtggatgattaggaattaaggaataatttga 16449835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Original strand, 21413188 - 21413265
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcct 93  Q
    |||||||||||| |||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21413188 gttggtgatcatatgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 21413265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 46352 - 46029
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  46352 gttggtgatcatgtgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 46253  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46252 tcattgagaaggttggggctgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 46153  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46152 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtagaggaattggaagtaagagataatttgacggttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 46053  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  46052 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 46029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 20831569 - 20831892
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20831569 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 20831668  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20831669 tcattgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 20831768  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20831769 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggagataagagataatttgacggttgagacttggccggttaggattgaggatcgcgagttgaag 20831868  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20831869 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 20831892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20914392 - 20914072
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  20914392 gttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 20914293  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20914292 tcattgtgaaggttggggttgtagcgtatcgaattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgcgtctcagttgaggaagtatgt 20914193  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20914192 gcatgatgcgtctcacgtgattcaagtggatgaattggatgtaagagataatttgacagttgagacttggctagttaggattgagtatcgcgagttgaag 20914093  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagatt 332  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20914092 cgtttgcgtggcaaggagatt 20914072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 335
Target Start/End: Original strand, 22142232 - 22142541
Alignment:
Q  30 gttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggtt 129  Q
    |||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  22142232 gtttttgagagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcctcattttgttggaccatttgaggttattgagaaggtt 22142331  T
Q  130 ggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctc 229  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22142332 ggggttgtagcgtatcagattgtgttaccactgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgtatgatacgtctc 22142431  T
Q  230 atgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaa 325  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22142432 atgtgattcaagtggatgatttggaagtaagggataattttcccgttgagacttggccagttaggattgaggatcgtgaagtgaagcgtttgcgtggcaa 22142531  T
Q  326 ggagattgtt 335  Q
    ||||| ||||    
T  22142532 ggagactgtt 22142541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 46518903 - 46518716
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  46518903 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 46518804  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagtt 203  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46518803 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagtt 46518716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 21202464 - 21202783
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || |    | |||| || | |  |||||      
T  21202464 gttggtgatcatatgtttttgagagtgaatcctataaccggtgttggacgtactttgaagtgtcggaagttgacattgcattttgttagaccttttgaga 21202563  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || | ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21202564 ttgtcgagaaagttggagttgtagcgtatcggattgcgttaccgccatcgttgtcgaatcttcttgttgtgtttcatgtgtctcacttgcggaagtatgt 21202663  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||| |||||| ||| ||||||||||  | ||  ||||||  ||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  21202664 gtatgatgtgtctcacgtgattcaagtggacaatttttaagtaaaggataatttgaccgttgagacttgaccagttaggattgaggatcgggaagtgaag 21202763  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagat 331  Q
    | | || | |||||||||||    
T  21202764 catctgagaggcaaggagat 21202783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40456 - 40135
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40456 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 40357  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40356 tcattgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 40257  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  40256 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccgattaggattgaggatcgcgagttgaag 40157  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40156 cgtttgcgtggcaaggagattg 40135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7824056 - 7823735
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7824056 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 7823957  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7823956 tcattgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 7823857  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  7823856 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccgattaggattgaggatcgcgagttgaag 7823757  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7823756 cgtttgcgtggcaaggagattg 7823735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 27107888 - 27108209
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27107888 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 27107987  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107988 tcattgagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 27108087  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  27108088 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccgattaggattgaggatcgcgagttgaag 27108187  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27108188 cgtttgcgtggcaaggagattg 27108209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15364096 - 15363773
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | || | |||||| |    
T  15364096 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactccttgttttgtgggaccgtttgagg 15363997  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15363996 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttatagaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 15363897  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  15363896 gtatgatgcgtcacatgtgatccaagtagatgatttggatgtaagggataatttgaccgttgagacttggccagttagaattgaggatcgtgaagtgaag 15363797  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15363796 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 15363773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14936503 - 14936180
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | || | |||||| |    
T  14936503 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactccttgttttgtgggaccgtttgagg 14936404  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14936403 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttatcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 14936304  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  14936303 gtatgatgcgtcacatgtgatccaagtagatgatttggatgtaagggataatttgaccgttgagatttggccagttagaattgaggatcgtgaagtgaag 14936204  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14936203 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 14936180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45146711 - 45146390
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||  || || ||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| |||| | ||||||      
T  45146711 gttggtgatcatgtgtttttgagaatgaatcatgg-actggtgttggacgtgctttgaagtgtcgaaagttgactcctcattttgttggaccgtttgaga 45146613  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45146612 ttattgagaaggttggggttttagcgtatcggattacattaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgcggaagtatgt 45146513  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt---acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagc 312  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  45146512 gtatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagagataatttgacgttgagacttggccagttaggattgaggatcgtgaagtgaagc 45146413  T
Q  313 gtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45146412 gtttgcgtggcaaggagattgtt 45146390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 12368690 - 12369012
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  12368690 gttggtgatcacgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccagtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgtttg-ttggaccgtttgatg 12368788  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12368789 ttattgataaggttggggttgtagcgtatcggattacattgccaccgtctttgtcaaatcttcatgatgtgtttcatgtgtcttagttgaggaagtatgt 12368888  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  12368889 gcatgatgcgtctcatgtgatccaagtggatgaattggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggatttaggatcgtgaggtgaag 12368988  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
     |||||||| |||| |||||||||    
T  12368989 tgtttgcgttgcaaagagattgtt 12369012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 21674647 - 21674970
