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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9457_low_4 (Length: 373)
Name: NF9457_low_4
Description: NF9457
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9457_low_4 |
 |  |
|
| [»] chr8 (28 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (31 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr4 (23 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (25 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (22 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0195 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (20 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (30 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0266 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0025 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0023 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0141 (4 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0124 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0026 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0215 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0529 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1542 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (5 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0369 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0420 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0028 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1711 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1404 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0361 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22907607 - 22907241
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22907607 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt |
22907508 |
T |
 |
| Q |
108 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22907507 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
22907408 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22907407 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac |
22907308 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22907307 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
22907241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238323
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5238184 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
5238283 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238284 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
5238323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661275
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
24661414 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
24661315 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661314 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
24661275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685782
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
43685643 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
43685742 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685743 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
43685782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549211
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
24548956 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
24549055 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24549056 |
aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
24549155 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24549156 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
24549211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373495
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
43373761 |
tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
43373665 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43373664 |
tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
43373565 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
43373564 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttgg |
43373495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193743
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
16194005 |
aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc |
16193906 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||| || |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16193905 |
aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
16193806 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16193805 |
aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
16193743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774280
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||| |
|
|
| T |
6774535 |
aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc |
6774436 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6774435 |
aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
6774336 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6774335 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
6774280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16405002
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
16405268 |
tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa |
16405169 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| | | ||||| |
|
|
| T |
16405168 |
taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaattta---acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg |
16405072 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16405071 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
16405002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345803
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |
|
|
| T |
17345540 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa |
17345639 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | | |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
17345640 |
tatcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac |
17345738 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
17345739 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagtt |
17345803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844594
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
21844856 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
21844758 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21844757 |
taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt |
21844658 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21844657 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
21844594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851987
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
21852249 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
21852151 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21852150 |
taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt |
21852051 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21852050 |
aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
21851987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24929165 - 24928818
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaaca |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | || || |||||| |||||||| ||| || |
|
|
| T |
24929165 |
catcaacaattaaccacaaccagaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgta--------attcaccaatttcacaaaacca |
24929074 |
T |
 |
| Q |
119 |
ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||| ||||||| |
|
|
| T |
24929073 |
ccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattga |
24928975 |
T |
 |
| Q |
219 |
acaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta |
316 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||| |||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
24928974 |
acaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttc |
24928875 |
T |
 |
| Q |
317 |
accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
24928874 |
accaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttgg |
24928818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120952
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
30120690 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
30120788 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
30120789 |
taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
30120888 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30120889 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatca |
30120952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 43685584 - 43685656
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43685584 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
43685656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 5238125 - 5238197
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5238125 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
5238197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24661473 - 24661401
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24661473 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
24661401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
222975 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
222877 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
222876 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
222777 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaat |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
222776 |
gaacatgtaatttcaccaacaat |
222754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
736598 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
736500 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
736499 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
736400 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaat |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
736399 |
gaacatgtaatttcaccaacaat |
736377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
860493 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
860395 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
860394 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
860295 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaat |
325 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
860294 |
gaacatgtaatttcaccaacaat |
860272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674414
Alignment:
| Q |
110 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | ||| |
|
|
| T |
16674672 |
accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataac |
16674574 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||| |
|
|
| T |
16674573 |
atcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaac |
16674474 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
16674473 |
atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatca |
16674414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
| Q |
96 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
194 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
23837154 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca |
23837252 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23837253 |
cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat |
23837308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa |
76 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
22321654 |
catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa |
22321597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246735
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | ||||| |
|
|
| T |
41246613 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg |
41246711 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattg |
217 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41246712 |
acttaacaacaacaacatcaattg |
41246735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
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| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
23217924 |
catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
23218004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662492
Alignment:
| Q |
98 |
ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaa |
168 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
13662561 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaa |
13662492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Original strand, 22981241 - 22981299
Alignment:
| Q |
22 |
caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22981241 |
caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac |
22981299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41507177 - 41507116
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41507177 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
41507116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16744508 - 16744142
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16744508 |
aatgagatcaacatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt |
16744409 |
T |
 |
| Q |
108 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16744408 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaaca |
16744309 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16744308 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaa |
16744209 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16744208 |
atgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttgg |
16744142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 112 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912515
Alignment:
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211 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||| |
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|
| T |
17912771 |
caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat |
17912672 |
T |
 |
| Q |
212 |
caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17912671 |
cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt |
17912572 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
367 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17912571 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
17912515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15859051
Alignment:
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95 |
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194 |
Q |
| |
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|||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
15859331 |
caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
15859232 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
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|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
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| T |
15859231 |
attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
15859132 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
15859131 |
gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
15859051 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030174
Alignment:
| Q |
106 |
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205 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12030443 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca |
12030344 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||||||||| | |||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| |
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| T |
12030343 |
tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg |
12030244 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
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|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
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| T |
