View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9451_low_3 (Length: 536)

Name: NF9451_low_3
Description: NF9451
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9451_low_3
NF9451_low_3
[»] chr6 (84 HSPs)
chr6 (7-516)||(27283380-27283883)
chr6 (5-511)||(27209574-27210083)
chr6 (5-511)||(27239145-27239654)
chr6 (9-511)||(26927427-26927935)
chr6 (9-511)||(16756496-16757000)
chr6 (5-512)||(22927868-22928380)
chr6 (5-484)||(15405546-15406028)
chr6 (5-484)||(15417333-15417815)
chr6 (5-511)||(13291960-13292470)
chr6 (5-506)||(27025822-27026325)
chr6 (5-511)||(24298778-24299285)
chr6 (5-506)||(27031701-27032205)
chr6 (9-492)||(24870402-24870887)
chr6 (5-511)||(29508096-29508605)
chr6 (5-511)||(29556231-29556741)
chr6 (6-511)||(33369441-33369954)
chr6 (5-486)||(27200897-27201380)
chr6 (5-486)||(27247853-27248336)
chr6 (5-513)||(13517208-13517720)
chr6 (5-453)||(20131253-20131692)
chr6 (5-453)||(22201178-22201617)
chr6 (5-511)||(26792491-26792996)
chr6 (4-513)||(30550996-30551506)
chr6 (202-516)||(27622914-27623228)
chr6 (5-513)||(29579707-29580216)
chr6 (5-513)||(4538773-4539285)
chr6 (5-518)||(26109415-26109933)
chr6 (15-513)||(27491811-27492311)
chr6 (5-511)||(27014399-27014907)
chr6 (5-492)||(28167188-28167679)
chr6 (5-516)||(28214138-28214653)
chr6 (9-513)||(16937025-16937532)
chr6 (5-513)||(26665652-26666163)
chr6 (5-513)||(26771623-26772134)
chr6 (9-535)||(27355102-27355631)
chr6 (15-513)||(4531967-4532466)
chr6 (5-513)||(16680832-16681343)
chr6 (5-511)||(14138421-14138925)
chr6 (4-513)||(4779584-4780093)
chr6 (5-486)||(8898688-8899176)
chr6 (78-513)||(27064174-27064600)
chr6 (4-486)||(4764462-4764936)
chr6 (5-388)||(20175368-20175733)
chr6 (5-388)||(22160258-22160623)
chr6 (207-513)||(34457699-34458012)
chr6 (5-135)||(34457559-34457690)
chr6 (4-158)||(27622486-27622643)
chr6 (4-130)||(4755699-4755824)
chr6 (5-68)||(27064638-27064702)
chr6 (4-53)||(27622267-27622317)
chr6 (1-53)||(27622097-27622150)
chr6 (5-53)||(27621993-27622041)
chr6 (5-57)||(22927574-22927627)
chr6 (5-57)||(26665536-26665588)
chr6 (5-57)||(26771507-26771559)
chr6 (5-53)||(27622153-27622201)
chr6 (5-53)||(27622372-27622420)
chr6 (1-43)||(27622206-27622249)
chr6 (1-43)||(27622425-27622468)
chr6 (5-57)||(20131697-20131750)
chr6 (5-53)||(22201120-22201169)
chr6 (5-57)||(22927217-22927270)
chr6 (5-57)||(22927691-22927744)
chr6 (5-57)||(4538657-4538709)
chr6 (5-57)||(8898572-8898624)
chr6 (5-57)||(14138305-14138357)
chr6 (5-57)||(26109299-26109351)
chr6 (5-57)||(28167743-28167795)
chr6 (5-57)||(28214717-28214769)
chr6 (5-57)||(29508669-29508721)
chr6 (5-57)||(33369324-33369376)
chr6 (4-54)||(27621816-27621866)
chr6 (11-53)||(27622050-27622092)
chr6 (1-45)||(13291719-13291764)
chr6 (4-57)||(27201444-27201497)
chr6 (4-57)||(27247736-27247789)
chr6 (5-53)||(27622320-27622369)
chr6 (5-57)||(16681407-16681459)
chr6 (2-57)||(26928003-26928059)
chr6 (5-57)||(27064766-27064818)
chr6 (9-53)||(27210329-27210373)
chr6 (9-53)||(27238855-27238899)
chr6 (5-57)||(29556805-29556857)
chr6 (5-57)||(34457443-34457495)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (9-516)||(26508644-26509154)
chr7 (5-511)||(5154758-5155264)
chr7 (5-511)||(2161247-2161755)
chr7 (9-492)||(16048027-16048511)
chr7 (5-511)||(5165059-5165565)
chr7 (9-511)||(11417740-11418243)
chr7 (5-513)||(26662845-26663354)
chr7 (5-513)||(26678037-26678546)
chr7 (5-512)||(16442937-16443446)
chr7 (17-512)||(16511389-16511890)
chr7 (5-511)||(2779919-2780428)
chr7 (5-511)||(10909877-10910390)
chr7 (5-513)||(26596349-26596859)
chr7 (5-513)||(31557334-31557847)
chr7 (5-513)||(31083555-31084066)
chr7 (5-513)||(26441938-26442447)
chr7 (5-511)||(22148563-22149071)
chr7 (5-513)||(26519501-26520010)
chr7 (5-513)||(24585467-24585978)
chr7 (5-513)||(45393913-45394421)
chr7 (5-492)||(45737995-45738489)
chr7 (5-513)||(11447582-11448092)
chr7 (5-478)||(5140267-5140744)
chr7 (15-486)||(31130616-31131089)
chr7 (5-513)||(26312796-26313306)
chr7 (15-513)||(4206069-4206570)
chr7 (207-492)||(10848299-10848592)
chr7 (207-513)||(16744649-16744962)
chr7 (207-513)||(4138374-4138687)
chr7 (207-492)||(39206293-39206585)
chr7 (202-511)||(3451926-3452243)
chr7 (4-135)||(16744508-16744640)
chr7 (195-513)||(26268202-26268527)
chr7 (5-135)||(39206153-39206284)
chr7 (4-135)||(4138233-4138365)
chr7 (346-511)||(22152790-22152963)
chr7 (346-511)||(22208705-22208878)
chr7 (5-68)||(26267896-26267960)
chr7 (5-57)||(26442511-26442564)
chr7 (5-56)||(31557218-31557269)
chr7 (4-57)||(11417618-11417672)
chr7 (5-57)||(26508050-26508103)
chr7 (4-57)||(26596923-26596976)
chr7 (5-57)||(31083438-31083491)
chr7 (5-57)||(26442628-26442680)
chr7 (5-57)||(26507934-26507986)
chr7 (5-57)||(39205202-39205254)
chr7 (5-57)||(45738553-45738605)
chr7 (5-55)||(39206037-39206087)
chr7 (1-45)||(2161951-2161996)
chr7 (5-53)||(10848777-10848826)
chr7 (5-53)||(26508582-26508631)
chr7 (5-57)||(22149135-22149187)
chr7 (5-57)||(26267780-26267832)
chr7 (5-57)||(26312680-26312732)
chr7 (5-57)||(26508285-26508337)
chr7 (5-57)||(26662729-26662781)
chr7 (5-57)||(26677921-26677973)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (5-512)||(21696227-21696735)
chr2 (5-506)||(34267959-34268463)
chr2 (36-511)||(23117471-23117947)
chr2 (5-513)||(37678936-37679445)
chr2 (5-513)||(37694201-37694710)
chr2 (5-513)||(19409522-19410031)
chr2 (5-513)||(37932072-37932579)
chr2 (5-513)||(253689-254199)
chr2 (5-513)||(3789138-3789648)
chr2 (5-512)||(27397031-27397532)
chr2 (78-492)||(27427583-27428000)
chr2 (5-501)||(34297856-34298354)
chr2 (5-511)||(28888929-28889436)
chr2 (5-513)||(21670211-21670720)
chr2 (15-513)||(13929657-13930158)
chr2 (1-492)||(37384371-37384864)
chr2 (4-513)||(16822375-16822885)
chr2 (4-513)||(16898595-16899105)
chr2 (5-513)||(39896764-39897273)
chr2 (32-511)||(31867877-31868354)
chr2 (4-513)||(32056447-32056957)
chr2 (9-511)||(12662165-12662669)
chr2 (5-513)||(34868329-34868839)
chr2 (1-513)||(37944898-37945412)
chr2 (78-511)||(20844590-20845025)
chr2 (5-492)||(27123216-27123706)
chr2 (5-513)||(34161536-34162047)
chr2 (5-513)||(12593509-12594021)
chr2 (5-513)||(11628223-11628732)
chr2 (5-492)||(31882987-31883475)
chr2 (5-492)||(19449455-19449939)
chr2 (5-513)||(22921182-22921691)
chr2 (5-511)||(12709660-12710169)
chr2 (5-486)||(40240245-40240730)
chr2 (207-513)||(16168173-16168486)
chr2 (207-513)||(27810398-27810711)
chr2 (207-513)||(9343221-9343534)
chr2 (207-513)||(39045116-39045430)
chr2 (207-513)||(27782918-27783231)
chr2 (5-135)||(9343081-9343212)
chr2 (5-135)||(16168495-16168626)
chr2 (5-135)||(27783240-27783371)
chr2 (5-135)||(27810720-27810851)
chr2 (5-135)||(39044975-39045106)
chr2 (202-387)||(3790473-3790658)
chr2 (5-57)||(34267431-34267484)
chr2 (5-57)||(34267548-34267601)
chr2 (9-68)||(27427504-27427563)
chr2 (5-57)||(31867439-31867492)
chr2 (5-57)||(31867556-31867609)
chr2 (4-57)||(34162111-34162164)
chr2 (5-57)||(34267197-34267250)
chr2 (5-57)||(34267314-34267367)
chr2 (5-57)||(3789890-3789942)
chr2 (5-57)||(34267081-34267133)
chr2 (17-68)||(20845040-20845091)
chr2 (5-55)||(37678820-37678870)
chr2 (5-55)||(37694085-37694135)
chr2 (5-53)||(27397541-27397590)
chr2 (5-53)||(34267782-34267831)
chr2 (5-57)||(253573-253625)
chr2 (5-57)||(9342965-9343017)
chr2 (5-57)||(11628107-11628159)
chr2 (5-57)||(12594085-12594137)
chr2 (5-57)||(16168690-16168742)
chr2 (5-57)||(27783492-27783544)
chr2 (5-57)||(27810915-27810967)
chr2 (9-53)||(34298479-34298523)
chr2 (5-57)||(34868898-34868950)
chr2 (5-57)||(37384924-37384976)
chr2 (5-57)||(37944786-37944838)
chr2 (5-57)||(39897337-39897389)
chr2 (5-57)||(40240794-40240846)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (5-504)||(22895118-22895621)
chr5 (5-512)||(23898578-23899088)
chr5 (9-511)||(33784166-33784671)
chr5 (5-506)||(23632659-23633162)
chr5 (9-511)||(23726921-23727427)
chr5 (5-506)||(25206998-25207501)
chr5 (5-506)||(25271154-25271657)
chr5 (5-506)||(11556043-11556545)
chr5 (17-511)||(24976528-24977023)
chr5 (5-513)||(6880995-6881505)
chr5 (5-513)||(28952745-28953254)
chr5 (5-513)||(32589224-32589734)
chr5 (5-511)||(2517749-2518256)
chr5 (5-506)||(22992091-22992593)
chr5 (9-478)||(13179768-13180241)
chr5 (4-513)||(15751807-15752317)
chr5 (9-511)||(24608929-24609433)
chr5 (5-511)||(33299220-33299736)
chr5 (5-511)||(9543675-9544185)
chr5 (5-513)||(43084956-43085460)
chr5 (5-506)||(18121381-18121886)
chr5 (5-513)||(34623201-34623710)
chr5 (9-511)||(30941314-30941819)
chr5 (5-513)||(30036128-30036637)
chr5 (5-513)||(18493717-18494227)
chr5 (4-513)||(33523086-33523596)
chr5 (15-513)||(31819381-31819880)
chr5 (5-513)||(33881808-33882320)
chr5 (5-513)||(37761676-37762185)
chr5 (5-492)||(8658443-8658931)
chr5 (2-513)||(30158722-30159234)
chr5 (5-511)||(31438141-31438648)
chr5 (5-513)||(3796235-3796746)
chr5 (5-513)||(37351611-37352123)
chr5 (5-486)||(37745297-37745781)
chr5 (15-511)||(15651719-15652218)
chr5 (5-513)||(18368476-18368989)
chr5 (5-513)||(28655947-28656460)
chr5 (5-511)||(37664454-37664961)
chr5 (5-513)||(26487075-26487585)
chr5 (5-513)||(13435614-13436128)
chr5 (5-511)||(24730653-24731162)
chr5 (5-513)||(9324165-9324675)
chr5 (5-513)||(30175170-30175679)
chr5 (5-513)||(12138864-12139373)
chr5 (5-513)||(13317776-13318285)
chr5 (4-492)||(41681408-41681897)
chr5 (207-513)||(40466695-40467008)
chr5 (206-513)||(5644502-5644816)
chr5 (211-513)||(11330336-11330645)
chr5 (5-135)||(40466555-40466686)
chr5 (5-148)||(11330640-11330785)
chr5 (202-387)||(13178639-13178824)
chr5 (5-142)||(5644815-5644952)
chr5 (5-57)||(13179470-13179523)
chr5 (4-57)||(34623774-34623827)
chr5 (5-57)||(13179354-13179406)
chr5 (5-57)||(30036701-30036753)
chr5 (5-57)||(37745181-37745233)
chr5 (5-60)||(28656521-28656576)
chr5 (7-57)||(32589110-32589160)
chr5 (4-57)||(3796810-3796863)
chr5 (5-53)||(25207510-25207559)
chr5 (5-53)||(25271666-25271715)
chr5 (9-57)||(2518320-2518368)
chr5 (5-57)||(6881569-6881621)
chr5 (5-57)||(9324739-9324791)
chr5 (5-57)||(12139437-12139489)
chr5 (5-57)||(18493601-18493653)
chr5 (5-57)||(26487649-26487701)
chr5 (5-57)||(30175743-30175795)
chr5 (5-57)||(31438712-31438764)
chr5 (9-53)||(33299982-33300026)
chr5 (5-57)||(40466439-40466491)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (5-512)||(24585420-24585929)
chr4 (5-512)||(15234526-15235034)
chr4 (5-513)||(54840097-54840605)
chr4 (5-492)||(5701256-5701745)
chr4 (9-492)||(14671717-14672204)
chr4 (5-511)||(36323387-36323894)
chr4 (5-511)||(36337596-36338103)
chr4 (5-492)||(39857342-39857831)
chr4 (4-513)||(31119559-31120069)
chr4 (5-513)||(40098682-40099192)
chr4 (5-511)||(14752564-14753073)
chr4 (5-511)||(17019737-17020235)
chr4 (4-513)||(21976410-21976920)
chr4 (5-513)||(14105250-14105759)
chr4 (5-492)||(15275683-15276164)
chr4 (5-486)||(18793689-18794175)
chr4 (5-513)||(33666850-33667360)
chr4 (5-511)||(6576544-6577058)
chr4 (4-511)||(24119349-24119860)
chr4 (5-492)||(15379295-15379776)
chr4 (5-513)||(30760470-30760980)
chr4 (5-507)||(5012593-5013098)
chr4 (5-512)||(34182007-34182515)
chr4 (207-513)||(27156572-27156885)
chr4 (9-387)||(24814354-24814726)
chr4 (266-512)||(1906975-1907229)
chr4 (207-513)||(20331681-20331994)
chr4 (5-209)||(1907236-1907440)
chr4 (5-135)||(20331541-20331672)
chr4 (202-387)||(24813637-24813822)
chr4 (5-57)||(30761044-30761096)
chr4 (5-57)||(5013162-5013214)
chr4 (5-57)||(18793573-18793625)
chr4 (9-57)||(33666738-33666786)
chr4 (5-57)||(54840669-54840721)
chr4 (17-68)||(15399362-15399413)
chr4 (5-55)||(14105825-14105875)
chr4 (5-57)||(6577122-6577174)
chr4 (5-57)||(14752448-14752500)
chr4 (5-57)||(24585363-24585415)
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (5-511)||(5658773-5659282)
chr3 (5-506)||(16617580-16618084)
chr3 (5-512)||(19701055-19701565)
chr3 (8-492)||(22041087-22041574)
chr3 (5-511)||(18057907-18058416)
chr3 (5-512)||(16422845-16423353)
chr3 (5-511)||(29141864-29142375)
chr3 (5-511)||(11103474-11103982)
chr3 (5-511)||(35887399-35887905)
chr3 (78-511)||(4789817-4790252)
chr3 (5-511)||(4728265-4728772)
chr3 (9-484)||(15734232-15734710)
chr3 (5-506)||(18337268-18337768)
chr3 (5-513)||(28109052-28109564)
chr3 (9-506)||(8282579-8283076)
chr3 (5-511)||(22380693-22381201)
chr3 (5-511)||(6208534-6209041)
chr3 (78-512)||(15885903-15886339)
chr3 (5-512)||(4690313-4690829)
chr3 (5-513)||(17978041-17978551)
chr3 (5-513)||(5020370-5020887)
chr3 (2-513)||(24334835-24335347)
chr3 (5-511)||(4339790-4340297)
chr3 (5-511)||(31029353-31029864)
chr3 (5-513)||(32297290-32297803)
chr3 (5-513)||(18231851-18232360)
chr3 (5-513)||(5602402-5602913)
chr3 (5-513)||(18249377-18249886)
chr3 (5-513)||(20569946-20570456)
chr3 (5-492)||(48472590-48473081)
chr3 (5-511)||(18285467-18285977)
chr3 (5-513)||(22863954-22864464)
chr3 (5-513)||(22879013-22879523)
chr3 (5-511)||(18300767-18301278)
chr3 (5-513)||(10649730-10650237)
chr3 (5-492)||(20072693-20073184)
chr3 (5-486)||(21681406-21681890)
chr3 (5-511)||(4630420-4630930)
chr3 (5-513)||(17969967-17970481)
chr3 (5-512)||(15367903-15368408)
chr3 (5-387)||(16599406-16599782)
chr3 (5-513)||(51788681-51789191)
chr3 (5-511)||(4423557-4424066)
chr3 (9-535)||(16403885-16404414)
chr3 (5-486)||(31957547-31958029)
chr3 (5-511)||(32445791-32446301)
chr3 (5-387)||(7080022-7080398)
chr3 (5-511)||(5473628-5474125)
chr3 (78-513)||(28345830-28346266)
chr3 (78-513)||(8218284-8218720)
chr3 (5-513)||(6535834-6536343)
chr3 (5-513)||(28027930-28028443)
chr3 (207-513)||(5717714-5718027)
chr3 (207-513)||(5728624-5728937)
chr3 (207-513)||(5763431-5763744)
chr3 (206-513)||(5589642-5589956)
chr3 (5-326)||(35221712-35222024)
chr3 (139-513)||(10402811-10403186)
chr3 (207-513)||(29658254-29658567)
chr3 (207-513)||(47030114-47030428)
chr3 (5-135)||(5718036-5718167)
chr3 (5-135)||(5728946-5729077)
chr3 (5-135)||(5763291-5763422)
chr3 (5-135)||(29658115-29658245)
chr3 (9-142)||(5589510-5589643)
chr3 (4-135)||(47030437-47030568)
chr3 (397-511)||(7079867-7079981)
chr3 (5-68)||(8218749-8218813)
chr3 (5-68)||(10403197-10403261)
chr3 (7-68)||(9526989-9527051)
chr3 (9-69)||(15885815-15885875)
chr3 (5-57)||(4690953-4691006)
chr3 (5-57)||(51789255-51789307)
chr3 (7-54)||(9527419-9527466)
chr3 (4-57)||(4424130-4424184)
chr3 (5-57)||(4630994-4631046)
chr3 (5-57)||(8218877-8218929)
chr3 (5-57)||(10403325-10403377)
chr3 (5-57)||(10650301-10650353)
chr3 (5-57)||(11103358-11103410)
chr3 (5-57)||(28028507-28028559)
chr3 (5-57)||(31029237-31029289)
chr3 (5-57)||(48473145-48473197)
chr3 (6-57)||(20073248-20073299)
chr3 (4-57)||(18337773-18337827)
chr3 (4-57)||(18249950-18250003)
chr3 (5-57)||(5718231-5718283)
chr3 (5-57)||(5729141-5729193)
chr3 (5-57)||(5763175-5763227)
chr3 (5-57)||(20569830-20569882)
chr3 (5-57)||(21681954-21682006)
chr3 (5-57)||(22380577-22380629)
chr3 (4-56)||(24335409-24335461)
chr3 (5-57)||(28108936-28108988)
chr3 (5-57)||(32297867-32297919)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (5-506)||(20333465-20333969)
chr1 (5-511)||(14691968-14692474)
chr1 (5-511)||(14694650-14695156)
chr1 (5-511)||(14697334-14697840)
chr1 (5-501)||(14700015-14700511)
chr1 (5-506)||(16201078-16201583)
chr1 (9-513)||(51644921-51645427)
chr1 (5-512)||(20467484-20467998)
chr1 (10-512)||(21890805-21891308)
chr1 (5-511)||(41786384-41786891)
chr1 (5-511)||(10969344-10969852)
chr1 (5-513)||(3647846-3648363)
chr1 (5-492)||(28156425-28156915)
chr1 (5-513)||(10951791-10952301)
chr1 (5-513)||(28591780-28592291)
chr1 (5-57)||(21890329-21890382)
chr1 (5-57)||(21890563-21890616)
chr1 (5-57)||(20333112-20333164)
chr1 (5-57)||(28592414-28592466)
chr1 (5-57)||(3648427-3648479)
chr1 (5-57)||(10952365-10952417)
chr1 (5-57)||(20331995-20332047)
chr1 (5-57)||(20332111-20332163)
chr1 (5-57)||(20332524-20332576)
chr1 (5-57)||(20332876-20332928)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (5-506)||(14569836-14570340)
chr8 (5-511)||(15774250-15774760)
chr8 (9-506)||(21341203-21341702)
chr8 (78-506)||(22139595-22140025)
chr8 (5-511)||(2130296-2130804)
chr8 (9-511)||(33249039-33249547)
chr8 (9-512)||(16260613-16261119)
chr8 (9-512)||(19694791-19695299)
chr8 (78-492)||(18797404-18797820)
chr8 (5-512)||(19654350-19654863)
chr8 (9-484)||(19910198-19910676)
chr8 (9-511)||(27601946-27602449)
chr8 (5-513)||(29836023-29836534)
chr8 (5-492)||(18716177-18716668)
chr8 (5-475)||(31361267-31361739)
chr8 (7-513)||(31482888-31483393)
chr8 (5-513)||(44567680-44568191)
chr8 (5-516)||(12085738-12086253)
chr8 (5-513)||(19681156-19681666)
chr8 (5-492)||(22073948-22074429)
chr8 (5-513)||(33265420-33265937)
chr8 (5-513)||(9361304-9361815)
chr8 (5-305)||(22388891-22389190)
chr8 (207-513)||(28355161-28355474)
chr8 (207-513)||(19201592-19201906)
chr8 (5-135)||(28355021-28355152)
chr8 (5-135)||(19201452-19201583)
chr8 (202-387)||(15775288-15775473)
chr8 (5-57)||(21341082-21341135)
chr8 (5-57)||(19681730-19681782)
chr8 (7-57)||(21340848-21340899)
chr8 (4-57)||(27601765-27601819)
chr8 (5-57)||(19654175-19654228)
chr8 (4-68)||(22140042-22140107)
chr8 (5-57)||(9361879-9361931)
chr8 (5-57)||(44568255-44568307)
chr8 (4-57)||(21340607-21340661)
chr8 (4-53)||(33249856-33249906)
chr8 (5-57)||(19653998-19654051)
chr8 (5-57)||(33249674-33249727)
chr8 (5-53)||(15775006-15775054)
chr8 (5-57)||(18716732-18716784)
chr8 (9-53)||(21340435-21340479)
chr8 (5-57)||(28354905-28354957)
chr8 (5-57)||(31482770-31482822)
[»] scaffold0792 (2 HSPs)
scaffold0792 (5-511)||(3661-4173)
scaffold0792 (5-57)||(3545-3597)
[»] scaffold0322 (5 HSPs)
scaffold0322 (9-492)||(12769-13258)
scaffold0322 (207-513)||(2354-2667)
scaffold0322 (5-135)||(2676-2807)
scaffold0322 (4-57)||(13448-13501)
scaffold0322 (5-57)||(2871-2923)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (5-506)||(8707-9214)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (5-511)||(12715-13225)
scaffold0418 (1-57)||(13289-13345)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (5-513)||(10615-11127)
scaffold0143 (5-511)||(33971-34484)
scaffold0143 (5-57)||(11191-11243)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (5-512)||(27992-28491)
scaffold0109 (6-53)||(28500-28548)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (5-492)||(7991-8479)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (17-511)||(24032-24531)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (5-516)||(14636-15151)
scaffold0038 (5-57)||(15215-15267)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (5-513)||(2226-2736)
scaffold0159 (5-299)||(23646-23935)
scaffold0159 (436-513)||(18505-18582)
[»] scaffold0241 (2 HSPs)
scaffold0241 (5-492)||(25627-26108)
scaffold0241 (5-53)||(25569-25618)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (212-515)||(467-778)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (5-513)||(16273-16788)
scaffold0336 (5-57)||(16852-16904)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (15-310)||(1123-1412)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (81-511)||(39734-40181)
[»] scaffold0477 (2 HSPs)
scaffold0477 (5-310)||(13022-13324)
scaffold0477 (5-57)||(12906-12958)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (9-164)||(6850-7005)
scaffold0089 (445-511)||(6741-6807)
scaffold0089 (9-53)||(7198-7242)
[»] scaffold0748 (12 HSPs)
scaffold0748 (1-53)||(1351-1403)
scaffold0748 (1-53)||(1459-1511)
scaffold0748 (1-53)||(1567-1619)
scaffold0748 (1-53)||(1675-1727)
scaffold0748 (5-53)||(1247-1295)
scaffold0748 (1-43)||(1783-1825)
scaffold0748 (5-53)||(1298-1346)
scaffold0748 (5-53)||(1406-1454)
scaffold0748 (5-53)||(1514-1562)
scaffold0748 (5-53)||(1622-1670)
scaffold0748 (5-53)||(1730-1778)
scaffold0748 (4-42)||(1009-1047)
[»] scaffold0489 (1 HSPs)
scaffold0489 (5-57)||(2155-2207)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 516
Target Start/End: Original strand, 27283380 - 27283883
Alignment:
Q  7 tacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttga 105  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27283380 tacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttga 27283478  T
Q  106 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgac 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||   ||      
T  27283479 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattgactcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattga---tg-- 27283573  T
Q  206 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 305  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  27283574 -ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27283672  T
Q  306 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctt 405  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283673 catgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctt 27283772  T
Q  406 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27283773 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacccgactggggata 27283872  T
Q  506 acgccgttatg 516  Q
    |||||||||||    
T  27283873 acgccgttatg 27283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27210083 - 27209574
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27210083 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgactt 27209984  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||    
T  27209983 gacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactga---tg 27209887  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| ||    
T  27209886 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaa 27209790  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------g 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||           
T  27209789 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagt 27209690  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  27209689 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactct 27209590  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  27209589 actgggaataatgccg 27209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 27239145 - 27239654
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27239145 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgactt 27239244  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||    
T  27239245 gacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactga---tg 27239341  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| ||    
T  27239342 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaa 27239438  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------g 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||           
T  27239439 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagt 27239538  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  27239539 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactct 27239638  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  27239639 actgggaataatgccg 27239654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26927935 - 26927427
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn----gacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |           ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26927935 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 26927836  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||     
T  26927835 acgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg- 26927740  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  26927739 --ttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 26927642  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 396  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||    
T  26927641 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 26927542  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |    
T  26927541 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatcaactcgctggggatagaatctcgggagactcta 26927442  T
Q  497 ctggggataacgccg 511  Q
    ||||| |||| ||||    
T  26927441 ctgggaataatgccg 26927427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16757000 - 16756496
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16757000 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgt 16756901  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacag-agaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||  | |||||||||||| |||   || |      
T  16756900 cgatttgatttgaaacgtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt-gacaggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tgtc-- 16756807  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  16756806 -gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 16756708  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  16756707 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaat 16756608  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  16756607 cctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactg 16756508  T
Q  500 gggataacgccg 511  Q
    || |||| ||||    
T  16756507 ggaataatgccg 16756496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Original strand, 22927868 - 22928380
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnng--acaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||| |||||||||||    
T  22927868 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttacaaaatataggttgaaattgac 22927967  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  22927968 ttgatgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 22928064  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  22928065 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 22928161  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
     ||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || |    
T  22928162 gatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcct 22928261  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22928262 ggaaatcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagact 22928361  T
Q  494 cgactggggataacgccgt 512  Q
    | ||| ||||||| |||||    
T  22928362 ctactagggataatgccgt 22928380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 484
Target Start/End: Original strand, 15405546 - 15406028
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  15405546 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 15405645  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||   |||    
T  15405646 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactg---ttg 15405742  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  15405743 ---ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 15405839  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |      
T  15405840 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctga 15405939  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 484  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15405940 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 484
Target Start/End: Original strand, 15417333 - 15417815
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  15417333 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 15417432  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||   |||    
T  15417433 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactg---ttg 15417529  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  15417530 ---ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 15417626  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |      
T  15417627 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctga 15417726  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 484  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15417727 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 13291960 - 13292470
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  13291960 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 13292059  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  13292060 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg 13292156  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    
T  13292157 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaa 13292253  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  13292254 tgcatgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 13292353  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag-ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13292354 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactc 13292453  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     |||||| |||| ||||    
T  13292454 tactgggaataatgccg 13292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27026325 - 27025822
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  27026325 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgactt 27026227  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| | |   ||    
T  27026226 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactaa---tg 27026130  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    
T  27026129 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaa 27026033  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |      
T  27026032 tgcatgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctga 27025933  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  27025932 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactct 27025833  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||||| ||||    
T  27025832 actgggaataa 27025822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 24298778 - 24299285
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24298778 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagtttt---gacaaaatatagattgagattgactt 24298874  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  |  ||  |||||| |||| | ||    
T  24298875 gacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattaaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgag--tt--attgag-ttgagactg 24298969  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  24298970 atattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 24299069  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |    
T  24299070 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttgg 24299169  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  24299170 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 24299269  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  24299270 actgggaataatgccg 24299285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27032205 - 27031701
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  27032205 ggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcagaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 27032106  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  27032105 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactga---tg 27032009  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||    
T  27032008 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaa 27031912  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |        || | |    
T  27031911 tgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttgg 27031812  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |     
T  27031811 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactct 27031712  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||||| ||||    
T  27031711 actgggaataa 27031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24870887 - 24870402
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaa--cagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24870887 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaaatcagaaacagattcactggggatt--gttttttgacaaagtatagattgaaattgacttgac 24870790  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| ||| |||||||    
T  24870789 gttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattgaca 24870690  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||      ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24870689 ttg------gaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24870596  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  24870595 atgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 24870496  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24870495 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29508605 - 29508096
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  29508605 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 29508506  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   |    
T  29508505 tgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---t 29508409  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |    
T  29508408 g---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgta 29508312  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  29508311 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 29508213  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  29508212 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactc 29508113  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     |||||| |||||||||    
T  29508112 tactgggaataacgccg 29508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29556741 - 29556231
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  29556741 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 29556642  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  29556641 ttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 29556545  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  29556544 tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 29556448  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  29556447 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 29556349  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29556348 ggaaatcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagact 29556249  T
Q  494 cgactggggataacgccg 511  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  29556248 ctactgggaataatgccg 29556231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 511
Target Start/End: Original strand, 33369441 - 33369954
Alignment:
Q  6 gtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn------gacaaaatatagattgaaatt 98  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             ||||||||||||||||| |||    
T  33369441 gtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagatt 33369540  T
Q  99 gacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattga 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||    
T  33369541 gacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 33369640  T
Q  199 aattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgct 298  Q
       ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  33369641 ---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgct 33369734  T
Q  299 tgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------t 390  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        |    
T  33369735 tgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatt 33369833  T
Q  391 catagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaag 490  Q
    | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33369834 cttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaag 33369933  T
Q  491 acccgactggggataacgccg 511  Q
    || | |||||| |||| ||||    
T  33369934 actctactgggaataatgccg 33369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 27201380 - 27200897
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| |||||| |    
T  27201380 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacct 27201281  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  27201280 gacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 27201184  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  27201183 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 27201087  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | |    
T  27201086 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttgg 27200988  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27200987 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27200897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Original strand, 27247853 - 27248336
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| |||||| |    
T  27247853 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacct 27247952  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  27247953 gacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 27248049  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  27248050 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 27248146  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | |    
T  27248147 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttgg 27248245  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27248246 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27248336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 13517208 - 13517720
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  13517208 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 13517307  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||| ||| ||    
T  13517308 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatat 13517407  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||| ||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  13517408 tgatattg------gaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 13517501  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  13517502 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 13517600  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13517601 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacc 13517700  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
     ||||||||| || ||||||    
T  13517701 tgactggggaaaatgccgtt 13517720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20131692 - 20131253
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata-ttcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||          |||||||| ||||||| |||||||    
T  20131692 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggatt-------ttaacaaaatacagattgatattgact 20131600  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||       
T  20131599 tgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgacataagcattgaattgagacaga--- 20131503  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20131502 tg---ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttga 20131406  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------t 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        |    
T  20131405 aatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcct 20131313  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 453  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20131312 ggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 20131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 453
Target Start/End: Original strand, 22201178 - 22201617
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata-ttcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||          |||||||| ||||||| |||||||    
T  22201178 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggatt-------ttaacaaaatacagattgatattgact 22201270  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||       
T  22201271 tgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgacataagcattgaattgagacaga--- 22201367  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22201368 tg---ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttga 22201464  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------t 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        |    
T  22201465 aatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcct 22201557  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 453  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22201558 ggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 22201617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26792996 - 26792491
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26792996 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttt---gacaaaatatagattgagattgactt 26792900  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  26792899 gacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 26792803  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  26792802 ---ttgacattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 26792706  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  26792705 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 26792607  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||       
T  26792606 aaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacttt 26792507  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    ||||||||||| ||||    
T  26792506 actggggataatgccg 26792491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Original strand, 30550996 - 30551506
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  30550996 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgact 30551094  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  30551095 tgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 30551191  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  30551192 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 30551288  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  30551289 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 30551387  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30551388 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 30551487  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  30551488 gaccggggaaaacgccgtt 30551506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 202 - 516
Target Start/End: Original strand, 27622914 - 27623228
Alignment:
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| || ||| ||| |||    
T  27622914 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattg 27623013  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623014 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 27623112  T
Q  401 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623113 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 27623212  T
Q  501 ggataacgccgttatg 516  Q
    ||||||||||||||||    
T  27623213 ggataacgccgttatg 27623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 29580216 - 29579707
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29580216 ggtacaagctgctcttggacttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatacagattgagattgactt 29580118  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  29580117 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 29580021  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  29580020 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 29579924  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |    
T  29579923 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttgg 29579825  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29579824 aaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctg 29579725  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| || ||||||    
T  29579724 actggggagaatgccgtt 29579707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 4538773 - 4539285
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-agnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4538773 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgac 4538872  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  4538873 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 4538969  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  4538970 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 4539066  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  4539067 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 4539165  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  4539166 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagact 4539265  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
      ||||||||||| ||||||    
T  4539266 ttactggggataatgccgtt 4539285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 518
Target Start/End: Original strand, 26109415 - 26109933
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  26109415 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgac 26109514  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||  |    
T  26109515 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgt 26109614  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    |||||||||      |||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  26109615 tgacattga------aaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 26109708  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || |    
T  26109709 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttctt 26109807  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccg-ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
