View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9410_high_8 (Length: 390)

Name: NF9410_high_8
Description: NF9410
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9410_high_8
NF9410_high_8
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (10-339)||(12248329-12248658)
chr3 (10-312)||(23758314-23758616)
chr3 (10-382)||(38195735-38196107)
chr3 (10-382)||(39373064-39373437)
chr3 (10-379)||(28323701-28324071)
chr3 (10-265)||(4744819-4745074)
chr3 (10-265)||(5511775-5512030)
chr3 (10-265)||(5546505-5546760)
chr3 (10-265)||(13382153-13382409)
chr3 (10-265)||(13392747-13393003)
chr3 (10-265)||(5875146-5875401)
chr3 (10-265)||(16477358-16477615)
chr3 (10-265)||(5626861-5627115)
chr3 (10-265)||(12295704-12295958)
chr3 (10-265)||(41684756-41685010)
chr3 (10-382)||(8775686-8776040)
chr3 (10-265)||(24660997-24661251)
chr3 (10-265)||(24392956-24393211)
chr3 (10-318)||(6499864-6500180)
chr3 (10-318)||(9992794-9993112)
chr3 (100-317)||(10654248-10654462)
chr3 (10-255)||(18485129-18485373)
chr3 (12-319)||(16390427-16390744)
chr3 (10-182)||(6219538-6219710)
chr3 (10-183)||(19779600-19779773)
chr3 (10-184)||(37867664-37867838)
chr3 (10-184)||(37876182-37876356)
chr3 (10-180)||(20682617-20682787)
chr3 (10-180)||(14466815-14466985)
chr3 (10-180)||(13122889-13123059)
chr3 (10-104)||(10635920-10636014)
chr3 (17-198)||(29470675-29470856)
chr3 (305-382)||(18485055-18485132)
chr3 (287-318)||(37876014-37876045)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (10-339)||(9907060-9907389)
chr2 (10-382)||(27222366-27222738)
chr2 (10-382)||(35253978-35254351)
chr2 (10-382)||(35264587-35264960)
chr2 (10-265)||(9772231-9772489)
chr2 (10-265)||(40223396-40223651)
chr2 (10-265)||(43346462-43346717)
chr2 (10-265)||(11404345-11404604)
chr2 (10-265)||(10268046-10268300)
chr2 (10-265)||(10278623-10278877)
chr2 (42-265)||(34803303-34803526)
chr2 (10-182)||(24337264-24337436)
chr2 (10-184)||(29245393-29245567)
chr2 (10-184)||(43083835-43084009)
chr2 (10-180)||(22959203-22959373)
chr2 (10-179)||(4211085-4211254)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (10-339)||(466541-466869)
chr7 (10-379)||(11006181-11006552)
chr7 (10-265)||(2715185-2715440)
chr7 (10-265)||(9086337-9086592)
chr7 (10-265)||(26698677-26698932)
chr7 (10-265)||(26399644-26399899)
chr7 (10-265)||(8011635-8011892)
chr7 (10-265)||(40051652-40051906)
chr7 (10-382)||(42866840-42867193)
chr7 (10-364)||(1988568-1988903)
chr7 (10-265)||(11097117-11097376)
chr7 (10-265)||(24735834-24736088)
chr7 (10-185)||(21001956-21002131)
chr7 (10-184)||(5686723-5686897)
chr7 (10-184)||(9434427-9434601)
chr7 (10-184)||(6876791-6876965)
chr7 (12-186)||(19992966-19993140)
chr7 (10-182)||(22090372-22090544)
chr7 (10-180)||(4213219-4213389)
chr7 (10-180)||(17959623-17959793)
chr7 (10-180)||(168090-168260)
chr7 (10-178)||(8618587-8618755)
chr7 (226-334)||(9434264-9434375)
chr7 (226-334)||(21002182-21002293)
chr7 (107-181)||(15887291-15887365)
chr7 (287-335)||(9086247-9086295)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (10-382)||(18761969-18762340)
chr4 (10-265)||(451673-451928)
chr4 (10-265)||(30935979-30936234)
chr4 (10-265)||(21997513-21997768)
chr4 (10-382)||(24641294-24641667)
chr4 (10-382)||(27657627-27658000)
chr4 (10-246)||(55754716-55754952)
chr4 (10-265)||(36019433-36019687)
chr4 (10-265)||(10750056-10750310)
chr4 (10-265)||(10963825-10964079)
chr4 (10-184)||(24026926-24027100)
chr4 (10-182)||(17919294-17919466)
chr4 (10-184)||(19953843-19954017)
chr4 (10-180)||(16257112-16257282)
chr4 (12-184)||(40469482-40469654)
chr4 (212-279)||(40469690-40469757)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (10-265)||(12731552-12731807)
chr1 (10-265)||(12742145-12742400)
chr1 (10-382)||(35400043-35400416)
chr1 (10-382)||(35647568-35647941)
chr1 (10-382)||(3172546-3172920)
chr1 (10-265)||(38096126-38096383)
chr1 (10-265)||(7508343-7508597)
chr1 (10-265)||(36245931-36246185)
chr1 (10-379)||(47617437-47617786)
chr1 (10-265)||(51655375-51655629)
chr1 (10-364)||(5834191-5834524)
chr1 (10-184)||(4168401-4168575)
chr1 (10-184)||(19180085-19180259)
chr1 (10-182)||(5649257-5649429)
chr1 (10-182)||(21864824-21864996)
chr1 (10-180)||(12622677-12622847)
chr1 (17-198)||(153158-153339)
chr1 (287-335)||(36246227-36246275)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (10-382)||(46482-46854)
[»] scaffold0906 (2 HSPs)
scaffold0906 (10-339)||(3424-3760)
scaffold0906 (351-382)||(3757-3788)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (10-265)||(15994310-15994565)
chr5 (10-265)||(31842987-31843242)
chr5 (10-265)||(23371531-23371786)
chr5 (10-265)||(23706378-23706633)
chr5 (10-265)||(36583526-36583781)
chr5 (10-265)||(42052390-42052645)
chr5 (10-265)||(9345562-9345817)
chr5 (10-265)||(24589081-24589336)
chr5 (10-265)||(30228473-30228728)
chr5 (10-265)||(14559085-14559340)
chr5 (10-265)||(15768362-15768619)
chr5 (10-265)||(37730975-37731234)
chr5 (10-382)||(36697196-36697590)
chr5 (10-265)||(6985320-6985574)
chr5 (10-265)||(14039619-14039873)
chr5 (10-265)||(22685025-22685279)
chr5 (10-265)||(23305868-23306122)
chr5 (10-265)||(24817869-24818123)
chr5 (10-265)||(27469583-27469837)
chr5 (10-265)||(17728498-17728757)
chr5 (10-265)||(27043234-27043491)
chr5 (10-265)||(31358115-31358374)
chr5 (10-246)||(17616641-17616877)
chr5 (10-265)||(39491915-39492169)
chr5 (10-265)||(14448055-14448308)
chr5 (10-364)||(35225084-35225417)
chr5 (14-319)||(31447510-31447825)
chr5 (10-182)||(40399989-40400161)
chr5 (10-184)||(5291675-5291849)
chr5 (10-184)||(27604554-27604728)
chr5 (10-183)||(39361270-39361443)
chr5 (10-180)||(22156074-22156244)
chr5 (95-198)||(1110282-1110385)
chr5 (95-198)||(20796728-20796831)
chr5 (226-318)||(5291528-5291623)
chr5 (287-319)||(23371828-23371860)
chr5 (287-335)||(24588991-24589039)
chr5 (287-335)||(30228383-30228431)
chr5 (287-335)||(42052687-42052735)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (10-382)||(13687498-13687871)
chr8 (10-265)||(209087-209342)
chr8 (10-265)||(722710-722965)
chr8 (10-265)||(29077811-29078066)
chr8 (10-265)||(32087203-32087458)
chr8 (10-265)||(15766081-15766339)
chr8 (10-265)||(15790218-15790476)
chr8 (10-265)||(242914-243168)
chr8 (10-265)||(796284-796538)
chr8 (10-265)||(36294030-36294285)
chr8 (10-382)||(44482109-44482503)
chr8 (10-265)||(3358139-3358393)
chr8 (10-364)||(36078955-36079290)
chr8 (10-265)||(9342236-9342490)
chr8 (10-184)||(26112468-26112642)
chr8 (10-184)||(19129938-19130112)
chr8 (10-180)||(6152292-6152462)
chr8 (107-181)||(19226134-19226208)
chr8 (107-181)||(30324259-30324333)
chr8 (226-318)||(19129789-19129884)
chr8 (287-335)||(29077721-29077769)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (10-265)||(12856018-12856273)
chr6 (10-265)||(3662413-3662668)
chr6 (10-265)||(25788797-25789052)
chr6 (10-265)||(26865861-26866116)
chr6 (10-265)||(17983618-17983877)
chr6 (10-265)||(27342797-27343051)
chr6 (10-265)||(27403537-27403791)
chr6 (10-382)||(4631840-4632234)
chr6 (10-382)||(32310543-32310937)
chr6 (10-265)||(26026489-26026743)
chr6 (10-265)||(16931463-16931718)
chr6 (10-382)||(27385366-27385760)
chr6 (10-382)||(27475779-27476173)
chr6 (10-265)||(12726317-12726576)
chr6 (10-185)||(9122013-9122188)
chr6 (10-186)||(27373931-27374107)
chr6 (10-186)||(27464284-27464460)
chr6 (12-184)||(25590360-25590532)
chr6 (10-180)||(34816655-34816825)
chr6 (10-178)||(32971358-32971526)
chr6 (93-184)||(7669375-7669466)
chr6 (107-181)||(12359298-12359372)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (10-265)||(32234-32489)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-382)||(2249-2642)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (96-339)||(23641-23892)
scaffold0199 (10-85)||(23924-23999)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (12-184)||(267-439)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (17-185)||(52481-52649)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (107-198)||(3338-3429)
scaffold0398 (107-198)||(11593-11684)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (12-74)||(3567-3629)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (96-198)||(2863-2965)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (107-181)||(23758-23832)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 12248329 - 12248658
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12248329 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgctagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12248428  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12248429 tcagaagaaggatgatcagatcaagcatctcttagaacagttgtttaagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12248528  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttattg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12248529 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattg 12248628  T
Q  310 tttttaatgtcttatgctctgatacttctt 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12248629 tttttaatgtcttatgctctaatacttctt 12248658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 10 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23758616 - 23758314
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23758616 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 23758517  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23758516 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactaacttgttttttacttttgt 23758417  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttattg 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23758416 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttatttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttattg 23758317  T
Q  310 ttt 312  Q
    |||    
T  23758316 ttt 23758314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38196107 - 38195735
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  38196107 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 38196009  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38196008 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 38195910  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  38195909 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttat 38195810  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38195809 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 38195735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 39373437 - 39373064
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  39373437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 39373339  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39373338 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 39373240  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  39373239 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 39373140  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39373139 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 39373064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 379
Target Start/End: Original strand, 28323701 - 28324071
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  28323701 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatctcaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 28323799  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28323800 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttg 28323898  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  28323899 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 28323998  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctct 379  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28323999 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctct 28324071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4745074 - 4744819
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  4745074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 4744976  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4744975 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 4744876  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4744875 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 4744819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5512030 - 5511775
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5512030 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 5511932  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5511931 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 5511832  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5511831 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5511775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 5546505 - 5546760
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5546505 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 5546603  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546604 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 5546703  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5546704 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5546760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 13382153 - 13382409
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13382153 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 13382251  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-ttttttactttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13382252 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttactttt 13382351  T
Q  208 gttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13382352 gttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 13382409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 13392747 - 13393003
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13392747 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 13392845  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-ttttttactttt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13392846 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttactttt 13392945  T
