View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9415_low_9 (Length: 351)

Name: NF9415_low_9
Description: NF9415
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9415_low_9
NF9415_low_9
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (1-347)||(40473851-40474197)
chr4 (1-347)||(19777648-19777994)
chr4 (1-347)||(8387223-8387569)
chr4 (1-347)||(12477411-12477757)
chr4 (1-347)||(23956558-23956904)
chr4 (1-347)||(8052478-8052824)
chr4 (1-347)||(29038259-29038605)
chr4 (1-334)||(18226314-18226647)
chr4 (1-337)||(14302843-14303179)
chr4 (1-348)||(27712147-27712494)
chr4 (1-347)||(14681378-14681724)
chr4 (1-347)||(18298016-18298362)
chr4 (1-347)||(12524487-12524833)
chr4 (1-347)||(15146740-15147086)
chr4 (31-337)||(14850231-14850537)
chr4 (9-347)||(14160289-14160627)
chr4 (1-337)||(16354310-16354646)
chr4 (9-263)||(1639364-1639618)
chr4 (1-334)||(7091243-7091576)
chr4 (28-337)||(8706756-8707065)
chr4 (31-351)||(15002475-15002795)
chr4 (31-349)||(15246765-15247083)
chr4 (55-349)||(15358233-15358527)
chr4 (38-350)||(27901234-27901546)
chr4 (31-326)||(3263930-3264225)
chr4 (38-349)||(1648390-1648701)
chr4 (31-326)||(33223764-33224059)
chr4 (28-348)||(15414140-15414460)
chr4 (31-326)||(11206367-11206662)
chr4 (142-332)||(14695065-14695255)
chr4 (31-347)||(15078476-15078792)
chr4 (31-326)||(29452673-29452968)
chr4 (31-326)||(44661002-44661297)
chr4 (82-295)||(15320042-15320255)
chr4 (78-338)||(16148599-16148859)
chr4 (78-338)||(16152745-16153005)
chr4 (37-323)||(20891829-20892115)
chr4 (100-334)||(18614692-18614911)
chr4 (31-98)||(14691743-14691810)
chr4 (1-49)||(16251598-16251646)
chr4 (262-349)||(51605905-51605992)
chr4 (37-86)||(38811754-38811803)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (1-347)||(26791753-26792099)
chr3 (1-347)||(10906640-10906986)
chr3 (1-347)||(13253120-13253466)
chr3 (1-336)||(15339699-15340034)
chr3 (1-347)||(5424284-5424630)
chr3 (1-347)||(15588746-15589092)
chr3 (1-347)||(20061408-20061754)
chr3 (1-337)||(15724298-15724634)
chr3 (3-347)||(16411636-16411980)
chr3 (1-347)||(10006030-10006376)
chr3 (1-347)||(15347599-15347945)
chr3 (1-347)||(16636203-16636549)
chr3 (1-347)||(43163527-43163873)
chr3 (1-347)||(48425877-48426223)
chr3 (1-337)||(16806290-16806626)
chr3 (1-337)||(16371843-16372178)
chr3 (1-336)||(14125959-14126294)
chr3 (1-344)||(14875856-14876198)
chr3 (1-336)||(15401882-15402210)
chr3 (5-269)||(16756017-16756281)
chr3 (4-336)||(6601169-6601501)
chr3 (6-333)||(53384386-53384713)
chr3 (1-334)||(12498678-12499011)
chr3 (1-310)||(16692594-16692903)
chr3 (1-260)||(15062174-15062433)
chr3 (1-348)||(17490280-17490627)
chr3 (31-349)||(14574393-14574711)
chr3 (7-310)||(15248583-15248886)
chr3 (1-310)||(15209321-15209630)
chr3 (31-351)||(16827542-16827862)
chr3 (1-333)||(16491549-16491881)
chr3 (31-326)||(10384438-10384733)
chr3 (37-348)||(15228125-15228436)
chr3 (31-349)||(4678908-4679226)
chr3 (31-349)||(41177992-41178310)
chr3 (31-326)||(47124414-47124709)
chr3 (113-347)||(14580296-14580530)
chr3 (1-209)||(9523149-9523357)
chr3 (31-349)||(8758423-8758741)
chr3 (31-349)||(17493100-17493418)
chr3 (31-349)||(31694527-31694845)
chr3 (31-347)||(13942494-13942810)
chr3 (31-326)||(28754788-28755083)
chr3 (37-349)||(11303114-11303426)
chr3 (31-349)||(11960510-11960828)
chr3 (31-349)||(16380269-16380587)
chr3 (37-347)||(44777723-44778033)
chr3 (31-351)||(14087143-14087463)
chr3 (37-349)||(31939379-31939691)
chr3 (31-326)||(16337876-16338171)
chr3 (31-349)||(18133687-18134005)
chr3 (40-323)||(16329027-16329310)
chr3 (78-332)||(13319860-13320114)
chr3 (172-348)||(15234128-15234304)
chr3 (217-349)||(12359868-12360000)
chr3 (31-346)||(13971464-13971779)
chr3 (31-349)||(16835851-16836169)
chr3 (31-351)||(10419384-10419704)
chr3 (32-293)||(15015164-15015425)
chr3 (148-332)||(13299880-13300064)
chr3 (148-332)||(13310538-13310722)
chr3 (55-179)||(12360053-12360177)
chr3 (46-88)||(266908-266950)
chr3 (40-74)||(6152478-6152512)
chr3 (34-88)||(17193567-17193621)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (1-348)||(19483621-19483968)
chr8 (1-336)||(18857454-18857789)
chr8 (1-336)||(22128527-22128862)
chr8 (1-347)||(17673581-17673927)
chr8 (1-337)||(30312712-30313048)
chr8 (1-347)||(19113567-19113913)
chr8 (1-337)||(22132609-22132945)
chr8 (1-348)||(19978844-19979191)
chr8 (1-344)||(32601021-32601364)
chr8 (1-348)||(16407602-16407950)
chr8 (1-336)||(22119743-22120078)
chr8 (1-348)||(21166095-21166442)
chr8 (1-337)||(15534257-15534596)
chr8 (4-337)||(22040739-22041072)
chr8 (1-337)||(21921304-21921640)
chr8 (1-334)||(22988073-22988406)
chr8 (1-348)||(23650918-23651265)
chr8 (31-334)||(22247988-22248291)
chr8 (1-337)||(21043322-21043658)
chr8 (31-349)||(23655834-23656152)
chr8 (31-334)||(22377025-22377328)
chr8 (31-334)||(22383200-22383503)
chr8 (3-257)||(23949798-23950052)
chr8 (31-349)||(1267145-1267463)
chr8 (37-351)||(19852324-19852638)
chr8 (37-351)||(19858360-19858674)
chr8 (1-149)||(12274445-12274593)
chr8 (31-351)||(21841324-21841644)
chr8 (28-335)||(20389003-20389310)
chr8 (3-269)||(21393501-21393767)
chr8 (3-269)||(21787995-21788261)
chr8 (31-349)||(31570398-31570716)
chr8 (1-332)||(21251818-21252152)
chr8 (31-349)||(31416030-31416348)
chr8 (31-326)||(803252-803547)
chr8 (28-293)||(20395744-20396002)
chr8 (31-326)||(14566049-14566344)
chr8 (31-334)||(20009491-20009793)
chr8 (100-351)||(20985101-20985352)
chr8 (31-275)||(16270854-16271098)
chr8 (103-350)||(20975206-20975453)
chr8 (31-349)||(22051770-22052088)
chr8 (37-326)||(6604571-6604860)
chr8 (37-326)||(6680024-6680313)
chr8 (31-320)||(12305665-12305954)
chr8 (31-323)||(27355455-27355746)
chr8 (31-324)||(22371847-22372140)
chr8 (78-326)||(29303005-29303253)
chr8 (1-85)||(22164012-22164096)
chr8 (175-293)||(23886075-23886193)
chr8 (34-88)||(20652150-20652204)
chr8 (34-88)||(22983343-22983397)
chr8 (36-187)||(22316103-22316254)
chr8 (37-88)||(25283043-25283094)
chr8 (37-88)||(25283269-25283320)
chr8 (133-206)||(22623563-22623636)
chr8 (38-74)||(23156843-23156879)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (1-348)||(41352848-41353195)
chr1 (1-347)||(51332680-51333026)
chr1 (1-336)||(21831129-21831464)
chr1 (1-347)||(33390216-33390562)
chr1 (1-265)||(21837776-21838040)
chr1 (1-346)||(16349786-16350132)
chr1 (1-337)||(17044212-17044548)
chr1 (1-337)||(16077853-16078189)
chr1 (1-269)||(19107194-19107462)
chr1 (1-348)||(21749767-21750113)
chr1 (31-332)||(22109878-22110179)
chr1 (31-332)||(22113727-22114028)
chr1 (1-337)||(50619441-50619777)
chr1 (31-337)||(16373385-16373691)
chr1 (5-337)||(20139660-20139992)
chr1 (1-348)||(22361430-22361777)
chr1 (70-334)||(21025068-21025332)
chr1 (1-338)||(20250628-20250964)
chr1 (31-349)||(20939248-20939566)
chr1 (1-293)||(19760114-19760399)
chr1 (31-349)||(19855161-19855479)
chr1 (31-349)||(24098788-24099106)
chr1 (31-301)||(20295268-20295538)
chr1 (31-349)||(19662322-19662640)
chr1 (217-347)||(23197433-23197563)
chr1 (31-349)||(20835085-20835391)
chr1 (31-326)||(31539205-31539500)
chr1 (31-326)||(37677936-37678231)
chr1 (38-351)||(20855943-20856257)
chr1 (31-320)||(21951765-21952054)
chr1 (1-107)||(20937740-20937846)
chr1 (227-337)||(21234928-21235038)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (1-347)||(16625977-16626323)
chr6 (1-347)||(25113227-25113573)
chr6 (1-347)||(29591180-29591526)
chr6 (1-347)||(1542344-1542690)
chr6 (1-347)||(24312428-24312774)
chr6 (1-347)||(2874063-2874409)
chr6 (1-269)||(27188111-27188379)
chr6 (1-269)||(27260861-27261129)
chr6 (1-347)||(19865362-19865708)
chr6 (4-269)||(28262535-28262800)
chr6 (4-269)||(28341284-28341549)
chr6 (1-348)||(22077949-22078296)
chr6 (1-260)||(27566327-27566586)
chr6 (1-337)||(16962715-16963051)
chr6 (1-348)||(22761714-22762061)
chr6 (1-337)||(16926910-16927246)
chr6 (1-336)||(22434544-22434879)
chr6 (1-336)||(22442942-22443277)
chr6 (1-348)||(27330692-27331039)
chr6 (1-348)||(27391432-27391779)
chr6 (1-337)||(25609131-25609467)
chr6 (1-337)||(18407212-18407548)
chr6 (1-337)||(23079144-23079480)
chr6 (4-347)||(5838479-5838822)
chr6 (1-348)||(20636560-20636907)
chr6 (31-337)||(18196995-18197304)
chr6 (7-348)||(15896775-15897116)
chr6 (31-334)||(21472306-21472609)
chr6 (28-337)||(19488542-19488851)
chr6 (31-334)||(25768896-25769199)
chr6 (31-338)||(8762202-8762509)
chr6 (31-349)||(19435707-19436025)
chr6 (4-156)||(28291823-28291975)
chr6 (37-351)||(19454131-19454445)
chr6 (31-349)||(28282071-28282389)
chr6 (1-289)||(18966610-18966898)
chr6 (31-349)||(5296464-5296782)
chr6 (31-349)||(10468107-10468425)
chr6 (31-326)||(24365117-24365412)
chr6 (31-351)||(19880003-19880323)
chr6 (38-350)||(34644843-34645155)
chr6 (31-351)||(18795395-18795715)
chr6 (158-269)||(28288011-28288122)
chr6 (31-349)||(15460041-15460359)
chr6 (38-351)||(14380723-14381036)
chr6 (30-293)||(18436309-18436576)
chr6 (144-351)||(14379173-14379380)
chr6 (78-351)||(21563388-21563661)
chr6 (78-351)||(21569247-21569520)
chr6 (36-88)||(23027235-23027287)
chr6 (277-337)||(27565091-27565151)
chr6 (128-187)||(18837328-18837387)
chr6 (31-118)||(27560106-27560193)
chr6 (34-88)||(16098758-16098812)
chr6 (31-107)||(22796132-22796208)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-347)||(27371711-27372057)
chr2 (1-347)||(24710476-24710822)
chr2 (1-347)||(9610578-9610924)
chr2 (1-347)||(16925802-16926148)
chr2 (1-347)||(16999442-16999788)
chr2 (1-347)||(21144696-21145042)
chr2 (1-337)||(21324931-21325267)
chr2 (1-347)||(10869292-10869638)
chr2 (1-347)||(24262812-24263158)
chr2 (1-337)||(22324521-22324857)
chr2 (1-347)||(16923331-16923677)
chr2 (1-347)||(16982594-16982940)
chr2 (1-347)||(17064159-17064505)
chr2 (1-347)||(17067817-17068163)
chr2 (1-347)||(24876404-24876750)
chr2 (1-347)||(27218458-27218804)
chr2 (1-337)||(41608050-41608386)
chr2 (1-347)||(44385224-44385570)
chr2 (1-347)||(22756120-22756466)
chr2 (1-337)||(24675931-24676267)
chr2 (3-337)||(24707147-24707481)
chr2 (1-333)||(23107399-23107731)
chr2 (1-337)||(23066833-23067169)
chr2 (1-337)||(21890383-21890719)
chr2 (1-337)||(24819351-24819687)
chr2 (31-349)||(27788213-27788531)
chr2 (31-349)||(12574825-12575143)
chr2 (31-326)||(1064223-1064518)
chr2 (31-326)||(31831130-31831425)
chr2 (103-349)||(23277320-23277566)
chr2 (31-337)||(23294407-23294713)
chr2 (31-326)||(20828731-20829026)
chr2 (31-293)||(20833457-20833719)
chr2 (31-348)||(27364733-27365050)
chr2 (38-349)||(19651703-19652016)
chr2 (28-293)||(30210626-30210890)
chr2 (28-239)||(45529980-45530191)
chr2 (38-351)||(27209823-27210136)
chr2 (142-348)||(23111318-23111525)
chr2 (31-219)||(11357657-11357845)
chr2 (31-349)||(24949061-24949380)
chr2 (217-351)||(23099669-23099803)
chr2 (34-88)||(23816957-23817011)
chr2 (128-187)||(12640048-12640107)
chr2 (31-107)||(24642214-24642290)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-347)||(41771585-41771931)
chr5 (1-347)||(40709523-40709869)
chr5 (1-337)||(29475380-29475716)
chr5 (1-348)||(19770703-19771050)
chr5 (4-347)||(22332184-22332527)
chr5 (1-347)||(16357245-16357591)
chr5 (1-347)||(22135411-22135757)
chr5 (1-347)||(27519150-27519496)
chr5 (1-347)||(34567237-34567583)
chr5 (4-337)||(18776516-18776849)
chr5 (3-348)||(27667786-27668131)
chr5 (1-347)||(27611097-27611443)
chr5 (1-337)||(27684707-27685043)
chr5 (1-337)||(14999046-14999382)
chr5 (1-337)||(20800191-20800527)
chr5 (1-344)||(23440953-23441296)
chr5 (1-348)||(23574480-23574819)
chr5 (1-346)||(37290794-37291139)
chr5 (1-248)||(22349166-22349413)
chr5 (6-348)||(21881697-21882039)
chr5 (5-348)||(23517273-23517616)
chr5 (1-337)||(26738034-26738370)
chr5 (1-337)||(21338604-21338940)
chr5 (1-310)||(25423932-25424240)
chr5 (1-293)||(20467448-20467740)
chr5 (31-326)||(24797715-24798010)
chr5 (31-349)||(17268629-17268947)
chr5 (32-351)||(21890052-21890371)
chr5 (37-338)||(24619601-24619902)
chr5 (37-338)||(24715832-24716133)
chr5 (37-338)||(24748860-24749161)
chr5 (31-313)||(21496828-21497110)
chr5 (31-349)||(23079384-23079702)
chr5 (28-337)||(21831068-21831377)
chr5 (31-323)||(14886312-14886604)
chr5 (31-326)||(37542699-37542994)
chr5 (82-348)||(21563269-21563535)
chr5 (38-351)||(20822215-20822528)
chr5 (31-351)||(21680071-21680391)
chr5 (31-326)||(20343037-20343332)
chr5 (31-326)||(25848830-25849125)
chr5 (31-245)||(23472002-23472216)
chr5 (32-349)||(22235215-22235532)
chr5 (38-351)||(22462714-22463026)
chr5 (31-320)||(22503434-22503723)
chr5 (103-351)||(20774586-20774834)
chr5 (103-351)||(28894235-28894483)
chr5 (103-351)||(28915706-28915954)
chr5 (103-351)||(28923061-28923309)
chr5 (27-206)||(21407907-21408086)
chr5 (133-187)||(21936645-21936699)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-347)||(108929-109275)
scaffold0029 (31-351)||(113431-113751)
scaffold0029 (103-351)||(95116-95364)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (1-347)||(8708405-8708751)
chr7 (1-335)||(11236349-11236683)
chr7 (1-347)||(10871795-10872141)
chr7 (1-347)||(44790475-44790821)
chr7 (1-344)||(9596857-9597200)
chr7 (1-347)||(8199428-8199774)
chr7 (1-347)||(18550882-18551228)
chr7 (1-347)||(18178542-18178888)
chr7 (1-337)||(16452-16786)
chr7 (1-337)||(13686864-13687200)
chr7 (1-269)||(23202815-23203083)
chr7 (1-269)||(23508942-23509210)
chr7 (1-347)||(14333197-14333542)
chr7 (1-347)||(11552226-11552572)
chr7 (1-347)||(14955358-14955700)
chr7 (1-337)||(15160191-15160527)
chr7 (1-347)||(12688301-12688646)
chr7 (1-337)||(15204419-15204755)
chr7 (1-334)||(14040495-14040828)
chr7 (1-334)||(14350525-14350858)
chr7 (5-348)||(321160-321503)
chr7 (31-334)||(11771378-11771681)
chr7 (1-310)||(15153818-15154127)
chr7 (31-351)||(14263342-14263662)
chr7 (101-337)||(14212574-14212810)
chr7 (28-293)||(15625379-15625646)
chr7 (28-348)||(12205901-12206221)
chr7 (31-351)||(19148042-19148362)
chr7 (31-351)||(20747441-20747761)
chr7 (31-349)||(23504970-23505288)
chr7 (31-349)||(15101703-15102021)
chr7 (31-349)||(18053053-18053371)
chr7 (31-349)||(13666368-13666686)
chr7 (31-326)||(26117728-26118023)
chr7 (31-349)||(16071395-16071712)
chr7 (31-349)||(13022188-13022506)
chr7 (31-349)||(14434522-14434840)
chr7 (31-349)||(15341262-15341580)
chr7 (31-349)||(16949572-16949889)
chr7 (31-351)||(19613506-19613826)
chr7 (31-326)||(11305386-11305681)
chr7 (31-326)||(49153132-49153427)
chr7 (31-326)||(12456533-12456828)
chr7 (31-326)||(13967791-13968086)
chr7 (31-349)||(507-825)
chr7 (31-351)||(11387526-11387846)
chr7 (100-349)||(14285476-14285725)
chr7 (31-230)||(8211347-8211546)
chr7 (31-293)||(12457471-12457733)
chr7 (32-173)||(21662792-21662933)
chr7 (31-179)||(14130704-14130852)
chr7 (34-187)||(4440761-4440914)
chr7 (36-187)||(13353985-13354136)
chr7 (34-74)||(45147385-45147425)
chr7 (142-186)||(13455688-13455732)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-336)||(7781-8116)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-344)||(32694-33037)
scaffold0109 (1-337)||(9438-9774)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (1-347)||(3036-3382)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-331)||(13310-13640)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-269)||(8208-8476)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-269)||(43996-44264)
scaffold0028 (1-347)||(9316-9662)
scaffold0028 (3-347)||(15780-16124)
scaffold0028 (31-351)||(49628-49948)
scaffold0028 (126-348)||(733-955)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (3-337)||(66249-66583)
scaffold0042 (1-337)||(38948-39284)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-337)||(3533-3869)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-347)||(181041-181387)
scaffold0020 (31-264)||(100750-100986)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-347)||(63149-63495)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-310)||(277985-278294)
scaffold0005 (31-349)||(261180-261498)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-348)||(12900-13247)
scaffold0120 (1-348)||(6865-7209)
scaffold0120 (133-347)||(670-883)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (1-348)||(34868-35215)
scaffold0081 (1-348)||(19444-19791)
scaffold0081 (1-348)||(50274-50621)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (36-337)||(56894-57195)
scaffold0017 (1-337)||(196606-196942)
scaffold0017 (52-344)||(19188-19480)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (2-337)||(8240-8575)
scaffold0080 (69-344)||(49093-49368)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-344)||(79615-79958)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-344)||(6856-7199)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-332)||(112621-112952)
scaffold0040 (31-332)||(15749-16050)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-310)||(229885-230194)
scaffold0012 (31-334)||(218548-218851)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-348)||(16497-16843)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-344)||(28493-28836)
scaffold0023 (1-337)||(3585-3921)
scaffold0023 (8-333)||(130956-131281)
scaffold0023 (56-289)||(59652-59885)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-337)||(31881-32217)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-337)||(25816-26152)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-203)||(8632-8834)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-221)||(1256-1476)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-337)||(2942-3278)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-348)||(17094-17441)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (6-215)||(22714-22923)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (73-269)||(130-326)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (33-337)||(4745-5049)
scaffold0270 (33-337)||(11875-12179)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (1-348)||(1184-1531)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-348)||(1518-1865)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (31-334)||(4903-5206)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-283)||(5-287)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (5-348)||(6067-6410)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (76-348)||(4470-4742)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-348)||(8204-8551)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-344)||(29787-30130)
scaffold0026 (31-351)||(28929-29249)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-236)||(3216-3451)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (19-337)||(102093-102411)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-334)||(538-871)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-337)||(7019-7355)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (31-337)||(9842-10148)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (1-348)||(2107-2458)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (56-348)||(26061-26353)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (30-293)||(116077-116340)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (35-334)||(25664-25963)
scaffold0011 (31-349)||(149442-149760)
scaffold0011 (37-349)||(194820-195132)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (31-349)||(5622-5940)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-337)||(1735-2071)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (37-349)||(802-1114)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (56-332)||(2811-3087)
scaffold0010 (31-326)||(41472-41767)
scaffold0010 (32-349)||(46515-46832)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (31-334)||(17553-17856)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (31-349)||(13017-13335)
scaffold0034 (38-351)||(68249-68562)
scaffold0034 (31-349)||(4069-4387)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (1-333)||(19473-19805)
scaffold0114 (31-349)||(20772-21090)
scaffold0114 (31-349)||(45389-45707)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-337)||(11325-11661)
scaffold0018 (1-337)||(17517-17853)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (3-332)||(7464-7793)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (32-349)||(3664-3981)
scaffold0403 (1-269)||(7214-7482)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (31-351)||(3048-3368)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (1-209)||(24340-24548)
scaffold0198 (236-347)||(24544-24655)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-337)||(3982-4318)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (28-293)||(1777-2042)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (28-337)||(24200-24509)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (32-348)||(32283-32600)
scaffold0106 (1-154)||(14881-15034)
scaffold0106 (1-98)||(18221-18319)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-293)||(14251-14543)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (1-333)||(19134-19466)
scaffold0324 (100-333)||(14343-14576)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (31-351)||(48148-48468)
scaffold0053 (31-349)||(56963-57281)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (31-349)||(11173-11491)
scaffold0298 (31-349)||(14943-15261)
scaffold0298 (37-349)||(20861-21173)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (4-344)||(6894-7234)
scaffold0358 (171-337)||(3737-3903)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (31-351)||(5302-5622)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (37-348)||(3629-3940)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (37-351)||(176-490)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (28-322)||(22519-22813)
scaffold0261 (37-322)||(14340-14625)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (31-349)||(28097-28415)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (31-349)||(19992-20310)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (38-351)||(762-1075)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (31-351)||(741-1061)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (31-351)||(10665-10985)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (31-351)||(1087-1406)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (31-351)||(27396-27716)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (28-348)||(39876-40196)
scaffold0064 (28-119)||(28114-28205)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (37-351)||(18226-18541)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (102-349)||(89561-89808)
scaffold0001 (102-349)||(90239-90486)
scaffold0001 (1-176)||(390489-390664)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (28-350)||(9923-10245)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (31-347)||(20559-20875)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (31-349)||(4568-4886)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (32-349)||(2461-2778)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (31-349)||(15829-16147)
scaffold0089 (219-337)||(10497-10615)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (151-351)||(48096-48296)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (31-347)||(51298-51614)
scaffold0067 (31-347)||(60332-60648)
scaffold0067 (31-347)||(66720-67036)
scaffold0067 (256-349)||(27722-27815)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (31-334)||(18346-18646)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (217-351)||(1968-2102)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (31-349)||(7261-7579)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (31-349)||(43655-43973)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (31-311)||(51017-51297)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (28-337)||(202596-202905)
scaffold0004 (103-349)||(323648-323894)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (31-326)||(56039-56334)
scaffold0076 (31-351)||(32791-33111)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (31-349)||(2471-2789)
scaffold0222 (31-349)||(7932-8250)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (83-349)||(48322-48588)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (32-348)||(197-513)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (31-351)||(4648-4968)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (109-349)||(2601-2841)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (31-323)||(27133-27425)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-183)||(2309-2491)
scaffold0621 (223-337)||(2500-2614)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (31-349)||(13415-13733)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (31-349)||(80948-81266)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-97)||(15202-15298)
scaffold0044 (1-97)||(1462-1558)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (78-349)||(2446-2717)
scaffold0476 (1-119)||(10159-10277)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (31-349)||(6085-6403)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (31-349)||(6354-6672)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (103-351)||(347-596)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (31-335)||(279-583)
scaffold0139 (126-349)||(28184-28407)
scaffold0139 (126-349)||(34437-34660)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (31-326)||(32458-32753)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (31-326)||(20266-20561)
scaffold0104 (31-326)||(23086-23381)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (31-349)||(41789-42107)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (31-349)||(249485-249803)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (32-213)||(24971-25152)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (103-351)||(19793-20041)
scaffold0090 (103-351)||(23955-24203)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (126-349)||(11700-11923)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (78-349)||(5452-5722)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (40-293)||(4764-5017)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-158)||(1-158)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (31-349)||(13070-13390)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (220-351)||(39-170)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (31-349)||(11902-12220)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (37-349)||(24992-25293)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (217-349)||(59-191)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (150-337)||(39031-39218)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (126-293)||(10188-10355)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (1-119)||(39357-39475)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (193-348)||(18074-18229)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (38-349)||(10573-10884)
scaffold0235 (38-349)||(20787-21098)
scaffold0235 (128-187)||(26775-26834)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (232-332)||(3405-3505)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (232-332)||(30418-30518)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (246-349)||(40785-40888)
scaffold0102 (31-179)||(40610-40758)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (28-239)||(85745-85955)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (31-244)||(34060-34273)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (31-179)||(736-884)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (211-351)||(6799-6939)
scaffold0117 (34-74)||(815-855)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (237-326)||(6230-6319)
scaffold0585 (31-182)||(6319-6470)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (152-203)||(29816-29867)
scaffold0215 (226-347)||(29689-29810)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (261-348)||(177379-177466)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (56-150)||(15738-15832)
scaffold0282 (232-334)||(15613-15715)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (294-349)||(6446-6501)
scaffold0149 (294-349)||(10877-10932)
scaffold0149 (31-180)||(6521-6670)
scaffold0149 (31-180)||(10952-11101)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (152-284)||(27926-28058)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (31-98)||(12366-12433)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (38-173)||(7063-7198)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (34-88)||(24755-24809)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (217-326)||(16-125)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (31-161)||(17841-17971)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (34-74)||(32804-32844)
scaffold0021 (128-187)||(24931-24990)
scaffold0021 (34-74)||(72064-72104)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (128-187)||(15045-15104)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (128-187)||(3222-3281)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (37-88)||(9444-9495)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (38-88)||(47033-47083)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (34-187)||(10169-10322)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 40473851 - 40474197
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473851 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 40473950  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473951 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 40474050  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  40474051 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatta 40474150  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  40474151 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcagctttatgtgcttc 40474197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19777994 - 19777648
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777994 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 19777895  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777894 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttaaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 19777795  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  19777794 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 19777695  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19777694 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 19777648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 8387223 - 8387569
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387223 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 8387322  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387323 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 8387422  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  8387423 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 8387522  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8387523 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 8387569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 12477411 - 12477757
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477411 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 12477510  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477511 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 12477610  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  12477611 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 12477710  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  12477711 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 12477757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 23956558 - 23956904
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956558 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 23956657  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956658 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 23956757  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  23956758 catcttcttaatctcttcattgtcctggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 23956857  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  23956858 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 23956904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8052824 - 8052478
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052824 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 8052725  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8052724 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaatctcttcaagaat 8052625  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||  |||||||| | |       
T  8052624 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatct 8052525  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8052524 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 8052478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29038605 - 29038259
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038605 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 29038506  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038505 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 29038406  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  29038405 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 29038306  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  29038305 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 29038259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18226647 - 18226314
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18226647 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 18226548  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18226547 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaattgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 18226448  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| || ||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  18226447 cattttcttcatatctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgctcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 18226348  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  18226347 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 18226314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14303179 - 14302843
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303179 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 14303080  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303079 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 14302980  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  14302979 catcttcttaaactctttattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 14302880  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  14302879 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactt 14302843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 27712147 - 27712494
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27712147 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcctagtaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 27712246  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27712247 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27712346  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||  | |       
T  27712347 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatct 27712446  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  27712447 ctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttct 27712494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14681378 - 14681724
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681378 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 14681477  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14681478 gtttcaaaccaggccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaat 14681577  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  14681578 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 14681677  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||| ||| | ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  14681678 ctagaaactaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 14681724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 18298016 - 18298362
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298016 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttccgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 18298115  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18298116 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 18298215  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||| || | |       
T  18298216 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctaaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatct 18298315  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18298316 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 18298362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 12524487 - 12524833
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12524487 tctggcacatctaaaggtaccatctttccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaaccgtgccacatctc 12524586  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12524587 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagcttccggatggatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaat 12524686  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || || ||||| |||| ||| | |       
T  12524687 catctccttaatctctccatcgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttcatcatcgattttaaaatcactgtctttagtctgatct 12524786  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  12524787 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 12524833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15147086 - 15146740
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15147086 tctggcacatctaaagataccatcatactagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaataggaatacacaaactgtgccacatcgc 15146987  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146986 atttcaatccagacgaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 15146887  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || | ||| ||||| || ||||  |||||||| | | ||    
T  15146886 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacatattcgacctcggaatctcaacacaccatgtttatcgaccttaaattcaccttcttcagtctgatta 15146787  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15146786 ctagctaccaataagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 15146740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14850537 - 14850231
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  14850537 gcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 14850438  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||    
T  14850437 ttaaatcatgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaatctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaat 14850338  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | | | |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  14850337 acaaattctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatcgaccttaaagtctctatcttcaatctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaaca 14850238  T
Q  331 tcaactt 337  Q
    |||||||    
T  14850237 tcaactt 14850231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 14160289 - 14160627
Alignment:
Q  9 atctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaa 108  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14160289 atctaaagacaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaat 14160388  T
Q  109 ccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttct 208  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14160389 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactccgatggctctcttcaagaatcatcttct 14160488  T
Q  209 taatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaac 308  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |  | | ||  ||||||    
T  14160489 tcatctcatcattgtctggaatacaaattctaccgcggaatctcaacactccttggtcatcaactttaaagtcactatcttctgactgattatcagcaac 14160588  T
Q  309 catcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || ||| || ||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  14160589 caacaagtccacaaatttaacatcatctttctgtgcttc 14160627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16354646 - 16354310
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16354646 tctggcacatctaacgataccatcatacaagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttgtgacaaactaaataggaatacacaaactgtgccacatctc 16354547  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354546 gtttcaatccagaccaccagaaaatcatcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16354447  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
     || ||||| |||||||||   |  ||||| |||||    ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||| |||||| || | | ||    
T  16354446 tattttcttcatctcttcaccgttaggaattcaaatctgacctcggaatcttaacacatcatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcggtctgatta 16354347  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
     |||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  16354346 ttagctaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 16354310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1639618 - 1639364
Alignment:
Q  9 atctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaa 108  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||     
T  1639618 atctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttttgacaaaccaaacaagaatacacaaaatatgcaacatcacgtttcaat 1639519  T
Q  109 ccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttct 208  Q
    ||||||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1639518 ccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctcct 1639419  T
Q  209 taatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttg 263  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1639418 taatctcttcattgtctgaaatacaaattctacctcgaaacctcaacacaccttg 1639364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 7091243 - 7091576
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  7091243 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgataaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcac 7091342  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | | |||||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  7091343 gtttcaatccagaccaccaaaacaacctctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggataaatacttaagttacttctatggctctcttcaataat 7091442  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||  | ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |  |    
T  7091443 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcatacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatca 7091542  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  7091543 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaa 7091576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Original strand, 8706756 - 8707065
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |    
T  8706756 ccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaatt 8706855  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| ||    
T  8706856 tctttaagtcatgatacatctttgtagctctcggatgaatacttaagttacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagg 8706955  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  8706956 aatacaaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaactta 8707055  T
Q  328 acatcaactt 337  Q
    ||||||||||    
T  8707056 acatcaactt 8707065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15002795 - 15002475
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  15002795 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatagacaaaatgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 15002696  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||  || || |  || |||||||| |||||    
T  15002695 tcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttctagaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaat 15002596  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  15002595 acaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtttcattactagcaaccattaaatccacaaacttgaca 15002496  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  15002495 tcatcttgttgtgcttctctg 15002475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 15246765 - 15247083
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||   |||||||||| || | |||||    
T  15246765 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcagctcagaccaccaaaacaacttct 15246864  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  15246865 tcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaat 15246964  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15246965 acaaattcttcccctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 15247064  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  15247065 tccacttgctgtgcttctc 15247083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15358527 - 15358233
Alignment:
Q  55 gacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtag 154  Q
    ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  15358527 gacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaaaccagaccaccaaaatagtttcttcaaatcatgatacattttcgtag 15358428  T
Q  155 ctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaa 254  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| |  || | ||||| ||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15358427 ctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttactctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaa 15358328  T
Q  255 cacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15358327 cacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttctc 15358233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Original strand, 27901234 - 27901546
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  27901234 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatc 27901333  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||| || ||||| ||||||    
T  27901334 atgatacatttttgtagcttccggatgaatactcaagttactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaatt 27901433  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| || | |||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||    
T  27901434 ctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaactttgcatcaactt 27901533  T
Q  338 gttgtgcttctct 350  Q
    |||||||||||||    
T  27901534 gttgtgcttctct 27901546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3264225 - 3263930
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  3264225 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 3264126  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  3264125 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 3264026  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  3264025 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 3263930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1648701 - 1648390
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  1648701 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgtgcgacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatc 1648602  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||| | | | || | ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  1648601 atggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctagaattaaccttttcaactcatcattatcaggaatacaaatt 1648502  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  1648501 ctgcttctgaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcaccattctcagtttcattaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatccacct 1648402  T
Q  338 gttgtgcttctc 349  Q
    |||| |||||||    
T  1648401 gttgagcttctc 1648390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 33223764 - 33224059
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |  ||||    
T  33223764 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacatctcgtttcaaactggaccaccaaaacagtttct 33223863  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  33223864 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 33223963  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     ||||||||||||| ||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  33223964 acaaattcttcctctgaaccacagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaactt 33224059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15414460 - 15414140
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||  || || |||||||||   ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |  |    
T  15414460 ccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttaaaaccggaccaccaaaacaatt 15414361  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||  ||    
T  15414360 tcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaaactacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatgagg 15414261  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  15414260 aatacaaattcttcctcagaatctcaacacaccctgatcatgaaccttgaaatcactttcttcagtttgattactaacaaccaacaaatccacaaactta 15414161  T
Q  328 acatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    | |||||| |  |||||||||    
T  15414160 atatcaaccttctgtgcttct 15414140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11206662 - 11206367
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  11206662 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 11206563  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  11206562 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 11206463  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     ||||  ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  11206462 acaaacccttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 11206367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 14695065 - 14695255
Alignment:
Q  142 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttc 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| |    
T  14695065 tacatcttcgtagctcccggatgagtactcaagctacttatatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgc 14695164  T
Q  242 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |  || || |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  14695165 ctcggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtttaattactagaaaccaacaagtccacaaacttaacatc 14695255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Original strand, 15078476 - 15078792
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||| || |  ||||    
T  15078476 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaatccgaaccaccaaaataatttct 15078575  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || | ||| ||| ||||  ||||    
T  15078576 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctatgactttcttccagaatcaactttttcaactcatcactatcaagaat 15078675  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||    |||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||| |||    
T  15078676 gcaaattcttcctctgaaccttaacacaccctgctcatcgaccttgaaatcttcctcttcagtttgattactagcatccattaaatccacaaacttgaca 15078775  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||| ||  ||||||||    
T  15078776 tcaattttctgtgcttc 15078792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29452968 - 29452673
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||  || ||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||    
T  29452968 gcaggcttctgatgctccaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacgaacttagcaacatctcttttcaaaccagaccaccaaaacagtttct 29452869  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  29452868 tcaaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 29452769  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  29452768 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcattatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 29452673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44661297 - 44661002
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |  ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  44661297 gcaggcttctgatgctcagccttggacttctgacagatcaaacaggcataaaagaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 44661198  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  44661197 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaat 44661098  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  44661097 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtatcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 44661002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 295
Target Start/End: Original strand, 15320042 - 15320255
Alignment:
Q  82 acaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttc 181  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||| || ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  15320042 acaaactatgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcgtgatacatctttgtaggtcctggatgaatacttaagctacttc 15320141  T
Q  182 tatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtc 281  Q
    | ||||| ||||  | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15320142 tgtgactttcttttaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgtaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaggtc 15320241  T
Q  282 actatcttcagttt 295  Q
    || |||||||||||    
T  15320242 accatcttcagttt 15320255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 338
Target Start/End: Original strand, 16148599 - 16148859
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcta 177  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||     
T  16148599 atacacaaactgagcgacgtcacgcttcaagccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacattttcgtagctcccggatggatacttaagctg 16148698  T
Q  178 cttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttga 277  Q
    ||  | ||||| || || ||| ||| ||| || | | ||||||| || ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  16148699 ctcttgtgactttcctccagagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaatacaaattcttcctatgaacctcaacacaccctgatcatcgactttaa 16148798  T
Q  278 agtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttg 338  Q
    |||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16148799 agtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttg 16148859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 338
Target Start/End: Original strand, 16152745 - 16153005
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcta 177  Q
    |||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| || | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||     
T  16152745 atacacaaactgagcgacgtcacgcttcaagccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacattttcgtagctcccggatggatacttaagctg 16152844  T
Q  178 cttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttga 277  Q
    ||  | ||||| || || ||| ||| ||| || | | ||||||| || ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  16152845 ctcttgtgactttcctccagagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaatacaaattcttcctatgaacctcaacacaccctgatcatcgactttaa 16152944  T
Q  278 agtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttg 338  Q
    |||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16152945 agtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttg 16153005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Original strand, 20891829 - 20892115
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  || || | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||    
T  20891829 ttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcagat 20891928  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |  || || || || | ||| ||||     
T  20891929 catggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcgttgtcagaaatacaaac 20892028  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaa 323  Q
    |||| ||| ||| ||||  | ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| || |  |||||||||||||||    
T  20892029 tctttctctgaacctcaggaaaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagcgtcactaccagtagtcatcaaatcaacaaa 20892115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18614911 - 18614692
Alignment:
Q  100 cgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |               |||||| ||||||||||||||||    
T  18614911 cgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccag---------------acttctgtgactctcttcaagaa 18614827  T
Q  200 tcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcact 299  Q
    |||| ||||| |||||| |||  ||  |||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| || || || || ||||  |||||||| | | |    
T  18614826 tcattttcttcatctctgcatcgtcaagaatgcaaatccgacctcagaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaaatcacagtcttcagtctgatt 18614727  T
