View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9411_low_20 (Length: 276)

Name: NF9411_low_20
Description: NF9411
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9411_low_20
NF9411_low_20
[»] scaffold0695 (2 HSPs)
scaffold0695 (189-263)||(6118-6192)
scaffold0695 (27-95)||(6181-6248)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (189-263)||(20918-20992)
scaffold0254 (1-95)||(20981-21082)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (189-263)||(14118-14192)
scaffold0230 (3-95)||(14181-14280)
scaffold0230 (1-95)||(23358-23459)
scaffold0230 (189-225)||(23448-23484)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (189-263)||(37992-38066)
scaffold0134 (3-95)||(38055-38154)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (189-263)||(27960-28034)
scaffold0114 (27-96)||(28074-28143)
scaffold0114 (44-95)||(28023-28073)
[»] scaffold0028 (10 HSPs)
scaffold0028 (189-263)||(134382-134456)
scaffold0028 (189-263)||(136851-136925)
scaffold0028 (189-263)||(139320-139394)
scaffold0028 (189-263)||(141789-141863)
scaffold0028 (189-263)||(144258-144332)
scaffold0028 (27-95)||(134445-134512)
scaffold0028 (27-95)||(136914-136981)
scaffold0028 (27-95)||(139383-139450)
scaffold0028 (27-95)||(141852-141919)
scaffold0028 (27-95)||(144321-144388)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (189-263)||(94582-94656)
scaffold0023 (189-263)||(17357-17431)
scaffold0023 (1-97)||(17267-17370)
scaffold0023 (27-95)||(94645-94712)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (189-263)||(1484573-1484647)
chr8 (189-263)||(4542290-4542364)
chr8 (189-263)||(5853209-5853283)
chr8 (189-263)||(14409361-14409435)
chr8 (189-263)||(20403398-20403472)
chr8 (189-263)||(22001924-22001998)
chr8 (189-260)||(45290611-45290682)
chr8 (193-263)||(4483451-4483521)
chr8 (189-263)||(20046112-20046186)
chr8 (189-263)||(32810102-32810176)
chr8 (1-95)||(24048845-24048945)
chr8 (1-97)||(27472244-27472347)
chr8 (193-263)||(15203152-15203222)
chr8 (27-97)||(16413176-16413246)
chr8 (27-97)||(24485904-24485974)
chr8 (189-263)||(24485961-24486035)
chr8 (27-97)||(38549865-38549935)
chr8 (189-263)||(19896439-19896514)
chr8 (1-95)||(32121962-32122063)
chr8 (189-263)||(15070731-15070805)
chr8 (27-97)||(16198126-16198196)
chr8 (189-263)||(16413233-16413307)
chr8 (189-251)||(38550028-38550090)
chr8 (1-97)||(25657980-25658083)
chr8 (1-96)||(1326759-1326861)
chr8 (1-95)||(15070794-15070895)
chr8 (27-97)||(16401785-16401855)
chr8 (189-263)||(14823944-14824020)
chr8 (1-93)||(18677892-18677991)
chr8 (189-250)||(32121912-32121973)
chr8 (189-263)||(19936920-19936996)
chr8 (27-95)||(1484636-1484703)
chr8 (27-95)||(5853153-5853220)
chr8 (27-95)||(14409305-14409372)
chr8 (1-95)||(4483514-4483615)
chr8 (189-263)||(1326954-1327034)
chr8 (44-97)||(13425336-13425389)
chr8 (189-250)||(18677982-18678043)
chr8 (44-97)||(20982498-20982551)
chr8 (44-95)||(20982604-20982655)
chr8 (32-95)||(22001987-22002049)
chr8 (29-95)||(4542236-4542301)
chr8 (189-260)||(16401947-16402020)
chr8 (189-251)||(27472334-27472395)
chr8 (189-251)||(20982644-20982710)
chr8 (30-93)||(20046059-20046121)
chr8 (44-95)||(38549988-38550039)
chr8 (27-93)||(14824011-14824076)
chr8 (27-96)||(19896554-19896623)
chr8 (27-96)||(20403512-20403581)
chr8 (27-79)||(15203039-15203091)
chr8 (44-95)||(20403461-20403511)
chr8 (44-95)||(32810165-32810215)
chr8 (44-95)||(45290572-45290622)
chr8 (55-97)||(13425241-13425283)
chr8 (44-95)||(1326915-1326965)
chr8 (44-95)||(16401908-16401958)
chr8 (44-95)||(19896503-19896553)
chr8 (45-95)||(19936882-19936931)
chr8 (44-93)||(15203109-15203157)
chr8 (1-96)||(45290469-45290571)
chr8 (189-224)||(13425270-13425305)
chr8 (189-224)||(13425376-13425411)
chr8 (189-224)||(20982538-20982573)
chr8 (27-67)||(19936768-19936808)
chr8 (225-253)||(35026849-35026877)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (189-263)||(456492-456566)
chr7 (189-263)||(11393204-11393278)
chr7 (189-263)||(13841183-13841257)
chr7 (189-263)||(14269979-14270053)
chr7 (189-263)||(14949039-14949113)
chr7 (189-263)||(15376630-15376704)
chr7 (189-263)||(16232691-16232765)
chr7 (189-263)||(16410230-16410304)
chr7 (189-263)||(18430883-18430957)
chr7 (189-263)||(20385040-20385114)
chr7 (189-263)||(21189512-21189586)
chr7 (189-263)||(27217031-27217105)
chr7 (189-263)||(32125662-32125736)
chr7 (189-263)||(41523088-41523162)
chr7 (189-263)||(41525550-41525624)
chr7 (189-263)||(8468811-8468885)
chr7 (189-263)||(24702409-24702483)
chr7 (189-263)||(24704856-24704930)
chr7 (189-263)||(13869519-13869593)
chr7 (27-97)||(14269817-14269887)
chr7 (189-263)||(18640443-18640517)
chr7 (1-97)||(8940511-8940614)
chr7 (189-263)||(11303418-11303492)
chr7 (189-263)||(11972667-11972741)
chr7 (27-97)||(16213916-16213986)
chr7 (3-95)||(456555-456654)
chr7 (3-95)||(27217094-27217193)
chr7 (3-95)||(41523151-41523250)
chr7 (3-95)||(41525613-41525712)
chr7 (27-95)||(13869582-13869650)
chr7 (27-95)||(16232754-16232822)
chr7 (189-261)||(18627739-18627811)
chr7 (30-97)||(15081705-15081772)
chr7 (27-97)||(8468967-8469037)
chr7 (27-97)||(45847515-45847585)
chr7 (30-95)||(11393150-11393215)
chr7 (189-263)||(26355898-26355974)
chr7 (189-263)||(26358350-26358426)
chr7 (189-252)||(16108606-16108669)
chr7 (189-263)||(16213855-16213929)
chr7 (189-263)||(8940343-8940419)
chr7 (189-263)||(15081864-15081940)
chr7 (189-263)||(38898145-38898221)
chr7 (27-95)||(14948983-14949050)
chr7 (27-95)||(15376574-15376641)
chr7 (27-95)||(20384984-20385051)
chr7 (27-95)||(21189456-21189523)
chr7 (27-95)||(32125725-32125792)
chr7 (189-263)||(23664870-23664944)
chr7 (39-97)||(38897995-38898053)
chr7 (27-95)||(16410293-16410360)
chr7 (27-93)||(18627802-18627867)
chr7 (27-93)||(18640508-18640573)
chr7 (189-251)||(45847678-45847739)
chr7 (3-95)||(11303481-11303580)
chr7 (27-96)||(13841287-13841356)
chr7 (30-95)||(18430946-18431010)
chr7 (189-263)||(29796779-29796855)
chr7 (189-263)||(29800598-29800674)
chr7 (44-97)||(45847638-45847691)
chr7 (27-95)||(26355842-26355909)
chr7 (27-95)||(26358294-26358361)
chr7 (27-95)||(29796844-29796912)
chr7 (27-95)||(29800663-29800731)
chr7 (27-96)||(11972781-11972850)
chr7 (27-95)||(16108549-16108617)
chr7 (27-95)||(23664813-23664881)
chr7 (44-94)||(11972731-11972780)
chr7 (44-95)||(14269940-14269990)
chr7 (44-95)||(15081825-15081875)
chr7 (1-67)||(24702490-24702563)
chr7 (1-67)||(24704937-24705010)
chr7 (44-95)||(38898106-38898156)
chr7 (44-95)||(8940408-8940458)
chr7 (189-224)||(14269874-14269909)
chr7 (189-222)||(45847572-45847605)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (189-263)||(1540828-1540902)
chr6 (189-263)||(8055200-8055274)
chr6 (189-263)||(18334509-18334583)
chr6 (189-263)||(18913998-18914072)
chr6 (189-263)||(24422718-24422792)
chr6 (189-263)||(33861965-33862039)
chr6 (189-263)||(33864449-33864523)
chr6 (189-263)||(2291097-2291171)
chr6 (189-263)||(19005217-19005291)
chr6 (189-263)||(19858836-19858910)
chr6 (189-263)||(26924557-26924631)
chr6 (1-97)||(34963605-34963708)
chr6 (1-95)||(19847795-19847896)
chr6 (197-263)||(12742488-12742554)
chr6 (193-263)||(22782398-22782468)
chr6 (27-97)||(30676570-30676640)
chr6 (198-263)||(18937256-18937321)
chr6 (1-95)||(25535641-25535742)
chr6 (189-263)||(12942372-12942446)
chr6 (189-263)||(30676627-30676701)
chr6 (189-251)||(31630564-31630626)
chr6 (189-263)||(34963544-34963618)
chr6 (1-97)||(17377675-17377778)
chr6 (1-97)||(18914164-18914267)
chr6 (3-95)||(25688736-25688835)
chr6 (192-264)||(28289255-28289327)
chr6 (27-89)||(12742557-12742619)
chr6 (189-263)||(15875477-15875551)
chr6 (27-97)||(31630401-31630471)
chr6 (3-95)||(8055263-8055362)
chr6 (190-263)||(25656800-25656873)
chr6 (27-95)||(1598291-1598358)
chr6 (189-252)||(25688684-25688747)
chr6 (1-95)||(26924468-26924568)
chr6 (1-97)||(19005383-19005486)
chr6 (3-95)||(22782461-22782559)
chr6 (27-95)||(1540772-1540839)
chr6 (27-95)||(2291041-2291108)
chr6 (27-95)||(18334453-18334520)
chr6 (27-95)||(23992657-23992724)
chr6 (27-95)||(24422781-24422848)
chr6 (27-95)||(33862028-33862095)
chr6 (27-95)||(33864512-33864579)
chr6 (189-250)||(23992604-23992668)
chr6 (27-95)||(19858780-19858847)
chr6 (44-95)||(31630524-31630575)
chr6 (189-235)||(19847885-19847931)
chr6 (27-95)||(12942435-12942503)
chr6 (220-263)||(1595720-1595763)
chr6 (189-238)||(17377765-17377814)
chr6 (44-95)||(19005280-19005330)
chr6 (189-225)||(1598266-1598302)
chr6 (44-95)||(15875540-15875590)
chr6 (1-67)||(15875663-15875736)
chr6 (44-95)||(18914061-18914111)
chr6 (1-83)||(28289164-28289253)
chr6 (189-224)||(15875621-15875656)
chr6 (189-224)||(18914142-18914177)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (189-263)||(264685-264759)
chr5 (189-263)||(20909183-20909257)
chr5 (189-263)||(29346151-29346225)
chr5 (189-263)||(29348624-29348698)
chr5 (189-263)||(29351097-29351171)
chr5 (189-263)||(32027564-32027638)
chr5 (189-263)||(39245307-39245381)
chr5 (189-263)||(42245282-42245356)
chr5 (189-263)||(10732857-10732931)
chr5 (189-263)||(20917869-20917943)
chr5 (193-263)||(39363555-39363625)
chr5 (189-263)||(38619607-38619681)
chr5 (1-97)||(20901748-20901851)
chr5 (27-95)||(17517024-17517092)
chr5 (1-91)||(2154459-2154556)
chr5 (1-95)||(38619670-38619771)
chr5 (189-263)||(23064684-23064758)
chr5 (189-263)||(29330105-29330176)
chr5 (1-95)||(23064747-23064848)
chr5 (189-250)||(17517081-17517142)
chr5 (27-95)||(39245370-39245437)
chr5 (27-95)||(42245226-42245293)
chr5 (1-95)||(39363618-39363719)
chr5 (189-263)||(9776529-9776603)
chr5 (189-263)||(37804820-37804894)
chr5 (30-95)||(20909246-20909310)
chr5 (27-95)||(264629-264696)
chr5 (27-95)||(10732801-10732868)
chr5 (44-95)||(20901904-20901955)
chr5 (189-235)||(20901944-20901990)
chr5 (27-95)||(9776592-9776660)
chr5 (27-95)||(37804763-37804831)
chr5 (189-235)||(2154549-2154595)
chr5 (31-96)||(20917711-20917776)
chr5 (31-96)||(32027678-32027743)
chr5 (44-95)||(29330165-29330215)
chr5 (44-95)||(32027627-32027677)
chr5 (30-95)||(29346214-29346278)
chr5 (30-95)||(29348687-29348751)
chr5 (30-95)||(29351160-29351224)
chr5 (44-95)||(20917830-20917880)
chr5 (28-79)||(29330233-29330283)
chr5 (189-224)||(20901838-20901873)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (189-263)||(15118269-15118343)
chr4 (189-263)||(18239336-18239410)
chr4 (189-263)||(44615459-44615533)
chr4 (189-263)||(52873095-52873169)
chr4 (189-261)||(50222256-50222328)
chr4 (189-263)||(12224-12298)
chr4 (189-263)||(15355241-15355315)
chr4 (193-263)||(15496992-15497062)
chr4 (189-263)||(18215191-18215265)
chr4 (189-263)||(52312681-52312755)
chr4 (1-97)||(52872900-52873003)
chr4 (191-263)||(1837428-1837500)
chr4 (27-97)||(362412-362482)
chr4 (189-263)||(19618089-19618163)
chr4 (1-97)||(14970534-14970637)
chr4 (189-252)||(19242882-19242945)
chr4 (3-97)||(19617896-19617997)
chr4 (189-263)||(3515178-3515252)
chr4 (189-263)||(15534352-15534426)
chr4 (189-263)||(36038041-36038115)
chr4 (189-263)||(49547691-49547765)
chr4 (1-97)||(15496001-15496104)
chr4 (1-97)||(18214996-18215099)
chr4 (3-95)||(29267587-29267686)
chr4 (27-95)||(44615522-44615590)
chr4 (30-97)||(15355082-15355149)
chr4 (189-251)||(362268-362330)
chr4 (27-97)||(3515239-3515309)
chr4 (189-263)||(14048748-14048822)
chr4 (189-263)||(14970624-14970698)
chr4 (30-95)||(19242934-19242999)
chr4 (189-263)||(44773000-44773078)
chr4 (27-95)||(15118213-15118280)
chr4 (27-95)||(50222200-50222267)
chr4 (1-87)||(14746339-14746432)
chr4 (193-263)||(14746538-14746610)
chr4 (1-95)||(15534415-15534516)
chr4 (44-95)||(19857716-19857767)
chr4 (1-95)||(36038104-36038205)
chr4 (27-93)||(7641047-7641112)
chr4 (27-96)||(52312795-52312864)
chr4 (27-79)||(12115-12167)
chr4 (27-95)||(14048811-14048879)
chr4 (27-95)||(44772944-44773011)
chr4 (189-263)||(7641103-7641183)
chr4 (27-95)||(18239280-18239347)
chr4 (219-263)||(19857615-19857659)
chr4 (44-95)||(12185-12235)
chr4 (44-95)||(15355202-15355252)
chr4 (44-95)||(18215152-18215202)
chr4 (44-95)||(49547651-49547702)
chr4 (44-95)||(52312744-52312794)
chr4 (27-67)||(19857840-19857880)
chr4 (30-67)||(1837383-1837420)
chr4 (189-224)||(362390-362425)
chr4 (44-95)||(14746495-14746545)
chr4 (189-224)||(15355136-15355171)
chr4 (189-224)||(15496091-15496126)
chr4 (44-95)||(15496949-15496999)
chr4 (189-224)||(18215086-18215121)
chr4 (44-95)||(19618050-19618100)
chr4 (189-224)||(19857798-19857833)
chr4 (1-55)||(30147189-30147250)
chr4 (44-95)||(52873056-52873106)
chr4 (189-231)||(19857685-19857727)
chr4 (189-217)||(29267570-29267598)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (189-263)||(6469051-6469125)
chr3 (189-263)||(7781264-7781338)
chr3 (189-263)||(10247640-10247714)
chr3 (189-263)||(13154172-13154246)
chr3 (189-263)||(16282728-16282802)
chr3 (189-263)||(16454198-16454272)
chr3 (189-263)||(17463349-17463423)
chr3 (189-263)||(34159497-34159571)
chr3 (189-263)||(45606824-45606898)
chr3 (189-263)||(55476662-55476736)
chr3 (189-263)||(8899265-8899339)
chr3 (189-263)||(9707524-9707598)
chr3 (189-263)||(12567731-12567805)
chr3 (189-263)||(13544196-13544270)
chr3 (189-263)||(28848528-28848602)
chr3 (189-263)||(41124058-41124132)
chr3 (1-95)||(46822495-46822596)
chr3 (27-97)||(12119514-12119584)
chr3 (189-263)||(15977704-15977778)
chr3 (189-263)||(27165423-27165497)
chr3 (189-263)||(38961808-38961882)
chr3 (1-95)||(24513910-24514011)
chr3 (189-263)||(8499691-8499765)
chr3 (189-263)||(12305316-12305390)
chr3 (189-263)||(13151707-13151781)
chr3 (27-97)||(13436531-13436601)
chr3 (189-263)||(15412602-15412676)
chr3 (189-263)||(54520993-54521067)
chr3 (3-95)||(45606736-45606835)
chr3 (3-95)||(53301333-53301432)
chr3 (27-95)||(8499754-8499822)
chr3 (27-95)||(27165486-27165554)
chr3 (1-95)||(7781174-7781275)
chr3 (189-252)||(53301421-53301484)
chr3 (193-263)||(29544763-29544833)
chr3 (189-250)||(46822445-46822506)
chr3 (28-95)||(12567794-12567860)
chr3 (28-95)||(13544259-13544325)
chr3 (189-263)||(11913967-11914043)
chr3 (27-95)||(6468995-6469062)
chr3 (31-95)||(10557142-10557206)
chr3 (27-95)||(15412665-15412733)
chr3 (27-95)||(15977767-15977834)
chr3 (27-95)||(16454142-16454209)
chr3 (27-95)||(17463412-17463479)
chr3 (27-95)||(34159560-34159627)
chr3 (27-95)||(55476725-55476792)
chr3 (192-251)||(10557091-10557150)
chr3 (44-95)||(9707484-9707535)
chr3 (1-95)||(12305379-12305480)
chr3 (28-95)||(13154117-13154183)
chr3 (1-95)||(54521056-54521157)
chr3 (27-96)||(25229489-25229558)
chr3 (27-96)||(25237076-25237145)
chr3 (27-96)||(38961699-38961768)
chr3 (28-95)||(13151652-13151718)
chr3 (30-96)||(17444627-17444693)
chr3 (27-96)||(16282618-16282687)
chr3 (27-96)||(41124172-41124241)
chr3 (189-229)||(17444733-17444773)
chr3 (44-95)||(8899328-8899378)
chr3 (44-95)||(16282689-16282739)
chr3 (44-95)||(17444694-17444744)
chr3 (44-95)||(38961769-38961819)
chr3 (44-95)||(41124121-41124171)
chr3 (30-95)||(10247587-10247651)
chr3 (225-262)||(15977663-15977700)
chr3 (27-67)||(28848482-28848522)
chr3 (44-95)||(25237025-25237075)
chr3 (231-263)||(17446614-17446646)
chr3 (44-95)||(11913928-11913978)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (189-263)||(6726166-6726240)
chr2 (189-263)||(18809114-18809188)
chr2 (189-263)||(21154977-21155051)
chr2 (189-263)||(23709449-23709523)
chr2 (189-263)||(23711930-23712004)
chr2 (189-263)||(24898112-24898186)
chr2 (189-263)||(24900595-24900669)
chr2 (189-263)||(24903072-24903146)
chr2 (189-263)||(24905549-24905623)
chr2 (189-263)||(24908024-24908098)
chr2 (189-263)||(39682484-39682558)
chr2 (189-263)||(571568-571642)
chr2 (189-263)||(22105584-22105658)
chr2 (193-263)||(23131033-23131103)
chr2 (193-263)||(23133500-23133570)
chr2 (189-263)||(26505550-26505624)
chr2 (189-263)||(26508028-26508102)
chr2 (189-263)||(28577270-28577344)
chr2 (193-263)||(34402443-34402513)
chr2 (189-263)||(38967545-38967619)
chr2 (189-263)||(23135761-23135835)
chr2 (1-97)||(23707044-23707147)
chr2 (1-97)||(24918372-24918475)
chr2 (3-95)||(39682547-39682646)
chr2 (27-95)||(24529407-24529475)
chr2 (189-263)||(20261390-20261464)
chr2 (189-263)||(24367945-24368019)
chr2 (27-97)||(24642609-24642679)
chr2 (193-263)||(32039419-32039489)
chr2 (189-263)||(32214838-32214912)
chr2 (27-97)||(38967711-38967781)
chr2 (3-95)||(571631-571730)
chr2 (1-97)||(24681676-24681779)
chr2 (27-95)||(25616415-25616483)
chr2 (27-97)||(24671257-24671327)
chr2 (189-250)||(25616365-25616426)
chr2 (1-95)||(23131096-23131197)
chr2 (1-95)||(23133563-23133664)
chr2 (1-95)||(34402349-34402450)
chr2 (189-263)||(23707239-23707315)
chr2 (189-263)||(24918204-24918280)
chr2 (202-263)||(45029784-45029845)
chr2 (27-95)||(18809177-18809244)
chr2 (27-95)||(23711874-23711941)
chr2 (27-93)||(26505615-26505680)
chr2 (27-93)||(26508093-26508158)
chr2 (27-96)||(6726280-6726349)
chr2 (189-263)||(24642771-24642847)
chr2 (30-95)||(45027768-45027832)
chr2 (1-96)||(22105698-22105800)
chr2 (27-95)||(28577333-28577400)
chr2 (1-95)||(20261453-20261554)
chr2 (189-261)||(24671091-24671165)
chr2 (28-95)||(24898057-24898123)
chr2 (28-95)||(24905494-24905560)
chr2 (28-95)||(24907969-24908035)
chr2 (189-263)||(10684680-10684756)
chr2 (27-96)||(21154868-21154937)
chr2 (27-95)||(10684623-10684691)
chr2 (27-95)||(23709393-23709460)
chr2 (27-79)||(24368076-24368128)
chr2 (27-95)||(32039359-32039426)
chr2 (28-95)||(24900540-24900606)
chr2 (28-95)||(24903017-24903083)
chr2 (189-235)||(24529464-24529510)