Q  208 gttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13392946 gttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 13393003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 5875146 - 5875401
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||   | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5875146 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacaaagaatga-gggaaaaggatgagctac 5875244  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5875245 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 5875344  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5875345 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5875401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16477615 - 16477358
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  16477615 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 16477517  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16477516 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 16477417  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  16477416 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatatattatcattgttt 16477358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 5626861 - 5627115
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5626861 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 5626959  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5626960 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 5627059  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  5627060 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 5627115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 12295704 - 12295958
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  12295704 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 12295802  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12295803 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 12295902  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12295903 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 12295958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41685010 - 41684756
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  41685010 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 41684912  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41684911 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 41684812  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  41684811 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 41684756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8776040 - 8775686
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  8776040 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 8775942  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8775941 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 8775843  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttatt 308  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    ||||         ||| ||      |||||||||| ||||||||||||    
T  8775842 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatatta----tgtt--------ctatttt-----tttttaactctaatgatatttatt 8775760  T
Q  309 gtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8775759 gattttaatgtcacatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 8775686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24661251 - 24660997
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24661251 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 24661153  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661152 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 24661053  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24661052 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24660997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 24392956 - 24393211
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24392956 tggacatcactcctttctattcagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 24393054  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-ttttttactttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24393055 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttactttt 24393154  T
Q  208 gttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24393155 gttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24393211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Original strand, 6499864 - 6500180
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  6499864 tggacatcactcctttctatcaagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 6499962  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac---tctagcttgttttttactt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||    
T  6499963 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatcttttggaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacacttttagcttg-tttttactt 6500061  T
Q  206 ttgttc-------ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgat 298  Q
     |||||       | |||||||||  |||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  6500062 gtgttctaaattatcagtagcttttcctttgtatcttaacttgtcaatat-aatattatcattgtttctgaaaaatatgttctacagttttaactctgat 6500160  T
Q  299 gatatttattgtttttaatg 318  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6500161 gatgtttattgtttttaatg 6500180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 318
Target Start/End: Original strand, 9992794 - 9993112
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  9992794 tggacatcactcctttctatcccgaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 9992892  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc---tagcttgttttttactt 205  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||    
T  9992893 ttaagaagaaggatgatcatatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactcttagcttg-tttttactt 9992991  T
Q  206 ttgttc--------ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctga 297  Q
    | ||||        | |||||||||  || ||||||||||  | ||  |||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| | |||||||||| |    
T  9992992 tggttctaaatttatcagtagctttgcctctgtatcttaatttgtcaatataaatattatcattatttctgaaaaatatgttctacagttttaactctaa 9993091  T
Q  298 tgatatttattgtttttaatg 318  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9993092 tgatatttattgtttttaatg 9993112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 100 - 317
Target Start/End: Original strand, 10654248 - 10654462
Alignment:
Q  100 atgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10654248 atgagctacttcagaagaaagatgatcaaatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-ttt 10654346  T
Q  200 ttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatg 299  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10654347 ttacttttgttctctgtagctttgcctttgta--ttatactttctttataaatatcatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgata 10654444  T
Q  300 atatttattgtttttaat 317  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  10654445 atatttactgtttttaat 10654462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18485373 - 18485129
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  18485373 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 18485275  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18485274 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 18485176  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatatt 255  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  18485175 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatatt 18485129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Original strand, 16390427 - 16390744
Alignment:
Q  12 gacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctactt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  16390427 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcagccagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctactt 16390525  T
Q  111 cagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac--tc-tagcttgt-----ttttta 202  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||     |||||     
T  16390526 cagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccgacattctttgcttgttttaatttttg 16390625  T
Q  203 ct-tttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatga 300  Q
    || |  ||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||  |  |||||||||||| |    
T  16390626 ctctaagttgttagtagctttgcctttgtatcttaacttatctatataaatgttatcattgtttctaaatcttatgttttacaagctttaactctgataa 16390725  T
Q  301 tatttattgtttttaatgt 319  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  16390726 tatttgctgtttttaatgt 16390744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 6219538 - 6219710
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  6219538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 6219636  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 182  Q
    || || |||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6219637 ttaagcagaaggatgaacaaattaagtatctcttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 6219710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19779773 - 19779600
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  19779773 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcataagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 19779675  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 183  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779674 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 19779600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37867838 - 37867664
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  37867838 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 37867740  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867739 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37867664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37876356 - 37876182
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  37876356 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 37876258  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876257 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37876182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 20682617 - 20682787
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20682617 tggacatcactcctttctatacagaagaagagtacatcacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 20682715  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
    |  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20682716 tcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 20682787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14466985 - 14466815
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  14466985 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 14466886  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14466885 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 14466815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13123059 - 13122889
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  13123059 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcattctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 13122960  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13122959 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 13122889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 104
Target Start/End: Original strand, 10635920 - 10636014
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  10635920 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaaatgagagaaaaggatgag 10636014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 29470675 - 29470856
Alignment:
Q  17 cactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctacttcagaag 116  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||| |||| |||||||||||||||   ||||| | |   || | ||||||||| | ||||||||||    
T  29470675 cactcctttctatccagaagatgaggacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 29470774  T
Q  117 aaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 198  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  29470775 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgttt 29470856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18485132 - 18485055
Alignment:
Q  305 tattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18485132 tattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 18485055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37876045 - 37876014
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876045 tttaactctgatgatatttattgtttttaatg 37876014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 9907060 - 9907389
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9907060 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9907159  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9907160 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagtaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 9907259  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttattg 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9907260 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttattg 9907359  T
Q  310 tttttaatgtcttatgctctgatacttctt 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9907360 tttttaatgtcttatgctctcatatttctt 9907389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27222738 - 27222366
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27222738 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 27222640  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27222639 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 27222541  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27222540 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttat 27222441  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27222440 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 27222366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35254351 - 35253978
