View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9449_low_4 (Length: 337)

Name: NF9449_low_4
Description: NF9449
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9449_low_4
NF9449_low_4
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (3-321)||(16327063-16327381)
chr3 (1-321)||(11958533-11958853)
chr3 (3-321)||(10408425-10408743)
chr3 (3-321)||(16831882-16832200)
chr3 (3-321)||(28756776-28757094)
chr3 (3-321)||(47126401-47126719)
chr3 (14-321)||(16378299-16378606)
chr3 (35-321)||(12509869-12510155)
chr3 (1-319)||(12357879-12358197)
chr3 (1-321)||(8744742-8745062)
chr3 (3-319)||(31692539-31692855)
chr3 (5-321)||(24189761-24190077)
chr3 (1-321)||(13944481-13944801)
chr3 (3-319)||(14290886-14291202)
chr3 (3-319)||(31941362-31941678)
chr3 (1-264)||(17188888-17189151)
chr3 (1-319)||(12180803-12181121)
chr3 (13-321)||(18131711-18132018)
chr3 (1-319)||(17494105-17494424)
chr3 (1-321)||(10417397-10417717)
chr3 (1-224)||(11949277-11949500)
chr3 (3-319)||(16825633-16825951)
chr3 (3-319)||(12857850-12858165)
chr3 (1-201)||(13317886-13318086)
chr3 (69-319)||(12272797-12273047)
chr3 (3-319)||(15230062-15230378)
chr3 (3-319)||(15235930-15236246)
chr3 (132-319)||(14575445-14575632)
chr3 (48-264)||(15262134-15262350)
chr3 (48-252)||(12843513-12843717)
chr3 (67-280)||(15065559-15065772)
chr3 (48-280)||(16638261-16638493)
chr3 (48-280)||(43165163-43165395)
chr3 (48-280)||(48427935-48428167)
chr3 (48-254)||(15345655-15345861)
chr3 (35-120)||(35982839-35982924)
chr3 (48-280)||(12889197-12889429)
chr3 (48-280)||(13255178-13255410)
chr3 (48-304)||(15358547-15358803)
chr3 (48-280)||(24185678-24185910)
chr3 (48-254)||(10008114-10008320)
chr3 (48-254)||(10908724-10908930)
chr3 (48-254)||(15713466-15713672)
chr3 (48-280)||(3688431-3688663)
chr3 (48-280)||(15586802-15587034)
chr3 (35-258)||(15013155-15013378)
chr3 (48-304)||(14578818-14579074)
chr3 (48-304)||(15399927-15400183)
chr3 (48-280)||(16754111-16754343)
chr3 (48-280)||(20059464-20059696)
chr3 (67-280)||(14873997-14874210)
chr3 (48-280)||(6603223-6603455)
chr3 (48-280)||(16694652-16694884)
chr3 (48-280)||(53382428-53382660)
chr3 (48-254)||(26790823-26791029)
chr3 (67-280)||(5422359-5422572)
chr3 (48-280)||(16804357-16804589)
chr3 (140-280)||(17492339-17492479)
chr3 (48-109)||(11861033-11861094)
chr3 (69-114)||(8271830-8271875)
chr3 (69-114)||(13964786-13964831)
chr3 (48-125)||(23079427-23079504)
chr3 (69-114)||(30150021-30150066)
chr3 (69-114)||(15944026-15944071)
chr3 (69-114)||(22150168-22150213)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (1-321)||(16268791-16269111)
chr8 (1-321)||(22027847-22028167)
chr8 (1-321)||(22053757-22054077)
chr8 (1-319)||(29300993-29301311)
chr8 (1-321)||(31414099-31414419)
chr8 (3-321)||(28983805-28984123)
chr8 (3-321)||(28989024-28989342)
chr8 (3-319)||(22373765-22374081)
chr8 (6-264)||(19985131-19985389)
chr8 (39-319)||(21928324-21928604)
chr8 (86-321)||(27357430-27357665)
chr8 (3-319)||(20390982-20391298)
chr8 (48-252)||(22421506-22421710)
chr8 (35-280)||(19980902-19981147)
chr8 (51-264)||(22375071-22375283)
chr8 (74-254)||(21164178-21164358)
chr8 (70-254)||(22523507-22523691)
chr8 (48-279)||(21391475-21391706)
chr8 (48-279)||(21780801-21781032)
chr8 (78-279)||(21785999-21786200)
chr8 (48-280)||(17671636-17671868)
chr8 (48-252)||(21253908-21254112)
chr8 (48-280)||(19115335-19115567)
chr8 (48-264)||(20015877-20016093)
chr8 (48-280)||(32603080-32603312)
chr8 (6-264)||(22989996-22990254)
chr8 (48-280)||(18859512-18859744)
chr8 (48-254)||(22031064-22031270)
chr8 (48-254)||(22117789-22117995)
chr8 (48-254)||(22126573-22126779)
chr8 (2-264)||(22245583-22245845)
chr8 (2-264)||(22246001-22246263)
chr8 (48-280)||(22042762-22042994)
chr8 (48-280)||(30310758-30310990)
chr8 (48-280)||(22129231-22129463)
chr8 (48-281)||(19481686-19481919)
chr8 (48-280)||(15536318-15536550)
chr8 (69-114)||(20649990-20650035)
chr8 (69-114)||(21847972-21848017)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (3-319)||(20892861-20893177)
chr4 (3-321)||(3261920-3262238)
chr4 (3-321)||(29450663-29450981)
chr4 (3-321)||(44658992-44659310)
chr4 (3-321)||(11204358-11204676)
chr4 (1-321)||(51603916-51604236)
chr4 (1-258)||(16150527-16150784)
chr4 (1-258)||(16154673-16154930)
chr4 (1-321)||(27903213-27903533)
chr4 (3-319)||(15073189-15073505)
chr4 (35-319)||(14993525-14993809)
chr4 (1-222)||(53750594-53750815)
chr4 (19-189)||(15266736-15266906)
chr4 (3-136)||(7357280-7357413)
chr4 (53-280)||(14696970-14697197)
chr4 (138-319)||(15354301-15354482)
chr4 (6-249)||(14162370-14162613)
chr4 (6-252)||(15904-16150)
chr4 (48-280)||(17092060-17092292)
chr4 (48-280)||(12479469-12479701)
chr4 (48-280)||(14683436-14683668)
chr4 (48-280)||(16233903-16234135)
chr4 (67-321)||(18224376-18224630)
chr4 (48-254)||(23958642-23958848)
chr4 (48-280)||(8389281-8389513)
chr4 (48-280)||(19635005-19635237)
chr4 (48-254)||(8050534-8050740)
chr4 (48-254)||(14300890-14301096)
chr4 (74-280)||(15144829-15145035)
chr4 (48-254)||(16350465-16350671)
chr4 (48-280)||(40475909-40476141)
chr4 (48-254)||(19775704-19775910)
chr4 (48-254)||(27714231-27714437)
chr4 (185-321)||(15258755-15258891)
chr4 (30-92)||(15354229-15354291)
chr4 (159-280)||(16250872-16250993)
chr4 (48-214)||(13513285-13513451)
chr4 (48-149)||(16219188-16219289)
chr4 (48-149)||(16222508-16222609)
chr4 (171-280)||(14188375-14188484)
chr4 (195-264)||(16219115-16219184)
chr4 (195-264)||(16222435-16222504)
chr4 (69-114)||(14999681-14999726)
chr4 (51-115)||(18604733-18604797)
chr4 (245-319)||(8708737-8708811)
chr4 (69-114)||(15290350-15290395)
chr4 (78-114)||(18546820-18546856)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (3-321)||(514482-514800)
scaffold0001 (72-286)||(441545-441759)
scaffold0001 (6-263)||(495935-496192)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (1-321)||(5272-5592)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (3-321)||(13965781-13966099)
chr7 (3-321)||(21755230-21755548)
chr7 (1-321)||(16947583-16947903)
chr7 (1-321)||(14283485-14283805)
chr7 (3-321)||(26091911-26092229)
chr7 (3-321)||(49155119-49155437)
chr7 (3-321)||(11385542-11385860)
chr7 (1-321)||(12459446-12459766)
chr7 (3-321)||(26115703-26116021)
chr7 (3-321)||(40924930-40925248)
chr7 (6-319)||(14140499-14140812)
chr7 (1-321)||(15343249-15343569)
chr7 (1-321)||(13024163-13024482)
chr7 (1-319)||(13676271-13676589)
chr7 (3-319)||(15099716-15100032)
chr7 (1-321)||(18051064-18051384)
chr7 (1-319)||(19149831-19150149)
chr7 (1-319)||(20749230-20749548)
chr7 (6-319)||(14261362-14261674)
chr7 (6-319)||(12798617-12798930)
chr7 (3-264)||(12203913-12204174)
chr7 (50-252)||(15146105-15146307)
chr7 (48-321)||(14957371-14957644)
chr7 (48-264)||(9591238-9591454)
chr7 (48-280)||(44788531-44788763)
chr7 (48-280)||(11550282-11550514)
chr7 (48-280)||(14335254-14335486)
chr7 (48-254)||(8710489-8710695)
chr7 (48-280)||(18180601-18180833)
chr7 (48-254)||(11234393-11234599)
chr7 (48-254)||(13688925-13689131)
chr7 (48-254)||(18587351-18587557)
chr7 (48-252)||(14042581-14042785)
chr7 (48-252)||(14352611-14352815)
chr7 (48-280)||(17703635-17703867)
chr7 (48-254)||(15158237-15158443)
chr7 (159-280)||(8200906-8201027)
chr7 (48-280)||(12690360-12690591)
chr7 (1-285)||(15627377-15627661)
chr7 (166-280)||(10873548-10873662)
chr7 (69-114)||(4442951-4442996)
chr7 (69-114)||(7826924-7826969)
chr7 (69-114)||(13459057-13459102)
chr7 (48-125)||(16726621-16726698)
chr7 (69-114)||(27104975-27105020)
chr7 (69-114)||(27173305-27173350)
chr7 (43-74)||(12712816-12712847)
chr7 (69-114)||(14207343-14207388)
chr7 (69-114)||(14216033-14216078)
chr7 (78-114)||(38356-38392)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-321)||(67235-67555)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-321)||(19716681-19717001)
chr2 (3-302)||(20848067-20848366)
chr2 (3-319)||(23097684-23098000)
chr2 (1-317)||(23274056-23274372)
chr2 (1-321)||(12576812-12577132)
chr2 (3-319)||(23113184-23113499)
chr2 (1-122)||(19721244-19721365)
chr2 (72-286)||(24817575-24817789)
chr2 (48-280)||(11351422-11351654)
chr2 (6-280)||(21322935-21323209)
chr2 (48-280)||(9338082-9338314)
chr2 (48-280)||(9486716-9486948)
chr2 (48-280)||(16983740-16983972)
chr2 (48-280)||(17001500-17001732)
chr2 (48-252)||(23074391-23074595)
chr2 (48-280)||(24677987-24678219)
chr2 (78-280)||(23105469-23105671)
chr2 (48-280)||(22323053-22323285)
chr2 (48-280)||(24705193-24705425)
chr2 (48-280)||(24712534-24712766)
chr2 (48-280)||(44383281-44383513)
chr2 (67-280)||(23029191-23029404)
chr2 (67-280)||(27220516-27220729)
chr2 (51-264)||(27220532-27220745)
chr2 (35-264)||(45673710-45673939)
chr2 (48-252)||(22733485-22733689)
chr2 (67-254)||(27373795-27373982)
chr2 (48-220)||(22742677-22742849)
chr2 (48-220)||(23064973-23065145)
chr2 (48-280)||(24657369-24657601)
chr2 (48-254)||(10871376-10871582)
chr2 (48-290)||(30208631-30208873)
chr2 (67-280)||(21142771-21142984)
chr2 (48-280)||(24874461-24874693)
chr2 (48-254)||(24264896-24265102)
chr2 (48-280)||(23204814-23205046)
chr2 (35-125)||(19817502-19817592)
chr2 (213-317)||(23279239-23279343)
chr2 (46-114)||(22739363-22739431)
chr2 (159-254)||(41606209-41606302)
chr2 (45-114)||(22280771-22280840)
chr2 (48-115)||(23676583-23676650)
chr2 (69-114)||(25131275-25131320)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (3-321)||(52988615-52988933)
chr1 (3-321)||(48425747-48426065)
chr1 (6-321)||(38910027-38910342)
chr1 (1-310)||(24096811-24097120)
chr1 (3-321)||(37679923-37680241)
chr1 (3-321)||(31537195-31537513)
chr1 (35-321)||(20297255-20297541)
chr1 (1-319)||(19857150-19857468)
chr1 (12-319)||(21739243-21739550)
chr1 (1-319)||(20833096-20833414)
chr1 (12-321)||(20853967-20854276)
chr1 (3-319)||(22015943-22016259)
chr1 (1-264)||(18710316-18710579)
chr1 (4-222)||(20074908-20075126)
chr1 (6-319)||(21742753-21743066)
chr1 (157-321)||(12200392-12200556)
chr1 (48-280)||(16378978-16379210)
chr1 (48-280)||(20081619-20081851)
chr1 (48-254)||(22496499-22496705)
chr1 (48-280)||(16347838-16348070)
chr1 (48-264)||(24785100-24785316)
chr1 (48-280)||(51330735-51330967)
chr1 (48-223)||(21751988-21752163)
chr1 (67-254)||(33388291-33388478)
chr1 (48-254)||(21833212-21833418)
chr1 (6-87)||(21961135-21961216)
chr1 (48-280)||(17042258-17042490)
chr1 (48-304)||(21842072-21842328)
chr1 (48-254)||(19109278-19109484)
chr1 (48-281)||(41350911-41351144)
chr1 (53-109)||(21045372-21045428)
chr1 (48-196)||(21228799-21228947)
chr1 (69-114)||(20828656-20828701)
chr1 (69-114)||(20928104-20928149)
chr1 (48-125)||(22401631-22401708)
chr1 (48-103)||(22435976-22436031)
chr1 (69-114)||(20528103-20528148)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-321)||(23078211-23078531)
chr5 (1-321)||(14884297-14884617)
chr5 (6-321)||(20345024-20345339)
chr5 (3-321)||(22505421-22505739)
chr5 (6-321)||(25850814-25851129)
chr5 (3-319)||(23563476-23563792)
chr5 (12-321)||(20778655-20778964)
chr5 (1-321)||(20824195-20824515)
chr5 (12-321)||(22464692-22465001)
chr5 (1-321)||(17266640-17266960)
chr5 (12-321)||(28892259-28892568)
chr5 (3-319)||(21983485-21983801)
chr5 (3-319)||(21561333-21561649)
chr5 (1-220)||(21631705-21631924)
chr5 (48-280)||(21882575-21882807)
chr5 (48-280)||(25429222-25429454)
chr5 (48-280)||(16359303-16359535)
chr5 (48-304)||(26736080-26736336)
chr5 (48-280)||(34569295-34569527)
chr5 (48-280)||(40711581-40711813)
chr5 (6-264)||(23474012-23474270)
chr5 (48-254)||(29473426-29473632)
chr5 (48-264)||(18781931-18782147)
chr5 (48-280)||(27521207-27521439)
chr5 (48-254)||(14997092-14997298)
chr5 (48-254)||(22330240-22330446)
chr5 (48-280)||(27613157-27613389)
chr5 (48-280)||(41773643-41773875)
chr5 (48-254)||(19772787-19772993)
chr5 (48-254)||(27682753-27682959)
chr5 (48-254)||(37288849-37289055)
chr5 (48-280)||(22350720-22350952)
chr5 (48-280)||(27665843-27666075)
chr5 (67-280)||(20803398-20803611)
chr5 (48-280)||(22137469-22137701)
chr5 (48-149)||(21332339-21332440)
chr5 (35-264)||(21409951-21410180)
chr5 (48-220)||(23460832-23461004)
chr5 (159-321)||(21342878-21343040)
chr5 (176-264)||(20311667-20311755)
chr5 (48-180)||(23525952-23526084)
chr5 (163-264)||(21336762-21336863)
chr5 (69-114)||(23508633-23508678)
chr5 (69-114)||(24584159-24584204)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (3-321)||(318-636)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-321)||(8471-8791)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-321)||(251479-251799)
scaffold0009 (48-115)||(230026-230093)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (3-321)||(11666-11984)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (3-321)||(10834-11152)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-321)||(29791-30109)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-310)||(203249-203558)
scaffold0003 (48-220)||(424266-424438)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-321)||(263083-263403)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-298)||(30453-30750)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-321)||(39460-39780)
scaffold0010 (103-319)||(44656-44872)
scaffold0010 (12-254)||(4839-5081)
scaffold0010 (48-280)||(14322-14554)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-321)||(18797382-18797702)
chr6 (1-321)||(10466117-10466437)
chr6 (1-319)||(14377185-14377503)
chr6 (3-321)||(24367092-24367410)
chr6 (1-319)||(19455717-19456035)
chr6 (3-319)||(19437696-19438012)
chr6 (1-321)||(15462028-15462348)
chr6 (1-319)||(21567260-21567578)
chr6 (13-319)||(24515695-24516001)
chr6 (3-319)||(21474294-21474610)
chr6 (1-210)||(19465971-19466180)
chr6 (1-321)||(34642855-34643175)
chr6 (37-319)||(25770538-25770820)
chr6 (4-319)||(19486566-19486879)
chr6 (48-252)||(23081184-23081388)
chr6 (99-255)||(20010821-20010977)
chr6 (48-252)||(18405260-18405464)
chr6 (2-286)||(23085095-23085379)
chr6 (6-280)||(5836502-5836776)
chr6 (51-264)||(18182686-18182899)
chr6 (35-286)||(22436596-22436847)
chr6 (48-286)||(16924956-16925194)
chr6 (48-280)||(29589755-29589987)
chr6 (48-277)||(30678340-30678569)
chr6 (48-254)||(2872118-2872324)
chr6 (48-254)||(16574649-16574855)
chr6 (48-254)||(16620525-16620731)
chr6 (48-280)||(27559285-27559517)
chr6 (48-280)||(28312363-28312595)
chr6 (74-280)||(19867420-19867626)
chr6 (48-254)||(24293098-24293304)
chr6 (48-280)||(28260513-28260745)
chr6 (48-280)||(28285171-28285403)
chr6 (48-280)||(28339262-28339494)
chr6 (67-280)||(27190169-27190382)
chr6 (51-264)||(27190185-27190398)
chr6 (51-264)||(27258842-27259055)
chr6 (67-280)||(27258858-27259071)
chr6 (48-280)||(25115285-25115517)
chr6 (48-115)||(22829702-22829769)
chr6 (69-114)||(16379710-16379755)
chr6 (69-114)||(16647306-16647351)
chr6 (69-114)||(16100914-16100959)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (2-321)||(21979-22298)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (3-321)||(41592-41910)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-321)||(65425-65745)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-310)||(9914-10222)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-321)||(53550-53870)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (1-319)||(442-760)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-321)||(672-992)
scaffold0476 (48-280)||(10684-10916)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-321)||(64729-65049)
scaffold0067 (1-321)||(49307-49627)
scaffold0067 (1-321)||(58341-58661)
scaffold0067 (3-319)||(29483-29799)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-321)||(94021-94341)
scaffold0029 (1-321)||(115419-115739)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (3-319)||(98712-99028)
scaffold0020 (3-319)||(175847-176162)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-319)||(1438-1756)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-319)||(7603-7921)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-319)||(20673-20991)
scaffold0222 (1-321)||(614-934)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-319)||(325566-325884)
scaffold0004 (13-319)||(200607-200913)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-319)||(5336-5654)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-319)||(981-1299)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (1-319)||(151426-151744)
scaffold0011 (48-264)||(23707-23923)
scaffold0011 (69-118)||(73792-73841)
scaffold0011 (69-118)||(78173-78222)
scaffold0011 (69-121)||(175708-175760)
scaffold0011 (69-114)||(182054-182099)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (6-319)||(11819-12132)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (3-319)||(9901-10217)
scaffold0243 (48-304)||(24119-24375)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (3-319)||(63648-63964)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-264)||(8589-8852)
scaffold0235 (1-264)||(18803-19066)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (3-321)||(1401-1719)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (1-319)||(6897-7215)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (3-321)||(28414-28732)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (41-321)||(1-281)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (3-319)||(49964-50280)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (21-321)||(14980-15280)
scaffold0074 (51-260)||(6031-6240)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (45-319)||(979-1253)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (1-321)||(4976-5296)
scaffold0348 (4-310)||(17614-17920)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (3-319)||(29386-29702)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (3-319)||(1012-1328)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (20-319)||(1-300)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-319)||(53906-54224)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-319)||(164528-164846)
scaffold0023 (6-252)||(47115-47360)
scaffold0023 (74-231)||(30774-30931)
scaffold0023 (159-280)||(151979-152100)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (3-319)||(36798-37114)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-321)||(39915-40235)
scaffold0114 (48-304)||(17523-17778)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (35-319)||(42557-42841)
scaffold0102 (35-280)||(50506-50751)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (1-259)||(9354-9612)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (35-310)||(12595-12870)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (3-319)||(11689-12003)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (12-321)||(70229-70538)
scaffold0034 (45-310)||(2123-2388)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (3-319)||(43548-43864)
scaffold0104 (178-304)||(25090-25216)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (60-319)||(60598-60857)
scaffold0046 (3-207)||(70079-70283)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (51-319)||(2730-2998)
scaffold0523 (3-99)||(11872-11968)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (3-319)||(1580-1896)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (1-264)||(5719-5982)
scaffold0035 (48-218)||(41282-41452)
scaffold0035 (243-321)||(5608-5686)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (35-321)||(5459-5745)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (3-264)||(944-1205)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (6-223)||(6389-6606)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (6-319)||(5040-5353)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (35-304)||(4250-4519)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (3-319)||(34196-34512)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (35-264)||(20689-20918)
scaffold0261 (35-264)||(12509-12738)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (3-230)||(4433-4660)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (61-319)||(110469-110727)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (3-186)||(9150-9333)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (83-321)||(21708-21946)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (83-319)||(49086-49322)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-167)||(19096-19262)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (3-259)||(4021-4274)
scaffold0130 (67-220)||(7972-8125)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (130-321)||(25969-26160)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (154-321)||(3450-3617)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (1-151)||(1975-2125)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (35-286)||(23459-23710)
scaffold0018 (72-286)||(9549-9763)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (6-286)||(15111-15391)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (1-94)||(1614-1707)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (48-252)||(4360-4564)
scaffold0621 (48-194)||(1-147)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (48-252)||(8336-8540)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (48-264)||(6787-7003)
scaffold0270 (48-264)||(13917-14133)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (48-264)||(36412-36628)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-280)||(4986-5265)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (1-99)||(1734-1832)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-264)||(14398-14656)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (35-289)||(1888-2142)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (51-264)||(17792-18005)
scaffold0040 (48-229)||(111081-111262)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (6-263)||(216552-216809)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (48-280)||(10332-10564)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (48-304)||(2437-2693)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (48-280)||(13653-13885)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (48-280)||(29102-29334)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (48-264)||(57788-58004)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (48-280)||(17240-17472)
scaffold0017 (51-265)||(24219-24433)
scaffold0017 (74-253)||(195038-195217)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (6-252)||(55602-55848)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (48-309)||(1858-2119)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (6-264)||(15336-15582)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (48-304)||(552-808)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (48-280)||(22145-22377)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (3-122)||(1006-1125)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (78-304)||(24916-25142)
scaffold0218 (69-114)||(1147-1192)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (48-229)||(40681-40862)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (51-252)||(104153-104354)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (3-91)||(932-1020)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (130-319)||(1078-1259)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (48-252)||(11054-11258)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (48-252)||(7913-8117)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (69-229)||(14033-14193)
scaffold0120 (48-149)||(11293-11394)
scaffold0120 (69-114)||(25242-25287)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (48-252)||(8149-8353)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (48-304)||(54511-54767)
scaffold0080 (49-280)||(31781-32012)
scaffold0080 (48-280)||(10412-10644)
scaffold0080 (49-280)||(37247-37478)
scaffold0080 (48-280)||(13067-13299)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (2-286)||(26244-26528)
scaffold0042 (74-254)||(37020-37200)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (48-304)||(8824-9077)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (50-264)||(17851-18065)
scaffold0028 (48-264)||(11383-11599)
scaffold0028 (186-264)||(53641-53719)
scaffold0028 (48-124)||(55058-55134)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (3-113)||(51716-51826)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (48-280)||(1206-1438)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (48-280)||(10266-10498)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (48-252)||(41558-41762)
scaffold0022 (48-252)||(75278-75482)
scaffold0022 (74-280)||(34915-35121)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (6-205)||(3524-3723)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (48-231)||(7183-7366)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (48-254)||(3348-3554)
scaffold0044 (48-280)||(17058-17290)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (67-252)||(908-1093)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (48-216)||(14873-15041)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (51-254)||(65-268)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (70-252)||(4509-4691)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (6-304)||(18524-18822)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (51-264)||(11533-11746)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (48-280)||(13298-13530)
scaffold0109 (48-280)||(41053-41285)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (74-217)||(1-144)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (48-280)||(21502-21734)
scaffold0081 (48-280)||(36926-37158)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (163-286)||(12555-12678)
[»] scaffold0605 (2 HSPs)
scaffold0605 (12-94)||(1364-1446)
scaffold0605 (245-321)||(1279-1355)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (48-264)||(8172-8388)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (1-105)||(16736-16840)
scaffold0100 (102-286)||(21413-21597)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (48-230)||(943-1125)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (68-280)||(674-886)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (2-128)||(11078-11204)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (159-252)||(3527-3620)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (48-125)||(15753-15830)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (48-124)||(48719-48795)
scaffold0007 (176-286)||(83823-83933)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (48-118)||(2924-2994)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (45-114)||(13502-13571)
scaffold0467 (69-114)||(816-861)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (69-114)||(5499-5544)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (69-114)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (69-114)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (69-114)||(24027-24072)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (69-114)||(8221-8266)
scaffold0021 (69-114)||(90566-90611)
scaffold0021 (69-114)||(21071-21116)
scaffold0021 (69-114)||(30647-30692)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (69-121)||(3556-3608)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-55)||(2754-2808)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (69-114)||(2635-2680)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (69-114)||(4097-4142)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (69-110)||(7057-7098)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (69-114)||(5000-5045)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (67-108)||(171188-171229)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 16327063 - 16327381
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327063 gtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 16327162  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16327163 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaaggg 16327262  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16327263 ttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggaatggat 16327362  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16327363 gttattttcgggatgaatt 16327381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 11958533 - 11958853
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11958533 aagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacac 11958632  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958633 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 11958732  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  11958733 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatgg 11958832  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  11958833 atgttattttcggtatgaatt 11958853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10408743 - 10408425
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10408743 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 10408644  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10408643 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 10408544  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  10408543 ttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 10408444  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  10408443 gtgatttttggtatgaatt 10408425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 16831882 - 16832200
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16831882 gtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 16831981  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16831982 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 16832081  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| |||||     
T  16832082 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggac 16832181  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||| || |||||||    
T  16832182 gttatttttggaatgaatt 16832200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28757094 - 28756776
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28757094 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 28756995  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28756994 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 28756895  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||| |||||||||||    
T  28756894 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggat 28756795  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  28756794 gttatctttggtatgaatt 28756776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47126719 - 47126401
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47126719 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 47126620  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47126619 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 47126520  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  47126519 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 47126420  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  47126419 gtgatttttggtatgaatt 47126401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 321
Target Start/End: Original strand, 16378299 - 16378606
Alignment:
Q  14 gactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16378299 gactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcat 16378398  T
Q  114 tgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaacta 213  Q
    |||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378399 tgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaacta 16378498  T
Q  214 cttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgg 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  16378499 cttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgg 16378598  T
Q  314 gatgaatt 321  Q
    ||||||||    
T  16378599 gatgaatt 16378606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 35 - 321
Target Start/End: Original strand, 12509869 - 12510155
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12509869 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgt 12509968  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||    
T  12509969 gcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggt 12510068  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12510069 gtcttatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaatt 12510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 12357879 - 12358197
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12357879 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacac 12357978  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12357979 tagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaag 12358078  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| ||  | ||| |||||||||    
T  12358079 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatgg 12358178  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  12358179 atgttatttttgcgatgaa 12358197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 8744742 - 8745062
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8744742 aagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 8744841  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8744842 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 8744941  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||  || |||| ||||    
T  8744942 ggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatgg 8745041  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  8745042 atgttatttttgggatgaatt 8745062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 31692539 - 31692855
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31692539 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattg 31692638  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31692639 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaaggg 31692738  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || || ||| |||| ||||||    
T  31692739 ttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggat 31692838  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  31692839 gttatttttgggatgaa 31692855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24190077 - 24189761
Alignment:
Q  5 gtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24190077 gtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggt 24189978  T
Q  105 gctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24189977 gctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggtt 24189878  T
Q  205 cagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  || ||  || |||| ||||||||    
T  24189877 cagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgt 24189778  T
Q  305 tattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||| || |||||||    
T  24189777 tatttttggaatgaatt 24189761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13944801 - 13944481
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13944801 aagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 13944702  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944701 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 13944602  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||  | || ||| |||| ||||    
T  13944601 ggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatgg 13944502  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  13944501 atgttatttttgggatgaatt 13944481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 14290886 - 14291202
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  14290886 gtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacacta 14290985  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14290986 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 14291085  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| | || || ||||| |||||||||||||||    
T  14291086 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggat 14291185  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  14291186 gtgatttttgggatgaa 14291202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31941678 - 31941362
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941678 gtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 31941579  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941578 atgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 31941479  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |  |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||  || || ||||| || || || ||| |||| ||||||    
