View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9451_low_4 (Length: 515)

Name: NF9451_low_4
Description: NF9451
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9451_low_4
NF9451_low_4
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-495)||(27283398-27283883)
chr6 (1-490)||(27209574-27210063)
chr6 (1-490)||(27239165-27239654)
chr6 (1-490)||(26927427-26927920)
chr6 (1-490)||(16756496-16756985)
chr6 (1-463)||(15405566-15406028)
chr6 (1-463)||(15417353-15417815)
chr6 (1-491)||(22927888-22928380)
chr6 (1-490)||(13291980-13292470)
chr6 (1-485)||(27025822-27026305)
chr6 (1-485)||(27031701-27032185)
chr6 (54-471)||(24870402-24870821)
chr6 (1-490)||(29508096-29508585)
chr6 (1-490)||(24298798-24299285)
chr6 (1-490)||(29556231-29556721)
chr6 (1-490)||(33369460-33369954)
chr6 (1-492)||(13517228-13517720)
chr6 (181-495)||(27622914-27623228)
chr6 (1-465)||(27200897-27201360)
chr6 (1-465)||(27247873-27248336)
chr6 (40-492)||(30551054-30551506)
chr6 (58-432)||(20131253-20131623)
chr6 (58-432)||(22201247-22201617)
chr6 (1-492)||(29579707-29580196)
chr6 (3-492)||(27491811-27492299)
chr6 (1-490)||(26792491-26792976)
chr6 (1-492)||(4538793-4539285)
chr6 (3-492)||(4531967-4532454)
chr6 (1-497)||(26109435-26109933)
chr6 (1-490)||(27014399-27014888)
chr6 (1-471)||(28167188-28167659)
chr6 (1-495)||(28214138-28214633)
chr6 (1-492)||(26665672-26666163)
chr6 (1-492)||(26771643-26772134)
chr6 (54-514)||(27355170-27355631)
chr6 (40-492)||(16937077-16937532)
chr6 (1-492)||(16680832-16681323)
chr6 (54-492)||(27064174-27064603)
chr6 (41-492)||(4779584-4780035)
chr6 (1-490)||(14138441-14138925)
chr6 (1-465)||(8898708-8899176)
chr6 (1-465)||(4764462-4764916)
chr6 (186-492)||(34457699-34458012)
chr6 (58-367)||(20175368-20175666)
chr6 (58-367)||(22160325-22160623)
chr6 (1-114)||(34457579-34457690)
chr6 (41-137)||(27622546-27622643)
chr6 (41-109)||(4755757-4755824)
chr6 (1-37)||(24871073-24871109)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (1-495)||(26508660-26509154)
chr7 (1-490)||(2161247-2161735)
chr7 (3-490)||(5154758-5155242)
chr7 (1-490)||(11417755-11418243)
chr7 (3-471)||(16048027-16048493)
chr7 (3-490)||(5165059-5165543)
chr7 (1-491)||(16442957-16443446)
chr7 (1-491)||(16511396-16511890)
chr7 (1-492)||(26662865-26663354)
chr7 (1-492)||(26678057-26678546)
chr7 (1-490)||(2779919-2780408)
chr7 (54-490)||(10909952-10910390)
chr7 (1-492)||(31557354-31557847)
chr7 (1-492)||(26596349-26596839)
chr7 (2-492)||(31083576-31084066)
chr7 (1-492)||(26441938-26442427)
chr7 (1-490)||(22148563-22149051)
chr7 (1-492)||(26519501-26519990)
chr7 (3-465)||(31130616-31131077)
chr7 (3-492)||(4206069-4206558)
chr7 (40-492)||(45393913-45394365)
chr7 (1-492)||(11447582-11448072)
chr7 (1-471)||(45737995-45738469)
chr7 (1-492)||(24585487-24585978)
chr7 (1-492)||(26312816-26313306)
chr7 (1-457)||(5140287-5140744)
chr7 (186-471)||(10848299-10848592)
chr7 (186-492)||(16744649-16744962)
chr7 (186-492)||(4138374-4138687)
chr7 (186-471)||(39206293-39206585)
chr7 (181-490)||(3451926-3452243)
chr7 (174-492)||(26268202-26268527)
chr7 (1-114)||(16744529-16744640)
chr7 (1-114)||(4138254-4138365)
chr7 (1-114)||(39206173-39206284)
chr7 (325-490)||(22152790-22152963)
chr7 (325-490)||(22208705-22208878)
chr7 (1-38)||(16442899-16442936)
chr7 (1-38)||(26508602-26508639)
chr7 (1-38)||(10848769-10848806)
chr7 (1-37)||(5165791-5165827)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (40-491)||(24585476-24585929)
chr4 (1-491)||(15234526-15235014)
chr4 (1-492)||(54840097-54840585)
chr4 (1-471)||(14671717-14672189)
chr4 (1-471)||(5701256-5701725)
chr4 (40-492)||(31119617-31120069)
chr4 (1-492)||(40098702-40099192)
chr4 (1-490)||(36323407-36323894)
chr4 (1-490)||(36337616-36338103)
chr4 (1-490)||(14752584-14753073)
chr4 (1-490)||(17019737-17020215)
chr4 (1-492)||(14105250-14105739)
chr4 (40-492)||(21976410-21976862)
chr4 (1-490)||(24119349-24119839)
chr4 (1-471)||(39857342-39857811)
chr4 (40-465)||(18793747-18794175)
chr4 (125-471)||(15275816-15276164)
chr4 (1-490)||(6576544-6577038)
chr4 (1-492)||(33666870-33667360)
chr4 (125-471)||(15379428-15379776)
chr4 (1-492)||(30760470-30760960)
chr4 (42-486)||(5012593-5013039)
chr4 (1-491)||(34182027-34182515)
chr4 (186-492)||(27156572-27156885)
chr4 (245-491)||(1906975-1907229)
chr4 (54-366)||(24814421-24814726)
chr4 (186-492)||(20331681-20331994)
chr4 (1-188)||(1907236-1907420)
chr4 (1-114)||(20331561-20331672)
chr4 (181-366)||(24813637-24813822)
chr4 (1-85)||(15379315-15379395)
chr4 (1-83)||(15275703-15275781)
chr4 (1-38)||(15235035-15235072)
chr4 (1-38)||(15275645-15275682)
chr4 (1-38)||(15379257-15379294)
chr4 (1-38)||(17020473-17020510)
chr4 (1-37)||(14672390-14672426)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (1-483)||(22895118-22895601)
chr5 (1-491)||(23898578-23899068)
chr5 (1-490)||(33784166-33784656)
chr5 (1-490)||(23726921-23727412)
chr5 (1-485)||(25206998-25207481)
chr5 (1-485)||(25271154-25271637)
chr5 (1-485)||(11556043-11556525)
chr5 (1-490)||(24976528-24977016)
chr5 (41-485)||(23632659-23633105)
chr5 (1-492)||(28952765-28953254)
chr5 (3-492)||(6880995-6881483)
chr5 (65-485)||(22992171-22992593)
chr5 (1-492)||(32589244-32589734)
chr5 (54-457)||(13179836-13180241)
chr5 (1-490)||(24608929-24609418)
chr5 (40-492)||(15751865-15752317)
chr5 (54-490)||(33299220-33299658)
chr5 (1-485)||(18121401-18121886)
chr5 (1-490)||(2517749-2518236)
chr5 (3-492)||(31819393-31819880)
chr5 (1-490)||(9543695-9544185)
chr5 (40-492)||(33523086-33523538)
chr5 (40-492)||(43084956-43085404)
chr5 (40-492)||(30036128-30036580)
chr5 (1-492)||(33881808-33882300)
chr5 (1-492)||(34623201-34623690)
chr5 (1-492)||(37761676-37762165)
chr5 (1-471)||(8658463-8658931)
chr5 (54-490)||(30941314-30941752)
chr5 (1-492)||(18493737-18494227)
chr5 (40-490)||(15651766-15652218)
chr5 (40-492)||(30158722-30159174)
chr5 (1-492)||(3796235-3796726)
chr5 (1-490)||(31438141-31438628)
chr5 (1-465)||(37745317-37745781)
chr5 (1-492)||(37351631-37352123)
chr5 (2-492)||(13435635-13436128)
chr5 (1-492)||(28655947-28656440)
chr5 (1-492)||(18368496-18368989)
chr5 (1-492)||(26487075-26487565)
chr5 (1-490)||(37664474-37664961)
chr5 (1-492)||(9324165-9324655)
chr5 (1-490)||(24730653-24731142)
chr5 (1-492)||(30175170-30175659)
chr5 (1-492)||(12138864-12139353)
chr5 (1-471)||(41681408-41681876)
chr5 (2-492)||(13317797-13318285)
chr5 (186-492)||(40466695-40467008)
chr5 (185-492)||(5644502-5644816)
chr5 (190-492)||(11330336-11330645)
chr5 (181-366)||(13178639-13178824)
chr5 (1-114)||(40466575-40466686)
chr5 (1-121)||(5644815-5644932)
chr5 (1-127)||(11330640-11330765)
chr5 (1-38)||(22895622-22895659)
chr5 (1-38)||(23899089-23899126)
chr5 (1-37)||(22991875-22991911)
chr5 (1-37)||(23727671-23727707)
chr5 (1-37)||(24609619-24609655)
chr5 (1-37)||(30942005-30942041)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-485)||(34267979-34268463)
chr2 (54-491)||(21696296-21696735)
chr2 (13-490)||(23117471-23117947)
chr2 (1-492)||(37678956-37679445)
chr2 (1-492)||(37694221-37694710)
chr2 (54-471)||(27427580-27428000)
chr2 (1-490)||(28888929-28889416)
chr2 (41-492)||(3789138-3789591)
chr2 (3-492)||(13929669-13930158)
chr2 (1-492)||(37932072-37932559)
chr2 (1-492)||(21670231-21670720)
chr2 (2-492)||(19409543-19410031)
chr2 (1-492)||(253709-254199)
chr2 (1-492)||(39896764-39897253)
chr2 (125-491)||(27397031-27397399)
chr2 (40-492)||(16822433-16822885)
chr2 (40-492)||(16898595-16899047)
chr2 (54-490)||(31867921-31868354)
chr2 (40-480)||(34297856-34298297)
chr2 (40-492)||(32056447-32056899)
chr2 (54-490)||(20844590-20845028)
chr2 (1-471)||(37384371-37384840)
chr2 (54-490)||(12662165-12662604)
chr2 (1-471)||(31882987-31883455)
chr2 (1-492)||(34868329-34868819)
chr2 (1-471)||(27123216-27123686)
chr2 (1-492)||(34161536-34162027)
chr2 (1-492)||(37944922-37945412)
chr2 (1-492)||(22921202-22921691)
chr2 (1-492)||(11628243-11628732)
chr2 (1-492)||(12593509-12594001)
chr2 (1-490)||(12709680-12710169)
chr2 (1-471)||(19449475-19449939)
chr2 (1-465)||(40240245-40240710)
chr2 (186-492)||(16168173-16168486)
chr2 (186-492)||(27810398-27810711)
chr2 (186-492)||(9343221-9343534)
chr2 (186-492)||(39045116-39045430)
chr2 (186-492)||(27782918-27783231)
chr2 (181-366)||(3790473-3790658)
chr2 (1-114)||(9343101-9343212)
chr2 (1-114)||(16168495-16168606)
chr2 (1-114)||(27783240-27783351)
chr2 (1-114)||(27810720-27810831)
chr2 (1-114)||(39044995-39045106)
chr2 (1-85)||(27397432-27397512)
chr2 (1-38)||(12662855-12662892)
chr2 (1-38)||(19449417-19449454)
chr2 (1-38)||(27397533-27397570)
chr2 (1-38)||(27397591-27397628)
chr2 (6-38)||(27427287-27427319)
chr2 (1-37)||(28889675-28889711)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (1-490)||(5658773-5659262)
chr3 (1-485)||(16617600-16618084)
chr3 (1-471)||(22041087-22041557)
chr3 (1-491)||(19701055-19701545)
chr3 (1-490)||(18057907-18058396)
chr3 (1-490)||(29141884-29142375)
chr3 (54-490)||(4789814-4790252)
chr3 (1-463)||(15734248-15734710)
chr3 (1-485)||(8282594-8283076)
chr3 (1-490)||(6208534-6209021)
chr3 (1-491)||(16422845-16423334)
chr3 (1-490)||(11103494-11103982)
chr3 (54-491)||(15885900-15886339)
chr3 (1-490)||(4728265-4728752)
chr3 (1-490)||(22380713-22381201)
chr3 (3-490)||(35887399-35887883)
chr3 (1-492)||(28109072-28109564)
chr3 (54-485)||(18337268-18337701)
chr3 (54-491)||(4690313-4690752)
chr3 (40-492)||(24334835-24335287)
chr3 (1-490)||(4339810-4340297)
chr3 (1-492)||(17978061-17978551)
chr3 (1-492)||(5020370-5020867)
chr3 (1-492)||(32297290-32297783)
chr3 (1-490)||(31029373-31029864)
chr3 (1-492)||(5602422-5602913)
chr3 (40-492)||(18231851-18232303)
chr3 (1-492)||(20569966-20570456)
chr3 (1-490)||(18285487-18285977)
chr3 (1-492)||(18249377-18249866)
chr3 (1-490)||(18300787-18301278)
chr3 (1-465)||(21681406-21681870)
chr3 (1-471)||(48472590-48473061)
chr3 (1-471)||(20072693-20073164)
chr3 (1-492)||(22863973-22864464)
chr3 (1-492)||(22879032-22879523)
chr3 (1-490)||(4630420-4630910)
chr3 (1-492)||(10649730-10650217)
chr3 (1-492)||(17969987-17970481)
chr3 (1-465)||(31957567-31958029)
chr3 (1-492)||(51788681-51789171)
chr3 (1-490)||(5473628-5474105)
chr3 (54-514)||(16403953-16404414)
chr3 (41-492)||(28345830-28346281)
chr3 (1-490)||(4423557-4424046)
chr3 (1-491)||(15367903-15368388)
chr3 (1-366)||(16599406-16599762)
chr3 (54-490)||(32445791-32446228)
chr3 (54-492)||(8218284-8218723)
chr3 (1-366)||(7080022-7080378)
chr3 (1-492)||(6535854-6536343)
chr3 (54-492)||(28027930-28028362)
chr3 (186-492)||(5717714-5718027)
chr3 (186-492)||(5728624-5728937)
chr3 (186-492)||(5763431-5763744)
chr3 (185-492)||(5589642-5589956)
chr3 (118-492)||(10402811-10403186)
chr3 (186-492)||(29658254-29658567)
chr3 (1-305)||(35221712-35222004)
chr3 (186-492)||(47030114-47030428)
chr3 (1-114)||(5718036-5718147)
chr3 (1-114)||(5728946-5729057)
chr3 (1-114)||(5763311-5763422)
chr3 (40-114)||(29658171-29658245)
chr3 (40-114)||(47030437-47030511)
chr3 (1-121)||(5589526-5589643)
chr3 (376-490)||(7079867-7079981)
chr3 (1-38)||(16423535-16423572)
chr3 (1-38)||(35222083-35222120)
chr3 (1-38)||(4789525-4789562)
chr3 (1-38)||(16617542-16617579)
chr3 (1-38)||(19701566-19701603)
chr3 (1-38)||(22041578-22041615)
chr3 (6-38)||(4691304-4691336)
chr3 (1-37)||(5659521-5659557)
chr3 (1-37)||(35888131-35888167)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-485)||(20333485-20333969)
chr1 (1-485)||(16201098-16201583)
chr1 (54-490)||(14692036-14692474)
chr1 (54-490)||(14694718-14695156)
chr1 (54-490)||(14697402-14697840)
chr1 (54-480)||(14700083-14700511)
chr1 (1-492)||(51644921-51645411)
chr1 (7-491)||(21890825-21891308)
chr1 (1-491)||(20467484-20467978)
chr1 (41-490)||(41786441-41786891)
chr1 (1-490)||(10969344-10969832)
chr1 (1-471)||(28156425-28156896)
chr1 (1-492)||(3647846-3648343)
chr1 (1-492)||(10951791-10952281)
chr1 (40-492)||(28591780-28592235)
chr1 (1-38)||(16201040-16201077)
chr1 (1-38)||(20333427-20333464)
chr1 (1-38)||(20467999-20468036)
chr1 (1-37)||(14691693-14691729)
chr1 (1-37)||(14694375-14694411)
chr1 (1-37)||(14697059-14697095)
chr1 (1-37)||(14699740-14699776)
chr1 (6-38)||(21890176-21890208)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (1-485)||(14569836-14570320)
chr8 (54-490)||(15774250-15774688)
chr8 (54-485)||(22139595-22140028)
chr8 (6-485)||(21341223-21341702)
chr8 (1-491)||(16260613-16261104)
chr8 (1-490)||(2130316-2130804)
chr8 (1-490)||(33249039-33249532)
chr8 (54-471)||(18797404-18797823)
chr8 (1-491)||(19694791-19695284)
chr8 (1-490)||(27601961-27602449)
chr8 (1-491)||(19654370-19654863)
chr8 (54-463)||(19910265-19910676)
chr8 (1-454)||(31361267-31361719)
chr8 (1-492)||(29836023-29836514)
chr8 (1-471)||(18716177-18716648)
chr8 (125-471)||(22074081-22074429)
chr8 (1-492)||(44567680-44568171)
chr8 (1-492)||(31482906-31483393)
chr8 (1-495)||(12085758-12086253)
chr8 (1-492)||(19681156-19681646)
chr8 (54-492)||(33265420-33265859)
chr8 (1-492)||(9361304-9361795)
chr8 (186-492)||(28355161-28355474)
chr8 (54-284)||(22388966-22389190)
chr8 (186-492)||(19201592-19201906)
chr8 (1-114)||(19201472-19201583)
chr8 (181-366)||(15775288-15775473)
chr8 (1-114)||(28355041-28355152)
chr8 (1-85)||(22073968-22074048)
chr8 (1-37)||(33249849-33249885)
chr8 (1-38)||(15774998-15775035)
chr8 (1-38)||(18798075-18798112)
chr8 (1-38)||(22073910-22073947)
chr8 (1-38)||(22140227-22140264)
chr8 (6-38)||(19695484-19695516)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (1-490)||(3681-4173)
[»] scaffold0322 (3 HSPs)
scaffold0322 (1-471)||(12769-13242)
scaffold0322 (186-492)||(2354-2667)
scaffold0322 (1-114)||(2676-2787)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-471)||(8011-8479)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-490)||(12715-13205)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (58-490)||(33971-34405)
scaffold0143 (1-492)||(10615-11107)
scaffold0143 (1-38)||(34722-34759)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (3-485)||(8729-9214)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (54-490)||(24093-24531)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-491)||(27992-28471)
scaffold0109 (1-38)||(28492-28529)
scaffold0109 (1-38)||(28550-28587)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (1-492)||(2246-2736)
scaffold0159 (1-278)||(23666-23935)
scaffold0159 (415-492)||(18505-18582)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-495)||(14636-15131)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (139-471)||(25774-26108)
scaffold0241 (1-38)||(25589-25626)
scaffold0241 (1-83)||(25647-25725)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (191-494)||(467-778)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-492)||(16273-16768)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (3-289)||(1135-1412)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (41-490)||(39714-40181)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (1-289)||(13042-13324)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (1-143)||(6850-6990)
scaffold0089 (424-490)||(6741-6807)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Original strand, 27283398 - 27283883
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27283398 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcac--tggggattagttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 27283494  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||   ||   |||||||||||||||    
T  27283495 aaggtagaaattgaccaatattattgactcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattga---tg---ttgacattggaaatg 27283588  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  27283589 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 27283688  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 400  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283689 ttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 27283788  T
Q  401 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283789 gggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacccgactggggataacgccgttatg 27283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27210063 - 27209574
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  27210063 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttga 27209966  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  27209965 aaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 27209872  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  27209871 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 27209772  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||||||||||||||||||    
T  27209771 ttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagata 27209672  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27209671 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 27239165 - 27239654
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  27239165 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttga 27239262  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  27239263 aaggtagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 27239356  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  27239357 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 27239456  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||||||||||||||||||    
T  27239457 ttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagata 27239556  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27239557 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27239654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26927920 - 26927427
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgat 96  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  26927920 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattggtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaa 26927823  T
Q  97 ttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgga 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||| |||||||    
T  26927822 ttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgtcattgga 26927729  T
Q  197 aatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttgg 296  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  26927728 aatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttgg 26927629  T
Q  297 cagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttgga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||    
T  26927628 cagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgga 26927529  T
Q  389 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 488  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||    
T  26927528 gataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatcaactcgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgc 26927429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 16756985 - 16756496
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| | || ||||||||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16756985 ttgagctagccacttgaccaagcagaaacagattcac--tggggattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 16756888  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacag-agaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||  | |||||||||||| |||   || |   ||||||||||||    
T  16756887 aacgtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt-gacaggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tgtc---gacattggaaat 16756795  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  16756794 gcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 16756695  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  16756694 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagat 16756595  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  16756594 gacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 16756496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 15405566 - 15406028
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405566 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 15405663  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||   |||   |||| ||||||||||    
T  15405664 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactg---ttg---ttgatattggaaatg 15405757  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  15405758 caatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 15405857  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||||||||||||||||     
T  15405858 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatg 15405957  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 463  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15405958 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 15417353 - 15417815
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15417353 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 15417450  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||   |||   |||| ||||||||||    
T  15417451 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactg---ttg---ttgatattggaaatg 15417544  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  15417545 caatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 15417644  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||||||||||||||||     
T  15417645 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatg 15417744  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 463  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15417745 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 22927888 - 22928380
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttg--acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22927888 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttttacaaaatataggttgaaattgacttgatgtcgatttgattt 22927985  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  22927986 gaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 22928079  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||||     
T  22928080 tgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttggcg 22928179  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  22928180 atttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggaga 22928279  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  22928280 taacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactagggataatgccg 22928379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 13291980 - 13292470
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13291980 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 13292077  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  13292078 aaggtagaaattgaccaacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 13292171  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  13292172 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 13292271  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  13292272 ttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 13292371  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag-ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  13292372 acgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 13292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27026305 - 27025822
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27026305 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 27026209  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| | |   ||   |||||||||||||||    
T  27026208 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactaa---tg---ttgacattggaaatg 27026115  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  27026114 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 27026015  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||||||||||||||||     
T  27026014 ttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatg 27025915  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  27025914 acgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataa 27025822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27032185 - 27031701
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  | |  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27032185 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcaga--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 27032088  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  27032087 aaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatg 27031994  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  |    
T  27031993 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcgat 27031894  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  27031893 ttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 27031794  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||    
T  27031793 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactctactgggaataa 27031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24870821 - 24870402
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  24870821 tttgacaaagtatagattgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 24870722  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||      ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24870721 acatgagtattgaattgagactgatattgacattg------gaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 24870628  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24870627 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgta 24870528  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
     |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  24870527 atggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 24870428  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  24870427 ttgctggggatagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29508585 - 29508096
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29508585 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 29508488  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  29508487 aaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 29508394  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  29508393 gcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 29508294  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  29508293 tttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 29508195  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  29508194 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccg 29508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 24298798 - 24299285
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24298798 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt---tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcggtttgatttga 24298892  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  |  ||  |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  24298893 aaggtagaaattaaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgag--tt--attgag-ttgagactgatattgacattggaaatg 24298987  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  24298988 caatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 24299087  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  24299088 ttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 24299187  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24299188 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24299285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 29556721 - 29556231
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  29556721 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaatt 29556624  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  29556623 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 29556530  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  29556529 tgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 29556430  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||| |||| |||    
T  29556429 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttgaaga 29556331  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  29556330 tgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 29556231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 33369460 - 33369954
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt------gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttg 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33369460 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttg 33369557  T
Q  95 atttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattg 194  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||    
T  33369558 aattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattg 33369651  T
Q  195 gaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggtt 294  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||    
T  33369652 gaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 33369751  T
Q  295 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttg 386  Q
    |||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||    
T  33369752 ggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttg 33369850  T
Q  387 gagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataac 486  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||     
T  33369851 gagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataat 33369950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 13517228 - 13517720
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13517228 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 13517325  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||| ||| ||||| ||||      ||||    
T  13517326 gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattg------gaaa 13517419  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  13517420 tgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 13517519  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  13517520 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 13517618  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  13517619 tgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccg 13517718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 181 - 495
Target Start/End: Original strand, 27622914 - 27623228
Alignment:
Q  181 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| || ||| ||| |||    
T  27622914 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattg 27623013  T
Q  280 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623014 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 27623112  T
Q  380 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623113 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 27623212  T
Q  480 ggataacgccgttatg 495  Q
    ||||||||||||||||    
T  27623213 ggataacgccgttatg 27623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27201360 - 27200897
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  27201360 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcacc--ggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttga 27201263  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  27201262 aaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 27201169  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  27201168 caatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 27201069  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | ||||||||||||||||||     
T  27201068 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatg 27200970  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27200969 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27200897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Original strand, 27247873 - 27248336
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  27247873 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcacc--ggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttga 27247970  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  27247971 aaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 27248064  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  27248065 caatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 27248164  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | ||||||||||||||||||     
T  27248165 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatg 27248263  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27248264 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27248336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Original strand, 30551054 - 30551506
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  30551054 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttt 30551152  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30551153 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 30551246  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||    
T  30551247 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcaga 30551345  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  30551346 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggca 30551445  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30551446 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 30551506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 58 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20131623 - 20131253
Alignment:
Q  58 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 156  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20131623 acaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgaca 20131524  T
Q  157 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 256  Q
    || ||||||||||||||  ||   ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20131523 taagcattgaattgagacaga---tg---ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcat 20131430  T
Q  257 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 356  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20131429 gattatgcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtg 20131337  T
Q  357 gctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 432  Q
    |||||||||| ||||        | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20131336 gctcgtgctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 20131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 58 - 432
Target Start/End: Original strand, 22201247 - 22201617
Alignment:
Q  58 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 156  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22201247 acaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgaca 22201346  T
Q  157 taggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcat 256  Q
    || ||||||||||||||  ||   ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22201347 taagcattgaattgagacaga---tg---ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcat 22201440  T
Q  257 gattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtg 356  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22201441 gattatgcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtg 22201533  T
Q  357 gctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 432  Q
    |||||||||| ||||        | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22201534 gctcgtgctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 22201617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29580196 - 29579707
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29580196 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatacagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 29580100  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  29580099 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 29580006  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  29580005 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 29579906  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |||||||||| |||||||     
T  29579905 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatg 29579807  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  29579806 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggagaatgccgtt 29579707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27492299 - 27491811
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27492299 gaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 27492203  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||    
T  27492202 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgca 27492109  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  27492108 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatttt 27492009  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||    
T  27492008 gtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgac 27491910  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  || ||||| |||||||||    
T  27491909 gtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgtt 27491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 26792976 - 26792491
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  26792976 ttgaactagtcacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttt---tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattga 26792882  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  26792881 aaggtagaaattgactgatattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 26792788  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26792787 caatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 26792688  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||      