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35254351 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 35254253  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35254252 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 35254154  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  35254153 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 35254054  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35254053 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 35253978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35264960 - 35264587
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35264960 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 35264862  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35264861 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 35264763  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  35264762 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 35264663  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35264662 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 35264587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 9772231 - 9772489
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9772231 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9772330  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg---ttttttacttt 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  9772331 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttttacttt 9772430  T
Q  207 tgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9772431 tgttcttcgtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 9772489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40223651 - 40223396
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  40223651 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 40223553  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40223552 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttg 40223453  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  40223452 ttcttagtagctttgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 40223396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43346717 - 43346462
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  43346717 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 43346619  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346618 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 43346519  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43346518 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 43346462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 11404345 - 11404604
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  11404345 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 11404443  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttact 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  11404444 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttact 11404543  T
Q  205 tttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11404544 tttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 11404604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10268300 - 10268046
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  10268300 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 10268202  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268201 ttcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 10268102  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10268101 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10268046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10278877 - 10278623
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  10278877 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 10278779  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10278778 ttcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 10278679  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10278678 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10278623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 265
Target Start/End: Original strand, 34803303 - 34803526
Alignment:
Q  42 tacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctc 140  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34803303 tacatcacaagggttgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgaactacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctc 34803401  T
Q  141 ttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34803402 ttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatct 34803501  T
Q  241 ttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  34803502 ttctttatatatattatcattgttt 34803526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 24337264 - 24337436
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  24337264 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 24337362  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 182  Q
    |  ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24337363 tcaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 24337436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29245567 - 29245393
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  29245567 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 29245469  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245468 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 29245393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43084009 - 43083835
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  43084009 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 43083911  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083910 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 43083835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 22959203 - 22959373
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  22959203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22959302  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22959303 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22959373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4211254 - 4211085
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  | ||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  4211254 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 4211156  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcac 179  Q
    |  | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4211155 tcaaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac 4211085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 466541 - 466869
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  466541 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 466640  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  466641 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 466739  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttattg 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  466740 tcttagtagctttctctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataactcatatgttctatacttttaattctgataatatttattg 466839  T
Q  310 tttttaatgtcttatgctctgatacttctt 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  466840 tttttaatgtcttatgctctcatatttctt 466869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11006552 - 11006181
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  11006552 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 11006454  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11006453 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 11006355  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta--tacttttaactctgatgatattt 305  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||  |  |||||||||| |||||||||    
T  11006354 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatattt 11006255  T
Q  306 attgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctct 379  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11006254 attgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctct 11006181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 2715185 - 2715440
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2715185 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 2715283  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2715284 ttcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttg 2715383  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2715384 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 2715440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9086592 - 9086337
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  9086592 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 9086494  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9086493 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 9086394  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9086393 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 9086337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 26698677 - 26698932
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  26698677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 26698775  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26698776 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacatccaactctagcttgttttttacttttg 26698875  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26698876 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26698932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 26399644 - 26399899
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  26399644 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 26399742  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26399743 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaactgttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 26399842  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26399843 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26399899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 8011635 - 8011892
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  8011635 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 8011733  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8011734 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 8011833  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  8011834 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 8011892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 40051652 - 40051906
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  40051652 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaataatga-gggaaaaggatgagctac 40051750  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40051751 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 40051850  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  40051851 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 40051906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42867193 - 42866840
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  42867193 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 42867095  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42867094 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 42866996  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||                   ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  42866995 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatat-------------------tatgttctattttttttaactctaatgatatttat 42866915  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42866914 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 42866840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1988903 - 1988568
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  1988903 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 1988805  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1988804 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 1988706  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||                   ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  1988705 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatat-------------------tatgttctattttttttaactctaatgatatttat 1988625  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttat 364  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1988624 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttat 1988568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11097376 - 11097117
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaag-ggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagcta 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  11097376 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagtggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagcta 11097278  T
Q  108 cttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtt---ttttact 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  11097277 cttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttact 11097178  T
Q  205 tttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11097177 tttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 11097117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24736088 - 24735834
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24736088 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 24735990  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735989 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 24735890  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24735889 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24735834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 21001956 - 21002131