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||  |||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||| |  |||||      
T  21674647 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcctcgttttgttggaccttttgaga 21674746  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21674747 ttattgagaaggttggggttgcagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgcggaagtatgt 21674846  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  21674847 gtatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagggatagtttgaccgttgagacttggccagttaggattgaggatcgcaaagtgaag 21674946  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  21674947 cgtttgcatggcaaggagattgtt 21674970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13378854 - 13378532
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  13378854 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctataacttgagttggtcgtgctttgaattgtcggaagttgactccttgttttgttggaccgtttgatg 13378755  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13378754 ttgttgagacggttggggttgtagtgtatcggatttcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcaattgaggaagtatgt 13378655  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||  | ||||||||||| |  ||  ||||     
T  13378654 ttatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggcccatgaggattgaggaccatgaagtgaaa 13378555  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgt 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  13378554 cgtctgcgtggcaaggagattgt 13378532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 17923837 - 17923517
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagg-gtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgat 114  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||| | ||||||     
T  17923837 gttggtgatcatgtgttttttaagagtgaatccggtaaccggtggtggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcctcgttttgttggaccgtttgag 17923738  T
Q  115 gttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatg 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17923737 attattgagaaggttggggttgcagcgtatcggattgcgttaccaccgcctttgtcgaatttacatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatg 17923638  T
Q  215 tgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaa 310  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||    ||||||| ||||| |||||  ||||| ||  ||||    
T  17923637 tgtatgatgcgtctaatgtgattcaagcggatgatttggaagtaagagataatttaaccgttcagacttggctagttacgattgcagatcgtgaagtgaa 17923538  T
Q  311 gcgtttgcgtggcaaggagat 331  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  17923537 gcgtttgcgtgacaaagagat 17923517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4440084 - 4439761
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| | || || || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  |||||      
T  4440084 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttattggaccatttgaga 4439985  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4439984 ttattgagaaggttgcagttgtagcgtatcagattgcgttaccaccgtctttgtcaaatttacatgatgtgtttcatgtgtctgagttgaggaagtatgt 4439885  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||| | ||||||||| ||||||  ||  |||||    
T  4439884 gtatgatgtgtctcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagagataatttgactgtttagacttgggctgttaggatttaggatcatgaagtgaag 4439785  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  4439784 cgtttacgtggcaaggagattgtt 4439761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12193712 - 12193412
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||      
T  12193712 gttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaaatgccggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgaga 12193613  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12193612 ttgttgagaaggttggggttgtagcatatcggattacgttaccacgatatttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgcggaaatatgt 12193513  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  12193512 gtatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagggataatttgaccgttgagacttggtcagttagaattgaggattgagaggtgaag 12193413  T
Q  312 c 312  Q
    |    
T  12193412 c 12193412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13353306 - 13352988
Alignment:
Q  17 ttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgt 116  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| |  ||| |  |    
T  13353306 ttggtgatcttgtgtttctgagagtgaatactgtgactggtgttggacgtgctttgaagtgttgaaagttgactcctcgttttgttggaccatttaagct 13353207  T
Q  117 tattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtg 216  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13353206 tattgagaaggttggggttgtagtgtatcggattgcgttaccaccgtctttgttgaacttacatgacgtgtttcacgtgtctcagttgaggaagtatgtg 13353107  T
Q  217 catgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagc 312  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    ||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||    
T  13353106 tatgatgcgtcccatgtgattcaagtggatgatttggatgtaagagataatttaaccgttgagacttgaccagttgggattgaggatcgcgaagtgaagc 13353007  T
Q  313 gtttgcgtggcaaggagat 331  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13353006 gtttgcgtggcaaagagat 13352988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23641666 - 23641419
Alignment:
Q  23 atcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattga 122  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| | | ||||| ||||| ||| |||| |||||| | ||| || | |  ||||||||||| | ||||||  |||| ||    
T  23641666 atcatatgtttttcagagtgaatcatataaccggtgttggacgttcttttaagtgtcgaaagttgacactgcgttttattggaccgtttgagattataga 23641567  T
Q  123 gaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgat 222  Q
    ||||||||| | || ||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||| | |||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23641566 gaaggttggagctgtagcgtatcggattgcgttgccgccatcattgtcgaatcttcatgatttatttca--tatcttagttgaggaagtatgtgtatgat 23641469  T
Q  223 gcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac 272  Q
      |||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23641468 ttgtctcccgtgattcaagtggatgattttgaagtaagggataatttgac 23641419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20466807 - 20466682
Alignment:
Q  147 gattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggat 246  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||  |||| |||||| |||||||||||    
T  20466807 gattgcgttaccactatcgttgtcgaatcttcatagtgtgtatcatgtgtctcaattgcggaagtatgtgtttgacccgtcacatgtgattcaagtggat 20466708  T
Q  247 gaattggaagtaagagataatttgac 272  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||    
T  20466707 gatttggaaggaagggataatttgac 20466682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 17145380 - 17145572
Alignment:
Q  24 tcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgag 123  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||| || | ||  |||||||||| | ||||||  ||||| ||    
T  17145380 tcatgtgtttttaagagtgaataatgtaaccggtgttggacgtgttttggagtgtcggaagttgacaccctgttttattggaccgtttgagattatttag 17145479  T
Q  124 aaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtg 216  Q
    || ||||| |||| ||||||| |||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  17145480 aatgttggagttgtagcgtatcggattgtgttaccgccatcgttgtcaaatcttcatgatgtgtttcatgtattccaattgaggaaatatgtg 17145572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Original strand, 11229174 - 11229299
Alignment:
Q  146 ggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtgga 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||   | ||||  |||||||| |  || ||||||||||| ||||   ||| |||||| |||| |||||    
T  11229174 ggattgcgttaccaccgtcgttgtcaaatctgcaaagtctgttctatgtgtcttaaatgtggaagtatgtgtatgacatgtcacatgtgattcaggtgga 11229273  T
Q  246 tgaattggaagtaagagataatttga 271  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  11229274 tgatttggaagtaagggttaatttga 11229299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 248
Target Start/End: Original strand, 41416 - 41492
Alignment:
Q  172 aatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatga 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||| |||||||    
T  41416 aatcttcatgaagtgtttcatgtgtcgcaacttaggaaatatgttcatgatccgtctcacatagttcaaatggatga 41492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22276077 - 22275754
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22276077 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 22275978  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275977 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 22275878  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22275877 acatgatgcgtctcatgtgatacaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacagttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagatgaag 22275778  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22275777 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 22275754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 12640564 - 12640887
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  12640564 gttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 12640663  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640664 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 12640763  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12640764 gcatgatgcttctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtcagagataatttgaccgttgagactttgccggttaggattgaggatcgcgagttgaag 12640863  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  12640864 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 12640887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 24831832 - 24832155