T  26792687 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacg 26792589  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  26792588 acgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 26792491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 4538793 - 4539285
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattgg--tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4538793 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggttt 4538890  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  4538891 gaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 4538984  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  4538985 tgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 4539084  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  4539085 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 4539183  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| ||||    
T  4539184 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccg 4539283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4532454 - 4531967
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4532454 gaactagtaacttgaccgaacaaaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 4532358  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||    
T  4532357 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgca 4532264  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  4532263 atatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatttt 4532164  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |        || | |||||||||||||||||| ||    
T  4532163 gtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgac 4532065  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||||    
T  4532064 gtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccgtt 4531967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Original strand, 26109435 - 26109933
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggttt-gtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26109435 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 26109532  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||  ||||||||||      |||    
T  26109533 gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattga------aaa 26109626  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  26109627 tgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 26109726  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||||||||||||||||    
T  26109727 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaatcctctttggaga 26109825  T
Q  391 taacgccg-ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| |||    
T  26109826 tgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgcc 26109925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27014888 - 27014399
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||    
T  27014888 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcacg--ggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaattg 27014791  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  27014790 aaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 27014697  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  27014696 gcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 27014597  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  27014596 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 27014498  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  27014497 gacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 27014399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28167659 - 28167188
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28167659 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tagggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 28167562  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  28167561 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 28167468  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  28167467 tgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 28167368  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  28167367 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 28167269  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167268 tgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28214633 - 28214138
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattgg--tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  28214633 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgacttggcgtcgatttggttt 28214536  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  28214535 gaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 28214442  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  28214441 tgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 28214342  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  28214341 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 28214243  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| |||||||    
T  28214242 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccg 28214143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 26665672 - 26666163
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26665672 ttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 26665769  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||| ||||||||    
T  26665770 aaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacgttggaaat 26665863  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  26665864 gtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcag 26665963  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  26665964 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagat 26666062  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  26666063 gacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 26666162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 26771643 - 26772134
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26771643 ttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 26771740  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||| ||||||||    
T  26771741 aaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacgttggaaat 26771834  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  26771835 gtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcag 26771934  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  26771935 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagat 26772033  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  26772034 gacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 26772133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 514
Target Start/End: Original strand, 27355170 - 27355631
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  27355170 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 27355269  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27355270 acatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 27355363  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27355364 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgta 27355462  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||    
T  27355463 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaac 27355562  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctgg 514  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| ||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  27355563 ttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgg 27355631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Original strand, 16937077 - 16937532
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 137  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  16937077 tggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggt 16937176  T
Q  138 tttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgc 237  Q
    ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937177 tttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgc 16937270  T
Q  238 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattg 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||     
T  16937271 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatta 16937369  T
Q  338 gagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgaggg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || || |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16937370 gagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggg 16937469  T
Q  430 cagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | | ||| ||    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  16937470 ccggtaggtatgtgacttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 16937532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16681323 - 16680832
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  16681323 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattg 16681226  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  16681225 aaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 16681132  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  16681131 gcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 16681032  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |        || ||||||| |||||||    
T  16681031 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagat 16680933  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||||    
T  16680932 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgt 16680833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27064603 - 27064174
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  27064603 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaactgaaaggcagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctg 27064504  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27064503 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatg 27064410  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||          || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27064409 ca----------tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgta 27064321  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||  | ||    
T  27064320 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgac 27064221  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27064220 ttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 27064174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4780035 - 4779584
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagatttt 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  4780035 ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggtttt 4779937  T
Q  141 gacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatg 240  Q
    |||||||||   |||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4779936 gacagagaacccgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatg 4779843  T
Q  241 ggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggag 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||     
T  4779842 ggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaa 4779744  T
Q  341 tattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 432  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||    
T  4779743 ttttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcag 4779644  T
Q  433 atagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
      || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  4779643 gcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 4779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 14138441 - 14138925
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt------gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttg 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14138441 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttg 14138538  T
Q  95 atttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattg 194  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||  ||||||||||         
T  14138539 aattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattga----- 14138633  T
Q  195 gaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggtt 294  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          || ||| ||||||| |||||||||  |||    
T  14138634 -aaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 14138722  T
Q  295 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttg 386  Q
    |||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||    
T  14138723 ggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttg 14138821  T
Q  387 gagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataac 486  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||     
T  14138822 gagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataat 14138921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Original strand, 8898708 - 8899176
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtt---tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  8898708 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggttttttatttgacaaaatataggttgagattgacttgacatcgatttggtt 8898805  T
Q  98 tgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgg 195  Q
    |||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||    
T  8898806 tgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattgg 8898899  T
Q  196 aaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttg 295  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  8898900 aaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttg 8898999  T
Q  296 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttgg 387  Q
    ||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| |||    
T  8899000 gcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatgg 8899098  T
Q  388 agataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  8899099 agatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 8899176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4764916 - 4764462
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||| |||| ||||||||| |||  ||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||    
T  4764916 ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgaca--ggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaattg 4764819  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||  ||||||||||      ||||    
T  4764818 aaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattga------aaat 4764725  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  4764724 gcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 4764635  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  4764634 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 4764536  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4764535 gacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttg 4764462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34458012
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | ||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagagtcttggaagacctgact 34457997  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  34457998 ggggaaaatgccgtt 34458012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20175666 - 20175368
Alignment:
Q  58 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgac 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  20175666 acaaaatacagattgaaattgacttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtc 20175567  T
Q  156 ataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgca 255  Q
    |||| ||||||||||||      || || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20175566 atagacattgaattgag------atagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgca 20175473  T
Q  256 tgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagt 355  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  20175472 tgattatgcatgtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagt 20175380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Original strand, 22160325 - 22160623
Alignment:
Q  58 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgac 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  22160325 acaaaatacagattgaaattgacttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtc 22160424  T
Q  156 ataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgca 255  Q
    |||| ||||||||||||      || || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22160425 atagacattgaattgag------atagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgca 22160518  T
Q  256 tgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagt 355  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  22160519 tgattatgcatgtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagt 22160611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 34457579 - 34457690
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34457579 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 34457676  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  34457677 aaggtagaaattga 34457690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 27622546 - 27622643
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27622546 ggggattggtttgttttgacaaaatatatattgaaagtgacttgacgtcgatttaatttgaaaagtagaaattgaccaatattattggctcacaagat 27622643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Original strand, 4755757 - 4755824
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4755757 ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaa 4755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 24871109 - 24871073
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24871109 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 24871073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Original strand, 26508660 - 26509154
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508660 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcac--tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 26508757  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||| ||||    
T  26508758 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattgggaatg 26508851  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  26508852 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgcatgactgttggcagt 26508951  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |||||||||||||||||||    
T  26508952 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaatcctctttggagata 26509051  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509052 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 26509151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2161735 - 2161247
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2161735 ttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattggtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 2161638  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  2161637 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 2161544  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||     
T  2161543 caatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcagc 2161444  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||      
T  2161443 tggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacg 2161344  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  2161343 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcag-tagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 2161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5155242 - 5154758
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5155242 gaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt---tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 5155148  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||||     
T  5155147 ggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcg 5155054  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  5155053 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagttt 5154954  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||    
T  5154953 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgac 5154854  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  5154853 gtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 5154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 11417755 - 11418243
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11417755 ttgagctagccacttgaccgaacataaacaaattcaca--ggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 11417851  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  11417852 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 11417945  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  11417946 caatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 11418045  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  11418046 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatg 11418145  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  11418146 acgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 11418243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16048493 - 16048027
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16048493 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tggggattaggtt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaa 16048398  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||| |||   ||   ||| |||||||||||||    
T  16048397 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctaacataagtattgaattgagactga---tg---ttggcattggaaatgca 16048304  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  16048303 atatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcagttt 16048204  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||||     
T  16048203 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataaa 16048104  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16048103 gtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5165543 - 5165059
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165543 gaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt---tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 5165449  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||  | ||| |||||||| ||| ||||||||||      ||||||||    
T  5165448 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtattaaattgagactgatattgacattg------gaaatgca 5165355  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  5165354 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagttt 5165255  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||    
T  5165254 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgac 5165155  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| ||||    
T  5165154 gtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactagggataatgccg 5165059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 16442957 - 16443446
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16442957 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatt--caatggggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttga 16443053  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| | |   ||    ||| ||||||||||    
T  16443054 aaggtagaaattaaccaacgttgttggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactaa---tgc---tgatattggaaatg 16443147  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  16443148 caatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 16443247  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||    
T  16443248 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagata 16443347  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  16443348 acgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgt 16443446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 16511396 - 16511890
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgat 96  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| ||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16511396 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattgttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgat 16511493  T
Q  97 ttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgga 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| ||| ||||      ||||||||    
T  16511494 ttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatattg------acattgga 16511587  T
Q  197 aatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttgg 296  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  16511588 aatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttgg 16511687  T
Q  297 cagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttgga 388  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |        || | |||||||||||||||    
T  16511688 cgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttgga 16511787  T
Q  389 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 488  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||    
T  16511788 gatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgc 16511887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 26662865 - 26663354
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26662865 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 26662961  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  26662962 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 26663055  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26663056 caatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 26663155  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  26663156 ttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 26663254  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  26663255 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 26663354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 26678057 - 26678546
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26678057 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 26678153  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  26678154 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 26678247  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26678248 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 26678347  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  26678348 ttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 26678446  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  26678447 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 26678546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2780408 - 2779919
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  2780408 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 2780311  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  2780310 aaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 2780217  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  2780216 gcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 2780117  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| ||||    
T  2780116 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttgaagat 2780018  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  2780017 gacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 2779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Original strand, 10909952 - 10910390
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  10909952 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 10910051  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| ||| ||||      ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10910052 acatgagtattgagttgagactgatattg------acattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 10910145  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10910146 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgta 10910245  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
     |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  10910246 atggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 10910345  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  10910346 ttgctgaggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 10910390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 31557354 - 31557847
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggttt-gtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  31557354 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaatt 31557451  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  31557452 gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 31557545  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  31557546 tgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 31557645  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||||||||||||||||    
T  31557646 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggaga 31557744  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  31557745 tggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagactttactggggaaaacgcc 31557844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26596839 - 26596349
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26596839 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 26596743  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||| |||||||||||    
T  26596742 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgtcattggaaatg 26596649  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26596648 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 26596549  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  26596548 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 26596450  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  26596449 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgt 26596350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 492
Target Start/End: Original strand, 31083576 - 31084066
Alignment:
Q  2 tgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  31083576 tgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggaggttggtttggttgacaaaatatagattgagattgatttgacatcgatttgaattgaa 31083673  T
Q  102 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgc 201  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   ||| ||||||||||||    
T  31083674 aggtagaaattgactgataacattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtgttgaattgagactga---tg---ttgtcattggaaatgc 31083767  T
Q  202 aacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtt 301  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||||||    
T  31083768 aatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtt 31083867  T
Q  302 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 393  Q
    ||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |    
T  31083868 tgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatga 31083966  T
Q  394 cgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  31083967 cgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 31084066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26442427 - 26441938
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26442427 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattga 26442331  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||| |||   ||   ||| |||||||||||    
T  26442330 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgatatgagtattgaattgagactga---tg---ttgtcattggaaatg 26442237  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26442236 cgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 26442137  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| |||||||     
T  26442136 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatg 26442038  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  26442037 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 26441938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22149051 - 22148563
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22149051 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattga 22148955  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| |||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||  |     |||||||||||||||    
T  22148954 aaggcagaaatcgaccgatattatcggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgt-----ttgacattggaaatg 22148860  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  22148859 cgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 22148760  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  22148759 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 22148661  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22148660 acgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26519990 - 26519501
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  26519990 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttga 26519894  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || |||||| || |||   ||   |||||||||||| ||    
T  26519893 aaggtagaaactgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactga---tg---ttgacattggaactg 26519800  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  26519799 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 26519700  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  26519699 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 26519601  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26519600 acgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 31131077 - 31130616
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31131077 gaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaa 31130981  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||| || |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| ||||   ||   |||||||||||     
T  31130980 ggtaaaatttgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattg---tt---attggaaatgcg 31130887  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  31130886 atatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagttt 31130787  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||    
T  31130786 gtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgac 31130688  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
    | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31130687 gtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 31130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4206558 - 4206069
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 101  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  4206558 gaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaa 4206461  T
Q  102 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgc 201  Q
    ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| |||||||||||    
T  4206460 aggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatgc 4206367  T
Q  202 aacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtt 301  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||    
T  4206366 aatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattt 4206267  T
Q  302 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 393  Q
    ||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |    
T  4206266 tgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatga 4206168  T
Q  394 cgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  4206167 cgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 4206069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 45394365 - 45393913
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagatt 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  45394365 tggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggtt 45394266  T
Q  139 ttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgca 238  Q
    ||||||||  |  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45394265 ttgacaga--acctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgca 45394174  T
Q  239 tgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgg 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |    
T  45394173 tgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcag 45394075  T
Q  339 agtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggc 430  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |        || | | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45394074 aatattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggc 45393975  T
Q  431 agatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  45393974 aggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 45393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11448072 - 11447582
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11448072 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 11447976  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  11447975 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgtcatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 11447882  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| |||||||||  |||||||     
T  11447881 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcat 11447782  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  11447781 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 11447683  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  11447682 gacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 11447583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45738469 - 45737995
