View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9410_low_3 (Length: 845)

Name: NF9410_low_3
Description: NF9410
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9410_low_3
NF9410_low_3
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (1-830)||(27272268-27273094)
chr6 (315-830)||(15424005-15424520)
chr6 (315-830)||(22934568-22935083)
chr6 (315-830)||(23857013-23857528)
chr6 (315-830)||(24863710-24864225)
chr6 (315-830)||(26988994-26989510)
chr6 (315-830)||(24304306-24304821)
chr6 (315-826)||(26918373-26918884)
chr6 (315-829)||(16749847-16750361)
chr6 (315-830)||(13298639-13299154)
chr6 (324-829)||(29549477-29549982)
chr6 (339-829)||(3696098-3696588)
chr6 (322-830)||(27290058-27290566)
chr6 (339-829)||(34463035-34463525)
chr6 (339-829)||(4545464-4545954)
chr6 (325-829)||(4757767-4758271)
chr6 (325-829)||(27044390-27044895)
chr6 (325-829)||(27485132-27485636)
chr6 (339-829)||(4723823-4724313)
chr6 (339-829)||(16674156-16674646)
chr6 (315-829)||(29573006-29573520)
chr6 (337-829)||(29501430-29501922)
chr6 (325-829)||(4773009-4773513)
chr6 (325-829)||(4525289-4525793)
chr6 (315-829)||(30557705-30558219)
chr6 (325-829)||(26116099-26116603)
chr6 (325-829)||(27007730-27008234)
chr6 (315-829)||(16943716-16944230)
chr6 (339-829)||(28207471-28207961)
chr6 (325-830)||(27359680-27360185)
chr6 (325-830)||(27450023-27450528)
chr6 (315-651)||(27000066-27000402)
chr6 (324-829)||(26777299-26777809)
chr6 (1-296)||(27629925-27630220)
chr6 (325-703)||(17025280-17025658)
chr6 (321-820)||(14142983-14143482)
chr6 (321-820)||(26787943-26788442)
chr6 (321-820)||(27196316-27196815)
chr6 (321-820)||(27252425-27252924)
chr6 (321-820)||(22456641-22457131)
chr6 (647-829)||(27019461-27019643)
chr6 (324-802)||(13521789-13522267)
chr6 (325-652)||(20160704-20161031)
chr6 (325-652)||(22171800-22172127)
chr6 (324-769)||(8892060-8892504)
chr6 (324-769)||(8903295-8903739)
chr6 (324-769)||(33374005-33374450)
chr6 (321-769)||(28162656-28163104)
chr6 (321-551)||(22477240-22477470)
chr6 (531-829)||(17092129-17092427)
chr6 (3-247)||(4524976-4525220)
chr6 (120-264)||(20160508-20160652)
chr6 (120-264)||(22172179-22172323)
chr6 (141-259)||(28162485-28162603)
chr6 (3-230)||(4757448-4757675)
chr6 (42-247)||(29549204-29549409)
chr6 (324-688)||(27629530-27629894)
chr6 (3-230)||(4546066-4546293)
chr6 (3-230)||(27360292-27360519)
chr6 (3-230)||(27450635-27450862)
chr6 (3-230)||(28207129-28207356)
chr6 (141-259)||(13522323-13522441)
chr6 (45-259)||(24304871-24305085)
chr6 (42-264)||(26918106-26918328)
chr6 (141-259)||(33374506-33374624)
chr6 (42-230)||(17024988-17025176)
chr6 (3-230)||(4724425-4724652)
chr6 (141-259)||(8892560-8892678)
chr6 (45-259)||(15424570-15424784)
chr6 (111-264)||(22477521-22477674)
chr6 (42-259)||(26988727-26988944)
chr6 (45-264)||(26999802-27000021)
chr6 (3-82)||(30558446-30558525)
chr6 (141-259)||(8903795-8903913)
chr6 (3-229)||(29572700-29572926)
chr6 (171-264)||(22935125-22935218)
chr6 (171-264)||(23857570-23857663)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (315-830)||(27434178-27434693)
chr2 (315-830)||(28882206-28882721)
chr2 (315-830)||(20837910-20838425)
chr2 (315-830)||(23128300-23128815)
chr2 (315-830)||(12655534-12656049)
chr2 (315-829)||(11634921-11635435)
chr2 (315-829)||(11641110-11641624)
chr2 (315-829)||(21676917-21677431)
chr2 (325-829)||(37375163-37375667)
chr2 (315-829)||(34286346-34286860)
chr2 (315-829)||(34291406-34291920)
chr2 (315-829)||(34861672-34862186)
chr2 (315-829)||(37685644-37686158)
chr2 (315-829)||(37700909-37701423)
chr2 (315-829)||(32049790-32050304)
chr2 (315-829)||(37925485-37925999)
chr2 (317-829)||(13936279-13936791)
chr2 (339-829)||(260488-260978)
chr2 (339-829)||(27777238-27777728)
chr2 (339-829)||(27816996-27817486)
chr2 (339-829)||(40233527-40234017)
chr2 (324-829)||(39890075-39890580)
chr2 (315-829)||(16829073-16829587)
chr2 (315-829)||(16891894-16892408)
chr2 (339-829)||(12716337-12716827)
chr2 (339-829)||(27803723-27804213)
chr2 (315-830)||(31876273-31876788)
chr2 (339-829)||(12586826-12587316)
chr2 (339-829)||(39051557-39052047)
chr2 (315-829)||(19416234-19416748)
chr2 (339-829)||(9349717-9350207)
chr2 (315-802)||(22925790-22926277)
chr2 (316-830)||(21702898-21703412)
chr2 (315-572)||(34279441-34279698)
chr2 (321-830)||(19456155-19456664)
chr2 (321-820)||(27118686-27119185)
chr2 (321-769)||(31891123-31891571)
chr2 (321-769)||(34303098-34303546)
chr2 (324-769)||(3784655-3785100)
chr2 (324-769)||(34157012-34157456)
chr2 (324-802)||(16163600-16164081)
chr2 (339-625)||(27392985-27393271)
chr2 (69-259)||(21703460-21703650)
chr2 (141-259)||(31891624-31891742)
chr2 (3-230)||(12716933-12717160)
chr2 (141-259)||(3784481-3784599)
chr2 (42-264)||(21677476-21677698)
chr2 (141-259)||(34156838-34156956)
chr2 (141-258)||(34303600-34303717)
chr2 (45-264)||(27434738-27434957)
chr2 (3-230)||(39889748-39889975)
chr2 (141-259)||(16163426-16163544)
chr2 (141-259)||(27118515-27118633)
chr2 (42-264)||(37925218-37925440)
chr2 (3-264)||(32049484-32049745)
chr2 (41-264)||(13936838-13937061)
chr2 (3-82)||(16829814-16829893)
chr2 (3-82)||(16891588-16891667)
chr2 (41-264)||(34279173-34279396)
chr2 (45-259)||(23128865-23129079)
chr2 (3-229)||(31875967-31876193)
chr2 (3-229)||(34861366-34861592)
chr2 (3-229)||(37686238-37686464)
chr2 (3-229)||(37701503-37701729)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (315-830)||(2136963-2137478)
chr8 (315-830)||(27608609-27609124)
chr8 (315-830)||(16277550-16278065)
chr8 (315-830)||(19688094-19688609)
chr8 (315-830)||(14557620-14558135)
chr8 (316-830)||(16283446-16283960)
chr8 (315-829)||(19674437-19674951)
chr8 (315-829)||(31489455-31489969)
chr8 (315-829)||(19208065-19208579)
chr8 (315-829)||(28361660-28362174)
chr8 (315-829)||(31354520-31355034)
chr8 (325-829)||(19286468-19286972)
chr8 (325-829)||(3329212-3329716)
chr8 (325-829)||(29829328-29829832)
chr8 (315-829)||(33258719-33259233)
chr8 (325-829)||(12092429-12092933)
chr8 (324-829)||(9354627-9355133)
chr8 (483-748)||(189258-189523)
chr8 (324-802)||(18710591-18711069)
chr8 (324-820)||(19658754-19659249)
chr8 (321-802)||(44563103-44563582)
chr8 (324-820)||(33244670-33245166)
chr8 (708-830)||(18791096-18791218)
chr8 (339-769)||(22080643-22081073)
chr8 (42-259)||(18710315-18710532)
chr8 (141-259)||(44562932-44563050)
chr8 (45-264)||(16283181-16283400)
chr8 (141-259)||(9354453-9354571)
chr8 (141-259)||(19659305-19659423)
chr8 (3-264)||(19286155-19286416)
chr8 (339-391)||(19518280-19518332)
chr8 (41-264)||(31490014-31490237)
chr8 (45-259)||(16277286-16277500)
chr8 (36-264)||(19674161-19674389)
chr8 (3-230)||(12093031-12093258)
chr8 (45-259)||(2137528-2137742)
chr8 (45-259)||(14557359-14557573)
chr8 (3-229)||(19208659-19208885)
chr8 (50-160)||(22081240-22081350)
chr8 (42-100)||(31354253-31354311)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (315-830)||(10916499-10917014)
chr7 (315-830)||(16503011-16503526)
chr7 (315-830)||(2154570-2155085)
chr7 (315-830)||(16518047-16518562)
chr7 (315-826)||(11424412-11424922)
chr7 (315-826)||(5127989-5128500)
chr7 (315-829)||(5146972-5147486)
chr7 (315-829)||(4144755-4145269)
chr7 (315-829)||(16736092-16736606)
chr7 (315-829)||(16751146-16751660)
chr7 (315-829)||(17523529-17524043)
chr7 (315-829)||(17529172-17529686)
chr7 (315-829)||(26435254-26435768)
chr7 (339-829)||(26537502-26537992)
chr7 (315-829)||(26319501-26320015)
chr7 (315-829)||(45387340-45387854)
chr7 (315-829)||(9618648-9619162)
chr7 (315-829)||(26274726-26275240)
chr7 (315-829)||(26669546-26670060)
chr7 (325-829)||(31564022-31564526)
chr7 (315-829)||(24592173-24592687)
chr7 (339-829)||(3445327-3445817)
chr7 (339-787)||(11441593-11442041)
chr7 (325-829)||(31124927-31125431)
chr7 (45-830)||(16041059-16041835)
chr7 (321-830)||(16449629-16450138)
chr7 (321-802)||(26484697-26485178)
chr7 (321-802)||(39210682-39211163)
chr7 (324-802)||(2775365-2775843)
chr7 (321-802)||(2108664-2109145)
chr7 (450-769)||(4200679-4200998)
chr7 (667-829)||(26513130-26513292)
chr7 (448-802)||(26682659-26683013)
chr7 (324-769)||(31088156-31088601)
chr7 (389-769)||(45733531-45733911)
chr7 (321-708)||(18540802-18541189)
chr7 (324-708)||(5159525-5159909)
chr7 (45-264)||(16503571-16503790)
chr7 (45-264)||(16518607-16518826)
chr7 (42-264)||(5127722-5127944)
chr7 (6-264)||(45387037-45387295)
chr7 (42-247)||(4145331-4145536)
chr7 (123-251)||(16450199-16450327)
chr7 (44-247)||(5159254-5159457)
chr7 (3-230)||(31564624-31564851)
chr7 (3-217)||(3444985-3445199)
chr7 (141-259)||(31088657-31088775)
chr7 (141-259)||(45733292-45733410)
chr7 (42-229)||(9618381-9618568)
chr7 (3-229)||(24592767-24592993)
chr7 (3-229)||(26275320-26275546)
chr7 (3-217)||(26485982-26486196)
chr7 (339-428)||(26485756-26485845)
chr7 (42-229)||(26320095-26320282)
chr7 (3-100)||(16736815-16736912)
chr7 (3-100)||(16751869-16751966)
chr7 (3-100)||(17523223-17523320)
chr7 (3-100)||(17529895-17529992)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (315-830)||(17014011-17014526)
chr4 (315-830)||(14665029-14665544)
chr4 (315-830)||(24592059-24592574)
chr4 (315-829)||(14763050-14763564)
chr4 (315-829)||(6569864-6570378)
chr4 (325-829)||(18800359-18800863)
chr4 (325-829)||(36344261-36344765)
chr4 (315-829)||(5005884-5006398)
chr4 (315-829)||(27163063-27163577)
chr4 (339-829)||(33673544-33674034)
chr4 (315-829)||(40105384-40105898)
chr4 (325-829)||(54833408-54833912)
chr4 (339-829)||(30753789-30754279)
chr4 (315-829)||(14098552-14099066)
chr4 (315-829)||(31126264-31126778)
chr4 (339-829)||(39850673-39851163)
chr4 (315-829)||(21969712-21970226)
chr4 (69-829)||(1900031-1900782)
chr4 (321-830)||(15284673-15285182)
chr4 (69-830)||(15227644-15228396)
chr4 (324-769)||(24460411-24460856)
chr4 (321-709)||(14235391-14235779)
chr4 (324-708)||(24112682-24113066)
chr4 (324-708)||(34188827-34189211)
chr4 (339-769)||(15391144-15391574)
chr4 (42-230)||(19373005-19373193)
chr4 (44-247)||(24112411-24112614)
chr4 (3-230)||(31126857-31127084)
chr4 (44-247)||(34189279-34189482)
chr4 (45-259)||(14664765-14664979)
chr4 (41-230)||(18800961-18801150)
chr4 (3-264)||(54833095-54833356)
chr4 (41-217)||(39850366-39850542)
chr4 (141-259)||(24460912-24461030)
chr4 (42-259)||(24592621-24592838)
chr4 (120-259)||(15285235-15285374)
chr4 (3-82)||(30753447-30753526)
chr4 (41-82)||(5005613-5005654)
chr4 (3-264)||(21969406-21969667)
[»] chr5 (81 HSPs)
chr5 (315-830)||(24687799-24688314)
chr5 (315-830)||(23717630-23718145)
chr5 (315-826)||(11549359-11549870)
chr5 (315-827)||(23752095-23752607)
chr5 (315-827)||(33777492-33778004)
chr5 (315-830)||(30934638-30935153)
chr5 (315-830)||(22998756-22999271)
chr5 (316-830)||(24970024-24970538)
chr5 (315-830)||(15658402-15658917)
chr5 (325-829)||(18500373-18500877)
chr5 (325-829)||(28649250-28649754)
chr5 (315-829)||(2511056-2511570)
chr5 (315-829)||(6874310-6874824)
chr5 (315-829)||(8665118-8665632)
chr5 (315-829)||(12132160-12132674)
chr5 (315-829)||(15758500-15759014)
chr5 (315-829)||(9317456-9317970)
chr5 (315-829)||(30152023-30152537)
chr5 (315-830)||(18375054-18375569)
chr5 (315-829)||(5637915-5638429)
chr5 (339-829)||(43078281-43078771)
chr5 (324-829)||(34616532-34617037)
chr5 (315-829)||(26480397-26480910)
chr5 (315-829)||(30168474-30168988)
chr5 (325-829)||(37754995-37755499)
chr5 (339-829)||(31826050-31826540)
chr5 (339-829)||(31431469-31431959)
chr5 (325-829)||(3789556-3790060)
chr5 (315-829)||(41674714-41675228)
chr5 (325-829)||(37770630-37771134)
chr5 (325-829)||(37671126-37671630)
chr5 (315-829)||(33516361-33516875)
chr5 (339-829)||(24681469-24681959)
chr5 (339-829)||(24723996-24724486)
chr5 (325-829)||(37358286-37358790)
chr5 (324-829)||(28959429-28959934)
chr5 (315-769)||(9548246-9548700)
chr5 (315-829)||(30029420-30029934)
chr5 (324-829)||(32599115-32599620)
chr5 (316-829)||(23892212-23892725)
chr5 (325-829)||(13324472-13324976)
chr5 (339-829)||(40473192-40473682)
chr5 (321-820)||(29888734-29889233)
chr5 (315-745)||(29966793-29967223)
chr5 (316-830)||(22888476-22888990)
chr5 (316-830)||(25199035-25199549)
chr5 (324-802)||(33877261-33877739)
chr5 (324-769)||(11325808-11326253)
chr5 (324-768)||(13184352-13184796)
chr5 (324-769)||(13440197-13440642)
chr5 (324-708)||(33292539-33292923)
chr5 (6-229)||(15759094-15759317)
chr5 (120-259)||(22888289-22888428)
chr5 (3-230)||(37358891-37359118)
chr5 (69-249)||(25198797-25198977)
chr5 (3-230)||(24681136-24681363)
chr5 (3-230)||(24723663-24723890)
chr5 (141-259)||(11325634-11325752)
chr5 (141-259)||(13184852-13184970)
chr5 (141-259)||(13440698-13440816)
chr5 (45-259)||(23891947-23892161)
chr5 (42-264)||(31431166-31431388)
chr5 (3-229)||(31826656-31826882)
chr5 (141-259)||(33877087-33877205)
chr5 (42-259)||(33777225-33777442)
chr5 (3-247)||(32599688-32599932)
chr5 (3-151)||(37771314-37771462)
chr5 (42-217)||(8665724-8665899)
chr5 (44-247)||(33292268-33292471)
chr5 (3-230)||(37671728-37671955)
chr5 (41-264)||(41674446-41674669)
chr5 (3-229)||(12131854-12132080)
chr5 (3-229)||(37754667-37754893)
chr5 (42-259)||(23718195-23718412)
chr5 (42-259)||(23752657-23752874)
chr5 (45-229)||(2510792-2510976)
chr5 (45-229)||(9317192-9317376)
chr5 (42-229)||(5637648-5637835)
chr5 (42-229)||(26480130-26480317)
chr5 (3-82)||(28960182-28960261)
chr5 (3-82)||(33516055-33516134)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (315-830)||(4796439-4796954)
chr3 (316-830)||(15892492-15893006)
chr3 (315-830)||(8295929-8296444)
chr3 (315-830)||(8301053-8301568)
chr3 (315-830)||(6192273-6192788)
chr3 (315-827)||(15740883-15741395)
chr3 (315-826)||(18330626-18331137)
chr3 (315-826)||(35880723-35881234)
chr3 (315-830)||(4721588-4722103)
chr3 (315-830)||(29148541-29149056)
chr3 (315-830)||(18051219-18051734)
chr3 (324-826)||(22387368-22387870)
chr3 (315-829)||(18276839-18277353)
chr3 (315-829)||(18307441-18307955)
chr3 (315-829)||(7073169-7073683)
chr3 (315-829)||(18292140-18292654)
chr3 (315-829)||(28115741-28116255)
chr3 (315-829)||(4416876-4417390)
chr3 (315-829)||(5609109-5609623)
chr3 (315-829)||(31964260-31964774)
chr3 (315-829)||(10396090-10396604)
chr3 (315-829)||(28339259-28339773)
chr3 (324-829)||(28021241-28021746)
chr3 (315-829)||(21674650-21675164)
chr3 (315-829)||(7996519-7997033)
chr3 (315-829)||(10643027-10643541)
chr3 (339-829)||(36996864-36997354)
chr3 (339-829)||(48465908-48466398)
chr3 (324-829)||(4346474-4346979)
chr3 (339-829)||(8211719-8212209)
chr3 (315-829)||(47023410-47023924)
chr3 (325-829)||(18242706-18243210)
chr3 (339-829)||(11110136-11110626)
chr3 (379-829)||(51782044-51782494)
chr3 (345-829)||(5466972-5467456)
chr3 (324-829)||(22870643-22871148)
chr3 (324-829)||(22885702-22886207)
chr3 (337-829)||(5596144-5596636)
chr3 (325-829)||(6542249-6542753)
chr3 (315-829)||(17984743-17985257)
chr3 (315-829)||(18225148-18225662)
chr3 (339-829)||(20576634-20577124)
chr3 (339-829)||(29664757-29665247)
chr3 (315-829)||(5013669-5014183)
chr3 (315-829)||(24328116-24328630)
chr3 (315-697)||(50133990-50134372)
chr3 (379-707)||(51797133-51797462)
chr3 (315-769)||(5713184-5713638)
chr3 (315-769)||(5724094-5724548)
chr3 (315-769)||(5767820-5768274)
chr3 (315-732)||(5756967-5757383)
chr3 (321-830)||(18530351-18530860)
chr3 (324-769)||(17993631-17994076)
chr3 (321-830)||(16626292-16626801)
chr3 (321-802)||(32292715-32293196)
chr3 (324-802)||(31033931-31034409)
chr3 (324-820)||(5652353-5652849)
chr3 (324-769)||(4625910-4626355)
chr3 (324-701)||(32439120-32439497)
chr3 (325-622)||(20066010-20066307)
chr3 (42-247)||(8211431-8211636)
chr3 (324-535)||(4893176-4893387)
chr3 (42-264)||(22871220-22871442)
chr3 (42-264)||(22886279-22886501)
chr3 (3-230)||(6542854-6543081)
chr3 (41-264)||(7072901-7073124)
chr3 (45-247)||(5466678-5466880)
chr3 (141-259)||(17994132-17994250)
chr3 (141-258)||(4625736-4625853)
chr3 (122-247)||(32438927-32439052)
chr3 (42-259)||(35880456-35880673)
chr3 (42-264)||(4721321-4721543)
chr3 (42-264)||(7996252-7996474)
chr3 (42-264)||(10642760-10642982)
chr3 (45-259)||(15741433-15741647)
chr3 (45-259)||(18050955-18051169)
chr3 (122-247)||(4892983-4893108)
chr3 (3-130)||(4347164-4347291)
chr3 (45-264)||(4796999-4797218)
chr3 (120-295)||(16626818-16626993)
chr3 (141-259)||(5652179-5652297)
chr3 (42-216)||(18330364-18330538)
chr3 (69-259)||(18530114-18530304)
chr3 (41-82)||(11110889-11110930)
[»] scaffold0089 (4 HSPs)
scaffold0089 (315-830)||(39814-40329)
scaffold0089 (315-830)||(46730-47245)
scaffold0089 (316-830)||(29760-30274)
scaffold0089 (45-259)||(29495-29709)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (315-830)||(27288-27804)
scaffold0143 (45-259)||(27024-27238)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (315-829)||(41793054-41793568)
chr1 (315-829)||(10962665-10963179)
chr1 (315-829)||(28584976-28585490)
chr1 (315-830)||(51638213-51638728)
chr1 (316-830)||(16207776-16208290)
chr1 (321-830)||(20461082-20461591)
chr1 (321-802)||(28151863-28152344)
chr1 (316-830)||(20340080-20340594)
chr1 (3-230)||(51637907-51638134)
chr1 (120-259)||(20460914-20461053)
chr1 (42-229)||(10962398-10962585)
chr1 (45-264)||(41793613-41793832)
chr1 (141-259)||(20340642-20340760)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (315-830)||(30449-30964)
scaffold0124 (321-662)||(20390-20730)
scaffold0124 (69-259)||(20168-20358)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (315-829)||(8812-9326)
scaffold0159 (315-829)||(20011-20526)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (315-829)||(6985-7499)
scaffold0350 (3-229)||(7579-7805)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (339-829)||(6030-6524)
scaffold0415 (389-662)||(1831-2103)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (315-830)||(14675-15190)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (315-829)||(25947-26462)
scaffold0144 (3-217)||(26554-26768)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (315-703)||(1-390)
scaffold0029 (42-264)||(435-657)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (324-829)||(9571-10076)
scaffold0336 (42-247)||(7961-8166)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (339-829)||(7969-8459)
scaffold0038 (3-230)||(7627-7854)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (321-824)||(46545-47072)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (316-830)||(2403-2917)
scaffold0260 (141-259)||(2965-3083)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (321-598)||(5-282)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (339-802)||(21581-22044)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (465-810)||(383-728)
[»] scaffold2173 (2 HSPs)
scaffold2173 (234-296)||(1-63)
scaffold2173 (324-688)||(94-458)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 559; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27273094 - 27272268
Alignment:
Q  1 gtatcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27273094 gtatcattgtatttgagaagggtgagtcttctacaaatgggttgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 27272995  T
Q  101 ctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttc 200  Q
    |||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |    
T  27272994 ctctggagcaggtcagactacagctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgtaccgtattctcaacatccattctac 27272895  T
Q  201 cctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagnnnn 300  Q
    || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  27272894 ccgccattttactattagtatcctttgccatcaggaccacctcaagtacctgtgaatgctattgtgcagcagaagccacaacaaccaccagttcagcaac 27272795  T
Q  301 nnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtac 400  Q
                  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27272794 aacaacaacag---aatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtac 27272698  T
Q  401 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 500  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27272697 aaccagacagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgag 27272598  T
Q  501 gggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaa 600  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27272597 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaa 27272498  T
Q  601 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtg 700  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  27272497 atcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtg 27272398  T
Q  701 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27272397 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagcttgatg 27272298  T
Q  801 aatgataattttttgactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27272297 aatgataagtttttgactgttagtgatgtc 27272268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 15424520 - 15424005
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15424520 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 15424421  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424420 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 15424321  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15424320 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 15424221  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424220 aatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 15424121  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424120 tcagccatgatcatgccgagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 15424021  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  15424020 gactgttagtgatgtc 15424005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 22935083 - 22934568
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22935083 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 22934984  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934983 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 22934884  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22934883 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 22934784  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934783 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 22934684  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934683 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 22934584  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  22934583 gactgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 23857528 - 23857013
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23857528 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 23857429  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857428 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23857329  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23857328 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 23857229  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857228 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 23857129  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857128 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 23857029  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  23857028 gactgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 24863710 - 24864225
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863710 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24863809  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863810 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 24863909  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24863910 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 24864009  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24864010 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctgt 24864109  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24864110 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacgtccaaagcttgatgaatgataatttttt 24864209  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  24864210 gactgttagtgatgtc 24864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 26988994 - 26989510
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26988994 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 26989093  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989094 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 26989193  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26989194 gaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 26989293  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989294 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 26989393  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattttt 813  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26989394 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgattaattttt 26989493  T
Q  814 tgactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||||||||||||||    
T  26989494 tgactgttagtgatgtc 26989510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 24304821 - 24304306
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304821 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24304722  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24304721 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgattt 24304622  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24304621 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 24304522  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304521 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 24304422  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24304421 tcagccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctttt 24304322  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  24304321 gactgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 826
Target Start/End: Original strand, 26918373 - 26918884
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918373 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 26918472  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26918473 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 26918572  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26918573 gaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26918672  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918673 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 26918772  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918773 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagataacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 26918872  T
Q  815 gactgttagtga 826  Q
    |||||| |||||    
T  26918873 gactgtcagtga 26918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 16749847 - 16750361
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16749847 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 16749946  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749947 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 16750046  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16750047 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 16750146  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16750147 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttctctgt 16750246  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750247 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 16750346  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||||||||    
T  16750347 gactgttagtgatgt 16750361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 13299154 - 13298639
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299154 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 13299055  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  13299054 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacacttt 13298955  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13298954 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 13298855  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298854 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 13298755  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  13298754 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagcttgatgaatgacaattattt 13298655  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  13298654 gactgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549982
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29549676  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29549677 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatc 29549776  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549777 gaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 29549876  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  29549877 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcag 29549976  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  29549977 tgatgt 29549982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 3696098 - 3696588
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3696098 cctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 3696197  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  3696198 caaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 3696297  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | |    
T  3696298 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaa 3696397  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3696398 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtc 3696497  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  3696498 taggatgccttcgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagcgatgt 3696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 322 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290058
Alignment:
Q  322 aagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccccc 421  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  422 acctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtac 521  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtac 27290367  T
Q  522 atcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatga 621  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27290366 attgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatga 27290267  T
Q  622 tcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcca 721  Q
    | || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290266 ttgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcca 27290167  T
Q  722 tgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtt 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290166 tgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtt 27290067  T
Q  822 agtgatgtc 830  Q
    |||||||||    
T  27290066 agtgatgtc 27290058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 34463525 - 34463035
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  34463525 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgttgcctc 34463426  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  34463425 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 34463326  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  34463325 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 34463226  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34463225 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 34463126  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  34463125 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 4545954 - 4545464
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  4545954 cctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 4545855  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  4545854 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 4545755  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  4545754 tgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 4545655  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4545654 gctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 4545555  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4545554 taggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4758271
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4758066  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4758067 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 4758166  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||    
T  4758167 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttcggactgtcagt 4758266  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  4758267 gatgt 4758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044895
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct-atgctttgaagtacat 523  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatat 27044589  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27044590 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27044689  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044690 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 27044789  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||    
T  27044790 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcag 27044889  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  27044890 tgatgt 27044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 27485132 - 27485636
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485132 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 27485231  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27485232 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27485331  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27485332 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27485431  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485432 aagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 27485531  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27485532 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgttagt 27485631  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  27485632 gatgt 27485636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 4724313 - 4723823
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4724313 cctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctc 4724214  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |    
T  4724213 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcat 4724114  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  4724113 tgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 4724014  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4724013 gctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 4723914  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4723913 taggatgcctccgagatcctttgggctgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 16674156 - 16674646
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16674156 cctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 16674255  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16674256 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 16674355  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  16674356 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 16674455  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16674456 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgtc 16674555  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  16674556 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 29573006 - 29573520
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||| |    
T  29573006 aatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggta 29573105  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29573106 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 29573205  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  29573206 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 29573305  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573306 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 29573405  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  29573406 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 29573505  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  29573506 gactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 337 - 829
Target Start/End: Original strand, 29501430 - 29501922
Alignment:
Q  337 tccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgct 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  29501430 tccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcc 29501529  T
Q  437 tcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctc 536  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||    
T  29501530 tccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactc 29501629  T
Q  537 gttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgagg 636  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  29501630 attgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgagg 29501729  T
Q  637 cagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtg 736  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501730 aagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtg 29501829  T
Q  737 cctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
     |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29501830 tctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773513
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4773308  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4773309 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatga 4773408  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  4773409 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 4773508  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  4773509 gatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525793
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 4525488  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4525489 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4525588  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4525589 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatga 4525688  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  4525689 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 4525788  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  4525789 gatgt 4525793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 30558219 - 30557705
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30558219 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 30558120  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30558119 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30558020  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  30558019 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 30557920  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557919 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 30557820  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30557819 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 30557720  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  30557719 gactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116099
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 26116404  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26116403 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 26116304  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116303 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 26116204  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||| |||    
T  26116203 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttcgatgaacgataatcttctgactgtcagt 26116104  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  26116103 gatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27008234
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27008029  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27008030 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 27008129  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  27008130 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 27008229  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  27008230 gatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 16944230 - 16943716
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  16944230 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 16944131  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16944130 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 16944031  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  16944030 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtg 16943931  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16943930 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 16943831  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  16943830 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttct 16943731  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  16943730 gactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 28207471 - 28207961
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  28207471 cctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctc 28207570  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| |    
T  28207571 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcat 28207670  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  28207671 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 28207770  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  28207771 gctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtc 28207870  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  28207871 taggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 325 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27360185 - 27359680
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27360185 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27360086  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  27360085 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27359986  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27359985 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27359886  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27359885 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatga 27359786  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  27359785 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 27359686  T
Q  825 gatgtc 830  Q
    ||||||    
T  27359685 gatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 325 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27450528 - 27450023
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27450528 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27450429  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  27450428 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27450329  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27450328 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27450229  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27450228 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatga 27450129  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  27450128 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagt 27450029  T
Q  825 gatgtc 830  Q
    ||||||    
T  27450028 gatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 315 - 651
Target Start/End: Original strand, 27000066 - 27000402
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000066 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27000165  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000166 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27000265  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  27000266 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 27000365  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttg 651  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27000366 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26777809 - 26777299
