View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9450_low_20 (Length: 330)

Name: NF9450_low_20
Description: NF9450
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9450_low_20
NF9450_low_20
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (1-310)||(27283574-27283883)
chr6 (1-305)||(27209574-27209886)
chr6 (1-305)||(27239342-27239654)
chr6 (3-305)||(16756496-16756806)
chr6 (5-305)||(26927427-26927735)
chr6 (1-310)||(27622919-27623228)
chr6 (1-305)||(24298973-24299285)
chr6 (1-306)||(22928067-22928380)
chr6 (1-278)||(15405743-15406028)
chr6 (1-278)||(15417530-15417815)
chr6 (1-286)||(24870402-24870695)
chr6 (1-300)||(27025822-27026129)
chr6 (1-305)||(33369643-33369954)
chr6 (1-300)||(27031701-27032008)
chr6 (1-305)||(13292157-13292470)
chr6 (1-305)||(29556231-29556542)
chr6 (1-307)||(13517407-13517720)
chr6 (1-307)||(30551193-30551506)
chr6 (1-305)||(29508096-29508407)
chr6 (1-307)||(4538972-4539285)
chr6 (1-307)||(29579707-29580020)
chr6 (1-310)||(28214138-28214454)
chr6 (1-305)||(26792491-26792802)
chr6 (1-280)||(27200897-27201183)
chr6 (1-280)||(27248050-27248336)
chr6 (1-307)||(27491811-27492125)
chr6 (1-307)||(34457699-34458012)
chr6 (1-305)||(27014399-27014710)
chr6 (1-329)||(27355296-27355631)
chr6 (1-286)||(28167188-28167480)
chr6 (1-307)||(4531967-4532280)
chr6 (1-307)||(16937219-16937532)
chr6 (1-312)||(26109614-26109933)
chr6 (1-280)||(8898890-8899176)
chr6 (1-307)||(4779584-4779897)
chr6 (1-307)||(26665850-26666163)
chr6 (1-307)||(26771821-26772134)
chr6 (1-307)||(16680832-16681145)
chr6 (1-307)||(27064174-27064477)
chr6 (1-305)||(14138624-14138925)
chr6 (1-247)||(20131253-20131500)
chr6 (1-247)||(22201370-22201617)
chr6 (1-300)||(4764442-4764738)
chr6 (1-182)||(20175368-20175542)
chr6 (1-182)||(22160449-22160623)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (1-310)||(26508837-26509154)
chr7 (1-305)||(5154758-5155070)
chr7 (1-305)||(11417931-11418243)
chr7 (6-306)||(16443138-16443446)
chr7 (1-305)||(5165059-5165371)
chr7 (5-286)||(16048027-16048316)
chr7 (1-305)||(2161247-2161558)
chr7 (1-307)||(26678233-26678546)
chr7 (1-286)||(10848299-10848592)
chr7 (1-306)||(16511577-16511890)
chr7 (1-307)||(26663041-26663354)
chr7 (1-305)||(10910078-10910390)
chr7 (1-305)||(2779919-2780230)
chr7 (5-307)||(31083756-31084066)
chr7 (1-307)||(31557533-31557847)
chr7 (1-307)||(16744649-16744962)
chr7 (6-280)||(31130616-31130898)
chr7 (1-307)||(45393913-45394226)
chr7 (5-307)||(26441938-26442247)
chr7 (1-305)||(22148563-22148874)
chr7 (5-307)||(26596349-26596659)
chr7 (1-307)||(4138374-4138687)
chr7 (1-307)||(4206069-4206382)
chr7 (1-307)||(26519501-26519814)
chr7 (1-286)||(39206293-39206585)
chr7 (1-286)||(45737995-45738287)
chr7 (1-307)||(11447582-11447896)
chr7 (1-307)||(26312992-26313306)
chr7 (1-272)||(5140466-5140744)
chr7 (1-307)||(24585664-24585978)
chr7 (1-305)||(3451926-3452238)
chr7 (6-307)||(26268219-26268527)
chr7 (140-305)||(22152790-22152963)
chr7 (140-305)||(22208705-22208878)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (6-306)||(21696427-21696735)
chr2 (1-300)||(34268156-34268463)
chr2 (1-306)||(27397031-27397344)
chr2 (1-305)||(23117471-23117783)
chr2 (1-286)||(19449645-19449939)
chr2 (1-307)||(13929845-13930158)
chr2 (4-305)||(28888929-28889238)
chr2 (1-305)||(20844590-20844902)
chr2 (1-286)||(27427706-27428000)
chr2 (1-307)||(19409718-19410031)
chr2 (1-307)||(37679132-37679445)
chr2 (1-307)||(37694397-37694710)
chr2 (1-307)||(16822572-16822885)
chr2 (1-307)||(16898595-16898908)
chr2 (17-305)||(31868058-31868354)
chr2 (1-307)||(16168173-16168486)
chr2 (1-307)||(32056447-32056760)
chr2 (1-307)||(37932072-37932385)
chr2 (1-307)||(3789138-3789452)
chr2 (1-307)||(253886-254199)
chr2 (1-307)||(21670407-21670720)
chr2 (1-307)||(27810398-27810711)
chr2 (3-295)||(34297856-34298155)
chr2 (1-305)||(12662165-12662478)
chr2 (1-307)||(9343221-9343534)
chr2 (1-307)||(39045116-39045430)
chr2 (1-307)||(39896764-39897077)
chr2 (1-286)||(37384371-37384663)
chr2 (1-307)||(11628419-11628732)
chr2 (1-307)||(22921378-22921691)
chr2 (1-286)||(31882987-31883279)
chr2 (6-305)||(12709863-12710169)
chr2 (1-307)||(12593509-12593822)
chr2 (1-307)||(37945099-37945412)
chr2 (1-286)||(27123216-27123508)
chr2 (5-307)||(34161536-34161845)
chr2 (1-307)||(34868329-34868643)
chr2 (1-307)||(27782918-27783231)
chr2 (1-280)||(40240245-40240531)
chr2 (1-181)||(3790473-3790653)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (2-300)||(20333663-20333969)
chr1 (1-300)||(16201276-16201583)
chr1 (1-305)||(14692162-14692474)
chr1 (1-305)||(14694844-14695156)
chr1 (1-305)||(14697528-14697840)
chr1 (1-295)||(14700209-14700511)
chr1 (2-306)||(20467484-20467796)
chr1 (3-306)||(21890997-21891308)
chr1 (5-307)||(51644921-51645230)
chr1 (1-307)||(28591780-28592093)
chr1 (1-305)||(41786580-41786891)
chr1 (1-305)||(10969344-10969656)
chr1 (1-286)||(28156425-28156717)
chr1 (1-307)||(10951791-10952105)
chr1 (18-307)||(3647846-3648142)
chr1 (93-170)||(13769558-13769634)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-306)||(24585616-24585929)
chr4 (6-306)||(15234526-15234834)
chr4 (1-286)||(15275871-15276164)
chr4 (1-286)||(15379483-15379776)
chr4 (1-286)||(14671717-14672010)
chr4 (1-307)||(54840097-54840410)
chr4 (1-307)||(27156572-27156885)
chr4 (1-307)||(31119756-31120069)
chr4 (1-307)||(21976410-21976723)
chr4 (28-305)||(17019737-17020022)
chr4 (1-307)||(20331681-20331994)
chr4 (1-305)||(6576544-6576856)
chr4 (62-306)||(1906975-1907227)
chr4 (1-286)||(5701256-5701548)
chr4 (1-305)||(14752762-14753073)
chr4 (1-305)||(36323583-36323894)
chr4 (1-305)||(36337792-36338103)
chr4 (1-286)||(39857342-39857634)
chr4 (1-280)||(18793889-18794175)
chr4 (1-307)||(40098879-40099192)
chr4 (1-305)||(24119349-24119661)
chr4 (1-301)||(5012593-5012902)
chr4 (1-307)||(14105250-14105563)
chr4 (1-307)||(33667046-33667360)
chr4 (17-306)||(34182219-34182515)
chr4 (1-307)||(30760470-30760784)
chr4 (1-181)||(24814547-24814726)
chr4 (1-181)||(24813642-24813822)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (6-298)||(22895118-22895418)
chr5 (1-305)||(23726921-23727233)
chr5 (1-300)||(11556043-11556350)
chr5 (1-306)||(23898578-23898892)
chr5 (1-305)||(33784166-33784478)
chr5 (1-272)||(13179962-13180241)
chr5 (1-300)||(22992286-22992593)
chr5 (1-300)||(23632659-23632966)
chr5 (6-300)||(25206998-25207300)
chr5 (6-300)||(25271154-25271456)
chr5 (1-305)||(24608929-24609241)
chr5 (1-305)||(24976528-24976840)
chr5 (1-307)||(15752004-15752317)
chr5 (1-307)||(6880995-6881308)
chr5 (1-307)||(30036128-30036441)
chr5 (1-305)||(33299220-33299532)
chr5 (1-307)||(31819567-31819880)
chr5 (1-307)||(33523086-33523399)
chr5 (1-307)||(28952941-28953254)
chr5 (1-305)||(9543874-9544185)
chr5 (1-307)||(33881808-33882121)
chr5 (1-307)||(18493914-18494227)
chr5 (1-305)||(30941314-30941626)
chr5 (1-307)||(43084956-43085262)
chr5 (1-307)||(32589421-32589734)
chr5 (1-305)||(2517749-2518060)
chr5 (5-300)||(18121583-18121886)
chr5 (1-307)||(30158722-30159035)
chr5 (1-307)||(40466695-40467008)
chr5 (1-305)||(15651907-15652218)
chr5 (1-307)||(37351810-37352123)
chr5 (1-307)||(37761676-37761989)
chr5 (1-280)||(37745495-37745781)
chr5 (6-305)||(24730653-24730959)
chr5 (1-307)||(34623201-34623514)
chr5 (1-286)||(8658639-8658931)
chr5 (1-305)||(31438141-31438452)
chr5 (1-307)||(3796235-3796548)
chr5 (1-307)||(5644502-5644815)
chr5 (5-307)||(11330336-11330645)
chr5 (1-307)||(13435815-13436128)
chr5 (6-307)||(13317977-13318285)
chr5 (1-307)||(28655947-28656260)
chr5 (1-307)||(18368676-18368989)
chr5 (1-307)||(30175170-30175483)
chr5 (1-305)||(37664650-37664961)
chr5 (1-307)||(9324165-9324479)
chr5 (1-307)||(26487075-26487389)
chr5 (1-307)||(12138864-12139177)
chr5 (6-286)||(41681408-41681693)
chr5 (1-181)||(13178644-13178824)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (1-300)||(21341394-21341702)
chr8 (1-286)||(18797404-18797697)
chr8 (1-286)||(22074136-22074429)
chr8 (1-305)||(15774250-15774562)
chr8 (1-300)||(22139595-22139902)
chr8 (1-305)||(2130492-2130804)
chr8 (1-305)||(33249039-33249351)
chr8 (1-306)||(16260613-16260926)
chr8 (1-300)||(14569836-14570143)
chr8 (1-306)||(19654550-19654863)
chr8 (1-306)||(19694791-19695104)
chr8 (1-278)||(19910391-19910676)
chr8 (1-305)||(27602137-27602449)
chr8 (1-307)||(29836023-29836336)
chr8 (1-269)||(31361267-31361542)
chr8 (1-307)||(28355161-28355474)
chr8 (7-310)||(12085943-12086253)
chr8 (1-286)||(18716177-18716469)
chr8 (1-307)||(33265420-33265733)
chr8 (1-307)||(19201592-19201906)
chr8 (1-307)||(31483080-31483393)
chr8 (1-307)||(44567680-44567995)
chr8 (1-307)||(19681156-19681470)
chr8 (1-307)||(9361304-9361616)
chr8 (3-99)||(22389094-22389190)
chr8 (1-181)||(15775288-15775468)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-305)||(5658773-5659085)
chr3 (1-305)||(35887399-35887711)
chr3 (1-306)||(19701055-19701368)
chr3 (1-305)||(22380889-22381201)
chr3 (1-306)||(15367903-15368217)
chr3 (1-306)||(15886026-15886339)
chr3 (1-305)||(4789940-4790252)
chr3 (1-305)||(29142063-29142375)
chr3 (1-300)||(18337268-18337575)
chr3 (1-305)||(4728265-4728577)
chr3 (1-305)||(6208534-6208846)
chr3 (1-305)||(18057907-18058219)
chr3 (1-300)||(8282769-8283076)
chr3 (9-306)||(16422845-16423150)
chr3 (1-305)||(11103671-11103982)
chr3 (1-300)||(16617776-16618084)
chr3 (1-307)||(5020370-5020683)
chr3 (1-286)||(22041087-22041381)
chr3 (1-306)||(4690313-4690626)
chr3 (1-307)||(28109250-28109564)
chr3 (1-307)||(24334835-24335148)
chr3 (1-307)||(32297290-32297603)
chr3 (1-278)||(15734425-15734710)
chr3 (1-307)||(5717714-5718027)
chr3 (1-307)||(5728624-5728937)
chr3 (1-307)||(5763431-5763744)
chr3 (1-307)||(10649730-10650042)
chr3 (1-307)||(17978238-17978551)
chr3 (1-307)||(18231851-18232164)
chr3 (1-305)||(31029553-31029864)
chr3 (1-305)||(4630420-4630731)
chr3 (1-305)||(32445791-32446102)
chr3 (1-307)||(5589643-5589956)
chr3 (1-307)||(18249377-18249690)
chr3 (1-307)||(28345830-28346143)
chr3 (1-305)||(4339986-4340297)
chr3 (1-305)||(18285666-18285977)
chr3 (1-305)||(18300967-18301278)
chr3 (1-307)||(6536029-6536343)
chr3 (1-307)||(29658254-29658567)
chr3 (1-329)||(16404079-16404414)
chr3 (1-307)||(22864151-22864464)
chr3 (1-307)||(22879210-22879523)
chr3 (1-286)||(48472590-48472882)
chr3 (1-280)||(21681406-21681692)
chr3 (1-280)||(31957743-31958029)
chr3 (1-307)||(47030114-47030428)
chr3 (3-305)||(4423557-4423866)
chr3 (1-307)||(10402811-10403124)
chr3 (5-307)||(20570147-20570456)
chr3 (1-286)||(20072693-20072985)
chr3 (1-307)||(5602599-5602913)
chr3 (6-307)||(17970172-17970481)
chr3 (1-307)||(8218284-8218597)
chr3 (1-307)||(51788681-51788995)
chr3 (1-305)||(5473628-5473929)
chr3 (1-181)||(16599406-16599585)
chr3 (34-307)||(28027930-28028210)
chr3 (1-181)||(7080022-7080201)
chr3 (6-120)||(35221712-35221826)
chr3 (191-305)||(7079867-7079981)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-306)||(27992-28303)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (6-309)||(467-778)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-286)||(12769-13062)
scaffold0322 (1-307)||(2354-2667)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (1-305)||(3861-4173)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-286)||(25815-26108)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (13-300)||(8918-9214)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-305)||(24219-24531)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-305)||(33971-34283)
scaffold0143 (6-307)||(10615-10925)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-310)||(14636-14952)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-305)||(12715-13026)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-286)||(8187-8479)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (1-307)||(2422-2736)
scaffold0159 (1-105)||(23842-23948)
scaffold0159 (230-307)||(18505-18582)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-307)||(16273-16586)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-305)||(39858-40181)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (1-106)||(1309-1414)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (1-105)||(13221-13325)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (239-305)||(6741-6807)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 27283574 - 27283883
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27283574 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27283673  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctcttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283674 atgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctcttt 27283773  T
Q  201 ggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27283774 ggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacccgactggggataa 27283873  T
Q  301 cgccgttatg 310  Q
    ||||||||||    
T  27283874 cgccgttatg 27283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27209886 - 27209574
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27209886 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27209787  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       |||    
T  27209786 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaa 27209687  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  27209686 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27209587  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  27209586 gggaataatgccg 27209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 27239342 - 27239654
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27239342 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27239441  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       |||    
T  27239442 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaa 27239541  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  27239542 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27239641  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  27239642 gggaataatgccg 27239654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16756806 - 16756496
Alignment:
Q  3 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16756806 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 16756707  T
Q  103 gactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||    
T  16756706 gactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 16756607  T
Q  195 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  16756606 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 16756507  T
Q  295 ggataacgccg 305  Q
    | |||| ||||    
T  16756506 gaataatgccg 16756496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26927735 - 26927427
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26927735 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26927636  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  26927635 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26927536  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||     
T  26927535 ctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatcaactcgctggggatagaatctcgggagactctactggga 26927436  T
Q  297 ataacgccg 305  Q
    |||| ||||    
T  26927435 ataatgccg 26927427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 27622919 - 27623228
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27622919 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 27623018  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctt 199  Q
    |||||  |||| |||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623019 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctt 27623117  T
Q  200 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623118 tggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 27623217  T
Q  300 acgccgttatg 310  Q
    |||||||||||    
T  27623218 acgccgttatg 27623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 24298973 - 24299285
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24298973 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24299072  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  24299073 atgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24299172  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  24299173 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 24299272  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  24299273 gggaataatgccg 24299285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 22928067 - 22928380
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22928067 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatgc 22928166  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  22928167 atgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22928266  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22928267 tcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 22928366  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
     ||||||| |||||    
T  22928367 agggataatgccgt 22928380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 15405743 - 15406028
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15405743 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15405842  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  15405843 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15405942  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 278  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15405943 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 15417530 - 15417815
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15417530 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15417629  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  15417630 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15417729  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 278  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15417730 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24870695 - 24870402
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24870695 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24870596  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  24870595 atgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 24870496  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24870495 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27026129 - 27025822
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27026129 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 27026030  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  27026029 atgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 27025930  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  27025929 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27025830  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  27025829 gggaataa 27025822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 33369643 - 33369954
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33369643 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33369742  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33369743 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33369841  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  33369842 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 33369941  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  33369942 gggaataatgccg 33369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27032008 - 27031701
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27032008 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgc 27031909  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  27031908 atgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27031809  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  27031808 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactctact 27031709  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  27031708 gggaataa 27031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 13292157 - 13292470
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13292157 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 13292256  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13292257 atgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 13292356  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag-ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  13292357 tcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 13292456  T
Q  292 tggggataacgccg 305  Q
    |||| |||| ||||    
T  13292457 tgggaataatgccg 13292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29556542 - 29556231
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29556542 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29556443  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29556442 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29556344  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  29556343 tcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 29556244  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  29556243 gggaataatgccg 29556231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 13517407 - 13517720
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13517407 ttgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13517506  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13517507 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13517605  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13517606 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 13517705  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  13517706 ggggaaaatgccgtt 13517720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 30551193 - 30551506
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30551193 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30551292  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30551293 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30551391  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30551392 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 30551491  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  30551492 ggggaaaacgccgtt 30551506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29508407 - 29508096
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29508407 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29508308  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29508307 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29508209  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  29508208 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 29508109  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||||||||    