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttga 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45738469 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttga 45738372  T
Q  96 tttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgg 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||    
T  45738371 attgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattgg 45738278  T
Q  196 aaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttg 295  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  45738277 aaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttg 45738178  T
Q  296 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttgg 387  Q
    ||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||    
T  45738177 gcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgg 45738079  T
Q  388 agataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45738078 agatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctggggatagaatcttgggagac 45737995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 24585487 - 24585978
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24585487 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 24585584  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||      | ||| ||||| ||||||||||    
T  24585585 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgag------actgatattgatattggaaatg 24585678  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||    
T  24585679 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagt 24585778  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    |||||| |||   ||  | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  24585779 ttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 24585877  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||    
T  24585878 gacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgt 24585977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 26312816 - 26313306
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26312816 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 26312912  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||| ||||||||||    
T  26312913 aaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatg 26313006  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |    
T  26313007 caatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcatt 26313106  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  26313107 ttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 26313205  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||    
T  26313206 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgt 26313305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 5140287 - 5140744
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5140287 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgatttgacgtcgatttgatttga 5140384  T
Q  101 aaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  5140385 aaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 5140478  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  5140479 tgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 5140578  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||    
T  5140579 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggaga 5140677  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 457  Q
    | ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||    
T  5140678 tgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 186 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848299
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 10848493  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 377  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        | ||||    
T  10848492 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaa 10848393  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10848392 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 10848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744962
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16744947  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  16744948 ggggaaaatgccgtt 16744962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138687
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 4138672  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| |||||||||    
T  4138673 ggggaaaacgccgtt 4138687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 186 - 471
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206585
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3452243 - 3451926
Alignment:
Q  181 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3452243 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3452144  T
Q  280 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |          
T  3452143 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 3452045  T
Q  374 --gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3452044 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 3451945  T
Q  472 ccgactggggataacgccg 490  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  3451944 tctactgggaataatgccg 3451926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 492
Target Start/End: Original strand, 26268202 - 26268527
Alignment:
Q  174 ttgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatgg 272  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| ||||||     
T  26268202 ttgaatttgacatttgtattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatga 26268301  T
Q  273 atgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcat 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  26268302 atgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattac 26268400  T
Q  373 a--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatctt 464  Q
    |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| | | ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  26268401 acattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaccta-ggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatctt 26268499  T
Q  465 ggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||    
T  26268500 ggaagactttactggggaaaacgccgtt 26268527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 16744529 - 16744640
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16744529 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 16744626  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  16744627 aaggtagaaattga 16744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 4138254 - 4138365
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4138254 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tagggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttga 4138351  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  4138352 aaggtagaaattga 4138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 39206173 - 39206284
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39206173 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tgggggttagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 39206270  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  39206271 aaggtagaaattga 39206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 325 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152790
Alignment:
Q  325 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  417 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22152790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 325 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208705
Alignment:
Q  325 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  417 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 16442899 - 16442936
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16442899 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 16442936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 26508602 - 26508639
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26508602 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 26508639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 10848806 - 10848769
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10848806 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 10848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 5165827 - 5165791
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5165827 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 5165791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 40 - 491
Target Start/End: Original strand, 24585476 - 24585929
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24585476 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaaatgaccaatattattggctcacaaggttt 24585575  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585576 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcat 24585669  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585670 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 24585769  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24585770 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggca 24585869  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| |||||    
T  24585870 gatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccgt 24585929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 15235014 - 15234526
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15235014 ttgaacaaaccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tggggattagttt--ttgacaaaatgtagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttga 15234919  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    ||| ||||||||||    
T  15234918 aaggcagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacatgacatgagtattgaattgagactga---tgc---tgatattggaaatg 15234825  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| || |||||     
T  15234824 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgtgggcagc 15234725  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||    
T  15234724 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagata 15234625  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  15234624 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgt 15234526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 54840585 - 54840097
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  54840585 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttt--ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcaattcgatttga 54840490  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  54840489 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 54840396  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  54840395 caatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 54840296  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  54840295 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 54840197  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54840196 acgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 54840097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 14672189 - 14671717
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14672189 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattgttttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 14672092  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| ||| ||||||||||      ||||    
T  14672091 gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatattgacattg------gaaa 14671998  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||     
T  14671997 tgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcg 14671898  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  14671897 atttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggaga 14671798  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14671797 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5701725 - 5701256
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5701725 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 5701628  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  5701627 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 5701534  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  5701533 caatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 5701434  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  5701433 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 5701335  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701334 acgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 5701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Original strand, 31119617 - 31120069
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  31119617 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttt 31119715  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31119716 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 31119809  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  31119810 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 31119908  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  31119909 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggca 31120008  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31120009 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 31120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 40098702 - 40099192
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40098702 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 40098799  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| ||||||||||    
T  40098800 aaggtagaaattgaccgatattattggctcataaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatg 40098893  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| | |    
T  40098894 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtatt 40098993  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  40098994 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 40099092  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  40099093 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 40099192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 36323407 - 36323894
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36323407 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tagggattagttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 36323503  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  36323504 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 36323597  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  36323598 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 36323697  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| ||||||||     
T  36323698 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatg 36323796  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36323797 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 36337616 - 36338103
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36337616 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tagggattagttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 36337712  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  36337713 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 36337806  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  36337807 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 36337906  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| ||||||||     
T  36337907 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatg 36338005  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36338006 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 14752584 - 14753073
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14752584 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 14752681  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| |||||||||    
T  14752682 aaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaaat 14752775  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  14752776 gcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 14752875  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  14752876 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagat 14752974  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14752975 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 14753073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17020215 - 17019737
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17020215 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 17020118  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||  ||||||                   
T  17020117 aaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgaca--------------- 17020033  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
      ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  17020032 --acatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 17019935  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  17019934 ttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 17019835  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  17019834 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 17019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14105739 - 14105250
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14105739 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 14105643  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  14105642 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 14105549  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  || |||| |    
T  14105548 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcatt 14105449  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| |||||||     
T  14105448 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatg 14105350  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  14105349 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 14105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21976862 - 21976410
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  21976862 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttt 21976764  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21976763 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 21976670  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||    
T  21976669 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcaga 21976571  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  21976570 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggca 21976471  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21976470 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 21976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24119839 - 24119349
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24119839 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-attcactggggattggtttgtttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttga 24119741  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  24119740 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 24119647  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  24119646 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 24119547  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaaatcctctttggagat 391  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |          |||||||||||||||||    
T  24119546 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaaatcctctttggagat 24119448  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24119447 gacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 39857811 - 39857342
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39857811 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 39857714  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  39857713 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 39857620  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |    
T  39857619 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcatt 39857520  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| |||||||     
T  39857519 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatg 39857421  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857420 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 465
Target Start/End: Original strand, 18793747 - 18794175
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtt--tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 137  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  18793747 tggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggt 18793846  T
Q  138 tttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgc 237  Q
    ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18793847 tttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgc 18793940  T
Q  238 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattg 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||     
T  18793941 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatta 18794039  T
Q  338 gagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgaggg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18794040 gagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggg 18794139  T
Q  430 cagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
    | | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  18794140 ccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 18794175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 125 - 471
Target Start/End: Original strand, 15275816 - 15276164
Alignment:
Q  125 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacag 224  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||    
T  15275816 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattg------acattggaaatgcaacatgtataggtggtataatag 15275909  T
Q  225 tttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagac 324  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275910 ttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagac 15276009  T
Q  325 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  15276010 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaa 15276109  T
Q  417 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15276110 ccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 15276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6577038 - 6576544
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttga 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||     ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6577038 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttttttgaccaaatatggattgagattgacttgacgtcgatttga 6576941  T
Q  96 tttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgg 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||    
T  6576940 attgaaaggcagaaattgaccgatactaatggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattgg 6576847  T
Q  196 aaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttg 295  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  6576846 aaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttg 6576747  T
Q  296 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc-tttg 386  Q
    ||||||||||| |||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| ||||    
T  6576746 gcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctcttttg 6576648  T
Q  387 gagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataac 486  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||     
T  6576647 gagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccactggggataat 6576548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 33666870 - 33667360
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33666870 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 33666966  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  33666967 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 33667060  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  33667061 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 33667160  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  33667161 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 33667259  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  33667260 gacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 33667359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 125 - 471
Target Start/End: Original strand, 15379428 - 15379776
Alignment:
Q  125 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacag 224  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||      |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  15379428 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtattgaatcgagactataattg------acattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatag 15379521  T
Q  225 tttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagac 324  Q
    ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15379522 ttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagac 15379621  T
Q  325 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  15379622 agacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcggga 15379721  T
Q  417 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379722 ccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15379776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30760960 - 30760470
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30760960 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 30760864  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  30760863 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 30760770  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  30760769 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 30760670  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||| |||||||||    
T  30760669 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttggagat 30760571  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  30760570 gacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 30760471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 5013039 - 5012593
Alignment:
Q  42 gggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttg 141  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  5013039 gggattggtttgtt-gaccaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttaaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttg 5012941  T
Q  142 acagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttca-ttaaatgcatg 240  Q
    |||||| |  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5012940 acagaggacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatg 5012847  T
Q  241 ggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggag 340  Q
    || || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||    
T  5012846 ggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagag 5012748  T
Q  341 tatt-gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    | || |||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  5012747 tgttggggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggca 5012648  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataac 486  Q
    | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5012647 ggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacccgactggggataac 5012593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 34182027 - 34182515
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattgg---tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |   || ||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34182027 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggt--tcactggggattggttttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatt 34182124  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||  |     ||||||||||||    
T  34182125 tgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgt-----ttgacattggaa 34182219  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    ||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  34182220 at-----atgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 34182314  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
    | || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||    
T  34182315 aattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggag 34182413  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| |||    
T  34182414 atgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgcc 34182513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 27156572 - 27156885
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27156572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27156671  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27156672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27156770  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27156771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27156870  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  27156871 ggggaaaatgccgtt 27156885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 245 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 1907229 - 1906975
Alignment:
Q  245 cataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 344  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907229 cataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 1907130  T
Q  345 gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 436  Q
    |||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  1907129 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtag 1907030  T
Q  437 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  1907029 ctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 1906975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 366
Target Start/End: Original strand, 24814421 - 24814726
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||  ||    
T  24814421 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctgacaaggttttaacagggaacctg 24814520  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||||| |||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24814521 acatgagtattgaatggagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 24814614  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24814615 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgta 24814713  T
Q  354 gtggctcgtgcta 366  Q
    |||||||||||||    
T  24814714 gtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331994
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 20331979  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  20331980 ggggaaaatgccgtt 20331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1907420 - 1907236
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907420 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tagggattagttt-tttgacaaaatatagattcaaattgacttgacgtcgatttgatttga 1907324  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattg 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1907323 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctgacataagtattgaattgagattgatgttgacattg 1907236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 20331561 - 20331672
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20331561 ttgaactagccacttaaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 20331658  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  20331659 aaggtagaaattga 20331672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 24813637 - 24813822
Alignment:
Q  181 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  24813637 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 24813736  T
Q  280 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813737 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 15379315 - 15379395
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15379315 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacacatt--cattggggattagttt--ttgacaaaatataaattgaaattgacttgac 15379395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15275703 - 15275781
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttg 83  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15275703 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcac--tggggattagttt--ttgacaaaatataaattgaaattgacttg 15275781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15235072 - 15235035
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15235072 ttgaactagccacttgaccgaacagaaatagatagaca 15235035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 15275645 - 15275682
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15275645 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 15275682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 15379257 - 15379294
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15379257 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 15379294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17020510 - 17020473
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17020510 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 17020473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 14672426 - 14672390
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14672426 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 14672390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 22895601 - 22895118
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22895601 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagattcac--tggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 22895504  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    ||| |||||||||    
T  22895503 aaaggtagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tgc---tgatattggaaat 22895410  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  22895409 gcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcag 22895310  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  22895309 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagat 22895210  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggat 483  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22895209 aacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggggat 22895118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 23899068 - 23898578
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23899068 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 23898972  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||  ||||||||||      |||||    
T  23898971 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattga------aaatg 23898878  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || | | ||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  23898877 caatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagt 23898778  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||    
T  23898777 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagata 23898678  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  23898677 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgt 23898578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33784656 - 33784166
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  33784656 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 33784559  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  33784558 aaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 33784465  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  33784464 gcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 33784365  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  33784364 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatcctctttggagat 33784265  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| |||||||||||||| ||| |||   | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  33784264 gacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 33784166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23727412 - 23726921
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| |||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23727412 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 23727315  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  23727314 gaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaa 23727221  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  || ||||    
T  23727220 tgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggca 23727121  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  23727120 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 23727021  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  23727020 tgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 23726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25207481 - 25206998
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207481 ttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tagggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 25207385  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    ||| ||||||||||    
T  25207384 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tgc---tgatattggaaatg 25207291  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25207290 caatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 25207191  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||||||||||||    
