View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9422_high_1 (Length: 569)

Name: NF9422_high_1
Description: NF9422
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9422_high_1
NF9422_high_1
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (10-229)||(21001956-21002175)
chr7 (10-229)||(9434382-9434601)
chr7 (10-229)||(5686677-5686897)
chr7 (10-234)||(6876791-6877014)
chr7 (12-218)||(19992966-19993171)
chr7 (10-234)||(22090323-22090544)
chr7 (10-234)||(17959623-17959845)
chr7 (10-234)||(4213170-4213389)
chr7 (10-234)||(8618538-8618755)
chr7 (10-234)||(168040-168260)
chr7 (10-185)||(1988728-1988903)
chr7 (10-185)||(8011635-8011810)
chr7 (10-185)||(2715185-2715360)
chr7 (10-185)||(24735913-24736088)
chr7 (10-185)||(9086417-9086592)
chr7 (10-185)||(26399644-26399819)
chr7 (10-185)||(40051652-40051827)
chr7 (10-185)||(11097200-11097376)
chr7 (10-185)||(11006377-11006552)
chr7 (10-185)||(26698677-26698852)
chr7 (10-185)||(42867018-42867193)
chr7 (10-185)||(466541-466716)
chr7 (19-181)||(15887203-15887365)
chr7 (191-229)||(5711419-5711457)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (10-229)||(9122013-9122232)
chr6 (12-224)||(25590321-25590532)
chr6 (10-218)||(27373899-27374107)
chr6 (10-218)||(27464252-27464460)
chr6 (10-185)||(12856098-12856273)
chr6 (10-185)||(26865941-26866116)
chr6 (10-234)||(34816655-34816875)
chr6 (10-185)||(3662493-3662668)
chr6 (10-185)||(12726317-12726492)
chr6 (10-185)||(17983618-17983793)
chr6 (10-185)||(25788877-25789052)
chr6 (10-185)||(26026568-26026743)
chr6 (10-185)||(27342876-27343051)
chr6 (10-185)||(27403616-27403791)
chr6 (10-234)||(32971358-32971580)
chr6 (10-185)||(16931543-16931718)
chr6 (96-234)||(7669378-7669513)
chr6 (10-126)||(27385644-27385760)
chr6 (10-126)||(27476057-27476173)
chr6 (10-126)||(4632118-4632234)
chr6 (10-126)||(32310543-32310659)
chr6 (94-185)||(4632038-4632129)
chr6 (94-185)||(27385564-27385655)
chr6 (94-185)||(27475977-27476068)
chr6 (94-185)||(32310648-32310739)
chr6 (19-181)||(12359298-12359460)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (10-229)||(5291630-5291849)
chr5 (10-229)||(27604508-27604728)
chr5 (10-229)||(40399989-40400207)
chr5 (10-234)||(39361270-39361495)
chr5 (14-218)||(31447510-31447714)
chr5 (10-185)||(15768362-15768537)
chr5 (10-185)||(37731059-37731234)
chr5 (10-234)||(22156074-22156294)
chr5 (10-185)||(6985320-6985495)
chr5 (10-185)||(9345562-9345737)
chr5 (10-185)||(14039619-14039794)
chr5 (10-185)||(14448133-14448308)
chr5 (10-185)||(14559165-14559340)
chr5 (10-185)||(17616641-17616816)
chr5 (10-185)||(17728498-17728673)
chr5 (10-185)||(22685025-22685200)
chr5 (10-185)||(23305868-23306043)
chr5 (10-185)||(23371531-23371706)
chr5 (10-185)||(23706378-23706553)
chr5 (10-185)||(27043316-27043491)
chr5 (10-185)||(27469583-27469758)
chr5 (10-185)||(31358115-31358290)
chr5 (10-185)||(36583606-36583781)
chr5 (10-185)||(42052390-42052565)
chr5 (10-185)||(24589161-24589336)
chr5 (10-185)||(30228553-30228728)
chr5 (10-185)||(39491994-39492169)
chr5 (10-185)||(24817948-24818123)
chr5 (10-185)||(35225084-35225259)
chr5 (10-185)||(15994390-15994565)
chr5 (10-185)||(31842987-31843162)
chr5 (39-189)||(1110291-1110441)
chr5 (17-185)||(20796650-20796818)
chr5 (10-126)||(36697196-36697312)
chr5 (94-185)||(36697301-36697392)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (10-229)||(19180040-19180259)
chr1 (10-229)||(4168357-4168575)
chr1 (10-234)||(5649257-5649480)
chr1 (10-234)||(12622677-12622896)
chr1 (10-234)||(21864763-21864996)
chr1 (10-185)||(38096208-38096383)
chr1 (10-185)||(51655375-51655550)
chr1 (10-185)||(7508422-7508597)
chr1 (10-185)||(36245931-36246106)
chr1 (10-185)||(35400043-35400218)
chr1 (10-185)||(35647568-35647743)
chr1 (10-185)||(47617437-47617612)
chr1 (10-185)||(5834349-5834524)
chr1 (10-185)||(3172745-3172920)
chr1 (10-185)||(12731632-12731807)
chr1 (10-185)||(12742225-12742400)
chr1 (17-189)||(153158-153330)
chr1 (231-304)||(52689229-52689302)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (10-229)||(37867618-37867838)
chr3 (10-229)||(37876136-37876356)
chr3 (10-236)||(6219538-6219763)
chr3 (10-236)||(19779548-19779773)
chr3 (12-218)||(16390427-16390633)
chr3 (10-234)||(20682617-20682837)
chr3 (10-202)||(9992794-9992986)
chr3 (10-185)||(6499864-6500039)
chr3 (10-234)||(13122839-13123059)
chr3 (10-234)||(14466766-14466985)
chr3 (10-185)||(13382153-13382328)
chr3 (10-185)||(13392747-13392922)
chr3 (10-185)||(4744899-4745074)
chr3 (10-185)||(5511855-5512030)
chr3 (10-185)||(5546505-5546680)
chr3 (10-185)||(24661076-24661251)
chr3 (10-185)||(5626861-5627036)
chr3 (10-185)||(5875146-5875321)
chr3 (10-185)||(12295704-12295879)
chr3 (10-185)||(16477440-16477615)
chr3 (10-185)||(24392956-24393131)
chr3 (10-185)||(41684835-41685010)
chr3 (10-185)||(8775865-8776040)
chr3 (10-185)||(18485198-18485373)
chr3 (10-185)||(23758441-23758616)
chr3 (10-185)||(38195932-38196107)
chr3 (10-185)||(39373262-39373437)
chr3 (10-185)||(28323701-28323876)
chr3 (17-189)||(29470675-29470847)
chr3 (10-185)||(12248329-12248504)
chr3 (10-104)||(10635920-10636014)
chr3 (100-185)||(10654248-10654333)
chr3 (518-562)||(46223009-46223053)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (10-229)||(43083789-43084009)
chr2 (10-234)||(24337264-24337486)
chr2 (10-229)||(29245346-29245567)
chr2 (10-234)||(4211034-4211254)
chr2 (10-185)||(40223476-40223651)
chr2 (10-234)||(22959203-22959423)
chr2 (10-185)||(11404345-11404520)
chr2 (10-185)||(43346542-43346717)
chr2 (10-185)||(10268125-10268300)
chr2 (10-185)||(10278702-10278877)
chr2 (10-185)||(27222563-27222738)
chr2 (10-185)||(35254176-35254351)
chr2 (10-185)||(35264785-35264960)
chr2 (10-185)||(9907060-9907235)
chr2 (10-185)||(9772231-9772406)
chr2 (40-185)||(34803301-34803446)
chr2 (10-44)||(34799692-34799726)
chr2 (10-43)||(35759242-35759275)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (10-234)||(26112419-26112642)
chr8 (10-228)||(19129892-19130112)
chr8 (10-234)||(6152242-6152462)
chr8 (10-185)||(15766081-15766256)
chr8 (10-185)||(15790218-15790393)
chr8 (10-185)||(36294110-36294285)
chr8 (10-185)||(209087-209262)
chr8 (10-185)||(242993-243168)
chr8 (10-185)||(722710-722885)
chr8 (10-185)||(796363-796538)
chr8 (10-185)||(3358139-3358314)
chr8 (10-185)||(9342315-9342490)
chr8 (10-185)||(29077891-29078066)
chr8 (10-185)||(32087203-32087378)
chr8 (10-185)||(13687498-13687673)
chr8 (10-185)||(36079115-36079290)
chr8 (19-181)||(19226134-19226296)
chr8 (10-126)||(44482387-44482503)
chr8 (19-181)||(30324171-30324333)
chr8 (94-185)||(44482307-44482398)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (10-234)||(17919243-17919466)
chr4 (10-234)||(19953843-19954068)
chr4 (10-234)||(24026926-24027147)
chr4 (12-226)||(40469482-40469694)
chr4 (10-234)||(16257063-16257282)
chr4 (10-185)||(55754716-55754891)
chr4 (10-185)||(10750056-10750231)
chr4 (10-185)||(10963825-10964000)
chr4 (10-185)||(18761969-18762144)
chr4 (10-185)||(24641492-24641667)
chr4 (10-185)||(36019512-36019687)
chr4 (10-185)||(451753-451928)
chr4 (10-185)||(27657825-27658000)
chr4 (10-185)||(30935979-30936154)
chr4 (10-185)||(21997593-21997768)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (12-226)||(227-439)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (10-185)||(32314-32489)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (10-185)||(46482-46657)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (17-187)||(52481-52651)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (10-187)||(3424-3601)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (12-89)||(3552-3629)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (94-223)||(2861-2987)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (19-185)||(3250-3416)
scaffold0398 (107-185)||(11593-11671)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (10-126)||(2526-2642)
scaffold0454 (94-185)||(2446-2537)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (114-181)||(23758-23825)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (94-186)||(23802-23894)
scaffold0199 (10-126)||(23883-23999)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 21001956 - 21002175
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21001956 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 21002055  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002056 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 21002155  T
Q  210 gttctaagtactttagttgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21002156 gttctaagtactttagttgc 21002175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9434601 - 9434382
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9434601 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9434502  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9434501 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccatttttctttgcttgttttaattttt 9434402  T
Q  210 gttctaagtactttagttgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9434401 gttctaagtactttagttgc 9434382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5686897 - 5686677
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5686897 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5686798  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca-attttctttgcttgttttaatctt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5686797 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccattttttctttgcttgttttaatctt 5686698  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5686697 tgttctaagtactttagttgc 5686677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 6876791 - 6877014
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6876791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6876890  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6876891 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc-attttttttgcttgttttaatcttt 6876989  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  6876990 gttctaagtactttagttgcactgc 6877014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 19992966 - 19993171
Alignment:
Q  12 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  19992966 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcatgctggattcaaaagaagaatgagagaaaaggatgagttactta 19993065  T
Q  112 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatctttgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||    
T  19993066 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactctttgcttg-tttaatttttgt 19993164  T
Q  212 tctaagt 218  Q
    |||||||    
T  19993165 tctaagt 19993171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22090544 - 22090323
