View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9417_low_10 (Length: 273)

Name: NF9417_low_10
Description: NF9417
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9417_low_10
NF9417_low_10
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (17-259)||(2520-2762)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (17-259)||(26484847-26485089)
chr7 (17-259)||(2775512-2775754)
chr7 (17-259)||(39210771-39211013)
chr7 (17-259)||(2108753-2108995)
chr7 (17-259)||(4200700-4200942)
chr7 (17-259)||(16449746-16449988)
chr7 (17-259)||(16041476-16041718)
chr7 (17-259)||(26682748-26682990)
chr7 (17-259)||(11424524-11424766)
chr7 (17-259)||(2154726-2154968)
chr7 (17-259)||(10916616-10916858)
chr7 (17-252)||(16518171-16518406)
chr7 (17-252)||(16503135-16503370)
chr7 (17-259)||(5128145-5128387)
chr7 (17-259)||(3445459-3445701)
chr7 (17-259)||(31088212-31088454)
chr7 (17-259)||(45733613-45733855)
chr7 (17-259)||(26274842-26275084)
chr7 (17-259)||(31564138-31564380)
chr7 (17-259)||(11441725-11441967)
chr7 (17-259)||(26435410-26435652)
chr7 (17-259)||(26537618-26537860)
chr7 (17-259)||(4144871-4145113)
chr7 (17-259)||(26669662-26669904)
chr7 (17-259)||(45387496-45387738)
chr7 (17-259)||(5147088-5147330)
chr7 (17-259)||(24592289-24592531)
chr7 (17-259)||(26319617-26319859)
chr7 (32-259)||(16736208-16736435)
chr7 (32-259)||(16751262-16751489)
chr7 (32-259)||(17523700-17523927)
chr7 (32-259)||(17529288-17529515)
chr7 (17-259)||(9618804-9619046)
chr7 (17-259)||(31125073-31125315)
chr7 (17-241)||(18540952-18541176)
chr7 (89-241)||(5159744-5159896)
chr7 (213-259)||(26513130-26513176)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (17-259)||(14143090-14143332)
chr6 (17-259)||(26788093-26788335)
chr6 (17-259)||(27196466-27196708)
chr6 (17-259)||(27252532-27252774)
chr6 (17-259)||(13521878-13522120)
chr6 (17-223)||(22456775-22456981)
chr6 (17-259)||(27290175-27290417)
chr6 (17-259)||(22934685-22934927)
chr6 (17-259)||(23857130-23857372)
chr6 (17-259)||(24863866-24864108)
chr6 (17-259)||(13298756-13298998)
chr6 (17-259)||(16750003-16750245)
chr6 (17-259)||(24304423-24304665)
chr6 (17-259)||(26989150-26989392)
chr6 (17-259)||(29549624-29549866)
chr6 (17-259)||(33374061-33374303)
chr6 (17-259)||(26918529-26918771)
chr6 (17-259)||(15424122-15424364)
chr6 (17-259)||(27359797-27360039)
chr6 (17-259)||(27450140-27450382)
chr6 (17-259)||(4545580-4545822)
chr6 (17-259)||(4773155-4773397)
chr6 (17-259)||(8892116-8892357)
chr6 (17-259)||(8903351-8903592)
chr6 (17-259)||(27007876-27008118)
chr6 (17-259)||(27272385-27272627)
chr6 (17-259)||(28162806-28163048)
chr6 (17-259)||(30557821-30558063)
chr6 (17-259)||(3696230-3696472)
chr6 (17-259)||(4525435-4525677)
chr6 (17-259)||(4723939-4724181)
chr6 (17-259)||(4757913-4758155)
chr6 (17-259)||(29573162-29573404)
chr6 (17-259)||(34463151-34463393)
chr6 (17-259)||(28207603-28207845)
chr6 (17-258)||(16674288-16674529)
chr6 (74-256)||(17092248-17092430)
chr6 (17-259)||(26116215-26116457)
chr6 (17-249)||(17025426-17025658)
chr6 (17-259)||(27044536-27044779)
chr6 (17-259)||(16943832-16944074)
chr6 (17-259)||(29501564-29501806)
chr6 (17-259)||(27485278-27485520)
chr6 (17-189)||(27000222-27000394)
chr6 (17-259)||(26777415-26777662)
chr6 (32-198)||(20160865-20161031)
chr6 (32-198)||(22171800-22171966)
chr6 (17-97)||(22477240-22477320)
chr6 (53-228)||(27629536-27629711)
chr6 (193-259)||(27019461-27019527)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (17-259)||(31034020-31034262)
chr3 (17-259)||(32292865-32293107)
chr3 (17-254)||(18530501-18530738)
chr3 (17-256)||(16626412-16626651)
chr3 (18-259)||(18051376-18051617)
chr3 (17-259)||(8296085-8296327)
chr3 (17-259)||(15740997-15741239)
chr3 (17-259)||(6192429-6192671)
chr3 (17-259)||(4796556-4796798)
chr3 (17-259)||(5652500-5652742)
chr3 (17-259)||(7073325-7073567)
chr3 (17-259)||(15892609-15892851)
chr3 (17-259)||(18330782-18331024)
chr3 (17-259)||(29148658-29148900)
chr3 (17-259)||(5713340-5713582)
chr3 (17-259)||(5724250-5724492)
chr3 (17-259)||(5756985-5757227)
chr3 (17-259)||(5767876-5768118)
chr3 (17-259)||(8301170-8301412)
chr3 (32-259)||(4417047-4417274)
chr3 (17-259)||(17993687-17993929)
chr3 (17-259)||(22387481-22387723)
chr3 (17-259)||(29664873-29665115)
chr3 (17-259)||(35880879-35881121)
chr3 (17-259)||(11110252-11110494)
chr3 (17-259)||(20576750-20576992)
chr3 (17-259)||(28021388-28021630)
chr3 (17-259)||(28115857-28116099)
chr3 (17-259)||(4626057-4626299)
chr3 (17-259)||(4721744-4721986)
chr3 (17-259)||(8211851-8212093)
chr3 (17-259)||(10396246-10396488)
chr3 (17-259)||(36996980-36997222)
chr3 (17-259)||(48466040-48466282)
chr3 (17-259)||(4346590-4346832)
chr3 (17-259)||(5467098-5467340)
chr3 (17-259)||(6542365-6542607)
chr3 (17-259)||(18276955-18277197)
chr3 (17-259)||(18307557-18307799)
chr3 (17-259)||(18242852-18243094)
chr3 (17-259)||(18292256-18292498)
chr3 (17-259)||(21674806-21675048)
chr3 (17-259)||(22870759-22871001)
chr3 (17-259)||(22885818-22886060)
chr3 (17-259)||(51782136-51782378)
chr3 (17-252)||(51797226-51797461)
chr3 (17-259)||(5596260-5596502)
chr3 (17-259)||(7996675-7996917)
chr3 (17-259)||(10643183-10643425)
chr3 (17-259)||(24328272-24328514)
chr3 (17-259)||(5013825-5014067)
chr3 (17-252)||(31964383-31964618)
chr3 (17-259)||(5609225-5609467)
chr3 (17-259)||(28339415-28339657)
chr3 (17-259)||(47023566-47023808)
chr3 (17-259)||(17984859-17985101)
chr3 (17-243)||(50133990-50134216)
chr3 (17-259)||(18225304-18225546)
chr3 (17-241)||(32439267-32439491)
chr3 (17-225)||(20066156-20066364)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (17-259)||(20340197-20340439)
chr1 (17-259)||(28152013-28152255)
chr1 (17-256)||(16207896-16208135)
chr1 (17-256)||(20461232-20461471)
chr1 (17-259)||(51638369-51638611)
chr1 (17-259)||(10962821-10963063)
chr1 (17-259)||(28585132-28585374)
chr1 (17-259)||(41793170-41793412)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (17-259)||(23892367-23892609)
chr5 (17-259)||(29888841-29889083)
chr5 (17-259)||(33877408-33877650)
chr5 (17-254)||(25199190-25199427)
chr5 (17-256)||(22888631-22888870)
chr5 (17-259)||(11325955-11326197)
chr5 (17-259)||(24687916-24688158)
chr5 (17-259)||(23752209-23752451)
chr5 (17-259)||(11549515-11549757)
chr5 (17-259)||(22998873-22999115)
chr5 (17-259)||(23717747-23717989)
chr5 (17-259)||(9548302-9548544)
chr5 (17-259)||(30934794-30935036)
chr5 (17-259)||(13184407-13184649)
chr5 (17-258)||(33777648-33777889)
chr5 (17-259)||(15658519-15658761)
chr5 (17-259)||(13440253-13440495)
chr5 (17-259)||(24970179-24970421)
chr5 (17-259)||(28649396-28649638)
chr5 (17-259)||(30152179-30152421)
chr5 (17-259)||(31431601-31431843)
chr5 (17-259)||(18500489-18500731)
chr5 (17-259)||(24681601-24681843)
chr5 (17-259)||(24724128-24724370)
chr5 (17-259)||(31826166-31826408)
chr5 (17-259)||(33516517-33516759)
chr5 (17-259)||(9317612-9317854)
chr5 (17-259)||(12132316-12132558)
chr5 (17-259)||(13324588-13324830)
chr5 (17-259)||(40473308-40473550)
chr5 (17-259)||(43078413-43078655)
chr5 (17-259)||(18375171-18375413)
chr5 (17-259)||(30168630-30168872)
chr5 (17-259)||(32599231-32599473)
chr5 (17-259)||(37358402-37358644)
chr5 (17-259)||(37671242-37671484)
chr5 (17-259)||(2511212-2511454)
chr5 (17-259)||(29966825-29967067)
chr5 (17-259)||(30029576-30029818)
chr5 (17-259)||(37755141-37755383)
chr5 (17-252)||(8665241-8665476)
chr5 (17-252)||(15758623-15758858)
chr5 (17-252)||(37770753-37770988)
chr5 (17-259)||(3789702-3789944)
chr5 (17-259)||(34616679-34616921)
chr5 (17-259)||(5638071-5638313)
chr5 (17-259)||(6874466-6874708)
chr5 (17-259)||(26480553-26480794)
chr5 (17-259)||(28959545-28959787)
chr5 (17-259)||(41674870-41675112)
chr5 (17-241)||(33292686-33292910)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (17-259)||(21703015-21703257)
chr2 (17-259)||(9349833-9350075)
chr2 (17-256)||(19456275-19456514)
chr2 (17-255)||(34303158-34303396)
chr2 (17-259)||(27434295-27434537)
chr2 (17-259)||(28882362-28882604)
chr2 (17-259)||(23128417-23128659)
chr2 (17-259)||(12655690-12655932)
chr2 (17-259)||(20838066-20838308)
chr2 (17-259)||(22925879-22926121)
chr2 (17-259)||(12586958-12587200)
chr2 (17-259)||(27118836-27119078)
chr2 (17-259)||(3784802-3785044)
chr2 (17-259)||(40233659-40233901)
chr2 (17-259)||(27777370-27777612)
chr2 (17-259)||(27817128-27817370)
chr2 (17-259)||(34157159-34157400)
chr2 (17-259)||(39051673-39051915)
chr2 (17-259)||(12716453-12716695)
chr2 (17-259)||(13936395-13936637)
chr2 (17-255)||(16163747-16163985)
chr2 (17-259)||(16829189-16829431)
chr2 (17-259)||(16892050-16892292)
chr2 (17-259)||(32049946-32050188)
chr2 (17-259)||(27803855-27804097)
chr2 (17-259)||(34286502-34286744)
chr2 (17-259)||(34291562-34291804)
chr2 (17-259)||(37375309-37375551)
chr2 (17-259)||(34861828-34862070)
chr2 (17-259)||(37685760-37686002)
chr2 (17-259)||(37701025-37701267)
chr2 (17-259)||(37925641-37925883)
chr2 (17-259)||(260604-260846)
chr2 (17-259)||(21677033-21677275)
chr2 (17-259)||(39890222-39890464)
chr2 (17-259)||(19416350-19416592)
chr2 (17-251)||(31876429-31876663)
chr2 (17-259)||(31891179-31891421)
chr2 (17-198)||(27393117-27393298)
chr2 (32-259)||(11635037-11635264)
chr2 (32-259)||(11641226-11641453)
chr2 (17-118)||(34279597-34279698)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (17-256)||(1900424-1900663)
chr4 (17-256)||(15228037-15228276)
chr4 (17-256)||(15284793-15285032)
chr4 (17-259)||(14665185-14665427)
chr4 (17-259)||(17014167-17014409)
chr4 (17-259)||(24592176-24592418)
chr4 (17-252)||(14235394-14235629)
chr4 (17-255)||(15391204-15391442)
chr4 (17-259)||(18800475-18800717)
chr4 (17-259)||(24460467-24460709)
chr4 (17-259)||(36344377-36344619)
chr4 (17-259)||(5006040-5006282)
chr4 (17-259)||(6570020-6570262)
chr4 (17-259)||(31126380-31126622)
chr4 (17-259)||(39850805-39851047)
chr4 (17-259)||(14763166-14763408)
chr4 (17-259)||(27163179-27163421)
chr4 (17-259)||(40105500-40105742)
chr4 (17-259)||(54833554-54833796)
chr4 (17-259)||(14098708-14098950)
chr4 (17-259)||(21969868-21970110)
chr4 (17-259)||(30753921-30754163)
chr4 (17-259)||(33673660-33673902)
chr4 (17-241)||(34188840-34189064)
chr4 (17-241)||(24112829-24113053)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (17-259)||(18710738-18710980)
chr8 (29-259)||(16283613-16283843)
chr8 (17-252)||(27608733-27608968)
chr8 (17-259)||(19688250-19688492)
chr8 (17-255)||(22080703-22080941)
chr8 (17-259)||(14557776-14558018)
chr8 (17-259)||(16277706-16277948)
chr8 (17-259)||(19658861-19659102)
chr8 (17-259)||(44563253-44563493)
chr8 (27-259)||(189256-189488)
chr8 (17-259)||(2137080-2137322)
chr8 (17-259)||(3329328-3329570)
chr8 (17-259)||(29829474-29829716)
chr8 (17-259)||(33244817-33245059)
chr8 (32-259)||(19674608-19674835)
chr8 (17-259)||(12092545-12092787)
chr8 (17-259)||(19286614-19286856)
chr8 (17-259)||(31489571-31489813)
chr8 (17-259)||(19208181-19208423)
chr8 (17-259)||(28361776-28362018)
chr8 (17-252)||(31354676-31354911)
chr8 (17-259)||(33258875-33259117)
chr8 (17-259)||(9354774-9355017)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (17-207)||(1832-2021)
scaffold0415 (17-259)||(6165-6408)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (17-207)||(20540-20729)
scaffold0124 (17-259)||(30604-30846)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (17-259)||(39931-40173)
scaffold0089 (17-259)||(46847-47089)
scaffold0089 (20-259)||(29918-30157)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (17-247)||(492-722)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (17-255)||(21713-21951)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (17-259)||(9718-9960)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (17-258)||(27444-27685)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (17-249)||(1-233)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (17-259)||(7101-7343)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (17-259)||(14792-15034)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (17-259)||(8928-9170)
scaffold0159 (17-259)||(20167-20409)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (17-259)||(8101-8343)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (17-259)||(26063-26305)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (17-148)||(1-132)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (53-259)||(46661-46872)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (53-228)||(277-452)


Alignment Details
Target: scaffold0260 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2520
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2762 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 2663  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2662 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 2563  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2562 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 2520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 26484847 - 26485089
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26484847 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26484946  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  26484947 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26485046  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26485047 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 26485089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 2775512 - 2775754
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2775512 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2775611  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  2775612 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 2775711  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2775712 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 2775754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39211013 - 39210771
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  39211013 catcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 39210914  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  39210913 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 39210814  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39210813 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 39210771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2108995 - 2108753
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2108995 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2108896  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||    
T  2108895 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaac 2108796  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2108795 tcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctg 2108753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 4200700 - 4200942
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  4200700 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 4200799  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4200800 tccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 4200899  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4200900 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 4200942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16449988 - 16449746
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |    
T  16449988 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacg 16449889  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16449888 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaac 16449789  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16449788 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctg 16449746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 16041476 - 16041718
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  16041476 catcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 16041575  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  16041576 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 16041675  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16041676 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctg 16041718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26682990 - 26682748
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  26682990 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 26682891  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  26682890 tccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26682791  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26682790 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 26682748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11424766 - 11424524
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  11424766 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11424667  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11424666 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11424567  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11424566 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11424524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154968
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  2154726 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2154825  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  2154826 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2154925  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2154926 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 2154968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10916858 - 10916616
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  10916858 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 10916759  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  10916758 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 10916659  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  10916658 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctg 10916616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16518406 - 16518171
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16518406 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 16518307  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  16518306 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16518207  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16518206 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 16518171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16503370 - 16503135
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16503370 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16503271  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  16503270 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 16503171  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16503170 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 16503135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5128145 - 5128387
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  5128145 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 5128244  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || | |||    
T  5128245 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaac 5128344  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  5128345 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 5128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 3445459 - 3445701
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  3445459 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3445558  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  3445559 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 3445658  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3445659 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3445701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31088454 - 31088212