     |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  26109808 ggaaatcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagac 26109907  T
Q  493 ccgactggggataacgccgttatgat 518  Q
       ||||||||||| |||||| ||||    
T  26109908 tttactggggataatgccgttgtgat 26109933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27492311 - 27491811
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatt 113  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27492311 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatt 27492213  T
Q  114 tgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacat 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||    
T  27492212 tgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga---tg---ttgacat 27492119  T
Q  214 tggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  27492118 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 27492019  T
Q  314 ttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctt 405  Q
    |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||||||||||    
T  27492018 ttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctt 27491920  T
Q  406 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggat 504  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  || |||||     
T  27491919 tggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagacctcaccggggaa 27491820  T
Q  505 aacgccgtt 513  Q
    |||||||||    
T  27491819 aacgccgtt 27491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27014907 - 27014399
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |        ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27014907 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcacgggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgactt 27014808  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
     ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  27014807 aacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 27014711  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  27014710 ---ttgacattggaaatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 27014614  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  27014613 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 27014515  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||||||| |     
T  27014514 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctggggatagaatctcggaagactct 27014415  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  27014414 actgggaataatgccg 27014399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28167679 - 28167188
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  28167679 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 28167580  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||       
T  28167579 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga--- 28167483  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  28167482 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 28167386  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  28167385 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 28167287  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167286 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 28214653 - 28214138
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-agnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  28214653 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgac 28214554  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  28214553 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 28214457  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  28214456 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 28214360  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  28214359 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 28214261  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |     
T  28214260 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggct 28214161  T
Q  494 cgactggggataacgccgttatg 516  Q
      |||||||| ||||||||||||    
T  28214160 ttactggggaaaacgccgttatg 28214138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 513
Target Start/End: Original strand, 16937025 - 16937532
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16937025 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgac 16937124  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||       
T  16937125 atcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg--- 16937218  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16937219 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16937318  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  16937319 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 16937417  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||    
T  16937418 ttctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtgacttgctggggatagagtcttgagagactccact 16937517  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| |||||||||    
T  16937518 ggggaaaacgccgtt 16937532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 26665652 - 26666163
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  26665652 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgact 26665751  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  26665752 tgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 26665848  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   ||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  26665849 g---ttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 26665945  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  26665946 atgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttg 26666044  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  26666045 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 26666144  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  26666145 tactggggaaaacgccgtt 26666163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 26771623 - 26772134
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  26771623 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgact 26771722  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  26771723 tgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 26771819  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   ||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  26771820 g---ttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 26771916  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  26771917 atgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttg 26772015  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  26772016 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 26772115  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  26772116 tactggggaaaacgccgtt 26772134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 535
Target Start/End: Original strand, 27355102 - 27355631
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaactt-gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27355102 caagctgctcttggattgagcttagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 27355201  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||       
T  27355202 gtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg--- 27355295  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27355296 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27355395  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27355396 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27355494  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||     
T  27355495 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcacc 27355594  T
Q  499 ggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctgg 535  Q
    ||||| ||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  27355595 ggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgg 27355631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4532466 - 4531967
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatt 113  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4532466 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacaaaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatt 4532368  T
Q  114 tgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacat 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||    
T  4532367 tgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactga---tg---ttgacat 4532274  T
Q  214 tggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  4532273 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 4532174  T
Q  314 ttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctt 405  Q
    |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |        || | |||||||||||    
T  4532173 ttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacacattcttggaaatcctctt 4532075  T
Q  406 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 505  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||    
T  4532074 tggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggata 4531975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16681343 - 16680832
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  16681343 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 16681244  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||  | || ||||||||| |||   |    
T  16681243 tgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactga---t 16681147  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  16681146 g---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 16681050  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata-------- 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |            
T  16681049 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcg 16680951  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| |    
T  16680950 gagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactc 16680851  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     || ||||| |||||||||    
T  16680850 caccggggaaaacgccgtt 16680832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 14138421 - 14138925
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn------gacaaaatatagattgaaat 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             ||||||||||||||||| ||    
T  14138421 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagat 14138520  T
Q  98 tgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattg 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| ||    
T  14138521 tgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactg 14138620  T
Q  198 aaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 297  Q
    |  ||||||||||      |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          || ||| ||||    
T  14138621 atgttgacattga------aaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtatgaatgc 14138704  T
Q  298 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-------- 389  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |            
T  14138705 ttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacat 14138803  T
Q  390 tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaa 489  Q
    || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14138804 tcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaa 14138903  T
Q  490 gacccgactggggataacgccg 511  Q
    ||| | |||||| |||| ||||    
T  14138904 gactctactgggaataatgccg 14138925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4780093 - 4779584
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |       |||||||||||||||||  |||||||    
T  4780093 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttgactt 4779995  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  4779994 gacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatcgaattgagactga---tg 4779898  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  4779897 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 4779801  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  4779800 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 4779702  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  4779701 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttt 4779602  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  4779601 actggggaaaacgccgtt 4779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Original strand, 8898688 - 8899176
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||| |||| |||||    
T  8898688 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatataggttgagattga 8898787  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattga 198  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||    
T  8898788 cttgacatcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 8898887  T
Q  199 aattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgct 298  Q
       ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  8898888 ---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgct 8898981  T
Q  299 tgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---- 394  Q
    || |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        
T  8898982 tgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacatt 8899080  T
Q  395 ----gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  8899081 ctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 8899176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27064600 - 27064174
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27064600 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaactgaaaggcagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27064501  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    |  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  27064500 tgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgca- 27064408  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
             || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27064407 ---------tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtg 27064318  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    |||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||  | |||||    
T  27064317 gctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttg 27064218  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27064217 ctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 27064174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 4764936 - 4764462
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  4764936 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 4764837  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    | ||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||  ||    
T  4764836 taacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtt 4764737  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    ||||||||      |||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          || ||| ||||||| |    
T  4764736 gacattga------aaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtatgaatgcttgta 4764653  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  4764652 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 4764554  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4764553 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttg 4764462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20175733 - 20175368
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata-ttcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||          |||||||| ||||||||||||||||    
T  20175733 ggtacaagctgttcttggattgaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttcattgggattt--------taacaaaatacagattgaaattgactt 20175642  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||      ||    
T  20175641 gacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtcatagacattgaattgag------at 20175548  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
     || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||    
T  20175547 agatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttga 20175448  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 388  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20175447 aatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 20175368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 388
Target Start/End: Original strand, 22160258 - 22160623
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata-ttcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||          |||||||| ||||||||||||||||    
T  22160258 ggtacaagctgttcttggattgaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttcattgggattt--------taacaaaatacagattgaaattgactt 22160349  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||      ||    
T  22160350 gacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtcatagacattgaattgag------at 22160443  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
     || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||    
T  22160444 agatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttga 22160543  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 388  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22160544 aatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 22160623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34458012
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | ||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagagtcttggaagacctgact 34457997  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  34457998 ggggaaaatgccgtt 34458012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 34457559 - 34457690
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34457559 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 34457658  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457659 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 34457690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Original strand, 27622486 - 27622643
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttctt-ggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcact-ggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||  ||||||| |        ||||||||||| ||||||| |||    
T  27622486 gggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgaccagaaagaaagaaattgacgaggggattggtttgttttgacaaaatatatattgaaagtga 27622585  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 158  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27622586 cttgacgtcgatttaatttgaaaagtagaaattgaccaatattattggctcacaagat 27622643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 4755699 - 4755824
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |       |||||||||||||||||  |||||||    
T  4755699 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttgactt 4755797  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 130  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  4755798 gacgtcgacttgaattgaaaggtagaa 4755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27064702 - 27064638
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064702 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 27064638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622267 - 27622317
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttctt-ggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622267 gggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 27622317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622097 - 27622150
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttctt-ggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27622097 gatgggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaaca 27622150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 27621993 - 27622041
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27621993 ggtacaagctgttcttggatcgaacctgccacttgaccacacagaaaca 27622041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 22927574 - 22927627
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22927574 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 22927627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26665536 - 26665588
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26665536 ggtacaagctgctcttggatcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 26665588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26771507 - 26771559
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26771507 ggtacaagctgctcttggatcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 26771559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622153 - 27622201
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27622153 ggtacgagctgtccttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaaca 27622201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622372 - 27622420
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27622372 ggtacgagctgtccttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaaca 27622420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 27622206 - 27622249
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttctt-ggatcgaacttgccacttgacca 43  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27622206 gatgggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgacca 27622249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 27622425 - 27622468
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttctt-ggatcgaacttgccacttgacca 43  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27622425 gatgggtacaagctgttctttggatcgaacttgccacttgacca 27622468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20131750 - 20131697
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20131750 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagagacatatt 20131697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 22201120 - 22201169
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22201120 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 22201169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 22927217 - 22927270
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22927217 ggtacgagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 22927270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 22927691 - 22927744
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22927691 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatatt 22927744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 4538657 - 4538709
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4538657 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 4538709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 8898572 - 8898624
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8898572 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 8898624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 14138305 - 14138357
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14138305 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 14138357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26109299 - 26109351
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26109299 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 26109351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28167795 - 28167743
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28167795 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 28167743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28214769 - 28214717
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28214769 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 28214717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 29508721 - 29508669
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29508721 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 29508669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 33369324 - 33369376
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33369324 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 33369376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 27621816 - 27621866
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacat 54  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  27621816 gggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacagaaacat 27621866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622050 - 27622092
Alignment:
Q  11 agctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  27622050 agctgttcttggatcgaacctgccactcgaccaaatagaaaca 27622092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 13291719 - 13291764
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  13291719 gatgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaa 13291764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27201497 - 27201444
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27201497 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 27201444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 27247736 - 27247789
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27247736 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 27247789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 27622320 - 27622369
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttctt-ggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27622320 ggtacgagctgttctttggatcgaacttgccactcgaccagacagaaaca 27622369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16681459 - 16681407
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  16681459 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 16681407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26928059 - 26928003
Alignment:
Q  2 atgggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26928059 atgggtacaagtcgttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatatt 26928003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27064818 - 27064766
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27064818 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 27064766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27210373 - 27210329
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  27210373 caagctgctcttggatcgagctagccacttgagcaaacagaaaca 27210329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Original strand, 27238855 - 27238899
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  27238855 caagctgctcttggatcgagctagccacttgagcaaacagaaaca 27238899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 29556857 - 29556805
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  29556857 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 29556805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 34457443 - 34457495
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  34457443 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 34457495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 516
Target Start/End: Original strand, 26508644 - 26509154
Alignment:
Q  9 caagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508644 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacg 26508743  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |    
T  26508744 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---t 26508837  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||    
T  26508838 tgacattgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgca 26508937  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |||||    
T  26508938 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaat 26509037  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26509038 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgactg 26509137  T
Q  500 gggataacgccgttatg 516  Q
    |||||||||||||||||    
T  26509138 gggataacgccgttatg 26509154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5155264 - 5154758
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  5155264 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttt---gacaaaatatagattgaaattgactt 5155168  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  5155167 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 5155071  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  5155070 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 5154974  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  5154973 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 5154874  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  5154873 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 5154774  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  5154773 actgggaataatgccg 5154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2161755 - 2161247
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||    
T  2161755 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattggtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 2161656  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  2161655 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 2161559  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  2161558 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 2161462  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  2161461 tgcatgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 2161362  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  2161361 aaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcag-tagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 2161263  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  2161262 actgggaataatgccg 2161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16048511 - 16048027
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16048511 caagctgctcttggattcgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattaggtttt--gacaaaatatagattgaaactgacttgacg 16048414  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||| |||   ||   |    
T  16048413 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctaacataagtattgaattgagactga---tg---t 16048320  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| | || ||| ||||| | ||||||    
T  16048319 tggcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgca 16048220  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  16048219 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaat 16048120  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16048119 cctctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5165565 - 5165059
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  5165565 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttt---gacaaaatatagattgaaattgactt 5165469  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||  | ||| |||||||| ||| ||||    
T  5165468 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtattaaattgagactgatattg 5165369  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    ||||||      ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  5165368 acattg------gaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 5165275  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  5165274 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 5165175  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |     
T  5165174 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactct 5165075  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  5165074 actagggataatgccg 5165059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Original strand, 11417740 - 11418243
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11417740 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacataaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgacttgacgt 11417838  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||    
T  11417839 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---tt 11417932  T
Q  209 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 308  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  11417933 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 11418032  T
Q  309 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 400  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||    
T  11418033 gactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatc 11418132  T
Q  401 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 500  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  11418133 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgg 11418232  T
Q  501 ggataacgccg 511  Q
    | |||| ||||    
T  11418233 gaataatgccg 11418243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 26662845 - 26663354
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||| ||||||||    
T  26662845 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgactt 26662943  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  26662944 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 26663040  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  26663041 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 26663137  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  26663138 tgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 26663236  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26663237 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctg 26663336  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| || ||||||    
T  26663337 actggggaaaatgccgtt 26663354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 26678037 - 26678546
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||| ||||||||    
T  26678037 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgactt 26678135  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  26678136 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 26678232  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  26678233 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 26678329  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  26678330 tgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 26678428  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26678429 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctg 26678528  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| || ||||||    
T  26678529 actggggaaaatgccgtt 26678546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Original strand, 16442937 - 16443446
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16442937 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaatggggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaactgactt 16443035  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| | |   ||    
T  16443036 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattaaccaacgttgttggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactaa---tg 16443132  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  16443133 c---tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 16443229  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |    
T  16443230 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 16443329  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  16443330 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 16443429  T
Q  496 actggggataacgccgt 512  Q
     |||||||||| |||||    
T  16443430 gctggggataatgccgt 16443446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 512
Target Start/End: Original strand, 16511389 - 16511890
Alignment:
Q  17 tcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgat 112  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16511389 tcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgat 16511488  T
Q  113 ttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| ||| ||||      |||    
T  16511489 ttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatattg------aca 16511582  T
Q  213 ttggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 312  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  16511583 ttggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 16511682  T
Q  313 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctct 404  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |        || | ||||||||||    
T  16511683 gttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgtgctatattacacattcctggaaatcctct 16511782  T
Q  405 ttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggat 504  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||    
T  16511783 ttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaat 16511882  T
Q  505 aacgccgt 512  Q
    || |||||    
T  16511883 aatgccgt 16511890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2780428 - 2779919
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  2780428 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 2780329  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  2780328 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 2780232  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  2780231 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 2780135  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  2780134 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctg 2780036  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2780035 gaaatcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactc 2779936  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     |||||| |||| ||||    
T  2779935 tactgggaataatgccg 2779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 10909877 - 10910390
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn----gacaaaatatagattgaaattg 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||| ||||    
T  10909877 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattg 10909976  T
Q  100 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||     
T  10909977 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgat 10910076  T
Q  200 attgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
    ||||      ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  10910077 attg------acattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 10910170  T
Q  300 gaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tc 391  Q
    | |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        ||    
T  10910171 gtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattc 10910270  T
Q  392 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 491  Q
     | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  10910271 ctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggaga 10910370  T
Q  492 cccgactggggataacgccg 511  Q
    | | |||||| |||| ||||    
T  10910371 ctctactgggaataatgccg 10910390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26596859 - 26596349
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26596859 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 26596761  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  26596760 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 26596664  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    
T  26596663 ---ttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaa 26596567  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | |    
T  26596566 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgg 26596468  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26596467 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacct 26596368  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  26596367 gactggggaaaatgccgtt 26596349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 31557334 - 31557847
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  31557334 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgac 31557433  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||       
T  31557434 ttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga--- 31557530  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||     
T  31557531 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgt 31557627  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || |    
T  31557628 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttctt 31557726  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagac 492  Q
     ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31557727 ggaaatcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagac 31557826  T
Q  493 ccgactggggataacgccgtt 513  Q
       |||||||| |||||||||    
T  31557827 tttactggggaaaacgccgtt 31557847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 31083555 - 31084066
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |       ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31083555 ggtacaagctgttcttggacctgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggaggttggtttggttgacaaaatatagattgagattgattt 31083654  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||    
T  31083655 gacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgataacattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtgttgaattgagactga---tg 31083751  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  31083752 ---ttgtcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 31083848  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  31083849 tgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 31083947  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  31083948 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactc 31084047  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     || ||||| |||||||||    
T  31084048 caccggggaaaacgccgtt 31084066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26442447 - 26441938
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26442447 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-ggttttttgacaaaatatagattgagattgactt 26442349  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||| |||   ||    
T  26442348 gacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgatatgagtattgaattgagactga---tg 26442252  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  26442251 ---ttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 26442155  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  26442154 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 26442056  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  26442055 aaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacccc 26441956  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||| |||||||||    
T  26441955 accggggaaaacgccgtt 26441938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22149071 - 22148563
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22149071 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-ggttttttgacaaaatatagattgagattgactt 22148973  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||  ||     
T  22148972 gacatcgatttgaattgaaaggcagaaatcgaccgatattatcggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtt- 22148874  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  22148873 ----tgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 22148778  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  22148777 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 22148679  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |     
T  22148678 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactct 22148579  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  22148578 actgggaataatgccg 22148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26520010 - 26519501
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||| |    
T  26520010 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgacct 26519912  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || |||||| || |||   ||    
T  26519911 gacatcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactga---tg 26519815  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  26519814 ---ttgacattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 26519718  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  26519717 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 26519619  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  26519618 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttt 26519519  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  26519518 actggggaaaacgccgtt 26519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 24585467 - 24585978
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24585467 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 24585566  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||      | ||    
T  24585567 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgag------actg 24585660  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  24585661 atattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 24585760  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
     ||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  24585761 cgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 24585859  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | |    
T  24585860 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctc 24585959  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  24585960 cactggggaaaacgccgtt 24585978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 45394421 - 45393913