T  29508108 gggaataacgccg 29508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 4538972 - 4539285
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4538972 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4539071  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4539072 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4539170  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   |||    
T  4539171 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttact 4539270  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    |||||||| ||||||    
T  4539271 ggggataatgccgtt 4539285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29580020 - 29579707
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29580020 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29579921  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | ||||    
T  29579920 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaa 29579822  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29579821 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 29579722  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  29579721 ggggagaatgccgtt 29579707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28214454 - 28214138
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28214454 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28214355  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28214354 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28214256  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||    
T  28214255 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 28214156  T
Q  293 ggggataacgccgttatg 310  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28214155 ggggaaaacgccgttatg 28214138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26792802 - 26792491
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26792802 ttgacattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26792703  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26792702 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26792604  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  26792603 tcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 26792504  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    |||||||| ||||    
T  26792503 ggggataatgccg 26792491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27201183 - 27200897
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27201183 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27201084  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | ||||    
T  27201083 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaa 27200985  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27200984 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27200897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 27248050 - 27248336
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27248050 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27248149  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | ||||    
T  27248150 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaa 27248248  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27248249 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27248336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27492125 - 27491811
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27492125 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27492026  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | ||||    
T  27492025 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 27491927  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||    
T  27491926 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagacctcac 27491827  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
     ||||| |||||||||    
T  27491826 cggggaaaacgccgtt 27491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34458012
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | ||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagagtcttggaagacctgact 34457997  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  34457998 ggggaaaatgccgtt 34458012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27014710 - 27014399
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27014710 ttgacattggaaatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27014611  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27014610 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27014512  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  27014511 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctact 27014412  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  27014411 gggaataatgccg 27014399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 27355296 - 27355631
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27355296 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27355395  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27355396 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27355494  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||     
T  27355495 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcacc 27355594  T
Q  293 ggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctgg 329  Q
    ||||| ||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  27355595 ggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgg 27355631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28167480 - 28167188
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28167480 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28167381  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28167380 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28167282  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167281 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4532280 - 4531967
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4532280 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4532181  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |        || | ||||    
T  4532180 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacacattcttggaaa 4532082  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  4532081 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 4531982  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    |||||||| ||||||    
T  4531981 ggggataatgccgtt 4531967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 16937219 - 16937532
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16937219 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16937318  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  16937319 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 16937417  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||    
T  16937418 ttctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtgacttgctggggatagagtcttgagagactccact 16937517  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  16937518 ggggaaaacgccgtt 16937532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 26109614 - 26109933
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26109614 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26109713  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||    
T  26109714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaa 26109812  T
Q  193 tcctctttggagataacgccg-ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||    
T  26109813 tcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttac 26109912  T
Q  292 tggggataacgccgttatgat 312  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  26109913 tggggataatgccgttgtgat 26109933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 8898890 - 8899176
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8898890 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8898989  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  8898990 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 8899088  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  8899089 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 8899176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4779897 - 4779584
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4779897 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4779798  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4779797 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4779699  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  4779698 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 4779599  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  4779598 ggggaaaacgccgtt 4779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 26665850 - 26666163
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26665850 ttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 26665949  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26665950 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaa 26666048  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  26666049 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26666148  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  26666149 ggggaaaacgccgtt 26666163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 26771821 - 26772134
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26771821 ttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 26771920  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26771921 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaa 26772019  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  26772020 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26772119  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  26772120 ggggaaaacgccgtt 26772134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16681145 - 16680832
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16681145 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16681046  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |        || |    
T  16681045 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 16680947  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  16680946 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccacc 16680847  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  16680846 ggggaaaacgccgtt 16680832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27064477 - 27064174
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||          |||||||||||| |||||||||    
T  27064477 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatg----------catgtatgaatgcttgtaatgc 27064388  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27064387 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27064289  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27064288 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 27064189  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  27064188 ggggaaaacgccgtt 27064174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 14138624 - 14138925
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||    
T  14138624 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg----------tatgaatgcttgtaatgc 14138713  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  14138714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14138812  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14138813 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 14138912  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  14138913 gggaataatgccg 14138925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20131500 - 20131253
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  20131500 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgc 20131401  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    ||||  ||||||| |||||| | | ||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  20131400 atgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 20131308  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 247  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20131307 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 20131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 22201370 - 22201617
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  22201370 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgc 22201469  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    ||||  ||||||| |||||| | | ||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  22201470 atgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 22201562  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 247  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22201563 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 22201617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4764738 - 4764442
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||    
T  4764738 ttgacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg----------tatgaatgcttgtaatgc 4764649  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  4764648 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4764550  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  4764549 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 4764450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20175542 - 20175368
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  20175542 ttgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatgc 20175443  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 182  Q
    | ||  ||||| | |||||| | | |||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20175442 acgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 20175368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 22160449 - 22160623
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  22160449 ttgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatgc 22160548  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 182  Q
    | ||  ||||| | |||||| | | |||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22160549 acgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 22160623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 26508837 - 26509154
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26508837 ttgacattgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgc 26508936  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | ||||    
T  26508937 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaa 26509036  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26509037 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgact 26509136  T
Q  293 ggggataacgccgttatg 310  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26509137 ggggataacgccgttatg 26509154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5155070 - 5154758
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5155070 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5154971  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5154970 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5154871  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  5154870 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 5154771  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  5154770 gggaataatgccg 5154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 11417931 - 11418243
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417931 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11418030  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11418031 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 11418130  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  11418131 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 11418230  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  11418231 gggaataatgccg 11418243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 16443138 - 16443446
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16443138 attggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 16443237  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  16443238 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 16443337  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  16443338 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 16443437  T
Q  298 taacgccgt 306  Q
    ||| |||||    
T  16443438 taatgccgt 16443446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5165371 - 5165059
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5165371 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5165272  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5165271 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 5165172  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  5165171 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 5165072  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
     ||||||| ||||    
T  5165071 agggataatgccg 5165059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16048316 - 16048027
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  16048316 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatga 16048217  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  16048216 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 16048117  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16048116 ctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2161558 - 2161247
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2161558 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2161459  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2161458 atgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2161359  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  2161358 tcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcag-tagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 2161260  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  2161259 gggaataatgccg 2161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 26678233 - 26678546
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26678233 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26678332  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26678333 atgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26678431  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26678432 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26678531  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  26678532 ggggaaaatgccgtt 26678546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848299
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 10848493  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        | ||||    
T  10848492 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaa 10848393  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10848392 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 10848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16511577 - 16511890
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16511577 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16511676  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |        || | ||||    
T  16511677 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgtgctatattacacattcctggaaa 16511776  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  16511777 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 16511876  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  16511877 gggaataatgccgt 16511890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 26663041 - 26663354
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26663041 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26663140  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26663141 atgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26663239  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26663240 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26663339  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  26663340 ggggaaaatgccgtt 26663354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 10910078 - 10910390
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10910078 ttgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 10910177  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    | ||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  10910178 acgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 10910277  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  10910278 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 10910377  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  10910378 gggaataatgccg 10910390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2780230 - 2779919
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2780230 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2780131  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2780130 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 2780032  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  2780031 tcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 2779932  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  2779931 gggaataatgccg 2779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 31083756 - 31084066
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31083756 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 31083855  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    || |||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  31083856 ctattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 31083954  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggg 295  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || |||    
T  31083955 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggg 31084054  T
Q  296 gataacgccgtt 307  Q
    || |||||||||    
T  31084055 gaaaacgccgtt 31084066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 31557533 - 31557847
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31557533 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31557632  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | ||||    
T  31557633 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 31557731  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  31557732 tcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagactttac 31557831  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  31557832 tggggaaaacgccgtt 31557847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744962
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16744947  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  16744948 ggggaaaatgccgtt 16744962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31130898 - 31130616