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  31088454 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 31088355  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  31088354 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31088255  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  31088254 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 31088212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 45733613 - 45733855
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  45733613 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 45733712  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  45733713 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 45733812  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45733813 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 45733855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26275084 - 26274842
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  26275084 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26274985  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  26274984 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26274885  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26274884 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26274842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31564380 - 31564138
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  31564380 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31564281  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31564280 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 31564181  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31564180 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31564138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 11441725 - 11441967
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  11441725 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 11441824  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  11441825 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 11441924  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11441925 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11441967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 26435410 - 26435652
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  26435410 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26435509  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  26435510 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26435609  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26435610 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26435652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26537860 - 26537618
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  26537860 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26537761  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  26537760 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26537661  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26537660 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26537618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4145113 - 4144871
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  4145113 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 4145014  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  4145013 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4144914  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4144913 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4144871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26669904 - 26669662
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  26669904 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26669805  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  26669804 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26669705  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26669704 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26669662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 45387496 - 45387738
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  45387496 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 45387595  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  45387596 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 45387695  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45387696 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 45387738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5147330 - 5147088
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  5147330 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 5147231  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||||||||||| || || | |||    
T  5147230 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 5147131  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5147130 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5147088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24592531 - 24592289
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  24592531 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24592432  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  24592431 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24592332  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24592331 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24592289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26319859 - 26319617
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  26319859 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26319760  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  26319759 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26319660  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26319659 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26319617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16736435 - 16736208
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16736435 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16736336  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16736335 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 16736236  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16736235 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16736208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16751489 - 16751262
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16751489 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16751390  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16751389 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 16751290  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16751289 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16751262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 17523700 - 17523927
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17523700 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17523799  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17523800 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 17523899  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17523900 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 17523927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17529515 - 17529288
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17529515 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17529416  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17529415 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 17529316  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17529315 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 17529288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 9618804 - 9619046
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  9618804 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9618903  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  9618904 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9619003  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9619004 tcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9619046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 31125073 - 31125315
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  31125073 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31125172  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31125173 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccac 31125272  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31125273 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31125315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 18540952 - 18541176
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18540952 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 18541051  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  18541052 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 18541151  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaag 241  Q
    |||||||||||| || || ||||||    
T  18541152 tcctctggtgccactccatatcaag 18541176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Original strand, 5159744 - 5159896
Alignment:
Q  89 caaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||| | ||||| ||||| || |||||| ||| ||| || | ||    
T  5159744 caagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgagatatgtgaagaggttc 5159843  T
Q  189 ccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 241  Q
    |||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  5159844 ccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccgctccatatcaag 5159896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513176
Alignment:
Q  213 caactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26513176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14143332 - 14143090
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14143332 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 14143233  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  14143232 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 14143133  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14143132 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 14143090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 26788093 - 26788335
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26788093 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26788192  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  26788193 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 26788292  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26788293 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 26788335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27196466 - 27196708
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27196466 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27196565  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  27196566 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27196665  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27196666 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 27196708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27252774 - 27252532
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27252774 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27252675  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  27252674 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 27252575  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27252574 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 27252532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13522120 - 13521878
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13522120 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 13522021  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  13522020 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 13521921  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13521920 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 13521878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22456981 - 22456775
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22456981 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatt 22456882  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456881 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 22456782  T
Q  217 tcctctg 223  Q
    |||||||    
T  22456781 tcctctg 22456775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27290417 - 27290175
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290417 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 27290318  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27290317 tccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27290218  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27290217 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27290175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22934927 - 22934685
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22934927 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 22934828  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  22934827 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22934728  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22934727 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22934685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23857372 - 23857130
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23857372 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 23857273  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23857272 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23857173  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23857172 tcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23857130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 24863866 - 24864108
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24863866 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24863965  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24863966 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24864065  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24864066 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctg 24864108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13298998 - 13298756
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  13298998 catcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 13298899  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  13298898 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 13298799  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13298798 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 13298756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 16750003 - 16750245
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16750003 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16750102  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||    
T  16750103 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaac 16750202  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  16750203 tcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttctctg 16750245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24304665 - 24304423
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24304665 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24304566  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||    
T  24304565 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24304466  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24304465 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24304423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 26989150 - 26989392
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  26989150 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26989249  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26989250 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26989349  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26989350 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26989392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 29549624 - 29549866
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  29549624 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29549723  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  29549724 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaac 29549823  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29549824 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29549866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33374303 - 33374061
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || ||||||||||| || |    
T  33374303 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacg 33374204  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  33374203 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 33374104  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  33374103 tcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctg 33374061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 26918529 - 26918771
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  26918529 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26918628  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  26918629 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 26918728  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26918729 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26918771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15424364 - 15424122
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  15424364 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15424265  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  15424264 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15424165  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15424164 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 15424122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27360039 - 27359797
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27360039 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27359940  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  27359939 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27359840  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27359839 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctg 27359797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27450382 - 27450140
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27450382 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27450283  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  27450282 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccac 27450183  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27450182 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctg 27450140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4545822 - 4545580
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  4545822 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4545723  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4545722 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 4545623  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4545622 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4545580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 4773155 - 4773397
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  4773155 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4773254  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  4773255 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 4773354  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4773355 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctg 4773397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8892357 - 8892116
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  8892357 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8892259  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  8892258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8892159  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  8892158 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 8892116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8903592 - 8903351