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26777809 gctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 26777710  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26777709 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26777610  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26777609 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26777510  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgc-----acatcaagctgtgcaaagcttctctgttcag 718  Q
    ||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||     || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26777509 gaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcag 26777410  T
Q  719 ccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgact 818  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26777409 ccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgact 26777310  T
Q  819 gttagtgatgt 829  Q
    || ||||||||    
T  26777309 gtcagtgatgt 26777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27630220 - 27629925
Alignment:
Q  1 gtatcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27630220 gtatcattgtatttgagaagggtgagtcttctacaagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 27630121  T
Q  101 ctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttc 200  Q
    |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||| | ||||| ||||||    
T  27630120 ctcgggagcaggtcagtctacggctactgtcgcccctgttaatgttgctcagctacctccaccatacccctgtacaccatattctcagcatccattcttc 27630021  T
Q  201 cctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcag 296  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27630020 ccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcag 27629925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 325 - 703
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025658
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
     || || || | ||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 17025579  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 703  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17025580 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 321 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 14143482 - 14142983
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  14143482 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 14143383  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  14143382 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 14143283  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  14143282 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 14143183  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  14143182 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 14143083  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  14143082 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 14142983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 321 - 820
Target Start/End: Original strand, 26787943 - 26788442
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  26787943 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 26788042  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  26788043 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26788142  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26788143 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26788242  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  26788243 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 26788342  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  26788343 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 26788442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 321 - 820
Target Start/End: Original strand, 27196316 - 27196815
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27196316 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27196415  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  27196416 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27196515  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27196516 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27196615  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  27196616 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 27196715  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27196716 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27196815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 321 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 27252924 - 27252425
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27252924 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27252825  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  27252824 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27252725  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27252724 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27252625  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  27252624 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 27252525  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    |||| || | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27252524 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 27252425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 321 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 22457131 - 22456641
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  | | |||| || |||||||||||||||||||| |    
T  22457131 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22457032  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  22457031 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22456932  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| | || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||    
T  22456931 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtg 22456832  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||    
T  22456831 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcc---------tctgcacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgacc 22456741  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||| || | || |||| |  |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  22456740 atgatcatgccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaattatttgactgt 22456641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 647 - 829
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019643
Alignment:
Q  647 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 27019560  T
Q  747 cttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019561 cttcgtaatgctttgagttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 27019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 324 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 13522267 - 13521789
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13522267 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13522168  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  13522167 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 13522068  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  13522067 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 13521968  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  13521967 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 13521868  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    | |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  13521867 accatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 13521789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 325 - 652
Target Start/End: Original strand, 20160704 - 20161031
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  20160704 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 20160803  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  20160804 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 20160903  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || |||||||    
T  20160904 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 20161003  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 652  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20161004 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 325 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22172127 - 22171800
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22172127 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 22172028  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  22172027 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 22171928  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || |||||||    
T  22171927 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 22171828  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 652  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22171827 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 8892504 - 8892060
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8892504 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8892405  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  8892404 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8892305  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  8892304 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8892206  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  8892205 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 8892106  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8892105 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8892060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 8903739 - 8903295
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8903739 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8903640  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  8903639 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8903540  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  8903539 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8903441  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  8903440 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 8903341  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  8903340 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 8903295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 33374450 - 33374005
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33374450 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33374351  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  33374350 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33374251  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  33374250 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33374151  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  | | ||| |||| ||||||||   ||| |    
T  33374150 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgaccacg 33374051  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  33374050 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 33374005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 321 - 769
Target Start/End: Original strand, 28162656 - 28163104
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  28162656 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 28162755  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||| |||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||| || |||| |||    
T  28162756 cacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggta 28162855  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  28162856 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 28162955  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  | | ||| |||| ||||||||   ||    
T  28162956 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgacc 28163055  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  28163056 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 28163104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 321 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22477470 - 22477240
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  | | |||| || |||||||||||||||||||| |    
T  22477470 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22477371  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  22477370 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22477271  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaag 551  Q
    ||| ||||| |||||| | || |||||||||    
T  22477270 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 531 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092129
Alignment:
Q  531 aagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 630  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||  || | ||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  631 gtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 730  Q
    |||||| |||| | | |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||| ||| ||||   ||||||||||      
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatag 17092228  T
Q  731 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    ||  |||| |  || | | ||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||  |||||||||| || || | | ||||||||||||||||    
T  17092227 cagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaactatctgactgttagtgatgt 17092129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 4524976 - 4525220
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  4524976 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 4525075  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4525076 ctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 4525175  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 247  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  4525176 accgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggt 4525220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 264
Target Start/End: Original strand, 20160508 - 20160652
Alignment:
Q  120 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaat 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   | |||||  |||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||| |    
T  20160508 atggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagt 20160607  T
Q  220 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||||| | ||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20160608 atcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattg 20160652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22172323 - 22172179
Alignment:
Q  120 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaat 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   | |||||  |||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||| |    
T  22172323 atggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagt 22172224  T
Q  220 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||||| | ||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22172223 atcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattg 22172179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 28162485 - 28162603
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  28162485 aatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 28162584  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  28162585 ctcaggtacccgttaatgc 28162603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 4757448 - 4757675
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  4757448 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 4757547  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    |  ||||  |||| || |||||||||||||| ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4757548 ccggagccggtcaatcaatggctactgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccc 4757647  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  4757648 accgttttatcatcagtaccctttgcca 4757675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 247
Target Start/End: Original strand, 29549204 - 29549409
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| ||||||||||| || || ||| | |    
T  29549204 tcgaagaggtatggtaatggacatcacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatca 29549303  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||    
T  29549304 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacc 29549403  T
Q  242 tcaggt 247  Q
    ||||||    
T  29549404 tcaggt 29549409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 27629894 - 27629530
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| | ||| || |    
T  27629894 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaggcctccgc 27629795  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | ||||| || |  || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  27629794 cagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 27629695  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||  | | |||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| |||||     
T  27629694 tgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgatt 27629595  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgca 688  Q
    ||||  | ||| | ||| || | ||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||    
T  27629594 gaagcgtatgaagaagcgcccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggtgcccctgca 27629530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4546293 - 4546066
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||      
T  4546293 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcag 4546194  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    ||  |||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4546193 ctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 4546094  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  4546093 accgttttatcatcagtaccctttgcca 4546066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27360519 - 27360292
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  27360519 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 27360420  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27360419 ctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccc 27360320  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27360319 accgttttatcatcagtaccctttgcca 27360292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27450862 - 27450635
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  27450862 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 27450763  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27450762 ctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccc 27450663  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27450662 accgttttatcatcagtaccctttgcca 27450635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 28207129 - 28207356
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||      
T  28207129 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcag 28207228  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    ||  |||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  28207229 ctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 28207328  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  28207329 accgttttatcatcagtaccctttgcca 28207356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13522441 - 13522323
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  13522441 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13522342  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13522341 ctcaggtacccgttaatgc 13522323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24305085 - 24304871
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || |||||||||||||| ||| | ||||    
T  24305085 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatg 24304986  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  24304985 ctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 24304886  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  24304885 agtacccgttaatgc 24304871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 26918106 - 26918328
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  26918106 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 26918205  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  26918206 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 26918305  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  26918306 tcaagtacccgtcaatgcaattg 26918328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33374624 - 33374506
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  33374624 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 33374525  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  33374524 ctcaggtacccgttaatgc 33374506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 17024988 - 17025176
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || ||||  ||||  ||||||||||||| || ||| | |    
T  17024988 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgctcctatca 17025087  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
    |||| || ||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  17025088 atgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 17025176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4724652 - 4724425
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||      
T  4724652 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcag 4724553  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    ||  |||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4724552 ctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 4724453  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  4724452 accgttttatcatcagtaccctttgcca 4724425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8892678 - 8892560
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  8892678 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 8892579  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8892578 ctcaggtacccgttaatgc 8892560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15424784 - 15424570
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  15424784 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 15424685  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  15424684 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 15424585  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  15424584 agtacccgttaatgc 15424570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22477674 - 22477521
Alignment:
Q  111 agtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccatttt 210  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||| ||  ||||||   | ||| | ||||| | ||||||| | ||||| ||||| || ||||| |    
T  22477674 agtcaatccatggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattct 22477575  T
Q  211 accatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    | ||| | |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22477574 atcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattg 22477521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Original strand, 26988727 - 26988944
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  26988727 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 26988826  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| || ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  26988827 atgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 26988926  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  26988927 tcaagtacccgttaatgc 26988944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Original strand, 26999802 - 27000021
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  26999802 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 26999901  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  26999902 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 27000001  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  27000002 agtacccgttaatgcaattg 27000021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30558525 - 30558446
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  30558525 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaac 30558446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8903913 - 8903795
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||  ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  8903913 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 8903814  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8903813 ctcaggtacccgttaatgc 8903795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 29572700 - 29572926
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  29572700 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 29572799  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  29572800 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 29572899  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29572900 accgttttatcatcagtaccctttgcc 29572926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22935218 - 22935125
Alignment:
Q  171 tatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22935218 tatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattg 22935125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23857663 - 23857570
Alignment:
Q  171 tatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23857663 tatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattg 23857570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27434693 - 27434178
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434693 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27434594  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434593 agcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27434494  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27434493 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 27434394  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434393 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 27434294  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434293 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 27434194  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  27434193 gactgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 28882206 - 28882721
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882206 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 28882305  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882306 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 28882405  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28882406 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 28882505  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882506 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 28882605  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882606 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 28882705  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  28882706 gactgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 20837910 - 20838425
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20837910 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 20838009  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838010 agcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 20838109  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20838110 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 20838209  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838210 aatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 20838309  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838310 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 20838409  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  20838410 gactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 23128815 - 23128300
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128815 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 23128716  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128715 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23128616  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23128615 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 23128516  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128515 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 23128416  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128415 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactattcaagatgatatccaaagcttgatgaatgataatttttt 23128316  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  23128315 gactgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 12655534 - 12656049
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655534 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 12655633  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12655634 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 12655733  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12655734 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgta 12655833  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655834 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 12655933  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655934 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 12656033  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  12656034 gactgtgagtgatgtc 12656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 11635435 - 11634921
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11635435 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 11635336  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11635335 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgcttt 11635236  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11635235 gaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtg 11635136  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11635135 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 11635036  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11635035 tcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 11634936  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||  |||||||    
T  11634935 gactgtcggtgatgt 11634921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 11641624 - 11641110
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11641624 aatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 11641525  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11641524 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgcttt 11641425  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11641424 gaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtg 11641325  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641324 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 11641225  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11641224 tcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 11641125  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||  |||||||    
T  11641124 gactgtcggtgatgt 11641110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 21677431 - 21676917
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21677431 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 21677332  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21677331 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 21677232  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  21677231 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 21677132  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677131 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 21677032  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  21677031 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttct 21676932  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    ||| || ||||||||    
T  21676931 gaccgtcagtgatgt 21676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375667
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37375362  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37375363 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37375462  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375463 aagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37375562  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37375563 acatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 37375662  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  37375663 gatgt 37375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 34286346 - 34286860
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34286346 aatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 34286445  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34286446 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgcttt 34286545  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  34286546 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtg 34286645  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286646 aatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 34286745  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34286746 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttct 34286845  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  34286846 gactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 34291406 - 34291920
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34291406 aatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 34291505  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34291506 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgcttt 34291605  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  34291606 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtg 34291705  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291706 aatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 34291805  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34291806 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttct 34291905  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  34291906 gactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 34861672 - 34862186
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34861672 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 34861771  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34861772 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 34861871  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  34861872 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 34861971  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861972 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 34862071  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34862072 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 34862171  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  34862172 gactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 37686158 - 37685644
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37686158 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 37686059  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37686058 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 37685959  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  37685958 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtg 37685859  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37685858 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 37685759  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37685758 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 37685659  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  37685658 gactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 37701423 - 37700909
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37701423 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 37701324  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37701323 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 37701224  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  37701223 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtg 37701124  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701123 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 37701024  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37701023 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 37700924  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  37700923 gactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 32049790 - 32050304
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32049790 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 32049889  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    | |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32049890 aacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 32049989  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  32049990 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 32050089  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32050090 aatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 32050189  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  32050190 ttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 32050289  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  32050290 gactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 37925485 - 37925999
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37925485 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 37925584  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37925585 agcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 37925684  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  37925685 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 37925784  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925785 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 37925884  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37925885 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 37925984  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  37925985 gactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 317 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 13936791 - 13936279
Alignment:
Q  317 tcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaag 416  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  13936791 tcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaag 13936692  T
Q  417 cccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttga 516  Q
    || ||||| || || || | ||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13936691 cctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttga 13936592  T
Q  517 agtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaa 616  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13936591 agtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaa 13936492  T
Q  617 tatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttc 716  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936491 tatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttc 13936392  T
Q  717 agccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttga 816  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  13936391 agccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctga 13936292  T
Q  817 ctgttagtgatgt 829  Q
    |||| ||||||||    
T  13936291 ctgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 260978 - 260488
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  260978 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgcctc 260879  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  260878 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 260779  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| |    
T  260778 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaa 260679  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  260678 gttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtc 260579  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  260578 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 27777238 - 27777728
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  27777238 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 27777337  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  27777338 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 27777437  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  27777438 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 27777537  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27777538 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 27777637  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27777638 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 27816996 - 27817486
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  27816996 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 27817095  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  27817096 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 27817195  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  27817196 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 27817295  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27817296 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 27817395  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27817396 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 40233527 - 40234017
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  40233527 cctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 40233626  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  40233627 caaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 40233726  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |    
T  40233727 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaa 40233826  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40233827 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 40233926  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||    
T  40233927 tgggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctaactgtcagtgatgt 40234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890580
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatat 39890274  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39890275 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 39890374  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39890375 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 39890474  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  39890475 atcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggcttgatggatgataatcttctgactgtcag 39890574  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  39890575 tgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 16829587 - 16829073
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16829587 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 16829488  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16829487 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16829388  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16829387 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 16829288  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829287 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 16829188  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16829187 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 16829088  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  16829087 gactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 16891894 - 16892408