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |        |||||| |||||||||| ||||||||    
T  45394421 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgactt 45394322  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  45394321 gacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaga--acctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 45394227  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  45394226 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 45394130  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |        || | |    
T  45394129 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgg 45394031  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  45394030 gaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttt 45393931  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  45393930 actggggaaaacgccgtt 45393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 45738489 - 45737995
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-----gacaaaatatagattgaaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            ||||||||||||||||| |||    
T  45738489 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgttgacaaaatatagattgagatt 45738390  T
Q  99 gacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattga 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||    
T  45738389 gacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 45738290  T
Q  199 aattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgct 298  Q
       ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  45738289 ---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgct 45738196  T
Q  299 tgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------t 390  Q
    || |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        |    
T  45738195 tgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatt 45738097  T
Q  391 catagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaag 490  Q
    | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  45738096 cttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctggggatagaatcttgggag 45737997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11448092 - 11447582
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | |||||| |||||||| ||||||||    
T  11448092 ggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgactt 11447994  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||  | |||||||||||| |||   ||    
T  11447993 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgtcatgagtattgaattgagactga---tg 11447897  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| |    
T  11447896 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgta 11447800  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  11447799 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 11447701  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  11447700 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 11447601  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  11447600 tactggggaaaacgccgtt 11447582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 478
Target Start/End: Original strand, 5140267 - 5140744
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5140267 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgattt 5140366  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  5140367 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 5140463  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  5140464 tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 5140560  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 394  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |           
T  5140561 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctc 5140659  T
Q  395 -gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 478  Q
     || ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||    
T  5140660 ggagatcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 31131089 - 31130616
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatt 113  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31131089 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatt 31130991  T
Q  114 tgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacat 213  Q
    || ||||||||||| || |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| ||||   ||   ||    
T  31130990 tggtttgaaaggtaaaatttgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattg---tt---at 31130897  T
Q  214 tggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 313  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  31130896 tggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 31130797  T
Q  314 ttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctt 405  Q
    |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||    
T  31130796 ttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctt 31130698  T
Q  406 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31130697 tggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 31130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 26312796 - 26313306
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26312796 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatataaattgagattgactt 26312894  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  26312895 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 26312991  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  26312992 ---ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 26313088  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||   |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  26313089 tgcatgactattggcattttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 26313187  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  26313188 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactc 26313287  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     || ||||| |||||||||    
T  26313288 caccggggaaaacgccgtt 26313306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4206570 - 4206069
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgat 112  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4206570 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgat 4206471  T
Q  113 ttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgaca 212  Q
    |||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| |    
T  4206470 ttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgata 4206377  T
Q  213 ttggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 312  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  4206376 ttggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 4206277  T
Q  313 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctct 404  Q
     |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||    
T  4206276 attggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctct 4206178  T
Q  405 ttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggat 504  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||     
T  4206177 ttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaa 4206078  T
Q  505 aacgccgtt 513  Q
    |||||||||    
T  4206077 aacgccgtt 4206069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 207 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848299
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 10848493  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 398  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        | ||||    
T  10848492 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaa 10848393  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10848392 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 10848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744962
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16744947  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  16744948 ggggaaaatgccgtt 16744962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138687
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 4138672  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| |||||||||    
T  4138673 ggggaaaacgccgtt 4138687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 207 - 492
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206585
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3452243 - 3451926
Alignment:
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3452243 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3452144  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |          
T  3452143 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 3452045  T
Q  395 --gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3452044 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 3451945  T
Q  493 ccgactggggataacgccg 511  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  3451944 tctactgggaataatgccg 3451926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 16744508 - 16744640
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||    
T  16744508 gggtacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgact 16744607  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744608 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 513
Target Start/End: Original strand, 26268202 - 26268527
Alignment:
Q  195 ttgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 293  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  26268202 ttgaatttgacatttgtattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatga 26268301  T
Q  294 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcat 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  26268302 atgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattac 26268400  T
Q  394 a--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatctt 485  Q
    |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| | | ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  26268401 acattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaccta-ggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatctt 26268499  T
Q  486 ggaagacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||    
T  26268500 ggaagactttactggggaaaacgccgtt 26268527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 39206153 - 39206284
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39206153 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgcttgacaaaatatagattgagattgactt 39206252  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206253 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 4138233 - 4138365
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  4138233 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgact 4138332  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138333 tgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 4138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 346 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152790
Alignment:
Q  346 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  438 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22152790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 346 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208705
Alignment:
Q  346 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  438 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 26267896 - 26267960
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26267896 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt 26267960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26442564 - 26442511
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26442564 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 26442511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 31557218 - 31557269
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatat 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  31557218 ggtacaagctgctcttggatcgagctagccacttgaccaaacggaaacatat 31557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 11417618 - 11417672
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11417618 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaccgaaacatatt 11417672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26508050 - 26508103
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26508050 ggtacaagctgttcttgggcttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 26508103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26596976 - 26596923
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26596976 gggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 26596923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 31083438 - 31083491
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31083438 ggtacaagctgttctcggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 31083491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26442680 - 26442628
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26442680 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 26442628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26507934 - 26507986
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507934 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 26507986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 39205202 - 39205254
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39205202 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 39205254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 45738605 - 45738553
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45738605 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 45738553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 39206037 - 39206087
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata 55  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  39206037 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacata 39206087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 2161996 - 2161951
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaa 45  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  2161996 gatgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaa 2161951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10848826 - 10848777
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10848826 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 10848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 26508582 - 26508631
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26508582 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 26508631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22149187 - 22149135
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  22149187 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 22149135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26267780 - 26267832
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  26267780 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 26267832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26312680 - 26312732
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  26312680 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 26312732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26508285 - 26508337
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||    
T  26508285 ggtacaagctgctcttggattgagctgggtacttgaccaaacagaaacatatt 26508337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26662729 - 26662781
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  26662729 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 26662781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 26677921 - 26677973
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  26677921 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 26677973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Original strand, 21696227 - 21696735
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21696227 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcgctggggattagctttt--gacaaaatatagattgaaactgactt 21696324  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  21696325 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgatttgagactga---tg 21696421  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  21696422 c---tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 21696518  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |    
T  21696519 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaatattacacattcctgg 21696618  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |     
T  21696619 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctct 21696718  T
Q  496 actggggataacgccgt 512  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21696719 actggggataatgccgt 21696735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Original strand, 34267959 - 34268463
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34267959 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacagggtattagtttttttgacaaaatatagattgagattgactt 34268058  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  34268059 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 34268155  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  34268156 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 34268252  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |    
T  34268253 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctgg 34268352  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  34268353 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 34268452  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||||||||||    
T  34268453 actggggataa 34268463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 36 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23117947 - 23117471
Alignment:
Q  36 cttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117947 cttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 23117849  T
Q  136 ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggat 235  Q
    || |||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  23117848 ccgatattattggctcccaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatgaat 23117755  T
Q  236 gatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||| ||  |||||||||||||||    
T  23117754 gatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcgatttgtagacacagtt 23117655  T
Q  336 tcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggaga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  23117654 tcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagg 23117555  T
Q  428 cgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  23117554 cgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 23117471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 37678936 - 37679445
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37678936 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 37679034  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  37679035 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 37679131  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  37679132 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 37679228  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  37679229 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcgg 37679327  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37679328 agatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctg 37679427  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| || ||||||    
T  37679428 actggggaaaatgccgtt 37679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 37694201 - 37694710
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37694201 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 37694299  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  37694300 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 37694396  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  37694397 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 37694493  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  37694494 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcgg 37694592  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37694593 agatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctg 37694692  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| || ||||||    
T  37694693 actggggaaaatgccgtt 37694710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 19409522 - 19410031
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||    
T  19409522 ggtacaagctgttcttggacctgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgactt 19409620  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  19409621 gacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 19409717  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  19409718 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 19409814  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  19409815 tgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 19409913  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19409914 aaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccc 19410013  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  19410014 actggggaaaacgccgtt 19410031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37932579 - 37932072
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37932579 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttt---gacaaaatatagattgagattgactt 37932483  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  37932482 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 37932386  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  37932385 ---ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 37932289  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  37932288 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 37932190  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932189 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccg 37932090  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  37932089 actggggaaaacgccgtt 37932072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 253689 - 254199
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  253689 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 253788  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  253789 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 253885  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  253886 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 253982  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  253983 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 254081  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  254082 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctg 254181  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| || ||||||    
T  254182 actggggaaaatgccgtt 254199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3789648 - 3789138
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3789648 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttg 3789549  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||     
T  3789548 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg- 3789453  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcatta-aatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  3789452 --ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 3789355  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  3789354 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 3789256  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789255 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccg 3789156  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  3789155 actggggaaaacgccgtt 3789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27397532 - 27397031
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  27397532 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggaatagttttt--gacaaaatatagattgaaattgactt 27397435  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| | ||  ||   |       ||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  27397434 gacattgacatgtcct-------agagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattg 27397342  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    ||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  27397341 acattg------gaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 27397248  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |    
T  27397247 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgg 27397148  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  27397147 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcc 27397048  T
Q  496 actggggataacgccgt 512  Q
     |||||||||| |||||    
T  27397047 gctggggataatgccgt 27397031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 78 - 492
Target Start/End: Original strand, 27427583 - 27428000
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  27427583 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 27427682  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    |  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27427683 tgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcat 27427776  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27427777 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatg 27427876  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaat-caactt 468  Q
    |||||||||| |        || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  27427877 gctcgtgctatattacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaactt 27427976  T
Q  469 gctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  27427977 gctggggacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34298354 - 34297856
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34298354 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccactagaccaaatagaaacatattcactggggattggtttgcttgacaaaatatagattgagattgactt 34298255  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||   ||    
T  34298254 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattga---tg 34298158  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
     |   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  34298157 tc---gacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 34298061  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  34298060 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 34297962  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  34297961 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 34297862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28889436 - 28888929
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||         ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28889436 ggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggatt--gttttttgacaaaatatagattgaaactgactt 28889339  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | ||||||||||||||||   ||    
T  28889338 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccaaaattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagattga---tg 28889242  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||  |    
T  28889241 ---ttaacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtta 28889145  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |    
T  28889144 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 28889045  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  28889044 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 28888945  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  28888944 actgggaataatgccg 28888929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 21670211 - 21670720
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21670211 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 21670309  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||| |||   ||    
T  21670310 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactga---tg 21670406  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||    
T  21670407 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaa 21670503  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  21670504 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 21670602  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21670603 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctg 21670702  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  21670703 actggggaaaacgccgtt 21670720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 513
Target Start/End: Original strand, 13929657 - 13930158
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgat 112  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13929657 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgat 13929756  T
Q  113 ttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgaca 212  Q
    |||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||    
T  13929757 ttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgaca 13929850  T
Q  213 ttggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 312  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  13929851 ttggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 13929950  T
Q  313 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctct 404  Q
    ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||||    
T  13929951 gttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctct 13930049  T
Q  405 ttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggat 504  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  13930050 ttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggag 13930149  T
Q  505 aacgccgtt 513  Q
    |||||||||    
T  13930150 aacgccgtt 13930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37384864 - 37384371
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||||||||| ||||    
T  37384864 gatgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgatttttttgacaaagtatagattgagattg 37384765  T
Q  100 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || | ||||||| |||     
T  37384764 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcggattgagactga- 37384666  T
Q  200 attgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
      ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37384665 --tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 37384571  T
Q  300 gaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tc 391  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||    
T  37384570 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattc 37384472  T
Q  392 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 491  Q
     | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37384471 ttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 37384372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Original strand, 16822375 - 16822885
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  16822375 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgact 16822473  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  16822474 tgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 16822570  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  16822571 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 16822667  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  16822668 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 16822766  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16822767 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 16822866  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  16822867 gaccggggaaaacgccgtt 16822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16899105 - 16898595
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  16899105 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgact 16899007  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  16899006 tgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 16898910  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  16898909 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 16898813  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  16898812 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 16898714  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898713 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 16898614  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  16898613 gaccggggaaaacgccgtt 16898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 39897273 - 39896764
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39897273 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 39897175  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  39897174 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 39897078  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||    
T  39897077 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaa 39896981  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  39896980 tgcatgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 39896882  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  39896881 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagacttt 39896782  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  39896781 actggggaaaacgccgtt 39896764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 511
Target Start/End: Original strand, 31867877 - 31868354
Alignment:
Q  32 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 130  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31867877 gccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggaagaa 31867976  T
Q  131 attgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgta 230  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||     ||| |    
T  31867977 attgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat-----atgca 31868065  T
Q  231 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  31868066 tggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagaca 31868165  T
Q  331 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31868166 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 31868265  T
Q  423 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31868266 ggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaaacttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32056957 - 32056447
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  32056957 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgact 32056859  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  32056858 tgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 32056762  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  32056761 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 32056665  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  32056664 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 32056566  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056565 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 32056466  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  32056465 gaccggggaaaacgccgtt 32056447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 12662669 - 12662165
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12662669 caagctgctcttgggttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatta-ttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgt 12662571  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||    ||||| |||||| ||   |||   ||    
T  12662570 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgaatattgagttgagactg---ttg---tt 12662477  T
Q  209 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 308  Q
    || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  12662476 gatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 12662377  T
Q  309 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 400  Q
    ||  ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||    
T  12662376 gactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 12662277  T
Q  401 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  12662276 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactg 12662177  T
Q  500 gggataacgccg 511  Q
    || |||| ||||    
T  12662176 ggaataatgccg 12662165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 34868839 - 34868329
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||  |||||||| ||||||||    
T  34868839 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaaagtagattgagattgactt 34868741  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  34868740 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 34868644  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  34868643 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 34868547  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  34868546 atgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 34868448  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  34868447 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 34868348  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  34868347 tactggggaaaacgccgtt 34868329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Original strand, 37944898 - 37945412
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||    
T  37944898 gatgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattg 37944997  T
Q  100 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaa 199  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||  | || ||||||||| |||     
T  37944998 actcgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactga- 37945096  T
Q  200 attgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
      ||   ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| |||||     
T  37945097 --tg---ttgacattggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctg 37945191  T
Q  300 gaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tc 391  Q
    | |||||||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||    
T  37945192 gtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattc 37945290  T
Q  392 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 491  Q
     | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37945291 ttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaaga 37945390  T
Q  492 cccgactggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||||||| || ||||||    
T  37945391 cctgactggggaaaatgccgtt 37945412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 78 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20845025 - 20844590
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   | ||    
T  20845025 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgtca 20844926  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    |  | ||||| |||||| ||| ||||||||||      ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20844925 tgagtattgagttgagactgatattgacattg------gaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcat 20844832  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20844831 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgtaatg 20844732  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    |||||||||| |        || | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20844731 gctcgtgctatattacacattcctggaaatcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttg 20844632  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  20844631 ctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 20844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27123706 - 27123216
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  27123706 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgact 27123607  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   |    
T  27123606 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---t 27123510  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  27123509 g---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 27123413  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  27123412 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 27123314  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123313 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 34162047 - 34161536
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  34162047 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 34161948  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  34161947 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 34161851  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |    
T  34161850 g---ttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgta 34161754  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || |     
T  34161753 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttg 34161655  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  34161654 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactc 34161555  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     || ||||| |||||||||    
T  34161554 caccggggaaaacgccgtt 34161536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12594021 - 12593509
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||  |||||||    
T  12594021 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgtttgacaaaatatagattgagtttgactt 12593922  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  12593921 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 12593825  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||     
T  12593824 tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgt 12593728  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 394  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |           
T  12593727 aatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctc 12593629  T
Q  395 -gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12593628 ggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacc 12593529  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
     ||||||||| || ||||||    
T  12593528 tgactggggaaaatgccgtt 12593509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 11628223 - 11628732
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |       ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  11628223 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggtt-ggtttgttgacaaaatataaactgagattgactt 11628321  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    |||||||||||| |||   ||    
T  11628322 gacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatattgaattgagactga---tg 11628418  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  11628419 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 11628515  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  11628516 tgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 11628614  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |     
T  11628615 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactcc 11628714  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||| |||||||||    
T  11628715 accggggaaaacgccgtt 11628732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31883475 - 31882987
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31883475 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgattt 31883377  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||| ||| ||||    
T  31883376 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattg 31883277  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    ||||||      ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  31883276 acattg------gaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 31883183  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  31883182 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 31883084  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883083 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 31882987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Original strand, 19449455 - 19449939
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  19449455 ggtacaagctgttcttggacttgaactaggcacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaattgactt 19449554  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| | ||  ||   |       ||| || | |||||  || |||||| | || | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  19449555 gacattgacatgtcct-------agagatgggccaatggcactggctccccaggtcttgatagagaatttgacataggtatcaaattgagactgaaattg 19449647  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    |||||||      |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  19449648 acattga------aaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 19449741  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tag 395  Q
     ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        |||    