T  31941478 tctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctatgtttggcagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggat 31941379  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  31941378 gttatttttgggatgaa 31941362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17189151 - 17188888
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17189151 aagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 17189052  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17189051 gggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaag 17188952  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17188951 ggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 17188888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12181121 - 12180803
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12181121 aagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacac 12181022  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12181021 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaag 12180922  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||  || || ||| |||||||||    
T  12180921 ggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatgg 12180822  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
     |||||| || ||||||||    
T  12180821 ttgttatctttgggatgaa 12180803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Original strand, 18131711 - 18132018
Alignment:
Q  13 tgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactca 112  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18131711 tgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactca 18131809  T
Q  113 ttgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18131810 ttgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 18131909  T
Q  213 acttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcg 312  Q
    ||||||||||||||| | |||||||   | ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| || || || ||| |||||||||||||||||||      
T  18131910 acttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttt 18132009  T
Q  313 ggatgaatt 321  Q
    |||||||||    
T  18132010 ggatgaatt 18132018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17494424 - 17494105
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || | || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17494424 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 17494325  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg-aaactccagctaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17494324 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaa 17494225  T
Q  200 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| ||||||||    
T  17494224 gggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatg 17494125  T
Q  300 gatgttattttcgggatgaa 319  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  17494124 tatgttatttttgggatgaa 17494105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 10417397 - 10417717
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10417397 aagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 10417496  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10417497 cggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 10417596  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||  | || |||| ||| ||||    
T  10417597 ggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatgg 10417696  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10417697 atgttattttcgggatgaatt 10417717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11949277 - 11949500
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11949277 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 11949376  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11949377 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 11949476  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  11949477 ggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 16825633 - 16825951
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaata--gtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825633 gtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatac 16825732  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16825733 tagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaag 16825832  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | |||||  |||||||||| ||||  || ||| | ||||| || || ||| |||||||||    
T  16825833 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatgg 16825932  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  16825933 atgtgatttttgggatgaa 16825951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 12857850 - 12858165
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857850 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggac-gacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 12857948  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||| | |||||||||||||| |    ||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12857949 gtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaaggg 12858048  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||  |||||| | || || ||||| |||  ||||||||||    
T  12858049 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtgactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggat 12858148  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  12858149 gtaatctttgggatgaa 12858165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13317886 - 13318086
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13317886 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 13317985  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317986 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 13318085  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  13318086 g 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272797
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  169 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagt 12272848  T
Q  269 tgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
     ||| ||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12272847 cgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 12272797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15230378 - 15230062
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||   || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15230378 gtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 15230279  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230278 gtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 15230179  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||||| | || || ||||| ||  |||||||||||    
T  15230178 ttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggat 15230079  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  15230078 gtaatctttgggatgaa 15230062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15236246 - 15235930
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||   || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15236246 gtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 15236147  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236146 gtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 15236047  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||||| | || || ||||| ||  |||||||||||    
T  15236046 ttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggat 15235947  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  15235946 gtaatctttgggatgaa 15235930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14575632 - 14575445
Alignment:
Q  132 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttga 231  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14575632 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaa 14575533  T
Q  232 ggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  14575532 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaa 14575445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262134
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 15262151  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| |||||||||    
T  15262150 gtttggtcgagattttg 15262134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843717
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 12843612  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
     | | | | | ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | | |||    
T  12843613 atcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttat 12843712  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  12843713 gtttg 12843717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065559
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatat 15065673  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||| |    
T  15065672 gaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 15065573  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  15065572 atggatttagtttg 15065559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16638493 - 16638261
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||| || |   ||||    
T  16638493 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 16638394  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16638393 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16638294  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16638293 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16638261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43165395 - 43165163
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  43165395 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 43165296  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  43165295 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 43165196  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  43165195 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 43165163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48428167 - 48427935
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  48428167 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 48428068  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  48428067 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 48427968  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  48427967 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 48427935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 15345655 - 15345861
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15345655 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15345754  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  15345755 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15345854  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  15345855 gtttggt 15345861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35982924 - 35982839
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35982924 tgaggaccgacttatcagagatacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12889429 - 12889197
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  12889429 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12889330  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  12889329 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 12889230  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  12889229 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 12889197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13255410 - 13255178
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  13255410 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 13255311  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  13255310 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 13255211  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  13255210 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 13255178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15358803 - 15358547
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15358803 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15358704  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  15358703 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15358604  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||  |||| |||   |||||||||||    
T  15358603 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 15358547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24185910 - 24185678
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  24185910 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24185811  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  24185810 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 24185711  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  24185710 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 24185678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10008320 - 10008114
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10008320 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10008221  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  10008220 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10008121  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  10008120 gtttggt 10008114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10908930 - 10908724
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10908930 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10908831  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  10908830 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10908731  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  10908730 gtttggt 10908724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 15713466 - 15713672
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15713466 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15713565  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  15713566 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15713665  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  15713666 gtttggt 15713672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3688663 - 3688431
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    | |||| || |   ||||    
T  3688663 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgg 3688564  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  3688563 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 3688464  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  3688463 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 3688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 15586802 - 15587034
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15586802 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15586901  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  15586902 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15587001  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  15587002 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 15587034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 258
Target Start/End: Original strand, 15013155 - 15013378
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||| |  | | |||    
T  15013155 tgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattatagatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgt 15013254  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    |||  |||||||||| | ||| | ||   |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||| ||    
T  15013255 gctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagt 15013354  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagag 258  Q
    ||||| | || |||||||||||||    
T  15013355 gtcctttgtcgatgtttggtagag 15013378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 14578818 - 14579074
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||| ||| |||||  || ||| ||| |||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14578818 atcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 14578917  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || |     | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||| | |||||    
T  14578918 gtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctat 14579017  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | |||||||   ||||||| ||||| ||||| |||   |||||||||||    
T  14579018 gtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgt 14579074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 15399927 - 15400183
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15399927 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15400026  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  15400027 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15400126  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||  |||| |||   |||||||||||    
T  15400127 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 15400183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 16754111 - 16754343
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16754111 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16754210  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16754211 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctat 16754310  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16754311 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16754343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 20059464 - 20059696
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  20059464 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20059563  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  20059564 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20059663  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  20059664 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 20059696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874210
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | | | | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||   || || | |||||||||||| | ||||||| |    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 14874196  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  14874197 atggatttagtttg 14874210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6603455 - 6603223
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  6603455 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 6603356  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  6603355 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 6603256  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  6603255 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 6603223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16694884 - 16694652
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |  |||||    
T  16694884 atcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgg 16694785  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  16694784 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 16694685  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16694684 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16694652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 53382428 - 53382660
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  53382428 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 53382527  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  53382528 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 53382627  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  53382628 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 53382660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 26790823 - 26791029
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |  | |||| ||     ||||    
T  26790823 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgg 26790922  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  26790923 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 26791022  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  26791023 gtttggt 26791029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422572
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 5422558  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  5422559 atggatttagtttg 5422572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 16804357 - 16804589
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||| |||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16804357 atcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16804456  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || || ||| | |||| | | |||||    
T  16804457 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctat 16804556  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16804557 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16804589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17492479 - 17492339
Alignment:
Q  140 taagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcct 239  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||     
T  17492479 taagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtccc 17492380  T
Q  240 atatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
     | | |||||||| | | ||||||| | ||||||| |||||    
T  17492379 ttgtttatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttg 17492339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 109  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271875
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8271875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964831
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Original strand, 23079427 - 23079504
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 125  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  23079427 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgct 23079504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150021
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 30150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 15944026 - 15944071
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15944026 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 15944071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 22150168 - 22150213
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22150168 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22150213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 16268791 - 16269111
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16268791 aagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatac 16268890  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16268891 tggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 16268990  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  16268991 ggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatgg 16269090  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16269091 atgttattttcgggatgaatt 16269111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 22027847 - 22028167
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027847 aagtgtttgcattgaccggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 22027946  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027947 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 22028046  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||| ||||||||     
T  22028047 ggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatga 22028146  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  22028147 atgttatttttgggatgaatt 22028167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22054077 - 22053757
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22054077 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 22053978  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22053977 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 22053878  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  22053877 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatgg 22053778  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  22053777 atgttatttttggaatgaatt 22053757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 29300993 - 29301311
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29300993 aagtgttttcattgacgggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 29301092  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29301093 tggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 29301192  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  29301193 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgttatcgggtatgg 29301292  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  29301293 atgtaatttttgggatgaa 29301311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 31414099 - 31414419
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31414099 aagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatat 31414198  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31414199 tggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 31414298  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||| | ||| || ||||||    
T  31414299 ggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagccgacttagtttgtttgtcgttgacgagtatgg 31414398  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  31414399 atgttatttttggaatgaatt 31414419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28984123 - 28983805
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28984123 gtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 28984024  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28984023 gtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 28983924  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||| ||| |||||||||||    
T  28983923 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggat 28983824  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  28983823 gttatctttggtatgaatt 28983805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28989342 - 28989024
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28989342 gtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 28989243  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28989242 gtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaaggg 28989143  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||| ||| |||||||||||    
T  28989142 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggat 28989043  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  28989042 gttatctttggtatgaatt 28989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22374081 - 22373765
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374081 gtgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 22373982  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22373981 gtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 22373882  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||| ||||  |||||| | || || ||||||| | | |||||||||    
T  22373881 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatggat 22373782  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  22373781 gtaatctttgggatgaa 22373765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19985389 - 19985131
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985389 tttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 19985290  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985289 ctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19985190  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  19985189 agtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttg 19985131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 39 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21928604 - 21928324
Alignment:
Q  39 gaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgctt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |    
T  21928604 gaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcat 21928505  T
Q  139 ataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcc 238  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21928504 ataagttgggtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgc 21928405  T
Q  239 tatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
      | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| || ||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  21928404 gttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaa 21928324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 86 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357430
Alignment:
Q  86 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  186 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgc 27357466  T
Q  286 cattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27357465 cgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaatt 27357430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20391298 - 20390982
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20391298 gtgtttgcattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactg 20391199  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| | ||| | ||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391198 gtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 20391099  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||  |||||| | || || ||||| |||  ||||||||||    
T  20391098 ttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggat 20390999  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  20390998 gtaatctttgggatgaa 20390982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421710
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctat 22421705  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  22421706 gtttg 22421710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19981147 - 19980902
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  19981147 tgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 19981048  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    |||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |    
T  19981047 gcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 19980948  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||| | |||||||||||| | ||||||| | | |||||||||||    
T  19980947 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttg 19980902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375283
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||  || ||||| || |||||| | ||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 22375269  T
Q  251 tggtagagattttg 264  Q
    ||||||||||||||    
T  22375270 tggtagagattttg 22375283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 21164178 - 21164358
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| | || ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  21164178 tactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 21164277  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 254  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  21164278 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggt 21164358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523507
Alignment:
Q  70 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 169  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  170 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 254  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggt 22523507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 279
Target Start/End: Original strand, 21391475 - 21391706
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  ||||||||    
T  21391475 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21391574  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  21391575 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21391674  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagttt 279  Q
    ||||| | | ||||||| | | ||||||||||    
T  21391675 gtttgatcgtgattttgagatggatttagttt 21391706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 279
Target Start/End: Original strand, 21780801 - 21781032
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  ||||||||    
T  21780801 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21780900  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  21780901 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21781000  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagttt 279  Q
    ||||| | | ||||||| | | ||||||||||    
T  21781001 gtttgatcgtgattttgagatggatttagttt 21781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 279
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786200
Alignment:
Q  78 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 177  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  178 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||||||| | | ||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21786198  T
Q  278 tt 279  Q
    ||    
T  21786199 tt 21786200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 17671636 - 17671868
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17671636 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17671735  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  17671736 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17671835  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  17671836 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 17671868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21254112 - 21253908
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  21254112 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgg 21254013  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  21254012 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21253913  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  21253912 gtttg 21253908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19115567 - 19115335
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19115567 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19115468  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  19115467 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19115368  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  19115367 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 19115335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Original strand, 20015877 - 20016093
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  20015877 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20015976  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  20015977 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20016076  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| | |||||||    
T  20016077 gtttggtcgtgattttg 20016093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32603312 - 32603080
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  32603312 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 32603213  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  32603212 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 32603113  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  32603112 gtttggttgtgattttgaaatggatttagtttg 32603080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22990254 - 22989996
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  22990254 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtg 22990155  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||  |||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22990154 ctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttc 22990055  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
     || |||||||||||||| ||||| || |||||  | |||||||||||| | |||||||    
T  22990054 ggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttg 22989996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859512
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18859645  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  18859644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18859545  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  18859544 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 18859512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031064
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22031071  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  22031070 gtttggt 22031064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 22117789 - 22117995
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  |  ||| || |   ||||    