Q  300 actagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  18614726 actagcaaccaataaatctacaaacttgacatcaa 18614692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Original strand, 14691743 - 14691810
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatc 98  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14691743 gcaggtttctgatgttcaacctttgacttttgacaaatcaaacaggaatacaccaactgtgccacatc 14691810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16251646 - 16251598
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaa 49  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16251646 tctggcacatctagagataccatcataccagcaggtttttgatgctcaa 16251598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 51605992 - 51605905
Alignment:
Q  262 tgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||| || |||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  51605992 tgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctc 51605905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 86
Target Start/End: Original strand, 38811754 - 38811803
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaa 86  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  38811754 ttctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagtatacacaaa 38811803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26792099 - 26791753
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792099 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 26792000  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791999 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 26791900  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  26791899 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 26791800  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26791799 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttttgtgcttc 26791753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10906640 - 10906986
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906640 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 10906739  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906740 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 10906839  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | |       
T  10906840 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 10906939  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10906940 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 10906986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 13253120 - 13253466
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253120 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 13253219  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13253220 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 13253319  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  13253320 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 13253419  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  13253420 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 13253466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 15339699 - 15340034
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339699 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcgggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 15339798  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339799 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 15339898  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||||| | |       
T  15339899 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatct 15339998  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  15339999 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaact 15340034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5424630 - 5424284
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5424630 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 5424531  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5424530 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 5424431  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  5424430 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 5424331  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  5424330 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 5424284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15589092 - 15588746
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589092 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 15588993  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15588992 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 15588893  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  15588892 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 15588793  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15588792 ctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaactttctgtgcttc 15588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20061754 - 20061408
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061754 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 20061655  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20061654 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaat 20061555  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  20061554 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 20061455  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20061454 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 20061408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15724634 - 15724298
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724634 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 15724535  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724534 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 15724435  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  15724434 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacagattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 15724335  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||    
T  15724334 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgaaatcaactt 15724298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16411980 - 16411636
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16411980 tggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 16411881  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16411880 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 16411781  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||  | |   ||    
T  16411780 tcttcttaacctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagactgatctct 16411681  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||| ||| || |||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  16411680 agcaaccaacaagtccacaaactttaaatcaactttctgtgcttc 16411636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10006030 - 10006376
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10006030 tctggcgcgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 10006129  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10006130 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 10006229  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  10006230 catcttcttaatctcttcatcgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 10006329  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10006330 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 10006376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15347945 - 15347599
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15347945 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 15347846  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15347845 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaat 15347746  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  15347745 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 15347646  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15347645 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 15347599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16636203 - 16636549
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636203 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 16636302  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636303 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16636402  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  16636403 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 16636502  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16636503 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 16636549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 43163527 - 43163873
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163527 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 43163626  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163627 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 43163726  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  43163727 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 43163826  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  43163827 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 43163873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 48425877 - 48426223
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48425877 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggattacacaaactgtgccacatctc 48425976  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425977 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 48426076  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  48426077 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 48426176  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  48426177 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 48426223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16806626 - 16806290
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16806626 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 16806527  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16806526 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16806427  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||  ||  || ||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| || || || ||| |||  |||||||| | | ||    
T  16806426 cattttcttcatctctggatcgtcaggaatgcaaatccgatctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagacaccgtcttcagtctgatta 16806327  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  16806326 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 16806290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16371843 - 16372178
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16371843 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaactgtgccacatcgc 16371942  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371943 gtttcaa-ccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16372041  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| | | ||    
T  16372042 cattttcttcatctctttatcatcaggaatacaaattcgggctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagccaccatcttcagtctgatta 16372141  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||    
T  16372142 ctagcaaccaacaagtatacaaacttgacatcaactt 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14126294 - 14125959
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  14126294 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacgggaatacacaaactgtgtcacatcac 14126195  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14126194 gtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcttgatacatcttcgtagctcccggttgaatgctcaagctacttctatgactctcttcaagaat 14126095  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||| | |||||| |||  |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  14126094 cattttcatcatctctacatcgtaaggaatgcaaatacaacctcggaatctcaacacaccatgataatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgatta 14125995  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  14125994 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaact 14125959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14876198 - 14875856
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14876198 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcaacttctgataaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 14876099  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14876098 gtttcaaaccagaccaccagaaaattttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctataactcttttcaagaat 14875999  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  14875998 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcaacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgacctt-aagtcaccatcttcagtctgatta 14875900  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    || ||||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||||    
T  14875899 cttgcaaccaacaagtctacaaacttgatatcaactttttgtgc 14875856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15402210 - 15401882
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402210 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcgggtttctgatgctcaactttcgac-------aaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 15402118  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402117 gtttcaaaccagaccaccagaaaatattctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 15402018  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | |       
T  15402017 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttccttggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 15401918  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  15401917 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaact 15401882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16756281 - 16756017
Alignment:
Q  5 gcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgttt 104  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756281 gcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgaccttcgactcctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgttt 16756182  T
Q  105 caaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatc 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756181 caaaccagacccccagaaaatcttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatc 16756082  T
Q  205 ttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16756081 ttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatc 16756017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Original strand, 6601169 - 6601501
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6601169 ggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcttgtt 6601268  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601269 tcaaactagaccaccaaaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 6601368  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactacta 303  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |  || || ||||| |||||||  | |   ||     
T  6601369 cttcttaatctcttcattgtcgggaatgcaaattctccctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctg 6601468  T
Q  304 gcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  6601469 gcaaccagcaaatccacaaactttacatcaact 6601501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 53384713 - 53384386
Alignment:
Q  6 cacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttc 105  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53384713 cacatccaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgacctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttc 53384614  T
Q  106 aaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53384613 aaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatct 53384514  T
Q  206 tcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagc 305  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||  | |   |||||    
T  53384513 tcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctctagc 53384414  T
Q  306 aaccatcaaatcaacaaacttaacatca 333  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  53384413 aaccaacaaatccacaaacttcacatca 53384386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 12498678 - 12499011
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  12498678 tctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgtttaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaattgtgccacatcgc 12498777  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12498778 atttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaat 12498877  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| | ||||||| | | ||    
T  12498878 cattttcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccaacttcagtctaatta 12498977  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  12498978 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 12499011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 16692594 - 16692903
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16692594 tctggcatatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgcgccacatctc 16692693  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692694 gcttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaagtcctgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16692793  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| || || |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| | ||||||||| | | ||    
T  16692794 catttttttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgttgactttaaagtctccatcttcagtctaatta 16692893  T
Q  301 ctagcaacca 310  Q
    ||||||||||    
T  16692894 ctagcaacca 16692903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 15062174 - 15062433
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||      
T  15062174 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaactatgccacatcaa 15062273  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15062274 gtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaat 15062373  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacacc 260  Q
    ||| ||||| ||| |||||| |||  |||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15062374 cattttcttcatcccttcatcatcatgaatacaaatttggcctcggaatctcaacacacc 15062433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 17490280 - 17490627
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||  || || || |    
T  17490280 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactaagcaacgtcgc 17490379  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17490380 gtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 17490479  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| | |  || || ||| | |||||||| | |  |    
T  17490480 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcaacgattttaaaatcattgtcttcagtctgatca 17490579  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17490580 ctagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgcgcttct 17490627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 14574393 - 14574711
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  14574393 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaaccgagcaacatctcgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 14574492  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||||| ||| || | ||| ||| |||| |||||    
T  14574493 tcaagtcgtgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttctagaatcaactttttcaactcatcactatcaggaat 14574592  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14574593 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccatgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 14574692  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  14574693 tccacttgctgtgcttctc 14574711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 15248583 - 15248886
Alignment:
Q  7 acatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttca 106  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15248583 acatctaaagataccatcatcccagcaggtttttgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttca 15248682  T
Q  107 aaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctt 206  Q
    | ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15248683 acccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatctt 15248782  T
Q  207 cttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagca 306  Q
    ||| ||||| || |  || ||||| |||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |  || || |||||||||||||| | | | ||||||    
T  15248783 cttcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattctgcctcgaaaacgcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattcctagca 15248882  T
Q  307 acca 310  Q
    ||||    
T  15248883 acca 15248886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 15209321 - 15209630
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15209321 tctggtacatctaaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaattttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgcgccacatcac 15209420  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15209421 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcacccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 15209520  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| || |  ||  |||  |||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||    
T  15209521 cattttcttcatctcatcgtcgtcaagaaaacaaattctgcctcgaaaacgcaacactccatgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgatta 15209620  T
Q  301 ctagcaacca 310  Q
    ||||||||||    
T  15209621 ctagcaacca 15209630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16827862 - 16827542
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  16827862 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 16827763  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||  | || || | ||||| ||| || |  || ||||||||  ||||    
T  16827762 tcaaatcatgatacatttttgtagctccctgatgaatacttaagctacttttgtgggtttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcatgaat 16827663  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16827662 acaaatttttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 16827563  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  16827562 tcaacttgatgtgcttctctg 16827542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16491881 - 16491549
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  16491881 tctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgc 16491782  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||| ||| |  |||||||| || |  ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||    
T  16491781 gttacaatctggaccaccaaaacaaattctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttttatggtactcttcaagaat 16491682  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||  || ||||| ||||||||| |||| |  || || ||||| |||||||| | |  |    
T  16491681 catcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcaaaacctcaatacaccttgaccatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatca 16491582  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatca 333  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  16491581 ctagcaaccaacaggtccacaaacttaacatca 16491549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 10384438 - 10384733
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  10384438 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttct 10384537  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  10384538 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 10384637  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  10384638 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 10384733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 348
Target Start/End: Original strand, 15228125 - 15228436
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    |||||||| ||||  || || |||||||||   ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||| || |    
T  15228125 ttctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 15228224  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | | || | ||| |||||||| |||||  ||||    
T  15228225 catgatacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacgttttcaactcatcattatcaggaatagaaat 15228324  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||     
T  15228325 tcttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttggttactagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaacc 15228424  T
Q  337 tgttgtgcttct 348  Q
    |  |||||||||    
T  15228425 ttctgtgcttct 15228436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 4678908 - 4679226
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  4678908 gcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 4679007  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  4679008 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 4679107  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4679108 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgaca 4679207  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  4679208 tccacttgctgtgcttctc 4679226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 41177992 - 41178310
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  41177992 gcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 41178091  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || |||| ||| || || ||||||||||| |||||    
T  41178092 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggatcaactttttcatttcttcattatcaggaat 41178191  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  41178192 acaaattctacctctgattctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgaca 41178291  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  41178292 tccacttgctgtgcttctc 41178310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 47124414 - 47124709
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||    
T  47124414 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 47124513  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||| || |||||    
T  47124514 tcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcctcattgtcaggaat 47124613  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  47124614 gcaaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 47124709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14580530 - 14580296
Alignment:
Q  113 accaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaat 212  Q
    ||||||| || | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14580530 accaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcctcaagaatcatcttcttaat 14580431  T
Q  213 ctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatc 312  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | | | |||||| ||||| |    
T  14580430 ctcttcatcgtctggaatacaaattctacctcgaaaccttaatacaccttgatcatcgatcttgaaatcactatcttcaatctgattactagtaaccaac 14580331  T
Q  313 aaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  14580330 aaatccacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 14580296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 9523149 - 9523357
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  9523149 tctggcacatctaatggtatcatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcac 9523248  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||| |  | ||||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9523249 gtttgagtctagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 9523348  T
Q  201 catcttctt 209  Q
    ||| |||||    
T  9523349 cattttctt 9523357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8758741 - 8758423
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || ||||  || ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  8758741 gcaggtttctggtgttcaactttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacaactttt 8758642  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  8758641 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 8758542  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    || ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  8758541 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactattttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaactaacttgaca 8758442  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  8758441 tccacttgctgtgcttctc 8758423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 17493100 - 17493418
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||   ||||| | ||||| ||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  17493100 gcaggcttctgatgttcaaccttagatttctgacaagtcaaacatgcatacaaaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 17493199  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  17493200 tcaaatcatgatacattttcgtagctccagaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaat 17493299  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  17493300 acaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaacctttaagtcactatcttcagtgtcactaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 17493399  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  17493400 tccacttgctgtgcttctc 17493418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31694845 - 31694527
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | ||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || | |||||    
T  31694845 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaacttct 31694746  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | | ||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||| ||| |||||    
T  31694745 tcagatcataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaat 31694646  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| || ||||||||||| |||    
T  31694645 gcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaagtcaacaaacttcaca 31694546  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  31694545 tccacttgctgtgcttctc 31694527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Original strand, 13942494 - 13942810
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||| | |||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  13942494 gcaggtttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacgaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 13942593  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  13942594 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 13942693  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||| | |||||| | ||| |||    
T  13942694 acaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaacctggaagtcactatcttcaatgccattaccagcaaccattagatcaaccagcttgaca 13942793  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || ||||||||||||||    
T  13942794 tccacttgttgtgcttc 13942810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 28754788 - 28755083
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  28754788 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 28754887  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  28754888 tcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 28754987  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  28754988 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 28755083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11303426 - 11303114
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || | |||||| ||||    
T  11303426 ttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacatttcaacccggaccaccaaaatagcttcttcaaat 11303327  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  | || || || || | | ||| | | || |  || |||||||| |||||||||||    
T  11303326 catgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgcctttcctctaaactcaaccttttgaaatcatcattatcaggaatgcaaat 11303227  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11303226 tcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccattaaccatcaaatcaacaaacttaacatctact 11303127  T
Q  337 tgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||    
T  11303126 tgctgtgcttctc 11303114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11960828 - 11960510
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  11960828 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 11960729  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  11960728 tcaaatcatggtacatctttatagcccctgggtgaatactcaaactactatcgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 11960629  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| || |  |||||||||||||||||| | |    
T  11960628 acaaaatcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 11960529  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  11960528 tctacttgctgagcttctc 11960510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16380587 - 16380269
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||   || || | ||||||||| || || |||||||  ||||| ||  ||||||| || | ||| |    
T  16380587 gcaggcttttgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatctcaattcaacccgtaccaccaaaacagctttt 16380488  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  |||||||| || |||||    
T  16380487 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaat 16380388  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16380387 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagtaacaatcaaatcaaccaacttgaca 16380288  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || || |||||||||||||    
T  16380287 tccacctgttgtgcttctc 16380269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 347
Target Start/End: Original strand, 44777723 - 44778033
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| || ||||    
T  44777723 ttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaat 44777822  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  44777823 cgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaatacaaat 44777922  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    ||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |  || ||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||    
T  44777923 tctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcgataccattaccagcaaccattagatcaaccaacttgacatccact 44778022  T
Q  337 tgttgtgcttc 347  Q
    || || |||||    
T  44778023 tgctgcgcttc 44778033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 14087143 - 14087463
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  14087143 gcaggtttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttt 14087242  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || ||||||||    
T  14087243 tcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtctggaat 14087342  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| || | |||||  ||| || ||||| |||||||| |||    
T  14087343 gcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgaca 14087442  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  14087443 tcaacctgttgcgcttctctg 14087463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 349
Target Start/End: Original strand, 31939379 - 31939691
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | ||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| || | ||    
T  31939379 ttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcagat 31939478  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||| ||| |||||||||||    
T  31939479 cataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacccttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaatgcaaat 31939578  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  31939579 tcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaagtcaacaaacttcacatccact 31939678  T
Q  337 tgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||    
T  31939679 tgctgtgcttctc 31939691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16338171 - 16337876
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  16338171 gcaggcttctgatgctcaactttagacttctaacaagtcaaacaagcataaacaaactgagcaacatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 16338072  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  16338071 tcagatcatggtacatctttgtagcccccaggtgaatactcaacctactcttatgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 16337972  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  16337971 acaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactattctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 16337876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18134005 - 18133687
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  18134005 gcaggcttctaatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 18133906  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| | ||| | ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  18133905 tcaaatcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccaaaattaactttttcaactcgtcattatcaggaat 18133806  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     | ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| |||    
T  18133805 actaattcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttcattaccaacaatcatcaaatgaacaaacttcaca 18133706  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  18133705 tctacttgctgcgcttctc 18133687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16329310 - 16329027
Alignment:
Q  40 tgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgt 139  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||  || || | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||| |    
T  16329310 tgatgctcaaccttggacttttgacaaatcaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaataatttcttcagatcat 16329211  T
Q  140 ggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattct 239  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  16329210 ggtacatctttgtagaccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcatcattgtcaggaatacaaactct 16329111  T
Q  240 tcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaa 323  Q
    ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| || |  |||||||||||||||    
T  16329110 tcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaacaaa 16329027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13320114 - 13319860
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcta 177  Q
    |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13320114 atacacaaactgagcgacgtcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccgggtgaatactcaatcta 13320015  T
Q  178 cttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttga 277  Q
    ||  | ||||| || || | ||||| ||| || |   | |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13320014 ctcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttga 13319915  T
Q  278 agtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    | |||||||  |||||||||  || ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  13319914 aatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatc 13319860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 348
Target Start/End: Original strand, 15234128 - 15234304
Alignment:
Q  172 aagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaa 271  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | | || | ||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234128 aagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacgttttcaactcatcattatcaggaatagaaattcttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaa 15234227  T
Q  272 ccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  15234228 ccttgaagtcactatcttcagtttggttactagccaccaacaaatccacaaacttaacatcaaccttctgtgcttct 15234304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12360000 - 12359868
Alignment:
Q  217 tcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaat 316  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| | ||||||| ||||    
T  12360000 tcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccaacaaccattaaat 12359901  T
Q  317 caacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12359900 caacaaacttcacatctacttgttgtgcttctc 12359868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13971779 - 13971464
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  13971779 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttt 13971680  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || || |||||    
T  13971679 tcaagtcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcgggaat 13971580  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| || | |||||  ||| || ||||| |||||||  |||    
T  13971579 gcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaactcgaca 13971480  T
Q  331 tcaacttgttgtgctt 346  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  13971479 tcaacctgttgcgctt 13971464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16836169 - 16835851
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |    
T  16836169 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtgaagcacgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaactttt 16836070  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| ||    |||||||| || |||||    
T  16836069 tcaactcatgatacatcttcgtagctccgggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaacttttttgattcttcattgtcaggaat 16835970  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| |||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  16835969 acaaattctacctctgaatcttaatactccctgatcatcaactttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgaca 16835870  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || || || ||||||||||    
T  16835869 tccacctgctgtgcttctc 16835851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10419704 - 10419384
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | |||||||||| | || |||||    ||||| | ||||||||| || | |||||    
T  10419704 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgcgcgacatccttcttcaatctagaccaccaaaacaacttct 10419605  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||| || ||||     
T  10419604 tcaagtcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaac 10419505  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| || | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  10419504 acaaattctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcagcttgattactatcaaccattaaatccacaaacttgaca 10419405  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  10419404 tcaactcgttgtgcttctctg 10419384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15015425 - 15015164
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |   ||||||| || | ||||||    
T  15015425 caggtttctggtgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacctgaaccaccaaaataacttctt 15015326  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatg 231  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| | ||||| | |||||||||||| || |||  || ||| |||||     
T  15015325 caaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgaatttcttccataatcatcttcttcatttctgtatcatcaggaata 15015226  T
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||||||||    || || | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15015225 caaattctattccgaaaccgcaacactccttgatcatcaactttaaaatcactatcttcagt 15015164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13300064 - 13299880
Alignment:
Q  148 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcgga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |   | |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  13300064 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctga 13299965  T
Q  248 atctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  || ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  13299964 acctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatc 13299880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13310722 - 13310538
Alignment:
Q  148 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcgga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |   | |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  13310722 ttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctga 13310623  T
Q  248 atctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  || ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  13310622 acctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatc 13310538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12360177 - 12360053
Alignment:
Q  55 gacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtag 154  Q
    ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  12360177 gacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtag 12360078  T
Q  155 ctcccgggtgaatactcaagctact 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  12360077 ctcccggatgaatactcaagctact 12360053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 266950 - 266908
Alignment:
Q  46 tcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  266950 tcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 266908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6152512 - 6152478
Alignment:
Q  40 tgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaaca 74  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6152512 tgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaaca 6152478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 17193567 - 17193621
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||    
T  17193567 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaatcaaacaagcataaacaaact 17193621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19483968 - 19483621
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483968 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 19483869  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483868 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 19483769  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| | |       
T  19483768 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatct 19483669  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19483668 ctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttct 19483621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 18857454 - 18857789
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18857454 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctaatgctcaactttcgacttttgacaaactaaacaggagtacacaaactgtgccacatctc 18857553  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18857554 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttctagaat 18857653  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||   | ||    
T  18857654 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttcttcagtccgatta 18857753  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  18857754 ctagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaact 18857789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22128862 - 22128527
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128862 tctggcacatctaaaggtaccatccttccagcaggcttctgatgctcaacttttgatttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 22128763  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22128762 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagaat 22128663  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  22128662 catcttcttaatatcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 22128563  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  22128562 ctagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaact 22128527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17673927 - 17673581
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673927 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 17673828  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17673827 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttaaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 17673728  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  17673727 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 17673628  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  17673627 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 17673581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30313048 - 30312712
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30313048 tctgacacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatagacaaactgtgccacatctc 30312949  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30312948 ttttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 30312849  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  30312848 cattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 30312749  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  30312748 ctagcaactaacaaatctacaaacttgacatcaactt 30312712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 19113567 - 19113913
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113567 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 19113666  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113667 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 19113766  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||| |||| ||| | |       
T  19113767 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtctttagtctgatct 19113866  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19113867 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 19113913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22132945 - 22132609
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22132945 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaattcacaaactgtgccacatctc 22132846  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22132845 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttcaatgactctcctcaagaat 22132746  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| || || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  22132745 cattttcttcatctctgcatcgtcgggaatgcaaatccgacctcagaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 22132646  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  22132645 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 22132609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 19978844 - 19979191
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19978844 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 19978943  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978944 gttttaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 19979043  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||  | | ||    
T  19979044 cattttcttcatctcttcattgtcaagaatacaaattcgacctcggaatctcaatacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagcctgatta 19979143  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19979144 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttct 19979191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 32601021 - 32601364
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32601021 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactttgccacatctc 32601120  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32601121 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttatttatatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 32601220  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| | ||| |||||| |||  || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  32601221 catttccttcatctctgcatcgtcgggaatacaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 32601320  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  32601321 ctagcaaccaacaaatctacatacttgacatcaactttttgtgc 32601364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16407950 - 16407602
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16407950 tctggcacgtctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaataggaatacacaaactgtgccgcatctc 16407851  T
Q  101 gtttcaaa-ccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaa 199  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407850 gtttcaaatccagactaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaa 16407751  T
Q  200 tcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcact 299  Q
    |||| || || ||||||||||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | |    
T  16407750 tcattttattcatctcttcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgatt 16407651  T
Q  300 actagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16407650 actagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttttgtgcttct 16407602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22120078 - 22119743
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22120078 tctggcacatctaaaggtaccatcattccaacaggtttctgatgctcaactttcgatttctgacaaactaaacaggaatacacgaactgtgccacatctt 22119979  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22119978 gtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcaacttctatgactctattcaagaat 22119879  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  22119878 catcttcttaatatcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacataccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 22119779  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  22119778 ctagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaact 22119743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21166442 - 21166095
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21166442 tctggcacatctaaagataccatcataccagcggatttctgatgttcaatcttcgacttctgataaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 21166343  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166342 gtttcaatctagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 21166243  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||||||||| | | ||    
T  21166242 cattttcttcatctcttcatcgttgggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtctccatcttcagtctgatta 21166143  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21166142 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttatgtgcttct 21166095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15534257 - 15534596
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  15534257 tctggcacatctagagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaaacaggaatacacgaattatgccacatctc 15534356  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttt---aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534357 gtttcaaaccagaccaccagaaaatctttttttctaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaag 15534456  T
Q  198 aatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttca 297  Q
    |||||||||||| || ||| ||| |||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| | |    
T  15534457 aatcatcttctttatttctgcatcatcatgaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctga 15534556  T
Q  298 ctactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
     |||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15534557 ttactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatctactt 15534596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Original strand, 22040739 - 22041072
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22040739 ggcacatctaaagataccatcataccagcagatttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtt 22040838  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040839 tcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 22040938  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactacta 303  Q
     ||||| || | | |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||   ||||| || | | |||||    
T  22040939 tttcttcatatttgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcatcgtcttccgtctgattacta 22041038  T
Q  304 gcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  22041039 gcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 22041072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21921640 - 21921304
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  21921640 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaacctttgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcac 21921541  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21921540 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttactcctatgactctcttcaagaat 21921441  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  ||| |||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| |  || || ||  | |||||||| | | ||    
T  21921440 cattttctttatctcatcatcgtcttgaatacaaatcctacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcgttgtcttcagtctgatta 21921341  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21921340 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactt 21921304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 22988073 - 22988406
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22988073 tctggcacgtcttaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccatatcac 22988172  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22988173 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 22988272  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |  |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||    