T  19449742 cgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttag 19449841  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19449842 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 19449939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 22921182 - 22921691
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22921182 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 22921280  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |  |  || |||  |  ||||||||||| ||| ||||    
T  22921281 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaatgacctgtcatgagttttgaattgagactgatattg 22921380  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
          ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  22921381 ------acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 22921474  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  22921475 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 22921573  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | |     
T  22921574 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctcc 22921673  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22921674 actggggaaaacgccgtt 22921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 12709660 - 12710169
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  12709660 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 12709759  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| |||    
T  12709760 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatatt 12709859  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   ||   ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  12709860 g---tt---attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 12709953  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || |     
T  12709954 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttg 12710052  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  12710053 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactt 12710152  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     ||||||||||| ||||    
T  12710153 tactggggataatgccg 12710169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 40240730 - 40240245
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||  |||||||    
T  40240730 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttgtttgacaaaatatagattgagcttgactt 40240631  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||      |     
T  40240630 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgag------ac 40240537  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||     
T  40240536 tgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgt 40240437  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 394  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | | |           
T  40240436 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctc 40240338  T
Q  395 -gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
     || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  40240337 ggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 40240245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168173
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16168188  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  16168187 ggggaaaatgccgtt 16168173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810398
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27810413  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  27810412 ggggaaaatgccgtt 27810398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343534
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | ||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 9343519  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  9343520 ggggaaaatgccgtt 9343534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045430
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaactttgctggagatagaatcttggaagacctgac 39045414  T
Q  498 tggggataacgccgtt 513  Q
    |||||| || ||||||    
T  39045415 tggggaaaatgccgtt 39045430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782918
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccact 27782933  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||| | |||||||||    
T  27782932 gggaaaaacgccgtt 27782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 9343081 - 9343212
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9343081 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 9343180  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343181 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 9343212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16168626 - 16168495
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16168626 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 16168527  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168526 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27783371 - 27783240
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27783371 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 27783272  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783271 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27810851 - 27810720
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27810851 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 27810752  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810751 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27810720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 39044975 - 39045106
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39044975 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttcgacaaaatatagattgagattgactt 39045074  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045075 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39045106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3790658 - 3790473
Alignment:
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3790658 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3790559  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790558 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 34267431 - 34267484
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34267431 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 34267484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 34267548 - 34267601
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34267548 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 34267601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 68
Target Start/End: Original strand, 27427504 - 27427563
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27427504 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcattggggatt 27427563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 31867439 - 31867492
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31867439 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 31867492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 31867556 - 31867609
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31867556 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 31867609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34162164 - 34162111
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34162164 gggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 34162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 34267197 - 34267250
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34267197 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacagaaacatatt 34267250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 34267314 - 34267367
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34267314 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacagaaacatatt 34267367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3789942 - 3789890
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3789942 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 3789890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 34267081 - 34267133
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34267081 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 34267133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20845091 - 20845040
Alignment:
Q  17 tcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20845091 tcttggattgagctagccacttgaccaaatagaaacagattcactggggatt 20845040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 37678820 - 37678870
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata 55  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  37678820 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacata 37678870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 37694085 - 37694135
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata 55  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  37694085 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacata 37694135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27397590 - 27397541
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27397590 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 27397541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 34267782 - 34267831
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34267782 ggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgaccaaacagaaaca 34267831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 253573 - 253625
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  253573 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 253625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 9342965 - 9343017
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  9342965 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 9343017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 11628107 - 11628159
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11628107 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacggaaacatatt 11628159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12594137 - 12594085
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  12594137 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 12594085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16168742 - 16168690
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  16168742 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 16168690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27783544 - 27783492
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27783544 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 27783492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27810967 - 27810915
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27810967 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 27810915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 34298523 - 34298479
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  34298523 caagctgctcttggatcgagctagccacttgagcaaacagaaaca 34298479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34868950 - 34868898
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  34868950 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 34868898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 37384976 - 37384924
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37384976 ggtacaagctgctcttggattgagccagccacttgaccaaacggaaacatatt 37384924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 37944786 - 37944838
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  37944786 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 37944838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 39897389 - 39897337
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  39897389 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 39897337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 40240846 - 40240794
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  40240846 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 40240794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22895621 - 22895118
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  22895621 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgact 22895522  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  22895521 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 22895425  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  22895424 gc---tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgca 22895328  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  22895327 atgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctg 22895228  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22895227 gaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactc 22895128  T
Q  495 gactggggat 504  Q
     |||||||||    
T  22895127 tactggggat 22895118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23899088 - 23898578
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  23899088 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgactt 23898990  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||  |||    
T  23898989 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttg 23898890  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    |||||||      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || | | ||||||| ||    
T  23898889 acattga------aaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaa 23898796  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |    
T  23898795 tgtatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctgg 23898696  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  23898695 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactc 23898596  T
Q  495 gactggggataacgccgt 512  Q
     ||||||||||| |||||    
T  23898595 tactggggataatgccgt 23898578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 33784671 - 33784166
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33784671 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 33784572  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |    
T  33784571 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---t 33784478  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  33784477 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 33784378  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  33784377 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaat 33784278  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||   | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||    
T  33784277 cctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactg 33784178  T
Q  500 gggataacgccg 511  Q
    || |||| ||||    
T  33784177 ggaataatgccg 33784166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23633162 - 23632659
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23633162 ggtacaagctgctcttggatcgagctgggcacttgagcgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttg 23633063  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||     
T  23633062 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg- 23632967  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  23632966 --ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 23632869  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 396  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | ||    
T  23632868 gcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttgga 23632769  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  23632768 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 23632669  T
Q  497 ctggggataa 506  Q
    ||||| ||||    
T  23632668 ctgggaataa 23632659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23727427 - 23726921
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||         |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23727427 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgac 23727328  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||       
T  23727327 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg--- 23727234  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  23727233 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 23727134  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  23727133 atgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 23727034  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  23727033 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 23726934  T
Q  499 ggggataacgccg 511  Q
    ||| |||| ||||    
T  23726933 gggaataatgccg 23726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 25207501 - 25206998
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  25207501 ggtacaagctgttcttggacttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaattgactt 25207403  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  25207402 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 25207306  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  25207305 c---tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 25207209  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |    
T  25207208 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgg 25207109  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  25207108 gaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 25207009  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||| ||||||    
T  25207008 actgaggataa 25206998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 25271657 - 25271154
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  25271657 ggtacaagctgttcttggacttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaattgactt 25271559  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  25271558 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 25271462  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  25271461 c---tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 25271365  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |    
T  25271364 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgg 25271265  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  25271264 gaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 25271165  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||| ||||||    
T  25271164 actgaggataa 25271154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 11556545 - 11556043
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||  | |||| ||||||||    
T  11556545 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaata--ggttgagattgactt 11556448  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  11556447 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 11556351  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  11556350 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 11556254  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  11556253 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctgg 11556154  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |     
T  11556153 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactct 11556054  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||||| ||||    
T  11556053 actgggaataa 11556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24977023 - 24976528
Alignment:
Q  17 tcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttga 116  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24977023 tcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggatt-gtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttga 24976925  T
Q  117 tttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||    
T  24976924 tttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattgg 24976831  T
Q  217 aaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttg 316  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  24976830 aaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttg 24976731  T
Q  317 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttgg 408  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||||||||||    
T  24976730 gcgatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttgg 24976631  T
Q  409 agataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacg 508  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |    
T  24976630 agatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatg 24976531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6881505 - 6880995
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6881505 ggtacaagctgttctcggactcgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataaattgagattgactt 6881406  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  6881405 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 6881309  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  6881308 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 6881212  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  6881211 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 6881113  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  6881112 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 6881013  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||| |||||||||||    
T  6881012 actgggaataacgccgtt 6880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 28952745 - 28953254
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  28952745 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaaattgactt 28952843  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  28952844 gacgtcgatttgatttgaaagatagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 28952940  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  28952941 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 28953037  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------g 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||           
T  28953038 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttga 28953136  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||       
T  28953137 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggacagaatctcggaagacttt 28953236  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  28953237 actggggaaaacgccgtt 28953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 32589224 - 32589734
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32589224 ggtacaagccgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 32589323  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    || |||||| || |||   ||    
T  32589324 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatatcgaattgggactga---tg 32589420  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  32589421 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 32589517  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||   ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  32589518 tgcatgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgc-gggaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 32589616  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  32589617 aaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttgggagacctg 32589716  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  32589717 actggggagaacgccgtt 32589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2518256 - 2517749
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2518256 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgcttgacaaaatatagattgagattgactt 2518157  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  2518156 gacgtcgatttgatt-gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 2518061  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  2518060 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 2517964  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  2517963 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 2517865  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||       
T  2517864 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagacttt 2517765  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2517764 actggggataatgccg 2517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Original strand, 22992091 - 22992593
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||        ||||| |||  | |||||||||||||    
T  22992091 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcactcgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttgacaacata--ggttgaaattgactt 22992188  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  22992189 ggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg 22992285  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    
T  22992286 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaa 22992382  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  22992383 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 22992482  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  22992483 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 22992582  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||||| ||||    
T  22992583 actgggaataa 22992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 478
Target Start/End: Original strand, 13179768 - 13180241
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||         ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13179768 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactgggatttagtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 13179867  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||       
T  13179868 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg--- 13179961  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13179962 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13180061  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13180062 atgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 13180161  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 478  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  13180162 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Original strand, 15751807 - 15752317
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       |||||||||||||||||  ||||||    
T  15751807 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttgact 15751905  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  15751906 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 15752002  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  15752003 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 15752099  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata-------- 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |            
T  15752100 atgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 15752198  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752199 gaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 15752298  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15752299 gactggggaaaacgccgtt 15752317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24609433 - 24608929
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         || ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24609433 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgaaaaagtatagattgagattgacttgacgt 24609334  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |     ||  |||    
T  24609333 cgatttgatttgaaaggtagaaattgacctatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagact-----tgt-att 24609240  T
Q  209 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 308  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||     
T  24609239 gacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcac 24609140  T
Q  309 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 400  Q
    ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||||    
T  24609139 gactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 24609040  T
Q  401 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 500  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  24609039 ctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 24608940  T
Q  501 ggataacgccg 511  Q
    | |||| ||||    
T  24608939 gaataatgccg 24608929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 33299736 - 33299220
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-------gacaaaatatagattgaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||              ||||||||||||||||| |    
T  33299736 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttttttgacaaaatatagattgaga 33299637  T
Q  97 ttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagatt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |    
T  33299636 ttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagact 33299537  T
Q  197 gaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 296  Q
    ||   ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  33299536 ga---tg---ttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 33299443  T
Q  297 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca------- 389  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           
T  33299442 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaca 33299343  T
Q  390 -tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttgga 488  Q
     || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| | ||     
T  33299342 ttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatatcggg 33299243  T
Q  489 agacccgactggggataacgccg 511  Q
    |||| | |||||| |||| ||||    
T  33299242 agactctactgggaataatgccg 33299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 9543675 - 9544185
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9543675 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 9543774  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  9543775 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 9543871  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  9543872 tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 9543968  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  9543969 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 9544067  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  9544068 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagact 9544167  T
Q  494 cgactggggataacgccg 511  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  9544168 ctactgggaataatgccg 9544185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 43085460 - 43084956
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| |||||||    
T  43085460 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattgact 43085361  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  43085360 tggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 43085264  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  43085263 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 43085167  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-tcatagaaatcc 401  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||||    
T  43085166 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattcttggaaatcc 43085068  T
Q  402 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 501  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || |||    
T  43085067 tctctggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggg 43084968  T
Q  502 gataacgccgtt 513  Q
    || |||||||||    
T  43084967 gaaaacgccgtt 43084956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Original strand, 18121381 - 18121886
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |        |||||| |||||||||| |||||||    
T  18121381 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgact 18121480  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||   |    
T  18121481 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagcattgaattgagactga---t 18121577  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  18121578 g---ttgccattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 18121674  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------t 393  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |    
T  18121675 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcct 18121773  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||     
T  18121774 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagact 18121873  T
Q  494 cgactggggataa 506  Q
    | |||||| ||||    
T  18121874 ctactgggaataa 18121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 34623710 - 34623201
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34623710 ggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 34623612  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||   ||    
T  34623611 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgggtattgaattgagactga---tg 34623515  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  34623514 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 34623418  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  34623417 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 34623319  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |     
T  34623318 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactcc 34623219  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||| |||||||||    
T  34623218 accggggaaaacgccgtt 34623201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 30941819 - 30941314
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30941819 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 30941720  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||   |||   |    
T  30941719 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactg---ttg---t 30941626  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    ||| |||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  30941625 tgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 30941526  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||||    
T  30941525 tgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 30941426  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||    
T  30941425 cctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctactg 30941326  T
Q  500 gggataacgccg 511  Q
    || |||| ||||    
T  30941325 ggaataatgccg 30941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30036637 - 30036128
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||  |||||||    
T  30036637 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaatagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttgactt 30036539  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  30036538 gacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 30036442  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  30036441 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 30036345  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  30036344 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 30036246  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30036245 aaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccg 30036146  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  30036145 actggggaaaacgccgtt 30036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 18493717 - 18494227
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18493717 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 18493816  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||   || ||  | || ||||||||| |||   ||    
T  18493817 gacgtcgatttgatttgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgatagagaacccgatatgagtatcgaattgagactga---tg 18493913  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  18493914 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 18494010  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | |    
T  18494011 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttgg 18494109  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  18494110 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactct 18494209  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||| |||||||||    
T  18494210 accggggaaaacgccgtt 18494227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33523596 - 33523086
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  33523596 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgact 33523498  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  33523497 tgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 33523401  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  33523400 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 33523304  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  33523303 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 33523205  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33523204 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 33523105  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  33523104 gaccggggaaaacgccgtt 33523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 513
Target Start/End: Original strand, 31819381 - 31819880
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatt 113  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31819381 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgacctgacgtcgatt 31819479  T
Q  114 tgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || |||||| || |||   ||   |||||||    
T  31819480 tgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactga---tg---ttgacat 31819573  T
Q  214 tggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 313  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |    
T  31819574 tggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactg 31819673  T
Q  314 ttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctt 405  Q
    |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |        |||||||||||    
T  31819674 ttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctt 31819772  T
Q  406 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 505  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31819773 tggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaa 31819872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33882320 - 33881808
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  33882320 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 33882221  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||| ||| ||    
T  33882220 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatat 33882121  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||| ||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  33882120 tgatattg------gaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 33882027  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  33882026 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 33881928  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33881927 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacc 33881828  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
     ||||||||| || ||||||    
T  33881827 tgactggggaaaatgccgtt 33881808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37762185 - 37761676
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37762185 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 37762087  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  37762086 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgataatattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 37761990  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  37761989 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 37761893  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  37761892 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 37761794  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  37761793 aaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttt 37761694  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  37761693 actggggaaaacgccgtt 37761676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Original strand, 8658443 - 8658931
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8658443 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 8658541  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  8658542 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 8658638  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  8658639 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 8658735  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  8658736 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 8658834  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658835 aaatcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30159234 - 30158722
Alignment:
Q  2 atgggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       |||||||||||||||||  ||||    
T  30159234 atgggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttga 30159136  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  30159135 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 30159038  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  30159037 -tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 30158942  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  30158941 taatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 30158843  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30158842 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 30158743  T
Q  493 ccgactggggataacgccgtt 513  Q
      ||||||||| || ||||||    
T  30158742 ttgactggggaaaatgccgtt 30158722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 31438648 - 31438141
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||  |||||||    
T  31438648 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttgactt 31438550  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  31438549 gacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 31438453  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  31438452 ---ttgacattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 31438356  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  31438355 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 31438257  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||       
T  31438256 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacttt 31438157  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31438156 actggggataatgccg 31438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3796746 - 3796235
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  3796746 ggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattctgacaaaatatagattgagattgact 3796647  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  3796646 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagtttcgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 3796550  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  3796549 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 3796453  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  3796452 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 3796354  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  3796353 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 3796254  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  3796253 tactggggaaaacgccgtt 3796235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 37351611 - 37352123
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-agnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||||||| ||||||    
T  37351611 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgac 37351710  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  37351711 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggctcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 37351807  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  37351808 tg---ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 37351904  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 394  Q
    |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |           
T  37351905 aatgcatgactgttggcatttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 37352003  T
Q  395 -gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  37352004 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagact 37352103  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
      ||||||||||| ||||||    
T  37352104 ttactggggataatgccgtt 37352123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Original strand, 37745297 - 37745781
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||| |||| ||||||| |||||||    
T  37745297 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgctttgacagaatagagattgagattgact 37745396  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||  ||   |    
T  37745397 tgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagaccga---t 37745493  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  37745494 g---ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 37745590  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcata 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || |     
