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Alignment Overview

Query: NF9457_low_4 (Length: 373)

Name: NF9457_low_4
Description: NF9457
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9457_low_4
NF9457_low_4
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (8-373)||(22907241-22907607)
chr8 (235-373)||(5238184-5238323)
chr8 (235-373)||(24661275-24661414)
chr8 (235-373)||(43685643-43685782)
chr8 (113-366)||(24548956-24549211)
chr8 (106-373)||(43373495-43373761)
chr8 (113-373)||(16193743-16194005)
chr8 (113-366)||(6774280-6774535)
chr8 (106-373)||(16405002-16405268)
chr8 (109-371)||(17345540-17345803)
chr8 (106-366)||(21844594-21844856)
chr8 (106-366)||(21851987-21852249)
chr8 (19-373)||(24928818-24929165)
chr8 (106-366)||(30120690-30120952)
chr8 (8-80)||(43685584-43685656)
chr8 (8-80)||(5238125-5238197)
chr8 (8-80)||(24661401-24661473)
chr8 (106-325)||(222754-222975)
chr8 (106-325)||(736377-736598)
chr8 (106-325)||(860272-860493)
chr8 (110-366)||(16674414-16674672)
chr8 (96-250)||(23837154-23837308)
chr8 (19-76)||(22321597-22321654)
chr8 (95-217)||(41246613-41246735)
chr8 (19-99)||(23217924-23218004)
chr8 (98-168)||(13662492-13662561)
chr8 (22-80)||(22981241-22981299)
chr8 (19-80)||(41507116-41507177)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (8-373)||(16744142-16744508)
chr3 (112-367)||(17912515-17912771)
chr3 (95-373)||(15859051-15859331)
chr3 (106-373)||(12030174-12030443)
chr3 (106-373)||(14842588-14842856)
chr3 (106-373)||(15936654-15936922)
chr3 (235-373)||(2449265-2449404)
chr3 (95-373)||(51158045-51158325)
chr3 (106-373)||(2049777-2050046)
chr3 (19-373)||(13838783-13839130)
chr3 (19-215)||(15468520-15468717)
chr3 (106-373)||(15938496-15938764)
chr3 (19-215)||(22275088-22275285)
chr3 (113-356)||(15614808-15615053)
chr3 (98-366)||(16821099-16821369)
chr3 (106-366)||(55316187-55316449)
chr3 (106-373)||(45860773-45861041)
chr3 (113-248)||(47984624-47984759)
chr3 (113-248)||(48003198-48003333)
chr3 (106-366)||(41270043-41270305)
chr3 (106-373)||(13954917-13955185)
chr3 (106-373)||(13975749-13976017)
chr3 (113-248)||(47993911-47994046)
chr3 (113-248)||(48012484-48012619)
chr3 (8-80)||(2449391-2449463)
chr3 (106-155)||(19231945-19231994)
chr3 (19-99)||(18969968-18970048)
chr3 (95-127)||(22144532-22144564)
chr3 (135-256)||(12264932-12265053)
chr3 (19-80)||(48421624-48421685)
chr3 (135-250)||(11329098-11329214)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (8-373)||(26680070-26680436)
chr4 (110-373)||(15675116-15675381)
chr4 (95-372)||(13246386-13246665)
chr4 (113-373)||(31115603-31115865)
chr4 (95-366)||(54118278-54118551)
chr4 (235-373)||(10488659-10488798)
chr4 (235-373)||(16327953-16328092)
chr4 (110-373)||(10104277-10104523)
chr4 (106-366)||(10644187-10644449)
chr4 (106-237)||(111362-111493)
chr4 (106-373)||(13048248-13048517)
chr4 (268-373)||(122020-122125)
chr4 (106-366)||(47357622-47357884)
chr4 (8-80)||(10488600-10488672)
chr4 (25-80)||(16328079-16328134)
chr4 (109-184)||(7849970-7850044)
chr4 (106-250)||(15044794-15044938)
chr4 (19-80)||(19559410-19559471)
chr4 (203-373)||(40885581-40885753)
chr4 (161-250)||(41166083-41166172)
chr4 (95-127)||(44055870-44055902)
chr4 (163-250)||(7185981-7186068)
chr4 (338-373)||(33240901-33240936)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (8-373)||(7292886-7293252)
chr7 (94-373)||(13037041-13037322)
chr7 (106-373)||(11580766-11581035)
chr7 (113-371)||(47481060-47481320)
chr7 (106-373)||(36052634-36052900)
chr7 (235-373)||(11516324-11516463)
chr7 (235-373)||(15441591-15441730)
chr7 (235-373)||(30262156-30262295)
chr7 (106-373)||(16211733-16212002)
chr7 (106-373)||(18253862-18254130)
chr7 (109-365)||(16478985-16479244)
chr7 (113-371)||(13320988-13321250)
chr7 (106-366)||(13572644-13572906)
chr7 (106-373)||(3059933-3060202)
chr7 (106-366)||(10989378-10989639)
chr7 (124-366)||(13911046-13911292)
chr7 (106-366)||(2437425-2437687)
chr7 (106-373)||(25292365-25292633)
chr7 (8-80)||(11516265-11516337)
chr7 (8-80)||(15441717-15441789)
chr7 (8-80)||(30262282-30262354)
chr7 (109-360)||(296006-296257)
chr7 (19-99)||(13351999-13352079)
chr7 (95-127)||(15822691-15822723)
chr7 (95-250)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (8-373)||(37093-37459)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (95-373)||(19794731-19795011)
chr2 (106-373)||(36982468-36982737)
chr2 (110-372)||(24341417-24341681)
chr2 (235-373)||(19689428-19689567)
chr2 (235-373)||(23820168-23820307)
chr2 (106-373)||(8891209-8891478)
chr2 (113-371)||(25265419-25265679)
chr2 (235-373)||(14906467-14906606)
chr2 (106-373)||(462706-462974)
chr2 (235-373)||(20015108-20015247)
chr2 (106-366)||(43642991-43643250)
chr2 (109-350)||(7507894-7508138)
chr2 (106-373)||(20627340-20627609)
chr2 (106-366)||(19886683-19886945)
chr2 (106-373)||(17396680-17396948)
chr2 (8-80)||(14906593-14906665)
chr2 (8-80)||(20015049-20015121)
chr2 (8-80)||(23820109-23820181)
chr2 (34-80)||(19689554-19689600)
chr2 (161-217)||(19669279-19669335)
chr2 (19-80)||(25601911-25601972)
chr2 (95-127)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (106-373)||(19173-19442)
scaffold0195 (106-373)||(21257-21526)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (106-373)||(36940-37209)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (95-373)||(23153403-23153683)
chr6 (113-366)||(14626152-14626407)
chr6 (106-371)||(35009468-35009735)
chr6 (109-371)||(1657777-1658040)
chr6 (109-371)||(15862443-15862705)
chr6 (113-366)||(1650127-1650382)
chr6 (106-360)||(25175531-25175787)
chr6 (106-366)||(27654005-27654267)
chr6 (109-242)||(27740808-27740941)
chr6 (106-366)||(16825774-16826038)
chr6 (95-249)||(18381821-18381975)
chr6 (19-80)||(15889853-15889914)
chr6 (317-366)||(27751605-27751654)
chr6 (120-226)||(22361926-22362032)
chr6 (22-80)||(25640702-25640760)
chr6 (95-124)||(32898745-32898774)
chr6 (19-99)||(15005034-15005114)
chr6 (19-99)||(22585674-22585754)
chr6 (19-99)||(22590505-22590585)