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31130898 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 31130799  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    |||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  31130798 tgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 31130700  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31130699 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 31130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45394226 - 45393913
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45394226 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45394127  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |        || | | ||    
T  45394126 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaa 45394028  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  45394027 tcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 45393928  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  45393927 ggggaaaacgccgtt 45393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26442247 - 26441938
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26442247 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26442148  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  26442147 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26442049  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  26442048 ctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagaccccaccgggg 26441949  T
Q  297 ataacgccgtt 307  Q
    | |||||||||    
T  26441948 aaaacgccgtt 26441938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22148874 - 22148563
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22148874 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22148775  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22148774 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22148676  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||    
T  22148675 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctact 22148576  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  22148575 gggaataatgccg 22148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26596659 - 26596349
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26596659 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26596560  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | ||||||||    
T  26596559 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcct 26596461  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 295  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26596460 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggg 26596361  T
Q  296 gataacgccgtt 307  Q
    || || ||||||    
T  26596360 gaaaatgccgtt 26596349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138687
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 4138672  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  4138673 ggggaaaacgccgtt 4138687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4206382 - 4206069
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4206382 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4206283  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4206282 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 4206184  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  4206183 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 4206084  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  4206083 ggggaaaacgccgtt 4206069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26519814 - 26519501
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26519814 ttgacattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26519715  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26519714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26519616  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  26519615 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26519516  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  26519515 ggggaaaacgccgtt 26519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206585
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45738287 - 45737995
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45738287 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45738188  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  45738187 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 45738089  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45738088 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctggggatagaatcttgggagac 45737995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11447896 - 11447582
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11447896 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatg 11447797  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  11447796 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 11447698  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  11447697 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 11447598  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  11447597 tggggaaaacgccgtt 11447582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 26312992 - 26313306
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26312992 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26313091  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26313092 atgactattggcattttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26313190  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  26313191 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 26313290  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
     ||||| |||||||||    
T  26313291 cggggaaaacgccgtt 26313306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 5140466 - 5140744
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5140466 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5140565  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  5140566 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 5140664  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 272  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||    
T  5140665 tcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 24585664 - 24585978
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24585664 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 24585763  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||  | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  24585764 atgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 24585862  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  24585863 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 24585962  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  24585963 tggggaaaacgccgtt 24585978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3452238 - 3451926
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3452238 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 3452139  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 191  Q
    |||||  |||| |||||||||||||    ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  3452138 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 3452040  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  3452039 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 3451940  T
Q  292 tggggataacgccg 305  Q
    |||| |||| ||||    
T  3451939 tgggaataatgccg 3451926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 26268219 - 26268527
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26268219 attggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatga 26268318  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
      |||| |||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  26268319 tggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26268417  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  26268418 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgg-acctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggg 26268516  T
Q  297 ataacgccgtt 307  Q
    | |||||||||    
T  26268517 aaaacgccgtt 26268527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152790
Alignment:
Q  140 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  232 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 305  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22152790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208705
Alignment:
Q  140 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  232 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 305  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Original strand, 21696427 - 21696735
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21696427 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 21696526  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctc 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||    
T  21696527 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaatattacacattcctggaaatcctc 21696626  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  21696627 tttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggga 21696726  T
Q  298 taacgccgt 306  Q
    ||| |||||    
T  21696727 taatgccgt 21696735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 34268156 - 34268463
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34268156 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34268255  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  34268256 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaa 34268355  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  34268356 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 34268455  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||||||||    
T  34268456 ggggataa 34268463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27397344 - 27397031
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27397344 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27397245  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  27397244 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 27397145  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||    
T  27397144 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgct 27397045  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    |||||||| |||||    
T  27397044 ggggataatgccgt 27397031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23117783 - 23117471
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23117783 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgc 23117684  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  23117683 atgactgtttgcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 23117584  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  23117583 tcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 23117484  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  23117483 gggaataatgccg 23117471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 19449645 - 19449939
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19449645 ttgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 19449744  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        ||||||    
T  19449745 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttagaaa 19449844  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19449845 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 19449939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 13929845 - 13930158
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13929845 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13929944  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13929945 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13930043  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13930044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgact 13930143  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  13930144 ggggagaacgccgtt 13930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28889238 - 28888929
Alignment:
Q  4 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28889238 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatg 28889139  T
Q  104 actgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcc 195  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||    
T  28889138 actgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcc 28889039  T
Q  196 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 295  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  28889038 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 28888939  T
Q  296 gataacgccg 305  Q
     |||| ||||    
T  28888938 aataatgccg 28888929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20844902 - 20844590
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20844902 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20844803  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    | ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  20844802 acgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 20844703  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  20844702 tcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 20844603  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  20844602 gggaataatgccg 20844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 27427706 - 27428000
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27427706 ttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27427805  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  27427806 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 27427905  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaat-caacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27427906 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaacttgctggggacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 19409718 - 19410031
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19409718 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19409817  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19409818 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19409916  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19409917 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 19410016  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  19410017 ggggaaaacgccgtt 19410031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 37679132 - 37679445
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37679132 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37679231  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  37679232 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37679330  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37679331 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37679430  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  37679431 ggggaaaatgccgtt 37679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 37694397 - 37694710
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37694397 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37694496  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  37694497 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37694595  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37694596 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37694695  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  37694696 ggggaaaatgccgtt 37694710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 16822572 - 16822885
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16822572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16822671  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16822672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16822770  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16822771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16822870  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  16822871 ggggaaaacgccgtt 16822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16898908 - 16898595
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16898908 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16898809  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16898808 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16898710  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16898709 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16898610  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  16898609 ggggaaaacgccgtt 16898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Original strand, 31868058 - 31868354
Alignment:
Q  17 aatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgttggcagtt 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31868058 aatatgcatggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattt 31868157  T
Q  117 tgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |    
T  31868158 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatga 31868257  T
Q  209 cgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 305  Q
    || |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31868258 cgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaaacttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168173
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16168188  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  16168187 ggggaaaatgccgtt 16168173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32056760 - 32056447
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32056760 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32056661  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  32056660 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32056562  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32056561 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 32056462  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  32056461 ggggaaaacgccgtt 32056447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37932385 - 37932072
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37932385 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37932286  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37932285 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37932187  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932186 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 37932087  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  37932086 ggggaaaacgccgtt 37932072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3789452 - 3789138
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3789452 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 3789353  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  3789352 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 3789254  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789253 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgac 3789154  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  3789153 tggggaaaacgccgtt 3789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 253886 - 254199
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  253886 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 253985  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  253986 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 254084  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  254085 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 254184  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  254185 ggggaaaatgccgtt 254199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 21670407 - 21670720
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21670407 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21670506  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21670507 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21670605  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21670606 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 21670705  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  21670706 ggggaaaacgccgtt 21670720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810398
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27810413  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  27810412 ggggaaaatgccgtt 27810398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34298155 - 34297856
Alignment:
Q  3 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcat 102  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34298155 gacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 34298056  T
Q  103 gactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||    
T  34298055 gactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatc 34297957  T
Q  195 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  34297956 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 34297857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12662478 - 12662165
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12662478 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12662379  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  12662378 atgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 12662279  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||    
T  12662278 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 12662179  T
Q  292 tggggataacgccg 305  Q
    |||| |||| ||||    
T  12662178 tgggaataatgccg 12662165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343534
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | ||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 9343519  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  9343520 ggggaaaatgccgtt 9343534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045430
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaactttgctggagatagaatcttggaagacctgac 39045414  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| || ||||||    
T  39045415 tggggaaaatgccgtt 39045430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39897077 - 39896764
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39897077 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 39896978  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| |     ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  39896977 atgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39896879  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  39896878 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactttact 39896779  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  39896778 ggggaaaacgccgtt 39896764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37384663 - 37384371
