View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9464_low_5 (Length: 275)

Name: NF9464_low_5
Description: NF9464
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9464_low_5
NF9464_low_5
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (6-275)||(33965-34234)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (6-275)||(7341235-7341504)
chr8 (6-275)||(32377544-32377813)
chr8 (6-275)||(32431501-32431770)
chr8 (6-275)||(8422492-8422761)
chr8 (14-275)||(30304246-30304507)
chr8 (14-275)||(35965381-35965642)
chr8 (14-275)||(43370931-43371192)
chr8 (14-270)||(43688812-43689068)
chr8 (18-275)||(2145635-2145897)
chr8 (16-275)||(45455542-45455801)
chr8 (14-186)||(1115936-1116108)
chr8 (14-270)||(7169064-7169311)
chr8 (83-270)||(22581061-22581248)
chr8 (14-167)||(39751772-39751925)
chr8 (185-273)||(45116582-45116670)
chr8 (185-273)||(44321173-44321261)
chr8 (206-267)||(13781602-13781663)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (6-275)||(43622771-43623040)
chr7 (6-275)||(30787695-30787964)
chr7 (6-275)||(45764535-45764804)
chr7 (6-275)||(617385-617654)
chr7 (14-275)||(18106552-18106813)
chr7 (14-275)||(42500571-42500832)
chr7 (14-270)||(47062047-47062303)
chr7 (14-270)||(8400750-8401006)
chr7 (14-270)||(43827248-43827503)
chr7 (123-275)||(15067162-15067314)
chr7 (14-127)||(15060777-15060890)
chr7 (185-273)||(1297321-1297409)
chr7 (160-258)||(16795749-16795847)
chr7 (185-275)||(43378944-43379034)
chr7 (185-273)||(45172547-45172635)
chr7 (185-258)||(16794266-16794339)
chr7 (185-273)||(40445203-40445291)
chr7 (185-273)||(46791660-46791748)
chr7 (185-273)||(47867137-47867225)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (6-275)||(49565100-49565369)
chr4 (14-275)||(19072293-19072554)
chr4 (14-275)||(3404954-3405215)
chr4 (14-275)||(9891186-9891447)
chr4 (14-275)||(41024363-41024624)
chr4 (14-270)||(4769298-4769554)
chr4 (14-270)||(38463478-38463734)
chr4 (14-275)||(44049774-44050035)
chr4 (14-270)||(4976919-4977175)
chr4 (14-270)||(11502670-11502926)
chr4 (14-270)||(4978599-4978851)
chr4 (14-270)||(21471958-21472214)
chr4 (14-198)||(51643211-51643395)
chr4 (47-270)||(6182875-6183098)
chr4 (14-125)||(18580117-18580225)
chr4 (185-273)||(32716628-32716716)
chr4 (212-275)||(4617919-4617982)
chr4 (185-273)||(1591168-1591256)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (6-275)||(3949899-3950168)
chr3 (6-275)||(8159619-8159888)
chr3 (14-275)||(6742051-6742312)
chr3 (6-275)||(30946278-30946547)
chr3 (14-275)||(13746357-13746618)
chr3 (14-275)||(16445784-16446045)
chr3 (14-275)||(36816152-36816413)
chr3 (14-234)||(9428510-9428730)
chr3 (14-275)||(14399719-14399980)
chr3 (14-275)||(48249503-48249764)
chr3 (14-275)||(7841652-7841912)
chr3 (16-275)||(46991882-46992141)
chr3 (16-270)||(77661-77915)
chr3 (14-275)||(6504591-6504852)
chr3 (14-275)||(21954875-21955135)
chr3 (14-270)||(7838760-7839016)
chr3 (58-270)||(29908027-29908238)
chr3 (58-270)||(29949193-29949404)
chr3 (58-270)||(29998347-29998558)
chr3 (209-270)||(28610560-28610621)
chr3 (14-62)||(29930532-29930580)
chr3 (14-62)||(29979686-29979734)
chr3 (185-273)||(4120432-4120520)
chr3 (192-275)||(9556400-9556483)
chr3 (185-272)||(40467847-40467934)
chr3 (185-273)||(2284695-2284783)
chr3 (185-273)||(12491422-12491510)
chr3 (185-273)||(51548171-51548259)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (6-275)||(212077-212346)
chr2 (6-275)||(5348323-5348592)
chr2 (6-275)||(41561168-41561437)
chr2 (6-275)||(10623090-10623359)
chr2 (14-275)||(27274996-27275257)
chr2 (12-272)||(38946925-38947185)
chr2 (14-275)||(3802202-3802463)
chr2 (14-275)||(39795134-39795395)
chr2 (14-269)||(24750822-24751077)
chr2 (14-270)||(1098467-1098723)
chr2 (16-270)||(45476524-45476777)
chr2 (14-275)||(24604725-24604986)
chr2 (14-270)||(43948923-43949179)
chr2 (14-264)||(28354549-28354799)
chr2 (14-270)||(12907133-12907389)
chr2 (14-270)||(34920423-34920679)
chr2 (14-260)||(11692466-11692712)
chr2 (14-275)||(436475-436736)
chr2 (14-275)||(41007616-41007877)
chr2 (14-270)||(9655320-9655576)
chr2 (99-275)||(7264229-7264405)
chr2 (14-270)||(17996813-17997069)
chr2 (207-275)||(24941286-24941354)
chr2 (160-270)||(28423115-28423225)
chr2 (207-275)||(3353917-3353985)
chr2 (168-248)||(21535507-21535587)
chr2 (14-52)||(7264196-7264234)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (6-275)||(3947097-3947366)
chr1 (6-275)||(3984269-3984538)
chr1 (6-275)||(20350612-20350881)
chr1 (6-275)||(44466738-44467007)
chr1 (6-275)||(38774751-38775020)
chr1 (14-275)||(29355324-29355585)
chr1 (14-275)||(5079099-5079360)
chr1 (14-275)||(41455001-41455262)
chr1 (14-275)||(13630580-13630841)
chr1 (14-270)||(37016078-37016334)
chr1 (14-275)||(50116399-50116660)
chr1 (14-275)||(12649215-12649476)
chr1 (14-270)||(38691580-38691836)
chr1 (14-266)||(46974328-46974580)
chr1 (14-272)||(51663422-51663680)
chr1 (14-270)||(13174945-13175201)
chr1 (14-270)||(21943005-21943261)
chr1 (97-270)||(19498105-19498277)
chr1 (14-109)||(44619905-44620000)
chr1 (21-226)||(32106328-32106533)
chr1 (21-175)||(26466006-26466160)
chr1 (185-273)||(36360158-36360246)
chr1 (14-55)||(7980068-7980109)
chr1 (185-273)||(7403953-7404041)
chr1 (185-273)||(28863225-28863313)
chr1 (185-273)||(45472687-45472775)
chr1 (106-203)||(25231558-25231655)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (14-275)||(2045-2306)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (6-275)||(1611387-1611656)
chr6 (14-270)||(31147486-31147742)
chr6 (14-275)||(18607160-18607421)
chr6 (14-275)||(29287589-29287845)
chr6 (89-275)||(28357557-28357743)
chr6 (14-270)||(21357991-21358244)
chr6 (14-270)||(23961973-23962226)
chr6 (14-88)||(28251060-28251134)
chr6 (14-90)||(24220332-24220408)
chr6 (185-273)||(9095463-9095551)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (14-275)||(37819513-37819774)
chr5 (14-275)||(7020516-7020777)
chr5 (14-271)||(28885048-28885305)
chr5 (14-275)||(11032088-11032349)
chr5 (14-275)||(38858826-38859087)
chr5 (14-275)||(34078944-34079205)
chr5 (14-275)||(27866481-27866742)
chr5 (14-275)||(7799642-7799903)
chr5 (14-270)||(4202580-4202836)
chr5 (14-270)||(18536977-18537233)
chr5 (14-275)||(1036515-1036776)
chr5 (14-275)||(25895733-25895998)
chr5 (14-215)||(13566787-13566988)
chr5 (21-252)||(20286180-20286410)
chr5 (21-270)||(20287439-20287689)
chr5 (185-275)||(11819551-11819641)
chr5 (185-273)||(27013307-27013395)
chr5 (160-265)||(25053043-25053148)
chr5 (185-273)||(42343826-42343913)
chr5 (185-273)||(43295549-43295637)
chr5 (232-275)||(13566743-13566786)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (14-275)||(15993-16254)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (14-275)||(17233-17494)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (14-167)||(12426-12580)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (185-273)||(28524-28612)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 33965 - 34234
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33965 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 34064  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34065 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 34164  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 34234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 7341235 - 7341504
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341235 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 7341334  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341335 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 7341434  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341435 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 7341504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32377813 - 32377544
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377813 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 32377714  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377713 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 32377614  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377613 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 32377544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32431770 - 32431501
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431770 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 32431671  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431670 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 32431571  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431570 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 32431501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8422761 - 8422492
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422761 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 8422662  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422661 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 8422562  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422561 attatattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 8422492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30304507 - 30304246
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304507 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 30304408  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304407 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 30304308  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304307 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 30304246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35965642 - 35965381
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35965642 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 35965543  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  35965542 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacagttgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 35965443  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  35965442 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 35965381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 43370931 - 43371192
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43370931 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagctgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 43371030  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43371031 cgaagttggaggagcacagctatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43371130  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  43371131 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 43371192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43689068 - 43688812