chr6 (135-250)||(25367374-25367490)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (114-373)||(18531094-18531355)
chr5 (106-366)||(23506932-23507194)
chr5 (110-373)||(22053860-22054125)
chr5 (95-373)||(27182574-27182854)
chr5 (235-373)||(20623066-20623205)
chr5 (235-373)||(21233555-21233694)
chr5 (238-373)||(37052844-37052980)
chr5 (235-373)||(16536294-16536433)
chr5 (109-371)||(34939248-34939511)
chr5 (235-373)||(25900433-25900571)
chr5 (106-366)||(18778014-18778276)
chr5 (106-366)||(22366503-22366765)
chr5 (106-366)||(25426596-25426858)
chr5 (106-366)||(12342-12604)
chr5 (19-215)||(17471768-17471956)
chr5 (125-366)||(4200007-4200251)
chr5 (106-366)||(19499867-19500129)
chr5 (106-366)||(21073617-21073879)
chr5 (106-366)||(27009809-27010071)
chr5 (106-366)||(43443417-43443679)
chr5 (8-80)||(20623007-20623079)
chr5 (8-80)||(21233681-21233753)
chr5 (113-187)||(29190478-29190552)
chr5 (268-366)||(29188306-29188404)
chr5 (8-80)||(25900558-25900630)
chr5 (8-80)||(37052782-37052854)
chr5 (8-80)||(16536235-16536307)
chr5 (117-250)||(19862186-19862319)
chr5 (106-250)||(23493885-23494029)
chr5 (19-80)||(2031697-2031758)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (106-373)||(1091-1360)
scaffold0266 (106-373)||(3609-3877)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (110-366)||(8820-9078)
scaffold0025 (106-373)||(148688-148957)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (106-366)||(20445646-20445908)
chr1 (106-373)||(20931312-20931581)
chr1 (106-366)||(20531411-20531673)
chr1 (95-373)||(20893653-20893933)
chr1 (235-372)||(51452589-51452727)
chr1 (106-373)||(20913004-20913266)
chr1 (106-350)||(22227777-22228022)
chr1 (106-350)||(22232474-22232719)
chr1 (113-366)||(2116228-2116484)
chr1 (109-373)||(41394191-41394458)
chr1 (106-373)||(37844477-37844746)
chr1 (106-366)||(18601140-18601402)
chr1 (113-193)||(45051416-45051496)
chr1 (8-80)||(51452530-51452602)
chr1 (268-366)||(45051554-45051652)
chr1 (106-366)||(5072410-5072672)
chr1 (96-127)||(49967607-49967638)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (106-373)||(48565-48834)
scaffold0023 (110-366)||(36065-36323)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (106-373)||(983-1250)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (106-373)||(48155-48423)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (106-371)||(12083-12347)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (106-366)||(123198-123460)
scaffold0011 (95-127)||(255074-255106)
scaffold0011 (95-127)||(261680-261712)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (235-373)||(22637-22776)
scaffold0141 (235-373)||(26892-27031)
scaffold0141 (8-80)||(22578-22650)
scaffold0141 (8-80)||(26833-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (235-373)||(1609-1748)
scaffold0124 (8-80)||(1735-1807)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (113-371)||(41622-41882)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (106-373)||(6091-6358)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (106-373)||(107715-107983)
scaffold0026 (106-331)||(64585-64812)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (113-366)||(9371-9626)
scaffold0215 (113-366)||(16269-16524)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (106-372)||(128197-128464)
scaffold0008 (125-366)||(31697-31942)
scaffold0008 (99-127)||(22650-22678)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (113-371)||(13480-13740)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (95-373)||(41686-41965)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (106-366)||(8846-9107)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (106-373)||(247469-247738)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (106-373)||(5088-5356)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (113-366)||(2936-3192)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (108-373)||(561-828)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (95-237)||(9338-9480)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (96-373)||(171863-172141)
scaffold0001 (96-373)||(177566-177844)
scaffold0001 (95-127)||(70882-70914)
scaffold0001 (19-80)||(171794-171855)
scaffold0001 (19-80)||(177497-177558)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (109-371)||(34489-34755)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (106-373)||(26442-26710)
scaffold0162 (113-371)||(8209-8466)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (106-365)||(42965-43226)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (106-350)||(5254-5498)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (106-350)||(3690-3936)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (96-373)||(271983-272261)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
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[»] scaffold0139 (2 HSPs)
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scaffold0139 (106-366)||(21138-21399)
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[»] scaffold0420 (1 HSPs)
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[»] scaffold1711 (1 HSPs)
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[»] scaffold0361 (1 HSPs)
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[»] scaffold0066 (2 HSPs)
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[»] scaffold0053 (1 HSPs)
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[»] scaffold0021 (1 HSPs)
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[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (19-80)||(1028-1089)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
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[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (19-80)||(1286-1347)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
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[»] scaffold0160 (1 HSPs)
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[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (19-80)||(24496-24557)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