12030243 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
12030174 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842588
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
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| T |
14842856 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca |
14842758 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
14842757 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg |
14842658 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
14842657 |
aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
14842588 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936654
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
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| T |
15936922 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
15936824 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |
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|
| T |
15936823 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
15936724 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
15936723 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg |
15936654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449265
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235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2449404 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
2449305 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2449304 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
2449265 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158045
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
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|
| T |
51158325 |
caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc |
51158227 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt |
291 |
Q |
| |
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|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |
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|
| T |
51158226 |
aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt |
51158127 |
T |
 |
| Q |
292 |
tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51158126 |
tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050046
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
2049777 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
2049876 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| || || |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
2049877 |
tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg |
2049976 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
2049977 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttgg |
2050046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 373
Target Start/End: Original strand, 13838783 - 13839130
Alignment:
| Q |
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catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaaca |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | || || |||||| |||||||| ||| || |
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|
| T |
13838783 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcattcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgta--------attcaccaatttcacaaaacca |
13838874 |
T |
 |
| Q |
119 |
ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| || ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||||||| |
|
|
| T |
13838875 |
ccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattga |
13838973 |
T |
 |
| Q |
219 |
acaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
13838974 |
acaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttc |
13839073 |
T |
 |
| Q |
317 |
accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13839074 |
accatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
13839130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468520
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| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt-cacaaatttcaccaaaac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15468717 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac |
15468618 |
T |
 |
| Q |
118 |
accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
215 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
15468617 |
aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat |
15468520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938496
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
15938764 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
15938666 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |
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|
| T |
15938665 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
15938566 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
15938565 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttgg |
15938496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275285
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19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttc-ctcaattcacaaatttcaccaaaac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22275088 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac |
22275187 |
T |
 |
| Q |
118 |
accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22275188 |
accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat |
22275285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 356
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615053
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15614808 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
15614907 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
15614908 |
aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
15615007 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaa |
356 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15615008 |
aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaa |
15615053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 366
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
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| |
|
||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | | |
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16821099 |
ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat |
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T |
 |
| Q |
198 |
agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct |
294 |
Q |
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| T |
16821198 |
aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt |
16821297 |
T |
 |
| Q |
295 |
acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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|||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16821298 |
acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca |
16821369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316449
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205 |
Q |
| |
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| T |
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tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
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T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
55316286 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
55316385 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
55316386 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
55316449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45861041
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
45860773 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
45860871 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | || ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
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| T |
45860872 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt |
45860971 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45860972 |
aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg |
45861041 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
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212 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||| |
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|
| T |
47984624 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc |
47984723 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
248 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
47984724 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
47984759 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
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| Q |
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||| |
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| T |
48003198 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc |
48003297 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
248 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
48003298 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
48003333 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270305
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | |
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| T |
41270043 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
41270141 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
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|
| T |
41270142 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
41270241 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41270242 |
gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
41270305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954917
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | |
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|
| T |
13955185 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
13955087 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | || ||||| | | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
13955086 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt |
13954987 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13954986 |
aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg |
13954917 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975749
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
13976017 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
13975919 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | || ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
13975918 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt |
13975819 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13975818 |
aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg |
13975749 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
47993911 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc |
47994010 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
248 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
47994011 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
47994046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
48012484 |
aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc |
48012583 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac |
248 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
48012584 |
aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac |
48012619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2449463 - 2449391
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2449463 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
2449391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231994
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19231945 |
tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaa |
19231994 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
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| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
18969968 |
catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
18970048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22144564 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
22144532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12265053 - 12264932
Alignment:
| Q |
135 |
ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| | || | |||||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
12265053 |
ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc |
12264954 |
T |
 |
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaa |
256 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
12264953 |
atttcaacaacaacatatcaaa |
12264932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 48421624 - 48421685
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || || ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48421624 |
catcaacaattaaccacaaccacaatttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
48421685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11329214 - 11329098
Alignment:
| Q |
135 |
ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| || | |
|
|
| T |
11329214 |
ttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatca |
11329115 |
T |
 |
| Q |
234 |
caattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11329114 |
caattcaacaacaacat |
11329098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Original strand, 26680070 - 26680436
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
26680070 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatt |
26680169 |
T |
 |
| Q |
108 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26680170 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
26680269 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26680270 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaac |
26680369 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26680370 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
26680436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675116
Alignment:
| Q |
110 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||| |
|
|
| T |
15675381 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac |
15675282 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
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| T |
15675281 |
atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
15675182 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15675181 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 95 - 372
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246665
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194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
13246485 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
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|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13246486 |
attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
13246585 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg |
372 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13246586 |
gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg |
13246665 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
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Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
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212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
31115603 |
aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc |
31115702 |
T |
 |
| Q |
213 |
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310 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
31115703 |
aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt |
31115802 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31115803 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