T  25207190 ttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctctttggagata 25207091  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  25207090 acgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgaggataa 25206998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25271637 - 25271154
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25271637 ttgaaccagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tagggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 25271541  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    ||| ||||||||||    
T  25271540 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tgc---tgatattggaaatg 25271447  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25271446 caatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 25271347  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||||||||||||    
T  25271346 ttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctctttggagata 25271247  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  25271246 acgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgaggataa 25271154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11556525 - 11556043
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11556525 ttgaactagccacctgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaata--ggttgagattgacttgacgtcgatttgatttga 11556430  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  11556429 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 11556336  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  11556335 caatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 11556236  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  11556235 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatg 11556136  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||    
T  11556135 acgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataa 11556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24977016 - 24976528
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24977016 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattgtttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 24976920  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  24976919 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 24976826  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  24976825 caacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 24976726  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  24976725 ttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 24976626  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24976625 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24976528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 23633105 - 23632659
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagatttt 140  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  23633105 ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggtttt 23633006  T
Q  141 gacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatg 240  Q
    |||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23633005 gacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatg 23632912  T
Q  241 ggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggag 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  23632911 ggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggag 23632812  T
Q  341 tattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 432  Q
    | |||||||||  ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23632811 tgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcag 23632712  T
Q  433 atagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  23632711 atagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataa 23632659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 28952765 - 28953254
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28952765 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 28952861  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  28952862 aagatagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 28952955  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28952956 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 28953055  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       |||||||||||||||||     
T  28953056 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaatcctctttggagatg 28953154  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  28953155 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggacagaatctcggaagactttactggggaaaacgccgtt 28953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6881483 - 6880995
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6881483 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttgacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 6881386  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||||     
T  6881385 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcg 6881292  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6881291 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagttt 6881192  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||    
T  6881191 gtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgac 6881093  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  6881092 gtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccgtt 6880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 65 - 485
Target Start/End: Original strand, 22992171 - 22992593
Alignment:
Q  65 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcatt 164  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||    
T  22992171 ataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatt 22992270  T
Q  165 gaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgc 264  Q
    ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22992271 gaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgt 22992364  T
Q  265 gtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc 364  Q
     || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992365 atgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc 22992464  T
Q  365 taca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggat 456  Q
    || |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  22992465 tatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggat 22992564  T
Q  457 agaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||||||| || |||| | |||||| ||||    
T  22992565 agaatctcgggagactctactgggaataa 22992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 32589244 - 32589734
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32589244 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 32589341  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    || |||||| || |||   ||   |||||||||||||||    
T  32589342 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatatcgaattgggactga---tg---ttgacattggaaatg 32589435  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32589436 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgatcgttggcagt 32589535  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| |||     
T  32589536 ttgtaggcacgacttcgc-gggaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatg 32589634  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  32589635 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgtt 32589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 457
Target Start/End: Original strand, 13179836 - 13180241
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  13179836 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctg 13179935  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13179936 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatg 13180029  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13180030 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgta 13180129  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  13180130 gtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaac 13180229  T
Q  446 ttgctggggata 457  Q
    | ||||||||||    
T  13180230 tcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24609418 - 24608929
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24609418 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattgttttttttgaaaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 24609321  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |     ||  ||||||||||||||||    
T  24609320 aaggtagaaattgacctatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagact-----tgt-attgacattggaaatg 24609227  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |    
T  24609226 caatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgat 24609127  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  24609126 ttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 24609027  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24609026 acgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24608929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Original strand, 15751865 - 15752317
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  15751865 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt 15751963  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15751964 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 15752057  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||    
T  15752058 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattaga 15752156  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15752157 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggca 15752256  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752257 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 15752317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33299658 - 33299220
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  33299658 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 33299559  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| |||   ||   ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33299558 acatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatg 33299465  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299464 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 33299365  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||||  ||||    
T  33299364 gtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaac 33299265  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||||||||||| | || |||| | |||||| |||| ||||    
T  33299264 ttgctggggatagaatatcgggagactctactgggaataatgccg 33299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 18121401 - 18121886
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18121401 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcac--tggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttg 18121498  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||   ||   ||| ||||||||||    
T  18121499 aaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagcattgaattgagactga---tg---ttgccattggaaat 18121592  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  18121593 gcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 18121692  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggaga 390  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||||||||||||||||    
T  18121693 tttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcctctttggaga 18121791  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    | ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||    
T  18121792 tgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataa 18121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2518236 - 2517749
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2518236 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatt-ga 2518140  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  2518139 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 2518046  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  2518045 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 2517946  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  2517945 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 2517847  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  2517846 acgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg 2517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 492
Target Start/End: Original strand, 31819393 - 31819880
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31819393 gaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacctgacgtcgatttgatttgaaa 31819489  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || |||||| || |||   ||   ||||||||||||||||     
T  31819490 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactga---tg---ttgacattggaaatgcg 31819583  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  31819584 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatttt 31819683  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||    
T  31819684 gtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgac 31819782  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31819783 gtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 31819880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 9543695 - 9544185
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9543695 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 9543792  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  9543793 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 9543886  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  9543887 tgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 9543986  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  9543987 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 9544085  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  9544086 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 9544185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33523538 - 33523086
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  33523538 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttt 33523440  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33523439 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 33523346  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  33523345 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 33523247  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  33523246 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggca 33523147  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33523146 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 33523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 43085404 - 43084956
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtt--tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 137  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  43085404 tggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggt 43085305  T
Q  138 tttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgc 237  Q
    ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43085304 tttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgc 43085211  T
Q  238 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattg 337  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||     
T  43085210 atgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatta 43085112  T
Q  338 gagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 436  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||    
T  43085111 gagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattcttggaaatcctctctggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtag 43085012  T
Q  437 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
     ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  43085011 gtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 43084956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30036580 - 30036128
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  30036580 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttt 30036482  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30036481 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 30036388  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  30036387 gggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 30036289  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30036288 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggca 30036189  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30036188 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 30036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33882300 - 33881808
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33882300 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 33882203  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||| ||| ||||| ||||      ||||    
T  33882202 gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattg------gaaa 33882109  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  33882108 tgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 33882009  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  33882008 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 33881910  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  33881909 tgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccg 33881810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34623690 - 34623201
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34623690 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 34623594  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  34623593 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgggtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 34623500  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  34623499 caatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 34623400  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  34623399 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 34623301  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  34623300 acgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 34623201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37762165 - 37761676
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37762165 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 37762069  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  37762068 aaggtagaaattgaccgataatattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 37761975  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  37761974 caatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 37761875  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| ||||     
T  37761874 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatg 37761776  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  37761775 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 37761676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Original strand, 8658463 - 8658931
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8658463 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 8658559  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  8658560 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 8658653  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  8658654 caatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 8658753  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  8658754 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 8658852  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658853 acgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 30941752 - 30941314
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  30941752 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 30941653  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| ||   |||   |||| |||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30941652 acatgagtattgagttgagactg---ttg---ttgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 30941559  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  30941558 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacaca 30941459  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  30941458 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 30941359  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  30941358 ttgctgaggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 30941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 18493737 - 18494227
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18493737 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 18493834  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||   || ||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  18493835 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgatagagaacccgatatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 18493928  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  18493929 caatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 18494028  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | ||||||||||||||||||     
T  18494029 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatg 18494127  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||    
T  18494128 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctaccggggaaaacgccgtt 18494227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 490
Target Start/End: Original strand, 15651766 - 15652218
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagatt 138  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  15651766 tggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtt 15651865  T
Q  139 ttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgca 238  Q
    |||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651866 ttgacagagaacctgacatgagtgttgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgca 15651959  T
Q  239 tgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgg 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |    
T  15651960 tgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattag 15652058  T
Q  339 agtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggc 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15652059 agtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggc 15652158  T
Q  431 agatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  15652159 aggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 15652218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30159174 - 30158722
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  30159174 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt 30159076  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    |||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30159075 tgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 30158982  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||    
T  30158981 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattaga 30158883  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |    
T  30158882 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggata 30158783  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  30158782 ggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttgactggggaaaatgccgtt 30158722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3796726 - 3796235
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3796726 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttattctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttg 3796629  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  3796628 aaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagtttcgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 3796535  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  3796534 gcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 3796435  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  3796434 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 3796336  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  3796335 gacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 3796236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 31438628 - 31438141
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  31438628 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattga 31438532  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  31438531 aaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 31438438  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  31438437 cagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 31438338  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  31438337 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 31438239  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  31438238 acgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 31438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Original strand, 37745317 - 37745781
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttg-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  37745317 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgctttgacagaatagagattgagattgacttgacgtcgacttgaattg 37745414  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||  ||   ||   ||||||||||||||    
T  37745415 aaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagaccga---tg---ttgacattggaaat 37745508  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  37745509 gtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 37745608  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||||||||||||||||    
T  37745609 tttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagat 37745707  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  37745708 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatcttg 37745781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 37351631 - 37352123
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggatt--ggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  37351631 ttgaactagccacttgaccaaacagaaac--atattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggttt 37351728  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| ||||||||    
T  37351729 gaaaggtagaaattgattgatattattggctcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaaa 37351822  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  37351823 tgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 37351922  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  37351923 tttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 37352021  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| ||||    
T  37352022 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccg 37352121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 492
Target Start/End: Original strand, 13435635 - 13436128
Alignment:
Q  2 tgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtt----tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||  ||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13435635 tgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcac--tggggattggtttgttcttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaat 13435732  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||    
T  13435733 tgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaa 13435826  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  13435827 atgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 13435926  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
    | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||    
T  13435927 attttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggag 13436025  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||    
T  13436026 atgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgcc 13436125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28656440 - 28655947
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28656440 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttg 28656343  T
Q  100 aaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    |||||||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||    
T  28656342 aaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaa 28656249  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  28656248 atgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 28656149  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggag 389  Q
    | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||| |||||||||    
T  28656148 attttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcttctttggag 28656050  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||    
T  28656049 atgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgcaccttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgcc 28655950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 18368496 - 18368989
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18368496 ttgaactagccacttgtccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaat 18368593  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||    
T  18368594 tgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaa 18368687  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  18368688 atgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 18368787  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggag 389  Q
    | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || || |||| |||||    
T  18368788 attttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggag 18368886  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||| ||||||    
T  18368887 atgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagccttgagagactccactggggaaaacgcc 18368986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26487565 - 26487075
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26487565 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 26487469  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||| ||||||||||    
T  26487468 aaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatg 26487375  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |    
T  26487374 caatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcatt 26487275  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  26487274 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 26487176  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||    
T  26487175 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgt 26487076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 37664474 - 37664961
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  37664474 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattga 37664570  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  37664571 aaggtagagattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactga---tg---ttgacattggaaatg 37664664  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
      | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37664665 tgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 37664764  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  37664765 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 37664863  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| |||||||    
T  37664864 acgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggaaaacgccg 37664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9324655 - 9324165
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9324655 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggagattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 9324559  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||| ||||||||||    
T  9324558 aaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatg 9324465  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |    
T  9324464 caatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcatt 9324365  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  9324364 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 9324266  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||    
T  9324265 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgt 9324166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 24731142 - 24730653
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||    
T  24731142 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattaagattgacttaacgttgattcgatttg 24731045  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| ||||   ||   |||||||||    
T  24731044 aaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattg---tt---attggaaat 24730951  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  24730950 gcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 24730851  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  24730850 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 24730752  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  24730751 gacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 24730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30175659 - 30175170
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30175659 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 30175563  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||      | ||| ||||| ||||||||||    
T  30175562 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgag------actgatattgatattggaaatg 30175469  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  30175468 cgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 30175369  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||| |||||||||||     
T  30175368 ttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcttctttggagatg 30175270  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  30175269 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 30175170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12139353 - 12138864
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12139353 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 12139257  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||| ||||||||||    
T  12139256 aaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatg 12139163  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |    
T  12139162 caatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcatt 12139063  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  12139062 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 12138964  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  12138963 acgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 12138864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41681876 - 41681408
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41681876 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaa-attcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 41681778  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||  |||||||||     
T  41681777 aaggcagacattgaccgatattattggctcacaaggtttggacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga---tg---ttggtattggaaata 41681684  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    |||||| |||  || || ||||||  |||||||||    
T  41681683 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgatta----tgcatgtatgaatgtaacgcatgactgttggcagt 41681588  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||| |||   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||      | ||||||||||||||||    
T  41681587 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcctctttggaga 41681489  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681488 tgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 41681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 492
Target Start/End: Original strand, 13317797 - 13318285
Alignment:
Q  2 tgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  13317797 tgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaa 13317893  T
Q  102 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgc 201  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||  |  ||||| ||||| ||| ||||   ||   |||||||||||    
T  13317894 aggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggtttcgacagagaacctgacatgagttttgaactgagactgatattg---tt---attggaaatgc 13317987  T
Q  202 aacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtt 301  Q
     | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  13317988 gatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattt 13318087  T
Q  302 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 393  Q
    ||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |    
T  13318088 tgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatga 13318186  T
Q  394 cgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    || |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  13318187 cgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 13318285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40467008
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 40466993  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  40466994 ggggaaaatgccgtt 40467008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644502
Alignment:
Q  185 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 284  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  285 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 376  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5644716 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5644618  T