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43689068 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatttctaattt 43688969  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  43688968 cgaagttgggggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactataatcgaagatatcttttgggctcatccaaaatccgttaagtt 43688869  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43688868 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 43688812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2145897 - 2145635
Alignment:
Q  18 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-----ggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2145897 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatataatagaggtgacaagaagttgttgcaatatctaatc 2145798  T
Q  113 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |    
T  2145797 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagt 2145698  T
Q  213 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  2145697 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 2145635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 45455542 - 45455801
Alignment:
Q  16 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45455542 accatattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaaaaagccgttgcaatatctaatctcg 45455641  T
Q  116 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  || ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45455642 aagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtaccacaatcaaatatattttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 45455741  T
Q  216 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  45455742 ttaaaatttttccaacggttttggttatggactccaccaacaaaaccaacatgtacagga 45455801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 1115936 - 1116108
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115936 agaccacattgcatgacaaatgtgaaacaaatgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 1116035  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1116036 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatgtttt 1116108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 7169064 - 7169311
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||| | ||||||    
T  7169064 agaccacattccatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtg---------cgttgcaatatataatct 7169154  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7169155 caaagttggatgagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7169254  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7169255 gtttaacaattttccaacgattttggttatgaactccacctacaaaaccaacatgta 7169311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 270
Target Start/End: Original strand, 22581061 - 22581248
Alignment:
Q  83 ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagata 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||    
T  22581061 ggtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaata 22581160  T
Q  183 ttttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  22581161 tcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggactccacctgcaaaaccaacatgta 22581248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39751925 - 39751772
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39751925 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaaaccattgcaatatctaatct 39751826  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 167  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39751825 cgaagttggaggagcacaacttcacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 39751772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 45116582 - 45116670
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  45116582 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 45116670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 44321173 - 44321261
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  44321173 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 44321261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13781663 - 13781602
Alignment:
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacat 267  Q
    ||||||||| | |||| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13781663 attaaattgctcaacacttttccgaccgttttggtcatggactccacttacaaaaccaacat 13781602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43623040 - 43622771
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623040 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 43622941  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622940 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 43622841  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622840 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 43622771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 30787695 - 30787964
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787695 agaaccagataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaagcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 30787794  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787795 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 30787894  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787895 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 30787964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 45764535 - 45764804
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764535 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgcgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 45764634  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764635 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 45764734  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45764735 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccagcatgtatagga 45764804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 617654 - 617385
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  617654 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatt 617555  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617554 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 617455  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617454 attaagttgtttaacaattttccaacgattttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 617385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 18106552 - 18106813
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106552 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 18106651  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18106652 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 18106751  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18106752 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 18106813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 42500571 - 42500832
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42500571 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 42500670  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42500671 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 42500770  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42500771 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 42500832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 47062047 - 47062303
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggt-gacaagaagccgttgcaatttctaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  47062047 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggttgacaagaagccgttgcaatatctaatc 47062146  T
Q  113 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaat 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  47062147 tcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaa-aacacaaagtgaaagtactacaattgaagatatctttcgggctcatccaacatccgttaagt 47062245  T
Q  213 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  47062246 tgtttaaaaaatttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaaaatgta 47062303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 8400750 - 8401006
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8400750 agaccacattggatgacaaatatcaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagacggcgttgcaatatctaatct 8400849  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8400850 cgaagttggaggagcacaactatacttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactacaattaaagatattttttgggctcatccaacatctgttaagtt 8400949  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  8400950 gtttaacaattttctaacggttttggttatggatttcacctacaaaaccaacatgta 8401006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43827503 - 43827248
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43827503 agaccacattgcatgacaaatatcaagcaagtgtacaatgaacgtcagcaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatcta-tct 43827405  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43827404 cgaagttgaatgagcacaactatacttatttcacaagaacacaaagtgaaagtactacaattgaaaatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43827305  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43827304 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacgtgta 43827248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 123 - 275
Target Start/End: Original strand, 15067162 - 15067314
Alignment:
Q  123 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15067162 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 15067261  T
Q  223 ttttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15067262 ttttccaacggttttggttatggactccacatacaaaaccaacatgtatagga 15067314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 15060777 - 15060890
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15060777 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 15060876  T
Q  114 cgaagttggaggag 127  Q
    ||||||||||||||    
T  15060877 cgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 1297321 - 1297409
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  1297321 ttttggactcatccaacatcgataaagttgtttaacatttttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 1297409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16795847 - 16795749
Alignment:
Q  160 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaa 258  Q
    ||||||||| ||| || ||||  | |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||    