T  22988273 cattttcttcatctcatcatcgtaaggaatagaaattctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgatta 22988372  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    |||| || || ||| || ||||||||||||||||    
T  22988373 ctagaaatcaacaattccacaaacttaacatcaa 22988406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23650918 - 23651265
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  23650918 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaagtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatccaacaagaatacacaaactgtgcaacatcac 23651017  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || | ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23651018 gtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagatacttctatgactctcttcaagaat 23651117  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||| | | ||    
T  23651118 cattttcttcatctcttcatcgtctaaaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacacattgatcatcgatcttaaaatcactgtctttagtctgatta 23651217  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  23651218 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttct 23651265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22248291 - 22247988
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  22248291 gcaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 22248192  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | || |||||    
T  22248191 tcaaatcatgatacatcctcgtagctcccggatgaatacacaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcgtcaatgtcaggaat 22248092  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||||||||| || ||| || ||||||||||||    
T  22248091 acaaattctgccttggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaaca 22247992  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  22247991 tcaa 22247988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 21043322 - 21043658
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  21043322 tctggcacatctaaagacaccgtcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagaatacacaaattgtgcaacgtcgc 21043421  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||| || |||||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21043422 atttcaatccggaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaat 21043521  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  21043522 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcagcactctttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatta 21043621  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21043622 cttgcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactt 21043658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 23655834 - 23656152
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  23655834 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 23655933  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||  ||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  23655934 tcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgaccttcttccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaat 23656033  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23656034 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 23656133  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  23656134 tccacttgttgtgcttctc 23656152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22377328 - 22377025
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||   | || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  22377328 gcaggtttctgatgctcaactattgatttatgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttct 22377229  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |  |||||    
T  22377228 tcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgttaggaat 22377129  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||| |  || || |||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  22377128 acaaattctgcctcagaatctcaacactcccagatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtgcacaaacttaaca 22377029  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  22377028 tcaa 22377025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22383503 - 22383200
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||   | || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  22383503 gcaggtttctgatgctcaactattgatttatgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttct 22383404  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |  |||||    
T  22383403 tcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgttaggaat 22383304  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||| |  || || |||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  22383303 acaaattctgcctcagaatctcaacactccccgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtgcacaaacttaaca 22383204  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  22383203 tcaa 22383200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 23949798 - 23950052
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |    
T  23949798 tggcacatctaaagatatcatcaacccagcaagtttctgatgctcgacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcactt 23949897  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  23949898 ttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatgtgactctcttcaagaatcg 23949997  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacac 257  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  23949998 tcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaatttctgcctcggaatcgcaacac 23950052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 1267145 - 1267463
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||   ||||| | ||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| |    
T  1267145 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctggaaagtcaaacatgcatacacaaaatgggcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttt 1267244  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  1267245 tcaaatcatggtacatctttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 1267344  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||    
T  1267345 acaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgaca 1267444  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  1267445 tccacttgatgtgcttctc 1267463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Original strand, 19852324 - 19852638
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||| | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||| || |    
T  19852324 ttctgatgctcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcataaaaaaactgagcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 19852423  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||||    
T  19852424 catgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaat 19852523  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  19852524 tcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagtttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaatt 19852623  T
Q  337 tgttgtgcttctctg 351  Q
    |  || |||||||||    
T  19852624 ttctgcgcttctctg 19852638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Original strand, 19858360 - 19858674
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||| | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||| || |    
T  19858360 ttctgatgctcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcataaaaaaactgagcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 19858459  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||||    
T  19858460 catgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaat 19858559  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |    
T  19858560 tcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagtttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaatt 19858659  T
Q  337 tgttgtgcttctctg 351  Q
    |  || |||||||||    
T  19858660 ttctgcgcttctctg 19858674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12274593 - 12274445
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12274593 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 12274494  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatctt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12274493 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatctt 12274445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 21841324 - 21841644
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||   ||||| | ||| ||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  21841324 gcaggcttctaatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcataaacaaacatagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 21841423  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  21841424 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaat 21841523  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  21841524 gcaaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttaattactagcaaccattaaatccacaaacttgaca 21841623  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21841624 tcaacttgttgtgcttctctg 21841644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 20389003 - 20389310
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||| | ||||| || ||||| || |||||| | || |  |    
T  20389003 ccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtacaacatcacgcttcaatccggaccactaaaacaatt 20389102  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| ||    
T  20389103 tcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacgtatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagg 20389202  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  20389203 aatacaaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgaatactagcaaccaacaagtcgacaaactta 20389302  T
Q  328 acatcaac 335  Q
    | ||||||    
T  20389303 atatcaac 20389310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21393767 - 21393501
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||| || || |||    
T  21393767 tggcacatctaaccataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctggcaaatcaaacaagcatacacaaactgtgcaacgtcgcgt 21393668  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||| || |||||||| || | |||||||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21393667 ttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 21393568  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    | | ||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  21393567 tttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 21393501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21788261 - 21787995
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||| || || |||    
T  21788261 tggcacatctaaccataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctggcaaatcaaacaagcatacacaaactgtgcaacgtcgcgt 21788162  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||| || |||||||| || | |||||||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21788161 ttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 21788062  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    | | ||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  21788061 tttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 21787995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31570716 - 31570398
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  31570716 gcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 31570617  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  31570616 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 31570517  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||| || |||||| | |||||| ||||| |||    
T  31570516 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgaca 31570417  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  31570416 tccacttgctgtgcttctc 31570398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 21251818 - 21252152
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||  || || |    
T  21251818 tctggcacatctaacgataccatcacaccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatatacaaactgtgtaacgtcgc 21251917  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatct---tcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaag 197  Q
    ||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||   ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  21251918 gtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtcgtagctcccggatgaatactcaggttacttctgtggctctcttcaag 21252017  T
Q  198 aatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttca 297  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |    
T  21252018 aatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctga 21252117  T
Q  298 ctactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
       ||| |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  21252118 tctctaacaaccaacaagtccacaaacttaacatc 21252152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31416348 - 31416030
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  31416348 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcataaacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 31416249  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  31416248 tcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 31416149  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || || ||| |||||||||||||| | |    
T  31416148 acaaattcttcctctgaatctcaatacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtaatcattaaatcaacaaacttcaaa 31416049  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  31416048 tccacttgctgagcttctc 31416030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 803547 - 803252
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||  || ||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||    
T  803547 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacgaacttagcaacatctcttttcaaaccagaccaccaaaacagtttct 803448  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  803447 tcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctctagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 803348  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  803347 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20396002 - 20395744
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |    
T  20396002 ccagcaggtttctgatgctcaa-------cttttgacaaatcaaacatgaataaacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatt 20395910  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  20395909 tcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttcttcaagaatcatcttctttatctcatcattgtcggg 20395810  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    |||  ||||||| ||||| |||| |||||  || ||||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  20395809 aatataaattctgcctcgaaatcgcaacaatccctgatcatcaacttttaagtcaccatcctcagt 20395744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 14566049 - 14566344
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  14566049 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaattaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 14566148  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  14566149 tcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctacttttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 14566248  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||  ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  14566249 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 14566344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20009793 - 20009491
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||    
T  20009793 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaaacg-gaccaccaaaataatttct 20009695  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||||||  ||||    
T  20009694 tcaaatcatgatacatatttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaagaat 20009595  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||| |||||| ||||| |||| ||| |||    
T  20009594 acaaattcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccctcttcagttcgattactagtaaccattaaatccacaagcttgaca 20009495  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  20009494 tcaa 20009491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20985352 - 20985101
Alignment:
Q  100 cgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaa 199  Q
    |||| ||||||||||||||| || |  ||||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| | ||    
T  20985352 cgttacaaaccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctctcgggtgaatacttaagatacttctgtgactttcttccaaaa 20985253  T
Q  200 tcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcact 299  Q
    ||| ||| || | ||| ||||| |  ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20985252 tcaactttttcaactcatcatttttaggaatacaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcatt 20985153  T
Q  300 actagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  20985152 actagtaactattaaatcaacaaacttgacatcaactttctgtgcttctctg 20985101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16271098 - 16270854
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||    
T  16271098 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 16270999  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  16270998 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 16270899  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaacctt 275  Q
     || | |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16270898 acatactcttcctctgaacctcagtacaccctgatcatcaacctt 16270854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20975453 - 20975206
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    |||||||| |||||||| || | |||| | ||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| || || | |||||    
T  20975453 ttcaaaccggaccaccaaaacagcttcctcaaatcatgatacattttcgtagctcccgtatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatca 20975354  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     ||| || |   | |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||     
T  20975353 actttttcaaaccatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattacc 20975254  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctct 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  20975253 agcaaccattaaatcaacaaacttcacatccacttgttttgcttctct 20975206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 22051770 - 22052088
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||   ||||| | ||||| ||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |    
T  22051770 gcaggcttctgatgctcaatgttagacttctagcaagtcaaacatgcatacataaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttt 22051869  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  |||||||| || |||||    
T  22051870 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaacctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaat 22051969  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||||||||| ||| |||||||| | ||| |||    
T  22051970 acaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctccgtgccattactagcaatcattaaatcaaccagcttgaca 22052069  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  22052070 tccacttgctgtgcttctc 22052088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 326
Target Start/End: Original strand, 6604571 - 6604860
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||    
T  6604571 ttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaat 6604670  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| || ||||| || |     
T  6604671 catgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacagac 6604770  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
    ||| || | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  | |  || |||||||||||||||    
T  6604771 tctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcaccaaatcaacaaactt 6604860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 326
Target Start/End: Original strand, 6680024 - 6680313
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||    
T  6680024 ttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaat 6680123  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| || ||||| || |     
T  6680124 catgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacagac 6680223  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
    ||| || | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  | |  || |||||||||||||||    
T  6680224 tctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcaccaaatcaacaaactt 6680313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 320
Target Start/End: Original strand, 12305665 - 12305954
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| | ||| | |||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| || |  ||||    
T  12305665 gcaggcttctgatgatcaaccttagacttctgacaaataaaacaagcataaaaaaactgagcaacatcacaattcaaaccggaccaccaaaacagtttct 12305764  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| || |||||    
T  12305765 tcaaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctcttcaagaattaacttcttcaactcatcattgtcaggaat 12305864  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaac 320  Q
    ||| | ||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  12305865 gcatactcttcatctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaac 12305954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 323
Target Start/End: Original strand, 27355455 - 27355746
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  27355455 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 27355554  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||| |  ||| | ||| ||  | || |||||    
T  27355555 tcaaatcatgatacatctttgtagcccccgggtgtatactcaatctactcttgtgactatcttcaagaatcaac-ccttcaactcatcgctgtcaggaat 27355653  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaa 323  Q
     |||| ||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||| || |  ||| |||||||||||    
T  27355654 acaaactctccctctgaatctcagtacaccctgatcatcaaccttaaagtcactgtcctcagcgtcactaccagtagtcattaaatcaacaaa 27355746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Original strand, 22371847 - 22372140
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || |||||  ||||||| |  |||||||| || |  ||||    
T  22371847 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaatctggaccaccaaaataatttct 22371946  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||| |||| |||||    
T  22371947 tcaagtcatgatacatctttgtagctcccaggtgaatacttaagctacttctgtgactttcttctataatcaactttttcaactcatcactatcaggaat 22372046  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaac 324  Q
    | | |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||  | ||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22372047 gaatattcttcctctgaacctcaacacacacagatcatcaaccttgaaatcacccttttcggtttgattactagcaaccattaaatccacaaac 22372140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29303253 - 29303005
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcta 177  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |  | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  29303253 atacacaaactgagcaacatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagttccttcaaatcatgatacatctttgtagcccccgggtgaatgctcaaccta 29303154  T
Q  178 cttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttga 277  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||  ||||| |  || ||||| || ||||| |||| ||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| |    
T  29303153 ctcttgtgactctctacaagaatcaatttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcatctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaa 29303054  T
Q  278 agtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
    |||||||||| ||||| ||| | | ||    ||||||||||||||||||    
T  29303053 agtcactatcctcagtgtcattgccagatgtcatcaaatcaacaaactt 29303005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22164096 - 22164012
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22164096 tctggcacatctaaagataccatcataccagcagatttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaa 22164012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 293
Target Start/End: Original strand, 23886075 - 23886193
Alignment:
Q  175 ctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaacct 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||  |||||| || | |||||| ||||    
T  23886075 ctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctgcctcggaattgcaacactccctaatcatcgacct 23886174  T
Q  275 tgaagtcactatcttcagt 293  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  23886175 tagagtcactatcttcagt 23886193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 20652204 - 20652150
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  20652204 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaagcaagcatacacaaact 20652150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 22983343 - 22983397
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  22983343 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcatatacaaact 22983397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Original strand, 22316103 - 22316254
Alignment:
Q  36 tttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaa-aatcttctttaa 134  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||  |  ||    ||||  |||| |||||| || ||||| ||| ||    
T  22316103 tttctaatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactctgtgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaatct-cttcaa 22316201  T
Q  135 atcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22316202 atcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 22316254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Original strand, 25283043 - 25283094
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  25283043 ttctgatgttcaatcttagacttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 25283094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Original strand, 25283269 - 25283320
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  25283269 ttctgatgttcaatcttagacttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 25283320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22623636 - 22623563
Alignment:
Q  133 aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctt 206  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  22623636 aaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgacttttttccagaatcatctt 22623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23156879 - 23156843
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaaca 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23156879 tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaaca 23156843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41353195 - 41352848
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41353195 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 41353096  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41353095 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 41352996  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| | |       
T  41352995 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatccttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatct 41352896  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  41352895 ctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttct 41352848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51333026 - 51332680
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333026 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 51332927  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51332926 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 51332827  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||| || | |       
T  51332826 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatct 51332727  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  51332726 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 51332680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21831129 - 21831464
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831129 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggcttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 21831228  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831229 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 21831328  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  21831329 catcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 21831428  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  21831429 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaact 21831464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33390562 - 33390216
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33390562 tctggcacgtttaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctggcaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 33390463  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33390462 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaat 33390363  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  33390362 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 33390263  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  33390262 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 33390216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 21837776 - 21838040
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837776 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 21837875  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837876 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 21837975  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgat 265  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837976 catcttattaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgat 21838040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16350132 - 16349786
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350132 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 16350033  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350032 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16349933  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt-cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcact 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||| ||||| || | |      
T  16349932 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattacttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatc 16349833  T
Q  300 actagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgctt 346  Q
     |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  16349832 tctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgctt 16349786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17044548 - 17044212
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  17044548 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactttgccacatctt 17044449  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044448 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 17044349  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||   | |||||||| || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  17044348 cattttcttcatctctgcatcgtcgggaatacaaatccgacctcggaatctcaacatgtcgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 17044249  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  17044248 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 17044212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16078189 - 16077853
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16078189 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaagtttctgatgctcaatcttcgacttctgacagactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 16078090  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078089 atttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16077990  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
     || ||||| |||||| |||  || || |||||||| |  ||| |||||||||||||||| || ||||| || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  16077989 tattttcttcatctctgcatcgtcagggatgcaaatccgaccttggaatctcaacacaccgtggtcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 16077890  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  16077889 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 16077853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 19107194 - 19107462
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19107194 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacatgaatacacaaactgtgccacatctc 19107293  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19107294 gcttcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtggctctcttcaagaat 19107393  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107394 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 19107462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21749767 - 21750113
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  21749767 tctggcacatctagagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgccacatcac 21749866  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21749867 gtttcaatccagaccaccaaaacatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 21749966  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| | || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || || || |||||||| | |  |    
T  21749967 cattttcttcatctcat-atcatctggaatacaaatcctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatctctgtcttcagtctaatca 21750065  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21750066 ctagccaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgtgcttct 21750113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 332
Target Start/End: Original strand, 22109878 - 22110179
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  22109878 gcaggtttttgatgctcaactttcaacttctaacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 22109977  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  22109978 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaat 22110077  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  22110078 acaaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagtctgattactaggaaccaacaagtccacaaacttaaca 22110177  T
Q  331 tc 332  Q
    ||    
T  22110178 tc 22110179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 332
Target Start/End: Original strand, 22113727 - 22114028
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  22113727 gcaggtttttgatgctcaactttcaacttctaacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 22113826  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  22113827 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaat 22113926  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  22113927 acaaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagtctgattactaggaaccaacaagtccacaaacttaaca 22114026  T
Q  331 tc 332  Q
    ||    
T  22114027 tc 22114028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 50619777 - 50619441
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50619777 tctggtacatctaaagataccataatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 50619678  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50619677 gtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgactctcttcaagaat 50619578  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || |  || |||||||| | | ||    
T  50619577 cattttcttcatctcatcattgtatggaatacaaattctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatatctgtcttcagtctgatta 50619478  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  50619477 ctagtaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactt 50619441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Original strand, 16373385 - 16373691
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||  || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  16373385 gcaggtttctgatgctcaactttcgacttcttaaaaatcaagcaagaatacacaaattgtgtcacgtcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttct 16373484  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  16373485 tcaaatcatgatacatcttcgcagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaat 16373584  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  16373585 acaaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaaca 16373684  T
Q  331 tcaactt 337  Q
    |||||||    
T  16373685 tcaactt 16373691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 20139660 - 20139992
Alignment:
Q  5 gcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgttt 104  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20139660 gcacatctaatgataccatcataccagcaggtttctaatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaagaatagacaaactgtgcaacatcacgttt 20139759  T
Q  105 caaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatc 204  Q
    ||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139760 caatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatc 20139859  T
Q  205 ttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactag 304  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||||||    
T  20139860 ttcttcatttcttcatagtctggaatacaaatcctaccttgaaacctcaacacaccttggtcatcgatattaaaatcactgtcttcagtctgattactag 20139959  T
Q  305 caaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  20139960 caaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 20139992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22361777 - 22361430
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| || || |    
T  22361777 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactatgcaacgtcgc 22361678  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22361677 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatagatcttcgtagctcccggatgaatactcaagtttcttctatgactctcttcaagaat 22361578  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  | |||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| |  || || ||||  |||||||| | |  |    
T  22361577 cattttcttcatctcatcatcgtttggaatacaaatcctacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatca 22361478  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22361477 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttttatgcttct 22361430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 334
Target Start/End: Original strand, 21025068 - 21025332
Alignment:
Q  70 aaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatac 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21025068 aaacaagaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatac 21025167  T
Q  170 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||     
T  21025168 tcaagctacttctatgactcttttcaagaatcattttcttcctcccttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatt 21025267  T
Q  270 aaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  21025268 gaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaa 21025332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 20250628 - 20250964
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||| |    
T  20250628 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaataagaatacacaaactgtgcaacatcac 20250727  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||  ||| ||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20250728 gtttcagtcca-accaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 20250826  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||  || ||||||| |||||||||||| |  || || ||||| ||||||||   | ||    
T  20250827 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcaaaacctcaacataccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtccgatta 20250926  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttg 338  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  20250927 ctagccaccaacaagtccacaaacttaacatcaacttg 20250964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20939566 - 20939248
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  20939566 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttct 20939467  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||| | ||| || |  || |||| ||| |||||    
T  20939466 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaattaacttttttaaatcatcatcatcaggaat 20939367  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20939366 gcaaattcttcttctgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaccttcaca 20939267  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  20939266 tccacttgttgtgcttctc 20939248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19760399 - 19760114
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||       ||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  19760399 tctggcacatctaaagataccatcaacccaacagatttctgatgctcaa-------cttttgacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcac 19760307  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19760306 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatctttatagctcctggatggatactcaagctacttatgtgactctcttcaagaat 19760207  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||||||  | ||||| || |  || ||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19760206 catctttctcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattctacctcggaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagt 19760114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 19855161 - 19855479
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||  || || | ||| |||||||| ||||||||||| || | | |||    
T  19855161 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaatttgagcaatatcccgtttcaacccagaccaccaaaacagcgtct 19855260  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |  | ||||| || || | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  19855261 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctattcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaat 19855360  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19855361 acaaatccttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaacaatcaaatcaacaaacttaaca 19855460  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19855461 tccacttgttgtgcttctc 19855479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24099106 - 24098788
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||| ||||| || || |||||  | |||||||| |||||||| || |  ||||    
T  24099106 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcaagcataaacaaaatgagcaacatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 24099007  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | | | ||||| || |||||    
T  24099006 tcaaatcatggtacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaacccatcattgtcaggaat 24098907  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||| | |    
T  24098906 acaaattcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcgtcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtaatcatcaaatcaacaaacttcaaa 24098807  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  24098806 tccacttgctgagcttctc 24098788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 301
Target Start/End: Original strand, 20295268 - 20295538
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  20295268 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 20295367  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | | ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  20295368 tcagatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 20295467  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactac 301  Q
     |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||| || || || |||||||    
T  20295468 acaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcggtgtcactac 20295538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19662640 - 19662322
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  19662640 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttcagacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 19662541  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  19662540 tcaaatcatgatacattttcgtagcttccggacgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaat 19662441  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  || ||| |||||||||||||||||| | ||| |||    
T  19662440 acaaattcttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgaca 19662341  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  19662340 tccacttcctgtgcttctc 19662322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 217 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23197563 - 23197433
Alignment:
Q  217 tcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaat 316  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23197563 tcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttaaagtcactatcttcagtttcactaccagcaaccatcaaat 23197464  T
Q  317 caacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23197463 ccacaaacttaacatccacttgctgtgcttc 23197433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20835391 - 20835085
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  20835391 gcaggcttctgatgttcaaccttagacatctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 20835292  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || ||  ||| |||| ||           || ||| |||||    
T  20835291 tcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctct-gaaccatcatc-----------atcatcgggaat 20835204  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20835203 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcaca 20835104  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  20835103 tccactagttgtgcttctc 20835085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31539500 - 31539205
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  31539500 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 31539401  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  31539400 tcaaatcatgatacattttcgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 31539301  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||  ||| |||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||  |||| ||| ||| || |  || |||||||||||||||    
T  31539300 acaaactctacctgtgaacctcagcacaccctgatcatcaattttgaaatcactatccccagtgtcattaccagaagtcaccaaatcaacaaactt 31539205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 37677936 - 37678231
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  37677936 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactaagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 37678035  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  37678036 tcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 37678135  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  37678136 acaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccggaagtcatcaaatcaacaaactt 37678231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20856257 - 20855943
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatc-tcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||| ||||   ||||| | |||||||||| | || ||||| |  ||| |||||||||||||| || |  ||||| || |    
T  20856257 tctgatgttcaaccttagacttctaacaagtgaaacacgcatacacaaaccgagcgacatccttctttaaaaccagaccaccaaaacaatttcttcaagt 20856158  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  || ||||| || ||||| |||||    
T  20856157 catgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcctcattgtcaggaatacaaat 20856058  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || | |  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20856057 tctgcctcttaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactattctccgctagattactagcgaccatcaaatccacaaacttaacatcaact 20855958  T
Q  337 tgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| |||||||||    
T  20855957 tgttgcgcttctctg 20855943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 320
Target Start/End: Original strand, 21951765 - 21952054
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  21951765 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 21951864  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||| |||||| |  || ||||| |  |||||    
T  21951865 tcaaatcatgaaacatatttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaaggatcaacttcttcaaatcatcattgttaggaat 21951964  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaac 320  Q
     |||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  21951965 acaaactcttcctctgaatctcagtacaccctgatcatccaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaac 21952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 20937740 - 20937846
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20937740 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacagactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 20937839  T
Q  101 gtttcaa 107  Q
    |||||||    
T  20937840 gtttcaa 20937846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21235038 - 21234928
Alignment:
Q  227 gaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||  |||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21235038 gaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaaatctacaaactt 21234939  T
Q  327 aacatcaactt 337  Q
     ||||||||||    
T  21234938 gacatcaactt 21234928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16626323 - 16625977
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626323 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 16626224  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626223 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16626124  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  16626123 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 16626024  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16626023 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 16625977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 25113227 - 25113573
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25113227 tctggtacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 25113326  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25113327 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 25113426  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  25113427 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgaatttaaaatcactgtcttcagtctgatct 25113526  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  25113527 ctagcaaccaacaagtccacaaattttacatcgactttctgtgcttc 25113573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29591526 - 29591180
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29591526 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 29591427  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29591426 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 29591327  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  29591326 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 29591227  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  29591226 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 29591180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1542690 - 1542344
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1542690 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactatgccacatctc 1542591  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1542590 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaat 1542491  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |  || || ||||| |||||||| |    |    
T  1542490 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattctctctcggaatctcaacagaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctggtca 1542391  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1542390 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 1542344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24312774 - 24312428
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24312774 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 24312675  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24312674 gtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 24312575  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  24312574 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 24312475  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  24312474 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 24312428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2874409 - 2874063
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874409 tctggcacgtctaaaggcaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 2874310  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874309 gtttcaaaccagaccaccaaaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 2874210  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||||| | |       
T  2874209 catcttcttaatctctccattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatct 2874110  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  2874109 ctagcaaccaacaagtcctcaaactttacatcaactttctgtgcttc 2874063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 27188111 - 27188379
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27188111 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccaacgggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgagccacatctc 27188210  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188211 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27188310  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27188311 catcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacgccttcatcatc 27188379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27261129 - 27260861
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27261129 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccaacgggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgagccacatctc 27261030  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261029 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27260930  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27260929 catcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacgccttcatcatc 27260861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 19865362 - 19865708
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19865362 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 19865461  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19865462 gtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagataatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaat 19865561  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||   |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  19865562 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgaactcgaaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 19865661  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19865662 ctagcaaccaacaagtctataaacttgacatcaactttctgtgcttc 19865708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28262800 - 28262535
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28262800 ggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcctt 28262701  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262700 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 28262601  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28262600 cttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatc 28262535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28341549 - 28341284
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28341549 ggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcctt 28341450  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341449 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 28341350  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28341349 cttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttgatcatc 28341284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22078296 - 22077949
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22078296 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcac 22078197  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078196 gtttcaatccagaccaccaaaataatttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 22078097  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||| || | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  || || |||| ||||| ||| | | ||    
T  22078096 catcttcttcatctcatcatcgtctagagtacaaattcttcctcgaaacctcaacataccttgatcatcaattttaaaatcaccatctttagtctgatta 22077997  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22077996 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttatgtgcttct 22077949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27566586 - 27566327