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  8903592 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8903494  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  8903493 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 8903394  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  8903393 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 8903351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27007876 - 27008118
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27007876 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatg 27007975  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27007976 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27008075  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27008076 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27008118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27272627 - 27272385
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| ||||    
T  27272627 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 27272528  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  27272527 ttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaac 27272428  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  27272427 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 27272385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28162806 - 28163048
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  28162806 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 28162905  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  28162906 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 28163005  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  28163006 tcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctg 28163048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30558063 - 30557821
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  30558063 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30557964  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  30557963 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30557864  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30557863 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30557821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 3696230 - 3696472
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  3696230 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3696329  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  3696330 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3696429  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3696430 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3696472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 4525435 - 4525677
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  4525435 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4525534  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4525535 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 4525634  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  4525635 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctg 4525677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4724181 - 4723939
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  4724181 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4724082  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4724081 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 4723982  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4723981 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4723939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 4757913 - 4758155
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  4757913 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4758012  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  4758013 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 4758112  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4758113 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4758155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 29573162 - 29573404
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  29573162 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29573261  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29573262 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29573361  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29573362 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29573404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34463393 - 34463151
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  34463393 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 34463294  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  34463293 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34463194  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34463193 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34463151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28207603 - 28207845
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  28207603 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28207702  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  28207703 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 28207802  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28207803 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctg 28207845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 16674288 - 16674529
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  16674288 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16674387  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || | |||    
T  16674388 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 16674487  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctct 258  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16674488 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 16674529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17092430 - 17092248
Alignment:
Q  74 aagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagg 173  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  17092430 aagaagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgagg 17092331  T
Q  174 tatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  17092330 tatgtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctct 17092248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26116457 - 26116215
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  26116457 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26116358  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  26116357 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcac 26116258  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  26116257 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctg 26116215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 17025426 - 17025658
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  17025426 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 17025525  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  17025526 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 17025625  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaa 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17025626 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27044536 - 27044779
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct-atgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaat 115  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || | |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  27044536 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataat 27044635  T
Q  116 gtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaa 215  Q
    || || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  27044636 gttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgcca 27044735  T
Q  216 ctcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  27044736 ctcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctg 27044779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16944074 - 16943832
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  16944074 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16943975  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16943974 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16943875  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16943874 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16943832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 29501564 - 29501806
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  29501564 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29501663  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29501664 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29501763  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29501764 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29501806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27485278 - 27485520
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  27485278 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27485377  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||    
T  27485378 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 27485477  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27485478 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27485520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 27000222 - 27000394
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  27000222 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27000321  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 189  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000322 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26777662 - 26777415
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  26777662 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26777563  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  26777562 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccac 26777463  T
Q  217 tcctctggtgcctctac-----acatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| |     || ||||||| |||||||||||||||    
T  26777462 tcctctggtgcctctgctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctg 26777415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Original strand, 20160865 - 20161031
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| || |    
T  20160865 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 20160964  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 198  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20160965 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22171966 - 22171800
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| || |    
T  22171966 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 22171867  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 198  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  22171866 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22477320 - 22477240
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22477320 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27629711 - 27629536
Alignment:
Q  53 tatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacg 152  Q
    |||||||| || ||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | || |    
T  27629711 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 27629612  T
Q  153 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcc 228  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27629611 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcgcccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggtgcc 27629536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019527
Alignment:
Q  193 acttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27019527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31034262 - 31034020
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31034262 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 31034163  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  31034162 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 31034063  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31034062 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 31034020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 32292865 - 32293107
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32292865 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 32292964  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  32292965 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 32293064  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32293065 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 32293107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 18530501 - 18530738
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  18530501 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 18530600  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18530601 tccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaac 18530700  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530701 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcct 18530738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16626651 - 16626412
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  16626651 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16626552  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16626551 tccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaac 16626452  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16626451 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 16626412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 18051376 - 18051617
Alignment:
Q  18 atcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgt 117  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18051376 atcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 18051475  T
Q  118 ccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaact 217  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18051476 cccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaact 18051575  T
Q  218 cctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18051576 cctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctg 18051617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 8296085 - 8296327
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8296085 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 8296184  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  8296185 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8296284  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8296285 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 8296327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15741239 - 15740997
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  15741239 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15741140  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  15741139 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 15741040  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15741039 tcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 15740997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 6192429 - 6192671
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  6192429 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 6192528  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  6192529 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 6192628  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6192629 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6192671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4796798 - 4796556
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  4796798 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 4796699  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  4796698 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 4796599  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4796598 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4796556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5652500 - 5652742
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  5652500 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 5652599  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  5652600 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 5652699  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5652700 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 5652742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 7073325 - 7073567
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7073325 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 7073424  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  7073425 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7073524  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7073525 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 7073567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15892851 - 15892609
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  15892851 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15892752  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15892751 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 15892652  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15892651 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 15892609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 18330782 - 18331024
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18330782 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18330881  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  18330882 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 18330981  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18330982 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 18331024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29148900 - 29148658
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  29148900 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29148801  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  29148800 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaac 29148701  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29148700 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29148658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5713340 - 5713582
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  5713340 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5713439  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  5713440 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5713539  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5713540 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5713582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5724250 - 5724492
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  5724250 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5724349  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  5724350 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5724449  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5724450 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5724492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5757227 - 5756985
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  5757227 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5757128  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  5757127 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5757028  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5757027 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5756985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5768118 - 5767876