T  16795847 tgaaagtaaaactgttcaagacttattttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccatgtacaa 16795749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43379034 - 43378944
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  43379034 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtatagga 43378944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 45172635 - 45172547
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | || || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  45172635 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataattgattccacgtacaaaaccaacttgtatag 45172547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16794339 - 16794266
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaa 258  Q
    |||||| |||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||    
T  16794339 ttttggactcatcaaacatcagtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaa 16794266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40445291 - 40445203
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  40445291 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgttttgataatggattccatgtacaaaaccaacttgtatag 40445203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 46791660 - 46791748
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || || ||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| || ||| |||||||    
T  46791660 ttttggactcatccaacatcagtaaagttatttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaactaacttgtatag 46791748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47867225 - 47867137
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||  || | |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  47867225 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgctttgataatggactccacgtacaaaatcaacttgtatag 47867137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49565369 - 49565100
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565369 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 49565270  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565269 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 49565170  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565169 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 49565100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19072554 - 19072293
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072554 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 19072455  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072454 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 19072355  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072354 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 19072293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 3404954 - 3405215
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404954 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 3405053  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3405054 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 3405153  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3405154 gtttaacaattttcaaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 3405215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 9891186 - 9891447
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9891186 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 9891285  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9891286 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttggactcatccaacatccattaagtt 9891385  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9891386 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 9891447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 41024363 - 41024624
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41024363 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaaaaagtcgttgcaatttctaatct 41024462  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024463 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 41024562  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41024563 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 41024624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 4769298 - 4769554
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4769298 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaatgtctacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctgattt 4769397  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4769398 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4769497  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4769498 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 4769554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38463734 - 38463478
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38463734 agaccacactgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatacggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 38463635  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  38463634 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 38463535  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38463534 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 38463478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 44049774 - 44050035
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44049774 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaacgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatct 44049873  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44049874 cgaagttggaggagcgcagctatacttattactcaataacacaaagtgaaactactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 44049973  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  44049974 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 44050035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 4976919 - 4977175
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4976919 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaatgcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 4977018  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  4977019 caaagttggaggagcacaactatacttattactaaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 4977118  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4977119 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 4977175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 11502670 - 11502926
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11502670 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtaaacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 11502769  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  11502770 cgaagttggaagagcacaactatacttattactcaagaacacaaagagaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcaaacatccgttaagtt 11502869  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11502870 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 11502926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4978851 - 4978599
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4978851 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaa----ggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4978756  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||| ||    
T  4978755 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcttccaacgtctgttaagtt 4978656  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4978655 gtttaacaattttcgaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 4978599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 21471958 - 21472214
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  21471958 agaccacattggataa-aaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatttaatct 21472056  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21472057 cgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacacaaagtgaaagtactaaaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 21472156  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtac-aagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  21472157 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaacaccaacatgta 21472214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51643395 - 51643211
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51643395 agaccacattgcatgacaaatgtaaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagacgccgttgcaatatctaatct 51643296  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  51643295 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatcc 51643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Original strand, 6182875 - 6183098
Alignment:
Q  47 tacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattact 146  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||| |||| || |||||||||| |  | |||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||| |     
T  6182875 tacaatgaacatcaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaagacggtgatgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactatgtttatttca 6182974  T
Q  147 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 246  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  6182975 ccataacacaaattgaaagtactactattcaagacatattttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacagttttgattatgaa 6183074  T
Q  247 ctccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||  ||||| |||||||||||    
T  6183075 ctccatctacaaaaccaacatgta 6183098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18580225 - 18580117
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18580225 agacctcattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgga---caaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatttaatct 18580129  T
Q  114 cgaagttggagg 125  Q
    ||||||| ||||    
T  18580128 cgaagtttgagg 18580117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 32716628 - 32716716
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  32716628 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 32716716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Original strand, 4617919 - 4617982
Alignment:
Q  212 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4617919 ttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagga 4617982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 1591168 - 1591256
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  1591168 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacaatttttcgactgttttgataatggattccacgtagaaaaccaacttgtatag 1591256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 3949899 - 3950168
