View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9448_low_1 (Length: 612)

Name: NF9448_low_1
Description: NF9448
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9448_low_1
NF9448_low_1
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (12-289)||(15775710-15775987)
chr8 (448-612)||(15775294-15775458)
chr8 (494-612)||(33265560-33265678)
chr8 (501-612)||(28355223-28355334)
chr8 (501-612)||(31483142-31483253)
chr8 (499-612)||(9361443-9361556)
chr8 (499-612)||(12085997-12086110)
chr8 (499-612)||(18716296-18716409)
chr8 (499-612)||(29836163-29836276)
chr8 (499-612)||(31361369-31361482)
chr8 (501-612)||(19201654-19201765)
chr8 (499-612)||(44567821-44567934)
chr8 (499-612)||(19681296-19681409)
chr8 (448-612)||(22074146-22074310)
chr8 (448-612)||(21341404-21341568)
chr8 (499-612)||(18797523-18797637)
chr8 (135-284)||(15775884-15776032)
chr8 (499-612)||(15774388-15774502)
chr8 (448-612)||(14569969-14570133)
chr8 (448-542)||(19695001-19695094)
chr8 (499-612)||(22139728-22139842)
chr8 (499-612)||(33249177-33249291)
chr8 (499-612)||(2130552-2130666)
chr8 (499-612)||(16260752-16260866)
chr8 (499-612)||(19654610-19654724)
chr8 (448-542)||(27602147-27602240)
chr8 (499-542)||(19910451-19910494)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (12-289)||(24813123-24813400)
chr4 (448-612)||(24813652-24813816)
chr4 (499-612)||(18793949-18794062)
chr4 (499-612)||(40098939-40099052)
chr4 (501-612)||(20331743-20331854)
chr4 (499-612)||(6576683-6576796)
chr4 (499-612)||(24119488-24119601)
chr4 (448-612)||(31119766-31119929)
chr4 (448-612)||(54840237-54840400)
chr4 (499-612)||(5701375-5701488)
chr4 (499-612)||(14105390-14105503)
chr4 (499-612)||(24814607-24814720)
chr4 (499-612)||(27156632-27156745)
chr4 (499-612)||(39857461-39857574)
chr4 (448-612)||(21976550-21976713)
chr4 (499-612)||(14752822-14752935)
chr4 (499-612)||(34182263-34182376)
chr4 (499-612)||(36323643-36323756)
chr4 (499-612)||(36337852-36337965)
chr4 (499-612)||(30760610-30760723)
chr4 (499-612)||(33667107-33667220)
chr4 (499-612)||(5012727-5012841)
chr4 (448-612)||(15379493-15379657)
chr4 (500-612)||(1907114-1907227)
chr4 (448-612)||(15275881-15276045)
chr4 (499-612)||(24585676-24585790)
chr4 (135-284)||(24813078-24813226)
chr4 (448-612)||(15234665-15234829)
chr4 (499-542)||(17019946-17019989)
chr4 (499-539)||(14671910-14671950)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (12-289)||(13178078-13178355)
chr5 (448-612)||(13178654-13178818)
chr5 (499-612)||(2517887-2518000)
chr5 (499-612)||(9543934-9544047)
chr5 (499-612)||(15651967-15652080)
chr5 (448-612)||(15752014-15752177)
chr5 (448-612)||(33881948-33882111)
chr5 (501-612)||(40466757-40466868)
chr5 (499-612)||(5644642-5644755)
chr5 (499-612)||(6881135-6881248)
chr5 (499-612)||(18368736-18368849)
chr5 (499-612)||(28656087-28656200)
chr5 (499-612)||(28953001-28953114)
chr5 (499-612)||(37664710-37664823)
chr5 (499-612)||(43085089-43085202)
chr5 (448-612)||(30158862-30159025)
chr5 (448-612)||(33523226-33523389)
chr5 (501-612)||(11330476-11330587)
chr5 (497-612)||(12139004-12139119)
chr5 (499-612)||(3796375-3796488)
chr5 (499-612)||(9324306-9324419)
chr5 (499-612)||(13435875-13435988)
chr5 (499-612)||(18493974-18494087)
chr5 (499-612)||(26487216-26487329)
chr5 (499-612)||(30036268-30036381)
chr5 (499-612)||(31438279-31438392)
chr5 (499-612)||(32589481-32589594)
chr5 (499-612)||(34623341-34623454)
chr5 (499-612)||(37351870-37351983)
chr5 (499-612)||(37745555-37745668)
chr5 (499-610)||(24730793-24730904)
chr5 (499-612)||(18121639-18121753)
chr5 (499-612)||(8658699-8658812)
chr5 (499-612)||(13318032-13318145)
chr5 (499-612)||(31819627-31819740)
chr5 (506-612)||(30175310-30175416)
chr5 (499-612)||(37761816-37761929)
chr5 (448-612)||(25207131-25207295)
chr5 (448-612)||(25271287-25271451)
chr5 (499-612)||(41681529-41681638)
chr5 (448-612)||(11556176-11556340)
chr5 (448-612)||(22895249-22895413)
chr5 (499-612)||(33299358-33299472)
chr5 (499-612)||(33784304-33784418)
chr5 (448-612)||(23727059-23727223)
chr5 (135-284)||(13178033-13178181)
chr5 (448-612)||(13179972-13180136)
chr5 (499-612)||(22992346-22992460)
chr5 (499-563)||(23632842-23632906)
chr5 (499-542)||(24976737-24976780)
chr5 (499-542)||(30941523-30941566)
chr5 (499-539)||(24609141-24609181)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (12-289)||(3790872-3791149)
chr2 (448-612)||(3790479-3790643)
chr2 (448-612)||(37679142-37679305)
chr2 (448-612)||(37694407-37694570)
chr2 (499-612)||(34161676-34161789)
chr2 (448-612)||(19409728-19409891)
chr2 (501-612)||(253948-254059)
chr2 (501-612)||(27783058-27783169)
chr2 (501-612)||(39045178-39045289)
chr2 (499-612)||(12593649-12593762)
chr2 (499-612)||(13929905-13930018)
chr2 (503-612)||(34297984-34298093)
chr2 (499-612)||(37384490-37384603)
chr2 (448-612)||(16822582-16822745)
chr2 (448-612)||(16898735-16898898)
chr2 (448-612)||(22921388-22921551)
chr2 (448-612)||(32056587-32056750)
chr2 (501-608)||(9343283-9343390)
chr2 (501-612)||(16168313-16168424)
chr2 (501-612)||(21670469-21670580)
chr2 (499-612)||(3789278-3789391)
chr2 (499-612)||(27123335-27123448)
chr2 (499-612)||(31883106-31883219)
chr2 (499-612)||(40240358-40240471)
chr2 (499-610)||(12709918-12710029)
chr2 (501-612)||(27810538-27810649)
chr2 (501-612)||(37945161-37945272)
chr2 (499-612)||(34868469-34868582)
chr2 (499-612)||(37932212-37932325)
chr2 (499-612)||(11628479-11628592)
chr2 (448-612)||(27397170-27397334)
chr2 (499-612)||(39896904-39897017)
chr2 (448-612)||(21696432-21696596)
chr2 (499-612)||(34268216-34268330)
chr2 (499-612)||(31868102-31868216)
chr2 (448-612)||(19449655-19449819)
chr2 (135-199)||(3791130-3791194)
chr2 (499-612)||(23117609-23117723)
chr2 (494-612)||(27427761-27427880)
chr2 (499-542)||(12662375-12662418)
chr2 (448-542)||(28889138-28889231)
chr2 (499-539)||(20844802-20844842)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (448-612)||(27622929-27623093)
chr6 (499-612)||(29556369-29556482)
chr6 (499-612)||(33369703-33369816)
chr6 (448-612)||(13517417-13517580)
chr6 (499-610)||(29579849-29579960)
chr6 (499-612)||(8898950-8899063)
chr6 (499-612)||(16937279-16937392)
chr6 (499-612)||(26665910-26666023)
chr6 (499-612)||(26771881-26771994)
chr6 (499-612)||(26792629-26792742)
chr6 (499-612)||(4532107-4532220)
chr6 (499-612)||(4539032-4539145)
chr6 (499-612)||(27014537-27014650)
chr6 (499-612)||(27201010-27201123)
chr6 (499-612)||(27248110-27248223)
chr6 (499-612)||(27355356-27355469)
chr6 (499-612)||(28167307-28167420)
chr6 (499-612)||(28214281-28214394)
chr6 (448-612)||(30551203-30551366)
chr6 (501-612)||(34457761-34457872)
chr6 (499-612)||(16680972-16681085)
chr6 (499-612)||(26109674-26109787)
chr6 (499-612)||(27491952-27492065)
chr6 (514-612)||(27064314-27064412)
chr6 (499-612)||(4779724-4779837)
chr6 (499-612)||(29508234-29508347)
chr6 (514-612)||(4764575-4764673)
chr6 (514-612)||(14138689-14138787)
chr6 (499-612)||(16756634-16756748)
chr6 (499-612)||(26927565-26927679)
chr6 (448-612)||(27209712-27209876)
chr6 (448-612)||(27239352-27239516)
chr6 (448-612)||(27283584-27283748)
chr6 (448-612)||(13292167-13292331)
chr6 (499-612)||(15405803-15405917)
chr6 (499-612)||(15417590-15417704)
chr6 (448-612)||(27025955-27026119)
chr6 (448-548)||(20131391-20131490)
chr6 (448-548)||(22201380-22201479)
chr6 (448-542)||(27031905-27031998)
chr6 (499-542)||(24299033-24299076)
chr6 (499-542)||(24870592-24870635)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (448-612)||(26268224-26268388)
chr7 (448-612)||(3452064-3452228)
chr7 (135-289)||(3452501-3452655)
chr7 (138-289)||(26267899-26268050)
chr7 (499-612)||(5140526-5140639)
chr7 (448-612)||(26678243-26678406)
chr7 (501-612)||(4138436-4138547)
chr7 (501-612)||(16744711-16744822)
chr7 (499-612)||(2780057-2780170)
chr7 (499-612)||(22148701-22148814)
chr7 (499-612)||(26442078-26442191)
chr7 (499-612)||(26596490-26596603)
chr7 (499-612)||(31083812-31083925)
chr7 (499-612)||(31130730-31130843)
chr7 (448-612)||(26663051-26663214)
chr7 (499-612)||(39206353-39206466)
chr7 (499-612)||(45738114-45738227)
chr7 (499-612)||(4206209-4206322)
chr7 (499-612)||(11447722-11447835)
chr7 (499-612)||(26313052-26313165)
chr7 (499-612)||(45394053-45394166)
chr7 (499-612)||(26519641-26519754)
chr7 (499-612)||(31557593-31557706)
chr7 (501-612)||(24585726-24585838)
chr7 (448-612)||(11417941-11418105)
chr7 (551-612)||(22152928-22152989)
chr7 (551-612)||(22208843-22208904)
chr7 (448-612)||(10848418-10848582)
chr7 (449-612)||(26508848-26509011)
chr7 (499-612)||(5154896-5155010)
chr7 (499-612)||(5165197-5165311)
chr7 (448-612)||(16048146-16048310)
chr7 (448-612)||(16443143-16443307)
chr7 (499-612)||(2161384-2161498)
chr7 (499-542)||(16511637-16511680)
chr7 (499-539)||(10910138-10910178)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (448-612)||(18249517-18249680)
chr3 (499-612)||(10402951-10403064)
chr3 (499-612)||(21681519-21681632)
chr3 (448-612)||(24334975-24335138)
chr3 (448-612)||(28345970-28346133)
chr3 (499-612)||(20570203-20570316)
chr3 (448-612)||(10649869-10650032)
chr3 (448-612)||(31957753-31957916)
chr3 (501-608)||(5589705-5589812)
chr3 (501-612)||(29658316-29658427)
chr3 (499-612)||(4630558-4630671)
chr3 (499-612)||(5020510-5020623)
chr3 (499-612)||(5602660-5602773)
chr3 (499-612)||(11103731-11103844)
chr3 (499-612)||(16404139-16404252)
chr3 (499-612)||(16599412-16599525)
chr3 (448-612)||(16617786-16617950)
chr3 (499-612)||(17970227-17970340)
chr3 (448-612)||(22041207-22041371)
chr3 (499-612)||(32297430-32297543)
chr3 (499-612)||(32445929-32446042)
chr3 (499-612)||(48472709-48472822)
chr3 (500-612)||(4340047-4340159)
chr3 (501-612)||(5717854-5717965)
chr3 (501-612)||(5728764-5728875)
chr3 (501-612)||(5763493-5763604)
chr3 (499-612)||(4423695-4423808)
chr3 (499-612)||(6536090-6536203)
chr3 (499-612)||(7080028-7080141)
chr3 (499-612)||(17978298-17978411)
chr3 (499-612)||(18231991-18232104)
chr3 (499-612)||(20072812-20072925)
chr3 (499-612)||(28028070-28028183)
chr3 (499-612)||(31029613-31029726)
chr3 (501-612)||(47030255-47030366)
chr3 (499-612)||(8218424-8218537)
chr3 (499-612)||(18285726-18285839)
chr3 (499-612)||(18301027-18301140)
chr3 (499-612)||(22864211-22864324)
chr3 (499-612)||(22879270-22879383)
chr3 (499-612)||(28109310-28109423)
chr3 (514-612)||(5473766-5473864)
chr3 (499-612)||(51788821-51788934)
chr3 (448-612)||(15368043-15368207)
chr3 (448-612)||(35887537-35887701)
chr3 (499-612)||(29142123-29142237)
chr3 (499-612)||(4790000-4790114)
chr3 (448-612)||(18058045-18058209)
chr3 (448-612)||(19701194-19701358)
chr3 (499-612)||(5658911-5659025)
chr3 (448-612)||(4728403-4728567)
chr3 (448-612)||(6208672-6208836)
chr3 (499-563)||(8282829-8282893)
chr3 (448-612)||(15734435-15734599)
chr3 (499-563)||(16423034-16423098)
chr3 (499-542)||(4690523-4690566)
chr3 (499-542)||(15886086-15886129)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (499-612)||(12853-12966)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (499-612)||(3647986-3648099)
chr1 (448-612)||(51645061-51645224)
chr1 (499-612)||(10951931-10952044)
chr1 (499-612)||(28591920-28592033)
chr1 (501-608)||(10969486-10969593)
chr1 (499-612)||(28156544-28156657)
chr1 (499-612)||(41786640-41786753)
chr1 (448-612)||(16201286-16201450)
chr1 (448-612)||(20333672-20333836)
chr1 (534-607)||(13769558-13769631)
chr1 (499-612)||(14692222-14692336)
chr1 (499-612)||(14694904-14695018)
chr1 (499-612)||(14697588-14697702)
chr1 (499-612)||(14700269-14700383)
chr1 (448-612)||(20467623-20467787)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (499-612)||(2494-2607)
scaffold0322 (448-612)||(12888-13052)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (499-612)||(8247-8360)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (499-612)||(2483-2596)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (499-612)||(14779-14892)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (499-612)||(10756-10869)
scaffold0143 (499-542)||(34180-34223)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (499-612)||(16413-16526)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (448-612)||(28129-28293)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (499-612)||(8966-9080)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (448-608)||(613-773)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (499-612)||(3921-4035)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (448-612)||(25825-25989)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (499-542)||(1369-1412)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (499-542)||(13281-13324)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (496-539)||(24276-24319)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (499-542)||(39922-39965)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15775987 - 15775710
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775987 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 15775888  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775887 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 15775788  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775787 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 15775710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 15775458 - 15775294
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15775458 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatgatggtt 15775359  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15775358 gacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 15775294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 494 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 33265678 - 33265560
Alignment:
Q  494 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagt 593  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265678 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagt 33265579  T
Q  594 attgggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33265578 attgggcacgtagtggctc 33265560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 28355223 - 28355334