chr2 (189-238)||(24681535-24681584)
chr2 (44-95)||(6726229-6726279)
chr2 (1-67)||(32214758-32214831)
chr2 (30-96)||(41523936-41524002)
chr2 (44-93)||(24368010-24368058)
chr2 (27-67)||(23135841-23135881)
chr2 (48-95)||(21154942-21154988)
chr2 (44-95)||(22105647-22105697)
chr2 (44-95)||(23707200-23707250)
chr2 (44-95)||(24642732-24642782)
chr2 (44-95)||(24681573-24681623)
chr2 (44-95)||(38967608-38967658)
chr2 (47-95)||(24671154-24671201)
chr2 (44-95)||(24918269-24918319)
chr2 (44-87)||(41524003-41524045)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (189-263)||(13989037-13989111)
chr1 (189-263)||(21475004-21475078)
chr1 (189-263)||(21923208-21923282)
chr1 (189-263)||(29298307-29298381)
chr1 (189-263)||(29776859-29776933)
chr1 (189-263)||(22122984-22123058)
chr1 (189-263)||(16275280-16275354)
chr1 (189-263)||(16362089-16362163)
chr1 (193-263)||(21840938-21841008)
chr1 (189-263)||(23593651-23593725)
chr1 (189-263)||(31612484-31612558)
chr1 (3-95)||(21474916-21475015)
chr1 (189-249)||(22050806-22050866)
chr1 (27-95)||(23593594-23593662)
chr1 (1-97)||(16275084-16275187)
chr1 (189-252)||(15859925-15859988)
chr1 (27-95)||(13989100-13989167)
chr1 (27-95)||(16362152-16362220)
chr1 (27-95)||(21923152-21923219)
chr1 (1-96)||(27161414-27161516)
chr1 (28-95)||(21841001-21841067)
chr1 (189-238)||(27161556-27161605)
chr1 (27-95)||(15859869-15859936)
chr1 (1-96)||(22050664-22050766)
chr1 (1-96)||(29776973-29777075)
chr1 (27-96)||(22122875-22122944)
chr1 (27-96)||(29298474-29298543)
chr1 (218-263)||(43543222-43543267)
chr1 (44-95)||(16275240-16275291)
chr1 (30-96)||(31612598-31612664)
chr1 (44-95)||(22050767-22050817)
chr1 (44-95)||(29776922-29776972)
chr1 (1-60)||(13227132-13227198)
chr1 (1-60)||(29535320-29535386)
chr1 (44-95)||(29298370-29298420)
chr1 (44-95)||(31612547-31612597)
chr1 (44-95)||(22122945-22122995)
chr1 (45-95)||(27161518-27161567)
chr1 (192-224)||(16275177-16275209)
chr1 (44-96)||(29298421-29298473)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (189-263)||(13563-13637)
scaffold0444 (3-95)||(13626-13725)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (189-263)||(40571-40645)
scaffold0044 (30-95)||(40634-40698)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (1-97)||(30251-30354)
scaffold0149 (189-235)||(30112-30158)
scaffold0149 (46-95)||(30147-30196)
scaffold0149 (189-224)||(30229-30264)
[»] scaffold0494 (4 HSPs)
scaffold0494 (1-97)||(351-454)
scaffold0494 (44-97)||(507-560)
scaffold0494 (217-263)||(12194-12240)
scaffold0494 (189-224)||(547-582)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (30-97)||(4926-4993)
scaffold0716 (189-263)||(4865-4939)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (1-95)||(6763-6864)
scaffold0317 (189-238)||(6853-6902)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (193-263)||(10944-11014)
scaffold0454 (28-95)||(11007-11073)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (189-263)||(38573-38647)
scaffold0074 (32-97)||(38521-38586)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (27-97)||(10023-10093)
scaffold0043 (189-224)||(10001-10036)
scaffold0043 (44-78)||(9936-9970)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (27-97)||(11521-11591)
scaffold0029 (189-261)||(11461-11534)
[»] scaffold0513 (4 HSPs)
scaffold0513 (32-97)||(10647-10712)
scaffold0513 (189-263)||(10804-10878)
scaffold0513 (44-91)||(10765-10811)
scaffold0513 (189-224)||(10699-10734)
[»] scaffold1792 (2 HSPs)
scaffold1792 (1-95)||(441-542)
scaffold1792 (189-225)||(416-452)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (1-95)||(4130-4231)
scaffold0741 (194-263)||(4225-4296)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (193-263)||(35986-36057)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (189-263)||(1599-1673)
scaffold1427 (1-95)||(1662-1763)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (189-263)||(3194-3268)
scaffold0422 (1-95)||(3257-3358)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (193-263)||(9413-9483)
scaffold0363 (28-95)||(9476-9542)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (189-263)||(501255-501329)
scaffold0001 (62-97)||(501316-501351)
[»] scaffold0747 (3 HSPs)
scaffold0747 (1-97)||(821-924)
scaffold0747 (189-263)||(653-729)
scaffold0747 (44-95)||(718-768)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (1-97)||(57713-57816)
[»] scaffold0306 (3 HSPs)
scaffold0306 (1-95)||(15156-15257)
scaffold0306 (1-78)||(11167-11251)
scaffold0306 (189-263)||(15091-15167)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-95)||(13454-13555)
scaffold0040 (27-66)||(43002-43041)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (27-97)||(53732-53802)
scaffold0022 (194-263)||(53794-53865)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (193-263)||(1247-1319)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (189-263)||(15189-15265)
scaffold0106 (44-95)||(15150-15200)
scaffold0106 (30-67)||(15040-15077)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (189-233)||(9932-9976)
scaffold0145 (44-95)||(9965-10016)
scaffold0145 (46-96)||(10017-10067)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-60)||(68230-68296)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (1-67)||(6713-6786)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (30-72)||(7996-8038)


Alignment Details
Target: scaffold0695 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6192 - 6118
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6248 - 6181
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6248 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 6181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20992 - 20918
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 20918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21082 - 20981
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21082 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 20983  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  20982 gt 20981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14192 - 14118
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 14118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14280 - 14181
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 23358 - 23459
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23358 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 23457  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  23458 gt 23459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 225
Target Start/End: Original strand, 23448 - 23484
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23448 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38066 - 37992
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38066 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 37992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38154 - 38055
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38154 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 38055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28034 - 27960
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28034 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 27960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 28143 - 28074
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  28143 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 28074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 28023
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 28023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 10)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 134456 - 134382
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134456 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 134382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 136925 - 136851
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136925 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 136851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 139394 - 139320
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139394 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 139320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 141863 - 141789
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141863 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 141789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 144332 - 144258
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144332 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 144258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 134512 - 134445
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  134512 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 134445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 136981 - 136914
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136981 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 136914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 139450 - 139383
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  139450 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 139383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 141919 - 141852
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  141919 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 141852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 144388 - 144321
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  144388 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 144321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 94656 - 94582
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94656 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 94582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 17357 - 17431
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17357 atacgatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 17431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 17267 - 17370
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17267 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatatt 17366  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  17367 gttc 17370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 94712 - 94645
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  94712 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 94645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1484647 - 1484573
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484647 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 1484573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 4542290 - 4542364
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542290 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 4542364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 5853209 - 5853283
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853209 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 5853283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 14409361 - 14409435
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409361 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 14409435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20403472 - 20403398
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403472 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 20403398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22001998 - 22001924
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001998 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 22001924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Original strand, 45290611 - 45290682
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290611 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttga 45290682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4483521 - 4483451
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483521 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 4483451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 20046112 - 20046186
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046112 atacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 20046186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32810176 - 32810102
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810176 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 32810102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24048945 - 24048845
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactgga------cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048945 acttgagttatggtcaaattactgcagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg 24048846  T
Q  95 t 95  Q
    |    
T  24048845 t 24048845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 27472244 - 27472347
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472244 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 27472343  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  27472344 gttc 27472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 15203152 - 15203222
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203152 gatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 15203222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 16413176 - 16413246
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413176 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 16413246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 24485904 - 24485974
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485904 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 24485974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 24485961 - 24486035
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24485961 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgt 24486035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 38549865 - 38549935
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549865 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 38549935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19896514 - 19896439
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgat-gttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896514 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttgattattatttgatgt 19896439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32122063 - 32121962
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32122063 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatatt 32121964  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  32121963 gt 32121962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15070805 - 15070731
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15070805 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 15070731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16198196 - 16198126
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198196 cacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 16198126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 16413233 - 16413307
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16413233 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 16413307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 38550028 - 38550090
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550028 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 25657980 - 25658083
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25657980 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatatt 25658079  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  25658080 gttc 25658083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 1326759 - 1326861
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1326759 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatatt 1326858  T
Q  94 gtt 96  Q
    |||    
T  1326859 gtt 1326861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15070895 - 15070794
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070895 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 15070796  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  15070795 gt 15070794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 16401785 - 16401855
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16401785 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttc 16401855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14824020 - 14823944
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14824020 atacgatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgt 14823944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 18677892 - 18677991
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18677892 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatatt 18677991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32121973 - 32121912
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121973 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 19936920 - 19936996
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  19936920 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 19936996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1484703 - 1484636
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1484703 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1484636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 5853153 - 5853220