31115865 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118278
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| Q |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
54118551 |
caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
54118452 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| || |
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| T |
54118451 |
attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt |
54118352 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118351 |
gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
54118278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488798
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
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|
| T |
10488659 |
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T |
 |
| Q |
334 |
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373 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10488759 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
10488798 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327953
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| Q |
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aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16328092 |
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16327993 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16327992 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
16327953 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104277
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| Q |
110 |
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209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10104523 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa-------------------caacaac |
10104443 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
10104442 |
atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
10104343 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10104342 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
10104277 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644449
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205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
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10644285 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10644286 |
taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt |
10644385 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10644386 |
gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
10644449 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
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| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
111362 |
tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
111461 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
111462 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
111493 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13048517 - 13048248
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || ||| ||||| || ||| | |
|
|
| T |
13048517 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaactatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattca |
13048419 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
13048418 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt |
13048319 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13048318 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattgaagttgg |
13048248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122125
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367 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
122020 |
gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac |
122119 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
122120 |
agttgg |
122125 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357884
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| Q |
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
47357622 |
tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
47357720 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
47357721 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
47357820 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47357821 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatca |
47357884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
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8 |
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Q |
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|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
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Q |
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|
|
| T |
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caatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
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T |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
7849970 |
caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| |||||| | | |||||| |||||| || |
|
|
| T |
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tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca |
15044892 |
T |
 |
| Q |
205 |
acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15044893 |
acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat |
15044938 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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Q |
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|
|
| T |
19559410 |
catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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299 |
Q |
| |
|
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|
|
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caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac |
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T |
 |
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tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
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Q |
| |
|
||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
40885654 |
tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttgg |
40885581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41166172 - 41166083
Alignment:
| Q |
161 |
atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41166172 |
atacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat |
41166083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44055870 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
44055902 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185981
Alignment:
| Q |
163 |
acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7186068 |
acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat |
7185981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 338 - 373
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33240936
Alignment:
| Q |
338 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33240901 |
atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
33240936 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Original strand, 7292886 - 7293252
Alignment:
| Q |
8 |
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107 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7292886 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt |
7292985 |
T |
 |
| Q |
108 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7292986 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
7293085 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7293086 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac |
7293185 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7293186 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
7293252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13037041
Alignment:
| Q |
94 |
tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
13037322 |
tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc |
13037223 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatt |
291 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
13037222 |
aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt |
13037123 |
T |
 |
| Q |
292 |
tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13037122 |
tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
13037041 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580766
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
11581035 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
11580936 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |
|
|
| T |
11580935 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
11580836 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
11580835 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttgg |
11580766 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481060
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | | | |||||| |
|
|
| T |
47481320 |
aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc |
47481221 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg |
309 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47481220 |
aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg |
47481122 |
T |
 |
| Q |
310 |
gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47481121 |
taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt |
47481060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36052900
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
36052634 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
36052733 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | ||||| | | ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36052734 |
caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta---acaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
36052830 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
36052831 |
aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttgg |
36052900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516463
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
11516324 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
11516423 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11516424 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
11516463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441591
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15441730 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
15441631 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15441630 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
15441591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262156
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30262295 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
30262196 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30262195 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
30262156 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212002
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
16211733 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
16211832 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16211833 |
taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
16211932 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16211933 |
aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
16212002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253862
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
18254130 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
18254032 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
18254031 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
18253932 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
18253931 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg |
18253862 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478985
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| | |
|
|
| T |
16479244 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
16479145 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | ||||| | || | ||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || |
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| T |
16479144 |
acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa |
16479045 |
T |
 |
| Q |
306 |
catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc |
365 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16479044 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc |
16478985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321250
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
13320988 |
aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc |
13321087 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaaca |
307 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| | | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |
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|
| T |
13321088 |
aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaaca |
13321186 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
13321187 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt |
13321250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572906
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
13572644 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
13572742 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13572743 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt |
13572842 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13572843 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13572906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060202
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |
|
|
| T |
3059933 |
tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca |
3060032 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| |||||| ||| |||||||| || || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3060033 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt |
3060131 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
3060132 |
gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttgg |
3060202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989639
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
10989378 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
10989476 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | || ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
10989477 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
10989575 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10989576 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
10989639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911046
Alignment:
| Q |
124 |
aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | ||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
13911292 |
aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg |
13911193 |
T |
 |
| Q |
224 |
aatcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc |
319 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
13911192 |
aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc |
13911093 |
T |
 |
| Q |
320 |
aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13911092 |
aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13911046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437687
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
2437425 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
2437523 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt |
301 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | |||| | ||| ||||| | | ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