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27566586 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcac 27566487  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27566486 gtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgactctcttcaagaat 27566387  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacacc 260  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27566386 cattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacacc 27566327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16963051 - 16962715
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16963051 tctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaatcaaacaagagtacacaaactgtgccacatcgc 16962952  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    | ||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16962951 gcttcaatccagaccaccaaaatatattctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16962852  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||| | |||||| |||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  16962851 cattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacgccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgatta 16962752  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  16962751 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 16962715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22762061 - 22761714
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  22762061 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgaaaaatcaaacaagaatacataaactgtgcaacatcgc 22761962  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22761961 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 22761862  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| | |  |    
T  22761861 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaagtcactgtcttcagtctgatca 22761762  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22761761 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttttgcgcttct 22761714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16927246 - 16926910
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| | || |||||||||||||||||||| |    
T  16927246 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaattttcgacttctaacaaatcaaataagagtacacaaactgtgccacatcgc 16927147  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    | ||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16927146 gcttcaatccagaccaccaaaatctcttctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaat 16927047  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||| | |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  16927046 cattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctaatta 16926947  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  16926946 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 16926910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 22434544 - 22434879
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22434544 tctgccacgtctaacgataccatcataccagtaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaattaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 22434643  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434644 gtttcaatccggaccaccaaaatattttcttcagatcatgaaacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 22434743  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| || ||||||| | | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| | | ||    
T  22434744 cattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgatctcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagtctaatta 22434843  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  22434844 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaact 22434879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 22442942 - 22443277
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22442942 tctgccacgtctaacgataccatcataccagtaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaattaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 22443041  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22443042 gtttcaatccggaccaccaaaatattttcttcagatcatgaaacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 22443141  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| || ||||||| | | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| | | ||    
T  22443142 cattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgatctcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagtctaatta 22443241  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  22443242 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaact 22443277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27331039 - 27330692
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  27331039 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgccacattgc 27330940  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27330939 gtttcaacccagaccaccaaaataacttctttagatcatgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaat 27330840  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||   | | || |||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  27330839 catcttcttcatctcatcatcgtctggaatacatattctattttgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatta 27330740  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27330739 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttatgtgcttct 27330692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27391779 - 27391432
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  27391779 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgccacattgc 27391680  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27391679 gtttcaacccagaccaccaaaataacttctttagatcatgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaat 27391580  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||   | | || |||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  27391579 catcttcttcatctcatcatcgtctggaatacatattctattttgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatta 27391480  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27391479 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttatgtgcttct 27391432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25609467 - 25609131
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||| |    
T  25609467 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaagaatacacaaacggtgcaacatcac 25609368  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||| ||||||||||| || | |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25609367 atttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 25609268  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||  |||||||| | | ||    
T  25609267 catcttcttcatctcttcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaatacaccttggtcatcgatcttaaaatcaccgtcttcagtctgatta 25609168  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  25609167 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactt 25609131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18407548 - 18407212
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18407548 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacaaaaactgtgcaacatcgc 18407449  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||| | || || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18407448 gtttcaatccagactagcaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 18407349  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||| |||| | |  |    
T  18407348 cattttcttcatctcttcatcatctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctccagtctgatca 18407249  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  18407248 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcgactt 18407212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 23079144 - 23079480
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  23079144 tctggtacatctaaagataccatcatcccaacaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaattatgctacatcac 23079243  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || | ||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079244 gtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 23079343  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||    
T  23079344 catcttcttcatctcatcatcgtcaggaatagaaattctccctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgatta 23079443  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  23079444 ctagcaaccaacaaatctacaaacctaacatcaactt 23079480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5838822 - 5838479
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5838822 ggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcgaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtt 5838723  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||| ||| ||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5838722 tcaatccaaaccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcctcgagaatcat 5838623  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactacta 303  Q
     ||||| ||||||||||| || || || ||||||   ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||| ||||||||| | | |||||    
T  5838622 tttcttcatctcttcattgtcagggatacaaatttgaccttggaatcttaacacaccatggtcatcgaccttaaaatcaccatcttcagtctgattacta 5838523  T
Q  304 gcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || || | |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  5838522 gcgactaacaaatccacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 5838479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20636907 - 20636560
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  20636907 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgc 20636808  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20636807 gtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 20636708  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  ||||||||  |||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || |||||  ||||||| | | ||    
T  20636707 cattttcttcatctcatcatcgtctggaataaaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgccttcagtctgatta 20636608  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  20636607 ctagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaaccttttgcgcttct 20636560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18197304 - 18196995
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaa---ccagaccaccagaaaatct 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    || |||||||| || |  |    
T  18197304 gcaggtttctgatgctcaacctttgacttctagaaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaataatcccgaccaccaaaacaaat 18197205  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||    
T  18197204 ttttcaaatcatgatacatcttggtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcgtcgtctgg 18197105  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| | | |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  18197104 aatacaaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactatccttagtgtgattactagcaaccaacaagtccacaaactta 18197005  T
Q  328 acatcaactt 337  Q
    || |||||||    
T  18197004 acgtcaactt 18196995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Original strand, 15896775 - 15897116
Alignment:
Q  7 acatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttca 106  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15896775 acatctatagataccatcaacccagcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaattagacatgaatatacaaactgtgccacatcacgtttca 15896874  T
Q  107 aaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctt 206  Q
    | ||||||||||| || | | |||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  15896875 acccagaccaccaaaataacctcttcaaatcatgatacatctttgtagctcctggatggatactcaagatacttgtgtgactctctttaagaatcatctt 15896974  T
Q  207 cttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagca 306  Q
    ||| ||||| ||||  || ||||| | |||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | | | ||    
T  15896975 cttcatctcatcatcgtcaggaatacgaattctgcctcgtaatcgcaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtctgatttccacca 15897074  T
Q  307 accatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    || |  ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15897075 acaagtaaatctacaaactttacatcaactttttgtgcttct 15897116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Original strand, 21472306 - 21472609
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  21472306 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttct 21472405  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||| |||| |||||    
T  21472406 tcaaatcatggtacatctttgtagctcccgggtgaatacttaagctgcttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaat 21472505  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21472506 gcaaattattcctctgaacctcaacacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgaca 21472605  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  21472606 tcaa 21472609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19488851 - 19488542
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||| ||| ||||  || || ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  |    
T  19488851 ccagcaggcttctaatgatcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatt 19488752  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| ||    
T  19488751 tcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagg 19488652  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  19488651 aatacgaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaacctggaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaactta 19488552  T
Q  328 acatcaactt 337  Q
    ||||||||||    
T  19488551 acatcaactt 19488542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Original strand, 25768896 - 25769199
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||    
T  25768896 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatttct 25768995  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||| |||| |||||    
T  25768996 taaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaat 25769095  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  25769096 acaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcattttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgaca 25769195  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  25769196 tcaa 25769199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8762509 - 8762202
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  8762509 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 8762410  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| | ||||| ||| || |  |||||||| || |||||    
T  8762409 tcaaatcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttttgtgactttattctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaat 8762310  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  8762309 acaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttaca 8762210  T
Q  331 tcaacttg 338  Q
    || |||||    
T  8762209 tccacttg 8762202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 19435707 - 19436025
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||    
T  19435707 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacataaactgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 19435806  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  19435807 tcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttattctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 19435906  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19435907 acaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatccaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcaca 19436006  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  19436007 tccacttgctgagcttctc 19436025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28291975 - 28291823
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28291975 ggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcttt 28291876  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  28291875 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagct 28291823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Original strand, 19454131 - 19454445
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| ||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||| ||||    
T  19454131 ttctgatgttcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaat 19454230  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  | ||||| || || | |||||  || || | ||| |||| ||| ||||| |||||    
T  19454231 catgttacattttcgtagctcccggatgaatacttaagttactcttgtgactttcctcgaaaatcaattttttcaactcgtcatcatcaggaatacaaat 19454330  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19454331 tcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatccact 19454430  T
Q  337 tgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||||||||||    
T  19454431 tgttgtgcttctctg 19454445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28282389 - 28282071
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  28282389 gcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 28282290  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  28282289 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 28282190  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   | ||| || |||||| | |||||| ||||| |||    
T  28282189 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgaca 28282090  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  28282089 tccacttgctgtgcttctc 28282071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18966898 - 18966610
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||   ||| ||||||| |||||||||   || |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  18966898 tctggcacatctaaaggtgtcatcaacccaccaggtttatgatgctcaccttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaattgtggcacatcac 18966799  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
      ||||| | |||||| || || |  || || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18966798 tattcaacctagaccagcaaaacaaatttttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaat 18966699  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatctt 289  Q
    ||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18966698 catcttcctcatctcatcattgtcaggaatacaaattctacctcgaaatcacaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatctt 18966610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5296782 - 5296464
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||   || || | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  5296782 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgataagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 5296683  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||| | ||||| ||| || |  |||||||| || |||||    
T  5296682 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaagctactcttgtaactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaat 5296583  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  5296582 acaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaacattaaatcaacaaactttaca 5296483  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || | |||||| |||||||    
T  5296482 tccagttgttgcgcttctc 5296464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10468425 - 10468107
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || |||||  | |||||||| |||||||| || |  ||||    
T  10468425 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 10468326  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  10468325 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 10468226  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  10468225 acaaactcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaactttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttaca 10468126  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  10468125 tccacttgctgtgcttctc 10468107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 24365117 - 24365412
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  24365117 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacgaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttct 24365216  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  24365217 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaat 24365316  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  24365317 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 24365412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 19880003 - 19880323
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||   ||||||| ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| | || | ||| |    
T  19880003 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctggcaagtcaaacaggcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccactaaaacagctttt 19880102  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | || || ||||| | ||||| | | || ||||| || || |  |||||    
T  19880103 tcaagtcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtggctttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgttaggaat 19880202  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  19880203 acaaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagtctgattactatcaaccattaaatccacaaacttgaca 19880302  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  19880303 tcaacctgttgtgcttctctg 19880323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34645155 - 34644843
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||||||  |||||| || | ||| || || ||    
T  34645155 tctgatgttcaacctttgacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaactgagcaacatcacgcttcaaaccaacccaccaaaacagctttttcaagtc 34645056  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca-tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  34645055 gtggtacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatctt-ttcatctcatcgttatcaggaatgcaaat 34644957  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||| ||| ||||| |||||||| || || |||    
T  34644956 tctgcctctgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattgctatcaatcattaaatccacaaacttgacgtccact 34644857  T
Q  337 tgttgtgcttctct 350  Q
     |||| ||||||||    
T  34644856 agttgcgcttctct 34644843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 18795395 - 18795715
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |    
T  18795395 gcaggcttctgatgctcgaccttagacttctggcaagtcaaacacgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttt 18795494  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||| |  |||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  18795495 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttcttccaagatcaactttttcaactcatcattgtccggaat 18795594  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||  || ||| ||||| |||||||| |||    
T  18795595 acaaattctacctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagattgattactataaaacattaaatccacaaacttgaca 18795694  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  18795695 tcaacctgttgcgcttctctg 18795715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28288122 - 28288011
Alignment:
Q  158 ccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28288122 ccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacac 28288023  T
Q  258 accttgatcatc 269  Q
     |||||||||||    
T  28288022 gccttgatcatc 28288011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 15460041 - 15460359
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||| | || |||||    ||||| ||||||||||| || | |||||    
T  15460041 gcaggcttctgatgttcaatcttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgcgcgacatccttcttcaatccagaccaccaaaacaacttct 15460140  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||  | ||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||| || |||||    
T  15460141 tcaagtcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaat 15460240  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| || | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  15460241 acaaattctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcagcttgattactatcaaccattaaatccacaaacttgaca 15460340  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  15460341 tcaactcgttgtgcttctc 15460359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14381036 - 14380723
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||| |||||    
T  14381036 tctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 14380937  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || | ||| ||||| ||  |||| ||||||    
T  14380936 atggtacatctttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaatacaaatt 14380837  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14380836 cttcctctgaacctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccactt 14380737  T
Q  338 gttgtgcttctctg 351  Q
    | || |||||||||    
T  14380736 gctgcgcttctctg 14380723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 293
Target Start/End: Original strand, 18436309 - 18436576
Alignment:
Q  30 agcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttca----aaccagaccaccagaaaat 125  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||    | ||||||||||| || |     
T  18436309 agcaggtttctgatgttcaactttagacttctaacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcacttcaacccacccagaccaccaaaataa 18436408  T
Q  126 cttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatct 225  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || || |||  || |||     
T  18436409 cttcttcaaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttccagaatcaactttttgatttctgtatcatca 18436508  T
Q  226 ggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||||| ||||||||    || || | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18436509 ggaatacaaattctattccgaaaccgcaacactccttgatcatcaactttaaaatcactatcttcagt 18436576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14379380 - 14379173
Alignment:
Q  144 catcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcct 243  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || | ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  14379380 catctttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaatacaaattcttcct 14379281  T
Q  244 cggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtg 343  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  14379280 ctgaacctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgcg 14379181  T
Q  344 cttctctg 351  Q
    ||||||||    
T  14379180 cttctctg 14379173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21563661 - 21563388
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaa-aatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagct 176  Q
    ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||| || || || |||||||||||||||||||| || || || ||| |    
T  21563661 atacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatct-cttcaagtcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagtt 21563563  T
Q  177 acttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttg 276  Q
    ||| || || || || || | ||| | ||  || | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21563562 actcctgtggctttcctctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttg 21563463  T
Q  277 aagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    || |||||| | |||| || | |||||| |||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21563462 aaatcactagcctcagcttgattactagtaaccaatatatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctg 21563388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21569520 - 21569247
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaa-aatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagct 176  Q
    ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||| || || || |||||||||||||||||||| || || || ||| |    
T  21569520 atacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatct-cttcaagtcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagtt 21569422  T
Q  177 acttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttg 276  Q
    ||| || || || || || | ||| | ||  || | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21569421 actcctgtggctttcctctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttg 21569322  T
Q  277 aagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    || |||||| | |||| || | |||||| |||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21569321 aaatcactagcctcagcttgattactagtaaccaatacatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctg 21569247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23027287 - 23027235
Alignment:
Q  36 tttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  23027287 tttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaact 23027235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27565151 - 27565091
Alignment:
Q  277 aagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  27565151 aagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 27565091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18837387 - 18837328
Alignment:
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  18837387 tctttaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 18837328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27560193 - 27560106
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccacc 118  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||    
T  27560193 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctctcttcaacccagaccacc 27560106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 16098758 - 16098812
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  16098758 ggtttctgatgttcaatcttcgacttatgacaaaccaaacaagcatagacaaact 16098812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22796208 - 22796132
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaa 107  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  22796208 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaa 22796132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27371711 - 27372057
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371711 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 27371810  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371811 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27371910  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  27371911 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 27372010  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27372011 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 27372057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 24710476 - 24710822
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710476 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 24710575  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710576 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 24710675  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  24710676 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 24710775  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24710776 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttttgtgcttc 24710822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 9610578 - 9610924
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610578 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 9610677  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610678 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 9610777  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  9610778 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 9610877  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9610878 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 9610924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16925802 - 16926148
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16925802 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatctc 16925901  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925902 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16926001  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  16926002 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 16926101  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16926102 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 16926148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16999442 - 16999788
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16999442 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatctc 16999541  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999542 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16999641  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  16999642 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 16999741  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16999742 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 16999788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21145042 - 21144696
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145042 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 21144943  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21144942 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 21144843  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  21144842 catcttcttaatctcctcattgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 21144743  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||||||  || || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  21144742 ctagcaaccaataagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 21144696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21325267 - 21324931
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  21325267 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatatacgaattgtgcaacatcac 21325168  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325167 gtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 21325068  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  21325067 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 21324968  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||    
T  21324967 ctagcaatcaacaagtctacaaacttgacatcaactt 21324931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10869292 - 10869638
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869292 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 10869391  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10869392 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaat 10869491  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  10869492 catcttcttaatctcttcatcgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 10869591  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10869592 ctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaactttctgtgcttc 10869638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 24262812 - 24263158
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262812 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 24262911  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24262912 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaccctcttcaagaat 24263011  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  24263012 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 24263111  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  24263112 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 24263158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22324857 - 22324521
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324857 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 22324758  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22324757 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagaat 22324658  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||  | |       
T  22324657 catcttcttaatctcttcattatctgggacacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatct 22324558  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22324557 ctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactt 22324521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16923331 - 16923677
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923331 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 16923430  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923431 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16923530  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  16923531 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 16923630  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16923631 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaacttcctgtgcttc 16923677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16982594 - 16982940
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982594 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 16982693  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982694 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16982793  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  16982794 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 16982893  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16982894 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaacttcctgtgcttc 16982940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 17064159 - 17064505
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064159 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 17064258  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064259 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 17064358  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  17064359 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 17064458  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  17064459 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaacttcctgtgcttc 17064505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 17067817 - 17068163
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067817 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 17067916  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067917 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 17068016  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  17068017 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 17068116  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  17068117 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaacttcctgtgcttc 17068163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24876750 - 24876404
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24876750 tctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 24876651  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24876650 gtttcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaat 24876551  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||| ||   |       
T  24876550 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcggtccgatct 24876451  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  24876450 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 24876404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27218458 - 27218804
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218458 tctggcacgtgtaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 27218557  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218558 gttttaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27218657  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||| || | |       
T  27218658 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatct 27218757  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27218758 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 27218804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41608386 - 41608050
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41608386 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgttcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatctc 41608287  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608286 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 41608187  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  41608186 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 41608087  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  41608086 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactt 41608050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44385570 - 44385224
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44385570 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgcccgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacataaactatgccacatctc 44385471  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385470 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 44385371  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  44385370 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatttcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 44385271  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44385270 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 44385224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22756466 - 22756120
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22756466 tctggcacatctaaagataccatcatactagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttcttacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 22756367  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756366 gtttcaatctagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 22756267  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
     || ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  22756266 tattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 22756167  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  22756166 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacataaactttatgtgcttc 22756120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 24675931 - 24676267
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24675931 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaagtttctaatgctcaatcttcgactttagacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 24676030  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24676031 gtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaggctacttctatgactctcttcaagaat 24676130  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  24676131 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 24676230  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  24676231 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 24676267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24707481 - 24707147
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24707481 tggcacatctaaagataccatcgtaccagcaggtttctaatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaattgtgccacatcgcgt 24707382  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24707381 ttcaatccggaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaacca 24707282  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
    | ||||| |||  ||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | ||||    
T  24707281 ttttcttcatcaattcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgattact 24707182  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    | |||| | ||||| || |||||| ||||||||||    
T  24707181 aacaactaacaaataaaaaaacttgacatcaactt 24707147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23107731 - 23107399
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23107731 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 23107632  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  23107631 gtttcaatccagaccgccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggattaatactcaagttacttctatggctctcttcaggaat 23107532  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||| || |||| |||||||||||||||||  || || ||| | |||||||| | |  |    
T  23107531 cattttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcaattttaaaatcattgtcttcagtctgatca 23107432  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatca 333  Q
    |||||||||| ||| || |||||| | ||||||    
T  23107431 ctagcaaccaacaagtccacaaacattacatca 23107399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 23066833 - 23067169
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| | ||| |    
T  23066833 tctggcacatctaaagacaccatcataccagtaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaataatacacaaactgtgcaatatcgc 23066932  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23066933 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 23067032  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| |  || || ||||  |||||||| | |  |    
T  23067033 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaaccgcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatca 23067132  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  23067133 ctagaaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactt 23067169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21890719 - 21890383
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  21890719 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctaatgttcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgc 21890620  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    | ||||| || |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890619 gcttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 21890520  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| || |  ||| |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || ||||   ||||||| | | ||    
T  21890519 cattttcttcatctcatcgtcgtctagaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcacctccttcagtctgatta 21890420  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  21890419 ctagcaaccaacaagtccataaacttaacatcaactt 21890383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24819687 - 24819351
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||   || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  24819687 tctggcacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaagcaaacaggaatacacaaattgtgccacattac 24819588  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||| | ||||||||| || | | |||| ||||  || ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  24819587 ttttcaacctagaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagt 24819488  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   | ||    
T  24819487 catcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggatta 24819388  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  24819387 ctagcaaccaacaaatccacaaacttaacatctactt 24819351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 27788213 - 27788531
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  27788213 gcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 27788312  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  27788313 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 27788412  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||| || |||||| | |||||| ||||| |||    
T  27788413 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattagatcaaccaacttgaca 27788512  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  27788513 tccacttgctgtgcttctc 27788531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 12574825 - 12575143
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||  |    
T  12574825 gcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctctt 12574924  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| || ||    
T  12574925 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcagggat 12575024  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||| ||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||    
T  12575025 acaaactctacctctgaatctaagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaataccactaccagcaaccattagatcaactaacttgaca 12575124  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  12575125 tccacttgttgtgcttctc 12575143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 1064223 - 1064518
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  1064223 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 1064322  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |  |||||    
T  1064323 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgttaggaat 1064422  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  1064423 acaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 1064518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 31831130 - 31831425
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || | |||||    
T  31831130 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcataaacaaactgagcaacatctcttttcataccggaccaccaaaacagcttct 31831229  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||| || |||||    
T  31831230 tcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttctttaactcctcattgtcaggaat 31831329  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  31831330 acaaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 31831425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 349
Target Start/End: Original strand, 23277320 - 23277566
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| |    
T  23277320 ttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatta 23277419  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     ||| || |  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  23277420 actttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttcattacc 23277519  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  23277520 aacaaccatcaaatcaacgaacttcacatctacttgctgcgcttctc 23277566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Original strand, 23294407 - 23294713
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || |  |||||||| |||||||| || | |||||    
T  23294407 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacacttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 23294506  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| || || ||||| | ||| || |  |  |||| ||| |||||    
T  23294507 tcaaatcatgatacattttcgttgctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttcctctagaattaactttttcaaattatcatcatcaggaat 23294606  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  23294607 gcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagcttcattaccagcaaccattaaatccacaaacttcaca 23294706  T
Q  331 tcaactt 337  Q
    || ||||    
T  23294707 tccactt 23294713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 20828731 - 20829026
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  20828731 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctaacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatccctttttaaaccggaccaccaaaacagtttct 20828830  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  20828831 tcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 20828930  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  20828931 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcagatcaacaaactt 20829026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Original strand, 20833457 - 20833719
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  20833457 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctaacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatccctttttaaaccggaccaccaaaacagtttct 20833556  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  20833557 tcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 20833656  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20833657 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 20833719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27365050 - 27364733
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  27365050 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttt 27364951  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || || |||||    
T  27364950 tcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaat 27364851  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| || | |||||  ||| || ||||| |||||||| |||    
T  27364850 gcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgaca 27364751  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttct 348  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  27364750 tcaacctgttgcgcttct 27364733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19652016 - 19651703
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| |  | |||||| |||||    
T  19652016 tctgatgttcaacgttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaatcagcttcttcaaatc 19651917  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || ||||||||||||    
T  19651916 atgatacattttcgtagctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatgcaaatt 19651817  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagt--cactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaac 335  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |  || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19651816 cttcctctgaatctcaatacaccccgatcatccaccttgaagtcacactatcctcaatgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccac 19651717  T
Q  336 ttgttgtgcttctc 349  Q
    ||| || |||||||    
T  19651716 ttgctgcgcttctc 19651703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30210890 - 30210626
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||    
T  30210890 ccagcaggtttctgatgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccacca-aacaact 30210792  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || || |||  || ||| ||    
T  30210791 tcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttttgtgactttcttctagaatcatctttttcatttctgtatcatcagg 30210692  T
Q  228 aatgcaaattct-tcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||| |||||||| |||| | || | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  30210691 aatacaaattctatcct-gaaaccgcaacactccttgatcatcaactttaaaatcactatcttcagt 30210626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Original strand, 45529980 - 45530191
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||    
T  45529980 ccagcaggtttctgatgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaaacaact 45530079  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||  || ||| ||    
T  45530080 tcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttctagaatcatctttttcatttctgtatcatcagg 45530179  T
Q  228 aatgcaaattct 239  Q
    ||| ||||||||    
T  45530180 aatacaaattct 45530191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27210136 - 27209823
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||  | || |||||    ||||||||||||||||| || | |||||| || ||    
T  27210136 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaacgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtc 27210037  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |  |||| |||||| |  |||| ||| || ||||| || |||    
T  27210036 atgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaatatcaacttcttcaattctttattgtcaggaatacagatt 27209937  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
     | ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||  | | |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  27209936 ttgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaatcttgaaatcactattctcagcctgattactagtaaccataaaatccacaaacttgacatcaactt 27209837  T
Q  338 gttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||||||||||    
T  27209836 gttgtgcttctctg 27209823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Original strand, 23111318 - 23111525
Alignment:
Q  142 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaa-gctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattctt 240  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||| | ||||| || || | ||||| ||| || | ||| ||| | ||  ||||| |||||||     
T  23111318 tacatttttgtagctcccggatgaatacttaaagctacttatgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcatcactgtcaagaatgaaaattctg 23111417  T
Q  241 cctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgtt 340  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  23111418 cctcagaatctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcaccatctctagtttgattactagcaaccaacaaatccacaaacttaacatcaaatttct 23111517  T
Q  341 gtgcttct 348  Q
    ||||||||    
T  23111518 gtgcttct 23111525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11357845 - 11357657
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  11357845 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 11357746  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttca 219  Q
    | || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||    
T  11357745 tcaagtcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttca 11357657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 24949061 - 24949380
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||  |||||||| || | |||||    