T  37745591 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttg 37745689  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  37745690 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatcttg 37745781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 511
Target Start/End: Original strand, 15651719 - 15652218
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgat 112  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |        |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15651719 gttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgat 15651818  T
Q  113 ttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   ||||||    
T  15651819 ttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactga---tg---ttgaca 15651912  T
Q  213 ttggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 312  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  15651913 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 15652012  T
Q  313 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctct 404  Q
    ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||    
T  15652013 gttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctct 15652111  T
Q  405 ttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggat 504  Q
    |||||||| | | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||    
T  15652112 ttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaat 15652211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 18368476 - 18368989
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||| |||||    
T  18368476 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgtccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattga 18368575  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  18368576 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 18368673  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18368674 -tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 18368769  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 394  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |          
T  18368770 taatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 18368868  T
Q  395 --gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
      || || |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||  ||||  ||||    
T  18368869 cggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagccttgagagac 18368968  T
Q  493 ccgactggggataacgccgtt 513  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  18368969 tccactggggaaaacgccgtt 18368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28656460 - 28655947
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  28656460 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 28656361  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  28656360 tgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 28656263  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28656262 -tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 28656167  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tca 392  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   ||     
T  28656166 taatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattct 28656068  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||  ||||    
T  28656067 tggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgcaccttgctggggatagaatcttgagagac 28655968  T
Q  493 ccgactggggataacgccgtt 513  Q
     | || ||||| |||||||||    
T  28655967 tccaccggggaaaacgccgtt 28655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 37664454 - 37664961
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37664454 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 37664552  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||| |||   ||    
T  37664553 gacgtcgattcgaattgaaaggtagagattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactga---tg 37664649  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  37664650 ---ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 37664746  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  37664747 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 37664845  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||       
T  37664846 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagacttt 37664945  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||||| |||||||    
T  37664946 actggggaaaacgccg 37664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26487585 - 26487075
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26487585 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatataaattgagattgactt 26487487  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  26487486 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 26487390  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  26487389 ---ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 26487293  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  26487292 tgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 26487194  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  26487193 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactc 26487094  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     || ||||| |||||||||    
T  26487093 caccggggaaaacgccgtt 26487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 13435614 - 13436128
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn----gacaaaatatagattgaaattg 99  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||    
T  13435614 ggtacaagctggtcttggacgtgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgttcttttgacaaaatatagattgagattg 13435713  T
Q  100 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaa 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||     
T  13435714 acttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga- 13435812  T
Q  200 attgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
      ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  13435813 --tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 13435907  T
Q  300 gaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tc 391  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||    
T  13435908 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattc 13436006  T
Q  392 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 491  Q
     | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13436007 ttggaaatcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagaga 13436106  T
Q  492 cccgactggggataacgccgtt 513  Q
    | | || ||||| |||||||||    
T  13436107 ctccaccggggaaaacgccgtt 13436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24731162 - 24730653
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||| | |||||||    
T  24731162 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattaagattgact 24731063  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| |||    
T  24731062 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatatt 24730963  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   ||   ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  24730962 g---tt---attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 24730869  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || |     
T  24730868 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttg 24730770  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  24730769 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactt 24730670  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     ||||||||||| ||||    
T  24730669 tactggggataatgccg 24730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9324675 - 9324165
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |       ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9324675 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggagatt-ggtttgttgacaaaatataaattgagattgactt 9324577  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  9324576 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 9324480  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  9324479 ---ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 9324383  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  9324382 tgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 9324284  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  9324283 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactc 9324184  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     || ||||| |||||||||    
T  9324183 caccggggaaaacgccgtt 9324165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30175679 - 30175170
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | ||||||||||||||| ||||||||    
T  30175679 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatatagattgagattgactt 30175581  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||      | ||    
T  30175580 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgag------actg 30175487  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||| ||||||| ||    
T  30175486 atattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaa 30175387  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  30175386 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 30175288  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | |     
T  30175287 aaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctcc 30175188  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  30175187 actggggaaaacgccgtt 30175170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12139373 - 12138864
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12139373 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatataaattgagattgactt 12139275  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  12139274 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 12139178  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  12139177 ---ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 12139081  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  12139080 tgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 12138982  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  12138981 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttt 12138882  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  12138881 actggggaaaacgccgtt 12138864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 13317776 - 13318285
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||  |||||||    
T  13317776 ggtacaagctgttcttggacgtgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttgactt 13317874  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||  |  ||||| ||||| ||| ||||    
T  13317875 gacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggtttcgacagagaacctgacatgagttttgaactgagactgatattg 13317974  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       ||   ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  13317975 ---tt---attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 13318068  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  13318069 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 13318167  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  13318168 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttt 13318267  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13318268 actggggaaaacgccgtt 13318285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 41681897 - 41681408
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata-ttcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||    
T  41681897 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgac 41681798  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||       
T  41681797 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagacattgaccgatattattggctcacaaggtttggacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga--- 41681701  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||  ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    |||||| |||  ||     
T  41681700 tg---ttggtattggaaatacgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgatta----tgcatgtatgaatgt 41681608  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat----cat---- 393  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||        
T  41681607 aacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 41681509  T
Q  394 --agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 491  Q
      | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41681508 ggaaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 41681409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40467008
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 40466993  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  40466994 ggggaaaatgccgtt 40467008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 206 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644502
Alignment:
Q  206 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 305  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  306 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 397  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5644716 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5644618  T
Q  398 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||  || |||||||||  || | | ||    
T  5644617 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgtagacagaatcttgagaggctccac 5644518  T
Q  498 tggggataacgccgtt 513  Q
    |||||| |||||||||    
T  5644517 tggggaaaacgccgtt 5644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330336
Alignment:
Q  211 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 310  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  311 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 402  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |        || | ||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  403 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 502  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagacctgactgggg 11330347  T
Q  503 ataacgccgtt 513  Q
    | || ||||||    
T  11330346 aaaatgccgtt 11330336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 40466555 - 40466686
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40466555 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 40466654  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466655 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 40466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11330785 - 11330640
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||    
T  11330785 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 11330686  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 148  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11330685 taacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatatcattgg 11330640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 387
Target Start/End: Original strand, 13178639 - 13178824
Alignment:
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  13178639 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 13178738  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178739 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5644952 - 5644815
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5644952 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgctgacaaaatatagattgagattgactt 5644854  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatat 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5644853 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatat 5644815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 13179470 - 13179523
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13179470 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 13179523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34623827 - 34623774
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34623827 gggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 34623774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 13179354 - 13179406
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13179354 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 13179406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 30036753 - 30036701
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30036753 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 30036701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 37745181 - 37745233
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37745181 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 37745233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 28656576 - 28656521
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcac 60  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28656576 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcac 28656521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 32589110 - 32589160
Alignment:
Q  7 tacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  32589110 tacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacagaaacatatt 32589160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3796863 - 3796810
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  3796863 gggtacaagctgctcttggattgagctagccatttgaccaaacggaaacatatt 3796810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25207559 - 25207510
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25207559 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaaca 25207510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25271715 - 25271666
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25271715 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaaca 25271666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2518368 - 2518320
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2518368 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 2518320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6881621 - 6881569
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6881621 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 6881569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 9324791 - 9324739
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  9324791 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 9324739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12139489 - 12139437
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  12139489 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 12139437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 18493601 - 18493653
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18493601 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 18493653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26487701 - 26487649
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  26487701 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 26487649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 30175795 - 30175743
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  30175795 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 30175743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 31438764 - 31438712
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  31438764 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 31438712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33300026 - 33299982
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  33300026 caagctgttcttggatcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 33299982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 40466439 - 40466491
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  40466439 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 40466491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Original strand, 24585420 - 24585929
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||    
T  24585420 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttg 24585519  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||     
T  24585520 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaaatgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg- 24585615  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  24585616 --ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 24585713  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 396  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||    
T  24585714 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 24585813  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |    
T  24585814 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactcta 24585913  T
Q  497 ctggggataacgccgt 512  Q
    ||||| |||| |||||    
T  24585914 ctgggaataatgccgt 24585929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15235034 - 15234526
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15235034 ggtacaagctgttcttggacttgaacaaaccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttttt--gacaaaatgtagattgaaactgactt 15234937  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  15234936 gacgtcgatttgatttgaaaggcagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacatgacatgagtattgaattgagactga---tg 15234840  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  15234839 c---tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 15234743  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  15234742 tgcatgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 15234643  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  15234642 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 15234543  T
Q  496 actggggataacgccgt 512  Q
     |||||||||| |||||    
T  15234542 gctggggataatgccgt 15234526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 54840605 - 54840097
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54840605 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttt--gacaaaatatagattgagattgactt 54840508  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  54840507 gacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 54840411  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  54840410 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 54840314  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  54840313 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 54840215  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54840214 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccg 54840115  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  54840114 actggggaaaacgccgtt 54840097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5701745 - 5701256
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5701745 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5701646  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  5701645 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 5701549  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  5701548 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 5701452  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  5701451 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 5701353  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701352 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 5701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14672204 - 14671717
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14672204 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgac 14672105  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||| |||||||    
T  14672104 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattgaca 14672005  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||      ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14672004 ttg------gaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14671911  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    | ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  14671910 acgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 14671811  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14671810 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 36323387 - 36323894
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36323387 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 36323485  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  36323486 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 36323582  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  36323583 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaa 36323679  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  36323680 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 36323778  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  36323779 aaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 36323878  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  36323879 actgggaataatgccg 36323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 36337596 - 36338103
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36337596 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgactt 36337694  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  36337695 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 36337791  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  36337792 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaa 36337888  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  36337889 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 36337987  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  36337988 aaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 36338087  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  36338088 actgggaataatgccg 36338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39857831 - 39857342
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39857831 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 39857732  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  39857731 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 39857635  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  39857634 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 39857538  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  39857537 tgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 39857439  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    || || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857438 aattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Original strand, 31119559 - 31120069
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  31119559 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgact 31119657  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  31119658 tgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 31119754  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  31119755 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 31119851  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  31119852 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 31119950  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31119951 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 31120050  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  31120051 gaccggggaaaacgccgtt 31120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 40098682 - 40099192
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40098682 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 40098781  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  40098782 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcataaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 40098878  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  40098879 ---ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 40098975  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||| | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  40098976 tgcatgactgttggtattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 40099074  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | |     
T  40099075 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctcc 40099174  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40099175 actggggaaaacgccgtt 40099192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 14752564 - 14753073
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  14752564 ggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgact 14752663  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  14752664 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 14752760  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  14752761 g---ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 14752857  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  14752858 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctg 14752956  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14752957 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactc 14753056  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     |||||| |||| ||||    
T  14753057 tactgggaataatgccg 14753073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17020235 - 17019737
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  17020235 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 17020136  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||  |||    
T  17020135 gacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttg 17020036  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    |||                 ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  17020035 aca-----------------acatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 17019953  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |    
T  17019952 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctgg 17019853  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  17019852 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 17019753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21976920 - 21976410
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||    
T  21976920 gggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgact 21976822  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  21976821 tgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 21976725  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  21976724 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 21976628  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  21976627 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 21976529  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976528 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccc 21976429  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  21976428 gaccggggaaaacgccgtt 21976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14105759 - 14105250
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14105759 ggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 14105661  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  14105660 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 14105564  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  14105563 ---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 14105467  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  || |||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  14105466 tgcatgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcgg 14105368  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  14105367 agatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactcc 14105268  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14105267 actggggaaaacgccgtt 14105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Original strand, 15275683 - 15276164
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15275683 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttt--gacaaaatataaattgaaattgactt 15275780  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    | | | ||  |       |   |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  15275781 ggcattgacat-------atcctagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattg 15275873  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
          |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  15275874 ------acattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 15275967  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |    
T  15275968 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgg 15276067  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15276068 aaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 15276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Original strand, 18793689 - 18794175
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaac-agaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| |||||    
T  18793689 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatagaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattga 18793788  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  18793789 cttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 18793886  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18793887 -tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 18793982  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  18793983 taatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 18794081  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  18794082 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 18794175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 33666850 - 33667360
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | |||||| |||||||| ||||||||    
T  33666850 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgactt 33666948  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  33666949 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 33667045  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |    
T  33667046 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgta 33667142  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  33667143 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 33667241  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  33667242 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 33667341  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  33667342 tactggggaaaacgccgtt 33667360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6577058 - 6576544
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-----gacaaaatatagattgaaatt 98  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            ||| |||||| |||||| |||    
T  6577058 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttttgaccaaatatggattgagatt 6576959  T
Q  99 gacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattga 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||    
T  6576958 gacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactaatggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga 6576859  T
Q  199 aattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgct 298  Q
       ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  6576858 ---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgct 6576765  T
Q  299 tgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------t 390  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        |    
T  6576764 tgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatt 6576666  T
Q  391 catagaaatcctc-tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaa 489  Q
    | | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6576665 cttggaaatcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatctcggaa 6576566  T
Q  490 gacccgactggggataacgccg 511  Q
    ||| | ||||||||||| ||||    
T  6576565 gactccactggggataatgccg 6576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24119860 - 24119349
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata-ttcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| |       |||||||||||| |||||||||||    
T  24119860 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatataggttgaaattgac 24119761  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  24119760 ttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 24119664  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  24119663 tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 24119567  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 394  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |           
T  24119566 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctc 24119468  T
Q  395 --gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
       ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24119467 ggaaaatcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 24119368  T
Q  493 ccgactggggataacgccg 511  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  24119367 tctactgggaataatgccg 24119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Original strand, 15379295 - 15379776
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15379295 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattagttttt--gacaaaatataaattgaaattgactt 15379392  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| | ||  |       |   |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||    
T  15379393 gacattgacat-------atcctagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtattgaatcgagactataattg 15379485  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
          |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||    
T  15379486 ------acattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaa 15379579  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | |    
T  15379580 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgg 15379679  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379680 aaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15379776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30760980 - 30760470
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | |||||| |||||||| ||||||||    
T  30760980 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgactt 30760882  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  30760881 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 30760785  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |    
T  30760784 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgta 30760688  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  30760687 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 30760589  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  30760588 gaaatcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 30760489  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  30760488 tactggggaaaacgccgtt 30760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 5013098 - 5012593
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |       ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5013098 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatgttcactagggatt-ggtttgttgaccaaatatagattgaaattgactt 5013000  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  5012999 gacgtcgatttgatttaaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagaggacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 5012903  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttca-ttaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  5012902 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 5012806  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt-gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||| |||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |        || |    
T  5012805 atgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 5012707  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5012706 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacc 5012607  T
Q  494 cgactggggataac 507  Q
    ||||||||||||||    
T  5012606 cgactggggataac 5012593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Original strand, 34182007 - 34182515
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |          |||||| |||||||||| |||||    
T  34182007 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttttgacaaagtatagattgagattga 34182106  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||      
T  34182107 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatg 34182206  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    |     ||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  34182207 t-----ttgacattggaaat-----atgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 34182296  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        ||     
T  34182297 taatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattct 34182395  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34182396 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 34182495  T
Q  493 ccgactggggataacgccgt 512  Q
     | |||||| |||| |||||    
T  34182496 tctactgggaataatgccgt 34182515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 27156572 - 27156885
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27156572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27156671  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27156672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27156770  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27156771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27156870  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  27156871 ggggaaaatgccgtt 27156885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 387
Target Start/End: Original strand, 24814354 - 24814726
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||        ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  24814354 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaagcagaaacagaatcactgggatttagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgaca 24814453  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||  ||||||  | ||||||| |||| |||   ||   |    
T  24814454 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctgacaaggttttaacagggaacctgacatgagtattgaatggagactga---tg---t 24814547  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  24814548 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 24814647  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 387  Q
    |||  ||||||| ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814648 tgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 266 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1907229 - 1906975
Alignment:
Q  266 cataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 365  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907229 cataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 1907130  T
Q  366 gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 457  Q
    |||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  1907129 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtag 1907030  T
Q  458 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 512  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  1907029 ctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 1906975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331994
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 20331979  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  20331980 ggggaaaatgccgtt 20331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1907440 - 1907236
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1907440 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattcaaattgactt 1907342  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  |||    
T  1907341 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctgacataagtattgaattgagattgatgttg 1907242  T
Q  204 acattg 209  Q
    ||||||    
T  1907241 acattg 1907236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 20331541 - 20331672
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20331541 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttaaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 20331640  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331641 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 20331672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 387
Target Start/End: Original strand, 24813637 - 24813822
Alignment:
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  24813637 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 24813736  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813737 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 30761096 - 30761044
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30761096 ggtacaagctgctcttggatcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 30761044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5013214 - 5013162
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5013214 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 5013162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 18793573 - 18793625