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949899 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 3949998  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949999 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 3950098  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950099 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 3950168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8159888 - 8159619
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159888 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 8159789  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159788 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 8159689  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159688 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 8159619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 6742051 - 6742312
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742051 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 6742150  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742151 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 6742250  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742251 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 6742312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30946547 - 30946278
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946547 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 30946448  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946447 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 30946348  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946347 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 30946278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13746618 - 13746357
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746618 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 13746519  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13746518 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 13746419  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13746418 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 13746357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 16445784 - 16446045
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16445784 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 16445883  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16445884 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 16445983  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16445984 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtatagga 16446045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36816413 - 36816152
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816413 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 36816314  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36816313 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtaatacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 36816214  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36816213 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 36816152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9428730 - 9428510
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428730 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 9428631  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9428630 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 9428531  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggt 234  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9428530 gtttaacaattttccaacggt 9428510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 14399719 - 14399980
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14399719 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 14399818  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14399819 cgaatttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 14399918  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14399919 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 14399980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48249764 - 48249503
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48249764 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 48249665  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48249664 ctatgttggatgagcacaactatacttatcactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 48249565  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48249564 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 48249503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7841912 - 7841652
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7841912 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7841813  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  7841812 cgaagttggaggagcacaacta-acttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggttcatccaacatccgttaagtt 7841714  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7841713 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagagga 7841652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46992141 - 46991882
Alignment:
Q  16 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  46992141 accacattgcatgacaaatatgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttt 46992042  T
Q  116 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46992041 atgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 46991942  T
Q  216 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46991941 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 46991882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 77915 - 77661
Alignment:
Q  16 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  77915 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcg 77816  T
Q  116 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  77815 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactaccatcgaagatatcttttgggctcatccaacatttgttaagttgt 77716  T
Q  216 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  77715 ttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 77661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6504852 - 6504591
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6504852 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcacatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaacct 6504753  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6504752 cgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 6504653  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  6504652 ttttaacaattttccaaccgttttggttatggactccacctacataaccaacatgtacagga 6504591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21955135 - 21954875
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21955135 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatat-taatct 21955037  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21955036 cgaagttggaggaccacaactatacttatttctcaagaaaacaaagtgaaagtaccacaatcgaagataccttttgggctcatccaacatccattaagtt 21954937  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  21954936 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaacgaacatgtacagga 21954875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 7838760 - 7839016
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7838760 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtggcaagaagccgttgcaatatctaatct 7838859  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||    
T  7838860 tgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacataaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccgacatctgttaagtt 7838959  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7838960 gtttaacaattttccaacggttttggtcatggactccacctacaaaaccaacatgta 7839016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 29908027 - 29908238
Alignment:
Q  58 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29908027 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29908125  T
Q  158 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 257  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29908126 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29908225  T
Q  258 agaccaacatgta 270  Q
    | |||||||||||    
T  29908226 aaaccaacatgta 29908238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 29949193 - 29949404
Alignment:
Q  58 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949193 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29949291  T
Q  158 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 257  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29949292 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29949391  T
Q  258 agaccaacatgta 270  Q
    | |||||||||||    
T  29949392 aaaccaacatgta 29949404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 29998347 - 29998558
Alignment:
Q  58 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998347 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29998445  T
Q  158 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 257  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29998446 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29998545  T
Q  258 agaccaacatgta 270  Q
    | |||||||||||    
T  29998546 aaaccaacatgta 29998558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28610621 - 28610560
Alignment:
Q  209 aaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28610621 aaatggtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 28610560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Original strand, 29930532 - 29930580
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29930532 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29930580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Original strand, 29979686 - 29979734
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29979686 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29979734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4120520 - 4120432
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  4120520 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgaccgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 4120432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9556483 - 9556400
Alignment:
Q  192 ctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  9556483 ctcatccaacatccgtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccaacttgtacagga 9556400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40467934 - 40467847