T  22117789 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgg 22117888  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  22117889 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22117988  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  22117989 gtttggt 22117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 22126573 - 22126779
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22126573 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22126672  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  22126673 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22126772  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  22126773 gtttggt 22126779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 22245583 - 22245845
Alignment:
Q  2 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |    
T  22245583 agtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatt 22245682  T
Q  102 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 201  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22245683 agtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagg 22245782  T
Q  202 gttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    |||| || |||||||||||||| || || |  |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22245783 gttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 22245845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 22246001 - 22246263
Alignment:
Q  2 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| |    
T  22246001 agtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatt 22246100  T
Q  102 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 201  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22246101 agtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagg 22246200  T
Q  202 gttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    |||| || |||||||||||||| || || |  |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22246201 gttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 22246263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22042994 - 22042762
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || || | |||| || |   ||||    
T  22042994 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgg 22042895  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  22042894 gtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22042795  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  22042794 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 22042762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 30310758 - 30310990
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  30310758 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 30310857  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  30310858 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 30310957  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  30310958 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 30310990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 22129231 - 22129463
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22129231 atcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22129330  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  22129331 gtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22129430  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  22129431 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 22129463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 281
Target Start/End: Original strand, 19481686 - 19481919
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19481686 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19481785  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  19481786 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19481885  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgc 281  Q
    |||| || | |||||||   | ||||||||||||    
T  19481886 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgc 19481919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15536550 - 15536318
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | | || || |   ||||    
T  15536550 atcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgg 15536451  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||  | |||||| | |||||    
T  15536450 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctat 15536351  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
     |||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  15536350 atttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 15536318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650035
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20650035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 21847972 - 21848017
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21847972 aatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 21848017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20893177 - 20892861
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893177 gtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 20893078  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893077 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 20892978  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20892977 ttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggat 20892878  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| || |||||    
T  20892877 gttatttttggaatgaa 20892861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 3261920 - 3262238
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3261920 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 3262019  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3262020 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 3262119  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  3262120 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 3262219  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  3262220 gttatctttggtatgaatt 3262238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 29450663 - 29450981
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29450663 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 29450762  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29450763 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 29450862  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  29450863 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 29450962  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  29450963 gtgatttttggtatgaatt 29450981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 44658992 - 44659310
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658992 gtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 44659091  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44659092 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 44659191  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  44659192 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 44659291  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  44659292 gttatctttggtatgaatt 44659310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 11204358 - 11204676
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11204358 gtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 11204457  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11204458 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 11204557  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  11204558 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggat 11204657  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||| || |||||||    
T  11204658 gttatttttggaatgaatt 11204676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 51603916 - 51604236
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51603916 aagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 51604015  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51604016 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 51604115  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||  || |||| ||||    
T  51604116 ggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatgg 51604215  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  51604216 atgttatttttgggatgaatt 51604236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16150784 - 16150527
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16150784 aagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatac 16150685  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16150684 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 16150585  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16150584 ggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 16150527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16154930 - 16154673
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16154930 aagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatac 16154831  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16154830 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 16154731  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16154730 ggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 16154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27903533 - 27903213
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27903533 aagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 27903434  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27903433 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaag 27903334  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||  ||| |||     
T  27903333 ggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatga 27903234  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  27903233 atgttattttagggatgaatt 27903213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15073505 - 15073189
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073505 gtgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 15073406  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073405 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 15073306  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| | || ||  |||| ||| |||||||||||    
T  15073305 ttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggat 15073206  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  15073205 gtaatctttgggatgaa 15073189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 319
Target Start/End: Original strand, 14993525 - 14993809
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| || | |||    
T  14993525 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgt 14993624  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |    
T  14993625 gcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagtt 14993724  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||||  | |||||||||||| |||  ||||  || ||  | ||||| || || ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  14993725 gtccgttgtctatgtttggtggaggctttgaagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatttttgggatgaa 14993809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 53750594 - 53750815
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53750594 aagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 53750693  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750694 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 53750793  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  53750794 ggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15266906 - 15266736
Alignment:
Q  19 gtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 118  Q
    ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15266906 gtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtagttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgttt 15266807  T
Q  119 cattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 189  Q
    ||||| | || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15266806 cattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7357413 - 7357280
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7357413 gtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 7357314  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgc 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7357313 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14697197 - 14696970
Alignment:
Q  53 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttta 152  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |     
T  14697197 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtctt 14697098  T
Q  153 gttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 252  Q
    | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||  | ||||||||||    
T  14697097 gctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttg 14696998  T
Q  253 gtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    || |||||||||   |||||||||||||    
T  14696997 gtcgagattttgaaattgatttagtttg 14696970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 15354301 - 15354482
Alignment:
Q  138 tataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtc 237  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  15354301 tataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtc 15354400  T
Q  238 ctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
       | ||||||||||||||||| |||   || || |||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15354401 tgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 15354482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14162613 - 14162370
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   |  ||||| || || |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  14162613 tttgcattgacgggtacccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtg 14162514  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| ||| |||| |||||| || | ||||||| |||||||| | | | | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14162513 ctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14162414  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgt 249  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  14162413 ggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgt 14162370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 15904 - 16150
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15904 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 16003  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16004 ctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16103  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 252  Q
     || |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||    
T  16104 ggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 16150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 17092060 - 17092292
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17092060 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 17092159  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  17092160 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17092259  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  17092260 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 17092292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12479701 - 12479469
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  12479701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12479602  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  12479601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 12479502  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  12479501 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 12479469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14683668 - 14683436
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14683668 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14683569  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  14683568 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 14683469  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  14683468 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 14683436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 16233903 - 16234135
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16233903 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16234002  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16234003 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16234102  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16234103 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16234135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 321
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224630
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18224575  T
Q  267 gttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
     | |||||||||||  | || |||   ||||||||||||||||| || |||||||    
T  18224576 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaatt 18224630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958642
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 23958749  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  23958748 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 23958649  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  23958648 gtttggt 23958642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8389513 - 8389281
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  8389513 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8389414  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||  |||||| | |||||    
T  8389413 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 8389314  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  8389313 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 8389281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19635237 - 19635005
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19635237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19635138  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  19635137 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19635038  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||| ||| | |||||||   | |||||||||||    
T  19635037 gttcggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 19635005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 8050534 - 8050740
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  8050534 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8050633  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  | |||| | |||||    
T  8050634 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctat 8050733  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  8050734 gtttggt 8050740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 14300890 - 14301096
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14300890 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14300989  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  14300990 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 14301089  T
Q  248 gtttggt 254  Q
     ||||||    
T  14301090 atttggt 14301096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15145035
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatt 273  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||   | ||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 15145028  T
Q  274 tagtttg 280  Q
    |||||||    
T  15145029 tagtttg 15145035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350671
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16350564  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  16350565 gtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 16350664  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    || ||||    
T  16350665 gtctggt 16350671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40476141 - 40475909
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  40476141 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40476042  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  40476041 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 40475942  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  40475941 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 40475909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775910
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19775803  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||  |||||| | |||||    
T  19775804 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctat 19775903  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  19775904 gtttggt 19775910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27714437 - 27714231
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27714437 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27714338  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||    
T  27714337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctat 27714238  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  27714237 gtttggt 27714231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258755
Alignment:
Q  185 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||     
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtagtcgaccttgtttgttta 15258792  T
Q  285 ccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  15258791 ccgttgacgggtatggatgtcattttttggatgaatt 15258755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 92
Target Start/End: Original strand, 15354229 - 15354291
Alignment:
Q  30 actactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatt 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354229 actagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Original strand, 16250872 - 16250993
Alignment:
Q  159 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 258  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||||| | |    
T  16250872 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 16250971  T
Q  259 attttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||   | |||||||||||    
T  16250972 attttgaaatggatttagtttg 16250993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13513451 - 13513285
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   | ||    
T  13513451 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 13513352  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 214  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13513351 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16219289 - 16219188
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16219289 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16219190  T
Q  148 gt 149  Q
    ||    
T  16219189 gt 16219188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16222609 - 16222508
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16222609 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16222510  T
Q  148 gt 149  Q
    ||    
T  16222509 gt 16222508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14188484 - 14188375
Alignment:
Q  171 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttg 270  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||| |||||| | | |||||||   | |    
T  14188484 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtgattttgaaatgg 14188385  T
Q  271 atttagtttg 280  Q
    ||||||||||    
T  14188384 atttagtttg 14188375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16219115
Alignment:
Q  195 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 16219115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222435
Alignment:
Q  195 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 16222435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999681
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 14999681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 115  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8708811 - 8708737
Alignment:
Q  245 tatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||| | ||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  8708811 tatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 8708737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 15290350 - 15290395
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15290350 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 15290395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 114
Target Start/End: Original strand, 18546820 - 18546856
Alignment:
Q  78 cctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18546820 cctttaattgctattatagatactggagctacgcatt 18546856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 514482 - 514800
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  514482 gtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 514581  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  514582 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 514681  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  514682 ttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggat 514781  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  514782 gtgatttttggaatgaatt 514800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441545
Alignment:
Q  72 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 171  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||| |   | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  172 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttga 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattga 441560  T
Q  272 tttagtttgcttgcc 286  Q
    ||| ||||| |||||    
T  441559 tttggtttgtttgcc 441545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 495935
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 495993  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 263  Q
     || |||||||||||||| | ||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||    
T  495992 ggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagatttt 495935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 5272 - 5592
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5272 aagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatac 5371  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaag 5471  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  5472 ggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgcgtatgg 5571  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  5572 atgttatttttgggatgaatt 5592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 13965781 - 13966099
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13965781 gtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 13965880  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965881 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 13965980  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  13965981 ttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggat 13966080  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||| || |||||||    
T  13966081 gttatttttggaatgaatt 13966099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21755548 - 21755230
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21755548 gtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattg 21755449  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755448 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 21755349  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  21755348 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggat 21755249  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  21755248 gtgatttttgggatgaatt 21755230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 16947583 - 16947903
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16947583 aagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatac 16947682  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16947683 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 16947782  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16947783 ggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatgg 16947882  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16947883 atgttatttttggaatgaatt 16947903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 14283485 - 14283805
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  14283485 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggactgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacat 14283584  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14283585 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaag 14283684  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  14283685 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgg 14283784  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14283785 atgttatttttgggatgaatt 14283805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 26091911 - 26092229
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26091911 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 26092010  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26092011 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 26092110  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  26092111 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 26092210  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  26092211 gttatctttggtatgaatt 26092229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 49155437 - 49155119
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49155437 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 49155338  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49155337 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 49155238  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||    
T  49155237 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggat 49155138  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||| || |||||||    
T  49155137 gttatttttggtatgaatt 49155119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 11385542 - 11385860
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11385542 gtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 11385641  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
     |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11385642 atgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaaggg 11385741  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  11385742 ttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggat 11385841  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  11385842 gttatttttgggatgaatt 11385860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12459766 - 12459446
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12459766 aagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 12459667  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12459666 tgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 12459567  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  12459566 ggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatgg 12459467  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12459466 atgttatttttggaatgaatt 12459446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 26115703 - 26116021
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  26115703 gtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattg 26115802  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26115803 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 26115902  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  26115903 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 26116002  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  26116003 gttatctttggtatgaatt 26116021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 40924930 - 40925248
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40924930 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 40925029  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40925030 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 40925129  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  40925130 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 40925229  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  40925230 gttatctttggtatgaatt 40925248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14140812 - 14140499
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14140812 tttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 14140713  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140712 ctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 14140613  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||    
T  14140612 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgtt 14140513  T
Q  306 attttcgggatgaa 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  14140512 atttttgggatgaa 14140499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15343569 - 15343249
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15343569 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 15343470  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343469 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 15343370  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  15343369 ggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgg 15343270  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |  ||||||| || |||||||    
T  15343269 acattatttttggaatgaatt 15343249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13024482 - 13024163
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13024482 aagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatac 13024384  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13024383 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 13024284  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||  | || ||| |||||||||    
T  13024283 ggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtagggattttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatgg 13024184  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  13024183 atgttatttttggtatgaatt 13024163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13676589 - 13676271
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13676589 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgc 13676490  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676489 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 13676390  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || || ||| |||| ||||    
T  13676389 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatgg 13676290  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13676289 atgttatttttgggatgaa 13676271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 15099716 - 15100032
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099716 gtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 15099815  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099816 gtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 15099915  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||| || || ||| |||||||||||    
T  15099916 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggat 15100015  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  15100016 gtgatttttgggatgaa 15100032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 18051064 - 18051384
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18051064 aagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 18051163  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051164 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaag 18051263  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  18051264 ggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatgg 18051363  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  18051364 atgttatttttgggatgaatt 18051384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19150149 - 19149831
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150149 aagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 19150050  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150049 tggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaag 19149950  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||  || |||| || ||||| ||| |||||||||    
T  19149949 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatgg 19149850  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  19149849 atgtaatttttgggatgaa 19149831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20749548 - 20749230