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22090544 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaaccagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 22090445  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  ||    
T  22090444 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc---ttttttttgcttgttttaattctt 22090348  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  22090347 gttctacgtactttagttgcactgc 22090323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 17959623 - 17959845
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17959623 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17959722  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||    
T  17959723 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca--tttttttttttgcttgttttaattttt 17959820  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  17959821 gttctaagtactttagttgcactgc 17959845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4213389 - 4213170
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  4213389 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaatgatgagctact 4213290  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||  ||    
T  4213289 caagaagaaggatgagaaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac-----attttttttgcttgttttaattctt 4213195  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  4213194 gttctaagtactttagttgcactgc 4213170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8618755 - 8618538
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8618755 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaataagaatgagggaaaaggatgagctact 8618656  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| |||    
T  8618655 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgc-------attttttttgcttgttttaattttt 8618563  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  8618562 gttctaagtactttagttgcactgc 8618538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 168260 - 168040
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  168260 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 168161  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||  ||    
T  168160 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacat----ttttttttgcttgttttaattgtt 168065  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  168064 gttctaagtactttagttgcactgc 168040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1988903 - 1988728
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1988903 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 1988804  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988803 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 1988728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 8011635 - 8011810
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8011635 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 8011734  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8011735 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 8011810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 2715185 - 2715360
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2715185 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 2715284  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | | ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2715285 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 2715360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24736088 - 24735913
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24736088 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24735989  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735988 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 24735913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9086592 - 9086417
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9086592 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 9086493  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9086492 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9086417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 26399644 - 26399819
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26399644 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 26399743  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26399744 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaactgttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 26399819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 40051652 - 40051827
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  40051652 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaataatgagggaaaaggatgagctact 40051751  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40051752 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 40051827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11097376 - 11097200
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaag-ggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  11097376 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagtggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctac 11097277  T
Q  109 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11097276 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 11097200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11006552 - 11006377
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11006552 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 11006453  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006452 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 11006377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 26698677 - 26698852
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26698677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 26698776  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26698777 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacatccaa 26698852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42867193 - 42867018
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42867193 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 42867094  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42867093 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 42867018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 466541 - 466716
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  466541 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 466640  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466641 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 466716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Original strand, 15887203 - 15887365
Alignment:
Q  19 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   || | || | |||| |||||||    
T  15887203 ctcctttttatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactgagagcacagaaagaacaacttcagaagaa 15887302  T
Q  119 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
     ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15887303 tgatgagcaggttaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 15887365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5711457 - 5711419
Alignment:
Q  191 tttgcttgttttaatctttgttctaagtactttagttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5711457 tttgcttgttttaatctttgttctaagtactttagttgc 5711419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 9122013 - 9122232
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9122013 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9122112  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122113 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 9122212  T
Q  210 gttctaagtactttagttgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9122213 gttctaagtactttagttgc 9122232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25590532 - 25590321
Alignment:
Q  12 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25590532 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgaacttctta 25590433  T
Q  112 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatctttgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25590432 agaagaaggatgagcaaattaagtacctcttagaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccatttttc-ttgctagttttaatctttgt 25590334  T
Q  212 tctaagtacttta 224  Q
    |||||||||||||    
T  25590333 tctaagtacttta 25590321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27374107 - 27373899
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27374107 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27374008  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||    
T  27374007 tcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactctttgcttgttttaattttt 27373908  T
Q  210 gttctaagt 218  Q
    |||||||||    
T  27373907 gttctaagt 27373899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27464460 - 27464252
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27464460 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27464361  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||    
T  27464360 tcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactctttgcttgttttaattttt 27464261  T
Q  210 gttctaagt 218  Q
    |||||||||    
T  27464260 gttctaagt 27464252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12856273 - 12856098
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12856273 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 12856174  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856173 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 12856098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26866116 - 26865941
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26866116 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 26866017  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866016 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 26865941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 34816655 - 34816875
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  34816655 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 34816754  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaa-tctt 208  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| | ||    
T  34816755 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac-----attttttttgcttgttttaattttt 34816849  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34816850 tgttctaagtactttagttgcactgc 34816875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3662668 - 3662493
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3662668 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 3662569  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3662568 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 3662493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 12726317 - 12726492