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtata 272  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  40467934 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtata 40467847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2284783 - 2284695
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  2284783 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 2284695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 12491422 - 12491510
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| | |||| |||||||    
T  12491422 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccaactgttttgataatggattccgcgtacaaaatcaacttgtatag 12491510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51548259 - 51548171
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| || ||||||||||  | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  51548259 ttttggacttatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 51548171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 212346 - 212077
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212346 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 212247  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212246 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 212147  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212146 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 212077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 5348323 - 5348592
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348323 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 5348422  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348423 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 5348522  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348523 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 5348592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 41561168 - 41561437
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561168 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 41561267  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561268 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 41561367  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561368 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 41561437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10623359 - 10623090
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623359 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 10623260  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10623259 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatctaacatcc 10623160  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623159 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 10623090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27275257 - 27274996
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275257 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 27275158  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27275157 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 27275058  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27275057 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 27274996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 38946925 - 38947185
Alignment:
Q  12 agagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaat 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38946925 agagaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaat 38947024  T
Q  112 ctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38947025 ctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaag 38947124  T
Q  212 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtata 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947125 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtata 38947185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3802463 - 3802202
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802463 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacttcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 3802364  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3802363 cgaagttgaaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagtt 3802264  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3802263 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 3802202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 39795134 - 39795395
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39795134 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 39795233  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39795234 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgatagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 39795333  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39795334 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtatagga 39795395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 24750822 - 24751077
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24750822 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24750921  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24750922 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaatacaaagtgaaagtaatacgatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 24751021  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24751022 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgt 24751077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1098723 - 1098467
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1098723 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1098624  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1098623 cgaagttggaggagcacaactatacttattattcaagaacacaaagtgaaagtactacaaccgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 1098524  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1098523 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 1098467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Original strand, 45476524 - 45476777
Alignment:
Q  16 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45476524 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaa-tatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcg 45476622  T
Q  116 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  45476623 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgt 45476722  T
Q  216 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45476723 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 45476777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24604986 - 24604725
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24604986 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatagggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24604887  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  24604886 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 24604787  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24604786 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 24604725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43949179 - 43948923
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  43949179 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatataggtgacaagaagccgttgcgttatctaatct 43949080  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43949079 cgaagttagaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43948980  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43948979 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 43948923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28354799 - 28354549
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28354799 agaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatataggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 28354700  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  28354699 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 28354600  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28354599 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaa 28354549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12907389 - 12907133
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12907389 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttcaaattt 12907290  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  12907289 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatatcttttggactcatccaacatccgttaagtt 12907190  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12907189 gtttaacaattttccaacggatttggttatggacttcacctacaaaaccaacatgta 12907133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34920679 - 34920423
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34920679 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaattcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaattt 34920580  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  34920579 cgaagttggaggagcacacttatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 34920480  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34920479 gtttaacaatattccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 34920423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11692712 - 11692466
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11692712 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagaagccgttgcaatatttaatct 11692613  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  11692612 cgaaattggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaattactacaatagaagatatattttgggcccatccaacatccgttaagtt 11692513  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaga 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11692512 gtttaagaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaga 11692466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 436475 - 436736
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  436475 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaattgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 436574  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||    
T  436575 cgaagttggaggagcacatctatacttattattcaagaacacatagtgaaagtactacaatctaagatatcttttgggctcatctaacatcttttaagtt 436674  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  436675 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 436736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41007877 - 41007616