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18793573 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 18793625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Original strand, 33666738 - 33666786
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33666738 caagctgctcttggatcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 33666786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 54840721 - 54840669
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54840721 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 54840669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 15399362 - 15399413
Alignment:
Q  17 tcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15399362 tcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactagggatt 15399413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 14105875 - 14105825
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacata 55  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  14105875 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacata 14105825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6577174 - 6577122
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6577174 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 6577122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 14752448 - 14752500
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  14752448 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 14752500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 24585363 - 24585415
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||    
T  24585363 ggtacaagctgctcttggattgagctgggtacttgaccaaacagaaacatatt 24585415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5659282 - 5658773
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  5659282 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 5659183  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  5659182 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 5659086  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  5659085 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 5658989  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatag 395  Q
    |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || | |    
T  5658988 tgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctgg 5658889  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  5658888 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 5658789  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  5658788 actgggaataatgccg 5658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Original strand, 16617580 - 16618084
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  16617580 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaattgactt 16617678  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||    
T  16617679 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagagtttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactga---tg 16617775  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  16617776 ---ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaa 16617872  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |    
T  16617873 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttgg 16617972  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16617973 aaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactc 16618072  T
Q  495 gactggggataa 506  Q
      ||||||||||    
T  16618073 cgctggggataa 16618084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19701565 - 19701055
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19701565 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggaatagtttttatgacaaaatatagattgagattgactt 19701466  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  19701465 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatagaattgagactga---tg 19701369  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  19701368 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 19701272  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  19701271 tgtatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 19701172  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  19701171 aaatcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactct 19701072  T
Q  496 actggggataacgccgt 512  Q
    ||||||||||| |||||    
T  19701071 actggggataatgccgt 19701055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22041574 - 22041087
Alignment:
Q  8 acaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041574 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgac 22041476  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||       
T  22041475 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagaatttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactga---tg--- 22041382  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22041381 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgc 22041282  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 398  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | ||||    
T  22041281 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaa 22041182  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041181 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22041087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18058416 - 18057907
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  18058416 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 18058317  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  18058316 gacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggtttggacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg 18058220  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  18058219 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 18058123  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  18058122 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 18058023  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  18058022 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 18057923  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  18057922 actgggaataatgccg 18057907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16423353 - 16422845
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16423353 ggtacaagctgttcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttg 16423255  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||     
T  16423254 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg- 16423159  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  16423158 --ttgatatcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 16423061  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 396  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |        || | ||    
T  16423060 gcatgactgttggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgga 16422961  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |    
T  16422960 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactcta 16422861  T
Q  497 ctggggataacgccgt 512  Q
    |||||||||| |||||    
T  16422860 ctggggataatgccgt 16422845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 29141864 - 29142375
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||         ||||||||||||||||| ||||||    
T  29141864 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 29141963  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||       
T  29141964 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga--- 29142060  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  29142061 tg---ttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 29142157  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  29142158 aatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcct 29142257  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||     
T  29142258 ggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagact 29142357  T
Q  494 cgactggggataacgccg 511  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  29142358 ctactgggaataatgccg 29142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 11103474 - 11103982
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11103474 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgactt 11103573  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  11103574 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 11103670  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  11103671 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 11103767  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  11103768 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 11103866  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  11103867 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 11103966  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  11103967 actgggaataatgccg 11103982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 35887905 - 35887399
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||    
T  35887905 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttt---gacaaaatgtagattgagattgactt 35887809  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  35887808 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactga---tg 35887712  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  35887711 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 35887615  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |        || |      
T  35887614 tgcatgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctga 35887515  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |     
T  35887514 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactct 35887415  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  35887414 actgggaataatgccg 35887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 78 - 511
Target Start/End: Original strand, 4789817 - 4790252
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  4789817 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 4789916  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    || | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4789917 taagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcat 4790010  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4790011 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatg 4790110  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    |||||||||| |        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  4790111 gctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttg 4790210  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    ||  |||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  4790211 ctaaggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 4790252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4728772 - 4728265
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       ||||| |||  | |||||||||||||    
T  4728772 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgactt 4728675  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  4728674 ggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg 4728578  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    
T  4728577 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaa 4728481  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  4728480 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 4728381  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  4728380 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactct 4728281  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  4728280 actgggaataatgccg 4728265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Original strand, 15734232 - 15734710
Alignment:
Q  9 caagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15734232 caagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacg 15734331  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |    
T  15734332 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---t 15734425  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||||    
T  15734426 tgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgca 15734525  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  15734526 tgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 15734625  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 484  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15734626 cctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 18337768 - 18337268
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18337768 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcactcgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagtttt---gacaaaatataggttgaaattgacttg 18337672  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||   ||     
T  18337671 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactga---tg- 18337576  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||    
T  18337575 --ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaat 18337478  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 396  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        ||    
T  18337477 gcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctgga 18337378  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  18337377 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggatagaatcttgggagactcta 18337278  T
Q  497 ctggggataa 506  Q
    ||||| ||||    
T  18337277 ctgggaataa 18337268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 28109052 - 28109564
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |        |||||||||||||||||||||||||    
T  28109052 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttggtttgttttgacaaaatatagattgaaattgact 28109151  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  28109152 tgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 28109248  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||      
T  28109249 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtg 28109345  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  28109346 atgcatgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 28109444  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28109445 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttggaaaaccc 28109544  T
Q  495 -gactggggataacgccgtt 513  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  28109545 tgactggggaaaacgccgtt 28109564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 506
Target Start/End: Original strand, 8282579 - 8283076
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8282579 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacagaaacagattcagtggggatt--gttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgt 8282676  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||| || || |||   ||   ||    
T  8282677 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgcgactga---tg---tt 8282770  T
Q  209 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  8282771 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 8282870  T
Q  309 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 400  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||    
T  8282871 gactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 8282970  T
Q  401 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 500  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  8282971 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 8283070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 22380693 - 22381201
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||       |||||| |||||||||| ||||||||    
T  22380693 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacagggggttagtttttt-gacaaagtatagattgagattgactt 22380791  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  22380792 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg 22380888  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||    
T  22380889 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaa 22380985  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        |    
T  22380986 tgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctgg 22381085  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  22381086 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 22381185  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  22381186 actgggaataatgccg 22381201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6209041 - 6208534
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||       ||||| |||  | |||||||||||||    
T  6209041 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccgaacaaaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgactt 6208944  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  6208943 ggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg 6208847  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||    
T  6208846 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaa 6208750  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  6208749 tgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 6208650  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  6208649 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactct 6208550  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  6208549 actgggaataatgccg 6208534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 512
Target Start/End: Original strand, 15885903 - 15886339
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  15885903 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 15886002  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    |  | |||||| ||||| |||   ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15886003 tgagtattgaactgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcat 15886096  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15886097 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatg 15886196  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    |||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  15886197 gctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttg 15886296  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  15886297 ctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 15886339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4690829 - 4690313
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn------gacaaaatatagattgaaat 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||| ||    
T  4690829 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactagggattgttttttttttttttgacaaaatatagattgagat 4690730  T
Q  98 tgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| ||    
T  4690729 tgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactg 4690630  T
Q  198 aaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 297  Q
    |   ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  4690629 a---tg---ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 4690536  T
Q  298 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-------- 389  Q
    ||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |            
T  4690535 ttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacat 4690436  T
Q  390 tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaa 489  Q
    || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |    
T  4690435 tcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggga 4690336  T
Q  490 gacccgactggggataacgccgt 512  Q
    ||| | |||||| |||| |||||    
T  4690335 gactctactgggaataatgccgt 4690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 17978041 - 17978551
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||| ||||||||    
T  17978041 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttacaaaatatagattgagattgactt 17978140  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  17978141 gacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcgcaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 17978237  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  17978238 ---ttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 17978334  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  17978335 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaaa-acaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 17978433  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17978434 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccg 17978533  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||| |||||||||    
T  17978534 accggggaaaacgccgtt 17978551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5020887 - 5020370
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn------gacaaaatatagattgaaat 97  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |             ||||||||||||||||| ||    
T  5020887 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcacaggggattggtttttatttttttgacaaaatatagattgagat 5020788  T
Q  98 tgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattg 197  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||| |||||  |    
T  5020787 tgacttgacgccgatttaaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaaatgagacgg 5020688  T
Q  198 aaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgc 297  Q
    |  ||     ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  5020687 atgtt-----tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgc 5020593  T
Q  298 ttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--- 394  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |       
T  5020592 ttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacat 5020494  T
Q  395 -----gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaa 489  Q
         |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |    
T  5020493 tctcggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatcttgaga 5020394  T
Q  490 gacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    |||   |||||||| |||||||||    
T  5020393 gactttactggggaaaacgccgtt 5020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 24335347 - 24334835
Alignment:
Q  2 atgggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |       |||||||||||||||||  ||||    
T  24335347 atgggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcaatggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttga 24335249  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  24335248 cttgacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 24335151  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  24335150 -tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 24335055  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 394  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |          
T  24335054 taatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 24334956  T
Q  395 --gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
      |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24334955 tggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagac 24334856  T
Q  493 ccgactggggataacgccgtt 513  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  24334855 cccactggggaaaacgccgtt 24334835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 4339790 - 4340297
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |        ||||||||||||||||  |||||||    
T  4339790 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactagggattggtttgtta-acaaaatatagattgaggttgactt 4339888  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  4339889 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 4339985  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  4339986 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 4340082  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  4340083 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 4340181  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  4340182 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactct 4340281  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    ||||||||||| ||||    
T  4340282 actggggataatgccg 4340297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 31029353 - 31029864
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||| |||||    
T  31029353 ggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattga 31029452  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  31029453 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 31029550  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  31029551 -tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 31029646  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||||||||  ||||||| |||||||  ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  31029647 taatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 31029745  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31029746 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 31029845  T
Q  493 ccgactggggataacgccg 511  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  31029846 tctactgggaataatgccg 31029864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32297803 - 32297290
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||    
T  32297803 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgatcgaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaaaatatagattgagattgac 32297704  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | ||||||||||||  ||  |    
T  32297703 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagacggatgt 32297604  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    |     ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  32297603 t-----tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 32297509  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 394  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |           
T  32297508 aatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctc 32297410  T
Q  395 -gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32297409 ggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatcttggaagacc 32297310  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
     ||||||||| || ||||||    
T  32297309 tgactggggaaaatgccgtt 32297290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18232360 - 18231851
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||  |||||||    
T  18232360 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacgggaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgaggttgactt 18232262  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | | |||||||||| |||         
T  18232261 gacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactga----- 18232167  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
     | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  18232166 -cgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 18232068  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  18232067 tgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 18231969  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231968 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccg 18231869  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||| |||||||||    
T  18231868 accggggaaaacgccgtt 18231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 5602402 - 5602913
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5602402 ggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5602501  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  5602502 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 5602598  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  5602599 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 5602695  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  5602696 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 5602794  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | |    
T  5602795 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctc 5602894  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  5602895 cactggggaaaacgccgtt 5602913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18249886 - 18249377
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| |||||| |    
T  18249886 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggatt-ggttttttgacaaaatatagattgagattgacct 18249788  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | | |||||||||| |||   ||    
T  18249787 gacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgaaattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactga---tg 18249691  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  18249690 ---ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 18249594  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  18249593 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 18249495  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  18249494 aaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactcc 18249395  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    || ||||| |||||||||    
T  18249394 accggggaaaacgccgtt 18249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 20569946 - 20570456
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20569946 ggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 20570045  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  20570046 aacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 20570142  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  20570143 ---ttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 20570239  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  20570240 tgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcac-gggggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 20570338  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |     
T  20570339 aaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactcc 20570438  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20570439 actggggaaaacgccgtt 20570456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 48473081 - 48472590
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  48473081 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 48472982  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||       
T  48472981 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga--- 48472885  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  48472884 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 48472788  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  48472787 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 48472689  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472688 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 18285467 - 18285977
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18285467 ggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaagatatagattgagattgac 18285566  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  18285567 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 18285663  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||     
T  18285664 tg---ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgt 18285760  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  18285761 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcct 18285859  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18285860 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagact 18285959  T
Q  494 cgactggggataacgccg 511  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  18285960 ctactgggaataatgccg 18285977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 22863954 - 22864464
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22863954 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgactt 22864053  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||   | |||||||||||| |||   ||    
T  22864054 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactga---tg 22864150  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  22864151 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 22864247  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  22864248 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 22864346  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  22864347 aaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagacttt 22864446  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22864447 actggggaaaacgccgtt 22864464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 22879013 - 22879523
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22879013 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgactt 22879112  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||   | |||||||||||| |||   ||    
T  22879113 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactga---tg 22879209  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  22879210 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 22879306  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  22879307 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 22879405  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  22879406 aaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagacttt 22879505  T
Q  496 actggggataacgccgtt 513  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22879506 actggggaaaacgccgtt 22879523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 18300767 - 18301278
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| ||||||||||| |||||    
T  18300767 ggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgtttttttttttgacaagatatagattgagattga 18300866  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  18300867 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 18300964  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  18300965 -tg---ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttg 18301060  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  18301061 taatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcc 18301159  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18301160 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 18301259  T
Q  493 ccgactggggataacgccg 511  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  18301260 tctactgggaataatgccg 18301278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10650237 - 10649730
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||    |    
T  10650237 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttggccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagatt----t 10650142  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||   | |||||||||||| |||       
T  10650141 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggcttacaaggttttgacagagaacctgacacgagtattgaattgagactga--- 10650045  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  10650044 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 10649948  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  10649947 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 10649849  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10649848 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaaga-c 10649750  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
      |||||||| |||||||||    
T  10649749 ttactggggaaaacgccgtt 10649730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20073184 - 20072693
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  20073184 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 20073085  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||       
T  20073084 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga--- 20072988  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  20072987 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 20072891  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||    || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  20072890 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 20072792  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072791 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21681890 - 21681406
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  21681890 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgact 21681791  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  21681790 tgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 21681694  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  21681693 g---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 21681597  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata-------- 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |            
T  21681596 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcg 21681498  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  21681497 gagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 21681406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4630930 - 4630420
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||| ||||||    
T  4630930 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaatcagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgac 4630831  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||       
T  4630830 ttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga--- 4630734  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  4630733 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 4630637  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || |    
T  4630636 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctt 4630538  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4630537 ggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagact 4630438  T
Q  494 cgactggggataacgccg 511  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  4630437 ctactgggaataatgccg 4630420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 17969967 - 17970481
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||| |||||    
T  17969967 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattga 17970066  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| |    
T  17970067 cttgacgtcgatttgaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgata 17970166  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    |||   ||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  17970167 ttg---tt---attggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 17970260  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  17970261 taatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 17970359  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaaga 491  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  17970360 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagaga 17970459  T
Q  492 cccgactggggataacgccgtt 513  Q
    | | || ||||| |||||||||    
T  17970460 ctccaccggggaaaacgccgtt 17970481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15368408 - 15367903
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  15368408 ggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgact 15368309  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||| | ||  ||   |       ||| || |||||||  || |||||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||   |    
T  15368308 tgacattgacatgtcct-------agagatggaccaatggcactggctccccagatcttgacagagaatttgacataagtattgaattgagactga---t 15368219  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  15368218 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 15368122  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------ta 394  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |     
T  15368121 atgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttg 15368022  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15368021 gaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagact 15367922  T
Q  494 cgactggggataacgccgt 512  Q
    |  |||||||||| |||||    
T  15367921 ctgctggggataatgccgt 15367903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16599782 - 16599406
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16599782 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 16599683  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  16599682 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 16599586  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  16599585 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 16599489  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 387  Q
    |||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599488 tgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 51789191 - 51788681
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | |||||| |||||||| ||||||||    
T  51789191 ggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgactt 51789093  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  51789092 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 51788996  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcatta-aatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |    
T  51788995 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgta 51788899  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  51788898 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 51788800  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  51788799 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 51788700  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  51788699 tactggggaaaacgccgtt 51788681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4424066 - 4423557
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||    
T  4424066 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttattgacaaaatatagattgagattgact 4423967  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   |    
T  4423966 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---t 4423870  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    | |   ||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  4423869 gtc---gacattggacatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 4423773  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  4423772 atgcatgactgttggcattttataggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 4423674  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||      
T  4423673 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactt 4423574  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     ||||||||||| ||||    
T  4423573 tactggggataatgccg 4423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 535
Target Start/End: Original strand, 16403885 - 16404414
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaactt-gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgac 106  Q
    ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16403885 caagctgctcttggattgagcttagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 16403984  T
Q  107 gtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgaca 206  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||       
T  16403985 gtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg--- 16404078  T
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16404079 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16404178  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16404179 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16404277  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||     
T  16404278 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcacc 16404377  T
Q  499 ggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctgg 535  Q
    ||||| ||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  16404378 ggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgg 16404414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 486
Target Start/End: Original strand, 31957547 - 31958029
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31957547 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 31957645  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||| ||| ||||    
T  31957646 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattg 31957745  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
          ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  31957746 ------acattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 31957839  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  31957840 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 31957938  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 486  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31957939 aaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttg 31958029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 32446301 - 32445791
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||          |||||||||||| |||||||||||    