T  24949061 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgataagtcaaacatgcatacacaaaatgagcaacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacagcttct 24949160  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |   | |||| ||  |||||    
T  24949161 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatgaggaat 24949260  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacaca-ccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaac 329  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| | |||  || ||| ||||||| | |||| |||| |||| ||    
T  24949261 gcaaattcttcctctgaatctcatcacaaccatgatcatcaaccttgaagtcacgatccttagtgccattaccagcaacccttaaattaacatacttcac 24949360  T
Q  330 atcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||| ||||  ||||||||||    
T  24949361 atccactttctgtgcttctc 24949380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23099803 - 23099669
Alignment:
Q  217 tcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaat 316  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||| || | |||||| |||||  ||||    
T  23099803 tcattatcaggaatacaaattctgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagtaaccaataaat 23099704  T
Q  317 caacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23099703 ccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctg 23099669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23817011 - 23816957
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  23817011 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaact 23816957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12640107 - 12640048
Alignment:
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  12640107 tcttcaaatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 12640048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 24642214 - 24642290
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaa 107  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  24642214 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaa 24642290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 41771585 - 41771931
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771585 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 41771684  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771685 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 41771784  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  41771785 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 41771884  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  41771885 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 41771931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 40709523 - 40709869
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709523 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 40709622  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709623 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 40709722  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||| || | |       
T  40709723 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttccgtctgatct 40709822  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  40709823 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 40709869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29475716 - 29475380
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29475716 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacatgaatacacaaactgtgccacatctc 29475617  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29475616 gtttcaaaccagaccaccaggaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 29475517  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  29475516 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 29475417  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  29475416 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 29475380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 19770703 - 19771050
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770703 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 19770802  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770803 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 19770902  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||  | |       
T  19770903 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatct 19771002  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19771003 ctagcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttct 19771050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22332527 - 22332184
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332527 ggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgatttctggcaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 22332428  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332427 tcaaaccagaccaccagaaaatcttatttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 22332328  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactacta 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |   |||    
T  22332327 cttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctcta 22332228  T
Q  304 gcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22332227 gcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 22332184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 16357245 - 16357591
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357245 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 16357344  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357345 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16357444  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  16357445 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 16357544  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16357545 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 16357591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 22135411 - 22135757
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22135411 tctggcacatctaaaggtaccatcactccagtaggtttttgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacacctc 22135510  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22135511 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttctagaat 22135610  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  22135611 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatcctttctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttcttcagtctgatta 22135710  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22135711 ctagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 22135757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27519150 - 27519496
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27519150 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 27519249  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27519250 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27519349  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  27519350 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 27519449  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27519450 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 27519496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 34567237 - 34567583
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567237 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 34567336  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567337 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 34567436  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  34567437 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 34567536  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34567537 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 34567583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Original strand, 18776516 - 18776849
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776516 ggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaactgtgccacatctcgtt 18776615  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776616 tcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 18776715  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactacta 303  Q
     ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||   |||||||| | | |||||    
T  18776716 tttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcatcgtcttcagtctgattacta 18776815  T
Q  304 gcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  18776816 gcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactt 18776849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27668131 - 27667786
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668131 tggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 27668032  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668031 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 27667932  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||  | |   ||    
T  27667931 tcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcgaaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagcctgatctct 27667832  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  27667831 agcaaccaacaaatccacaaactttacatcaactttctgtgcttct 27667786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 27611097 - 27611443
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611097 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 27611196  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611197 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27611296  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  27611297 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 27611396  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27611397 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 27611443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27685043 - 27684707
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685043 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaattttagacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 27684944  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27684943 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 27684844  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  27684843 catcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 27684744  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  27684743 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactt 27684707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14999382 - 14999046
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999382 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttagacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 14999283  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999282 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 14999183  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  14999182 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacactttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 14999083  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  14999082 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactt 14999046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 20800191 - 20800527
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20800191 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctaatgtttaatcttcgacctctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 20800290  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20800291 gtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaggttacttctatgactctcttcaagaat 20800390  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  20800391 cattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgatta 20800490  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  20800491 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 20800527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 23440953 - 23441296
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23440953 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttatgacaaactaaacaagaatacacaaattgtgctacatcgc 23441052  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23441053 gtttcaatccagaccaccagaatatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaat 23441152  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  23441153 cattttcttcatctcttcatcgtcacgaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgatta 23441252  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  23441253 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttttgtgc 23441296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23574480 - 23574819
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23574480 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 23574579  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23574580 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaataaa 23574679  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    |||        | ||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||| ||| ||| | | | ||    
T  23574680 cat--------tttcttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaaatcaccatcctcaatctgatta 23574771  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  23574772 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaattttttgtgcttct 23574819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37291139 - 37290794
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291139 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttctacttctgacagactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 37291040  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291039 gtttcaaactagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatgatacatcttcgtggctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 37290940  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  37290939 catcttcctaatctcttcaatgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacagcttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 37290840  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgctt 346  Q
     ||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37290839 ttagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttttgtgctt 37290794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 22349166 - 22349413
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349166 tctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 22349265  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22349266 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcccgtgactctcttcaagaat 22349365  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22349366 catcttcttaatctcttcattgtctagaatacaaattcttcctcggaa 22349413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 21881697 - 21882039
Alignment:
Q  6 cacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttc 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  21881697 cacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatctttgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgcgacatcgtgtttc 21881796  T
Q  106 aaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatct 205  Q
    || |||||||||||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21881797 aatccagaccaccagaatatcttcttcagattatgatacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctattcaagaatcattt 21881896  T
Q  206 tcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagc 305  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | |||||||    
T  21881897 tcttcatctctacataatcaggaatacaaatacgacctcggaaactcaacacaccatggtcatcgacattaaagtcaccatcttcagtctgattactagc 21881996  T
Q  306 aaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    ||||| ||| |  |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21881997 aaccaacaagtatacaaacttgacatcaactttctgtgcttct 21882039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Original strand, 23517273 - 23517616
Alignment:
Q  5 gcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgttt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||    
T  23517273 gcacatctaaagataccatcgtaccagcaggtttctgatgttcaatcttcaacttctgacaaactaaacaggattacacaaactatgccacatcgcattt 23517372  T
Q  105 caaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatc 204  Q
    ||| | |||||||  |||||| ||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23517373 caatcaagaccactggaaaattttcttcagatcatgatacatcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatt 23517472  T
Q  205 ttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactag 304  Q
    ||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| || | | ||||||    
T  23517473 ttcttcatctcttcatctttaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttctgtctgattactag 23517572  T
Q  305 caaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    ||||||  || || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  23517573 caaccaataagtctacaaacttgacatcaactttatgtgcttct 23517616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26738370 - 26738034
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26738370 tctggtacatctaaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgcaacatcac 26738271  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| | ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738270 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 26738171  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |  || || |||| ||||||||| | | ||    
T  26738170 cattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattcttcctcgaaatctcaacgcaccatgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagtctgatta 26738071  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||    
T  26738070 ctagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaactt 26738034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21338940 - 21338604
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  21338940 tctggcacatctaaagataccatcatccccgtaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaattaaacaagaatacacgaactgtgccacatcac 21338841  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||| | || | |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21338840 gtttcaacccagaccacgaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 21338741  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  || || ||| | | |||||| | | ||    
T  21338740 cattttcttcatctcatcatcgtctagaatacaaattctacctcggaatctcaatactccctgatcatcgattttaaaatcattgttttcagtctgatta 21338641  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21338640 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactt 21338604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 25423932 - 25424240
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  25423932 tctgacacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcgc 25424031  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25424032 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa-ttacttctatgactctcttcaagaat 25424130  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |  || || ||||||||| |||| | |  |    
T  25424131 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacacgttgatcatcgattttaaaatcactatctccagtctgatca 25424230  T
Q  301 ctagcaacca 310  Q
    ||||||||||    
T  25424231 ctagcaacca 25424240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20467740 - 20467448
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||   ||||||||||||| ||||||||  || ||||| | |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20467740 tctggcacttctaaagatgtcatcaacccagcaggtttctaatgctcaacttttgacttttaacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcac 20467641  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| || |||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20467640 gtttcaaccccgaccaccaaaccaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgttactctcttcaagaat 20467541  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20467540 catcttcttcatctcatcatcatcaggaatacaaattttgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagt 20467448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24798010 - 24797715
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  24798010 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 24797911  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  24797910 tcaaatcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 24797811  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  24797810 gcaaactctacctctgaacctcaaaacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 24797715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17268947 - 17268629
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  17268947 gcaggtttctgatggtcaaccttagacttctggcaagttaaacatgcatacacaaaatgagcgacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 17268848  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  17268847 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgctcaagctactcttgtgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 17268748  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  17268747 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatgccattaccagcaaccatcagatcaacaaacttgaca 17268648  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || || || ||||||||||    
T  17268647 tccacctgctgtgcttctc 17268629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21890371 - 21890052
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||    |||| | ||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| || |  |||||    
T  21890371 caggcttctgatgctcaaccttagacttttgacaagtcgaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaatttctt 21890272  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatg 231  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||| | | ||| ||| || | ||| ||| |||| ||||||    
T  21890271 caaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactaaagctacttttgtggctttcttccaaactcaactttttcaactcatcactatcaggaatg 21890172  T
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  21890171 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcaccaaccttgaagtcactatatttagtttgattactagcaaccattaaatcgacaaacttgacat 21890072  T
Q  332 caacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21890071 caacttgttgtgcttctctg 21890052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24619902 - 24619601
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||   || || | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||    
T  24619902 ttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaatagtttcttcaaat 24619803  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || ||||| |||||    
T  24619802 catggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaat 24619703  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24619702 tcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcgact 24619603  T
Q  337 tg 338  Q
    ||    
T  24619602 tg 24619601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24716133 - 24715832
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||   || || | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||    
T  24716133 ttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaatagtttcttcaaat 24716034  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || ||||| |||||    
T  24716033 catggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaat 24715934  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24715933 tcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcgact 24715834  T
Q  337 tg 338  Q
    ||    
T  24715833 tg 24715832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24749161 - 24748860
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||   || || | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||    
T  24749161 ttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaatagtttcttcaaat 24749062  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || ||||| |||||    
T  24749061 catggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaat 24748962  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24748961 tcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcgact 24748862  T
Q  337 tg 338  Q
    ||    
T  24748861 tg 24748860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 313
Target Start/End: Original strand, 21496828 - 21497110
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  21496828 gcaggcttttgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 21496927  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |  || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || || ||||  |||||    
T  21496928 tcaggtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatccttattaggaat 21497027  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatca 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21497028 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactagcaaccatca 21497110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23079702 - 23079384
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   || || | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  23079702 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagctacgtcgcgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 23079603  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  23079602 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactacttttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 23079503  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||| || |  |||||||||||||||||| | |    
T  23079502 acaaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcctccgtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 23079403  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || |||||||| |||||||    
T  23079402 tctacttgttgagcttctc 23079384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21831377 - 21831068
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  || || || |||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |  |    
T  21831377 ccagtaggcttctgatgttcaactttagatttttgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgcttcaatccggaccaccaaaacaatt 21831278  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| ||    
T  21831277 tcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaaactacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagg 21831178  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
     || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  21831177 gatacaaattctgcctcagaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatctttagtttgattactagcaaccaacaattctacaaactta 21831078  T
Q  328 acatcaactt 337  Q
    ||||||||||    
T  21831077 acatcaactt 21831068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14886604 - 14886312
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  14886604 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 14886505  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  14886504 tcaaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 14886405  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaa 323  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  |||||||||||||||    
T  14886404 acaaactctacctctgaacctcagcaccccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaa 14886312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37542994 - 37542699
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||| || |  ||||    
T  37542994 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcataccggaccaccaaaacagtttct 37542895  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||| || || |||||    
T  37542894 tcaaatcatggtacattttcgtagctcctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaatttcttcaactcttcgttgtcaggaat 37542795  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  37542794 acaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 37542699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21563535 - 21563269
Alignment:
Q  82 acaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttc 181  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  21563535 acaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttc 21563436  T
Q  182 tatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtc 281  Q
    | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| | |||||  ||||| |||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21563435 tgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcataattataaggaatacaaattatgtgtcggaatctcaacacacgttgatcatcaaccttgaagtc 21563336  T
Q  282 actatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21563335 accatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 21563269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Original strand, 20822215 - 20822528
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | |||||||||| |||| |||||    ||||| || |||||||| || | |||||| || ||    
T  20822215 tctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgtgcgacatccttcttcaatccggaccaccaaaacaacttcttcaagtc 20822314  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||| || ||||  ||||||    
T  20822315 atgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaacacaaatt 20822414  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| || | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20822415 ctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcttcagcttgattactagcgactatcaaatctacaaacttaacatcaactt 20822514  T
Q  338 gttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||||||||||    
T  20822515 gttgtgcttctctg 20822528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21680391 - 21680071
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  21680391 gcaggtttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttt 21680292  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || || |||||    
T  21680291 tcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaat 21680192  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| || | |||||  ||| || ||||| |||||||| |||    
T  21680191 gcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgaca 21680092  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  21680091 tcaacctgttgcgcttctctg 21680071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 20343037 - 20343332
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||| || |  ||||    
T  20343037 gcaggcttctgatgttcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaactggaccaccaaaacagtttct 20343136  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  20343137 tcaaatcatggtatatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 20343236  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  20343237 acaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 20343332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 25848830 - 25849125
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  25848830 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaattcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttct 25848929  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||| |||||| | ||| ||||| || |||||    
T  25848930 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactatcatcaagaatcaacttcttcaactcatcattgtcaggaat 25849029  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     || | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||||| ||||||    
T  25849030 acatactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaataaactt 25849125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 23472002 - 23472216
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  23472002 gcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacatatcaaacaggaatataccaactatgccacataacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 23472101  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||    
T  23472102 tcaaatcatgatacatcgttctagctcccggatgaatacttaagctacttctataaatctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaat 23472201  T
Q  231 gcaaattcttcctcg 245  Q
     |||||||| |||||    
T  23472202 acaaattctgcctcg 23472216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22235532 - 22235215
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || ||||||||||||||| | || | ||| ||    
T  22235532 caggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccagaccactaaaacagcttttt 22235433  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatg 231  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || | ||||||||||||  ||||     
T  22235432 caaatcatggtacatctttgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcttcattatcatgaata 22235333  T
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22235332 caaattcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcgaccttaaagtcactatcctcagcttcattaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcacat 22235233  T
Q  332 caacttgttgtgcttctc 349  Q
    | || || || |||||||    
T  22235232 ctacctgctgcgcttctc 22235215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Original strand, 22462714 - 22463026
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||| | || ||| |    ||||||||||||||||| || | |||||| || ||    
T  22462714 tctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgagcgacagccttcttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaagtc 22462813  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||| || ||||| ||||||    
T  22462814 atgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttccaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaatt 22462913  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  || | || | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22462914 ctgcctctaaatctcaacacaccttg-ttatcaaccttgaaatcactattctctgcttgattaccagcaaccattaaatccacaaacttaacatcaactt 22463012  T
Q  338 gttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||||||||||    
T  22463013 gttgtgcttctctg 22463026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 320
Target Start/End: Original strand, 22503434 - 22503723
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| | || |  ||||    
T  22503434 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaattaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccactaaaatagtttct 22503533  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||| || |||||    
T  22503534 tcaaatcatggtacattttagtagccccgggctgaatactcaacctactcttatgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcatcattgtcaggaat 22503633  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaac 320  Q
     || | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||| || |  ||||||||||||    
T  22503634 acatactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcattgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaac 22503723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Original strand, 20774586 - 20774834
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| || || || ||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | |||||    
T  20774586 ttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccaggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatca 20774685  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     |||||| |  || ||||| || || || |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | || | ||||    
T  20774686 acttcttcaattcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattact 20774785  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
      ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774786 cacaaccattaaatccacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 20774834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28894483 - 28894235
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | |||||    
T  28894483 ttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatca 28894384  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     |||||| |  || ||||| || || || |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | || | |||     
T  28894383 acttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattacc 28894284  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
      ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894283 cacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 28894235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28915954 - 28915706
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | |||||    
T  28915954 ttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatca 28915855  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     |||||| |  || ||||| || || || |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | || | |||     
T  28915854 acttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattacc 28915755  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
      ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28915754 cacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 28915706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28923309 - 28923061
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | |||||    
T  28923309 ttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatca 28923210  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     |||||| |  || ||||| || || || |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | || | |||     
T  28923209 acttcttcagttcctcattgtcagggatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctcggcttgattacc 28923110  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
      ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923109 cacaaccatcaaatccacgaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 28923061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Original strand, 21407907 - 21408086
Alignment:
Q  27 accagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatc 126  Q
    |||| |||||||||| || ||||  || ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |      
T  21407907 accaacaggtttctggtgttcaacttttgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaaataaa 21408006  T
Q  127 ttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctt 206  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |  |||||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  21408007 ttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctgcatgaatactcaaattacttctgtgactttgttctagaatcatctt 21408086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21936699 - 21936645
Alignment:
Q  133 aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21936699 aaatcctgatacatcttagttgctcctgggtgaatactcaaactacttctatgac 21936645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 109275 - 108929
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109275 tctggcacatctaaaggcaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 109176  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109175 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 109076  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  109075 catcttcttaatctcttcattgtctggaatataaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 108976  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  108975 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 108929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 113431 - 113751
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||  |||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||| ||||||||| || | |||||    
T  113431 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctggcaagttaaacatgcatacacaaactaagcaacatcacgcttcaaactagaccaccaaaatagcttct 113530  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || ||  ||||    
T  113531 tcaagtcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctattcttgtgactttcttccaaaatcagccttttcatctcatcgttgtcaagaat 113630  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||| |||| ||| |||    
T  113631 acaaattctgcctccgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgcaatcactatcttcagtttgattactattaaccattaaatccacaagcttgaca 113730  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  113731 tcaacctgttgcgcttctctg 113751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 95364 - 95116
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||  ||||||| ||||| | ||| |    
T  95364 ttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaatta 95265  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     |||||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| || | ||||    
T  95264 acttctttaattcttcattgtcgggaacacaaattctacctctaaatctcaatacaccttgctcatcaactttgaaatcaccatcttcagcttgattact 95165  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    | ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  95164 atcaaccattaaatccacaaacttgatgtcaacttgttgtgcttctctg 95116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 8708405 - 8708751
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8708405 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaataaacaaactgtgccacatctc 8708504  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8708505 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 8708604  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  8708605 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 8708704  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8708705 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 8708751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11236683 - 11236349
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11236683 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgatttctgacaaactaaacaagaatacacaaactgtgccacatctc 11236584  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236583 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 11236484  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  11236483 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 11236384  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaac 335  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  11236383 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaac 11236349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 10871795 - 10872141
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10871795 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatctc 10871894  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871895 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 10871994  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  10871995 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 10872094  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10872095 ctagcaatcaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 10872141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44790821 - 44790475
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44790821 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatctc 44790722  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790721 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 44790622  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  44790621 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 44790522  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44790521 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 44790475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 9596857 - 9597200
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9596857 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctaatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcac 9596956  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596957 gtttcaaaccagaccaccataaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 9597056  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  |||||||| | | ||    
T  9597057 catcttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 9597156  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  9597157 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcagctttttgtgc 9597200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 8199428 - 8199774
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199428 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 8199527  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199528 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 8199627  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  8199628 catcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 8199727  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8199728 ctagcaaccaacaagtctacaaactttacatcaactttctgtgcttc 8199774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18551228 - 18550882
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551228 tctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 18551129  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551128 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaattatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 18551029  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  18551028 tatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 18550929  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18550928 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 18550882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 18178542 - 18178888
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18178542 tctggcagatccaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaattgtgccacatctc 18178641  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18178642 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaat 18178741  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | || ||||| |||| ||| | |       
T  18178742 catcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattctaaaatcactgtctttagtctgatct 18178841  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18178842 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 18178888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16786 - 16452
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16786 tctggcccatctaaagataccattataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 16687  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16686 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgataca--ttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16589  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  16588 cattttcttcatctctgcatcgtcaggaatacaaatccgacctcggaatctcaacacactgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 16489  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  16488 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 16452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 13686864 - 13687200
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686864 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttagacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactgtgccacatctc 13686963  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686964 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 13687063  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  13687064 cattttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcagcacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 13687163  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  13687164 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactt 13687200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23203083 - 23202815
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23203083 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgtttgactttcgatttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgcgccacatctc 23202984  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23202983 gtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 23202884  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23202883 catcttcttaatctcttcattgtctggaatgcatattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 23202815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23509210 - 23508942
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23509210 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgtttgactttcgatttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgcgccacatctc 23509111  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509110 gtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 23509011  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509010 catcttcttaatctcttcattgtctggaatgcatattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 23508942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14333197 - 14333542
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333197 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 14333296  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14333297 gtttcaaaccagaccacaagaaa-tcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 14333395  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || || ||||  |||||||| | |       
T  14333396 catcttcttaatctcttcattgcctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacacctagatcatcgattttaaaatcaccgtcttcagtctgatct 14333495  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  14333496 ctagcaaccaacaagtccacacactttacatcaactttctgtgcttc 14333542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11552572 - 11552226
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552572 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttatgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 11552473  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11552472 gtttcaaaccaggccaccagaaaatcttctttcaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcctcaagaat 11552373  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||| || | |       
T  11552372 catcttcttaatctcttcattgtatggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcggtctgatct 11552273  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  11552272 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatgaactttctgtgcttc 11552226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 14955358 - 14955700
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14955358 tctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaattcacaaactgtgccacatctt 14955457  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14955458 gtttcaaaccaggccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctc----atgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaat 14955553  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  14955554 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 14955653  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  14955654 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 14955700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15160527 - 15160191
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160527 tctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttagacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactgtgccacatctc 15160428  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  15160427 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactaaatatactcctatgactctcttcaagaat 15160328  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |  || || ||||| |||||||| | |       
T  15160327 cattttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcagcacaccttgattgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 15160228  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  15160227 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactt 15160191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 12688301 - 12688646
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12688301 tctggcacatctaaaggtaccatcactccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 12688400  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12688401 gtttcaaactaggccaccaaaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaat 12688500  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||||| | |       
T  12688501 catcttcttaatctcttca-tgtctagaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcaatgtcttcagtctgatct 12688599  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  12688600 ctagcaaccaacaagtccacaaactttaaatcaactttctgtgcttc 12688646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15204419 - 15204755
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15204419 tctggtacatctaaggataccatcaacccagcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcac 15204518  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| | ||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15204519 gtttcaacctagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcttccggatgaatactcaagctacttttgtgactctcttcaagaat 15204618  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  15204619 catcttctttatctcttcatcgtcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacattccctgatcatcgaccttgaagtcactatcttcagtctaatta 15204718  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  15204719 ctagcaaccaacaagcccacaaacttaacatcaactt 15204755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 14040495 - 14040828
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14040495 tctggtacatttaaagataccatcatcccagaaggtttctaatgatcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 14040594  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14040595 gtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagatt 14040694  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||    
T  14040695 cattttcttcatctcatcagcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgatta 14040794  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14040795 ctaacaaccaacaaatctacaaacttaacatcaa 14040828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 14350525 - 14350858
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14350525 tctggtacatttaaagataccatcatcccagaaggtttctaatgatcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 14350624  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14350625 gtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgactctcttcaagatt 14350724  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||    
T  14350725 cattttcttcatctcatcagcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgatta 14350824  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14350825 ctaacaaccaacaaatctacaaacttaacatcaa 14350858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 321503 - 321160
Alignment:
Q  5 gcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgttt 104  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||    
T  321503 gcacatctaaagatgtcatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttttgacaaattaaacaaaaatatacaaaccgtgccacatcgcgttt 321404  T
Q  105 caaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatc 204  Q
     || ||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  321403 taatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatggatactcaagctacttctatcactttcttcaagaatcatt 321304  T
Q  205 ttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactag 304  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | | ||||||    
T  321303 ttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctatctcggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgattactag 321204  T
Q  305 caaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  321203 caaccaacaagtctacaagcttaacatcaactttttgtgcttct 321160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11771681 - 11771378
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  11771681 gcaggtttctaatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttct 11771582  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||||    
T  11771581 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaat 11771482  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||||||||| || ||| || ||||||||||||    
T  11771481 acaaattctgcctcgaaatctcaccacgccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaaca 11771382  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  11771381 tcaa 11771378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15154127 - 15153818
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  15154127 tctggcacatctaaagataccatcataccagcagatttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcac 15154028  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  ||||| | ||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15154027 gtttcaatccagaccaccaaaacaaattcttcagatcatgatacatcttcatagctcccggatggatactcaagctactcctatgactctcttcaagaat 15153928  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||    
T  15153927 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgatta 15153828  T
Q  301 ctagcaacca 310  Q
    ||||||||||    
T  15153827 ctagcaacca 15153818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14263662 - 14263342
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  14263662 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 14263563  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||| ||| || |||||||| | |||| |||| ||||| || || | ||||| ||| || |  || ||| |||| |||||    