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5853153 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 5853220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 14409305 - 14409372
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14409305 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 14409372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4483615 - 4483514
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4483615 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatatt 4483516  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  4483515 gt 4483514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 1326954 - 1327034
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1326954 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgt 1327034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 97
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425389
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 13425389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Original strand, 18677982 - 18678043
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18677982 atacgatattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 97
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982551
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 20982551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982655
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 20982655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22002049 - 22001987
Alignment:
Q  32 tgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22002049 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 22001987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Original strand, 4542236 - 4542301
Alignment:
Q  29 cagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4542236 cagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 4542301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Original strand, 16401947 - 16402020
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||    
T  16401947 atacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 27472334 - 27472395
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472334 atacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 20982644 - 20982710
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20982644 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 20046059 - 20046121
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20046059 agtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 20046121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550039
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 38550039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14824076 - 14824011
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  14824076 cacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatatt 14824011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19896623 - 19896554
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  19896623 cacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 19896554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20403581 - 20403512
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  20403581 cacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 20403512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 15203039 - 15203091
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgttt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15203039 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgttt 15203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403461
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 20403461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810165
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 32810165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290622
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 45290622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 97
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425283
Alignment:
Q  55 aattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 13425283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326965
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1326965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401958
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 16401958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896503
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatattgt 19896503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 95
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936931
Alignment:
Q  45 atgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 19936931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 93
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203157
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatatt 15203157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 45290469 - 45290571
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||    
T  45290469 acttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgtt 45290568  T
Q  94 gtt 96  Q
    |||    
T  45290569 gtt 45290571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 13425270 - 13425305
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425270 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 13425376 - 13425411
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425376 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 20982538 - 20982573
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20982538 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Original strand, 19936768 - 19936808
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19936768 cacagtgaataattgtttatgattgatgaattagtatatgt 19936808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 253
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026877
Alignment:
Q  225 tatatatgatgttttaagatgttgattat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattat 35026877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 456566 - 456492
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456566 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 456492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 11393204 - 11393278
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393204 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 11393278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13841257 - 13841183
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841257 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 13841183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 14269979 - 14270053
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269979 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 14270053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 14949039 - 14949113
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949039 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 14949113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 15376630 - 15376704
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376630 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 15376704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16232765 - 16232691
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232765 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 16232691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16410304 - 16410230
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410304 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 16410230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18430957 - 18430883
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430957 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 18430883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 20385040 - 20385114
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385040 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 20385114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 21189512 - 21189586
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189512 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 21189586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27217105 - 27217031
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217105 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 27217031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32125736 - 32125662
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125736 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 32125662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41523162 - 41523088
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523162 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 41523088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41525624 - 41525550
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525624 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 41525550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8468885 - 8468811
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8468885 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgt 8468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24702483 - 24702409
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702483 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24702409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24704930 - 24704856
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704930 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24704856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13869593 - 13869519
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13869593 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 13869519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 14269817 - 14269887
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269817 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 14269887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18640517 - 18640443
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18640517 atacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgt 18640443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8940614 - 8940511
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940614 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 8940515  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  8940514 gttc 8940511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11303492 - 11303418
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11303492 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 11303418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11972741 - 11972667
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11972741 atacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgt 11972667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16213986 - 16213916
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213986 cacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 16213916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 456654 - 456555
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456654 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 456555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27217193 - 27217094
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217193 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 27217094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41523250 - 41523151
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523250 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 41523151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41525712 - 41525613
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525712 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 41525613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13869650 - 13869582
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869650 cacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 13869582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16232822 - 16232754
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232822 cacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 16232754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18627811 - 18627739
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgat 261  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18627811 atacgatattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgat 18627739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 15081705 - 15081772
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15081705 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 15081772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8469037 - 8468967
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8469037 cacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttc 8468967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 45847515 - 45847585
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45847515 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttc 45847585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Original strand, 11393150 - 11393215
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393150 agtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 11393215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 26355898 - 26355974
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26355898 atacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgt 26355974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 26358350 - 26358426
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26358350 atacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgt 26358426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Original strand, 16108606 - 16108669
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 252  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108606 atacaatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 16108669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16213929 - 16213855
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  16213929 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgt 16213855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8940419 - 8940343
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  8940419 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 8940343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 15081864 - 15081940
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  15081864 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgt 15081940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 38898145 - 38898221
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  38898145 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 38898221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 14948983 - 14949050
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14948983 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 14949050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 15376574 - 15376641
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15376574 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15376641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 20384984 - 20385051
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20384984 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 20385051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 21189456 - 21189523
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21189456 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgt 21189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32125792 - 32125725
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32125792 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 32125725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 23664870 - 23664944
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23664870 atacgatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgt 23664944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 97
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898053
Alignment:
Q  39 ttgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 38898053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16410360 - 16410293
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410360 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 16410293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18627867 - 18627802
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18627867 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 18627802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18640573 - 18640508
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18640573 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 18640508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 45847678 - 45847739
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45847678 atacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11303580 - 11303481
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11303580 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 11303481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13841356 - 13841287
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  13841356 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 13841287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18431010 - 18430946