Q  377 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 476  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||  || |||||||||  || | | ||    
T  5644617 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgtagacagaatcttgagaggctccac 5644518  T
Q  477 tggggataacgccgtt 492  Q
    |||||| |||||||||    
T  5644517 tggggaaaacgccgtt 5644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330336
Alignment:
Q  190 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 289  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  290 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 381  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |        || | ||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  382 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 481  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagacctgactgggg 11330347  T
Q  482 ataacgccgtt 492  Q
    | || ||||||    
T  11330346 aaaatgccgtt 11330336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Original strand, 13178639 - 13178824
Alignment:
Q  181 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  13178639 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 13178738  T
Q  280 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178739 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 40466575 - 40466686
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40466575 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 40466672  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  40466673 aaggtagaaattga 40466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5644932 - 5644815
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5644932 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgct-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 5644836  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatat 121  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  5644835 aaggtagaaattgaccgatat 5644815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11330765 - 11330640
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  11330765 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgatttgaattg 11330668  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattgg 127  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11330667 aaaggcagaaattgaccgatatcattgg 11330640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22895659 - 22895622
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22895659 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 22895622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 23899126 - 23899089
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23899126 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 23899089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 22991875 - 22991911
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22991875 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 22991911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 23727707 - 23727671
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23727707 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 23727671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 24609655 - 24609619
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24609655 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 24609619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 30942041 - 30942005
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30942041 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 30942005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 34267979 - 34268463
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||  ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34267979 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcaca--gggtattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 34268076  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  34268077 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 34268170  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  34268171 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 34268270  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||||    
T  34268271 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaatcctctttggagata 34268370  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  34268371 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggggataa 34268463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 54 - 491
Target Start/End: Original strand, 21696296 - 21696735
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21696296 tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctg 21696395  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| |||   ||    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21696396 acatgagtattgatttgagactga---tgc---tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatg 21696489  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696490 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 21696589  T
Q  354 gtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    |||||||||||     ||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  21696590 gtggctcgtgcaatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 21696689  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  21696690 ttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 21696735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23117947 - 23117471
Alignment:
Q  13 cttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 112  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117947 cttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 23117851  T
Q  113 gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatgg 212  Q
    |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||     
T  23117850 gaccgatattattggctcccaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatga 23117757  T
Q  213 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||| ||  |||||||||||||    
T  23117756 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcgatttgtagacacag 23117657  T
Q  313 tttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttggga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23117656 tttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttggga 23117557  T
Q  405 gacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  23117556 ggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 23117471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 37678956 - 37679445
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37678956 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 37679052  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  37679053 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 37679146  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37679147 caatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 37679246  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| |||||||     
T  37679247 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatg 37679345  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  37679346 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 37679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 37694221 - 37694710
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37694221 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 37694317  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  37694318 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 37694411  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  37694412 caatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 37694511  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| |||||||     
T  37694512 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatg 37694610  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  37694611 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 37694710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 54 - 471
Target Start/End: Original strand, 27427580 - 27428000
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  27427580 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 27427679  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27427680 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatg 27427773  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27427774 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgta 27427873  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaat-caa 444  Q
     |||||||||||| |        || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  27427874 atggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaa 27427973  T
Q  445 cttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27427974 cttgctggggacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28889416 - 28888929
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28889416 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattgtttt--ttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttga 28889321  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | ||||||||||||||||   ||   || ||||||||||||    
T  28889320 aaggtagaaactgaccaaaattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagattga---tg---ttaacattggaaatg 28889227  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |    
T  28889226 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcgat 28889127  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  28889126 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 28889027  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  28889026 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 28888929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3789591 - 3789138
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagatttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  3789591 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtttt 3789492  T
Q  141 gacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcatta-aatgcat 239  Q
    |||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  3789491 gacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcat 3789398  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  3789397 gggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 3789299  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3789298 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggca 3789199  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3789198 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 3789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 492
Target Start/End: Original strand, 13929669 - 13930158
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 101  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  13929669 gaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaa 13929766  T
Q  102 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgc 201  Q
    ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||||||    
T  13929767 aggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgc 13929860  T
Q  202 aacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtt 301  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  13929861 aatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattt 13929960  T
Q  302 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataa 393  Q
    ||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| |    
T  13929961 tgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatga 13930059  T
Q  394 cgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  13930060 cgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgtt 13930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37932559 - 37932072
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37932559 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttt---tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 37932465  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| ||||||||||    
T  37932464 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatg 37932371  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  37932370 caatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 37932271  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  37932270 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 37932172  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37932171 acgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 37932072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 21670231 - 21670720
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21670231 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 21670327  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  21670328 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactga---tg---ttgacattggaaatg 21670421  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  21670422 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 21670521  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  21670522 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 21670620  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21670621 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaacgccgtt 21670720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 492
Target Start/End: Original strand, 19409543 - 19410031
Alignment:
Q  2 tgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  19409543 tgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgttgatttgaattgaa 19409639  T
Q  102 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgc 201  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||||    
T  19409640 aggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgc 19409733  T
Q  202 aacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtt 301  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  19409734 aatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattt 19409833  T
Q  302 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 393  Q
    ||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| ||| |    
T  19409834 tgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatga 19409932  T
Q  394 cgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19409933 cgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccactggggaaaacgccgtt 19410031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 253709 - 254199
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  253709 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 253806  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  253807 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 253900  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  253901 cgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 254000  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  254001 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 254099  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  254100 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 254199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39897253 - 39896764
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39897253 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 39897157  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  39897156 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 39897063  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  ||||||| |    
T  39897062 caatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcatt 39896963  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| | |   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  39896962 ttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 39896864  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  39896863 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 39896764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 125 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27397399 - 27397031
Alignment:
Q  125 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacag 224  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27397399 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattg------gaaatgcaacatgtatggatggtataacag 27397306  T
Q  225 tttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagac 324  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27397305 ttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagac 27397206  T
Q  325 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27397205 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaa 27397106  T
Q  417 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  27397105 ccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataatgccgt 27397031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Original strand, 16822433 - 16822885
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  16822433 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttt 16822531  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16822532 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 16822625  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  16822626 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 16822724  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  16822725 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggca 16822824  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16822825 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 16822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16899047 - 16898595
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  16899047 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttt 16898949  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16898948 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 16898855  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  16898854 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 16898756  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  16898755 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggca 16898656  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16898655 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 16898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Original strand, 31867921 - 31868354
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  31867921 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggaagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 31868020  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31868021 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat-----atgcatggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatg 31868109  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868110 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 31868209  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||| ||   |||    
T  31868210 gtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaaac 31868309  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31868310 ttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 34298297 - 34297856
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  34298297 tggggattggtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactattggctcacaaggttt 34298198  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||   ||   | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34298197 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattga---tg---tcgacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcat 34298104  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||    
T  34298103 gggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattaga 34298005  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34298004 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggca 34297905  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 480  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  34297904 ggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 34297856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32056899 - 32056447
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  32056899 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttt 32056801  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32056800 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 32056707  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  32056706 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 32056608  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  32056607 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggca 32056508  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32056507 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 32056447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20845028 - 20844590
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  20845028 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 20844929  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
     |||  | ||||| |||||| ||| ||||||||||      ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20844928 tcatgagtattgagttgagactgatattgacattg------gaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatg 20844835  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20844834 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgta 20844735  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
     |||||||||||| |        || | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  20844734 atggctcgtgctatattacacattcctggaaatcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 20844635  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  20844634 ttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 20844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37384840 - 37384371
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37384840 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattgatttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 37384743  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || | ||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  37384742 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcggattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 37384649  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  37384648 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 37384549  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| |||||||     
T  37384548 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatg 37384450  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37384449 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 37384371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 12662604 - 12662165
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  12662604 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 12662505  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||    ||||| |||||| ||   |||   |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12662504 acatgaatattgagttgagactg---ttg---ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatg 12662411  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  12662410 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgca 12662311  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  12662310 gtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaac 12662211  T
Q  446 ttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  12662210 ttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 12662165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31883455 - 31882987
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31883455 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgatttgacgtcgatttgaattga 31883359  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||      | ||| ||||||||||||||||    
T  31883358 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgag------actgatattgacattggaaatg 31883265  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  31883264 caatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 31883165  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  31883164 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 31883066  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883065 acgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 31882987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34868819 - 34868329
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34868819 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgttgg-caaaaagtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 34868723  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  34868722 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 34868629  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  34868628 caatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 34868529  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  34868528 tttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 34868430  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  34868429 gacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 34868330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27123686 - 27123216
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27123686 ttgaactagccacttgactaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 27123589  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  27123588 aaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 27123495  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  27123494 gcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 27123395  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  27123394 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 27123296  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
     ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123295 gacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34162027 - 34161536
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  34162027 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttg 34161930  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||| ||||||||||    
T  34161929 aaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgtcattggaaat 34161836  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  34161835 gcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcag 34161736  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||||||||||||||||    
T  34161735 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagat 34161637  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| ||||||||    
T  34161636 gacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgt 34161537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 37944922 - 37945412
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37944922 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgactcgacgtcgatttgaattga 37945019  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || ||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||| |    
T  37945020 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaacg 37945113  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||   ||||||||    
T  37945114 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgactattggcagt 37945213  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  37945214 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 37945312  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  37945313 acgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 37945412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 22921202 - 22921691
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921202 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 22921298  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |  |  || |||  |  ||||||||||      | ||| ||||||||||||||||    
T  22921299 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaatgacctgtcatgagttttgaattgag------actgatattgacattggaaatg 22921392  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  22921393 caatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 22921492  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  22921493 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 22921591  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  22921592 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 22921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 11628243 - 11628732
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  11628243 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tgggggttggtttgtt-gacaaaatataaactgagattgacttgacgtcgatttgtattga 11628339  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  11628340 aaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 11628433  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |    
T  11628434 caatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcatt 11628533  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  11628534 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 11628632  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  11628633 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 11628732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12594001 - 12593509
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12594001 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tgggggttagtttgtttgacaaaatatagattgagtttgacttgacgtcgatttgatttga 12593904  T
Q  101 aaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  12593903 aaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 12593810  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||||||  |||| ||    
T  12593809 tgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcatgactgttgaca 12593710  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||    
T  12593709 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggaga 12593611  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  12593610 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccg 12593511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 12709680 - 12710169
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  12709680 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tgaggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttg 12709777  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| ||||   ||   |||||||||    
T  12709778 aaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattg---tt---attggaaat 12709871  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  12709872 gcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 12709971  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  12709972 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 12710070  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  12710071 gacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 12710169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Original strand, 19449475 - 19449939
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||   |      
T  19449475 ttgaactaggcacttgaccaaacagaaacacattcac--tggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacattgacatgtcct-- 19449570  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
         ||| || | |||||  || |||||| | || | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||      |||||    
T  19449571 -----agagatgggccaatggcactggctccccaggtcttgatagagaatttgacataggtatcaaattgagactgaaattgacattga------aaatg 19449659  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||    
T  19449660 caatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagt 19449759  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        |||||||||||||||||||||    
T  19449760 ttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttagaaatcctctttggagata 19449859  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19449860 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 19449939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 40240710 - 40240245
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40240710 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tagggattagtttgtttgacaaaatatagattgagcttgacttgacgtcgatttgatttga 40240613  T
Q  101 aaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||      | ||| ||||| ||||||||    
T  40240612 aaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgag------actgatattgatattggaaa 40240519  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  40240518 tgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 40240419  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||    
T  40240418 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggaga 40240320  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  40240319 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 40240245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168173
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16168188  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  16168187 ggggaaaatgccgtt 16168173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810398
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27810413  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  27810412 ggggaaaatgccgtt 27810398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343534
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | ||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 9343519  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  9343520 ggggaaaatgccgtt 9343534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045430
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 476  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaactttgctggagatagaatcttggaagacctgac 39045414  T
Q  477 tggggataacgccgtt 492  Q
    |||||| || ||||||    
T  39045415 tggggaaaatgccgtt 39045430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782918
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccact 27782933  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||| | |||||||||    
T  27782932 gggaaaaacgccgtt 27782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3790658 - 3790473
Alignment:
Q  181 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3790658 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3790559  T
Q  280 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790558 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 9343101 - 9343212
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9343101 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 9343198  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  9343199 aaggtagaaattga 9343212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16168606 - 16168495
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16168606 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 16168509  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  16168508 aaggtagaaattga 16168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27783351 - 27783240
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27783351 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 27783254  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  27783253 aaggtagaaattga 27783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27810831 - 27810720
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27810831 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 27810734  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  27810733 aaggtagaaattga 27810720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 39044995 - 39045106
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39044995 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgttcgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 39045092  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  39045093 aaggtagaaattga 39045106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27397512 - 27397432
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397512 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcac--tggggaatagttt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 27397432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 12662892 - 12662855
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12662892 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 12662855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 19449417 - 19449454
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19449417 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 19449454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 27397570 - 27397533
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27397570 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 27397533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 27397628 - 27397591
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27397628 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 27397591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 27427287 - 27427319
Alignment:
Q  6 ctagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27427287 ctagccacttgagcgaacaaaaacagatagaca 27427319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 28889711 - 28889675
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28889711 ttgaactagccacttgagcgaacagaaacagatagac 28889675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5659262 - 5658773