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  5768118 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5768019  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  5768018 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 5767919  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5767918 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 5767876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8301412 - 8301170
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  8301412 catcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 8301313  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  8301312 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 8301213  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8301212 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 8301170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 4417047 - 4417274
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4417047 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 4417146  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  4417147 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 4417246  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4417247 acacatcaagctgtgcaaagcctctctg 4417274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17993929 - 17993687
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  17993929 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 17993830  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  17993829 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 17993730  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17993729 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 17993687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22387723 - 22387481
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22387723 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22387624  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  22387623 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22387524  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  22387523 tcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttctctg 22387481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29665115 - 29664873
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  29665115 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29665016  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29665015 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29664916  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29664915 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29664873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 35880879 - 35881121
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  35880879 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 35880978  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  35880979 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 35881078  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35881079 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 35881121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11110494 - 11110252
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  11110494 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 11110395  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  11110394 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 11110295  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11110294 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20576992 - 20576750
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  20576992 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 20576893  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  20576892 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 20576793  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20576792 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 20576750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28021388 - 28021630
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  28021388 catcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28021487  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  28021488 tcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28021587  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28021588 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28021630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28116099 - 28115857
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||||| ||||    
T  28116099 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatg 28116000  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  28115999 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28115900  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28115899 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28115857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 4626057 - 4626299
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  4626057 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 4626156  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  4626157 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 4626256  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  4626257 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctg 4626299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 4721744 - 4721986
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  4721744 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatg 4721843  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  4721844 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaac 4721943  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4721944 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4721986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 8211851 - 8212093
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  8211851 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8211950  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  8211951 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8212050  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  8212051 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctg 8212093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 10396246 - 10396488
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | || |||||||| ||||    
T  10396246 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 10396345  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||    
T  10396346 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaac 10396445  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10396446 tcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctg 10396488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36997222 - 36996980
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  36997222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 36997123  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||  ||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  36997122 tcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 36997023  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36997022 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 36996980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 48466040 - 48466282
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  48466040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 48466139  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  48466140 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 48466239  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48466240 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 48466282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4346832 - 4346590
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  4346832 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4346733  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  4346732 tcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 4346633  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4346632 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 4346590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5467098 - 5467340
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||| ||||    
T  5467098 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatg 5467197  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  5467198 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5467297  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5467298 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5467340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6542607 - 6542365
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  6542607 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 6542508  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6542507 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctac 6542408  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6542407 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6542365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18277197 - 18276955
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  18277197 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18277098  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  18277097 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18276998  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18276997 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18276955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18307799 - 18307557
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  18307799 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18307700  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  18307699 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18307600  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18307599 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18307557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 18242852 - 18243094
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  18242852 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18242951  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18242952 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 18243051  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18243052 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18243094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18292498 - 18292256
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  18292498 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18292399  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  18292398 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18292299  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18292298 tcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 18292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 21674806 - 21675048
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  21674806 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21674905  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
      || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  21674906 ctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21675005  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21675006 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 21675048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22871001 - 22870759
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  22871001 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22870902  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  22870901 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22870802  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22870801 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22870759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22886060 - 22885818
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  22886060 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22885961  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  22885960 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 22885861  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22885860 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22885818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 51782136 - 51782378
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  51782136 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51782235  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  51782236 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51782335  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51782336 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 51782378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Original strand, 51797226 - 51797461
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  51797226 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51797325  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  51797326 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 51797425  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51797426 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagc 51797461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5596502 - 5596260
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  5596502 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5596403  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  5596402 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 5596303  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  5596302 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttctctg 5596260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 7996675 - 7996917
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  7996675 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7996774  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  7996775 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 7996874  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7996875 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 7996917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 10643183 - 10643425
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  10643183 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10643282  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  10643283 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 10643382  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10643383 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 10643425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 24328272 - 24328514
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  24328272 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24328371  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  24328372 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 24328471  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24328472 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24328514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5013825 - 5014067
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  5013825 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5013924  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  5013925 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5014024  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5014025 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5014067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31964618 - 31964383
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  31964618 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31964519  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  31964518 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31964419  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31964418 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagc 31964383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5609467 - 5609225
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  5609467 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5609368  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||    
T  5609367 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 5609268  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5609267 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5609225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28339415 - 28339657
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  28339415 catcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28339514  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  28339515 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28339614  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28339615 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28339657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 47023566 - 47023808
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  47023566 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 47023665  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  47023666 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 47023765  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  47023766 tcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctg 47023808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17985101 - 17984859
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  17985101 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 17985002  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  17985001 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 17984902  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||    
T  17984901 tcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttctctg 17984859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50134216 - 50133990
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  50134216 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 50134117  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  50134116 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 50134017  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagct 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  50134016 tcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 18225304 - 18225546
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  18225304 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18225403  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||||||||||| || || |||||    
T  18225404 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 18225503  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18225504 tcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18225546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 32439267 - 32439491
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32439267 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 32439366  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  32439367 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 32439466  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaag 241  Q
    |||||||||||| || || ||||||    
T  32439467 tcctctggtgccactccatatcaag 32439491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Original strand, 20066156 - 20066364
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||     
T  20066156 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaata 20066255  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | ||||   || |||||||| |||||||||||    
T  20066256 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccgtgctggatgtccgcaatgttgcaac 20066355  T
Q  217 tcctctggt 225  Q
    |||||||||    
T  20066356 tcctctggt 20066364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20340439 - 20340197