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355223 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 28355322  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  28355323 acgtagtggctc 28355334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 31483142 - 31483253
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483142 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 31483241  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  31483242 acgtagtggctc 31483253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 9361556 - 9361443
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9361556 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 9361457  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  9361456 gcacgtagtggctc 9361443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 12085997 - 12086110
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12085997 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 12086096  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  12086097 gcacgtagtggctc 12086110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18716409 - 18716296
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18716409 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 18716310  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  18716309 gcacgtagtggctc 18716296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 29836276 - 29836163
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29836276 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 29836177  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  29836176 gcacgtagtggctc 29836163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 31361482 - 31361369
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31361482 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgg 31361383  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  31361382 gcacgtagtggctc 31361369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 19201654 - 19201765
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201654 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 19201753  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  19201754 acgtagtggctc 19201765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 44567934 - 44567821
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44567934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 44567835  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||| |||||    
T  44567834 gcacgtagcggctc 44567821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 19681409 - 19681296
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  19681409 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 19681310  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  19681309 gcacgtagtggctc 19681296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 22074146 - 22074310
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  22074146 aaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 22074244  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22074245 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctc 22074310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 21341404 - 21341568
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  21341404 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 21341502  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21341503 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 21341568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18797637 - 18797523
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  18797637 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 18797538  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  18797537 ggcacgtagtggctc 18797523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15776032 - 15775884
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 233  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  15776032 gggacaaactgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 15775935  T
Q  234 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 284  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15775934 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 15775884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 15774502 - 15774388
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15774502 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15774403  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  15774402 ggcacgtagtggctc 15774388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 14570133 - 14569969
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  14570133 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgtt 14570035  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  14570034 ggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctc 14569969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19695094 - 19695001
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19695094 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 19695001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22139842 - 22139728
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  22139842 gtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 22139743  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  22139742 ggcacgtagtggctc 22139728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 33249291 - 33249177
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || | |||||||||| ||||||||    
T  33249291 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattg 33249192  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  33249191 ggcacgtagtggctc 33249177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 2130552 - 2130666
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  2130552 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattg 2130651  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  2130652 ggcacgtagtggctc 2130666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16260866 - 16260752
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  16260866 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 16260767  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||| ||||||    
T  16260766 ggcacgtaatggctc 16260752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 19654610 - 19654724
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||| |||| ||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  19654610 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 19654709  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||| ||||||    
T  19654710 ggcacgtaatggctc 19654724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 542
Target Start/End: Original strand, 27602147 - 27602240
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27602147 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 27602240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Original strand, 19910451 - 19910494
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19910451 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 19910494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 24813123 - 24813400
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813123 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 24813222  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813223 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 24813322  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813323 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaagtggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 24813400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 24813652 - 24813816
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24813652 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatgatggtt 24813751  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24813752 gacagtttgtagacacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 24813816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 18793949 - 18794062
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793949 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18794048  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  18794049 gcacgtagtggctc 18794062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 40098939 - 40099052
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40098939 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 40099038  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  40099039 gcacgtagtggctc 40099052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 20331743 - 20331854
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331743 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 20331842  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  20331843 acgtagtggctc 20331854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 6576796 - 6576683
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6576796 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgg 6576697  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  6576696 gcacgtagtggctc 6576683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 24119601 - 24119488
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24119601 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 24119502  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  24119501 gcacgtagtggctc 24119488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 31119766 - 31119929
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  31119766 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 31119864  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31119865 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31119929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 54840400 - 54840237
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  54840400 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 54840302  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  54840301 ggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggattattgggcacgtagtggctc 54840237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5701488 - 5701375
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5701488 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 5701389  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  5701388 gcacgtagtggctc 5701375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 14105503 - 14105390
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105503 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 14105404  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  14105403 gcacgtagtggctc 14105390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 24814607 - 24814720
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814607 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgg 24814706  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  24814707 gcacgtagtggctc 24814720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 27156632 - 27156745
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27156632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgg 27156731  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  27156732 gcacgtagtggctc 27156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 39857574 - 39857461
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857574 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 39857475  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  39857474 gcacgtagtggctc 39857461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 21976713 - 21976550
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  21976713 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 21976615  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21976614 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctc 21976550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 14752822 - 14752935
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14752822 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgg 14752921  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  14752922 gcacgtagtggctc 14752935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 34182263 - 34182376
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182263 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34182362  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    |||| |||||||||    
T  34182363 gcacatagtggctc 34182376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 36323643 - 36323756
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36323643 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36323742  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  36323743 gcacgtagtggctc 36323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 36337852 - 36337965
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36337852 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36337951  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  36337952 gcacgtagtggctc 36337965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 30760723 - 30760610
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  30760723 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 30760624  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  30760623 gcacgtagtggctc 30760610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 33667107 - 33667220
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  33667107 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 33667206  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  33667207 gcacgtagtggctc 33667220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5012841 - 5012727