T  32446301 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgacaaaatataggttgaaattgac 32446202  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  32446201 ttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaatcgaccgatactaatggctcacaaggttttgatagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 32446105  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  32446104 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 32446008  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-cat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       ||| | |    
T  32446007 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctt 32445909  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32445908 ggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagact 32445809  T
Q  494 cgactggggataacgccg 511  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  32445808 ctactgggaataatgccg 32445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7080398 - 7080022
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  7080398 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgaaattgactt 7080299  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||    
T  7080298 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg 7080202  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  7080201 ---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 7080105  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 387  Q
    |||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080104 tgcatgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5474125 - 5473628
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5474125 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacataaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 5474027  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||  |||    
T  5474026 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacagatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttg 5473927  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    |||||||      |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          || ||| ||||||| ||    
T  5473926 acattga------aaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtatgaatgcttgtaa 5473843  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  5473842 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 5473744  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| |     
T  5473743 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactct 5473644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28346266 - 28345830
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||    
T  28346266 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtca 28346167  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    |  |  ||||||||||| ||| ||||||||||      ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28346166 tgagttttgaattgagactgatattgacattg------gaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcat 28346073  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28346072 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtg 28345974  T
Q  378 gctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    ||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||    
T  28345973 gctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttg 28345874  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    |||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  28345873 ctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 28345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8218720 - 8218284
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  8218720 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 8218621  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    |  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8218620 tgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcat 8218527  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    |||||||| || ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| | || ||||||||||||||| |||    
T  8218526 gattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtg 8218428  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    |||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||    
T  8218427 gctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttg 8218328  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    |||| |||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  8218327 ctggagatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 8218284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 6535834 - 6536343
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | || ||||||||||||  |||||||    
T  6535834 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattgg-cacaatatagattgaggttgactt 6535932  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||||||||||  ||||||| |   |||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  6535933 gacgtcgatttagtttgaaatg---aaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 6536026  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  6536027 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 6536123  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 394  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |          
T  6536124 taatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 6536222  T
Q  395 --gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
      ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6536223 tggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 6536322  T
Q  493 ccgactggggataacgccgtt 513  Q
       |||||||| |||||||||    
T  6536323 tttactggggaaaacgccgtt 6536343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28028443 - 28027930
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn----------gacaaaatatagattg 93  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                 ||||||||||||||||    
T  28028443 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgggttttttttttttttttgacaaaatatagattg 28028344  T
Q  94 aaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgag 193  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||    
T  28028343 agatcgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgag 28028244  T
Q  194 attgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 293  Q
    | |||   ||   |||||||||||||||| | ||| |||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     
T  28028243 actga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatg-------taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatga 28028157  T
Q  294 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---- 389  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||        
T  28028156 atgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctcgtgctacattac 28028058  T
Q  390 ----tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatctt 485  Q
        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  28028057 acattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctt 28027958  T
Q  486 ggaagacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    |  ||||   |||||||| |||||||||    
T  28027957 gagagactttactggggaaaacgccgtt 28027930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717714
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5717729  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  5717728 ggggaaaatgccgtt 5717714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728624
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5728639  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  5728638 ggggaaaatgccgtt 5728624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763744
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5763729  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  5763730 ggggaaaatgccgtt 5763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 206 - 513
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589956
Alignment:
Q  206 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 305  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  306 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 397  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 5589840  T
Q  398 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  5589841 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgcaacttgctagagatagaatcttggaagacctgac 5589940  T
Q  498 tggggataacgccgtt 513  Q
    |||||| || ||||||    
T  5589941 tggggaaaatgccgtt 5589956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35222024 - 35221712
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35222024 ggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaattcactggagattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgactt 35221925  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  35221924 gacgtcgattt----tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcataagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 35221832  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  35221831 ---ctgatattggaaatgcactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 35221735  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgta 326  Q
     ||||||  ||||||||||||||    
T  35221734 cgcatgactgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10403186 - 10402811
Alignment:
Q  139 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgat 238  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  10403186 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgat 10403093  T
Q  239 ataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||     
T  10403092 ataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttca 10402993  T
Q  339 cagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgt 430  Q
    | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  10402992 cgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgt 10402894  T
Q  431 accggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    | |||||||||||| | |||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  10402893 atcggaaccatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 10402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658567
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 29658552  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  29658553 ggggaaaatgccgtt 29658567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030114
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactttgctggagatagaatcttggaagactccac 47030130  T
Q  498 tggggataacgccgtt 513  Q
    |||||| |||||||||    
T  47030129 tggggaaaacgccgtt 47030114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5718167 - 5718036
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5718167 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5718068  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5718067 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5729077 - 5728946
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5729077 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5728978  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728977 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5728946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 5763291 - 5763422
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5763291 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 5763390  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5763391 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5763422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 29658115 - 29658245
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29658115 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaagcatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttg 29658214  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658215 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 29658245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 5589510 - 5589643
Alignment:
Q  9 caagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5589510 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcattggggattagtttgtt-gaaaaaatatagattgagattgacttgacg 5589608  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatat 142  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5589609 tcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatat 5589643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 47030568 - 47030437
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47030568 gggtataagctgctcttggattgagctagtcacttgactgaacggaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 47030469  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47030468 gacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 47030437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 397 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079867
Alignment:
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  497 ctggggataacgccg 511  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7079881 ctgggaataatgccg 7079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8218813 - 8218749
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8218813 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 8218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10403261 - 10403197
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403261 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 10403197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9527051 - 9526989
Alignment:
Q  7 tacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9527051 tacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 9526989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 15885815 - 15885875
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatta 69  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15885815 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggatta 15885875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4691006 - 4690953
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4691006 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 4690953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 51789307 - 51789255
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51789307 ggtacaagctgctcttggatcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 51789255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 9527466 - 9527419
Alignment:
Q  7 tacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacat 54  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9527466 tacaagctgttcttggattgaactgggcacttgaccaaacagaaacat 9527419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4424184 - 4424130
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4424184 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatatt 4424130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 4631046 - 4630994
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4631046 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 4630994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 8218929 - 8218877
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8218929 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 8218877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10403377 - 10403325
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10403377 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 10403325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10650353 - 10650301
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10650353 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 10650301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 11103358 - 11103410
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  11103358 ggtacaagctgctcttggatcgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 11103410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28028559 - 28028507
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28028559 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 28028507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 31029237 - 31029289
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31029237 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 31029289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 48473197 - 48473145
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48473197 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 48473145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20073299 - 20073248
Alignment:
Q  6 gtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20073299 gtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 20073248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18337827 - 18337773
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18337827 gggtacaagtcgttcttggatgcgaacttgtaacttgaccaaacagaaacatatt 18337773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18250003 - 18249950
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18250003 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 18249950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5718283 - 5718231
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  5718283 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 5718231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5729193 - 5729141
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  5729193 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 5729141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 5763175 - 5763227
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  5763175 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 5763227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20569830 - 20569882
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20569830 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 20569882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21682006 - 21681954
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  21682006 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 21681954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 22380577 - 22380629
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  22380577 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaatcggaaacatatt 22380629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 24335461 - 24335409
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatat 56  Q
    |||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| |||||||||    
T  24335461 gggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatat 24335409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 28108936 - 28108988
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28108936 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacggaaacatatt 28108988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 32297919 - 32297867
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  32297919 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 32297867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Original strand, 20333465 - 20333969
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||    
T  20333465 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccactagaccgaacagaaacaaattcattggggattagtttttttgacaaaatgtagattgagattgactt 20333564  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||| |||   ||    
T  20333565 gaagtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgggtattgaattcagactga---tg 20333661  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  20333662 c---tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 20333758  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  20333759 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 20333858  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |     
T  20333859 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactct 20333958  T
Q  496 actggggataa 506  Q
     ||||||||||    
T  20333959 gctggggataa 20333969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 14691968 - 14692474
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14691968 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgactt 14692064  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  14692065 gacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg 14692161  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  14692162 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 14692258  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  14692259 tgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 14692358  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  14692359 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 14692458  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  14692459 actgggaataatgccg 14692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 14694650 - 14695156
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14694650 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgactt 14694746  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  14694747 gacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg 14694843  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  14694844 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 14694940  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  14694941 tgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 14695040  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  14695041 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 14695140  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  14695141 actgggaataatgccg 14695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 14697334 - 14697840
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14697334 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgactt 14697430  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  14697431 gacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg 14697527  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  14697528 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 14697624  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  14697625 tgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 14697724  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  14697725 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 14697824  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  14697825 actgggaataatgccg 14697840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 501
Target Start/End: Original strand, 14700015 - 14700511
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14700015 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgactt 14700111  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  14700112 gacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg 14700208  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  14700209 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 14700305  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  14700306 tgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 14700405  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |     
T  14700406 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactct 14700505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Original strand, 16201078 - 16201583
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||||||| ||||||    
T  16201078 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttttgacaaaatatagattgaagttgact 16201177  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||  | |||||||||||| |||   |    
T  16201178 ggacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcaatattattggctcacaagattttgatagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---t 16201274  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  16201275 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 16201371  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        || |     
T  16201372 atgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcctg 16201471  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  16201472 gaaatcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtagaatctcggaagactc 16201571  T
Q  495 gactggggataa 506  Q
     |||||||||||    
T  16201572 tactggggataa 16201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 51645427 - 51644921
Alignment:
Q  9 caagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  51645427 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgaca 51645328  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |    
T  51645327 tcgatttgatttgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---t 51645234  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  51645233 tgtcattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 51645134  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  51645133 tgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 51645035  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  51645034 cctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactg 51644935  T
Q  500 gggataacgccgtt 513  Q
    |||| |||||||||    
T  51644934 gggaaaacgccgtt 51644921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20467998 - 20467484
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnng----acaaaatatagattgaaattg 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||            |||||||||||||||||| ||    
T  20467998 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttttgtacaaaatatagattgaaactg 20467899  T
Q  100 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||     
T  20467898 acttgacgtggatttgatttgaaaggtagaaattgaccagtattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga- 20467800  T
Q  200 attgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
      ||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  20467799 --tgc---tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 20467705  T
Q  300 gaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tc 391  Q
    | |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |        ||    
T  20467704 gtaatgcatgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattc 20467605  T
Q  392 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 491  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20467604 ctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaaga 20467505  T
Q  492 cccgactggggataacgccgt 512  Q
    | |  |||||||||| |||||    
T  20467504 ctctgctggggataatgccgt 20467484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 21890805 - 21891308
Alignment:
Q  10 aagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtc 109  Q
    |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21890805 aagctgctcttggattgagttagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggatt-gtttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtc 21890903  T
Q  110 gatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   || |   |    
T  21890904 gatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tgtc---g 21890997  T
Q  210 acattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatg 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  21890998 acattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcacg 21891097  T
Q  310 atggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcc 401  Q
    |  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||    
T  21891098 actgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcc 21891197  T
Q  402 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 501  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21891198 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 21891297  T
Q  502 gataacgccgt 512  Q
     |||| |||||    
T  21891298 aataatgccgt 21891308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 41786384 - 41786891
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41786384 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattggcttg 41786483  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||     
T  41786484 acgtcgatttgatttgaaaggcggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg- 41786579  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  41786580 --ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 41786677  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 396  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||    
T  41786678 gcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 41786776  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |    
T  41786777 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagacttta 41786876  T
Q  497 ctggggataacgccg 511  Q
    |||||||||| ||||    
T  41786877 ctggggataatgccg 41786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 10969852 - 10969344
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |       | |||||| |||||||| ||||||||    
T  10969852 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgactt 10969754  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  10969753 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 10969657  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  10969656 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 10969560  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || |     
T  10969559 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttg 10969461  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  10969460 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactt 10969361  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     ||||||||||| ||||    
T  10969360 tactggggataatgccg 10969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3648363 - 3647846
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3648363 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 3648264  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||  |    
T  3648263 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt 3648164  T
Q  202 tgacatt-gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||||||| || ||  || |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  3648163 tgacattggaaatgcgatatg--atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 3648066  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 394  Q
     |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |          
T  3648065 taatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattct 3647967  T
Q  395 --gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
      || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  3647966 cggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagac 3647867  T
Q  493 ccgactggggataacgccgtt 513  Q
     | || ||||| |||||||||    
T  3647866 tccaccggggaaaacgccgtt 3647846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28156915 - 28156425
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |         ||||||||||||||||| |||||||    
T  28156915 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgact 28156816  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   |    
T  28156815 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---t 28156719  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  28156718 g---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 28156622  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  28156621 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 28156523  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156522 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10952301 - 10951791
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |       | |||||| |||||||| ||||||||    
T  10952301 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgactt 10952203  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  || |||  |  ||||||||||| ||| ||||    
T  10952202 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaagttgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgtcatgagttttgaattgagactgatattg 10952103  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    | ||||      ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  10952102 atattg------gaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 10952009  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata-------- 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |            
T  10952008 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 10951910  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | |    
T  10951909 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgagaggctc 10951810  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  10951809 cactggggaaaacgccgtt 10951791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28592291 - 28591780
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |         ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28592291 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgact 28592192  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    | || | |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  28592191 taacattgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 28592095  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  28592094 g---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 28591998  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  28591997 atgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 28591899  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||| |||||||| |||||  |||| |    
T  28591898 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatgtaacttgctagggatagagtcttgagagactc 28591799  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  28591798 cactggggaaaacgccgtt 28591780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 21890329 - 21890382
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21890329 ggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 21890382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 21890563 - 21890616
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21890563 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatatt 21890616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20333112 - 20333164
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20333112 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacagaaacatatt 20333164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28592466 - 28592414
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28592466 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 28592414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3648479 - 3648427
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3648479 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 3648427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10952417 - 10952365
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  10952417 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacggaaacatatt 10952365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20331995 - 20332047
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||| |||||||||    
T  20331995 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacaaaaacatatt 20332047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20332111 - 20332163
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||    
T  20332111 ggtacaagctgctcttggattgagttgggcacttgaccaaacagaaacatatt 20332163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20332524 - 20332576
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||  |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20332524 ggtacaagctactcttggattgagctgggcacttgaccaaacagaaacatatt 20332576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20332876 - 20332928
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||| |||||||||    
T  20332876 ggtacaagctgctcttggattgagctgggcacttgaccaaacataaacatatt 20332928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 14570340 - 14569836
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||    
T  14570340 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgactt 14570241  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||    
T  14570240 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg 14570144  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  14570143 ---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 14570047  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |    
T  14570046 tgcatgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttgg 14569947  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| |     
T  14569946 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactct 14569847  T
Q  496 actggggataa 506  Q
    |||||| ||||    
T  14569846 actgggaataa 14569836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 15774760 - 15774250
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  15774760 ggtacaagctgctctaggattgagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactgggatttagtttttttttgacaaaatatagattgaaattgact 15774661  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   |    
T  15774660 tgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---t 15774564  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  15774563 g---ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 15774467  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |     
T  15774466 atgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctg 15774367  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15774366 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactc 15774267  T
Q  495 gactggggataacgccg 511  Q
     |||||| |||| ||||    
T  15774266 tactgggaataatgccg 15774250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 506
Target Start/End: Original strand, 21341203 - 21341702
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21341203 caagctgctcttggattgcgctagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgacttgacgt 21341301  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | | |||||||||| |||   ||   ||    
T  21341302 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactga---tg---tt 21341395  T
Q  209 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 308  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  21341396 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 21341495  T
Q  309 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 400  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||    
T  21341496 gactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 21341595  T
Q  401 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  21341596 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactg 21341695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22140025 - 22139595
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  22140025 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgtcagagaacctgaca 22139926  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    |  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22139925 tgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcat 22139832  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22139831 gattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtg 22139732  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    |||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  22139731 gctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttg 22139632  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 506  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  22139631 ctggggacagaatctcggaagactctactggggataa 22139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 2130296 - 2130804
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||       |||||| ||||| |||||||||||||    
T  2130296 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaagtataggttgaaattgactt 2130394  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| ||| ||||    
T  2130395 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattg 2130494  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
          ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  2130495 ------acattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 2130588  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  2130589 tgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgg 2130688  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccg 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  2130689 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 2130788  T
Q  496 actggggataacgccg 511  Q
    |||||| |||| ||||    
T  2130789 actgggaataatgccg 2130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 33249547 - 33249039
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn----gacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |           ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33249547 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttg 33249448  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||| ||||| |||   ||     
T  33249447 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgagactga---tg- 33249352  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  33249351 --ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 33249254  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 396  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||    
T  33249253 gcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgga 33249154  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 496  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  33249153 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactcta 33249054  T
Q  497 ctggggataacgccg 511  Q
    ||||| |||| ||||    
T  33249053 ctgggaataatgccg 33249039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16261119 - 16260613
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |        ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16261119 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcattggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 16261020  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |    
T  16261019 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgactaatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---t 16260926  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||    
T  16260925 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgca 16260826  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||    
T  16260825 tgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaat 16260726  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactg 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||    
T  16260725 cctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactg 16260626  T
Q  500 gggataacgccgt 512  Q
    || |||| |||||    
T  16260625 ggaataatgccgt 16260613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19695299 - 19694791
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattgacttga 105  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19695299 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttgttttttttgacaaaatatagattgagattgacttga 19695200  T
Q  106 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgac 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| ||| ||||||    
T  19695199 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattgac 19695100  T
Q  206 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 305  Q
    ||||      ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  19695099 attg------gaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19695006  T
Q  306 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 397  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |        || | |||    
T  19695005 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttatattacacattcctggaa 19694906  T
Q  398 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  19694905 atcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 19694806  T
Q  498 tggggataacgccgt 512  Q
    |||| |||| |||||    
T  19694805 tgggaataatgccgt 19694791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 78 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18797820 - 18797404
Alignment:
Q  78 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  18797820 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggcttacaaggttttgacagagaacctgaca 18797721  T
Q  178 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 277  Q
    || | ||||||||||      || |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18797720 taagtattgaattga------aactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcat 18797627  T
Q  278 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 377  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797626 gattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 18797527  T
Q  378 gctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttg 469  Q
    |||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  18797526 gctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttg 18797427  T
Q  470 ctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||  |||||||||||||| ||||    
T  18797426 ctaaggatagaatcttgggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Original strand, 19654350 - 19654863