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12726317 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 12726416  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726417 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 12726492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 17983618 - 17983793
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17983618 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17983717  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983718 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 17983793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25789052 - 25788877
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25789052 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 25788953  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788952 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 25788877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26026743 - 26026568
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26026743 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 26026644  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26026643 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 26026568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27343051 - 27342876
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27343051 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27342952  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27342951 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27342876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27403791 - 27403616
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27403791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27403692  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27403691 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27403616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 32971358 - 32971580
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  32971358 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaatgatgagctact 32971457  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||     |||| ||||| ||||||||| |||    
T  32971458 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttg--catttttttttttttgcctgttttaattttt 32971555  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  32971556 gttctaagtactttagttgcactgc 32971580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16931718 - 16931543
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16931718 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 16931619  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931618 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagtngtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 16931543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 234
Target Start/End: Original strand, 7669378 - 7669513
Alignment:
Q  96 aaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttg 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7669378 aaggatgagctactcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttattctttg 7669477  T
Q  195 cttgttttaatctttgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7669478 cttgt----atctttgttctaagtactttagttgcactgc 7669513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27385760 - 27385644
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  27385760 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 27385661  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |||||||||||||||    
T  27385660 tcagaagaaggatgagc 27385644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27476173 - 27476057
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  27476173 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 27476074  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |||||||||||||||    
T  27476073 tcagaagaaggatgagc 27476057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4632234 - 4632118
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  4632234 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 4632135  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |||||||||||||||    
T  4632134 tcagaagaaggatgagc 4632118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 32310543 - 32310659
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  32310543 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 32310642  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |||||||||||||||    
T  32310643 tcagaagaaggatgagc 32310659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4632129 - 4632038
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632129 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 4632038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27385655 - 27385564
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385655 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27385564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27476068 - 27475977
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27476068 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27475977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 32310648 - 32310739
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32310648 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 32310739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12359460 - 12359298
Alignment:
Q  19 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || || ||| | ||||| ||  ||||||  ||| ||||   |||| |||||||    
T  12359460 ctcctttctatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagcagggctgaaaagcagattgagagcaaagaatgaagaacttcagaagaa 12359361  T
Q  119 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12359360 ggatgatcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 12359298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5291849 - 5291630
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5291849 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattataagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5291750  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5291749 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaatagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccagttttctttgcttgttttaatcttt 5291650  T
Q  210 gttctaagtactttagttgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5291649 gttctaagtactttagttgc 5291630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27604728 - 27604508
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27604728 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaaggactgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27604629  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttgcttgttttaatctt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27604628 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttattctttgcttgttttaatctt 27604529  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27604528 tgttctaagtactttagttgc 27604508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 40399989 - 40400207
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40399989 tggacatcactcctttctatccagaagaagaatacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 40400088  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40400089 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccctagttgcaca-ccaattttttttgcttgttttaatcttt 40400187  T
Q  210 gttctaagtactttagttgc 229  Q
     |||||||||||||||||||    
T  40400188 attctaagtactttagttgc 40400207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 39361270 - 39361495
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39361270 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 39361369  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttgcttgttttaatctt 208  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  39361370 caagaagaatgatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccttttattctttgcttgttttaatctt 39361469  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39361470 tgttctaagtactttagttgcactgc 39361495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 31447510 - 31447714
Alignment:
Q  14 catcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31447510 catcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcag 31447609  T
Q  114 aagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatctttgttc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  31447610 aagaaggatgagcaaattaagtatattttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacattctttgcttgttttaatttttgttc 31447709  T
Q  214 taagt 218  Q
    |||||    
T  31447710 taagt 31447714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 15768362 - 15768537
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15768362 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 15768461  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15768462 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 15768537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37731234 - 37731059
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37731234 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37731135  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37731134 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 37731059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 22156074 - 22156294
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  22156074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22156173  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaa-tctt 208  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| | ||    
T  22156174 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac-----attttttttgcttgttttaattttt 22156268  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22156269 tgttctaagtactttagttgcactgc 22156294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 6985320 - 6985495
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6985320 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 6985419  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6985420 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 6985495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 9345562 - 9345737
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9345562 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 9345661  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345662 ttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9345737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 14039619 - 14039794
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14039619 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14039718  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039719 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 14039794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14448308 - 14448133