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt-g 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5012841 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 5012742  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  5012741 ggcacgtagtggctc 5012727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 15379493 - 15379657
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||  |||    
T  15379493 aaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgtt 15379591  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15379592 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctc 15379657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 500 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 1907227 - 1907114
Alignment:
Q  500 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgg 598  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||    
T  1907227 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgg 1907128  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  1907127 gcacgtagtggctc 1907114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 15275881 - 15276045
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| | |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  15275881 aaatgcaacatgtataggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 15275979  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15275980 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15276045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 24585676 - 24585790
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  24585676 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 24585775  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  24585776 ggcacgtagtggctc 24585790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 24813078 - 24813226
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  24813078 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 24813175  T
Q  234 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 284  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  24813176 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 24813226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 15234829 - 15234665
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  15234829 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgtg 15234731  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15234730 ggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15234665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17019989 - 17019946
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17019989 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 17019946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 14671950 - 14671910
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 539  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14671950 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 14671910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 13178078 - 13178355
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178078 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 13178177  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178178 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttgaactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 13178277  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178278 tgaaactgacttgacatcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 13178355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 13178654 - 13178818
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13178654 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatgatggtt 13178753  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13178754 gacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 13178818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 2518000 - 2517887
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2518000 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 2517901  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  2517900 gcacgtagtggctc 2517887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 9543934 - 9544047
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9544033  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  9544034 gcacgtagtggctc 9544047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 15651967 - 15652080
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651967 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 15652066  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  15652067 gcacgtagtggctc 15652080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 15752014 - 15752177
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  15752014 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgtt 15752112  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752113 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 15752177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 33882111 - 33881948
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  33882111 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 33882013  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33882012 ggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctc 33881948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 40466757 - 40466868
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466757 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 40466856  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  40466857 acgtagtggctc 40466868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5644755 - 5644642
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644755 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5644656  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  5644655 gcacgtagtggctc 5644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 6881248 - 6881135
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6881248 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 6881149  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  6881148 gcacgtagtggctc 6881135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 18368736 - 18368849
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368736 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18368835  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  18368836 gcacgtagtggctc 18368849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28656200 - 28656087
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28656200 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 28656101  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  28656100 gcacgtagtggctc 28656087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 28953001 - 28953114
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28953001 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 28953100  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  28953101 gcacgtagtggctc 28953114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 37664710 - 37664823
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37664710 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 37664809  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  37664810 gcacgtagtggctc 37664823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 43085202 - 43085089
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43085202 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 43085103  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||| ||||||    
T  43085102 gcacgtaatggctc 43085089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 30159025 - 30158862
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  30159025 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 30158927  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158926 ggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 30158862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 33523389 - 33523226
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  33523389 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 33523291  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33523290 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 33523226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 11330587 - 11330476
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330587 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 11330488  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    |||||| |||||    
T  11330487 acgtagcggctc 11330476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 497 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 12139119 - 12139004
Alignment:
Q  497 atgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 596  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12139119 atgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 12139020  T
Q  597 gggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||||    
T  12139019 gggcacgtagtggctc 12139004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 3796488 - 3796375
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3796488 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 3796389  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  3796388 gcacgtagtggctc 3796375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 9324419 - 9324306
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324419 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9324320  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  9324319 gcacgtagtggctc 9324306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 13435875 - 13435988
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13435875 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 13435974  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  13435975 gcacgtagtggctc 13435988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 18493974 - 18494087
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18493974 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 18494073  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    |||| |||||||||    
T  18494074 gcacatagtggctc 18494087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 26487329 - 26487216
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487329 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26487230  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26487229 gcacgtagtggctc 26487216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 30036381 - 30036268
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30036381 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 30036282  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  30036281 gcacgtagtggctc 30036268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 31438392 - 31438279
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31438392 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31438293  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  31438292 gcacgtagtggctc 31438279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 32589481 - 32589594
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32589481 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgcgggaaagacaagacattggagtattgg 32589580  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  32589581 gcacgtagtggctc 32589594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 34623454 - 34623341
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34623454 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 34623355  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  34623354 gcacgtagtggctc 34623341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 37351870 - 37351983
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351870 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatttggtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 37351969  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  37351970 gcacgtagtggctc 37351983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 37745555 - 37745668
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37745555 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgg 37745654  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  37745655 gcacgtagtggctc 37745668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 499 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 24730904 - 24730793
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24730904 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 24730805  T
Q  599 gcacgtagtggc 610  Q
    ||||||||||||    
T  24730804 gcacgtagtggc 24730793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 18121639 - 18121753
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18121639 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacatttagagtattg 18121738  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  18121739 ggcacgtagtggctc 18121753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 8658699 - 8658812
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8658699 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtgttgg 8658798  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  8658799 gcacgtagtggctc 8658812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 13318032 - 13318145
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13318032 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 13318131  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  13318132 gcacgtagtggctc 13318145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 31819627 - 31819740
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31819627 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31819726  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    |||| |||||||||    
T  31819727 gcacatagtggctc 31819740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 506 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 30175416 - 30175310
Alignment:
Q  506 gcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgta 605  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30175416 gcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgggcacgta 30175317  T