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  21001956 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 21002054  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002055 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 21002131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5686897 - 5686723
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  5686897 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 5686799  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686798 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5686723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9434601 - 9434427
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  9434601 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 9434503  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434502 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 9434427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 6876791 - 6876965
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  6876791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 6876889  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876890 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 6876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Original strand, 19992966 - 19993140
Alignment:
Q  12 gacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctactt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| | ||||| | |||||||||||| |||||    
T  19992966 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcatgctggattcaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagttactt 19993064  T
Q  111 cagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 186  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993065 aagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 19993140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22090544 - 22090372
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22090544 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaaccagaattcatgctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 22090446  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 182  Q
    |  | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22090445 tcaaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 22090372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4213389 - 4213219
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  4213389 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agggaaaatgatgagctac 4213291  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
    |  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4213290 tcaagaagaaggatgagaaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 4213219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 17959623 - 17959793
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  17959623 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 17959721  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
    |  | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17959722 tcaaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 17959793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 168260 - 168090
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  168260 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 168161  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  168160 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8618755 - 8618587
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  8618755 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaataagaatg-agggaaaaggatgagctac 8618657  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgca 178  Q
    |  | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8618656 tcaaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 8618587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9434375 - 9434264
Alignment:
Q  226 tttgtatcttaacctttctttata--aatattatcattgtttataaatcatatgttctat-acttttaactctgatgatatttattgtttttaatgtctt 322  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  9434375 tttgtatcttaacttttctatatataaatattatcattgtttctggatcatatgttttacgagctttaactctgatgatatttactgtttttaatgttgt 9434276  T
Q  323 atgctctgatac 334  Q
     |||||||||||    
T  9434275 ttgctctgatac 9434264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 334
Target Start/End: Original strand, 21002182 - 21002293
Alignment:
Q  226 tttgtatcttaacctttctttata--aatattatcattgtttataaatcatatgttctat-acttttaactctgatgatatttattgtttttaatgtctt 322  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  21002182 tttgtatcttaacttttctatatataaatattatcattgtttctggatcatatgttttacgagctttaactctgatgatatttactgtttttaatgttgt 21002281  T
Q  323 atgctctgatac 334  Q
     |||||||||||    
T  21002282 ttgctctgatac 21002293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Original strand, 15887291 - 15887365
Alignment:
Q  107 acttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15887291 acttcagaagaatgatgagcaggttaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 15887365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9086295 - 9086247
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatact 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||    
T  9086295 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgctgtttgctctgatact 9086247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 18761969 - 18762340
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  18761969 tggacatcactcctttctatccagaagaggaatacatcacatgggctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 18762067  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  18762068 ttaagaagaaagatgaacaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttactcttg 18762166  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18762167 ttctgtgtagttttatctttgtaccttaacc-ttccttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctctattcttttaactctaatgatatttat 18762265  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18762266 tgtttttaatgtcctatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 18762340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 451928 - 451673
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  451928 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 451829  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  451828 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 451729  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  451728 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 451673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 30935979 - 30936234
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30935979 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 30936078  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30936079 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 30936178  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30936179 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 30936234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21997768 - 21997513
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21997768 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 21997669  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21997668 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 21997569  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21997568 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 21997513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24641667 - 24641294
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24641667 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 24641569  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24641568 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 24641470  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  24641469 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 24641370  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24641369 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 24641294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27658000 - 27657627
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27658000 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 27657902  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27657901 ttaaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 27657803  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  27657802 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 27657703  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27657702 ttgtttttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 27657627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Original strand, 55754716 - 55754952
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  55754716 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 55754814  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55754815 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 55754914  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttcttt 246  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  55754915 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttcttt 55754952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36019687 - 36019433
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  36019687 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 36019589  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019588 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacaattgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 36019489  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36019488 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 36019433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 10750056 - 10750310
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  10750056 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 10750154  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750155 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 10750254  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10750255 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10750310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 10963825 - 10964079
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  10963825 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 10963923  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963924 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 10964023  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10964024 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10964079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 24026926 - 24027100
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24026926 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 24027024  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    |  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24027025 tcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 24027100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17919466 - 17919294
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  17919466 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agggaaaaggatgagctac 17919368  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 182  Q
    |  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17919367 tcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagaaagcccaaccttagttgcacacc 17919294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 19953843 - 19954017
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  19953843 tggacatcactcctttctacccagaagaatagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaataagggaaaaggatgagctact 19953942  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
      ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19953943 caagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagtccaaccttagttgcacaccca 19954017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16257282 - 16257112
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  16257282 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 16257183  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16257182 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 16257112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 40469482 - 40469654
Alignment:
Q  12 gacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctactt 110  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  40469482 gacaacactcccttctatctagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctactt 40469580  T
Q  111 cagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40469581 cagaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 40469654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 279
Target Start/End: Original strand, 40469690 - 40469757
Alignment:
Q  212 ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgtt 279  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  40469690 ttagtagctttgcctttgtatcttgacttgtctttataaatgttatcattgcttctgaatcatatgtt 40469757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12731807 - 12731552
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12731807 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12731708  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12731707 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12731608  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12731607 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 12731552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12742400 - 12742145
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742400 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12742301  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12742300 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12742201  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12742200 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 12742145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 35400043 - 35400416