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[»] scaffold0970 (1 HSPs)
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[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (23-99)||(1629-1705)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22907607 - 22907241
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22907607 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 22907508  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22907507 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 22907408  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
22907407 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 22907308  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22907307 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 22907241  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238323
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 5238323  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661275
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 24661275  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685782
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 43685782  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549211
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 24549211  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373495
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttgg 43373495  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193743
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||    
16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 16193743  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774280
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 6774280  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16405002
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |   ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaattta---acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 16405002  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345803
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagtt 17345803  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844594
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21844594  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851987
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21851987  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24929165 - 24928818
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaaca 118  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | || ||        |||||| |||||||| ||| ||    
24929165 catcaacaattaaccacaaccagaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgta--------attcaccaatttcacaaaacca 24929074  T
119 ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc 218  Q
    ||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | | ||| |||||||     
24929073 ccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattga 24928975  T
219 acaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 316  Q
    ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |     
24928974 acaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttc 24928875  T
317 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
24928874 accaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttgg 24928818  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120952
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| |||||    
30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatca 30120952  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 43685584 - 43685656
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43685584 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 5238125 - 5238197
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5238125 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24661473 - 24661401
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24661473 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
303 aaacatggaatctaaccaacaat 325  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
303 aaacatggaatctaaccaacaat 325  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
303 aaacatggaatctaaccaacaat 325  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674414
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  | |||    
16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataac 16674574  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||    
16674573 atcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaac 16674474  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| |||||    
16674473 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatca 16674414  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
96 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||     
23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa 76  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
22321654 catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa 22321597  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246735
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 41246711  T
194 tattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
      ||| || |||||||||||||||    
41246712 acttaacaacaacaacatcaattg 41246735  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
23217924 catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 23218004  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662492
Alignment:
98 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaa 168  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaa 13662492  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Original strand, 22981241 - 22981299
Alignment:
22 caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
22981241 caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac 22981299  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41507177 - 41507116
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
41507177 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 41507116  T