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41007877 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtctaaaatgaacgtcaacaaatatgtaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 41007778  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  41007777 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 41007678  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  41007677 gtttaacaatttctcaacggttttgattatggactccacctacaaaactaacatgtacagga 41007616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 9655320 - 9655576
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  9655320 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagtaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatgt 9655419  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9655420 cgaagttgaaggagcacaactatatttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 9655519  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9655520 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgta 9655576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 275
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264405
Alignment:
Q  99 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaataccattgaagatattttttaggctcatcc 7264328  T
Q  199 aacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  7264329 aacatccattaagtagttaaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaattaacatgtatagga 7264405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17997069 - 17996813
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||| | ||||||||||    
T  17997069 agacaacattgcatgccaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatagaggtgacaagacgatgttgtagtttctaatct 17996970  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||    
T  17996969 caaagttggaggagcacaactgtgtttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactactattgaagatatcttttaggctcatccaacatccgttacgtt 17996870  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17996869 gtttaacaatattccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 17996813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24941354 - 24941286
Alignment:
Q  207 ttaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24941354 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 24941286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28423225 - 28423115
Alignment:
Q  160 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 259  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| || || |||||| | ||||  |||||||||||     
T  28423225 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgggttccacgtacaaa 28423126  T
Q  260 accaacatgta 270  Q
    |||||| ||||    
T  28423125 accaacttgta 28423115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3353985 - 3353917
Alignment:
Q  207 ttaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  3353985 ttaaattgtttaacaatttttcgactgttttgatcatggactccacctataaaaccaacatgtacagga 3353917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 248
Target Start/End: Original strand, 21535507 - 21535587
Alignment:
Q  168 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggact 248  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||   |||  |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21535507 atactattcaagacatattttgggctcatcctcaatcagttaggttggttaacaattttccaacagttttggttatggact 21535587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 52
Target Start/End: Original strand, 7264196 - 7264234
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 52  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7264196 agaccacattgcatgacaattgtgaagcaagtgtgcaat 7264234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3947366 - 3947097
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947366 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 3947267  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947266 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 3947167  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947166 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 3947097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 3984269 - 3984538
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984269 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 3984368  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984369 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 3984468  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984469 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 3984538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 20350612 - 20350881
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350612 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 20350711  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350712 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 20350811  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350812 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 20350881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Original strand, 44466738 - 44467007
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466738 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 44466837  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466838 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 44466937  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466938 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 44467007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38775020 - 38774751
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38775020 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatatgggtgacaagaagccgttgcaatt 38774921  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774920 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 38774821  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774820 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 38774751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29355585 - 29355324
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355585 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 29355486  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29355485 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 29355386  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29355385 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 29355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 5079099 - 5079360
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079099 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcagataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 5079198  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5079199 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 5079298  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5079299 gtttaacaattttcaaacggttttggttacggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 5079360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 41455001 - 41455262
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455001 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 41455100  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41455101 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 41455200  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  41455201 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtaaagga 41455262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 13630580 - 13630841
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13630580 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 13630679  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13630680 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 13630779  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13630780 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtatagga 13630841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 37016078 - 37016334
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37016078 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 37016177  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37016178 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 37016277  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37016278 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 37016334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 50116660 - 50116399
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50116660 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatgt 50116561  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  50116560 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccgttaagtt 50116461  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  50116460 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 50116399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12649476 - 12649215
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  12649476 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatat 12649377  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12649376 ctatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 12649277  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12649276 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 12649215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38691836 - 38691580
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38691836 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagagatgacaagaagccgttgcaatatctaatct 38691737  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  38691736 cgatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 38691637  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38691636 gtttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 38691580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 46974328 - 46974580
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46974328 agaccacattgcatgacaaatgtgaaacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 46974427  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46974428 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 46974527  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaaca 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46974528 gtttaacaatcttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaaca 46974580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 51663422 - 51663680