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18431010 agtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18430946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29796855 - 29796779
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  29796855 atacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgt 29796779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29800674 - 29800598
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  29800674 atacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgt 29800598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 97
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847691
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 45847691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 26355842 - 26355909
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26355842 cacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgt 26355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 26358294 - 26358361
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26358294 cacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgt 26358361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29796912 - 29796844
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29796912 cacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 29796844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29800731 - 29800663
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29800731 cacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 29800663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11972850 - 11972781
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  11972850 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtt 11972781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 16108549 - 16108617
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16108549 cacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgt 16108617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 23664813 - 23664881
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23664813 cacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 23664881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972731
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg 94  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattg 11972731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14269990
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 14269990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081875
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 15081875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24702563 - 24702490
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24702563 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt 24702490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24705010 - 24704937
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24705010 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt 24704937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898156
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 38898156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940408
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 8940408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 14269874 - 14269909
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14269874 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 222
Target Start/End: Original strand, 45847572 - 45847605
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttata 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45847572 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 1540828 - 1540902
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540828 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 1540902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8055274 - 8055200
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055274 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 8055200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 18334509 - 18334583
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334509 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 18334583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18914072 - 18913998
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914072 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 18913998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24422792 - 24422718
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422792 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24422718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33862039 - 33861965
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862039 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 33861965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33864523 - 33864449
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864523 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 33864449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 2291097 - 2291171
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291097 atacgatattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 2291171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19005291 - 19005217
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005291 atacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 19005217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 19858836 - 19858910
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19858836 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgt 19858910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 26924557 - 26924631
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924557 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 26924631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 34963708 - 34963605
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggaca-------cagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963708 acttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 34963609  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  34963608 gttc 34963605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 19847795 - 19847896
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847795 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 19847894  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  19847895 gt 19847896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12742554 - 12742488
Alignment:
Q  197 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742554 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 12742488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22782468 - 22782398
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22782468 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgt 22782398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 30676570 - 30676640
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676570 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 30676640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937256
Alignment:
Q  198 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 18937256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25535742 - 25535641
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactgga-------cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535742 acttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 25535643  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  25535642 gt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12942446 - 12942372
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12942446 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 12942372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 30676627 - 30676701
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30676627 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 30676701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 31630564 - 31630626
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630564 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34963618 - 34963544
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34963618 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 34963544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 17377675 - 17377778
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17377675 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 17377774  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  17377775 gttc 17377778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18914267 - 18914164
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18914267 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatatt 18914168  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  18914167 gttc 18914164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25688835 - 25688736
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25688835 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgt 25688736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Original strand, 28289255 - 28289327
Alignment:
Q  192 cgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgtc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28289255 cgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtc 28289327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12742619 - 12742557
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742619 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 12742557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15875551 - 15875477
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875551 atacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 15875477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 31630401 - 31630471
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630401 cacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 31630471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8055362 - 8055263
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactgga-------cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055362 ttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 8055263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25656873 - 25656800
Alignment:
Q  190 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25656873 tacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 25656800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1598358 - 1598291
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598358 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1598291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25688747 - 25688684
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25688747 atacgatattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgatta 25688684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 26924468 - 26924568
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924468 acttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 26924566  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  26924567 gt 26924568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19005486 - 19005383
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactgga-------cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19005486 acttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatatt 19005387  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  19005386 gttc 19005383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22782559 - 22782461
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggaca-------cagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22782559 ttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 22782461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 1540772 - 1540839
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1540772 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1540839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 2291041 - 2291108
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2291041 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 2291108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 18334453 - 18334520
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18334453 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18334520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23992724 - 23992657
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23992724 cacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 23992657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24422848 - 24422781
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24422848 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24422781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33862095 - 33862028
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33862095 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 33862028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33864579 - 33864512
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33864579 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 33864512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23992668 - 23992604
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat---gatgttttaagatgttgat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23992668 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 19858780 - 19858847
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  19858780 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ctgtgaatacgatattgt 19858847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630575
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 31630575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 19847885 - 19847931
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847885 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12942503 - 12942435
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12942503 cacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 12942435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595720
Alignment:
Q  220 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 1595720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 17377765 - 17377814
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 238  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377765 atactatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005280
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 19005280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1598302 - 1598266
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598302 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875540
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15875540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15875736 - 15875663
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15875736 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 15875663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914061
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatattgt 18914061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 28289164 - 28289253
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtga 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  28289164 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga 28289253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15875656 - 15875621
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15875656 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18914177 - 18914142
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18914177 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 264685 - 264759
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264685 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 264759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20909257 - 20909183
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909257 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 20909183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29346225 - 29346151
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346225 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 29346151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29348698 - 29348624
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348698 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 29348624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29351171 - 29351097
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351171 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 29351097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32027638 - 32027564
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027638 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 32027564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39245381 - 39245307
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245381 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 39245307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 42245282 - 42245356
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245282 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 42245356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 10732857 - 10732931