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Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16744508 - 16744142
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16744508 aatgagatcaacatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 16744409  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
16744408 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaaca 16744309  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
16744308 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaa 16744209  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16744208 atgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttgg 16744142  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 112 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912515
Alignment:
112 caaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacat 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||    
17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
212 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 17912515  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15859051
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 15859051  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030174
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 12030174  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842588
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 14842588  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936654
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg 15936654  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449265
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 2449265  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158045
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 291  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
292 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 51158045  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050046
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttgg 2050046  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 13838783 - 13839130
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaaca 118  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | || ||        |||||| |||||||| ||| ||    
13838783 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcattcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgta--------attcaccaatttcacaaaacca 13838874  T
119 ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc 218  Q
    ||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |||||||||||     
13838875 ccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattga 13838973  T
219 acaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 316  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| |     
13838974 acaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttc 13839073  T
317 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13839074 accatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 13839130  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468520
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt-cacaaatttcaccaaaac 117  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
15468717 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac 15468618  T
118 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
15468617 aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 15468520  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938496
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttgg 15938496  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275285
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttc-ctcaattcacaaatttcaccaaaac 117  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
22275088 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac 22275187  T
118 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
22275188 accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 22275285  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 356
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615053
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaa 356  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaa 15615053  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 366
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
98 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctatt 197  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | |    
16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
198 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 294  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
295 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316449
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 55316449  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45861041
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 45860871  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
45860872 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 45860971  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
45860972 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg 45861041  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270305
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 41270305  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954917
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg 13954917  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975749
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13975919  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
13975918 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 13975819  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13975818 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg 13975749  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2449463 - 2449391
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
2449463 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231994
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaa 19231994  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
18969968 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12265053 - 12264932
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 234  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  || ||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
12265053 ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 12264954  T
235 aattcaactacaacatgtcaaa 256  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
12264953 atttcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 48421624 - 48421685
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
48421624 catcaacaattaaccacaaccacaatttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 48421685  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11329214 - 11329098
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 233  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||| | | ||||||  |||||| |||||||||||||||  || ||||| || |     
11329214 ttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatca 11329115  T
234 caattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||| |||||||    
11329114 caattcaacaacaacat 11329098  T