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749548 aagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 20749449  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749448 tggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaag 20749349  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||  || |||| || ||||| ||| |||||||||    
T  20749348 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatgg 20749249  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  20749248 atgtaatttttgggatgaa 20749230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Original strand, 14261362 - 14261674
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14261362 tttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 14261461  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||| | || | || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14261462 ctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttt 14261561  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||  |||  || ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||     
T  14261562 agtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga-attgaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtg 14261660  T
Q  306 attttcgggatgaa 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  14261661 atttttgggatgaa 14261674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Original strand, 12798617 - 12798930
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12798617 tttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 12798716  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12798717 ctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttc 12798816  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||     
T  12798817 agtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgta 12798916  T
Q  306 attttcgggatgaa 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  12798917 atttttgggatgaa 12798930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 12203913 - 12204174
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12203913 gtgtttgcattgaccggtacatagacggttaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactg 12204012  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12204013 gtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaaggg 12204112  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  12204113 ttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttg 12204174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 252
Target Start/End: Original strand, 15146105 - 15146307
Alignment:
Q  50 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 149  Q
    ||||||||| ||||   ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  15146105 cagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggt 15146204  T
Q  150 ttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgt 249  Q
     | | | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||  |||||| |||||||||    
T  15146205 cttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgt 15146304  T
Q  250 ttg 252  Q
    |||    
T  15146305 ttg 15146307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957371
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14957545  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  14957544 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 14957445  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||  | || |||   ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14957444 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaatt 14957371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9591454 - 9591238
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   | ||    
T  9591454 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 9591355  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  9591354 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 9591255  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| | |||||||    
T  9591254 gtttggtcgtgattttg 9591238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 44788531 - 44788763
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  44788531 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 44788630  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  44788631 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 44788730  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  44788731 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 44788763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 11550282 - 11550514
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || | ||||  | |   ||||    
T  11550282 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgg 11550381  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  11550382 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 11550481  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  11550482 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 11550514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14335486 - 14335254
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14335486 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14335387  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  14335386 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 14335287  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  14335286 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 14335254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8710695 - 8710489
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  8710695 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8710596  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  8710595 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 8710496  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  8710495 gtttggt 8710489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18180833 - 18180601
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18180833 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18180734  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||    
T  18180733 gtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18180634  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  18180633 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 18180601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 11234393 - 11234599
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  11234393 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 11234492  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  11234493 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11234592  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  11234593 gtttggt 11234599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13689131 - 13688925
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||  | |   ||||    
T  13689131 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgg 13689032  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  13689031 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 13688932  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  13688931 gtttggt 13688925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 18587351 - 18587557
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18587351 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18587450  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  18587451 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18587550  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  18587551 gtttggt 18587557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042581
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  || |||||| | |||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14042586  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  14042585 gtttg 14042581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352611
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  || |||||| | |||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14352616  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  14352615 gtttg 14352611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703867
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17703734  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  17703735 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17703834  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  17703835 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 17703867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 15158237 - 15158443
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  15158237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15158336  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  15158337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15158436  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  15158437 gtttggt 15158443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200906
Alignment:
Q  159 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 258  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 8200928  T
Q  259 attttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||   | |||||||||||    
T  8200927 attttgaaatggatttagtttg 8200906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12690591 - 12690360
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  12690591 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12690493  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  12690492 gtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 12690393  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  12690392 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 12690360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15627661 - 15627377
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||  | || | |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15627661 aagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatac 15627562  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||  || | ||||||  || ||||||| | | | | ||   |||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  15627561 tggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaag 15627462  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgc 285  Q
    ||||| || ||||||||| | || ||| | |||||| || |  | ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| ||||    
T  15627461 ggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgc 15627377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873548
Alignment:
Q  166 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgt 265  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||     
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T
Q  266 ggttgatttagtttg 280  Q
      | |||||||||||    
T  10873562 aatggatttagtttg 10873548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826924
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 7826924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459057
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Original strand, 16726621 - 16726698
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 125  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||    
T  16726621 atcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgct 16726698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105020
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27105020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173305
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27173305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 74
Target Start/End: Original strand, 12712816 - 12712847
Alignment:
Q  43 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712816 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 12712847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14207388 - 14207343
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14207388 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14207343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14216078 - 14216033
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14216078 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14216033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 114
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38392
Alignment:
Q  78 cctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38356 cctttaattgctattatagatactggagctacgcatt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 67235 - 67555
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67235 aagtgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatac 67334  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  || |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67335 tggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 67434  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  67435 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatgg 67534  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  67535 acgttattttcgggatgaatt 67555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 19716681 - 19717001
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716681 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 19716780  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716781 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 19716880  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19716881 ggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatgg 19716980  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  19716981 atgttatttttggaatgaatt 19717001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20848366 - 20848067
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20848366 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 20848267  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20848266 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 20848167  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  ||||||||||    
T  20848166 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 23097684 - 23098000
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23097684 gtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttataagaggtacttgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 23097783  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23097784 gtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaaggg 23097883  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | || |||  ||||||||||    
T  23097884 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggat 23097983  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| || |||||    
T  23097984 gtcatttttggaatgaa 23098000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23274372 - 23274056
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23274372 aagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 23274273  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23274272 cggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 23274173  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||| ||||    
T  23274172 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatgg 23274073  T
Q  301 atgttattttcgggatg 317  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23274072 atgttatttttgggatg 23274056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12577132 - 12576812
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12577132 aagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgcctcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacac 12577033  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12577032 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 12576933  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || ||||| || || || ||| |||| ||||    
T  12576932 ggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatgg 12576833  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  12576832 atgttatttttgggatgaatt 12576812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23113499 - 23113184
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |   || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23113499 gtgtttgcattgactggaacacaggcagttattgaggac-gacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 23113401  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | ||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23113400 gtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaaggg 23113301  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  23113300 ttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggat 23113201  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  23113200 gtaatctttgggatgaa 23113184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 19721244 - 19721365
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19721244 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 19721343  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcatt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19721344 tggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 24817575 - 24817789
Alignment:
Q  72 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 171  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  24817575 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 24817674  T
Q  172 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttga 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24817675 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattga 24817774  T
Q  272 tttagtttgcttgcc 286  Q
    ||| ||||| |||||    
T  24817775 tttggtttgtttgcc 24817789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351654
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 11351521  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  11351522 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11351621  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  11351622 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 11351654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Original strand, 21322935 - 21323209
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    | |||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21322935 tttgcattgaccggtactcagaccgagaatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtg 21323034  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21323035 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21323134  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
     || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| | | | |||||||||||    
T  21323135 ggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttg 21323209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9338314 - 9338082
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  9338314 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9338215  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  9338214 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 9338115  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  9338114 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 9338082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9486948 - 9486716
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  9486948 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9486849  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  9486848 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 9486749  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  9486748 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 9486716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16983972 - 16983740
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16983972 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16983873  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16983872 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16983773  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16983772 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16983740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17001732 - 17001500
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17001732 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17001633  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  17001632 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17001533  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  17001532 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 17001500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074391
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23074496  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  23074495 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 23074396  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  23074395 gtttg 23074391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24678219 - 24677987
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  24678219 atcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 24678120  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  24678119 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 24678020  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||||| | | |||||||||||    
T  24678019 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttg 24677987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Original strand, 23105469 - 23105671
Alignment:
Q  78 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 177  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  23105469 cctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 23105568  T
Q  178 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagt 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | ||||||| | | ||||||||    
T  23105569 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 23105668  T
Q  278 ttg 280  Q
    |||    
T  23105669 ttg 23105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 22323053 - 22323285
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22323053 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22323152  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  22323153 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22323252  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  22323253 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 22323285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 24705193 - 24705425
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  24705193 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24705292  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||    
T  24705293 gtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctat 24705392  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  24705393 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 24705425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24712766 - 24712534
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24712766 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24712667  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  24712666 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24712567  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  24712566 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 24712534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 44383281 - 44383513
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  44383281 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgg 44383380  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  44383381 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 44383480  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  44383481 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 44383513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029404
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgag 23029390  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  23029391 atggatttagtttg 23029404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27220729 - 27220516
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27220729 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27220630  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27220629 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27220530  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  27220529 atggatttagtttg 27220516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220532
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||    
T  27220645 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 27220546  T
Q  251 tggtagagattttg 264  Q
    |||| | |||||||    
T  27220545 tggtcgtgattttg 27220532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 264
Target Start/End: Original strand, 45673710 - 45673939
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  45673710 tgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgt 45673809  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    | || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |    
T  45673810 gattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagat 45673909  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||| | | |||||||||||| | |||||||    
T  45673910 gtcttttgtctatgtttggtcgtgattttg 45673939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733689
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||  | |||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctat 22733684  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  22733685 gtttg 22733689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373795
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27373883  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 254  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  27373882 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 27373795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Original strand, 22742677 - 22742849
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  22742677 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 22742776  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 220  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22742777 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23064973
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23065046  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 220  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23065045 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 24657369 - 24657601
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  24657369 atcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24657468  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
     | | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  24657469 atcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 24657568  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  24657569 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 24657601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10871582 - 10871376
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10871582 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10871483  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||    
T  10871482 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctat 10871383  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  10871382 gtttggt 10871376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 290
Target Start/End: Original strand, 30208631 - 30208873
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | | |||| ||  || ||||    
T  30208631 atcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgg 30208730  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||   ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| || ||| || || || | ||||||| | || ||    
T  30208731 gtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgat 30208830  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattg 290  Q
    ||||| |||||||||||  || || ||||| || |||||||||    
T  30208831 gtttgatagagattttgcagtggacttagtctgtttgccattg 30208873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21142984
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 21142970  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  21142971 atggatttagtttg 21142984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 24874461 - 24874693
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24874461 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24874560  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||| | |||||    
T  24874561 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctat 24874660  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  24874661 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 24874693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24265102 - 24264896
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24265102 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24265003  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | | |||    
T  24265002 gtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttat 24264903  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  24264902 gtttggt 24264896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23205046 - 23204814
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |  ||||| |  | |||| || |   ||||    
T  23205046 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgg 23204947  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || | | | |||||| | |||||    
T  23204946 gtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctat 23204847  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    |  |||| | ||||||||  | |||||||||||    
T  23204846 ggatggtcgtgattttgtaatggatttagtttg 23204814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19817592 - 19817502
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 125  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19817592 tgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattgct 19817502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279239
Alignment:
Q  213 acttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcg 312  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||| |||||||||||||| |    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttg 23279244  T
Q  313 ggatg 317  Q
    |||||    
T  23279243 ggatg 23279239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  46 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606302
Alignment:
Q  159 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 254  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcct-tgtctatgtttggt 41606302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  45 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23676650 - 23676583
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 115  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23676650 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25131320 - 25131275
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25131320 aatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 25131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 52988933 - 52988615
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52988933 gtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 52988834  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988833 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 52988734  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  52988733 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 52988634  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  52988633 gttatctttggtatgaatt 52988615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48426065 - 48425747
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48426065 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 48425966  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425965 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 48425866  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  48425865 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 48425766  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  48425765 gttatctttggtatgaatt 48425747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 38910027 - 38910342
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38910027 tttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 38910126  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38910127 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 38910226  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||     
T  38910227 agtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtg 38910326  T
Q  306 attttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || |||||||    
T  38910327 atttttggtatgaatt 38910342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 24096811 - 24097120
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24096811 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatac 24096910  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24096911 tagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 24097010  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24097011 ggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatgg 24097110  T
Q  301 atgttatttt 310  Q
    ||||||||||    
T  24097111 atgttatttt 24097120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37680241 - 37679923
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37680241 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 37680142  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680141 gtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 37680042  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  37680041 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 37679942  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  37679941 gttatctttggtatgaatt 37679923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 31537195 - 31537513
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31537195 gtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 31537294  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31537295 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 31537394  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||| |||||||||||    
T  31537395 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggat 31537494  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  31537495 gttatctttggtatgaatt 31537513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 35 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20297541 - 20297255
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20297541 tgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgt 20297442  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20297441 gcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggt 20297342  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || || || |||||||    
T  20297341 gtcctatatttatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaatt 20297255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19857468 - 19857150
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19857468 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatac 19857369  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857368 tggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 19857269  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| | |||||||    
T  19857268 ggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatgg 19857169  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  19857168 atgatatttttgggatgaa 19857150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Original strand, 21739243 - 21739550
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 111  Q
    |||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21739243 ttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactc 21739342  T
Q  112 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 211  Q
    |||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739343 attgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 21739442  T
Q  212 tacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttc 311  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  21739443 tacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaattttt 21739542  T
Q  312 gggatgaa 319  Q
    ||||||||    