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35400043 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 35400141  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35400142 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttg 35400240  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  35400241 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 35400340  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35400341 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 35400416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 35647568 - 35647941
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35647568 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 35647666  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35647667 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttg 35647765  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  35647766 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 35647865  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35647866 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 35647941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3172920 - 3172546
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  3172920 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 3172822  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3172821 ttaaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 3172723  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta--tacttttaactctgatgatattt 305  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||  |  |||||||||| |||||||||    
T  3172722 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatattt 3172623  T
Q  306 attgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3172622 attgtttttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 3172546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38096383 - 38096126
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  38096383 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 38096285  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38096284 ttcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 38096185  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  38096184 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 38096126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7508597 - 7508343
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  7508597 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 7508499  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508498 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 7508399  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  7508398 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 7508343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 36245931 - 36246185
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  36245931 tggacatcactcctttctatccataagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 36246029  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36246030 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 36246129  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36246130 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 36246185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 379
Target Start/End: Original strand, 47617437 - 47617786
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  47617437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 47617535  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47617536 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg--ttttacttttg 47617633  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||                   ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  47617634 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatat-------------------tatgttctattttttttaactctaatgatatttat 47617714  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctct 379  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47617715 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctct 47617786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 51655375 - 51655629
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  51655375 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 51655473  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51655474 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 51655573  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  51655574 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 51655629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5834524 - 5834191
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5834524 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 5834426  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5834425 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 5834327  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttatt 308  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||                   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  5834326 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatat-------------------tatgttctat-tttttaactctaatgatatttatt 5834247  T
Q  309 gtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttat 364  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5834246 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttat 5834191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4168575 - 4168401
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  4168575 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 4168477  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168476 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 4168401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19180259 - 19180085
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  19180259 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 19180161  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180160 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19180085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 5649257 - 5649429
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  5649257 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 5649355  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 182  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5649356 tcaataagaaggatgagcagattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 5649429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21864996 - 21864824
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  21864996 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaacaagaattcatgctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 21864898  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 182  Q
    |  | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21864897 tcaaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 21864824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 12622677 - 12622847
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||  | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  12622677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 12622775  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
    |  | |||||||| || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12622776 tcaaaaagaaggacgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 12622847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 153158 - 153339
Alignment:
Q  17 cactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctacttcagaag 116  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||||||||||   ||||| | |   || | |||| |||| | ||||||||||    
T  153158 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaagaatgaacaacttcagaag 153257  T
Q  117 aaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 198  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  153258 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgttt 153339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Original strand, 36246227 - 36246275
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatact 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||    
T  36246227 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgctgtttgctctgatact 36246275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 46482 - 46854
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  46482 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 46580  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46581 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttg 46679  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  46680 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttat 46779  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46780 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 46854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3760
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  3424 tggatatcactcccttctacccagaggaagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagagaaaattaagggaaaaggatgagctact 3523  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagc------ttgttttttac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      || ||||||||    
T  3524 tcagaagaaggatgatcagatcagatatctcttagagcagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattctagctttttttttttttttac 3623  T
Q  204 ttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttta-taaatcatatgttctatacttttaactctgatgata 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3624 ttttgttcttagtagctttatccttgtatcttaactcttctttataaatattatcattgtttattaaatcatatgttctatacttttaattctgatgata 3723  T
Q  303 tttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3724 tttattgtttttaatgtcttatgctttgatacatctt 3760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 382
Target Start/End: Original strand, 3757 - 3788
Alignment:
Q  351 tcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3757 tcttatgtttttatatggttatatgctctgct 3788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15994565 - 15994310
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15994565 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaatgatgagctact 15994466  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15994465 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 15994366  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15994365 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 15994310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 31842987 - 31843242
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31842987 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 31843086  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31843087 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatttcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 31843186  T
Q  210 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31843187 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 31843242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 23371531 - 23371786
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  23371531 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 23371629  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371630 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 23371729  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23371730 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 23371786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 23706378 - 23706633
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  23706378 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 23706476  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706477 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 23706576  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23706577 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 23706633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36583781 - 36583526
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  36583781 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 36583683  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36583682 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 36583583  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36583582 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 36583526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 42052390 - 42052645
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  42052390 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 42052488  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42052489 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 42052588  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42052589 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 42052645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 9345562 - 9345817
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  9345562 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 9345660  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345661 tttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 9345760  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9345761 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 9345817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24589336 - 24589081
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  24589336 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-ggtaaaaggatgagctac 24589238  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589237 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 24589138  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589137 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 24589081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30228728 - 30228473