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37384663 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37384564  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  37384563 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 37384465  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37384464 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 37384371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 11628419 - 11628732
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11628419 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11628518  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11628519 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 11628617  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  11628618 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 11628717  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  11628718 ggggaaaacgccgtt 11628732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 22921378 - 22921691
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22921378 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22921477  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22921478 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22921576  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  22921577 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 22921676  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  22921677 ggggaaaacgccgtt 22921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31883279 - 31882987
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31883279 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31883180  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31883179 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31883081  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883080 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 31882987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 305
Target Start/End: Original strand, 12709863 - 12710169
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12709863 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 12709962  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    |||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |||||||||    
T  12709963 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctc 12710061  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||    
T  12710062 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactgggga 12710161  T
Q  298 taacgccg 305  Q
    ||| ||||    
T  12710162 taatgccg 12710169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12593822 - 12593509
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12593822 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgc 12593723  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    |||||||||| |||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  12593722 atgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 12593624  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12593623 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 12593524  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  12593523 ggggaaaatgccgtt 12593509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 37945099 - 37945412
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37945099 ttgacattggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgc 37945198  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37945199 atgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37945297  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37945298 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37945397  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  37945398 ggggaaaatgccgtt 37945412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27123508 - 27123216
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27123508 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27123409  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27123408 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27123310  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123309 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34161845 - 34161536
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34161845 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatga 34161746  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcct 196  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||||||    
T  34161745 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcct 34161647  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||    
T  34161646 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccgggg 34161547  T
Q  297 ataacgccgtt 307  Q
    | |||||||||    
T  34161546 aaaacgccgtt 34161536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34868643 - 34868329
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34868643 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34868544  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  34868543 catgactgttggcattttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 34868445  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  34868444 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 34868345  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  34868344 tggggaaaacgccgtt 34868329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782918
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccact 27782933  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||| | |||||||||    
T  27782932 gggaaaaacgccgtt 27782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40240531 - 40240245
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40240531 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 40240432  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  40240431 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 40240333  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  40240332 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 40240245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3790653 - 3790473
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3790653 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 3790554  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 181  Q
    |||||  |||| |||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790553 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 20333663 - 20333969
Alignment:
Q  2 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20333663 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20333762  T
Q  102 tgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  20333763 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 20333862  T
Q  194 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||    
T  20333863 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctg 20333962  T
Q  294 gggataa 300  Q
    |||||||    
T  20333963 gggataa 20333969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 16201276 - 16201583
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16201276 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16201375  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | ||||    
T  16201376 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcctggaaa 16201475  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||    
T  16201476 tcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtagaatctcggaagactctact 16201575  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||||||||    
T  16201576 ggggataa 16201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 14692162 - 14692474
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14692162 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14692261  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14692262 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14692361  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14692362 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14692461  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  14692462 gggaataatgccg 14692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 14694844 - 14695156
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14694844 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14694943  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14694944 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14695043  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14695044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14695143  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  14695144 gggaataatgccg 14695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 14697528 - 14697840
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14697528 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14697627  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14697628 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14697727  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14697728 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14697827  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  14697828 gggaataatgccg 14697840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 14700209 - 14700511
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14700209 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14700308  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14700309 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14700408  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  14700409 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14700508  T
Q  293 ggg 295  Q
    |||    
T  14700509 ggg 14700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20467796 - 20467484
Alignment:
Q  2 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20467796 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20467697  T
Q  102 tgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  20467696 tgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaat 20467597  T
Q  194 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  20467596 cctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctg 20467497  T
Q  294 gggataacgccgt 306  Q
    ||||||| |||||    
T  20467496 gggataatgccgt 20467484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Original strand, 21890997 - 21891308
Alignment:
Q  3 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcat 102  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  21890997 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcac 21891096  T
Q  103 gactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 194  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||||    
T  21891097 gactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 21891196  T
Q  195 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  21891197 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 21891296  T
Q  295 ggataacgccgt 306  Q
    | |||| |||||    
T  21891297 gaataatgccgt 21891308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51645230 - 51644921
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51645230 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 51645131  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  51645130 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 51645032  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  51645031 ctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggg 51644932  T
Q  297 ataacgccgtt 307  Q
    | |||||||||    
T  51644931 aaaacgccgtt 51644921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28592093 - 28591780
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28592093 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28591994  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28591993 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28591895  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||| |||||||| |||||  |||| | |||    
T  28591894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatgtaacttgctagggatagagtcttgagagactccact 28591795  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  28591794 ggggaaaacgccgtt 28591780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 41786580 - 41786891
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41786580 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 41786679  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  41786680 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 41786778  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||    
T  41786779 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 41786878  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    |||||||| ||||    
T  41786879 ggggataatgccg 41786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10969656 - 10969344
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10969656 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10969557  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  10969556 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 10969458  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||    
T  10969457 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttac 10969358  T
Q  292 tggggataacgccg 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  10969357 tggggataatgccg 10969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28156717 - 28156425
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28156717 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28156618  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28156617 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28156519  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156518 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10952105 - 10951791
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10952105 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10952006  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||    ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  10952005 catgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 10951907  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  10951906 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 10951807  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  10951806 tggggaaaacgccgtt 10951791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3648142 - 3647846
Alignment:
Q  18 atatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgttggcagttt 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3648142 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagttt 3648043  T
Q  118 gtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataac 209  Q
    |||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||    
T  3648042 gtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgac 3647944  T
Q  210 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 307  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  3647943 gtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 3647846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13769634 - 13769558
Alignment:
Q  93 tgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13769634 tgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaatacattagagtattgggcacgtagt 13769558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 24585616 - 24585929
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24585616 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24585715  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  24585716 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24585815  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  24585816 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 24585915  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  24585916 gggaataatgccgt 24585929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15234834 - 15234526
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15234834 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 15234735  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  15234734 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 15234635  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  15234634 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 15234535  T
Q  298 taacgccgt 306  Q
    ||| |||||    
T  15234534 taatgccgt 15234526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 15275871 - 15276164
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15275871 ttgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15275970  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  15275971 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 15276070  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15276071 tcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 15276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 15379483 - 15379776
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15379483 ttgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgc 15379582  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  15379583 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 15379682  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379683 tcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15379776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14672010 - 14671717
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14672010 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14671911  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    | ||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  14671910 acgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 14671811  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14671810 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54840410 - 54840097
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54840410 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 54840311  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  54840310 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 54840212  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54840211 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 54840112  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  54840111 ggggaaaacgccgtt 54840097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 27156572 - 27156885
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27156572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27156671  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27156672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27156770  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27156771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27156870  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  27156871 ggggaaaatgccgtt 27156885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 31119756 - 31120069
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31119756 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31119855  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31119856 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31119954  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31119955 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 31120054  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  31120055 ggggaaaacgccgtt 31120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21976723 - 21976410
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21976723 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21976624  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21976623 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21976525  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21976524 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 21976425  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  21976424 ggggaaaacgccgtt 21976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17020022 - 17019737
Alignment:
Q  28 atgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatag 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  17020022 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacag 17019923  T
Q  128 tttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttggga 219  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17019922 ttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttggga 17019823  T
Q  220 gacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  17019822 gacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 17019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331994
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 20331979  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  20331980 ggggaaaatgccgtt 20331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6576856 - 6576544
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6576856 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 6576757  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  6576756 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6576658  T
Q  193 tcctc-tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  6576657 tcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccac 6576558  T
Q  292 tggggataacgccg 305  Q
    ||||||||| ||||    
T  6576557 tggggataatgccg 6576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1907227 - 1906975
Alignment:
Q  62 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907227 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgg 1907128  T
Q  162 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 253  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  1907127 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagct 1907028  T
Q  254 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 306  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  1907027 atgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 1906975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5701548 - 5701256
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5701548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5701449  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5701448 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5701350  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 5701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 14752762 - 14753073
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14752762 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14752861  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14752862 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 14752960  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14752961 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 14753060  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  14753061 gggaataatgccg 14753073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 36323583 - 36323894