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||          |||||||||||| ||||||||||    
T  19654350 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgacaaaatataggttgaaattga 19654449  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  | |||||||||||| |||      
T  19654450 cttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctaacatgagtattgaattgagactga-- 19654547  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19654548 -tg---ttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 19654643  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        ||     
T  19654644 taatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcc 19654743  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19654744 tggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggc 19654843  T
Q  493 ccgactggggataacgccgt 512  Q
     | |||||| |||| |||||    
T  19654844 tctactgggaataatgccgt 19654863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 484
Target Start/End: Original strand, 19910198 - 19910676
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacg 107  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19910198 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacg 19910297  T
Q  108 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||| ||||        
T  19910298 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattg---- 19910393  T
Q  208 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 307  Q
      ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  19910394 --acattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 19910491  T
Q  308 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 399  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||||    
T  19910492 tgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 19910591  T
Q  400 cctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 484  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19910592 cctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 511
Target Start/End: Original strand, 27601946 - 27602449
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27601946 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacagaaacaaaatcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgacttgacgt 27602044  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacatt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||    
T  27602045 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---tt 27602138  T
Q  209 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 308  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  27602139 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 27602238  T
Q  309 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 400  Q
    ||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | ||||||    
T  27602239 gactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatc 27602338  T
Q  401 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 500  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | |||||    
T  27602339 ctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctactgg 27602438  T
Q  501 ggataacgccg 511  Q
    | |||| ||||    
T  27602439 gaataatgccg 27602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 29836534 - 29836023
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgact 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||| |||||||||| |||||||    
T  29836534 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgact 29836435  T
Q  103 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaatt 202  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   |    
T  29836434 taacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---t 29836338  T
Q  203 gacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  29836337 g---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 29836241  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata-------- 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |            
T  29836240 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 29836142  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29836141 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagaccc 29836042  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  29836041 gactggggaaaacgccgtt 29836023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18716668 - 18716177
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  18716668 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 18716569  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  18716568 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 18716472  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  18716471 tg---ttgacattggaagtgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 18716375  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  18716374 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 18716276  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716275 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 31361739 - 31361267
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31361739 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatc-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 31361641  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||| |||||  ||  ||     
T  31361640 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaaatgagacggatgtt- 31361542  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
        ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  31361541 ----tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 31361446  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------g 395  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |    
T  31361445 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcgg 31361347  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 475  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  31361346 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Original strand, 31482888 - 31483393
Alignment:
Q  7 tacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttga 105  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |       ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31482888 tacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatgggtttt---gacaaaatatagattgagattgacttga 31482984  T
Q  106 cgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgac 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||      
T  31482985 cgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg-- 31483079  T
Q  206 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 305  Q
     |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31483080 -ttgacattggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31483178  T
Q  306 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 397  Q
    |||||  || |||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  31483179 catgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 31483277  T
Q  398 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  31483278 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctggagatagaatcttggaagactttac 31483377  T
Q  498 tggggataacgccgtt 513  Q
    |||||| |||||||||    
T  31483378 tggggaaaacgccgtt 31483393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 44568191 - 44567680
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | || |||||||||||| ||||||||    
T  44568191 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-cataatatagattgagattgactt 44568093  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  44568092 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 44567996  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  44567995 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 44567899  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcat 393  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |         || |    
T  44567898 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgctatattacacatttctt 44567800  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||     
T  44567799 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagact 44567700  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
      |||||||| |||||||||    
T  44567699 ttactggggaaaacgccgtt 44567680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 516
Target Start/End: Original strand, 12085738 - 12086253
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  12085738 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgac 12085837  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  |  | ||||||||| |||       
T  12085838 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtttcgaattgagactga--- 12085934  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   ||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  12085935 tg---ttgatgttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 12086031  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  12086032 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 12086130  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |     
T  12086131 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggct 12086230  T
Q  494 cgactggggataacgccgttatg 516  Q
      |||||||| ||||||||||||    
T  12086231 ttactggggaaaacgccgttatg 12086253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19681666 - 19681156
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       | |||||| |||||||| ||||||||    
T  19681666 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgactt 19681568  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  19681567 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 19681471  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |    
T  19681470 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgta 19681374  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  19681373 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 19681275  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19681274 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactt 19681175  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  19681174 tactggggaaaacgccgtt 19681156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Original strand, 22073948 - 22074429
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||       | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22073948 ggtacaaggtgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattagttttt--ggcaaaatataaattgaaattgactt 22074045  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| | ||  |       |   |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||| |||| || |||||    
T  22074046 gacattgacat-------atcctagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaatcgagactgtaattg 22074138  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
          |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  22074139 ------acattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 22074232  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | |    
T  22074233 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgg 22074332  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074333 aaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33265937 - 33265420
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-------agnnnnnnngacaaaatatagattgaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |        ||||||||||||||||| |    
T  33265937 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttattttttttgacaaaatatagattgaga 33265838  T
Q  97 ttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagatt 196  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |    
T  33265837 ttgacttgacgccgatttaaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagact 33265738  T
Q  197 gaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatg 296  Q
    ||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||    
T  33265737 ga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatg 33265644  T
Q  297 cttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca------- 389  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |           
T  33265643 cttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaca 33265545  T
Q  390 -tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttgga 488  Q
     || | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||      
T  33265544 ttcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgag 33265445  T
Q  489 agacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    ||||   |||||||| |||||||||    
T  33265444 agactttactggggaaaacgccgtt 33265420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9361815 - 9361304
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  9361815 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgac 9361716  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||       
T  9361715 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga--- 9361619  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  9361618 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 9361522  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  9361521 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 9361423  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
      ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  ||||     
T  9361422 gaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagact 9361324  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
    | || ||||| |||||||||    
T  9361323 ccaccggggaaaacgccgtt 9361304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Original strand, 22388891 - 22389190
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn----gacaaaatatagattgaaattg 99  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||| ||||    
T  22388891 ggtacaagctgttcttggatttgaactagtcacttgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattg 22388990  T
Q  100 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||     
T  22388991 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga- 22389089  T
Q  200 attgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
      ||   | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  22389090 --tg---tcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 22389184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355474
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 28355459  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  28355460 ggggaaaatgccgtt 28355474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201906
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||  ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 19201890  T
Q  498 tggggataacgccgtt 513  Q
     ||||| |||||||||    
T  19201891 cggggaaaacgccgtt 19201906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 28355021 - 28355152
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28355021 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 28355120  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355121 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 28355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Original strand, 19201452 - 19201583
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19201452 ggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 19201551  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201552 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 19201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15775473 - 15775288
Alignment:
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  15775473 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 15775374  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775373 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 21341082 - 21341135
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21341082 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 21341135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 19681782 - 19681730
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19681782 ggtacaagctgctcttggatcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 19681730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 21340848 - 21340899
Alignment:
Q  7 tacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21340848 tacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt 21340899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 27601765 - 27601819
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  27601765 gggtacaagctgttcttggatgcgaactggtaacttgaccaaacagaaacatatt 27601819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 19654175 - 19654228
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19654175 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatatt 19654228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22140107 - 22140042
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt 68  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22140107 gggtgcaagttgttcttggatgcgaactggttacttgaccaaacagaaacatattcactgaggatt 22140042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 9361931 - 9361879
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9361931 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 9361879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44568307 - 44568255
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44568307 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 44568255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 21340607 - 21340661
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21340607 gggtacaagctgttcttggatgtgaactggtaacttgaccaaacagaaacatatt 21340661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33249906 - 33249856
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33249906 gggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 33249856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 19653998 - 19654051
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19653998 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacggaaacatatt 19654051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33249727 - 33249674
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  33249727 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacggaaacatatt 33249674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15775054 - 15775006
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  15775054 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccgaacagaaaca 15775006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18716784 - 18716732
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18716784 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 18716732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Original strand, 21340435 - 21340479
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  21340435 caagctgctcttggatcgagctagccacttgagcaaacagaaaca 21340479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 28354905 - 28354957
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  28354905 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 28354957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 31482770 - 31482822
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  31482770 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 31482822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Original strand, 3661 - 4173
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattga 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||| |||||    
T  3661 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatatagattgagattga 3760  T
Q  101 cttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  | |||||||||||| |||      
T  3761 cttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttggcagagaacctgacatgagtattgaattgagactga-- 3858  T
Q  201 ttgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 300  Q
     ||   |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  3859 -tg---ttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttg 3954  T
Q  301 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 392  Q
     |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        ||     
T  3955 taatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattct 4054  T
Q  393 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4055 tggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagac 4154  T
Q  493 ccgactggggataacgccg 511  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  4155 tctactgggaataatgccg 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3597
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3545 ggtacaagctgctcttggattgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatt 3597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 5)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 12769
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatc-gaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattgacttg 104  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||          |||||||| || ||||||| |||||||    
T  13258 caagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacacattcacttgggattagttttttttttgacaaaatgtaaattgaaactgacttg 13159  T
Q  105 acgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattga 204  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||      | |||||| |||    
T  13158 acgtcgatttgatttgaaagataaaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattg------ggttgaaactga 13065  T
Q  205 cattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 304  Q
      |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  13064 tgttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 12965  T
Q  305 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--------cataga 396  Q
    | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||    
T  12964 gtatgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctgga 12865  T
Q  397 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12864 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagac 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2354
Alignment:
Q  207 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 306  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  307 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 398  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  399 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 498  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 2369  T
Q  499 ggggataacgccgtt 513  Q
    ||||| || ||||||    
T  2368 ggggaaaatgccgtt 2354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2807 - 2676
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2807 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacaggaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 2708  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2707 gacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13501 - 13448
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13501 gggtacaagctgttcttggattgaactgggcacttgaccaaacagagacatatt 13448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2871
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2923 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 2871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 506
Target Start/End: Original strand, 8707 - 9214
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||         |||||| |||| ||||| |||||     
T  8707 ggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtataaattgagattgaa 8806  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||| |||||||| ||| ||    
T  8807 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattaaattgagactgatat 8906  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    |||||||||   ||   |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  8907 tgacattga---tg---atgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 9000  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  9001 aatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcct 9100  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagac 492  Q
     || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  9101 ggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagac 9200  T
Q  493 ccgactggggataa 506  Q
     | |||||| ||||    
T  9201 tctactgggaataa 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 13225 - 12715
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||| ||||||    
T  13225 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttttgacaaaatatagattgagattgac 13126  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  13125 ttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 13029  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  13028 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 12932  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  12931 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 12833  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  12832 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagact 12733  T
Q  494 cgactggggataacgccg 511  Q
    | |||||| |||| ||||    
T  12732 ctactgggaataatgccg 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13345 - 13289
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13345 gatgggtacaagctgctcttgattcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 13289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11127 - 10615
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11127 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgactt 11028  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| ||| ||||    
T  11027 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatattg 10928  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       ||   |||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  10927 ---tt---attggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 10834  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcat 393  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |||   ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |         || |    
T  10833 atgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatttctt 10735  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||     
T  10734 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagact 10635  T
Q  494 cgactggggataacgccgtt 513  Q
      |||||||| |||||||||    
T  10634 ttactggggaaaacgccgtt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 34484 - 33971
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnng----acaaaatatagattgaaattg 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||  |||||| |||||||||| |||||| |||||||||            ||||||||||| |||||||||    
T  34484 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccgtttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgtacaaaatataggttgaaattg 34385  T
Q  100 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||      
T  34384 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactg-- 34287  T
Q  200 attgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
     |||   |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  34286 -ttg---ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 34191  T
Q  300 gaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tc 391  Q
    | |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        ||    
T  34190 gtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattc 34091  T
Q  392 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 491  Q
     | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  34090 ctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggaga 33991  T
Q  492 cccgactggggataacgccg 511  Q
    | | |||||| |||| ||||    
T  33990 ctctactgggaataatgccg 33971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11243 - 11191
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11243 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 11191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28491 - 27992
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  28491 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttt--gacaaaatatagattgaaattgactt 28394  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||| | ||  ||   |       ||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  28393 gacattgacatgtcct-------agagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacacaggtatcgaattgagactgaaattg 28301  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
    |||| |      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  28300 acatgg------gaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 28207  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-ca-----tcatagaa 397  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     || | |||    
T  28206 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaa 28107  T
Q  398 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 497  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  28106 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagactccgc 28007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28548 - 28500
Alignment:
Q  6 gtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28548 gtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 28500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Original strand, 7991 - 8479
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7991 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 8089  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  8090 gacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 8186  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  8187 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 8283  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatag 395  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |    
T  8284 tgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgg 8382  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8383 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 511
Target Start/End: Original strand, 24032 - 24531
Alignment:
Q  17 tcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatt 113  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24032 tcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactagggattgtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatt 24131  T
Q  114 tgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacat 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| ||| ||||      ||||    
T  24132 tgatttgaaaagtagaaattgaccgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatattg------acat 24225  T
Q  214 tggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatgg 313  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  |    
T  24226 tggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactg 24325  T
Q  314 ttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctt 405  Q
     ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||| |||||    
T  24326 ctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaattctctt 24425  T
Q  406 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 505  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  24426 tggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaata 24525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 15151 - 14636
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-agnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  15151 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgac 15052  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  15051 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 14955  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  14954 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 14858  T
Q  302 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 393  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  14857 aatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 14759  T
Q  394 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 493  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |     
T  14758 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggct 14659  T
Q  494 cgactggggataacgccgttatg 516  Q
      |||||||| ||||||||||||    
T  14658 ttactggggaaaacgccgttatg 14636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15267 - 15215
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15267 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 15215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 2226 - 2736
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2226 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacagaggatc-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 2324  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  2325 gacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 2421  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 302  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  2422 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 2518  T
Q  303 atgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcata 394  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |     
T  2519 atgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttg 2617  T
Q  395 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | |    
T  2618 gaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctc 2717  T
Q  495 gactggggataacgccgtt 513  Q
     |||||||| |||||||||    
T  2718 cactggggaaaacgccgtt 2736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 23646 - 23935
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23646 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaaaggggatc-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgactt 23744  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    
T  23745 gacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg 23841  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 299  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23842 ---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18505
Alignment:
Q  436 aaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 513  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 18505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 492
Target Start/End: Original strand, 25627 - 26108
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgactt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25627 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttt--gacaaaatataaattgaaattaactt 25724  T
Q  104 gacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattg 203  Q
    | | | ||  |       |   |||| || | |||||  || || ||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  25725 ggcattgacat-------atcctagagatgggccaatggcactgactcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattg 25817  T
Q  204 acattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaa 303  Q
          |||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  25818 ------acattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaa 25911  T
Q  304 tgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tag 395  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||        | |    
T  25912 tgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctcatgctatatcacacattcttgg 26011  T
Q  396 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26012 aaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaagac 26108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 25569 - 25618
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25569 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 25618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 212 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 467
Alignment:
Q  212 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  312 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 403  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||||||||    
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  404 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 503  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 479  T
Q  504 taacgccgttat 515  Q
    ||| ||||||||    
T  478 taatgccgttat 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16788 - 16273
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnn-----gacaaaatatagattgaaatt 98  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||| |||    
T  16788 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacaaaaacatattcactggggattgtttttttttttttgacaaaatatagattgagatt 16689  T
Q  99 gacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattga 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||    
T  16688 gacttggcgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga 16589  T
Q  199 aattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgct 298  Q
       ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  16588 ---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgct 16495  T
Q  299 tgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------t 390  Q
    || |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |        |    
T  16494 tgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgttatattacacatt 16396  T
Q  391 catagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaag 490  Q
    | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  ||    
T  16395 cttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagag 16296  T
Q  491 acccgactggggataacgccgtt 513  Q
    || | || ||||| |||||||||    
T  16295 actccaccggggaaaacgccgtt 16273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16904 - 16852
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16904 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacatatt 16852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 1123 - 1412
Alignment:
Q  15 gttcttggat-cgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatt 113  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1123 gttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggatt-ggtttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatt 1221  T
Q  114 tgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacat 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||    
T  1222 tgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga---tg---ttgacat 1315  T
Q  214 tggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 310  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  1316 tggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 511
Target Start/End: Original strand, 39734 - 40181
Alignment:
Q  81 aaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggt-agaaatt-gaccaatatcattgg-ctcacaagattttgacagagaatttgaca 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||    
T  39734 aaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggttagaaatttgaccgatattattggtctcacaaggttttgacagagaacccgaca 39833  T
Q  178 t-aggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat-gcaacatgtatgga-tgatataacagtttca-ttaaatgcat-gggcacataata 272  Q
    | ||  |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  39834 tgagtaattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgtaata 39927  T
Q  273 tgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc-agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagt-attgggc- 369  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||     
T  39928 tgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtggttgggca 40027  T
Q  370 acgtagtggctcgtgctacatcata----------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctga-gggcagatagc 458  Q
    ||| |||||||||||||| || | |           ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  40028 acgcagtggctcgtgctatattacacatttcctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagt 40127  T
Q  459 taat-caacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  40128 taatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 40181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Original strand, 13022 - 13324
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttgga-tcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatt-agnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgac 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||| ||||||||||||| ||||||    
T  13022 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgac 13121  T
Q  102 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaat 201  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| | |||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||       
T  13122 ttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggattacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga--- 13218  T
Q  202 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 301  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  13219 tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 13315  T
Q  302 aatgcatga 310  Q
    |||||||||    
T  13316 aatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 12906 - 12958
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12906 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacggaaacatatt 12958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7005 - 6850
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 108  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         |||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  7005 caagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgc 6906  T
Q  109 cgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgac 164  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6905 tgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgac 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6741
Alignment:
Q  445 tgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 511  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 6741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 7242 - 7198
Alignment:
Q  9 caagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  7242 caagctgctcttggatcgagctagccacttgagcaaacagaaaca 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 12)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1351 - 1403
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1351 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaaca 1403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1459 - 1511
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1459 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaaca 1511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1567 - 1619
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1567 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaaca 1619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 1675 - 1727
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1675 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccagacagaaaca 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 1247 - 1295
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1247 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccacacagaaaca 1295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 1783 - 1825
Alignment:
Q  1 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgacca 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1783 gatgggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgacca 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1346
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1298 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaaca 1346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 1406 - 1454
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1406 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaaca 1454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 1514 - 1562
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1514 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaaca 1562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 1622 - 1670
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1622 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaaca 1670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1778
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaaca 53  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1730 ggtacgagctgttcttggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaaca 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 42
Target Start/End: Original strand, 1009 - 1047
Alignment:
Q  4 gggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgacc 42  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1009 gggtacaagctgttcttggattgaactggccacttgacc 1047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 2155 - 2207
Alignment:
Q  5 ggtacaagctgttcttggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacatatt 57  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2155 ggtacaagctgctcttggattgagctagccacttgaccaaatggaaacatatt 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University