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732857 atacgattttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 10732931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 20917869 - 20917943
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917869 atacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 20917943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39363625 - 39363555
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363625 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 39363555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38619681 - 38619607
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38619681 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 38619607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 20901748 - 20901851
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901748 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 20901847  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  20901848 gttc 20901851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 17517024 - 17517092
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517024 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 17517092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 2154459 - 2154556
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154459 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 2154556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38619771 - 38619670
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619771 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 38619672  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  38619671 gt 38619670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23064758 - 23064684
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23064758 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 23064684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29330176 - 29330105
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29330176 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga---tgattattatttgatgt 29330105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23064848 - 23064747
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064848 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 23064749  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  23064748 gt 23064747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Original strand, 17517081 - 17517142
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517081 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39245437 - 39245370
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39245437 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 39245370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 42245226 - 42245293
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42245226 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 42245293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39363719 - 39363618
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39363719 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatatt 39363620  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  39363619 gt 39363618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9776603 - 9776529
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  9776603 atacgatattgtcaatgattggtgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgt 9776529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 37804820 - 37804894
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  37804820 atacgatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgt 37804894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20909310 - 20909246
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20909310 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 20909246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 264629 - 264696
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  264629 cacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 264696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 10732801 - 10732868
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10732801 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgt 10732868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901955
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 20901955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 20901944 - 20901990
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901944 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 9776660 - 9776592
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9776660 cacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 9776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 37804763 - 37804831
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37804763 cacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 37804831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 2154549 - 2154595
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154549 atacgatactgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 20917711 - 20917776
Alignment:
Q  31 gtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  20917711 gtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 20917776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 32027743 - 32027678
Alignment:
Q  31 gtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  32027743 gtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 32027678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330165
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29330165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027627
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 32027627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29346278 - 29346214
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29346278 agtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29346214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29348751 - 29348687
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29348751 agtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29348687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29351224 - 29351160
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29351224 agtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29351160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917880
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgt 20917880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 29330283 - 29330233
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgttt 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29330283 acagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29330233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 20901838 - 20901873
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20901838 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 15118269 - 15118343
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118269 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 15118343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 18239336 - 18239410
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239336 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 18239410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44615533 - 44615459
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615533 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 44615459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 52873095 - 52873169
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873095 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 52873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Original strand, 50222256 - 50222328
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222256 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgat 50222328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 12224 - 12298
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12224 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattggatgt 12298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 15355241 - 15355315
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355241 atacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 15355315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 15496992 - 15497062
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496992 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 15497062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 18215191 - 18215265
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18215191 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgt 18215265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 52312755 - 52312681
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312755 atacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 52312681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 52872900 - 52873003
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872900 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 52872999  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  52873000 gttc 52873003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 1837428 - 1837500
Alignment:
Q  191 acgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837428 acgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 1837500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 362482 - 362412
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362482 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 362412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 19618089 - 19618163
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19618089 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 19618163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 14970534 - 14970637
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggaca-------cagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970534 acttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 14970633  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  14970634 gttc 14970637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19242945 - 19242882
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242945 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 19242882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 19617896 - 19617997
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19617896 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 19617995  T
Q  96 tc 97  Q
    ||    
T  19617996 tc 19617997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3515252 - 3515178
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3515252 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 3515178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15534426 - 15534352
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15534426 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 15534352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36038115 - 36038041
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36038115 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 36038041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 49547691 - 49547765
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49547691 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 49547765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 15496001 - 15496104
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15496001 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatatt 15496100  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  15496101 gttc 15496104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 18214996 - 18215099
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18214996 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacgatatt 18215095  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  18215096 gttc 18215099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29267686 - 29267587
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29267686 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgt 29267587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 44615590 - 44615522
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615590 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 44615522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Original strand, 15355082 - 15355149
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15355082 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttc 15355149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 362330 - 362268
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362330 atacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3515309 - 3515239
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3515309 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttc 3515239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14048822 - 14048748
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14048822 atacgatattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 14048748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 14970624 - 14970698
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14970624 atacgatattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 14970698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19242999 - 19242934
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242999 agtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 19242934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 44773000 - 44773078
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg----tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773000 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgt 44773078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 15118213 - 15118280
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15118213 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15118280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 50222200 - 50222267
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50222200 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 50222267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 14746339 - 14746432
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatac 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14746339 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatac 14746432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 14746538 - 14746610
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  14746538 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 14746610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15534516 - 15534415
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15534516 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatatt 15534417  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  15534416 gt 15534415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857716
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 19857716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 36038205 - 36038104
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36038205 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatatt 36038106  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  36038105 gt 36038104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Original strand, 7641047 - 7641112
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7641047 cacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 7641112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 52312864 - 52312795
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  52312864 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 52312795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12167
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgttt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12115 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14048879 - 14048811
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048879 cacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 14048811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 44772944 - 44773011
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44772944 cacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 44773011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 7641103 - 7641183
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat------gatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641103 atacgatatttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgt 7641183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 18239280 - 18239347
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18239280 cacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18239347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857615
Alignment:
Q  219 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 19857615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12235
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 12235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355252
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215202
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18215202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 49547651 - 49547702