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  24831832 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 24831931  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24831932 tcattaagaaggttggggttgtagcgtaccggattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagcatgt 24832031  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24832032 gcatgatacgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgcgagttgaag 24832131  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  24832132 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 24832155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 24570313 - 24570636
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  24570313 gttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgttggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 24570412  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24570413 ttgttgagaaggttggggttgtagcgtattggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtacgt 24570512  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||| ||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    |||||| | |||||||||||||| |  || ||||||    
T  24570513 gcacgatgcgtctcatgtgatcgaagtggacgagttggaagtaagagataatttgaccgttgaaacttggtcggttaggattgaggaccttgaattgaag 24570612  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24570613 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 24570636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28144761 - 28144442
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| | ||||||      
T  28144761 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtaaccggtgttggacgtgctttgaagtgtaggaagttaactcatcgttttgttggaccgtttgaga 28144662  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  28144661 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtttctcagttacggaagtatgt 28144562  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  28144561 gtatgatgcgtcacatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagggataatttgaccgttgagacttggccagttaggattgaggatcgtgaagtgaag 28144462  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagat 331  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  28144461 cgtttgcgaggcaaagagat 28144442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 22762214 - 22762537
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||| |||||| |||||||||| | ||| || |||||| ||||  ||| | ||||||||    
T  22762214 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtaactggtgttagtcgtggtttgaagtgtcgaaagttgactcctcattttggtggaccgtttgatg 22762313  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22762314 ttgttgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtccaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtttgt 22762413  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac----ggtacttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |  ||||| || |||||||||||||| || ||  |||||    
T  22762414 gtatgatgcgtctcatgtgattcaagtggacgaattggaagtaagagataatttaaccattgagacttgtccggttaggattgaggaccgtgaagtgaag 22762513  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22762514 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 22762537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 23817738 - 23817994
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | || |  ||||| |    
T  23817738 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcctagttttgtaggaccatttgagg 23817837  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817838 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccaactttgccgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 23817937  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac 272  Q
      ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23817938 atatgatgcgtctcatgtgatccaagtggatgagttggtagtaagagataatttgac 23817994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25128445 - 25128135
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||| |  |||||| |||| |||| | ||||||      
T  25128445 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccatgtgactggtgttggacgcgctttgaattgtcgaaagtttactcctctttttgttggaccgtttgaga 25128346  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25128345 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttatcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgcggaagtatgt 25128246  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  25128245 gtatgatgcaacacatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagggataatttgaccgttgagacttgaccagttaggattgaggatcgcgaagtgaag 25128146  T
Q  312 cgtttgcgtgg 322  Q
    |||||||||||    
T  25128145 cgtttgcgtgg 25128135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 21908936 - 21909232
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  || || || ||||| |||| |||||||||  ||||| || | || | |||| |||| |  |||||      
T  21908936 gttgatgatcatgtgttttttagagtgaatcacgtaactggtgttggacgtgatttgaagtgccggaagttgacaccgcattttgttggaccatttgaga 21909035  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattgga-------ttgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgagga 208  Q
    |||| ||||| || || |||| |||||||||||       |||||||||   |||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  21909036 ttatagagaaagtcggagttgtagcgtattggataatggattgcgttactgtcgtcgttatcgaatcttaatgatgtttttcatgtatcttaattgagga 21909135  T
Q  209 agtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcg 301  Q
    |||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  21909136 agtatgtatatgatatgtctcatatgattcaagtggatgatattgaggtaagagataatttgactgttaagacttggccagttaggattgaagatcg 21909232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1341
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1018 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 1117  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1118 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtatctcagttgaggaagtaagt 1217  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1218 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagataattttaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 1317  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||| || |||||||||    
T  1318 cgtttgcgtggaaaagagattgtt 1341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 98213 - 97890
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  98213 gttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 98114  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  98113 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgttgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaattatgt 98014  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  98013 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggattgtgagttgaag 97914  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  97913 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 97890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 23573 - 23897
Alignment:
Q  15 tgttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| | |||||||    
T  23573 tgttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactccccattttattggaccgtttgat 23672  T
Q  115 gttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatg 214  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23673 gttattgagaaggttgggattgtagcgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtttg 23772  T
Q  215 tgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaa 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  23773 tgcatgatgtgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatatgaccgttgagacttggccggttagaattgacgatcgtgagatgaa 23872  T
Q  311 gcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||    
T  23873 gcgtttgcgaggcaaaaagattgtt 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 21850885 - 21851208
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21850885 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 21850984  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850985 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcagattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 21851084  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21851085 gcatgatgcgtctcatgtgatccaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagacttggccggttaggattaaagatcgtgagttgaag 21851184  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  21851185 cggttgcgtggcaaggagattgtt 21851208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 16877643 - 16877966
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16877643 gttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 16877742  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16877743 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtcttagttgaggaagtatgt 16877842  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16877843 gcatgatgcttctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtcagagataatttgaccgttgagactttgccggttaggattgaggatcgcgagttgaag 16877942  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  16877943 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 16877966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 21197053 - 21197373
Alignment:
Q  19 ggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgtta 118  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  21197053 ggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatgttg 21197152  T
Q  119 ttgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgca 218  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21197153 ttgagacggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccatcgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaaatatgtgta 21197252  T
Q  219 tgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgt 314  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||    