2437524 |
taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata |
2437622 |
T |
 |
| Q |
302 |
taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2437623 |
tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
2437687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292365
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| | |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
25292633 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattca |
25292535 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | |||||| | ||| ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
25292534 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatattta |
25292435 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25292434 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttgg |
25292365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 11516265 - 11516337
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11516265 |
aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac |
11516337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15441789 - 15441717
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15441789 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
15441717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30262354 - 30262282
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30262354 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
30262282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 296006
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | |||||||||| |||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
296257 |
caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa |
296161 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattc-aactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaa |
304 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| | | |||||| ||| ||| | | ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
296160 |
catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca |
296062 |
T |
 |
| Q |
305 |
acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata |
360 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
296061 |
acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacata |
296006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 13351999 - 13352079
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
13351999 |
catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
13352079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822723 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
15822691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
17224230 |
caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc |
17224132 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| || || || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17224131 |
acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat |
17224075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 8 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37459 - 37093
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt |
107 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37459 |
aatgagatcaacattaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatt |
37360 |
T |
 |
| Q |
108 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37359 |
tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca |
37260 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
37259 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaac |
37160 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37159 |
atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
37093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794731
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19795011 |
caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
19794913 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatt |
291 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
19794912 |
aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt |
19794813 |
T |
 |
| Q |
292 |
tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19794812 |
tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
19794731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982468
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
36982737 |
tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa |
36982638 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36982637 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
36982538 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36982537 |
aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttgg |
36982468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341417
Alignment:
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110 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||| |
|
|
| T |
24341681 |
accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac |
24341582 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
24341581 |
atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
24341482 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg |
372 |
Q |
| |
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| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24341481 |
tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg |
24341417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689428
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19689567 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
19689468 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19689467 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
19689428 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820307
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23820168 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
23820267 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23820268 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
23820307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891478
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | | | |
|
|
| T |
8891209 |
tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca |
8891308 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |
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|
| T |
8891309 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
8891408 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8891409 |
aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttgg |
8891478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265419
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
25265679 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc |
25265580 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || | | |||||||| ||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
25265579 |
aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt |
25265480 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25265479 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagtt |
25265419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906467
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14906606 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
14906507 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906506 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
14906467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 462706 - 462974
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || | | |
|
|
| T |
462706 |
tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca |
462804 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
462805 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt |
462903 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
462904 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttgg |
462974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015247
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
20015108 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat |
20015207 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20015208 |
tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttgg |
20015247 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642991
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||| |
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|
| T |
43643250 |
tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa |
43643154 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| | | ||||| |
|
|
| T |
43643153 |
tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg |
43643054 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43643053 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
43642991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
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| Q |
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caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| | |
|
|
| T |
7508138 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
7508039 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
7508038 |
acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg |
7507941 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7507940 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
7507894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627340
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || | | |
|
|
| T |
20627609 |
tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca |
20627510 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| || || |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20627509 |
taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg |
20627410 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20627409 |
gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttgg |
20627340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886683
Alignment:
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
19886945 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
19886847 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
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| T |
19886846 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat |
19886747 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19886746 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
19886683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396680
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| || |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
17396948 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattca |
17396850 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | || ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |
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| T |
17396849 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt |
17396750 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17396749 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg |
17396680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14906665 - 14906593
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8 |
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Q |
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|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906665 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
14906593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 20015049 - 20015121
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8 |
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|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20015049 |
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20015121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 23820109 - 23820181
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| |
|
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|
|
| T |
23820109 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19689600 - 19689554
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34 |
acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
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Q |
| |
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|
| T |
19689600 |
acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
19689554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
| Q |
161 |
atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19669335 |
atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
19669279 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 25601911 - 25601972
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25601911 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
25601972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32465813 |
caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca |
32465845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19442
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
19173 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa |
19272 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19273 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
19372 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19373 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
19442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21526
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
21257 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa |
21356 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21357 |
taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
21456 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21457 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
21526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36940
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
37209 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca |
37110 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | | ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37109 |
taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
37010 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37009 |
aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
36940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153683
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
23153403 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca |
23153502 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | || |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
23153503 |
attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
23153602 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23153603 |
gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
23153683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626152
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
14626407 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
14626308 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg |
309 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||| | || |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14626307 |
aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg |
14626209 |
T |
 |
| Q |
310 |
gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14626208 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
14626152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009468
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |
|
|
| T |
35009735 |
tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa |
35009636 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || | | |||||||| ||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
35009635 |
caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg |
