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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9413_low_10 (Length: 306)

Name: NF9413_low_10
Description: NF9413
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9413_low_10
NF9413_low_10
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (1-296)||(18663022-18663317)
chr3 (1-296)||(18663223-18663518)
chr3 (24-296)||(18663424-18663696)
chr3 (39-179)||(18662938-18663078)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-296)||(13671188-13671483)
chr4 (1-296)||(13656542-13656837)
chr4 (1-296)||(13671389-13671684)
chr4 (24-296)||(5739240-5739512)
chr4 (24-296)||(13671590-13671862)
chr4 (24-296)||(13656743-13657015)
chr4 (1-179)||(5739156-5739334)
chr4 (39-179)||(13671104-13671244)
chr4 (54-179)||(13656458-13656583)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (1-296)||(18581523-18581818)
chr5 (24-296)||(18581345-18581617)
chr5 (54-179)||(18581777-18581902)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (1-296)||(37461194-37461489)
chr2 (65-296)||(37461057-37461288)
chr2 (54-179)||(37461448-37461573)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-296)||(12923800-12924092)
chr6 (1-229)||(12923599-12923827)
chr6 (24-296)||(12923421-12923693)
chr6 (54-179)||(12924051-12924176)
chr6 (150-209)||(19540742-19540801)
chr6 (150-222)||(19540631-19540702)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (35-299)||(22565-22829)
scaffold0014 (39-179)||(22770-22910)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18663317 - 18663022
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663317 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 18663218  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663217 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 18663118  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663117 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 18663022  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18663518 - 18663223
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663518 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 18663419  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663418 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 18663319  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   | | |  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18663318 tacatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 18663223  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18663696 - 18663424
Alignment:
Q  24 ccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 123  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663696 ccaacaatccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 18663597  T
Q  124 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18663596 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaata 18663497  T
Q  224 tccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||   | | | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18663496 tccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 18663424  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18663078 - 18662938
Alignment:
Q  39 tacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctccc 138  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18663078 tacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctccc 18662979  T
Q  139 acttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  18662978 acctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 18662938  T

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Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13671483 - 13671188
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671483 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 13671384  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671383 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 13671284  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671283 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 13671188  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13656837 - 13656542
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656837 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccatatatacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 13656738  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656737 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 13656638  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656637 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaaagaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 13656542  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13671684 - 13671389
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671684 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 13671585  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671584 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 13671485  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   | | | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  13671484 tacatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 13671389  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5739512 - 5739240
Alignment:
Q  24 ccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 123  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739512 ccaacaatccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaatttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 5739413  T
Q  124 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739412 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaata 5739313  T
Q  224 tccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||   | | | |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5739312 tccaacaatcgctatctacaaagcagcctacacatcatctcatatctcaaacacatacaaatttcccaccttt 5739240  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13671862 - 13671590
Alignment:
Q  24 ccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 123  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671862 ccaacaatccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 13671763  T
Q  124 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13671762 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaata 13671663  T
Q  224 tccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||   | | | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  13671662 tccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 13671590  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13657015 - 13656743
Alignment:
Q  24 ccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 123  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657015 ccaacaatccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 13656916  T
Q  124 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13656915 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatatccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaata 13656816  T
Q  224 tccaac-ttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||  ||||  |  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  13656815 tccaacaatcca-tatatacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 13656743  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5739334 - 5739156
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5739334 acatctaacacaccttcaaatatccaacaatcgctatctacaaagcagcctacacatcatctcatatctcaaacacatacaaatttcccacctttcctct 5739235  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5739234 ctactccaagtccacaaatgtctacaattcatactcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 5739156  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13671244 - 13671104
Alignment:
Q  39 tacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctccc 138  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  13671244 tacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctccc 13671145  T
Q  139 acttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  13671144 acctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 13671104  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13656583 - 13656458
Alignment:
Q  54 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  13656583 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaatacct 13656484  T
Q  154 acaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||    
T  13656483 acaaatatccaatctccccactctac 13656458  T

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Target: chr5 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 18581523 - 18581818
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581523 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 18581622  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581623 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 18581722  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581723 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaatcgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 18581818  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Original strand, 18581345 - 18581617
Alignment:
Q  24 ccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 123  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581345 ccaacaatccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 18581444  T
Q  124 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaata 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18581445 actgtccatgctcccatttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccgctctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaata 18581544  T
Q  224 tccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||   | | | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  18581545 tccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 18581617  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 18581777 - 18581902
Alignment:
Q  54 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  18581777 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctctcacctctcaaatacct 18581876  T
Q  154 acaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||    
T  18581877 acaaatatccaatctccccactctac 18581902  T

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Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 37461194 - 37461489
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37461194 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccttatttacaaagcatcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 37461293  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37461294 ctacttcaagtccacaaatgtctactttccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 37461393  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37461394 tacatctaacacaccttcaaatatccaatttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 37461489  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 65 - 296
Target Start/End: Original strand, 37461057 - 37461288
Alignment:
Q  65 tatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaataccca 164  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37461057 tatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctaatgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaataccca 37461156  T
Q  165 acaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatccc 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |   |  ||||| ||| || | ||||||||||    
T  37461157 acaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccttatttacaaagcatcctacacatcatccc 37461256  T
Q  265 atatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  37461257 atatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 37461288  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 37461448 - 37461573
Alignment:
Q  54 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  37461448 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaatacct 37461547  T
Q  154 acaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||    
T  37461548 acaaatatccaatctccccactctac 37461573  T

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Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 12923800 - 12924092
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12923800 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatttacaaagcaacctacacatcatccc---tctcaaaaaaatacaaacttcccacctttcctct 12923896  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923897 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 12923996  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923997 tacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 12924092  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 12923599 - 12923827
Alignment:
Q  1 acatctaaaacaccttcaaatatccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923599 acatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctct 12923698  T
Q  101 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923699 ctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatct 12923798  T
Q  201 tacatctaacacaccttcaaatatccaac 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12923799 tacatctaaaacaccttcaaatatccaac 12923827  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Original strand, 12923421 - 12923693
Alignment:
Q  24 ccaaaaatccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 123  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923421 ccaacaatccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtct 12923520  T
Q  124 actgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaata 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12923521 actatccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaata 12923620  T
Q  224 tccaacttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccaccttt 296  Q
    ||||||   | | | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  12923621 tccaacaatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccaccttt 12923693  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 12924051 - 12924176
Alignment:
Q  54 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 153  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  12924051 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaatacct 12924150  T
Q  154 acaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
    ||| ||| ||||   |||||||||||    
T  12924151 acatatatccaatctccccactctac 12924176  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19540801 - 19540742
Alignment:
Q  150 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  19540801 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggcaacctacatatcatctcacatctaa 19540742  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19540702 - 19540631
Alignment:
Q  150 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaat 222  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19540702 acctacaaatatc-aacaacaccactctacaaggaaatctacacatcatcttacatctaaaataccttcaaat 19540631  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 35 - 299
Target Start/End: Original strand, 22565 - 22829
Alignment:
Q  35 tatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgc 134  Q
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T  22565 tatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactttccatgc 22664  T
Q  135 tcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaacttcca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22665 tcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaatttcca 22764  T
Q  235 caacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22765 caacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgct 22829  T

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Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 22770 - 22910
Alignment:
Q  39 tacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctccc 138  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22770 tacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctccc 22869  T
Q  139 acttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 179  Q
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T  22870 acctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 22910  T

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