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16891894 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 16891993  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16891994 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16892093  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16892094 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 16892193  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16892194 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 16892293  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16892294 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 16892393  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  16892394 gactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 12716827 - 12716337
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  12716827 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 12716728  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  12716727 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 12716628  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  12716627 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaa 12716528  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12716527 gctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtc 12716428  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12716427 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 27803723 - 27804213
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  27803723 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 27803822  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  27803823 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 27803922  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  27803923 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 27804022  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27804023 gctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 27804122  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27804123 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 31876273 - 31876788
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31876273 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 31876372  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31876373 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 31876472  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  31876473 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 31876572  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31876573 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctctgt 31876672  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  31876673 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttct 31876772  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  31876773 gactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 12586826 - 12587316
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  12586826 cctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 12586925  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  12586926 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 12587025  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  12587026 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 12587125  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12587126 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 12587225  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12587226 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 39052047 - 39051557
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  39052047 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 39051948  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  39051947 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 39051848  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  39051847 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 39051748  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39051747 gctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgccaagtgtc 39051648  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39051647 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 19416748 - 19416234
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  19416748 aatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 19416649  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19416648 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 19416549  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    ||| || |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  19416548 gaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 19416449  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416448 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 19416349  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  19416348 ttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttct 19416249  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  19416248 gactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 9350207 - 9349717
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||| ||||| || || || | ||    
T  9350207 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctc 9350108  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  9350107 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 9350008  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |    
T  9350007 tgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaa 9349908  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||  | ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9349907 gctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 9349808  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  9349807 taggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 315 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 22926277 - 22925790
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22926277 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 22926178  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22926177 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 22926078  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||     
T  22926077 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtg 22925978  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  22925977 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 22925878  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    |   ||||||||||||||| |||| || |||  |  ||||| ||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22925877 ttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 22925790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 21703412 - 21702898
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  21703412 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaa 21703313  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  21703312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttg 21703213  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21703212 aagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 21703113  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  21703112 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtt 21703013  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
     | ||| |||||| |||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||    
T  21703012 taaccacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaattatttg 21702913  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    ||||| || ||||||    
T  21702912 actgtcagcgatgtc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 315 - 572
Target Start/End: Original strand, 34279441 - 34279698
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34279441 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 34279540  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34279541 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 34279640  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 572  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279641 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 321 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 19456664 - 19456155
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  19456664 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 19456565  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||    
T  19456564 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagta 19456465  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || |||    
T  19456464 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatg 19456365  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||    
T  19456364 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgacc 19456265  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||  ||||  | |||| |  |||||||||||||||||||   ||||||| | || ||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  19456264 atgatcatgccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaattatttgactgt 19456165  T
Q  821 tagtgatgtc 830  Q
     || ||||||    
T  19456164 cagcgatgtc 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 321 - 820
Target Start/End: Original strand, 27118686 - 27119185
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  27118686 caagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 27118785  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  27118786 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 27118885  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| |||    
T  27118886 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatg 27118985  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| ||||  || ||  ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  27118986 attgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 27119085  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  27119086 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 27119185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 321 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 31891571 - 31891123
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  31891571 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 31891472  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  31891471 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggta 31891372  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  31891371 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 31891272  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || | ||| |||| ||||||||   ||    
T  31891271 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgacc 31891172  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  31891171 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 31891123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 321 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 34303546 - 34303098
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  34303546 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 34303447  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  34303446 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 34303347  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||    
T  34303346 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatg 34303247  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   |     
T  34303246 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaca 34303147  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| |||||||||    
T  34303146 atgatcatgccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgcta 34303098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Original strand, 3784655 - 3785100
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  3784655 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 3784754  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  3784755 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 3784854  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  3784855 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 3784954  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  3784955 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 3785054  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  3785055 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 3785100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Original strand, 34157012 - 34157456
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  34157012 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34157111  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  34157112 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 34157211  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  34157212 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 34157310  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  34157311 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 34157410  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  34157411 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 34157456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 324 - 802
Target Start/End: Original strand, 16163600 - 16164081
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16163600 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16163699  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||    
T  16163700 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 16163799  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  16163800 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 16163899  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag---cttctctgttcagcc 720  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||   | ||||||||   ||    
T  16163900 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctcctctctgtttgacc 16163999  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16164000 atgatcatgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 16164081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 339 - 625
Target Start/End: Original strand, 27392985 - 27393271
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||    
T  27392985 cctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctc 27393084  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    ||||||||   || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||| |    
T  27393085 ccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcat 27393184  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 625  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||    
T  27393185 tgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcga 27393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21703650 - 21703460
Alignment:
Q  69 aagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatact 168  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  ||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||  | |||     
T  21703650 aagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgtcgtacc 21703551  T
Q  169 cctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    | ||||| || |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  21703550 catatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 21703460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31891742 - 31891624
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  31891742 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 31891643  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31891642 ctcaggtacccgttaatgc 31891624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12717160 - 12716933
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  12717160 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 12717061  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  12717060 ctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 12716961  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||    
T  12716960 gccattttatcatcagtaccctttgcca 12716933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 3784481 - 3784599
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  3784481 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 3784580  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  3784581 ctcaggtacccgttaatgc 3784599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21677698 - 21677476
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  21677698 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 21677599  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | ||||| |||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  21677598 atgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 21677499  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||    
T  21677498 tcaagtgcccgtcaatgcgattg 21677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 34156838 - 34156956
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  34156838 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 34156937  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  34156938 ctcaggtacccgttaatgc 34156956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34303717 - 34303600
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  34303717 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 34303618  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatg 258  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  34303617 ctcaggtacccgttaatg 34303600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27434957 - 27434738
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  27434957 aagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatg 27434858  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||  | ||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || | ||||||    
T  27434857 ctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctca 27434758  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  27434757 agtacccgttaatgcaattg 27434738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 39889748 - 39889975
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  39889748 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 39889847  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  39889848 ctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 39889947  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  39889948 accgttttatcatcagtaccctttgcca 39889975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 16163426 - 16163544
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  16163426 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 16163525  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  16163526 ctcaggtacccgttaatgc 16163544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 27118515 - 27118633
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| |  |||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  27118515 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 27118614  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  27118615 ctcaggtacccgttaatgc 27118633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 37925218 - 37925440
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  37925218 tcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 37925317  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||    
T  37925318 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacc 37925417  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||    
T  37925418 tcaagtgcccgtcaatgcgattg 37925440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 32049484 - 32049745
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||      
T  32049484 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcctcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaaaaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 32049583  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||  | ||||| |||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  32049584 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 32049683  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  32049684 gccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattg 32049745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13937061 - 13936838
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtt 140  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| |     
T  13937061 gtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatc 13936962  T
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| | || | ||    
T  13936961 aatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaac 13936862  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||    
T  13936861 ctcaagtgcccgtcaatgcaattg 13936838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16829893 - 16829814
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16829893 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaac 16829814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 16891588 - 16891667
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16891588 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaac 16891667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 34279173 - 34279396
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| |     
T  34279173 gtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatc 34279272  T
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| | || | ||    
T  34279273 aatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaac 34279372  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||    
T  34279373 ctcaagtgcccgtcaatgcaattg 34279396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23129079 - 23128865
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  23129079 aagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 23128980  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  23128979 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 23128880  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  23128879 agtacccgttaatgc 23128865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 31875967 - 31876193
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  31875967 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 31876066  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  31876067 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 31876166  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31876167 accgttttatcatcagtaccctttgcc 31876193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 34861366 - 34861592
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  34861366 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 34861465  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  34861466 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 34861565  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  34861566 accgttttatcatcagtaccctttgcc 34861592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37686464 - 37686238
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  37686464 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 37686365  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37686364 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 37686265  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  37686264 accgttttatcatcagtaccctttgcc 37686238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37701729 - 37701503
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  37701729 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 37701630  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37701629 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 37701530  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  37701529 accgttttatcatcagtaccctttgcc 37701503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 2137478 - 2136963
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137478 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 2137379  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137378 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 2137279  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2137278 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 2137179  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137178 aatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 2137079  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2137078 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatctttt 2136979  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  2136978 gactgttagtgatgtc 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 27609124 - 27608609
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609124 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27609025  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27609024 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgcttt 27608925  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  27608924 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 27608825  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  27608824 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttccctat 27608725  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608724 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 27608625  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  27608624 gactgttagtgatgtc 27608609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 16277550 - 16278065
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277550 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 16277649  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16277650 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 16277749  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16277750 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgta 16277849  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277850 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 16277949  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277950 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 16278049  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  16278050 gactgttagtgatgtc 16278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 19688094 - 19688609
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688094 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 19688193  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688194 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 19688293  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19688294 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 19688393  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688394 aatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 19688493  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688494 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgtccaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 19688593  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    || ||| | |||||||    
T  19688594 gaatgtcaatgatgtc 19688609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 14557620 - 14558135
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557620 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 14557719  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557720 agccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 14557819  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14557820 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 14557919  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557920 aatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 14558019  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558020 tcagtcatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 14558119  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  14558120 gactgttagtgatgtc 14558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Original strand, 16283446 - 16283960
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283446 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaa 16283545  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16283546 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttg 16283645  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16283646 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtga 16283745  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16283746 acatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtt 16283845  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283846 tagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 16283945  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    ||||| |||||||||    
T  16283946 actgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 19674437 - 19674951
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19674437 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 19674536  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19674537 aacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgcttt 19674636  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  19674637 gaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 19674736  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674737 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 19674836  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  19674837 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 19674936  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  19674937 gactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 31489969 - 31489455
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31489969 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 31489870  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31489869 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 31489770  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  31489769 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 31489670  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489669 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 31489570  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  31489569 tcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 31489470  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  31489469 gactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 19208579 - 19208065
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19208579 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 19208480  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19208479 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 19208380  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  19208379 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 19208280  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208279 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 19208180  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19208179 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 19208080  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  19208079 gactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 28362174 - 28361660
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28362174 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 28362075  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28362074 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 28361975  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  28361974 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 28361875  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28361874 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 28361775  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  28361774 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 28361675  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  28361674 gactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 31354520 - 31355034
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31354520 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 31354619  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31354620 agcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 31354719  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  31354720 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 31354819  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31354820 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgt 31354919  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |    
T  31354920 tcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcctgatggatgataatctcct 31355019  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  31355020 gactgtcagtgatgt 31355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286972
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 19286667  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19286668 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 19286767  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286768 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 19286867  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  19286868 tcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaat 19286967  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  19286968 gatgt 19286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329212
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcg 3329417  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329416 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 3329317  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||    
T  3329316 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataacttcctgactgtcagt 3329217  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  3329216 gatgt 3329212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829832
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29829527  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29829528 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 29829627  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829628 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 29829727  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  29829728 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagt 29829827  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  29829828 gatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 33258719 - 33259233
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  33258719 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 33258818  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33258819 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 33258918  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||     
T  33258919 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtg 33259018  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259019 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 33259118  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  33259119 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttct 33259218  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  33259219 gactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092429
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 12092734  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12092733 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 12092634  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12092633 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatga 12092534  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  12092533 tcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgaccgtcagt 12092434  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  12092433 gatgt 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9355133
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 9354826  T
Q  524 cgtgaaaaag-ctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 622  Q
     || |||||  ||| | || ||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9354827 tgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 9354926  T
Q  623 cgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccat 722  Q
    |||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354927 cgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccat 9355026  T
Q  723 gatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtta 822  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |    
T  9355027 gatcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtca 9355126  T
Q  823 gtgatgt 829  Q
    |||||||    
T  9355127 gtgatgt 9355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 483 - 748
Target Start/End: Original strand, 189258 - 189523
Alignment:
Q  483 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  189258 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 189357  T
Q  583 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 682  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189358 tcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcc 189457  T
Q  683 tctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 748  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189458 tctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcct 189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 324 - 802
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18711069
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 18710790  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  18710791 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 18710890  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  18710891 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 18710990  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    |||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18710991 atcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 18711069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 324 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 19659249 - 19658754
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19659249 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 19659150  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||| |||| || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  19659149 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 19659050  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  19659049 tgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 19658951  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  19658950 gaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 19658851  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  19658850 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 19658754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 321 - 802
Target Start/End: Original strand, 44563103 - 44563582
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  44563103 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 44563202  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    |||||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  44563203 cacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 44563302  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  44563303 cattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatg 44563400  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| |||   || ||  |||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  44563401 attgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 44563500  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44563501 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 44563582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 324 - 820
Target Start/End: Original strand, 33244670 - 33245166
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| ||| || || |||||| |||| |  | |||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33244670 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 33244769  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||| |||| || ||| | |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  33244770 ctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33244869  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| |||||     
T  33244870 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgatt 33244969  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||  ||||  || ||  ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||  | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  33244970 gaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaactcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatg 33245069  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  33245070 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 33245166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 708 - 830
Target Start/End: Original strand, 18791096 - 18791218
Alignment:
Q  708 tctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgata 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18791096 tctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcattcgtaatcctttgggttgctacactgctcaagatgacatccaaagcttgatgaatgata 18791195  T
Q  808 attttttgactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18791196 attttttgactgttagtgatgtc 18791218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 339 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 22081073 - 22080643
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||| |||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||| ||    
T  22081073 cctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctc 22080974  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    |||||||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||| |    
T  22080973 ccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcat 22080874  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat-gtgaggc 637  Q
    ||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||| |  ||| |     
T  22080873 tgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agactcatgaaga 22080775  T
Q  638 agctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgc 737  Q
    || ||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||| ||     
T  22080774 agttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgt 22080675  T
Q  738 ctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    | || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  22080674 ccagaatgccgccataatccttggggttgcta 22080643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Original strand, 18710315 - 18710532
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || ||||  |||| || |||||||| || || ||| | |    
T  18710315 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatca 18710414  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||    
T  18710415 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacc 18710514  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  18710515 tcaggttcccgtcaatgc 18710532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 44562932 - 44563050
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  44562932 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 44563031  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  44563032 ctcaggtacccgttaatgc 44563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Original strand, 16283181 - 16283400
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  16283181 aagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatg 16283280  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||  | ||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||||||| |||| | ||||||    
T  16283281 ctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctca 16283380  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||||||| | ||||| ||||    
T  16283381 ggtacccattaatgcaattg 16283400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 9354453 - 9354571
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  9354453 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 9354552  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  9354553 ctcaggtacccgttaatgc 9354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19659423 - 19659305