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Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Original strand, 26680070 - 26680436
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
26680070 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatt 26680169  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26680170 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 26680269  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
26680270 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaac 26680369  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26680370 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 26680436  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675116
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 15675116  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 95 - 372
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246665
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 372  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 13246665  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118278
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 54118278  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488798
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 10488798  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327953
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 16327953  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104277
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||                   |||||||    
10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa-------------------caacaac 10104443  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 10104277  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644449
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||  | |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 10644449  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 237  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13048517 - 13048248
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||||| || |||  |    
13048517 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaactatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattca 13048419  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | |||||   ||| ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
13048418 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt 13048319  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
13048318 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattgaagttgg 13048248  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122125
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
368 agttgg 373  Q
    ||||||    
122120 agttgg 122125  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357884
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatca 47357884  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 10488600 - 10488672
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10488600 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16328134 - 16328079
Alignment:
25 caatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
16328134 caatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaac 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 204  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||   ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
205 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 19559410 - 19559471
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
19559410 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaac 19559471  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885581
Alignment:
203 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
300 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||    
40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttgg 40885581  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41166172 - 41166083
Alignment:
161 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
41166172 atacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185981
Alignment:
163 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
7186068 acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 338 - 373
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33240936
Alignment:
338 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 33240936  T

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Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Original strand, 7292886 - 7293252
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
7292886 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 7292985  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
7292986 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 7293085  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
7293086 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 7293185  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
7293186 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 7293252  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13037041
Alignment:
94 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatt 291  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
292 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 13037041  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580766
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttgg 11580766  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481060
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt 47481060  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36052900
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |   ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta---acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttgg 36052900  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516463
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 11516463  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441591
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 15441591  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262156
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 30262156  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212002
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 16212002  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253862
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg 18253862  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478985
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 305  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
306 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 365  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc 16478985  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321250
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaaca 307  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| | |  ||||||| | |||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||||  || |||||    
13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt 13321250  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572906
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13572906  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060202
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  | ||||||| ||||||  ||| |||||||| || || |||||| |||||||||    
3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||    
3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttgg 3060202  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989639
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 10989639  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911046
Alignment:
124 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
224 aatcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 319  Q
    ||||| | ||||| ||||| |||||   | |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
320 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437687
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 301  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
302 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292365
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |   |||| ||| | || |||  |    
25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattca 25292535  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |   | |||||| | |||  ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
25292534 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatattta 25292435  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
25292434 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttgg 25292365  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 11516265 - 11516337
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11516265 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15441789 - 15441717
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15441789 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30262354 - 30262282
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30262354 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 296006
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattc-aactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 304  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | |||||| |||  |||  | |  ||||||| |||||||   | |||||| |||||||||||||| |||||| || |    
296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
305 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 360  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| |||||||||    
296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacata 296006  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 13351999 - 13352079
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
13351999 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 13352079  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||   | ||||||    
17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37459 - 37093
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
37459 aatgagatcaacattaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 37360  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
37359 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 37260  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
37259 acatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaac 37160  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37159 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 37093  T

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Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794731
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatt 291  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
292 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 19794731  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982468
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttgg 36982468  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341417
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 372  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 24341417  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689428
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 19689428  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820307
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 23820307  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891478
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttgg 8891478  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265419
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagtt 25265419  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906467
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 14906467  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 462706 - 462974
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| || | |    
462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttgg 462974  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015247
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttgg 20015247  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642991
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 43642991  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
208 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627340
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || | |    
20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttgg 20627340  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886683
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 19886683  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396680
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||  |||| ||| | || |||  |    
17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattca 17396850  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
17396849 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 17396750  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
17396749 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg 17396680  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14906665 - 14906593
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14906665 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 20015049 - 20015121
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20015049 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 23820109 - 23820181
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
23820109 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19689600 - 19689554
Alignment:
34 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19689600 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
161 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
19669335 atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 25601911 - 25601972
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
25601911 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 25601972  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