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5659262 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 5659165  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  5659164 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 5659071  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||     
T  5659070 caatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagc 5658971  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||||||||||||||||     
T  5658970 tggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctggaaatcctctttggagatg 5658871  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  5658870 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 5658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 16617600 - 16618084
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16617600 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tggggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 16617696  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  16617697 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagagtttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 16617790  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  16617791 caacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagt 16617890  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||||||||||||||||||    
T  16617891 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagata 16617990  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
     || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  16617991 tcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataa 16618084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22041557 - 22041087
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041557 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tggggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 22041461  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  22041460 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagaatttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 22041367  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  22041366 caacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagt 22041267  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||||||||||||||||||    
T  22041266 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagata 22041167  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
     || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041166 tcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22041087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19701545 - 19701055
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19701545 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tggggaatagtttttatgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 19701448  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  19701447 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatagaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 19701354  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  19701353 caatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagt 19701254  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||| ||||||||||||    
T  19701253 ttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcttctttggagata 19701154  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  19701153 acgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgt 19701055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 18058396 - 18057907
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18058396 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttga 18058299  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  18058298 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggtttggacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 18058205  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  18058204 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 18058105  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  18058104 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 18058005  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  18058004 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 18057907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 29141884 - 29142375
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29141884 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 29141981  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  29141982 gaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaa 29142075  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  29142076 cgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 29142175  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||| |||||    
T  29142176 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttcggaga 29142275  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  29142276 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 29142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Original strand, 4789814 - 4790252
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  4789814 tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 4789913  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||| | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4789914 acataagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 4790007  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790008 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 4790107  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
     |||||||||||| |        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  4790108 atggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 4790207  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||  |||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  4790208 ttgctaaggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 4790252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 15734248 - 15734710
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734248 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 15734345  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  15734346 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 15734439  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||  ||||||  |    
T  15734440 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgcatgactgttggcgat 15734539  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  15734540 ttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 15734639  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 463  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15734640 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 8282594 - 8283076
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8282594 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatt--cagtggggattgtttt--ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 8282689  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||| || || |||   ||   |||||||||||||||    
T  8282690 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgcgactga---tg---ttgacattggaaatg 8282783  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  8282784 caacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 8282883  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  8282884 ttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 8282983  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  8282984 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggtataa 8283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6209021 - 6208534
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||| |||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6209021 ttgaactagtcacttgaccgaacaaaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttga 6208926  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  6208925 aaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 6208832  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  6208831 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 6208732  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  6208731 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 6208632  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  6208631 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 6208534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 16423334 - 16422845
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16423334 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattagttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 16423238  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| || |||||||    
T  16423237 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatatcggaaatg 16423144  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  16423143 caatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcggt 16423044  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||    
T  16423043 ttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagata 16422944  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16422943 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgt 16422845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 11103494 - 11103982
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11103494 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 11103591  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  11103592 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 11103685  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  11103686 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 11103785  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  11103786 ttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 11103884  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  11103885 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 11103982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 54 - 491
Target Start/End: Original strand, 15885900 - 15886339
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  15885900 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 15885999  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||| ||||| |||   ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15886000 acatgagtattgaactgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 15886093  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15886094 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgta 15886193  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
     |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  15886194 atggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatc 15886293  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  15886294 ttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 15886339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4728752 - 4728265
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| |||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4728752 ttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttga 4728657  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  4728656 aaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 4728563  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  4728562 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 4728463  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  4728462 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 4728363  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  4728362 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 4728265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 22380713 - 22381201
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  |||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22380713 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--gggggttagttt-tttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 22380809  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  22380810 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatg 22380903  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |    
T  22380904 caatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgat 22381003  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        ||||||||||||||||||     
T  22381004 ttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaatcctctttggagatg 22381103  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  22381104 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 22381201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35887883 - 35887399
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35887883 gaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt---tgacaaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 35887789  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||||    
T  35887788 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatgca 35887695  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 302  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  35887694 atatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttgacagttt 35887595  T
Q  303 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||||||||||||||||| ||    
T  35887594 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgac 35887495  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  35887494 gtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccg 35887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 28109072 - 28109564
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28109072 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tgggggttggtttgttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttggtttg 28109169  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  28109170 aaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 28109263  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||| ||||    
T  28109264 gcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttagcag 28109363  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  28109364 tttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 28109462  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc-gactggggataacgccg 490  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  28109463 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttggaaaaccctgactggggaaaacgccg 28109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 18337701 - 18337268
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  18337701 tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 18337602  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18337601 acatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 18337508  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18337507 catgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgta 18337408  T
Q  354 gtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| || |||        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||    
T  18337407 gtggctcgtgctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaac 18337308  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  18337307 ttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataa 18337268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 54 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 4690752 - 4690313
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  4690752 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 4690653  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4690652 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 4690559  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  4690558 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgca 4690459  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  4690458 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 4690359  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| |||||    
T  4690358 ttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccgt 4690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24335287 - 24334835
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  24335287 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttt 24335189  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24335188 tgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 24335095  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||    
T  24335094 gggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattaga 24334996  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24334995 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggca 24334896  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24334895 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccactggggaaaacgccgtt 24334835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 4339810 - 4340297
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4339810 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tagggattggtttgtta-acaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgatttga 4339906  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  4339907 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 4340000  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  4340001 caatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 4340100  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  4340101 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 4340199  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  4340200 acgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactggggataatgccg 4340297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 17978061 - 17978551
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17978061 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattga 17978158  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||| ||    
T  17978159 aaggtagaaattgactgatattattggctcgcaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaactg 17978252  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  17978253 caatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 17978352  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  17978353 ttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 17978451  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17978452 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 17978551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5020867 - 5020370
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgt------ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttg 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||  |||||||||||| |      ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  5020867 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaca--ggggattggtttttatttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgccgattta 5020770  T
Q  95 atttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattg 194  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||| |||||  ||  ||     ||| ||||    
T  5020769 aattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaaatgagacggatgtt-----tgatattg 5020675  T
Q  195 gaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggtt 294  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||    
T  5020674 gaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 5020575  T
Q  295 ggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttg 386  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||    
T  5020574 ggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaatcctctttg 5020476  T
Q  387 gagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataac 486  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||    
T  5020475 gagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaac 5020376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32297783 - 32297290
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||  ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32297783 ttgaactagccacttgatcgaacagaaacatattcac--tggggattgttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 32297686  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | ||||||||||||  ||  ||     ||| ||||||||    
T  32297685 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagacggatgtt-----tgatattggaaa 32297591  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  32297590 tgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 32297491  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| ||||||    
T  32297490 gtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggaga 32297392  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  32297391 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccg 32297292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 31029373 - 31029864
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31029373 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaat 31029470  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||    
T  31029471 tgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaa 31029564  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  31029565 atgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 31029664  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
    | |||||||  ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||    
T  31029665 attttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggag 31029763  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||    
T  31029764 atgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 31029863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 5602422 - 5602913
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5602422 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttga 5602519  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  5602520 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 5602613  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  5602614 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 5602713  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  5602714 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 5602812  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||    
T  5602813 gacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgt 5602912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18232303 - 18231851
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  18232303 tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttt 18232205  T
Q  140 tgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcat 239  Q
    ||||||||||  ||||||  | | |||||||||      | |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18232204 tgacagagaacctgacatgagtactgaattgag------actgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcat 18232111  T
Q  240 gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgga 339  Q
    ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||    
T  18232110 gggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcaga 18232012  T
Q  340 gtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18232011 gtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggca 18231912  T
Q  432 gatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18231911 ggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 18231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 20569966 - 20570456
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20569966 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgatttgaattga 20570063  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||| |||||||||||    
T  20570064 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgtcattggaaatg 20570157  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  20570158 cgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 20570257  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| |||||||     
T  20570258 ttgtaggcacgacttcac-gggggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatg 20570356  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  20570357 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 20570456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 18285487 - 18285977
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattg--gtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || |||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18285487 ttgaactagccacttgaccaaacagaaac--atattcactggggattgttttttttttgacaagatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 18285584  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| ||||||||    
T  18285585 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaaa 18285678  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  18285679 tgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 18285778  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  18285779 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggaga 18285877  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  18285878 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 18285977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18249866 - 18249377
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18249866 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcacc--ggggattggttt-tttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgaattga 18249770  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | | |||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  18249769 aaggtagaaattgaccgaaattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 18249676  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  18249675 caatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 18249576  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| |||||||     
T  18249575 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatg 18249477  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  18249476 acgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 18249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 18300787 - 18301278
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||| ||| |||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18300787 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattgtttttttttttgacaagatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaat 18300884  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||| |||||||    
T  18300885 tgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgatattggaa 18300978  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  18300979 atgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 18301078  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
    | ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||    
T  18301079 attttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggag 18301177  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||    
T  18301178 atgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 18301277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21681870 - 21681406
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||    
T  21681870 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacattgatttgaattg 21681773  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  21681772 aaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 21681679  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  21681678 gcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 21681579  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| |||||||    
T  21681578 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagat 21681480  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  21681479 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 21681406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 48473061 - 48472590
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  48473061 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 48472964  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  48472963 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 48472870  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  48472869 tgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 48472770  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  48472769 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 48472671  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472670 tgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 20073164 - 20072693
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20073164 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 20073067  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  20073066 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 20072973  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  20072972 tgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 20072873  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||    || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  20072872 ttttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 20072774  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072773 tgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 22863973 - 22864464
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22863973 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 22864070  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||   | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  22864071 aaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 22864164  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  22864165 gcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 22864264  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| ||||    
T  22864265 tttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagat 22864363  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||    
T  22864364 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgt 22864463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 22879032 - 22879523
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22879032 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 22879129  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||   | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  22879130 aaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 22879223  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  22879224 gcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 22879323  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| ||||    
T  22879324 tttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagat 22879422  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||    
T  22879423 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgt 22879522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4630910 - 4630420
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| ||  ||  ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||    
T  4630910 ttgaactagccacttgaccaatcagaaacatattcac--tggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacattgatttgaatt 4630813  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  4630812 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 4630719  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  4630718 tgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 4630619  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||| ||    
T  4630618 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtga 4630520  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  4630519 tgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 4630420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10650217 - 10649730
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||    
T  10650217 ttgaactagccacttggccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagatt----tgacgtcgatttgatttga 10650124  T
Q  101 aaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||   | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  10650123 aaggtagaaattgagactgatgttattggcttacaaggttttgacagagaacctgacacgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 10650030  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  10650029 tgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 10649930  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  10649929 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 10649831  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  10649830 tgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaaga-cttactggggaaaacgccg 10649732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 17969987 - 17970481
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17969987 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaat 17970084  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| ||| ||||   ||   |||||||    
T  17970085 tgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattg---tt---attggaa 17970178  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||    
T  17970179 atgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggc 17970278  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
    | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||    
T  17970279 actttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggag 17970377  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 488  Q
    || ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||    
T  17970378 atgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgc 17970477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 465
Target Start/End: Original strand, 31957567 - 31958029
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31957567 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 31957663  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||  |  ||||||||||      | ||| ||||||||||||||||    
T  31957664 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgag------actgatattgacattggaaatg 31957757  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  31957758 caatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 31957857  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  31957858 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 31957956  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 465  Q
    |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31957957 acgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttg 31958029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51789171 - 51788681
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51789171 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 51789075  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  51789074 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 51788981  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcatta-aatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  51788980 caatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 51788881  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  51788880 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 51788782  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  51788781 gacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 51788682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 5474105 - 5473628
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5474105 ttgaactagccacttgaccgaacataaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 5474009  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||  ||||||||||      |||||    
T  5474008 aaggtagaaattgacagatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattga------aaatg 5473915  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  5473914 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca----------tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 5473825  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  5473824 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 5473726  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  5473725 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 5473628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 514
Target Start/End: Original strand, 16403953 - 16404414
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  16403953 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 16404052  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16404053 acatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 16404146  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16404147 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgta 16404245  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||    
T  16404246 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaac 16404345  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctgg 514  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| ||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  16404346 ttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctgg 16404414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28346281 - 28345830
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagatttt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  28346281 ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtttt 28346183  T
Q  141 gacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatg 240  Q