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  19659423 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 19659324  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  19659323 ctcaggtacccgttaatgc 19659305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 19286155 - 19286416
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  19286155 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 19286254  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    |  ||||  |||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  19286255 cgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccc 19286354  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     || ||||| ||||| || ||||| ||| | || | ||||||||| || || ||||| ||||    
T  19286355 accgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattg 19286416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19518332 - 19518280
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagg 391  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19518332 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 19518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31490237 - 31490014
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtt 140  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| |||||| |     
T  31490237 gtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatc 31490138  T
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   || || ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||    
T  31490137 aatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaac 31490038  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||    
T  31490037 ctcaagtgcccgtcaatgcgattg 31490014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 16277286 - 16277500
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  16277286 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 16277385  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  16277386 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 16277485  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  16277486 agtacccgttaatgc 16277500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Original strand, 19674161 - 19674389
Alignment:
Q  36 agtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgccc 135  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||| || || |    
T  19674161 agtgcgtcgaagaggtatggtaatggacatcacaagaagaaagaaacggacgtggggatggtgtcagctggagccagtcaatccatggctaccgttgctc 19674260  T
Q  136 ctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcagg 235  Q
    || | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||| | ||    
T  19674261 ctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccggg 19674360  T
Q  236 accacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     | |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  19674361 tcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattg 19674389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12093258 - 12093031
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||      
T  12093258 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcag 12093159  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    ||  |||  | || |||||||||||| | || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  12093158 ctgcagccggccaatctatggctactattgctcctatcaatgcagctcaagtgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 12093059  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  12093058 accgttttatcatcagtaccctttgcca 12093031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2137742 - 2137528
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  2137742 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 2137643  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  2137642 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 2137543  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  2137542 agtacccgttaatgc 2137528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 14557359 - 14557573
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || |||||||||||||| ||| | ||||    
T  14557359 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatg 14557458  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  14557459 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 14557558  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     ||||| || |||||    
T  14557559 agtacctgttaatgc 14557573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19208885 - 19208659
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  19208885 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaagtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 19208786  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19208785 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 19208686  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  19208685 accgttttatcatcagtaccctttgcc 19208659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22081350 - 22081240
Alignment:
Q  50 gtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgct 149  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||  |  || | ||||| || ||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  22081350 gtatggcaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccatcaatgctgct 22081251  T
Q  150 cagctacctcc 160  Q
    |||||||||||    
T  22081250 cagctacctcc 22081240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Original strand, 31354253 - 31354311
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  31354253 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatc 31354311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 10917014 - 10916499
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10917014 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 10916915  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916914 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 10916815  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10916814 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 10916715  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10916714 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctgt 10916615  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916614 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 10916515  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  10916514 gactgttagtgatgtc 10916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 16503526 - 16503011
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503526 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 16503427  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16503426 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtttt 16503327  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16503326 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 16503227  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16503226 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgt 16503127  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503126 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 16503027  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  16503026 gactgttagtgatgtc 16503011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 2154570 - 2155085
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154570 aatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 2154669  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2154670 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgcttt 2154769  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2154770 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 2154869  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154870 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 2154969  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154970 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 2155069  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  2155070 gactgttagtgatgtc 2155085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 16518562 - 16518047
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518562 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 16518463  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16518462 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtttt 16518363  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16518362 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 16518263  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16518262 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgt 16518163  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518162 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 16518063  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  16518062 gactgttagtgatgtc 16518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 11424922 - 11424412
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11424922 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacagggca 11424823  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424822 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 11424723  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  11424722 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 11424623  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424622 aatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 11424523  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11424522 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataat-tttt 11424424  T
Q  815 gactgttagtga 826  Q
    ||||||||||||    
T  11424423 gactgttagtga 11424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 826
Target Start/End: Original strand, 5127989 - 5128500
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5127989 aatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggta 5128088  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5128089 agcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgcttt 5128188  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  5128189 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 5128288  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5128289 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgt 5128388  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128389 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 5128488  T
Q  815 gactgttagtga 826  Q
    ||||||||||||    
T  5128489 gactgttagtga 5128500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 5147486 - 5146972
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5147486 aatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5147387  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5147386 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5147287  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  5147286 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 5147187  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147186 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 5147087  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5147086 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 5146987  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  5146986 gactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 4145269 - 4144755
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4145269 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 4145170  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4145169 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 4145070  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4145069 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 4144970  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144969 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 4144870  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || |    
T  4144869 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctaatgaatgataatcttct 4144770  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  4144769 gactgtcagtgatgt 4144755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 16736606 - 16736092
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16736606 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 16736507  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16736506 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16736407  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  16736406 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 16736307  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736306 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 16736207  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  16736206 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 16736107  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  16736106 gactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 16751660 - 16751146
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16751660 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 16751561  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16751560 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16751461  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  16751460 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 16751361  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751360 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 16751261  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  16751260 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 16751161  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  16751160 gactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 17523529 - 17524043
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17523529 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 17523628  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17523629 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 17523728  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  17523729 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 17523828  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523829 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 17523928  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  17523929 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 17524028  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  17524029 gactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 17529686 - 17529172
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17529686 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 17529587  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17529586 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 17529487  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  17529486 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 17529387  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529386 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 17529287  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  17529286 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 17529187  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  17529186 gactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 26435254 - 26435768
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26435254 aatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26435353  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26435354 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 26435453  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26435454 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26435553  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435554 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 26435653  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26435654 tcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 26435753  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  26435754 gactgtcagtgatgt 26435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26537992 - 26537502
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26537992 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 26537893  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  26537892 caaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 26537793  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  26537792 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 26537693  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26537692 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 26537593  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26537592 taggatgccttcgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26537502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26320015 - 26319501
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26320015 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26319916  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26319915 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 26319816  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  26319815 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtg 26319716  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319715 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 26319616  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26319615 tcaatcatgatcatgccaagtgactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 26319516  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  26319515 gactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 45387340 - 45387854
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  45387340 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 45387439  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45387440 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 45387539  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  45387540 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 45387639  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387640 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 45387739  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  45387740 tcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttct 45387839  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  45387840 gactgtcagtgatgt 45387854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 9618648 - 9619162
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9618648 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 9618747  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9618748 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 9618847  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9618848 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 9618947  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618948 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 9619047  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9619048 tcagccatgagcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 9619147  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  9619148 gactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26275240 - 26274726
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26275240 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26275141  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26275140 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgcttt 26275041  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26275040 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26274941  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26274940 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 26274841  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  26274840 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttaatgaatgataatcttct 26274741  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  26274740 gactgtcagtgatgt 26274726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26670060 - 26669546
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26670060 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26669961  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26669960 agcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 26669861  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26669860 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26669761  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26669760 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 26669661  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  26669660 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctcct 26669561  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  26669560 gactgtcagtgatgt 26669546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564022
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31564227  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564226 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 31564127  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  31564126 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 31564027  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  31564026 gatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 24592687 - 24592173
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  24592687 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 24592588  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24592587 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 24592488  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||     
T  24592487 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtg 24592388  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592387 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 24592288  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  24592287 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttct 24592188  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  24592187 gactgtcagtgatgt 24592173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 3445327 - 3445817
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3445327 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 3445426  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  3445427 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcat 3445526  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  3445527 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaa 3445626  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3445627 actcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtc 3445726  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3445727 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 339 - 787
Target Start/End: Original strand, 11441593 - 11442041
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11441593 cctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 11441692  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  11441693 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 11441792  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  11441793 cgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaa 11441892  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11441893 gctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 11441992  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacat 787  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11441993 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacat 11442041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 31124927 - 31125431
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31124927 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 31125026  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31125027 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31125126  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31125127 gtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31125226  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31125227 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 31125326  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |||    
T  31125327 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagt 31125426  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  31125427 gatgt 31125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 45 - 830
Target Start/End: Original strand, 16041059 - 16041835
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  ||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16041059 aagaggtatggtaacggtcatcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatg 16041158  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||| |||||||  | ||| | ||||| || |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| || | ||||||    
T  16041159 ctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctca 16041258  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactatccctccg 344  Q
    ||||||||| ||| |  | || ||||| | || ||| || |||||||||||                    |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  16041259 ggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagc---------atcaacaagctagacctaccttccctccg 16041349  T
Q  345 ataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggt 444  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16041350 ataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggt 16041449  T
Q  445 tcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatca 544  Q
    || | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16041450 tccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatca 16041549  T
Q  545 aggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcct 644  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | ||  |||| ||||||     
T  16041550 gggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctccc 16041649  T
Q  645 agacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggat 744  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| |  || |||||| |||| |||| || ||    
T  16041650 agactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtttaatcacgatcataccaattgcccagaat 16041749  T
Q  745 gccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 830  Q
    || | ||||||| ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  16041750 gcttccgtaatcttttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 321 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 16450138 - 16449629
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16450138 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16450039  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  16450038 cacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 16449939  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  16449938 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 16449839  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||   ||    
T  16449838 attgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgacc 16449739  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||  | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  16449738 atgatcatgccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 16449639  T
Q  821 tagtgatgtc 830  Q
     || ||||||    
T  16449638 cagcgatgtc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 321 - 802
Target Start/End: Original strand, 26484697 - 26485178
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  26484697 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 26484796  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  26484797 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26484896  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26484897 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26484996  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  26484997 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 26485096  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26485097 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26485178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 321 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39210682
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||  |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 39210964  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  39210963 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 39210864  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  39210863 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 39210764  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  39210763 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 39210682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 324 - 802
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775843
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||| ||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 2775664  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  2775665 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 2775764  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    |||||||||| |||| || |||  |   |||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  2775765 atcatgccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 2775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 321 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 2109145 - 2108664
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  2109145 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 2109046  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  2109045 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 2108946  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  2108945 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 2108846  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  |||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||  | ||| |||| ||||||||   ||    
T  2108845 attgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgacc 2108746  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  2108745 atgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 2108664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 450 - 769
Target Start/End: Original strand, 4200679 - 4200998
Alignment:
Q  450 tccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaa 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| || | |||||||    
T  4200679 tccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 4200778  T
Q  550 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagact 649  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||    
T  4200779 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 4200878  T
Q  650 tgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctt 749  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |     
T  4200879 tgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattc 4200978  T
Q  750 cgtaatcctttgggttgcta 769  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4200979 tgtaatcctttgggttgcta 4200998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 667 - 829
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513292
Alignment:
Q  667 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttg 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctctgggttg 26513229  T
Q  767 ctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  26513230 ccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 448 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 26683013 - 26682659
Alignment:
Q  448 ggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaagg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  | ||||| ||| | || |||||    
T  26683013 ggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaagg 26682914  T
Q  548 aaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctaga 647  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||    
T  26682913 aaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 26682814  T
Q  648 cttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcc 747  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||      
T  26682813 cttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgat 26682714  T
Q  748 ttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26682713 tctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 26682659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 31088601 - 31088156
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31088601 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31088502  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  31088501 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 31088402  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  31088401 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 31088302  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  31088301 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 31088202  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||  |||||||||    
T  31088201 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgcta 31088156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 389 - 769
Target Start/End: Original strand, 45733531 - 45733911
Alignment:
Q  389 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggt 488  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  45733531 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggt 45733630  T
Q  489 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 588  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |    
T  45733631 catgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgaca 45733730  T
Q  589 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgca 688  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  45733731 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactaca 45733830  T
Q  689 catcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||| || | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  45733831 catcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 45733911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 321 - 708
Target Start/End: Original strand, 18540802 - 18541189
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  18540802 caagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 18540901  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    |||| || || || | ||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  18540902 caccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 18541001  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    |||||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  18541002 catcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 18541101  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagctt 708  Q
    || ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  18541102 attgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 18541189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 324 - 708
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159909
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | || || || | ||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacat 5159724  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| || || ||||| ||     
T  5159725 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataatt 5159824  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagctt 708  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  5159825 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctt 5159909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16503790 - 16503571
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  16503790 aagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatg 16503691  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||    
T  16503690 ctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctca 16503591  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  16503590 ggtacccgttaatgcaattg 16503571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16518826 - 16518607
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  16518826 aagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatg 16518727  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||    
T  16518726 ctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctca 16518627  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  16518626 ggtacccgttaatgcaattg 16518607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 5127722 - 5127944
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  5127722 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 5127821  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||| | || | |||    
T  5127822 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacc 5127921  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  5127922 tcaagtacccgttaatgcaattg 5127944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 45387037 - 45387295
Alignment:
Q  6 attgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctcta 105  Q
    ||||| ||||| || | ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  ||     
T  45387037 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 45387136  T
Q  106 gagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctcc 205  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| |||||||| ||    
T  45387137 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 45387236  T
Q  206 attttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  45387237 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattg 45387295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4145536 - 4145331
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  4145536 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 4145437  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||    
T  4145436 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacc 4145337  T
Q  242 tcaggt 247  Q
    ||||||    
T  4145336 tcaggt 4145331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16450327 - 16450199
Alignment:
Q  123 gctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatc 222  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  | ||| | || || | ||||||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  16450327 gctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatc 16450228  T
Q  223 ctttgccatcaggaccacctcaggtaccc 251  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||    
T  16450227 ctttgccatcgggtcaacctcaggtaccc 16450199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Original strand, 5159254 - 5159457
Alignment:
Q  44 gaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaat 143  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| || || || || | | ||  || ||||||||||| || ||| | |||    
T  5159254 gaagagatatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccatggctactgttgctcctatcaat 5159353  T
Q  144 gctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctc 243  Q
    ||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||    
T  5159354 gctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctc 5159453  T
Q  244 aggt 247  Q
    ||||    
T  5159454 aggt 5159457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31564851 - 31564624
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  31564851 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 31564752  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31564751 ctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttccc 31564652  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  31564651 accgttttatcatcagtaccctttgcca 31564624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 3444985 - 3445199
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  3444985 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 3445084  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | ||    ||||||||| | ||||||||||||||    
T  3445085 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttccc 3445184  T
Q  203 tccattttaccatca 217  Q
     || |||||||||||    
T  3445185 accgttttaccatca 3445199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31088775 - 31088657
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  31088775 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 31088676  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31088675 ctcaggtacccgttaatgc 31088657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 45733292 - 45733410
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  45733292 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 45733391  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  45733392 ctcaggtacccgttaatgc 45733410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 9618381 - 9618568
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  9618381 tcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 9618480  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  9618481 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 9618568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24592993 - 24592767
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| || ||| ||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  24592993 atcattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 24592894  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  24592893 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 24592794  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24592793 accgttttatcatcagtaccctttgcc 24592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26275546 - 26275320
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  26275546 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 26275447  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  26275446 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 26275347  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26275346 accgttttatcatcagtaccctttgcc 26275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26486196 - 26485982
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  26486196 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 26486097  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || || ||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||||||| | ||||||||||||||    
T  26486096 ctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttccc 26485997  T
Q  203 tccattttaccatca 217  Q
     || |||||||||||    
T  26485996 accgttttaccatca 26485982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26485845 - 26485756
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgat 428  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||    
T  26485845 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgat 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26320282 - 26320095
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  26320282 tcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 26320183  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26320182 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 26320095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16736912 - 16736815
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 100  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||   |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  16736912 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatc 16736815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16751966 - 16751869
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 100  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||   |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  16751966 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatc 16751869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 17523223 - 17523320