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20340439 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 20340340  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20340339 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaac 20340240  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20340239 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 20340197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28152013 - 28152255
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28152013 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 28152112  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28152113 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 28152212  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28152213 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 28152255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16208135 - 16207896
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208135 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 16208036  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16208035 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 16207936  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16207935 tcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctct 16207896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 20461232 - 20461471
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||| || || ||||| || |  |    
T  20461232 catcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcg 20461331  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  20461332 tccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaac 20461431  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20461432 tcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctct 20461471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 51638369 - 51638611
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  51638369 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 51638468  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  51638469 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 51638568  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  51638569 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 51638611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 10962821 - 10963063
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  10962821 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10962920  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  10962921 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 10963020  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10963021 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 10963063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28585132 - 28585374
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  28585132 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28585231  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  28585232 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28585331  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28585332 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28585374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41793412 - 41793170
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  41793412 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41793313  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  41793312 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 41793213  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41793212 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 41793170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 23892367 - 23892609
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892367 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 23892466  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892467 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 23892566  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23892567 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctg 23892609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29889083 - 29888841
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29889083 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 29888984  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888983 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 29888884  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29888883 tcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctg 29888841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 33877408 - 33877650
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  33877408 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 33877507  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  33877508 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaac 33877607  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33877608 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 33877650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 25199190 - 25199427
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199190 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 25199289  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25199290 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaac 25199389  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcct 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25199390 tcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcct 25199427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 22888631 - 22888870
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888631 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 22888730  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||    
T  22888731 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaac 22888830  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22888831 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctct 22888870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 11325955 - 11326197
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11325955 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 11326054  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  11326055 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 11326154  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11326155 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 11326197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24688158 - 24687916
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24688158 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24688059  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24688058 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 24687959  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24687958 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24687916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23752451 - 23752209
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  23752451 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23752352  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23752351 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23752252  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23752251 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23752209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 11549515 - 11549757
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  11549515 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11549614  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11549615 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 11549714  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11549715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11549757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22999115 - 22998873
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22999115 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22999016  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  22999015 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 22998916  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22998915 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 22998873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23717989 - 23717747
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  23717989 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23717890  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23717889 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23717790  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23717789 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23717747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9548544 - 9548302
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  9548544 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 9548445  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  9548444 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9548345  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  9548344 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctctctg 9548302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 30934794 - 30935036
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  30934794 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 30934893  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  30934894 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaac 30934993  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  30934994 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 30935036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13184649 - 13184407
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  13184649 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13184550  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  13184549 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13184450  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13184449 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 13184407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 33777648 - 33777889
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  33777648 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 33777747  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  33777748 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 33777847  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33777848 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctct 33777889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15658761 - 15658519
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  15658761 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15658662  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15658661 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15658562  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  15658561 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctg 15658519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13440495 - 13440253
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  13440495 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13440396  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  13440395 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 13440296  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  13440295 tcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctg 13440253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 24970179 - 24970421
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||| ||||    
T  24970179 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatg 24970278  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |  ||||    
T  24970279 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaac 24970378  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  24970379 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 24970421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28649396 - 28649638
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  28649396 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28649495  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  28649496 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28649595  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28649596 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28649638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 30152179 - 30152421
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  30152179 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30152278  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30152279 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 30152378  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  30152379 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctg 30152421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 31431601 - 31431843
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  31431601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31431700  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31431701 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 31431800  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  31431801 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctg 31431843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18500731 - 18500489
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  18500731 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18500632  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||  |||||||||| || |||||    
T  18500631 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaac 18500532  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18500531 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18500489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 24681601 - 24681843
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  24681601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24681700  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  24681701 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24681800  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24681801 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24681843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 24724128 - 24724370
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  24724128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24724227  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  24724228 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 24724327  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24724328 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24724370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31826408 - 31826166
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  31826408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31826309  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  31826308 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 31826209  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31826208 tcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31826166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 33516517 - 33516759
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  33516517 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33516616  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  33516617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33516716  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33516717 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 33516759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 9317612 - 9317854
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  9317612 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9317711  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  9317712 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 9317811  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9317812 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9317854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 12132316 - 12132558
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  12132316 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12132415  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  12132416 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12132515  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12132516 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12132558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13324830 - 13324588
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  13324830 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 13324731  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  13324730 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 13324631  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13324630 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 13324588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40473550 - 40473308
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  40473550 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 40473451  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  40473450 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40473351  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40473350 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 40473308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 43078413 - 43078655
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  43078413 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 43078512  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  43078513 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 43078612  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43078613 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 43078655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18375413 - 18375171
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  18375413 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18375314  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  18375313 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18375214  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18375213 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18375171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 30168630 - 30168872
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  30168630 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatg 30168729  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  30168730 tcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30168829  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30168830 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30168872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32599473 - 32599231
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  32599473 catcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32599374  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||    
T  32599373 tcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccac 32599274  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32599273 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctg 32599231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37358644 - 37358402
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||     
T  37358644 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataata 37358545  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  37358544 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 37358445  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37358444 tcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37358402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37671484 - 37671242