T  21739543 gggatgaa 21739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 20833096 - 20833414
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  20833096 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacac 20833195  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20833196 tggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataag 20833295  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||| ||||    
T  20833296 ggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatgg 20833395  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20833396 atgttatttttgggatgaa 20833414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 321
Target Start/End: Original strand, 20853967 - 20854276
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 111  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20853967 ttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgc 20854066  T
Q  112 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 211  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20854067 attgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaac 20854166  T
Q  212 tacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttc 311  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||| ||| |||||||||||||||    
T  20854167 tacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttc 20854266  T
Q  312 gggatgaatt 321  Q
    ||||||||||    
T  20854267 gggatgaatt 20854276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 22015943 - 22016259
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22015943 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactg 22016042  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||| ||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22016043 gtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 22016142  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||| || || ||| |||||||||||    
T  22016143 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggat 22016242  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  22016243 gtaatttttgggatgaa 22016259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18710579 - 18710316
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18710579 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacac 18710480  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18710479 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 18710380  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  18710379 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 18710316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 20074908 - 20075126
Alignment:
Q  4 tgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20074908 tgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactgg 20075007  T
Q  104 tgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075008 tgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggt 20075107  T
Q  204 tcagtaactacttctcttg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20075108 tcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Original strand, 21742753 - 21743066
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21742753 tttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtg 21742852  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742853 ctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 21742952  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| || ||||| ||||||||| |||||||     
T  21742953 ggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtgtggatgtg 21743052  T
Q  306 attttcgggatgaa 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  21743053 atttttgggatgaa 21743066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200392
Alignment:
Q  157 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtag 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtag 12200457  T
Q  257 agattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12200456 agattttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaatt 12200392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16379210 - 16378978
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16379210 atcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16379111  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    ||   | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||    
T  16379110 gtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctat 16379011  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||||| | ||||||| |||||    
T  16379010 gtttggtcgtgattttgagattgatttggtttg 16378978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081851
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 20081718  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  20081719 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20081818  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||||| | | |||||||||||    
T  20081819 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttg 20081851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 22496499 - 22496705
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  22496499 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgg 22496598  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  22496599 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22496698  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  22496699 gtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 16347838 - 16348070
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16347838 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16347937  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16347938 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16348037  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16348038 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16348070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Original strand, 24785100 - 24785316
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   ||||    
T  24785100 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgg 24785199  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  24785200 gtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24785299  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| | |||||||    
T  24785300 gtttggtcgtgattttg 24785316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 51330735 - 51330967
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  51330735 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 51330834  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  51330835 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 51330934  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  51330935 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 51330967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 223  Q
    || | | | | ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 254
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388478
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 254  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 33388478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21833418 - 21833212
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |  | |||| || |   ||||    
T  21833418 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgg 21833319  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||    
T  21833318 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctat 21833219  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  21833218 gtttggt 21833212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21961216 - 21961135
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 87  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961216 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042490
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    |  | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17042457  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  17042458 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 17042490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21842328 - 21842072
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || | |||| || |   || |    
T  21842328 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttag 21842229  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||| | | |||||    
T  21842228 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctat 21842129  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||  |||| |||   |||||||||||    
T  21842128 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 21842072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19109484 - 19109278
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||   | | ||||||| |   |||     
T  19109484 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttga 19109385  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  19109384 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19109285  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  19109284 gtttggt 19109278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 281
Target Start/End: Original strand, 41350911 - 41351144
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  41350911 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41351010  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  41351011 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 41351110  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgc 281  Q
    |||| || | |||||||   | ||||||||||||    
T  41351111 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgc 41351144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 109
Target Start/End: Original strand, 21045372 - 21045428
Alignment:
Q  53 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 109  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21045372 aggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Original strand, 21228799 - 21228947
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  21228799 atcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 21228898  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 196  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21228899 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828701
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928104
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22401708 - 22401631
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 125  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22401708 atcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 103
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 103  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20528148 - 20528103
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20528148 aatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcatt 20528103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 23078211 - 23078531
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078211 aagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 23078310  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078311 tggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaag 23078410  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||||    
T  23078411 ggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatgg 23078510  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23078511 atgttatttttgggatgaatt 23078531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 14884297 - 14884617
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14884297 aagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatac 14884396  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14884397 tggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 14884496  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||| |||||||||    
T  14884497 ggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatgg 14884596  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||| || || |||||||    
T  14884597 atgttatctttggtatgaatt 14884617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20345339 - 20345024
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20345339 tttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 20345240  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20345239 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 20345140  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    | |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20345139 aataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctttgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtt 20345040  T
Q  306 attttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || |||||||    
T  20345039 atttttggaatgaatt 20345024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22505739 - 22505421
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22505739 gtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 22505640  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22505639 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 22505540  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  22505539 ttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattttgtggtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggat 22505440  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  22505439 gtgatttttggaatgaatt 22505421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25851129 - 25850814
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25851129 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtg 25851030  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25851029 ctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttc 25850930  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||    
T  25850929 agtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgtt 25850830  T
Q  306 attttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || |||||||    
T  25850829 atttttggaatgaatt 25850814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 23563476 - 23563792
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23563476 gtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactg 23563575  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563576 gtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 23563675  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || |||||| |||||||||||    
T  23563676 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggat 23563775  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23563776 gttatttttgggatgaa 23563792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20778964 - 20778655
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 111  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20778964 ttgactggtaatcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacac 20778865  T
Q  112 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 211  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20778864 attgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgac 20778765  T
Q  212 tacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttc 311  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||| ||| |||||||||||||||    
T  20778764 tacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttc 20778665  T
Q  312 gggatgaatt 321  Q
    ||||||||||    
T  20778664 gggatgaatt 20778655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20824515 - 20824195
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20824515 aagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 20824416  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20824415 tggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 20824316  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  | || |||| ||| ||||    
T  20824315 ggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatgg 20824216  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20824215 atgttattttcgggatgaatt 20824195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22465001 - 22464692
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 111  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22465001 ttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgc 22464902  T
Q  112 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 211  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22464901 attgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaac 22464802  T
Q  212 tacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttc 311  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||| ||| |||||||||||||||    
T  22464801 tacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttc 22464702  T
Q  312 gggatgaatt 321  Q
    ||||||||||    
T  22464701 gggatgaatt 22464692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 17266640 - 17266960
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17266640 aagtttttgctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 17266739  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||| |||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266740 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 17266839  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  17266840 ggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgg 17266939  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  17266940 atgttatttttgggatgaatt 17266960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 321
Target Start/End: Original strand, 28892259 - 28892568
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 111  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28892259 ttgactggtactcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgc 28892358  T
Q  112 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 211  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28892359 attgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaac 28892458  T
Q  212 tacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttc 311  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||  | || |||| ||| |||||||| || |||    
T  28892459 tacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttc 28892558  T
Q  312 gggatgaatt 321  Q
    ||||||||||    
T  28892559 gggatgaatt 28892568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 21983485 - 21983801
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21983485 gtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactg 21983584  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983585 gtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 21983684  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  21983685 ttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggat 21983784  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  21983785 gtaatctttgggatgaa 21983801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 21561333 - 21561649
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21561333 gtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactg 21561432  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||| | ||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21561433 gtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 21561532  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  21561533 ttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccattgacgggtgtggat 21561632  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  21561633 gtaatctttgggatgaa 21561649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21631705 - 21631924
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||    | |||||||||  | || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21631705 aagtgtttgctttgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatac 21631804  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| | ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21631805 tggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaag 21631904  T
Q  201 ggttcagtaactacttctct 220  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  21631905 ggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21882807 - 21882575
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  21882807 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21882708  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  21882707 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 21882608  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||||| | | |||||||||||    
T  21882607 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttg 21882575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429222
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | | ||||  ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||  | |||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctat 25429255  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||| | | ||||||| | ||||||| |||||    
T  25429254 gtttgatcgtgattttgagattgatttggtttg 25429222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16359535 - 16359303
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16359535 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16359436  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16359435 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16359336  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  16359335 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 16359303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736336
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctat 26736279  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | |||||||   ||||||| ||||| || || |||   |||||||||||    
T  26736280 gtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgt 26736336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34569527 - 34569295
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  34569527 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 34569428  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  34569427 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 34569328  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  34569327 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 34569295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40711813 - 40711581
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  40711813 atcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40711714  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  40711713 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 40711614  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  40711613 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 40711581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23474270 - 23474012
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||    | |||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  23474270 tttgcattgactggtatgcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtg 23474171  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| | | | |  |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23474170 ctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23474071  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
     || |||||||||||||| | ||  || |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  23474070 ggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 23474012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 29473426 - 29473632
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  29473426 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29473525  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  29473526 gtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 29473625  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  29473626 gtttggt 29473632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18782147 - 18781931
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18782147 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18782048  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||    
T  18782047 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 18781948  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| | |||||||    
T  18781947 gtttggtcgtgattttg 18781931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27521439 - 27521207
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27521439 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27521340  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  27521339 gtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27521240  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  27521239 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 27521207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 14997092 - 14997298
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||| || |   ||||    
T  14997092 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 14997191  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  14997192 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 14997291  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  14997292 gtttggt 14997298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 22330240 - 22330446
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22330240 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22330339  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  22330340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22330439  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  22330440 gtttggt 22330446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27613389 - 27613157
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27613389 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27613290  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  27613289 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27613190  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  27613189 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 27613157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41773875 - 41773643
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  41773875 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41773776  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||| || | |||||    
T  41773775 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctat 41773676  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  41773675 gtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttg 41773643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772787
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19772894  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  19772893 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19772794  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  19772793 gtttggt 19772787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 27682753 - 27682959
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27682753 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27682852  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  27682853 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27682952  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  27682953 gtttggt 27682959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 37288849 - 37289055
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  37288849 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 37288948  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||| |    
T  37288949 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtcttt 37289048  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  37289049 gtttggt 37289055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350720
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 22350853  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  22350852 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22350753  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  22350752 gtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttg 22350720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27666075
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27665942  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  27665943 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27666042  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  27666043 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 27666075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803398
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 20803412  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  20803411 atggatttagtttg 20803398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22137701 - 22137469
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22137701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22137602  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | | |||    
T  22137601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttat 22137502  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  22137501 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 22137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 149
Target Start/End: Original strand, 21332339 - 21332440
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21332339 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 21332438  T
Q  148 gt 149  Q
    ||    
T  21332439 gt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21410180 - 21409951
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  | | |||    
T  21410180 tgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattgttttattgctgctgattgt 21410081  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    | ||  || |||||| | ||| | ||   ||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || |||| |||||| || || |||| ||    
T  21410080 gtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctattaatggggaaatggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagttctctagtatgcttgaagt 21409981  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  21409980 gtcctttgttgatgtttggtagagattttg 21409951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23461004 - 23460832
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  23461004 atcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 23460905  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 220  Q
    || | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23460904 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 321
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21343040
Alignment:
Q  159 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 258  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| | |||||||||| | | |    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 21342977  T
Q  259 attttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||   | |||||||||||  | ||||||   ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  21342978 attttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaatt 21343040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20311755 - 20311667
Alignment:
Q  176 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || || |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  20311755 aatggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 20311667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23526084 - 23525952
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||| || |||||    
T  23526084 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgg 23525985  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 180  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||    
T  23525984 gtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 264
Target Start/End: Original strand, 21336762 - 21336863
Alignment:
Q  163 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattt 262  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| ||||| || |||| | | |||||||||||| | |||||    
T  21336762 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggtcgcgattt 21336861  T
Q  263 tg 264  Q
    ||    
T  21336862 tg 21336863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508633
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 23508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584159
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24584159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 636 - 318
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  636 gtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 537  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  536 gtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaaggg 437  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||     
T  436 ttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggag 337  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  336 gtgatttttggaatgaatt 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8791 - 8471
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8791 aagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 8692  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8691 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 8592  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  8591 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatgg 8492  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  8491 atgttatttttgggatgaatt 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 251799 - 251479
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  251799 aagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatac 251700  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  251699 tagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 251600  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  251599 ggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatgg 251500  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  251499 atgttatttttgggatgaatt 251479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 115
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 115  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11984 - 11666
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11984 gtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 11885  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11884 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 11785  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  11784 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 11685  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  11684 gtgatttttggtatgaatt 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11152 - 10834
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11152 gtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 11053  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||  | |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  11052 gtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaaggg 10953  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10952 ttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagggactttgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggtatggat 10853  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||| || |||||||    
T  10852 gttatttttggaatgaatt 10834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30109 - 29791
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30109 gtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 30010  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30009 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 29910  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  29909 ttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggat 29810  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || ||||| || |||||||    
T  29809 gtgatttttggaatgaatt 29791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 203558 - 203249
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  203558 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 203459  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203458 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 203359  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  203358 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgg 203259  T
Q  301 atgttatttt 310  Q
    | ||||||||    
T  203258 acgttatttt 203249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 424438 - 424266