Q  606 gtggctc 612  Q
    |||||||    
T  30175316 gtggctc 30175310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 37761929 - 37761816
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37761929 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagaatattgg 37761830  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  37761829 gcacgtagtggctc 37761816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 25207295 - 25207131
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  25207295 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 25207197  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25207196 ggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 25207131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 25271451 - 25271287
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  25271451 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 25271353  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25271352 ggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 25271287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 41681638 - 41681529
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||     || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41681638 gtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagtcattagagtattgg 41681543  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  41681542 gcacgtagtggctc 41681529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 11556340 - 11556176
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  11556340 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 11556242  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11556241 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 11556176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22895413 - 22895249
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  22895413 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgtt 22895315  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22895314 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctc 22895249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 33299472 - 33299358
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  33299472 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 33299373  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  33299372 ggcacgtagtggctc 33299358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 33784418 - 33784304
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  33784418 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 33784319  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  33784318 ggcacgtagtggctc 33784304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 23727223 - 23727059
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||     
T  23727223 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtc 23727125  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23727124 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 23727059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 13178033 - 13178181
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  13178033 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 13178130  T
Q  234 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 284  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13178131 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 13178181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 13179972 - 13180136
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  13179972 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 13180070  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13180071 ggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctc 13180136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 22992346 - 22992460
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  22992346 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 22992445  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  22992446 ggcacgtagtggctc 22992460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 23632906 - 23632842
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacac 563  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  23632906 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 23632842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24976780 - 24976737
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24976780 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 24976737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 30941566 - 30941523
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30941566 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 30941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24609181 - 24609141
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 539  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24609181 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 24609141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3791149 - 3790872
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3791149 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcataggata 3791050  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791049 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 3790950  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790949 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaacctggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 3790872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 3790643 - 3790479
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3790643 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatgatggtt 3790544  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3790543 gacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctc 3790479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 37679142 - 37679305
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  37679142 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 37679240  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679241 ggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 37679305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 37694407 - 37694570
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  37694407 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 37694505  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37694506 ggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 37694570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 34161789 - 34161676
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161789 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34161690  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  34161689 gcacgtagtggctc 34161676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 19409728 - 19409891
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  19409728 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgtt 19409826  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19409827 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 19409891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 253948 - 254059
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253948 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 254047  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  254048 acgtagtggctc 254059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27783169 - 27783058
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783169 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27783070  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  27783069 acgtagtggctc 27783058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 39045178 - 39045289
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045178 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 39045277  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  39045278 acgtagtggctc 39045289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 12593762 - 12593649
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593762 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 12593663  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  12593662 gcacgtagtggctc 12593649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 13929905 - 13930018
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13929905 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 13930004  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  13930005 gcacgtagtggctc 13930018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 503 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 34298093 - 34297984
Alignment:
Q  503 tatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 602  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298093 tatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 34297994  T
Q  603 gtagtggctc 612  Q
    ||||||||||    
T  34297993 gtagtggctc 34297984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 37384603 - 37384490
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37384603 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 37384504  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  37384503 gcacgtagtggctc 37384490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 16822582 - 16822745
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  16822582 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 16822680  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16822681 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 16822745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16898898 - 16898735
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  16898898 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 16898800  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16898799 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 16898735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 22921388 - 22921551
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  22921388 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 22921486  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921487 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 22921551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 32056750 - 32056587
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  32056750 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 32056652  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32056651 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 32056587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 608
Target Start/End: Original strand, 9343283 - 9343390
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343283 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 9343382  T
Q  601 acgtagtg 608  Q
    ||||||||    
T  9343383 acgtagtg 9343390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16168424 - 16168313
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168424 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16168325  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  16168324 acgtagtggctc 16168313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 21670469 - 21670580
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21670469 aatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 21670568  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  21670569 acgtagtggctc 21670580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 3789391 - 3789278
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3789391 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 3789292  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  3789291 gcacgtagtggctc 3789278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27123448 - 27123335
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27123448 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27123349  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  27123348 gcacgtagtggctc 27123335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 31883219 - 31883106
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31883219 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31883120  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  31883119 gcacgtagtggctc 31883106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 40240471 - 40240358
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40240471 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 40240372  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  40240371 gcacgtagtggctc 40240358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 499 - 610
Target Start/End: Original strand, 12709918 - 12710029
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12709918 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 12710017  T
Q  599 gcacgtagtggc 610  Q
    ||||||||||||    
T  12710018 gcacgtagtggc 12710029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27810649 - 27810538
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810649 aataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27810550  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  27810549 acgtagtggctc 27810538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 37945161 - 37945272
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945161 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 37945260  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  37945261 acgtagtggctc 37945272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 34868582 - 34868469
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  34868582 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 34868483  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  34868482 gcacgtagtggctc 34868469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 37932325 - 37932212