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  37671484 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37671385  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |    
T  37671384 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgc 37671285  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37671284 ccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37671242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 2511212 - 2511454
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  2511212 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 2511311  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  2511312 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaac 2511411  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2511412 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 2511454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29967067 - 29966825
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  29967067 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29966968  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29966967 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 29966868  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29966867 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29966825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 30029576 - 30029818
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  30029576 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30029675  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  30029676 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 30029775  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30029776 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30029818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 37755141 - 37755383
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  37755141 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37755240  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  37755241 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37755340  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  37755341 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctg 37755383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8665476 - 8665241
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  8665476 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8665377  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  8665376 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 8665277  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8665276 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagc 8665241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15758858 - 15758623
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  15758858 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 15758759  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15758758 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 15758659  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15758658 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagc 15758623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37770988 - 37770753
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||    
T  37770988 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37770889  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||    
T  37770888 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctac 37770789  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37770788 tcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagc 37770753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 3789702 - 3789944
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  3789702 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3789801  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  3789802 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 3789901  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3789902 tcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3789944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 34616679 - 34616921
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  34616679 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34616778  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  34616779 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 34616878  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34616879 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34616921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5638071 - 5638313
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | |||||||| || ||||    
T  5638071 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatg 5638170  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  5638171 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5638270  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5638271 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 5638313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 6874466 - 6874708
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  6874466 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6874565  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  6874566 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 6874665  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6874666 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6874708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 26480553 - 26480794
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  26480553 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26480652  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  26480653 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26480752  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26480753 t-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 26480794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28959787 - 28959545
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  28959787 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28959688  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||  |||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  28959687 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccac 28959588  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28959587 tcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctg 28959545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 41674870 - 41675112
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||| ||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  41674870 catcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41674969  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  41674970 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 41675069  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  41675070 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctg 41675112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 33292686 - 33292910
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33292686 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 33292785  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  33292786 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 33292885  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaag 241  Q
    |||||||||||| || || ||||||    
T  33292886 tcctctggtgccactccatatcaag 33292910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21703257 - 21703015
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21703257 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 21703158  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  21703157 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaac 21703058  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21703057 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctg 21703015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9350075 - 9349833
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  9350075 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 9349976  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  9349975 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaac 9349876  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9349875 ccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9349833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19456514 - 19456275
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  19456514 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19456415  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  19456414 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 19456315  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456314 tcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 19456275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34303396 - 34303158
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  34303396 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34303297  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303296 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 34303197  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctc 255  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34303196 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 34303158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27434537 - 27434295
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  27434537 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27434438  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27434437 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27434338  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27434337 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27434295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 28882362 - 28882604
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  28882362 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 28882461  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  28882462 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 28882561  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28882562 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28882604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23128659 - 23128417
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  23128659 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23128560  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23128559 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 23128460  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23128459 tcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 23128417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 12655690 - 12655932
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  12655690 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 12655789  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12655790 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 12655889  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12655890 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12655932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 20838066 - 20838308
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  20838066 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 20838165  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||    
T  20838166 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaac 20838265  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20838266 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 20838308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22926121 - 22925879
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  22926121 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 22926022  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22926021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 22925922  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22925921 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 22925879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 12586958 - 12587200
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  12586958 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12587057  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  12587058 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 12587157  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12587158 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12587200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27118836 - 27119078
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  27118836 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 27118935  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||  |||||||    
T  27118936 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaac 27119035  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27119036 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 27119078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 3784802 - 3785044
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  3784802 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 3784901  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  3784902 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 3785001  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  3785002 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 3785044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 40233659 - 40233901
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  40233659 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40233758  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || | |||    
T  40233759 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 40233858  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  40233859 tcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctg 40233901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27777370 - 27777612
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27777370 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27777469  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27777470 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27777569  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27777570 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27777612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27817128 - 27817370
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27817128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27817227  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27817228 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 27817327  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27817328 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27817370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 34157159 - 34157400
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  34157159 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34157257  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  34157258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 34157357  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  34157358 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 34157400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39051915 - 39051673
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  39051915 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39051816  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  39051815 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 39051716  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39051715 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39051673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12716695 - 12716453
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  12716695 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12716596  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  12716595 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 12716496  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12716495 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 12716453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13936637 - 13936395
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  13936637 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 13936538  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  13936537 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 13936438  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13936437 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 13936395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 16163747 - 16163985
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  16163747 catcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16163846  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  16163847 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 16163946  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctc 255  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  16163947 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 16163985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16829431 - 16829189
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  16829431 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16829332  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16829331 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16829232  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16829231 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16829189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 16892050 - 16892292
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  16892050 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16892149  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16892150 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 16892249  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16892250 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16892292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 32049946 - 32050188
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  32049946 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32050045  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  32050046 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 32050145  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32050146 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 32050188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 27803855 - 27804097
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  27803855 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27803954  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||    
T  27803955 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaac 27804054  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27804055 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 27804097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 34286502 - 34286744
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  34286502 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34286601  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  34286602 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34286701  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34286702 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34286744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 34291562 - 34291804
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  34291562 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34291661  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  34291662 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34291761  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34291762 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34291804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 37375309 - 37375551