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49547651 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 49547702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312744
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 52312744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19857880 - 19857840
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19857880 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 19857840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 1837383 - 1837420
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1837383 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 1837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 362425 - 362390
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  362425 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746545
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgt 14746545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 15355136 - 15355171
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15355136 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 15496091 - 15496126
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496091 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15496999
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 15496999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 18215086 - 18215121
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215086 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618100
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 19618100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19857833 - 19857798
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19857833 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 30147250 - 30147189
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattact-------ggacacagtgaataattgaatatgattgatga 55  Q
    |||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147250 acttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873106
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 52873106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19857727 - 19857685
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857727 atacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29267598 - 29267570
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267598 atacgatattgtccatgattgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 6469051 - 6469125
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469051 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 6469125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 7781264 - 7781338
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781264 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 7781338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 10247640 - 10247714
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247640 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 10247714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 13154172 - 13154246
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154172 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 13154246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 16282728 - 16282802
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282728 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 16282802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 16454198 - 16454272
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454198 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 16454272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17463423 - 17463349
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463423 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 17463349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34159571 - 34159497
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159571 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 34159497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 45606824 - 45606898
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606824 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 45606898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 55476736 - 55476662
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476736 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 55476662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8899339 - 8899265
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8899339 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgt 8899265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 9707524 - 9707598
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707524 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 9707598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12567805 - 12567731
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12567805 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 12567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13544270 - 13544196
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13544270 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 13544196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 28848528 - 28848602
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848528 atacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 28848602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41124132 - 41124058
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124132 atacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 41124058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 46822596 - 46822495
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822596 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 46822497  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  46822496 gt 46822495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 12119514 - 12119584
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119514 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 12119584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15977778 - 15977704
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15977778 atacgatattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgt 15977704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27165497 - 27165423
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27165497 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 27165423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 38961808 - 38961882
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38961808 atacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgt 38961882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24514011 - 24513910
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24514011 acttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 24513912  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  24513911 gt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8499765 - 8499691
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8499765 atacgatattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgt 8499691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12305390 - 12305316
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12305390 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 12305316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 13151707 - 13151781
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151707 atacgatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 13151781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13436601 - 13436531
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13436601 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttc 13436531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15412676 - 15412602
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15412676 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgt 15412602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 54521067 - 54520993
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  54521067 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 54520993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 45606736 - 45606835
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactgga-------cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606736 ttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 45606835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 53301333 - 53301432
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301333 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 53301432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8499822 - 8499754
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499822 cacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 8499754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27165554 - 27165486
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165554 cacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 27165486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 7781174 - 7781275
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggaca-------cagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781174 acttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 7781273  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  7781274 gt 7781275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Original strand, 53301421 - 53301484
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301421 atacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 53301484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 29544763 - 29544833
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29544763 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 29544833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46822506 - 46822445
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822506 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12567860 - 12567794
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12567860 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 12567794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13544325 - 13544259
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13544325 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13544259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 11913967 - 11914043
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  11913967 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 11914043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 6468995 - 6469062
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6468995 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 6469062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10557206 - 10557142
Alignment:
Q  31 gtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10557206 gtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgt 10557142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15412733 - 15412665
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412733 cacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 15412665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15977834 - 15977767
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15977834 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15977767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 16454142 - 16454209
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16454142 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 16454209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17463479 - 17463412
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17463479 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 17463412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 34159627 - 34159560
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34159627 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 34159560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 55476792 - 55476725
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55476792 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 55476725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10557150 - 10557091
Alignment:
Q  192 cgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557150 cgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707535
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 9707535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12305480 - 12305379
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12305480 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatatt 12305381  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  12305380 gt 12305379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 13154117 - 13154183
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13154117 acagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13154183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 54521157 - 54521056
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54521157 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatatt 54521058  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  54521057 gt 54521056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 25229558 - 25229489
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  25229558 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 25229489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 25237145 - 25237076
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  25237145 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 25237076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 38961699 - 38961768
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  38961699 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 38961768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 13151652 - 13151718
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13151652 acagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13151718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 17444627 - 17444693
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  17444627 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 17444693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 16282618 - 16282687
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  16282618 cacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 16282687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 41124241 - 41124172
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  41124241 cacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 41124172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 17444733 - 17444773
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444733 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899328
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 8899328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282739
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 16282739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444744
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 17444744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961819
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 38961819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124121
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 41124121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Original strand, 10247587 - 10247651
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10247587 agtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 10247651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  225 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Original strand, 28848482 - 28848522
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28848482 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 28848522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237025
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 25237025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 263
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446646
Alignment:
Q  231 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 17446646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11913978
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatattgt 11913978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6726240 - 6726166
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726240 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 6726166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18809188 - 18809114
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809188 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 18809114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 21154977 - 21155051
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154977 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 21155051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 23709449 - 23709523
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709449 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 23709523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 23711930 - 23712004
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711930 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 23712004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 24898112 - 24898186