T  14263562 tcaagtcatgatacatctttgtagttcctggatgaatacttaggctatttctgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcactatcaggaat 14263463  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| |||    
T  14263462 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagtaaccattaaatcaacgaacttgaca 14263363  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14263362 tcaacttgttgtgcttctctg 14263342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 337
Target Start/End: Original strand, 14212574 - 14212810
Alignment:
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14212574 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttcgatgactctcttcaagaat 14212673  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| || ||| |||  || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  14212674 cattttcttcatttctgcatcgtcgggaatacaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 14212773  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  14212774 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 14212810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Original strand, 15625379 - 15625646
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| || | ||    
T  15625379 ccagcaggtttctgatgctctacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaactgtgccacattacatttcaacccagaccaccaaaacaact 15625478  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  15625479 tcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcagg 15625578  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatca--tcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  15625579 aatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatctcgaccttaaagtcactatcttcagt 15625646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12206221 - 12205901
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||  || || |||||||||   ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |  |    
T  12206221 ccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatt 12206122  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || ||  |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | | || | ||| |||||||| ||    
T  12206121 tcttcaagtcatgaaacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaaccttttcaactcatcattatcagg 12206022  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  12206021 aatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttggttgctagccaccaacaaatccacaaactta 12205922  T
Q  328 acatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||| |  |||||||||    
T  12205921 acatcaacctcctgtgcttct 12205901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 19148042 - 19148362
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  19148042 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 19148141  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||| || | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  19148142 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaat 19148241  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  19148242 gcaaattcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgaca 19148341  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  19148342 tcaacttgctgtgcttctctg 19148362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 20747441 - 20747761
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  20747441 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 20747540  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||| || | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  20747541 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaat 20747640  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  20747641 gcaaattcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgaca 20747740  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  20747741 tcaacttgctgtgcttctctg 20747761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23505288 - 23504970
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  23505288 gcaggtttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 23505189  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || || || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  23505188 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttcttcattatcaggaat 23505089  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||| ||||||||| | |||||| ||||| |||    
T  23505088 acaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcaataccattaccagcaaccattagatcaaccaacttgaca 23504989  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  23504988 tccacttgttgtgcttctc 23504970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15102021 - 15101703
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||  |  ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  15102021 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactaagaaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 15101922  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |  || || ||||| |||||    
T  15101921 tcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcgttatcaggaat 15101822  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||    
T  15101821 acaaattcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgtcattaccaacaaccatcaaatcaataaacttgaca 15101722  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  15101721 tccacttgttgtgcttctc 15101703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18053371 - 18053053
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  18053371 gcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttt 18053272  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || |  || | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  18053271 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaagattaactttttcatttcttcattatcaggaat 18053172  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  18053171 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcagatcaaccaacttgaca 18053072  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  18053071 tccacttgctgtgcttctc 18053053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 13666368 - 13666686
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  13666368 gcaggcttctgatgttcaaccttcgacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 13666467  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  || |||||||| |||||    
T  13666468 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaat 13666567  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13666568 acaaattcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcaca 13666667  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  13666668 tctacttgttgtgcttctc 13666686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26118023 - 26117728
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  26118023 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacgaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 26117924  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  26117923 tcaaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaat 26117824  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| | | |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  26117823 acaaactttacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 26117728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16071712 - 16071395
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |   ||||| | ||| ||||||||  | ||||| |||||||| | ||||||||| || |  ||||    
T  16071712 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttttgacgagtcaaacatgcataaacaaactgaccaacatcacgtttcaacctagaccaccaaaataatttct 16071613  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || | ||||| ||| ||||  || ||||||||  ||||    
T  16071612 tcaaatcatggtatatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatggctttcctctaaaatcaactttttaaa-tcatcattatcatgaat 16071514  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16071513 acaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagcttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgaca 16071414  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || | |||  |||||||||    
T  16071413 tccatttgacgtgcttctc 16071395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 13022188 - 13022506
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |  |||||| | |||||||| || |  ||||    
T  13022188 gcaggcttctgatgatcaacattagacttctgacaagtcaaacaagcataaacaaactgagcaacatcacacttcaaaacggaccaccaaaacagtttct 13022287  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  13022288 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 13022387  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  13022388 acaaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttaca 13022487  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  13022488 tccacttgctgcgcttctc 13022506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 14434522 - 14434840
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   || || | ||| ||||| || || ||||| || |||||| | |||||||| || | ||| |    
T  14434522 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatatacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaacggaccaccaaaacagctttt 14434621  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  |||||||| || |||||    
T  14434622 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaat 14434721  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  14434722 acaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgaca 14434821  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || || || ||||||||||    
T  14434822 tccacctgctgtgcttctc 14434840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 15341262 - 15341580
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || | |||||    
T  15341262 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagctacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 15341361  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| | ||||| | ||| | ||| || |  |||||||| || |||||    
T  15341362 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaatttcttctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaat 15341461  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||  |  || ||| ||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  15341462 acaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactattttctttgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgaca 15341561  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| | ||||||||    
T  15341562 tccacttgctttgcttctc 15341580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16949889 - 16949572
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || |  ||||    
T  16949889 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttgaaaccggaccaccaaaacagtttct 16949790  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| |  |||||    
T  16949789 c-aaatcgtggtacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgttaggaat 16949691  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |  || ||| |||||||||||||| | |    
T  16949690 acaaattcttcctctaaatctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccaataatcattaaatcaacaaacttcaaa 16949591  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  16949590 tccacttgctgagcttctc 16949572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 19613506 - 19613826
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  19613506 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttt 19613605  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || || |||||    
T  19613606 tcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaat 19613705  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| || | |||||  ||| || ||||| |||||||| |||    
T  19613706 gcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgaca 19613805  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  19613806 tcaacctgttgcgcttctctg 19613826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11305681 - 11305386
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||| | |||||||| || |  ||||    
T  11305681 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaatcggaccaccaaaacagtttct 11305582  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  11305581 tcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 11305482  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  11305481 acaaactctacctctgaacctcagtacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 11305386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 49153132 - 49153427
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  49153132 gcaggcttctgatgctcaaccttggatttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcttttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 49153231  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  49153232 tcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 49153331  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  || |||||||||||||||    
T  49153332 acaaactctacctctgaacctcagaacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcaacaaatcaacaaactt 49153427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 12456533 - 12456828
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||||||||| || || || || ||||||||||  |||||||| || | |||||    
T  12456533 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaaatgagctacgtcacgtttcaaactggaccaccaaaacagcttct 12456632  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  12456633 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 12456732  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     ||||||||||||| ||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  12456733 acaaattcttcctctgaaccttagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaatgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaactt 12456828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13968086 - 13967791
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  13968086 gcaggcttctgatgctcaacctttgacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 13967987  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| || |||||||  ||||| |  || ||| | ||  ||||    
T  13967986 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcgagaatcaaattcttcaaatcatcactgtcaagaat 13967887  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||||||||||||    
T  13967886 acaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaactt 13967791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 825 - 507
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||    
T  825 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcacgcataaacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 726  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  725 tcaaatcatggtacatctttgttgctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 626  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||| ||| || ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  | |  |||||||||||||||||| | |    
T  625 acaaatttttcttctgaacctcataacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattacccgtagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 526  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  525 tctacttgctgagcttctc 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11387846 - 11387526
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaa-aatcttc 129  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  11387846 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatct-c 11387748  T
Q  130 tttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaa 229  Q
    || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || || || || || | ||| | ||| || | ||| |||||||| ||||    
T  11387747 ttcaagtcatgatacatcttcgtagctcccggatggatacttaagttactcctgtggctttcctctaaaattaactttttcaactcatcattatcaggaa 11387648  T
Q  230 tgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaac 329  Q
    | |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| || | |||||| |||||| ||||| |||||||| ||    
T  11387647 tacaaattctgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttgac 11387548  T
Q  330 atcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  11387547 atcaacttgttgcgcttctctg 11387526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14285725 - 14285476
Alignment:
Q  100 cgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||    
T  14285725 cgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaa 14285626  T
Q  200 tcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcact 299  Q
    ||| ||| || | ||| ||||| || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  || |    
T  14285625 tcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaatcctccctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccatt 14285526  T
Q  300 actagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| |||||||||||| | ||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  14285525 accagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccagttgctgtgcttctc 14285476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8211546 - 8211347
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  8211546 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttct 8211447  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  8211446 ttaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 8211347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Original strand, 12457471 - 12457733
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || |||||||  |||||| | |||||||| || |  ||||    
T  12457471 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacaagcataaacaaactgagcaacatctcacttcaaatcggaccaccaaaacagtttct 12457570  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || || || || |||||    
T  12457571 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcgttgtcaggaat 12457670  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
     |||| ||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  12457671 acaaactcttcctctaaacctcagcacaccttggtcatcaaccttaaaatcactatcctcagt 12457733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 173
Target Start/End: Original strand, 21662792 - 21662933
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||||    
T  21662792 caggtttctgatgttcaactttcgacttttgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaaacaacttctt 21662891  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaa 173  Q
     ||||| || || || || ||||||||||| |||||||||||    
T  21662892 caaatcatgatatatttttgtagctcccggatgaatactcaa 21662933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 14130704 - 14130852
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   || || | ||| ||||| || || ||||| || |||||| | |||||||| || | ||| |    
T  14130704 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatatacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaacggaccaccaaaacagctttt 14130803  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctact 179  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14130804 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 14130852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Original strand, 4440761 - 4440914
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttta 133  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | ||| ||||| | ||| |  ||    ||||  ||||||||||| || | | ||||||    
T  4440761 ggtttctgatgttcaatcgtcgacttctgacaaaccatacaagcatatacaaattctgcgatctccttcttcattccagaccaccaaaacaacctcttta 4440860  T
Q  134 aatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  4440861 aatcctgatacatcttcgtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 4440914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Original strand, 13353985 - 13354136
Alignment:
Q  36 tttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaa-aatcttctttaa 134  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||| ||| |  ||    ||||  |||| |||||| || ||||| ||| ||    
T  13353985 tttctgatgttcaatcttagacttctaacaaaccaaacaagcataaacaaactctgcgatctccttcttcattccagtccaccaaaacaatct-cttcaa 13354083  T
Q  135 atcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13354084 atcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 13354136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 45147385 - 45147425
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaaca 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45147385 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaaca 45147425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 186
Target Start/End: Original strand, 13455688 - 13455732
Alignment:
Q  142 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatga 186  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  13455688 tacatcttcgtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatga 13455732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 7781 - 8116
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggcttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 7880  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7881 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 7980  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |       
T  7981 catcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatct 8080  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  8081 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaact 8116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33037 - 32694
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037 tctggcacatctaaagataccatcataccagcgggtttctgatgctcaatctttgacctctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 32938  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32937 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaat 32838  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  32837 cattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgatta 32738  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||||||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||    
T  32737 ctagcaaccaacaagtctagaaacttgacatcaactttttgtgc 32694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 9438 - 9774
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9438 tctggcacatctaaagataccatcttaccagcgggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 9537  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 9637  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||  |||||| | | | ||    
T  9638 cattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaattcaccgtcttcattctgatta 9737  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  9738 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 9774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 3036 - 3382
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3036 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcgtcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 3135  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3136 gtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 3235  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  3236 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattaaacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 3335  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  3336 ctggcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 3382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 13310 - 13640
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13310 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 13409  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13410 atttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 13509  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||  ||| |||| | | ||    
T  13510 cattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacgccgtggtcatcgactttaaagtcaccgtctccagtctgatta 13609  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  13610 ctagcatccaacaagtccacaaacttaacat 13640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 8208 - 8476
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8208 tctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactagacaggaatacacaaactgtgccacatctc 8307  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8308 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaat 8407  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8408 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 8476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 43996 - 44264
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43996 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 44095  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44096 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgagtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaat 44195  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44196 catcttcttaatctcttcattgtctgtaatacaaattctctctcggaatctcaacacaccttgatcatc 44264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 9316 - 9662
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9316 tctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactagacaggaatacacaaactgtgccacatctc 9415  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9416 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaat 9515  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || ||| | ||||||||   |  |    
T  9516 catcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttcaaatcattgtcttcagtccgatca 9615  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9616 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 347
Target Start/End: Original strand, 15780 - 16124
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780 tggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactagtcaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 15879  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15880 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatca 15979  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || ||| | ||||||||   |   ||    
T  15980 tcttcttaatctctttattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtccgatctct 16079  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16080 agcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactttctgtgcttc 16124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 49948 - 49628
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  49948 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttt 49849  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || ||||| |||||    
T  49848 tcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttatcaggaat 49749  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||| | || |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||  ||| || ||||| |||||||| |||    
T  49748 gcaaattctgcatctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttcattactattaactattaaatccacaaacttgaca 49649  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  49648 tcaacctgttgcgcttctctg 49628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 955 - 733
Alignment:
Q  126 cttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatct 225  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  955 cttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttgtgactctcttccagaatcatcttctttatctcttcatcgtct 856  T
Q  226 ggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaact 325  Q
     |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  || || ||||| |||||||| | | |||||||||||| |||  | |||||||    
T  855 agaatacaaattctacctcgaaacctcaatacaccatgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaaggccacaaact 756  T
Q  326 taacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    | |||||||||| ||||||||||    
T  755 tgacatcaactttttgtgcttct 733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Original strand, 66249 - 66583
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  66249 tggcacatctaaagataccatcataccagcaagtttttgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggagtacacaaactgtgccacatcacgt 66348  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66349 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacattttcgtagctcccagatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 66448  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
    | ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||   | ||||    
T  66449 ttttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcatcaactttaaagtcaccgtcttcagtccgattact 66548  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  66549 agcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 66583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39284 - 38948
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39284 tctggcacatctaaggataccatcaaaccagcgggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcgc 39185  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39184 gtttcaatccagaccaccataaaattttcttcagatcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgagtctcttcaagaat 39085  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  39084 cattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgatctcggaatctcaacacaccatggtcatcaagcttaaagtcaccatcttcagtctgatta 38985  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || | ||| || ||||||||||    
T  38984 ctagcaaccaacaagtctaaaaaattgacatcaactt 38948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3869 - 3533
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3869 tctggcacatctaaagataccatcttaccagcgggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 3770  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3769 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 3670  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||  |||||| | | | ||    
T  3669 cattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaattcaccgtcttcattctgatta 3570  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  3569 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 181041 - 181387
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  181041 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcgatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 181140  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181141 gtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 181240  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  181241 cattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcggcctcggaatttcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 181340  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
     ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  181341 ttagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 181387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 100986 - 100750
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || | |||||    
T  100986 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaaatcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgcttcaaatcagaccaccaaaacagcttct 100887  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtg---aatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||| | ||   |||||| ||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| |  ||    
T  100886 tcaaatcatgatacatctttgtagctcccagatgaataatacttaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgttagg 100787  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttga 264  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  100786 aatacaaattcttcctctgaatctcaacacaccttga 100750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 63495 - 63149
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  63495 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttcttatgttcaatcttcgacttctgacaaacctaacaggaatacacaaactgcgccacatcgc 63396  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63395 gtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 63296  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||  |||||||| | | ||    
T  63295 cattttcttcatctcttcatcgtcaggaattcaaattcgacctcgtaatctcaacacaccttgtttttcgactttaaagtcaccttcttcagtctgatta 63196  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  63195 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttc 63149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 278294 - 277985
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  278294 tctggcacatctaatgataccatcatatcagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacatgaatacacaaattgtgccacatcgc 278195  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  278194 gtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaacctacttctatgactctcttcaagaat 278095  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  278094 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 277995  T
Q  301 ctagcaacca 310  Q
    ||||||||||    
T  277994 ctagcaacca 277985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 261180 - 261498
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| |    
T  261180 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttt 261279  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||  ||||| | ||| | ||| || |  |||||||| ||  |||     
T  261280 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaccttcttctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaagaac 261379  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||| |||  |  || ||| ||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  261380 acaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtctttattttctttgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgaca 261479  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| | ||||||||    
T  261480 tccacttgctttgcttctc 261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 12900 - 13247
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  12900 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaattaaacaagaatacacgaactgtgcaacatctc 12999  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||  |||||| |||| || | |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13000 gtttcagtccagacaaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctccagggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 13099  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| | | ||    
T  13100 cattttcttcatctcatcattgtctggaatacaaatcctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatta 13199  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13200 ctagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 6865 - 7209
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  6865 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatactcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagtatacacaaactgtgcaacatcgc 6964  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6965 gtttcaatccagaccacc---aaaacaactttagatcgtggtacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 7061  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||  || || |||||| |||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |  |    
T  7062 cattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctctaaaccttaacacagcttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatca 7161  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  7162 ctagcaaccaacaagtcaacaaacttaacatcgactttctgtgcttct 7209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 133 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 883 - 670
Alignment:
Q  133 aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgc 232  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| || || | ||||| ||| || | |||| ||||||| ||||| |    
T  883 aaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactct-cattatcaggaatac 785  T
Q  233 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  784 aaattcttcctctgaacctcaatacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacatc 685  T
Q  333 aacttgttgtgcttc 347  Q
     ||||||||||||||    
T  684 cacttgttgtgcttc 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 34868 - 35215
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  34868 tctggcacatctaaggataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgtcacattgc 34967  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34968 gtttcaatctagaccaccagaatattttcttcagatcatgatacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaat 35067  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  35068 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 35167  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35168 ctagcaaccgacaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 35215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 19444 - 19791
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  19444 tctggcacatctaaggataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgtcacattgc 19543  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19544 gtttcaatctagaccaccagaatattttcttcagatcatgatacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaat 19643  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  19644 cattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 19743  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19744 ctagcaaccgacaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 19791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 50274 - 50621
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  50274 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctggcaaatcaaacaagaatacgcaaactgtgccacatcac 50373  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||| || || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50374 gtttcaatccagaccagcaaaataacttctttagatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 50473  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  50474 cattttcttcatctcatcatcttctggaatacaaattctacctcgaaacctcaatacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagtctgatta 50573  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  50574 ctagtaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttttgcgcttct 50621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 56894 - 57195
Alignment:
Q  36 tttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaa 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56894 tttctgatgctcaattttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaa 56993  T
Q  136 tcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaa 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  || |||||| |||    
T  56994 tcgtgatacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgtaaa 57093  T
Q  236 ttcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaac 335  Q
    | |  |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||  |||||||| | | |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  57094 tccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgactttaaagtcaccgtcttcagtctgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaac 57193  T
Q  336 tt 337  Q
    ||    
T  57194 tt 57195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 196942 - 196606
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  196942 tctggcatatctaaagataccatcatatcagtgggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagaatacacaaactatgccacatctc 196843  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  196842 gtttcaatccagaccaccataaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatggctctcctcaagaat 196743  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  196742 cattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatacgacctcggaatctcaacacacgatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagtctgatta 196643  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  196642 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 196606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19480 - 19188
Alignment:
Q  52 ttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |    
T  19480 ttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatcacgtttcaatccagaccaccagaagatcttctttaaaccatgatacatctttg 19381  T
Q  152 tagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatct 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| |  |||||||| ||    
T  19380 tagctcccggatgaatactcaagctacttatatgactctattcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaacct 19281  T
Q  252 caacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||| |||| || |||||||| || ||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19280 caacgcaccatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaactggacatcaactttttgtgc 19188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 8240 - 8575
Alignment:
Q  2 ctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcg 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |   |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8240 ctggcacatctaaaggtaccatcattttagcatgtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatttct 8339  T
Q  102 tttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatc 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8340 tttgaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatc 8439  T
Q  202 atcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactac 301  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  || || ||| | |||||||| | |   |    
T  8440 atcttcgtaatctctccattgtctggaatacaaattcttccttggaatctcaacacaccttgaccatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatctc 8539  T
Q  302 tagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  8540 tagcaaccaacaagtccacaaactttacatcaactt 8575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 344
Target Start/End: Original strand, 49093 - 49368
Alignment:
Q  69 taaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaata 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| || |||| ||||||    
T  49093 taaacagaaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatctagaacaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtatctgccggatgaata 49192  T
Q  169 ctcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcat 268  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |  || ||||| ||||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  49193 ctcaagttacttttatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcattgtcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcat 49292  T
Q  269 caaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    | |  || || ||| | |||||||| | |  ||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  49293 cgattttaaaatcattgtcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtccacaaactttacatcagctttttgtgc 49368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 79958 - 79615
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  79958 tctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgttcgatcttcgacttatgacaaaataaacacaaatacacaaactgtgccacatctc 79859  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79858 gtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 79759  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  |||||||| | | ||    
T  79758 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaatttgatctcgtaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaattcaccttcttcagtctgatta 79659  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    ||||| ||||  || || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  79658 ctagctaccaataagtctacaaacttgacatcaactttttgtgc 79615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 6856 - 7199
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  6856 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaaccttcgacttatgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgc 6955  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6956 gtttcaatccagaccaccaaaatatcttctttagatcatgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 7055  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||| || || || |||| ||||||||||| | |     
T  7056 cattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccaaggtcatcgactttaaaatcaccatcttcagtttgattg 7155  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  7156 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttttgtgc 7199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 112952 - 112621
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  112952 tctggcacatctaaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaattaaacaagaatacacaaattgtgccacatcac 112853  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112852 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 112753  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  || || |||| ||||||||| | | ||    
T  112752 catcttcttcatctcctcatcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacacctcgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagtatgatta 112653  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    |||||| | | ||| || ||||||||||||||    
T  112652 ctagcagctaacaagtctacaaacttaacatc 112621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 332
Target Start/End: Original strand, 15749 - 16050
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  15749 gcaggtttctgatgctgaacttttgacttctgacaaatcaaacagtaatacacaaactgtgccacgtctcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 15848  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  || |||||    
T  15849 tcaaatcatgatacatcttagtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcgtcgtcaggaat 15948  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || | | |||| ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  15949 acaaattatatctcgaaatctcaacacaccctgatcatcgactttgaagtcactatcttccgtctgattacttgcaaccaacaagtccacaaacttaaca 16048  T
Q  331 tc 332  Q
    ||    
T  16049 tc 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 229885 - 230194
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  229885 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaattttcgacttctgacaaaccaaacaagaatacacaaattgtgccacatcac 229984  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  229985 gtttcaatccagaccaccaaaccaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaat 230084  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||| | | ||    
T  230085 catcttcttcatctcatcatcgtctggaatataaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgatcttaaaatcaccatcttcagtctgatta 230184  T
Q  301 ctagcaacca 310  Q
    ||||||||||    
T  230185 ctagcaacca 230194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 218851 - 218548
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  218851 gcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacaggaattcacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttct 218752  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  218751 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattatcaggaat 218652  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  |  || || ||| | |||||||| | | |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  218651 acaaattctgcctcggaatctcaacaatccctgatcattgattttaaaatcattgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaaca 218552  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  218551 tcaa 218548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16497 - 16843
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16497 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcac 16596  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16597 gtttcaatccagaccaccaaaataacttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16696  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||  |||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |  || || ||||||||||| || | | ||    
T  16697 cattttcttcatctc-acatcgtctggaatgcaaattctacctcgaaacctcaagacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttctgtctgatta 16795  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  16796 ctagcaaccaacaagtctacaaccttaacatcaactttctgtgcttct 16843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28836 - 28493
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28836 tctggcacatctaaagataccatcataccagcgggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 28737  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||  ||||| || | ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28736 gtttcaatacagacaactataaaatcttctttggatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 28637  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| | |||| |||  |  ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  28636 cattttcttcaactctacatcgtaaggaatacaaatccgacctcggaaactcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtctgatta 28537  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||||||||| ||| || | |||||| |||||||||| ||||||    
T  28536 ctagcaaccaacaagtctataaacttgacatcaactttttgtgc 28493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3921 - 3585
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3921 tctggaacatctaaagataccatcatcccaacaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaattaaacaggaatacacaaattgtgccacatcac 3822  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| | ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3821 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 3722  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    |||||| || ||||| |||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |  || || |||||| ||||||| | | ||    
T  3721 catctttttcatctcatcaccgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacgcaccttgagcatcgattttaaaatcactaccttcagtctgatta 3622  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
     ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  3621 ttagcaaccaccaagtctacaaacttaacatcaactt 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 130956 - 131281
Alignment:
Q  8 catctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaa 107  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  130956 catctaacgataccatcataacagcaggtttctgatgcttaaccatcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactttgcaacgtcgcgtttcaa 131055  T
Q  108 accagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttc 207  Q
     ||||||||||| || | |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  131056 tccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacctcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgcttctatggctctcttcaagaatcattttc 131155  T
Q  208 ttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaa 307  Q
    || ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |  ||||||||    
T  131156 ttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatcactagcaa 131255  T
Q  308 ccatcaaatcaacaaacttaacatca 333  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||    
T  131256 ccaacaagtccacaaacttaacatca 131281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Original strand, 59652 - 59885
Alignment:
Q  56 acttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagc 155  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||| || | |||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  59652 acttctgacaaattaaacacgcatacccaaattgtgccacatgtcgcttcaacccggaccaccaaaataacttcttaaaatcttgatacatttttgtagc 59751  T
Q  156 tcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaac 255  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||  || ||| ||||| ||||||||    || || | ||||    
T  59752 tcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttccataatcatcttcttcatttctgtatcatcaggaatacaaattctattccgaaaccgcaac 59851  T
Q  256 acaccttgatcatcaaccttgaagtcactatctt 289  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  59852 actccttgatcatcaactttaaaatcactatctt 59885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32217 - 31881
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  32217 tctggtacatctaaagataccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctcacaaattaaataggaatacacaaactgtgccacatcac 32118  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || | ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32117 gtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcacatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 32018  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| | | ||    
T  32017 catcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgatta 31918  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||    
T  31917 ctagcaactaacaagtctacaaacttgacatcaactt 31881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 25816 - 26152
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25816 tctggcacatctaacgataccatcatacaagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttgtgacaaactaaataggaatacacaaactgtgccacatctc 25915  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25916 gtttcaatccagaccaccagaaaatcatcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 26015  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
     || ||||| |||||||||   |  ||||| |||||    ||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | ||    
T  26016 tattttcttcatctcttcaccgttaggaattcaaatctgacctcggaatcttaacacatcatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgatta 26115  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
     ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  26116 atagcaaccaacaagtatacaaacttaacatcaactt 26152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 8632 - 8834
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8632 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactttgccacatctc 8731  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8732 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtcatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 8831  T
Q  201 cat 203  Q
    |||    
T  8832 cat 8834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 1256 - 1476
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1256 tctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgcccgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacataaactatgccacatctc 1355  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1356 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 1455  T
Q  201 catcttcttaatctcttcatt 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1456 catcttcttaatctcttcatt 1476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3278 - 2942
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  3278 tctggcacatctaaggataccatcataccagcgggtttctgacgttcagtcttcgacttctgacaaaccaaacaagaacacacaaactgtgccacatcgc 3179  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3178 gtttcgatccagaccaccagaaaattttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 3079  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| |||||| |||  || ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| | | ||    
T  3078 cattttcttcatctctacatcgtcaggaatacaaatccgacctcggaacctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagtcttatta 2979  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  2978 ctagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactt 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17441 - 17094
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17441 tctggcacatctaaagatagcatcaacccaacaggtttttgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcac 17342  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  17341 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttttgtgactctcttcaagaat 17242  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||  |||| |||||||| |||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||    
T  17241 catcttcttcatctcatcatcttcaagaatacaaattctgcctcagaatcgcaacacctcctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtctgatta 17142  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17141 ctagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgcgcttct 17094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 22714 - 22923
Alignment:
Q  6 cacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttc 105  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22714 cacatctagagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaaacaggaatatacaaactgtgccacatctcgtttc 22813  T
Q  106 aaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatct 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22814 aaaccagaccaccaaaaaattttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatatgactctcttcaagaatcattt 22913  T
Q  206 tcttaatctc 215  Q
    |||| |||||    
T  22914 tcttcatctc 22923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 73 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 130
Alignment:
Q  73 caggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactca 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  326 caggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactca 227  T
Q  173 agctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  226 agctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgttgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttcatcatc 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 337