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  37375309 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37375408  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | || ||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  37375409 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37375508  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  37375509 tcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctg 37375551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 34861828 - 34862070
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  34861828 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34861927  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  34861928 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaac 34862027  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34862028 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34862070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37686002 - 37685760
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  37686002 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37685903  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  37685902 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37685803  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37685802 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37685760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37701267 - 37701025
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  37701267 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37701168  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  37701167 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37701068  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37701067 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37701025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 37925641 - 37925883
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  37925641 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37925740  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  37925741 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 37925840  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37925841 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 37925883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 260846 - 260604
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  260846 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 260747  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||| ||| |||||||||||||| || || | |||    
T  260746 tcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaac 260647  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  260646 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 260604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21677275 - 21677033
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  21677275 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21677176  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  21677175 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21677076  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21677075 tcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 21677033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 39890222 - 39890464
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  39890222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 39890321  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  39890322 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 39890421  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39890422 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39890464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19416592 - 19416350
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  19416592 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19416493  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  19416492 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19416393  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19416392 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19416350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 31876429 - 31876663
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  31876429 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31876528  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  31876529 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31876628  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaag 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31876629 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 31876663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31891421 - 31891179
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || ||| |||| || |    
T  31891421 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacg 31891322  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  31891321 tccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 31891222  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  31891221 tcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctg 31891179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 27393117 - 27393298
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  27393117 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 27393216  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 198  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| |||||    
T  27393217 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttga 27393298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11635264 - 11635037
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||  || | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  11635264 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11635165  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  11635164 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11635065  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11635064 acacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11635037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11641453 - 11641226
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||  || | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  11641453 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11641354  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  11641353 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctct 11641254  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11641253 acacatcaagctgtgcaaagcttctctg 11641226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Original strand, 34279597 - 34279698
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  34279597 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 34279696  T
Q  117 tc 118  Q
    ||    
T  34279697 tc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 1900424 - 1900663
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1900424 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatg 1900523  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||    
T  1900524 tcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaac 1900623  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1900624 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctct 1900663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 15228037 - 15228276
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| || |    
T  15228037 catcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacg 15228136  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15228137 tccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaac 15228236  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15228237 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 15228276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15285032 - 15284793
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  15285032 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 15284933  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  15284932 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaac 15284833  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctct 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15284832 tcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 15284793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 14665185 - 14665427
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||     
T  14665185 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataata 14665284  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  14665285 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14665384  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14665385 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14665427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 17014167 - 17014409
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  17014167 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 17014266  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  17014267 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 17014366  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17014367 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 17014409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24592418 - 24592176
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24592418 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24592319  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24592318 tcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 24592219  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24592218 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 24592176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14235629 - 14235394
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14235629 catcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 14235530  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  14235529 tccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgac 14235430  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  14235429 tcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagc 14235394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15391442 - 15391204
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  15391442 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatg 15391343  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15391342 tccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagagtcatgaagaagttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaac 15391243  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctc 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  15391242 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctc 15391204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18800717 - 18800475
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  18800717 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18800618  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  18800617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 18800518  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18800517 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 18800475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24460709 - 24460467
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  24460709 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 24460610  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||||||||    
T  24460609 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaac 24460510  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24460509 tcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctg 24460467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36344619 - 36344377
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  36344619 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 36344520  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  36344519 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 36344420  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  36344419 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctg 36344377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 5006040 - 5006282
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  5006040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatg 5006139  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  5006140 tcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 5006239  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5006240 tcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctctg 5006282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 6570020 - 6570262
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  6570020 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6570119  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  6570120 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 6570219  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6570220 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6570262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31126622 - 31126380
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  31126622 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31126523  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  31126522 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31126423  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31126422 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31126380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 39850805 - 39851047
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  39850805 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39850904  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  39850905 ttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 39851004  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39851005 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39851047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14763408 - 14763166
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  14763408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 14763309  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  14763308 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14763209  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14763208 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14763166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27163421 - 27163179
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  27163421 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27163322  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27163321 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 27163222  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  27163221 tcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 27163179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40105742 - 40105500
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  40105742 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40105643  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  40105642 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 40105543  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40105542 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 40105500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 54833554 - 54833796
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  54833554 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 54833653  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  54833654 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 54833753  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  54833754 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 54833796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 14098708 - 14098950
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  14098708 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14098807  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  14098808 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14098907  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14098908 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14098950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 21969868 - 21970110
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  21969868 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 21969967  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  21969968 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 21970067  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21970068 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 21970110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 30753921 - 30754163
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  30753921 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30754020  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  30754021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaac 30754120  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30754121 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33673902 - 33673660
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  33673902 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33673803  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||    
T  33673802 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33673703  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33673702 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 33673660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34189064 - 34188840
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34189064 catcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 34188965  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  34188964 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 34188865  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaag 241  Q
    |||||||||||| || || ||||||    
T  34188864 tcctctggtgccactccatatcaag 34188840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 24112829 - 24113053
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || || || || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24112829 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 24112928  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||  || |||||||| |||||||||||    
T  24112929 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaac 24113028  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaag 241  Q
    |||||||||||| || || ||||||    
T  24113029 tcctctggtgccactccatatcaag 24113053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 18710738 - 18710980
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18710738 catcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18710837  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  18710838 tcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaac 18710937  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18710938 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 18710980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 16283613 - 16283843
Alignment:
Q  29 ctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcc 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16283613 ctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 16283712  T
Q  129 tcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcc 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16283713 tcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcc 16283812  T
Q  229 tctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16283813 tctacacatcaagctatgcaaagcttctctg 16283843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27608968 - 27608733