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 100  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||   |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  17523223 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatc 17523320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17529992 - 17529895
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatc 100  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||   |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  17529992 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatc 17529895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 17014011 - 17014526
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014011 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggca 17014110  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17014111 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 17014210  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17014211 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 17014310  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014311 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 17014410  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014411 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 17014510  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  17014511 gactgttagtgatgtc 17014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 14665029 - 14665544
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14665029 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 14665128  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665129 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 14665228  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14665229 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 14665328  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665329 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 14665428  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665429 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 14665528  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  14665529 gactgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 24592574 - 24592059
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592574 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24592475  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24592474 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 24592375  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24592374 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgta 24592275  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592274 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 24592175  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592174 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 24592075  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  24592074 gactgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 14763564 - 14763050
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14763564 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 14763465  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14763464 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 14763365  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14763364 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 14763265  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763264 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 14763165  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14763164 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 14763065  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  14763064 gactgtcagtgatgt 14763050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 6569864 - 6570378
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6569864 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 6569963  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6569964 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 6570063  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  6570064 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 6570163  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570164 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 6570263  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6570264 tcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 6570363  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  6570364 gactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800359
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18800564  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800563 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 18800464  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  18800463 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 18800364  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  18800363 gatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344261
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 36344566  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36344565 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 36344466  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344465 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatga 36344366  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36344365 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 36344266  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  36344265 gatgt 36344261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 5005884 - 5006398
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5005884 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaaggca 5005983  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5005984 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5006083  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||     
T  5006084 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtg 5006183  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5006184 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctctgt 5006283  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5006284 tcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttggattgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 5006383  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  5006384 gactgtcagtgatgt 5006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 27163577 - 27163063
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27163577 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 27163478  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27163477 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 27163378  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    ||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  27163377 gaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 27163278  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  27163277 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgt 27163178  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  27163177 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 27163078  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  27163077 gactgtcagtgatgt 27163063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 33674034 - 33673544
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||    
T  33674034 cctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgttgcctc 33673935  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  33673934 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 33673835  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  33673834 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 33673735  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33673734 gttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 33673635  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33673634 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 40105898 - 40105384
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  40105898 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggca 40105799  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40105798 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 40105699  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  40105698 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 40105599  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105598 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 40105499  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40105498 ttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 40105399  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  40105398 gactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833912
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 54833607  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54833608 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 54833707  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833708 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 54833807  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  54833808 tcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaat 54833907  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  54833908 gatgt 54833912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 30753789 - 30754279
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  30753789 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 30753888  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |    
T  30753889 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcat 30753988  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  30753989 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 30754088  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30754089 gctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 30754188  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30754189 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 14098552 - 14099066
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14098552 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggca 14098651  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14098652 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 14098751  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14098752 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 14098851  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098852 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 14098951  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  14098952 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataaccttct 14099051  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  14099052 gactgtcagtgatgt 14099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 31126778 - 31126264
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31126778 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 31126679  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31126678 agcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 31126579  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  31126578 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 31126479  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31126478 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 31126379  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31126378 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 31126279  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  31126278 gactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 39850673 - 39851163
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  39850673 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 39850772  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39850773 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgt 39850872  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  39850873 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 39850972  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39850973 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 39851072  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39851073 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 21969712 - 21970226
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || || ||||    
T  21969712 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactaggcaaggca 21969811  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| ||||| || || || | ||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21969812 agcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 21969911  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21969912 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 21970011  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||| |||   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21970012 aatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 21970111  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21970112 ttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 21970211  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  21970212 gactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 829
Target Start/End: Original strand, 1900031 - 1900782
Alignment:
Q  69 aagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatact 168  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  ||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  | |||     
T  1900031 aagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacc 1900130  T
Q  169 cctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgca 268  Q
    | ||||| || |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||    
T  1900131 catatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttca 1900230  T
Q  269 gcagaagccacagcaaccaccagttcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 368  Q
    ||| | || ||| || |||||||||||                    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||| |||||     
T  1900231 gcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---------atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagtta 1900321  T
Q  369 cttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatt 468  Q
    || |||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||| |||||||    
T  1900322 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatt 1900421  T
Q  469 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 568  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1900422 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataa 1900521  T
Q  569 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 668  Q
    ||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||| ||||| | |||| | |||    
T  1900522 tgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgca 1900621  T
Q  669 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 768  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   |||||| |||||||  |||| || |||  | | |||| ||||||||||||    
T  1900622 actcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgaccatgccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgct 1900721  T
Q  769 atactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |   ||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  1900722 acgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 321 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 15285182 - 15284673
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||   ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  15285182 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 15285083  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  15285082 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 15284983  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| || |||    
T  15284982 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatg 15284883  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | |||||||| |||||| |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||    
T  15284882 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgacc 15284783  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||  ||||    |||| | ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| | || |||||||| || |||| |||||||||    
T  15284782 atgatcatgccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaattatttgactgt 15284683  T
Q  821 tagtgatgtc 830  Q
     || ||||||    
T  15284682 cagcgatgtc 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 830
Target Start/End: Original strand, 15227644 - 15228396
Alignment:
Q  69 aagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatact 168  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  ||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  | |||     
T  15227644 aagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacc 15227743  T
Q  169 cctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgca 268  Q
    | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| | || ||    
T  15227744 cgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgtcgttca 15227843  T
Q  269 gcagaagccacagcaaccaccagttcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 368  Q
    ||| | || ||| || ||||||| |||                    | || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||| |||||     
T  15227844 gcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagc---------agcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagtta 15227934  T
Q  369 cttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatt 468  Q
    || |||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  15227935 ctcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 15228034  T
Q  469 tccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 568  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  15228035 tccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataa 15228134  T
Q  569 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 668  Q
     ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |  | || ||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  15228135 cgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgca 15228234  T
Q  669 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 768  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| || | || |||| | ||||||||||| ||||||     
T  15228235 actcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgcc 15228334  T
Q  769 atactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 830  Q
    |   ||||| | | |||||||| ||||||||||| || | || ||||||||| || ||||||    
T  15228335 acgttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagttatttgactgtcagcgatgtc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 24460856 - 24460411
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24460856 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 24460757  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  24460756 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 24460657  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  24460656 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 24460557  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    |||| || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  24460556 gaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 24460457  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  24460456 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 24460411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 321 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 14235779 - 14235391
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| | || | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14235779 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctc 14235680  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||| | || |||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||     
T  14235679 cacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagtt 14235580  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || || |||||| | || || |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  14235579 cattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 14235480  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 709  Q
    || ||    | ||| | |||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||    
T  14235479 attgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgactcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttc 14235391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 324 - 708
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24113066
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | || || || | ||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 24112881  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||     
T  24112882 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 24112981  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagctt 708  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  24112982 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 24113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 324 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34188827
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | || || || | ||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 34189012  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||     
T  34189011 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 34188912  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagctt 708  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  34188911 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 34188827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 339 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 15391574 - 15391144
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||| ||    
T  15391574 cctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctc 15391475  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    |||||||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||| |    
T  15391474 ccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcat 15391375  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat-gtgaggc 637  Q
    |||  | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||||| ||| |  ||| |     
T  15391374 tgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcg-agagtcatgaaga 15391276  T
Q  638 agctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgc 737  Q
    || ||| || |||||  ||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   |||| |||||||||| |||    
T  15391275 agttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgc 15391176  T
Q  738 ctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    | || |||||  | |||||||| |||||||||    
T  15391175 ccagaatgccgccataatccttggggttgcta 15391144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Original strand, 19373005 - 19373193
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| ||||||||||| || || ||| | |    
T  19373005 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatca 19373104  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  19373105 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 19373193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Original strand, 24112411 - 24112614
Alignment:
Q  44 gaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaat 143  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| || || || || | | ||  || | ||||||||| || ||||| |||    
T  24112411 gaagagatatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctgtcaat 24112510  T
Q  144 gctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctc 243  Q
    ||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||    
T  24112511 gctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctc 24112610  T
Q  244 aggt 247  Q
    ||||    
T  24112611 aggt 24112614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31127084 - 31126857
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||      
T  31127084 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcag 31126985  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   || || ||| | ||||||||||||||    
T  31126984 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttccc 31126885  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  31126884 accgttttatcatcagtaccctttgcca 31126857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34189482 - 34189279
Alignment:
Q  44 gaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaat 143  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| || || || || | | ||  || | |||||||||||| ||| | |||    
T  34189482 gaagagatatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgtcgctcctatcaat 34189383  T
Q  144 gctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctc 243  Q
    ||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||    
T  34189382 gctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctc 34189283  T
Q  244 aggt 247  Q
    ||||    
T  34189282 aggt 34189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 14664765 - 14664979
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  14664765 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 14664864  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||  ||||| | ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  14664865 ctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 14664964  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  14664965 agtacccgttaatgc 14664979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18801150 - 18800961
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtt 140  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||  || ||||  ||||  ||||||||||||| || ||| |     
T  18801150 gtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacagaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatc 18801051  T
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
    ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  18801050 aatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgcca 18800961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 54833095 - 54833356
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  54833095 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 54833194  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    |  ||||  |||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  54833195 cgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttccc 54833294  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     || ||||| ||||| || ||||| ||| | || | ||||||||| || || ||||| ||||    
T  54833295 accgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattg 54833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 39850366 - 39850542
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtt 140  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| |     
T  39850366 gtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatc 39850465  T
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatca 217  Q
    ||||| |||||  | |||||  ||||| | ||    ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  39850466 aatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 39850542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24461030 - 24460912
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  24461030 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 24460931  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  24460930 ctcaggtacccgttaatgc 24460912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24592838 - 24592621
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  24592838 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 24592739  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  24592738 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 24592639  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  24592638 tcaagtacccgttaatgc 24592621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15285374 - 15285235
Alignment:
Q  120 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaat 219  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||   ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  15285374 atggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagt 15285275  T
Q  220 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||| | ||||| || | ||||||||| ||||| |||||    
T  15285274 atcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 15285235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 30753447 - 30753526
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  30753447 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaac 30753526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 82
Target Start/End: Original strand, 5005613 - 5005654
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5005613 gtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaac 5005654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 21969406 - 21969667
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||      
T  21969406 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaaaaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 21969505  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||  | ||||| |||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  21969506 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 21969605  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     || ||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  21969606 gccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattg 21969667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 24688314 - 24687799
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688314 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24688215  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688214 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 24688115  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24688114 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 24688015  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688014 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 24687915  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24687914 tcagccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 24687815  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  24687814 gactgtcagtgatgtc 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 23718145 - 23717630
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718145 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 23718046  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718045 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23717946  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23717945 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 23717846  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717845 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 23717746  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717745 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 23717646  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  23717645 gactgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 826
Target Start/End: Original strand, 11549359 - 11549870
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549359 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 11549458  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549459 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 11549558  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11549559 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 11549658  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549659 aatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 11549758  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549759 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 11549858  T
Q  815 gactgttagtga 826  Q
    ||||| ||||||    
T  11549859 gactgctagtga 11549870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 23752607 - 23752095
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752607 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 23752508  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752507 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23752408  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  23752407 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 23752308  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752307 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 23752208  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752207 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 23752108  T
Q  815 gactgttagtgat 827  Q
    |||||||||||||    
T  23752107 gactgttagtgat 23752095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 827
Target Start/End: Original strand, 33777492 - 33778004
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777492 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 33777591  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33777592 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 33777691  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  33777692 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtg 33777791  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33777792 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctat 33777891  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777892 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 33777991  T
Q  815 gactgttagtgat 827  Q
    |||||||||||||    
T  33777992 gactgttagtgat 33778004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 30934638 - 30935153
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30934638 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 30934737  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934738 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 30934837  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30934838 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 30934937  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30934938 tatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgt 30935037  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30935038 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 30935137  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  30935138 gactgttagtgatgtc 30935153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 22999271 - 22998756
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22999271 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 22999172  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999171 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 22999072  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22999071 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgta 22998972  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998971 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 22998872  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998871 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 22998772  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  22998771 gactgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Original strand, 24970024 - 24970538
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970024 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 24970123  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970124 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 24970223  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24970224 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaa 24970323  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24970324 atatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgtt 24970423  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970424 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 24970523  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    |||||||||||||||    
T  24970524 actgttagtgatgtc 24970538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 15658917 - 15658402
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15658917 aatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 15658818  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15658817 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 15658718  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15658717 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 15658618  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15658617 aatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctgt 15658518  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658517 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 15658418  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  15658417 gactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500373
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18500578  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500577 aagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 18500478  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18500477 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 18500378  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  18500377 gatgt 18500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649754
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 28649549  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649550 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 28649649  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28649650 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctataccgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagt 28649749  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  28649750 gatgt 28649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 2511056 - 2511570
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2511056 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 2511155  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2511156 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 2511255  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  2511256 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 2511355  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511356 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 2511455  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  2511456 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 2511555  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  2511556 gactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 6874310 - 6874824
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6874310 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 6874409  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6874410 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 6874509  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  6874510 gaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 6874609  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874610 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 6874709  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6874710 tcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 6874809  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  6874810 gactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 8665632 - 8665118
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8665632 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 8665533  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8665532 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 8665433  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  8665432 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtg 8665333  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8665332 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgt 8665233  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  8665232 tcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttct 8665133  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    ||| || ||||||||    
T  8665132 gaccgtcagtgatgt 8665118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 12132160 - 12132674
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12132160 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 12132259  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12132260 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 12132359  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  12132360 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 12132459  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132460 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 12132559  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12132560 tcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 12132659  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  12132660 gactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 15759014 - 15758500
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15759014 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 15758915  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15758914 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 15758815  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  15758814 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 15758715  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15758714 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgt 15758615  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  15758614 tcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 15758515  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  15758514 gactgtcagtgatgt 15758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 9317456 - 9317970
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9317456 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 9317555  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9317556 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 9317655  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9317656 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 9317755  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317756 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 9317855  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9317856 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 9317955  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  9317956 gactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 30152023 - 30152537
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30152023 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 30152122  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30152123 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30152222  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  30152223 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 30152322  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30152323 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgt 30152422  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  30152423 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 30152522  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  30152523 gactgtcagtgatgt 30152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 18375569 - 18375054