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  51663422 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaaaatggaaggcaaatagaggtgacaataagtcgttgcaatatctaatct 51663521  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  51663522 cgaagttggaggagcacaactatacttattagtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcctttaagtt 51663621  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtata 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  51663622 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactctacctacaaaaccaacatgtata 51663680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 13174945 - 13175201
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13174945 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaaatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaattt 13175044  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  13175045 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgtgctcatccaacatccgctaagtt 13175144  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  13175145 gtttaacaaatttccagcggttttggttatggactccacctacaaaaccatcatgta 13175201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21943261 - 21943005
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  21943261 agaccacattgcatgacaaatgtcaaacaagtgtacaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggcgacaagaaactgttgcaatatctaatct 21943162  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||    
T  21943161 cgaagttggaggagcacaactatgcttatttctcaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccatcattcgttaagtt 21943062  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21943061 gtttaacaaattttcaacggttttggttatggattccacctacaaaaccaacatgta 21943005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19498105
Alignment:
Q  97 gttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcat 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||| ||  |||||| |||| ||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctaaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatactttt-gggctcat 19498179  T
Q  197 ccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  19498178 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacccacaaaacaaacatgta 19498105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44620000 - 44619905
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttcta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44620000 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtgcaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatcta 44619905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32106533 - 32106328
Alignment:
Q  21 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 120  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| |  | |||| | | ||||||| |||||    
T  32106533 attgcaagacaaatatcaagcaagtatgcaattaacatcaacaaatatggaagtcgaacagaggtgacaagacgatgatgcattatataatctcaaagtt 32106434  T
Q  121 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaac 220  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32106433 ggaggagcacaactatgtttatttcaccagaacacaaagtgaaagtactactattgaagacatattttaagctcatccaacatccattaagttgtttaac 32106334  T
Q  221 aatttt 226  Q
    ||||||    
T  32106333 aatttt 32106328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26466160 - 26466006
Alignment:
Q  21 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 120  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||| | || | |  |||||| ||||||||||| |||||    
T  26466160 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaataaatatggaagtcatacagaggttaaaaaacggtgttgcagtttctaatctcaaagtt 26466061  T
Q  121 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactatt 175  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26466060 gaaggagcacaactatgtttatttctcaagaacacaaaatgaaagtactactatt 26466006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36360246 - 36360158
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  36360246 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 36360158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 7980109 - 7980068
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980109 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 7980068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 7403953 - 7404041
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  7403953 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 7404041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 28863225 - 28863313
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  28863225 ttttggactcatccaacattcgtaaaattgtttaacactttttcgactgttttgataatggattctacgtacaaaaccaacttgtatag 28863313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472775
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  45472687 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatcccacgtacaaaaccaacttgtatag 45472775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 203
Target Start/End: Original strand, 25231558 - 25231655
Alignment:
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacat 203  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| | | | |||| ||  |||||||| ||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||    
T  25231558 tctaatctcaaaattggaggagcacaactatgtttatttcaccataacaaaaagtgaaagtactacaattaaagacatattttgggttcatccaacat 25231655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 2045 - 2306
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 2144  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 2244  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2245 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 2306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1611656 - 1611387
Alignment:
Q  6 agaagcagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611656 agaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatt 1611557  T
Q  106 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611556 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 1611457  T
Q  206 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1611456 attaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatttatagga 1611387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 31147486 - 31147742
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31147486 agaccacattgcatgataaatttgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 31147585  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  31147586 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatacaacatccgttaagtt 31147685  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31147686 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 31147742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 18607160 - 18607421
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  18607160 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatatctaattt 18607259  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  18607260 ttaagttggaggagcacaacaatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 18607359  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18607360 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 18607421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29287845 - 29287589
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||| |    
T  29287845 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgc----tctaatat 29287750  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  29287749 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaattt 29287650  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29287649 gtttaa-aattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 29287589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 89 - 275
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357743
Alignment:
Q  89 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttttt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatctttt 28357656  T
Q  189 gggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28357657 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaagaccaacatgtatagga 28357743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21358244 - 21357991
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21358244 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 21358148  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21358147 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 21358048  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21358047 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 21357991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23962226 - 23961973
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23962226 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 23962130  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  23962129 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 23962030  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23962029 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 23961973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 28251060 - 28251134
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgac 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251060 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 28251134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 24220332 - 24220408
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 90  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24220332 agaccacattgcatgacaaatatcaagtaagtgtaaaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 24220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 9095463 - 9095551
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  9095463 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgatcatggattccacgtacaaagccaacttgtatag 9095551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37819774 - 37819513
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819774 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 37819675  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37819674 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 37819575  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37819574 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtatagga 37819513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7020777 - 7020516
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020777 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 7020678  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7020677 cgaagttggaggagcacatctatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 7020578  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7020577 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 7020516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28885305 - 28885048