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  27608968 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27608869  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27608868 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 27608769  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27608768 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 27608733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 19688250 - 19688492
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19688250 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 19688349  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  19688350 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 19688449  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19688450 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19688492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22080941 - 22080703
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22080941 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 22080842  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22080841 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagactcatgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaac 22080742  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctc 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  22080741 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctc 22080703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 14557776 - 14558018
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  14557776 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 14557875  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  14557876 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 14557975  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14557976 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14558018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 16277706 - 16277948
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  16277706 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16277805  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  16277806 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 16277905  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16277906 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 16277948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19659102 - 19658861
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  19659102 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19659004  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  19659003 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaac 19658904  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  19658903 tcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctg 19658861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 44563253 - 44563493
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  44563253 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 44563351  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||| ||| ||||    
T  44563352 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaac 44563450  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44563451 tcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 44563493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 259
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189488
Alignment:
Q  27 ctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgt 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  127 cctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtg 226  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtg 189455  T
Q  227 cctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  189456 cctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 189488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2137322 - 2137080
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  2137322 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2137223  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    || | |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  2137222 tctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 2137123  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2137122 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 2137080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3329570 - 3329328
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  3329570 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatg 3329471  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3329470 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 3329371  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3329370 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 3329328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 29829474 - 29829716
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  29829474 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29829573  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  29829574 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 29829673  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29829674 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 29829716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 33244817 - 33245059
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |    
T  33244817 catcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 33244916  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||  |||| ||||||||    
T  33244917 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaac 33245016  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  33245017 tcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctg 33245059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 19674608 - 19674835
Alignment:
Q  32 ggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcg 131  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19674608 ggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 19674707  T
Q  132 acaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctct 231  Q
    |||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674708 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctct 19674807  T
Q  232 acacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19674808 gcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19674835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12092787 - 12092545
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  12092787 catcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12092688  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||    
T  12092687 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcac 12092588  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  12092587 tcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctg 12092545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 19286614 - 19286856
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  19286614 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19286713  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  19286714 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 19286813  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19286814 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19286856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31489813 - 31489571
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  31489813 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31489714  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  31489713 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31489614  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31489613 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 31489571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19208423 - 19208181
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  19208423 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19208324  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  19208323 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 19208224  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19208223 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 19208181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28362018 - 28361776
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  28362018 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28361919  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  28361918 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 28361819  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28361818 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 28361776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 252
Target Start/End: Original strand, 31354676 - 31354911
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  31354676 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31354775  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  31354776 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 31354875  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagc 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31354876 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagc 31354911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 33258875 - 33259117
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  33258875 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 33258974  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  33258975 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 33259074  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33259075 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 33259117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 9354774 - 9355017
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaag-ctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaat 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||  || ||||| || ||  |||||  |||||||||| || || |||||||| |||    
T  9354774 catcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataat 9354873  T
Q  116 gtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaa 215  Q
    || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||    
T  9354874 gttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaa 9354973  T
Q  216 ctcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9354974 ctcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 9355017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2021 - 1832
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2021 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 1923  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1922 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaa 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 6165 - 6408
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgcttt-gaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaat 115  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||    
T  6165 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataat 6264  T
Q  116 gtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaa 215  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||    
T  6265 gtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaa 6364  T
Q  216 ctcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6365 ctcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 6408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 20540 - 20729
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20540 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 20638  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20639 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaa 20729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 30604 - 30846
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||    
T  30604 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30703  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||    
T  30704 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaac 30803  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30804 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40173 - 39931
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  40173 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 40074  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40073 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaac 39974  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39973 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 39931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47089 - 46847
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  47089 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 46990  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  46989 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaac 46890  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  46889 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 46847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 29918 - 30157
Alignment:
Q  20 caaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtcc 119  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  29918 caaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 30017  T
Q  120 ctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcc 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30018 cgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcc 30117  T
Q  220 tctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30118 tctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 30157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 722 - 492
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||    
T  722 catcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataatg 623  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  622 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaac 523  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgc 247  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  522 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgc 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 21713 - 21951
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21713 catcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatg 21812  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21813 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaagttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaac 21912  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctc 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21913 tcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctc 21951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 9718 - 9960
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  9718 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9817  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9818 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 9917  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9918 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctg 9960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 27444 - 27685
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  27444 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27543  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  27544 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaac 27643  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  27644 tcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctct 27685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 1
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  233 catcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 134  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  133 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaac 34  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7343 - 7101
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  7343 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7244  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  7243 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 7144  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7143 tcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 7101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14792
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  15034 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14935  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  14934 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 14835  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14834 tcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 14792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9170 - 8928
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  9170 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9071  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||    
T  9070 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 8971  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8970 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 20167 - 20409
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  20167 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 20266  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||    
T  20267 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaac 20366  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20367 tcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctg 20409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Original strand, 8101 - 8343
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  8101 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8200  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  8201 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccac 8300  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8301 tcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctg 8343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26305 - 26063
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  26305 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26206  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaac 216  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  26205 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaac 26106  T
Q  217 tcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcctctctg 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  26105 tcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctg 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 1
Alignment:
Q  17 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| |    
T  132 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacg 33  T
Q  117 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 46872 - 46661
Alignment:
Q  53 tatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaa-gttaactttt-gagaacaatgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatca 150  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |   |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatca 46773  T
Q  151 cgctgctgtgaacatgattgag-gtatatgagg-aagctccca-gacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgc 247  Q
     |||||||| || |||| | |  |||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  46772 tgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgc 46673  T
Q  248 aaagcctctctg 259  Q
    ||||| ||||||    
T  46672 aaagcttctctg 46661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 277 - 452
Alignment:
Q  53 tatgctttgaaatatattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacg 152  Q
    |||||||| || ||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | || |    
T  277 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 376  T
Q  153 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcc 228  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  377 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcacccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggtgcc 452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University