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37932325 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagcattgg 37932226  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  37932225 gcacgtagtggctc 37932212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 11628479 - 11628592
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11628479 gtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 11628578  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  11628579 gcacgtagtggctc 11628592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27397334 - 27397170
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  27397334 aaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 27397236  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   |||   | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27397235 ggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27397170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 39897017 - 39896904
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||  ||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39897017 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 39896918  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  39896917 gcacgtagtggctc 39896904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 21696432 - 21696596
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  21696432 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 21696530  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21696531 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 21696596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 34268216 - 34268330
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  34268216 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 34268315  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  34268316 ggcacgtagtggctc 34268330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 31868102 - 31868216
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  31868102 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 31868201  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  31868202 ggcacgtagtggctc 31868216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 19449655 - 19449819
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||    
T  19449655 aaatgcaatatacatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgtt 19449753  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19449754 ggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 19449819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3791194 - 3791130
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  3791194 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatt 3791130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 23117723 - 23117609
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga-tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtatt 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||    
T  23117723 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcga-tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 23117625  T
Q  597 gggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||||    
T  23117624 gggcacgtagtggctc 23117609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 612
Target Start/End: Original strand, 27427761 - 27427880
Alignment:
Q  494 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagag 592  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||    
T  27427761 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggag 27427860  T
Q  593 tattgggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  27427861 tattgggcacgtaatggctc 27427880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12662418 - 12662375
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12662418 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 12662375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 28889231 - 28889138
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28889231 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatga 28889138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 20844842 - 20844802
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 539  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20844842 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20844802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 27622929 - 27623093
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622929 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 27623028  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623029 gacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 27623093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 29556482 - 29556369
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29556482 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29556383  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  29556382 gcacgtagtggctc 29556369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 33369703 - 33369816
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369703 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 33369802  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  33369803 gcacgtagtggctc 33369816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 13517417 - 13517580
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  13517417 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 13517515  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13517516 ggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctc 13517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 499 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 29579960 - 29579849
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579960 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29579861  T
Q  599 gcacgtagtggc 610  Q
    ||||||||||||    
T  29579860 gcacgtagtggc 29579849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 8898950 - 8899063
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898950 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 8899049  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  8899050 gcacgtagtggctc 8899063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 16937279 - 16937392
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937279 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16937378  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  16937379 gcacgtagtggctc 16937392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 26665910 - 26666023
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665910 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26666009  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26666010 gcacgtagtggctc 26666023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 26771881 - 26771994
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26771881 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26771980  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26771981 gcacgtagtggctc 26771994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 26792742 - 26792629
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26792742 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 26792643  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26792642 gcacgtagtggctc 26792629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4532220 - 4532107
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4532220 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4532121  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  4532120 gcacgtagtggctc 4532107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 4539032 - 4539145
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4539032 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4539131  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  4539132 gcacgtagtggctc 4539145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27014650 - 27014537
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27014650 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27014551  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  27014550 gcacgtagtggctc 27014537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27201123 - 27201010
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27201123 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27201024  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  27201023 gcacgtagtggctc 27201010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 27248110 - 27248223
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27248110 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27248209  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  27248210 gcacgtagtggctc 27248223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 27355356 - 27355469
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27355356 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27355455  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  27355456 gcacgtagtggctc 27355469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28167420 - 28167307
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28167420 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28167321  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  28167320 gcacgtagtggctc 28167307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28214394 - 28214281
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28214394 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28214295  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  28214294 gcacgtagtggctc 28214281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 30551203 - 30551366
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  30551203 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 30551301  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30551302 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctc 30551366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 34457761 - 34457872
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457761 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 34457860  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    || |||||||||    
T  34457861 acatagtggctc 34457872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16681085 - 16680972
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16681085 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16680986  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    |||| |||||||||    
T  16680985 gcacatagtggctc 16680972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 26109674 - 26109787
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26109674 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgg 26109773  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26109774 gcacgtagtggctc 26109787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27492065 - 27491952
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27492065 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27491966  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||| ||||    
T  27491965 gcacgtagtagctc 27491952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 514 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27064412 - 27064314
Alignment:
Q  514 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064412 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 27064314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4779837 - 4779724
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4779837 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaattttgg 4779738  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  4779737 gcacgtagtggctc 4779724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 29508347 - 29508234
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29508347 gtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacatcagagtattgg 29508248  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  29508247 gcacgtagtggctc 29508234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 514 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4764673 - 4764575
Alignment:
Q  514 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4764673 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 4764575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 514 - 612
Target Start/End: Original strand, 14138689 - 14138787
Alignment:
Q  514 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14138689 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 14138787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16756748 - 16756634
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  16756748 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 16756649  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  16756648 ggcacgtagtggctc 16756634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 26927679 - 26927565
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  26927679 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 26927580  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  26927579 ggcacgtagtggctc 26927565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27209876 - 27209712
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  27209876 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 27209778  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27209777 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27209712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 27239352 - 27239516
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  27239352 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 27239450  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27239451 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27239516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 27283584 - 27283748
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  27283584 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 27283682  T