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     | |||| || |   |||     
T  424438 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttga 424339  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 220  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  424338 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 263403 - 263083
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  263403 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 263304  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263303 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 263204  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  263203 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgg 263104  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    | |||||||| || |||||||    
T  263103 acgttatttttggaatgaatt 263083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 30453 - 30750
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  30453 aagtgtttgcattgactggtacgcagacaacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatat 30552  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30553 tggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaag 30652  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30653 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgggtat 30750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 39460 - 39780
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39460 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatac 39559  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39560 tggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 39659  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  39660 ggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgg 39759  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||| || || |||||||    
T  39760 atgttatctttggtatgaatt 39780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 319
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44872
Alignment:
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| | |||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggat 44855  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  44856 gttatttttgggatgaa 44872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5081 - 4839
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 111  Q
    |||||||||||||||||    | |||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  5081 ttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacac 4982  T
Q  112 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 211  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4981 attgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaac 4882  T
Q  212 tacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 254  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||| | ||| ||||||||    
T  4881 tacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggt 4839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14322
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | || | || |   ||||    
T  14554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgg 14455  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||| | |||||| | |||||    
T  14454 gtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctat 14355  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  14354 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 14322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18797702 - 18797382
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797702 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 18797603  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18797602 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaag 18797503  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| || || ||  || |||||||||    
T  18797502 ggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatgg 18797403  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  18797402 atgttatttttgggatgaatt 18797382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 10466117 - 10466437
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466117 aagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 10466216  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10466217 tgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 10466316  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  10466317 ggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtagggactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatgg 10466416  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  10466417 atgttatttttgggataaatt 10466437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 14377185 - 14377503
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14377185 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacac 14377284  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14377285 tggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaag 14377384  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||||||||||||| || |  || || |||||||| ||| | |||  ||||||||    
T  14377385 ggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagacttcgaagtcgacttagtttgtttgtcgttgatgggtatgg 14377484  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| || |||||    
T  14377485 atgttatttttggaatgaa 14377503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24367410 - 24367092
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24367410 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactg 24367311  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||   | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24367310 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagga 24367211  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||||    
T  24367210 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggat 24367111  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  24367110 gttatctttggtatgaatt 24367092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19456035 - 19455717
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456035 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 19455936  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19455935 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaag 19455836  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||||||||    
T  19455835 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgg 19455736  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  19455735 atgttatttttgggatgaa 19455717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19438012 - 19437696
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19438012 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 19437913  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19437912 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 19437813  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | | |||||||| |||||| ||||  || || |||||||| || || ||| | |||||||||    
T  19437812 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagagactttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggat 19437713  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  19437712 gttatttttgggatgaa 19437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15462348 - 15462028
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15462348 aagtatttgccttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 15462249  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15462248 tggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 15462149  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||| ||| ||||    
T  15462148 ggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatgg 15462049  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  15462048 atgttatcttcgggatgaatt 15462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 21567260 - 21567578
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  21567260 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacac 21567359  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21567360 tggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgggtttgattgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaag 21567459  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | || ||| |||||||||    
T  21567460 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatgg 21567559  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||| || |||||    
T  21567560 atgtcatttttggaatgaa 21567578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Original strand, 24515695 - 24516001
Alignment:
Q  13 tgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactca 112  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24515695 tgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactca 24515794  T
Q  113 ttgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  24515795 ttgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaact 24515894  T
Q  213 acttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcg 312  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| || || || ||| |||| |||||  ||||||| |    
T  24515895 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacgggaatggacattatttttg 24515994  T
Q  313 ggatgaa 319  Q
    |||||||    
T  24515995 ggatgaa 24516001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21474610 - 21474294
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474610 gtgtttgctttgactggtacgcaaacttctaatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 21474511  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| |||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474510 gtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaaggg 21474411  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||| | ||| |||||||||||    
T  21474410 ttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgtcgttgacgggtatggat 21474311  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  21474310 gtaatctttgggatgaa 21474294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19466180 - 19465971
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466180 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 19466081  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466080 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 19465981  T
Q  201 ggttcagtaa 210  Q
    ||||||||||    
T  19465980 ggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 34642855 - 34643175
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||  | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||    
T  34642855 aagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacac 34642954  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34642955 tggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaag 34643054  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||  |||||||||| || ||| |||| ||||    
T  34643055 ggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatgg 34643154  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  34643155 atgttatatttgggatgaatt 34643175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25770820 - 25770538
Alignment:
Q  37 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || | |||||    
T  25770820 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgc 25770721  T
Q  137 ttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgt 236  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25770720 ttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgt 25770621  T
Q  237 cctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||  | ||||||||||||||||| ||||  |||||  | || || ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  25770620 ccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 25770538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 319
Target Start/End: Original strand, 19486566 - 19486879
Alignment:
Q  4 tgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19486566 tgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactgg 19486665  T
Q  104 tgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 203  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||  | ||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19486666 tgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 19486765  T
Q  204 tcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatg 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||  || ||||||||||||    
T  19486766 ttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgcc--tgacgggtatggatg 19486863  T
Q  304 ttattttcgggatgaa 319  Q
    | || || ||||||||    
T  19486864 taatctttgggatgaa 19486879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081184
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23081289  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    |||| | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  23081288 gttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 23081189  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  23081188 gtttg 23081184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 255
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010977
Alignment:
Q  99 actggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcta 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  199 agggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggta 20010977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405464
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctat 18405459  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  18405460 gtttg 18405464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 286
Target Start/End: Original strand, 23085095 - 23085379
Alignment:
Q  2 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 101  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||    | |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  23085095 agtgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaact 23085194  T
Q  102 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 201  Q
    |||||||| |||||||| |||| | || | | ||||| |||||||||| |   | | ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23085195 ggtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagg 23085294  T
Q  202 gttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||    
T  23085295 gttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttgcc 23085379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Original strand, 5836502 - 5836776
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   || |||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  5836502 tttgctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 5836601  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||||||  |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5836602 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 5836701  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
     ||||||||  |||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  5836702 ggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 5836776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182899
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||| |    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgct 18182885  T
Q  251 tggtagagattttg 264  Q
    |||| |||||||||    
T  18182886 tggtcgagattttg 18182899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22436847 - 22436596
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  22436847 tgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 22436748  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    |||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |    
T  22436747 gcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaat 22436648  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
    || || | |||||||||||| | ||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  22436647 gttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcc 22436596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 286
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925194
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctat 16925155  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
    ||||||| | |||||||   | ||||||||||| |||||    
T  16925156 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcc 16925194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 29589755 - 29589987
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  29589755 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29589854  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  29589855 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 29589954  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  29589955 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 29589987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 277
Target Start/End: Original strand, 30678340 - 30678569
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| | |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  30678340 atcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgg 30678439  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| ||| |||| |  | || ||    
T  30678440 gtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgat 30678539  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagt 277  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  30678540 gtttggtcgagactttgaagttgatttagt 30678569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 2872118 - 2872324
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  2872118 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 2872217  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  2872218 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 2872317  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  2872318 gtttggt 2872324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16574855 - 16574649
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16574855 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16574756  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16574755 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16574656  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  16574655 gtttggt 16574649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 16620525 - 16620731
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16620525 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16620624  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  16620625 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16620724  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  16620725 gtttggt 16620731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559517
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 27559484  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  27559485 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 27559517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28312595 - 28312363
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  28312595 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgg 28312496  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||  |||||| | |||||    
T  28312495 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctat 28312396  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  28312395 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 28312363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867420
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||  | ||| | ||| ||||||| | |    
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatt 273  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| | | | ||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatt 19867427  T
Q  274 tagtttg 280  Q
    |||||||    
T  19867426 tagtttg 19867420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Original strand, 24293098 - 24293304
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  24293098 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24293197  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  24293198 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24293297  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  24293298 gtttggt 24293304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 28260513 - 28260745
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28260513 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28260612  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  28260613 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28260712  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  28260713 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 28260745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28285403 - 28285171
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28285403 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28285304  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  28285303 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28285204  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  28285203 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 28285171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 28339262 - 28339494
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28339262 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28339361  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  28339362 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28339461  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  28339462 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 28339494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27190382 - 27190169
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | || |||||    
T  27190382 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27190283  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| |||||| | |||||||      
T  27190282 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaa 27190183  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  27190182 atggatttagtttg 27190169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190185
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| ||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatt 27190199  T
Q  251 tggtagagattttg 264  Q
    |||| | |||||||    
T  27190198 tggtcgtgattttg 27190185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259055
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| ||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatt 27259041  T
Q  251 tggtagagattttg 264  Q
    |||| | |||||||    
T  27259042 tggtcgtgattttg 27259055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 280
Target Start/End: Original strand, 27258858 - 27259071
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | || |||||    
T  27258858 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27258957  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 266  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||| |||||| | |||||||      
T  27258958 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaa 27259057  T
Q  267 gttgatttagtttg 280  Q
     | |||||||||||    
T  27259058 atggatttagtttg 27259071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25115517 - 25115285
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   | ||    
T  25115517 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgg 25115418  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  25115417 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 25115318  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  25115317 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 25115285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 115
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829769
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 115  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379755
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647351
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16647351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16100959 - 16100914
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16100959 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 16100914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22298 - 21979
Alignment:
Q  2 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22298 agtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatact 22199  T
Q  102 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  22198 ggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagt 22099  T
Q  202 gttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  22098 gttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatgga 21999  T
Q  302 tgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  21998 tgttatttttggaatgaatt 21979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41910 - 41592
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41910 gtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactg 41811  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41810 gtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 41711  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  41710 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggat 41611  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||| || || |||||||    
T  41610 gttatctttggtatgaatt 41592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 65425 - 65745
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  65425 aagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacac 65524  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65525 tggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 65624  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  65625 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagagattttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgg 65724  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  65725 atgttatttttggaatgaatt 65745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10222
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9914 aagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgat-ataggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 10012  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10013 tggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 10112  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  10113 ggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgg 10212  T
Q  301 atgttatttt 310  Q
    | ||||||||    
T  10213 acgttatttt 10222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 53550 - 53870
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53550 aagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaac 53649  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53650 tggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttaggtttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 53749  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  53750 ggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatgg 53849  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  53850 atgttatttttggaatgaatt 53870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 760 - 442
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  760 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 661  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  660 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaag 561  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| | |||||||    
T  560 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatgg 461  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  460 atgttatttttgggatgaa 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 672 - 992
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  672 aagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 771  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  772 tggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaag 871  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||  | || ||| |||| ||||    
T  872 ggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatgg 971  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  972 atgtcatttttgggatgaatt 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10684
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctat 10717  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   |||||||||||||    
T  10716 gtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttg 10684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 64729 - 65049
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  64729 aagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 64828  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  64829 tggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaag 64928  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | |||||| |||||||||    
T  64929 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatgg 65028  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||| |||||| || |||||||    
T  65029 atgctatttttggaatgaatt 65049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 49307 - 49627
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49307 aagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 49406  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  49407 tggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaag 49506  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | |||||| |||||||||    
T  49507 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatgg 49606  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||| |||||| || |||||||    
T  49607 atgctatttttggaatgaatt 49627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 58341 - 58661
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  58341 aagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 58440  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  58441 tggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaag 58540  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | |||||| |||||||||    
T  58541 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatgg 58640  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||| |||||| || |||||||    
T  58641 atgctatttttggaatgaatt 58661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29799 - 29483
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29799 gtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 29700  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29699 gtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 29600  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||  ||| ||| || || ||| ||||||||||     
T  29599 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatggag 29500  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  29499 gtgatttttgggatgaa 29483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 94021 - 94341
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  94021 aagtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 94120  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94121 tggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 94220  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  | || |||| ||| ||||    
T  94221 ggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatgg 94320  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  94321 atgttattttcgggatgaatt 94341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 115739 - 115419
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| || || | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  115739 aagtgtttgccttggctggtatgcaaaccacaaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatac 115640  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| |||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  115639 tggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactaggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaag 115540  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||| || |||| ||||    
T  115539 ggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatgg 115440  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  115439 atgttatatttgggatgaatt 115419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 98712 - 99028
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98712 gtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 98811  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98812 gtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 98911  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  98912 ttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggat 99011  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  99012 gttatttttgggatgaa 99028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 176162 - 175847
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  || | | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176162 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaataaagaccgacttatcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactg 176064  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176063 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 175964  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  || ||| | || || ||||| ||| |||||||||||    
T  175963 ttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggat 175864  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  175863 gtaatctttgggatgaa 175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 1438 - 1756
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1438 aagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 1537  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1538 tggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 1637  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| | ||||| || || ||| |||||||||    
T  1638 ggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatgg 1737  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  1738 atgtaatttttgggatgaa 1756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7921 - 7603
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7921 aagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 7822  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7821 tggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 7722  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| | ||||| || || ||| |||||||||    
T  7721 ggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatgg 7622  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  7621 atgtaatttttgggatgaa 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20991 - 20673
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20991 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 20892  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20891 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 20792  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||| ||||    
T  20791 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatgg 20692  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20691 atgttatttttgggatgaa 20673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 614 - 934
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  614 aagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaac 713  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  714 tggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgggtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 813  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||  | ||||||||| ||||||| ||||  || || |||||| | || || ||| |||||||||    
T  814 ggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatgg 913  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  914 atgttatttttggaatgaatt 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 325884 - 325566
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  325884 aagtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacac 325785  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  325784 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 325685  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || || ||| |||| ||||    
T  325684 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatgg 325585  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  325584 atgttatttttgggatgaa 325566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Original strand, 200607 - 200913