Target Start/End: Original strand, 4745 - 5049
Alignment:
Q  33 aggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttt 132  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| || | ||||||     
T  4745 aggtttctgatgctccacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactatgccacatcacgtttcaacccagacgaccaaaacaacttcttc 4844  T
Q  133 aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgc 232  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |    
T  4845 aaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatac 4944  T
Q  233 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  4945 aaattctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatc 5044  T
Q  333 aactt 337  Q
    |||||    
T  5045 aactt 5049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 337
Target Start/End: Original strand, 11875 - 12179
Alignment:
Q  33 aggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttt 132  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| || | ||||||     
T  11875 aggtttctgatgctccacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactatgccacatcacgtttcaacccagacgaccaaaacaacttcttc 11974  T
Q  133 aaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgc 232  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |    
T  11975 aaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatac 12074  T
Q  233 aaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  12075 aaattctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatc 12174  T
Q  333 aactt 337  Q
    |||||    
T  12175 aactt 12179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1531 - 1184
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1531 tctggcacatctaaagataccatcattcccgcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcac 1432  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| || | ||| || | ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  1431 gtttcaacccagatcaccaaaacaactttttcagatcatgatatatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaaatat 1332  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  1331 cattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatta 1232  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1231 ctagcaaccaaaaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 1184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 1518 - 1865
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||| |    
T  1518 tctggcacatctaaatataccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaaccgtgcaacatcac 1617  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    | ||||| |||||||| || || | | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1618 gcttcaatccagaccatcaaaacaacatcttcaaatcatggtgcatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttcaatgactctcttcaagaat 1717  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  1718 catcttcttcatctcatcatcgtctagaatacaaatccttcctctaaatctcaacacaccttgatcgtcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatta 1817  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1818 ctagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Original strand, 4903 - 5206
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || | |||||    
T  4903 gcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttct 5002  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  5003 ttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgattactcaagctacttttatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaat 5102  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  5103 acaaattctgcctcgaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgattacttgcaaccaacaagtctacaaacttaaca 5202  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  5203 tcaa 5206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 287 - 5
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  287 tctggcacatctaaggataccatcatactagcaggtttgtgatgttcaatcttcgatttctgacaaactaaacaggaatacaaaaattgtgccatatcgc 188  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  187 gtttcaaaccagaccactagaaaattttcttcagatcatgaaacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 88  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcac 283  Q
     || ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||    
T  87 tattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcaacgaccttaaagtcac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Original strand, 6067 - 6410
Alignment:
Q  5 gcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgttt 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6067 gcacatataaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctaacaagtcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgcgttt 6166  T
Q  105 caaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatc 204  Q
    ||| | ||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6167 caatctagaccactaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcatagctcccagatggatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatt 6266  T
Q  205 ttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactag 304  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||  |||||||||||| |||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||||||    
T  6267 ttcttcatctcatcattgtctagaatgcaaatcctacctcgaaacttcaacacacctttatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactag 6366  T
Q  305 caaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6367 caaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 6410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4742 - 4470
Alignment:
Q  76 gaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagc 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4742 gaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagc 4643  T
Q  176 tacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaacctt 275  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4642 tacttctatgaccctcttcaagaatcattatcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcaacctt 4543  T
Q  276 gaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
     ||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  4542 aaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctaaaaacttgacatcaactttctgtgcttct 4470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8551 - 8204
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  8551 tctggtacatctaaagataccatcattcccgcaggtttctgatgctcaactttcgacttctaacaaatcaaacatgaatacacgaactgtgccacatcac 8452  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || ||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8451 gtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatctgcgtagctcccggatggatacttaagccacttctatgattctcttcaagaat 8352  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | ||    
T  8351 catcttcttcatctcatcatcgtcatgaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaactcactgtcttcagtctgatta 8252  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8251 ctagcaaccaacaagtatacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 8204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 29787 - 30130
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |    
T  29787 tctggcacatctaaagacaccatcataccagtaggtttctgatggtcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactctgcaacatcgc 29886  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||| || | || | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29887 gtttcaatccagacgacaaaaacaacctctttagatcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 29986  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  | |||||| ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||||||| | |  |    
T  29987 cattttcttcatctcatcatcgtttggaatacaaatcctacctcgaaacctcaacacacgttgatcatcgatcttaaaatcactgtcttcagtctgatca 30086  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
    |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  30087 ctagaaaccaacaaatgtacaaacttaacatcaactttttgtgc 30130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 28929 - 29249
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  28929 gcaggcttctaattctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactaagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 29028  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||| ||| || | ||| ||| |||| |||||    
T  29029 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtggctttcttccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaat 29128  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||| |||    
T  29129 gaaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgaca 29228  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  29229 tcaacttgctgtgcttctctg 29249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 3216 - 3451
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  3216 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcaatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcac 3315  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3316 gtttcaatccagaccaccagaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaat 3415  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  3416 cattttcttcatctcctcatcgtctggaatacaaat 3451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 337
Target Start/End: Original strand, 102093 - 102411
Alignment:
Q  19 accatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccacc 118  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  102093 accatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaataggaatacacaaactgtgacacatcatgtttcaacccagaccacc 102192  T
Q  119 agaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttc 218  Q
    | || | ||| || | ||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  102193 aaaacaactttttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcctc 102292  T
Q  219 attatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatca 318  Q
    ||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||     
T  102293 atcgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactattttcagtctcattactatcaaccaacaaatct 102392  T
Q  319 acaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  102393 acaaacttaacatcgactt 102411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 538 - 871
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||      
T  538 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcgggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgt 637  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  638 gtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaataatcaagttacttctatgactctcttcaagaat 737  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| || |  ||||||||  |||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| |  || || |||||||| ||||| | | ||    
T  738 cattttcttcatctcatcgtcgtctggaatagaaatcctacctcgaaacctcaacacagcttgatcatcgattttaaaatcactatcctcagtctgatta 837  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  838 ctagccaccaacaactctacaaacttaacatcaa 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7355 - 7019
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |    
T  7355 tctggcacatctaaagataccatcaacccaacaggtttctgatgctccacttttgacttctgacaaaccaaacatgaatatacaaactatgccacatcac 7256  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7255 gtttcaaccgagaccaccaaaacatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaat 7156  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| || || ||||  |  ||||| |||||||| ||||  || | |||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |  |    
T  7155 catcttcttcatttcatcatcgtaaggaatacaaattctacctcaaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcattatcttcagtctgatca 7056  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  7055 ctagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactt 7019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Original strand, 9842 - 10148
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| || | ||| |    
T  9842 gcaggtttttgatgctcaacctttgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactatgccacatcacgtttcagtccagaccaccaaaacaactttt 9941  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||  ||||    
T  9942 tcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatgaatgctcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcatgaat 10041  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  || | | |||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  10042 acaaattcttcctcagaatctcaacacaccttggtcatcgaccttaaagtcattatcttttgtctgattactagcaaccaacaagtacacaaacttaaca 10141  T
Q  331 tcaactt 337  Q
    |||||||    
T  10142 tcaactt 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 2107 - 2458
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  2107 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgacgctcatccttcgacttctgacaaataaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgc 2206  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttc----tatgactctcttcaa 196  Q
     |||||| ||||||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    ||||||||| |||||    
T  2207 atttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgctacatcttcggagctcccggatgaatactcaagttacttctatatatgactctattcaa 2306  T
Q  197 gaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttc 296  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| |     
T  2307 gaatcattttcttcatctcgtcatcgtctggaagacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctg 2406  T
Q  297 actactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    | |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2407 attactagcaaccaacaagtacacaaacttaacatcaactttttgcgcttct 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26353 - 26061
Alignment:
Q  56 acttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagc 155  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  26353 acttctgacaaatcaaacaagaatatacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaataactttttcaaatcatgatacatcttcgtagc 26254  T
Q  156 tcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaac 255  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  26253 tcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcgaaatctcaac 26154  T
Q  256 acaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | | |||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26153 acaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgattactagcaactaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgtgcttct 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 116340 - 116077
Alignment:
Q  30 agcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttc 129  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||     
T  116340 agcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgagaaatcaaacatgaatacacaaactgcgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttt 116241  T
Q  130 tttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaa 229  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  116240 ttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaa 116141  T
Q  230 tgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  116140 tacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagt 116077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25963 - 25664
Alignment:
Q  35 gtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaa 134  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||| ||    
T  25963 gtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaa 25864  T
Q  135 atcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaa 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  25863 atcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtcaggaatacaa 25764  T
Q  235 attcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaa 334  Q
    ||||| ||||| || | |||||| || | |||||| |  || || || ||||||||||| | | ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  25763 attctccctcgaaaacgcaacactccctaatcatcgattttaaaatcgctatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaa 25664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 149442 - 149760
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  149442 gcaggcttctgatgctcaacattagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 149541  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  149542 tcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaat 149641  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  149642 gcaaatttttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactttcctcagtttcattaccagcaaccatcaagtccacaaacttgaca 149741  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  149742 tccactagttgtgcttctc 149760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 195132 - 194820
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||| ||||    
T  195132 ttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaat 195033  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  || |||| ||| |||||||||||    
T  195032 cgtgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaat 194933  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  194932 tcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacatccact 194833  T
Q  337 tgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||||||    
T  194832 tgttgtgcttctc 194820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 5622 - 5940
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  5622 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 5721  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  5722 tcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaat 5821  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5822 acaaattcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 5921  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5922 tcaacttgttgtgcttctc 5940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 1735 - 2071
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1735 tctggcacatctaaagacaccatcattccagtaggtttttgatcctcaactttcgacttctgacaaatcaaaccagaatacacaaattgtgccacatcac 1834  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| | ||| ||||| || | ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1835 gtttcaacctagatcaccaaaataactttttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctttgagaat 1934  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||||| | | ||    
T  1935 catcttcttcatctcctcatcgtctagaatacaaattctacctcggaatctgaacacaccttgatcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgatta 2034  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  2035 ctagcaactaccaagtctacaaacttaacatcaactt 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1114 - 802
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| || |    
T  1114 ttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagt 1015  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||| ||| |  | ||| ||| |||| |||||||||||    
T  1014 catgatacatttttgtagctcccgggtgaatactctagctactcttgtgactttcttctagaatcaacttttccaactcatcactatcaggaatgcaaat 915  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  914 tcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttccgtttcattattagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccact 815  T
Q  337 tgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||||||    
T  814 tgttgtgcttctc 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 332
Target Start/End: Original strand, 2811 - 3087
Alignment:
Q  56 acttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagc 155  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  2811 acttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagc 2910  T
Q  156 tcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaac 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2911 tcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcattaggaatacaaattctgcctcagaatctcaac 3010  T
Q  256 acaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    || || |||||||| |  || || |||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  3011 accccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagtaaccaacaagtccacaaacttaacatc 3087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41767 - 41472
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  41767 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 41668  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||    
T  41667 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattgtcaggaat 41568  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  41567 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaatcaacaaactt 41472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 46832 - 46515
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | ||||||    
T  46832 caggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttctt 46733  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatg 231  Q
     ||||| || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||| | ||| || |  || |||||||| |||||     
T  46732 caaatcatgattcatttttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaata 46633  T
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46632 cagattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagcttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttcacat 46533  T
Q  332 caacttgttgtgcttctc 349  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  46532 ctacttgctgtgcttctc 46515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Original strand, 17553 - 17856
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| || | |||||    
T  17553 gcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcatttcaacctagaccaccaaaacaacttct 17652  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||    
T  17653 tcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaat 17752  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |  || || ||| |||||||||| | | |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  17753 acaaattctgcctcagaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcattatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaaca 17852  T
Q  331 tcaa 334  Q
    ||||    
T  17853 tcaa 17856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13335 - 13017
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||    
T  13335 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttgtgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 13236  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  13235 tcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 13136  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13135 gcaaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattacccgcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 13036  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  13035 tccacttgttgtgcttctc 13017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Original strand, 68249 - 68562
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||| | || | |||||| |||||    
T  68249 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccctcttcaaaccagaccacaaaaacaacttcttcaaatc 68348  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||| || ||||| ||||||    
T  68349 atgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaatt 68448  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| || | |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  68449 ctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttagcatcaactt 68548  T
Q  338 gttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||||||||||    
T  68549 gttgtgcttctctg 68562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4387 - 4069
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  4387 gcaggcttttgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 4288  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | | | || |  || |||||||| |||||    
T  4287 ttaaatcatgatacatctttgtagctcccgaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaaccttttgaaatcatcattatcaggaat 4188  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4187 acaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcaca 4088  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  4087 tctactagttgtgcttctc 4069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19805 - 19473
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || |    
T  19805 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacgaactgtgcaacgtcgc 19706  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  19705 gtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacatctatggctctcttcaagaat 19606  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || ||||  |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |  |    
T  19605 cattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatca 19506  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatca 333  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  19505 ctagcaaccaacaagtctacaaacttaacatca 19473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 20772 - 21090
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||| | ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |    
T  20772 gcaggtttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaataaattgagctacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttt 20871  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  |||||||| |  |||||    
T  20872 tcaaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcatgctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtaaggaat 20971  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||| |||||||||| ||| |||    
T  20972 acaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaatctttaca 21071  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || |||||||| |||||||    
T  21072 tccacttgttgcgcttctc 21090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 45389 - 45707
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | ||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||  || | |||||    
T  45389 gcaggcttctgatgttcaaatttagacttctgacaagtcaaacatgcatacaaaaactgagcaacgtcgcgtttcaaaccggaccaccgaaacagcttct 45488  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  |||||||| ||  || |    
T  45489 tcaaatcatggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaagatt 45588  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||   |||||||| |||||||||||||| |||    
T  45589 acaaattctacatctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattatccgcaaccattaaatcaacaaactttaca 45688  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  45689 tccacttgctgcgcttctc 45707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11661 - 11325
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||   || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  11661 tctggcacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaagcaaacaggaatacacaaattgtgccacattac 11562  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||| | ||||||||| || | | |||| ||||  || ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  11561 ttttcaacctagaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagt 11462  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   | ||    
T  11461 catcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggatta 11362  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  11361 ctagcaaccaacaaatccacaaacttaacatctactt 11325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17853 - 17517
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||   || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  17853 tctggcacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaagcaaacaggaatacacaaattgtgccacattac 17754  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
     |||||| | ||||||||| || | | |||| ||||  || ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  17753 ttttcaacctagaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctctttaagagt 17654  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   | ||    
T  17653 catcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatcgactttgaagtcactatcttcagtcggatta 17554  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  17553 ctagcaaccaacaaatccacaaacttaacatctactt 17517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7793 - 7464
Alignment:
Q  3 tggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgt 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  7793 tggcacatctaatgataccatcataccagcaggtttctgatgttcaaccttcgacttctaacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcgt 7694  T
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    ||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7693 ttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatca 7594  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
    | ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |   ||    
T  7593 ttttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatcctacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatctct 7494  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatc 332  Q
    | |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  7493 aacaaccaacaagtctacaaacttaacatc 7464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Original strand, 3664 - 3981
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  3664 caggcttctgatgctcaaccttagtcttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctt 3763  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatg 231  Q
     || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| | ||| || | ||| |||||||||||||||    
T  3764 caagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccagaataaactttttcaactcatcattatctggaatg 3863  T
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3864 caaattctccctctgaacctcaacacaccctgaacatcaaccttgaagtcactctcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacat 3963  T
Q  332 caacttgttgtgcttctc 349  Q
    | ||||| || |||||||    
T  3964 ccacttgctgcgcttctc 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 7214 - 7482
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  7214 tctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttttgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacgtcac 7313  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||  | |||||||| || | | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  7314 gtttcaattcggaccaccaaaacaacctctttagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttacttctatggatctcttcaagaat 7413  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 269  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || || |  ||||||||||||||    
T  7414 catcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaaccttagtacaccttgatcatc 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 3048 - 3368
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  3048 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 3147  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||| |||||    
T  3148 tcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgacattcttccagaatcatctttttcaactcatcattatcaggaat 3247  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  3248 acaaattcttcctctgaacctcaacacaccctcaccatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttggca 3347  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  3348 tcaacttgctgtgcttctctg 3368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24340 - 24548
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24340 tctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcatcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgc 24439  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    |||||||   |||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  24440 gtttcaatttagaccaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcctcgatgaattctcaagctacttctacgactctcttcaataat 24539  T
Q  201 catcttctt 209  Q
    ||| |||||    
T  24540 cattttctt 24548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 347
Target Start/End: Original strand, 24544 - 24655
Alignment:
Q  236 ttcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaac 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| || ||| ||||  |||||||    
T  24544 ttcttcatcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccagcaagtctacacacttgccatcaac 24643  T
Q  336 ttgttgtgcttc 347  Q
    || |||||||||    
T  24644 tttttgtgcttc 24655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 3982 - 4318
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||   || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  3982 tctggcacatctaaaggtgtcatcagccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacatgaataaataaattgtgccacatcac 4081  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4082 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacatcttggtagatcccaaatgaatactcaagctacttctatgactctcttccaaaat 4181  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| | | ||    
T  4182 catcttcttaatctcatcatcgtcatgaatacaaattcggcctcgaaatctcagcacaccttggtcatcaactctaaagtcactatcctcagtctgatta 4281  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  4282 ctagcaaccaacaagtccacaaacttgacatcaactt 4318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Original strand, 1777 - 2042
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| || | ||    
T  1777 ccagcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaactgtgtcacatcacgtttcaacctagaccaccaaaacagct 1876  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| ||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |    
T  1877 tcttcaaatcatgatacatctttatagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcgagaatcatcttctttatctcatcattgtcaag 1976  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  1977 aatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcaactttaaagtcactatcctcagt 2042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24509 - 24200
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  |    
T  24509 ccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacaagcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatt 24410  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| ||    
T  24409 tcttcaagtcattatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagg 24310  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  24309 aatacaaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaactta 24210  T
Q  328 acatcaactt 337  Q
    ||||||||||    
T  24209 acatcaactt 24200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 348
Target Start/End: Original strand, 32283 - 32600
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaa-atcttct 130  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||    
T  32283 caggattctgatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaaacagtttct 32382  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  32383 tcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaat 32482  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  32483 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgaca 32582  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttct 348  Q
    || |||||||| ||||||    
T  32583 tccacttgttgcgcttct 32600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 14881 - 15034
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||||| || || |    
T  14881 tctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctaacaaatcaaacaagcatacacaaactgtgcaacgtcgc 14980  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtag 154  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| || || ||||||||||    
T  14981 gtttcaatccggaccaccaaaaaaacttctttagatcatgatagatcttcgtag 15034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18319 - 18221
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacac-aaactgtgccacatc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18319 tctggcacatctaaagatacaatcatcccagcagatttctgatgctcagctttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaaactgtgccacatc 18221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14543 - 14251
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||   ||| |||||||||||| |||||  || ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||      
T  14543 tctggcacatctaaaggtgtcatcaacccaacaggtttctgatactcaacttttgacttctaacaaatcaaacatgaatacacaaactgtgtcacatcat 14444  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14443 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaat 14344  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14343 catcttcttcatctcatcatagtcaggaatacaaattctgcctcgaaaccgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagt 14251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19466 - 19134
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||| |||| || || |    
T  19466 tctggaacatctaacgataccaacatatcagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctggcaaatcaaacaagcatacacaaaccgtgcaacgtcgc 19367  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 200  Q
    ||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19366 gtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaat 19267  T
Q  201 catcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcacta 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| |  || || ||| | |||||||||| |  |    
T  19266 cattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaattcattgtcttcagtttgatca 19167  T
Q  301 ctagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatca 333  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  19166 ctagcaaccaacaagtccacaaactttacatca 19134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14343
Alignment:
Q  100 cgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaa 199  Q
    |||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14576 cgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaa 14477  T
Q  200 tcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcact 299  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||| |  || || ||| | |||||||||| |      
T  14476 tcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattttaaattcattgtcttcagtttgatc 14377  T
Q  300 actagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatca 333  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  14376 actagcaaccaacaagtccacaaactttacatca 14343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 48468 - 48148
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || |||||  ||||||| | ||||||||| || | |||||    
T  48468 gcaggcttctgatgctcaaccttatacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcaggtttcaacctagaccaccaaaacaacttct 48369  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  48368 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctactcctatggctttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaat 48269  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  48268 acaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgaca 48169  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  48168 tcaacttgctgtgcttctctg 48148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 57281 - 56963
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||   || || | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |    
T  57281 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaactttt 57182  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttctt-aatctcttcattatctggaa 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || || || | ||| ||| ||||    
T  57181 ttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaactgt-catcatcaggaa 57083  T
Q  230 tgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaac 329  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  57082 tgcaaattcttcccctgaacctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatgccattaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcac 56983  T
Q  330 atcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  56982 atccacttgttgcgcttctc 56963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11491 - 11173
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  11491 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 11392  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || || || || | ||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  11391 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcctccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaat 11292  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  11291 gcaaattcttcctttgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcaca 11192  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  11191 tctacttgctgcgcttctc 11173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15261 - 14943
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  15261 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 15162  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || || || || | ||||| ||| || |  || |||||||| |||||    
T  15161 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcctccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaat 15062  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15061 gcaaattcttcctttgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcaca 14962  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  14961 tctacttgctgcgcttctc 14943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 349
Target Start/End: Original strand, 20861 - 21173
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||    |||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| || | |||||| ||||    
T  20861 ttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtctaacacgcatacaccaactgagcaacatcacgtttcaacccagacaaccaaaatagcttcttcaaat 20960  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |||||    
T  20961 catgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaat 21060  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
     ||||||  |||  |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21061 ccttcctgtgaacttcaatataccctgatcattaaccttgaagtcactatcttcaatttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccact 21160  T
Q  337 tgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||    
T  21161 tgctgtgcttctc 21173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Original strand, 6894 - 7234
Alignment:
Q  4 ggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| || || | ||    
T  6894 ggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaagcaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcatt 6993  T
Q  104 tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||| || |||||||| || | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6994 tcaatccggaccaccaaaacaacttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcat 7093  T
Q  204 cttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactacta 303  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| |  ||||  || ||||  |||||||||| ||| |  || || ||||| |||| ||| | |  ||||    
T  7094 cttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcaaaacctcagtacaccttgattatcgattttaaaatcactgtctttagtctgatcacta 7193  T
Q  304 gcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgc 344  Q
     |||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7194 acaactaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgtgc 7234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3903 - 3737
Alignment:
Q  171 caagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatca 270  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3903 caagctactcctatggctctcttcaagaatcatcttgttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcg 3804  T
Q  271 accttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |  || |  || || ||||| |||| | |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  3803 attttaatatcgctgtcttcggtttgattacttgcaaccaagaagtcaacaaacttaacatcaactt 3737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 5302 - 5622
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  5302 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagtttct 5401  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| | ||||  ||| || | ||| ||| |||| |||||    
T  5402 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgtatttcttccaaaatcgactttttcaactcatcactatcaggaat 5501  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||| |||    
T  5502 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgaca 5601  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5602 tcaactttttgtgcttctctg 5622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 348
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3940
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | || | |||||| ||||    
T  3629 ttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccactaaaacagcttcttcaaat 3728  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||||||| |||||||||||    
T  3729 catgatacattttcgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaat 3828  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3829 tcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcaatgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctact 3928  T
Q  337 tgttgtgcttct 348  Q
    || |||||||||    
T  3929 tgctgtgcttct 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 490 - 176
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |  ||||| || |    
T  490 ttctgatgttcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaataatttcttcaagt 391  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||| ||||  |||||||| |    
T  390 catgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcactatcaagaatgcaagt 291  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |    
T  290 tcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttgattactagcaaccattaaatccacaaacatgacatcaatt 191  T
Q  337 tgttgtgcttctctg 351  Q
    |  ||||||||||||    
T  190 ttatgtgcttctctg 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22813 - 22519
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||    
T  22813 ccagcagtcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagct 22714  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||||||| ||    
T  22713 tcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcagg 22614  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaa 322  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22613 aatacaaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 22519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14625 - 14340
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||  |  ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||    
T  14625 ttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaacttagtaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaat 14526  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||||||| ||||| |||||    
T  14525 catgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaat 14426  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaa 322  Q
     ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14425 ccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 14340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 28097 - 28415
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  28097 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 28196  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  28197 tcaagtcgtgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaat 28296  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  28297 acaaattcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttatagtcactatcctcagtttcattaccagcaactatcaggtcaacaaacttgaca 28396  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  28397 tccacttgttgtgcttctc 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 19992 - 20310
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  19992 gcaggcttctgatgttcaacctttgacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 20091  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||  || |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  20092 tcaaatcatgatacaaattagtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactctcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 20191  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20192 acaaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttcagcttcattaccagtaaccatcaaatcaacaaacttaaca 20291  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || |||||||| |||||||    
T  20292 tccacttgttgcgcttctc 20310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 351
Target Start/End: Original strand, 762 - 1075
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||   ||||| | |||||||||||| || |||||    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  762 tctgatgctcaaccttatacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatc 861  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |||||||| || ||||| ||||||    
T  862 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaatt 961  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| || | |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  962 ctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctcagcttgattactagtaaccataaaatccacaaacttgacatcaactt 1061  T
Q  338 gttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||||||||||    
T  1062 gttgtgcttctctg 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 741 - 1061
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| || |  ||||    
T  741 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacgaactgagcaacatcacgtttcaacccaaaccaccaaaacaatttct 840  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||| | | ||||| ||| || |  || |  ||||| |||||    
T  841 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtggctttctaccaaaatcaactttttcaaatcattgttatcaggaat 940  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  941 acaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttcattactagcaaccattaaatcaacaaacttgaca 1040  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1041 tcaacttgttgtgcttctctg 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 10665 - 10985
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| || |  ||||    
T  10665 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacctagaccaccaaaacagtttct 10764  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |  || ||||||||  ||||    
T  10765 tcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaggctacttctgtgactttcttctagaatcaactttttcaaatcatcattatcaagaat 10864  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10865 gcaaatccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccattttcagtttcattgctagcaaccattaaatcaacaaactttaca 10964  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    | |||||  ||||||||||||    
T  10965 taaactttatgtgcttctctg 10985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1087
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||    
T  1406 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttct 1307  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | | || | ||| ||||| || |||||    
T  1306 tcaagtcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacattttcaactcatcattgtcaggaat 1207  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1206 gcaaattcttcctctgaacctcaacactccttgatcatcaaccttgaaatcactatcttcag-tccattactagcaaccattaaatcaacaaacttgaca 1108  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||  |||| ||||||||||||    
T  1107 tcggcttgctgtgcttctctg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 27396 - 27716
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||    
T  27396 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttct 27495  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| |||||    
T  27496 tcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaat 27595  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  27596 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaacattgaagtcatcattttcagtttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgaca 27695  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||| ||  || |||||||||    
T  27696 tcaattttctgcgcttctctg 27716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40196 - 39876
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  |    
T  40196 ccagcaagtttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatt 40097  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| | ||||| ||| || |  || |||||||  ||    
T  40096 tcttcaagtcatgataaatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgaatatcttctaaaatcaactttttcaattcatcattataagg 39997  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || |||||||||    
T  39996 aatacaaattcttcctcgaaatctcaacacgccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaactta 39897  T
Q  328 acatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  39896 atatcaactttttgtgcttct 39876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28205 - 28114
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccacca 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||  || || ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  28205 ccagcaagtttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccacca 28114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Original strand, 18226 - 18541
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaa-atcttctttaaa 135  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| ||| |||| || ||| |  ||||| |||    
T  18226 ttctgatgctcaaccttaaacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacatttcaacccaaaccatcaaaaacaatttcttcaaa 18325  T
Q  136 tcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaa 235  Q
    |  || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| ||||| ||||||| ||| || | ||| ||| ||||  |||||||||    
T  18326 tgatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgttactttcttccagaatcaactttttcaactcatcactatcatgaatgcaaa 18425  T
Q  236 ttcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaac 335  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18426 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaac 18525  T
Q  336 ttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18526 ttgctgtgcttctctg 18541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 89808 - 89561
Alignment:
Q  102 tttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatc 201  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||  | ||||| ||||| | ||||    
T  89808 tttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagctactcttgtgactttcttctaaaatc 89709  T
Q  202 atcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactac 301  Q
    | ||| || |  || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  89708 aactttttcaaatcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattac 89609  T
Q  302 tagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  89608 tagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctc 89561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 90486 - 90239
Alignment:
Q  102 tttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatc 201  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||  | ||||| ||||| | ||||    
T  90486 tttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagctactcttgtgactttcttctaaaatc 90387  T
Q  202 atcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactac 301  Q
    | ||| || |  || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  90386 aactttttcaaatcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattac 90287  T
Q  302 tagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  90286 tagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctc 90239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 390664 - 390489
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  390664 tctggcatatctaaagataccatcattctagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgctacatcac 390565  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagct 176  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  390564 gtttcaatccagaccaccaaaataactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagct 390489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10245 - 9923
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||  || || |||||||||   ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |    
T  10245 ccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatt 10146  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || || ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| |     
T  10145 tcttcaagtcatgatacatctttttagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaga 10046  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  10045 aatacaaattcttcctcggaatctcaacacacccagatcatcaaccttgaagtcactatctttagttggattactaccaaccaacaaatccacaaactta 9946  T
Q  328 acatcaacttgttgtgcttctct 350  Q
    |||||||| |  |||||||||||    
T  9945 acatcaaccttctgtgcttctct 9923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20875 - 20559