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14448308 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14448209  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14448208 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 14448133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14559340 - 14559165
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14559340 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14559241  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14559240 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 14559165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 17616641 - 17616816
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17616641 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 17616740  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17616741 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 17616816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 17728498 - 17728673
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17728498 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 17728597  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17728598 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 17728673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 22685025 - 22685200
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22685025 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 22685124  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22685125 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 22685200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 23305868 - 23306043
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23305868 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 23305967  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23305968 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 23306043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 23371531 - 23371706
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23371531 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 23371630  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371631 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 23371706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 23706378 - 23706553
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23706378 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 23706477  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706478 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 23706553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27043491 - 27043316
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27043491 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 27043392  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27043391 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27043316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 27469583 - 27469758
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27469583 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 27469682  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27469683 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27469758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 31358115 - 31358290
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31358115 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 31358214  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358215 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 31358290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36583781 - 36583606
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36583781 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36583682  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36583681 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 36583606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 42052390 - 42052565
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42052390 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 42052489  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42052490 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 42052565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24589336 - 24589161
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24589336 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgaggtaaaaggatgagctact 24589237  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589236 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 24589161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30228728 - 30228553
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  30228728 tggacattactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 30228629  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30228628 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 30228553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39492169 - 39491994
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||  | ||||||||||||||    
T  39492169 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgaggaaaaaggatgagctact 39492070  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39492069 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 39491994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24818123 - 24817948
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24818123 tggacatcaatcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24818024  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818023 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 24817948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 35225084 - 35225259
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35225084 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35225183  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35225184 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 35225259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15994565 - 15994390
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || || |||||||||||    
T  15994565 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaatgatgagctact 15994466  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15994465 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 15994390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 31842987 - 31843162
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  31842987 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 31843086  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31843087 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatttcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 31843162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1110441 - 1110291
Alignment:
Q  39 gagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatc 138  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1110441 gagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcaaattaagtatc 1110342  T
Q  139 tcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatttt 189  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1110341 tattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttt 1110291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Original strand, 20796650 - 20796818
Alignment:
Q  17 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||  ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||  |||||||| | |||| |||||    
T  20796650 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaagaactgttagaattcaagccgggttgaaaagaagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 20796749  T
Q  117 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20796750 aaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaa 20796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 36697196 - 36697312
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  36697196 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 36697295  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |||||||||||||||    
T  36697296 tcagaagaaggatgagc 36697312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 36697301 - 36697392
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36697301 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 36697392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19180259 - 19180040
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19180259 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19180160  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19180159 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccagttttctttgcttgttttaatcttt 19180060  T
Q  210 gttctaagtactttagttgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19180059 gttctaagtactttagttgc 19180040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4168575 - 4168357
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4168575 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 4168476  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4168475 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc-attttttttgcttgttttaatcttt 4168377  T
Q  210 gttctaagtactttagttgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4168376 gttctaagtactttagttgc 4168357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 5649257 - 5649480
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5649257 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5649356  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5649357 caataagaaggatgagcagattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcaca-ccaattttttttgcttgttttaatcttt 5649455  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  5649456 gttctaagtactttagttgcactgc 5649480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 12622677 - 12622896
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12622677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 12622776  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| |||    
T  12622777 caaaaagaaggacgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac-----attttttttgcttgttttaattttt 12622871  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  12622872 gttctaagtactttagttgcactgc 12622896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21864996 - 21864763
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21864996 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaacaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 21864897  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc---------caattttctttgcttgtt 200  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||            |||| ||||||||||    