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885305 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 28885206  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28885205 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 28885106  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  28885105 gtttaacaattttccaacggttttggttatggattccacgtacgaaaccaacatgtat 28885048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11032349 - 11032088
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11032349 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatatctaatct 11032250  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11032249 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 11032150  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11032149 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtatagga 11032088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38859087 - 38858826
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38859087 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 38858988  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38858987 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 38858888  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  38858887 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatatatagga 38858826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 34078944 - 34079205
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078944 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 34079043  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34079044 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 34079143  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34079144 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 34079205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27866742 - 27866481
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27866742 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaaacctttgcaatttctaatct 27866643  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27866642 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 27866543  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27866542 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 27866481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7799903 - 7799642
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7799903 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7799804  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7799803 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7799704  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7799703 gtttaacaattttccaacggttttggttaaggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 7799642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4202836 - 4202580
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4202836 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4202737  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4202736 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4202637  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4202636 gtttaacaattttccaacagttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgta 4202580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18537233 - 18536977
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18537233 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 18537134  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18537133 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 18537034  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  18537033 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaactaacatgta 18536977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 1036515 - 1036776
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1036515 agaccacattgcatgacaaatgtgacacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1036614  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  1036615 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccattaagtt 1036714  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  1036715 gtttaacaattttccaacggttttggttacggactcaacctacaaaatcaacatgtatagga 1036776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25895998 - 25895733
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25895998 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatat 25895899  T
Q  114 cgaa----gttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccatta 209  Q
    | |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25895898 ctatatatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgagagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccatta 25895799  T
Q  210 aattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25895798 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 25895733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13566988 - 13566787
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566988 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 13566889  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  13566888 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggatcattcaacatccattaagtt 13566789  T
Q  214 gt 215  Q
    ||    
T  13566788 gt 13566787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 20286180 - 20286410
Alignment:
Q  21 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 120  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||    | |||| ||||||||||| |||||    
T  20286180 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacatcaacaaatatggaagtcaaacagaggtgacaagactgtggtgcagtttctaatctcaaagtt 20286279  T
Q  121 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaac 220  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | | ||| |||      
T  20286280 ggaggagcacaattatctttatttctcaataacacaaaatgaaagtactactattgaagacatattttgggctcatccaacatccgcttagttg-ttatg 20286378  T
Q  221 aattttccaacggttttggttatggactccac 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20286379 aattttccaacagttttggttatggactccac 20286410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 270
Target Start/End: Original strand, 20287439 - 20287689
Alignment:
Q  21 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagtt 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||    
T  20287439 attgtatgacaaatatcaagcaagtatataatgaacgtcaataaatatgaaagtcaaacagaggtgacaagacggggttccagtttctaatctcaaagtt 20287538  T
Q  121 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa-attgtttaa 219  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |   | |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  || |||||    
T  20287539 ggaggagcacaattatgtttatttctcaagaacaaatggtcaaagtactactattgaagacatattttgcgctcatccaacatccgttaagtttttttaa 20287638  T
Q  220 caattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgta 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  20287639 caattttccaacggttctggttatggactccacctaccaaaccaacatgta 20287689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 275
Target Start/End: Original strand, 11819551 - 11819641
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    |||||| ||||||||| |||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11819551 ttttggactcatccaaaatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagga 11819641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27013395 - 27013307
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  27013395 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatagattccacgtacaaaaccaacttgtatag 27013307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Original strand, 25053043 - 25053148
Alignment:
Q  160 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaag 259  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |||||||||||     
T  25053043 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaatatcgataaagctgtttaacaattttccggctgttttgataatggattccacgtacaaa 25053142  T
Q  260 accaac 265  Q
    ||||||    
T  25053143 accaac 25053148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 42343826 - 42343913
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  42343826 ttttggactcatccaacatc-agtatattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtatag 42343913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Original strand, 43295549 - 43295637
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  43295549 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 43295637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13566786 - 13566743
Alignment:
Q  232 ggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  13566786 ggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtctagga 13566743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16254 - 15993
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaacgcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 16155  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16154 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagtt 16055  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16054 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtatagga 15993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 17233 - 17494
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17233 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgaaatatctaatct 17332  T
Q  114 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||    
T  17333 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttaggctcatccaacatctgttaagtt 17432  T
Q  214 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatagga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  17433 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacagga 17494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 12426 - 12580
Alignment:
Q  14 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaa-ggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12426 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatcgaaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatc 12525  T
Q  113 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12526 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28612 - 28524
Alignment:
Q  185 ttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtatag 273  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| || || || || |||||| |||||||    
T  28612 ttttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattctacataaaaaaccaacttgtatag 28524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University