Q  548 gatagtttgtagacac-gacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||||||| |  || | | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27283683 ggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 13292167 - 13292331
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  13292167 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 13292265  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |    ||||||||||| | ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13292266 ggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 13292331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 15405803 - 15405917
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15405803 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15405902  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  15405903 ggcacgtagtggctc 15405917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 15417590 - 15417704
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15417590 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15417689  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  15417690 ggcacgtagtggctc 15417704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27026119 - 27025955
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  27026119 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 27026021  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |    ||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27026020 ggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 27025955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20131490 - 20131391
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20131490 aaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggtt 20131392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 548
Target Start/End: Original strand, 22201380 - 22201479
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22201380 aaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggtt 22201478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27031998 - 27031905
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27031998 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatga 27031905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Original strand, 24299033 - 24299076
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24299033 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 24299076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24870635 - 24870592
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24870635 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 24870592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 26268224 - 26268388
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26268224 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatgatggtt 26268323  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26268324 gacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 26268388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 3452228 - 3452064
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3452228 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatgatggtt 3452129  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  3452128 gacagtttgtagacacgacttcacggggaagccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctc 3452064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3452655 - 3452501
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatctt 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3452655 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatctt 3452556  T
Q  235 agtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3452555 agtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 3452501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Original strand, 26267899 - 26268050
Alignment:
Q  138 acaagctgttcttggact-gaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatcttag 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26267899 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaaca-gaaacatattcactggggattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatcttag 26267997  T
Q  237 tttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26267998 tttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaataggggtg 26268050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 5140526 - 5140639
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5140526 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5140625  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  5140626 gcacgtagtggctc 5140639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 26678243 - 26678406
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  26678243 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 26678341  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678342 ggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26678406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 4138436 - 4138547
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138436 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 4138535  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  4138536 acgtagtggctc 4138547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 16744711 - 16744822
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744711 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16744810  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  16744811 acgtagtggctc 16744822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 2780170 - 2780057
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2780170 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 2780071  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  2780070 gcacgtagtggctc 2780057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22148814 - 22148701
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22148814 gtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 22148715  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  22148714 gcacgtagtggctc 22148701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 26442191 - 26442078
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26442191 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26442092  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26442091 gcacgtagtggctc 26442078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 26596603 - 26596490
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596603 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26596504  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26596503 gcacgtagtggctc 26596490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 31083812 - 31083925
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31083812 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 31083911  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  31083912 gcacgtagtggctc 31083925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 31130843 - 31130730
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31130843 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31130744  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  31130743 gcacgtagtggctc 31130730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 26663051 - 26663214
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  26663051 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 26663149  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663150 ggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 26663214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 39206353 - 39206466
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39206353 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 39206452  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  39206453 gcacgtagtggctc 39206466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 45738227 - 45738114
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45738227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 45738128  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  45738127 gcacgtagtggctc 45738114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4206322 - 4206209
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4206322 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 4206223  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  4206222 gcacgtagtggctc 4206209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 11447835 - 11447722
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  11447835 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 11447736  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  11447735 gcacgtagtggctc 11447722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 26313052 - 26313165
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313052 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcaagacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26313151  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26313152 gcacgtagtggctc 26313165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 45394166 - 45394053
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45394166 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 45394067  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  45394066 gcacgtagtggctc 45394053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 26519754 - 26519641
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  26519754 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 26519655  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  26519654 gcacgtagtggctc 26519641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 31557593 - 31557706
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31557593 gtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31557692  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||| ||||    
T  31557693 gcacgtagtagctc 31557706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 24585726 - 24585838
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattggg 599  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24585726 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacatttagagtattggg 24585825  T
Q  600 cacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||    
T  24585826 cacgtagtggctc 24585838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 11417941 - 11418105
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  11417941 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 11418039  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418040 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 11418105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 551 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22152989 - 22152928
Alignment:
Q  551 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22152989 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 22152928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 551 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22208904 - 22208843
Alignment:
Q  551 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22208904 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 22208843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 10848582 - 10848418
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||    
T  10848582 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgtt 10848484  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10848483 ggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 10848418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 449 - 612
Target Start/End: Original strand, 26508848 - 26509011
Alignment:
Q  449 aatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttg 548  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  26508848 aatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgcatgactgttg 26508946  T
Q  549 atagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
      |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26508947 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 26509011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5155010 - 5154896
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  5155010 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 5154911  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  5154910 ggcacgtagtggctc 5154896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5165311 - 5165197
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  5165311 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 5165212  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  5165211 ggcacgtagtggctc 5165197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16048310 - 16048146
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||  |||    
T  16048310 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgtt 16048212  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16048211 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 16048146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 16443143 - 16443307
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  16443143 aaatgcaatatgtatggatgatataa-aagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 16443241  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16443242 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctc 16443307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 2161498 - 2161384
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  2161498 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 2161399  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  2161398 ggcacgtagtggctc 2161384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Original strand, 16511637 - 16511680
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16511637 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 16511680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 539
Target Start/End: Original strand, 10910138 - 10910178