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898112 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24898186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 24900595 - 24900669
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900595 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24900669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 24903072 - 24903146
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903072 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24903146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 24905549 - 24905623
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905549 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24905623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 24908024 - 24908098
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908024 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 24908098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39682558 - 39682484
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682558 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 39682484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 571642 - 571568
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571642 atacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 571568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22105658 - 22105584
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105658 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgt 22105584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23131103 - 23131033
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131103 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 23131033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23133570 - 23133500
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133570 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 23133500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26505624 - 26505550
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505624 atacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 26505550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26508102 - 26508028
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508102 atacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 26508028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28577344 - 28577270
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577344 atacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 28577270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 34402443 - 34402513
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402443 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 34402513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38967619 - 38967545
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38967619 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgt 38967545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23135835 - 23135761
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23135835 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgt 23135761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 23707044 - 23707147
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23707044 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 23707143  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  23707144 gttc 23707147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24918475 - 24918372
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24918475 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 24918376  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  24918375 gttc 24918372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39682646 - 39682547
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682646 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 39682547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 24529407 - 24529475
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529407 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 24529475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20261464 - 20261390
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20261464 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 20261390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24368019 - 24367945
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24368019 atacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgt 24367945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 24642609 - 24642679
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24642609 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 24642679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 32039419 - 32039489
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039419 gatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgt 32039489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 32214838 - 32214912
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32214838 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 32214912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38967781 - 38967711
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38967781 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 38967711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 571730 - 571631
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571730 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 571631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24681779 - 24681676
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24681779 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 24681680  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  24681679 gttc 24681676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25616483 - 25616415
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616483 cacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25616415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24671327 - 24671257
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24671327 cacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 24671257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25616426 - 25616365
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25616426 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23131197 - 23131096
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23131197 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatatt 23131098  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  23131097 gt 23131096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23133664 - 23133563
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23133664 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatatt 23133565  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  23133564 gt 23133563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 34402349 - 34402450
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34402349 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatatt 34402448  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  34402449 gt 34402450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 23707239 - 23707315
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  23707239 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 23707315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24918280 - 24918204
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  24918280 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 24918204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45029845
Alignment:
Q  202 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgt 45029845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18809244 - 18809177
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18809244 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18809177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 23711874 - 23711941
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23711874 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 23711941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26505680 - 26505615
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26505680 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 26505615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26508158 - 26508093
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26508158 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 26508093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 6726349 - 6726280
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  6726349 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 6726280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 24642771 - 24642847
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  24642771 atacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgt 24642847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Original strand, 45027768 - 45027832
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45027768 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 45027832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22105800 - 22105698
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||    
T  22105800 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgtt 22105701  T
Q  94 gtt 96  Q
    |||    
T  22105700 gtt 22105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28577400 - 28577333
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28577400 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgt 28577333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20261554 - 20261453
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20261554 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatatt 20261455  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  20261454 gt 20261453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24671165 - 24671091
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||    
T  24671165 atacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 24671091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 24898057 - 24898123
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24898057 acagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24898123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 24905494 - 24905560
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24905494 acagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24905560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 24907969 - 24908035
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24907969 acagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24908035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 10684680 - 10684756
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  10684680 atacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgt 10684756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 21154868 - 21154937
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  21154868 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 21154937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 10684623 - 10684691
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10684623 cacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 10684691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 23709393 - 23709460
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23709393 cacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 23709460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24368128 - 24368076
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgttt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24368128 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 24368076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 32039359 - 32039426
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  32039359 cacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatattgt 32039426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 24900540 - 24900606
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24900540 acagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgt 24900606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 24903017 - 24903083
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24903017 acagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgt 24903083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 24529464 - 24529510
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529464 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24681584 - 24681535
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24681584 atacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgttt 24681535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726229
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 6726229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 32214758 - 32214831
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32214758 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 32214831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 41523936 - 41524002
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  41523936 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 41524002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24368010
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 24368010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23135881 - 23135841
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23135881 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 23135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21154988
Alignment:
Q  48 attgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 21154988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105647
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatattgt 22105647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707250
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 23707250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642782
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 24642782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681573
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 24681573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967608
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 38967608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671154
Alignment:
Q  47 gattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 24671154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918269
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg-ttgcgaatacgatattgt 24918269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 87
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatac 87  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13989111 - 13989037
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989111 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 13989037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 21475004 - 21475078
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475004 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 21475078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 21923208 - 21923282
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923208 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 21923282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29298381 - 29298307
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298381 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 29298307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29776933 - 29776859
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776933 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 29776859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 22122984 - 22123058
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22122984 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgt 22123058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 16275280 - 16275354
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16275280 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgt 16275354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16362163 - 16362089
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16362163 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 16362089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21841008 - 21840938
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21841008 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 21840938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 23593651 - 23593725
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23593651 atacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 23593725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31612558 - 31612484
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31612558 atacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgt 31612484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 21474916 - 21475015
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattact-------ggacacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474916 ttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 21475015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 249
Target Start/End: Original strand, 22050806 - 22050866