T  21197253 cgatgcgtctcatgtgattcaagtggacgaattggaagtaagagataatttgatcgttgagacttggccggttaggattgaggaccatgaagtgaagcgt 21197352  T
Q  315 ttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21197353 ttgcgtggcaaggagattgtt 21197373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 20652881 - 20653204
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  20652881 gttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgtttcgttggaccgtttgatg 20652980  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20652981 tggttgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcattaccaccatcgttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtatctcagttgaggaagtatgt 20653080  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||    
T  20653081 gtatgatgcatctcatgtgatccaagtggatgatttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatagtgaagtgaag 20653180  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  20653181 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 20653204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22982669 - 22982346
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| | || | ||||||||    
T  22982669 gttggtgatcatgcgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgtgctttgaagtgtcagaagttgactcctcgttttgtcggaccgtttgatg 22982570  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || ||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22982569 ttgttgaggaaattggggttgtagcgtatcggattgcgttgccaccatctttgccgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 22982470  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    | |||||| |||||||||||||| |||||  ||||     
T  22982469 gtatgacgcgtctcatgtgattcaagtggatgaactagaagtaagagataatttgaccgttgagatttggccggttaggattgaggaccgagaagtgaaa 22982370  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  22982369 cgtttgcgtggcaaggaaattgtt 22982346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23151154 - 23150858
Alignment:
Q  43 aatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgt 142  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||| |||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23151154 aatcctgtaactggtgttgggcgtgctttaaagtgtaggaagtcgactcctcattttgttggtccttttgatgttgttgagaaggttggggttgtagcgt 23151055  T
Q  143 attggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagt 242  Q
    ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||    
T  23151054 atcagaatgcgttaccatcgtctttgtcgaatcttcatgatatgtttcatgtgtctcaattgcggaagtatgtgtatgatgcgtctcatgcgatccaagt 23150955  T
Q  243 ggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  23150954 ggatgaattggaagtaagggataatttgaccgttgagacttggccagtttggattgaggatcgtgaagtgaagcggttgcatgacaaagagattgtt 23150858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22315424 - 22315110
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |  |||||      
T  22315424 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttggaccatttgaga 22315325  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||         ||||||| | ||||| ||    
T  22315324 ttattgagaaggttggggttgtagcatatcggattgcgttaccaccatcgttgtcgaatttacatgatgtgtt---------tcagttgcgaaagtacgt 22315234  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
      |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  22315233 atatgatgcgttgcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagagacaatttgaccgttgaaacttggccagttaggattgaggatcgtgaagtgaag 22315134  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22315133 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 22315110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25282364 - 25282044
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||| ||| |||||| ||||  |||| || |  |  ||||| |||||||||||||      
T  25282364 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtaaccagtgttggacgtactttgatgtgttagaagttgacagcgtgttttgttgggctgtttgagt 25282265  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtc-tttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatg 214  Q
    |||||||||| ||||| | || ||| |||  |||||||||  | ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25282264 ttattgagaatgttggagatgtagcatatcagattgcgttttcgccgtcgtttttcgaattttcatgatgtgtttcatgtatctcaattgaggaagtatg 25282165  T
Q  215 tgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaa 310  Q
    || |||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  25282164 tgtatgatgtgtctcacgtgattcaagtggatgatttagaagtaagggataatttgattgttgagacttgaccagttaggattgaggatcgggaagtgaa 25282065  T
Q  311 gcgtttgcgtggcaaggagat 331  Q
    ||||||| | ||||| |||||    
T  25282064 gcgtttgagaggcaaagagat 25282044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Original strand, 26135833 - 26135958
Alignment:
Q  196 tctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttagga 291  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  26135833 tctcggttgcggaagtatgtgtatgatgcgtctcacgtgattcaagtggatgattttgaagtaagggataatttgaccgttgaaacttggccagttagga 26135932  T
Q  292 ttgaggatcgagagttgaagcgtttg 317  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||    
T  26135933 ttgaggatcgggaggtgaagcatttg 26135958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 24818170 - 24818420
Alignment:
Q  22 gatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattg 121  Q
    |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| || |  ||||||||||||||||||||| || | ||   ||||||||| |  |||||  | ||||    
T  24818170 gatcatgtgtttttaagagtgaacctcgtgaccggtgtcgaacgtgctttgaagtgtaggaagttgacaccatattttattggtccatttgagatcattg 24818269  T
Q  122 agaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatga 221  Q
    |||| || || |  | ||||||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||  ||| |||||||| ||| |  | |  ||||||||| ||||    
T  24818270 agaaagtgggagcagtagcgtatcggattgcgttgccgccgttgttgtcgaatcttcatagtgtatttcatgtatctaaactcaaaaagtatgtgtatga 24818369  T
Q  222 tgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac 272  Q
      |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24818370 cccgtcacatgtgattcaagtggatgatttggaagtaattgataatttgac 24818420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24094327 - 24094118
Alignment:
Q  64 cgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||| || | || |||||  |||| |||||| |  ||||  |||||||||| |||| | ||||| ||||| | || |  ||||    
T  24094327 cgtgctttgaagtgtaggaagttgacaccacgtttacttggtctgtttaagattatcaagaaggttggagttgtaccgtatcggatttcattgcttccgt 24094228  T
Q  164 ctttgtcgaatcttcat-gatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagag 262  Q
    | ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||     ||||||||||  ||||  | ||  | ||| |||||||||| || ||||||||||| |    
T  24094227 cgttgtcgaatcttcatagttttttttcatgtgtctcaacatcggaagtatgtttatgacccatcataggtgattcaagtggaggatttggaagtaaggg 24094128  T
Q  263 ataatttgac 272  Q
    ||||||||||    
T  24094127 ataatttgac 24094118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19863134 - 19863076
Alignment:
Q  172 aatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctca 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19863134 aatcttcatgaagtgtttcatgtgtctcaacttaggaaatatgttcatgatccgtctca 19863076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19867771 - 19867713
Alignment:
Q  172 aatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctca 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19867771 aatcttcatgaagtgtttcatgtgtctcaacttaggaaatatgttcatgatccgtctca 19867713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14997483 - 14997160
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  14997483 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 14997384  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997383 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcattaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgcttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 14997284  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14997283 gaatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggttgagacttggccgattaggattgaggatcgtgagtcgaag 14997184  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  14997183 cgtttgcgtggcaaagggattgtt 14997160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 15293262 - 15293585
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15293262 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 15293361  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15293362 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 15293461  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15293462 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggttgagactttaccggttaggattgaggatcgcgagttgaag 15293561  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  15293562 cgtttgcatggcaaagagattgtt 15293585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13247812 - 13247489
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  13247812 gttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgatcggtgttggtcttgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 13247713  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247712 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 13247613  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac----ggtacttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13247612 gcatgatgcgtctcatgtgatacaagtggatgatgtggaagtaagggataatttgaccattgagacttggccggttaggattgaggatcgcgagttgaag 13247513  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13247512 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 13247489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 55375463 - 55375786
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||| |||| | ||||||||    