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  30228728 tggacattactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 30228630  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30228629 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 30228530  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30228529 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 30228473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14559340 - 14559085
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  14559340 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 14559242  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14559241 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 14559142  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14559141 ttctcagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 14559085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 15768362 - 15768619
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  15768362 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 15768460  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15768461 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 15768560  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15768561 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 15768619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37731234 - 37730975
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  37731234 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 37731136  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37731135 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 37731036  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37731035 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 37730975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 36697196 - 36697590
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaag------ggaa-------- 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||      ||||            
T  36697196 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 36697295  T
Q  96 -------aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 188  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36697296 tcagaagaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 36697395  T
Q  189 tagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatactt 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | |||    
T  36697396 tagcttgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttctt 36697494  T
Q  288 ttaa-ctctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36697495 ttaaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 36697590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 6985320 - 6985574
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  6985320 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 6985418  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6985419 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 6985518  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  6985519 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 6985574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 14039619 - 14039873
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  14039619 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 14039717  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039718 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 14039817  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  14039818 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 14039873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 22685025 - 22685279
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22685025 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 22685123  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22685124 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 22685223  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  22685224 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 22685279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 23305868 - 23306122
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  23305868 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 23305966  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23305967 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 23306066  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  23306067 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 23306122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24818123 - 24817869
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24818123 tggacatcaatcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 24818025  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818024 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 24817925  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24817924 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24817869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 27469583 - 27469837
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27469583 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 27469681  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27469682 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 27469781  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  27469782 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 27469837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 17728498 - 17728757
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  17728498 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 17728596  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17728597 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 17728696  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  17728697 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 17728757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27043491 - 27043234
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27043491 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 27043393  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27043392 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactccaacttgttttttacttttg 27043293  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  27043292 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 27043234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 31358115 - 31358374
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  31358115 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 31358213  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358214 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 31358313  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  31358314 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 31358374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Original strand, 17616641 - 17616877
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  17616641 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 17616739  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17616740 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 17616839  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttcttt 246  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  17616840 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttcttt 17616877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39492169 - 39491915
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| || |||||||||||||||    
T  39492169 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-ggaaaaaggatgagctac 39492071  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39492070 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 39491971  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  39491970 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 39491915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14448308 - 14448055
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  14448308 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 14448210  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14448209 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 14448110  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| |   |||||| |||| |||||||||||||||    
T  14448109 ttctcagtagctgtgtctttgtatcct--tctttctatatatatattatcattgttt 14448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 364
Target Start/End: Original strand, 35225084 - 35225417
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35225084 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 35225182  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35225183 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttg 35225281  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaactctgatgatatttatt 308  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||                   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35225282 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatat-------------------tatgttctat-tttttaactctaatgatatttatt 35225361  T
Q  309 gtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttat 364  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35225362 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttat 35225417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 319
Target Start/End: Original strand, 31447510 - 31447825
Alignment:
Q  14 catcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctacttca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31447510 catcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctacttca 31447608  T
Q  113 gaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac--tc-tagcttgttttttacttttgt 209  Q
    |||||||||||| || || |||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||| | ||||||    
T  31447609 gaagaaggatgagcaaattaagtatattttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacattctttgcttg-ttttaatttttgt 31447707  T
Q  210 tc-------ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgat 301  Q
    ||       |||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| | | |||| |||||| ||  |  |||||||||||| ||    
T  31447708 tctaagttgttagtagctttgcctttgtatcttaacttatctatataaatgttatcattgtctctgaatcttatgttttacaagctttaactctgataat 31447807  T
Q  302 atttattgtttttaatgt 319  Q
    |||| |||||||||||||    
T  31447808 atttgttgtttttaatgt 31447825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 40399989 - 40400161
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  40399989 tggacatcactcctttctatccagaagaagaatacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 40400087  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 182  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40400088 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccctagttgcacacc 40400161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5291849 - 5291675
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  5291849 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattataagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 5291751  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291750 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaatagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5291675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27604728 - 27604554
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  27604728 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaaggactgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 27604630  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604629 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 27604554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Original strand, 39361270 - 39361443
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  39361270 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agggaaaaggatgagctac 39361368  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 183  Q
    |  ||||||| ||||| || || |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39361369 tcaagaagaatgatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 39361443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 22156074 - 22156244
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  22156074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22156173  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22156174 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22156244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1110385 - 1110282
Alignment:
Q  95 aaaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagctt 194  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  1110385 aaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgctt 1110286  T
Q  195 gttt 198  Q
    ||||    
T  1110285 gttt 1110282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 198
Target Start/End: Original strand, 20796728 - 20796831
Alignment:
Q  95 aaaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagctt 194  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||    
T  20796728 aaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgctt 20796827  T
Q  195 gttt 198  Q
    ||||    
T  20796828 gttt 20796831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5291623 - 5291528
Alignment:
Q  226 tttgtatcttaacctttctttata--aatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatatttattgtttttaatg 318  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5291623 tttgtatcttaacttttctatatataaatattatcattgtttctggatcatatgttttacaagctttaactctgatgatatttactgtttttaatg 5291528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 319
Target Start/End: Original strand, 23371828 - 23371860
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgt 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23371828 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgt 23371860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24589039 - 24588991