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Target: scaffold0195 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19442
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 19442  T

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Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21526
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 21526  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36940
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 36940  T

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Target: chr6 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153683
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 23153683  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626152
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 14626152  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009468
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagtt 35009468  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657777
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagtt 1657777  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862705
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
15862543 cat-aaatgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt 15862705  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650127
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca 1650127  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175787
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 360  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27654005
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatca 27654005  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| || | ||||||   ||  | |||| |    
27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 242  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825774
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||  |||| |||   || |||  |    
16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattca 16825940  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaa--catgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||   | |  |||| || | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
16825939 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 16825840  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |  ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
16825839 gaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 16825774  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 249  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889853
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
15889914 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaac 15889853  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 366
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751654
Alignment:
317 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27751654  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
120 caacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||||| | || |||  |||||| |||||||||||||||     
22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
219 acaagaat 226  Q
    ||| ||||    
22361933 acatgaat 22361926  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25640760 - 25640702
Alignment:
22 caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
25640760 caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac 25640702  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15005114 - 15005034
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
15005114 catcaataatcaactacaaccacaacttataatcattcattctatcacaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 15005034  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22585754 - 22585674
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
22585754 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt 22585674  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22590585 - 22590505
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
22590585 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt 22590505  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25367490 - 25367374
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 233  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||| | ||| |  | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
25367490 ttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatca 25367391  T
234 caattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||| |||||||    
25367390 caattcaacaacaacat 25367374  T

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Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18531094
Alignment:
114 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||    
18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
214 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 18531094  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507194
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 23507194  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053860
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttgg 22053860  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182574
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||     
27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 27182574  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623205
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 20623205  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233555
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 21233555  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 238 - 373
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37052980
Alignment:
238 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
337 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 37052980  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536433
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 16536433  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939511
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || |  || | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt 34939511  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900433
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 25900433  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18778014
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | ||  ||  |    
18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18778014  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366503
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 22366503  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426858
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 25426858  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12604
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 12604  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17471956 - 17471768
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaaca 118  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | |||||        |||||| |||||||||||||||    
17471956 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaatttcaccaaaaca 17471865  T
119 ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
17471864 ccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 17471768  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4200007
Alignment:
125 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
225 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 321  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
322 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 4200007  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500129
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||| | || |||  |    
19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 19500129  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073617
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||    
21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatca 21073617  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010071
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27010071  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443417
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||  |    ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 43443417  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 20623007 - 20623079
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20623007 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21233753 - 21233681
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21233753 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190478
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat 29190478  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188306
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 29188306  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25900630 - 25900558
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25900630 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 37052782 - 37052854
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
37052782 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 16536235 - 16536307
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
16536235 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 250
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862319
Alignment:
117 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
19862186 caccaacaacaactcat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat 19862284  T
216 tgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    |||||| || || || | ||||||||| |||||||    
19862285 tgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat 19862319  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23494029
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 204  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
23493885 tttcaccaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 23493983  T
205 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
23493984 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 23494029  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 2031697 - 2031758
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
2031697 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 2031758  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1360
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttgg 1360  T

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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3609
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||| |||| |    
3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 3609  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9078
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||| |||    
8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 9078  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 148688 - 148957
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | |    
148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 148957  T

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Target: chr1 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20445908
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 20445908  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931581
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  | |  ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 20931581  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531673
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatca 20531673  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893653
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||     
20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 20893653  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452727
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 51452727  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913266
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| |||||  ||  ||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 20913266  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228022
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22228022  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232719
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22232719  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116484
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
213 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 373
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394458
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 305  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
306 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttgg 41394458  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844477
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttgg 37844477  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601140
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 51452530 - 51452602
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51452530 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051652
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca 45051652  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072410
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatca 5072410  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 127
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
96 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48834
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| | |  ||||||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 48834  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||| | || |||  | |||    
36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 983
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |    
1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 983  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48423
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg 48423  T