T  21864896 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacaccttttttttttttttttttttgcttgtt 21864797  T
Q  201 ttaatctttgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21864796 ttaattcttgttctaagtactttagttgcactgc 21864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38096383 - 38096208
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38096383 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 38096284  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | | ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38096283 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 38096208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 51655375 - 51655550
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  51655375 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 51655474  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51655475 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 51655550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7508597 - 7508422
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  7508597 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 7508498  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508497 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 7508422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 36245931 - 36246106
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36245931 tggacatcactcctttctatccataagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36246030  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36246031 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 36246106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 35400043 - 35400218
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35400043 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35400142  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400143 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 35400218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 35647568 - 35647743
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35647568 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35647667  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647668 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 35647743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 47617437 - 47617612
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47617437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 47617536  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47617537 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 47617612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5834524 - 5834349
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5834524 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5834425  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834424 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 5834349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3172920 - 3172745
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3172920 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 3172821  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172820 taaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 3172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12731807 - 12731632
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  12731807 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12731708  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12731707 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 12731632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12742400 - 12742225
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  12742400 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12742301  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742300 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 12742225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 153158 - 153330
Alignment:
Q  17 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  ||| |||| | |||| |||||    
T  153158 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaagaatgaacaacttcagaag 153257  T
Q  117 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  153258 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttt 153330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52689302 - 52689229
Alignment:
Q  231 ctgcttactacaattttcacacttagaaaactcacctactaactagcccttatactcgttccatttattccact 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52689302 ctgcttactacaattttcacacttagaaaactcacctactaactagcccttatactcgttccatttattccact 52689229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37867838 - 37867618
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37867838 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37867739  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttgcttgttttaatctt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37867738 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttattctttgcttgttttaatctt 37867639  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37867638 tgttctaagtactttagttgc 37867618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37876356 - 37876136
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37876356 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37876257  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttgcttgttttaatctt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37876256 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttattctttgcttgttttaatctt 37876157  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37876156 tgttctaagtactttagttgc 37876136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Original strand, 6219538 - 6219763
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6219538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6219637  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6219638 taagcagaaggatgaacaaattaagtatctcttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcaca-ccaattttttttgcttgctttaatcttt 6219736  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgctt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6219737 gttctaagtactttagttgcactgctt 6219763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19779773 - 19779548
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19779773 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcataagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19779674  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19779673 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc-tttttttttgcttgttttaatcttt 19779575  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgctt 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19779574 gttctaagtactttagttgcactgctt 19779548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 16390427 - 16390633
Alignment:
Q  12 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  16390427 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcagccagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 16390526  T
Q  112 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatctttgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||     
T  16390527 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccgacattctttgcttgttttaatttttgc 16390626  T
Q  212 tctaagt 218  Q
    |||||||    
T  16390627 tctaagt 16390633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 20682617 - 20682837
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20682617 tggacatcactcctttctatacagaagaagagtacatcacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 20682716  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||    
T  20682717 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacat----ttttttttgcttgttttaattttt 20682812  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  20682813 gttctaagtactttagttgcactgc 20682837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 9992794 - 9992986
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9992794 tggacatcactcctttctatcccgaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9992893  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgtttt 202  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  9992894 taagaagaaggatgatcatatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactcttagcttgtttt 9992986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 6499864 - 6500039
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6499864 tggacatcactcctttctatcaagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6499963  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499964 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatcttttggaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 6500039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13123059 - 13122839
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  13123059 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcattctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 13122960  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||    
T  13122959 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacat----ttttttttgcttgttttaattttt 13122864  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  13122863 gttctaagtactttagttgcactgc 13122839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14466985 - 14466766
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  14466985 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 14466886  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| |||    
T  14466885 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac-----attttttttgcttgttttaattttt 14466791  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14466790 gttctaactactttacttgcactgc 14466766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 13382153 - 13382328
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13382153 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13382252  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382253 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 13382328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 13392747 - 13392922
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13392747 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13392846  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392847 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 13392922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4745074 - 4744899
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4745074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 4744975  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4744974 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 4744899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5512030 - 5511855