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 539  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10910138 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 10910178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18249680 - 18249517
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  18249680 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 18249582  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249581 ggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 18249517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 10403064 - 10402951
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403064 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 10402965  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  10402964 gcacgtagtggctc 10402951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 21681632 - 21681519
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 21681533  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  21681532 gcacgtagtggctc 21681519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 24335138 - 24334975
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  24335138 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgtt 24335040  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24335039 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 24334975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28346133 - 28345970
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  28346133 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 28346035  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28346034 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 28345970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 20570203 - 20570316
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20570203 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggggagacaagacattagagtattgg 20570302  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  20570303 gcacgtagtggctc 20570316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 10650032 - 10649869
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  10650032 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 10649934  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10649933 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 10649869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 31957753 - 31957916
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  31957753 aaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 31957851  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31957852 ggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 31957916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 608
Target Start/End: Original strand, 5589705 - 5589812
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589705 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 5589804  T
Q  601 acgtagtg 608  Q
    ||||||||    
T  5589805 acgtagtg 5589812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 29658316 - 29658427
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658316 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 29658415  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  29658416 acgtagtggctc 29658427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4630671 - 4630558
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4630671 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4630572  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  4630571 gcacgtagtggctc 4630558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5020623 - 5020510
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020623 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5020524  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  5020523 gcacgtagtggctc 5020510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 5602660 - 5602773
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5602660 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 5602759  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  5602760 gcacgtagtggctc 5602773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 11103731 - 11103844
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11103731 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgg 11103830  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  11103831 gcacgtagtggctc 11103844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 16404139 - 16404252
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16404139 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16404238  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  16404239 gcacgtagtggctc 16404252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16599525 - 16599412
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599525 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16599426  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  16599425 gcacgtagtggctc 16599412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 16617786 - 16617950
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  16617786 aaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgtt 16617884  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16617885 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctc 16617950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 17970227 - 17970340
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 17970326  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  17970327 gcacgtagtggctc 17970340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22041371 - 22041207
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  22041371 aaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgtt 22041273  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22041272 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctc 22041207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 32297543 - 32297430
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32297543 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgg 32297444  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  32297443 gcacgtagtggctc 32297430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 32446042 - 32445929
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32446042 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 32445943  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  32445942 gcacgtagtggctc 32445929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 48472822 - 48472709
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48472822 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 48472723  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  48472722 gcacgtagtggctc 48472709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 500 - 612
Target Start/End: Original strand, 4340047 - 4340159
Alignment:
Q  500 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattggg 599  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4340047 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattggg 4340146  T
Q  600 cacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||    
T  4340147 cacgtagtggctc 4340159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5717965 - 5717854
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5717965 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5717866  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  5717865 acgtagtggctc 5717854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5728875 - 5728764
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5728875 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5728776  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  5728775 acgtagtggctc 5728764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Original strand, 5763493 - 5763604
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5763493 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5763592  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  5763593 acgtagtggctc 5763604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4423808 - 4423695
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4423808 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttataggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4423709  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  4423708 gcacgtagtggctc 4423695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 6536090 - 6536203
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6536090 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 6536189  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  6536190 gcacgtagtggctc 6536203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 7080141 - 7080028
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080141 gtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 7080042  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  7080041 gcacgtagtggctc 7080028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 17978298 - 17978411
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17978298 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgg 17978397  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  17978398 gcacgtagtggctc 17978411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18232104 - 18231991
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18232104 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 18232005  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  18232004 gcacgtagtggctc 18231991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 20072925 - 20072812
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20072925 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacatcacggggaagacaagacatcagagtattgg 20072826  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  20072825 gcacgtagtggctc 20072812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28028183 - 28028070
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28028183 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtaatgg 28028084  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||| ||||||||||    
T  28028083 gcaagtagtggctc 28028070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 31029613 - 31029726
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31029613 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31029712  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  31029713 gcacgtagtggctc 31029726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 501 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 47030366 - 47030255
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47030366 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggc 47030267  T
Q  601 acgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||    
T  47030266 acgtagtggctc 47030255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 8218537 - 8218424
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8218537 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaaggcgttagagtattgg 8218438  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    |||||| |||||||    
T  8218437 gcacgtggtggctc 8218424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 18285726 - 18285839
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18285726 gtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgg 18285825  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  18285826 gcacgtagtggctc 18285839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 18301027 - 18301140
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18301027 gtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgg 18301126  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  18301127 gcacgtagtggctc 18301140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 22864211 - 22864324
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22864211 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22864310  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  22864311 gcacgtagtggctc 22864324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 22879270 - 22879383
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22879270 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22879369  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  22879370 gcacgtagtggctc 22879383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 28109310 - 28109423
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||  |||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28109310 gtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacattagagtattgg 28109409  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  28109410 gcacgtagtggctc 28109423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 514 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5473864 - 5473766
Alignment:
Q  514 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5473864 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 5473766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 51788934 - 51788821
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  51788934 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 51788835  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  51788834 gcacgtagtggctc 51788821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 15368207 - 15368043
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  15368207 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 15368109  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15368108 ggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15368043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 35887701 - 35887537
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  35887701 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 35887603  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    || |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35887602 gacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctc 35887537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 29142123 - 29142237