T  55375463 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagctttgaagtgtatgaagttgacttctcgttttgttggaccgtttgatg 55375562  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55375563 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtacgt 55375662  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  55375663 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagaaataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgatgatcgtgagatgaag 55375762  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    
T  55375763 cgtttgcgtgacaaagagattgtt 55375786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 16445317 - 16445576
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16445317 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 16445416  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445417 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 16445516  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16445517 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacggt 16445576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9291002 - 9290679
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  9291002 gttggtgatcaggtatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgtttcgttggaccgtttgatg 9290903  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9290902 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcaaattgcgttaccaccatctttgtagaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcaattgagaaagtatgt 9290803  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  9290802 acatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtcagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggatcgaggatcgtgagttgaag 9290703  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||    
T  9290702 cgtttgcgtggcaaagaaattgtt 9290679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 12132514 - 12132837
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| | ||| ||      
T  12132514 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtgtcgaaagttgactcctcgttttgttggaccgttggaga 12132613  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12132614 ttatggagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcctcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgcggaagtatgt 12132713  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    ||||| ||||||| |||||||||| | ||  |||||    
T  12132714 gtataatgtgtctcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagggataatttgaccgttgagacttgaccagttaagattgaggattgtgaagtgaag 12132813  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  12132814 catttgcgtggcaaggagattgtt 12132837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 112 - 335
Target Start/End: Original strand, 37955992 - 37956218
Alignment:
Q  112 gatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagt 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37955992 gatgttgttgagaaggttggg-ttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgttttatgtgtctcaattgaggaagt 37956090  T
Q  212 atgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagtt 307  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||  |    
T  37956091 atgtgtatgatgcgtcccatgtgattcaagtggatgatatggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgcgaagt 37956190  T
Q  308 gaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37956191 gaagcgtttgcgtggcaaggaaattgtt 37956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16685421 - 16685165
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || | || |||||| |||||| ||||||      
T  16685421 gttggtgatcatgggtttttgagagtgaatcatgtaaccggtgttgggtgtgctttgaagtgttggaagttgacaccgcgttttgttgggccgtttgaga 16685322  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |||| ||||||||||  | |  |  ||||  || ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16685321 ttatagagaaggttgaagctatattgtatcagactgcgttaccgccgtcgtcgttgaatcttcatgatgtgttttatgtatctcagttgaggaagtatgt 16685222  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac 272  Q
    | | ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16685221 gtacgatccgtctcacgtgattcaagtggatgatttggaagtacgggataatttgac 16685165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 331
Target Start/End: Original strand, 12343063 - 12343260
Alignment:
Q  138 agcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggtt 237  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||| |  ||| |||||| ||| ||    
T  12343063 agcgtatcgaattgcgttaccaccgtctttgtcaaatcttcaagatgtgtttcatgtgtcttagctgcgaaagtatgtgtacaatgtgtctcacgtgatt 12343162  T
Q  238 caagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagat 331  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||    |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  12343163 caagtggatgattcggaagtaagggataatttgaccgttgagacttggtcagttaggatcgaggatcgcgaggtgaagcttttgcgaggcaaagagat 12343260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 84
Target Start/End: Original strand, 12342968 - 12343036
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaag 84  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  12342968 gttggtgatcatgtattttttagagtgtatcctgtaaccgatgttagacgtgctttgaagtgtcggaag 12343036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14855 - 14532
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  14855 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 14756  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14755 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccatcatctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 14656  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||    
T  14655 gcatgatgcgtctcatgtgatacaagtggatgaattggaagtgagagataatttgatcgttgagacttggcaggttaggatcgaggatcgtgagttgaag 14556  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  14555 tgtatgcgtggcaaggagattgtt 14532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43735 - 43413
Alignment:
Q  17 ttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgt 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  43735 ttggtgatcatgtgtttttgacggtgaatcctgtaaccgtagttggtcgtgctttaaagtgtaggaaattgactcctcgttttgttggaccatttgatgt 43636  T
Q  117 tattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtg 216  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43635 tattgagaaggttagggttgtagtgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtacgtg 43536  T
Q  217 catgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagc 312  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43535 catgatgcgcctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgtgagttgaagc 43436  T
Q  313 gtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
     |||||||||||| |||||||||    
T  43435 atttgcgtggcaaagagattgtt 43413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 33103 - 33425
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  33103 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcctcgttttgttggattgtttgatg 33202  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33203 taactgagaaggttggggttgtagc-tatcagattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtatcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 33301  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33302 acacgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacgattgagacttggccggttaggattgagaatcgagagttgaag 33401  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33402 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 33425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 494 - 817
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  494 gttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaacgtttgatg 593  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  594 tcattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtatttcatgtgtctcagttaaggaagtatgt 693  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  694 tcatgatgtgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggttgagaccttgccggttaggatcgaggatcgtgagttgaag 793  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  794 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23588 - 23269
Alignment:
Q  20 gtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttat 119  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||| | ||||||||| ||    
T  23588 gtgatcacgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactgctcgttttgttggaccgtttgatgtcat 23489  T
Q  120 tgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcat 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23488 tgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccttctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcat 23389  T
Q  220 gatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23388 gatgcgtctcatgtgattcaagttgatgaattggaaataagggataatttgacagttgagacttggccggttaggattgaggatggagagttgaagcgtt 23289  T
Q  316 tgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  23288 tgcgtggcaaagggattgtt 23269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 7918 - 8242
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattggg-ctgtttgat 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  | |||||||    
T  7918 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggtaccgtttgat 8017  T
Q  115 gttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatg 214  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8018 gtgattgaaaaggttggggttgtagcgtaccgaattgcgttgccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgggtcttagttgaggaagtatg 8117  T
Q  215 tgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8118 tgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaaggcataatttgacggttgagactttgccggttaggattgaggatcgtgagttgaa 8217  T
Q  311 gcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  8218 gcgtttgcgtggcaaagagattgtt 8242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 40 - 335