Alignment:
Q  13 tgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactca 112  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  200607 tgactggtacgcagacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacaca 200706  T
Q  113 ttgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 212  Q
    ||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200707 ttgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaact 200806  T
Q  213 acttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcg 312  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||   | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| || || |    
T  200807 acttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttg 200906  T
Q  313 ggatgaa 319  Q
    |||||||    
T  200907 ggatgaa 200913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 5336 - 5654
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5336 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgc 5435  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5436 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 5535  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||||||||||||| |||   || || ||||| || || || ||| |||||||||    
T  5536 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtctgtttaccgttgacgggtatgg 5635  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  5636 atattatttttgggatgaa 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 981 - 1299
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  981 aagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 1080  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1081 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 1180  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || || ||| || | ||||    
T  1181 ggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgagaatgg 1280  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  1281 atgttatttttgggatgaa 1299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 151744 - 151426
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151744 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 151645  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151644 tagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 151545  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||||||  |||  || || |||||||| || |  ||| |||||||||    
T  151544 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatgg 151445  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  151444 atgttatttttgggatgaa 151426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23923
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| || | |||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctat 23906  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| |||||||||    
T  23907 gtttggtcgagattttg 23923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 118
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73841
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 73841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 118
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78222
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 78222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182054
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 182054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12132 - 11819
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12132 tttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcg 12033  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 11933  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||     
T  11932 agtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagatactttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgta 11833  T
Q  306 attttcgggatgaa 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  11832 atttttgggatgaa 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 9901 - 10217
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9901 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 10000  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10001 gtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 10100  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | || |||||  | ||||||||| ||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||||||||||    
T  10101 ttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggat 10200  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  10201 gttatttttgggatgaa 10217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24375
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctat 24318  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | ||||||  | ||||||| ||||| || || |||   |||||||||||    
T  24319 gtttgatcgtgattttaggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgt 24375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 63648 - 63964
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  63648 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactg 63747  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||| ||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63748 gtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 63847  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  63848 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggat 63947  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  63948 gtgatttttgggatgaa 63964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 8589 - 8852
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8589 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacac 8688  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689 tagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 8788  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  8789 ggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 8852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 18803 - 19066
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18803 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacac 18902  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18903 tagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 19002  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  19003 ggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 1401 - 1719
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1401 gtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 1500  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1501 gtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 1600  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| ||| |||||||||||    
T  1601 ttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggat 1700  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || || || ||||||||||    
T  1701 gtaatctttgggatgaatt 1719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7215 - 6897
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7215 aagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 7116  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7115 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 7016  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |||   || || ||||| || || || ||| |||| ||||    
T  7015 ggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatgg 6916  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  6915 atgttatttttgggatgaa 6897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 321
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28732
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28414 gtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 28513  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28514 gtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 28613  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| ||| |||||||||||    
T  28614 ttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggat 28713  T
Q  303 gttattttcgggatgaatt 321  Q
    || || || ||||||||||    
T  28714 gtaatctttgggatgaatt 28732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 41 - 321
Target Start/End: Original strand, 1 - 281
Alignment:
Q  41 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  || |||| |||    
T  1 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatat 100  T
Q  141 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtccta 240  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  101 aagttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtccta 200  T
Q  241 tatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  201 tatctatgtttgttagggactttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaatt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 50280 - 49964
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50280 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 50181  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50180 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaaggg 50081  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| | |||||||| || ||| |||||||||||    
T  50080 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggat 49981  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  49980 gtaatttttgggatgaa 49964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15280 - 14980
Alignment:
Q  21 acgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 120  Q
    ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15280 acgcaaaccactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 15181  T
Q  121 ttgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 220  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15180 ttgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctct 15081  T
Q  221 tgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaat 320  Q
     |||||| | ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||  || || |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  15080 agtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagattttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaat 14981  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  14980 t 14980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6031
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  6240 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtc 6141  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    |   | | ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||    
T  6140 ttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtt 6041  T
Q  251 tggtagagat 260  Q
    |||| |||||    
T  6040 tggtcgagat 6031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 45 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 979
Alignment:
Q  45 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  145 tgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatc 244  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtc 1054  T
Q  245 tatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1053 tatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 4976 - 5296
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4976 aagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacac 5075  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5076 tggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 5175  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | || ||| |||||||||    
T  5176 ggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatgg 5275  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  5276 atgttatttttggaatgaatt 5296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 310
Target Start/End: Original strand, 17614 - 17920
Alignment:
Q  4 tgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17614 tgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattgg 17713  T
Q  104 tgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggt 203  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17714 tgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggt 17813  T
Q  204 tcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatg 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||   |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | || ||| ||||||||||||    
T  17814 tcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatg 17913  T
Q  304 ttatttt 310  Q
    |||||||    
T  17914 ttatttt 17920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29702 - 29386
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29702 gtgtttgctctgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacta 29603  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29602 gtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 29503  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||| | || || ||||| ||| |||||||||||    
T  29502 ttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggat 29403  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || || || ||||||||    
T  29402 gtaatctttgggatgaa 29386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 1012 - 1328
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1012 gtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactg 1111  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||| |||||||| | || | |||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1112 gtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 1211  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||||||||||    
T  1212 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggat 1311  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| ||||||||    
T  1312 gttatttttgggatgaa 1328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 319
Target Start/End: Original strand, 1 - 300
Alignment:
Q  20 tacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttc 119  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1 tacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttc 100  T
Q  120 attgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 219  Q
    |||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 attgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 200  T
Q  220 ttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||| | || ||| |  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  201 ttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaa 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54224 - 53906
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54224 aagtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 54125  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54124 tggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaag 54025  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |||   || || ||||| || || || ||| |||| ||||    
T  54024 ggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacttttaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatgg 53925  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  53924 atgttatttttgggatgaa 53906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 164528 - 164846
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  164528 aagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 164627  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  164628 tggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaat 164727  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||   | |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| || || || ||| |||| || |    
T  164728 ggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctatgtttggtagggactttcaggtcgatttagtgtgtttaccgttgacgggaatag 164827  T
Q  301 atgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  164828 atgttatttttgggatgaa 164846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 47115 - 47360
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  47115 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtg 47214  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  47215 ctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttc 47313  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 252  Q
     || |||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||    
T  47314 ggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttg 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 30774 - 30931
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  30774 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 30873  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttga 231  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  30874 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 30931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 151979
Alignment:
Q  159 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||| | | |    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 152001  T
Q  259 attttgtggttgatttagtttg 280  Q
    |||||| | ||||||| |||||    
T  152000 attttgagattgatttggtttg 151979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37114 - 36798
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||| | ||||| |||||||| || |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114 gtgttttctttgaccggtacgcaaacaactaatgaagacagacttatcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 37015  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37014 gtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 36915  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| |||||||||||    
T  36914 ttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggat 36815  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    | |||||| ||||||||    
T  36814 gatatttttgggatgaa 36798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40235 - 39915
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40235 aagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 40136  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |  || |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40135 aggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggggttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 40036  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatgg 300  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | || ||| | |||||||    
T  40035 ggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatgg 39936  T
Q  301 atgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||| ||| || |||||||    
T  39935 atgttagttttggaatgaatt 39915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17778
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||  | | ||||||  ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || |  |  |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcct-tgtctat 17721  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | ||||||| | | |||||||||||||| || |||   |||||||||||    
T  17722 gtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgt 17778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42841 - 42557
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||    
T  42841 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgt 42742  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  42741 gcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggt 42642  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42641 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaa 42557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 280
Target Start/End: Original strand, 50506 - 50751
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||    
T  50506 tgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgt 50605  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    |||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||  |    
T  50606 gcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaat 50705  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||| | |||||||||||| | ||||||| | | |||||||||||    
T  50706 gtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttg 50751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 9354 - 9612
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9354 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacac 9453  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9454 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaag 9553  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  9554 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 9612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12870 - 12595
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  12870 tgaggaccaacttatcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 12771  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12770 gcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagtt 12671  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttatttt 310  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||   |  || | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  12670 gtccattgtctatgtttggtagagactttgaaatcaatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttt 12595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12003 - 11689
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  12003 gtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaccatg 11904  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |  |||  || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11903 gtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 11806  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| | || || ||||  |||||||||||||||    
T  11805 ttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggat 11706  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  11705 gtaatttttgggatgaa 11689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 70538 - 70229
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 111  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  70538 ttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactc 70439  T
Q  112 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 211  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  70438 attgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaac 70339  T
Q  212 tacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttc 311  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||  ||| ||| ||||||||||     
T  70338 tacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttattttt 70239  T
Q  312 gggatgaatt 321  Q
    ||||||||||    
T  70238 gggatgaatt 70229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 2123 - 2388
Alignment:
Q  45 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2123 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagt 2222  T
Q  145 tgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatc 244  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |  | ||    
T  2223 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtc 2322  T
Q  245 tatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttatttt 310  Q
    ||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || |  ||| | | |||||||||||||||    
T  2323 tatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttactgttgaccgctatggatgttatttt 2388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 43548 - 43864
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43548 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 43647  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648 gtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaaggg 43747  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| | ||||   | ||| |||| || ||||||||| |||||||| ||    
T  43748 tttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagatactttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaat 43847  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  43848 gtaatttttgggatgaa 43864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25090
Alignment:
Q  178 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagt 277  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  278 ttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||| || || ||| |||| ||||||||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgt 25090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 60 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60598
Alignment:
Q  60 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  160 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 60658  T
Q  260 ttttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
     ||||  || ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  60657 ctttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaa 60598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 70283 - 70079
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70283 gtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactg 70184  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70183 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 70084  T
Q  203 ttcag 207  Q
    |||||    
T  70083 ttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2730
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||| ||||||||||||     
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtt 2799  T
Q  251 tggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||||||||| ||||  || ||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2798 tggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaa 2730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 11872 - 11968
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11872 gtgtttgctttgactggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1896 - 1580
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1896 gtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 1797  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1796 gtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaaggg 1697  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| || ||||| ||  |||||||||||    
T  1696 ttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttaacgggtatggat 1597  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  1596 gtaatttttgggatgaa 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5719
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  | |||| |||||| || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5982 aagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatac 5883  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5882 tagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatg 5783  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  5782 ggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 5719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 41282 - 41452
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | | |||| ||  || ||||    
T  41282 atcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgg 41381  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 218  Q
    || | ||| | ||   |||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  41382 gtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5686 - 5608
Alignment:
Q  243 tctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5686 tctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaatt 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5745 - 5459
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | |    
T  5745 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttat 5646  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  5645 gcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgactt 5546  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||  || |||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  5545 gtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaatt 5459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 944 - 1205
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  944 gtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacacta 1043  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1044 gtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 1143  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || |||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  1144 ttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 6389 - 6606
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6389 tttgctttgactggtacacagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 6488  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6489 ctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttc 6588  T
Q  206 agtaactacttctcttgt 223  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  6589 agtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5353 - 5040
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5353 tttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtg 5254  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5253 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttc 5154  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgtt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || |||||  | || |||||||||||||| ||||  || ||| | ||||| || || ||| |||||||||||||     
T  5153 agtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgta 5054  T
Q  306 attttcgggatgaa 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  5053 atttttgggatgaa 5040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Original strand, 4250 - 4519
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  4250 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 4349  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || |||||||||||| || || | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4350 gcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagtt 4449  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| | || || ||||| ||| ||||| |||||||    
T  4450 gtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgt 4519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34512 - 34196
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34512 gtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactg 34413  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34412 gtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaaggg 34313  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggat 302  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||  || ||  ||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  34312 ttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaaagactttgaagtcgacctagtttgtttatcgttgacgggtatggat 34213  T
Q  303 gttattttcgggatgaa 319  Q
    || ||||| ||||||||    
T  34212 gtaatttttgggatgaa 34196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 264
Target Start/End: Original strand, 20689 - 20918
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  20689 tgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 20788  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20789 gcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 20888  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  20889 gtccgttgtctatgtttggtagagactttg 20918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 264
Target Start/End: Original strand, 12509 - 12738
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  12509 tgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 12608  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    || ||||| |||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12609 gcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggt 12708  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  12709 gtccgttgtctatgtttggtagagactttg 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 4433 - 4660
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4433 gtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactg 4532  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4533 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 4632  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttg 230  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  4633 ttcagtaactacttctctagtatgtttg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110469
Alignment:
Q  61 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  161 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagat 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||     
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagac 110528  T
Q  261 tttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    ||||  ||  |  ||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  110527 tttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 110469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 9150 - 9333
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9150 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 9249  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9250 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 83 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21708
Alignment:
Q  83 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 182  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  183 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtagggattttgaggtagacttagtttgtt 21747  T
Q  283 tgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    | ||  || |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21746 taccgctgacgggaatggatgttatttttgggattaatt 21708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 319
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49322
Alignment:
Q  83 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  183 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgct 282  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |  |    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatatt 49285  T
Q  283 tgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49286 tgccgttgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaa 49322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 19096 - 19262
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19096 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatac 19195  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19196 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 4021 - 4274
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||    
T  4021 gtgtttgcattgaccggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctattattgacactg 4117  T
Q  103 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| | ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4118 gtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 4217  T
Q  203 ttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||   | |||||||||||||||||    
T  4218 ttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagaga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 220
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8125
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| || | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 220  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26160 - 25969
Alignment:
Q  130 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 229  Q
    ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26160 aatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgttt 26061  T
Q  230 gaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
     ||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26060 aaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaatt 25969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 321
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3617
Alignment:
Q  154 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttgg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3450 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttgg 3549  T
Q  254 tagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    ||| |||||||  || || ||||||||||| ||| || | || |||||||| || || ||||||||||    
T  3550 tagggattttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaatt 3617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 1975 - 2125
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1975 aagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacac 2074  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||    
T  2075 tggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggttt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 23459 - 23710
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| || |  ||    
T  23459 tgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagt 23558  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    |||| |||||||||| | | | | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |    