35009536 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
35009535 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagtt |
35009468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657777
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |
|
|
| T |
1658040 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa |
1657941 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | | |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
1657940 |
catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac |
1657842 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
1657841 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagtt |
1657777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862705
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |
|
|
| T |
15862443 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa |
15862542 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
||| || || |||||||||||| |||||||| || | ||| | | |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
15862543 |
cat-aaatgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac |
15862640 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
15862641 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt |
15862705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650127
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |||||| |
|
|
| T |
1650382 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc |
1650283 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1650282 |
aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt |
1650183 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
1650182 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca |
1650127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 360
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175787
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
25175531 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
25175629 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
25175630 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
25175729 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata |
360 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25175730 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata |
25175787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27654005
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
27654267 |
tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
27654169 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
27654168 |
taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
27654069 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
27654068 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatca |
27654005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| || | |||||| || | |||| | |
|
|
| T |
27740808 |
caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca |
27740907 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac |
242 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27740908 |
catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac |
27740941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825774
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||| |||| ||| || ||| | |
|
|
| T |
16826038 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattca |
16825940 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaa--catgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||| | | |||| || | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
16825939 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
16825840 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16825839 |
gaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
16825774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
18381975 |
caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc |
18381877 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca |
249 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18381876 |
acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca |
18381821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889853
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
15889914 |
catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaac |
15889853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 366
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751654
Alignment:
| Q |
317 |
accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27751605 |
accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
27751654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
| Q |
120 |
caacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| | || ||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22362032 |
caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga |
22361934 |
T |
 |
| Q |
219 |
acaagaat |
226 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
22361933 |
acatgaat |
22361926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25640760 - 25640702
Alignment:
| Q |
22 |
caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25640760 |
caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac |
25640702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898745 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
32898774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15005114 - 15005034
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt |
99 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
15005114 |
catcaataatcaactacaaccacaacttataatcattcattctatcacaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
15005034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22585754 - 22585674
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
22585754 |
catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt |
22585674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22590585 - 22590505
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
22590585 |
catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt |
22590505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25367490 - 25367374
Alignment:
| Q |
135 |
ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||| | ||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | |
|
|
| T |
25367490 |
ttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatca |
25367391 |
T |
 |
| Q |
234 |
caattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25367390 |
caattcaacaacaacat |
25367374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18531094
Alignment:
| Q |
114 |
aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||| |
|
|
| T |
18531355 |
aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca |
18531256 |
T |
 |
| Q |
214 |
attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
18531255 |
attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt |
18531157 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18531156 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
18531094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507194
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
23506932 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
23507031 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23507032 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
23507131 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23507132 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
23507194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053860
Alignment:
| Q |
110 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||| |
|
|
| T |
22054125 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac |
22054026 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
22054025 |
atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
22053926 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22053925 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttgg |
22053860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182574
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
194 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
27182854 |
caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
27182755 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
27182754 |
attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
27182655 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27182654 |
gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
27182574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623205
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20623066 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
20623165 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623166 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
20623205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233555
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21233694 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
21233595 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233594 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
21233555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 238 - 373
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37052980
Alignment:
| Q |
238 |
tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat |
336 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37052844 |
tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat |
37052943 |
T |
 |
| Q |
337 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37052944 |
tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
37052980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536433
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16536294 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
16536393 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16536394 |
tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
16536433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 371
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939511
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| || |
|
|
| T |
34939248 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa |
34939347 |
T |
 |
| Q |
209 |
catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||| |||||||| || | || | | |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |
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|
| T |
34939348 |
catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac |
34939446 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
34939447 |
atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt |
34939511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900433
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25900571 |
aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat |
25900473 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900472 |
tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
25900433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18778014
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || || | |
|
|
| T |
18778276 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca |
18778178 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
18778177 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
18778078 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18778077 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
18778014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366503
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
22366765 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
22366667 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
22366666 |
taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
22366567 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22366566 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
22366503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426858
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
25426596 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
25426694 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
25426695 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
25426794 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25426795 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
25426858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12604
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
12342 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
12440 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| | |
|
|
| T |
12441 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat |
12540 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12541 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
12604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17471956 - 17471768
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaaca |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17471956 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaatttcaccaaaaca |
17471865 |
T |
 |
| Q |
119 |
ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
17471864 |
ccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat |
17471768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4200007
Alignment:
| Q |
125 |
acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | ||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
4200251 |
acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga |
4200152 |
T |
 |
| Q |
225 |
atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa |
321 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
4200151 |
atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa |
4200052 |
T |
 |
| Q |
322 |
caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4200051 |
caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
4200007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500129
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
19499867 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca |
19499965 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
19499966 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
19500065 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19500066 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
19500129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073617
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
21073879 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga |
21073781 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
21073780 |
taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat |
21073681 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21073680 |
gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatca |
21073617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010071
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
27009809 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
27009907 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27009908 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt |
27010007 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27010008 |
aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
27010071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443417
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
43443679 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
43443581 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |
|
|
| T |
43443580 |
taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
43443481 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43443480 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
43443417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 20623007 - 20623079