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18375569 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 18375470  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18375469 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 18375370  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18375369 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 18375270  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375269 aatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 18375170  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18375169 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttct 18375070  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  18375069 gactgtcagtgatgtc 18375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 5637915 - 5638429
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5637915 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 5638014  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5638015 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 5638114  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  5638115 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtg 5638214  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5638215 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 5638314  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  5638315 tcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttct 5638414  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  5638415 gactgtcagtgatgt 5638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 43078281 - 43078771
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43078281 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 43078380  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43078381 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgt 43078480  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  43078481 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 43078580  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43078581 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 43078680  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  43078681 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34617037
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34616731  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34616732 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 34616831  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616832 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 34616931  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  34616932 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcag 34617031  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  34617032 tgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 26480397 - 26480910
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26480397 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 26480496  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26480497 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 26480596  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26480597 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26480696  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480697 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaact-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 26480795  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26480796 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatatctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 26480895  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  26480896 gactgtcagtgatgt 26480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 30168474 - 30168988
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30168474 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggca 30168573  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30168574 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30168673  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  30168674 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 30168773  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168774 aatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 30168873  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  30168874 tcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatgctgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttct 30168973  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  30168974 gactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755499
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37755294  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37755295 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37755394  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  37755395 tcatgccaagtgtctagggtgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagt 37755494  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  37755495 gatgt 37755499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 31826540 - 31826050
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31826540 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 31826441  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  31826440 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcat 31826341  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  31826340 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaa 31826241  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31826240 actcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 31826141  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31826140 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 31826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 31431469 - 31431959
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31431469 cctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 31431568  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  31431569 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 31431668  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  31431669 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 31431768  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31431769 gctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 31431868  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  31431869 taggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3790060
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 3789855  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789856 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 3789955  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  3789956 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 3790055  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  3790056 gatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 41674714 - 41675228
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41674714 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 41674813  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |    
T  41674814 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctct 41674913  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
     ||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||     
T  41674914 aaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtg 41675013  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||| ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41675014 aatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgt 41675113  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41675114 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 41675213  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||| ||||    
T  41675214 gactgtcagtaatgt 41675228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770630
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
     |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37770835  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37770834 aagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatga 37770735  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  37770734 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagt 37770635  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  37770634 gatgt 37770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671126
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37671331  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671330 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37671231  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  37671230 tcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 37671131  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  37671130 gatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 33516361 - 33516875
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33516361 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 33516460  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33516461 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 33516560  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  33516561 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 33516660  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516661 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 33516760  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33516761 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 33516860  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  33516861 gactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 24681469 - 24681959
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  24681469 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 24681568  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24681569 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 24681668  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  24681669 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaa 24681768  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24681769 gctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtc 24681868  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24681869 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 24723996 - 24724486
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  24723996 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 24724095  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  24724096 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 24724195  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  24724196 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaa 24724295  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24724296 gctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtc 24724395  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24724396 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 37358790 - 37358286
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358790 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 37358691  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  37358690 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 37358591  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37358590 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37358491  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358490 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 37358391  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  37358390 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagattgatgaatgataatcttctgactgtcagt 37358291  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  37358290 gatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959429
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28959735  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28959734 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 28959635  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  |||||||   ||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28959634 gaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatg 28959535  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  28959534 atcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcag 28959435  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  28959434 tgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 315 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 9548700 - 9548246
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9548700 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 9548601  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548600 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 9548501  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9548500 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 9548401  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||| |||||||    
T  9548400 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctctctgt 9548301  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |   ||||||| ||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  9548300 ttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 9548246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 30029420 - 30029934
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  30029420 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 30029519  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30029520 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 30029619  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  30029620 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 30029719  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029720 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 30029819  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  30029820 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttct 30029919  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  30029920 gactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599115
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32599421  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  32599420 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatc 32599321  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32599320 gaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatg 32599221  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  32599220 atcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcag 32599121  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  32599120 tgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 316 - 829
Target Start/End: Original strand, 23892212 - 23892725
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  23892212 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 23892311  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||| ||    
T  23892312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctg 23892411  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  23892412 aagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtga 23892511  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    |  |||| || | || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23892512 acgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtt 23892611  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
     | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  23892612 taaccatgatcatgccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctacttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaattattta 23892711  T
Q  816 actgttagtgatgt 829  Q
    ||||||||||||||    
T  23892712 actgttagtgatgt 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324472
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
     || || || | ||| |||||| | || || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 13324677  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13324676 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 13324577  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  13324576 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagt 13324477  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  13324476 gatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 40473682 - 40473192
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  40473682 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 40473583  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  40473582 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 40473483  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  40473482 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 40473383  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40473382 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgtc 40473283  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  40473282 taggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgacgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 321 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 29889233 - 29888734
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||| |  |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  29889233 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctc 29889134  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29889133 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagta 29889034  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  29889033 catcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 29888934  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  29888933 attgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaacc 29888834  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
     |||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  29888833 gtgatcatgccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctatgctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 29888734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 315 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 29967223 - 29966793
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  29967223 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 29967124  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29967123 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 29967024  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  29967023 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 29966924  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29966923 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 29966824  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatg 745  Q
    |||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  29966823 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatg 29966793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Original strand, 22888476 - 22888990
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22888476 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 22888575  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  22888576 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 22888675  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22888676 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 22888775  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||| ||||    
T  22888776 acatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtt 22888875  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
       |||||||||||| |  |||| || |||| | ||||||||||||||||| ||   ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  22888876 tgaccatgatcatgctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 22888975  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    ||||| || ||||||    
T  22888976 actgtcagcgatgtc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Original strand, 25199035 - 25199549
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  25199035 atcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 25199134  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||     
T  25199135 gcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcttta 25199234  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  25199235 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 25199334  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    | ||||| || | || ||||  ||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | | ||||    
T  25199335 acatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtt 25199434  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
       ||||||||||||||  |||| || |||| |  ||||||||| ||| |||||    |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  25199435 tgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctacgtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 25199534  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    ||||| || ||||||    
T  25199535 actgtcagcgatgtc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 324 - 802
Target Start/End: Original strand, 33877261 - 33877739
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33877261 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33877360  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  33877361 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 33877460  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  33877461 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33877560  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  33877561 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 33877660  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    | |||||||| |||| || |||  |  |||||||||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  33877661 accatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 33877739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11326253
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 11326007  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| |||||     
T  11326008 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgatt 11326107  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  11326108 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 11326207  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  11326208 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 11326253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 324 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 13184796 - 13184352
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13184796 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13184697  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  13184696 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13184597  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  13184596 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13184497  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  13184496 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 13184397  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 768  Q
    |||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    
T  13184396 atcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 13184352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 13440642 - 13440197
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||| | || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13440642 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13440543  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  13440542 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13440443  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||     
T  13440442 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13440343  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||| | ||||||   |||||    
T  13440342 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctgtttgaccatg 13440243  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  13440242 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 13440197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 324 - 708
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292923
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | || || || | ||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 33292738  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||  || || ||||||||     
T  33292739 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgatt 33292838  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagctt 708  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||    
T  33292839 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 33292923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15759317 - 15759094
Alignment:
Q  6 attgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctcta 105  Q
    ||||| ||||| || | ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  ||     
T  15759317 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctg 15759218  T
Q  106 gagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctcc 205  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| ||    
T  15759217 gagcaggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 15759118  T
Q  206 attttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     ||||| ||||| || ||||||||    
T  15759117 gttttatcatcagtaccctttgcc 15759094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 259
Target Start/End: Original strand, 22888289 - 22888428
Alignment:
Q  120 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaat 219  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  | ||| | ||||| || |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  22888289 atggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagt 22888388  T
Q  220 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||    
T  22888389 atcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgc 22888428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37359118 - 37358891
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||||||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  37359118 atcattgtatttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 37359019  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37359018 ctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 37358919  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  37358918 accgttttatcatcagtaccctttgcca 37358891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 249
Target Start/End: Original strand, 25198797 - 25198977
Alignment:
Q  69 aagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatact 168  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||| |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| |||||||| | ||  | |||||  | |||     
T  25198797 aagaagaaggaaacagaagtagggatggtatccgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgcttcccaattgcctccgtcgtacc 25198896  T
Q  169 cctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtac 249  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  25198897 catatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtac 25198977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 24681136 - 24681363
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  24681136 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 24681235  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  24681236 ctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 24681335  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||    
T  24681336 gccattttatcatcagtaccctttgcca 24681363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 24723663 - 24723890
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  24723663 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 24723762  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  24723763 ctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 24723862  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||    
T  24723863 gccattttatcatcagtaccctttgcca 24723890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 11325634 - 11325752
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||  |||| ||    
T  11325634 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaac 11325733  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  11325734 ctcaggtacccgttaatgc 11325752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13184970 - 13184852
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  13184970 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13184871  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13184870 ctcaggtacccgttaatgc 13184852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13440816 - 13440698
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  13440816 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13440717  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13440716 ctcaggtacccgttaatgc 13440698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 23891947 - 23892161
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  ||||   ||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  23891947 aagaggtatggtaacggacatcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccgatcaatccatggctactgttgctcctattaatg 23892046  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||  | ||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||    
T  23892047 ctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctca 23892146  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||| |||||    
T  23892147 ggtacccgtcaatgc 23892161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 31431166 - 31431388
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || ||||  |||| ||| |||||||||| || ||| | |    
T  31431166 tcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatca 31431265  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  31431266 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 31431365  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  31431366 tcaagtacccgtcaatgcaattg 31431388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31826882 - 31826656
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  31826882 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 31826783  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  31826782 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 31826683  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31826682 accgttttatcatcagtaccctttgcc 31826656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 33877087 - 33877205
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  33877087 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 33877186  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  33877187 ctcaggtacccgttaatgc 33877205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Original strand, 33777225 - 33777442
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  33777225 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatca 33777324  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  33777325 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 33777424  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  33777425 tcaagtacccgttaatgc 33777442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32599932 - 32599688
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||      
T  32599932 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcag 32599833  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||| ||||||| || ||| | ||||| || ||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  32599832 ctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 32599733  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 247  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  32599732 accgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggt 32599688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37771462 - 37771314
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||      
T  37771462 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcag 37771363  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctca 151  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||    
T  37771362 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctca 37771314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8665899 - 8665724
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  8665899 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 8665800  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatca 217  Q
    |||| |||||  | ||||| |||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  8665799 atgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatca 8665724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Original strand, 33292268 - 33292471
Alignment:
Q  44 gaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaat 143  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| || || || || | | ||  || | ||||||||| || ||| | |||    
T  33292268 gaagagatatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctatcaat 33292367  T
Q  144 gctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctc 243  Q
    ||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||    
T  33292368 gctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctc 33292467  T
Q  244 aggt 247  Q
    ||||    
T  33292468 aggt 33292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37671955 - 37671728
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  37671955 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 37671856  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    |  ||||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37671855 ccggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 37671756  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  37671755 accgttttatcatcagtaccctttgcca 37671728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 41674446 - 41674669
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| |     
T  41674446 gtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatc 41674545  T
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||| | || ||  | |||||  ||||| | ||||  |||||  || | ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| | || ||||    
T  41674546 aatacagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtatgctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccac 41674645  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||    
T  41674646 ctcaagtacccgtcaatgcaattg 41674669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 12131854 - 12132080
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  12131854 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 12131953  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  12131954 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 12132053  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12132054 accgttttatcatcagtaccctttgcc 12132080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 37754667 - 37754893
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  37754667 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 37754766  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||  | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  37754767 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 37754866  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  37754867 accgttttatcatcagtaccctttgcc 37754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23718412 - 23718195
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  23718412 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 23718313  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| || ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  23718312 atgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 23718213  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  23718212 tcaagtacccgttaatgc 23718195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23752874 - 23752657
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  23752874 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 23752775  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| || ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  23752774 atgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 23752675  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  23752674 tcaagtacccgttaatgc 23752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 2510792 - 2510976
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  || ||||  |||| || |||||||| || || ||| | ||||    
T  2510792 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatg 2510891  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  2510892 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 2510976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 9317192 - 9317376
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  9317192 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatg 9317291  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
    | |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  9317292 cagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 9317376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 5637648 - 5637835
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  5637648 tcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 5637747  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5637748 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 5637835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 26480130 - 26480317
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  26480130 tcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 26480229  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26480230 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 26480317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28960261 - 28960182
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  28960261 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaac 28960182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 33516055 - 33516134
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  33516055 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaac 33516134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 4796954 - 4796439
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796954 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 4796855  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796854 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 4796755  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4796754 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 4796655  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796654 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 4796555  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796554 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 4796455  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  4796454 gactgttagtgatgtc 4796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 15893006 - 15892492
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893006 atcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 15892907  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892906 gcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 15892807  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15892806 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaa 15892707  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892706 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 15892607  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892606 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 15892507  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    |||||||||||||||    
T  15892506 actgttagtgatgtc 15892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 8295929 - 8296444
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295929 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggca 8296028  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296029 agcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 8296128  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8296129 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 8296228  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296229 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 8296328  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8296329 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgatgatttttt 8296428  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  8296429 gactgtcagtgatgtc 8296444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 8301568 - 8301053
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301568 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 8301469  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8301468 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgcttt 8301369  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8301368 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 8301269  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301268 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 8301169  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301168 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 8301069  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    || |||  ||||||||    
T  8301068 gattgtcggtgatgtc 8301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 6192273 - 6192788
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192273 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 6192372  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192373 agcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 6192472  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6192473 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 6192572  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192573 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 6192672  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192673 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 6192772  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  6192773 gactgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 15741395 - 15740883
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741395 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 15741296  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15741295 agcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgcttt 15741196  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15741195 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 15741096  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741095 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 15740996  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15740995 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatggatgataatttttt 15740896  T
Q  815 gactgttagtgat 827  Q
    |||||||||||||    
T  15740895 gactgttagtgat 15740883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 826
Target Start/End: Original strand, 18330626 - 18331137
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330626 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 18330725  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18330726 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 18330825  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  18330826 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 18330925  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18330926 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgt 18331025  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18331026 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgaaaatttttt 18331125  T
Q  815 gactgttagtga 826  Q
    ||||||||||||    
T  18331126 gactgttagtga 18331137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 826
Target Start/End: Original strand, 35880723 - 35881234