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050806 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 23593594 - 23593662
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593594 cacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 23593662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 16275084 - 16275187
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16275084 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatatt 16275183  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  16275184 gttc 16275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Original strand, 15859925 - 15859988
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15859925 atacgatattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgatta 15859988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13989167 - 13989100
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13989167 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13989100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16362220 - 16362152
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16362220 cacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgt 16362152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 21923152 - 21923219
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21923152 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 21923219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 27161414 - 27161516
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  27161414 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatatt 27161513  T
Q  94 gtt 96  Q
    |||    
T  27161514 gtt 27161516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21841067 - 21841001
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21841067 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 21841001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 27161556 - 27161605
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161556 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 15859869 - 15859936
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  15859869 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgt 15859936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 22050664 - 22050766
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||    
T  22050664 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgtt 22050763  T
Q  94 gtt 96  Q
    |||    
T  22050764 gtt 22050766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29777075 - 29776973
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||    
T  29777075 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgtt 29776976  T
Q  94 gtt 96  Q
    |||    
T  29776975 gtt 29776973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 22122875 - 22122944
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  22122875 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 22122944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29298543 - 29298474
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  29298543 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 29298474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543222
Alignment:
Q  218 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 43543222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275291
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgt 16275291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 31612664 - 31612598
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | || |||||||||    
T  31612664 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtt 31612598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050817
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 22050817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776922
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29776922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13227198 - 13227132
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattact-------ggacacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227198 acttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 13227132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29535386 - 29535320
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattact-------ggacacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535386 acttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 29535320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298370
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29298370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612547
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgt 31612547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22122995
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatg-ttgtgaatacgatattgt 22122995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 95
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161567
Alignment:
Q  45 atgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 27161567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 16275177 - 16275209
Alignment:
Q  192 cgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16275177 cgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298421
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 29298421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13637 - 13563
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 13563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13725 - 13626
Alignment:
Q  3 ttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13725 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 13626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40645 - 40571
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40645 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgt 40571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 40698 - 40634
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40698 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 40634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30354 - 30251
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30354 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 30255  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  30254 gttc 30251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30158 - 30112
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30147
Alignment:
Q  46 tgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 30147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30264 - 30229
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30264 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 351 - 454
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 450  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  451 gttc 454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 97
Target Start/End: Original strand, 507 - 560
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 263
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12240
Alignment:
Q  217 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 12240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 547 - 582
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  547 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4993 - 4926
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993 agtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 4926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4939 - 4865
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4939 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgt 4865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 6763 - 6864
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattact-------ggacacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6763 acttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 6862  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  6863 gt 6864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 6853 - 6902
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6853 atactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 6902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10944
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11014 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 10944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11073 - 11007
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11073 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 11007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 38573 - 38647
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38573 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 38647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Original strand, 38521 - 38586
Alignment:
Q  32 tgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38521 tgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 38586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10093 - 10023
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10093 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 10023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10036 - 10001
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10036 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtt 78  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11591 - 11521
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11591 cacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 11521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11534 - 11461
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgattattatttgat 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11534 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgat 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10712
Alignment:
Q  32 tgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 10712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 10804 - 10878
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10804 atacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgt 10878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10811
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgata 10811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 224
Target Start/End: Original strand, 10699 - 10734
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10699 atacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 542 - 441
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  542 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatatt 443  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  442 gt 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 452 - 416
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 4130 - 4231
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4130 acttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatatt 4229  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  4230 gt 4231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 263
Target Start/End: Original strand, 4225 - 4296
Alignment:
Q  194 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  4225 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 4296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 35986 - 36057
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35986 gatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgt 36057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1599
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  1673 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgt 1599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1763 - 1662
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1763 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatatt 1664  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  1663 gt 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3268 - 3194
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3268 atacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 3194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3358 - 3257
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 3259  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  3258 gt 3257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9483 - 9413
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9483 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgt 9413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 9542 - 9476
Alignment:
Q  28 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9542 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 9476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 501329 - 501255
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  501329 atacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgt 501255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501316
Alignment:
Q  62 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 501316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 924 - 821
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  924 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatatt 825  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  824 gttc 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 729 - 653
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  729 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 718
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 57816 - 57713
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57816 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaatatgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 57717  T
Q  94 gttc 97  Q
    ||||    
T  57716 gttc 57713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15257 - 15156
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15257 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatatt 15158  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  15157 gt 15156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11251
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattact-------ggacacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11167 acttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15167 - 15091
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  15167 atactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 15091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 13454 - 13555
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13454 acttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatatt 13553  T
Q  94 gt 95  Q
    ||    
T  13554 gt 13555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43041 - 43002
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatg 66  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43041 cacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 53732 - 53802
Alignment:
Q  27 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53732 cacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttc 53802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 263
Target Start/End: Original strand, 53794 - 53865
Alignment:
Q  194 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  53794 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgt 53865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 1247 - 1319
Alignment:
Q  193 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  1247 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 1319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 15189 - 15265
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattattatttgatgt 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||    
T  15189 atacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 15265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15200
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgt 15200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 15040 - 15077
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15040 agtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatgt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9976 - 9932
Alignment:
Q  189 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9976 atacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9965
Alignment:
Q  44 tatgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 95  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgt 9965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10017
Alignment:
Q  46 tgattgatgaattagcatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 96  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtt 10017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 68296 - 68230
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattact-------ggacacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 60  Q
    |||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68296 acttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 68230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6786 - 6713
Alignment:
Q  1 acttgagttatggtcaaattactggac-------acagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6786 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 6713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8038 - 7996
Alignment:
Q  30 agtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgtatgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8038 agtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University