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36323583 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgc 36323682  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  36323683 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 36323781  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  36323782 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 36323881  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  36323882 gggaataatgccg 36323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 36337792 - 36338103
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36337792 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgc 36337891  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  36337892 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 36337990  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  36337991 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 36338090  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  36338091 gggaataatgccg 36338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39857634 - 39857342
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39857634 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39857535  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  39857534 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 39857436  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857435 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18793889 - 18794175
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18793889 ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18793988  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18793989 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18794087  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  18794088 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 18794175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 40098879 - 40099192
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40098879 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40098978  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  40098979 atgactgttggtattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40099077  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  40099078 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 40099177  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  40099178 ggggaaaacgccgtt 40099192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24119661 - 24119349
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24119661 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24119562  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaa 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |          ||    
T  24119561 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 24119463  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  24119462 atcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24119363  T
Q  292 tggggataacgccg 305  Q
    |||| |||| ||||    
T  24119362 tgggaataatgccg 24119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5012902 - 5012593
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatt-aaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5012902 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5012803  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt-gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 190  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |        || | ||    
T  5012802 cgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 5012704  T
Q  191 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5012703 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacccga 5012604  T
Q  291 ctggggataac 301  Q
    |||||||||||    
T  5012603 ctggggataac 5012593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14105563 - 14105250
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14105563 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14105464  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  14105463 atgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 14105365  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||    
T  14105364 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccact 14105265  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  14105264 ggggaaaacgccgtt 14105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 33667046 - 33667360
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33667046 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 33667145  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  33667146 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 33667244  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  33667245 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 33667344  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  33667345 tggggaaaacgccgtt 33667360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 34182219 - 34182515
Alignment:
Q  17 aatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgttggcagtt 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  34182219 aatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaatt 34182318  T
Q  117 tgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 208  Q
     |||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |    
T  34182319 cgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatga 34182417  T
Q  209 cgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 306  Q
    || |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| |||||    
T  34182418 cgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccgt 34182515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30760784 - 30760470
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30760784 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 30760685  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  30760684 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 30760586  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  30760585 atcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 30760486  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  30760485 tggggaaaacgccgtt 30760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 24814547 - 24814726
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24814547 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24814646  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 181  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814647 atgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 24813642 - 24813822
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813642 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 24813741  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 181  Q
    |||||  |||| |||||||||||||    |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813742 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22895418 - 22895118
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22895418 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 22895319  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  22895318 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 22895219  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  22895218 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggga 22895119  T
Q  298 t 298  Q
    |    
T  22895118 t 22895118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23727233 - 23726921
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23727233 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 23727134  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  23727133 atgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 23727034  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  23727033 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 23726934  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  23726933 gggaataatgccg 23726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11556350 - 11556043
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11556350 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11556251  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11556250 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 11556151  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  11556150 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 11556051  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  11556050 gggaataa 11556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23898892 - 23898578
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  23898892 ttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatgt 23898793  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  23898792 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 23898693  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||    
T  23898692 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactctac 23898593  T
Q  292 tggggataacgccgt 306  Q
    ||||||||| |||||    
T  23898592 tggggataatgccgt 23898578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33784478 - 33784166
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33784478 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33784379  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33784378 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 33784279  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||   | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  33784278 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 33784179  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  33784178 gggaataatgccg 33784166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 13179962 - 13180241
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13179962 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13180061  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13180062 atgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 13180161  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 272  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  13180162 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 22992286 - 22992593
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22992286 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 22992385  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22992386 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22992485  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  22992486 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 22992585  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  22992586 gggaataa 22992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23632966 - 23632659
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23632966 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 23632867  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | ||||    
T  23632866 atgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 23632767  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  23632766 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 23632667  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  23632666 gggaataa 23632659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25207300 - 25206998
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25207300 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25207201  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||    
T  25207200 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25207101  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||    
T  25207100 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25207001  T
Q  298 taa 300  Q
    |||    
T  25207000 taa 25206998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25271456 - 25271154
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25271456 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25271357  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||    
T  25271356 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25271257  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||    
T  25271256 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25271157  T
Q  298 taa 300  Q
    |||    
T  25271156 taa 25271154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24609241 - 24608929
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24609241 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24609142  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    | ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  24609141 acgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 24609042  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  24609041 tcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 24608942  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  24608941 gggaataatgccg 24608929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24976840 - 24976528
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24976840 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24976741  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  24976740 atgactgttggcgatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 24976641  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  24976640 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 24976541  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  24976540 gggaataatgccg 24976528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 15752004 - 15752317
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752004 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15752103  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  15752104 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15752202  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752203 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 15752302  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  15752303 ggggaaaacgccgtt 15752317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6881308 - 6880995
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6881308 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 6881209  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  6881208 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6881110  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  6881109 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 6881010  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||| |||||||||||    
T  6881009 gggaataacgccgtt 6880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30036441 - 30036128
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30036441 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30036342  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30036341 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30036243  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30036242 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 30036143  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  30036142 ggggaaaacgccgtt 30036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33299532 - 33299220
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33299532 ttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33299433  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33299432 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 33299333  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| | || |||| | |||    
T  33299332 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatatcgggagactctact 33299233  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  33299232 gggaataatgccg 33299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 31819567 - 31819880
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31819567 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31819666  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |        || | ||||    
T  31819667 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaa 31819765  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31819766 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 31819865  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  31819866 ggggaaaacgccgtt 31819880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33523399 - 33523086
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33523399 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33523300  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33523299 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33523201  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33523200 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 33523101  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  33523100 ggggaaaacgccgtt 33523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 28952941 - 28953254
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28952941 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28953040  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       |||    
T  28953041 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaa 28953139  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||   |||    
T  28953140 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggacagaatctcggaagactttact 28953239  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  28953240 ggggaaaacgccgtt 28953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 9543874 - 9544185
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9543874 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9543973  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  9543974 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 9544072  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  9544073 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 9544172  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  9544173 gggaataatgccg 9544185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33882121 - 33881808
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33882121 ttgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33882022  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33882021 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33881923  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33881922 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 33881823  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  33881822 ggggaaaatgccgtt 33881808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 18493914 - 18494227
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18493914 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18494013  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  18494014 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 18494112  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  18494113 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctacc 18494212  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  18494213 ggggaaaacgccgtt 18494227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30941626 - 30941314
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30941626 ttgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30941527  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | ||||    
T  30941526 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30941427  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  30941426 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 30941327  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  30941326 gggaataatgccg 30941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43085262 - 43084956
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43085262 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 43085163  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-tcatagaaatcctctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||     
T  43085162 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattcttggaaatcctctc 43085064  T
Q  200 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 299  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |    
T  43085063 tggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaa 43084964  T
Q  300 acgccgtt 307  Q
    ||||||||    
T  43084963 acgccgtt 43084956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 32589421 - 32589734
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32589421 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32589520  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||    ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  32589521 atgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgc-gggaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32589619  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  32589620 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgact 32589719  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  32589720 ggggagaacgccgtt 32589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2518060 - 2517749
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2518060 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2517961  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2517960 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2517862  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||    
T  2517861 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 2517762  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    |||||||| ||||    
T  2517761 ggggataatgccg 2517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 18121583 - 18121886
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18121583 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 18121682  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcc 195  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||||||    
T  18121683 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcc 18121781  T
Q  196 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 295  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  18121782 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 18121881  T
Q  296 gataa 300  Q
     ||||    
T  18121882 aataa 18121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30159035 - 30158722