Target Start/End: Original strand, 44578 - 44877
Alignment:
Q  40 gtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcag 139  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  44578 gtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatgttattgagcaggttgaggttgtag 44677  T
Q  140 cgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttca 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44678 cgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcaattgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtgattca 44777  T
Q  240 agtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44778 agtggatgaattggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggctggttaggattgaggatcgtgagttgaagcgtatgcgtggcaaagagattgtt 44877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 106681 - 107004
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  106681 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 106780  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106781 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcagattgcgttaccaccgtctttgttgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 106880  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||     
T  106881 gcatgttgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagataacttgaccgttgagacttggccggttatgattgaggatcatgagatgaat 106980  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  106981 cgtttacgtggcaaggagattgtt 107004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24078 - 23755
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | | ||||||||    
T  24078 gttggtgatcatgtgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactccttgttttgttagaccgtttgatg 23979  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23978 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 23879  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23878 tcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagatattttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagatgaag 23779  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
      |||||||||||| |||||||||    
T  23778 tatttgcgtggcaaagagattgtt 23755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 231756 - 231444
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||| | || |||      
T  231756 gttggtgatcatgtgttttttagagtgaatcatgtaacatgtgttggacgtgctttgaagtgtcggaagttgacacctcgttttgttggaccgtatgaga 231657  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || || | |||||| | || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  231656 ttgttaaaaaggttagagtggcagcgtatcagaatgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtttcagttgcggaagtatgt 231557  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    |||| ||||||||||||||| ||||  ||  |||||    
T  231556 gtatgatgcgtctcacgcgattcaattggatgatttggaagtaagggataatttgaccgttgagactttgccagttaggattgaagatcacgaagtgaag 231457  T
Q  312 cgtttgcgtggca 324  Q
    |||||||| ||||    
T  231456 cgtttgcgaggca 231444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 16279 - 16601
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||    
T  16279 gttggggatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgaccggtgtttgtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttattggaccgtttgatg 16378  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16379 ttattgaaaaggt-ggggttgtagcgtatcggagtgtgttaccaccgtctttgttgaatcttcatgatgtgtttcgtgtgtcttagttgaggaagtatgt 16477  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16478 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgatgtggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagttgatg 16577  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  16578 cgtttgcatggcaaggagattgtt 16601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 78737 - 79060
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  78737 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggacggtttgatg 78836  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78837 ttatagagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctatgtcaaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 78936  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||    
T  78937 atatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggatagaagatcgtgagatgaag 79036  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  79037 cgtttgcgtggcaaagagattgtt 79060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 4052 - 4375
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| |  |||||||    
T  4052 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatttggtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaatttgactcctcgttttgttggaccatttgatg 4151  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4152 ttattgagaaggttagggttgtagagtgtcggattgcgttgccaccgtctttgtagaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 4251  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4252 gcatgatgcgtctcatgtgatccaagtggatgaattggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagttgaag 4351  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  4352 cgtttgcgtggcaaggtgattgtt 4375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 8999 - 9322
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | |||||| |    
T  8999 gttggtgatcatctgtttttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgagg 9098  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9099 ttattgagaaggttggggttgtagtgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtatctcaattgaggaagtatgt 9198  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||  || ||  |||||    
T  9199 gtatgatgcgtctcatgtaatccaagtggatgagttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgagggccgtgaagtgaag 9298  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  9299 cgtttgcgtggcaagaagattgtt 9322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13106 - 12783
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |  ||| |||    
T  13106 gttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgtttttttggtcctttttatg 13007  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||| |||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13006 tcattgagatggtttgtgttgtagcgtatcggatttcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 12907  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12906 gcatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagatgaag 12807  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||  ||||||| |||||||||    
T  12806 cgtttctgtggcaaagagattgtt 12783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 1162 - 1485
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1162 gttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 1261  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  1262 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcatgatgtgattaatgtatctcagttgaggaagtatgt 1361  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||  | |||||||||||||| |  ||  |||||    
T  1362 gtatgatgcgtctcatgtgatccaagtggatgaattggaagtaagagataatttgaccgttgagacttgttcggttaggattgaggaccatgaagtgaag 1461  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  1462 cgtttgcatggcaaggagattgtt 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 335
Target Start/End: Original strand, 10425 - 10740
Alignment:
Q  24 tcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgag 123  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  10425 tcatgggtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccatttgatgttattgag 10524  T
Q  124 aaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatg 223  Q
    || |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10525 aaagttggggttgtagcgtatcgaattgcgttaccaccatctttgtcgaatattcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatcatg 10624  T
Q  224 cgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcg 319  Q
    || |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  10625 cggctcatgtgatccaagtggatgaatcggaagtgagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgaactgaaacgtttgcg 10724  T
Q  320 tggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||    
T  10725 tggcaaggagattgtt 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22892 - 22576
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22892 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 22793  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||       |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22792 tcattgagaaggttggggttgtag-------gattgcattaccaccatctctgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 22700  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  22699 gcatgatgcgtctcatgttattcaagtggatgagttggaagtaagagataatttgactgttgagacttggccggttaggattgaagatcgtgagatgaag 22600  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22599 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 22576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 441 - 763
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||| | ||||||||    
T  441 gttggtgatcatgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactccccgttttgttggaccgtttgatg 540  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  541 ttgttgagaaggttggggtcgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtatttcatgtgtttcagttgaggaagtatgt 640  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  641 gtatgatgcgtctcatgtgattcaagtggacgaattgaaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgaactgaag 740  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||   |||||||||||||||||||    
T  741 cg-ccgcgtggcaaggagattgtt 763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 122058 - 122381
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| |  ||| |||    