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20623007 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
20623079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21233753 - 21233681
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21233753 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
21233681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190478
Alignment:
| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29190552 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat |
29190478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188306
Alignment:
| Q |
268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29188404 |
gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
29188306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25900630 - 25900558
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| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25900630 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
25900558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 37052782 - 37052854
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| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37052782 |
aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac |
37052854 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 16536235 - 16536307
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16536235 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac |
16536307 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 250
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862319
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117 |
caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19862186 |
caccaacaacaactcat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat |
19862284 |
T |
 |
| Q |
216 |
tgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
|||||| || || || | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19862285 |
tgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat |
19862319 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23494029
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||| |||||| | | |||||| |||||| || |
|
|
| T |
23493885 |
tttcaccaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca |
23493983 |
T |
 |
| Q |
205 |
acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23493984 |
acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat |
23494029 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 2031697 - 2031758
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
2031697 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
2031758 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1360
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | | |
|
|
| T |
1091 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca |
1190 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1191 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
1290 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1291 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttgg |
1360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3609
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
3877 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca |
3779 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |||| | ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3778 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
3679 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3678 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
3609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9078
Alignment:
| Q |
110 |
accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||| ||| |
|
|
| T |
8820 |
accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac |
8919 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca |
307 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| |
|
|
| T |
8920 |
atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca |
9019 |
T |
 |
| Q |
308 |
tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9020 |
tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
9078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 148688 - 148957
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | | |
|
|
| T |
148688 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca |
148787 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
148788 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
148887 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
148888 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
148957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20445908
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
20445646 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca |
20445745 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||| | | || || |
|
|
| T |
20445746 |
taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg |
20445845 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20445846 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
20445908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931581
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
20931312 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
20931411 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||| | | ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
20931412 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg |
20931511 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20931512 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
20931581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531673
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |
|
|
| T |
20531411 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca |
20531510 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||| | | || || |
|
|
| T |
20531511 |
taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg |
20531610 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20531611 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatca |
20531673 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893653
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
20893933 |
caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca |
20893834 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
20893833 |
attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt |
20893734 |
T |
 |
| Q |
293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20893733 |
gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
20893653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452727
Alignment:
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
51452589 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
51452688 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg |
372 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452689 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg |
51452727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913266
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | | |
|
|
| T |
20913004 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca |
20913103 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
| T |
20913104 |
taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg |
20913196 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20913197 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
20913266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228022
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
22227777 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca |
22227875 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22227876 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg |
22227975 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22227976 |
aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
22228022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232719
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
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| T |
22232474 |
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22232572 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
22232573 |
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22232672 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
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|
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| T |
22232673 |
aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
22232719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116484
Alignment:
| Q |
113 |
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212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
2116228 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
2116327 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg |
309 |
Q |
| |
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||||| |||||||| | | |||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
2116328 |
aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg |
2116427 |
T |
 |
| Q |
310 |
gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2116428 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
2116484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 373
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394458
Alignment:
| Q |
109 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca |
207 |
Q |
| |
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| T |
41394191 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
41394290 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa |
305 |
Q |
| |
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| T |
41394291 |
acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa |
41394390 |
T |
 |
| Q |
306 |
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373 |
Q |
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| T |
41394391 |
catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
41394458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844477
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
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| T |
37844746 |
tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
37844648 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttca-taacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
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| T |
37844647 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt |
37844548 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
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| T |
37844547 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttgg |
37844477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601140
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
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| T |
18601402 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
18601304 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
18601303 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
18601204 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
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| T |
18601203 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
18601140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
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| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
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|
| T |
45051416 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc |
45051496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 51452530 - 51452602
Alignment:
| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51452530 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
51452602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051652
Alignment:
| Q |
268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
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| T |
45051554 |
gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca |
45051652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072410
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
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| T |
5072672 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca |
5072574 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
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| T |
5072573 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat |
5072474 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |
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|
| T |
5072473 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatca |
5072410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 127
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
| Q |
96 |
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127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967607 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
49967638 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48834
Alignment:
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106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48565 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca |
48664 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
48665 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg |
48764 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48765 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
48834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
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209 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | || ||| | ||| |
|
|
| T |
36065 |
accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac |
36163 |
T |
 |
| Q |
210 |
atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac |
306 |
Q |
| |
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||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | || |
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| T |
36164 |
atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat |
36263 |
T |
 |
| Q |
307 |
atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36264 |
atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca |
36323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 983
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | |
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|
| T |
1250 |
tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca |
1152 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
1151 |
taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg |
1053 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1052 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48423
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106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
48155 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta |
48253 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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|
| T |
48254 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg |
48353 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
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|
| T |
48354 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg |
48423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 371
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12347
Alignment:
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106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
12083 |
tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca |
12181 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||| | | ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |