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30159035 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30158936  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30158935 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30158837  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30158836 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttgact 30158737  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  30158736 ggggaaaatgccgtt 30158722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40467008
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 40466993  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  40466994 ggggaaaatgccgtt 40467008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 15651907 - 15652218
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15651907 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15652006  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  15652007 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15652105  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  15652106 tcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 15652205  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  15652206 gggaataatgccg 15652218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 37351810 - 37352123
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37351810 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37351909  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| || |||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37351910 atgactgttggcatttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37352008  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   |||    
T  37352009 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttact 37352108  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    |||||||| ||||||    
T  37352109 ggggataatgccgtt 37352123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37761989 - 37761676
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37761989 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37761890  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37761889 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37761791  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  37761790 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 37761691  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  37761690 ggggaaaacgccgtt 37761676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 37745495 - 37745781
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37745495 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37745594  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||    
T  37745595 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaa 37745693  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  37745694 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatcttg 37745781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24730959 - 24730653
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24730959 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 24730860  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    |||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |||||||||    
T  24730859 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctc 24730761  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||    
T  24730760 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactgggga 24730661  T
Q  298 taacgccg 305  Q
    ||| ||||    
T  24730660 taatgccg 24730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34623514 - 34623201
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34623514 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34623415  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  34623414 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34623316  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  34623315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 34623216  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  34623215 ggggaaaacgccgtt 34623201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 8658639 - 8658931
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8658639 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8658738  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  8658739 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8658837  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658838 tcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31438452 - 31438141
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31438452 ttgacattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31438353  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31438352 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31438254  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  31438253 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 31438154  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    |||||||| ||||    
T  31438153 ggggataatgccg 31438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3796548 - 3796235
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3796548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 3796449  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  3796448 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 3796350  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  3796349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 3796250  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  3796249 ggggaaaacgccgtt 3796235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5644815 - 5644502
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5644815 ttgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5644716  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5644715 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5644617  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||  || |||||||||  || | | |||    
T  5644616 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgtagacagaatcttgagaggctccact 5644517  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  5644516 ggggaaaacgccgtt 5644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330336
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |        || | ||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagacctgactgggg 11330347  T
Q  297 ataacgccgtt 307  Q
    | || ||||||    
T  11330346 aaaatgccgtt 11330336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 13435815 - 13436128
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435815 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13435914  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13435915 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13436013  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  13436014 tcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccacc 13436113  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  13436114 ggggaaaacgccgtt 13436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 13317977 - 13318285
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13317977 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 13318076  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    |||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  13318077 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 13318175  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  13318176 tttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggga 13318275  T
Q  298 taacgccgtt 307  Q
     |||||||||    
T  13318276 aaacgccgtt 13318285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28656260 - 28655947
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28656260 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28656161  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  28656160 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 28656062  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||  |||| | ||     
T  28656061 tcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgcaccttgctggggatagaatcttgagagactccacc 28655962  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  28655961 ggggaaaacgccgtt 28655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 18368676 - 18368989
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18368676 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18368775  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  18368776 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 18368874  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||    
T  18368875 ttctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagccttgagagactccact 18368974  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  18368975 ggggaaaacgccgtt 18368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30175483 - 30175170
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30175483 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30175384  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30175383 atgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30175285  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  30175284 tcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 30175185  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  30175184 ggggaaaacgccgtt 30175170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 37664650 - 37664961
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37664650 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37664749  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37664750 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37664848  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||    
T  37664849 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 37664948  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||||| |||||||    
T  37664949 ggggaaaacgccg 37664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9324479 - 9324165
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9324479 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9324380  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  9324379 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 9324281  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  9324280 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 9324181  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
     ||||| |||||||||    
T  9324180 cggggaaaacgccgtt 9324165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26487389 - 26487075
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26487389 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26487290  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26487289 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26487191  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  26487190 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 26487091  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
     ||||| |||||||||    
T  26487090 cggggaaaacgccgtt 26487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12139177 - 12138864
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12139177 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12139078  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  12139077 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12138979  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  12138978 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 12138879  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  12138878 ggggaaaacgccgtt 12138864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41681693 - 41681408
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||    
T  41681693 attggaaatacgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgattatgcatgtatgaa----tgtaacgcatgac 41681598  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaaatcc 195  Q
    |||||||||||||||| ||    ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||      | ||||||    
T  41681597 tgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcc 41681499  T
Q  196 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681498 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 41681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 13178644 - 13178824
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  13178644 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 13178743  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 181  Q
    |||||  |||| |||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178744 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 21341394 - 21341702
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21341394 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21341493  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21341494 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 21341593  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||    
T  21341594 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 21341693  T
Q  292 tggggataa 300  Q
    |||| ||||    
T  21341694 tgggaataa 21341702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18797697 - 18797404
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18797697 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18797598  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18797597 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18797498  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18797497 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 22074136 - 22074429
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22074136 ttgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22074235  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  22074236 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 22074335  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074336 tcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15774562 - 15774250
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15774562 ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15774463  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | ||||    
T  15774462 atgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaa 15774363  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15774362 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 15774263  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  15774262 gggaataatgccg 15774250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22139902 - 22139595
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22139902 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgc 22139803  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22139802 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22139703  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||    
T  22139702 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggacagaatctcggaagactctact 22139603  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||||||||    
T  22139602 ggggataa 22139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 2130492 - 2130804
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2130492 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2130591  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2130592 atgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 2130691  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  2130692 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 2130791  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  2130792 gggaataatgccg 2130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33249351 - 33249039
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33249351 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33249252  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33249251 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 33249152  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33249151 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactctact 33249052  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  33249051 gggaataatgccg 33249039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16260926 - 16260613
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16260926 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgc 16260827  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  16260826 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 16260727  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||    
T  16260726 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 16260627  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  16260626 gggaataatgccgt 16260613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14570143 - 14569836
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14570143 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14570044  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | ||||    
T  14570043 atgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttggaaa 14569944  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14569943 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 14569844  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  14569843 gggaataa 14569836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 19654550 - 19654863
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19654550 ttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19654649  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  19654650 atgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 19654749  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||    
T  19654750 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 19654849  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  19654850 gggaataatgccgt 19654863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19695104 - 19694791
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19695104 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19695005  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |        || | ||||    
T  19695004 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttatattacacattcctggaaa 19694905  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  19694904 tcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 19694805  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  19694804 gggaataatgccgt 19694791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 19910391 - 19910676
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19910391 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19910490  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | ||||    
T  19910491 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19910590  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 278  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19910591 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 27602137 - 27602449
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27602137 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27602236  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | ||||    
T  27602237 atgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27602336  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | |||    
T  27602337 tcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctact 27602436  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  27602437 gggaataatgccg 27602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29836336 - 29836023
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29836336 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29836237  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29836236 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29836138  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29836137 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 29836038  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  29836037 ggggaaaacgccgtt 29836023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31361542 - 31361267
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31361542 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31361443  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  31361442 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 31361344  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 269  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  31361343 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355474
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 28355459  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  28355460 ggggaaaatgccgtt 28355474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 12085943 - 12086253
Alignment:
Q  7 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgact 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12085943 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 12086042  T
Q  107 gttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctct 198  Q
    ||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||    
T  12086043 gttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctct 12086141  T
Q  199 ttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggat 298  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   ||||||||     
T  12086142 ttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaa 12086241  T
Q  299 aacgccgttatg 310  Q
    ||||||||||||    
T  12086242 aacgccgttatg 12086253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18716469 - 18716177
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18716469 ttgacattggaagtgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18716370  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18716369 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18716271  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716270 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33265733 - 33265420
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33265733 ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33265634  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33265633 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33265535  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  33265534 tcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 33265435  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  33265434 ggggaaaacgccgtt 33265420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201906
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||  || |  ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 19201890  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
     ||||| |||||||||    
T  19201891 cggggaaaacgccgtt 19201906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 31483080 - 31483393