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatact 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||    
T  24589039 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgctgtttgctctgatact 24588991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30228431 - 30228383
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatact 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||    
T  30228431 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgctgtttgctctgatact 30228383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Original strand, 42052687 - 42052735
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatact 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||    
T  42052687 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgctgtttgctctgatact 42052735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 13687498 - 13687871
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13687498 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 13687596  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13687597 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttg 13687695  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatattta 306  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  13687696 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatattta 13687795  T
Q  307 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13687796 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 13687871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 209087 - 209342
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  209087 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 209185  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209186 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 209285  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  209286 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 209342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 722710 - 722965
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  722710 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 722808  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  722809 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 722908  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  722909 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 722965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29078066 - 29077811
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  29078066 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 29077968  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29077967 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 29077868  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29077867 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 29077811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 32087203 - 32087458
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  32087203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 32087301  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32087302 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 32087401  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32087402 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 32087458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 15766081 - 15766339
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  15766081 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaagaatgagctac 15766179  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg---ttttttactt 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15766180 tttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttactt 15766279  T
Q  206 ttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15766280 ttgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 15766339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 15790218 - 15790476
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15790218 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 15790316  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg---ttttttactt 205  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15790317 tttagaagaaggatgatcggatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttactt 15790416  T
Q  206 ttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15790417 ttgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 15790476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 243168 - 242914
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  243168 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 243070  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  243069 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttac-tttg 242971  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  242970 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 242914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 796538 - 796284
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  796538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 796440  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  796439 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttac-tttg 796341  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  796340 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 796284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36294285 - 36294030
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| | ||||||||||||||||    
T  36294285 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gagaaaaggatgagctac 36294187  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36294186 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 36294087  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36294086 ttctcagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 36294030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44482503 - 44482109
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaag------ggaa-------- 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||      ||||            
T  44482503 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 44482404  T
Q  96 -------aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 188  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44482403 tcagaagaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagctgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 44482304  T
Q  189 tagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatactt 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | |||    
T  44482303 tagcttgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttctt 44482205  T
Q  288 ttaa-ctctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44482204 ttaaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 44482109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 3358139 - 3358393
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  3358139 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 3358237  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358238 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 3358337  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| ||| || | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  3358338 ttcttcgtatctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 3358393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36079290 - 36078955
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  36079290 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 36079192  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36079191 ttaagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttg 36079093  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatatttat 307  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||                   ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  36079092 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatat-------------------tatgttctattttttttaactctaatgatatttat 36079012  T
Q  308 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttat 364  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36079011 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttat 36078955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9342490 - 9342236
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  9342490 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 9342392  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9342391 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcatattttttacttttg 9342292  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9342291 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 9342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26112642 - 26112468
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  26112642 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatg-agagaaaaggatgagctac 26112544  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || || |||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112543 ttaagcagaaggatgaacaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 26112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19130112 - 19129938
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  19130112 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 19130014  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    || ||||||||||| | || || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19130013 ttaagaagaaggatcagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19129938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6152462 - 6152292
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  6152462 tggacatcactcctttctatcgagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 6152363  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | |||||| |||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6152362 caaaaagaagaatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 6152292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19226208 - 19226134
Alignment:
Q  107 acttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19226208 acttcagaagaaggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 19226134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Original strand, 30324259 - 30324333
Alignment:
Q  107 acttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30324259 acttcagaagaaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 30324333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19129884 - 19129789
Alignment:
Q  226 tttgtatcttaacctttctttata--aatattatcattgtttataaatcatatgttcta-tacttttaactctgatgatatttattgtttttaatg 318  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||| |  |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19129884 tttgtatcttaacttttctatatataaatactatcattgtttctggatcatatgttttacaagctttaactctgatgatatttactgtttttaatg 19129789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29077769 - 29077721
Alignment:
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatact 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||    
T  29077769 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgctgtttgctctgatact 29077721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12856273 - 12856018
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  12856273 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 12856175  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12856174 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttg 12856075  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12856074 ttcttagtagctttgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 12856018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3662668 - 3662413
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  3662668 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 3662570  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3662569 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 3662470  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3662469 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 3662413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25789052 - 25788797
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  25789052 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 25788954  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788953 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 25788854  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25788853 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 25788797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26866116 - 26865861
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  26866116 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 26866018  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26866017 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttg 26865918  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26865917 ttcttagtagctatgtccttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26865861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 17983618 - 17983877
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  17983618 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 17983716  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttact 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  17983717 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttact 17983816  T
Q  205 tttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17983817 tttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 17983877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27343051 - 27342797
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27343051 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 27342953  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27342952 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 27342853  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  27342852 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 27342797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27403791 - 27403537