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| T |
12182 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta |
12279 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
|||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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| T |
12280 |
aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagtt |
12347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123198
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106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
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Q |
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| T |
123460 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca |
123361 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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|
| T |
123360 |
taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
123261 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
123260 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
123198 |
T |
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Target: scaffold0011; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
255106 |
caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca |
255074 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
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95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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261712 |
caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca |
261680 |
T |
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Target: scaffold0141 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22776
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aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
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| T |
22637 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
22736 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22737 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
22776 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27031
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235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26892 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
26991 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26992 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
27031 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 22578 - 22650
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| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22578 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
22650 |
T |
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Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 26833 - 26905
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8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26833 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
26905 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1609
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235 |
aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1748 |
aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat |
1649 |
T |
 |
| Q |
334 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1648 |
tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
1609 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1807 - 1735
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| Q |
8 |
aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1807 |
aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac |
1735 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41882
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| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
41622 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc |
41721 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg |
309 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || | | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
41722 |
aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg |
41820 |
T |
 |
| Q |
310 |
gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
41821 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt |
41882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 6091
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
6358 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca |
6260 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
6259 |
taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg |
6161 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6160 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
6091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 107715 - 107983
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tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
107715 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
107813 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | || ||||||| | ||| |||||||||| | ||||| |||||| | || |||| |
|
|
| T |
107814 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg |
107913 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
107914 |
aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg |
107983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64585
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
64812 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
64714 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
64713 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt |
64614 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcataca |
331 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
64613 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcataca |
64585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
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aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
9626 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
9527 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
9526 |
atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
9427 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9426 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
9371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
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| Q |
113 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | |||||| |
|
|
| T |
16524 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc |
16425 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | | ||||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16424 |
atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt |
16325 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16324 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
16269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128197
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106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
128464 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca |
128365 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| | |||| | ||| || |||||||||||| ||||| || | |||| |||| |
|
|
| T |
128364 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg |
128266 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg |
372 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
128265 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg |
128197 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
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125 |
acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| || | || ||| | ||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
31942 |
acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga |
31843 |
T |
 |
| Q |
225 |
atcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca |
320 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | |||| |
|
|
| T |
31842 |
atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca |
31743 |
T |
 |
| Q |
321 |
acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
31742 |
acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca |
31697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #3
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tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
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Q |
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||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
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Q |
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| T |
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aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc |
13579 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
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||||| ||| | || | | |||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
|
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| T |
13580 |
aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt |
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T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13680 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagtt |
13740 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0106
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Target: scaffold0106; HSP #1
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194 |
Q |
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|
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|
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caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca |
41784 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt |
292 |
Q |
| |
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|||| || | | | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
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attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt |
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T |
 |
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293 |
ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
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||||||||| | |||| ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41885 |
ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
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T |
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Name: scaffold0498
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Target: scaffold0498; HSP #1
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Q |
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|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||| | |
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tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca |
8944 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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| T |
8945 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg |
9044 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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|||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9045 |
aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0012; HSP #1
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205 |
Q |
| |
|
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|
| T |
247738 |
tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca |
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T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattt--gcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||| | ||| || |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |
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|
| T |
247638 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg |
247539 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
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|||||| ||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
247538 |
aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttgg |
247469 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
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Target: scaffold0218; HSP #1
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Q |
| |
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||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
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| T |
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tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca |
5258 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
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| T |
5257 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
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T |
 |
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304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
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|||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |
|
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| T |
5157 |
aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttgg |
5088 |
T |
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Name: scaffold0529
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Target: scaffold0529; HSP #1
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212 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
2936 |
aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc |
3035 |
T |
 |
| Q |
213 |
aatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg |
309 |
Q |
| |
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|||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||| |
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|
| T |
3036 |
aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg |
3135 |
T |
 |
| Q |
310 |
gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3136 |
taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatca |
3192 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1542 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
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Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
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Target Start/End: Complemental strand, 828 - 561
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207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | | | |
|
|
| T |
828 |
tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata |
729 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa |
305 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||| | | ||||||| | ||| | |||||||||| |||| |||||| | | ||||| || |
|
|
| T |
728 |
acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa |
629 |
T |
 |
| Q |
306 |
catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
628 |
catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg |
561 |
T |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
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9338 |
caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca |
9437 |
T |
 |
| Q |
195 |
attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat |
237 |
Q |
| |
|
|||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9438 |
attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat |
9480 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
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Target: scaffold0001; HSP #1
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195 |
Q |
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|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||| | || ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