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5512030 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5511931  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5511930 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 5511855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 5546505 - 5546680
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5546505 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5546604  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546605 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 5546680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24661251 - 24661076
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24661251 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24661152  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661151 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 24661076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 5626861 - 5627036
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5626861 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 5626960  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5626961 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 5627036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 5875146 - 5875321
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5875146 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacaaagaatgagggaaaaggatgagctact 5875245  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5875246 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 5875321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 12295704 - 12295879
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12295704 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 12295803  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12295804 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 12295879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16477615 - 16477440
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16477615 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 16477516  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16477515 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 16477440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 24392956 - 24393131
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24392956 tggacatcactcctttctattcagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24393055  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24393056 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 24393131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41685010 - 41684835
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41685010 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 41684911  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41684910 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 41684835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8776040 - 8775865
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8776040 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 8775941  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775940 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 8775865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18485373 - 18485198
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18485373 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 18485274  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485273 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 18485198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23758616 - 23758441
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  23758616 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 23758517  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23758516 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 23758441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38196107 - 38195932
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  38196107 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 38196008  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38196007 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 38195932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39373437 - 39373262
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39373437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 39373338  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373337 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 39373262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 28323701 - 28323876
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28323701 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatctcaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 28323800  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323801 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 28323876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 29470675 - 29470847
Alignment:
Q  17 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| |||||    
T  29470675 cactcctttctatccagaagatgaggacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 29470774  T
Q  117 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29470775 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttt 29470847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 12248329 - 12248504
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  12248329 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgctagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12248428  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12248429 tcagaagaaggatgatcagatcaagcatctcttagaacagttgtttaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 12248504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 104
Target Start/End: Original strand, 10635920 - 10636014
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  10635920 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaaatgagagaaaaggatgag 10636014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 10654248 - 10654333
Alignment:
Q  100 atgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10654248 atgagctacttcagaagaaagatgatcaaatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 10654333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 518 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 46223053 - 46223009
Alignment:
Q  518 aagttgtatgctttctagttcaagtagcaattcctgtctctgctt 562  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46223053 aagtagtatgttttctagttcaagtagcaattcatgtctctgctt 46223009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43084009 - 43083789
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43084009 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 43083910  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttgcttgttttaatctt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43083909 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttattctttgcttgttttaatctt 43083810  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43083809 tgttctaagtactttagttgc 43083789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 24337264 - 24337486
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24337264 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 24337363  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24337364 caagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcaca-ccaatttt-tttgcttgttttaatcttt 24337461  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  24337462 gttctaagtactttagttgcactgc 24337486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29245567 - 29245346
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29245567 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 29245468  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca--attttctttgcttgttttaatct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  29245467 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttttttctttgcttgttttaatct 29245368  T
Q  208 ttgttctaagtactttagttgc 229  Q
     ||||||||||| |||||||||    
T  29245367 ctgttctaagtattttagttgc 29245346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4211254 - 4211034
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4211254 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 4211155  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    |  |||| ||||||||||||||| |||    
T  4211154 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca----cttttttttttgcttgttttaattttt 4211059  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  4211058 gttctaagtactttagttgcactgc 4211034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40223651 - 40223476
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  40223651 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 40223552  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223551 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 40223476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 22959203 - 22959423
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  22959203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22959302  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaa-tctt 208  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| | ||    
T  22959303 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac-----attttttttgcttgttttaattttt 22959397  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959398 tgttctaagtactttagttgcactgc 22959423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 11404345 - 11404520
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11404345 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 11404444  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404445 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 11404520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43346717 - 43346542
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  43346717 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 43346618  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346617 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 43346542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10268300 - 10268125
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10268300 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10268201  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268200 tcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 10268125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10278877 - 10278702
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10278877 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10278778  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10278777 tcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 10278702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27222738 - 27222563