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35880723 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggca 35880822  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880823 agcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 35880922  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  35880923 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 35881022  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35881023 aatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 35881122  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35881123 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgaaattttttt 35881222  T
Q  815 gactgttagtga 826  Q
    ||||||||||||    
T  35881223 gactgttagtga 35881234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 4721588 - 4722103
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721588 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 4721687  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4721688 agcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacacttt 4721787  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  4721788 gaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtg 4721887  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721888 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 4721987  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721988 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 4722087  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  4722088 gactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 29149056 - 29148541
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29149056 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 29148957  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148956 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 29148857  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29148856 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 29148757  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148756 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 29148657  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29148656 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgacaattcttt 29148557  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  29148556 gactgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 18051219 - 18051734
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18051219 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 18051318  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051319 agcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 18051418  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  18051419 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 18051518  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    || ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18051519 aacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgt 18051618  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051619 ttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 18051718  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||||||||||||    
T  18051719 gactgttagtgatgtc 18051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 324 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387368
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22387671  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22387670 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22387571  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387570 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 22387471  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387470 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 22387371  T
Q  824 tga 826  Q
    |||    
T  22387370 tga 22387368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 18277353 - 18276839
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18277353 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 18277254  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18277253 agcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 18277154  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18277153 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 18277054  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277053 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 18276954  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18276953 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 18276854  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  18276853 gactgtcagtgatgt 18276839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 18307955 - 18307441
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18307955 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 18307856  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18307855 agcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 18307756  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18307755 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 18307656  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307655 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 18307556  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18307555 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 18307456  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  18307455 gactgtcagtgatgt 18307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 7073169 - 7073683
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |    
T  7073169 aatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggta 7073268  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7073269 agcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 7073368  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  7073369 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 7073468  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073469 aacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 7073568  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7073569 tcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 7073668  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  7073669 gactgtcagtgatgt 7073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 18292654 - 18292140
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18292654 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 18292555  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18292554 agcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 18292455  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18292454 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 18292355  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18292354 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgt 18292255  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18292254 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 18292155  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  18292154 gactgtcagtgatgt 18292140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 28116255 - 28115741
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28116255 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 28116156  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28116155 agcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 28116056  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  28116055 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 28115956  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28115955 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 28115856  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28115855 tcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 28115756  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  28115755 gactgtcagtgatgt 28115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 4416876 - 4417390
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4416876 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 4416975  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4416976 aacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 4417075  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4417076 gaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 4417175  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4417176 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgt 4417275  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  4417276 tcagccatgatcatgccaagtgtctcggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaaacttgatgaatgataatcttct 4417375  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  4417376 gactgtcagtgatgt 4417390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 5609623 - 5609109
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5609623 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 5609524  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5609523 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgcttt 5609424  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  5609423 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 5609324  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609323 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 5609224  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  5609223 tcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 5609124  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  5609123 gactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 31964774 - 31964260
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31964774 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 31964675  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31964674 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 31964575  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  31964574 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 31964475  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31964474 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgt 31964375  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  31964374 tcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 31964275  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| || |||||    
T  31964274 gactgtcagagatgt 31964260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 10396090 - 10396604
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  10396090 aatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggta 10396189  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10396190 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 10396289  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  10396290 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 10396389  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10396390 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgt 10396489  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10396490 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttct 10396589  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  10396590 gactgtcagtgatgt 10396604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 28339259 - 28339773
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28339259 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 28339358  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28339359 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 28339458  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  28339459 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 28339558  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339559 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 28339658  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  28339659 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 28339758  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  28339759 gactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021746
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28021440  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28021441 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28021540  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021541 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 28021640  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  28021641 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcag 28021740  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  28021741 tgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 21674650 - 21675164
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21674650 aatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacagggca 21674749  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21674750 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 21674849  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  21674850 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 21674949  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674950 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 21675049  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21675050 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 21675149  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  21675150 gactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 7996519 - 7997033
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7996519 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 7996618  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7996619 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 7996718  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    ||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  7996719 gaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 7996818  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996819 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 7996918  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  7996919 tcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttct 7997018  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  7997019 gactgtcagtgatgt 7997033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 10643027 - 10643541
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10643027 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 10643126  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10643127 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 10643226  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    ||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  10643227 gaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 10643326  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643327 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 10643426  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  10643427 tcagtcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttct 10643526  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  10643527 gactgtcagtgatgt 10643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 36997354 - 36996864
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  36997354 cctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctc 36997255  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  36997254 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcat 36997155  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  36997154 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaa 36997055  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36997054 actcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 36996955  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  36996954 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 48465908 - 48466398
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  48465908 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 48466007  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  48466008 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 48466107  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  48466108 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 48466207  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48466208 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 48466307  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  48466308 taggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346474
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4346780  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4346779 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4346680  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346679 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 4346580  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||    
T  4346579 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcag 4346480  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  4346479 tgatgt 4346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 8211719 - 8212209
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8211719 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 8211818  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  8211819 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 8211918  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  8211919 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 8212018  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8212019 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 8212118  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8212119 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 8212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 47023410 - 47023924
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47023410 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 47023509  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47023510 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 47023609  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  47023610 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtg 47023709  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47023710 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctgt 47023809  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  47023810 ttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 47023909  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  47023910 gactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Original strand, 18242706 - 18243210
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242706 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 18242805  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18242806 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18242905  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18242906 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18243005  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18243006 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 18243105  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |||    
T  18243106 tcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagt 18243205  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  18243206 gatgt 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 11110626 - 11110136
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  11110626 cctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgttgcctc 11110527  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  11110526 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 11110427  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |    
T  11110426 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaa 11110327  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11110326 gctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 11110227  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11110226 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 11110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 379 - 829
Target Start/End: Original strand, 51782044 - 51782494
Alignment:
Q  379 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaagg 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  51782044 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaagg 51782143  T
Q  479 cgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcat 578  Q
     ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51782144 tgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacat 51782243  T
Q  579 gtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctgg 678  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51782244 gtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctgg 51782343  T
Q  679 tgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttca 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  51782344 tgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttca 51782443  T
Q  779 agacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  51782444 agacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 345 - 829
Target Start/End: Original strand, 5466972 - 5467456
Alignment:
Q  345 ataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggt 444  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5466972 atacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggt 5467071  T
Q  445 tcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatca 544  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5467072 tcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatca 5467171  T
Q  545 aggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcct 644  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  5467172 agggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcct 5467271  T
Q  645 agacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggat 744  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5467272 agacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggat 5467371  T
Q  745 gccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  5467372 gcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 5467456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870643
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22870849  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22870848 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 22870749  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||    
T  22870748 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcag 22870649  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  22870648 tgatgt 22870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885702
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22885908  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22885907 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 22885808  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||    
T  22885807 atcatgccaagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcag 22885708  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  22885707 tgatgt 22885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 337 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 5596636 - 5596144
Alignment:
Q  337 tccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgct 436  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5596636 tccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcc 5596537  T
Q  437 tcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctc 536  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||    
T  5596536 tccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactc 5596437  T
Q  537 gttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgagg 636  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  5596436 attgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgagg 5596337  T
Q  637 cagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtg 736  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596336 aagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtg 5596237  T
Q  737 cctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  5596236 tctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 325 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542249
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 624  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 6542454  T
Q  625 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 724  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542453 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatga 6542354  T
Q  725 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagt 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||    
T  6542353 tcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatttcctgaccgtcagt 6542254  T
Q  825 gatgt 829  Q
    |||||    
T  6542253 gatgt 6542249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 17985257 - 17984743
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17985257 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggca 17985158  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  17985157 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgcttt 17985058  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  17985057 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 17984958  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17984957 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttctctgt 17984858  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  17984857 tcagtcatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccatattgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgatgatcttct 17984758  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    ||| || ||||||||    
T  17984757 gaccgtcagtgatgt 17984743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 18225148 - 18225662
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  18225148 aatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 18225247  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18225248 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 18225347  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  18225348 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtg 18225447  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225448 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 18225547  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  18225548 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttataccgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttct 18225647  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  18225648 gactgtcagtgatgt 18225662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 20577124 - 20576634
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  20577124 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 20577025  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  20577024 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 20576925  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  20576924 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 20576825  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20576824 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 20576725  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  20576724 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 29665247 - 29664757
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || || || | ||    
T  29665247 cctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctc 29665148  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  29665147 caaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 29665048  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  29665047 tgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 29664948  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29664947 gctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtc 29664848  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29664847 taggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 5013669 - 5014183
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5013669 aatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 5013768  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5013769 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5013868  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  5013869 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 5013968  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013969 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 5014068  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  5014069 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttct 5014168  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  5014169 gactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 24328116 - 24328630
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| || || ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  24328116 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 24328215  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24328216 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 24328315  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    ||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  24328316 gaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 24328415  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328416 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 24328515  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  24328516 ttaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 24328615  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  24328616 gactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 315 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 50134372 - 50133990
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50134372 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 50134273  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50134272 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 50134173  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  50134172 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 50134073  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagct 697  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134072 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 379 - 707
Target Start/End: Original strand, 51797133 - 51797462
Alignment:
Q  379 tactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttccca-ggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaag 477  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  51797133 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaag 51797232  T
Q  478 gcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgca 577  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  51797233 gtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccaca 51797332  T
Q  578 tgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctg 677  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51797333 tgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctg 51797432  T
Q  678 gtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagct 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51797433 gtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagct 51797462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 769
Target Start/End: Original strand, 5713184 - 5713638
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5713184 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5713283  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5713284 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5713383  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5713384 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5713483  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    || ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| |||||||    
T  5713484 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgt 5713583  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5713584 ttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 769
Target Start/End: Original strand, 5724094 - 5724548
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5724094 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5724193  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5724194 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5724293  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5724294 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5724393  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    || ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| |||||||    
T  5724394 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgt 5724493  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5724494 ttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5724548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 5768274 - 5767820
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5768274 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5768175  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5768174 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5768075  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5768074 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5767975  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    || ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| |||||||    
T  5767974 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgt 5767875  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |   ||||||||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  5767874 ttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 5767820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 315 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5757383 - 5756967
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5757383 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5757284  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5757283 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5757184  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5757183 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5757084  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    || ||||| || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | ||| |||| |||||||    
T  5757083 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgt 5756984  T
Q  715 tcagccatgatcatgcca 732  Q
    |  | |||||||||||||    
T  5756983 t-tgacatgatcatgcca 5756967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 321 - 830
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530860
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 18530550  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  18530551 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 18530650  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | | ||||   ||    
T  18530651 attgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgacc 18530750  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||| || | || |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||    
T  18530751 atgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctatgttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaattatttgactgt 18530850  T
Q  821 tagtgatgtc 830  Q
     || ||||||    
T  18530851 cagcgatgtc 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993631
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 17993877  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  17993876 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 17993777  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| |||||| |||   || ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993776 gaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 17993677  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17993676 atcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgcta 17993631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 321 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 16626801 - 16626292
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||  ||||| || || ||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16626801 caagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16626702  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16626701 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 16626602  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||| || |||    
T  16626601 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatg 16626502  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||    
T  16626501 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgacc 16626402  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||  ||||  | |||| | | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||    
T  16626401 atgatcatgccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgt 16626302  T
Q  821 tagtgatgtc 830  Q
     || ||||||    
T  16626301 cagcgatgtc 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 321 - 802
Target Start/End: Original strand, 32292715 - 32293196
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||| | |    
T  32292715 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctc 32292814  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  32292815 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 32292914  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  32292915 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 32293014  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  32293015 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 32293114  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  32293115 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 32293196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 324 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31033931
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 31034210  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  31034209 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 31034110  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  31034109 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 31034010  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    |||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  31034009 atcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 31033931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 324 - 820
Target Start/End: Original strand, 5652353 - 5652849
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||  |||    
T  5652353 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcac 5652452  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||| |||| || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  5652453 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 5652552  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  5652553 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgatt 5652652  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | |||||||| |||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||    
T  5652653 gaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatg 5652752  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||    
T  5652753 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgt 5652849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 324 - 769
Target Start/End: Original strand, 4625910 - 4626355
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4625910 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 4626009  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    ||||||| | || ||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  4626010 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 4626109  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     || ||||| ||| | || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  4626110 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 4626209  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    || | || ||||  |||||| |||   || ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | |||  ||| ||||||||   |||||    
T  4626210 gaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctgtttgaccatg 4626309  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgcta 769  Q
    |||||||||  |||| || |||| | | |||||||| |||||||||    
T  4626310 atcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgcta 4626355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 324 - 701
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439497
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | || || || | ||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 32439319  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
    ||| || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||     
T  32439320 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 32439419  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgc 701  Q
    ||   |||||| |  | ||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  32439420 gagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgc 32439497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 325 - 622
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066307
Alignment:
Q  325 ctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 424  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  425 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 524  Q
     |  || || | ||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatc 20066209  T
Q  525 gtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 622  Q
    || || |||||  | |||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  20066210 gtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 20066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 247
Target Start/End: Original strand, 8211431 - 8211636
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  8211431 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 8211530  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||    
T  8211531 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacc 8211630  T
Q  242 tcaggt 247  Q
    ||||||    
T  8211631 tcaggt 8211636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 535
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893387
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | || || || | ||| ||||||   || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T
Q  524 cgtgaaaaagct 535  Q
    ||| || |||||    
T  4893376 cgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22871442 - 22871220
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| |||||||||||||| || ||| | |    
T  22871442 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatca 22871343  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||| | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||| |  ||    
T  22871342 atgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcc 22871243  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||    
T  22871242 tcaagtgcccgtcaatgcaattg 22871220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22886501 - 22886279
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| |||||||||||||| || ||| | |    
T  22886501 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatca 22886402  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||| | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||| |  ||    
T  22886401 atgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcc 22886302  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||    
T  22886301 tcaagtgcccgtcaatgcaattg 22886279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6543081 - 6542854