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  29142123 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 29142222  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  29142223 ggcacgtagtggctc 29142237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 4790000 - 4790114
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  4790000 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 4790099  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||| ||||||    
T  4790100 ggcacgtaatggctc 4790114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18058209 - 18058045
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  18058209 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 18058111  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18058110 ggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 18058045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 19701358 - 19701194
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||| ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||    
T  19701358 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-atcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgtt 19701260  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19701259 ggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 19701194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 5659025 - 5658911
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  5659025 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 5658926  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  5658925 ggcacgtagtggctc 5658911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4728567 - 4728403
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  4728567 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 4728469  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4728468 ggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 4728403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 6208836 - 6208672
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  6208836 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 6208738  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6208737 ggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 6208672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 563
Target Start/End: Original strand, 8282829 - 8282893
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacac 563  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  8282829 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 8282893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 15734435 - 15734599
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| |||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||  |||    
T  15734435 aaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgcatgactgtt 15734533  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |    |||||||||||   |||   | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15734534 ggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 15734599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16423098 - 16423034
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacac 563  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||   ||||||||||||    
T  16423098 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcggtttgtagacac 16423034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 4690566 - 4690523
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4690566 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 4690523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Original strand, 15886086 - 15886129
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15886086 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 15886129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 12966 - 12853
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12966 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 12867  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  12866 gcacgtagtggctc 12853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 3648099 - 3647986
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648099 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 3648000  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  3647999 gcacgtagtggctc 3647986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 51645224 - 51645061
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  51645224 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 51645126  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51645125 ggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctc 51645061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 10952044 - 10951931
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952044 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgg 10951945  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  10951944 gcacgtagtggctc 10951931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28592033 - 28591920
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28592033 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 28591934  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  28591933 gcacgtagtggctc 28591920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 10969593 - 10969486
Alignment:
Q  501 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 600  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969593 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 10969494  T
Q  601 acgtagtg 608  Q
    ||||||||    
T  10969493 acgtagtg 10969486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28156657 - 28156544
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28156657 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28156558  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  28156557 gcacgtagtggctc 28156544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 41786640 - 41786753
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41786640 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgtcagagtattgg 41786739  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  41786740 gcacgtagtggctc 41786753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 16201286 - 16201450
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  16201286 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 16201384  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16201385 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 16201450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 20333672 - 20333836
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  20333672 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 20333770  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20333771 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 20333836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 534 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13769631 - 13769558
Alignment:
Q  534 aatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagt 607  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13769631 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaatacattagagtattgggcacgtagt 13769558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 14692222 - 14692336
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  14692222 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 14692321  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  14692322 ggcacgtagtggctc 14692336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 14694904 - 14695018
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  14694904 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 14695003  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  14695004 ggcacgtagtggctc 14695018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 14697588 - 14697702
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  14697588 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 14697687  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  14697688 ggcacgtagtggctc 14697702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 14700269 - 14700383
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  14700269 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 14700368  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  14700369 ggcacgtagtggctc 14700383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 20467787 - 20467623
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  20467787 aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 20467689  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  || ||||||||||   |||   | || ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20467688 ggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctc 20467623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2494
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2607 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 2508  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  2507 gcacgtagtggctc 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 13052 - 12888
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||    
T  13052 aaatgcaatatgcatgggtgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgtt 12954  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||| ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12953 ggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 12888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 8247 - 8360
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8247 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 8346  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  8347 gcacgtagtggctc 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2596
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2483 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 2582  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  2583 gcacgtagtggctc 2596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 14892 - 14779
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14892 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 14793  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  14792 gcacgtagtggctc 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 10869 - 10756
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10869 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacagggaagacaagacattagaatattgg 10770  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  10769 gcacgtagtggctc 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 34223 - 34180
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34223 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 34180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16526 - 16413
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 598  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16526 gtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaaaacatcagagtattgg 16427  T
Q  599 gcacgtagtggctc 612  Q
    ||||||||||||||    
T  16426 gcacgtagtggctc 16413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 28293 - 28129
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  28293 aaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 28195  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28194 ggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 28129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 8966 - 9080
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  8966 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 9065  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||||||||||||    
T  9066 ggcacgtagtggctc 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 613
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||     
T  773 aaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgtg 675  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtg 608  Q
    |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  674 ggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 3921 - 4035
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  3921 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 4020  T
Q  598 ggcacgtagtggctc 612  Q
    |||||| ||||||||    
T  4021 ggcacgcagtggctc 4035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 612
Target Start/End: Original strand, 25825 - 25989
Alignment:
Q  448 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 547  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||| | ||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  25825 aaatgaaagatgtatgggtggtataatagtttt-atcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 25923  T
Q  548 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 612  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || | |||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25924 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctc 25989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Original strand, 1369 - 1412
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1369 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Original strand, 13281 - 13324
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13281 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 539
Target Start/End: Original strand, 24276 - 24319
Alignment:
Q  496 catgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 539  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24276 catgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 24319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 542
Target Start/End: Original strand, 39922 - 39965
Alignment:
Q  499 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 542  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39922 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University