171863 |
aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
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T |
 |
| Q |
196 |
ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc |
293 |
Q |
| |
|
||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
171962 |
ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg |
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T |
 |
| Q |
294 |
tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
172062 |
ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttgg |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||| | || ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
177566 |
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T |
 |
| Q |
196 |
ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc |
293 |
Q |
| |
|
||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
177665 |
ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg |
177764 |
T |
 |
| Q |
294 |
tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
177765 |
ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttgg |
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127 |
Q |
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|
|
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caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca |
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catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
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Q |
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|
|
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catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
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T |
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catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
177497 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
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T |
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Target: scaffold0075 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
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207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| | |
|
|
| T |
34755 |
caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata |
34656 |
T |
 |
| Q |
208 |
acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa |
304 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | ||| | |||||||||| |||||| |||| |||| | || | |
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|
| T |
34655 |
acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga |
34556 |
T |
 |
| Q |
305 |
acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
34555 |
acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtt |
34489 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
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| |
|
||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | |
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|
| T |
26710 |
tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca |
26612 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
26611 |
taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg |
26512 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
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| T |
26511 |
aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
26442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8209
Alignment:
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113 |
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212 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
8466 |
aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc |
8367 |
T |
 |
| Q |
213 |
aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || | | |||||| ||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| || |
|
|
| T |
8366 |
aattgaacatggttctcatcataattca---acaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt |
8270 |
T |
 |
| Q |
311 |
aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagtt |
371 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
8269 |
aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagtt |
8209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 365
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
| Q |
106 |
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205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
42965 |
tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca |
43063 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43064 |
taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt |
43163 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc |
365 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
43164 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc |
43226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
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| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || | |||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
5498 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca |
5401 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5400 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt |
5302 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5301 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
5254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:
Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
3690 |
tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca |
3788 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3789 |
taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt |
3888 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3889 |
gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca |
3936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272261
Alignment:
| Q |
96 |
aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta |
195 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
271983 |
aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa |
272081 |
T |
 |
| Q |
196 |
ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc |
293 |
Q |
| |
|
||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| | | ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
272082 |
ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg |
272181 |
T |
 |
| Q |
294 |
tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg |
373 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
272182 |
ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttgg |
272261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Original strand, 3 - 265
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| ||| | || ||| | |
|
|
| T |
3 |
tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca |
101 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
102 |
taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt |
201 |
T |
 |
| Q |
303 |
aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
202 |
aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| | |
|
|
| T |
14344 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca |
14246 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| | ||||| | | | ||||| | | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14245 |
taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc |
14146 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
14145 |
aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca |
14083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21138
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| |||||||| | || ||| | |
|
|
| T |
21399 |
tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca |
21301 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta |
303 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| ||||| | | ||||||| | ||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21300 |
taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg |
21201 |
T |
 |
| Q |
304 |
aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21200 |
aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca |
21138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5765
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268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
367 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5660 |
gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa |
5759 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
5760 |
agttgg |
5765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
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106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | |
|
|
| T |
48482 |
tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca |
48580 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatca |
228 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
48581 |
taacatcaagtgaacaagaatca |
48603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa |
205 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
147 |
tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca |
49 |
T |
 |
| Q |
206 |
caacatcaattgcacaagaatca |
228 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
48 |
taatatcatttgaacaagaatca |
26 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:
Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13347
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| Q |
268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13445 |
gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca |
13347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51209
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| Q |
268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
51314 |
gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac |
51215 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
51214 |
agttgg |
51209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89481
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| Q |
268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa |
367 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
89586 |
gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac |
89487 |
T |
 |
| Q |
368 |
agttgg |
373 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
89486 |
agttgg |
89481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 79533 - 79616
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135 |
ttctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
79533 |
ttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg |
79616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1711 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:
Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1326
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268 |
gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca |
366 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1424 |
gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca |
1326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:
Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1863
Alignment:
| Q |
106 |
tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1815 |
tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaa |
1863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:
Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3252
Alignment:
| Q |
114 |
aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3183 |
aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaa |
3252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:
Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Original strand, 54412 - 54630
Alignment:
| Q |
135 |
ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | || | |||||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
54412 |
ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc |
54511 |
T |
 |
| Q |
235 |
aattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatac |
330 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| || ||||||| | ||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
54512 |
atttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatac |
54610 |
T |
 |
| Q |
331 |
acttattatcaattcatgca |
350 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
54611 |
aattatcatcaattcatgca |
54630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Original strand, 45007 - 45051
Alignment:
| Q |
135 |
ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattca |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45007 |
ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattca |
45051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| | || ||| |
|
|
| T |
77139 |
caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc |
77041 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat |
250 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
77040 |
acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat |
76984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132420
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | ||||| |
|
|
| T |
132542 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg |
132444 |
T |
 |
| Q |
194 |
tattagcatcaacaacatcaattg |
217 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
132443 |
acttaacaacaacaacatcaattg |
132420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1028
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1089 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
1028 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:
Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45815
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45876 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
45815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:
Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 1286 - 1347
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1286 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
1347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12068 - 12007
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12068 |
catcaacaattaaacacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
12007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7522 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
7551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 3406 - 3467
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3406 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
3467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24557 - 24496
Alignment:
| Q |
19 |
catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac |
80 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24557 |
catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac |
24496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
| Q |
95 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38253 |
caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca |
38282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:
Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2532
Alignment:
| Q |
161 |
atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2476 |
atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg |
2532 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:
Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1705 - 1629
Alignment:
| Q |
23 |
aacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt |
99 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
1705 |
aacaattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt |
1629 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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