    |||| || |  || |||  |  ||||||||||      | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28346182 gacaaaggacctgtcatgagttttgaattgag------actgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatg 28346089  T
Q  241 ggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggag 340  Q
    || || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||    
T  28346088 ggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagag 28345990  T
Q  341 tattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  28345989 tattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcag 28345890  T
Q  433 atagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
     ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  28345889 gtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 28345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 4424046 - 4423557
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgt-ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  4424046 ttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcac--tggggattggtttttattgacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttg 4423949  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   | ||||||||| ||    
T  4423948 aaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---tcgacattggacat 4423855  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  4423854 gcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 4423755  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||| ||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  4423754 tttataggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 4423656  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  4423655 gacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 4423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 15368388 - 15367903
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||         
T  15368388 ttgaactaaccacttgaccaaacagaaacacattcac--tggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacattgacatg----- 15368296  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
         |||| || |||||||  || |||||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  15368295 --tcctagagatggaccaatggcactggctccccagatcttgacagagaatttgacataagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 15368204  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  15368203 gcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 15368104  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagat 391  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | ||||||||||||||||||    
T  15368103 tttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaaatcctctttggagat 15368004  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||    
T  15368003 aacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccg 15367904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16599762 - 16599406
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16599762 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 16599665  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  16599664 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 16599571  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |    
T  16599570 caatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcatt 16599471  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 366  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599470 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 32446228 - 32445791
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||  ||    
T  32446228 tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaatcgaccgatactaatggctcacaaggttttgatagagaacctg 32446129  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  32446128 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatg 32446035  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32446034 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgta 32445936  T
Q  354 gtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    |||||||||||     ||||   || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  32445935 gtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 32445836  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  32445835 ttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 32445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8218723 - 8218284
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  8218723 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 8218624  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8218623 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 8218530  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| | || |||||||||||||||     
T  8218529 catgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtg 8218431  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||    
T  8218430 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaac 8218331  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  8218330 ttgctggagatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 8218284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7080378 - 7080022
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7080378 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgaattga 7080281  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  7080280 aaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 7080187  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  7080186 caatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcaat 7080087  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 366  Q
    | |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080086 tcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 6535854 - 6536343
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| || | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  6535854 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttattgg-cacaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttagtttga 6535950  T
Q  101 aaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    || |   |||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  6535951 aatg---aaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 6536041  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  6536042 tgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 6536141  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggag 389  Q
    | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||||||| ||    
T  6536142 attttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaag 6536240  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  6536241 atgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgcc 6536340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28028362 - 28027930
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  28028362 tttgacaaaatatagattgagatcgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 28028263  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| |||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28028262 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatg-------taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 28028176  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  28028175 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtaatgggcaagta 28028077  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    |||||||||||||||        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||| ||  ||||    
T  28028076 gtggctcgtgctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaac 28027977  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  28027976 ttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 28027930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717714
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5717729  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  5717728 ggggaaaatgccgtt 5717714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728624
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5728639  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  5728638 ggggaaaatgccgtt 5728624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763744
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5763729  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  5763730 ggggaaaatgccgtt 5763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 492
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589956
Alignment:
Q  185 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 284  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  285 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 376  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 5589840  T
Q  377 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 476  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  5589841 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgcaacttgctagagatagaatcttggaagacctgac 5589940  T
Q  477 tggggataacgccgtt 492  Q
    |||||| || ||||||    
T  5589941 tggggaaaatgccgtt 5589956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10403186 - 10402811
Alignment:
Q  118 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgat 217  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  10403186 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgat 10403093  T
Q  218 ataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||     
T  10403092 ataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttca 10402993  T
Q  318 cagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgt 409  Q
    | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  10402992 cgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgt 10402894  T
Q  410 accggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | |||||||||||| | |||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  10402893 atcggaaccatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 10402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658567
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 29658552  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  29658553 ggggaaaatgccgtt 29658567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35222004 - 35221712
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||    
T  35222004 ttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tggagattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattt----tga 35221911  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    ||| ||||||||||    
T  35221910 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcataagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ctgatattggaaatg 35221817  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||    
T  35221816 cactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagt 35221717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030114
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 476  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactttgctggagatagaatcttggaagactccac 47030130  T
Q  477 tggggataacgccgtt 492  Q
    |||||| |||||||||    
T  47030129 tggggaaaacgccgtt 47030114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5718147 - 5718036
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5718147 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 5718050  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  5718049 aaggtagaaattga 5718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5729057 - 5728946
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5729057 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 5728960  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  5728959 aaggtagaaattga 5728946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 5763311 - 5763422
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5763311 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 5763408  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  5763409 aaggtagaaattga 5763422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 114
Target Start/End: Original strand, 29658171 - 29658245
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658171 tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 29658245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47030511 - 47030437
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47030511 tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 47030437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 5589526 - 5589643
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5589526 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatatt--cattggggattagtttgtt-gaaaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 5589622  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatat 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  5589623 aaggcagaaattgaccgatat 5589643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079867
Alignment:
Q  376 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 475  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  476 ctggggataacgccg 490  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7079881 ctgggaataatgccg 7079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 16423572 - 16423535
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16423572 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 16423535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 35222120 - 35222083
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35222120 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 35222083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 4789525 - 4789562
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4789525 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 4789562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 16617542 - 16617579
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16617542 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 16617579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 19701603 - 19701566
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19701603 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 19701566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22041615 - 22041578
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22041615 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 22041578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 4691336 - 4691304
Alignment:
Q  6 ctagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4691336 ctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 4691304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 5659557 - 5659521
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5659557 ttgagctagccacttgaccgaacataaacagatagac 5659521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 35888167 - 35888131
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35888167 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 35888131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 20333485 - 20333969
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||   ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  20333485 ttgaactagccactagaccgaacagaaacaaatt--cattggggattagtttttttgacaaaatgtagattgagattgacttgaagtcgatttggtttga 20333582  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||| |||   ||    ||||||||||||||    
T  20333583 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgggtattgaattcagactga---tgc---tgacattggaaatg 20333676  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  20333677 caatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 20333776  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||    
T  20333777 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagata 20333876  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||    
T  20333877 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataa 20333969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 16201098 - 16201583
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16201098 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcac--tagggattagttttttttgacaaaatatagattgaagttgactggacgtcgatttgatttg 16201195  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  16201196 aaaggtagaaattgatcaatattattggctcacaagattttgatagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 16201289  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  16201290 gcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 16201389  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  16201390 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcctggaaatcctctttggagat 16201489  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  16201490 aacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtagaatctcggaagactctactggggataa 16201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Original strand, 14692036 - 14692474
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  14692036 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 14692135  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14692136 acatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 14692229  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14692230 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 14692329  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  14692330 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaac 14692429  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14692430 ttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Original strand, 14694718 - 14695156
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  14694718 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 14694817  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14694818 acatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 14694911  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14694912 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 14695011  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  14695012 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaac 14695111  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14695112 ttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Original strand, 14697402 - 14697840
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  14697402 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 14697501  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14697502 acatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 14697595  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697596 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 14697695  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  14697696 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaac 14697795  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14697796 ttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14697840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 480
Target Start/End: Original strand, 14700083 - 14700511
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  14700083 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 14700182  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14700183 acatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 14700276  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700277 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 14700376  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  14700377 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaac 14700476  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 480  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  14700477 ttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 14700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51645411 - 51644921
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51645411 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttga 51645314  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||| |||||||||||    
T  51645313 aaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgtcattggaaatg 51645220  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  51645219 caatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 51645120  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| ||||     
T  51645119 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatg 51645021  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  51645020 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 51644921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 491
Target Start/End: Original strand, 21890825 - 21891308
Alignment:
Q  7 tagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggta 106  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890825 tagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattgtttt-tttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggta 21890921  T
Q  107 gaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacat 206  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| |||   || |   |||||||||||||||||||    
T  21890922 gaaattgaccgatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactga---tgtc---gacattggaaatgcaacat 21891015  T
Q  207 gtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtag 306  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||| ||  ||||||  |||||||    
T  21891016 gcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcacgactgttggcgatttgtag 21891115  T
Q  307 acacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccg 398  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||    
T  21891116 acacagttccgcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcg 21891215  T
Q  399 ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  21891216 ttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 21891308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 20467978 - 20467484
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttg----acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgat 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| |||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20467978 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcac--tggggattagttttttttttgtacaaaatatagattgaaactgacttgacgtggatttgat 20467881  T
Q  97 ttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgga 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||    ||||||||||    
T  20467880 ttgaaaggtagaaattgaccagtattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tgc---tgacattgga 20467787  T
Q  197 aatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttgg 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  20467786 aatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttgg 20467687  T
Q  297 cagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttgga 388  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||    
T  20467686 cagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttgga 20467587  T
Q  389 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 488  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||    
T  20467586 gataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgc 20467487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 41 - 490
Target Start/End: Original strand, 41786441 - 41786891
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagatttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  41786441 ggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattggcttgacgtcgatttgatttgaaaggcggaaattgaccgatattattggctcacaaggtttt 41786540  T
Q  141 gacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatg 240  Q
    |||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41786541 gacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatg 41786634  T
Q  241 ggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggag 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||| |  |||    
T  41786635 ggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgtcagag 41786733  T
Q  341 tattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41786734 tattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcag 41786833  T
Q  433 atagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
      || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  41786834 gcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg 41786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 10969832 - 10969344
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10969832 ttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 10969736  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  10969735 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 10969642  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  10969641 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 10969542  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  10969541 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 10969443  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  10969442 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 10969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28156896 - 28156425
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||| || |||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28156896 ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgac--tggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 28156799  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  28156798 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 28156705  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  28156704 tgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 28156605  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  28156604 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 28156506  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156505 tgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3648343 - 3647846
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3648343 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tgaggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 3648246  T
Q  101 aaggtagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacatt-gacattggaa 197  Q
    ||||||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||  |||||||| || ||  ||     
T  3648245 aaggtagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgat 3648146  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  3648145 atg--atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 3648048  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggag 389  Q
    ||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| |||||    
T  3648047 agtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggag 3647949  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||||    
T  3647948 atgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgcc 3647849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10952281 - 10951791
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10952281 ttgaactagccacttgaccagacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 10952185  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  || |||  |  ||||||||||      | ||| ||||| ||||||||||    
T  10952184 aaggtagaagttgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgtcatgagttttgaattgag------actgatattgatattggaaatg 10952091  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    | | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  10952090 cgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 10951991  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  10951990 tttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 10951892  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||    
T  10951891 gacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgt 10951792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28592235 - 28591780
Alignment:
Q  40 tggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 137  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |    
T  28592235 tggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttaacattgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatactattggctcacaaggt 28592136  T
Q  138 tttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgc 237  Q
    ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28592135 tttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgc 28592042  T
Q  238 atgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattg 337  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||     
T  28592041 atgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatta 28591943  T
Q  338 gagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgaggg 429  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28591942 gaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggg 28591843  T
Q  430 cagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    | | ||| ||   |||||||| |||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  28591842 ctggtaggtatgtaacttgctagggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 28591780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 16201040 - 16201077
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16201040 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 16201077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 20333427 - 20333464
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20333427 ttgaactagccacttaaccgaacagaaacagatagaca 20333464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20468036 - 20467999
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20468036 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 20467999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 14691693 - 14691729
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14691693 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 14691729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 14694375 - 14694411
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14694375 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 14694411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 14697059 - 14697095
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14697059 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 14697095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 14699740 - 14699776
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14699740 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagac 14699776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Original strand, 21890176 - 21890208
Alignment:
Q  6 ctagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21890176 ctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 21890208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 14570320 - 14569836
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14570320 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 14570223  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||||| |||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  14570222 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactga---tg---ttgacattggaaatg 14570129  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  14570128 caacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcgat 14570029  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  14570028 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttggaaatcctctttggagatg 14569929  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  14569928 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataa 14569836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15774688 - 15774250
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  15774688 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaaggttttgacagagaacctg 15774589  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15774588 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 15774495  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15774494 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 15774395  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    |||||||||||||||        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  15774394 gtggctcgtgctacattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaac 15774295  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  15774294 ttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 15774250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22140028 - 22139595
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||    
T  22140028 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgtcagagaacctg 22139929  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22139928 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 22139835  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22139834 catgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgta 22139735  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  22139734 gtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaac 22139635  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  22139634 ttgctggggacagaatctcggaagactctactggggataa 22139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 21341223 - 21341702
Alignment:
Q  6 ctagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggt 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341223 ctagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggt 21341319  T
Q  106 agaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaaca 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | | |||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||| |    
T  21341320 agaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcaata 21341413  T
Q  206 tgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgta 305  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  21341414 tgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgta 21341513  T
Q  306 gacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgcc 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |    
T  21341514 gacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtc 21341613  T
Q  398 gttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  21341614 gttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataa 21341702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 16261104 - 16260613
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16261104 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagatt--cattggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttg 16261007  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  16261006 aaaggtagaaattgactaatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 16260913  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||||||    
T  16260912 gcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcag 16260813  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  16260812 tttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagat 16260713  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||||    
T  16260712 aacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggaataatgccgt 16260613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 2130316 - 2130804
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2130316 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttt-tttgacaaagtataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 2130412  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| ||| ||||      ||||||||||||    
T  2130413 aaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattg------acattggaaatg 2130506  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |    
T  2130507 caatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgat 2130606  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  2130607 ttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 2130706  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  2130707 acgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 2130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33249532 - 33249039
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgat 96  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33249532 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacaggttcac--tggggattggtttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgat 33249435  T
Q  97 ttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgga 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||| ||||| |||   ||   |||||||||||    
T  33249434 ttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaactgagactga---tg---ttgacattgga 33249341  T
Q  197 aatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttgg 296  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  33249340 aatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttgg 33249241  T
Q  297 cagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttgga 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||    
T  33249240 cgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttgga 33249141  T
Q  389 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 488  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||    
T  33249140 gatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactctactgggaataatgc 33249041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18797823 - 18797404