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  6543081 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 6542982  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  6542981 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 6542882  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  6542881 accgttttatcatcagtaccctttgcca 6542854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 264
Target Start/End: Original strand, 7072901 - 7073124
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |     
T  7072901 gtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccagtcaatccatggctactgttgctcctatc 7073000  T
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| | || | ||    
T  7073001 aatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaac 7073100  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||    
T  7073101 ctcaagtgcccgtcaatgcaattg 7073124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 247
Target Start/End: Original strand, 5466678 - 5466880
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| |||||||||||||| || ||| | ||||    
T  5466678 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatg 5466777  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||    
T  5466778 cagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctca 5466877  T
Q  245 ggt 247  Q
    |||    
T  5466878 ggt 5466880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17994250 - 17994132
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  17994250 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 17994151  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  17994150 ctcaggtacccgttaatgc 17994132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 258
Target Start/End: Original strand, 4625736 - 4625853
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  4625736 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 4625835  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatg 258  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4625836 ctcaggtacccgttaatg 4625853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 247
Target Start/End: Original strand, 32438927 - 32439052
Alignment:
Q  122 ggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatat 221  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  32438927 ggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtac 32439026  T
Q  222 cctttgccatcaggaccacctcaggt 247  Q
    ||||||||| | || | |||||||||    
T  32439027 cctttgccaccgggccaacctcaggt 32439052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Original strand, 35880456 - 35880673
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  35880456 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 35880555  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  35880556 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 35880655  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  35880656 tcaagtacccgttaatgc 35880673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 4721321 - 4721543
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  4721321 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 4721420  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||  ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  4721421 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 4721520  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  4721521 tcaagtacccgtcaatgcaattg 4721543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 7996252 - 7996474
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||  | |    
T  7996252 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatca 7996351  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | ||||| |||||| | |||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  7996352 atgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 7996451  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||    
T  7996452 tcaagtgcccgtcaatgcaattg 7996474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Original strand, 10642760 - 10642982
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||  | |    
T  10642760 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatca 10642859  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | ||||| |||||| | |||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  10642860 atgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 10642959  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||    
T  10642960 tcaagtgcccgtcaatgcaattg 10642982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15741647 - 15741433
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  15741647 aagaggtatggcaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 15741548  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  15741547 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 15741448  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  15741447 agtacccgttaatgc 15741433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 18050955 - 18051169
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  18050955 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 18051054  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  18051055 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 18051154  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  18051155 agtacccgttaatgc 18051169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 247
Target Start/End: Original strand, 4892983 - 4893108
Alignment:
Q  122 ggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatat 221  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  4892983 ggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtac 4893082  T
Q  222 cctttgccatcaggaccacctcaggt 247  Q
    ||||||||| | || | |||||||||    
T  4893083 cctttgccaccgggccaacctcaggt 4893108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4347291 - 4347164
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  4347291 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 4347192  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgt 130  Q
    || ||||  |||| || |||||||||||    
T  4347191 ctggagccggtcaatccatggctactgt 4347164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4797218 - 4796999
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  4797218 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 4797119  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  4797118 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 4797019  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  4797018 agtacccgttaatgcaattg 4796999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16626993 - 16626818
Alignment:
Q  120 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaat 219  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  | ||| | |||||||  |||||| | ||||| ||||| || || || || ||||| |    
T  16626993 atggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagt 16626894  T
Q  220 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttca 295  Q
    ||||| | ||||| || | ||||| ||||||||| ||||| || || ||||| | || ||| || ||||||| |||    
T  16626893 atcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctca 16626818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 5652179 - 5652297
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||||| ||| || | ||    
T  5652179 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaac 5652278  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  5652279 ctcaggtacccgttaatgc 5652297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 216
Target Start/End: Original strand, 18330364 - 18330538
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  18330364 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 18330463  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatc 216  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  18330464 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccaccattttatcatc 18330538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 18530114 - 18530304
Alignment:
Q  69 aagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatact 168  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  || | ||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||     
T  18530114 aagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggaactagtcaatccatggctactgttacccctattaatgctgcccagttacctccatcgtacc 18530213  T
Q  169 cctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||| || | |||||| || ||||| |||||    
T  18530214 cgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgc 18530304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11110930 - 11110889
Alignment:
Q  41 gtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaac 82  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11110930 gtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaggaaac 11110889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 40329 - 39814
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40329 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 40230  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40229 agcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 40130  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129 gaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 40030  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40029 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 39930  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39929 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgacgaatgataatttttt 39830  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| | |||||||    
T  39829 gactgtcaatgatgtc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 47245 - 46730
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47245 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 47146  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47145 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 47046  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  47045 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 46946  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46945 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 46846  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46845 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggcttgatgaatgataatttttt 46746  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  46745 gactgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Original strand, 29760 - 30274
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 29859  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29860 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttg 29959  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29960 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaa 30059  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30060 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 30159  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30160 cagccatgatcacgccaagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 30259  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    |||||||||||||||    
T  30260 actgttagtgatgtc 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 29495 - 29709
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  ||||  |||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  29495 aagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatg 29594  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    |||| ||  | |||||| | ||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || | ||||||    
T  29595 ctgcccaaatgcctccatcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctca 29694  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  29695 agtacccgttaatgc 29709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 27288 - 27804
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27288 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27387  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27388 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27487  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27488 gaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 27587  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27588 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctat 27687  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatga-taattttt 813  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27688 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgattaattttt 27787  T
Q  814 tgactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||||||||||||||    
T  27788 tgactgttagtgatgtc 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 27024 - 27238
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||    
T  27024 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatg 27123  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| | ||| | || | ||||||    
T  27124 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctca 27223  T
Q  245 ggtacccgtgaatgc 259  Q
     |||||||| |||||    
T  27224 agtacccgttaatgc 27238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 41793568 - 41793054
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41793568 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 41793469  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41793468 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 41793369  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  41793368 gaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 41793269  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793268 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 41793169  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  41793168 tcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 41793069  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||| ||||    
T  41793068 gactgtcagtaatgt 41793054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 10962665 - 10963179
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10962665 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacagggta 10962764  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10962765 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 10962864  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  10962865 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 10962964  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962965 aatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 10963064  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10963065 tcaatcatgatcatgccaagtgtttaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 10963164  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  10963165 gactgtcagtgatgt 10963179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 28584976 - 28585490
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28584976 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 28585075  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28585076 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 28585175  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  28585176 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 28585275  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28585276 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 28585375  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  28585376 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttct 28585475  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  28585476 gactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 51638213 - 51638728
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  51638213 aatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggta 51638312  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51638313 agcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 51638412  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  51638413 gaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 51638512  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  51638513 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgt 51638612  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51638613 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttct 51638712  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  51638713 gactgtcagtgatgtc 51638728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 16208290 - 16207776
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16208290 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaa 16208191  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16208190 acctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 16208091  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  16208090 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 16207991  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    | ||||| || | || ||||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  16207990 acatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtt 16207891  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
       ||||||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||| ||||||   |||||| | |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  16207890 tgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctatgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaattatttg 16207791  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    ||||| || ||||||    
T  16207790 actgtcagcgatgtc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 321 - 830
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461591
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20461281  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| || ||||||||| | || ||||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || |||    
T  20461282 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatg 20461381  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || || | || ||||  |||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||| ||| ||||   ||    
T  20461382 attgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgacc 20461481  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgt 820  Q
    ||||||||||||  || | || |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  20461482 atgatcatgccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgt 20461581  T
Q  821 tagtgatgtc 830  Q
     || ||||||    
T  20461582 cagcgatgtc 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 321 - 802
Target Start/End: Original strand, 28151863 - 28152344
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  28151863 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 28151962  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  28151963 cacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 28152062  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  28152063 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 28152162  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagcc 720  Q
    || ||   || ||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||    
T  28152163 attgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgacc 28152262  T
Q  721 atgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
    ||||||||||||| |||| || |||  |  ||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  28152263 atgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 28152344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 20340594 - 20340080
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  20340594 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 20340495  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20340494 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 20340395  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20340394 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 20340295  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  20340294 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtt 20340195  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
       ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  20340194 tgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 20340095  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    ||||| || ||||||    
T  20340094 actgtcagcgatgtc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 51637907 - 51638134
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  51637907 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 51638006  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  51638007 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 51638106  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  51638107 accgttttatcatcagtaccctttgcca 51638134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 259
Target Start/End: Original strand, 20460914 - 20461053
Alignment:
Q  120 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaat 219  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||| | ||||| |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  20460914 atggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaat 20461013  T
Q  220 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||| | ||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  20461014 atcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20461053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 10962398 - 10962585
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  10962398 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatca 10962497  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  10962498 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 10962585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41793832 - 41793613
Alignment:
Q  45 aagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatg 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||  || ||||  |||| || |||||||| || || ||| | ||||    
T  41793832 aagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatg 41793733  T
Q  145 ctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctca 244  Q
    | || ||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | ||||||    
T  41793732 cagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 41793633  T
Q  245 ggtacccgtgaatgctattg 264  Q
     || ||||| ||||| ||||    
T  41793632 agtgcccgtcaatgcaattg 41793613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20340760 - 20340642
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | || || |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  20340760 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 20340661  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20340660 ctcaggtacccgtcaatgc 20340642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Original strand, 30449 - 30964
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30449 aatcagcaagctagacctactttcc-tcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 30547  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30548 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30647  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30648 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 30747  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30748 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 30847  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataa-ttttt 813  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30848 ttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 30947  T
Q  814 tgactgttagtgatgtc 830  Q
    ||||||| |||||||||    
T  30948 tgactgtcagtgatgtc 30964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 321 - 662
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20730
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  20390 caagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20489  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  20490 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20589  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 620  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  20590 cattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 20688  T
Q  621 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 662  Q
    || || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20689 attgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 20730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 20168 - 20358
Alignment:
Q  69 aagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatact 168  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  ||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  | |||     
T  20168 aagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacc 20267  T
Q  169 cctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    | ||||| || |||||| | ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  20268 catatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 8812
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9326 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 9227  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9226 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 9127  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  9126 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtg 9027  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9026 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 8927  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  8926 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttct 8827  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  8826 gactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Original strand, 20011 - 20526
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20011 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 20110  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20111 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 20210  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  20211 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtg 20310  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20311 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 20410  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat-tttt 813  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  20411 tcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctttc 20510  T
Q  814 tgactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20511 tgactgtcagtgatgt 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 6985
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7499 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 7400  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7399 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 7300  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  7299 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtg 7200  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7199 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 7100  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7099 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttct 7000  T
Q  815 gactgttagtgatgt 829  Q
    |||||| ||||||||    
T  6999 gactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7805 - 7579
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  7805 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 7706  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  7705 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 7606  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcc 229  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||    
T  7605 accgttttatcatcagtaccctttgcc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 6030 - 6524
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttg-tatgctgagttgcttccgacttt-actccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgct 436  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6030 cctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcc 6129  T
Q  437 tcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttc-catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt-gaagtacatcgtgaaaaagc 534  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  6130 tccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagc 6229  T
Q  535 tcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtga 634  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  6230 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 6329  T
Q  635 ggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 734  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6330 ggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 6429  T
Q  735 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6430 tgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1831
Alignment:
Q  389 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggt 488  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  489 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 588  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  589 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaac 662  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1904 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 315 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 15190 - 14675
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15190 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 15091  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15090 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 14991  T
Q  515 gaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 614  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  14990 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 14891  T
Q  615 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 714  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890 aatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgt 14791  T
Q  715 tcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatttttt 814  Q
    |||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14790 tcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttct 14691  T
Q  815 gactgttagtgatgtc 830  Q
    |||||| |||||||||    
T  14690 gactgtcagtgatgtc 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 315 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 26462 - 25947
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 414  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26462 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26363  T
Q  415 agcccccacctgatccgttgcttccca-ggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctt 513  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26362 agcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctt 26263  T
Q  514 tgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgt 613  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26262 tgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgt 26163  T
Q  614 aaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 713  Q
     ||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  26162 gaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 26063  T
Q  714 ttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttt 813  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26062 ttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttc 25963  T
Q  814 tgactgttagtgatgt 829  Q
    ||||||| ||||||||    
T  25962 tgactgtcagtgatgt 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26768 - 26554
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| || ||| ||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||      
T  26768 atcattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 26669  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  26668 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 26569  T
Q  203 tccattttaccatca 217  Q
     || ||||| |||||    
T  26568 accgttttatcatca 26554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 315 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 1
Alignment:
Q  315 aatcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctg-agttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggc 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  390 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggc 291  T
Q  414 aagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctt 513  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  290 aagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctt 191  T
Q  514 tgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgt 613  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  190 tgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgt 91  T
Q  614 aaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 703  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  90 aaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 435
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | |    
T  657 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaactggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatca 558  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||    
T  557 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacc 458  T
Q  242 tcaggtacccgtgaatgctattg 264  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  457 tcaagtacccgttaatgcaattg 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 324 - 829
Target Start/End: Original strand, 9571 - 10076
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9770  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9771 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9870  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatg 723  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9871 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctgttcagccatg 9970  T
Q  724 atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttag 823  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9971 atcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcag 10070  T
Q  824 tgatgt 829  Q
    ||||||    
T  10071 tgatgt 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 247
Target Start/End: Original strand, 7961 - 8166
Alignment:
Q  42 tcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgtta 141  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || ||||  |||| ||| |||||||||| || ||| | |    
T  7961 tcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatca 8060  T
Q  142 atgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacc 241  Q
    |||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  8061 atgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacc 8160  T
Q  242 tcaggt 247  Q
    ||||||    
T  8161 tcaggt 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 339 - 829
Target Start/End: Original strand, 7969 - 8459
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7969 cctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctc 8068  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| |    
T  8069 caaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcat 8168  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  8169 tgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaa 8268  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8269 gctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtc 8368  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 829  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8369 taggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 7627 - 7854
Alignment:
Q  3 atcattgtatttgaaaagggtgagtcttctataagtgggtcgaagaggtatggcaatggccaccacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcct 102  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||      
T  7627 atcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcag 7726  T
Q  103 ctagagcaagtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccc 202  Q
    ||  |||  |||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | |||||  ||||| | |||   ||||| ||| | ||||||||||||||    
T  7727 ctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 7826  T
Q  203 tccattttaccatcaatatcctttgcca 230  Q
     || ||||| ||||| || |||||||||    
T  7827 accgttttatcatcagtaccctttgcca 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 321 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46545
Alignment:
Q  321 caagctagacctactat-ccctccgatacc-gatgttgtatgctgagttgcttccgac---tttactccatagaggg-cattgtacaacc-agacagggc 413  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  414 aa--gcccccacctgatccgttgcttcccaggttca-ggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtc--atg-atgtcgaggggtgc- 506  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||     
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcg 46873  T
Q  507 tatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaa-gctgactttt-gagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 604  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatca 46773  T
Q  605 tgccgctgtaaatatga-tcgaagaatgtgaggca-gctccta-gacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgc 701  Q
    ||| ||||||||||||| || ||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46772 tgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgc 46673  T
Q  702 aaagcttctctgttcagccatg-atcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc-tttgggttgctatactgttcaaga-cgacatcc-aaagcttg 797  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  46672 aaagcttctctgttcagccatgaatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatccttttgggttgctttactgttcaagattgacatccaaaagcttg 46573  T
Q  798 atgaatgataa-ttttttgactgttagt 824  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46572 atgaatgataatttttttgactgttagt 46545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 316 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 2917 - 2403
Alignment:
Q  316 atcagcaagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 415  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  2917 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 2818  T
Q  416 gcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 515  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2817 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 2718  T
Q  516 aagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 615  Q
    |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  2717 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 2618  T
Q  616 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgtt 715  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  2617 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtt 2518  T
Q  716 cagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttg 815  Q
       ||||||||||||||  || | || |||  |  ||||||||||||||| ||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  2517 tgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttg 2418  T
Q  816 actgttagtgatgtc 830  Q
    ||||| || ||||||    
T  2417 actgtcagcgatgtc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2965
Alignment:
Q  141 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactcttaacatccgttcttccctccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | || || |  |||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  3083 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 2984  T
Q  241 ctcaggtacccgtgaatgc 259  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  2983 ctcaggtacccgtcaatgc 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 321 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 5
Alignment:
Q  321 caagctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 420  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |    
T  282 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctc 183  T
Q  421 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 520  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  182 cacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 83  T
Q  521 catcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 598  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  82 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 339 - 802
Target Start/End: Original strand, 21581 - 22044
Alignment:
Q  339 cctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcttc 438  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| |||||||| || |  | ||| || || |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||| ||    
T  21581 cctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcctc 21680  T
Q  439 ccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgt 538  Q
    |||||||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |    
T  21681 ccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcat 21780  T
Q  539 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 638  Q
    ||| || |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    | |||   |    
T  21781 tgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaa 21880  T
Q  639 gctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 738  Q
    | |||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||||| ||||    
T  21881 gttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcc 21980  T
Q  739 taggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 802  Q
     || |||||  | |||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  21981 cagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 465 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 383
Alignment:
Q  465 gatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgaga 564  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  565 ataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgt 664  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    | ||| | || ||| || ||||| |||||||| ||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgt 529  T
Q  665 cgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggt 764  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||  ||  ||||   ||||||||||||||| |||| |  |||||  | |||||||| ||||    
T  528 tgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgccgccataatccttggggt 429  T
Q  765 tgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatt 810  Q
    || ||   ||||||  | |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  428 tgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaatgacaatt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 296
Target Start/End: Original strand, 1 - 63
Alignment:
Q  234 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcag 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcag 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 688
Target Start/End: Original strand, 94 - 458
Alignment:
Q  324 gctagacctactatccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 423  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  94 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 193  T
Q  424 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 523  Q
    | ||||| || |  || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  194 cagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 293  T
Q  524 cgtgaaaaagctcgttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 623  Q
     ||  | | |||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| |||||     
T  294 tgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgatt 393  T
Q  624 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgca 688  Q
    ||||  | ||| | ||| || | ||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||    
T  394 gaagcgtatgaagaagcacccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggtgcccctgca 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University