T  122058 gttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcattttgttggaccatttaatg 122157  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122158 taattgagaaggttggggatgtagcgtataggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 122257  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    |||||||  |||||||| | | ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||    
T  122258 gcatgatttgtctcatgggatacaagtagatgatgtggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgagtgtcgtgactggaag 122357  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  122358 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 122381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 28377 - 28610
Alignment:
Q  19 ggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgtta 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  28377 ggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgatttgttggaccgtttgatgtta 28476  T
Q  119 ttgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgca 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28477 ttgagaaggttggggttgtagcgtataggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtaagtaca 28576  T
Q  219 tgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattg 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28577 tgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgaattg 28610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 335
Target Start/End: Original strand, 36046 - 36138
Alignment:
Q  247 gaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36046 gaattggatgtaagagataatttgacggttgagacttggccggttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttacgtggcaaggagattgtt 36138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13449 - 13126
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13449 gttggtgatcacgtattcttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgcgttaaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttgggttgtttgatg 13350  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13349 ttgttgagagggttggggttgtagcgtatcagattgtgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtatctcagttgaggaagtatgt 13250  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||    
T  13249 gtatgatgcttctcatgtgatccaagtggatgagttggaagtaagagataatttgactgttgaaacttggccggttaggattgaggaccgtgaagtgaag 13150  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  13149 cgtttgcatggcaaagagattgtt 13126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6508 - 6333
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||| |  |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  6508 gttggtgatcacgtattcttgagagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgcgttaaagtgtcggaagttaactccacgttttgttgggccgtttgatg 6409  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttca 191  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6408 ttgttgagagggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccactgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttca 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5939 - 5627
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  5939 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactccttgttttgttggaccgtttgatg 5840  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  5839 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcatgatgtgttt-----------gttgaggaagtatgt 5751  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  5750 gtatgatgcgtcccatgtgattcaagtggatgaattcgaagtaagagataatttgaccgttgagacttggcgggttaggattgaggatcgtgaagtgaag 5651  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    | |||||||| ||| |||||||||    
T  5650 cttttgcgtgacaaagagattgtt 5627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10553 - 10241
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  10553 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactccttgttttgttggaccgtttgatg 10454  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  10453 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcatgatgtgttt-----------gttgaggaagtatgt 10365  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  10364 gtatgatgcgtcccatgtgattcaagtggatgaattcgaagtaagagataatttgaccgttgagacttggcgggttaggattgaggatcgtgaagtgaag 10265  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    | |||||||| ||| |||||||||    
T  10264 cttttgcgtgacaaagagattgtt 10241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8548 - 8236
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  8548 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactccttgttttgttggaccgtttgatg 8449  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  8448 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccatctttgtcgaatcttcatgatgtgttt-----------gttgaggaagtatgt 8360  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  8359 gtatgatgcgtcccatgtgattcaagtggatgaattcgaagtaagagataatttgaccgttgagacttggcgggttaggattgaggatcgtgaagtgaag 8260  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    | |||||||| ||| |||||||||    
T  8259 cttttgcgtgacaaagagattgtt 8236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9185 - 8862
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  9185 gttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgttggaatttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 9086  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9085 tcgtagagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgttgaatcttcatgatgtgtttcacgtgtcttagttgaggaagtatgt 8986  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac----ggtacttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
    | | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |  |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||     
T  8985 gtacgatgcgtctcatatgattcaagtggatgaactggaagtaagagataatttgaccgctgagacttggccggttaggattgaggaccgtgaagtgaaa 8886  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  8885 cgtctgcgtggcaaggagattgtt 8862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 3983 - 4290
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||| | ||||||||    
T  3983 gttgatgatcatgtgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcctcgtttagttggaccgtttgatg 4082  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                 
T  4083 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcattaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagt------------- 4169  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
       | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4170 ---taatgcgtctcatgtggttcaagtggataaattggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcgtgagatgaag 4266  T
Q  312 cgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  4267 cggttgcgtggcaaagagattgtt 4290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14721 - 14489
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | |||||| |    
T  14721 gttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgagg 14622  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14621 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatat 14522  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatga 248  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14521 gtatgatgcgactcatgtgattcaagtggatga 14489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7474 - 7415
Alignment:
Q  276 acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7474 acttggccagttaggattgaggaacgtgaagtgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 118 - 335
Target Start/End: Original strand, 5370 - 5590
Alignment:
Q  118 attgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgc 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370 attgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgc 5469  T
Q  218 atgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcg 313  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  5470 atgatgcctctcatgtgattcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgatggttgagacttggccggttaggattgaggatcgtga-ctgaagag 5568  T
Q  314 tttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  5569 tttgcgtagcaaagagattgtt 5590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 14845 - 15014
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  14845 gttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgtttg-ttggactgtttgatg 14943  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14944 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtg 15014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8293 - 8090
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8293 gttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 8194  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8193 ttattgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatat 8094  T
Q  216 gcat 219  Q
    ||||    
T  8093 gcat 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10854 - 10549
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  |||| || | ||||||||| |||||| ||||||      
T  10854 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaattttgtaaccggtgttggacgtgctttcaagtgttagaagttgacacctcgttttgttgggccgtttgaga 10755  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10754 ttgttgagaaggttggagttgtagcgtatcggattgtgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgcggaagtatgt 10655  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaag 311  Q
      |  |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  10654 atacaatgcgtctcgcgtgattcaagtggatgatttggaggtatgagataatttgaccgttgagacttggccagttagaattgaggatcgcgaggtgaag 10555  T
Q  312 cgtttg 317  Q
    ||||||    
T  10554 cgtttg 10549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 131 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1269 - 1061
Alignment:
Q  131 gggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctca 230  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1269 gggttgtagcgtatcggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcataatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctca 1170  T
Q  231 tgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgac----ggtacttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaag 326  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  1169 tgtgatccaagtggatgagttggaagtaagagataatttgacttttgagactttgccggttaggattgaggatcgtgatttgaagcgtttgcgtggcaaa 1070  T
Q  327 gagattgtt 335  Q
    |||||||||    
T  1069 gagattgtt 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14328 - 14039
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | || |||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14328 gttggtgatcatgtatttttgagactgaatcctataactggagtcagtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcctcgttttgttgggccgtttgatg 14229  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14228 tcatcgagaaggttggggttgtagcgtatcgggttgcgttaccacagtctttggcaaatcttcatgatgtgtttcatgtgtcttagttgaagaagtatgt 14129  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcg 301  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||  ||||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||||    
T  14128 gtatgatgcgtctcatgtgattcaagcagatgatttggaagtaaggaataatttaaccgttgagacttggccggttaggattgaggatcg 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3357 - 3170
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  3357 gttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgatg 3258  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagtt 203  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3257 tcgttgagaaggttggggttgtagcgtatcggattgcattaccaccatctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagtt 3170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3152 - 2991
Alignment:
Q  178 catgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt-- 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||      
T  3152 catgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgtatgatgcgtctcatgtgattcaagtggatgatttggaagtaagagataatttggccgttg 3053  T
Q  276 --acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
      | || |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3052 agattttgccagttaggattgaggaccgtgaagtgaagcgtttgcgtggcaaagagattgtt 2991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14116 - 13849
Alignment:
Q  58 gttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttac 157  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  14116 gttggacgtgctttgaagtgtcgaaagttgactcctcgttttgttggaccgtttgagattattgaaaaggttggggttatagcgtatcagattgcgttac 14017  T
Q  158 caccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14016 caccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttc-tgtgtcctagttgcggcagtatgtgtatgatgcgtctcatgtgattcaagtggataaattggaagt 13918  T
Q  258 aagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtgg 322  Q
    ||||||||||||||| ||    ||||| | |||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||    
T  13917 aagagataatttgaccgttgagacttgactagttaggattgaggatcacgaagtgaagcgtttgtgtgg 13849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 298
Target Start/End: Original strand, 370248 - 370533
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  | |||||||||||| ||||| || | || |||||| |||| |  |||||      
T  370248 gttggtgatcatgtgttttttagagtgaattctgtaaccggtgttggatgagctttgaagtgttggaagttgacaccgcgttttgttggaccatttgaga 370347  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    || |||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  370348 ttgttgataaggttggagttgtagcgtattggattgtgttacc-ccgtcattgtcgaatcttcatgatgtgtttcatttgtctcagttgcagaagtatgt 370446  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgagga 298  Q
       | |||| | ||  ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||    
T  370447 attttatgcatttcgcgtgattcaagtggatgatttggaagtatgggataatttgaccgtagagacttggacagttaggattgagga 370533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 200
Target Start/End: Original strand, 5189 - 5319
Alignment:
Q  70 ttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatgttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgt 169  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5189 ttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttgttgggccatttgatgttattgagaaggttggggttgtagtgtatcggattgcgttaccaccgtctttgt 5288  T
Q  170 cgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctca 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5289 agaatcttcatgatgtgtttcatgtttctca 5319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Original strand, 5315 - 5428
Alignment:
Q  226 tctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5315 tctcatgtgattcaagtggatgagttggaagcaagagataatttgaccgttgagacttggccgattaggattgaggatcgtgagttgaagcgttttcgtg 5414  T
Q  322 gcaaggagattgtt 335  Q
     ||| |||||||||    
T  5415 acaaagagattgtt 5428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 78415 - 78224
Alignment:
Q  148 attgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatg 247  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  78415 attgcgttaccgccgtcgttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgcggaagtacgtgtatgatgtgtctcacatgattcaagtggatg 78316  T
Q  248 aattggaagtaagagataatttgacgg----tacttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |    ||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||| || | ||||| |||||||||    
T  78315 atttggaagtaagggataatttgaccgtttatacttgagcagttaggattgaggatcgggaagtgaagcgtatgagaggcaaagagattgtt 78224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 74098 - 73811
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgggctgtttgatg 115  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || | || |||||| |||| | ||||||      
T  74098 gttgatgatcatgtgtttctgagagtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaagtgttggaagttgacaccacgttttgttggaccgtttgaga 73999  T
Q  116 ttattgagaaggttggggttgcagcgtattggattgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgt 215  Q
    |   | | |||||||| | || ||| ||| |||||||||||   | ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  73998 taggttataaggttggagatgtagcatatcggattgcgttattgctgtcgttgcagaatcttcatgatgtgttt-atgtgtctcagttgaggaagtatgt 73900  T
Q  216 gcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatc 300  Q
    | |||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||| |||||||| ||||||||    
T  73899 gtatgatgtgtctcacgtgattcaagtttatgatttggaagtaagggataatttgacagttgagacttggctagttaggagtgaggatc 73811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 328
Target Start/End: Original strand, 202903 - 203038
Alignment:
Q  197 ctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggat 292  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||  ||||||||||    
T  202903 ctcagttgcggaagtatgtgtatgatgtgtctcttgtgattcaagtggatgatttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttgatcagttaggat 203002  T
Q  293 tgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaagga 328  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  203003 tgaggatcgcgaggtgaagcgttttcgtggcaagga 203038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21358 - 21237
Alignment:
Q  215 tgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaa 310  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21358 tgcatgatgagtctcatgtgatccaagtagatgaattggaagtaagagataatttgaccgttgagatttggccggttaggattgaagatcgtgagttgaa 21259  T
Q  311 gcgtttgcgtggcaaggagatt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21258 gcgtttgcgtggcaaggagatt 21237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Original strand, 1007 - 1130
Alignment:
Q  148 attgcgttaccaccgtctttgtcgaatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctcatgtggttcaagtggatg 247  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||    
T  1007 attgcgttaccaccgacgttgtcgaacctgcataatgtgtttcatgtgtctcaattgcataagtatgtgtatgatttgtcccatgtggttcaagtgaatg 1106  T
Q  248 aattggaagtaagagataatttga 271  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  1107 atttggaagtaagtgataatttga 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 335
Target Start/End: Original strand, 1 - 90
Alignment:
Q  250 ttggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtggcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1 ttggaagtaagagataatttgaccgttgagacttggctggttaggattgaggatcgtgagttgaagcgtatgcgtggcaaagagattgtt 90  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Original strand, 33897 - 34010
Alignment:
Q  226 tctcatgtggttcaagtggatgaattggaagtaagagataatttgacggt----acttggccagttaggattgaggatcgagagttgaagcgtttgcgtg 321  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||    
T  33897 tctcatgtgattcaactggatgatttgaaagtaaaagataatttgaccgttgtgacttgaccagttaggattgagcatcgcaaggtgaagcgtttccgtg 33996  T
Q  322 gcaaggagattgtt 335  Q
    ||||||| ||||||    
T  33997 gcaaggaaattgtt 34010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7366 - 7278
Alignment:
Q  16 gttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgttaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagctggctcctcgttttattgg 104  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| ||||    
T  7366 gttggtgatcatgtgttcttgagagcgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctctgaagcgtaggaagttgactccccgttttgttgg 7278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Original strand, 13459 - 13517
Alignment:
Q  172 aatcttcatgatgtgtttcatgtgtctcagttgaggaagtatgtgcatgatgcgtctca 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  13459 aatcttcatgaagtgtttcatgtgtctcaactaaggaaatatgttcatgatccgtctca 13517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University