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31483080 ttgacattggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31483179  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||| |||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31483180 atgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31483278  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  31483279 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctggagatagaatcttggaagactttact 31483378  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  31483379 ggggaaaacgccgtt 31483393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44567995 - 44567680
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44567995 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 44567896  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcataga 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |         || | ||    
T  44567895 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgctatattacacatttcttgga 44567797  T
Q  191 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 290  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |    
T  44567796 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagacttta 44567697  T
Q  291 ctggggataacgccgtt 307  Q
    ||||||| |||||||||    
T  44567696 ctggggaaaacgccgtt 44567680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19681470 - 19681156
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19681470 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 19681371  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  19681370 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 19681272  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  19681271 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 19681172  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  19681171 tggggaaaacgccgtt 19681156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9361616 - 9361304
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9361616 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9361517  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  9361516 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaa 9361418  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  9361417 tcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagactccacc 9361319  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  9361318 ggggaaaacgccgtt 9361304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 22389094 - 22389190
Alignment:
Q  3 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22389094 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15775468 - 15775288
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  15775468 ttgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatg 15775369  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 181  Q
    |||||  |||| |||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775368 catgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5659085 - 5658773
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5659085 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5658986  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||    
T  5658985 atgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctggaaa 5658886  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  5658885 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 5658786  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  5658785 gggaataatgccg 5658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35887711 - 35887399
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35887711 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 35887612  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  35887611 atgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 35887512  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  35887511 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 35887412  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  35887411 gggaataatgccg 35887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19701368 - 19701055
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19701368 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19701269  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19701268 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 19701169  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  19701168 tcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 19701069  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    |||||||| |||||    
T  19701068 ggggataatgccgt 19701055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 22380889 - 22381201
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22380889 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 22380988  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        ||||    
T  22380989 atgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaa 22381088  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  22381089 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 22381188  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  22381189 gggaataatgccg 22381201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15368217 - 15367903
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15368217 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15368118  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | ||||    
T  15368117 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaaa 15368018  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  15368017 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgc 15367918  T
Q  292 tggggataacgccgt 306  Q
    ||||||||| |||||    
T  15367917 tggggataatgccgt 15367903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 15886026 - 15886339
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15886026 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15886125  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  15886126 atgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 15886225  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15886226 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctact 15886325  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  15886326 gggaataatgccgt 15886339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 4789940 - 4790252
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4789940 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4790039  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  4790040 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 4790139  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | |||    
T  4790140 tcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctact 4790239  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  4790240 gggaataatgccg 4790252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 29142063 - 29142375
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29142063 ttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29142162  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29142163 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 29142262  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  29142263 tcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 29142362  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  29142363 gggaataatgccg 29142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18337575 - 18337268
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18337575 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 18337476  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        ||||    
T  18337475 atgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaa 18337376  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  18337375 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 18337276  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  18337275 gggaataa 18337268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4728577 - 4728265
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4728577 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 4728478  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4728477 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4728378  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  4728377 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 4728278  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  4728277 gggaataatgccg 4728265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6208846 - 6208534
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6208846 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 6208747  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  6208746 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6208647  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  6208646 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 6208547  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  6208546 gggaataatgccg 6208534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18058219 - 18057907
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18058219 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18058120  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18058119 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18058020  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  18058019 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 18057920  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  18057919 gggaataatgccg 18057907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 8282769 - 8283076
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8282769 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8282868  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  8282869 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 8282968  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  8282969 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 8283068  T
Q  293 ggggataa 300  Q
    ||| ||||    
T  8283069 gggtataa 8283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16423150 - 16422845
Alignment:
Q  9 ggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgt 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16423150 ggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgt 16423051  T
Q  109 tggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctcttt 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||    
T  16423050 tggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttt 16422951  T
Q  201 ggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  16422950 ggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactctactggggataa 16422851  T
Q  301 cgccgt 306  Q
     |||||    
T  16422850 tgccgt 16422845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 11103671 - 11103982
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11103671 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11103770  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11103771 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 11103869  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  11103870 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 11103969  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  11103970 gggaataatgccg 11103982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 16617776 - 16618084
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16617776 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgc 16617875  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | ||||    
T  16617876 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaa 16617975  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  16617976 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgc 16618075  T
Q  292 tggggataa 300  Q
    |||||||||    
T  16618076 tggggataa 16618084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5020683 - 5020370
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5020683 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5020584  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  5020583 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 5020485  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  5020484 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 5020385  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  5020384 ggggaaaacgccgtt 5020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22041381 - 22041087
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22041381 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgc 22041282  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | ||||    
T  22041281 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaa 22041182  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041181 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22041087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4690626 - 4690313
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4690626 ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4690527  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  4690526 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4690427  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  4690426 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 4690327  T
Q  293 ggggataacgccgt 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  4690326 gggaataatgccgt 4690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 28109250 - 28109564
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28109250 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatgc 28109349  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28109350 atgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28109448  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc-gac 291  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  28109449 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttggaaaaccctgac 28109548  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  28109549 tggggaaaacgccgtt 28109564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24335148 - 24334835
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24335148 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24335049  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  24335048 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24334950  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24334949 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 24334850  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  24334849 ggggaaaacgccgtt 24334835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32297603 - 32297290
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32297504  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  32297503 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 32297405  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32297404 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatcttggaagacctgact 32297305  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  32297304 ggggaaaatgccgtt 32297290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 15734425 - 15734710
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  15734425 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgc 15734524  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  15734525 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15734624  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 278  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15734625 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717714
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5717729  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  5717728 ggggaaaatgccgtt 5717714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728624
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5728639  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  5728638 ggggaaaatgccgtt 5728624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763744
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5763729  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  5763730 ggggaaaatgccgtt 5763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10650042 - 10649730
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10650042 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 10649943  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  10649942 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 10649844  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  10649843 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaaga-cttact 10649745  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  10649744 ggggaaaacgccgtt 10649730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 17978238 - 17978551
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17978238 ttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 17978337  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  17978338 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 17978436  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17978437 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 17978536  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  17978537 ggggaaaacgccgtt 17978551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18232164 - 18231851
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18232164 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18232065  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18232064 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18231966  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18231965 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 18231866  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  18231865 ggggaaaacgccgtt 18231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 31029553 - 31029864
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31029553 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31029652  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| |||||||  |    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31029653 atgactgttggcattttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31029751  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  31029752 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 31029851  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  31029852 gggaataatgccg 31029864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4630731 - 4630420
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4630731 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4630632  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  4630631 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 4630533  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  4630532 tcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 4630433  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  4630432 gggaataatgccg 4630420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32446102 - 32445791
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32446102 ttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32446003  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  32446002 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 32445904  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  32445903 tcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 32445804  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  32445803 gggaataatgccg 32445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 5589643 - 5589956
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5589643 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5589742  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | ||||    
T  5589743 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 5589841  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  5589842 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgcaacttgctagagatagaatcttggaagacctgact 5589941  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  5589942 ggggaaaatgccgtt 5589956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18249690 - 18249377
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18249690 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18249591  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18249590 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18249492  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  18249491 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccacc 18249392  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  18249391 ggggaaaacgccgtt 18249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28346143 - 28345830
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28346143 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28346044  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||    
T  28346043 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaa 28345945  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  28345944 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 28345845  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  28345844 ggggaaaacgccgtt 28345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 4339986 - 4340297
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4339986 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4340085  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4340086 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4340184  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  4340185 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 4340284  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    |||||||| ||||    
T  4340285 ggggataatgccg 4340297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 18285666 - 18285977
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18285666 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18285765  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18285766 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18285864  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18285865 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18285964  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  18285965 gggaataatgccg 18285977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 18300967 - 18301278