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27222738 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27222639  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222638 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27222563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35254351 - 35254176
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35254351 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35254252  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254251 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 35254176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35264960 - 35264785
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35264960 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35264861  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264860 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 35264785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 9907060 - 9907235
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  9907060 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9907159  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9907160 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagtaagcccaaccttagttgcacacccaa 9907235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 9772231 - 9772406
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  9772231 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9772330  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9772331 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9772406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 185
Target Start/End: Original strand, 34803301 - 34803446
Alignment:
Q  40 agtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatct 139  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  34803301 agtacatcacaagggttgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgaactacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatct 34803400  T
Q  140 cttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34803401 cttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 34803446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 44
Target Start/End: Original strand, 34799692 - 34799726
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtac 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34799692 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtac 34799726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 43
Target Start/End: Original strand, 35759242 - 35759275
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagta 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759242 tggacatcactcctttctatccagaagaagagta 35759275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26112642 - 26112419
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26112642 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 26112543  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26112542 taagcagaaggatgaacaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc-attttttttgcttgttttaatcttt 26112444  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  26112443 gttctaagtactttagttgcactgc 26112419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19130112 - 19129892
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19130112 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19130013  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca--attttctttgcttgttttaatct 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  19130012 taagaagaaggatcagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttttttctttgcttgttataatct 19129913  T
Q  208 ttgttctaagtactttagttg 228  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  19129912 ttgttctaagtattttagttg 19129892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6152462 - 6152242
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  6152462 tggacatcactcctttctatcgagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 6152363  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||    
T  6152362 caaaaagaagaatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacat----ttttttttgcttgttttaattttt 6152267  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  6152266 gttctaagtactttagttgcactgc 6152242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 15766081 - 15766256
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15766081 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaagaatgagctact 15766180  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15766181 ttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 15766256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 15790218 - 15790393
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15790218 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 15790317  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15790318 ttagaagaaggatgatcggatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 15790393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36294285 - 36294110
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36294285 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagagaaaaggatgagctact 36294186  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36294185 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 36294110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 209087 - 209262
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  209087 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 209186  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209187 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 209262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 243168 - 242993
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  243168 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 243069  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  243068 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 242993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 722710 - 722885
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  722710 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 722809  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  722810 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 722885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 796538 - 796363
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  796538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 796439  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  796438 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 796363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 3358139 - 3358314
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3358139 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 3358238  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358239 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 3358314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9342490 - 9342315
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9342490 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 9342391  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342390 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9342315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29078066 - 29077891
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  29078066 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 29077967  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29077966 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 29077891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 32087203 - 32087378
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32087203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 32087302  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32087303 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 32087378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 13687498 - 13687673
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13687498 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13687597  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687598 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 13687673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36079290 - 36079115
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36079290 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36079191  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079190 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 36079115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19226296 - 19226134
Alignment:
Q  19 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   || | || | |||| |||||||    
T  19226296 ctcctttctatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactgagagcacagaaagaacaacttcagaagaa 19226197  T
Q  119 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19226196 ggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 19226134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 44482503 - 44482387
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  44482503 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 44482404  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |||||||||||||||    
T  44482403 tcagaagaaggatgagc 44482387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Original strand, 30324171 - 30324333
Alignment:
Q  19 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   ||  ||| | |||| |||||||    
T  30324171 ctcctttttatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagagtgagagcacagactgaacaacttcagaagaa 30324270  T
Q  119 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30324271 ggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 30324333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44482398 - 44482307
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44482398 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagctgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 44482307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17919466 - 17919243
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17919466 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17919367  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  17919366 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagaaagcccaaccttagttgcaca-cctattttttttgcttgttttaatcttt 17919268  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  17919267 gttctaagtactttagttgcactgc 17919243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 19953843 - 19954068