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27403791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatga-gggaaaaggatgagctac 27403693  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27403692 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 27403593  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  27403592 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 27403537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4632234 - 4631840
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaag------ggaa-------- 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||      ||||            
T  4632234 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 4632135  T
Q  96 -------aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 188  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632134 tcagaagaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 4632035  T
Q  189 tagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatactt 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | |||    
T  4632034 tagcttgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttctt 4631936  T
Q  288 ttaa-ctctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4631935 ttaaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 4631840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Original strand, 32310543 - 32310937
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaag------ggaa-------- 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||      ||||            
T  32310543 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 32310642  T
Q  96 -------aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 188  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32310643 tcagaagaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 32310742  T
Q  189 tagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatactt 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | |||    
T  32310743 tagcttgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttctt 32310841  T
Q  288 ttaa-ctctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32310842 ttaaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 32310937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26026743 - 26026489
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  26026743 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 26026645  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26026644 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 26026545  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  26026544 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 26026489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16931718 - 16931463
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  16931718 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 16931620  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931619 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagtngtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 16931520  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatat-tatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16931519 ttcttagtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatatatatcattgttt 16931463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27385760 - 27385366
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaag------ggaa-------- 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||      ||||            
T  27385760 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 27385661  T
Q  96 -------aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 188  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385660 tcagaagaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 27385561  T
Q  189 tagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatactt 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||| ||| | |||    
T  27385560 tagcttgttttt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttctt 27385462  T
Q  288 ttaa-ctctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27385461 ttaaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgattcttcttctgtttttatttggttatatgctctgct 27385366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27476173 - 27475779
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaag------ggaa-------- 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||      ||||            
T  27476173 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 27476074  T
Q  96 -------aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 188  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27476073 tcagaagaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 27475974  T
Q  189 tagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatactt 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||| ||| | |||    
T  27475973 tagcttgttttt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttctt 27475875  T
Q  288 ttaa-ctctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27475874 ttaaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgattcttcttctgtttttatttggttatatgctctgct 27475779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 12726317 - 12726576
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  12726317 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 12726415  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726416 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 12726515  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12726516 ttcttagtagctgtgtccttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 12726576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 9122013 - 9122188
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  9122013 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 9122111  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122112 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9122188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27374107 - 27373931
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  27374107 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 27374009  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 186  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374008 ttcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 27373931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27464460 - 27464284
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  27464460 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctac 27464362  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 186  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27464361 ttcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 27464284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25590532 - 25590360
Alignment:
Q  12 gacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaa-atgaagggaaaaggatgagctactt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||| | || |||||||| || |||    
T  25590532 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatga-gagagaaggatgaacttctt 25590434  T
Q  111 cagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
     ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590433 aagaagaaggatgagcaaattaagtacctcttagaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 25590360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 34816655 - 34816825
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  34816655 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 34816754  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 180  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34816755 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 34816825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 32971358 - 32971526
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||||| |||||||||||    
T  32971358 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaatgatgagctact 32971457  T
Q  110 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgca 178  Q
      | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32971458 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 32971526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Original strand, 7669375 - 7669466
Alignment:
Q  93 gaaaaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7669375 gaaaaggatgagctactcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 7669466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12359372 - 12359298
Alignment:
Q  107 acttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12359372 acttcagaagaaggatgatcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 12359298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32489 - 32234
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctac 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||| ||||||||||||||||||    
T  32489 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatga-gggaaaaggatgagctac 32391  T
Q  109 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32390 ttcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttg 32291  T
Q  209 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32290 ttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 32234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2642 - 2249
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaag------ggaa-------- 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||      ||||            
T  2642 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 2543  T
Q  96 -------aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 188  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2542 tcagaagaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc 2443  T
Q  189 tagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatactt 287  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | |||    
T  2442 tagcttgttctt-acttttgttctgtgttagtttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttctt 2344  T
Q  288 ttaa-ctctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2343 ttaaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatg-ttttatttggttatatgctctgct 2249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23641
Alignment:
Q  96 aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23892 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacatctcttagagcagttaaagaaacaagcccaaccttagttgcacacccaatactagcttg 23793  T
Q  196 ttttttacttttgt--------tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ataaatcatatgttctatact 286  Q
    ||||||  |||| |        | |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23792 ttttttttttttttaactttgcttttagtagctttatccttgtaacttaactcttctttataaatattatcattgtttgttaaatcatatgttctatact 23693  T
Q  287 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 339  Q
    ||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23692 tttacttctgataatatttattg-ttttaatatcttatgctctgatatttctt 23641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23999 - 23924
Alignment:
Q  10 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaa 85  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  23999 tggatatcactcctttctatccagaggcagattacatcacaagatctgctagaattcgagctgggcataataggaa 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 267
Alignment:
Q  12 gacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagga-aatgaagggaaaaggatgagctactt 110  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  439 gacaacactcctttctatccataagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatga-gagaaaaggatgagctactt 341  T
Q  111 cagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 184  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  340 cagaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 52481 - 52649
Alignment:
Q  17 cactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaatgaagggaaaaggatgagctacttcagaag 116  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||||||||||   ||||| | |   || | ||||||||| | ||||||||||    
T  52481 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 52580  T
Q  117 aaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52581 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagatgtataagcaagtcaaaccttagttgcacacccaa 52649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Original strand, 3338 - 3429
Alignment:
Q  107 acttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  3338 acttcagaagaaggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgttt 3429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Original strand, 11593 - 11684
Alignment:
Q  107 acttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  11593 acttcagaagaaggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgttt 11684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3629 - 3567
Alignment:
Q  12 gacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgcaagaattcatgctggg 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3629 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaatacatgctggg 3567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 2863 - 2965
Alignment:
Q  96 aaggatgagctacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 195  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||  | |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  2863 aaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcagattaaatatctactggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacacccaattgttgcttg 2962  T
Q  196 ttt 198  Q
    |||    
T  2963 ttt 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23832 - 23758
Alignment:
Q  107 acttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23832 acttcaaaagaaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 23758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University