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18300967 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18301066  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18301067 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18301165  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18301166 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18301265  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  18301266 gggaataatgccg 18301278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 6536029 - 6536343
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6536029 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 6536128  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  6536129 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 6536227  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  6536228 atcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 6536327  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  6536328 tggggaaaacgccgtt 6536343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658567
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |     ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 29658552  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  29658553 ggggaaaatgccgtt 29658567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 16404079 - 16404414
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16404079 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16404178  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16404179 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16404277  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||     
T  16404278 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcacc 16404377  T
Q  293 ggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctgg 329  Q
    ||||| ||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  16404378 ggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgg 16404414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 22864151 - 22864464
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22864151 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22864250  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22864251 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22864349  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  22864350 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttact 22864449  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  22864450 ggggaaaacgccgtt 22864464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 22879210 - 22879523
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22879210 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22879309  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22879310 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22879408  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  22879409 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttact 22879508  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  22879509 ggggaaaacgccgtt 22879523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48472882 - 48472590
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48472882 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 48472783  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  48472782 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 48472684  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472683 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21681692 - 21681406
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21681692 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21681593  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  21681592 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 21681494  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  21681493 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 21681406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 31957743 - 31958029
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31957743 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31957842  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31957843 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31957941  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 280  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31957942 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttg 31958029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030114
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactttgctggagatagaatcttggaagactccac 47030130  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  47030129 tggggaaaacgccgtt 47030114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4423866 - 4423557
Alignment:
Q  3 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcat 102  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4423866 gacattggacatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 4423767  T
Q  103 gactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 194  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||    
T  4423766 gactgttggcattttataggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatc 4423668  T
Q  195 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||    
T  4423667 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactgg 4423568  T
Q  295 ggataacgccg 305  Q
    |||||| ||||    
T  4423567 ggataatgccg 4423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10403124 - 10402811
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10403124 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 10403025  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  10403024 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 10402926  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||     
T  10402925 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagaccccacc 10402826  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  10402825 ggggaaaacgccgtt 10402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 307
Target Start/End: Original strand, 20570147 - 20570456
Alignment:
Q  5 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20570147 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20570246  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 196  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||| | | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  20570247 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcac-gggggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 20570345  T
Q  197 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||    
T  20570346 ctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactgggg 20570445  T
Q  297 ataacgccgtt 307  Q
    | |||||||||    
T  20570446 aaaacgccgtt 20570456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20072985 - 20072693
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20072985 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20072886  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||     || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20072885 atgactgttggcattttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20072787  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072786 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 5602599 - 5602913
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5602599 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5602698  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5602699 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5602797  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  5602798 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 5602897  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  5602898 tggggaaaacgccgtt 5602913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Original strand, 17970172 - 17970481
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17970172 attggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 17970271  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 197  Q
    | |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  17970272 tattggcactttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 17970370  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactgggg 296  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||    
T  17970371 tttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccgggg 17970470  T
Q  297 ataacgccgtt 307  Q
    | |||||||||    
T  17970471 aaaacgccgtt 17970481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8218597 - 8218284
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8218597 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgc 8218498  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |        || | ||||    
T  8218497 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8218399  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||| |||||| |||||  |||| | |||    
T  8218398 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggagatagagtcttgagagactccact 8218299  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  8218298 ggggaaaacgccgtt 8218284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51788995 - 51788681
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  51788995 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 51788896  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  51788895 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 51788797  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  51788796 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 51788697  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  51788696 tggggaaaacgccgtt 51788681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5473929 - 5473628
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||    
T  5473929 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg----------tatgaatgcttgtaatgc 5473840  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  5473839 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5473741  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  5473740 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 5473641  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  5473640 gggaataatgccg 5473628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16599585 - 16599406
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16599585 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16599486  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 181  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599485 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28028210 - 28027930
Alignment:
Q  34 taacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgc 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |    
T  28028210 taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcac 28028111  T
Q  134 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 225  Q
     | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  28028110 gggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctcgtgctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtg 28028012  T
Q  226 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 307  Q
     ||| |||  |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  28028011 tcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 28027930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7080201 - 7080022
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7080201 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 7080102  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 181  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080101 atgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35221826 - 35221712
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35221826 attggaaatgcactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgac 35221727  T
Q  106 tgttggcagtttgta 120  Q
    |||||||||||||||    
T  35221726 tgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079867
Alignment:
Q  191 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 290  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  291 ctggggataacgccg 305  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7079881 ctgggaataatgccg 7079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28303 - 27992
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28303 ttgacatgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28204  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-ca-----tcatagaaatc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     || | ||||||    
T  28203 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaaatc 28104  T
Q  195 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||    
T  28103 ctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagactccgctgg 28004  T
Q  295 ggataacgccgt 306  Q
    |||||| |||||    
T  28003 ggataatgccgt 27992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 467
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  106 tgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 197  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||||||||    
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  198 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 479  T
Q  298 taacgccgttat 309  Q
    ||| ||||||||    
T  478 taatgccgttat 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12769
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13062 ttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 12963  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--------catagaaa 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||||    
T  12962 atgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctggaaa 12863  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12862 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagac 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2354
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 2369  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| || ||||||    
T  2368 ggggaaaatgccgtt 2354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 3861 - 4173
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3861 ttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 3960  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        || | || |    
T  3961 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaca 4060  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  4061 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 4160  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  4161 gggaataatgccg 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 25815 - 26108
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25815 ttgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 25914  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||        | ||||    
T  25915 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctcatgctatatcacacattcttggaaa 26014  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26015 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaagac 26108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Original strand, 8918 - 9214
Alignment:
Q  13 atgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatgactgttggc 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8918 atgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 9017  T
Q  113 agtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 204  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | || |||||||||||||    
T  9018 gatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggacatcctctttggag 9117  T
Q  205 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 300  Q
    || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  9118 atgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataa 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 24219 - 24531
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24219 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24318  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    | ||||| ||||  |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  24319 acgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 24418  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  24419 ttctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 24518  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  24519 gggaataatgccg 24531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34283 - 33971
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34283 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34184  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  34183 atgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 34084  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | |||    
T  34083 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 33984  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  33983 gggaataatgccg 33971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10615
Alignment:
Q  6 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgcatga 104  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10925 attggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 10826  T
Q  105 ctgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaaatcc 195  Q
    ||||||||||||||||  ||    ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |         || | |||||||    
T  10825 ctgttggcagtttgtaagcacgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcc 10727  T
Q  196 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 295  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||    
T  10726 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggg 10627  T
Q  296 gataacgccgtt 307  Q
    || |||||||||    
T  10626 gaaaacgccgtt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14952 - 14636
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14952 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14853  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14852 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14754  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||    
T  14753 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 14654  T
Q  293 ggggataacgccgttatg 310  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  14653 ggggaaaacgccgttatg 14636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13026 - 12715
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13026 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12927  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  12926 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12828  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  12827 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 12728  T
Q  293 ggggataacgccg 305  Q
    ||| |||| ||||    
T  12727 gggaataatgccg 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 8187 - 8479
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8187 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8286  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  8287 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8385  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8386 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 2422 - 2736
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2422 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2521  T
Q  100 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  2522 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 2620  T
Q  192 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | ||    
T  2621 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccac 2720  T
Q  292 tggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| |||||||||    
T  2721 tggggaaaacgccgtt 2736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 23842 - 23948
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg-attgtaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23842 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctttgtaat 23941  T
Q  99 gcatgac 105  Q
    |||||||    
T  23942 gcatgac 23948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18505
Alignment:
Q  230 aaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 307  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 18505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16586 - 16273
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16586 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16487  T
Q  101 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |        || | ||||    
T  16486 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgttatattacacattcttggaaa 16388  T
Q  193 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 292  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  16387 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagactccacc 16288  T
Q  293 ggggataacgccgtt 307  Q
    ||||| |||||||||    
T  16287 ggggaaaacgccgtt 16273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40181
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaat-gcaatatgtatgga-tgatataacagtttta-ttaaatgcat-gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgta 96  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39858 ttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 39957  T
Q  97 atgcatgactgttggc-agtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagt-attgggc-acgtagtggctcgtgctacatcata----- 188  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||| || | |         
T  39958 atgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtggttgggcaacgcagtggctcgtgctatattacacattt 40057  T
Q  189 -----gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctga-gggcagatagctaat-caacttgctggggatagaatcttgg 281  Q
          ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  40058 cctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaatgcaacttgctggggatagaatctcgg 40157  T
Q  282 aagacccgactggggataacgccg 305  Q
    ||||| | |||||| |||| ||||    
T  40158 aagactctactgggaataatgccg 40181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 1309 - 1414
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1309 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 1408  T
Q  101 atgact 106  Q
    ||||||    
T  1409 atgact 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 13221 - 13325
Alignment:
Q  1 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgattgtaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13221 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13320  T
Q  101 atgac 105  Q
    |||||    
T  13321 atgac 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6741
Alignment:
Q  239 tgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 305  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 6741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University