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Target: scaffold0302 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 371
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12347
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  | ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagtt 12347  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123198
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||| || | |    
123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca 123198  T

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Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

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Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22776
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 22776  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27031
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 27031  T

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Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 22578 - 22650
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22578 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

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Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 26833 - 26905
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26833 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1609
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 1609  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1807 - 1735
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
1807 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41882
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||    
41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt 41882  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 6091
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| |    
6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 6091  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 107715 - 107983
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | || ||||||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg 107983  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64585
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcataca 331  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T

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Target: scaffold0215 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128197
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| ||  |||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 372  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 128197  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
125 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
225 atcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 320  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||   | |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
321 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

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Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 127
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
99 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13740
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||    
13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagtt 13740  T

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Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Original strand, 41686 - 41965
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |     
41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 41965  T

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Target: scaffold0498 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9107
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatca 9107  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247469
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg 247469  T

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Target: scaffold0218 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 5088
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| |||||  ||  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttgg 5088  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3192
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
213 aatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    ||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatca 3192  T

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Target: scaffold1542 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 561
Alignment:
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | | |    
828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 305  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| | |  ||||||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
306 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 561  T

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Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 237
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 237  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Original strand, 171863 - 172141
Alignment:
96 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 195  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
171863 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 171961  T
196 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 293  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
171962 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 172061  T
294 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
172062 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttgg 172141  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Original strand, 177566 - 177844
Alignment:
96 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 195  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
177566 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 177664  T
196 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 293  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
177665 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 177764  T
294 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
177765 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttgg 177844  T

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Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

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Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 171794 - 171855
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
171794 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 171855  T

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Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 177497 - 177558
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
177497 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 177558  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34489
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
208 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 304  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
305 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt 34489  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26442
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| | |  ||||||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttgg 26442  T

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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8209
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||   ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
8366 aattgaacatggttctcatcataattca---acaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt 371  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagtt 8209  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 365
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 365  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272261
Alignment:
96 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 195  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||   | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
271983 aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 272081  T
196 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 293  Q
    ||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
272082 ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 272181  T
294 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
272182 ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttgg 272261  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 3 - 265
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 265  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| |  | |||  |    
14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21138
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| | || |||  |    
21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca 21138  T

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Target: scaffold0772 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5765
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
368 agttgg 373  Q
    ||||||    
5760 agttgg 5765  T

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Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
206 caacatcaattgcacaagaatca 228  Q
     |||||||| || ||||||||||    
48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

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Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
206 caacatcaattgcacaagaatca 228  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13347
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13347  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51209
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
368 agttgg 373  Q
    ||||||    
51214 agttgg 51209  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89481
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
368 agttgg 373  Q
    ||||||    
89486 agttgg 89481  T

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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 79533 - 79616
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
79533 ttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg 79616  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1326
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 1326  T

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Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1863
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaa 1863  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3252
Alignment:
114 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaa 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaa 3252  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Original strand, 54412 - 54630
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 234  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
54412 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 54511  T
235 aattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatac 330  Q
    | |||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||    
54512 atttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatac 54610  T
331 acttattatcaattcatgca 350  Q
    | |||| |||||||||||||    
54611 aattatcatcaattcatgca 54630  T

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Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Original strand, 45007 - 45051
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattca 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
45007 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattca 45051  T

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Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||  | || |||    
77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132420
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 132444  T
194 tattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
      ||| || |||||||||||||||    
132443 acttaacaacaacaacatcaattg 132420  T

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Target: scaffold0483 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1028
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
1089 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 1028  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45815
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
45876 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 45815  T

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Target: scaffold1734 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 1286 - 1347
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
1286 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 1347  T

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Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12068 - 12007
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| || ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
12068 catcaacaattaaacacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 12007  T

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Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

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Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 3406 - 3467
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
3406 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 3467  T

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Target: scaffold0122 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24557 - 24496
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
24557 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 24496  T

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Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

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Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2532
Alignment:
161 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||    
2476 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

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Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1705 - 1629
Alignment:
23 aacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||| || ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
1705 aacaattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 1629  T

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