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  19953843 tggacatcactcctttctacccagaagaatagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaataagggaaaaggatgagctact 19953942  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttgcttgttttaatctt 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19953943 caagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagtccaaccttagttgcacacccatttattctttgcttgttttaatctt 19954042  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19954043 tgttctaagtactttagttgcactgc 19954068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 24026926 - 24027147
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24026926 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 24027025  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt-ttctttgcttgttttaatctt 208  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||    
T  24027026 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacccatttattctttgcttgt----atctt 24027121  T
Q  209 tgttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24027122 tgttctaagtactttagttgcactgc 24027147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 40469482 - 40469694
Alignment:
Q  12 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 111  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  40469482 gacaacactcccttctatctagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 40469581  T
Q  112 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatctttgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  40469582 agaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccc-attttttttgcttg-tttaatttttgt 40469679  T
Q  212 tctaagtactttagt 226  Q
    ||||| || ||||||    
T  40469680 tctaaatattttagt 40469694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16257282 - 16257063
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  16257282 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 16257183  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatcttt 209  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| |||    
T  16257182 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac-----attttttttgcttgttttaattttt 16257088  T
Q  210 gttctaagtactttagttgctctgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  16257087 gttctaagtactttagttgcactgc 16257063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 55754716 - 55754891
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55754716 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 55754815  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55754816 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 55754891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 10750056 - 10750231
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10750056 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10750155  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750156 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 10750231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 10963825 - 10964000
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10963825 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10963924  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963925 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 10964000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 18761969 - 18762144
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18761969 tggacatcactcctttctatccagaagaggaatacatcacatgggctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 18762068  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18762069 taagaagaaagatgaacaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 18762144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24641667 - 24641492
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24641667 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 24641568  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641567 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 24641492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36019687 - 36019512
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36019687 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 36019588  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019587 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacaattgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 36019512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 451928 - 451753
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  451928 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 451829  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  451828 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 451753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27658000 - 27657825
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27658000 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27657901  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657900 taaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 27657825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 30935979 - 30936154
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  30935979 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 30936078  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30936079 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 30936154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21997768 - 21997593
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  21997768 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 21997669  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997668 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 21997593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 227
Alignment:
Q  12 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  439 gacaacactcctttctatccataagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 340  T
Q  112 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttctttgcttgttttaatctttgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  339 agaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccc-atcttctttgcttg-tttaatttttgt 242  T
Q  212 tctaagtactttagt 226  Q
    |||||||| ||||||    
T  241 tctaagtattttagt 227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32489 - 32314
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32489 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 32390  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    | | ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32389 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 32314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 46482 - 46657
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  46482 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 46581  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 46657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 52481 - 52651
Alignment:
Q  17 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| |||||    
T  52481 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 52580  T
Q  117 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52581 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagatgtataagcaagtcaaaccttagttgcacacccaatt 52651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3601
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||   | || || ||||||||||||||    
T  3424 tggatatcactcccttctacccagaggaagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagagaaaattaagggaaaaggatgagctact 3523  T
Q  110 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt 187  Q
    | ||||||||||||| || || |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tcagaagaaggatgatcagatcagatatctcttagagcagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaatt 3601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3629 - 3552
Alignment:
Q  12 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatg 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 2861 - 2987
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattttcttt 193  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    ||    
T  2861 agaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcagattaaatatctactggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacacccaatt---gtt 2957  T
Q  194 gcttgttttaatctttgttctaagtacttt 223  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  2958 gcttgtttagatttttgttctaagtacttt 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 3250 - 3416
Alignment:
Q  19 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||  ||||| || |||||| | ||||||||  | ||||   || |||| | |||| |||||||    
T  3250 ctcctttttatccagaagatgattacatttcaagagctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactaagagcacagaatgaacaacttcagaagaa 3349  T
Q  119 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3350 ggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaa 3416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 11593 - 11671
Alignment:
Q  107 acttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11593 acttcagaagaaggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaa 11671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2642 - 2526
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  2642 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 2543  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |||||||||||||||    
T  2542 tcagaagaaggatgagc 2526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2537 - 2446
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2537 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 2446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23825 - 23758
Alignment:
Q  114 aagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 181  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23825 aagaaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 23758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23894 - 23802
Alignment:
Q  94 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaat 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   ||||||| || ||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23894 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacatctcttagagcagttaaagaaacaagcccaaccttagttgcacacccaat 23802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23999 - 23883
Alignment:
Q  10 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||| ||||| |  ||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  23999 tggatatcactcctttctatccagaggcagattacatcacaagatctgctagaattcgagctgggcataataggaagctaagagagaaggaagaactact 23900  T
Q  110 taagaagaaggatgagc 126  Q
    | |  ||||||||||||    
T  23899 tcatcagaaggatgagc 23883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University