T  23559 gcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagat 23658  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  23659 gtcatttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcc 23710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9763
Alignment:
Q  72 agtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaag 171  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  9549 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 9648  T
Q  172 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttga 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9649 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattga 9748  T
Q  272 tttagtttgcttgcc 286  Q
    ||| ||||| |||||    
T  9749 tttggtttgtttgcc 9763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15391
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15310  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
     || ||||||||| | || ||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  15311 ggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattgatttggtttgtttgcc 15391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 1614 - 1707
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1614 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4360
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 4365  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  4364 gtttg 4360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 194  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8540 - 8336
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  8540 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 8441  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||    
T  8440 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctat 8341  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  8340 gtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7003 - 6787
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7003 atcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 6904  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  6903 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 6804  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| |||||||||    
T  6803 gtttggtcgagattttg 6787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14133 - 13917
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14133 atcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 14034  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  14033 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 13934  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13933 gtttggtcgagattttg 13917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36412
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 36429  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| | |||||||    
T  36428 gtttggtcgtgattttg 36412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5265 - 4986
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    | | |||||||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5265 aagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatac 5166  T
Q  101 tggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaag 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | || | ||||||| |||||||||| | ||| | |   ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  5165 tggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaag 5066  T
Q  201 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||||| | || ||||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  5065 ggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttg 4986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1734 - 1832
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1734 aagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 14398 - 14656
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||    | |||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  14398 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtg 14497  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14498 ctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14597  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
     || |||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  14598 ggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttg 14656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2142 - 1888
Alignment:
Q  35 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgt 134  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  | | |||    
T  2142 tgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgt 2043  T
Q  135 gcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggt 234  Q
    |||  |||||||||| |  || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || || |||| ||    
T  2042 gctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagt 1943  T
Q  235 gtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccatt 289  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||||  ||  | ||||| |||||||||||    
T  1942 gtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtgaacttagtctgcttgccatt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17792
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| | ||||||||||     
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 17806  T
Q  251 tggtagagattttg 264  Q
    |||| |||| ||||    
T  17805 tggtcgagactttg 17792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111262
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 229  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgttt 111262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 263
Target Start/End: Original strand, 216552 - 216809
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||    | |||||| | | | ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  216552 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtg 216651  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| |||| |||| | ||| |||  ||||| ||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  216652 ctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttc 216751  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 263  Q
     || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  216752 ggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagatttt 216809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10564
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || ||  | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10531  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||||| | | |||||||||||    
T  10532 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttg 10564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 2437 - 2693
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  | ||||||||  ||||||||    
T  2437 atcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgg 2536  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  2537 gtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 2636  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | ||||||| | | ||||| ||||| || || |||   |||||||||||    
T  2637 gtttgatcgtgattttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgt 2693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 13653 - 13885
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13653 atcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgg 13752  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || || |||||  | |||||    
T  13753 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctat 13852  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| ||||||||    |||||||||||||    
T  13853 gtttggtcgagattttaaaattgatttagtttg 13885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29334
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 29301  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  29302 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 29334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Original strand, 57788 - 58004
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||| |    
T  57788 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttag 57887  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  57888 gtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 57987  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| |||||||||    
T  57988 gtttggtcgagattttg 58004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17472
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 17439  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  17440 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 17472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24219
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| | || | |||| ||  || |||| |     
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||| ||||||| | || |||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtt 24234  T
Q  251 tggtagagattttgt 265  Q
    |||||||||||||||    
T  24233 tggtagagattttgt 24219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Original strand, 195038 - 195217
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  |||    
T  195038 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 195137  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttgg 253  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||    
T  195138 gagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttgg 195217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 55602 - 55848
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55602 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 55701  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55702 ctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 55801  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 252  Q
     || |||||||||||||| || || || |||||| | ||||||||||    
T  55802 ggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttg 55848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1858
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 1920  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattt 309  Q
    ||||| | | ||||||| | ||||| | ||||| || || |||   ||||||||| ||||||    
T  1919 gtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagcggtatggatnttattt 1858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15336
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15582 tttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtg 15483  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||            ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15482 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttc 15395  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
     || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||| | ||||| |||||||||    
T  15394 ggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttg 15336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 552 - 808
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 751  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | ||||||| | ||||| | ||||| || || |||   |||||||||||    
T  752 gtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatggatgt 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22377 - 22145
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22377 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22278  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  22277 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22178  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  22177 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 22145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 1006 - 1125
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||     
T  1006 gtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacagacttatcagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacacta 1105  T
Q  103 gtgctactcattgtttcatt 122  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  1106 gtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 304
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25142
Alignment:
Q  78 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 177  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  |||||  ||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  178 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagt 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| | | ||||||| | | ||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 25115  T
Q  278 ttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||| || || |||   |||||||||||    
T  25116 ttgtttacctttgagtggtatggatgt 25142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1192
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40862
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 229  Q
    || | ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 40862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 104354 - 104153
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||     
T  104354 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtc 104255  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
      ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||    
T  104254 ctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 104155  T
Q  251 tg 252  Q
    ||    
T  104154 tg 104153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 932 - 1020
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  932 gtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1259 - 1078
Alignment:
Q  130 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 229  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |    
T  1259 aatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggt--------tacttctcttgtttgtct 1168  T
Q  230 gaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaa 319  Q
     || ||||   | ||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1167 aagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 1078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11258
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  11054 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 11153  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  11154 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 11253  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  11254 gtttg 11258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8117
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||  |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8112  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  8113 gtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14033
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 168  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  |||||||||| | | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  169 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 229  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgttt 14033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11293
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  148 gt 149  Q
    ||    
T  11294 gt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8149
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    |  | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8154  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  8153 gtttg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 54767 - 54511
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  54767 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 54668  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || |  |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  54667 gtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctat 54568  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | ||||||| | | ||||||||||| || || |||   |||||||||||    
T  54567 gtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgt 54511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31781
Alignment:
Q  49 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 148  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 31913  T
Q  149 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatg 248  Q
    | | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||    
T  31912 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatg 31813  T
Q  249 tttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    |||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  31812 tttggtcgtgattttgatatggatttagtttg 31781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10644
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || |  | |||| || |   ||||    
T  10412 atcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgg 10511  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||    
T  10512 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactat 10611  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  10612 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37247
Alignment:
Q  49 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 148  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 37379  T
Q  149 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatg 248  Q
    | | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||  |||||| | ||||||    
T  37378 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatg 37279  T
Q  249 tttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    |||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  37278 tttggtcgtgattttgatatggatttagtttg 37247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 13067 - 13299
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||   |||  | |||| || |   ||||    
T  13067 atcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgg 13166  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| || ||||    
T  13167 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactat 13266  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  13267 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 13299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26528 - 26244
Alignment:
Q  2 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 101  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    | |||||| ||| | || |||||||  ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |    
T  26528 agtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatatt 26429  T
Q  102 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 201  Q
    |||||||| || ||||| |||| | || | ||||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26428 ggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagg 26329  T
Q  202 gttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| ||||| |||||    
T  26328 gttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttgcc 26244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 254
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37200
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||||| |||    
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggt 254  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggt 37200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9077 - 8824
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  9077 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatttt---attgcttattattgtgctactaagttgg 8981  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||    
T  8980 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8881  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
    ||||| | | ||||||| | | ||||||||||| || || |||   |||||||||||    
T  8880 gtttgattgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgt 8824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17851
Alignment:
Q  50 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 149  Q
    |||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   | | |||| || |   ||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  150 ttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgt 249  Q
     | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgt 17866  T
Q  250 ttggtagagattttg 264  Q
    ||||| | |||||||    
T  17865 ttggtcgtgattttg 17851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11599 - 11383
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   | | |||| || |   |||     
T  11599 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttga 11500  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||    
T  11499 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11400  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| | |||||||    
T  11399 gtttggtcgtgattttg 11383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53641
Alignment:
Q  186 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 264  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttg 53641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 55134 - 55058
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 124  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  55134 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 51826 - 51716
Alignment:
Q  3 gtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 102  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51826 gtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactc 51727  T
Q  103 gtgctactcat 113  Q
    |||||||||||    
T  51726 gtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1438
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| |  | | || || ||  ||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  1306 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 1405  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||||| | | |||||||||||    
T  1406 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttg 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10498 - 10266
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  10498 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10399  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  10398 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10299  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  10298 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 10266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41558
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||    
T  41662 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 41563  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  41562 gtttg 41558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75278
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||    
T  75382 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 75283  T
Q  248 gtttg 252  Q
    |||||    
T  75282 gtttg 75278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35121
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatt 273  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||   | ||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 35114  T
Q  274 tagtttg 280  Q
    |||||||    
T  35115 tagtttg 35121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3723 - 3524
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3723 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtg 3624  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3623 ctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7366 - 7183
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  7366 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 7267  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttga 231  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  7266 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 7183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3554 - 3348
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  3554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 3455  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  3454 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 3355  T
Q  248 gtttggt 254  Q
    |||||||    
T  3354 gtttggt 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17058
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctat 17091  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    |||| || | |||||||   | |||||||||||    
T  17090 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttg 17058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 908
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 166  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  167 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 252  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || || || | ||||||| | ||||||||||    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttg 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14873
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  15041 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 14942  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 216  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14941 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 65
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  268 agaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 169  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  168 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtt 69  T
Q  251 tggt 254  Q
    ||||    
T  68 tggt 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4509
Alignment:
Q  70 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 169  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  170 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 252  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||  ||||| | ||||||||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttg 4509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18822 - 18524
Alignment:
Q  6 tttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||    
T  18822 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtg 18723  T
Q  106 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 205  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18722 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18623  T
Q  206 agtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgt 304  Q
     || ||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||| | | |||||||   ||||||| ||||| || || |||   |||||||||||    
T  18622 ggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgt 18524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 264
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11746
Alignment:
Q  51 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 150  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 11632  T
Q  151 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 250  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  11633 ttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtt 11732  T
Q  251 tggtagagattttg 264  Q
    | || | |||||||    
T  11733 tagtcgtgattttg 11746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13530
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  13298 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 13397  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| | |||||| |||| ||    
T  13398 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaat 13497  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    | ||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  13498 ggttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 13530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41285 - 41053
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| |  | | || || |   ||||    
T  41285 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgg 41186  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||    
T  41185 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 41086  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | |||||||   | |||||||||||    
T  41085 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttg 41053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 144 - 1
Alignment:
Q  74 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 173  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | | ||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  144 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 45  T
Q  174 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 217  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21734 - 21502
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  21734 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21635  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  | |||| | |||||    
T  21634 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctat 21535  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||| | | | |||||||||||    
T  21534 gtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttg 21502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37158 - 36926
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  37158 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 37059  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||  | |||| | |||||    
T  37058 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctat 36959  T
Q  248 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttg 280  Q
    ||||||| | ||||| | | | |||||||||||    
T  36958 gtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttg 36926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12555
Alignment:
Q  163 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattt 262  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  263 tgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
    || | ||||| | |||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcc 12555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1446 - 1364
Alignment:
Q  12 ttgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 94  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1446 ttgactggtacacagactaccaacgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1355 - 1279
Alignment:
Q  245 tatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgccattgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  | || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1355 tatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaatt 1279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8388 - 8172
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | ||||  | |   || |    
T  8388 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttag 8289  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 247  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||   |||||  | |||||    
T  8288 gtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctat 8189  T
Q  248 gtttggtagagattttg 264  Q
    ||||||| | |||||||    
T  8188 gtttggtcgtgattttg 8172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 16736 - 16840
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16736 aagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatac 16835  T
Q  101 tggtg 105  Q
    |||||    
T  16836 tggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 286
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21597
Alignment:
Q  102 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||  | ||| | ||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  202 gttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgcttgcc 286  Q
    |||| || ||||||||||| || ||| ||| ||||||  | || ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtttgtttgcc 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 943 - 1125
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 147  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  943 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 1042  T
Q  148 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 230  Q
    || | | | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  1043 gtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 280
Target Start/End: Original strand, 674 - 886
Alignment:
Q  68 taatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatg 167  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  168 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgg 267  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || | ||  |||||| ||| |||||||||| | |||||||       
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaa 873  T
Q  268 ttgatttagtttg 280  Q
    | |||||||||||    
T  874 tggatttagtttg 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11204 - 11078
Alignment:
Q  2 agtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||    | |||||| ||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11204 agtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatact 11105  T
Q  102 ggtgctactcattgtttcattgctatt 128  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11104 ggtactactcattgttttattgctatt 11078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3527
Alignment:
Q  159 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttg 252  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 3527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 125
Target Start/End: Original strand, 15753 - 15830
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 125  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15753 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgct 15830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48719
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 124  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  48795 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 286
Target Start/End: Original strand, 83823 - 83933
Alignment:
Q  176 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgattta 275  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || |||| ||||||| | || |||||||||||||||||||  || || |||    
T  83823 aatggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggactta 83922  T
Q  276 gtttgcttgcc 286  Q
    || ||||||||    
T  83923 gtctgcttgcc 83933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2924
Alignment:
Q  48 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 118  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 114
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13571
Alignment:
Q  45 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 816 - 861
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5544
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26460
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 26460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35149
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 35149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24027
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8221
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90566
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 21071 - 21116
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21071 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 30647 - 30692
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  30647 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 30692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3556
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcat 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 2808 - 2754
Alignment:
Q  1 aagtgtttgcattgactggtacgcagactactactgaggaccgacttatcagagg 55  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  2808 aagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagagg 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2635
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4142
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4097 aatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 110
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7098
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctact 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7057 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctact 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 114
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5045
Alignment:
Q  69 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 114  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  67 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University