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  18797823 tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggcttacaaggttttgacagagaacctg 18797724  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||| | ||||||||||      || |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18797723 acataagtattgaattga------aactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 18797630  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797629 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 18797530  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  18797529 gtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 18797430  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||    
T  18797429 ttgctaaggatagaatcttgggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19695284 - 19694791
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggt---ttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19695284 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattgttgttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatt 19695187  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||      |||    
T  19695186 tgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattgacattg------gaa 19695093  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  19695092 atgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 19694993  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |        || | ||||||||||||||||    
T  19694992 gatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttatattacacattcctggaaatcctctttggag 19694893  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||    
T  19694892 atgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 19694793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 27601961 - 27602449
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |   |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601961 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaaatcaca--ggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 27602057  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  27602058 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 27602151  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  27602152 caatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 27602251  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||| |     
T  27602252 ttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagctg 27602351  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27602352 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 19654370 - 19654863
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| |||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19654370 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagttttttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcggtttgatt 19654467  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||    
T  19654468 tgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctaacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaa 19654561  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    || ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  |||| |    
T  19654562 attcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgac 19654661  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||||||||||||||    
T  19654662 agttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggag 19654761  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||    
T  19654762 ataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggaataatgcc 19654861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 54 - 463
Target Start/End: Original strand, 19910265 - 19910676
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  19910265 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 19910364  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| ||| ||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19910365 acatgagtattgagttgagactgatattg------acattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 19910458  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  19910459 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacaca 19910558  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  19910559 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 19910658  T
Q  446 ttgctggggatagaatct 463  Q
    |||||| |||||||||||    
T  19910659 ttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31361719 - 31361267
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31361719 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggatcggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 31361623  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||| |||||  ||  ||     ||| ||||||||||    
T  31361622 aaggtagaaattgactgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaaatgagacggatgtt-----tgatattggaaatg 31361528  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  31361527 caatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 31361428  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||||||||||||     
T  31361427 ttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaatcctctttggagatg 31361329  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 454  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  31361328 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29836514 - 29836023
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  29836514 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgacttaacgttgattcgatttg 29836417  T
Q  100 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat 199  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||||||    
T  29836416 aaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaat 29836323  T
Q  200 gcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  29836322 gcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 29836223  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||||||||||||    
T  29836222 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 29836124  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29836123 gacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgt 29836024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18716648 - 18716177
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18716648 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 18716551  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||     
T  18716550 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaag 18716457  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  18716456 tgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 18716357  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  18716356 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 18716258  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716257 tgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 125 - 471
Target Start/End: Original strand, 22074081 - 22074429
Alignment:
Q  125 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacag 224  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||| || |||| |||| || |||||      |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  22074081 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaatcgagactgtaattg------acattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatag 22074174  T
Q  225 tttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagac 324  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074175 ttttattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagac 22074274  T
Q  325 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |    
T  22074275 agacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcggga 22074374  T
Q  417 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074375 ccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 44568171 - 44567680
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44568171 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-cataatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 44568075  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  44568074 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 44567981  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  44567980 caatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 44567881  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |         || | |||||||||||||||||    
T  44567880 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgctatattacacatttcttggaaatcctctttggaga 44567782  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  44567781 tgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccg 44567682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 31482906 - 31483393
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31482906 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggatgggttt---tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 31483000  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  31483001 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 31483094  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  || ||||||    
T  31483095 cactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagt 31483194  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  31483195 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 31483293  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  31483294 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 31483393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Original strand, 12085758 - 12086253
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggttt-gtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12085758 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 12085855  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  |  | ||||||||| |||   ||   ||||  |||||||    
T  12085856 gaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtttcgaattgagactga---tg---ttgatgttggaaa 12085949  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  12085950 tgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 12086049  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  12086050 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 12086148  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| |||||||    
T  12086149 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccg 12086248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19681646 - 19681156
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19681646 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 19681550  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  19681549 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 19681456  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  19681455 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 19681356  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  19681355 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 19681257  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  19681256 gacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgt 19681157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 33265859 - 33265420
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  33265859 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctg 33265760  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  33265759 acatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatg 33265666  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33265665 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgta 33265567  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
    ||||||||||||| |        || | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  33265566 gtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaac 33265467  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  33265466 ttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 33265420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9361795 - 9361304
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9361795 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 9361698  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  9361697 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 9361604  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  9361603 tgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 9361504  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||||||||||||||||    
T  9361503 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaatcctctttggaga 9361405  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||    
T  9361404 tgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccg 9361306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355474
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 28355459  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  28355460 ggggaaaatgccgtt 28355474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Original strand, 22388966 - 22389190
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |    
T  22388966 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccg 22389065  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | |||||||||||| |||   ||   | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22389066 acatgagtattgaattgagactga---tg---tcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatg 22389159  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 284  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22389160 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201906
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||  ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 476  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 19201890  T
Q  477 tggggataacgccgtt 492  Q
     ||||| |||||||||    
T  19201891 cggggaaaacgccgtt 19201906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 19201472 - 19201583
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19201472 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 19201569  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  19201570 aaggtagaaattga 19201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15775473 - 15775288
Alignment:
Q  181 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  15775473 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 15775374  T
Q  280 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775373 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 28355041 - 28355152
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28355041 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 28355138  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  28355139 aaggtagaaattga 28355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 22073968 - 22074048
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22073968 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacacatt--cattggggattagttt--ttggcaaaatataaattgaaattgacttgac 22074048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 33249885 - 33249849
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagac 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33249885 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagac 33249849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 15775035 - 15774998
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775035 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 15774998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 18798112 - 18798075
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18798112 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 18798075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 22073910 - 22073947
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22073910 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 22073947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22140264 - 22140227
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22140264 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 22140227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 19695516 - 19695484
Alignment:
Q  6 ctagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19695516 ctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 19695484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Original strand, 3681 - 4173
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtt---tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3681 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggttttttatttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaat 3778  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   ||||||||||||    
T  3779 tgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttggcagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaa 3872  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  3873 atgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggc 3972  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggag 389  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        || | || |||||||||||||    
T  3973 gatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggacatcctctttggag 4072  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgcc 489  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| |||    
T  4073 atgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgcc 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13242 - 12769
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || |  |||||| |||| |||   |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13242 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacacattcactt--gggattagttttttttttgacaaaatgtaaattgaaactgacttgacgtcgatttgatt 13145  T
Q  98 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaa 197  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||      | |||||| |||  ||||||||||||    
T  13144 tgaaagataaaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattg------ggttgaaactgatgttgacattggaa 13051  T
Q  198 atgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc 297  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||    
T  13050 atgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggc 12951  T
Q  298 agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--------catagaaatcctctttggag 389  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||||||||||||||||    
T  12950 agttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctggaaatcctctttggag 12851  T
Q  390 ataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12850 ataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagac 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 186 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2354
Alignment:
Q  186 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 285  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  286 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 377  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  378 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 477  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 2369  T
Q  478 ggggataacgccgtt 492  Q
    ||||| || ||||||    
T  2368 ggggaaaatgccgtt 2354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2787 - 2676
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2787 ttgaactagccacttgaccaaacaggaacatattcac--tggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttga 2690  T
Q  101 aaggtagaaattga 114  Q
    ||||||||||||||    
T  2689 aaggtagaaattga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 471
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8479
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8011 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 8107  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  8108 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 8201  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  8202 caatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatt 8301  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  8302 ttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatg 8400  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8401 acgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13205 - 12715
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13205 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 13108  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  13107 gaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 13014  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  13013 tgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 12914  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    |||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  12913 gtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 12815  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  12814 tgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccg 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 34405 - 33971
Alignment:
Q  58 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  34405 acaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacat 34306  T
Q  158 aggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatg 257  Q
      | ||||| |||||| ||   |||   |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34305 gagtattgagttgagactg---ttg---ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatg 34212  T
Q  258 attatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgg 357  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  34211 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtgg 34112  T
Q  358 ctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc 449  Q
    ||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  34111 ctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc 34012  T
Q  450 tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    || ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  34011 tgaggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 33971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11107 - 10615
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11107 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 11010  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| ||| ||||   ||   ||||||||||    
T  11009 aaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatattg---tt---attggaaatg 10916  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  10915 taatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcag 10816  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
    ||||||  |||   ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |         || | |||||||||||||||||    
T  10815 tttgtaagcacgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcctctttggaga 10717  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  10716 tgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccg 10617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 34759 - 34722
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34759 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagaca 34722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 485
Target Start/End: Original strand, 8729 - 9214
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||| |||| |||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8729 gaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcaca--ggggattagtttttttttgacaaagtataaattgagattgaattgacgtcgatttgatttga 8826  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||  | ||| |||||||| ||| |||||||||||   ||   |||    
T  8827 aaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattaaattgagactgatattgacattga---tg---atg 8920  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  8921 cgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 9020  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | || |||||||||||||||     
T  9021 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggacatcctctttggagatg 9120  T
Q  393 acgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 485  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  9121 acgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataa 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 490
Target Start/End: Original strand, 24093 - 24531
Alignment:
Q  54 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  24093 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctg 24192  T
Q  154 acataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatg 253  Q
    ||||  | ||||| |||||| ||| ||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  24193 acatgagtattgagttgagactgatattg------acattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatg 24286  T
Q  254 catgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgta 353  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  | ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24287 catgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgta 24386  T
Q  354 gtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac 445  Q
     |||||||||||| |        || | ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  24387 atggctcgtgctatattacacattcctggaaattctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac 24486  T
Q  446 ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24487 ttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 28471 - 27992
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||          
T  28471 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcac--tggggattagttt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacattgacatg------ 28382  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
        |||| || | |||||  || |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||      |||||||| |||||||    
T  28381 -tcctagagatgggccaatggcactggctcaccaggtcttgacagagaatttgacacaggtatcgaattgagactgaa------attgacatgggaaatg 28289  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28288 caacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagt 28189  T
Q  301 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-ca-----tcatagaaatcctctttggagataac 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     || | |||||||||||||||||||||    
T  28188 ttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaaatcctctttggagataac 28089  T
Q  395 gccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  28088 gtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataatgccgt 27992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28492
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28529 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 28492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 28587 - 28550
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28587 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 28550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 2246 - 2736
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2246 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaca--gaggatcggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttga 2342  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  2343 aagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 2436  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag 299  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||     
T  2437 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcat 2536  T
Q  300 tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagat 391  Q
    ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||    
T  2537 tttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagat 2635  T
Q  392 aacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 491  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| ||||||||    
T  2636 gacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgt 2735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 23666 - 23935
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23666 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaaa--ggggatcggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttga 23762  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatg 200  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||    
T  23763 aagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatg 23856  T
Q  201 caacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 278  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23857 caatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18505
Alignment:
Q  415 aaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 18505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 14636
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattgg--tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  15131 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgacttggcgtcgatttggttt 15034  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  15033 gaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 14940  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggca 298  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  14939 tgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggca 14840  T
Q  299 gtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 390  Q
     ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  14839 ttttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 14741  T
Q  391 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| |||||||    
T  14740 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccg 14641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 139 - 471
Target Start/End: Original strand, 25774 - 26108
Alignment:
Q  139 ttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgca 238  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||      |||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |    
T  25774 ttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattg------acattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgta 25867  T
Q  239 tgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgg 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25868 tgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattgg 25967  T
Q  339 agtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggc 430  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||        | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25968 actattgggcacgtagtggctcatgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggc 26067  T
Q  431 agatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 471  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26068 aggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaagac 26108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 25589 - 25626
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagaca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25589 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagaca 25626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 25647 - 25725
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttg 83  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   || |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25647 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacacat--tcactggggattagtt--tttgacaaaatataaattgaaattaacttg 25725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 191 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 467
Alignment:
Q  191 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  291 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 382  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||||||||    
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  383 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 482  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 479  T
Q  483 taacgccgttat 494  Q
    ||| ||||||||    
T  478 taatgccgttat 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16768 - 16273
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgttt-----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttga 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| ||| |||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16768 ttgaactagccacttgaccaaacaaaaacatattcac--tggggattgtttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttga 16671  T
Q  96 tttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattgg 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||| |||   ||   ||||||||||    
T  16670 attgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactga---tg---ttgacattgg 16577  T
Q  196 aaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttg 295  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  16576 aaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttg 16477  T
Q  296 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttgg 387  Q
    ||| ||||||| |||   ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |        || | ||||||||||||||    
T  16476 gcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgttatattacacattcttggaaatcctctttgg 16378  T
Q  388 agataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacg 487  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||| ||||    
T  16377 agatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacg 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 289
Target Start/End: Original strand, 1135 - 1412
Alignment:
Q  3 gaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 102  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1135 gaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcac--tggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 1231  T
Q  103 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaatgca 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |  ||||||||||| |||   ||   |||||||||||||||||    
T  1232 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatgca 1325  T
Q  203 acatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 289  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  1326 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 490
Target Start/End: Original strand, 39714 - 40181
Alignment:
Q  41 ggggattggtttgtttgacaaaa-tatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggt-agaaatt-gaccaatatcattgg-ctcacaaga 136  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||     
T  39714 ggggattgttttttttgacaaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggttagaaatttgaccgatattattggtctcacaagg 39813  T
Q  137 ttttgacagagaatttgacat-aggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaat-gcaacatgtatgga-tgatataacagtttca-tta 232  Q
    |||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  39814 ttttgacagagaacccgacatgagtaattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaatta 39907  T
Q  233 aatgcat-gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc-agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 330  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39908 aatgcattgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaa 40007  T
Q  331 gacattggagt-attgggc-acgtagtggctcgtgctacatcata----------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc 418  Q
    |||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||| || | |           ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40008 gacactggagtggttgggcaacgcagtggctcgtgctatattacacatttcctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaacc 40107  T
Q  419 atggctga-gggcagatagctaat-caacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  40108 atggctgaggggcaggtagttaatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 40181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 13042 - 13324
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattgg--tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgattt 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||  |||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  13042 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcac--tggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggttt 13139  T
Q  99 gaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataggcattgaattgagattgaaattgacattgacattggaaa 198  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||| | |||||  ||||||||||||  ||||||  | |||||||||||| |||   ||   |||||||||||||    
T  13140 gaaaggtagaaattgattgatattattggattacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactga---tg---ttgacattggaaa 13233  T
Q  199 tgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 289  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  13234 tgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6990 - 6850
Alignment:
Q  1 ttgaactagccacttgaccgaacaaaaacagatagacattggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6990 ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcac--tggggattgttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgctgatttgatttga 6893  T
Q  101 aaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgac 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6892 aaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgac 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6741
Alignment:
Q  424 tgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 490  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 6741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University