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20875 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatagacaaactgagcaacatcacgcttcaacccagaccaccaaaaaagcttct 20776  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||  | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| | ||| | ||||| ||| || |  || |||| ||| |||||    
T  20775 tcaaatcaagatagatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgacttttttctaaaatcaactttttcaaatcatcatcatcaggaat 20676  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20675 gcaaattcttcctctgaatctcaacacaccatgatcatcaaccttaaagtcactatcctgagtgccactaccagcaaccatcaaatcgacaaacttgaca 20576  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || ||||| ||||||||    
T  20575 tccacttgctgtgcttc 20559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4886 - 4568
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || | |||||    
T  4886 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 4787  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||| || |  |||||||| || |||||    
T  4786 tcaaatcatggtacattttcgtagcttccggatgaatactcaagctactcttatgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaat 4687  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  4686 acaaattctacctctgaatctcaatacaccctaatcatcaaccttgaagtcattatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttaca 4587  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  4586 tccacttgctgcgcttctc 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 349
Target Start/End: Original strand, 2461 - 2778
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||    
T  2461 caggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacttttcaaaccagaccaccaaaacagcttctt 2560  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatg 231  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||| || || | |||||  || || |  || |||||||| ||||||    
T  2561 caaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaataattaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaatg 2660  T
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2661 caaattcttcctctgaaccttaacacaccctaatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcatcaaacttaagat 2760  T
Q  332 caacttgttgtgcttctc 349  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  2761 ctacttgctgtgcttctc 2778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16147 - 15829
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  16147 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacagccataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 16048  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  16047 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcttcattatcaggaat 15948  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |  || ||| |||  | |  |||||||||||||||||| | |    
T  15947 acaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatccttggtatcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 15848  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || |||| ||| |||||||    
T  15847 tccactttttgagcttctc 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 219 - 337
Target Start/End: Original strand, 10497 - 10615
Alignment:
Q  219 attatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatca 318  Q
    |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||     
T  10497 attatcagggatacaaattctgcctcggtatctcaacacaccttcatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtcc 10596  T
Q  319 acaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10597 acaaacttaacatcaactt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 351
Target Start/End: Original strand, 48096 - 48296
Alignment:
Q  151 gtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| || | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  48096 gtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacc 48195  T
Q  251 tcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctct 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  48196 tcaacacaccttcatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacctgatgtgcttctct 48295  T
Q  351 g 351  Q
    |    
T  48296 g 48296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51614 - 51298
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||  | || || || |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  51614 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaaacgagcgacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 51515  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || ||||| || |||||    
T  51514 ttaaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaat 51415  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  51414 acaaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcaca 51315  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || ||||||||||||||    
T  51314 tccacttgttgtgcttc 51298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 60648 - 60332
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||  | || || || |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  60648 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaaacgagcgacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 60549  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || ||||| || |||||    
T  60548 ttaaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaat 60449  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  60448 acaaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcaca 60349  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || ||||||||||||||    
T  60348 tccacttgttgtgcttc 60332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 67036 - 66720
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||  | || || || |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  67036 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaaacgagcgacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 66937  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || ||||| || |||||    
T  66936 ttaaatcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaat 66837  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  66836 acaaattctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcaca 66737  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttc 347  Q
    || ||||||||||||||    
T  66736 tccacttgttgtgcttc 66720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 349
Target Start/End: Original strand, 27722 - 27815
Alignment:
Q  256 acaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  27722 acaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctc 27815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18646 - 18346
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaacca-gaccaccagaaaatcttc 129  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||| |||||||| || | ||||    
T  18646 gcaggtttctgatgctcaacttttgactttggacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgca----aaaccaagaccaccaaaacaacttc 18551  T
Q  130 tttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaa 229  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||    
T  18550 ttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaa 18451  T
Q  230 tgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaac 329  Q
    | ||||||||   ||| || | |||||| || |||||||| |  || || |||| ||||||||| | | |||||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  18450 tacaaattctgaatcgaaaacgcaacactccctgatcatcgattttaaaatcacaatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtccacaaacttaac 18351  T
Q  330 atcaa 334  Q
    |||||    
T  18350 atcaa 18346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2102 - 1968
Alignment:
Q  217 tcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaat 316  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2102 tcattatcaggaatacaaattcttcctcggaacctcaacacaccctgatcattaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaatcatcaaat 2003  T
Q  317 caacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2002 caacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctg 1968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7579 - 7261
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  7579 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaactcaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 7480  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  7479 tcaaatcatgatacatctttgtagccctcgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 7380  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  7379 acaaactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttaca 7280  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  7279 tccacttgctgcgcttctc 7261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 43655 - 43973
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||   || || | |||||||||||| || || ||  |||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  43655 gcaggcttctaatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagctacgtcaagtttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 43754  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||| || |||||    
T  43755 tcaaatcattgtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaattaacttcttcaactcatcattgtcaggaat 43854  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||| | |    
T  43855 acaaattcttcctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagcagtcatcaaatcaacaaacttcaaa 43954  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  43955 tctacttgctgagcttctc 43973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 51297 - 51017
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaa-aatcttc 129  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  51297 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatct-c 51199  T
Q  130 tttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaa 229  Q
    || ||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || |  || ||| |||| ||||    
T  51198 ttcaaatcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagttacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcactatcaggaa 51099  T
Q  230 tgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccat 311  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  51098 tgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatctccagtttcattactagaaaccat 51017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 202905 - 202596
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||  |||||   ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||  | |||||||| || |  |    
T  202905 ccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacattcatatacaaactgtgcaacattacgtttgaatgcggaccaccaaaacaatt 202806  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| || || || |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| |||||||| ||    
T  202805 tcttcaagtcatgatacatctttgtagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacttttttaactcatcattatcagg 202706  T
Q  228 aatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactta 327  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  ||||||||| ||| || |||||||||    
T  202705 aatacaaattctaccgcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgatttttagcaaccaacaagtccacaaactta 202606  T
Q  328 acatcaactt 337  Q
    ||||||||||    
T  202605 acatcaactt 202596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 349
Target Start/End: Original strand, 323648 - 323894
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| |    
T  323648 ttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctccaaaatta 323747  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     ||| || |  || |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||     
T  323748 actttttcaaatcatcatcatcaagaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcattgccattacc 323847  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  323848 agcaaccattaaatcaacaaacttcacacccacttgttgtgcttctc 323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 56334 - 56039
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  56334 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacttcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 56235  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  56234 tcaaatcatggtacatctttgtagctctcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 56135  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  56134 acaaattcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatccaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaattatcaaatcaacaaactt 56039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33111 - 32791
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||| || | ||| |    
T  33111 gcaggtttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttt 33012  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || || |||||    
T  33011 tcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaat 32912  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| || | |||||  ||| || ||||| |||||||| |||    
T  32911 gcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaactattaaatccacaaacttgaca 32812  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  32811 tcaacctgttgcgcttctctg 32791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2789 - 2471
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  2789 gcaggcttcttatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacgaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaacttct 2690  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  |||||||| || |||||    
T  2689 tcaaatcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaat 2590  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  2589 acaaatccttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcgaccttgaagtcactatcctctgtttcattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcaca 2490  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || |||||||| |||||||    
T  2489 tctacttgttgcgcttctc 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 7932 - 8250
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||  |||||||| || | ||| |    
T  7932 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgataagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttat 8031  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||| || | ||| | ||| || |   | |||| ||| |||||    
T  8032 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgactctcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcatcaggaat 8131  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  8132 gaaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcccttaccagtaaccatcaaatcaacaaacttcaca 8231  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || || || || |||||||    
T  8232 tctacatgctgcgcttctc 8250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48588 - 48322
Alignment:
Q  83 caaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttct 182  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  48588 caaactgagctacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactctt 48489  T
Q  183 atgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtca 282  Q
    |||||| || || | ||||| ||| || |  |||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48488 atgactttcctctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtca 48389  T
Q  283 ctatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  48388 ctatcctctgtttcattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccacttgttgtgcctctc 48322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 348
Target Start/End: Original strand, 197 - 513
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || || ||  |||||||||| |||||||| || |  |||||    
T  197 caggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcatgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttctt 296  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatg 231  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  |||||||| || |||||     
T  297 caaatcatggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattttcaggaata 396  T
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
     ||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  397 taaattctacctctgaatctcaatacaccctggtcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacat 496  T
Q  332 caacttgttgtgcttct 348  Q
    | ||||| || ||||||    
T  497 ccacttgctgcgcttct 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Original strand, 4648 - 4968
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | ||| | |||||| || | ||| |||||||| | ||||||||| || |  ||||    
T  4648 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacacgcataaaaaaactgagcaatatcacgtttcaaccaagaccaccaaaacaatttct 4747  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | || || ||   ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||| |||  | |  || |||||||  |||||    
T  4748 tcaagtcatgaatcatctttttagctcccggatgaatacttaagctacttctgtggctttcttctaaaatcaactttatcaaatcatcattattaggaat 4847  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4848 gcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccctcttcggtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgaca 4947  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4948 tcaacttgttgtgcttctctg 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2841 - 2601
Alignment:
Q  109 ccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttct 208  Q
    ||||||||||| || | |||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | |||||  || |    
T  2841 ccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaaatttt 2742  T
Q  209 taatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaac 308  Q
    | | ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2741 tcaactcatcattatcaggaatgcaaattctttctccgaacctcaacacaccctcatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattaccagcaac 2642  T
Q  309 catcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  2641 catcaaatcaacaaacttgacatccagttgctgtgcttctc 2601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 323
Target Start/End: Original strand, 27133 - 27425
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | ||| ||||| || || |||| || ||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  27133 gcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaagcataaacaaaatgagcaacatatcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 27232  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  27233 tcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcatgatcaggaat 27332  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaa 323  Q
     |||| |||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |  |  |||||||||||||||    
T  27333 acaaactcttcctttgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcactaccaatagtcatcaaatcaacaaa 27425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 2309 - 2491
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2309 tctggcacttctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttttgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatccc 2408  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttcta 183  Q
    |||| || ||||||||||| || |  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  2409 gttttaatccagaccaccaaaatagtttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatcaatacttaagctacttcta 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 337
Target Start/End: Original strand, 2500 - 2614
Alignment:
Q  223 tctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaa 322  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||||| ||||| |  || || ||| | |||||||| | | |||||||||||| ||| || ||||    
T  2500 tctggaatacaaattctacctctaaacttcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcattgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaa 2599  T
Q  323 acttaacatcaactt 337  Q
    |||||||||||||||    
T  2600 acttaacatcaactt 2614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13733 - 13415
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  13733 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 13634  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||| | ||| || |  || |||| |||  ||||    
T  13633 tcaaatcatgatacatttttgtagctcctagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctagaattaactttttcaaatcatcatcatcaagaat 13534  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13533 gcaaattcttcctctgaatctcaacacacccttttcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattactagcaaccattaaatcaacaaacttcaca 13434  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||||||||    
T  13433 tccacttgttgtgcttctc 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 81266 - 80948
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||| ||||   ||||| | |||||||||||| || || || | ||||||||| |||| ||| || |  ||||    
T  81266 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctcacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacatttcaaaccggaccgccaaaacagtttct 81167  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||| || |||||    
T  81166 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttcaagaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaat 81067  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||| |||| ||||||| | ||| |||    
T  81066 acaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactgtcctctgtttcattaccagcaatcatcgaatcaaccagcttgaca 80967  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  80966 tccacttgctgtgcttctc 80948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 15202 - 15298
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacat 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202 tctggtacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacat 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1462 - 1558
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacat 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1462 tctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacat 1558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2717 - 2446
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcta 177  Q
    ||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||| | || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2717 atacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccacgaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagcta 2618  T
Q  178 cttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttga 277  Q
    ||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || | | | ||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2617 ctcttgtgactttcttccaaaatcaactttttcaacccatcattgtcagggatacaaattctgcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttga 2518  T
Q  278 agtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  2517 agtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctc 2446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 10159 - 10277
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  10159 tctggcacatctaaggacaccatcataccagcaggtttctgaggctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaaatgtgccacatcac 10258  T
Q  101 gtttcaaaccagaccacca 119  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  10259 gtttcaacccagaccacca 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 6085 - 6403
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||   || || | ||||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||| || | ||| |    
T  6085 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatctcgcttcaaactggaccaccaaaatagctttt 6184  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  |||||||| || |||||    
T  6185 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaat 6284  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||  ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||| ||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  6285 acaaattctatctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgaca 6384  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  6385 tccacttgctgtgcttctc 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6672 - 6354
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  6672 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 6573  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || | ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  || |||| ||| |||||    
T  6572 tcaaatcatgatgcactttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaat 6473  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  6472 gcaaattcttcctctaaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaactaacttcaca 6373  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
     | ||||| | ||||||||    
T  6372 gccacttgctttgcttctc 6354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 596 - 347
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttc-aagaatc 201  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||| ||||| || ||||    
T  596 ttcaaaccagaccactaaaacagcttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaaatc 497  T
Q  202 atcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactac 301  Q
    | |||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || | || | |||    
T  496 aacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctccgcttgattac 397  T
Q  302 tagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  396 tagtaaccattaaatccacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 279
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaa-aatcttc 129  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  583 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaatct-c 485  T
Q  130 tttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaa 229  Q
    || |  || |  |||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| || | ||| ||| |||| ||||    
T  484 ttcaggtcataatacatctttgtagctcctaaatgaatacttaagctacttctgtgactttcttcgaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaa 385  T
Q  230 tgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaac 329  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||| ||    
T  384 tgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctaatcgtcaaccttgaagtcacgatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgac 285  T
Q  330 atcaac 335  Q
    ||||||    
T  284 atcaac 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 349
Target Start/End: Original strand, 28184 - 28407
Alignment:
Q  126 cttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatct 225  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||||||      
T  28184 cttcttgaaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatta 28283  T
Q  226 ggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaact 325  Q
    | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28284 gaaatacaaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaagct 28383  T
Q  326 taacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  28384 tgacatccacttgttgtgcttctc 28407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 349
Target Start/End: Original strand, 34437 - 34660
Alignment:
Q  126 cttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatct 225  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || |  || |||||||      
T  34437 cttcttgaaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatta 34536  T
Q  226 ggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaact 325  Q
    | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  34537 gaaatacaaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaagct 34636  T
Q  326 taacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  34637 tgacatccacttgttgtgcttctc 34660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32753 - 32458
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  32753 gcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttct 32654  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | | |||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  32653 tcagatcacggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaat 32554  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     ||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |  ||||||||||||||||||    
T  32553 acaaattcttcctctgaacctcattacaccctgatcatctaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaactt 32458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 20266 - 20561
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | |||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || |  ||||    
T  20266 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacatcacgctttaaaccggaccaccaaaacagattct 20365  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  20366 tcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaat 20465  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     ||||||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  20466 acaaattcttcctatgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaactt 20561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 326
Target Start/End: Original strand, 23086 - 23381
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | |||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || |  ||||    
T  23086 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacatcacgctttaaaccggaccaccaaaacagattct 23185  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||| || |||||    
T  23186 tcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaat 23285  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
     ||||||||||||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  23286 acaaattcttcctatgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaactt 23381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 41789 - 42107
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  41789 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 41888  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||||| ||| || | ||| |||||||  |||||    
T  41889 tcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattattaggaat 41988  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |  || ||| ||||||||  | |||||||||||| |||    
T  41989 acaaattcttcctctggacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctatgccattaccagcaaccaatatatcaacaaacttcaca 42088  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  42089 tccacttgctgagcttctc 42107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 249485 - 249803
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||   || || | ||| ||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || | |||||    
T  249485 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatatacaaaatgagctacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttct 249584  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||| | ||| | ||||| ||| || | ||| ||||| || |||||    
T  249585 tcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgacttttttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaat 249684  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |  || ||||||||||||||| | |    
T  249685 acaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcaccaaatcaacaaacttcaaa 249784  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  249785 tccacttgctgagcttctc 249803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25152 - 24971
Alignment:
Q  32 caggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctt 131  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  25152 caggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctt 25053  T
Q  132 taaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatc 213  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25052 caaatcatgatacatctttgtagctccctaatgaatactcaagctacgtctgttactttcttcaagaatcattttcttaatc 24971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Original strand, 19793 - 20041
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| |    
T  19793 ttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatta 19892  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||     
T  19893 actttttcatctcatcattgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagcttgattacc 19992  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |  |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  19993 attaaccattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctg 20041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 351
Target Start/End: Original strand, 23955 - 24203
Alignment:
Q  103 ttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 202  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| |    
T  23955 ttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatta 24054  T
Q  203 tcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactact 302  Q
     ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||     
T  24055 actttttcatctcatcattgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagattgattaca 24154  T
Q  303 agcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    |  || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  24155 ataaaacattaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctg 24203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 349
Target Start/End: Original strand, 11700 - 11923
Alignment:
Q  126 cttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatct 225  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |  |||| ||| || |  |||||||| ||     
T  11700 cttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttatgactttcttctaagatcaactttttcaattcttcattgtca 11799  T
Q  226 ggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaact 325  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11800 ggaatacaaattctacctatgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattaccagcaaccattaaatcaacaaact 11899  T
Q  326 taacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    | ||||| |||||||| |||||||    
T  11900 ttacatccacttgttgcgcttctc 11923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5722 - 5452
Alignment:
Q  78 atacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcta 177  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||  |||||||| || | ||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5722 atacacaaactgagctacgtcacgtttcaaactggaccaccaaaatagctt-ttcaaatcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagcta 5624  T
Q  178 cttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttga 277  Q
    ||  | ||||| ||||| | ||||| ||| || |  |||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  5623 ctcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctaatcatcaactttga 5524  T
Q  278 agtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||| |  ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  5523 agtcactatcctgtgtttcactacatacaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttctc 5452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5017 - 4764
Alignment:
Q  40 tgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgt 139  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| || | |||||| |||||||    
T  5017 tgatgttcaaccttcgacttctgacaaattaaacatgcatacacaaattgtgcaacatctcgctttaacccggaccaccaaaataacttcttcaaatcgt 4918  T
Q  140 ggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattct 239  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||  |||||| ||||| |||||||     
T  4917 gatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttccagaatcatctttttcatttctgtattatcaggaatacaaattca 4818  T
Q  240 tcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
        || || | |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  4817 attccgaaaccgcaacactccttgatcatcaactttaaaatcactatcttcagt 4764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 1
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| || || |    
T  158 tctggcacatctaatgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaataagaatacacaaactgtgcaacgtcgc 59  T
Q  101 gtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcc 158  Q
    ||||||| || |||||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  58 gtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 13070 - 13390
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagacca-ccagaaaatcttc 129  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||   ||||| | ||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||| || | ||||    
T  13070 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttcagacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaaccaaaacagcttc 13169  T
Q  130 tttaaatcgtggtacatcttcgtagct-cccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgga 228  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | | | || |  || |||||||| |||    
T  13170 tttaaatcatgatacattttcgtagcttcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaaccttttgaaatcatcattatcagga 13269  T
Q  229 atgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaa 328  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  13270 atacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttca 13369  T
Q  329 catcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  13370 catctactagttgtgcttctc 13390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 351
Target Start/End: Original strand, 39 - 170
Alignment:
Q  220 ttatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaa 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  39 ttatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacaccccctgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaa 138  T
Q  320 caaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  139 caaacttgacatcaacttgctgtgcttctctg 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 11902
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||   || || | ||||||||| || || ||||| |  ||||||||  ||||||| || | ||| |    
T  12220 gcaggcttctaatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatcacaattcaaaccgaaccaccaaaacagctttt 12121  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  |||||||| || |||||    
T  12120 tcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcatctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaat 12021  T
Q  231 gcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaaca 330  Q
     |||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||| ||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  12020 acaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgaca 11921  T
Q  331 tcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||| | ||||||||    
T  11920 tccacttgatatgcttctc 11902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25293 - 24992
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 136  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||    
T  25293 ttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaat 25194  T
Q  137 cgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaat 236  Q
    |  | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |  || |||||||| ||||| |||||    
T  25193 caggatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaat 25094  T
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaact 336  Q
    |||||||| |||           | |||||||||||||| ||||||||||| | |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25093 tcttcctctgaa-----------cctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctact 25005  T
Q  337 tgttgtgcttctc 349  Q
    || ||||||||||    
T  25004 tgatgtgcttctc 24992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 349
Target Start/End: Original strand, 59 - 191
Alignment:
Q  217 tcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaat 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |  || ||| |||||| |||||||    
T  59 tcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcaataacattaccagcaacaatcaaat 158  T
Q  317 caacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  159 caacaaacttaacatctacttgctgtgcttctc 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39218 - 39031
Alignment:
Q  150 cgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaat 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||     
T  39218 cgtagctcccggatgaatactcaagttactcctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctcgaaac 39119  T
Q  250 ctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| | |  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  39118 ctcatcactccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactt 39031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10355 - 10188
Alignment:
Q  126 cttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatct 225  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |  ||     
T  10355 cttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgtatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcttcatgtcatcgtcgtca 10256  T
Q  226 ggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 293  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  10255 ggaatacaaattctgcttcggaatcgcaacactccctgatcgtcgaccttaaagtcactatcttcagt 10188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39475 - 39357
Alignment:
Q  1 tctggcacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||      
T  39475 tctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaaccgtgcaacatcgt 39376  T
Q  101 gtttcaaaccagaccacca 119  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  39375 gtttcaatccagaccacca 39357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18229 - 18074
Alignment:
Q  193 tcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcag 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |  || || ||||| |||||||    
T  18229 tcaagaatcatcttcttcatctcttcatcgtctggaatacaaattctacctcggatcctcaatacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcag 18130  T
Q  293 tttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    | | | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18129 tctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttatgtgcttct 18074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10573
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | |||||| || || || || || || |||||||  |||||||| || | |||||| |||||    
T  10884 tctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacgaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaatc 10785  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |   | |||| ||  ||||||||||||    
T  10784 atgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatgcaaatt 10685  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  10684 ctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcatccactt 10585  T
Q  338 gttgtgcttctc 349  Q
     ||| |||||||    
T  10584 attgcgcttctc 10573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21098 - 20787
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| | |||||| || || || || || || |||||||  |||||||| || | |||||| |||||    
T  21098 tctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacgaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaatc 20999  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaatt 237  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || || | ||| | ||| || |   | |||| ||  ||||||||||||    
T  20998 atgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatgcaaatt 20899  T
Q  238 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaactt 337  Q
    || |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  20898 ctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcatccactt 20799  T
Q  338 gttgtgcttctc 349  Q
     ||| |||||||    
T  20798 attgcgcttctc 20787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Original strand, 26775 - 26834
Alignment:
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  26775 tcttcaaatcatgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3505 - 3405
Alignment:
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3505 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 3406  T
Q  332 c 332  Q
    |    
T  3405 c 3405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30418
Alignment:
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30518 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 30419  T
Q  332 c 332  Q
    |    
T  30418 c 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 349
Target Start/End: Original strand, 40785 - 40888
Alignment:
Q  246 gaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgct 345  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  40785 gaatctcaacacaccctgataatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattgttagtaaccatcaaatcaacaaacttgatatccacttgatgtgct 40884  T
Q  346 tctc 349  Q
    ||||    
T  40885 tctc 40888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 40610 - 40758
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  40610 gcaggcttttgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaaaaatttct 40709  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctact 179  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  40710 tcaaatcatggtacatctttgtagctctcggatgaatacttaagctact 40758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 85955 - 85745
Alignment:
Q  28 ccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatct 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||    
T  85955 ccagcaggtttctgatgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatgcacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccacca-aataact 85857  T
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgg 227  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||  | ||| | ||||| ||||| | ||||||||| || || |||  || ||| ||    
T  85856 tcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggataaatactcaaattgcttatgtgactttcttccaaaatcatctttttcatttctgtatcatcagg 85757  T
Q  228 aatgcaaattct 239  Q
    ||| ||||||||    
T  85756 aatacaaattct 85745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 34060 - 34273
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||   ||||| | ||| | ||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  34060 gcaggattctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcataaaaaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaaaagctttt 34159  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaat 230  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| | ||||| | | || ||||| || || || |||||    
T  34160 tcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaat 34259  T
Q  231 gcaaattcttcctc 244  Q
    ||||||||| ||||    
T  34260 gcaaattctgcctc 34273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 736 - 884
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || | |||||    
T  736 gcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttct 835  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctact 179  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  836 tcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6939 - 6799
Alignment:
Q  211 atctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaacca 310  Q
    ||||| ||||| || ||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||     
T  6939 atctcatcattgtcaggaacacaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttgattactattaaccc 6840  T
Q  311 tcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctctg 351  Q
    | ||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  6839 ttaaatccacaagcttgacatcaacctgttgcgcttctctg 6799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 855 - 815
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaaca 74  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  855 ggtttctgatgttcattcttcgacttctgacaaaccaaaca 815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6319 - 6230
Alignment:
Q  237 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaactt 326  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  6319 tcttcctctgaaccttaacacaccttgatcatcaactttgaagtcaccatcttcagtttgattactagtaaccattaaatccacaaactt 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6470 - 6319
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||   ||||| |  || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  6470 gcaggcttctcatgttcaatcttagacttctgacaagtcaaacatgcctatagaaattgtgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttct 6371  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttct 182  Q
    | || || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6370 tcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttct 6319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29867 - 29816
Alignment:
Q  152 tagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29867 tagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagcatcat 29816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29810 - 29689
Alignment:
Q  226 ggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaact 325  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||| ||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||    
T  29810 ggaatacaaattcgacctcggaatcttaacacaccatggtcatcgaccataaagtcaccatcttcagtctgattacaagcaaccaacaagtctacaaact 29711  T
Q  326 taacatcaacttgttgtgcttc 347  Q
    | ||||||||||  ||||||||    
T  29710 tgacatcaactttctgtgcttc 29689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 177466 - 177379
Alignment:
Q  261 ttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttct 348  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  177466 ttgatcatcaaccttgaagtcattagcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttatgcttct 177379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15832 - 15738
Alignment:
Q  56 acttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtggtacatcttc 150  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||    
T  15832 acttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcatgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttc 15738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15715 - 15613
Alignment:
Q  232 caaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacat 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |  || || |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  15715 caaattctgcctcggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcaccatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacat 15616  T
Q  332 caa 334  Q
    |||    
T  15615 caa 15613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6501 - 6446
Alignment:
Q  294 ttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6501 ttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctc 6446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10932 - 10877
Alignment:
Q  294 ttcactactagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatcaacttgttgtgcttctc 349  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10932 ttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctc 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6670 - 6521
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||  | ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  6670 gcaggcttctggtgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcattgaaaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 6571  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactt 180  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6570 tcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactt 6521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11101 - 10952
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||  | ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  11101 gcaggcttctggtgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcattgaaaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttct 11002  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactt 180  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11001 tcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactt 10952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 284
Target Start/End: Original strand, 27926 - 28058
Alignment:
Q  152 tagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatct 251  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||| | |  || || || || ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  27926 tagcccccgggtgaatactcaatctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcctcaattcatcgttgtcaggaatacaaactcttcctctgaatct 28025  T
Q  252 caacacaccttgatcatcaaccttgaagtcact 284  Q
    ||  ||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  28026 cagtacaccctaatcatcaatcttgaaatcact 28058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Original strand, 12366 - 12433
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatc 98  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12366 gcaggtttctgatgttcaacctttgacttttgacaaatcaaacaggaatacaccaactgtgccacatc 12433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 173
Target Start/End: Original strand, 7063 - 7198
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||| | ||| |||||| | || |||||    ||||||||||||||||| || | |||||| || ||    
T  7063 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatatacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtc 7162  T
Q  138 gtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaa 173  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7163 atgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaa 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Original strand, 24755 - 24809
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  24755 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 24809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 326
Target Start/End: Original strand, 16 - 125
Alignment:
Q  217 tcattatctggaatgcaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactactagcaaccatcaaat 316  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||  | |  ||||||||    
T  16 tcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccataaagtcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaat 115  T
Q  317 caacaaactt 326  Q
    ||||||||||    
T  116 caacaaactt 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17971 - 17841
Alignment:
Q  31 gcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttct 130  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || | | |||    
T  17971 gcaggcttctgatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgttttaacccagaccaccaaaacaacatct 17872  T
Q  131 ttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgg 161  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  17871 tcaaatcatgatacatttttgtagctcccgg 17841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 32844 - 32804
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaaca 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32844 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaaca 32804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Original strand, 24931 - 24990
Alignment:
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24931 tcttcaaatcctgatacatcttagtagctcctgggtgaatactcaaactagttctatgac 24990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 72064 - 72104
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaaca 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  72064 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctaacaaaccaaaca 72104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Original strand, 15045 - 15104
Alignment:
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15045 tcttcaaatcctggtacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 15104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3281 - 3222
Alignment:
Q  128 tctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  3281 tcttcaaatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 3222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 9495 - 9444
Alignment:
Q  37 ttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  9495 ttctgctgctcaatcttcgacttttgacaaaccaaacaagcatacacaaact 9444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 88
Target Start/End: Original strand, 47033 - 47083
Alignment:
Q  38 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaact 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  47033 tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaact 47083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Original strand, 10169 - 10322
Alignment:
Q  34 ggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttta 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||| | ||| |  ||    ||||  |||| |||||| || | | |||| |    
T  10169 ggtttctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaattctgcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 10268  T
Q  134 aatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 187  Q
    |||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  10269 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcctatgac 10322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University